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15 results on '"Duchesne, Rachel"'

4. Extracellular DNA release, quorum sensing, and PrrF1/F2 small RNAs are key players in Pseudomonas aeruginosa tobramycin-enhanced biofilm formation

Author

Tahrioui, Ali, Duchesne, Rachel, Bouffartigues, Emeline, Rodrigues, Sophie, Maillot, Olivier, Tortuel, Damien, Hardouin, Julie, Taupin, Laure, Groleau, Marie-Christine, Dufour, Alain, Déziel, Eric, Brenner-Weiss, Gerald, Feuilloley, Marc, Orange, Nicole, Lesouhaitier, Olivier, Cornelis, Pierre, and Chevalier, Sylvie

Published
2019
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5. The absence of SigX results in impaired carbon metabolism and membrane fluidity in Pseudomonas aeruginosa

Author

Fléchard, Maud, Duchesne, Rachel, Tahrioui, Ali, Bouffartigues, Emeline, Depayras, Ségolène, Hardouin, Julie, Lagy, Coralie, Maillot, Olivier, Tortuel, Damien, Azuama, Cecil Onyedikachi, Clamens, Thomas, Duclairoir-Poc, Cécile, Catel-Ferreira, Manuella, Gicquel, Gwendoline, Feuilloley, Marc G. J., Lesouhaitier, Olivier, Heipieper, Hermann J., Groleau, Marie-Christine, Déziel, Éric, Cornelis, Pierre, and Chevalier, Sylvie

Published
2018
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7. The Temperature-Regulation of Pseudomonas aeruginosa cmaX-cfrX-cmpX Operon Reveals an Intriguing Molecular Network Involving the Sigma Factors AlgU and SigX

Author

Bouffartigues, Emeline, primary, Si Hadj Mohand, Ishac, additional, Maillot, Olivier, additional, Tortuel, Damien, additional, Omnes, Jordane, additional, David, Audrey, additional, Tahrioui, Ali, additional, Duchesne, Rachel, additional, Azuama, Cecil Onyedikachi, additional, Nusser, Michael, additional, Brenner-Weiss, Gerald, additional, Bazire, Alexis, additional, Connil, Nathalie, additional, Orange, Nicole, additional, Feuilloley, Marc G. J., additional, Lesouhaitier, Olivier, additional, Dufour, Alain, additional, Cornelis, Pierre, additional, and Chevalier, Sylvie, additional

Published
2020
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8. Some elements on detoxification pathway in P. fluorescens under nitrosative stress

Author

Depayras, Ségolène, Thibault, Chautrand, Kondakova, Tatiana, Souak, Djouhar, Duchesne, Rachel, Bouteiller, Mathilde, Hardouin, Julie, Konto-Ghiorghi, Yoan, Maillot, Olivier, Merieau, Annabelle, Feuilloley, Marc, Orange, Nicole, Duclairoir Poc, Cécile, Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), University of Illinois at Urbana-Champaign [Urbana], University of Illinois System, Polymères Biopolymères Surfaces (PBS), Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Université Le Havre Normandie (ULH), and Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, [SDE.IE]Environmental Sciences/Environmental Engineering, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.BC.IC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB], [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.EE.IEO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis
Abstract

International audience

Published
2019

9. Rôles du facteur sigma à fonction extracytoplasmique SigX dans l'adaptation, la formation de biofilm et la réponse à des stress de l'enveloppe chez Pseudomonas aeruginosa

Author

Duchesne, Rachel, Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Normandie Université, Sylvie Chevalier-Laurency, and STAR, ABES

Subjects
P. aeruginosa, Stress de l'enveloppe, Biofilm, ECF sigma factors, Facteurs sigma ECF, SigX, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Cell wall stress, [SDV.BBM.BM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Dir.biologie medecine sante, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology
Abstract

