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Depuis les années 1990, la France connaît régulièrement des épisodes de mortalités importantes de dauphins, qui entraînent des pics d’échouages sur le littoral Atlantique en hiver. Depuis 2016, les échouages de petits cétacés dans le golfe de Gascogne présentant des traces de capture, atteignent des niveaux inédits. Si les données scientifiques actuelles permettent d’évaluer globalement le risque induit par ces captures accidentelles pour la conservation de la population de dauphins communs, elles sont toutefois trop lacunaires pour comprendre les déterminants écosystémiques et halieutiques à l’origine de ces captures. En concertation avec l’Office français de la biodiversité, les professionnels de la pêche et l’Etat, La Rochelle Université-CNRS et l’Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer (Ifremer) ont construit le projet Delmoges (Delphinus Mouvements Gestion). Il vise, dans un premier temps, à combler ces lacunes en allant chercher des nouvelles données sur les habitats des dauphins, sur leurs interactions trophiques dans l’écosystème et leurs interactions techniques avec les engins de pêche. Ensuite, le projet propose d’intégrer les connaissances sur l’ensemble du socioécosystème pour envisager une diversité de scénarios de diminution des captures accidentelles incluant des solutions technologiques et, enfin, d’en évaluer les conséquences biologiques et socioéconomiques. Le livrable L311 est produit dans le contexte du « WP3 – Interactions spatio-temporelles et techniques dans les engins de pêche ». Il vise à proposer une description des activités de pêche et une typologie des flottilles opérant dans le golfe de Gascogne. La première partie présente un ensemble de chiffres et indicateurs clés de l’activité de pêche professionnelle observée dans le golfe de Gascogne en 2022 ainsi que les tendances observées sur la période 2012-2022. Ces éléments contextualisent l’analyse typologique présentée par la suite qui caractérise les stratégies (à l ‘

WGWIDE reports on the status and considerations for management of the Northeast Atlantic mackerel, blue whiting, Western and North Sea horse mackerel, Northeast Atlantic boarfish, Norwegian spring-spawning herring, striped red mullet (subareas 6, 8, and divisions 7.a–c, e–k and 9.a), and red gurnard (subareas 3, 4, 5, 6, 7, and 8) stocks. 2024 catch advice was drafted for all eight stocks. Benchmark assessments are proposed for 2025 for mackerel, herring, and striped red mullet while both horse mackerel stocks and boarfish are scheduled to be benchmarked in 2024. Northeast Atlantic mackerel. This migratory stock is widely distributed throughout the Northeast Atlantic with significant fisheries in several ICES subareas. The assessment conducted in 2023 is an update assessment, based on the configuration agreed during the 2019 interbenchmark and incorporates updates to the commercial catch, tagging, swept-area, egg survey, and recruitment index dataseries. Advice is given based on stock reference points which were updated during a management strategy evaluation carried out in 2020. SSB has been declining since 2014 but is above MSY Btrigger in 2023. Fishing mortality has been increasing since 2016 and above FMSY since 2021. Blue whiting. This pelagic gadoid is widely distributed in the eastern part of the North Atlantic. The current assessment configuration (interbenchmark in 2016) uses preliminary catch and sampling data along with the acoustic survey data from the current year. The 2023 update assessment indicates that SSB is increasing following strong recent recruitment and is well above MSY Btrigger. Fishing mortality has been above FMSY since 2014. Norwegian spring-spawning herring. This stock is migratory, spawning along the Norwegian coast and feeding throughout much of the Norwegian Sea. The 2023 update assessment is based on an implementation of the XSAM assessment mode

