Search

Burn areas are susceptible to bacterial growth and infections, particularly in cases with lengthy periods of hospital stay. Burn wound healing, which involves various molecular and cellular mechanisms, continues to be a significant problem. Growth factors and cytokines play an active and vital role in wound healing. In the present study, the effects of kefir on wound healing in a 2nd-degree mouse burn model infected with e.coli, s.aureus and p.aeruginosa were investigated in vitro. In order to clarify the effects of kefir in the wound healing process, the macroscopic changes in kefir-applied scar tissue as well as wound depth and width were examined and IL-1α, IL-1β, IL-6, IL-8, IL-10 and TNF-α, VEGF, TGF-β protein levels were determined using the qRT-PCR method. The findings of the present study show that kefir has a positive impact on the factors playing a role in wound healing and accelerates the healing process.

Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ TANER ATASOY Yer Bilgisi: İstanbul Gelişim Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Antrenörlük Eğitimi Ana Bilim Dalı Konu: Spor = Sports Dizin: Beden eğitimi = Physical education ; Mesleki benlik saygısı = Occupational self-esteem ; Öğretmen tutumu = Teacher attitude, Yapılan çalışmada Beden Eğitimi Öğretmenlerinin Mesleki Benlik Saygıları ile Engellilere Yönelik Tutumlarının cinsiyet, yaş, eğitim durumu, mesleki tecrübe, bulunulan kurumda çalışma süresi, ailede engelli bireyin bulunma durumu, engellilere yönelik eğitim alma gibi değişkenlere göre karşılaştırılması hedeflenmiştir. Çalışmanın amacı doğrultusunda araştırmanın evrenini, İstanbul ili Bağcılar ilçesinde, 2022-2023 eğitim öğretim yılında, devlet ve özel okullarında görev yapan araştırmaya katılmaya gönüllü 84'ü kadın 136'sı erkek olmak üzere 220 beden eğitimi öğretmeni oluşturmaktadır. Bu araştırmada, nicel araştırma yöntemlerinden nedensel karşılaştırma modeli kullanılmıştır. Kullanılan örnekleme yöntemi ise çalışanların tamamının örnekleme girme şansının eşit ve tesadüfi olduğu, aynı zamanda araştırma sonuçlarının çabuk ve kolay bir şekilde ortaya konulmasını sağlayan basit tesadüfi örnekleme yöntemidir. Elde edilen veriler IBMM SPSS 25.0 paket programı aktarılarak analizler yapılmıştır. Normallik analizleri yapılarak non parametrik analizler uygulanmıştır. İstatistiksel analiz olarak Mann Whitney U, Kruskal Walls H ve Post-hoc analizleri uygulanmıştır. Sonuç olarak Mesleki benlik saygısı ile engellilere yönelik tutumda cinsiyet, çalışılan kurumda görev yapma süresinde ve engellilere yönelik eğitim alma değişkenlerine göre farklılaşmalar gözlemlenirken; yaşa, eğitim durumlarına, mesleki tecrübelerine ve ailede engelli birey olması değişkenlerine göre ise anlamlı farklılıklar bulunamamıştır., In the study, it was aimed to examine the Professional Self-Esteems of Physical Education Teachers and their Attitudes towards the Disabled according to variables such as gender, age, education level, professional experience, working time in the institution, presence of a disabled person in the family, and receiving education for the disabled. In line with the purpose of the study, the universe of the research consists of 220 physical education teachers, 84 female and 136 male, who volunteered to participate in the research, working in public and private schools in the province of Bağcılar in the 2022-2023 academic year. In this study, the causal comparison model, one of the quantitative research methods, was used. The sampling method used is a simple random sampling method, in which all the employees have an equal and random chance of entering the sample, and at the same time, the research results are revealed quickly and easily. The obtained data were analyzed by transferring the IBMM SPSS 25.0 package program. Normality analyzes were performed and non-parametric analyzes were applied. As statistical analysis, Mann Whitney U, Kruskal Walls H analyzes were applied. As a result, while there are differences in professional self-esteem and attitudes towards the disabled, gender, the duration of working in the institution and the status of receiving education for the disabled; No significant differences were found according to age, educational background, professional experience and the presence of a disabled person in the family.

Objective: Hydatid cyst or echinococcosis is a zoonotic parasitic disease caused by the larval stages of Echinococcus granulosus, which is common in our country. It is necessary to use radiological and serological methods as diagnosing this disease based on clinical symptoms is very difficult. In this retrospective study, it was aimed to determine the condition in our region by retrospectively analyzing the hemogram, biochemistry, radiological and pathological findings and the epidemiological data of the patients prediagnosed with hydatid cyst.Materials and Methods: A total of 412 patients, 279 female and 133 male, who applied to various clinics of the Mardin State Hospital with hydatid cyst prediagnosis. 52 patients were diagnosed with hydatid cyst based on ultrasonography, computerized tomography and radiological findings, and liver involvement was detected in all 64 patients, 12 of which were pathologically verified.Results: 38 (59.3%) of 64 patients included in the study were female, 26 (40.6%) were male and their ages ranged from 0-77. The most common symptoms were severe abdominal pain, distention, chest pain, shortness of breath, cough, fever, nausea and vomiting. 83.4% of the patients applied to the general surgery, 5.5% applied to the pediatric surgery and 10.1% applied to other clinics.Conclusion: The parameter with the highest increase was GGT, followed by ALT, AST and ALP. Elevated RDW (29%) was the most common finding in the hemogram parameters, followed by decreased MCV, hematocrit and hemoglobin., Giriş ve Amaç: Hydatid cyst ya da echinococcosis, ülkemizde yaygın olarak görülen Echinococcus granulosus’un neden olduğu ve larval dönemin oluşturduğu zoonotik paraziter bir hastalıktır. Klinik semptomlarla bu hastalığın tanısını koymak oldukça zor olduğundan radyolojik ve serolojik yöntemlerin kullanılması gerekmektedir. Bu retrospektif çalışmada, kist hidatik ön tanısı konulan hastaların hemogram, biyokimya, radyolojik, patolojik bulguları ile epidemiyolojik verileri geriye dönük olarak incelenerek bölgemizdeki durumun belirlenip değerlendirilmesi amaçlanmıştır.Gereç ve Yöntemler: Çalışmaya, Kamu Hastaneler Birliği Mardin Devlet Hastanesine kist hidatik ön tanısı ile çeşitli kliniklere başvuran 279’u kadın 133’ü erkek olmak üzere toplam 412 hasta dahil edilmiştir. 412 hastadan 52’ine ultrasonografi, bilgisayarlı tomografi ve radyolojik bulgular ile kist hidatik tanısı konulmuş olup 12’sinde patolojik olarak doğrulanmış toplam 64 hastanın hepsinde karaciğerde tutulumunun olduğu saptanmıştır.Bulgular: Çalışmaya alınan 64 hastanın 38 (%59.3)’i kadın, 26 (%40.6)’sı erkek olup yaşları 0 ile 77 arasında değişmektedir. Hastalarda şiddetli karın ağrısı, karın şişliği, göğüs ağrısı, nefes darlığı, öksürük, ateş, bulantı, kusma en sık olarak saptanan semptomlardır. Hastaların sırasıyla; %83.4’ü genel cerrahi, %5.5’inin çocuk cerrahisi ve %10.1’inin ise diğer kliniklerine başvurduğu belirlenmiştir.Sonuç: Biyokimyasal olarak tanı anında en sık yükselen test GGT olup, bunu ALT, AST, ALP artışı izlemiştir. Hemogram parametrelerinde RDW yüksekliği (%29) en sık rastlanılan bulgu olup, bunu hematokrit, hemoglobin ve MCV düşüklüğü sırayla takip etmiştir.

