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1. Clinical outcomes of non–small-cell lung cancer patients with BRAF mutations: results from the French Cooperative Thoracic Intergroup biomarkers France study

Author

P. Missy, Franck Morin, Faraj Al Freijat, Jean-Philippe Merlio, Fabrice Barlesi, Hervé Lena, Alexandra Langlais, David Planchard, Clara Fontaine-Deraluelle, Didier Debieuvre, S. Couraud, Pierre-Paul Bringuier, Clarisse Audigier-Valette, L. Moreau, Michèle Beau-Faller, Pierre-Jean Souquet, Remi Veillon, Jean Mosser, Virginie Westeel, Alain Morel, L'Houcine Ouafik, Service de pneumologie [Centre Hospitalier Lyon Sud - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'oncologie multidisciplinaire innovations thérapeutiques [Hôpital Nord - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital Nord [CHU - APHM], Groupe hospitalier de la région de Mulhouse Sud-Alsace (GHRMSA), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Hôpital Louis Pasteur [Colmar] (CH Colmar), Laboratoire de Biochimie et de Biologie Moléculaire, CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Pontchailloux [Rennes], Institut de neurophysiopathologie (INP), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Transfert d’Oncologie Biologique, APHM, Hôpital Nord, Hôpital Nord [CHU - APHM], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Innate Immunity and Immunotherapy (CRCINA-ÉQUIPE 7), Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes-Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Intercommunal Toulon-La Seyne sur Mer - Hôpital Sainte-Musse, Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] (IFCT), Intergroupe Francophone de Cancérologie thoracique, Institut Gustave Roussy (IGR), National Cancer Institute, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Aix Marseille Université (AMU), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA), Hospices Civils de Lyon (HCL), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Service de pneumologie, Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] (CH E.Muller Mulhouse), Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace (GHTHA)-Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace (GHTHA), Département de biologie de la tumeur, CH Colmar, Hôpital Pontchaillou, Equipe 4, Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Service de Transfert d’Oncologie Biologique, Service de Pneumologie, Hôpital Jean Minjoz, Hôpital Sainte-Musse, Pôle chirurgical et interventionnel [Gustave Roussy], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre hospitalier universitaire régional de Besançon (CHRU Besançon), Innate immunity and Immunotherapy (CRCINA - Département INCIT - Equipe 7), Centre de recherche de Cancérologie et d'Immunologie / Nantes - Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)

Subjects
Male, 0301 basic medicine, Oncology, Cancer Research, Lung Neoplasms, [SDV]Life Sciences [q-bio], medicine.medical_treatment, Disease, medicine.disease_cause, 0302 clinical medicine, Carcinoma, Non-Small-Cell Lung, Molecular Targeted Therapy, Prospective cohort study, education.field_of_study, Middle Aged, Chemotherapy regimen, Progression-Free Survival, 3. Good health, Treatment Outcome, 030220 oncology & carcinogenesis, Female, France, KRAS, Proto-Oncogene Proteins B-raf, medicine.medical_specialty, Population, Antineoplastic Agents, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, BRAF, Oncogenic driver, 03 medical and health sciences, Internal medicine, medicine, Humans, Chemotherapy, Lung cancer, education, Protein Kinase Inhibitors, neoplasms, Aged, business.industry, Non–small-cell lung cancer, medicine.disease, digestive system diseases, respiratory tract diseases, 030104 developmental biology, Case-Control Studies, Mutation, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, V600E
Abstract

International audience; Introduction - Patients with stage IV non-small-cell lung cancer (NSCLC) and BRAF V600 mutations may benefit from targeted therapies. Chemotherapy outcomes are little known in this population. Methods - The French Cooperative Thoracic Intergroup (IFCT) Biomarkers France study was a national prospective cohort study aiming to describe the molecular characteristics and clinical outcome of all consecutive NSCLC patients (N = 17,664) screened for molecular alterations. We used this data set to set up a case-control analysis. Cases had stage IV BRAF-mutated (BRAF-MT) NSCLC, whereas controls had NSCLC that was wild-type for EGFR, KRAS, HER2, BRAF, PIK3CA and ALK. Each case was matched for sex, age at diagnosis and smoking status to two controls randomly selected. Results - Overall, 83 cases with BRAF mutant disease (66.3% V600E) were matched to 166 controls. Five cases received tyrosine kinase inhibition in the first-line and 16 in the second-line. All others were treated with standard chemotherapy. There was no significant difference in first-line and second-line progression-free survival (PFS) between the groups, as well as in the disease control rate, BRAF mutation was not found to be prognostic of overall survival. We found no significant difference in outcome between the treatment types used in first-line or second-line in patients with BRAF-MT disease compared with controls nor between BRAF V600E or non-V600E compared with controls. Conclusions - BRAF mutation is not a strong prognostic factor in NSCLC. Although taxan-based therapy shows poorest PFS in first-line, no chemotherapy regimen was associated with prognosis.