This protocol was established for the evaluation of sexual maturity for exploited stock species, using quantitative histology (stereology). This document describes the reading method used on histological slides under the cross-platform QuPath. This document follows the work of different workshops that aimed to improve the compilation of data on sexual maturity. The WKMATCH (WorKshop for MATurity staging CHairs, 2012) and the WKASMSF (Workshop for Advancing Sexual Maturity Staging in Fish, 2018) defined a universal evaluation grid for sexual maturity staging of different species, including teleosteans. During the WKMATCH workshop, two main recommendations were made, underlining the need to improve and complete knowledge on sexual maturity, as well as to harmonize the practices used to determine these sexual phases. Another workshop, the WKMATHIS (WorKshop on sexual MATurity staging from HIStological tools) that took place in Caen in 2017, added new objectives : review the current knowledge on gonad histology, determine a sexual maturity scale at a cellular level, and histological studies should be made in order to improve the determination of sexual maturity on a macroscopic scale. This protocol, drawn from these workshops and their conclusions, offers guidelines on how to read histological slides through the use of stereology. As of June 2022, this protocol is linked to the MATO (MATurité Objectif des poissons par l’histologie quantitative) project, a study restricted to female gonad and the different cellular structures found inside the ovaries for different species (Pleuronectes platessa, Lepidorhombus whiffiagonis, Lepidorhombus boscii, Mullus surmuletus and Micromesistius poutassou). This protocol will present reading methods that favor an objective reading of histological slides, through stereology, and will allow less experienced readers to partake in this exercise. For a detailed description of the germinal cells, refe

Ce protocole a été réalisé dans le cadre du projet de standardisation des méthodes de lecture visuelle de la maturité sexuelle des poissons d'intérêts commerciaux (SIH IFREMER). Au cours de ce projet de 2021 à 2023, différents outils d’aide à l’identification de la maturité visuelle des poissons ont été mis en place : un répertoire de données de photographie de gonades de poissons marins (Photo_MATURITY), un protocole de photographie des gonades de poissons, des fiches d’identification de la maturité sexuelle des poissons d'intérêts commerciaux (INDEX.knit (lm-anna.github.io) ainsi que les outils de génération automatique des fiches d’identification (GitHub : MaturityScaleTools). Ces outils standardisent et apportent un soutien à la lecture visuelle de la maturité sexuelle des espèces présentes en Manche, en Mer du Nord, au niveau de la façade maritime française de la mer Méditerranée et de l’océan Atlantique, mais également présentes au niveau du littoral Guadeloupéen et Martiniquais. Ce protocole a été mis en place afin de pérenniser ces travaux. Il regroupe l’ensemble des méthodes de mise à jour des différents outils mis en place au cours de ce projet.

The following paper gives a detailed description of the oogenesis cycle for the European Plaice (Pleuronectes platessa), from oogonia to post-ovulatory follicle, including ovarian follicle and zona pellucida sizes. Noteworthy particularities were the difficulty in identifying cortical alveoli due to their very small size. Quantitative histology (stereology) on histological slides was used to determine a first size at maturity for females from the English Channel, which was found to be smaller compared to the literature (19 cm). Stereology also determined a first spawning event starting in January, with a peak in February and ongoing until March. Moreover, the use of stereology showed misclassifications for individuals categorized into a maturity phase using a macroscopic visual method. Misclassifications were found with individuals that had spawned (D) but were put under the immature (A) phase, and individuals in development (B) classified under D.

This protocol was set up under the MATO project (MATurité Objective des poissons par histologie quantitative), as part of Carine Sauger’s PhD. The MATO project, financed by IFREMER (Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer), aims at improving the evaluation of sexual maturity stages of exploited stock species using histology paired with a stereology reading process. The present document gathers protocols used in the study of marine female fish gonads as well as the study of the different cellular structures found in ovaries at the Port-en-Bessin IFREMER laboratory. Materials used here are not always the most optimal but favor a manual approach. Most of the histological methods found in this protocol are based on methods described by Gabe, or were modified so as to answer our queries from a fisheries point of view, from the collection of fresh samples to the staining and mounting of histological slides, including inclusion in paraffin., Ce recueil de protocoles a été mis en place dans le cadre du projet MATO (MATurité Objective des poisons par histologie quantitative) et dans le cadre de la thèse de Carine Sauger. Le projet MATO financé par l’IFREMER (Institut Français de Recherche pour l’Exploitation de la Mer) a pour but d’améliorer la détermination de la maturité sexuelle chez certaines espèces en utilisant l’histologie couplé à la stéréologie. Ce présent document recueille les protocoles utilisés à la station IFREMER de Port-en-bessin pour l’étude de gonades femelles de poissons marins et des différentes structures cellulaires retrouvées dans les ovaires. Les protocoles présents détaillent les méthodes utilisées, de la récolte de l’échantillon frais jusqu’au montage de la lame histologique et sa coloration, en passant par l’inclusion dans la paraffine. Il a été mis en place de façon à favoriser une approche manuelle des méthodes d’histologie.

