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Submitted by Maria Aparecida (cidazen@gmail.com) on 2023-01-16T19:41:57Z No. of bitstreams: 1 TAIZA PIMENTEL SANTOSvec.pdf: 25734140 bytes, checksum: 553d8e89170b6985c238ffe6be871fbb (MD5) Made available in DSpace on 2023-01-16T19:41:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TAIZA PIMENTEL SANTOSvec.pdf: 25734140 bytes, checksum: 553d8e89170b6985c238ffe6be871fbb (MD5) Previous issue date: 2022-12-20 FAPEMA Studies of zooplankton distribution patterns and diversity associated with environmental environmental heterogeneity are important for understanding the basic structure and function of coastal ecosystems. The study emphasized the importance of environmental filters in the dynamics microzooplankton community and the ecological relationships established with phytoplankton in three zones in the tropical mesomare estuary. The microzooplankton recorded a total of 89 species, belonging to 14 phyla, with Arthropoda being the most representative (72.21%), followed by the Ciliphora and Mollusca. The class Copepoda stands out, with the species Paracalanus crassiostris, Pseudodiaptomus gracilis and Oithona nana dominating the the community. From the total, 21 species were selected as indicators, highlighting Temora turbinata in the coastal zone (CZ), Rhizodomus tagatzi in the mixing zone (MZ) and Bosminopsis deitersi in the river zone (ZR). The environmental heterogeneity showed significant spatial differences, with variations governed mainly by the gradient of salinity temperature and pH, which acted as the main environmental filters. The species species of ZC and ZM showed direct ecological relationships with the diatom blooms Skeletonema costatum and Asterionellopsis glacialis, which favored the abundance of microzooplankton was favored by their occurrence, denoting a top-down control of the trophic web. trophic network. When the partitioning of beta diversity, the turnover component was responsible for the high diversity, due to the environmental heterogeneity, which distinguished communities between zones. The MZ acted as a dispersive center, with 58% of its species migrating between all zones, thus defining it as an area that requires greater protection of biodiversity. Estudos dos padrões de distribuição e diversidade do zooplâncton associados heterogeneidade ambiental são importantes para entender a estrutura básica e a função dos ecossistemas costeiros. O estudo enfatizou a importância dos filtros ambientais na dinâmica das comunidade microzooplanctônica e as relações ecologicas estabelecidas com o fitoplâncton em três zonas no estuário tropical de mesomarés. O microzooplâncton registrou um total de 89 espécies, inseridas em 14 Filos, sendo o Arthropoda o mais representativo (72,21%), seguido dos Ciliphora e Mollusca. A classe Copepoda se destaca, com as espécies Paracalanus crassiostris, Pseudodiaptomus gracilis e Oithona nana dominando a comunidade. Do total, 21 espécies foram selecionadas como indicadoras, destacando-se Temora turbinata na zona costeira (ZC), Rhizodomus tagatzi na zona de mistura (ZM) e Bosminopsis deitersi na zona de rio (ZR). A heterogeneidade ambiental apresentou diferenças espaciais significativas, com variações regidas principalmente pelo gradiente de salinidade, temperatura e pH, que atuaram como os principais filtros ambientais. As espécies de ZC e ZM demonstraram relações ecológicas diretas com as florações das diatomáceas Skeletonema costatum e Asterionellopsis glacialis, o qual a abundância do microzooplâncton foi favorecida pela ocorrência das mesmas, denotando um controle de cima para baixo da rede trófica. Quando ao particionamento da diversidade beta, o componente de rotatividade foi responsável pela alta diversidade, devido à heterogeneidade ambiental, a qual distinguiu as comunidades entre as zonas. A ZM atuou como um centro dispersor, com 58% de suas espécies migrando entre todas as zonas, definindo-a, assim, como uma área que demanda maior proteção da biodiversidade.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Anthropogenic actions within watershed can cause impacts that alter ecosystem functions and negatively impact biodiversity. The beta diversity is useful for analyzing the effects of impacts between communities. The studies presented here were carried out in a watershed with high occupation by agriculture in the Cerrado biome and investigated the effects of land uses on the beta diversity of aquatic macroinvertebrates. In the first study, patterns of turnover and nestedness between tributary streams and reservoir were analyzed. Considering the direct influences of land uses on the community structure of the streams, the hypothesis was tested that the turnover and nestedness of communities in the reservoir would respond directly to the changes that occurred in the streams communities. The second study we analyzed the functional beta diversity with the action of the environmental filters of the watershed. Considering that land uses work as filters that select functional traits, it was asked which traits would relate to different land uses. Ten points were sampled, between streams and the reservoir and in the rainy and dry periods. The environmental variables of water were analyzed, determining the percentages of land use in the entire watershed and in the surroundings of each point. Most macroinvertebrates were identified down to the family level and family Chironomidae down to the genus level, and six categories of functional traits were used. The results of the frist study showed that the patterns that occurred in the streams did not directly influence the communities in the reservoir. Land uses and pollution prevented dispersal. The results of the second study indicated that only the body length trait was positively correlated with perennial agriculture and wetlands. However, there was a predominance in the community composition of a resilient trait and a seasonal increase in genera considered to be tolerant. The studies here demonstrated the considerable level of environmental degradation and impacts on the biodiversity of the watershed. As ações antrópicas dentro das bacias hidrográficas podem causar impactos que alteram as funções ecossistêmicas e impactar negativamente a biodiversidade. A diversidade beta é útil para analisar os efeitos de impactos entre comunidades. Os estudos apresentados aqui foram feitos em uma microbacia com alta ocupação pela agricultura no bioma Cerrado e foram investigados os efeitos dos usos da terra na diversidade beta dos macroinvertebrados aquáticos. No primeiro estudo foram analisados os padrões de substituição e aninhamento dos táxons entre córregos tributários e reservatório. Considerando-se as influências diretas dos usos da terra na estrutura comunitária dos córregos, foi testada a hipótese de que a substituição e aninhamento das comunidades no reservatório responderiam diretamente às modificações que ocorreram nas comunidades dos córregos. O segundo estudo analisou a diversidade beta funcional com a ação dos filtros ambientais da microbacia. Considerando que os usos da terra funcionam como filtros que selecionam os traços funcionais, foi perguntado quais traços se relacionariam com diferentes usos da terra. Foram amostrados dez pontos, entre córregos e o reservatório e nos períodos chuvoso e seco. Foram analisadas as variáveis ambientais da água, determinadas as porcentagens de uso da terra em toda microbacia e no entorno de cada ponto. A maioria dos macroinvertebrados foram identificados até o nível de família e família Chironomidae até nível de gênero e foram utilizadas seis categorias de traços funcionais. Os resultados do primeiro estudo mostraram que os padrões que ocorreram nos córregos não influenciaram diretamente nas comunidades do reservatório. Os usos da terra e poluição impediram a dispersão. Os resultados do segundo estudo indicaram que somente o traço de comprimento do corpo esteve positivamente correlacionado com agricultura perene e áreas alagadas. No entanto, houve a predominância na composição comunitária de um traço resiliente e aumento sazonal de gêneros considerados tolerantes. Os estudos aqui demonstraram o considerável nível de degradação ambiental e impactos para a biodiversidade da microbacia. 88881.426418/2019-01

Submitted by Maria Aparecida (cidazen@gmail.com) on 2022-11-07T18:14:37Z No. of bitstreams: 1 Quedyane Cruz.pdf: 26644555 bytes, checksum: adce98a51bbcb352ea19979c2adbe4e9 (MD5) Made available in DSpace on 2022-11-07T18:14:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Quedyane Cruz.pdf: 26644555 bytes, checksum: adce98a51bbcb352ea19979c2adbe4e9 (MD5) Previous issue date: 2022-10-11 FAPEMA Beta diversity and functional traits of indicator phytoplankton associated with environmental heterogeneity were studied as descriptors of environmental quality along a tropical sea- river ecosystem. The results showed significant spatial differences in environmental heterogeneity, contributing to biological heterogeneity. Sporadic and recurrent blooms were associated with spatio-temporal variations of the environmental conditions, resulting in a reduction in alpha diversity in the estuarine sector (ES). Beta diversity was related to variations in salinity, pH, turbidity, temperature, dissolved inorganic nitrogen (DIN), and orthophosphate, which acted as environmental filters. Colonial, bloom-forming, harmful and small-size taxa demonstrated relations to silicate concentrations, suspended particulate matter and salinity. Unicellular and larger species showed correlations with higher photic zone depths, orthophosphate concentrations, dissolved oxygen and DIN. This study demonstrated that a possible decrease in beta diversity could cause homogenization of the community, indicating a possible reduction in environmental quality. Integrating information on the functional characteristics of phytoplankton into diversity studies made it possible to observe in greater detail the influence of environmental filters, favoring the identification of species and priority sites for biodiversity monitoring. A diversidade beta e as características morfofuncionais do fitoplâncton indicador associadas a heterogeneidade ambiental foram estudas como descritoras da qualidade ambiental em um ecossistema mar-rio tropical. Os resultados mostraram que a heterogeneidade ambiental foi marcada por diferenças espaciais significativas, contribuindo para a heterogeneidade biológica. Florações esporádicas e recorrentes estiveram associadas às variações espaço-temporais das condições ambientais, refletindo em uma redução da diversidade alfa no setor estuarino (SE). A diversidade beta apresentou relação com variações de salinidade, pH, turbidez, temperatura, nitrogênio inorgânico dissolvido (NID) e ortofosfato, que atuaram como filtros ambientais. Os táxons coloniais, com capacidade de formar florações, potencialmente tóxicos e de menor tamanho foram relacionados às concentrações de silicato, material particulado em suspensão e salinidade. As espécies solitárias e de maior tamanho foram relacionadas a maior profundidade da zona fótica e elevadas concentrações de ortofosfato, oxigênio dissolvido e NID. O estudo evidenciou que uma possível diminuição da diversidade beta pode fazer com que ocorra a homogeneização da comunidade, indicando possível redução da qualidade ambiental. Integrar informações sobre as características funcionais do fitoplâncton aos estudos sobre diversidade possibilitou observar com mais detalhes a influência dos filtros ambientais, favorecendo a identificação de espécies e locais prioritários para o monitoramento da biodiversidade.

A compreensão sobre a importância da dispersão de organismos planctônicas na variação da estrutura das comunidades tem sido um dos principais objetivos dos estudos ecológicos nos trechos afetados por reservatórios. Em rios que apresentam uma cascata de reservatórios, a diversidade dos organismos planctônicos situados no eixo central de um reservatório pode ser influenciada tanto pelos tributários que desaguam neste reservatório quanto pelos reservatórios à montante. Assim, este trabalho teve o objetivo principal de analisar a estrutura da comunidade zooplanctônica ao longo de uma cascata de reservatórios no rio Tocantins e verificar a importância dos tributários e reservatório à montante na composição e abundância das espécies. Analisamos a riqueza e a abundância da comunidade zooplanctônica em um trecho do rio Tocantins composto por três reservatórios construídos em cascata: UHEs Cana Brava, São Salvador e Peixe Angical. A amostragem foi realizada em 20 pontos de coleta em diferentes períodos sazonais. Realizamos uma análise de diversidade beta entre os tributários e o eixo central dos reservatórios, entre os pontos situados somente no eixo central dos três reservatórios e entre os tributários, para verificar a similaridade na estrutura das comunidades entre as diferentes regiões. A maior diversidade beta, ou seja, menor similaridade na estrutura das comunidades zooplanctônicas, foi obtida entre os pontos situados nos tributários e no eixo central de cada um dos reservatórios estudados, no período de chuva, demonstrando a influência da sazonalidade. Os fatores abióticos também foram distintos quando comparamos os períodos de seca e chuva, principalmente nos tributários. Os menores valores de diversidade beta foram mensurados comparando o eixo central dos reservatórios, principalmente para os rotíferos e microcrustáceos. Esse resultado demonstra a importância da dispersão longitudinal desses grupos entre os reservatórios em cascata. Além disso, tendo em vista a baixa riqueza de táxons exclusivos no interior dos reservatórios, podemos inferir que a dispersão de táxons dos tributários para o eixo central é importante, e que, posteriormente o tamanho populacional de algumas espécies será favorecido nas condições lênticas dos reservatórios, alterando a estrutura das comunidades. Esse estudo contribui para uma melhor compreensão sobre os fatores determinantes da diversidade de espécies zooplanctônicas em reservatórios, considerando o componente abiótico, a importância da dispersão longitudinal e lateral (tributários) dos diferentes grupos zooplanctônicos e o componente sazonal. Understanding the importance of the dispersion of planktonic organisms in the structure of communities has been one of the main goals of ecological studies in the stretches of rivers affected by the construction of reservoirs. Along a cascade of reservoir, the diversity of planktonic organisms located in the central body of a reservoir can be influenced both by the tributaries that flow into this reservoir and by the reservoirs upstream. In this way, the main goal of this study was to analyze the structure of the zooplankton community along a cascade of reservoirs in the Tocantins River and verifying the importance of tributaries and upstream reservoirs in the composition and abundance of species. We analyzed the richness and abundance of the zooplankton community in a stretch of the Tocantins River composed of three reservoirs built in cascade: HPP Cana Brava, São Salvador and Peixe Angical. The study was carried out at 20 sampling points in different seasonal periods. We performed a beta diversity analysis between the tributaries and the central body of the reservoirs, between the points located only on the central body of the three reservoirs and between the tributaries, to verify the similarity in the structure of the communities between the different regions. The highest beta diversity, in other words, the lowest similarity in the structure of zooplanktonic communities, was obtained between the sampling points located in the tributaries and in the central body of each of the studied reservoirs, mainly the rainy season, demonstrating the influence of seasonality. The abiotic factors were also different when comparing the dry and rainy periods, especially in the tributaries. The lowest values of beta diversity were measured comparing the central body of the reservoirs, mainly for rotifers and microcrustaceans. This result demonstrates the importance of the longitudinal dispersion of these groups among the reservoirs. Besides, considering the low richness of exclusive taxa inside the reservoirs (in the central body), we can infer that the dispersion of taxa from the tributaries to the central body is important, and the population size of some species will be favored under the lentic conditions of the reservoirs, changing the structure of communities. This study contributes to a better understanding of the factors responsible for the diversity of zooplanktonic community in reservoirs, considering the abiotic component, the importance of longitudinal and lateral (tributary) dispersion of the different zooplanktonic groups and the seasonal component. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

Modelos de distribuição de espécies são constituídos principalmente de dados ambientais (em sua maioria climáticos) e de distribuição das espécies para predizer a distribuição potencial das espécies. Neste sentido, a dispersão das espécies (i.e., movimento) é por muitas vezes ignorada nas predições. Em ambientes aquáticos, a dispersão não é restrita somente às barreiras físicas, mas também se dá pelo movimento direcional das espécies através da malha hidrográfica, que por sua vez pode ser incluída nos modelos por meio de preditores espaciais. Neste trabalho, nós buscamos avaliar o efeito da inclusão de preditores de dispersão assimétrica na distribuição geográfica potencial de um peixe de água doce da bacia Tocantins-Araguaia, Brasil. Além disso, nós estimamos se as predições usando preditores climáticos e de dispersão assimétrica variam dependendo da distribuição e amplitude de múltiplas espécies, e dependendo da inclusão de hidrelétricas como barreiras de dispersão nas predições. Para isso, nós geramos modelos usando sete conjunto de variáveis representando modelos climáticos e de dispersão, assim como suas interações. As métricas de avaliação dos modelos foram usadas para comparar a performance dos diferentes conjuntos de modelos (e.g., assimétrico e simétrico, e ambiental), a performance de modelos de múltiplas espécies baseando-se na distribuição das ocorrências entre sub-bacias e amplitude de distribuição, além do efeito da inclusão de barreiras de dispersão nos modelos. Primeiramente, os modelos com maiores performances foram os gerados usando preditores de dispersão assimétrica, tanto sozinhos como em conjunto com variáveis ambientais. Em segundo, espécies mais restritas tiveram modelos com maior performance quando modeladas usando preditores de dispersão assimétrica, especialmente quando distribuídas em diferentes sub-bacias. Por último, predições incluindo hidrelétricas como barreiras de dispersão mostraram uma maior perda de riqueza e composição de espécies, especialmente para as áreas com o maior número de barragens. Portanto, a inclusão de variáveis de dispersão assimétricas, considerando limites de dispersão das espécies, reduziu a extrapolação de predições para áreas climaticamente adequáveis, porém desconectadas pelos rios. Ademais, os modelos usando dispersão assimétrica melhor representaram espécies restritas em ambas sub-bacias e também o efeito de barreiras de dispersão na riqueza e composição de espécies ao longo da bacia. Sendo assim, futuros trabalhos usando modelos de distribuição de espécies, especialmente usando grupos com dispersão assimétrica, deveriam considerar a inclusão de preditores de dispersão assimétrica de forma a melhorar a performance dos modelos e realidade ecológica das predições. Species distribution models are based mainly on environmental (mostly climatic) and species distribution data to predict the potential distribution of species. In this sense, the species dispersal (i.e., movement) is often ignored in their predictions. In freshwater habitats, species dispersal is not restricted only by physical barriers but also by the directional movement of the hydrographic network, which can be considered through spatial predictors. Here, we aim to evaluate the effect of including asymmetrical dispersal predictors in the potential geographic distribution of a freshwater fish in the Tocantins-Araguaia River basin, Brazil. Furthermore, we aim to assess if the predictions using climatic and asymmetrical dispersal vary depending on multiple species occurrence distribution and range, and on the inclusion of hydropower plants as dispersal barriers in the predictions. For this, we built models with seven variable sets representing environmental (climatic) and dispersal models, as well as their interactions. The models’ accuracy metrics were then used to compare the performance of different model sets (e.g., asymmetrical and symmetrical dispersal and environmental predictors), the performance of multiple species models based on their occurrence distribution among sub-basins and range, and the effect of including dispersal barriers into the models. First, we found that the models with higher performance are those built using asymmetrical dispersal predictors, either solo or combined with environmental variables. Second, species more restricted had models with higher performance when modeled using asymmetrical dispersal predictors, especially when distributed in different sub-basins. Third, predictions including the hydropower plants as dispersal barriers showed a higher loss of species richness and composition, especially for the areas with the highest number of dams. Therefore, the inclusion of asymmetrical dispersal variables, taking into account dispersal limitations of species, decreased the overprediction to climatically suitable but disconnected areas through rivers. Furthermore, those models using asymmetrical dispersal better represented restricted species distributed in both sub-basins of the basin and also the effect of dispersal barriers in the fish species richness and composition along the basin. Therefore, future SDM studies, especially those using species groups with asymmetrical dispersal, should consider the inclusion of asymmetrical dispersal predictors to increase the model’s accuracy and ecological reality of predictions. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Freshwater fishes are fundamental components of biodiversity, and it is necessary to develop actions aimed at conserving these species in the face of anthropic changes in the XXI century. In this sense, it is fundamental to understand the mechanisms underlying the composition and distribution of these species along environmental gradients, applying different measures of diversity for this purpose. Alpha diversity represents the species richness in a given location, while beta diversity is a measure of species dissimilarity along environmental gradients, which includes two contrasting components of community structuring: species replacement and richness difference. Thus, alpha and beta diversities are part of regional species diversity, or gamma diversity. This study aimed to understand the taxonomic, functional, and phylogenetic diversity of the ichthyofauna of the Upper and Middle Paranapanema River. Presented as a book chapter, Chapter I includes a review of the ichthyofauna of rivers, streams, and reservoirs in the Upper and Middle Paranapanema River. In this sense, 128 species were recorded in these environments, with greater representation from the Characidae and Loricariidae families. The highest species richness and the lowest proportion of autochthonous species from the Upper Paraná River (83%) were found in reservoirs, with 20 species recorded only in these environments. The headwater streams have the lowest richness and the highest proportion of autochthonous species, being essential for the conservation of endemic species and species that are exclusive to this type of environment. Then, Chapter II investigates different measures of diversity for two spatial scales in the Paranapanema River: the Alto Paranapanema basin and the Pinhal sub-basin, for taxonomic, functional and phylogenetic diversity. The values of total alpha and beta diversity, as well as the values of the substitution and richness difference components of beta diversity were estimated. Next, the relationship of taxonomic beta diversity to the environment was analyzed, and the contribution of local, spatial, and stream-surrounding effects to the dissimilarity were divided. The gamma diversity and the taxonomic, functional and phylogenetic alpha and beta diversities were higher for the Alto Paranapanema basin compared to the Pinhal sub-basin. Furthermore, the replacement component was greater than the richness difference for the taxonomic beta diversity in the two spatial scales. The effect of the surrounding area was the most significant finding to explain the compositional dissimilarity for the basin, while the geographic distance was the most important result to explain the total beta diversity for the sub-basin. The general findings show the importance of using different scales in the study of stream fish diversity, as well as the relevance of headwater streams in order to preserve the diversity of ichthyofauna at a river basin scale. Peixes de água doce são importantes componentes da biodiversidade, sendo necessárias medidas para a sua conservação frente às mudanças antrópicas do século 21. Entender os mecanismos subjacentes à composição e distribuição dessas espécies ao longo de gradientes ambientais é um passo importante, sendo empregadas diferentes medidas de diversidade para esse fim. A diversidade alfa representa a riqueza de espécies em um local, enquanto a diversidade beta constitui uma medida de dissimilaridade de espécies ao longo de gradiente ambientais, apresentando dois componentes contrastantes de estruturação das comunidades: a substituição de espécies e a diferença de riqueza. As diversidades alfa e beta alimentam a diversidade regional de espécies, ou gama. O objetivo do trabalho foi compreender a diversidade taxonômica, funcional e filogenética da ictiofauna do Alto e Médio Rio Paranapanema. No Capítulo I foi realizada uma revisão sobre a ictiofauna de cabeceiras, rios, riachos e reservatórios no Alto e Médio Paranapanema e está apresentado no formato de capítulo de livro. Ao todo 128 espécies foram registradas nesses ambientes, sendo que a maior representatividade pertence às famílias Characidae e Loricariidae. Os reservatórios apresentam a maior riqueza de espécies e a menor proporção de espécies autóctones do Alto Paraná (83%), com 20 espécies encontradas apenas nesses ambientes. As cabeceiras possuem a menor riqueza e a maior proporção de espécies autóctones (96%), sendo importantes para a conservação de espécies endêmicas e exclusivas desse tipo de ambiente; no Capítulo II foram analisadas diferentes medidas de diversidade para duas escalas espaciais no Rio Paranapanema: a bacia do Alto Paranapanema e a sub-bacia do Pinhal. Foram estimados os valores de diversidade gama, alfa e beta, e dos componentes substituição e diferença de riqueza da diversidade beta. Foi analisada a relação da diversidade beta taxonômica com o ambiente, e particionada a contribuição dos efeitos locais, espaciais e do entorno dos riachos para a dissimilaridade composicional. A diversidade gama e as diversidades alfa e beta taxonômica, funcional e filogenética foram maiores para a bacia do Alto Paranapanema do que para a sub-bacia do Pinhal. O componente substituição da diversidade beta taxonômica foi maior do que a diferença de riqueza nas duas escalas. O efeito do entorno foi o mais importante para explicar a dissimilaridade composicional para a bacia, enquanto para a sub-bacia foi a distância geográfica. Os resultados gerais evidenciam a importância de se considerar diferentes escalas no estudo da diversidade de peixes de riacho, bem como a relevância dos riachos de cabeceira para a manutenção da diversidade da ictiofauna em uma escala de bacia hidrográfica. 001

