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237 results on '"Dignac, Marie-France"'

2. Carbon storage in soils

Author

Basile-Doelsch, Isabelle, primary, Chevallier, Tiphaine, additional, Dignac, Marie-France, additional, and Erktan, Amandine, additional

Published
2023
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11. Devenir des microplastiques dans les sols – quels indicateurs des sources, teneurs et impacts pour la qualité et la santé des sols ? (Projet PlastiSol)

Author

Dignac, Marie-France, Dignac, Marie-France, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Plastisol ADEME GRAINE 2019 (award number 2207D0002)

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, microplastiques, Projet PlastiSol, santé des sols, [SDE]Environmental Sciences, impacts, indicateurs, qualité des sols
Abstract

International audience

Published
2023

12. Devenir des microplastiques dans les sols : quels indicateurs des sources, teneurs et impacts pour la qualité et la santé des sols ?

Author

Dignac, Marie-France, Colombini, Gabin, Biron, Philippe, Felbacq, Axel, Rumpel, Cornelia, Dignac, Marie-France, and Dynamique environnementale et impacts des cocktails de contaminants provenant des plastiques dans les écosystèmes terrestres - - e-DIP2021 - ANR-21-CE34-0017 - AAPG2021 - VALID

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, microplastiques, sols
Published
2023

16. Presence of polyethylene micro-particles in an agricultural soil affects microbial activities and plants

Author

Richaume, Agnes, Colombini, Gabin, Derollez, E, Florio, Alessandro, Dignac, Marie-France, Navard, Patrick, Cantarel, Amélie A.M., Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plastisol ADEME GRAINE 2019 (award number 2207D0002), ANR-21-CE34-0017,e-DIP,Dynamique environnementale et impacts des cocktails de contaminants provenant des plastiques dans les écosystèmes terrestres(2021), Dignac, Marie-France, and Dynamique environnementale et impacts des cocktails de contaminants provenant des plastiques dans les écosystèmes terrestres - - e-DIP2021 - ANR-21-CE34-0017 - AAPG2021 - VALID

Subjects
[SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [SDV.EE.ECO] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems
Abstract

International audience

Published
2022

17. Microplastic pollution in long-term urban compost amended soils

Author

Colombini, Gabin, Rumpel, Cornelia, Houot, Sabine, Biron, Philippe, Denieul, Marie-Pierre, Dignac, Marie-France, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Veolia Environnement (FRANCE), Plastisol ADEME GRAINE 2019 (award number 2207D0002), and Dignac, Marie-France

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, microplastic pollution, Microplastic, [SDE]Environmental Sciences, urban compost, amended soils, soils
Abstract

International audience

Published
2022

18. La construction d’un collectif scientifique créatif et bienveillant par la mobilisation des émotions et des sens à travers les liens sciences-art : Le Réseau Matières Organiques

Author

Dignac, Marie-France, Maurin, Coralie, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Direction Ressources Humaines (UAR DRH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Dignac, Marie-France

Subjects
approche multi-sensorielle, multi-sensorial approach, research network, réseau de recherche, émotions, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, [SDV.SA.SDS] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, emotions, sciences-arts
Abstract

CONSTRUCTION OF A CREATIVE AND WELCOMING SCIENTIFIC COLLECTIVE THROUGH THE MOBILIZATION OF EMOTIONS AND SENSES VIA SCIENCE-ART LINKS:The french Organic Matter NetworkCompetition, publication, projects, funding, career: researchers are "squeezed like lem-ons". These pressures can erode their creativity. For the past ten years, the Organic Matter Network has been organizing research schools, with a major part devoted to original creative activities based on the sensorial, artistic or poetic perception of its research themes. We analyze in this article how the approach developed during these research schools, without constraint and following the desires of the group, has contributed to build a creative and friendly research collective. We try to formalize this approach and to evaluate its results., Concurrence, compétition, publication, projets, financement, carrière : les chercheurs sont « pressés comme des citrons ». Ces pressions peuvent briser leur créativité. Le Réseau Matières Organiques organise depuis dix ans des écoles-chercheurs laissant une large part à des ateliers créatifs originaux basés sur la perception sensorielle, artistique ou poétique de ses thématiques de recherches. Nous analysons dans cet article comment la démarche développée au fil de ces écoles, sans contrainte et en suivant les envies du groupe, a permis de construire un collectif de recherche créatif et bienveillant. Nous apportons des éléments de formalisation de cette démarche et tentons d'en évaluer les résultats.