Bu çalışmada, Mardin Devlet Hastanesi Ortopedi Servisinde yatan ve implant takılı toplam 180 hastanın yara yerlerinden alınan örneklerin 125’inde Staphylococus aureus suşu izole edilirken, 62’sinde ise Staphylococus epidermitis suşu izole edilmiştir. Bu izolatlarda Multiplex PCR ile slime üretiminden sorumlu icA ve icD genlerinin varlığı, Kongo red agar (CRA), standart test tüp (ST) ve mikropleyt (MP) gibi fenotipik yöntemlerle slime üretimleri, disk difüzyon agar ile suşların antibiyotik dirençlerine bakılarak slime (biyofilm) tabakasının direnç mekanizmasındaki rolünün saptanması amaçlanmıştır. İncelenen stafilokok suşlarının CRA, MP ve ST testleri ile slime üretimi sırasıyla %62.4, %57,7 ve %52.9 oranında pozitif bulunurken icA ve icD gen pozitifliği ise %65,6 (82/125) bulunmuştur. İncelenen tüm stafilokoklar ise teikoplanine ile vankomisin antibiyotiklerine karşı duyarlı oldukları belirlendi. Antibiyotiklere karşı direnç oranlarının slime pozitif suşlarında slime negatif suşlara göre daha yüksek olduğu görülürken, sadece penisilin, ampisilin ve eritromisine dirençlilik oranları istatistiksel olarak anlamlı bulundu. Sonuç olarak, icA ve icD genleri bakımından pozitif olan suşlarda antibiyotiklere dirençlilik oranları anlamlı bulundu., In this study, Staphylococus aureus strain was isolated in 125 of the samples of 180 patients’wounds who were hospitalized in Mardin State Hospital Orthopedic Service and implanted, while Staphylococus epidermitis strain was isolated in 62 of them. In these isolates, it was aimed to determine the presence of ica A and ica D genes responsible for slime production by Multiplex PCR, to determine slime production by phenotypic methods such as Congo red agar (CRA), standard test tube (ST) and microplate (MP) and to determine the role of the slime (biofilm) layer in the resistance mechanism by looking at the antibiotic resistance of the strains with disc diffusion agar. While the CRA, MP and ST tests of the staphylococcus strains examined were found to be respectively 62.4%, 57.7% and 52.9% positive, the ica A and ica D gene positivity was 65.6% (82/125). It was determined that all staphylococci examined were sensitive to teicoplanin and vancomycin antibiotics. While antibiotic resistance rates were higher in slime positive strains than slime negative strains, only penicillin, ampicillin and erythromycin resistance rates were found statistically significant. As a result, resistance to antibiotics was found to be significant in strains positive with regard to ica A and ica D genes.

Aim: Th e aim of this study was to investigate the presence of genes encoding staphylococcal enterotoxins (SEs), exfoliative toxins (ETAs, ETBs), and toxic shock syndrome toxin-1 (TSST-1) by polymerase chain reaction (PCR) in Staphylococcus aureus strains isolated from various clinical samples from the Mustafa Kemal University Hospital. In addition, PCRbased restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the coa gene was employed to genotype the isolates. Materials and methods: A total of 120 S. aureus strains isolated from various clinical samples (blood, wounds, urine, conjuctival swabs, and tracheal aspirate) over a 1 year period, 2007-2008, were used in this study. Results: Almost 65.8% of the isolates possessed at least one toxin gene. Th e genes most frequently found were seg-sei (40.8%), followed by sea (30%) and eta (19.2%). Overall, 35 toxin genotypes were observed, among which the genotypes seg-sei, sea-seg-sei, and sea-see predominated at the rate of 8.3%, 5.8%, and 5%, respectively. Four coagulase genotype patterns were observed, with molecular sizes ranging from 570 to 970 bp. Coa-based RFLP analysis revealed 7 diff erent patterns using AluI. Conclusion: Our results have revealed that toxin genes were very prevalent among S. aureus isolates, and the toxigenic isolates were independent of the genotypes obtained by PCR-RFLP of the coa gene (P > 0.05)., Amaç: Bu çalışmanın amacı Mustafa Kemal Üniversitesi Hastanesi’nde farklı klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında stafi lokokkal enterotoksinler (SE), eksfoliyatif toksinler (ETA, ETB) ve toksik şok sendrom toksin-1’i (TSST-1) kodlayan genlerin Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile belirlenmesi ve koagulaz genine dayalı restriction fragment length polymorphism (PZR-RFLP) ile tiplendirilmesidir. Yöntem ve gereç: Çalışmada farklı klinik örneklerden (kan, yara, idrar, konjuktival sürüntü örneği ve trakeal aspirat) 2007-2008 yılları arasında izole edilen 120 S. aureus suşu kullanıldı. Bulgular: İzolatların % 65,8’inin en az bir toksin geni taşıdığı saptandı. En yaygın toksin genlerinin seg-sei (% 40,8), sea (% 30) ve eta (% 19,2) olduğu tespit edildi. Çalışmada 35 toksin genotipinden, seg-sei (% 8.3), sea-seg-sei (% 5,8) ve sea-see (% 5) en yaygın genotipler olarak belirlendi. Moleküler büyüklükleri 570-970 bp arasında değişen 4 koagulaz genotipi gözlendi. Koagulaz geninin AluI ile kesilmesi ile yapılan RFLP analizi ile 7 farklı pattern bulundu. Sonuç: S. aureus izolatları arasında toksin genlerinin oldukça yaygın olduğu ve toksijenik suşların coa genine dayalı yapılan PZR-RFLP ile elde edilen genotiplerden bağımsız olduğu sonucuna varılmıştır (P > 0,05).