The Serranias Costeiras of the Ribeira de Iguape River basin comprise landscapes with steep slopes, where many streams are contained in protected areas. We evaluated the importance of these protected areas for stream fish diversity. We sampled the ichthyofauna during the dry season of 2010, 2018 and 2019 in 36 stream stretches. We used beta diversity measures and estimated species richness and dark diversity in streams from two types of protected areas (full protection, FP and sustainable use, SU) and outside (Out). The altitude-width and velocity gradient of the streams explained the species turnover. The PA type promoted the richness difference, with FP streams having less species richness than SU and outside. Streams from FP presented lower species richness and dark diversity. These results indicate that the few species in FPs are well protected. The FP streams contain a relevant proportion of the regional species pool and, therefore, are essential for conserving fish stream diversity in the study region. On the other hand, streams from SU or Out have higher species richness, but their fish fauna is more vulnerable. Due to longitudinal stream connectivity, we highlight the importance of rethinking the limits of protected areas. Resumo Os riachos das Serranias Costeiras da bacia do rio Ribeira de Iguape estão na região do estado de São Paulo com maior quantidade de áreas preservadas e com ictiofauna muito particular. Avaliamos a importância das áreas preservadas na diversidade da ictiofauna. Durante o período de seca de 2010, 2018 e 2019 coletamos a ictiofauna em 36 trechos de riachos em dois tipos de áreas protegidas (Proteção Integral, FP e Uso Sustentável, SU) e fora (Out). Utilizamos medidas de diversidade beta e estimamos a riqueza de espécies e a diversidade escura. A ictiofauna regional apresentou alta diversidade beta. O gradiente de largura e velocidade dos riachos e altitudinal explicou a substituição de espécies. A diferença de riqueza foi promovida pelo tipo de UC sendo que os riachos FP possuem menor riqueza de espécies que os SU e fora das UCs. Os riachos inseridos em FP contêm uma proporção relevante do pool regional de espécies e, portanto, são importantes para a conservação da diversidade de riachos na região de estudo. Por outro lado, os riachos que estão em SU ou Out possuem maior riqueza de espécies e sua fauna de peixes está mais vulnerável. Devido à conectividade longitudinal dos riachos ressaltamos a importância de repensar os limites das unidades de conservação.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Agrochemicals are largely used in sugar cane production in Brazil and they contaminate water bodies and potentially they can cause a process named biotic homogenization, through species selection and changes in the aquatic species compositions. In metacommunities the contamination can affect uncontaminated and connected water bodies through organisms dispersion or effluents sharing, on the other hand we can also predict that non affected places can help the local communities to recover after agrochemicals exposure directly, acting as key-communities and that phytoplankton communities would suffer the biotic homogenization process through pesticides (e.g., fipronil) and fertilizers (e.g., vinasse) addiction. The first one would cause top-down remotion, because of its toxicity to zooplankton and the second one would cause it because of bottom-up remotion by nutrients increase, leading to eutrophication. In contrast, fertilizers could also promote biotic heterogenization as a result of resources increase, which can favour a greater quantity of species. In this study, tried to understand possible changes in phytoplankton special and temporal composition in presence of fipronil and sugarcane vinasse, separately and test how key-communities can help contaminated communities to recover. To test our four hypotheses, we conducted an experiment in mesocosms outdoor contaminated with realistic concentrations for water bodies (an average of 2 µg/L of fipronil and 125 mL of vinasse for each 400 L mesocosm), considering a metacommunities approach, with dispersion among mesocosms. We found that the presence of the contaminants enhanced the diversity and richness loss, although it increased the species evenness. We also observed changes in the species composition, in which the same species respond to the top-down and bottom-up controls loosening or removal, respectively. Pesticides and fertilizers, in the concentrations we tested, tend to lead the phytoplankton communities to beta diversity decrease, although subsequently, the communities were able to recover, which does not support the biotic homogenization hypothesis. The species with the major contributions to beta diversity are the same for both contaminants and the patterns for local contributions were not clear, but it suggested that pristine communities had negative impacts after they received effluents and organisms from impacted locals. We concluded that the presence of contaminants in the current concentrations that are found in aquatic ecosystems can cause beta diversity decrease to phytoplankton communities that can still be recovered and that it selects species with some similar and particular characteristics in both cases, but mainly, that negative effects also occur on nonaffected communities that receive effluents and organisms from affected ones. Agroquímicos utilizados no cultivo da cana-de-açúcar no Brasil contaminam corpos d’água adjacentes e potencialmente causam o processo conhecido como homogeneização biótica, através de seleção de espécies e alterações nas composições de comunidades aquáticas. Em metacomunidades, a contaminação destes locais pode afetar demais corpos d’água não contaminados que estejam interligados a eles por dispersão de organismos ou compartilhamento de efluentes, por outro lado, também podemos prever que locais não impactados podem auxiliar na recuperação das comunidades locais que recebem agroquímicos diretamente, atuando como comunidades- chave e que comunidades de fitoplâncton sofreriam o processo de homogeneização biótica pela exposição aos pesticidas (e.g., fipronil) e fertilizantes (e.g., vinhaça). O primeiro pela remoção do controle top-down através da toxicidade para o zooplâncton e o segundo pela remoção do controle bottom-up pelo aumento de nutrientes, levando à eutrofização. Em contrapartida, fertilizantes também poderiam promover heterogeneização biótica por aumento de recursos, que auxiliaria no crescimento de várias espécies. Portanto, buscamos compreender as alterações na composição espacial e temporal do fitoplâncton, na presença de fipronil e vinhaça, separadamente e testar o papel das comunidades-chave na recuperação de comunidades contaminadas. Para testar nossas quatro hipóteses, utilizamos um experimento em mesocosmos ao ar livre contaminados com concentrações realistas em corpos d’água (em média 2 µg/L de fipronil e 125 mL de vinhaça para cada mesocosmo de 400 L), considerando uma abordagem de metacomunidades, com dispersão entre mesocosmos. Encontramos que a presença dos contaminantes acentuou o processo de perda de diversidade e de riqueza, mas gerou aumento de equitabilidade de abundâncias. Também observamos alteração na composição de espécies, onde as mesmas espécies responderam ao relaxamento ou remoção dos controles top-down e bottom-up, respectivamente. Pesticidas e fertilizantes, nas concentrações utilizadas, tendem a levar as comunidades de fitoplâncton à diminuição da diversidade beta, mas há posterior recuperação das comunidades, não sustentando a hipótese de homogeneização biótica. As espécies com maiores contribuições para a diversidade beta são semelhantes para ambos os contaminantes e a contribuição dos locais não tem padrão evidente, mas sugere que comunidades- chave também sofrem efeitos negativos após entrada de efluentes e organismos advindos de locais impactados. Concluímos que a presença dos contaminantes nas concentrações testadas mostra tendência à diminuição da diversidade beta para as comunidades de fitoplâncton que ainda podem ser recuperadas e seleciona espécies com características semelhantes em ambos os casos, mas principalmente, que efeitos negativos também ocorrem nas comunidades não contaminadas que recebem efluentes e organismos de comunidades contaminadas. CAPES: Código de Financiamento 001

Dams and predicted future extreme weather events can affect the structure of aquatic communities, both at a local and regional scale. They can influence, for example, the importance of sites and species for regional diversity as they promote local processes of extinction and colonization, as well as processes of biotic homogenization on a regional scale. It was investigated how damming and prolonged flood and drought periods influenced the local contribution to beta diversity (LCBD) based on phytoplankton functional groups (GFR), as well as the contribution of each GFR to beta diversity (SCBD). The relationship between the number of GFR (Functional richness - RF) on the LCBD was also evaluated. For this, it was analyzed data collected in years with extreme drought (2000-2001) and flood (2010-2011) from three sub-basins of the upper Paraná River floodplain were used, which have different damming effects (presence, indirect influence, and absence). Nutrient concentrations and pH influenced the beta diversity in the three sub-basins in the two periods. Extreme drought periods and the presence of a dam were related to higher values of LCBD and RF. High LCBD values were related to low RF values. Environments with the absence and indirect influence of the dam had higher RF values in the flood and higher LCBD values in the drought. GFR H1 (N-fixing cyanobacteria), Lo (large mucilaginous cyanobacteria), and P (filamentous diatoms) presented the greatest contribution to beta diversity. The damming region was related to filamentous cyanobacteria in the drought. The results showed that both damming and climatic periods influenced the contribution of sites to regional diversity. However, they also suggested that the greatest biotic uniqueness observed in the damming region and in the dry period was related to organisms that can affect water diversity and quality, such as cyanobacteria. It appears that these environments have unique environmental and biotic conditions that require greater attention in terms of monitoring to prevent the proliferation of organisms with toxigenic potential. The construction of dams in search of energy security, associated with the predicted scenario of an increase in extreme events, favors biotic uniqueness. Understanding how communities respond to these changes is crucial for the ecology of aquatic environments. CAPES Os barramentos e os eventos hidrológicos extremos atuais e os preditos para o futuro podem afetar a estrutura das comunidades aquáticas, tanto em escala local quanto regional. Estes eventos podem influenciar a importância de locais e espécies para a diversidade regional pois promovem processos locais de extinção e colonização, assim como processos de homogeneização biótica em escala regional. Foi investigado como o efeito de barramento e períodos de cheia e seca prolongados influenciam a contribuição local para a diversidade beta (LCBD) fitoplanctônica, baseada em grupos funcionais de Reynolds (GFR), e a contribuição de cada grupo funcional para a diversidade beta (SCBD). a relação entre o número de GFR (Riqueza Funcional – RF) sobre o LCBD. Para isso, utilizados dados de três sub-bacias da planície de inundação do alto rio Paraná, que possuem diferentes efeitos de barramento (presença, influência indireta e ausência), nos anos de seca (2000-2001) e cheia (2010-2011) extremas. As concentrações de nutrientes e o pH estiveram relacionadas com os padrões da diversidade beta nas três sub-bacias e nos dois períodos. Períodos de seca extrema e ambientes com presença de barramento apresentaram maiores valores de LCBD e RF. Altos valores de LCBD estiveram relacionados a baixos valores de RF. Ambientes com ausência e influência indireta de barramento apresentaram maiores valores de RF na cheia e maiores valores de LCBD na seca. Os GFR H1 (cianobactérias N-fixadoras), Lo (grandes cianobactérias mucilaginosas) e P (diatomáceas filamentosas) apresentaram maior contribuição à diversidade beta. A região com barramento esteve relacionada com cianobactérias filamentosas na seca. Os resultados mostraram que tanto barramento quanto períodos hidrológicos influenciaram a contribuição dos locais à diversidade regional. Porém, a maior singularidade biótica observada na região com barramento e no período seco esteve relacionada com organismos que podem afetar à diversidade e qualidade de água, como as cianobactérias. Esses ambientes aparentam possuir condições ambientais e bióticas exclusivas que requerem maior atenção em relação a monitoramento para evitar a proliferação de organismos com potencial toxigênico. A construção de barramentos em busca da segurança energética, associada ao cenário predito de aumento de eventos extremos, favorece a singularidade biótica. Entender como as comunidades respondem a essas alterações é crucial para ecologia de ambientes aquáticos.

The industrial advance of Europe between the 19th and 20th centuries resulted in major environmental impacts. Among these impacts, the deposition of acid compounds through acid rain stands out, and this phenomenon led to the acidification of water bodies. However, from the 1980s on, with the application of stricter environmental regulations, a gradual recovery of abiotic parameters began, including pH values, which began to return to less acidic ranges. Thus, we investigated the responses of the benthic community to the gradual recovery of abiotic variables after years of intense acidification, analyzing changes in community structure and, specifically, variations in beta diversity. The study was developed with data from streams in Wales, collected and provided by two research projects that monitor the region's water bodies. The streams were classified according to abiotic characteristics and the surrounding vegetation (Acid Forest, Acid Moorland and Circumneutral Moorland). In the first approach, the community of 69 streams was analyzed, testing whether (i) the composition of macroinvertebrate communities differed among the types of environments and years analyzed; and whether (ii) in early years beta diversity among streams was lower than in more recent years, as well as in streams of a more acidic category. Samples were collected in 1984, 1995, and 2012, with the earliest year under the greatest influence of acidification. A segregation in macroinvertebrate composition was observed between 1984 and the other years, and this difference in community composition between the years suggests that environmental recovery with rising pH values, allowed the entry and establishment of new macroinvertebrate species in the streams. The lowest beta diversity value was also observed in 1984, indicating biotic homogenization in this period and an increase in community dissimilarity over time. In the second approach, we investigated the hypothesis that a gradual increase in temporal beta diversity (TBI) values occurs over time. This was done by sampling eight streams in Wales over the period 1985 to 2018, and comparing beta diversity between the reference year 1985 with all other years. There was an increase in TBI values over the years for all environments, showing evidence of biological recovery concomitant with restoration of abiotic values. The results contributed to the understanding that the biotic community also responds to environmental recovery, and there are different ways to evaluate this process, such as beta diversity. The importance of long-term research is emphasized so that such changes can be monitored. CAPES; CNPq O avanço industrial da Europa entre os séculos XIX e XX resultou em grandes impactos ambientais. Dentre esses impactos, destaca-se a deposição de compostos ácidos através da chuva ácida, e tal fenômeno levou à acidificação de corpos d’água. Contudo, a partir da década de 1980, com a aplicação de normas ambientais mais rígidas, teve início uma recuperação gradual dos parâmetros abióticos, incluindo os valores de pH, que começaram a retornar para faixas menos ácidas. Investigou-se as respostas da comunidade bentônica diante da recuperação gradual das variáveis abióticas após anos de intensa acidificação, analisando mudanças na estrutura da comunidade e, especificamente, as variações da diversidade beta. Os estudos foram desenvolvidos com dados de riachos do País de Gales, coletados e cedidos por dois projetos de pesquisas galeses que monitoram os corpos aquáticos da região, sendo os riachos classificados de acordo com as características abióticas e da vegetação do entorno (Acid Forest, Acid Moorland e Circumneutral Moorland). Na primeira abordagem, analisou-se a comunidade de 69 riachos, testando se (i) a composição das comunidades difere entre os tipos de ambientes e anos analisados; e se (ii) nos anos iniciais a diversidade beta entre os riachos foi menor do que nos anos mais recentes, assim como nos riachos de uma categoria mais ácida. As amostras foram coletadas em 1984, 1995 e 2012, sendo o ano mais antigo sob maior influência da acidificação. Observou-se uma segregação na composição da biota entre 1984 e os demais anos, e essa diferença na composição da comunidade entre os anos sugere que a recuperação ambiental com ascensão nos valores de pH, permitiu a entrada e estabelecimento de novas espécies de macroinvertebrados nos riachos. O menor valor de diversidade beta também foi observado em 1984, indicando homogeneização biótica neste período e aumento da dissimilaridade das comunidades com o tempo. Na segunda abordagem, investigou-se a hipótese de que ocorre um aumento gradativo nos valores de diversidade beta temporal (TBI) ao longo do tempo. Para tanto, foram amostrados oito riachos no País de Gales no período entre 1985 e 2018, e comparado a diversidade beta dos riachos entre o ano referência 1985 com todos os demais anos. Houve um aumento dos valores de TBI ao longo dos anos para todos ambientes, mostrando indícios de recuperação biológica concomitante com o restabelecimento dos valores abióticos. Os resultados contribuíram para o entendimento de que a comunidade biótica também responde à recuperação ambiental. Sendo a diversidade beta uma das formas de se avaliar tal processo. E ressalta-se a importância de pesquisas de longa duração para que tais respostas bióticas possam ser monitoradas. 55 f. : il. color.

