Author: "Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA)" - Searchworks@Jio Institute Digital Library Search Results

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235 results on '"Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA)"'

1. Charge transfer dissociation of complex oligosaccharides: Comparison with collision-induced dissociation and extreme ultraviolet dissociative photoionization

Author: Hélène Rogniaux, Alexandre Giuliani, Glen P. Jackson, Mathieu Fanuel, Pengfei Li, David Ropartz, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Eugene Bennett Department of Chemistry, West Virginia University [Morgantown], Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Synchrotron SOLEIL, Department of Forensic and Investigative Science, University of Central Lancashire [Preston] (UCLAN), Agence Nationale de la Recherche Scientifique, France [ANR-08-BLAN-0065], National Institutes of Health [1R01GM114494-01], Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages ( BIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), University of Central Lancashire [Preston] ( UCLAN ), and C. Eugene Bennett Department of Chemistry
Subjects: Collision-induced dissociation, Ultraviolet Rays, Tandem mass spectrometry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Analytical chemistry, Oligosaccharides, Photoionization, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Helium, Dissociation (chemistry), law.invention, Fragmentation (mass spectrometry), Structural Biology, law, Polysaccharides, Extreme Ultra-violet photon activation, Molecule, Fragmentation method, Spectroscopy, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Chemistry, 010401 analytical chemistry, Photochemical Processes, Synchrotron, 0104 chemical sciences, Chemical physics, Helium-charge transfer dissociation, Ion trap, Synchrotrons, Characterization of complex oligosaccharide structures
Abstract: The structural characterization of oligosaccharides still challenges the field of analytical chemistry. Tandem mass spectrometry offers many advantages toward this aim, although the generic fragmentation method (low-energy collision-induced dissociation) shows clear limitations and is often insufficient to retrieve some essential structural information on these molecules. In this work, we present the first application of helium charge transfer dissociation (He-CTD) to characterize the structure of complex oligosaccharides. We compare this method with low-energy collision-induced dissociation and extreme-ultraviolet dissociative photoionization (XUV-DPI), which was shown previously to ensure the successful characterization of complex glycans. Similarly to what could be obtained by XUV-DPI, He-CTD provides a complete description of the investigated structures by producing many informative cross-ring fragments and no ambiguous fragmentation. Unlike XUV-DPI, which is performed at a synchrotron source, He-CTD has the undeniable advantage of being implementable in a conventional benchtop ion trap in a conventional laboratory setting. Graphical Abstract ᅟ.
Published: 2016

2. Binding site of different tannins on a human salivary proline-rich protein evidenced by dissociative photoionization tandem mass spectrometry

Author: Alexandre Giuliani, Sarah Ployon, Jean-Paul Mazauric, Francis Canon, Matthieu Réfrégiers, Véronique Cheynier, Pascale Sarni-Manchado, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Sciences Pour l'Oenologie (SPO), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Synchotron SOLEIL, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agence Nationale de la Recherche, France, under the projects ANR-08-BLAN-0065 and ANR-BLAN-0279, and by the Regional Council of Burgundy (FABER AIB 29000622), Européen de Développement Régional (FEDER) (European Union), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), the Regional Council of Burgundy (FABER AIB 29000622), Européen de Développement Régional (FEDER) (European Union), ANR-08-BLAN-0065,SR M52,Synchrotron Radiaton for Tandem Mass Spectrometry(2008), ANR-06-BLAN-0279,APTAK,How is it to activate polycistronic translation in eukaryotes(2006), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Sciences Pour l'Oenologie ( SPO ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [Nouvelle-Calédonie] ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Subjects: Mass spectrometry, Astringency, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Organic Chemistry, Gallate, Photoionization, Epigallocatechin gallate, Degree of polymerization, Tandem mass spectrometry, Biochemistry, Pro line-rich proteins, Binding site, chemistry.chemical_compound, chemistry, Proanthocyanidin, [ CHIM.ORGA ] Chemical Sciences/Organic chemistry, Drug Discovery, Tannins, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Non-covalent interaction
Abstract: The sensation of astringency is thought to originate from the interaction occurring between tannins and the salivary proline-rich proteins (PRPs). Astringency perception can be modified by the structure of tannins. Herein, we study the interactions occurring between the human salivary PRP, IB5, and three model tannins with different structure, epigallocatechin gallate and the procyanidin dimers B2 and B2 3′ O -gallate, using the coupling of mass spectrometry and VUV-synchrotron radiation. The results obtained indicate that the structure of tannins, in particular the degree of polymerization and the galloylation, does not modify the binding site on IB5 involved in the interaction.
Published: 2015