Published
2022

19. Organic matter decay response to root functional types and simulated sea-level rise in a temperate salt marsh

Author

Arnaud, Marie, primary, Geairon, Philippe, additional, Bakhos, Melissa, additional, Rumpel, Cornelia, additional, Dignac, Marie-France, additional, Norby, Richard J., additional, Kostyrka, Pierre, additional, Deborde, Jonathan, additional, Gernigon, Julien, additional, Lemesle, Jean-Christophe, additional, Bottinelli, Nicolas, additional, and Polsenaere, Pierre, additional

Published
2023
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21. Effets des traits fonctionnels des vers de terre sur les propriétés physico-chimiques et la composition chimique moléculaire des turricules

Author

Zi, Yacouba, Dignac, Marie-France, Rumpel, Cornelia, Bottinelli, Nicolas, Capowiez, Yvan, Florio, Alessandro, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Dignac, Marie-France

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, [SDE]Environmental Sciences
Abstract

International audience

Published
2022

22. Exploring the control of earthworm faeces micro- and macro-scale features on soil organic matter dynamics across species and ecological categories

Author

Le Mer, Guillaume, Bottinelli, Nicolas, Dignac, Marie-France, Jouquet, Pascal, Capowiez, Yvan, Mazurier, Arnaud, Baudin, François, Rumpel, Cornelia, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Dignac, Marie-France

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, [SDE]Environmental Sciences
Abstract

International audience

Published
2022

23. Effets des amendements organiques sur les teneurs en microplastiques de sols agricoles – retour d’expérience et perspectives de recherche

Author

Colombini, Gabin, Dignac, Marie-France, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plastisol ADEME GRAINE 2019 (award number 2207D0002), and Dignac, Marie-France

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, [SDE]Environmental Sciences
Abstract

International audience

Published
2022

24. Influence of sea level rise on the chemical composition of decomposing root and leaf materials in salt marsh soils

Author

Bakhos, Melissa, Arnaud, Marie, Dignac, Marie-France, Polsenaere, Pierre, Bottinelli, Nicolas, Rumpel, Cornelia, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Dignac, Marie-France

Subjects
[SDE.MCG] Environmental Sciences/Global Changes, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes
Abstract

International audience

Published
2022

26. Worms and minerals influence the biogeochemistry and turnover of composted organic matter

Author

Barthod, Justine, Rumpel, Cornelia, Kögel-Knabner, Ingrid, Dignac, Marie-France, Dignac, Marie-France, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Lehrstuhl für Bodenkunde, and Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM)

Subjects
Worms influence, [SDE] Environmental Sciences, biogeochemistry, minerals influence, [SDE]Environmental Sciences, composted organic matter
Abstract

International audience

Published
2022

27. A long-term field experiment reveals the accumulation of high amounts of microplastics in soils amended with composted waste residues

Author

Colombini, Gabin, Rumpel, Cornelia, Houot, Sabine, Biron, Philippe, Lhoutellier, Claire, Denieul, Marie-Pierre, Deltreil, Vincent, Dignac, Marie-France, Dignac, Marie-France, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Veolia Environnement (FRANCE), and Plastisol ADEME GRAINE 2019 (award number 2207D0002)

Subjects
[SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [SDV.EE.ECO] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems
Abstract

International audience

Published
2022

28. Influence de la fréquence de l’inondation sur la qualité de la matière organique en décomposition dans les sols des marais tidaux tempérés

Author

Bakhos, Melissa, Arnaud, Marie, Dignac, Marie-France, Polsenaere, Pierre, Bottinelli, Nicolas, Rumpel, Cornelia, Dignac, Marie-France, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, [SDE]Environmental Sciences
Abstract