Human activities have caused degradation of aquatic ecosystems and reduced biodiversity. The dams in particular directly impact the spatial and temporal variation of aquatic communities, and especially the phytoplankton community that responds quickly and efficiently to changes in the environment. The impact of a dam in an Amazon river (Jirau Hydroelectric Power Plant) on the spatial and temporal variation of the composition (beta diversity) of phytoplankton was investigated, from October 2009 to July 2017. The hypothesis was tested that the bus modifies beta diversity on a local and regional scale, and alters each location's contribution to beta diversity. The contribution of the sites to the beta diversity was evaluated as a function of the distance from the bus and the environmental heterogeneity. The phytoplankton composition was different between the phases before, fill and after the damming. Biotic homogenization was verified in the tributaries closest to the dam. The more distant sites presented greater contribution to diversity, but were associated with lower values of richness. The dam caused unidirectional changes, locally and regionally, that is, the community moved to a new state over time, and also caused biotic homogenization locally. The impact of the dam was observed only on the tributaries, indicating that run-of-river dams have a greater impact on the tributaries than on the main channel. CAPES As atividades humanas têm causado degradação dos ecossistemas aquáticos e reduz a biodiversidade. Os barramentos em especial, impactam diretamente a variação espacial e temporal das comunidades aquáticas, e especialmente a comunidade fitoplanctônica que responde de forma rápida e eficiente às mudanças do ambiente. Investigou-se o impacto de um barramento em um rio amazônico (Usina Hidrelétrica de Jirau) sobre a variação espacial e temporal da composição (diversidade beta) do fitoplâncton, no período de outubro de 2009 a julho de 2017. Foi testado a hipótese de que o barramento modifica a diversidade beta em escala local e regional, e altera a contribuição de cada local à diversidade beta. Avaliou-se a contribuição dos locais para a diversidade beta em função da distância do barramento e da heterogeneidade ambiental. A composição fitoplanctônica foi diferente entre as fases antes, enchimento e após o barramento. Verificou-se homogeneização biótica nos tributários mais próximos a barragem. Os locais mais distantes apresentaram maior contribuição a diversidade, mas foram associados a menores valores de riqueza. O barramento causou mudanças unidirecionais, localmente e regionalmente, ou seja, a comunidade passou para um novo estado ao longo do tempo, e também causou homogeneização biótica localmente. Observou-se o impacto do barramento somente nos tributários, indicando que as barragens a fio de água têm maior impacto nos tributários do que no canal principal. 53 f. : il. (algumas color.).

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2022-06-02T19:59:19Z No. of bitstreams: 1 2021 - Rafaela de Sousa Gomes Gon?alves.pdf: 1745899 bytes, checksum: 319d09462f752f6d1a5258c34928e326 (MD5) Made available in DSpace on 2022-06-02T19:59:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2021 - Rafaela de Sousa Gomes Gon?alves.pdf: 1745899 bytes, checksum: 319d09462f752f6d1a5258c34928e326 (MD5) Previous issue date: 2021-12-15 CAPES - Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior Shallow water estuarine environments have many habitats that favor colonization and use by different fish species. These coastal ecosystems are undergoing increasingly impacts resulting from industrial and urban developments in their surroundings, resulting in a growing loss of biodiversity, which may be accompanied by the losses of important ecological functions. Investigating the patterns and processes that act on biodiversity is essential to obtain a more view of the dynamics and roles of communities in the ecosystems, and for this, short and long-term studies are essential. Studies have mainly addressed the taxonomic structure, requiring a more integrated approach, aiming to understand the dynamics and roles of functional groups in space and time. The present study, divided into two chapters, aims to understand the spatiotemporal dynamics of the ichthyofauna of shallow areas in a tropical bay in a growing process of environmental change, exploring taxonomic and functional aspects. In chapter 1, we seek to describe the relationship between beta diversity and environmental heterogeneity, in order to test the hypothesis that environmental heterogeneity influences biodiversity. A weak positive relationship between environmental heterogeneity and beta diversity was detected, suggesting that more heterogeneous environments tend to have greater variations in biological composition. In Chapter 2, we assess temporal changes (1983-1985, 1999-2001, and 2017-2019) in taxonomic and functional indices. Previous studies have already reported a decline in the fish richness in the shallow areas of Sepetiba Bay, but the investigation of how the functional groups have been affected has not yet been investigated. We tested the hypothesis that functional diversity indices also changed over time, as a result of environmental changes in the recent decades. We found a substantial decrease in species richness and abundance in more recent periods compared to 1983-1985. However, the functional structure remained relatively stable, with the exception of functional richness, which showed a significant decrease, indicating an impact on the amount of functional space occupied by the local community, so that some of the resources potentially available to the community were no longer used. The stability observed in the functional descriptors can be explained by the fact that estuarine environments tend to have high functional redundancy due to the restrictions imposed by the marked environmental gradient, which can result in the convergence of functional traits between species, ensuring that, despite losses in richness and abundance of species, the main functions can be maintained. The information obtained in this study confirms that the use of functional indices is essential to complement taxonomic assessments, giving a detailed view of the extent of biodiversity loss in impacted environments. Os ambientes estuarinos de ?guas rasas apresentam muitos habitats que favorecem a coloniza??o e o uso por diferentes esp?cies de peixes. Esses ecossistemas costeiros est?o sendo cada vez mais influenciados por impactos decorrentes dos avan?os industriais e urbanos ao seu entorno, resultando numa crescente perda de biodiversidade, podendo ser acompanhada pela perda de importantes fun??es ecol?gicas. Investigar os padr?es e os processos que atuam na biodiversidade ? essencial para obter uma vis?o mais din?mica e dos pap?is das comunidades nos ecossistemas, e para isto, estudos de curto e longo prazo s?o fundamentais. Estudos abordando n?o s? a estrutura taxon?mica, como tamb?m uma abordagem mais integrada, s?o importantes para compreender a din?mica e pap?is dos grupos funcionais no espa?o e no tempo. O presente estudo, dividido em dois cap?tulos, visa compreender a din?mica espa?o-temporal da ictiofauna de ?reas rasas em uma baia tropical em crescente processo de altera??o ambiental, explorando aspectos taxon?micos e funcionais. No cap?tulo 1, buscamos descrever a rela??o entre a diversidade beta e a heterogeneidade ambiental, a fim de testar a hip?tese de que a heterogeneidade ambiental influencia a biodiversidade. Foi detectada uma fraca rela??o positiva entre a heterogeneidade ambiental e a diversidade beta, sugerindo que ambientes mais heterog?neos tendem a apresentar maiores varia??es na composi??o biol?gica. No cap?tulo 2, avaliamos as altera??es temporais (1983-1985, 1999-2001 e 2017-2019) nos ?ndices taxon?micos e funcionais. Estudos anteriores relataram um decl?nio na riqueza de peixes nas zonas rasas da Ba?a de Sepetiba, mas a investiga??o de que forma os grupos funcionais est?o sendo afetados, ainda n?o foi investigada. Testamos a hip?tese de que os ?ndices de diversidade funcional tamb?m mudaram ao longo do tempo, como resultado das altera??es ambientais sofridas nas ?ltimas d?cadas. Observamos uma diminui??o substancial na riqueza de esp?cies e abund?ncia nos per?odos mais recentes, em compara??o com 1983-1985. Entretanto, a estrutura funcional permaneceu relativamente est?vel, com exce??o da riqueza funcional, que apresentou uma queda significativa, indicando impacto na quantidade de espa?o funcional ocupado pela comunidade local, de forma que alguns dos recursos potencialmente dispon?veis para a comunidade deixaram de ser utilizados. A estabilidade observada nos descritores funcionais pode ser explicada porque ambientes estuarinos tendem a apresentar elevada redund?ncia funcional devido ?s restri??es impostas pelo marcado gradiente ambiental, o que podem resultar na converg?ncia de tra?os funcionais entre esp?cies, garantindo que, apesar das perdas na riqueza e abund?ncia de esp?cies, as principais fun??es podem ser mantidas. As informa??es obtidas no presente estudo confirmam que uso de ?ndices funcionais ? essencial para complementar as avalia??es taxon?micas, dando uma vis?o detalhada da dimens?o da perda de biodiversidade em ambientes impactados.

Submitted by Neusa Fagundes (neusa.fagundes@unioeste.br) on 2022-02-04T17:57:55Z No. of bitstreams: 2 Matheus_Zanetti2021.pdf: 1137681 bytes, checksum: 4e0f4d3540d79489d40d43334724a1d5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2022-02-04T17:57:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Matheus_Zanetti2021.pdf: 1137681 bytes, checksum: 4e0f4d3540d79489d40d43334724a1d5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2021-09-23 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES The main objective of community ecology is to investigate the distribution patterns of biodiversity and understand the processes and mechanisms of action of these processes that generate and maintain these patterns. In anthropized environments, communities can be affected in various ways, which makes it necessary to better understand the dynamics of metacommunities in these environments. This work aimed to compare the richness and composition of anuran species in an urban-rural gradient. Tadpoles were sampled in 39 bodies of water, in two reproductive seasons, between September 2017 and March 2018 and between September 2018 and March 2019. Twenty species belonging to five families were recorded. The rural area showed greater species richness and greater beta diversity among local rural communities compared to the urban area. We observed that urban areas harbor less richness and have lower beta diversity than rural areas, with frog species that occur in urban areas being a subset of species that occur in rural areas, where there is a higher turnover of species. Urbanization negatively affects anuran species, so that rural environments show a greater potential for species conservation when compared to the urban environment. We conclude that it is possible to concentrate conservation efforts in urbanized environments and use them in favor of maintaining species diversity through the maintenance of water bodies in urban areas within spaces with patches of vegetation and with a vegetation structure on the margin, within and water body arehers can help population persistence by providing terrestrial habitats for adults and juveniles and aquatic habitats for tadpoles. Likewise, it is suggested that the conservation of water bodies in rural landscapes and the maintenance of heterogeneity within that landscape may be the best way to conserve biodiversity, as well as the development of agro-environmental policies, where it is maintained whenever possible the quality of the environment with a view to increasing and maintaining the biodiversity of anurans. A ecologia de comunidades tem como objetivo principal investigar os padrões de distribuição da biodiversidade e compreender os processos e os mecanismos de ação destes processos que geram e mantêm esses padrões. Em ambientes antropizados, as comnunidades podem ser afetadas de várias formas, o que torna necessário um maior entendimento da dinâmica das metacomunidades nesses ambientes. Este trabalho teve como objetivo comparar a riqueza e composição de espécies de anuros em um gradiente urbano-rural. Foram amostrados girinos em 39 corpos d’água, em duas temporadas reprodutivas, entre setembro 2017 e março de 2018 e entre setembro de 2018 e março de 2019. Foram registradas 20 espécies, pertencentes a cinco famílias. A área rural apresentou maior riqueza de espécies e maior diversidade beta entre as comundidades locais rurais em comparação com a área urbana. Nós observamos que áreas urbanas abrigam uma menor riqueza e possuem uma menor diversidade beta do que as áreas rurais, sendo que as espécies de anuros que ocorrem em áreas urbanas são um subconjunto das espécies que ocorrem nas áreas rurais, onde há uma maior rotatividade de espécies. A urbanização afeta negativamente as espécies de anuros, de forma que os ambientes rurais mostram um maior potencial para conservação de espécies quando comparado com o ambiente urbano. Concluimos que é possível concentrar esforços de conservação em ambientes urbanizados e usá-los em prol da manutenção da diversidade de espécies através do mantimento de corpos d’água em áreas urbanas dentro de espaços com manchas de vegetação e com uma estruturação vegetacional na margem, dentro e aredores dos corpos d’água podem ajudar na persistência de populações por prover hábitats terrestres para adultos e juvenis e aquáticos para girinos. Da mesma foram, sugere-se que a conservação de corpos d’água em paisagens rurais e a manutenção da heterogeneidade dentro dessa paisagem pode ser a melhor maneira de conservar a biodiversidade, bem como o desenvolvimento de políticas agroambientais, onde seja mantido sempre que possível a qualidade do ambiente pensando em aumentar e manter a biodiversidade de anuros.

As nascentes são ecossistemas de importância ecológica, econômica e social. Entretanto, tendo em vista a expansão das atividades agrícolas em regiões tropicais, a pressão sobre esses ecossistemas tem aumentado. Apesar de sua importância, nascentes tropicais em áreas com diferente uso da terra são pouco estudadas. Portanto, esta tese, que está estruturada em três capítulos, ela tem como objetivo geral ampliar o conhecimento acerca do impacto de áreas cultivadas com eucalipto e da sazonalidade pluviométrica em nascentes tropicais da Mata Atântica brasileira, com base na estrutura e composição das assembleias de Ephemeroptera, Plecoptera e Trichoptera (EPT). No primeiro capítulo, verificamos se a composição granulométrica do sedimento nas nascentes em áreas de floresta difere de nascentes em áreas plantadas com eucalipto, uma vez que a conversão de florestas naturais pode promover mudanças na composição do sedimento em ambientes aquáticos. Foi possível observar que as nascentes em áreas de floresta estiveram associadas com areia muito grossa, enquanto aquelas em área de eucalipto estiveram associadas a partículas de granulometria mais fina, o que enfatiza a importância da vegetação ciliar para mitigar potenciais impactos da silvicultura do eucalipto no sedimento das nascentes. No segundo capítulo, utilizamos a estrutura taxonômica e funcional de EPT com o objetivo de verificar o impacto da silvicultura do eucalipto sobre a fauna de nascentes neotropicais. Nossos resultados mostraram que nascentes em área de eucalipto apresentaram redução da riqueza e mudança na composição de gêneros de EPT em comparação com nascentes em áreas de floresta. Também verificamos que o traço tamanho corporal e tipo de respiração foram as características funcionais mais influenciadas pelas variáveis ambientais em nascentes, tanto em áreas de eucalipto quanto de floresta. A redução e homogeneização da vegetação ciliar reduziram a qualidade do substrato vegetal, levando a perda de riqueza e alteração dos traços funcionais de EPT em nascentes em áreas de eucalipto. No terceiro capítulo, empregamos a diversidade beta e os componentes, substituição (turnover) e perda de espécies (aninhamento) das assembleias de EPT para verificar a influência dos períodos sazonais secos e chuvosos na estabilidade ambiental de nascentes em áreas de floresta e áreas de eucalipto. As nascentes apresentaram estabilidade ambiental entre os períodos secos e chuvosos, não havendo variação significativa da diversidade beta em ambas as áreas, e devido à heterogeneidade de habitats das nascentes a substituição de espécies foi predominante. Verificamos também homogeneidade dos parâmetros ambientais entre os períodos secos e chuvosos, e apesar da baixa variação da diversidade beta a variável areia fina em áreas de floresta, condutividade e turbidez em áreas de eucalipto foram as melhores preditoras. Acreditamos que os estudos contidos nesta tese contribuíram para ampliar o conhecimento da influência do uso da terra sobre as nascentes tropicais brasileiras, assim como, aponta para a necessidade de assegurar a preservação da proporção da vegetação ciliar, a fim de evitar alterações nas condições naturais do ecossistema de nascente. Springs are ecosystems of ecological, economic and social importance. However, in view of the expansion of agricultural activities in tropical regions, the pressure on these ecosystems has increased. Despite their importance, tropical springs in areas with different land use are poorly studied. Therefore, this thesis, which is structured in three chapters, aims to broaden the knowledge of the impact of areas cultivated with eucalyptus and rainfall seasonality in Brazilian tropical springs, based on the structure and composition of Ephemeroptera, Plecoptera and Trichoptera assemblages (EPT). In the first chapter, we verified whether the particle size composition of sediment from springs in forest areas differs from springs in areas planted with eucalyptus, since the conversion of natural forests can promote changes in the composition of sediment in aquatic environments. It was possible to observe that springs in forest areas were associated with very coarse sand, while those in eucalyptus areas were associated with finer particle size particles, which emphasizes the importance of riparian vegetation to mitigate potential impacts of eucalyptus forestry on the sediment from the springs. In the second chapter, we use the taxonomic and functional structure of EPT in order to verify the impact of eucalyptus forestry on the environmental quality of neotropical springs. Our results showed that springs in eucalyptus areas showed reduced richness and change in the composition of EPT genera compared to springs in forest areas. We also verified that respiration and body size were the functional traits most influenced by abiotic variables in springs both in eucalyptus and forest areas. The reduction and homogenization of riparian vegetation reduced the quality of the plant substrate, leading to loss of richness and alteration of the functional traits of EPT in springs in eucalyptus areas. In the third chapter, we employ the beta diversity and components, replacement (turnover) and loss of species (nestedness) of EPT assemblages to verify the influence of dry and rainy seasonal periods on the environmental stability of springs in forest areas and eucalyptus areas. The springs showed environmental stability between the dry and rainy periods, with no significant variation in beta diversity in both areas, and due to the heterogeneity of habitats in the springs, species turnover was predominant. We also verified homogeneity of environmental parameters between the dry and rainy periods, and despite the low variation of beta diversity, the fine sand variable, conductivity and turbidity were the best predictors in forest and eucalyptus areas, respectively. We believe that the studies contained in this thesis have contributed to broadening the knowledge of the influence of land use on Brazilian tropical springs, as well as pointing to the need to ensure the preservation of the proportion of riparian vegetation, in order to avoid changes in the natural conditions of the spring ecosystem.

Submitted by Concluinte Mestrado (concluinte.mestrado@setor.uepb.edu.br) on 2021-10-25T21:13:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação-Dalescka Barbosa de Melo.pdf: 1913814 bytes, checksum: d3e8151f0e82c2fbb05cdd177ba4c094 (MD5) Termos BDTD-Dalescka Barbosa de Melo.pdf: 388682 bytes, checksum: 969b168417264fb7551ae53134018575 (MD5) Approved for entry into archive by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2021-10-26T13:27:30Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação-Dalescka Barbosa de Melo.pdf: 1913814 bytes, checksum: d3e8151f0e82c2fbb05cdd177ba4c094 (MD5) Termos BDTD-Dalescka Barbosa de Melo.pdf: 388682 bytes, checksum: 969b168417264fb7551ae53134018575 (MD5) Made available in DSpace on 2021-11-24T13:50:35Z (GMT). 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Therefore, this dissertation sought to evaluate how extreme drought events, affected the water volume of reservoirs from different basins in the semiarid and how this variation affected the coexistence of Chironomidae assemblies. We tested the hypothesis, the extreme drought scenario will condition the local diversity, favoring the occurrence of genres with functional traits able to tolerate the hydric stress, caused by water volume fluctuations. Also, the taxonomic and functional diversity, particularly its β component, will decrease due to the biotic homogenization of the Chironomidae assemblies in both basins. To test the hypothesis, the Chironomidae from six reservoirs of different regions of the Brazilian semiarid were studied, (256 points) in 2014, 2015, and 2019. Period of extreme drought, with precipitation only from 2018, but below the annual average. The Chironomidae assemblies were then analyzed in different components of the α, β, and  diversity, in the taxonomic dimension using Simpson’s index and functional dimension the Rao’s index. To evaluate change in the assemblies as a function of water volume, the taxonomic and functional richness, Simpson Diversity, Rao Quadratic Entropy, functional redundancy, and the dominant functional traits of the assemblies were calculated, (community weighted means- CWM). The main results showed that the taxonomic and functional β-diversity was proportionally higher than α-diversity in the Paraíba basin, except in 2019 (similar α and β proportions). In the Piranhas-Açu basin, the reverse occurred, except in 2015 (only lowed β-functional). The indexes of diversity and the CWM results showed that fluctuations in water volume exert influence on the taxonomic composition and functional answer of assemblies, being more evident for the Piranhas-Açu basin. The combined effect of fluctuations in water volume and habitat conditions act as a filter, limiting the coexistence of genres and functions. Promoting different answers depending on the characteristics of the basin/reservoirs, such as a moderate turnover of species and functions or only turnover species, but similar function also in the situation of greater drought and lower water volume, or even biotic homogenization in periods of greater volume. As mudanças climáticas atuais têm revelado uma maior frequência de eventos extremos climáticos. A seca extrema é um exemplo de um extremo climático, que origina flutuações severas no volume hídrico dos ecossistemas aquáticos. Isto tem pressionando as espécies a adaptarem-se às novas condições. No entanto, nem todas as espécies conseguem persistir sobre os novos regimes climáticos, podendo comprometer a biodiversidade local. Diante disso, esta dissertação buscou avaliar como eventos de seca extrema afetam o volume hídrico dos reservatórios de diferentes bacias do semiárido e como essas variações condicionam a coexistência da assembleia de Chironomidae. Testamos a hipótese de que, o cenário de seca extrema condicionará a diversidade local, favorecendo a ocorrência de gêneros com características funcionais capazes de tolerarem o estresse hídrico causado pelas flutuações no volume. Também, a diversidade taxonômica e funcional, particularmente o componente β diminuirá como resultado da homogeneização biótica das assembleias de Chironomidae em ambas as bacias. Para testar a hipótese, os Chironomidae de seis reservatórios de diferentes regiões do semiárido brasileiro foram estudados (256 pontos) em 2014, 2015 e 2019. Período este de seca extrema, com precipitação apenas a partir de 2018, mas abaixo da média anual. Os Chironomidae foram então analisados, em diferentes componentes da diversidade α, β e  nas dimensões taxonômica usando o índice de Simpson e funcional o índice de Rao. Para avaliar mudanças na assembleia em função do volume hídrico foram calculados a Riqueza taxonômica e funcional, Diversidade de Simpson, Entropia Quadrática de Rao, Redundância funcional e os atributos funcionais dominantes da assembleia (community weigthed means- CWM). Os principais resultados mostram que a β diversidade taxonômica e funcional foi proporcionalmente superior ao α na bacia Paraíba, exceto em 2019 (proporções α e β próximas) e no Piranhas-Açu ocorreu o inverso exceto em 2015 (apenas β funcional inferior). Os índices de diversidade e a CWM mostraram que as flutuações no volume hídrico exercem influência na composição taxonômicas e respostas funcionais da assembleia, sendo estas mais evidentes na bacia Piranhas-Açu. O efeito combinado das flutuações do volume hídrico e das condições do habitat atuam como um filtro, limitando a coexistência de gêneros e funções. Promovendo diferentes respostas dependentes das características da bacia/reservatório, como um turnover moderado de espécies e funções ou turnover, mas funções similares em situações de maior seca e menor volume hídrico ou até mesmo homogeneização biótica nos períodos de maior volume.