Published
2019

2. MYD88 Somatic Mutation Is a Diagnostic Criterion in Primary Cutaneous Large B-Cell Lymphoma

Author

Vanessa Szablewski, François Le Gall, Anne de Muret, Jean-Philippe Merlio, Nicolas Ortonne, Agnès Carlotti, Maxime Battistella, David Cappellen, Marie Beylot-Barry, Béatrice Vergier, Audrey Gros, F. Franck, François Comoz, Anne Pham-Ledard, Sarah Menguy, Anne Croue, Brigitte Balme, Marie-Hélène Lorton, Laurence Lamant, Physiopathologie du cancer du foie, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Service d'anatomo-pathologie [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Cancer et Transplantation : Physiopathologie et Réponse Thérapeutique (UMR 1165), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM U955, équipe 9, Département de pathologie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Laboratoire d'Anatomie Pathologique [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service d'anatomie et cytologie pathologiques [Purpan], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Service de Pathologie, Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Clermont-Ferrand, Département de Pathologie, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Département de biologie de la tumeur, CHU Bordeaux [Bordeaux], Service de pathologie [Bordeaux], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse], and Jonchère, Laurent

Subjects
PCFCL, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Primary cutaneous B-cell lymphoma, Dermatology, [SDV.GEN.GH] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Biochemistry, primary cutaneous follicle center lymphoma, 030207 dermatology & venereal diseases, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Germline mutation, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, medicine, primary cutaneous B-cell lymphoma, PCBCL, B-cell lymphoma, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, primary cutaneous marginal zone lymphoma, GC, business.industry, Germinal center, Cell Biology, [SDV.MHEP.DERM] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Dermatology, PCLBCL-LT, medicine.disease, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, germinal center, primary cutaneous large B-cell lymphoma-leg type, 030220 oncology & carcinogenesis, PCMZL, Immunology, Mutation (genetic algorithm), Cancer research, Myeloid Differentiation Factor 88, Primary cutaneous marginal zone lymphoma, Differential diagnosis, business, [SDV.MHEP.DERM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Dermatology
Abstract

International audience; no abstract

Published
2016

3. Calcium Independent Effect of Orai1 and STIM1 in Non-Hodgkin B Cell Lymphoma Dissemination

Author

Simon, Latour, Isabelle, Mahouche, Floriane, Cherrier, Lamia, Azzi-Martin, Valérie, Velasco, Pierre, Soubeyran, Jean-Philippe, Merlio, Sandrine, Poglio, Laurence, Bresson-Bepoldin, Université de Bordeaux (UB), Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de pathologie, Institut Bergonié - CRLCC Bordeaux, Plateforme de génétique moléculaire des cancers d'Aquitaine, Département de biologie de la tumeur, CHU Bordeaux [Bordeaux], Métabolisme Plasticité et Mitochondrie [lié à l'ex IFR 31] (LMPM), IFR 31 Louis Bugnard (IFR 31), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Validation et identification de nouvelles cibles en oncologie (VINCO), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut Bergonié - CRLCC Bordeaux-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut Bergonié [Bordeaux], UNICANCER-UNICANCER, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Bergonié [Bordeaux], UNICANCER-UNICANCER-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Orai1, calcium, STIM1, lymphoma, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], lymphocyte, lcsh:Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, migration, lcsh:RC254-282, Article
Abstract

Ca2+ release-activated Ca2+ channels, composed of Orai1 and STIM1 (stromal interaction molecule 1) proteins, are the main Ca2+ entry mechanism in lymphocytes. Their role in cell migration and metastasis is demonstrated in solid cancers but it remains elusive in malignant hemopathies. Diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) is characterized by the dissemination of neoplastic B cells throughout the organism which is under the control of chemokines such as Stromal Derived Factor 1 (SDF-1) and its receptor CXCR4. CXCR4 activation triggers a complex intracellular signaling including an increase in intracellular Ca2+ concentration whose role is still unclear. Using pharmacological and genetic approaches, we revealed that STIM1 and Orai1 were responsible for Ca2+ influx induced by SDF-1. Furthermore, we provide in vitro and in vivo evidence that they are necessary for basal or SDF-1-induced DLBCL cell migration which is independent of Ca2+ entry. We identify that they act as effectors coupling RhoA and ROCK dependent signaling pathway to MLC2 phosphorylation and actin polymerization. Finally, we revealed an alteration of Orai1 and STIM1 expression in extra-nodal DLBCL. Thus, we discovered a novel Ca2+-independent but Orai1 and STIM1-dependent signaling pathway involved in basal and CXCR4 dependent cell migration, which could be relevant for DLBCL physiopathology.

