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20 results on '"Deloche, Marie-Christine"'

1. Massive detection of cryptic recessive genetic defects in dairy cattle mining millions of life histories

Author

Besnard, Florian, Guintard, Ana, Grohs, Cécile, Guzylack-Piriou, Laurence, Cano, Margarita, Escouflaire, Clémentine, Hozé, Chris, Leclerc, Hélène, Buronfosse, Thierry, Dutheil, Lucie, Jourdain, Jeanlin, Barbat, Anne, Fritz, Sébastien, Deloche, Marie-Christine, Remot, Aude, Gaussères, Blandine, Clément, Adèle, Bouchier, Marion, Contat, Elise, Relun, Anne, Plassard, Vincent, Rivière, Julie, Péchoux, Christine, Vilotte, Marthe, Eche, Camille, Kuchly, Claire, Charles, Mathieu, Boulling, Arnaud, Viard, Guillaume, Minéry, Stéphanie, Barbey, Sarah, Birbes, Clément, Danchin-Burge, Coralie, Launay, Frédéric, Mattalia, Sophie, Allais-Bonnet, Aurélie, Ravary, Bérangère, Millemann, Yves, Guatteo, Raphaël, Klopp, Christophe, Gaspin, Christine, Iampietro, Carole, Donnadieu, Cécile, Milan, Denis, Arcangioli, Marie-Anne, Boussaha, Mekki, Foucras, Gilles, Boichard, Didier, and Capitan, Aurélien

Published
2024
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3. Identification of the ABCC4, IER3, and CBFA2T2 candidate genes for resistance to paratuberculosis from sequence-based GWAS in Holstein and Normande dairy cattle

Author

Sanchez, Marie-Pierre, Guatteo, Raphaël, Davergne, Aurore, Saout, Judikael, Grohs, Cécile, Deloche, Marie-Christine, Taussat, Sébastien, Fritz, Sébastien, Boussaha, Mekki, Blanquefort, Philippe, Delafosse, Arnaud, Joly, Alain, Schibler, Laurent, Fourichon, Christine, and Boichard, Didier

Published
2020
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4. Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 for Horn Patterning in Bovidae

Author

Allais-Bonnet, Aurélie, Hintermann, Aurélie, Deloche, Marie-Christine, Cornette, Raphaël, Bardou, Philippe, Naval-Sanchez, Marina, Pinton, Alain, Haruda, Ashleigh, Grohs, Cécile, Zakany, Jozsef, Bigi, Daniele, Medugorac, Ivica, Putelat, Olivier, Greyvenstein, Ockert, Hadfield, Tracy, Jemaa, Slim Ben, Bunevski, Gjoko, Menzi, Fiona, Hirter, Nathalie, Paris, Julia M, Hedges, John, Palhiere, Isabelle, Rupp, Rachel, Lenstra, Johannes A, Gidney, Louisa, Lesur, Joséphine, Schafberg, Renate, Stache, Michael, Wandhammer, Marie-Dominique, Arbogast, Rose-Marie, Guintard, Claude, Blin, Amandine, Boukadiri, Abdelhak, Rivière, Julie, Esquerré, Diane, Donnadieu, Cécile, Danchin-Burge, Coralie, Reich, Coralie M, Riley, David G, van Marle-Koster, Este, Cockett, Noelle, Hayes, Benjamin J, Drögemüller, Cord, Kijas, James, Pailhoux, Eric, Tosser-Klopp, Gwenola, Duboule, Denis, Capitan, Aurélien, Allais-Bonnet, Aurélie, Hintermann, Aurélie, Deloche, Marie-Christine, Cornette, Raphaël, Bardou, Philippe, Naval-Sanchez, Marina, Pinton, Alain, Haruda, Ashleigh, Grohs, Cécile, Zakany, Jozsef, Bigi, Daniele, Medugorac, Ivica, Putelat, Olivier, Greyvenstein, Ockert, Hadfield, Tracy, Jemaa, Slim Ben, Bunevski, Gjoko, Menzi, Fiona, Hirter, Nathalie, Paris, Julia M, Hedges, John, Palhiere, Isabelle, Rupp, Rachel, Lenstra, Johannes A, Gidney, Louisa, Lesur, Joséphine, Schafberg, Renate, Stache, Michael, Wandhammer, Marie-Dominique, Arbogast, Rose-Marie, Guintard, Claude, Blin, Amandine, Boukadiri, Abdelhak, Rivière, Julie, Esquerré, Diane, Donnadieu, Cécile, Danchin-Burge, Coralie, Reich, Coralie M, Riley, David G, van Marle-Koster, Este, Cockett, Noelle, Hayes, Benjamin J, Drögemüller, Cord, Kijas, James, Pailhoux, Eric, Tosser-Klopp, Gwenola, Duboule, Denis, and Capitan, Aurélien