International audience

Published
2022

32. Effet des espèces d'arbres et des propriétés du site forestier sur la biochimie de la matière organique

Author

Khalfallah, Fadwa, Derrien, Delphine, Buée, Marc, Dignac, Marie-France, Augusto, Laurent, AUGUSTO, Laurent, Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Interactions Arbres-Microorganismes (IAM), Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Interactions Sol Plante Atmosphère (UMR ISPA), and Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Analyse des sols, Biochimie, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

International audience

Published
2022

33. Forest trees species shape the biochemistry of soil organic matter under the control of their associated microbial communities

Author

Khalfallah, Fadwa, Dignac, Marie-France, Biron, Philippe, Felbacq, A., de Schrijver, An, Legout, Arnaud, Smolander, Aino, Vanguelova, Elena, Verheyen, Kris, Vesterdal, Lars, Bernd, Zeller, Augusto, Laurent, Buée, Marc, Derrien, Delphine, AUGUSTO, Laurent, Interactions Arbres-Microorganismes (IAM), Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), Natural Resources Institute Finland (LUKE), University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH), Interactions Sol Plante Atmosphère (UMR ISPA), Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT)

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

International audience; Soil organic matter (SOM) is the largest carbon reservoir on the continents. It contains three to four times more carbon than vegetation. SOM content is particularly high in forest ecosystems, which cover 30% of Europe. The tree species is one of the main factors influencing the storage and biochemistry of soil organic matter, through its litter quality and the species-specific microbial communities.

Published
2022

37. Produit permettant d'étudier l'évolution des matières organiques dans et sur les sol

Author

Dignac, Marie-France, Derrien, Delphine, Boly, Vincent, Dignac, Marie-France, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecole Nationale Supérieure en Génie des Systèmes et de l'Innovation (ENSGSI), and Université de Lorraine (UL)

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, sol, matière organique, [SDE]Environmental Sciences, évolution
Published
2021

39. Open-Source Script for Design and 3D Printing of Porous Structures for Soil Science

Author

Bedell, Romain, Hassan, Alaa, Tinet, Anne-Julie, Arrieta-Escobar, Javier, Derrien, Delphine, DIGNAC, Marie-France, Boly, Vincent, Ouvrard, Stéphanie, Pearce, Joshua, Equipe de Recherche sur les Processus Innovatifs (ERPI), Université de Lorraine (UL), GeoRessources, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre de recherches sur la géologie des matières premières minérales et énergétiques (CREGU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Laboratoire Réactions et Génie des Procédés (LRGP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL), Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institute of Ecology & Environmental Sciences of Paris, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Laboratoire Sols et Environnement (LSE), Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Department of Electrical & Computer Engineering, University of Western Ontario, London, ONT. N6A 5B9, Canada, Department of Electrical and Computer Engineering, and University of Western Ontario (UWO)-University of Western Ontario (UWO)

Subjects
[SPI.OTHER]Engineering Sciences [physics]/Other, Technology, [SDE.IE]Environmental Sciences/Environmental Engineering, slicing, modeling, 3D printing, open-source image processing software, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, soil structure, additive manufacturing, open-source
Abstract

International audience; Three-dimensional (3D) printing in soil science is relatively rare but offers promising directions for research. Having 3D-printed soil samples will help academics and researchers conduct experiments in a reproducible and participatory research network and gain a better understanding of the studied soil parameters. One of the most important challenges in utilizing 3D printing techniques for soil modeling is the manufacturing of a soil structure. Until now, the most widespread method for printing porous soil structures is based on scanning a real sample via X-ray tomography. The aim of this paper is to design a porous soil structure based on mathematical models rather than on samples themselves. This can allow soil scientists to design and parameterize their samples according to their desired experiments. An open-source toolchain is developed using a Lua script, in the IceSL slicer, with graphical user interface to enable researchers to create and configure their digital soil models, called monoliths, without using meshing algorithms or STL files which reduce the resolution of the model. Examples of monoliths are 3D-printed in polylactic acid using fused filament fabrication technology with a layer thickness of 0.20, 0.12, and 0.08 mm. The images generated from the digital model slicing are analyzed using open-source ImageJ software to obtain information about internal geometrical shape, porosity, tortuosity, grain size distribution, and hydraulic conductivities. The results show that the developed script enables designing reproducible numerical models that imitate soil structures with defined pore and grain sizes in a range between coarse sand (from 1 mm diameter) to fine gravel (up to 12 mm diameter).