Necm Suresi içerisinde secde ayeti barındırarak inzâl olan ilk suredir. Kerim Kitabımız'ın elli üçüncü suresidir. Mekkî sûrelerdendir. Bu sûre Efendimiz'in en önemli mûcizelerini anlatması bakımından önemlidir. Özellikle İsra hadisesini ve ondaki Efendimizin konumunu daha detaylı görmekteyiz. Necm Suresi Efendimiz'i her konuda desteklemiştir. Özellikle her söylediğinin vahiy olması Efendimiz'e ayrı bir değer ve konum ortaya çıkarmıştır. Âlusi ve İbn Âşur, ikisi de hem dirâyet hem de rivayet tefsirini birbirine mezc etmiş müfessirlerdir. Yaşadıkları coğrafya itibariyle şarkın ve garbın düşünce sistemini aktarmaya çalışmışlardır. Biz de hem klasik hem de modern anlamda düşünceleri göstermeye çalıştık. Surenin tefsirini yapmadan önce, giriş bölümünde tefsirin önemini ve ona olan ihtiyacı anlattıktan sonra neden Necm Suresini tercih ettiğimizi anlatmaya ve farklı kaynaklardan yararlanarak ayetlerden elde edeceğimiz çıkarımları açıklamaya çalıştık. Ulemanın genelde ittifak etmelerinin yanında yirmiye yakın ayette rivayetleri farklı yorumladıklarını gördük. Garanik hadisesinde Efendimiz her yönüyle desteklenmiş ve müşriklerin itham ve fitneleri boşa çıkarılmıştır. Şahsi sorumluluk ilkesi surede işlenmiş ve hiçbir kimsenin değil bir kimsenin yaptıklarından sorumlu olmadığı serdedilmiştir. Kur'an'ı Kerim'in nüzûlünün üzerinden asırlar geçse de ''Hala diri ve yeni nâzil olmuş gibi canlıdır.'' kuralı anlatılmaya çalışılmıştır. Âyetler karşılaştırılarak mukarren metod uygulanmaya çalışılmıştır. Çok fazla îrabî tahlillere girmeden yanlız manaya odaklandı. Çok fazla başlık kullanmadan ana konuya dikkat çekildi. Müfessirleri ve tefsirleri tanıtmama nedenimiz, daha çok ayetlerin çıkarımlarını açıklamaktır.Bu çalışmayı tefsir mev'zui tarzında düşünerek yaptık. Tefsirlerde genelde aradığımız hususları almaya çalıştık.Anahtar kelimeler: Necm Sûresi, Âlûsî, İbn Âşur, Tefsir, Karşılaştırma. It is the first time in which the prophetic verse contains a verse in Surah Najm. It is the fifty third surah of our book. One of the surahs of Mecca. This time is important in terms of telling the most important miracles of our Lord. We especially see the Israeli incident and the position of our Lord in more detail. Surah Najm supported our Lord in all matters. In particular, the revelation of everything he says has revealed a distinct value and position to our Prophet. Âlusi and İbn Âşur are mufisirs that both blended in the dirac and narrative commentary to each other. They tried to convey the thought system of song and garb in terms of their geography. We tried to show both classical and modern ideas. Before explaining the surah, we tried to explain why we prefer the surah Necim after explaining the importance and need of the commentary in the introduction and explaining the inferences from the verses by using different sources. We have seen that the Ulama generally interpreted the narratives differently in almost twenty verses as well as alliance. In the Garanik incident, our Prophet was supported in every aspect and the accusations and corruption of the polytheists were frustrated. The principle of personal responsibility has been established in the surah and it has been demonstrated that no one is responsible for the actions of any person, not anyone. Even though centuries passed over the Qur'an's verse, '' It is still alive and alive as if it had been new.` rule was tried to be explained. The verses were compared and mucarren method was applied. The focus was on lonely meaning, without going through too much of an analysis. The main topic was noted without using too many titles. The reason why we do not introduce commentators and commentaries is to explain the inferences of the verses.We did this work by thinking in the style of commentary mev'zui. We have tried to get the issues we usually seek in the exegesis.Key words: Necm Surah, Alusi, Ibn Âsur, tafsir 65