Published
2021

5. Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 for Horn Patterning in Bovidae

Author

Allais-Bonnet, Aurélie, primary, Hintermann, Aurélie, additional, Deloche, Marie-Christine, additional, Cornette, Raphaël, additional, Bardou, Philippe, additional, Naval-Sanchez, Marina, additional, Pinton, Alain, additional, Haruda, Ashleigh, additional, Grohs, Cécile, additional, Zakany, Jozsef, additional, Bigi, Daniele, additional, Medugorac, Ivica, additional, Putelat, Olivier, additional, Greyvenstein, Ockert, additional, Hadfield, Tracy, additional, Jemaa, Slim Ben, additional, Bunevski, Gjoko, additional, Menzi, Fiona, additional, Hirter, Nathalie, additional, Paris, Julia M, additional, Hedges, John, additional, Palhiere, Isabelle, additional, Rupp, Rachel, additional, Lenstra, Johannes A, additional, Gidney, Louisa, additional, Lesur, Joséphine, additional, Schafberg, Renate, additional, Stache, Michael, additional, Wandhammer, Marie-Dominique, additional, Arbogast, Rose-Marie, additional, Guintard, Claude, additional, Blin, Amandine, additional, Boukadiri, Abdelhak, additional, Rivière, Julie, additional, Esquerré, Diane, additional, Donnadieu, Cécile, additional, Danchin-Burge, Coralie, additional, Reich, Coralie M, additional, Riley, David G, additional, Marle-Koster, Este van, additional, Cockett, Noelle, additional, Hayes, Benjamin J, additional, Drögemüller, Cord, additional, Kijas, James, additional, Pailhoux, Eric, additional, Tosser-Klopp, Gwenola, additional, Duboule, Denis, additional, and Capitan, Aurélien, additional

Published
2021
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6. Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 to Determine the Number and Topology of Horns in Bovidae

Author

Allais-Bonnet, Aurélie, primary, Hintermann, Aurélie, additional, Deloche, Marie-Christine, additional, Cornette, Raphaël, additional, Bardou, Philippe, additional, Naval-Sanchez, Marina, additional, Pinton, Alain, additional, Haruda, Ashleigh, additional, Grohs, Cécile, additional, Zakany, Jozsef, additional, Bigi, Daniele, additional, Medugorac, Ivica, additional, Putelat, Olivier, additional, Greyvenstein, Ockert, additional, Hadfield, Tracy, additional, Ben Jemaa, Slim, additional, Bunevski, Gjoko, additional, Menzi, Fiona, additional, Hirter, Nathalie, additional, Paris, Julia M., additional, Hedges, John, additional, Palhiere, Isabelle, additional, Rupp, Rachel, additional, Lenstra, Johannes A., additional, Gidney, Louisa, additional, Lesur, Joséphine, additional, Schafberg, Renate, additional, Stache, Michael, additional, Wandhammer, Marie-Dominique, additional, Arbogast, Rose-Marie, additional, Guintard, Claude, additional, Blin, Amandine, additional, Boukadiri, Abdelhak, additional, Riviere, Julie, additional, Esquerré, Diane, additional, Donnadieu, Cécile, additional, Danchin-Burge, Coralie, additional, Reich, Coralie M, additional, Riley, David, additional, van Marle-Koster, Este, additional, Cockett, Noelle, additional, Hayes, Benjamin J., additional, Drögemüller, Cord, additional, Kijas, James, additional, Pailhoux, Eric, additional, Tosser-Klopp, Gwenola, additional, Duboule, Denis, additional, and Capitan, Aurélien, additional