3. Action spectroscopy of a protonated peptide in the ultraviolet range

Author: Aleksandar R. Milosavljević, Francis Canon, Alexandre Giuliani, Laurent Nahon, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Belgrade [Belgrade], Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Synchrotron SOLEIL ( SSOLEIL ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: Models, Molecular, spectroscopy, Ultraviolet Rays, [SDV]Life Sciences [q-bio], General Physics and Astronomy, Electrons, Photoionization, Substance P, Photochemistry, Fragmentation (mass spectrometry), Ionization, tandem mass spectrometry, Side chain, Amino Acid Sequence, Physical and Theoretical Chemistry, Spectroscopy, mass spectrometry, Photolysis, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Chemistry, Lasers, Photodissociation, photodissociation, Dication, Excited state, Protons, protein, dissociative photoionization
Abstract: Action spectroscopy of protonated substance P, a model undecapeptide, has been probed from 5.2 eV to 20 eV. For photon energy above the ionization threshold measured at 10.3 ± 0.1 eV, the radical dication is observed along with side chain losses and abundant formation of all kinds of sequence ions. Below the photoionization threshold, the photoproducts involve side chain cleavages and backbone cleavages into a-, b-/y-, and c-sequence ions. Different electronic excited states appear to produce different fragment ions. Norrish type I and II reactions are proposed to account for some photoproducts. This study bridges the gap between laser activation and electron-induced dissociation of peptides. Moreover, our results report for the first time a comprehensive picture of the photochemical fragmentation of a gas phase peptide in a wide photon energy range.
Published: 2015

4. Traditional green leafy vegetables as underutilised sources of micronutrients in a rural farming community in south-west Nigeria II: consumption pattern and potential contribution to micronutrient requirements

Author: David Page, Catherine M. C. G. Renard, S. I. Ejoh, Faustina Dufie Wireko-Manu, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Ibadan, Kwame Nkrumah University of Science and Technology [GHANA] (KNUST), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: 0301 basic medicine, food system, indigenous vegetables, nutrient contribution, nutrient requirement, Nutrient requirement, enfant en bas âge, modèle de consommation, [SDV]Life Sciences [q-bio], femme, communauté rurale, Nigeria, Medicine (miscellaneous), Indigenous vegetables, 03 medical and health sciences, 0404 agricultural biotechnology, Nutrient, teneur en fer, Medicine, vitamine a, légume feuille, 2. Zero hunger, Consumption (economics), 030109 nutrition & dietetics, Nutrition and Dietetics, Agroforestry, business.industry, Nutrient contribution, apport nutritionnel, 04 agricultural and veterinary sciences, Micronutrient, 040401 food science, Food system, Agriculture, Food systems, Leafy vegetables, business, succession saisonniere
Abstract: International audience; Objective: To determine the consumption pattern of selected households consuming traditional green leafy vegetables (TGLVs) during three seasons and potential contribution to recommended nutrient intakes. Design: Repeated household survey using food frequency questionnaire to obtain consumption pattern of selected TGLVs. Setting and Subjects: Selected households in a small rural farming community: pre-rainy (n = 43), rainy (n = 36) and post-rainy seasons (n = 40). Results: Corchorus olitorius and A. hybridus were the most consumed by > 70% of households across three seasons. A. esculentus and A. viridis were the least consumed TGLVs through all the seasons. Uncultivated and cultivated TGLVs could contribute between 26–> 100% and 18–96%, respectively, of recommended intake for vitamin A for children and women. For young children, both the cultivated and uncultivated TGLVs could contribute more than 50% of their RDA for iron. Conclusion: seasonal availability, and preference for certain species, determine the consumption pattern of the TGLVs studied. Uncultivated and less utilised vegetables have the potential to make significant contributions to the micronutrient requirements of women and children, especially vitamin A and iron if frequently used.
Published: 2023