Amaç: Karbapenemler, Acinetobacter baumannii infeksiyonlarının tedavisinde kullanılan en önemli geniş spektrumlu antibiyotiklerdir. Fakat dünya genelinde karbapenemlere direnç gittikçe artmaktadır. Bu çalışmamızda, karbapenem direnci saptanan A. baumannii suşlarında gözlenen OXA tipi karbapenemaz genlerinin dağılımını, gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle incelemeyi ve epidemiyolojik veri sunmayı amaçladık. Yöntemler: Ocak 2016-Ocak 2018 arasında klinik örneklerden izole edilen karbapeneme dirençli 20 A. baumannii suşu çalışmaya dahil edildi. Bu suşlardan DNA izolasyonları gerçekleştirildi ve OXA-23, OXA-24, OXA-51 ve OXA-58 karbapenemazlarının genlerine spesifik primer ve TaqMan probları kullanılarak gerçek zamanlı PCR yöntemiyle OXA karbapenemaz genlerinin dağılımı incelendi. Bulgular: Karbapeneme dirençli A. baumannii suşlarının 16 (%80)’sının duyarlı olduğu tigesiklin bu suşlara bağlı infeksiyonlar için en iyi seçenekti. Tüm suşlarda blaOXA-51 saptanırken, blaOXA-24 sadece 1 (%5) suşta saptandı. Yirmi suştan 10 (%50)’unda blaOXA-23 ve blaOXA-51 birlikteliği vardı. Sonuçlar: Karbapeneme dirençli A. baumannii suşlarındaki OXA tipi karbapenemazların dağılımında blaOXA-23 ve blaOXA-51 birlikteliğinin daha sık olması dikkati çekmiştir. Gerçek zamanlı PCR gibi hızlı ve güvenilir sonuç verebilecek tekniklerle, böyle dirençli suşların rutin sürveyansları yapıldığında değerli epidemiyolojik veriler elde edilebilir. Klimik Dergisi 2019; 32(2): 123-6.

Amaç: Giardia intestinalis flagellalı, Giardiyaz’a neden olan bir protozoondur ve dünya çapında önemli bir sorundur. Moleküler yöntemlerle sekiz farklı genotipi saptanan G. intestinalis’de, A ve B genotipinin, insan ve memelilerde hastalıklarla ilişkili olduğu ve farklı genotiplerin, farklı klinik tablolar meydana getirebildiği bildirilmektedir. Biz de bu bilgiler ışığında, giardiyaz tanısı almış ve G. intestinalis pozitif saptanan dışkı örneklerinde bulunan G. intestinalis genotiplerinin dağılımını real-time PCR yöntemi ile belirlemeyi ve moleküler epidemiyolojik bir veri sunmayı amaçladık. Gereç ve Yöntem: Ocak 2016-Ocak 2018 tarihleri arasında, hem nativ hem de lugol ile mikroskobik olarak incelenen dışkı örnekleri içinde G. intestinalis kist ve/veya trofozoit’i pozitif bulunan 50 G. intestinalis pozitif hastanın dışkı numuneleri çalışmaya dâhil edildi. Dışkı örneklerinden DNA izolasyonu gerçekleştirildikten sonra genotip A ve genotip B için spesifik primerler kullanılarak real-time PCR ile analiz edildi. Bulgular: Çalışmamıza dâhil edilen 50 giardiyaz tanılı hastanın dışkı örneklerinde, 28’inde (%56) A genotipi saptanırken, 17’sinde (%34) B genotipi, 5’inde (%10) ise hem A, hem de B genotipi bulundu. Cinsiyete göre saptanan genotipler incelendiğinde, erkeklerde ve kadınlarda sırasıyla 25 (%50) ve 25 (%50) olarak bulundu. Sonuç: Sonuç olarak, çalışmamız ile ülkemizde giardiyaza neden olan ama ayrımı yalnızca moleküler yöntemlerle ortaya konabilen G. intestinalis genotipleri incelenerek, G. intestinalis’in A genotipinin, B genotipine oranla biraz daha fazla olduğu belirlendi. Ülkemizde G. intestinalis’in moleküler epidemiyolojisine yönelik veriler sınırlıdır. Bu çalışmanın buna katkı sağlayacağı düşüncesindeyiz., Objective: As a causative agent giardiasis, Giardia intestinalis is a flagellated protozoa, and it is a major problem worldwide. Eight different genotypes have been identified in G. intestinalis by molecular method. It has been reported that the genotypes A and B are related to diseases in human and mammals and different genotypes cause different clinical pictures. In this study, we aimed to determine the distribution of G. intestinalis genotypes in stool specimens of G. intestinalis positive patients by realtime PCR and to present a molecular epidemiological data. Material and Methods: Between January 2016 and January 2018, stool samples from fifty G. intestinalis cyst and / or trophozoite positive patients were included in the study. Native andlugol-treated stool specimens were microscopically examined. DNA isolation from stool specimens was performed and then analyzed by real-time PCR using specific primers for genotypes A and B. Results: In stool samples of fifty patients with diagnosis of giardiasis included in our study, genotype A (n=28: 56%), genotype B (n=17: 34%) and both genotype A and genotype B (n=5: 10%) were detected. These genotypes were found in 25 (50%) male, and 25 (50%) female patients. Conclusion: In conclusion, we investigated G. intestinalis genotypes which cause giardiasis in our country but these genotypes can only be distinguished by molecular methods. We found that G. intestinalis genotype A is slightly more frequent than genotype B. In our country, the data on the molecular epidemiology of G. intestinalis genotypes are very limited. We believe this work will contribute to this.

