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Additional file 1. Supplementary document containing additional information on the Methods, Non-identifiable patient characteristics, Quality control data, as well as non-significant findings.

Alzheimer’s Disease (AD) is a neurodegenerative disease characterized by two main pathological hallmarks: amyloid plaques and intracellular tau neurofibrillary tangles. However, a majority of studies focus on the individual pathologies and seldom on the interaction between the two pathologies. Herein, we present the longitudinal neuropathological and neurophysiological effects of a combined amyloid-tau model by hippocampal seeding of human-derived tau pathology in the APP.PS1/L166P amyloid animal model. We statistically assessed both neurophysiological and pathological changes using linear mixed modelling to determine if factors such as the age at which animals were seeded, genotype, seeding or buffer, brain region where pathology was quantified, and time-post injection differentially affect these outcomes. We report that AT8-positive tau pathology progressively develops and is facilitated by the amount of amyloid pathology present at the time of injection. The amount of AT8-positive tau pathology was influenced by the interaction of age at which the animal was injected, genotype, and time after injection. Baseline pathology-related power spectra and Higuchi Fractal Dimension (HFD) score alterations were noted in APP.PS1/L166P before any manipulations were performed, indicating a baseline difference associated with genotype. We also report immediate localized hippocampal dysfunction in the electroencephalography (EEG) power spectra associated with tau seeding which returned to comparable levels at 1 month-post-injection. Longitudinal effects of seeding indicated that tau-seeded wild-type mice showed an increase in gamma power earlier than buffer control comparisons which was influenced by the age at which the animal was injected. A reduction of hippocampal broadband power spectra was noted in tau-seeded wild-type mice, but absent in APP.PS1 animals. HFD scores appeared to detect subtle effects associated with tau seeding in APP.PS1 animals, which was differentially influenced by genotype. Notably, while tau histopathological changes were present, a lack of overt longitudinal electrophysiological alterations was noted, particularly in APP.PS1 animals that feature both pathologies after seeding, reiterating and underscoring the difficulty and complexity associated with elucidating physiologically relevant and translatable biomarkers of Alzheimer’s Disease at the early stages of the disease.

Respectueux de l’environnement et garantissant une sécurité alimentaire soutenue par la diversification des productions et des revenus qu’ils procurent, les systèmes agroforestiers apparaissent comme un modèle prometteur d’agriculture durable dans les pays du Sud les plus vulnérables aux changements globaux. Cependant, ces systèmes agroforestiers ne peuvent être optimisés qu’à condition de mieux comprendre et de mieux maîtriser les facteurs de leurs productions. L’ouvrage présente un ensemble de connaissances récentes sur les mécanismes biophysiques et socio-économiques qui sous-tendent le fonctionnement et la dynamique des systèmes agroforestiers. Il concerne, d’une part les systèmes agroforestiers à base de cultures pérennes, telles que cacaoyers et caféiers, de régions tropicales humides en Amérique du Sud, en Afrique de l’Est et du Centre, d’autre part les parcs arborés et arbustifs à base de cultures vivrières, principalement de céréales, de la région semi-aride subsaharienne d’Afrique de l’Ouest. Il synthétise les dernières avancées acquises grâce à plusieurs projets associant le Cirad, l’IRD et leurs partenaires du Sud qui ont été conduits entre 2012 et 2016 dans ces régions. L’ensemble de ces projets s’articulent autour des dynamiques des systèmes agroforestiers et des compromis entre les services de production et les autres services socio-écosystémiques que ces systèmes fournissent.

Basé sur des cas d’étude au Sénégal, ce chapitre dresse le bilan de 15 années de recherches sur le fonctionnement des sols d’agrosystèmes associant plantes cultivées (mil-arachide) et arbustes natifs au Sahel. Les travaux, publiés pour la plupart, ont montré que Guiera senegalensis et Piliostigma reticulatum redistribuent l’eau dans le sol, stimulent les microorganismes du sol et génèrent des îlots de fertilité au bénéfice de la culture associée. Ainsi, les rendements des cultures sont augmentés, y compris en absence de fertilisants : jusqu’à +137 % pour le mil en présence de P. reticulatum à Nioro-du-Rip. Cela justifie l’intérêt de maintenir ces arbustes dans les champs en appliquant une gestion agroécologique. Based on Senegalese case-studies, this chapter synthetized 15-years of research on the soil functioning of native shurb intercropping systems in the Sahel. Scientifically validated results showed that Guiera senegalensis and Piliostigma reticulatum perform water redistribution within soil profile, affect soil microbial communities and their activities and act as resource islands. Intercropping with woody shrubs resulted in a significant increase in crop yield: up to +137 % yields for millet associated with P. reticulatum at Nioro-du-Rip. The beneficial effects for the associated crops raise interest for developing shrub-based agro-ecological systems.