Orientadores: Michela Borges, Maikon Di Domenico Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Para a avaliação da diversidade dos Echinodermata na porção sul do Embaiamento Sul Brasileiro (ESB) foram realizados: (i) levantamento e padrão de ocorrência das espécies registradas para o litoral do Paraná nos ambientes: estuários, plataforma continental interna, externa e talude em substratos consolidados e não consolidados; (ii) elaboração de guia de identificação das espécies de Echinodermata do litoral paranaense, contendo diagnoses, informações ecológicas, geográficas e ilustrações e (iii) análise do padrão de distribuição espacial da diversidade dos Echinodermata presentes no Complexo Estuarino de Paranaguá- PR (CEP) e na Baía de Babitonga-SC (BB), investigando se existe diferenças na diversidade desses organismos dentro e entre os sistemas estuarinos e quais fatores ambientais influenciam no padrão encontrado Foram consultados artigos, registros em teses não publicadas, relatórios técnicos, base de dados, coleções de museus científicos com informações do litoral do Paraná e norte de Santa Catarina. Adicionalmente realizaram-se 12 coletas qualitativas em diferentes locais do litoral paranaense, para complementar as informações levantadas. Como resultado foram inventariados 65 espécies distribuídas em 5 classes, 13 ordens, 28 famílias e 43 gêneros, o que representa aproximadamente 19% das espécies conhecidas no Brasil. Ophiuroidea foi o grupo com maior número de espécies (38) seguido de Echinoidea (12 spp.), Asteroidea (11 spp.), Holothuroidea (2 spp.) e Crinoidea (2 spp.). Quanto à distribuição, Ophiuroidea foi registrado com maior frequência nos estuários, plataforma interna e externa. Echinoidea e Asteroidea apresentaram maior riqueza especifica na plataforma interna até 50 m. Holothuroidea e Crinoidea foram as classes com menor número de registros e foram encontradas habitando preferencialmente substratos consolidados da plataforma interna. Para avaliar a diversidade dos Echinodermata presentes no CEP e na BB, foram empregadas análises univariadas e multivariadas, utilizando como varáveis resposta: riqueza e composição de espécies e os índices de diversidade beta (?SIM, ?SOR e ?NES) em relação aos fatores: setor halino, latitude, longitude e distância da boca do estuário (km), tipo de sedimento, profundidade (m), salinidade, tamanho médio do grão, grau de seleção, temperatura, teor de carbonato de cálcio e de matéria orgânica. Foi observado que a riqueza de espécies aumenta à medida que aumenta a salinidade, entretanto, o gradiente de profundidade e a modificação do sedimento explicaram melhor a variação da riqueza e composição de espécies quanto nos padrões de diversidade total (?SIM) e hierarquíca (?NES) observados. A diversidade ? no CEP foi determinada por substituição e uma pequena proporção de aninhamento de espécies e na BB foi determinada essencialmente por substituição de espécies. Como conclusão, podemos afirmar que os equinodermos do Complexo Estuarino de Paranaguá e da Baía da Babitonga apresentam um alto grau de especificidade apresentando consistente estruturação espacial e ambiental. Os resultados obtidos nesse trabalho poderão contribuir para o melhor conhecimento da biodiversidade dos equinodermos no sul do Brasil, especialmente para o litoral paranaense, servindo de base para futuros monitoramentos dos impactos antrópicos, amparando estratégias conservacionistas nos diferentes ecossistemas marinhos e gerando subsídios para futuros estudos de taxonomia, ecologia e áreas afins Abstract: Echinodermata¿s diversity of the southern part of the Bight South Brasileiro (SBB) was evaluated through: (i) checklist and occurrence patterns occurrence patterns of Echinodermata from estuaries, continental shelf and continental slope in consolidated and non-consolidated substratum; (ii) preparation an echinoderms identification guide; (iii) spatial distribution and diversity of echinoderm found in Estuarine Complex Paranaguá- PR (CEP) and Babitonga-SC Bay (BB), evaluating as environmental factors within and between estuaries may influence. To find echinoderms records were consulted, published articles, unpublished theses, technical reports, databases, collections of scientific museums, to the coast of Paraná and north of Santa Catarina. In addition, to complement the information gathered, 12 qualitative sampling campaigns were made in different regions of the Paraná coast. As a result were inventoried 65 species in five classes, 13 orders, 28 families and 43 genres, representing approximately 19% of known species in Brazil. Ophiuroidea was the group with the highest number of species (38) followed by Echinoidea (12 spp.), Asteroidea (11 spp.), Holothuroidea (2 spp.) and Crinoidea (2 spp.). Ophiuroidea was found more frequently in estuaries, continental shelf and slope on consolidated and unconsolidated substrates. Echinoidea and Asteroidea had greater specifies richness in the continental shelf (until 50 m). Holothuroidea and Crinoidea were the least records, inhabiting mainly consolidated substrates in the continental shelf. Univariate and multivariate analyses were performed, as response variable richness, species composition and beta diversity indices (?SIM, ?SOR and ?NES) in relation to the factors: estuarine sector, geographic coordinates, distance from the estuary mouth (km), sediment type, mean grain size, standard deviation (sorting), depth (m), salinity, calcium carbonate and organic matter. Echinoderms present in both estuaries showed variability dependent on depth and sediment. ? diversity in CEP was determined by turnover and a small proportion of nesting species and BB essentially by replacing species. This work contribute to a better knowledge of the echinoderm's biodiversity in southern Brazil. Providing the basis for future monitoring of human impacts, supporting conservation strategies in different marine ecosystems and generating insights for future studies taxonomy and ecology Mestrado Biodiversidade Animal Mestra em Biologia Animal

Orientadores: Thomas Michael Lewinsohn, Sergio Ricardo Floeter Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Os recifes são ecossistemas marinhos fortemente ameaçados. Pressões antrópicas desencadeiam mudanças ambientais e climáticas que interferem direta ou indiretamente na qualidade dos recifes. Estudos sobre ecossistemas marinhos ainda são escassos se comparados à vasta literatura acerca de ecossistemas terrestres. Compreender como a biodiversidade recifal está distribuída e quais os processos que agem sobre a estruturação das comunidades recifais é essencial para a conservação destes ecossistemas. Esta dissertação tem como objetivo investigar os padrões espaciais da distribuição da biodiversidade de organismos recifais no oceano Atlântico. Tais padrões possibilitam inferências acerca dos processos que estruturam as comunidades estudadas. O primeiro capítulo é composto por uma introdução geral da dissertação, que apresenta um referencial teórico e contextual para a compreensão das pesquisas desenvolvidas durante o mestrado. Nessa introdução, apresento brevemente as teorias sobre processos estruturadores de comunidades ecológicas e a contribuição da Biogeografia de Ilhas, Ecologia Funcional e Ecologia Filogenética para o estudo de padrões e processos em comunidades ecológicas. Em seguida, contextualizo a região de estudo, apresentando brevemente a história do oceano Atlântico e o conhecimento dos processos ecológicos e histórico-evolutivos que influenciam a estruturação das comunidades de peixes recifais desse oceano. O segundo capítulo, em forma de artigo científico, trata de padrões de biogeografia de ilhas de peixes recifais, gastrópodes e macroalgas. Neste estudo investiguei como a área de plataforma rasa, isolamento e idade geológica das ilhas oceânicas do Atlântico influenciam a riqueza de espécies e endemismo de organismos recifais que as compõem. Mostrei que os padrões de biogeografia de ilhas de organismos recifais são distintos daqueles encontrados para organismos terrestres e, ainda, que há especificidade taxonômica nos padrões de biogeografia de ilhas entre grupos de organismos recifais. O terceiro capítulo, também em forma de artigo científico, trata de padrões qualitativos da distribuição de duas famílias de peixes recifais (Labridae e Pomacentridae). O objetivo foi compreender a contribuição relativa do ambiente e posição espacial dos recifes na variação da diversidade de peixes recifais entre os recifes do Atlântico ocidental. Neste estudo, investigo como a betadiversidade taxonômica, funcional e filogenética desses organismos varia entre recifes, de acordo com a distância geográfica e a dissimilaridade ambiental entre eles. Os resultados mostraram que a variação na composição de peixes entre recifes do Atlântico ocidental é influenciada principalmente por filtros ambientais e fracamente influenciada por processos que causam autocorrelação espacial na distribuição da biodiversidade. Ainda, as variáveis ambientais que melhor explicaram a diversidade beta de peixes entre os recifes variou fortemente, principalmente entre escalas e regiões biogeográficas, mas também entre famílias de peixes recifais. A dissertação se completa com uma conclusão geral que sintetiza as principais fontes de variação nos padrões de distribuição de organismos recifais no oceano Atlântico (entre escalas, regiões biogeográficas, grupos taxonômicos ou aspectos da biodiversidade) e apresenta um resumo das evidências de processos ecológicos, histórico-evolutivos ou neutros na estruturação das comunidades recifais do oceano Atlântico Abstract: Reefs are among the most threatened marine systems on earth. Anthropic pressures lead to environmental and climate changes that are able to affect reefs quality, directly or indirectly. Compared to terrestrial ecosystems, marine ones are barely studied. The conservation of reef ecosystems requires the comprehension of reef biodiversity distributional patterns and the processes that modulate them. The aim of this study was to investigate spatial patterns on the distribution of reef biodiversity in the Atlantic Ocean. The study of these patterns allows the inference of processes that structure these communities. The first chapter comprises a general introduction that contextualizes and gives a theoretical framework for the comprehension of the research conducted in this thesis. In this introduction I briefly show the theories concerning processes that structure ecological communities and the potential contribution of Island Biogeography, Functional Ecology and Phylogenetic Ecology to the study of patterns and processes on ecological communities. Then, I contextualize the study region, briefly covering the history of the Atlantic Ocean and the knowledge on the ecological and historical-evolutionary processes that affect the structure of reef fish community in the Atlantic Ocean. In the second chapter, formatted in scientific paper style, I investigate the island biogeographic patterns of reef fish, gastropods and seaweeds. I tested how the shallow shelf area, isolation and geological age of Atlantic oceanic islands influence species¿ richness and endemism of reef organisms. I showed that the patterns observed in reef organisms are different from those observed in the terrestrial ones and, furthermore, that for reef organisms the patterns are taxon-dependent. The third chapter, also formatted in scientific paper style, explore qualitative patterns on the distribution of two families of reef fish (Labridae e Pomacentridae) in the Atlantic Ocean. The aim of this study was to understand the relative contribution of reef environment and spatial location to variation of fish diversity between reefs in the Western Atlantic Ocean. To this end I investigated how the taxonomic, functional and phylogenetic aspects of biodiversity of the two reef fish families vary with spatial distance or environmental dissimilarity between reefs. Results showed that the variation of reef fish composition in Western Atlantic reefs is mainly driven by environmental filters and weakly influenced by processes that cause spatial autocorrelation of species distributions. However, the environmental variables that best explained reef fish beta diversity varied strongly, especially between scales and biogeographical regions, but also between reef fish families. This thesis ends with a general conclusion about the main sources of variation in the patterns of distribution of reef organisms in the Atlantic Ocean (including variation due to scale, biogeographic region, taxonomic group or aspect of biodiversity), as well as with a summary of the evidences of ecological, historical-evolutionary and neutral processes in structuring reef communities in the Atlantic Ocean Mestrado Ecologia Mestra em Ecologia

Orientadores: Flavio Antonio Maës dos Santos, Maurício Bonesso Sampaio Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Padrões ecológicos, como a distribuição da diversidade de espécies, podem variar de acordo com a escala espacial em que são observados. Esta variação de padrões dependentes de escala é ainda mais perceptível quando o objeto de estudo apresenta grande heterogeneidade, pois nestes ambientes há vários fatores que influenciam a distribuição e a organização da diversidade de espécies, tanto localmente quanto regionalmente. O domínio fitogeográfico do Cerrado possui grande heterogeneidade de condições ambientais, o que acarreta em padrão de distribuição de espécies em mosaico, com poucas espécies amplamente distribuídas e a maioria das espécies sendo raras ou restritas a uma ou poucas localidades. Este trabalho teve como objetivo responder a questões relacionadas a padrões de diversidade entre fragmentos de Cerrado em escala espacial de 200 km². Visamos compreender a organização geográfica da diversidade de árvores e arbustos, assim como sua distribuição em diferentes escalas espaciais dentro da nossa área de estudo. Determinamos os processos (substituição ou aninhamento de espécies) que geram as diferenças de composição de espécies entre comunidades de diferentes fragmentos de Cerrado, em diferentes escalas. Para avaliar as questões propostas, utilizamos o método de ponto-quadrante (125 pontos em cada fragmento amostrado) para amostragem da diversidade de espécies arbustivo-arbóreas, aplicando desenho amostral hierárquico e multiescalar com três escalas (transeções, blocos e áreas). Calculamos os parâmetros fitossociológicos para seis áreas de Cerrado (Campo sujo, Cerrado ralo, Cerrado típico, Cerrado denso e Cerradão). Utilizamos o teste de Mantel para verificar a relação entre distância geográfica e similaridade composicional entre áreas. Houve maior semelhança florística entre as áreas que possuíam a mesma fisionomia (i.e. áreas com estrutura da vegetação semelhante), independentemente da distância geográfica a que se localizavam. O padrão de distribuição de diversidade em mosaico descrito para o domínio do Cerrado se reproduziu em escala espacial local. Inclusive, algumas espécies mais frequentes nos fragmentos amostrados estão entre as mais frequentes do Cerrado. Constatamos que a diversidade ? é a principal responsável pela grande diversidade de espécies do Cerrado, mesmo em escalas espaciais locais, e verificamos que esta diversidade ? é produzida quase completamente por substituição de espécies, e não por aninhamento. Concluímos que qualquer fragmento de vegetação deste domínio deve ser avaliado e, se preciso conservado para evitar extinção de espécies, pois a maioria das espécies do Cerrado tem distribuição restrita a uma ou poucas áreas, mesmo em escala local Abstract: Ecological patterns such as species richness distribution vary according to the spatial scale in which they are observed. This scale dependent pattern variation is even more prominent when the object of study shows great heterogeneity, because there are several factors in these environments that influence on species diversity distribution and organization both, locally and regionally. The Cerrado is a phytogeographic domain that experiences the influence of many environmental conditions that leads its species distribution to occur in mosaics, with few widespread species and most species occurring restricted to one or few localities, a pattern widely described for all the Cerrado vegetation. The objective of this study was to answer questions about the diversity patterns among Cerrado areas in 200 km² scale. These questions were related to the organization and distribution, at different spatial scales, of trees and shrubs diversity, and to the type of process, spatial turnover or nestedness patterns, that generate compositional differences among communities. We used the Point-Centered Quarter Method (with 125 points sampled per fragment) to survey all the trees and shrubs species that was included in our criterion (3 cm of diameter at the height of 30 cm of the soil surface), and applied a sampling design with three hierarchical spatial scales (transects, blocks and areas). We calculated phytosociological parameters for six fragments of Cerrado Lato Sensu. We used the Mantel test to evaluate how the geographical distance was correlated to the compositional similarity among areas. Areas of the same physiognomy type tended to present greater similarity, independently of the geographical distance. The pattern of species distribution described for all the Cerrado vegetation repeated itself for a local spatial scale, furthermore some of the widespread species found at local scale are the same described for the entire Cerrado domain. We have found that beta diversity is the more influential factor for the high species diversity in the Cerrado vegetation, even at local spatial scales. We also found that beta diversity is a product, almost exclusively, of species spatial turnover instead of nestedness patterns. Lastly, we have concluded that due to Cerrado diversity patterns at local spatial scales, described here, any fragment of vegetation on this domain must be evaluated and protected (if necessary) to avoid species extinction, since most of Cerrado tree and shrub species has its distribution restricted to one or few localities Mestrado Ecologia Mestre em Ecologia CAPES