Background & objectives: This study was carried out to evaluate the association between the antibiotic susceptibility patterns and the antibiotic resistance genes in staphylococcal isolates obtained from various clinical samples of patients attending a teaching hospital in Hatay, Turkey. Methods: A total of 298 staphylococci clinical isolates were subjected to antimicrobial susceptibility testing. The genes implicated in resistance to oxacillin (mecA), gentamicin (aac(6’)/aph(2”), aph(3’-IIIa, ant(4’)-Ia), erythromycin (ermA, ermB, ermC, and msrA), tetracyclin (tetK, tetM), and penicillin (blaZ) were amplified using multiplex PCR method. Results: Methicillin resistance rate among 139 Staphlococcus aureus isolates was 16.5 and 25.9 per cent of S. aureus carried mecA gene. Of the 159 CoNS isolates, methicillin resistance rate was 18.9 and 29.6 per cent carried mecA gene. Ninety four isolates identified as gentamicin resistant phenotypically, contained at least one of the gentamicin resistance genes [aac(6’)/aph(2”), aph(3’)-IIIa, ant(4’)-Ia], 17 gentamicin-susceptible isolates were found as positive in terms of one or more resistance genes [aac(6’)/aph(2”), aph(3’)-IIIa, ant(4’)-Ia] by multiplex PCR. A total of 165 isolates were resistant to erythromycin, and contained at least one of the erythromycin resistance genes (ermA, ermB, ermC and msrA). Phenotypically, 106 staphylococcal isolates were resistant to tetracycline, 121 isolates carried either tetK or tetM or both resistance genes. The majority of staphylococci tested possessed the blaZ gene (89.9%). Interpretation & conclusions: The present results showed that the phenotypic antibiotic susceptibility patterns were not similar to those obtained by genotyping done by multiplex PCR. Rapid and reliable methods for antibiotic susceptibility are important to determine the appropriate therapy decisions. Multiplex PCR can be used for confirmation of the results obtained by conventional phenotypic methods, when needed.

We aim to present a unique case with discharging lacrimal gland fistula secondary to severe head trauma by an animal. A 9-year-old girl presented with serous fluid discharge from a cutaneous fistula in the left orbital region. The patient had history of surgery for traumatic frontal bone fracture and skin laceration in the superior orbital rim three weeks earlier. She underwent a complete ophthalmological examination and there was no anterior segment or fundus pathology. The orifice of the fistula was detected in mediolateral part of the left superior orbital rim and fluid secretion was increasing with irritation of the left eye. Neurosurgical complications were excluded and radiological assessment was nonremarkable. The patient’s legal representatives were informed and lacrimal gland fistulectomy was planned. However, the fistula was self-closed one week after initial ophthalmological examination, and the patient had no symptoms. In conclusion, traumatic injuries of superior orbital region should be carefully evaluated and wounds should be well closed to prevent consecutive lacrimal gland fistula.

This study was conducted to investigate the coagulase gene polymorphism of Staphylococcus aureus isolated from subclinical bovine mastitic milk samples from 3 different Turkish cities (Hatay, Gaziantep, and Burdur). Amplification of the coagulase gene from 80 S. aureus isolates produced 5 different polymerase chain reaction (PCR) products; 79 isolates showed only 1 amplicon, and 1 isolate showed 2 amplicons. The isolates were grouped into 9 genotypes by analysing the restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the gene; the 2 most common genotypes accounted for 73.8% of the isolates. The results indicated that many coagulase gene genotypes are present in the studied regions and only 1 or 2 genotypes predominated.

In this study, two different Ottoman and Turkish handwritten recognition systems have been developed using Hidden Markov Model (HMM) and Recurrent Neural Network (RNN). The systems are tested in both public use datasets and Civil Registration and Nationality (CRN) dataset.

Bu çalışmada otomatik konuşma tanıma (OKT) için tek kanalda konuşma-müzik ayrıştırma problemini inceledik. Çalışmanın motivasyonu, tanıma hatalarını arttıran arka-plan müziğinin etkisini azaltarak konuşma tanıma başarımını arttırmaktır. Bu çalışmada tek kanalda konuşma-müzik ayrıştırma metodu olarak Negatif Olmayan Matris Ayrıştırma (NOMA) karışımı modeli tabanlı bir yöntem tanımlanmıştır. Arka-plan müziklerini içeren bir katalog verildiği ve müziğin katalogdaki bir cıngıl tarafından üretildiği varsayımı altında karma konuşma ve müzik spektogramları için bir üretici model önerilmiştir. Önerilen yöntemde konuşma sinyali karma sinyalden yarı güdümlü biçimde kestirilen bir NOMA modeli ile temsil edilmektedir. Bu yöntem sırası ile Kullback-Leibler (KL) ve Itakura-Saito (IS) ıraksay ölçütlerine karşılık düşen Poisson ve karmaşık Gauss gözlem modelleri ile test edilmiştir. Deneylerimize göre önerilen karışım modeli hem konuşma-müzik ayrıştırma hem de konuşma tanıma testlerinde standart NOMA modellerinden daha iyi sonuçlar vermektedir. Daha sonra, önerilen NOMA karışım tabanlı yöntemin ayrıştırma başarımını iyileştirmek için önerilen olasılık/-sal model ve yöntem konuşma sinyali hakkındaki önsel bilgiyi kullanacak şekilde geliştiril/-miştir. Son olarak, konuşma-müzik ayrıştırma için NOMA tabanlı kelime altı konuşma modellerinin kullanılması önerilmiştir. Bu stratejinin genel bir konuşma modeline kıyasla daha iyi bir konuşma tanıma başarımı sağladığı gösterilmiştir. In this dissertation, we analyze the single-channel speech-music separation problem for automatic speech recognition (ASR). The motivation of the study is to increase the performance of the ASR systems by decreasing the effect of background music. We describe a single-channel speech-music separation method based on a mixture of non-negative matrix factorization (NMF) model. Given a catalog of background music material, we propose a generative model for the superposed speech and music spectrograms. The background music signal is assumed to be generated by a jingle in the catalog and it is modeled by a scaled conditional mixture model representing the jingle. The speech signal is modeled by an NMF model that is estimated in a semi-supervised manner from the mixed signal. The approach is tested with Poisson and complex Gaussian observation models that correspond respectively to Kullback-Leibler (KL) and Itakura-Saito (IS) divergence measures. Our experiments show that the proposed mixture model outperforms a standard NMF method both in speech-music separation and automatic speech recognition (ASR) tasks. Moreover, we extend the mixture of NMF based single-channel speech-music separation method such that it incorporates prior speech information to enhance the separation performance of the method. Finally, we propose to use sub-word NMF-based speech models for the separation of speech and music signals. By applying such a strategy, it is demonstrated that the recognition accuracy can be improved as compared to using a general speech model. 186