Basé sur des cas d'étude au Sénégal, ce chapitre dresse le bilan de 15 années de recherches sur le fonctionnement des sols d'agrosystèmes associant plantes cultivées (mil-arachide) et arbustes natifs au Sahel. Les travaux, publiés pour la plupart, ont montré que Guiera senegalensis et Piliostigma reticulatum redistribuent l'eau dans le sol, stimulent les microorganismes du sol et génèrent des îlots de fertilité au bénéfice de la culture associée. Ainsi, les rendements des cultures sont augmentés, y compris en absence de fertilisants : jusqu'à +137 % pour le mil en présence de P. reticulatum à Nioro-du-Rip. Cela justifie l'intérêt de maintenir ces arbustes dans les champs en appliquant une gestion agroécologique.

Capitale régionale en forte croissance au sein d’une ancienne zone viticole littorale, le pôle urbain de Montpellier s’est récemment constitué en Communauté d’Agglomération regroupant 31 communes. L’élaboration du Scot a représenté une étape prioritaire de structuration du projet de développement de ce nouveau territoire, combinant des dimensions urbaines et rurales. La prise en compte de l’agriculture a conduit à faire des espaces agricoles une des principales armatures du Scot et a permis de réviser à la baisse les surfaces ouvertes à l’urbanisation future. L’intégration de la question agricole au cours de ce processus a constitué une expérience innovante et stimulante : des échanges inédits ont eu lieu, associant de nouveaux partenaires autour de nouveaux sujets, amorçant des processus d’apprentissage. Suite à son approbation, la mise en oeuvre du Scot dans les communes constitue une mise à l’épreuve des choix faits en matière de planification spatiale et de développement urbain / territorial. Les hypothèses concernant la place de l’agriculture en particulier sont confrontées à la réalité des franges urbaines : le statut du sol ne suffit pas à garantir les dynamiques agricoles., As a quickly growing regional capital located in the Mediterranean littoral vineyard area, the city-region of Montpellier has recently constituted itself as a new local authority gathering 31 municipalities (Communauté d’Agglomération). Working out the territorial coherence scheme (Scot) was a priority step to structure the development project of this new territory, combining urban and rural dimensions. Taking into account agriculture led to design one of the major frameworks of the Scot from agricultural and natural patches, and made it possible to reduce areas open to future urban development. The way agriculture has been integrated in this process was an innovative and stimulating experience: original exchanges took place, bringing together new partners about new issues, being the starting point of learning processes. After the Scot has been approved, its implementation at the municipality level puts to the test the choices made in fields of spatial planning and territorial / urban development. Among others, assumptions concerning agriculture were confronted to reality of urban fringes: land status is not enough to guarantee dynamics of periurban agriculture.

Colloque du 5 mai 2009 à Versailles; National audience; As a quickly growing regional capital located in the Mediterranean littoral vineyard area, the city-region of Montpellier has recently constituted itself as a new local authority gathering 31 municipalities (Communauté d’Agglomération). Working out the territorial coherence scheme (Scot) was a priority step to structure the development project of this new territory, combining urban and rural dimensions. Taking into account agriculture led to design one of the major frameworks of the Scot from agricultural and natural patches, and made it possible to reduce areas open to future urban development. The way agriculture has been integrated in this process was an innovative and stimulating experience: original exchanges took place, bringing together new partners about new issues, being the starting point of learning processes. After the Scot has been approved, its implementation at the municipality level puts to the test the choices made in fields of spatial planning and territorial / urban development. Among others, assumptions concerning agriculture were confronted to reality of urban fringes: land status is not enough to guarantee dynamics of periurban agriculture.; Capitale régionale en forte croissance au sein d’une ancienne zone viticole littorale, le pôle urbain de Montpellier s’est récemment constitué en Communauté d’Agglomération regroupant 31 communes. L’élaboration du Scot a représenté une étape prioritaire de structuration du projet de développement de ce nouveau territoire, combinant des dimensions urbaines et rurales. La prise en compte de l’agriculture a conduit à faire des espaces agricoles une des principales armatures du Scot et a permis de réviser à la baisse les surfaces ouvertes à l’urbanisation future. L’intégration de la question agricole au cours de ce processus a constitué une expérience innovante et stimulante : des échanges inédits ont eu lieu, associant de nouveaux partenaires autour de nouveaux sujets, amorçant des processus d’apprentissage. Suite à son approbation, la mise en oeuvre du Scot dans les communes constitue une mise à l’épreuve des choix faits en matière de planification spatiale et de développement urbain / territorial. Les hypothèses concernant la place de l’agriculture en particulier sont confrontées à la réalité des franges urbaines : le statut du sol ne suffit pas à garantir les dynamiques agricoles.