Orientador: André Victor Lucci Freitas Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Estudos de diversidade que incluam as diferentes dimensões do ambiente são fundamentais para entender os processos que levam à estruturação das comunidades biológicas no tempo e no espaço. Em todo o mundo e especialmente na região tropical, o cenário de acelerada perda de biodiversidade, agravado pelas mudanças climáticas, torna urgente entender como as comunidades biológicas respondem às dimensões do seu habitat, o que ajuda a prever respostas a alterações no ambiente. A partir de dados de longo prazo de borboletas, um grupo muito utilizado como indicador biológico de alterações ambientais, o objetivo desta tese é entender a dinâmica das facetas da diversidade em distintas escalas do ambiente, focando em como a diversidade taxonômica e filogenética varia temporal e espacialmente. Um acompanhamento de três anos da uma comunidade de borboletas de um fragmento de Mata Atlântica do sudeste brasileiro mostrou que a comunidade como um todo apresenta flutuação sazonal da riqueza, com picos coincidentes com as transições entre período seco e chuvoso e vice-e-versa, mas que as famílias de borboletas apresentam padrões temporais distintos ao longo dos meses. Dentre elas, os Nymphalidae, e mais especificamente os ninfalídeos frugívoros, apresentaram padrões que mais proximamente refletem a variação da comunidade, o que suporta seu uso como indicadores biológicos temporais. Outros dois estudos de longo prazo, nos quais foi utilizado metodologia padronizada e replicável de armadilhas com isca para borboletas frugívoras, foram analisados nesta tese para entender a dinâmica temporal de comunidades tropicais verticalmente estruturadas. Esses estudos, um conduzido na Mata Atlântica Estacional do sudeste brasileiro por sete anos e outro numa floresta perene no leste de Uganda por seis anos, permitiram a comparação dos padrões de variação temporal das borboletas em dois estratos florestais (dossel e sub-bosque) em duas regiões biogeográficas distintas. A estruturação vertical foi mantida ao longo do tempo em ambas as florestas, porém as comunidades como um todo e os grupos de borboletas compartilhados entre elas não apresentaram padrões espaço-temporais congruentes, mostrando respostas diferentes das espécies tropicais às condições ambientais locais nas dimensões vertical e temporal do habitat. A betadiversidade temporal foi maior naqueles estratos que registraram menor número de indivíduos, mostrando uma relação inversa entre betadiversidade e abundância. Considerando os três estudos de longo prazo, foi possível observar que não existe uma relação direta entre a flutuação temporal da diversidade de espécies e a de linhagens, mas que existe uma congruência na betadiversidade de ambas as facetas da diversidade. A variação das comunidades no tempo foi claramente sazonal nas áreas neotropicais e mais homogênea na floresta afrotropical. Temperatura e precipitação foram relacionadas à segregação temporal da comunidade de borboletas nas três áreas estudadas, mas isto não foi mediado pela filogenia, ou seja, a relação de parentesco entre as espécies não determina a relação destas com o clima. Em comunidades estruturadas verticalmente, efeitos de clima somente foram observados nos ambientes onde a betadiversidade de borboletas é maior, sugerindo que o clima atua diferentemente ao longo da dimensão vertical das florestas tropicais Abstract: Studies on biological diversity may include the distinct dimensions of habitat to better understand the processes that lead to biological community structure in space and time. The worldwide scenario of accelerated biodiversity loss and climate change makes it urgent to understand how biodiversity respond to dimensions of its habitat in order to predict responses to environmental change, especially in the Tropics. Based on long-term data of butterflies, a common group used as biological indicators to environmental disturbance, the aim of this thesis is to understand the dynamics of biodiversity facets in different habitat scales, focusing in how taxonomic and phylogenetic diversity varies temporally and spatially. A three-year monitoring of a whole butterfly community in an Atlantic Forest fragment in Southeastern Brazil revealed a seasonal fluctuation pattern of the community, with species richness peaks during transitions between dry and rainy season and vice-versa, but butterfly families showed distinct temporal patterns throughout months. The whole Nymphalidae family and the fruit-feeding nymphalids showed a temporal pattern that better reflects the community variation, supporting its use as temporal biological indicators. Two other long-term studies, in which standardized and replicable bait traps for frugivorous butterflies were used, were analyzed in this thesis to understand the temporal dynamics of vertically structured tropical communities. In these studies, the first carried out in the seasonal Atlantic Forest in Southeastern Brazil throughout seven years, and the second carried out in an evergreen forest in Eastern Uganda for six years, the temporal variation of butterfly communities distributed in two forest strata (canopy and understory) were compared in two distinct biogeographic regions. In both forests, the vertical structures were maintained temporally, however the community of each forest and the shared groups showed non-congruent patterns, indicating distinct responses of tropical species to local environmental conditions in temporal and spatial dimensions. Temporal betadiversity was higher in the less abundant strata, indicating an inverse relation between betadiversity and abundance. The three studies together showed no relation between taxonomic and phylogenetic diversities throughout time but betadiversity patterns were congruent among these two diversity facets. Temporal fluctuation was clearly seasonal for the Neotropical communities and more homogenous for the Afrotropical community. Rainfall and temperature were related to temporal segregation of species in all three butterfly communities studied, but the relation of community variation and climate was not determined by the phylogenetic relation among species. In vertically structured butterfly communities, climate effects were only observed in strata with high betadiversity, suggesting that abiotic factors affect differently the vertical dimension of tropical forests Doutorado Ecologia Doutora em Ecologia CNPQ 141443/2018-9 CAPES

The Cerrado has high plant diversity, however, it is one of the most threatened biomes on the planet, being considered as one of the priority areas for conservation. In this sense, o objective was to evaluate the floristic and structural diversity of an area of ​​the Cerrado of future expansion of silviculture, at Fazenda Campeira, municipality of Jerumenha-PI. The forest inventory was carried out in 10 plots (20 x 50m). Phytosociology was assessed using individuals with DNS ≥ 3cm. for phytosociology and individuals in the vicinity or below the inclusion criteria for floristics, with measures of total height also being observed. 55 species were found, of these, 42 sampled in the phytosociological survey. The most representative species were: Fabaceae (198), Vochysiaceae (127) and Malpighiaceae (77) individual. The most important species were: Pouteria ramiflora (Mart.) Radlk.; Qualea parviflora Mart.; Byrsonima crassifolia (L.) Kunth.; Plathymenia reticulata Benth.; Pterodon abruptus (Moric.) Benth. The average height of the specimens was 4.54 ± 2.55m and the diametric structure was 12.25 ± 9.95cm. The density and basal area values ​​were 724 ind.ha-1 and 15, 874 m²/ha, respectively, with a Shannon diversity index (H') was 3.22 nats/ind. The region showed high diversity and considering the advance of deforestation in the region, taxonomic and ecological knowledge of these areas is necessary, as it is possible to glimpse measures for the recovery and conservation of the cerrados. El Cerrado tiene una alta diversidad vegetal, sin embargo, es uno de los biomas más amenazados del planeta, siendo considerado como una de las áreas prioritarias para la conservación. En este sentido, el objetivo fue evaluar la diversidad florística y estructural de un área del Cerrado de futura expansión de la silvicultura, en Fazenda Campeira, municipio de Jerumenha-PI. El inventario forestal se realizó en 10 parcelas (20 x 50m). La fitosociología se evaluó utilizando individuos con DNS ≥ 3cm. para fitosociología y personas cercanas o por debajo de los criterios de inclusión para florística, y también se observaron medidas de altura total. Se encontraron 55 especies, de estas, 42 muestreadas en el estudio fitosociológico. Las especies más representativas fueron: Fabaceae (198), Vochysiaceae (127) y Malpighiaceae (77) individuales. Las especies más importantes fueron: Pouteria ramiflora (Mart.) Radlk.; Qualea parviflora Mart.; Byrsonima crassifolia (L.) Kunth.; Plathymenia reticulata Benth.; Pterodon abruptus (Moric.) Benth. La altura promedio de los especímenes fue de 4.54 ± 2.55, la estructura diametral fue de 12.25 ± 9.95 cm. Los valores de densidad y área basal fueron 724 ind.ha-1 y 15, 874 m²/ha, respectivamente, con un índice de diversidad de Shannon (H') de 3.22 nats/ind. La región mostró una gran diversidad y considerando el avance de la deforestación en la región, es necesario el conocimiento taxonómico y ecológico de estas áreas, ya que es posible vislumbrar medidas para la recuperación y conservación de los cerrados. O Cerrado apresenta elevada diversidade vegetal, entretanto, é um dos biomas mais ameaçados do planeta, sendo considerado como uma das áreas prioritárias para a conservação. Nesse sentido, objetivou-se avaliar a diversidade florística e estrutural de uma área do Cerrado de futura expansão da silvicultura, na Fazenda Campeira município de Jerumenha-PI. O inventario florestal, foi realizado em 10 parcelas (20 x 50m). A fitossociologia foi avaliada por intermédio de indivíduos com DNS ≥ 3cm. para a fitossociologia e indivíduos nos arredores ou baixo do critério de inclusão para florística, sendo observadas também medidas de altura total. Foram encontradas 55 espécies, destas, 42 amostradas no levantamento fitossociológico. As espécies com maior representatividade foram: Fabaceae (198), Vochysiaceae (127) e Malpighiaceae (77) indivíduo. As espécies de maior valor de importância foram: Pouteria ramiflora (Mart.) Radlk.; Qualea parviflora Mart.; Byrsonima crassifolia (L.) Kunth.; Plathymenia reticulata Benth.; Pterodon abruptus (Moric.) Benth. A altura média dos espécimes foi 4.54 ± 2.55m e a estrutura diamétrica com 12.25 ± 9.95cm. Os valores de densidade e de área basal foram 724 ind.ha-1 e 15, 874 m2/ha, respectivamente, com um índice de diversidade de Shannon (H’) foi de 3,22 nats /ind. A região apresentou elevada diversidade e considerando o avanço do desmatamento na região, faz-se necessário conhecimento taxonômico e ecológico dessas áreas, pois é possível vislumbrar medidas de recuperação e conservação dos cerrados.

O Cerrado apresenta elevada diversidade vegetal, entretanto, é um dos biomas mais ameaçados do planeta, sendo considerado como uma das áreas prioritárias para a conservação. Nesse sentido, objetivou-se avaliar a diversidade florística e estrutural de uma área do Cerrado de futura expansão da silvicultura, na Fazenda Campeira município de Jerumenha-PI. O inventario florestal, foi realizado em 10 parcelas (20 x 50m). A fitossociologia foi avaliada por intermédio de indivíduos com DNS ≥ 3cm. para a fitossociologia e indivíduos nos arredores ou baixo do critério de inclusão para florística, sendo observadas também medidas de altura total. Foram encontradas 55 espécies, destas, 42 amostradas no levantamento fitossociológico. As espécies com maior representatividade foram: Fabaceae (198), Vochysiaceae (127) e Malpighiaceae (77) indivíduo. As espécies de maior valor de importância foram: Pouteria ramiflora (Mart.) Radlk.; Qualea parviflora Mart.; Byrsonima crassifolia (L.) Kunth.; Plathymenia reticulata Benth.; Pterodon abruptus (Moric.) Benth. A altura média dos espécimes foi 4.54 ± 2.55m e a estrutura diamétrica com 12.25 ± 9.95cm. Os valores de densidade e de área basal foram 724 ind.ha-1 e 15, 874 m2/ha, respectivamente, com um índice de diversidade de Shannon (H’) foi de 3,22 nats /ind. A região apresentou elevada diversidade e considerando o avanço do desmatamento na região, faz-se necessário conhecimento taxonômico e ecológico dessas áreas, pois é possível vislumbrar medidas de recuperação e conservação dos cerrados.

Submitted by Lais Samira Correia Nunes (lais.nunes@unesp.br) on 2020-09-23T18:56:19Z No. of bitstreams: 1 LaisSCNunes_2020_Tese.pdf: 9510345 bytes, checksum: 177d2f228d29ecc4e75e590c5f59e99d (MD5) Rejected by Adriana Ap. Puerta Buzzá (dripuerta@rc.unesp.br), reason: Prezada Laís, O documento enviado para a coleção Campus Unesp Rio Claro foi recusado pelo(s) seguinte(s) motivo(s): - Capa e página de rosto - ao final da página - falta constar a cidade de defesa. O correto é: Rio Claro - SP e na linha debaixo - 2020. - Ficha catalográfica está desconfigurada e fora do padrão. Necessário refazer no site e atentar quanto ao tamanho da fonte, pois parte do texto está fora do quadrado. Site https://www.biblioteca.unesp.br/ficha/. Não alterar, acrescentar ou excluir qualquer informação. A ficha deve ser colocada idêntica ao que o sistema gerar. - Agradecimentos: A Portaria nº 206, de 04/09/2018 Dispõe sobre obrigatoriedade de citação da CAPES nos agradecimentos da seguinte forma: Art. 3º Deverão ser usadas as seguintes expressões, no idioma do trabalho (Não alterar, acrescentar ou excluir qualquer informação. A frase deve ser colocada idêntica ao que consta na Portaria): "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001". Maiores informações: http://ib.rc.unesp.br/Home/Biblioteca37/repositorio_fluxograma_unesp_rioclaro.jpg Agradecemos a compreensão e aguardamos o envio do novo arquivo. Atenciosamente, Biblioteca Campus Rio Claro – E-mail: stati.rc@unesp.br Repositório Institucional UNESP https://repositorio.unesp.br on 2020-10-02T15:33:48Z (GMT) Submitted by Lais Samira Correia Nunes (lais.nunes@unesp.br) on 2020-10-06T13:22:37Z No. of bitstreams: 1 LaisSCNunes_2020_Tese.pdf: 9510685 bytes, checksum: defb56f875a55b06e64382d74abf28ee (MD5) Approved for entry into archive by Adriana Ap. Puerta Buzzá (dripuerta@rc.unesp.br) on 2020-10-16T01:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 nunes_lsc_dr_rcla.pdf: 9510685 bytes, checksum: defb56f875a55b06e64382d74abf28ee (MD5) Made available in DSpace on 2020-10-16T01:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 nunes_lsc_dr_rcla.pdf: 9510685 bytes, checksum: defb56f875a55b06e64382d74abf28ee (MD5) Previous issue date: 2020-09-03 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Esta tese de doutorado teve como objetivo estudar a diversidade, a competição interespecífica e a distribuição espacial de macrófitas aquáticas em rios costeiros do estado de São Paulo, através de estudos em campo (oito rios costeiros) e de experimentos em casa de vegetação. Nós elaboramos um inventário de espécies e de formas de vida de macrófitas aquáticas nos rios costeiros e encontramos um total de 45 táxons, 24 famílias e 6 formas de vida. As macrófitas emergentes foram mais frequentes e encontradas em todos os rios, porém as flutuantes e submersas foram registradas em somente dois rios. Nós observamos um gradiente de distribuição de espécies no gradiente norte-sul do litoral, com apenas 4 espécies ocorrendo em grande parte do trecho estudado e 43,5% dos táxons ocorrendo em somente um dos rios amostrados. Nós observamos que as diferenças de características das planícies costeiras (largura e inclinação) ao longo do litoral influenciam as características dos rios costeiros, especialmente sua heterogeneidade ambiental, seus comprimentos e seus gradientes longitudinais de salinidade. Nós encontramos que a heterogeneidade ambiental influencia positivamente a riqueza de formas de vida de macrófitas e a variação na composição de espécies entre os rios, no entanto, não influencia a riqueza de espécies. Os rios costeiros com heterogeneidade ambiental semelhante foram aqueles com maior similaridade na composição de espécies de macrófitas aquáticas independentemente de suas distâncias geográficas. Nós observamos elevada diversidade beta de espécies e de formas de vida de macrófitas aquáticas em escala local e regional. Na escala local, o turnover de espécies e o aninhamento de formas de vida foram explicados pelos gradientes ambientais longitudinais dos rios. Na escala regional, a diversidade beta de formas de vida foi explicada pelo comprimento dos rios; no entanto, a variação de espécies pareceu estar mais relacionada a fatores bióticos e históricos na dispersão e colonização. A partir dos estudos em campo, nós concluímos que as diferenças nas características das planícies costeiras promovem diferentes características ambientais nos rios costeiros que levam à formação de diferentes comunidades e padrões de diversidade e distribuição espacial de macrófitas aquáticas ao longo do litoral de São Paulo. Em relação aos estudos experimentais, nós encontramos que a competição entre as macrófitas emergentes Spartina alterniflora e Crinum americanum em sedimento natural de baixo e médio estuário do rio Itanhaém não é dependente das densidades iniciais de indivíduos jovens, pois S. alterniflora apresentou maior habilidade do que C. americanum em qualquer densidade nos dois tipos de sedimento. Nós encontramos também que a distribuição e a organização dos bancos destas espécies no estuário do rio Itanhaém podem ter siso influenciadas por suas ordens de chegada na colonização e efeitos de prioridade, pois indivíduos jovens não se estabeleceram em culturas heteroespecíficas de indivíduos adultos. Em experimento com substrato artificial, nós encontramos que a salinidade não foi limitante para o crescimento em monocultura de S. alterniflora e C. americanum e não influenciou o conteúdo de nitrogênio total em S. alterniflora. No entanto, em maior salinidade (30), C. americanum apresentou maior conteúdo de nitrogênio total em relação à condição não salina (0), possivelmente, como uma estratégia de tolerância à salinidade. No tratamento de maior salinidade ocorreu competição interespecífica assimétrica com maior habilidade competitiva de S. alterniflora. Os resultados de nossos experimentos sugerem que, possivelmente, em baixo estuário do rio Itanhaém C. americanum foi excluída competitivamente por S. alterniflora independentemente de suas densidades de colonização, e que em médio estuário a ordem de chegada destas espécies tem importância para a organização de seus bancos mistos. This Ph.D. thesis aimed to study the diversity, interspecific competition and spatial distribution of aquatic macrophytes in coastal rivers in the São Paulo State, through field studies (eight coastal rivers) and greenhouse experiments. We elaborated an inventory of macrophyte species and life forms in the coastal rivers and found a total of 45 taxa, 24 families and 6 life forms. The emergent macrophytes were the most frequent ones and they were found in all rivers, but the floating and submerged macrophytes were recorded in only two rivers. We observed a gradient of species distribution in the north-south gradient of the coast, with only 4 species occurring in a large part of the studied coastal length and 43.5% of the taxa occurring in only one of the sampled rivers. We observed that the differences in the characteristics of the coastal plains (width and slope) influence the characteristics of the coastal rivers, especially their environmental heterogeneity (EH), lengths and longitudinal salinity gradients. We found that EH positively influences life form richness and species composition variation among the rivers; however, it does not drive species richness. The coastal rivers with similar EH were those with the greatest similarity in species composition regardless of their geographical distances. We observed great beta diversity of macrophyte species and life forms at local and regional scales. At the local scale, the species turnover and life form nestedness were explained by the rivers’ longitudinal environmental gradients. At the regional scale, the life form beta diversity was explained by rivers’ length; however, species composition variation was probably related to biotic and historical factors in dispersion and colonization. From the field studies, we conclude that the differences in the characteristics of the coastal plains promote different environmental characteristics of the coastal rivers and lead to different communities and patterns of diversity and spatial distribution of aquatic macrophytes along the São Paulo coastal region. In relation to the experimental studies, we found that the competition between the emergent macrophytes Spartina alterniflora and Crinum americanum in natural sediment of the lower and middle Itanhaém River Estuary is not density-dependent of young individuals, as S. alterniflora had greater ability than C. americanum in any density in both sediment types. We also found that the distribution and stand organization of these species in the Itanhaém River Estuary may be influenced by their arrival order in colonization and priority effects, as young individuals did not establish themselves in heterospecific cultures of adult individuals. In an experiment using artificial substrate, we found that salinity was not limiting for the S. alterniflora and C. americanum growth in monoculture and it did not influence the S. alterniflora total nitrogen content. However, in higher salinity (30), C. americanum had higher total nitrogen content in relation to the treatment with no salt addition (0), possibly as a strategy of salt tolerance. In the higher salinity treatment, asymmetric interspecific competition occurred with greater competitive ability of S. alterniflora. The results of our experiments suggest that, possibly, in the lower Itanhaém River Estuary C. americanum was competitively excluded by S. alterniflora regardless of their colonization densities, and that in the middle estuary the arrival order was important for the organization of their mixed stands. FAPESP: 16/01416-4. CAPES: 001.

