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International audience; Q fever is a worldwide zoonotic disease mainly res-ponsible for reproductive disorder such as abortion in domestic ruminants. The serological diagnosis in domestic ruminants is mainly performed using ELISA tests. In France, there are three ELISA tests that are commercialized with little information about their sensitivities and specificities.

Additional file 2: Output of the model. R-Markdown Word document containing R code, summary of the models, Gelman and rubin’s statistics, trace plots and prior vs posterior density plots.

Additional file 1. Supplementary material. Appendix A. Cross-classified test results in each department and verification of the hypothesis of constant accuracy across populations. Appendix B. Complete specifications of the model. Appendix C. Simulation study. Appendix D. Herd sensitivity, herd specificity. Appendix E. Estimations of the model. Appendix F. Sensitivity analysis.

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Apports de la génétique sur la santé de la mamelle et le débit de traite. 2. Journée UMT SPR – OMACAP

Le déploiement à large échelle de Compteurs à Lait Electroniques Portables avec enregistrement de paramètres de la cinétique d’émission du lait, dans le cadre du contrôle de performances, permet d’explorer l’intérêt de nouveaux phénotypes d’aptitude à la traite des chèvres. Une étude a été conduite sur 5 820 chèvres issues de 16 élevages caprins de l’ouest de la France afin de mieux appréhender l’aptitude et les conditions de traite des animaux en tant que facteurs de risque potentiels des infections de la mamelle. La modélisation des cinétiques d’éjection du lait a permis d’identifier différentes classes de cinétiques se différenciant notamment par les temps de traite et la présence d’un ou deux plateaux. Ces informations couplées aux données morphologiques et de contrôle de performances pourraient être valorisées à la fois pour identifier des individus ou situations à risque et pour mieux adapter les installations et réglages du matériel de traite (dimensionnement des canalisations, détermination des seuils de dépose automatique, …).

National audience; La monotraite en élevages ovins et caprins, et les lactations longues sontdes pratiques de traite courantes en petits ruminants. La monotraite ovine et caprine est souvent pratiquée en supprimant la traite du soir. Laperte de production laitière est d’environ 14 % chez les ovins ; chez les caprins, le stade de lactation l’influence fortement. Chez les primipares, une perte de plus de 24 % est observée si la monotraite est pratiquée en début de lactation, et de 11,2 % en milieu de lactation, sachant que des pertes comparables en début ou en milieu de lactation sont aussirapportées dans la littérature. Chez les ovins comme chez les caprins, ces pertes sont compensées par un gain en organisation, grâce à laréduction du travail d’astreinte. En élevages caprins, les lactations longues sont d’abord un outil de maîtrise de la conduite du troupeau.Son intérêt réside dans l’écrêtement du pic de travail lors des mises baset dans la gestion des carrières de certaines catégories de chèvres enfonction de l’âge, du potentiel laitier et des résultats de reproduction.

National audience; "Chlamydia abortus est une des principales causes d’avortements infectieux des ovins et des caprins, mais l’impact réel des infections à Chlamydia chez les bovins est mal connu. Les Chlamydia induisent le plus souvent des infections asymptomatiques chez les bovins. Cet article résume les principales connaissances des infections à Chlamydia chez les bovins, ainsi que chez les ovins et les caprins, et compare leurs particularités épidémiologiques et leurs impacts économiques. Il montre que la prévalence des différentes espèces de Chlamydiaceae dans les voies génitales des bovins est très différente de celle des petits ruminants, ce qui pourrait expliquer les différences cliniques observées entre les bovins et les petits ruminants. Les avortements bovins à C. abortus sont rares et C. psittaci serait l’espèce prépondérante."

National audience; Causes majeures d’avortements de fin de gestation en élevages de petits ruminants, la chlamydiose abortive et la fièvre Q présentent de nombreuses similitudes sur le plan clinique, et en termes de réponse à l’infection. Des stratégies vaccinales ont été définies et appliquées sur le terrain depuis plusieurs années. Les vaccins vivants doivent être privilégiés à l’encontre de la chlamydiose abortive tandis qu’en matière de fièvre Q, des vaccins inactivés de phase I sont recommandés pour limiter l’excrétion. Compte tenu de la localisation intracellulaire de Chlamydia abortus et de Coxiella burnetii, l’immunité à médiation cellulaire joue un rôle majeur dans l’élimination de l’agent infectieux et dans la protection des individus vaccinés.Mis en place prioritairement dans les élevages infectés présentant des épisodes abortifs, les protocoles vaccinaux ciblent au premier chef les animaux de renouvellement et doivent être poursuivis plusieurs années en raison de la persistance d’animaux infectés et excréteurs dans les troupeaux, et pour la fièvre Q, en raison du maintien d’une contamination environnementale. Ces stratégies vaccinales doivent s’intégrer à des plans de maîtrise généraux intégrant des mesures sanitaires.