In this study, it was aimed to determine staphylococcal enterotoxin (SE) genes, toxic shock syndrome toxin (TSST) gene and exfoliative toxin (ET) genes in 110 Staphylococcus aureus strains from gangrenous mastitis cases in seven ewe flocks in Sanliurfa, Turkey. Among investigated isolates, only sec and tst toxin genes were detected. The results of this study showed that the rates of enterotoxin production were high (100%) in S. aureus strains isolated from ovine gangrenous mastitis. Moreover, it was demonstrated that S. aureus causing gangrenous mastitis harboured sec and tst genes suggesting that these genes may have a role in ovine mastitis pathogenesis., Bu çalışmada, Şanlıurfa yöresinde, yedi koyun sürüsündeki gangrenli mastitis vakalarından izole edilen 110 Staphylococcus aureus suşlarında stafilakokal enterotoksin, toksik şok sendrom toksin ve eksfoliatif toksin genleri bakımından araştırılması amaçlandı. İncelenen suşlarda yalnızca sec ve tst toksin genleri saptandı. Bu çalışmanın sonucunda koyunlarda gangrenöz mastitislerden izole edilen S. aureus suşlarında enterotoksin üretiminin yüksek (%100) olduğu, izole edilen S. aureus suşlarının sec ve tst genlerini içerdiği ve bu genlerinde koyunlarda mastitisin patogenezisinde rol oynayabileceği kanısına varıldı.

In order to study the prevalence and etiology of subclinical mastitis a bacteriological survey on 16 Awassi dairy sheep flocks in southern Turkey was conducted. A total of 1458 milk samples from 729 Awassi ewes in mid-lactation were tested with the California mastitis test (CMT). Samples from 170 (11.7%) glands and 135 (18.5%) sheep had positive CMT results. Bacteria were isolated from 93 (6.4%) udder halves and 82 (11.2%) ewes. Positive CMT and bacteriological results were combined to define subclinical mastitis. The prevalence of subclinical mastitis and positive CMT samples among the different flocks ranged from 1.9% to 11.5% and 2.8% to 21.9% of the glands, and 3.8% to 19% and 5.7% to 31.3% of the ewes, respectively, with averages of 6.4% and 11.7% of the glands, and 11.2% and 18.5% of the ewes, respectively. Coagulase-negative staphylococci (CNS) were the most prevalent bacteria, representing 76.5% of the isolates. Staphylococcus epidermidis (35.7%) was the most prevalent species, followed by Staphylococcus xylosus (10.2%), Staphylococcus saprophyticus (10.2%), Staphylococcus warneri (9.2%), and Staphylococcus intermedius (7.1%). Antimicrobial susceptibility of 78 Staphylococcus isolates was evaluated in this study. The most effective antibiotics were cephalothin (97.4%), sulfamethoxazole-trimethoprim (97.4%), amoxicillin + clavulanic acid (97.4%), enrofloxacin (94.9%), gentamycin (92.3%), and erythromycin (84.6%). The relationship between CMT +1 score and the Staphylococcus spp. isolation rate was statistically significant (P < 0.001). It was concluded that subclinical mastitis is not highly prevalent and it does not pose a significant health problem for milking Awassi sheep flocks in southern Turkey., Bu çalışma, Türkiye’nin güney bölgelerinde yetiştirilen 16 İvesi sürüsünde subklinik mastitislerin prevalans ve etiyolojisinin belirlenmesi amacıyla yapıldı. Çalışma materyalini 729 ivesi koyununa ait 1458 süt örneği oluşturdu. Örnekler laktasyonun orta döneminde, California mastitis testi (CMT) uygulandıktan sonra alındı. Çalışma materyalini oluşturan koyunların 135’inde (% 18,5) ve meme yarımlarının 170’inde (% 11,7) CMT pozitif sonuç elde edildi. Bakteri izolasyonu 93 (% 6,4) meme lobundan ve 82 (% 11,2) koyundan gerçekleştirildi. Hem CMT sonucu pozitif hem de bakteri izolasyonu yapılan örnekler mastitis olarak değerlendirildi. Subklinik mastitis ve CMT pozitif örneklerin sürülerde meme yarımı bazında dağılımı sırasıyla, % 1,9 ile % 11,5 ve % 2,8 ile % 21,9 arasında; koyun bazında dağılım ise sırayla % 3,8 ile % 19,0 ve % 5,7 ile % 31,3 arasında gerçekleşti. Subklinik mastitis ve CMT pozitif örneklerde ortalama dağılımlar ise meme yarımı bazında sırayla, % 6,4 ile % 11,7 ve koyun bazında % 11,2 ile % 18,5 olarak belirlendi. Koagulaz negatif stafilokoklar (KNS) % 76,5 ile en sık izole edilen bakteri grubunu oluşturdu. En sık izole edilen bakteri Staphylococcus epidermidis (% 35,7) olarak belirlendi, bunu Staphylococcus xylosus (% 10,2), Staphylococcus saprophyticus (% 10,2), Staphylococcus warneri (% 9,2), ve Staphylococcus intermedius (% 7,1) izledi. Antibiyotik duyarlılık testi uygulanan 78 stafilokok izolatına en etkili antibiyotiklerin sırasıyla, cephalothin (% 97,4), sulfamethoxazole-trimethoprim (% 97,4), amoxicillin + clavulanic acid (% 97,4), enrofloxacin (% 94,9), gentamycin (% 92,3) ve erythromycin (% 84,6) olduğu belirlendi. CMT skoru +1 olan örneklerden stafilokok türlerinin izole edilmesi istatistik açıdan önemli bulundu (P < 0,001). Sonuç olarak, Türkiye‘nin güney bölgesindeki İvesi sürülerinde subklinik mastitis oranının düşük olduğu ve önemli bir sürü problemi olmadığı belirlendi.