Published
2018

4. Routine molecular profiling of cancer: results of a one-year nationwide program of the French Cooperative Thoracic Intergroup (IFCT) for advanced non-small cell lung cancer (NSCLC) patients

Author

Barlesi, Fabrice, Mazières, Julien, Merlio, Jean-Philippe, Debieuvre, Didier, Mosser, Jean, Léna, Hervé, Ouafik, L'Houcine, Besse, Benjamin, Rouquette, Isabelle, Westeel, Virginie, Escande, Fabienne, Monnet, Isabelle, Lemoine, Antoinette, Veillon, Rémi, Blons, Hélène, Audigier-Valette, Clarisse, Bringuier, Pierre-Paul, Lamy, Régine, Beau-Faller, Michèle, Pujol, Jean-Louis, Sabourin, Jean-Christophe, Penault-Llorca, Frédérique, Denis, Marc G, Lantuejoul, Sylvie, Morin, Franck, Tran, Quân, Missy, Pascale, Langlais, Alexandra, Milleron, Bernard, Cadranel, Jacques, Soria, Jean-Charles, Zalcman, Gérard, Oncologie multidisciplinaire et innovations thérapeutiques [Hôpital Nord - APHM], Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital Nord [CHU - APHM]-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Rangueil-Larrey University Hospital, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Département de biologie de la tumeur, CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] (CH E.Muller Mulhouse), Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace (GHTHA), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de pneumologie [Rennes] = Pneumology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Département de biologie du cancer, Hôpital Nord [CHU - APHM], Institut Gustave Roussy (IGR), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (EA 3181) (CEF2P / CARCINO), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Microenvironnement et Physiopathologie de la Differenciation, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique (MEPPOT - U1147), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Intercommunal Toulon-La Seyne sur Mer - Hôpital Sainte-Musse, Equipe 4, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CH Bretagne Sud, Laboratoire de Biochimie et de Biologie Moléculaire, CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Département de Pathologie, CHU Grenoble, Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] (IFCT), Intergroupe Francophone de Cancérologie thoracique, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Pneumologie - Oncologie Thoracique - Maladies Pulmonaires Rares [CHU Tenon], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de pneumologie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), French National Cancer Institute (INCa)., Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital Nord [CHU - APHM], Centre de Recherches en Oncologie biologique et Oncopharmacologie (CRO2), Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], Laboratoire de Transfert d'Oncologie Biologique [Hôpital Nord - APHM], Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier de toulon, Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), CH de Lorient, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Service d'Anatomie et Cytologie Pathologique [CHU Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Inserm : U823, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (UR 3181) (CEF2P / CARCINO), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital Nord [CHU - APHM], Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ), Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] ( CH E.Muller Mulhouse ), Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace ( GHTHA ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de pneumologie, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -CHU Pontchaillou [Rennes], Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Institut Gustave Roussy ( IGR ), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole ( IUCT Oncopole - UMR 1037 ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC ( CEF2P / CARCINO ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique ( MEPPOT - U1147 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpital Sainte-Musse, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon ( CRCL ), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Dynamique des capacités humaines et des conduites de santé ( EPSYLON ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Jean Perrin Comprehensive Cancer Centre, Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] ( IFCT ), Service de Pneumologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Tenon [APHP], Service de pneumologie et réanimation [CHU Tenon], CHU Caen, Hôpital Larrey [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (EA 3181) ( CEF2P / CARCINO ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Université de Montpellier ( UM ), Ouafik, L'Houcine, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Jonchère, Laurent, Service de Pneumologie = Pneumologie - Oncologie Thoracique - Maladies Pulmonaires Rares [CHU Tenon], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)

Subjects
[SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.PSR] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.PSR]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, [ SDV.MHEP.PSR ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, [ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer
Abstract

International audience; Background: The molecular profiling of patients with advanced non-small-cell lung cancer (NSCLC) for known oncogenic drivers is recommended during routine care. Nationally, however, the feasibility and effects on outcomes of this policy are unknown. We aimed to assess the characteristics, molecular profiles, and clinical outcomes of patients who were screened during a 1-year period by a nationwide programme funded by the French National Cancer Institute. Methods This study included patients with advanced NSCLC, who were routinely screened for EGFR mutations, ALK rearrangements, as well as HER2 (ERBB2), KRAS, BRAF, and PIK3CA mutations by 28 certified regional genetics centres in France. Patients were assessed consecutively during a 1-year period from April, 2012, to April, 2013. We measured the frequency of molecular alterations in the six routinely screened genes, the turnaround time in obtaining molecular results, and patients' clinical outcomes. This study is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT01700582. Findings 18 679 molecular analyses of 17 664 patients with NSCLC were done (of patients with known data, median age was 64·5 years [range 18–98], 65% were men, 81% were smokers or former smokers, and 76% had adenocarcinoma). The median interval between the initiation of analysis and provision of the written report was 11 days (IQR 7–16). A genetic alteration was recorded in about 50% of the analyses; EGFR mutations were reported in 1947 (11%) of 17 706 analyses for which data were available, HER2 mutations in 98 (1%) of 11 723, KRAS mutations in 4894 (29%) of 17 001, BRAF mutations in 262 (2%) of 13 906, and PIK3CA mutations in 252 (2%) of 10 678; ALK rearrangements were reported in 388 (5%) of 8134 analyses. The median duration of follow-up at the time of analysis was 24·9 months (95% CI 24·8–25·0). The presence of a genetic alteration affected first-line treatment for 4176 (51%) of 8147 patients and was associated with a significant improvement in the proportion of patients achieving an overall response in first-line treatment (37% [95% CI 34·7–38·2] for presence of a genetic alteration vs 33% [29·5–35·6] for absence of a genetic alteration; p=0·03) and in second-line treatment (17% [15·0–18·8] vs 9% [6·7–11·9]; p

Published
2016

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