Submitted by Jeferson Carlos da Veiga Rodrigues (jveigar@unisinos.br) on 2021-01-05T16:32:32Z No. of bitstreams: 1 Roberta Cozer Bacca_.pdf: 2407679 bytes, checksum: 1e8d6117658e34a137da93d98c6c523e (MD5) Made available in DSpace on 2021-01-05T16:32:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Roberta Cozer Bacca_.pdf: 2407679 bytes, checksum: 1e8d6117658e34a137da93d98c6c523e (MD5) Previous issue date: 2020-10-27 CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Espécies não apresentam distribuições similares e uniformes ao longo de gradientes ambientais, em função de restrições bióticas e abióticas. Porém, os efeitos de muitos gradientes ambientais sobre a estrutura de comunidades animais ainda permanecem desconhecidos. Macroinvertebrados aquáticos são importantes representantes de ecossistemas de áreas úmidas, e suas comunidades são influenciadas pelo período de duração da água e por processos locais, regionais e espaciais. Neste sentido, o objetivo geral da tese foi analisar a diversidade beta e avaliar a influência de gradientes espaciais sobre as estruturas taxonômica e funcional de comunidades de macroinvertebrados aquáticos em áreas úmidas costeiras do Sul do Brasil nos biomas Mata Atlântica e Pampa. Em relação a diversidade beta, as comunidades de macroinvertebrados foram estudadas em 24 lagoas na Planície Costeira dos estados nos estados de SC e RS, distribuídas ao longo de um gradiente latitudinal. Avaliamos a influência de fatores locais (qualidade da água e estrutura do habitat) e fatores regionais (clima) sobre a diversidade beta de comunidades de macroinvertebrados. Nosso estudo demonstrou que as diferenças na composição de espécies entre áreas úmidas são mais fortemente influenciadas pelas diferenças ambientais do que pela distância geográfica entre as áreas úmidas.Tratando-se da análise taxonômica e funcional de macroinvertebrados aquáticos, as comunidades foram estudadas em 12 lagoas distribuídas ao longo de um gradiente latitudinal na Planície Costeira dos estados de SC e RS, entre os biomas Pampa e sul da Mata Atlântica, em dois anos (2015 e 2016). Em relação as análises taxonômicas, nosso estudo demonstrou que as diferenças na composição de espécies entre áreas úmidas são influenciadas tanto pelas variáveis ambientais locais quanto pelas regionais e espaciais. Para a categorização funcional os gêneros foram classificados quanto aos traços de voltinismo, dispersão, hábitos, grupos tróficos e tamanho máximo corporal. Avaliou-se também os efeitos relativos do ambiente, do clima e do bioma sobre a estrutura funcional da comunidade. Nosso estudo demonstrou que as diferenças na estruturação funcional de espécies entre áreas úmidas são influenciadas tanto pelas variáveis ambientais locais quanto pelas regionais e espaciais. Esses resultados contribuem para a ecologia de áreas úmidas e para uma melhor compreensão das interações entre áreas úmidas e macroinvertebrados aquáticos. Species do not have similar and uniform distributions along environmental gradients, due to biotic and abiotic restrictions. However, the effects of many environmental gradients on the structure of animal communities are still unknown. Aquatic macroinvertebrates are important representatives of wetland ecosystems, and their communities are influenced by the duration of the water and local, regional and spatial processes. In this sense, the general objective of the thesis was to analyze the beta diversity and evaluate the influence of spatial gradients on the taxonomic and functional structures of aquatic macroinvertebrate communities in coastal wetlands in southern Brazil in the Atlantic Forest and Pampa biomes. In relation to beta diversity, macroinvertebrate communities were studied in 24 lagoons on the coastal plain of the states in the states of SC and RS, distributed along a latitudinal gradient. We assessed the influence of local factors (water quality and habitat structure) and regional factors (climate) on the beta diversity of macroinvertebrate communities. Our study demonstrated that differences in species composition between wetlands are more strongly influenced by environmental differences than by geographic distance between wetlands. In terms of taxonomic and functional analysis of aquatic macroinvertebrates, communities were studied in 12 distributed ponds along a latitudinal gradient in the Coastal Plain of the states of SC and RS, between the Pampa and southern Atlantic Forest biomes, in two years (2015 and 2016). Regarding taxonomic analyzes, our study demonstrated that differences in species composition between wetlands are influenced by both local, regional and spatial environmental variables. For functional categorization, the genders were classified according to the characteristics of voltinism, dispersion, habits, trophic groups and maximum body size. The relative effects of the environment, climate and biome on the functional structure of the community were also evaluated. Our study demonstrated that the differences in the functional structuring of species between wetlands are influenced by both local, regional and spatial environmental variables. These results contribute to the ecology of wetlands and to a better understanding of the interactions between wetlands and aquatic macroinvertebrates.

Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-15T19:22:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-15T19:22:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-15T19:22:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-15T19:22:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Rejected by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br), reason: Prezado Bruno, realize a seguinte alteração e faça uma nova submissão no Repositório: - Indicar na folha de rosto que a pesquisa foi financiada pela FAPESP. Veja um exemplo em: "Tutorial para confecção dos exemplares" (https://www.assis.unesp.br/#!/ensino/pos-graduacao/orientacoes/defesa/) Qualquer dúvida, entre em contato por email: laura.inafuko@unesp.br on 2020-04-15T19:50:51Z (GMT) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-15T19:22:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Rejected by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br), reason: Prezado Bruno, realize a seguinte alteração e faça uma nova submissão no Repositório: - Indicar na folha de rosto que a pesquisa foi financiada pela FAPESP. Veja um exemplo em: "Tutorial para confecção dos exemplares" (https://www.assis.unesp.br/#!/ensino/pos-graduacao/orientacoes/defesa/) Qualquer dúvida, entre em contato por email: laura.inafuko@unesp.br on 2020-04-15T19:50:51Z (GMT) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-15T19:22:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Rejected by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br), reason: Prezado Bruno, realize a seguinte alteração e faça uma nova submissão no Repositório: - Indicar na folha de rosto que a pesquisa foi financiada pela FAPESP. Veja um exemplo em: "Tutorial para confecção dos exemplares" (https://www.assis.unesp.br/#!/ensino/pos-graduacao/orientacoes/defesa/) Qualquer dúvida, entre em contato por email: laura.inafuko@unesp.br on 2020-04-15T19:50:51Z (GMT) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Rejected by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br), reason: Prezado Bruno, realize a seguinte alteração e faça uma nova submissão no Repositório: - Indicar na folha de rosto que a pesquisa foi financiada pela FAPESP. 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No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Rejected by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br), reason: Prezado Bruno, realize a seguinte alteração e faça uma nova submissão no Repositório: - Indicar na folha de rosto que a pesquisa foi financiada pela FAPESP. Veja um exemplo em: "Tutorial para confecção dos exemplares" (https://www.assis.unesp.br/#!/ensino/pos-graduacao/orientacoes/defesa/) Qualquer dúvida, entre em contato por email: laura.inafuko@unesp.br on 2020-04-15T19:50:51Z (GMT) Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Submitted by Bruno Sandri Souza (bruno.sandri@unesp.br) on 2020-04-17T16:23:46Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_brunosandri.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Approved for entry into archive by Laura Akie Saito Inafuko (linafuko@assis.unesp.br) on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 Made available in DSpace on 2020-04-17T18:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_bs_me_assis.pdf: 4781955 bytes, checksum: a229f333650456ef52de565fe0f1bf18 (MD5) Previous issue date: 2020-03-12 A ecologia geográfica atua na busca por padrões da diversidade biológica que podem ser mapeados, sendo que o mapeamento de diferentes métricas compreende em um dos padrões da macroecologia como a determinação da distribuição global da diversidade beta de diversos organismos. O objetivo deste trabalho foi mapear o padrão de distribuição dos índices diversidade beta dos anuros da Mata Atlântica e do Cerrado utilizando 3 métodos de mapeamento; point-to-grid (PTG), mapas de extensão de ocorrência (EOO) e modelagem de nicho climático (ENM) e comparar esses a congruência desses padrões em cada método e avaliar como estruturação da diversidade beta com os componentes “aninhamento” e ‘’troca de espécies’’ variam de acordo com cada mapeamento. O método PTG, por ser um método de caráter pontual, vemos maior proporção de ausência de dados de ocorrência no sistema de grids das duas regiões. No Cerrado vemos valores altos da contribuição local da diversidade beta (Local Contribution to beta diversity: LCBD) nas regiões de ecótones enquanto na Mata Atlântica vemos valores maiores nas regiões costeiras. Os métodos ENM e EOO apresentaram uma congruência maior entre si do que com o método PTG nas duas regiões. A estruturação da diversidade beta mostrou que os métodos ENM e EOO apresentam valores maiores para o componente de “troca de espécies”, mas não tão alto do que a diversidade beta gerada por PTG. Com isso podemos ver que todos os métodos possuem seus defeitos e qualidadem, porém, na urgência dos estudos de diversidade de regiões ameaçadas como o Cerrado e a Mata Atlântica, recomendados o uso dos mapas de ENM e EOO. The geographical ecology aims to seek patterns of biological diversity that can be put on a map, such as the mapping of beta diversity gradients in a biogeographical scale of a range of organisms. The aim of this Dissertation is to map the distribution patterns of anuran beta diversity in the Atlantic Forest and Cerrado generated by three different mapping methods: point-to-grid (PTG), extent of occurrence maps (EOO), and ecological niche modelling (ENM), so we were able to compare the congruence of the beta diversity index generated by these different mapping methods. Moreover, we evaluate the turnover and nestedness components of the beta diversity among the mapping methods. PTG maps generated the most incongruent mapsprobably due to the punctual characteristics of species occurrences, so EEO and ENM generated similar beta diversity estimates for the Atlantic Forestand Cerrado. High beta diversity values in the Cerradowere recorded in ecotone regions, whereas in the Atlantic Forestthe highest beta diversity values were found along the Atlantic coast. The structure of beta diversity of PTG showed way too high values of importance for the turnover component compared to the EEO and ENM maps, which also recorded higher importance for turnover. Our results suggest that, for biogeographical and macroecological purposes, the use of PTG maps is unsuitable due to the high rates of omission erros. Then, in light of urgency of biogeographical conservation studies of threatened regions, such as the Atlantic Forestand Cerrado, we recommend the use of ENM and EEO maps.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES One of the main focuses of macroecological studies is to understand the spatial variation and, in addition, to evaluate which are the predictors that shape this variation among terrestrial, freshwater and marine ecosystems. Diversity can be measured by its taxonomic and functional value. Also, this diversity can be partitioned into alpha, beta and gama. Beta diversity corresponds to the difference of species composition or functional traits between pairs of communities e can be divided in turnover and nestedness components. Turnover is the substitution of species/functional traits between areas, being associated with species dispersal. Marine biodiversity can also be measured through variations of species and functions, that them perform. Reef areas are one of the main marine biodiversity centers in the world and have a high diversity of marine organisms, among them the reef fish. Reef fish corresponds to more than 6.000 species with a wide distribution throughout the oceans and it performs essential functions for the maintenance of reef ecosystems. The dissimilarity values between communities of tropical reef fish have been used to delimit biogeographic regions and to evaluate differences (i.e., beta diversity) in taxonomic, functional and phylogenetic compositions. Moreover, there is studies relating beta-diversity patterns to environmental variables at local and regional scales. Thus, the main aims of this dissertation are: (i) to investigate taxonomic and functional beta diversity patterns of reef fish assemblages on a global scale; (ii) to evaluate the congruence between taxonomic and functional and taxonomic beta diversity between pairs of reef fish assemblages; and (iii) to determine the relative importance of environmental predictors in patterns of taxonomic and functional beta diversity. Moreover, it is essential to know if the same predictor variables shape beta taxonomic and functional diversity in different realms and biogeographic regions. Um dos principais focos dos estudos macroecológicos é entender a variação espacial da diversidade de espécies e, além disso, avaliar quais são os preditores que a moldam ao longo dos ecossistemas terrestres, dulcícolas e marinhos. A diversidade pode ser mensurada tanto pelo seu valor taxonômico, quanto pelo seu valor funcional. Essa diversidade pode ser particionada em diversidades alfa, beta e gama. A diversidade beta corresponde a diferença na composição de espécies ou atributos funcionais entre pares de comunidades e pode ser dividida em turnover ou nestedness (aninhamento). O turnover corresponde à substituição de espécies/atributos funcionais entre áreas, sendo este padrão relacionado a dispersão de espécies. A biodiversidade marinha também pode ser mensurada através das variações nas espécies e funções que desempenham. Um dos principais centros de diversidade marinha são os ambientes recifais, onde encontram-se os peixes recifais. Os peixes recifais correspondem a mais de 6.000 espécies com ampla distribuição ao longo dos oceanos onde desempenham inúmeras funções essenciais para a manutenção do ecossistema recifal. Os valores de dissimilaridade entre comunidades de peixes recifais tropicais vem sendo utilizados para delimitar regiões biogeográficas e, também, avaliar diferenças (i.e., diversidade beta) nas composições taxonômica, funcional e filogenética. Todavia, ainda não foram conduzidos estudos que avaliam as diferenças na composição de espécies e funções em ampla escala. Dessa forma, os objetivos principais desta dissertação são: (i) avaliar os padrões de diversidade beta taxonômica e funcional de assembleias de peixes recifais em escala global; (ii) investigar a congruência entre diversidade beta taxonômica e funcional entre pares de assembleias de peixes recifais; e (iii) determinar a importância relativa dos preditores ambientais nos padrões de diversidade beta taxonômica e funcional. Além disso, é essencial saber se as mesmas variáveis preditoras influenciam os padrões de diversidade beta taxonômica e funcional em diferentes realms marinhos e regiões biogeográficas.

Na Caatinga a heterogeneidade espacial das diferentes ecorregiões e fitofisionomias, bem como a sazonalidade das chuvas e os pulsos dos recursos alimentares, foram atribuídos como fatores chaves no controle da estrutura e a dinâmica das assembleias de morcegos nesta floresta seca. Quase 95% do estado do Rio Grande do Norte (RN) corresponde à Caatinga, que abriga abundantes cavidades subterrâneas (~ 1000 cavernas). Como os padrões de diversidade espacial e temporal da fauna de morcegos são praticamente desconhecidos na Caatinga, o objetivo principal desta tese foi explorar os padrões espaciais e temporais de riqueza, abundância e composição de espécies de assembleias de morcegos em diferentes paisagens, fitofisionomias e em seus abrigos em cavernas. No Capítulo 1, explorei a riqueza e diversidade espacial e temporal na composição espécies e trófica de morcegos através de capturas com redes de neblina em 5 habitats diferentes de Caatinga em seis regiões do RN. Em 99 noites de amostragem, capturei 1575 indivíduos de 31 espécies, com um esforço de captura de 242 425 hm2 . Foram encontradas diferenças na composição de especeis e guildas tróficas entre as assembleias tanto nas diferentes áreas de estudo como nos diferentes habitats amostrados, provavelmente relacionadas às preferências ecológicas especificas das espécies e pelas características da paisagem de cada área. A riqueza e a composição das espécies não apresentaram variação sazonal, e abundância variou pouco entre as estações. Os recursos alimentares encontrados ao longo do ano podem ser o principal fator que sustenta uma estrutura semelhante da assembleia durante a estação seca e chuvosa. No capítulo 2, monitorei nove cavernas em quatro regiões da Caatinga do RN para examinar os efeitos das estações e do tamanho das cavernas sobre a riqueza, abundância e composição das espécies de morcegos cavernícolas. Utilizando dois métodos, registramos 17 espécies de morcegos em 2020 indivíduos capturados e 3200 indivíduos observados durante 61 dias de amostragem. A riqueza e a composição das espécies não mudaram sazonalmente e não foi encontrado um recambio temporal das espécies entre as estações. Um aumento na abundância geral de morcegos foi encontrado na estação chuvosa, principalmente pelos insetívoros, e alguns nectarívoros, especificamente no final da estação chuvosa. Foi encontrada uma interação entre as estações e o tamanho da caverna. Na estação chuvosa, as cavernas maiores tenderam a variar mais em abundância do que as cavernas menores provavelmente pela maior capacidade de carga das cavernas maiores (maior espaço e diversidade de microclimas). No entanto, a composição das espécies entre cavernas grandes e pequenas foi diferente. Em geral, o aumento sazonal da abundância nas cavernas é provavelmente atribuído à disponibilidade temporária de recursos alimentícios e a fins reprodutivos. Os morcegos frugívoros, insetívoros e animalívoros foram reprodutivamente ativos durante a estação chuvosa, onde seu alimento preferido é mais abundante. Enquanto aos sanguinívoros, onívoros e nectarívoros estiveram reprodutivamente ativos durante as duas estações já que seus recursos alimentícios estiveram disponíveis durante o ano todo. Já no capítulo 3, fiz uma revisão taxonômica em coleções e uma revisão bibliográfica para determinar a diversidade gamma de morcegos no RN resultando na primeira lista oficial de morcegos do estado, incluindo novos registros e discussões sobre áreas de conservação e áreas de pesquisa prioritária. Como resultado geral desta tese, consegui registar 32 espécies de 3595 indivíduos capturados e mais de 3200 morcegos observados durante 161 dias de amostragem. O analises dos dados indicam que, em geral, as assembleias de morcegos são adaptadas para permanecerem o ano todo nas mesmas áreas, mas são fortemente afetadas pela estrutura espacial da vegetação de suas áreas preferidas de forrageio, a disponibilidade sazonal de alimento e as características dos seus abrigos subterrâneos. Além disso, reforça a importância de cavernas durante a época chuvosa para a reprodução de várias espécies de morcegos na Caatinga potiguar, incluindo para espécies endêmicas e ameaçadas de extinção. Os resultados desta tese, junto com a colaboração fundamental de muitas pessoas valiosas, é um esforço para descrever e ter uma visão mais profunda da história natural e a ecologia da diversa fauna de morcegos da Caatinga brasileira. In the Caatinga dry forest, the spatial heterogeneity of the different ecoregions and phytophysiognomies, as well as the seasonality of rainfall and the pulses of food resources, were attributed as key factors in controlling the structure and dynamics of bat assemblages. Almost 95% of the state of Rio Grande do Norte (RN) corresponds to the Caatinga, which harbors abundant underground cavities (~ 1000 caves). As the patterns of spatial and temporal diversity of bat fauna are practically unknown in the Caatinga, the main objective of this thesis was to explore the spatial and temporal patterns of richness, abundance and species composition of bat assemblages in different landscapes, phytophysiognomies and cave roosts. In Chapter 1, I explored the spatial and temporal richness, abundance and trophic and species composition of bats through captures using mist nets in five different Caatinga habitats in six areas in RN. In 99 sampling nights, I captured 1575 individuals of 31 species, with a capture effort of 242 425 hm2 . Differences in the structure was found at the species- and ensemble-level (trophic guilds) between the assemblages both in the different studied areas and in the different habitats. This is likely related to species specific preferences to favor specific landscape characteristics and foraging habitats. Richness and species composition presented no evident seasonal variation between season. Food resource found along the year may be the key factor that sustain a similar structure of the bat assemblage year-round. In Chapter 2, I monitored nine caves in four regions of the Caatinga of RN to examine the effects of the seasons and the size of the caves on the richness, abundance and composition of the species of cave bats. Using two methods, we recorded 17 species of bats of 2020 captured individuals and 3700 individuals observed during 61 sampling days. Species richness and composition did not change seasonally and no temporal species turnover was found. An increase in the general abundance during in the rainy season was found, especially in insectivores and some nectarivores, specifically at the end of the rainy season. An interaction was found between the seasons and the size of the caves. In the rainy season, the larger caves tended to vary more in abundance than the smaller caves, probably due to the greater carrying capacity of larger caves (greater space and diversity of microclimates). However, the species composition between large and small caves was different. In general, the seasonal increase in abundance in caves is attributed to the temporary availability of food resources and reproductive purposes. Frugivores, insectivores and animalivores were reproductively active during the rainy season, where their preferred food is abundant. Sanguinivores, omnivores and nectarivores were reproductively active during both seasons as their food resources were available throughout the year. In chapter 3, I did a taxonomic review in museum collections and a bibliographic review to determine the gamma diversity of bats in RN resulting in the first official list of bats in the state, including new records and discussions on conservation areas and areas of research priority. In this thesis, I managed to register 32 species of 3595 captured individuals and more than 3700 observed bats during 161 days of sampling. In general, the data indicates that the bat species are adapted to remain in the same areas all year round, but the structure of bat assemblages are different depending on the foraging habitats and landscape contexts. However, changes in abundance can be found in their cave roosts depending on the trophic guild, and likely attributed to the seasonal availability of food and to the different use that the species are giving to the cave (e.g. reproduction). In addition, our data reinforces the importance of caves during the rainy season for the reproduction of several bat species in the Caatinga of RN, including for endemic and endangered species. The results of this thesis, together with the fundamental collaboration of many valuable people, is an effort to describe and to have a deeper insight of the natural history and ecology of the diverse bat fauna of the Brazilian Caatinga.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, 2020. Planícies de inundação são ambientes que envolvem uma complexidade de fatores ecológicos, visto que, além dos preditores ambientais e espaciais, o volume de água nessas regiões é amplamente controlado pelo pulso de inundação. Portanto, compreender a dinâmica ecológica que controla a composição dos organismos e os padrões de distribuição, pode ser um acréscimo valoroso para estudos ecológicos na região. Por isso, o objetivo geral desse estudo é compreender os a composição e os padrões de distribuição da comunidade zooplanctônica em um lago de uma planície de inundação amazônica. No primeiro capítulo, apresentamos uma revisão sistemática sobre os atributos funcionais da comunidade zooplanctônica em ambientes aquáticos continentais; no segundo capítulo, avaliamos a influência dos preditores ambientais e espaciais sobre as diferentes facetas taxonômica e funcional da comunidade zooplanctônica; no terceiro capítulo, avaliamos os padrões de distribuição e partições da diversidade beta zooplanctônico, sob a perspectiva de Podani, em quatro diferentes períodos hidrológicos, bem como os preditores ambientais e espaciais e a concordância temporal entre as diferentes partições; no quarto capítulo, realizamos um estudo cienciométrico sobre o biomonitoramento em ambientes aquáticos continentais e avaliamos os organismos, ambientes e tendências nos estudos publicados entre 1991 e 2016. Com isso, verificamos que os atributos funcionais relacionados ao tamanho corpóreo dos organismos são os mais utilizados nas publicações. Além disso, há lacunas sobre o tema para diversas partes do mundo. Apesar disso, para a região avaliada, os dados taxonômicos responderam mais efetivamente às variações ambientais e espaciais do que os dados funcionais. As regiões litorâneas, principalmente associadas à igarapés, foram as que mais contribuíram para a diversidade beta. Além disso, os dados de presença-ausência, foram mais efetivos que os de abundância em resposta às variações ambientais. A revisão cienciométrica sobre estudos de biomonitoramento em ambientes aquáticos continentais, revelou que há uma maior proporção de estudos em abientes lóticos e com maiores organismos (e.g., peixes e macroinvertebrados), entretanto, há lacunas com organismos menores (e.g., fitoplâncton e zooplâncton) em ambientes lênticos. Floodplains are environments that involve a complexity of ecological factors, since, in addition to environmental and spatial predictors, the volume of water in these regions is largely controlled by the flood pulse. Therefore, understanding the ecological dynamics that control the composition of organisms and distribution patterns can be a valuable addition to ecological studies in the region. Therefore, the general objective of this study is to understand the composition and distribution patterns of the zooplankton community in a lake in an Amazonian floodplain. In the first chapter, we present a systematic review on the functional attributes of the zooplankton community in continental aquatic environments; in the second chapter, we evaluate the influence of environmental and spatial predictors on the different taxonomic and functional facets of the zooplankton community; in the third chapter, we evaluated thedistribution patterns and partitions of beta zooplanktonic diversity, under Podani's perspective, in four different hydrological periods, as well as the environmental and spatial predictors and the temporal agreement between the different partitions; in the fourth chapter, we carried out a scientometric study on biomonitoring in continental aquatic environments and evaluated the organisms, environments and trends in the studies published between 1991 and 2016. With this, we verified that the functional attributes related to the body size of the organisms are the most used in publications. In addition, there are gaps on the topic for different parts of the world. Nevertheless, for the evaluated region, taxonomic data responded more effectively to environmental and spatial variations than functional data. Coastal regions, mainly associated with streams, were the ones that most contributed to beta diversity. In addition, the presence- absence data was more effective than the abundance data in response to environmental variations. The scientometric review of biomonitoring studies in continental aquatic environments revealed that there is a greater proportion of studies in lotic environments and with larger organisms (e.g., fish and macroinvertebrates), however, there are gaps with smaller organisms (e.g., phytoplankton and zooplankton) in lentic environments.