5. Contribution of synchrotron radiation to photoactivation studies of biomolecular ions in the gas phase

Author: Francis Canon, Aleksandar R. Milosavljević, Alexandre Giuliani, Laurent Nahon, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Synchrotron SOLEIL, University of Belgrade [Belgrade], Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), ANR-08-BLAN-0065, 'Pavle Savic' project of bilateral scientific collaboration, Serbia + France, Ministry of Education and Science of Republic of Serbia, COST Action, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: ion trap, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Photon, Light, Analytical chemistry, Synchrotron radiation, Photon energy, medicine.disease_cause, 7. Clean energy, biomolecules, Mass Spectrometry, Phase Transition, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Analytical Chemistry, Ion, law.invention, Biopolymers, law, tandem mass spectrometry, medicine, photon activation, Spectroscopy, Ions, Photons, Range (particle radiation), business.industry, Chemistry, synchrotron radiation, X-Rays, [ SDV.BIO ] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Equipment Design, Condensed Matter Physics, Laser, [ PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH ] Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Optoelectronics, Gases, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Ion trap, business, Synchrotrons, Ultraviolet
Abstract: Article first published online: 17 DEC 2013; Photon activation of ions in the visible and ultraviolet range attracts a growing interest, partly for its promising applications in tandem mass spectrometry. However, this task is not trivial, as it requires notably high brilliance photon sources. Hence, most of the work in that field has been performed using lasers. Synchrotron radiation is a source continuously tunable over a wide photon energy range and which possesses the necessary characteristics for ion activation. This review focuses on the array of applications of synchrotron radiation in photon activation of ions ranging from near UV to soft X-rays. © 2013 Wiley Periodicals, Inc. Mass Spec Rev.
Published: 2014

6. VUV photofragmentation of protonated leucine-enkephalin peptide dimer below ionization energy

Author: Miloš Lj. Ranković, Alexandre Giuliani, Francis Canon, Aleksandar R. Milosavljević, Viktor Z. Cerovski, Laurent Nahon, Institute of Physics [Belgrade], University of Belgrade [Belgrade], Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), French ANR [ANR-08-BLAN-0065], 'Pavle Savic' bilateral scientific project [N27482TE], COST Action [MP1002], Ministry of education, science and technological development of Republic or Serbia [171020, 171033], SOLEIL [20110324, 20130388], Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Synchrotron SOLEIL ( SSOLEIL ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: endocrine system, gas-phase, spectroscopy, Dimer, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, Tandem mass spectrometry, Photochemistry, 01 natural sciences, Dissociation (chemistry), Ion, chemistry.chemical_compound, Fragmentation (mass spectrometry), [ CHIM.ORGA ] Chemical Sciences/Organic chemistry, Ionization, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Quadrupole ion trap, photoionization, beamline, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, Photodissociation, [ SDV.IDA ] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, mass-spectrometry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Atomic and Molecular Physics, and Optics, 0104 chemical sciences, chemistry, Atomic physics, 0210 nano-technology
Abstract: The experimental investigation of 5-8 eV photons induced dissociation of the leucine-enkephalin (Leu-Enk) peptide dimer, performed by coupling a linear ion trap with a synchrotron beamline, in combination with the tandem mass spectrometry, has been reported. The present work extends the existing results on Leu-Enk VUV-induced dissociation to lower sub-ionization photon energy range. The measured tandem mass spectra show that even at the photon energies below the ionization threshold, VUV irradiation of the protonated Leu-Enk dimer precursor can lead to a rich fragmentation pattern, including peptide sequence ions and neutral losses. The photodissociation yields of selected ionic fragments reveal the absorption bands at about 6.7-7.1 eV (185-175 nm). The experimental results have been supported by theoretical description of the [2Leu-Enk + H](+) precursors, optimized at B3LYP/6-31+G(d,p) level of DFT.
Published: 2014

7. Application of VUV synchroton radiation to proteomic and analytical mass spectrometry

Author: Giuliani, Alexandre, Milosavljević, Aleksandar R., Canon, Francis, Nahon, Laurent, Réfrégiers, Matthieu, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Belgrade [Belgrade], Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ProdInra, Archive Ouverte, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Synchotron SOLEIL, University of Belgrade, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: [SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: Application of VUV synchroton radiation to proteomic and analytical mass spectrometry. 11. international conference on Synchroton radiation instrumentation (Sri 2012)
Published: 2013