Ce rapport décrit l’évolution de l’effort de pêche et des captures des flottilles de pêche opérant dans le golfe de Gascogne, entre 2010 et 2023. Cette description s’insère dans le contexte de l’augmentation du nombre d’échouages dans le golfe de Gascogne. Les analyses se concentreront donc sur les périodes hivernales. Ce rapport prolonge les analyses proposées dans la réponse à la saisine émise en 2022 sur le même sujet (Demaneche et al. , 2022).

un 1er rapport présente les résultats de l’expertise conduite par Pelagis et Ifremer concernant les points 2.a et 2.b de la saisine. La première partie traite donc des estimations du risque de captures accidentelles pour les chaluts pélagiques et la deuxième partie présente les résultats préliminaires pour les fileyeurs. - un deuxième vise à réaliser une analyse descriptive des données ObsMer collectées lors des hivers 2018-2019, 2019-2020, 2020-2021, 2021-2022 & 2022-2023 sur les flottilles concernées par les captures accidentelles de mammifères marins. Après un bref rappel sur les biais inhérents au programme ObsMer, ce chapitre présente les taux d’observation et les nombres de captures accidentelles de Delphinus delphis par engin, métier, flottille et sous-flottille. Les données utilisées pour cette seconde partie sont principalement issues des campagnes de sur-échantillonnage ObsMer dédiées aux captures accidentelles mais peuvent également provenir de l’échantillonnage ObsMer classique - un 3ème rapport répond à la seconde partie du point 2.c de la saisine. Il vise à évaluer l’apport du sur-échantillonnage ObsMer sur l’estimation des captures accidentelles de petits cétacés dans le golfe de Gascogne et à discuter l’intérêt de poursuivre cette collecte de manière pérenne.

Depuis les années 1990, la France connaît régulièrement des épisodes de mortalités importantes de dauphins, qui entraînent des pics d’échouages sur le littoral Atlantique en hiver. Depuis 2016, les échouages de petits cétacés dans le golfe de Gascogne présentant des traces de capture, atteignent des niveaux inédits. Si les données scientifiques actuelles permettent d’évaluer globalement le risque induit par ces captures accidentelles pour la conservation de la population de dauphins communs, elles sont toutefois trop lacunaires pour comprendre les déterminants écosystémiques et halieutiques à l’origine de ces captures. La Rochelle Université-CNRS et l’Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer (Ifremer) ont construit en concertation avec l’Office Français de la Biodiversité (OFB), les professionnels de la pêche et l’État, le projet Delmoges (Delphinus Mouvements Gestion). Il vise, dans un premier temps, à combler ces lacunes en allant chercher des nouvelles données sur les habitats des dauphins, sur leurs interactions trophiques dans l’écosystème et leurs interactions techniques avec les engins de pêche. Ensuite, le projet propose d’intégrer les connaissances sur l’ensemble du socio-écosystème pour envisager une diversité de scénarios de diminution des captures accidentelles incluant des solutions technologiques et, enfin, d’en évaluer les conséquences biologiques et socio-économiques. Ce rapport présente les différents aspects du projet et leurs avancées entre le 15 décembre 2022 et le 31 décembre 2023. On y retrouve les aspects scientifiques développés dans chacun des WPs, les comptes-rendus des réunions de COPILs et des comités de gouvernance, ainsi que le bilan des communications.