Bu çalışmada, subklinik inek mastitislerinden izole edilen 127'si Staphylococcus aureus ve 65'i koagulaz negatif stafilokok (KNS) toplam 192 stafilokok suşunun biyofilm üretimi Kongo Red Agar (CRA), Mikropleyt (MP) ve Standart Tüp (ST) testleri kullanılarak araştırıldı ve test sonuçları karşılaştırıldı. İncelenen stafilokok suşlarının CRA, MP ve ST testleri ile biyofilm üretimi sırasıyla %72.4, %67,7 ve %62.9 oranında pozitif bulundu. CRA, MP ve ST testleri arasında istatistiksel olarak önemli farklılık saptanmadı (p>0.05). Ayrıca, stafilokok suşlarının çeşitli antibiyotiklere karşı olan dirençlilikleri agar disk diffuzyon yöntemi ile araştırıldı. Biyofilm pozitif (BP) stafilokok suşlarında penisilin G, ampisilin, amoksisilin/klavulanik asit, tetrasiklin, eritromisin, gentamisin, enrofloksasin olan direnç oranları sırasıyla %73.8, %69.7, %6.2, %20.7, %21.4, %1.4, %0.7, biyofilm üretmeyen (BN) stafilokok suşlarında ise %42.6, %23.4, %4.3, % 14.9, %19.1, %0.0 olarak tespit edildi. İncelenen tüm stafilokoklar ise vankomisin ve teikoplanine duyarlı bulundu. Antibiyotiklere dirençlilik oranları BP suşlarda BN suşlara göre daha yüksek bulunmakla birlikte, sadece penisilin, ampisilin ve eritromisine dirençlilik oranları istatistiksel olarak anlamlı bulundu (p0.05). In addition, antibiotic resistance of Staphylococcus spp. against various antibiotics was also determined by the agar disk diffusion method. The percentage of resistance against penicilin G, ampicilin, amocycilin/clavulanic acid, tetracyclin, eritromycin, gentamycin, and enrofloxacin in biofilm producing (SP) Staphylococcus spp. was 73.8 %, 69.7 %, 6.2 %, 20.7 %, 21.4 %, 1.4 %, and 0.7%, respectively. For non-slime producing (SN) Staphylococcus spp. was 42.6%, 23.4%, 4.3%, 14.9 %, 19.1%, 0.0%, respectively. All the strains were susceptible to vancomycin and teicoplanin. Although higher antibiotic resistance rates were observed in SP strains than that of SN strains, statistically significant difference in resistance to three antibiotics (penicilin, ampicilin, and eritromycin) were found between SP strains and SN strains (p

Özet: Bu çalışma, üç farklı şehirden (Hatay, Gaziantep ve Burdur) toplanan mastitisli sığır sütlerinden izole edilen 80 Staphylococcus aureus susunun koagulaz gen polimorfizmini araştırmak amacıyla yapıldı. Seksen S. aureus susu 5 farklı polymerase chain reaction (PCR) amplikonu oluştururken, 79 izolat 1 amplikon ve 1 izolat 2 amplikon oluşturdu. İzolatlar, koagulaz geninin restriction fragment length polymorphism (RFLP) analizi ile 9 genotipe ayrıldı. İki yaygın genotip izolatların % 73,8'ini oluşturdu. Sonuçlar, çalışılan bölgelerde farklı genotiplerin olduğunu ve bunlardan sadece bir veya iki genotipin dominant olduğunu göstermektedir, This study was conducted to investigate the coagulase gene polymorphism of Staphylococcus aureus isolated from subclinical bovine mastitic milk samples from 3 different Turkish cities (Hatay, Gaziantep, and Burdur). Amplification of the coagulase gene from 80 5. aureus isolates produced 5 different polymerase chain reaction (PCR) products; 79 isolates showed only 1 amplicon, and 1 isolate showed 2 amplicons. The isolates were grouped into 9 genotypes by analysing the restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the gene; the 2 most common genotypes accounted for 73.8% of the isolates. The results indicated that many coagulase gene genotypes are present in the studied regions and only 1 or 2 genotypes predominated.

Gozü Kapalı Kaynak Ayrıştırma (GKKA) yontemleri genellikle aynı anda birden fazla kişinin konuştugu durumlarda konusmaların birden fazla mikrofondan alınarak, konusmacıların konusmalarının birbirinden ayrıştırılması için kullanılmaktadır. Bu çalışma zaman alanında GKKA yontemi üzerine odaklanmıştır. Uygulanan yontem, kaynak sinyallerinin istatiksel olarak bağımsız olma, duragan olmama ve beyaz olmama ozelliklerini kullanmaktadır. Kaynakların istatiksel bagımsız olması ayrıştırılmış sinyal-lerin çapraz ilintilerinin tüm zaman otelemelerinde sıfır olmasını gerektirir. Beyaz olmama ozelligi çıktı sinyallerinin çapraz ilintilerinin birden fazla zaman otelelemelesinde eş zamanlı olarak en küçüklenmesiyle, duragan olmama ozelligi ise çıktı sinyallerinin çapraz ilintilerinin eş zamanlı olarak birden fazla zaman aralıgında en küçüklenmesiyle kullanılmaktadır. Kullanılan yontemde, ayrıştırıcı süzgeç katsayıları tanımlanan maliyet fonksiyonunun döngülü eniyileme yontemi kullanılarak güncellenmesiyle elde edilmiştir. Katsayıların güncellenmesinde Dogal Gradyan yonteminden yararlanılmıştır ve kat-sayıların güncellenmesi parçalı gerçek zamanlı olarak gerçeklenmiştir. Ayrıştırıcı ma-trislerin Sylvester yapısında olma ozelligi ve bazı yaklaşıklamalar kullanılarak yontem verimli bir sekilde gerçeklenmiştir.Sentetik olarak karıştırılmış sinyallerde anlatılan yontemin basarılı oldugu sap-tanmıştır. Aynı zamanda bu yontem sentetik olarak gurultulendirilmiş sinyallerdeki gurültünun azaltılmasında kullanılmıştır. Bu başarımlar kullanılan yontemin konuşma tanıma motorlarında bir ön-üç işlemcisi gibi kullanılabilecegini onermektedir. Blind Source Separation (BSS) methods are generally used to separate the speechof people in the same room by using audio data recorded by multi-microphone system.This thesis focuses on a time-domain technique in BSS. In particular, the methodpresented uses the statistical independence of sources, the non-stationarity and the nonwhitenessof speech signals. The statistical independence of sources implies that crosscorrelationsof demixed signals over all time-lags are null. Here, non-whiteness propertyis exploited by simultaneous minimization of output cross-correlations over multipletime-lags and non-stationarity property is exploited by simultaneous minimization ofoutput cross-correlations at different time-instants. In the method, the demixing filtercoefficients are obtained using an iterative optimization method and cost function. Thecoefficients are updated via the Natural Gradient adaptation method and the methodis implemented in a block-online manner. Using Sylvester structure of the demixingfilter matrix and with some approximations, the method is implemented efficiently.The method is found to be successful in simulations that are done using syntheticallymixed signals in the computer. Moreover, the method is used to separate thenoise from the speech signals that are also mixed synthetically and this suggests thatthe method can be used as a front-end processor for speech recognition applications. 73