Published
2020
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7. Reverse genetics to describe a recessive defect in different breeds

Author

Michot, Pauline, Chahory, S., Deloche, Marie Christine, Barbey, Sarah, Boussaha, Mekki, Dangin Burge, C., Fritz, Sébastien, Boichard, Didier, Capitan, Aurélien, and Grohs, Cécile

Subjects
bovin, anomalie génétique, gène RP1, dégénérescence rétinienne, génétique inverse
Published
2017

8. Rapid discovery of de novo deleterious mutations in cattle enhances the value of livestock as model species

Author

Pausch, H., Jagannathan, V., Michot, Pauline, Grohs, Cécile, Piton, Guillaume, Ammermüller, S, Deloche, Marie Christine, Fritz, Sebastien, Leclerc, Hélène, Péchoux, Christine, Boukadiri, Abdelhak, Hozé, Chris, Saintilan, Romain, Créchet, Françoise, Mosca, M., Segelke, D., Guillaume, François, Bouet, Stephan, Baur, Aurélia, Vasilescu, A., Genestout, L., Thomas, A., Allais Bonnet, Aurélie, Rocha, Dominique, Colle, Marie-Anne, Klopp, Christophe, Esquerre, Diane, Wurmser, C., Flisikowski, K., Schwarzenbacher, H., Burgstaller, J., Brügmann, M., Dietschi, E., Rudolph, N., Freick, M., Barbey, Sarah, Fayolle, G., Danchin-Burge, C., Schibler, L., Bed'Hom, Bertrand, Hayes, B. J., Daetwyler, H. D., Fries, R, Boichard, Didier, Pin, D., Drögemüller, C., Bourneuf, Emmanuelle, Otz, P., and Capitan, Aurélien

Subjects
bovin, anomalie génétique, séquence du génome complet, modèle pour l'homme
Abstract

In humans, the clinical and molecular characterization of sporadic syndromes is often hindered by the small number of patients and the difficulty in developing animal models for severe dominant conditions. Here we show that the availability of large data sets of whole-genome sequences, high-density SNP chip genotypes and extensive recording of phenotype offers an unprecedented opportunity to quickly dissect the genetic architecture of severe dominant conditions in livestock. We report on the identification of seven dominant de novo mutations in CHD7, COL1A1, COL2A1, COPA, and MITF and exploit the structure of cattle populations to describe their clinical consequences and map modifier loci. Moreover, we demonstrate that the emergence of recessive genetic defects can be monitored by detecting de novo deleterious mutations in the genome of bulls used for artificial insemination. These results demonstrate the attractiveness of cattle as a model species in the post genomic era, particularly to confirm the genetic aetiology of isolated clinical case reports in humans.