Pseudomonas aeruginosa is a major opportunistic pathogen causing many infectious diseases in immunocompromised patients. Widely studied because of its involvement in lung infections of cysticfibrosis suffering patients, this bacterium is a major public health challenge. P. aeruginosa persistence is largely due to its ability to adopt a multicellular lifestyle called biofilm. P. aeruginosa genome encodes numerous genes predicted to be involved in signal transduction allowing this bacterium to adapt to many environments. Among these systems, the extracytoplasmic function sigma factors, which are transitory subunits of the RNA polymerase, are of major importance for stress resistance and adaptation. SigX is an ECF sigma factor that has been involved in virulence, biofilm formation and in short chain fatty acidsbiosynthesis. This work led to precise the cellular functions of SigX. We have shown that SigX is of major importance for membrane homeostasis, including composition, fluidity and permeability. As a consequence, SigX was shown to be involved in P. aeruginosa metabolism. SigX activity is enhanced in conditions leading to a cell wall stress, as the lack of the major outer membrane porin OprF, high concentrations of sucrose or sublethal concentration of tobramycin, suggesting that this ECF, as AlgU,is a new cell wall stress responsive sigma factor. Remarkably, some alterations could induce biofilm formation, a phenotype involving at least partially SigX. The molecular mechanisms leading to SigX activity should now be deciphered and the role of this ECF in biofilm formation should be precised., Pseudomonas aeruginosa est un pathogène opportuniste de l’Homme responsable de nombreuses infections des voies pulmonaires et urinaires chez des patients immunodéprimés. Largement étudié pour son implication dans la sévérité des symptômes liés à la mucoviscidose, le« bacille pyocyanique » constitue un enjeu majeur en termes de sécurité sanitaire puisqu’il représente après Escherichia coli et Staphylococcus aureus la 3ème cause d’infections nosocomiales en France (INVS, Enquête nationale de prévalence des infections nosocomiales en France, 2012). La persistance de P. aeruginosa notamment dans le cadre médical, est largement due à sa grande capacité à s’adapter et à se développer en communauté organisée au sein de biofilm. Le génome de P. aeruginosa contient de nombreux gènes codant des systèmes de régulation dont la majorité est impliquée dans des mécanismes de perception-transduction de signaux, conférant à la bactérie son fort pouvoir d’adaptation. Parmi ces systèmes, les facteurs sigma à fonction extracytoplasmique (ECF), des sous-unités transitoires de l’ARN polymérase, jouent un rôle fondamental dans la résistance et l’adaptation aux stress. SigX est un facteur sigma ECF, impliqué dans la virulence et la formation de biofilms, ainsi que dans la production des acides gras à courte chaine. Au cours de cette étude, les fonctions cellulaires de SigX ont été précisées, Nous avons montré que SigX joue un rôle important dans la composition, la fluidité et la perméabilité membranaires, et par conséquent dans le métabolisme de la cellule. L’activation de SigX en réponse à des conditions entrainant un stress de l’enveloppe, telles que la perte de la porine majoritaire OprF, la présence d’une concentration de sucrose dans le milieu de culture ou d’une concentration sub-inhibitrice de tobramycine, suggère que cet ECF, comme AlgU, pourrait appartenir à la classe des ECF de type RpoE.De manière remarquable, certaines altérations de l’enveloppe pourraient induire la formation de biofilm, un phénotype impliquant au moins partiellement SigX. Il conviendra à présent de caractériser les mécanismes moléculaires conduisant à l’activation de SigX et de préciser le rôle de ce facteur sigma dans la formation de biofilm.

Published
2017

10. The absence of OprF increased biofilm formation through variation of the c- di-GMP level in Pseudomonas aeruginosa

Author

Bouffartigues, Emeline, Moscoso, Joana, Duchesne, Rachel, Rosay, Thibaut, Fito-Boncompte, Laurène, Gicquel, Gwendoline, Maillot, Olivier, Bénard, Magalie, Bazire, Alexis, Brenner-Weiss, Gerald, Lesouhaitier, Olivier, Lerouge, Patrice, Dufour, Alain, Orange, Nicole, Feuilloley, Marc, Overhage, Joerg, Filloux, Alain, Chevalier, Sylvie, CHEVALIER, Sylvie, Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Department of Life Sciences, Imperial College London, Plate-Forme de Recherche en Imagerie Cellulaire de Haute-Normandie (PRIMACEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines (LBCM), Université de Brest (UBO)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Karlsruhe Institute of Technology (KIT), Laboratoire de Glycobiologie et Matrice Extracellulaire Végétale (Glyco-MEV), Université Le Havre Normandie - Faculté des Affaires Internationales (FAI), Université Le Havre Normandie (ULH), Chercheur indépendant, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-High-tech Research Infrastructures for Life Sciences (HeRacLeS), and Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology
Abstract