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La chèvre, souvent désignée comme «la vache du pauvre», est aussi le parent pauvre des études en pathologie chez les petits ruminants. Les références caprines ne constituent que 25 à 30% des travaux cités pour les petits ruminants dans leur ensemble. De nombreux exemples soulignent pourtant les dangers potentiels de négliger les spécificités physiologiques, métaboliques ou comportementales des caprins dans la maîtrise des processus pathologiques. Ce constat justifie que les caprins fassent l’objet de recherches particulières dont les résultats en pathologie comparée conduisent à formuler des hypothèses de portée générale, Within Europe, the goat industry appears to have minor importance when compared to sheep or cattle productions, and the interest of research and studies in caprine pathology is limited. Here, this article is aimed at presenting the main research models in France, the current available data on the pathogenic mechanisms and the physiopathological processes and the related development of measures of management control using examples of pathologies caused by different agents (prions, viruses, bacteria, protozoan or helminthic parasites) that affect goats and their production. It is also aimed at underlining the interest of specific caprine studies not only as models of comparative pathology in small ruminants but also as tools that take into account the specific constraints of the dairy industry.

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National audience; Reproductive seasonality observed in all breeds of goats originating from temperate latitudes and in some breeds from subtropical latitudes can now be controlled by artificial changes in photoperiod. Short days stimulate sexual activity, while long days inhibit it. This knowledge has allowed the development of photoperiodic treatments to control sexual activity in goats, in both the buck and doe. In the French intensive milk production system, goat artificial insemination plays an important role in controlling reproduction and, in conjunction with progeny testing, in improving milk production. Most dairy goats are inseminated out of the breeding season with deep frozen semen, after induction of oestrus and ovulation by hormonal treatment. This protocol provides a kidding rate of about 65%. New breeding strategies based on the buck effect associated with artificial insemination are being developed to reduce the use of hormones. With the development of insemination with frozen semen, a classical selection program was set up, including planned mating, progeny testing and the diffusion of proven sires by insemination in herds. Functional traits have become important for efficient breeding schemes in the dairy goat industries. Emphasis on functional traits related to udder morphology and health resulted from the knowledge established during the last decade. New windows have been opened based on new molecular tools allowing the detection and mapping of genes of economic importance in farm animals.; La saisonnalité de la reproduction chez les chèvres originaires des latitudes tempérées ou subtropicales peut maintenant être contrôlée par des changements artificiels de la photopériode. Les jours courts stimulent l’activité sexuelle tandis que les jours longs l’inhibent. Ces connaissances ont permis le développement de traitements photopériodiques pour le contrôle de l’activité sexuelle des chèvres et des boucs. En France, l’Insémination Artificielle (IA) des chèvres joue un rôle central pour le contrôle des appariements et l’organisation du schéma de sélection. La plupart des chèvres sont inséminées en dehors de la saison sexuelle avec de la semence cryoconservée, après induction hormonale de l’ovulation seule ou en combinaison avec des traitements photopériodiques. Les taux de fertilité sont en moyenne de 65%. De nouvelles stratégies sont en cours d’expérimentation. Elles sont basées sur l’IA après un effet mâle pour réduire l’utilisation des hormones. Le schéma de sélection s’est développé grâce aux progrès de l’IA. Ce schéma repose sur des plans d’accouplements entre reproducteurs d’élite, le testage sur descendance en fermes et la diffusion des semences de boucs améliorateurs. Après les caractères laitiers, les carac-tères fonctionnels sont désormais pris en compte. Actuellement, l’accent est mis sur la morphologie de la mamelle. La résistance à certaines maladies est à l’étude. Outre cette approche de génétique quantitative, de nouvelles perspectives basées sur une approche moléculaire permettront de détecter des gènes économiquement intéressants pour l’élevage caprin.

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National audience; Un bilan rétrospectif des comptages de cellules somatiques (CCS) des laits de troupeaux de brebis et de chèvres en France est dressé à partir du suivi des troupeaux réalisé dans le Centre-Ouest (espèce caprine), le Rayon de Roquefort et les Pyrénées-atlantiques (espèce ovine). Les moyennes arithmétiques annuelles de CCS atteignent 700 000 cellules par ml dans l’espèce ovine et 1 400 000 cellules par ml dans l’espèce caprine. Au cours de l’année, les numérations cellulaires présentent des variations saisonnières. Les moyennes de CCS des brebis laitières sont élevés en début de campagne laitière, minimales en janvier-février, et augmentent ensuite progressivement jusqu’à 900 000cellules par ml en juillet. Chez la chèvre, ces variations sont accentués, les CCS moyens dépassant 1 500 000 cellules par ml dès le mois d’août et 1 800 000 cellules par ml d’octobre à décembre. L’interprétation et la maîtrise des CCS des laits de troupeaux impose de tenir compte des particularités liées tant à l’espèce qu’aux conduites d’élevage.