Published
2017

9. L’Observatoire National des Anomalies Bovines, son action et ses résultats pour une aide efficace à la gestion des anomalies génétiques

Author

Duchesne, Amandine, Floriot, Sandrine, Deloche, Marie Christine, Boichard, Didier, Ducos, Alain, Danchin-Burge, Coralie, and Grohs, Cecile

Subjects
bovin, anomalie génétique, observatoire des anomalie bovine
Abstract

Le facteur limitant de l’identification des anomalies génétiques dans les populations animales d’élevage est la phase de détection des émergences et de caractérisation clinique. En effet, ces évènements sont rares et mal répertoriés dans les bases nationales d’information génétique. Après différentes expériences passées montrant que des anomalies n’avaient pas été détectées, un Observatoire National des Anomalies Bovines a été mis en place en 2002, rassemblant l’INRA, les acteurs de la sélection animale et les acteurs du monde vétérinaire. L’objectif de cet observatoire est avant tout de collecter les déclarations de cas sur une base normalisée, ainsi que les échantillons biologiques associés, mais aussi d’assurer une veille et une information scientifique et une coordination des actions (www.onab.fr). Les déclarations sont loin d’être exhaustives avec quelques centaines de dossiers par an. Mais par la bonne couverture géographique, raciale et partenariale de l’ONAB, elles sont sans doute suffisantes pour détecter la plupart des nouvelles émergences. Cet article présente un bilan des activités, en mettant l’accent sur les différentes anomalies rencontrées ainsi que les succès en termes d’identification des mutations causales correspondantes, ouvrant la voie à leur gestion en sélection., The limiting factor of genetic defect identification in farm animal populations is the outbreak detection and clinical characterization. Indeed these events are rare and poorly recorded in animal breeding databases. After several experiences in the past showing that outbreaks can be missed, a National Observatory for Bovine Abnormalities was implemented in 2002, jointly by INRA, the main actors in animal breeding, and veterinarian organizations. The goal of this observatory is primarily to collect cases in a central database as well as their corresponding epidemiologic context and biological samples. Another goal is to ensure a scientific watch, to provide information, and to coordinate actions between partners (www.onab.fr). Records are by far not exhaustive with several hundred files per year but are probably sufficient, through a good geographical and breed coverage, to detect most new outbreaks. This article presents an overview of ONAB’s activities, focusing on different defects encountered as well as on the identification of the corresponding causative mutations, paving the way for their management in selection.

Published
2016

10. Value of whole genome sequencing fo r early detection of genetic defects

Author

Michot, Pauline, Chahory, Chambrial, M., Barbey, Sarah, Grohs, Cecile, Deloche, Marie Christine, Danchin-Burge, Coralie, Fritz, Sebastien, Boichard, Didier, Capitan, Aurelien, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Allice, Unité d'Ophtalmologie, École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), Domaine expérimental animal du Pin (SEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), and ANR Apisgene Bovano

Subjects
séquence du génome, bovin, [SDV]Life Sciences [q-bio], anomalie génétique, séquence du génome complet
Abstract