International audience; Introduction Pseudomonas aeruginosa is well known to be a human opportunistic pathogen able to adapt to many environmental conditions. The first cellular structure in contact with the environment is the outer membrane. In Pseudomonas genus, OprF is the major outer membrane protein. It is an aspecific porin allowing the diffusion of several types of small polar molecules. OprF is also a pleiotropic protein involved in other numerous cellular functions, as adhesion on biotic or abiotic surfaces, cell wall resistance and virulence of P. aeruginosa. Through a multiphenotypic study, we show here that the lack of OprF increased biofilm formation through modulation of the c-di-GMP level.

Published
2017

11. Cell wall stress response in Pseudomonas aeruginosa: involvement of the ECF sigma factorSigX

Author

Bouffartigues, Emeline, Tortuel, Damien, Duchesne, Rachel, Tahrioui, Ali, Flechard, Maud, Gicquel, Gwendoline, Maillot, Olivier, Lesouhaitier, Olivier, Orange, Nicole, Feuilloley, Marc, Cornelis, Pierre, Chevalier, Sylvie, Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), and Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)

Subjects
[SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

12. The absence of SigX may result in a nutritional stress response in Pseudomonas aeruginosa

Author

Flechard, Maud, Bouffartigues, Emeline, Duchesne, Rachel, Hardouin, Julie, Maillot, Olivier, Orange, Nicole, Feuilloley, Marc, Cornelis, Pierre, Chevalier, Sylvie, Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Chimie Organique et Bioorganique : Réactivité et Analyse (COBRA), Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie Organique Fine (IRCOF), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Le Havre Normandie - Faculté des Affaires Internationales (FAI), Université Le Havre Normandie (ULH), American Society for Microbiology (ASM), and CHEVALIER, Sylvie

Subjects
[SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2015

13. The absence of the Pseudomonas aeruginosa OprF protein leads to increased biofilm formation through variation in c-di-GMP level

Author

Bouffartigues, Emeline, primary, Moscoso, Joana A., additional, Duchesne, Rachel, additional, Rosay, Thibaut, additional, Fito-Boncompte, Laurène, additional, Gicquel, Gwendoline, additional, Maillot, Olivier, additional, Bénard, Magalie, additional, Bazire, Alexis, additional, Brenner-Weiss, Gerald, additional, Lesouhaitier, Olivier, additional, Lerouge, Patrice, additional, Dufour, Alain, additional, Orange, Nicole, additional, Feuilloley, Marc G. J., additional, Overhage, Joerg, additional, Filloux, Alain, additional, and Chevalier, Sylvie, additional

Published
2015
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15. Sucrose favors Pseudomonas aeruginosa pellicle production through the extracytoplasmic function sigma factor SigX.

Author

Bouffartigues, Emeline, Duchesne, Rachel, Bazire, Alexis, Simon, Marjolaine, Maillot, Olivier, Dufour, Alain, Feuilloley, Marc, Orange, Nicole, and Chevalier, Sylvie

Subjects
*GENE expression, *PSEUDOMONAS aeruginosa, *SUCROSE, *BIOFILMS, *OSMOLAR concentration, *CYTOPLASM, *CYCLASES
Abstract

Pseudomonas aeruginosa biofilm formation was increased by addition of sucrose to Luria-Bertani medium, whereas addition of NaCl to a final similar osmolarity and use of maltose instead of sucrose, were ineffective. In a previous study, we showed that the extracytoplasmic sigma factor SigX is activated in the presence of sucrose. The sucrose-mediated pellicle increase was abolished in a sigX mutant strain. Sucrose addition led to an increase in pel expression and cyclic-diguanylate (c-di-GMP) pool level production. Interestingly, these two phenotypes were strongly decreased in a sigX mutant. Since pel is not known as a SigX-target, we suspect SigX to be involved in the c-di-GMP production. We found that expression of the diguanylate cyclase PA4843 gene was increased in the presence of sucrose at least partly through SigX activity. Our study shows that sucrose itself rather than osmolarity favours the biofilm mode of P. aeruginosa through the activation of SigX. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2014
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