L’Unité de recherche HMMN, créée en 2005, appartient depuis 2011 au Département Ressources Biologiques et Environnement (RBE), qui est l’un des 4 Département scientifiques de l’IFREMER, avec les Départements Océanographie et Dynamique des Ecosystèmes (ODE), Recherches physiques et Ecosystèmes de fond de Mer (REM) et Infrastructures de Recherche et Systèmes d’Information (IRSI). L’Unité de recherche HMMN est constituée de deux laboratoires, l’un situé à Boulogne sur mer dans les Hauts de France (LRHBL) et l’autre à Port-en-Bessin en Normandie (LRHPB). Ces deux laboratoires, ainsi que les autres laboratoires des Départements ODE et REM localisés à Boulogne s/mer et Port-en-Bessin (ODE: deux Laboratoires Environnement Ressources, LERBL et LERN; REM: un Laboratoire Comportement des Structures en Mer, LCSM), sont rattachés administrativement au Centre de Manche – Mer du Nord (CMMN) de l’IFREMER. L’équipe HMMN effectue des recherches en écologie marine et halieutique, principalement centrées sur les écosystèmes de Manche et Sud mer du Nord. Ces recherches trouvent un prolongement dans l’appui aux politiques publiques concernant la conservation des écosystèmes marins et l’aménagement des pêcheries et d’autres usages du domaines maritime (e.g., extraction de sables et granulats marins, production d’énergies marines renouvelables), dans un contexte de changement climatique. L’unité HMMN contribue à la collecte de données halieutiques et écosystémiques en mer, par enquêtes, et en laboratoire, et centralise à travers la cellule CREDO, le traitement et l’envoi des données halieutiques requises par une variété d’organismes scientifiques, gestionnaires, professionnels et non gouvernementaux. HMMN coordonne trois campagnes en mer à grande échelle régionale et héberge trois infrastructures technologiques: un Pôle National de Sclérochronologie (PNS), une Plateforme Réseaux Trophiques (PRT), et un Pôle de Taxinomie et d’Ecologie du Zooplancton (PTEZOO). En cherchant à mieux comprendr

Marine megafauna plays an important functional role in marine ecosystems as top predators but are threatened by a wide range of anthropogenic activities. Bycatch, the incidental capture of non-targeted species in commercial and recreational fisheries, is of particular concern for small cetacean species, such as dolphins and porpoises. In the North-East Atlantic, common dolphin (Delphinus delphis, Linné 1758) bycatch has been increasing and associated with large numbers of animals stranding during winter on the French Atlantic seashore since at least 2017. However, uncertainties around the true magnitude of common dolphin bycatch and the fisheries involved have led to delays in the implementation of mitigation measures. Current data collection on dolphin bycatch in France is with non-dedicated observers deployed on vessels for the purpose of national fisheries sampling programmes. These data cannot be assumed representative of the whole fisheries' bycatch events. This feature makes it difficult to use classic ratio estimators since they require a truly randomised sample of the fishery by dedicated observers. We applied a newly developed approach, regularised multilevel regression with post-stratification, to estimate total bycatch from unrepresentative samples and total fishing effort. The latter is needed for post-stratification and the former is analysed in a Bayesian framework with multilevel regression to regularise and better predict bycatch risk. We estimated the number of bycaught dolphins for each week and 10 International Council for the Exploration of the Sea (ICES) divisions from 2004 to 2020 by estimating jointly bycatch risk, haul duration, and the number of hauls per days at sea (DaS). Bycatch risk in pair trawlers flying the French flag was the highest in winter 2017 and 2019 and was associated with the longest haul durations. ICES divisions 8.a and 8.b (shelf part of the Bay of Biscay) were estimated to have the highest common dolphin bycatch. Our res