Published
2021

45. Collecte et valorisation « open science » des données de décomposition des litières végétales dans les sols

Author

Jacqueton, Céline, Akkal-Corfini, Nouraya, Bertrand, Isabelle, Chenu, Claire, Dignac, Marie-France, Fanin, Nicolas, Fontaine, Sébastien, Giacomini, S, Justes, Eric, Morvan, Thierry, Nicolardot, Bernard, Recous, Sylvie, Sauvadet, M., Thuriès, L, Vertès, Francoise, Zeller, Bernhard, Lashermes, Gwenaëlle, Fractionnement des AgroRessources et Environnement (FARE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Interactions Sol Plante Atmosphère (UMR ISPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Universidade Federal de Santa Maria = Federal University of Santa Maria [Santa Maria, RS, Brazil] (UFSM), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens (UMR SYSTEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Recyclage et risque (UPR Recyclage et risque), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), EL Mjiyad, Noureddine, Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, [SDE]Environmental Sciences
Abstract

National audience; La décomposition des litières végétales dans les sols a été largement étudiée notamment en raison de l’importance des processus environnementaux mis en jeu. En effet, le recyclage des biomasses végétales permet tout d’abord d’alimenter la biodiversité microbienne des sols. Ces microorganismes sont essentiels pour la qualité des sols puisque les mécanismes de dégradation dont ils sont à l’origine permettent le bouclage des cycles biogéochimiques en assurant la nutrition minérale des cultures en place. De plus, le recyclage des litières végétales alimente le puits de carbone du sol, ce qui contribue à limiter la teneur en dioxyde de carbone de l’atmosphère impliqué dans le réchauffement climatique.De nombreuses observations expérimentales de décomposition ont été publiées pour les litières végétales. Toutefois, ces données sont éparses et pas toujours accessibles. Afin de remédier à cela, les politiques actuelles en terme de gestion des données de la recherche favorise l’Open data et même plus largement l’Open Science, démarche dans laquelle s’inscrit l’INRA (Connehaye et Duée, 2016). Ces politiques sont menées dans des buts patrimoniaux, économiques mais également scientifiques et sociétaux. En effet, l’accès ouvert aux données permet d’éviter leur perte due à l’obsolescence matérielle, de favoriser la réutilisation de recherches antérieures, d’assurer la qualité des données, d’améliorer la visibilité des instituts grâce au système de citations mais également d’améliorer l’image de la science envers les citoyens.L’objectif de ce projet en cours est donc i) de rassembler des données de décomposition des litières végétales dans les sols acquises en conditions contrôlées dans le cadre de programmes de recherche passés et ii) de les partager en Open access. Ces données concernent classiquement la chimie ou biochimie de la ressource, la minéralisation du carbone (C) et la dynamique de l’azote (N), voire du soufre (S) et du phosphore (P) du sol suite à l’apport de litières. La dynamique du C microbien ou des communautés microbiennes a été suivie dans certains cas, et ces caractérisations peuvent avoir été complétées par l’utilisation de marquage isotopique stable (13C, 15N).Matériel & MéthodesLa réalisation d’un plan de gestion des données avec l’outil DMP OPIDoR (Data Management Plan pour une Optimisation du Partage et de l’Interopérabilité des Données de la Recherche) et le modèle INRA a permis de montrer qu’un intérêt particulier devra être apporté aux métadonnées dont une partie peut être perdue au fil du temps, annulant la possibilité de réutiliser les données. Prenant en compte l’importance des métadonnées, nous avons construit un fichier de collecte standardisé qui a été envoyé à chacun des contributeurs identifiés en amont.Une fois la phase de collecte terminée, des procédures de vérifications seront appliquées aux données afin de garantir leur qualité et d’éviter toute valeur aberrante ou erreur de saisie. Cette phase de consolidation permettra de déposer les données dans l’entrepôt institutionnel INRA (DataINRA) sous forme de tableau de données en format .csv comme recommandé par le World Wide Web Consortium (W3C). Les données déposées dans l’entrepôt seront référencées par un identifiant unique (DOI) ce qui permet