Submitted by Bruno Garcia Luize (bruno.luize@unesp.br) on 2020-01-10T19:56:47Z No. of bitstreams: 1 BrunoGarciaLuize_Tese_EcologiaBiodiversidade_2020.pdf: 7249985 bytes, checksum: 5a85d43935ce04d7a8d7613d7cd57966 (MD5) Rejected by Adriana Ap. Puerta Buzzá (dripuerta@rc.unesp.br), reason: Prezado Bruno, O documento enviado para a coleção Campus Unesp Rio Claro foi recusado pelo(s) seguinte(s) motivo(s): - Capa e Página de rosto: falta o cabeçalho na parte superior da folha com o Nome da Universidade, Instituto, departamento etc. - Nas folhas que contêm a ficha e a dedicatória necessário excluir os títulos: "Ficha catalográfica" e "Dedicatória". Agradecemos a compreensão e aguardamos o envio do novo arquivo. Atenciosamente, Biblioteca Campus Rio Claro Repositório Institucional UNESP https://repositorio.unesp.br on 2020-01-14T13:52:59Z (GMT) Submitted by Bruno Garcia Luize (bruno.luize@unesp.br) on 2020-01-29T10:45:34Z No. of bitstreams: 1 BrunoGarciaLuize_Tese_EcologiaBiodiversidade_2020.pdf: 7109991 bytes, checksum: 4e87e68560a322f67b3d44f83531fd2f (MD5) Rejected by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: - Ficha catalográfica: Ano. O ano deve ser o mesmo da página de rosto: 2019 Agradecemos a compreensão. on 2020-01-29T12:37:03Z (GMT) Submitted by Bruno Garcia Luize (bruno.luize@unesp.br) on 2020-01-30T12:32:39Z No. of bitstreams: 1 BrunoGarciaLuize_Tese_EcologiaBiodiversidade_2020.pdf: 7059310 bytes, checksum: d4b69069fdfc47fcf85a66afdaa528ba (MD5) Approved for entry into archive by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br) on 2020-01-30T17:26:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 luize_bg_dr_rcla.pdf: 7048212 bytes, checksum: 1d5f83d7fb839235d3050150177da4ed (MD5) Made available in DSpace on 2020-01-30T17:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 luize_bg_dr_rcla.pdf: 7048212 bytes, checksum: 1d5f83d7fb839235d3050150177da4ed (MD5) Previous issue date: 2019-12-13 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Áreas úmidas são ambientes na interface terrestre e aquática, onde sazonalmente a disponibilidade de água pode estar em excesso ou em escassez. A história geológica da bacia amazônica está intimamente relacionada com a presença de áreas úmidas em grandes extensões espaciais e temporais e em variadas tipologias. Dentre as tipologias de áreas úmidas presentes na Amazônia as áreas alagáveis ao longo das planícies de inundação dos grandes rios são possivelmente as que possuem maior extensão territorial. Esta tese aborda o papel das áreas úmidas para a diversidade de árvores na Amazônia. As florestas que crescem em áreas úmidas possuem menor diversidade de espécies arbóreas em relação às florestas em ambientes terrestres (i.e., florestas de terra-firme); possivelmente devido às limitações ecológicas e fisiológicas relacionadas a saturação hídrica do solo e as inundações periódicas. Entretanto, nas áreas úmidas da Amazônia já foram registradas 3,515 espécies de árvores (Capítulo 2), uma quantidade comparável à da diversidade na Floresta Atlântica. Em relação às florestas de terra-firme da Amazônia, as espécies de árvores que ocorrem em áreas úmidas tendem a apresentar maiores áreas de distribuição e amplitudes de tolerâncias de nicho ao longo da região Neotropical (Capítulo 3). A composição florística e a distância filogenética entre espécies arbóreas nas florestas de várzea da Amazônia central mudam amplamente entre localidades (Capítulo 4). O gradiente ambiental contido entre as manchas de floresta de várzea foi o fator preponderante para explicar a distância filogenética entre florestas, enquanto que a composição das espécies é influenciada principalmente pelas distâncias geográficas entre as localidades. Além disso, geralmente as espécies relativamente mais abundantes são as que apresentam maiores quantidades de associações de co-ocorrência (Capítulo 5). A estruturação destas co-ocorrências pode ser influenciada por interações bióticas de facilitação e de competição entre as espécies, mas também por características similares do nicho das espécies, indicada pela proximidade evolutiva entre elas. E ainda, por dispersão limitada, indicada por maiores ou menores sobreposições na distribuição geográfica das espécies. Uma das limitações do estudo da diversidade biológica está relacionada com o uso das espécies como unidade básica de análise. Para árvores em florestas tropicais nem sempre é possível distinguir espécies como unidades discretas. A carência de estruturas diagnósticas nas coletas botânicas, a baixa representatividade das variações fenotípicas entre os indivíduos de uma espécie nas coleções botânicas e as variações fenotípicas crípticas existentes entre espécies proximamente aparentadas são fatores que dificultam a descrição da diversidade em nível de espécie. O código de barras de DNA é apresentado como uma técnica promissora para diminuir a lacuna causada pela dificuldade na identificação das espécies com divergência recente como na família Lecythidaceae em florestas de várzea e terra firme na Amazônia central (Capítulo 6). Nesta tese nós estudamos a influência das áreas úmidas na a origem e manutenção da diversidade de árvores nas florestas da Amazônia e concluímos que estes ambientes promovem diferenças nas características ecológicas das espécies arbóreas e heterogeneidade biótica na região. Wetlands are in the interface of terrestrial and aquatic environments, where seasonally water availability may be in excess or scarcity. Geological history of Amazon basin is closely linked with a huge temporal and spatial extents of wetlands. Nowadays, floodplains (i.e., Vázea and Igapó) are the wetlands with greatest coverage in Amazon. The present thesis is focused on the role of wetlands to tree species diversity in Amazon. Wetland forests have lower tree species diversity than upland forests (i.e., Terra-Firme); most likely due to ecological and physiological limitations. Notwithstanding, in Amazonian wetland forests 3,515 tree species already were recorded, (Chapter 2), which is comparable to tree species diversity in the Atlantic Forest. Wetland tree species show greater ranges sizes and niche breadth compared to tree species do not occur in wetlands (Chapter 3). Floristic compositional turnover and phylogenetic distances between floodplain forests in Central Amazon is high (Chapter 4). The most influential driver of floristic compositional turnover was the geographic distances between localities, whereas phylogenetic distances is driven mainly by the environmental gradients between forests. Furthermore, in general, the most abundant species are those that shows greater co-occurrence associations (Chapter 5). Co-occurrence structure is influenced by biotic interactions like facilitation and competition among species, but also by niche similarities indicated in the evolutionary distance among them. Moreover, dispersal limitation suggested by species range overlap is another factor structuring species pairs co-occurrences. One of the limitations of biological diversity studies is the use of species as basic unities of evaluation. However, sometimes it is impossible distinguish tree species in tropical forests as discrete unities. The lack of diagnosis characters in botanical collections, low representativity of phenotypic variation, and cryptic character variation between close related species were factors that beset species delimitation. DNA barcode is presented as a promising technique to reduce the identification shortfall of recent diverging Lecythidaceae species occurring in várzea and terra-firme forests of Central Amazon (Chapter 6). At this thesis we studied the role of wetlands on the origin and maintenance of tree species diversity in Amazonian forests, and we conclude that wetlands promote changes in ecological features of tree species and generates biotic heterogeneity in the region. FAPESP: 2015/24554-0 FAPESP: 2017/22233-8 FAPESP: 2018/23532-1 MCT/CNPq/CT-INFRA/GEOMA: 382728/2010

Submitted by Laís Lautenschlager Rodrigues (lais.l.rodrigues@unesp.br) on 2019-11-18T12:31:35Z No. of bitstreams: 1 05_Dissertation_Rodrigues_LaisL.pdf: 2022790 bytes, checksum: 7d93c89ba57cfd21abc88035d666d9f6 (MD5) Approved for entry into archive by Adriana Ap. Puerta Buzzá (dripuerta@rc.unesp.br) on 2019-11-19T19:45:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rodrigues_ll_me_rcla.pdf: 2022790 bytes, checksum: 7d93c89ba57cfd21abc88035d666d9f6 (MD5) Made available in DSpace on 2019-11-19T19:45:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rodrigues_ll_me_rcla.pdf: 2022790 bytes, checksum: 7d93c89ba57cfd21abc88035d666d9f6 (MD5) Previous issue date: 2019-10-30 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A conversão de paisagens florestais para usos antrópicos é a principal causa do desmatamento das florestas tropicais em todo o mundo. Essas florestas são conhecidas por conter parte significativa da biodiversidade terrestre global, porém pouco se sabe sobre como as modificações na paisagem, como a perda de habitat para produção agropecuária e o principalmente o impacto do gado afetam a diversidade e ocupação de mamíferos resilientes nesses fragmentos. Sendo assim, nós examinamos como a riqueza de espécies e a composição de mamíferos são explicadas pela configuração da paisagem e como a presença do gado afeta a detecção de mamíferos de médio e grande porte. Foram amostradas 20 paisagens dominadas por pastagens ao longo de um gradiente de cobertura florestal (8% a 98%), no sudeste do Brasil. Nós registramos 75% das espécies de mamíferos esperadas para esta região em uma cobertura florestal de média a alta. A cobertura florestal, distância euclidiana do vizinho mais próximo e área estrutural foram as variáveis que melhor explicaram a ocorrência de algumas espécies de mamíferos dependentes de floresta. As comunidades de mamíferos exibiram um alto grau de alternação de espécies entre as paisagens, representando 95% da diversidade beta total. Os impactos da pecuária foram mostrados devido ao seu efeito negativo na detecção de espécies florestais e positivo na detecção de grupos de espécies não florestais. Discutimos a importância de manter fragmentos com alta cobertura vegetal para melhorar a conectividade entre paisagens perturbadas, favorecendo o fluxo de espécies de mamíferos, além da urgente necessidade de uma melhor compreensão dos impactos gerais do gado sobre a fauna e flora em remanescentes florestais, em uma escala mais fina que considere o interior dos fragmentos, avaliando quais os efeitos da presença do gado na alteração da qualidade desses ambientes e assim aprimorando a conservação da biodiversidade e dos recursos naturais. The landscape conversion to anthropic uses is the major cause of deforestation worldwide. Tropical forests are known to contain a significant portion of global terrestrial biodiversity, but little is known about how changes in landscape, such as habitat loss for livestock and its impacts affect the diversity and occupation of resilient mammals in forest fragments immersed in pasture matrices. Here we examine how species richness and mammal composition are explained by landscape configuration and how cattle presence affects the detection of medium and large mammals. We sampled 20 landscapes dominated by pastures along a forest cover gradient (8% to 98%) in southeastern Brazil. We recorded 75% of the mammalian species expected for this region in a medium-to-high forest cover. Landscapes metrics, as forest cover, Euclidean distance from the nearest neighbor and structural area were the variables that best explained the occurrence of some forest mammal species. Mammalian communities exhibited a high degree of species turnover between landscapes, representing 95% of total beta diversity. Livestock impacts were shown due to its negative effect on the detection of forest-dwelling species and positive on the detection of non-forest species groups. We discuss the importance of maintaining forest fragments with high vegetation cover to improve connectivity between disturbed landscapes, favoring mammalian species flow. There is an urgent need for a better understanding of livestock general impacts inside forest remnants, considering the interior of these fragments, assessing how cattle’s presence alters the quality of these habitats and thus improving the biodiversity and natural resources conservation. CAPES: 001.

A macroecologia estuda padrões ecológicos em grandes escalas espaciais, nestas escalas a principal fonte de informação é a distribuição geográfica das espécies. A partir da distribuição das espécies surgem padrões espaciais de riqueza, de tamanho de distribuição geográfico e endemismo. Mais recentemente, a macroecologia evolutiva vem propondo uma nova abordagem sobre os padrões macroecológicos de biodiversidade ao usar métricas que combinam o efeito do acúmulo de tempo evolutivo em conjunto com elemento básico da macroecologia, a área de distribuição das espécies. Nesta tese, exploramos como outra perspectiva dos padrões de biodiversidade pode ser obtida usando a diversidade filogenética e o endemismo filogenético, e como a resposta de evolução dos tamanhos de distribuição mudam entre partes da filogenia. Primeiro testamos como os padrões de diversidade beta podem evidenciar que processos ecológicos e evolutivos atuam com intensidade diferente ao longo das escalas e são determinantes do padrão geográfico de diversidade. Nós encontramos que quando consideramos apenas a diversidade filogenética, em pequenas escalas, a diversidade beta é importante para o aumento de diversidade nos trópicos. Em maiores escalas, e para a riqueza de espécies, o gradiente de diversidade é determinado por um efeito de retirada de espécies em áreas com temperatura mais sazonal em direção a região subtropical. Em seguida, testamos o efeito da estabilidade climática no passado como um determinante do padrão de endemismo filogenético, que capta o acúmulo do tempo evolutivo em área de distribuição restrita, em regiões mais estáveis ao longo dos ciclos glaciais. Nós encontramos que áreas mais estáveis apresentaram endemismo filogenético mais profundo. Encontramos também que áreas de paleo-endemismo estão concentradas em áreas mais estáveis do que áreas de endemismo misto. Porém, áreas de neo-endemismo estão em locais estáveis em regiões intáveis e áreas de super-endemismo estão localizadas em áreas climaticamente estáveis que apresentam condições de isolamento por distâncias, as ilhas do Caribe. Por fim, testamos como a origem histórica dos grupos pode afetar a resposta de evolução do tamanho de distribuição em relação ao atributo climático de nicho das espécies. Encontramos que espécies de grupos de origem temperada tendem a ter maior tamanho de distribuição em áreas mais frias e sazonais, seguindo um efeito de Rapoport de acordo com a hipótese de variabilidade climática. Enquanto espécies de grupos de origem tropical tendem a ampliar sua distribuição em áreas menos sazonais, apresentando um padrão contrário ao efeito de Rapoport, indicando um efeito histórico determinado por uma tendência de conservatismo filogenético das preferências climáticas ancestrais. Desta forma, nessa tese mostramos algumas alternativas de como integrar os principais padrões geográficos de biodiversidade por meio de uma abordagem de macroecologia evolutiva baseada em filogenias para uma melhor compreensão dos processos macroecológicos e macroevolutivos. Macroecology studies ecological patterns on large spatial scales, at these scales the main source of information is the geographical distribution of species. From the distribution of species emerge spatial patterns of richness, geographic range size, and endemism. Recently, evolutionary macroecology has been proposing a new approach to macroecological patterns of biodiversity when using metrics that combine the effect of time accumulation with the basic element of macroecology, the area of distribution of the species. In this thesis, we explore how another perspective of the biodiversity patterns can be obtained using phylogenetic diversity, phylogenetic endemism and how the evolutionary response of distribution sizes changes between parts of the phylogeny. First, we tested how beta diversity can evince ecological and evolutionary processes that act with different intensity along spatial scales and are determinants of the geographical pattern of biodiversity. We find that when we consider only small-scale phylogenetic diversity, beta diversity is important for increasing diversity in the tropics. On larger scales, and for species richness on all scales, the diversity gradient is determined by an effect of species removal in areas with a more seasonal temperature towards the subtropical region. We tested the effect of climate stability in the past as a determinant of the phylogenetic endemism pattern, that captures the accumulation of evolutionary time in a restricted distribution area, in more stable regions throughout the glacial cycles. We find that more stable areas presented deeper phylogenetic endemism, and also that areas of paleo-endemism are concentrated in more stable areas than areas of mixed endemism. However, areas of neo-endemism are located in stable areas surounded by unstable regions and areas of super endemism are located in climatically stable areas that present conditions of isolation by distances, as in the Caribbean islands. Lastly, we tested how the historical origin of groups can affect the range size evolution in relation to the climatic attribute of the species niches. We found that species of groups of temperate origin tend to have larger range sizes in colder and seasonal areas, following a Rapoport effect as a function of climate variability. Conversely, species of groups of tropical origin tend to broaden their range sizes in less seasonal areas, presenting a pattern contrary to the Rapoport effect, indicating a historical effect, determined by a trend of phylogenetic conservatism of ancestral climate preferences. Thus, in this thesis, we show some alternatives of how to integrate the main geographic patterns of biodiversity through an evolutionary macroecology approach based on phylogenies for a better understanding of macroecological and macroevolutionary processes. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