Depuis les années 1990, la France connaît régulièrement des épisodes de mortalités importantes de dauphins, qui entraînent des pics d’échouages sur le littoral Atlantique en hiver. Depuis 2016, les échouages de petits cétacés dans le golfe de Gascogne présentant des traces de capture, atteignent des niveaux inédits. Si les données scientifiques actuelles permettent d’évaluer globalement le risque induit par ces captures accidentelles pour la conservation de la population de dauphins communs, elles sont toutefois trop lacunaires pour comprendre les déterminants écosystémiques et halieutiques à l’origine de ces captures. La Rochelle Université-CNRS et l’Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer (Ifremer) ont construit en concertation avec l’Office Français de la Biodiversité (OFB), les professionnels de la pêche et l’État, le projet Delmoges (Delphinus Mouvements Gestion). Il vise, dans un premier temps, à combler ces lacunes en allant chercher des nouvelles données sur les habitats des dauphins, sur leurs interactions trophiques dans l’écosystème et leurs interactions techniques avec les engins de pêche. Ensuite, le projet propose d’intégrer les connaissances sur l’ensemble du socio-écosystème pour envisager une diversité de scénarios de diminution des captures accidentelles incluant des solutions technologiques et, enfin, d’en évaluer les conséquences biologiques et socio-économiques. Ce rapport présente les différents aspects du projet et leurs avancées depuis son lancement au 1er mars 2022. On y retrouve les aspects scientifiques développés dans chacun des WPs, le bilan annuel des communications, les comptes-rendus des réunions de COPILs et des comités de gouvernance.

WGWIDE reports on the status and considerations for management of the Northeast Atlantic mackerel, blue whiting, Western and North Sea horse mackerel, Northeast Atlantic boarfish, Norwegian spring-spawning herring, striped red mullet (Subareas 6, 8 and Divisions 7.a-c, e-k and 9.a), and red gurnard (Subareas 3, 4, 5, 6, 7, and 8) stocks. 2023 catch advice was drafted for mackerel, Western horse mackerel, blue whiting and herring. For the remainder, multi-annual catch advice was previously published. Benchmark assessments are proposed for 2024 for mackerel, both horse mackerel stocks, herring and striped red mullet with boarfish is scheduled to be benchmarked in 2023. Prior to any benchmark assessment for mackerel, WGWIDE recommends that a workshop to review the latest knowledge with regard to the stock component structure takes place. Northeast Atlantic Mackerel. This migratory stock is widely distributed throughout the Northeast Atlantic with significant fisheries in several ICES subareas. The assessment conducted in 2022 is an update assessment, based on the configuration agreed during the 2019 interbenchmark and incorporates updates to the commercial catch, tagging, swept area and egg survey (preliminary) data series. No recruitment index is available for the 2021 year-class as survey coverage was inadequate. Advice is given based on stock reference points which were updated during a management strategy evaluation carried out in 2020. Following a decline since 2014, SSB has been stable (above MSY Btrigger) since 2019. Fishing mortality has been increasing since 2016 and is above FMSY since 2020. Blue Whiting. This pelagic gadoid is widely distributed in the eastern part of the North Atlantic. The current assessment configuration (inter-benchmark in 2016) uses preliminary catch and sampling data along with the acoustic survey data from the current year. The 2022 update assessment indicates that SSB is increasing following strong recent r

This study evaluates the relationship between both commercial and scientific spatial fisheries data and a new satellite-based estimate of potential fish production (Ocean Productivity available to Fish, OPFish) in the European Seas. To construct OPFish, we used productivity frontal features derived from chlorophyll-a horizontal gradients, which characterize 10%–20% of the global phytoplankton production that effectively fuels higher trophic levels. OPFish is relatively consistent with the spatial distribution of both pelagic and demersal fish landings and catches per unit of effort (LPUEs and CPUEs, respectively). An index of harvest relative to ocean productivity (HP index) is calculated by dividing these LPUEs or CPUEs with OPFish. The HP index reflects the intensity of fishing by gear type with regard to local fish production. Low HP levels indicate lower LPUEs or CPUEs than expected from oceanic production, suggesting over-exploitation, while high HP levels imply more sustainable fishing. HP allows comparing the production-dependent suitability of local fishing intensities. Our results from bottom trawl data highlight that over-exploitation of demersal species from the shelves is twice as high in the Mediterranean Sea than in the North-East Atlantic. The estimate of HP index by dominant pelagic and demersal gears suggests that midwater and bottom otter trawls are associated with the lowest and highest overfishing, respectively. The contrasts of fishing intensity at local scales captured by the HP index suggest that accounting for the local potential fish production can promote fisheries sustainability in the context of ecosystem-based fisheries management as required by international marine policies.

