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Foram caracterizados geneticamente, utilizando-se cinco locos de microssatélites, 235 indivíduos de seis plantéis de tilápia (Ceará, Chitralada, Israel, Nilótica, Taiwan e Vermelha) da região Sudeste do Brasil. Verificou-se diferença genética entre os seis plantéis, obtida pelo cálculo do índice de fixação de alelos (Fst=0,3263). De modo geral, está ocorrendo perda de heterozigose nos plantéis, segundo mostrou a estimativa do coeficiente de endogamia intrapopulacional (Fis=0,0486). Os plantéis Israel e Nilótica foram os mais semelhantes geneticamente (Ig=0,6663). Os plantéis Chitralada e Taiwan foram os que menos apresentaram genes em comum (Ig=0,2463). O plantel denominado Vermelha foi o mais distinto entre todos.Two hundred and thirty five individuals from six commercial stocks of tilapias (Ceará, Chitralada, Israel, Nilótica, Taiwan and Red) from the Southeastern region of the country were genetically characterized using five microsatellite loci. The results suggest large genetic difference among the stocks, estimated through the fixation allele index (Fst = 0.3263), and a considerable loss of heterozigosity accurs in most of the stocks, according to the population inbreeding coefficient (Fis=0.0486). The Israel and Nilótica stocks were genetically similar (Ig=0.6663), while Chitralada and Taiwan showed less genes in common (Ig=0.2463). The Red stock was the most distinct stock.