La disponibilité de la séquence du génome complet de nombreux individus, rendue possible par l’évolution très rapide des technologies de séquençage d’ADN, constitue un apport majeur pour l’identification des anomalies génétiques. L’approche conventionnelle par phénotypage des individus, cartographie de l’anomalie, et identification de la mutation, gagne en rapidité et puissance lorsque l’on dispose d’une grande base de référence pour filtrer les variants candidats. Mais le s données de séquence permettent également d’envisager d’autres approches, en particulier pour les anomalies dont le phénotype est difficilement identifiable et qui passent encore inaperçues. Par exemple, la cartographie des déficits en homozygotes à partir des données de génotypage, suivie de l’analyse des données de séquence d’ individus porteurs, a permis l’identification de plusieurs mutations responsables de mortalité embryonnaire dans différentes ra ces. De façon plus prospective, on peut identifier des polymorphismes délétères dans les données de séquence à partir de leur annotation fonctionnelle, puis caractériser leur effet potentiel par le phénotypage d’animaux porteurs. Cette approche est illustrée avec une anomalie de la vision en race Normande. L’augmentation rapide du nombre d’anomalies génétiques résolues ces dernières années démontre la puissance apportée par le séquençage de génomes complets et ce phénomène s’amplifiera à l’avenir. L’approche comporte cependant des limites, l’annotation encore très incomplète des polymorphismes du génome ou la caractérisation phénotypique, souvent compliquée mais essentielle pour la compréhension des effets des mutations. Enfin, le nombre croissant d’anomalies découvertes dans chaque race nécessitera des stratégies de contre-sélection plus complexe s que l’éradication directe, The availability of whole genome sequences (WGS) of many individuals, made possible by the rapid evolution of DNA sequencing technologies, is a major factor for genetic defect identification. The conventional approach consisting in phenotyping affected animals, mapping and identification of the causal mutation gains speed and power with the availability of large sequence databases to filter out candidate variants. WGS also open new avenues, especially for defects with non specific phenotypes which may remain unobserved. Mapping of regions showing homozygous deficiency with massive genotyping data, followed by analysis of the genome sequences of carriers, enables the identification of several causal mutations responsible for embryonic lethality in different breeds. In a more prospective way, one can identify deleterious polymorphisms in WGS on the basis of their functional annotation, and then characterize their potential effect on carrier animals. Here this approach is illustrated by a defect affecting vision in the Normandy cattle breed. The rapid increase in the number of resolved genetic defects during the last years illustrates the power brought by WGS and this will continue in the future. These approaches still suffer from important limitations, especially the incomplete annotation of the biological effects of variants on the genome, or the phenotypic characterization of the mutations, oft n complex but necessary for a full comprehension of their effects. Finally, the increasing number of known defects in each breed requires new selection strategies, more complex than a direct elimination.

Published
2015

11. Intérêt du séquençage de génome complet pour la détection précoce des anomalies génétiques

Author

Michot, Pauline, Chahory, S, Chambrial, M., Barbey, Sarah, Grohs, Cecile, Deloche, Marie-Christine, Danchin-Burge, Coralie, Fritz, Sebastien, Boichard, Didier, Capitan, Aurelien, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Allice, Unité d'Ophtalmologie, École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), Domaine expérimental animal du Pin (SEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), and ANR Apisgene Bovano

Subjects
bovin, [SDV]Life Sciences [q-bio], anomalie génétique, séquence du génome complet
Abstract

National audience; The availability of whole genome sequences (WGS) of many individuals, made possible by the rapid evolution of DNA sequencing technologies, is a major factor for genetic defect identification. The conventional approach consisting in phenotyping affected animals, mapping and identification of the causal mutation gains speed and power with the availability of large sequence databases to filter out candidate variants. WGS also open new avenues, especially for defects with non specific phenotypes which may remain unobserved. Mapping of regions showing homozygous deficiency with massive genotyping data, followed by analysis of the genome sequences of carriers, enables the identification of several causal mutations responsible for embryonic lethality in different breeds. In a more prospective way, one can identify deleterious polymorphisms in WGS on the basis of their functional annotation, and then characterize their potential effect on carrier animals. Here this approach is illustrated by a defect affecting vision in the Normandy cattle breed. The rapid increase in the number of resolved genetic defects during the last years illustrates the power brought by WGS and this will continue in the future. These approaches still suffer from important limitations, especially the incomplete annotation of the biological effects of variants on the genome, or the phenotypic characterization of the mutations, oft n complex but necessary for a full comprehension of their effects. Finally, the increasing number of known defects in each breed requires new selection strategies, more complex than a direct elimination.; La disponibilité de la séquence du génome complet de nombreux individus, rendue possible par l’évolution très rapide des technologies de séquençage d’ADN, constitue un apport majeur pour l’identification des anomalies génétiques. L’approche conventionnelle par phénotypage des individus, cartographie de l’anomalie, et identification de la mutation, gagne en rapidité et puissance lorsque l’on dispose d’une grande base de référence pour filtrer les variants candidats. Mais le s données de séquence permettent également d’envisager d’autres approches, en particulier pour les anomalies dont le phénotype est difficilement identifiable et qui passent encore inaperçues. Par exemple, la cartographie des déficits en homozygotes à partir des données de génotypage, suivie de l’analyse des données de séquence d’ individus porteurs, a permis l’identification de plusieurs mutations responsables de mortalité embryonnaire dans différentes ra ces. De façon plus prospective, on peut identifier des polymorphismes délétères dans les données de séquence à partir de leur annotation fonctionnelle, puis caractériser leur effet potentiel par le phénotypage d’animaux porteurs. Cette approche est illustrée avec une anomalie de la vision en race Normande. L’augmentation rapide du nombre d’anomalies génétiques résolues ces dernières années démontre la puissance apportée par le séquençage de génomes complets et ce phénomène s’amplifiera à l’avenir. L’approche comporte cependant des limites, l’annotation encore très incomplète des polymorphismes du génome ou la caractérisation phénotypique, souvent compliquée mais essentielle pour la compréhension des effets des mutations. Enfin, le nombre croissant d’anomalies découvertes dans chaque race nécessitera des stratégies de contre-sélection plus complexe s que l’éradication directe