ivTAM ZAMANINDA ÜRETİM VE OTOMOTİV SEKTÖRÜNDE KANBANUYGULAMASI(Yüksek Lisans Tezi)Cemil DEMİRGAZİ ÜNİVERSİTESİFEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜMayıs 2006ÖZETGünümüzün üretim işletmeleri yeteri kadar kar amaçlayaraksürekliliklerini sağlayabilmek için ülke içi rekabet ortamını yanısıra global rekabet ortamına da ayak uydurmak zorundadırlar.Bunu sağlayabilmek için işletmelerin düşük maliyetli ve yüksekkaliteli mal ve hizmet üretmeleri gerekmektedir. İşletmefaaliyetlerinin etkin kılınması ve yüksek kalitenin yakalanabilmesi,üretim teknolojilerindeki gelişmelerin izlenerek işletmenin üretimyapısının bu değişimlere uygun hale getirilmesini ve otomasyonunyanı sıra kalifiye eleman istihdam edilmesini gerektirmektedir.Termin sürelerinin oldukça kısaldığı, stok maliyetlerininüstlenilmek istenmediği bugünkü sanayide TZÜ yaklaşımı birzorunluluk olarak benimsenmesi gereken bir yaklaşım olarakortaya çıkmıştır.Uygulamalar bölümünde, ham maddeleri ve yarı mamul stoklarınıminimize eden, kusurları ortadan kaldıran, üretimi dengeleyen,üretim sürecini devamlı olarak basitleştiren, esnek ve çokfonksiyonlu iş gücü sağlayan üretim kontrol sistemi olarak bilinenTZÜ sistemi ve ülkemiz ekonomisinin itici sektörü olan otomotivsektörü hakkında bilgi vermeye çalıştım. Lisans ve Yüksek Lisansvöğrenimim boyunca edindiğim mühendislik bilgilerimle, otobüs vekamyon üretimi yapan bir otomotiv işletmesinde uygulamaçalışması yapmayı tercih ettim ve bu işletmenin TZÜ Sistemineuygunluğunu ve geçiş sürecini irdelemeye çalıştım. Otomotivsektöründe faaliyet gösteren bir firmada TZÜ amaçlayarakmalzeme tedariğinden, tedarik edilen malzemelerin firma içindekidağıtımının nasıl yapıldığı anlatılmıştır. Özellilke kanban sistmeninbir otomotiv sektöründe nasıl uygulandığı ve elde edilen sonuçlarhakkında detaylı bilgiler verilmiştir. TZÜ amaçları olan hazırlıksürelerinin düşürülmesi, israfların önlenmesi, üretim hataoranlarının düşürülmesi, envanter mevcutlarının azaltılması gibisonuçlara ulaşılması için yürütülen faaliyetler ve elde edilensonuçların değerlendirmesi bu tez çalışmasında belirtilmiştir.Bilim Kodu : 919Anahtar Kelimeler : Tam zamanında üretim(TZÜ)Sayfa Adedi : 168Tez Yöneticisi : Yrd.Doç.Dr. Mehmet ATAK viJUST IN TIME AND KANBAN APPLICATION IN AUTOMOTIVEINDUSTRY(M.Sc. Thesis)Cemil DEMIRGAZI UNIVERSITYINSTUTE OF SCIENCE AND TECHNOLOGYMay 2006ABSTRACTToday?s production establishments aim profits enough to keep ontheir continuity. For this reason they have to adapt globalcompetition beside incoming competition environment. To providethis; the firms have to supply goods service for customers. Tomake the facility actions more effective and to be able to reachhigher quality, developments in production technology should befollowed and the product structure of firms must be doneappropriate to these changes and beside automation qualifiedstaff is ruquired. In today?s industry which the lead time seemsshortened and stock costs are not wanted to be in total cost, JustIn Time (JIT) approach appears as an obligation.The philosphy of JIT production generally express to buy rowmaterial how much when it is needed, to product manufacturedgoods that only must be enough for needs. In this system,efficiencys of using stocks and the increase of producktivity areaimed. Efficiency of using stocks starts by buying row materialand ends by leaving the terms of production of manufactured. Thistime interval is throughput time. It is paid importance very much.viiAs a result, transformation time, instead of direct workmanshipand machine hours in traditional method, is used as a bas eforgeneral manufactured costs in JIT production system.In an establishment the most logical way to decrease the cost ofproduction is to destroy reasons that cause waste. In this manner,there will be a decrease in serious dimensions and profitablenesswill be provided. The firms that product in high amounts todecrease the costs, in an unexpected crisis term, they will be leftdestitute with great amounts of stocks at their hand.Science Code : 919Key Words : Just In Time(JIT)Page Number : 168Adviser : Yrd.Doç.Dr. Mehmet ATAK 181

159