leur trouvabilité.Les données seront également regroupées dans une base de données permettant leur structuration et leur importation de manière ciblée dans un objectif de réutilisation. Cette base de données sera accessible à tous et référencée sur chacun des sites internet des UMR partenaires. Enfin, la rédaction d’un Data paper en collaboration avec les scientifiques contributeurs permettra de référencer les dépôts par le DOI et la base de données, d’expliquer la provenance et le traitement des données, de décrire les données et leur validation technique ainsi que de décrire leurs potentielles réutilisations avec leurs limites.Il est également prévu que ces données soient ensuite utilisées pour la calibration des paramètres des modèles de la plateforme Sol Virtuel (VSoil). Cette plate-forme ouverte facilite l’utilisation, le couplage et la diffusion de modèles de simulation numérique du fonctionnement de l’interface sol-plante. Elle est équipée du module « décomposition » du modèle agronomique STICS (Brisson et al., 2009) et la version « résidus de culture » est opérationnelle.Résultats et discussionsNos premiers résultats montrent que nous avons pu réunir une dizaine de contributeurs représentants au total une quarantaine de jeux de données concernant 45 litières différentes, dont 6 jeux de données avec des isotopes stables. Ces jeux de données couvrent une très grande diversité des espèces végétales étudiées (Figure 1), des organes de plante concernés, des grandeurs mesurées ou encore des sols utilisés pour les incubations. Les données mesurées en dynamique concernent a minima la minéralisation de C et la dynamique de N minéral du sol ; plusieurs jeux de données contiennent également des mesures de C microbien et quelques-uns des mesures de PLFAs. Les litières ont été caractérisées par leur rapport C/N ainsi que pour la plupart par fractionnement proximal Van Soest. Certaines caractérisation de litières portent également sur les sucres, les polyphénols ou encore la lignine Klason.Figure 1 : Composition des litières parmi les jeux de données déjà collectésConclusionA ce stade, environ 1/3 des jeux de données a déjà été collecté sur la totalité des jeux identifiés. La capitalisation des efforts de recherches des instituts et UMR partenaires est permise grâce à la valorisation des données et à l’optimisation de leur réutilisation. En effet, ces données pourront être réutilisées pour la calibration d’outils numériques ou l’acquisition de références facilement mobilisables. D’autre part, la démarche mise en place dans le cadre de ce projet pourra être élargie aux PROs pour lesquels une base de données à déjà été construite dans le passé (Lashermes et al., 2010).Références bibliographiques :Connehaye, E., Duée . Coord, 2016. Avis sur les enjeux éthiques et déontologiques du partage et de la gestion des données de recherche, INRA Science & Impact et CIRAD, vol.32. Brisson, N., Launay, M., Mary, B., Beaudoin, N. 2009. Conceptual Basis, Formalizations and Parameterization of the Stics Crop Model. Quae, 304 pages. Lashermes, G., Nicolardot, B., Parnaudeau, V., Thuries, L., Chaussod, R., Guillotin, M.L., Lineres, M., Mary, B., Metzger, L., Morvan, T., Tricaud, A., Villette, C., Houot, S. 2010. Typology of exogenous organic matters based on chemical and biochemical composition to predict potential nitrogen mineralization. Bioresource Technology, 101(1), 157-164.

Published
2019

47. 3D Printing: Challenges and Opportunities for its Application in Soil Science

Author

Arrieta Escobar, Javier Andrés, primary, Asadollahi-Yazdi, Elnaz, additional, Valette, Nicolas, additional, AUCLERC, Apolline, additional, Derrien, Delphine, additional, Ouvrard, Stéphanie, additional, Hassan, Alaa, additional, Boly, Vincent, additional, Falk, Véronique, additional, Tinet, Anne-Julie, additional, and Dignac, Marie-France, additional

Published
2020
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48. 3D printing: An emerging opportunity for soil science

Author

Arrieta-Escobar, Javier A., primary, Derrien, Delphine, additional, Ouvrard, Stéphanie, additional, Asadollahi-Yazdi, Elnaz, additional, Hassan, Alaa, additional, Boly, Vincent, additional, Tinet, Anne-Julie, additional, and Dignac, Marie-France, additional

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2020
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