Published
2015

12. Effects of dietary propylene glycol on follicular fluid and ovum pick up in vitro embryo production in growth-restricted heifers with two profiles of anti-müllerian hormone

Author

Gamarra, G., Ponsart, C., Lacaze, S., Le Guienne, B., HUMBLOT, P., Deloche, Marie-Christine, Monniaux, Danielle, Ponter, Andrew, Département Recherche et Développement, Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), MIDATEST, Laboratoire de Santé Animale, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Uppsala University, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), International Embryo Transfer Society (IETS). USA., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2015
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13. Ovum Pick Up and in vitro embryo production following propylene glycol diet in heifers differing in their AMH profiles

Author

Gamarra, Giselle, Ponsart, C., Lacaze, S., Le Guienne, Brigitte, HUMBLOT, P., Deloche, Marie-Christine, Monniaux, Danielle, Ponter, Andrew, Département Recherche et Développement, Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), MIDATEST, Biologie du développement et reproduction (BDR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Division of Reproduction, Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine and Agricultural Sciences, Swedish University of Agricultural Science, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Est, Association Européenne de Transfert Embryonnaire - European Embryo Transfer Association (AETE). FRA., ProdInra, Migration, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV.BDD] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, propylene glycol, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, embryo production, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, [SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, heifer
Abstract

International audience

Published
2014

14. A reverse genetic approach identifies an ancestral frameshift mutation in RP1 causing recessive progressive retinal degeneration in European cattle breeds

Author

Michot, Pauline, primary, Chahory, Sabine, additional, Marete, Andrew, additional, Grohs, Cécile, additional, Dagios, Dimitri, additional, Donzel, Elise, additional, Aboukadiri, Abdelhak, additional, Deloche, Marie-Christine, additional, Allais-Bonnet, Aurélie, additional, Chambrial, Matthieu, additional, Barbey, Sarah, additional, Genestout, Lucie, additional, Boussaha, Mekki, additional, Danchin-Burge, Coralie, additional, Fritz, Sébastien, additional, Boichard, Didier, additional, and Capitan, Aurélien, additional

Published
2016
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15. Phénotypage des échecs de gestation entre 0 et 90 jours après 1ère insémination postpartum en race Holstein et relations avec l'index de fertilité postpartum des pères utilisés

Author

Ledoux, Dorothee, Gatien, Julie, Grimard, Bénédicte, Deloche, Marie-Christine, Fritz, Sebastien, Lefebvre, Rachel, Humblot, Patrice, Ponsart, Claire, Biologie du développement et reproduction (BDR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Recherche et Développement, Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Department of clinical sciences, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Published
2011

16. Phenotyping pregnancy failure occurring within 90 days following first postpartum insemination in Holstein cattle and relationship with fertility breeding value of bull fathers