Um dos principais interesses da ecologia e biogeografia é compreender os padrões de gradiente geográfico de biodiversidade e seus processos. O estudo de diferença na composição de espécies nos sítios ou diversidade beta é importante na compreensão do gradiente de biodiversidade. Adicionalmente, os padrões de distribuição de espécies e diversidade de sítios estão conectados e a abordagem deles em conjunto ajuda a entender melhor o gradiente de biodiversidade de algum táxon. Porém, teve poucos estudos macroecológicos sob a abordagem de distribuição e diversidade em conjunto. Por sua vez, a diversidade beta de várias assembleias aquáticas e terrestres tem maior contribuição dos componentes de substituição de espécies nas menores latitudes e maior contribuição de diferença de riqueza nas maiores latitudes. No entanto, se desconhece o padrão desses componentes nas subordens de Carnivora. Assim, no primeiro capítulo deste estudo testamos a hipótese de gradiente latitudinal dos componentes de diversidade beta para Feliformia e Caniformia e sugerimos como possíveis fatores explicativos desses padrões à competição interespecífica, diferente história biogeográfica, conservação de nicho e glaciações do Quaternario. A nível global para as subordens de Carnivora esperamos encontrar maior substituição e diferença de riqueza nas menores e maiores latitudes, respectivamente. Também, esperamos encontrar o mesmo padrão nas regiões do Novo e Velho Mundo, embora, a quantidade de contribuição do componente será segundo a subordem da região. A través de regressões segmentadas, determinamos a relação entre cada componente de diversidade beta e latitude. Registramos que os componentes de diversidade beta de Feliformia e Caniformia seguem padrões geográficos adicionais ao latitudinal. Portanto, a substituição de espécies para ambas subordens não diminui com o aumento de latitude e tem maior contribuição nas regiões montanhosas e rios. A diferença de riqueza de espécies aumenta com a latitude e tem maior contribuição nas regiões temperadas e/ou áridas, como, Polo Ártico para Caniformia e Oriente Médio, Saara e Altiplano para ambas subordens. Além disso, a diferença de riqueza de Feliformia aumenta com a latitude no Hemisfério Sul, sendo maior no Novo do que Velho Mundo, sugerindo que a migração, diversificação e competição, teriam causado maior perda de espécies de Feliformia por Caniformia na América do Sul do que na África. No segundo capítulo com o intuito de compreender o gradiente de diversidade de Carnivora, examinamos os padrões de co-distribuição (i.e. grau de associação ou separação na distribuição espacial de espécies), co-diversidade (i.e. grau de similaridade ou diferença na composição de espécies entre sítios), campo de diversidade (i.e. riqueza nos sítios dentro da área de distribuição de uma espécie) e campo de diversidade cruzado (i.e. riqueza de espécies do clado oposto nos sítios dentro da área de distribuição focal) da ordem, subordens e famílias, sob a abordagem de distribuição e diversidade em conjunto. Usamos matrizes de presença-ausência, gráficos de dispersão e testes de razão de variância. Para Carnivora observamos co-distribuição e co-diversidade positivas e diferentes dos padrões gerados pelo modelo nulo coesivo. Ursidae e Canidae apresentam co-distribuição negativa e co-diversidade positiva, diferentes dos padrões do modelo nulo coesivo. A nível global, no campo de diversidade observamos em média 15,95 espécies dentro das áreas de distribuição geográfica de Carnivora. Além disso, existe maior frequência de sítios com baixa do que alta riqueza de espécies dentro das áreas de distribuição das espécies Carnivora. No campo de diversidade cruzado esperamos menor co-ocorrência de uma espécie Caniformia com espécies Feliformia e vice-versa, pela competição interespecífica entre as subordens de Carnivora. Concordando, observamos mais áreas de distribuição de espécies Caniformia com maior frequência de sítios de baixa riqueza de espécies Feliformia, e vice-versa. One important goal in ecology and biogeography is to understand biodiversity gradient patterns and their processes. Studying compositional difference of species among sites or beta diversity is important to understand this biodiversity gradient. Moreover, distribution ranges of species and species richness of sites are connected patterns. The connected approach of these patterns helps to understand better the biodiversity gradient of some taxon. Nevertheless, there were few macroecological studies that took into account this connected approach of patterns. On the other hand, beta diversity of several terrestrial and aquatic assemblages has more species replacement component in low latitudes and more difference in species richness component in high latitudes. However, we do not know about components of beta diversity patterns for Carnivora suborders, Feliformia and Caniformia. So, we evaluate the latitude gradient hypothesis of beta diversity components of Feliformia and Caniformia for the first chapter. Additionally, we suggest that interspecific competition, difference of historical biogeography, niche conservatism and Quaternary glaciations, might be the factors that explain these beta diversity patterns. We expect more species replacement in low latitudes and more difference in species richness in high latitudes for Carnivora suborders on global scale. We expect the same latitudinal patterns of beta diversity components for these suborders on the regions of the New and Old World, but the amount of each component might depend on the region of suborder. We used piecewise regressions to relate between each beta diversity component and latitude. For Feliformia and Caniformia, beta diversity components follow geographical patterns beyond the latitudinal one. Thus, species replacement does not reduce in high latitudes and this component is higher in mountains and some rivers for both suborders. Difference in species richness increases in high latitudes and this component is higher in temperate and arid regions, like Arctic Pole for Caniformia and Sahara, Middle East and Altiplano for both suborders. Moreover, difference in species richness of Feliformia is higher in high latitudes of New World’s Southern Hemisphere than Old World one, suggesting that migration, diversification and interspecific competition might cause more loss of Feliformia species by Caniformia species in South America than Africa. For the second chapter, to understand the diversity gradients of Carnivora, we examine the patterns of co-distribution (i.e. degree of association or segregation in the distribution ranges of species), co-diversity (i.e. degree of similarity or differentiation of species composition among localities), diversity field (i.e. set of species richness values among sites within the distribution range of a given species) and cross diversity field (i.e. set of richness values of the opposite clade among sites within the distribution range of a given species) of Carnivora, suborders and families. We evaluated these patterns through the connected approach of distribution ranges of species and species richness of sites. We used presence-absence matrices, scatter plots as range-diversity plots and variance-ratio tests. For Carnivora, positive co-distribution and positive co-diversity are found and they are different from cohesive null model patterns. Negative co-distribution and positive co-diversity are found for Ursidae and Canidae, in addition these observed patterns are different from cohesive null model patterns. We find 15,95 species as mean within distribution ranges for Carnivora. Additionally, there are more sites with low richness than high richness within distribution ranges for Carnivora. Because of interspecific competition of the Carnivora suborders, we expect low co-occurrences between a given Caniformia species and Feliformia species or vice-versa for cross diversity fields. Matching our expectation, we find more sites with low richness of Feliformia species within distribution ranges of Caniformia species and vice-versa. Outro

Submitted by JADSON VIANA DA SILVA (jadson.ifam@gmail.com) on 2019-09-26T14:27:00Z No. of bitstreams: 3 dissertacao_jvs.pdf: 1684884 bytes, checksum: 03da8b2cce2f3fe2e29358da4a432739 (MD5) Carta de autodep??sito.pdf: 502981 bytes, checksum: ee55f57db1e6bc6a41e393f0823ea6c3 (MD5) Ata da Defesa_Aprovada.pdf: 548674 bytes, checksum: 15c4375172ec4191026238b942c3b545 (MD5) Approved for entry into archive by PPGZOOL Zoologia (ppgzoo.ufam@gmail.com) on 2019-09-26T14:43:30Z (GMT) No. of bitstreams: 3 dissertacao_jvs.pdf: 1684884 bytes, checksum: 03da8b2cce2f3fe2e29358da4a432739 (MD5) Carta de autodep??sito.pdf: 502981 bytes, checksum: ee55f57db1e6bc6a41e393f0823ea6c3 (MD5) Ata da Defesa_Aprovada.pdf: 548674 bytes, checksum: 15c4375172ec4191026238b942c3b545 (MD5) Approved for entry into archive by PPGZOOL Zoologia (ppgzoo.ufam@gmail.com) on 2019-09-26T14:47:34Z (GMT) No. of bitstreams: 3 dissertacao_jvs.pdf: 1684884 bytes, checksum: 03da8b2cce2f3fe2e29358da4a432739 (MD5) Carta de autodep??sito.pdf: 502981 bytes, checksum: ee55f57db1e6bc6a41e393f0823ea6c3 (MD5) Ata da Defesa_Aprovada.pdf: 548674 bytes, checksum: 15c4375172ec4191026238b942c3b545 (MD5) Made available in DSpace on 2019-09-26T14:47:34Z (GMT). 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To define diversity distribution patterns, we identified changes in species composition using the Species Composition Interpolation (SCI) function, implemented in the environmental modeling platform, EGO Dynamics.This function analyzes Beta diversity patterns in space through hexagons and interpolation, which identifies the most significant changes in the spatial distribution of a dataset. Our multi-analytical approach recovered3, 7 and 14 areas in spatial resolutions of 2??, 3?? and 4??, respectively in the NDM analyses, and six bioregions using Infomap Bioregions. Our diversity analysis showed three distinct compositional patterns, one to the north of the Amazon River, the other to the east, including the Tapaj??s, Xingu and Tocantins basins, and finally a region encompassing the main course of the Amazon and tributaries to the west-northeast of the Amazon Basin. We provide the first quantitative analysis of endemism and species diversity for birds specialized in seasonally flooded Amazonian environments. Our results revealed spatially complex patterns of endemism and diversity for birds in floodplain environments with areas of varying degrees of overlap, nesting, and disjunction.In general, the areas of endemism identified are associated with the three main basins of the northern portion of South America, the Amazon Basin, the Tocantins Basin and the Orinoco Basin.Taxa identified as endemic to these areas comprise 28 % (70) of avian taxa dependent on flooded systems. Of these, two are considered threatened (NT and VU) and two have not yet been evaluated by IUCN and BirdLife International. Para entender os padr??es de endemismo e diversidade para aves especialistasnos primeiros est??gios do processo sucessional em ambientes alag??veisna Amaz??nia, empregamos um banco de dados incluindo 26.515 registros de ocorr??ncia georreferenciados para70t??xons.O conjunto de dados foi analisado atrav??s de duas abordagens que utilizam diferentes bases l??gicas para identificar padr??es de co-ocorr??ncia de esp??cies, e assim verificar a congru??ncia dos padr??es recuperados:a an??lise de endemicidade (EA)e o Infomap Bioregions. Para definir padr??es de distribui????o de diversidade, identificamos mudan??as na composi????o de taxa usando a fun????o de Interpola????o de Composi????o de Esp??cie (SCI), implementada na plataforma de modelagem ambiental, Din??mica EGO. Essa fun????o espacializa os padr??es de diversidade Beta por meio de hex??gonos e interpola????o, o que identifica as mudan??as mais significativas na distribui????o espacial de um conjunto de dados.Nossa abordagem multi-an??lise recuperou3, 7 e 14 ??reas de endemismo, nas resolu????es espaciaisde 2??, 3?? e 4??, respectivamente na an??lise com NDM e 6 biorregi??es na an??lise com Infomap Bioregions. Nossa an??lise da diversidade mostrou tr??s padr??es composicionais distintos: um ao norte do rio Amazonas; outro a leste, incluindo as bacias dos rios Tapaj??s, Xingu e Tocantins; e finalmente uma regi??o que abrange o curso principal do Amazonas e afluentes do oeste-nordeste da Bacia Amaz??nica.O presente trabalho consiste na primeira an??lise quantitativa de endemismo e diversidade de esp??cies deaves especialistas em ambientes alag??veis Amaz??nicos. Nossos resultados revelaram padr??es espacialmente complexos de endemismo e diversidade, com ??reas apresentando v??rios graus de sobreposi????o, aninhamento e disjun????o. Em geral, as ??reas de endemismo identificadas, est??o associadas as tr??s principais bacias da por????o norte da Am??rica do Sul, Bacia do Amazonas, Bacia do Tocantins e Bacia do Orinoco. T??xons identificados como end??micos para estas ??reas compreendem28 % (70) das aves dependentes de sistemasalag??veis. Destes, dois est??o inclu??dos nas categorias de amea??a (NT e VU) e dois ainda n??o foram avaliados de acordo com a IUCN e a BirdLife International.

Submitted by Bruno Martins Santos Ramires (brunoramiresbio@gmail.com) on 2019-05-10T12:38:52Z No. of bitstreams: 1 Bruno M S Ramires - Dissertação pós-banca.pdf: 2446461 bytes, checksum: 0fb4487a6549f2fdefff35ecfa56297c (MD5) Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2019-05-10T14:23:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ramires_bms_me_sjrp_par.pdf: 760764 bytes, checksum: 521631d6906f205d7818900ae6e35b39 (MD5) Made available in DSpace on 2019-05-10T14:23:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ramires_bms_me_sjrp_par.pdf: 760764 bytes, checksum: 521631d6906f205d7818900ae6e35b39 (MD5) Previous issue date: 2019-03-22 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Compreender como as mudanças ambientais afetam a biodiversidade ao longo do tempo é fundamental para a conservação de espécies. Diversos estudos têm demonstrado que processos determinísticos, como mudanças no clima e no uso da terra, provocam alterações em diferentes aspectos das comunidades biológicas, sendo que a diversidade beta consiste na ferramenta ecológica que permite mensurar essas mudanças ao longo do tempo. Dados padronizados obtidos por nossa equipe sobre a ictiofauna da Represa Municipal de São José do Rio Preto demonstraram que, entre 2002 e 2016, algumas espécies de peixes da represa se extinguiram localmente, enquanto que outras não presentes no período inicial, se fizeram presentes em 2016. Usando abordagens taxonômica e funcional, aplicamos a diversidade beta para mensurar as mudanças ocorridas na ictiofauna durante esse período, além de verificar se as alterações encontradas foram relacionadas a variáveis ambientais locais. As alterações a nível de populações de grupos funcionais independentes também foram calculadas, além de suas relações com variáveis do ambiente. Não foram encontradas diferenças significativas na variação taxonômica e funcional entre os anos, porém, foram encontradas alterações nos padrões de abundância de algumas espécies e de alguns grupos funcionais, sendo que para um deles o pH da água se mostrou como um preditor de abundância Understanding how environmental changes can affect biological diversity over time is essential for species conservation. Several studies demonstrate that deterministic process, as climate changes and land use cover, can lead to alterations in different aspects of biological communities, whereas beta diversity consists in an ecological tool that allows quantifying these differences over time. Standardized data obtained by our team about the fish fauna of São José do Rio Preto Municipal Dam demonstrated that, between 2002 and 2016, some fish species were locally extinct, while other species, not sampled in the former period, were recorded in 2016. Using taxonomic and functional approaches, beta diversity was applied to measure verify if fish assemblages changed during this period, and to test these changes were related to local variables. The variation at the population level and independent functional groups were also calculated, together with their relationship with environmental variables. At the taxonomic and functional levels, no significant differences between the years of study were found; however, alterations in the abundance patterns of some species and some functional groups were registered. 2015/22380-5

A major goal of ecology is to understand how spatial heterogeneity determines patterns of species diversity and composition. Studies have demonstrated positive relationship between environmental heterogeneity and diversity, but evidence from marine ecosystems is controversial and scarce in terms of how spatial heterogeneity and diel period mediate this relationship. We used fish communities from four Southwestern Atlantic vessel reefs to assess whether positive heterogeneity-diversity relationships (HDR) hold for these mobile organisms and whether the relationships weaken with nightfall. We sampled fishes in three habitats with contrasting structural complexity (high, low and control), over day and night, and employed two complementary diversity frameworks: partitioning of gamma diversity into independent alpha and beta components (Jost’s approach) and partitioning of beta diversity into turnover and nestedness components (Baselga’s approach). We recorded 5005 fishes belonging to 76 species and 31 families. As expected, the mean alpha diversity of rare species (0D) doubled from control to high complexity areas and decreased by half from day to night. The diversity of typical species (1D) showed a twofold increase from control to high complexity areas, but did not reduce at night. Complexity and diel period did not have significant effect on the diversity of dominant species (2D). No relationship between complexity and alpha diversity were weakened at night. Beta diversity of the three diversity orders significantly differed from 1 (totally homogeneous vessel reef), indicating that complexity underlies patterns of beta diversity. This effect was consistent at both diel periods, contradicting expectations of weaker influence of complexity at night. The turnover component of beta diversity was consistently greater than nestedness at day and night (2.8 and 1.9-fold, respectively). Our findings support positive HDR for the diversity of rare and typical species. Dominant species also respond to heterogeneity by replacing each other across the complexity gradient, but not by becoming more numerous in high complexity areas. Diel changes did not affect the strength of HDR, revealing an uninterrupted role of environmental heterogeneity on fish communities. Preserving heterogeneous habitats, such as structurally complex shipwrecks, is critical for conserving marine fish diversity. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Um dos principais objetivos da ecologia é compreender como a heterogeneidade espacial determina padrões de diversidade e composição de espécies. Estudos têm demonstrado relação positiva entre heterogeneidade ambiental e diversidade, mas evidências em ecossistemas marinhos são controversas e escassas em termos de como essa relação é mediada pela heterogeneidade espacial e o período do dia. Na presente pesquisa utilizamos comunidades de peixes de quatro naufrágios do Atlântico Sudoeste para avaliar se as relações positivas entre heterogeneidade e diversidade (HDR) são válidas para esses organismos móveis e se as relações enfraquecem ao anoitecer, quando grande parte da comunidade de peixes busca refúgio, potencialmente favorecendo a diversidade em locais mais complexos. Amostramos peixes em três habitats com complexidade estrutural contrastante (alta, baixa e controle), ao longo do dia e da noite, e empregamos duas abordagens complementares de diversidade: a partição da diversidade gama em componentes alfa e beta independentes (abordagem de Jost) e a partição da diversidade beta em componentes de turnover e nestedness (abordagem de Baselga). Registramos 5005 peixes pertencentes a 76 espécies e 31 famílias. Como esperado, a diversidade alfa média de espécies raras (0D) duplicou do controle para áreas de alta complexidade e diminuiu pela metade do dia para a noite. A diversidade de espécies típicas (1D) foi duas vezes maior nas áreas de alta complexidade do que nas áreas controle, mas não diminuiu à noite. Complexidade e período do dia não demonstraram efeito significativo sobre a diversidade de espécies dominantes (2D). As relações entre complexidade e diversidade alfa não foram enfraquecidas durante a noite. A diversidade beta das três ordens de diversidade diferiu significativamente de 1 (recife totalmente homogêneo), indicando que a complexidade regula os padrões de diversidade beta. Este efeito foi consistente em ambos os períodos do dia, contrariando expectativas de menor influência da complexidade à noite. O componente turnover da diversidade beta foi consistentemente maior que o nestedness no dia e na noite (2,8 e 1,9 vezes, respectivamente). Nossos resultados corroboram a HDR positiva para a diversidade de espécies raras e típicas. As espécies dominantes também respondem à heterogeneidade substituindo-se pelo gradiente de complexidade, mas não se tornando mais numerosas em áreas de alta complexidade. Mudanças do período do dia não afetaram a força da HDR, revelando um papel ininterrupto da heterogeneidade ambiental sobre as comunidades de peixes. A preservação de habitats heterogêneos, como naufrágios estruturalmente complexos, é fundamental para a conservação da diversidade de peixes marinhos.