Les travaux engagés dans le cadre du projet NourSeine (FEAMP-FFP 2017-2020) ne montrent pas d’évolution notable des communautés de juvéniles de la baie de Seine pour la période de suivi. Comme identifié dans la littérature, les populations de juvéniles sont structurées selon un gradient côte-large, en lien avec la salinité et la profondeur. L’utilisation des outils de géostatistique permettent de bien représenter la répartition des espèces dans l’estuaire et leurs interactions. Une réduction du taux de croissance journalier moyen de la plie (Pleuronectes platessa) est identifiée dans la période récente (2011-2017), sans que les causes en soient explicitées. Les liens entre l’efficacité de la fonction de nourricerie et cet indicateur de la condition des juvéniles restent à explorer.

The main objective of the Working Group on Biological Parameters (WGBIOP) is to review the status, issues, developments, and quality assurance of biological parameters used in assessment and management. WGBIOP (1) plans workshops, exchanges, and validation studies on a range of biological variables to review the quality of information supplied for stock assessment and improve quality assurance and training; (2) investigates data availability and develops documentation and methods to improve communication between data collectors and end-users; (3) delivers new and improved functionality for the SmartDots platform. Four otolith exchanges and two workshops were completed in 2020–2021 using SmartDots—eight further exchanges are ongoing. Proposed future exchanges and workshops were reviewed and approved. The development of the SmartDots platform proceeded with the inclusion of the maturity, eggs, atresia, fecundity, and larval identification modules into the software version. A live SmartDots tutorial for event coordinators was conducted. Work to further develop quality assurance guidelines—and review national applications of these—progressed. Age and maturity validation studies were reviewed and a new method for prioritizing future validation work was proposed. Progress with the Stock Identification Database (SID) was reviewed, and the potential for creating a WGBIOP library collection and active involvement of WGBIOP in updating FishBase.org data were evaluated. The importance of identifying and documenting links between all relevant databases and document repositories was identified, and a task to address this was initiated. Work on improving the feedback loop between data collectors and stock assessors on the usage and quality of biological parameters in stock assessment continued. Moving forward, WGBIOP aims to continue collaboration with WGALES and WGSMART on the development of the SmartDots platform, encouraging cross-group sharing of sk

This study evaluates the relationship between both commercial and scientific spatial fisheries data and a new satellite-based estimate of potential fish production (Ocean Productivity available to Fish, OPFish) in the European Seas. To construct OPFish, we used productivity frontal features derived from chlorophyll-a horizontal gradients, which characterize 10%–20% of the global phytoplankton production that effectively fuels higher trophic levels. OPFish is relatively consistent with the spatial distribution of both pelagic and demersal fish landings and catches per unit of effort (LPUEs and CPUEs, respectively). An index of harvest relative to ocean productivity (HP index) is calculated by dividing these LPUEs or CPUEs with OPFish. The HP index reflects the intensity of fishing by gear type with regard to local fish production. Low HP levels indicate lower LPUEs or CPUEs than expected from oceanic production, suggesting over-exploitation, while high HP levels imply more sustainable fishing. HP allows comparing the production-dependent suitability of local fishing intensities. Our results from bottom trawl data highlight that over-exploitation of demersal species from the shelves is twice as high in the Mediterranean Sea than in the North-East Atlantic. The estimate of HP index by dominant pelagic and demersal gears suggests that midwater and bottom otter trawls are associated with the lowest and highest overfishing, respectively. The contrasts of fishing intensity at local scales captured by the HP index suggest that accounting for the local potential fish production can promote fisheries sustainability in the context of ecosystem-based fisheries management as required by international marine policies.