Author

Ledoux, Dorothee, Gatien, Julie, Grimard, Bénédicte, Deloche, Marie-Christine, Fritz, Sebastien, Lefebvre, Rachel, Humblot, Patrice, Ponsart, Claire, Biologie du développement et reproduction (BDR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Department of clinical sciences, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Biologie du Développement et Reproduction (BDR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Recherche et Développement, and UNCEIA

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract

absent

Published
2011

19. A 3.7 Mb Deletion Encompassing ZEB2 Causes a Novel Polled and Multisystemic Syndrome in the Progeny of a Somatic Mosaic Bull

Author

Capitan, Aurélien, primary, Allais-Bonnet, Aurélie, additional, Pinton, Alain, additional, Marquant-Le Guienne, Brigitte, additional, Le Bourhis, Daniel, additional, Grohs, Cécile, additional, Bouet, Stéphan, additional, Clément, Laëtitia, additional, Salas-Cortes, Laura, additional, Venot, Eric, additional, Chaffaux, Stéphane, additional, Weiss, Bernard, additional, Delpeuch, Arnaud, additional, Noé, Guy, additional, Rossignol, Marie-Noëlle, additional, Barbey, Sarah, additional, Dozias, Dominique, additional, Cobo, Emilie, additional, Barasc, Harmonie, additional, Auguste, Aurélie, additional, Pannetier, Maëlle, additional, Deloche, Marie-Christine, additional, Lhuilier, Emeline, additional, Bouchez, Olivier, additional, Esquerré, Diane, additional, Salin, Gérald, additional, Klopp, Christophe, additional, Donnadieu, Cécile, additional, Chantry-Darmon, Céline, additional, Hayes, Hélène, additional, Gallard, Yves, additional, Ponsart, Claire, additional, Boichard, Didier, additional, and Pailhoux, Eric, additional

Published
2012
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20. Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 for Horn Patterning in Bovidae

Author

Daniele Bigi, Fiona Menzi, Slim Ben Jemaa, Marie-Christine Deloche, Aurélien Capitan, Johannes A. Lenstra, Marina Naval-Sanchez, Ivica Medugorac, Nathalie Hirter, Gwenola Tosser-Klopp, Diane Esquerre, Coralie M. Reich, Julia M. Paris, Rose-Marie Arbogast, Amandine Blin, Abdelhak Boukadiri, Aurélie Hintermann, Julie Rivière, Denis Duboule, Raphaël Cornette, Cécile Donnadieu, Marie-Dominique Wandhammer, Gjoko Bunevski, Louisa Gidney, Michael Stache, Isabelle Palhiere, Renate Schafberg, James Kijas, Claude Guintard, Joséphine Lesur, Jozsef Zakany, Rachel Rupp, Noelle E. Cockett, John Hedges, Ashleigh Haruda, Philippe Bardou, Olivier Putelat, Tracy Hadfield, Alain Pinton, Ockert Greyvenstein, Aurélie Allais-Bonnet, Este Van Marle-Koster, Eric Pailhoux, Coralie Danchin-Burge, David G. Riley, Cécile Grohs, Benjamin J. Hayes, Cord Drögemüller, Allice, Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique & Développement (BREED), Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation [Canberra] (CSIRO), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Martin-Luther-University Halle-Wittenberg, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Université Paris-Saclay-AgroParisTech-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Geneva [Switzerland], University of Bologna, Ludwig Maximilian University [Munich] (LMU), Archéologie d'Alsace, Archéologie et histoire ancienne : Méditerranée - Europe (ARCHIMEDE), Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Texas A&M University [College Station], Utah State University (USU), Université de Carthage - University of Carthage, Ss. Cyril and Methodius University in Skopje, University of Bern, Manx Text, Manx Loaghtan Sheep Breeders (MLSBG), Utrecht University [Utrecht], Rent a Peasant, Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements (AASPE), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Musée Zoologique de Strasbourg, Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Acquisition et Analyse de Données pour l'Histoire naturelle (2AD), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique ( GeT-PlaGe), Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de l'élevage (IDELE), Agriculture Victoria (AgriBio), Tshwane University of Technology [Pretoria] (TUT), Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation (QAAFI), University of Queensland [Brisbane], CSIRO Agriculture and Food (CSIRO), Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Collège de France (CdF (institution)), Allais-Bonnet, Aurélie, Hintermann, Aurélie, Deloche, Marie-Christine, Cornette, Raphaël, Bardou, Philippe, Naval-Sanchez, Marina, Pinton, Alain, Haruda, Ashleigh, Grohs, Cécile, Zakany, Jozsef, Bigi, Daniele, Medugorac, Ivica, Putelat, Olivier, Greyvenstein, Ockert, Hadfield, Tracy, Jemaa, Slim Ben, Bunevski, Gjoko, Menzi, Fiona, Hirter, Nathalie, Paris, Julia M, Hedges, John, Palhiere, Isabelle, Rupp, Rachel, Lenstra, Johannes A, Gidney, Louisa, Lesur, Joséphine, Schafberg, Renate, Stache, Michael, Wandhammer, Marie-Dominique, Arbogast, Rose-Marie, Guintard, Claude, Blin, Amandine, Boukadiri, Abdelhak, Rivière, Julie, Esquerré, Diane, Donnadieu, Cécile, Danchin-Burge, Coralie, Reich, Coralie M, Riley, David G, Marle-Koster, Este van, Cockett, Noelle, Hayes, Benjamin J, Drögemüller, Cord, Kijas, Jame, Pailhoux, Eric, Tosser-Klopp, Gwenola, Duboule, Deni, Capitan, Aurélien, École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), University of Bologna/Università di Bologna, Ss. Cyril and Methodius University in Skopje (UKIM), École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), and Collège de France - Chaire internationale Évolution des génomes et développement

Subjects
0106 biological sciences, Male, co-option, translocation, AcademicSubjects/SCI01180, regulatory mutation, 01 natural sciences, Hox genes, Hox gene, genes, 610 Medicine & health, Bilateria, time, Horns, 0303 health sciences, biology, Ecology, 630 Agriculture, Goats, [SDV.BDD.EO] Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Embryology and Organogenesis, Gene Expression Regulation, Developmental, alignment, Morphogenetic field, Biological Evolution, [SDV.BDD.MOR] Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Morphogenesis, 590 Animals (Zoology), Haploinsufficiency, transcription, Biometry, Evolution, growth, Locus (genetics), Mice, Transgenic, [SDV.GEN.GA] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, 010603 evolutionary biology, 03 medical and health sciences, goat and sheep genomics, Behavior and Systematics, framework, Genetics, Animals, Allele, Gene, Molecular Biology, Discoveries, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 030304 developmental biology, Homeodomain Proteins, locus, Sheep, Horn (anatomy), AcademicSubjects/SCI01130, [SDV.BDD.MOR]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Morphogenesis, sequence, biology.organism_classification, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV.BDD.EO]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Embryology and Organogenesis, Evolutionary biology, Mutation, genome-wide association, 570 Life sciences, goat and sheep genomic
Abstract

In the course of evolution, pecorans (i.e., higher ruminants) developed a remarkable diversity of osseous cranial appendages, collectively referred to as “headgear,” which likely share the same origin and genetic basis. However, the nature and function of the genetic determinants underlying their number and position remain elusive. Jacob and other rare populations of sheep and goats are characterized by polyceraty, the presence of more than two horns. Here, we characterize distinct POLYCERATE alleles in each species, both associated with defective HOXD1 function. We show that haploinsufficiency at this locus results in the splitting of horn bud primordia, likely following the abnormal extension of an initial morphogenetic field. These results highlight the key role played by this gene in headgear patterning and illustrate the evolutionary co-option of a gene involved in the early development of bilateria to properly fix the position and number of these distinctive organs of Bovidae.

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2021
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