8. Nanosolvation-induced stabilization of a protonated peptide dimer isolated in the gas phase

Author: Alexandre Giuliani, Laurent Nahon, Francis Canon, Viktor Z. Cerovski, Aleksandar R. Milosavljević, Institute of Physics [Belgrade], University of Belgrade [Belgrade], Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), This work was supported by the Agence Nationale de la Recherche Scientifique, France, under the project no. ANR-08-BLAN-0065 and partially by 'Pavle Savic' project of bilateral scientific collaboration between Serbia and France and the COST Action MP1002 (Nano- IBCT). A.R.M. and V.Z.C. acknowledge support by the MESTD RS (Project Nos. 171020 and 171033, respectively). The SOLEIL synchrotron radiation facility is acknowledged for providing beamtime under project 20110694., This work was supported by the Agence Nationale de la Recherche Scientifique, France, under the project no. ANR-08-BLAN-0065 and partially by 'Pavle Savic' project of bilateral scientific collaboration between Serbia and France and the COST Action MP1002 (Nano- IBCT). A.R.M. and V.Z.C. acknowledge support by the MESTD RS (Project Nos. 171020 and 171033, respectively). The SOLEIL synchrotron radiation facility is acknowledged for providing beamtime under project 20110694., Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Synchrotron SOLEIL ( SSOLEIL ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: Ultraviolet Rays, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Dimer, Analytical chemistry, Molecular Conformation, Peptide, Protonation, Photoionization, Mass spectrometry, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Catalysis, Molecular conformation, Gas phase, chemistry.chemical_compound, Computational chemistry, Leucine, Radiation damage, photoionization, mass spectrometry, microsolvation, chemistry.chemical_classification, 010405 organic chemistry, General Chemistry, General Medicine, Enkephalins, 0104 chemical sciences, ion spectroscopy, chemistry, radiation damage, Quantum Theory, Thermodynamics, Gases, Protons, Peptides, Dimerization, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: Clef UT : 000321298800048; International audience; A dash of water: Nanosolvation of a leucine-enkephalin peptide dimer by only three water molecules has a dramatic impact on its stability to VUV photon irradiation. A drastic reduction of the fragmentation abundance of the hydrated protonated peptide dimer precursor, isolated in the gas phase, was observed. Calculations show that hydration in fact stabilizes the dimer structure.
Published: 2013

9. Valence shell direct double photodetachment in polyanions

Author: Alexandre Giuliani, Philippe Dugourd, Rodolphe Antoine, Laurent Nahon, Denis Duflot, Claire Brunet, Francis Canon, Institut Lumière Matière [Villeurbanne] (ILM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physico-Chimie Moléculaire Théorique (PCMT), Laboratoire de Physique des Lasers, Atomes et Molécules - UMR 8523 (PhLAM), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR 08-BLAN-0065 + 2012-088620, Institut des Sciences Analytiques (ISA), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Institut Lumière Matière [Villeurbanne] ( ILM ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut des Sciences Analytiques ( ISA ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Physico-Chimie Moléculaire Théorique ( PCMT ), Laboratoire de Physique des Lasers, Atomes et Molécules - UMR 8523 ( PhLAM ), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Synchrotron SOLEIL ( SSOLEIL ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: mass spectrometry, synchrotron radiation, valence shell, photoionization, vuv radiation, vuv, protein, General Physics and Astronomy, Synchrotron radiation, Photoionization, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Ab initio quantum chemistry methods, 0103 physical sciences, Physics::Atomic and Molecular Clusters, Food and Nutrition, Physics::Atomic Physics, Physics::Chemical Physics, Physics, 010304 chemical physics, Relaxation (NMR), 0104 chemical sciences, [ PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH ] Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Alimentation et Nutrition, Ion trap, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Atomic physics, Absorption (chemistry), Valence electron, Excitation
Abstract: Funding Agency: Agence Nationale de la Recherche Scientifique, France = 08-BLAN-0065 + GENCI-CINES = 2012-088620; International audience; A valence shell study of electrosprayed insulin protein polyanion photodetachment was carried out on a vacuum ultra-violet synchrotron radiation beamline coupled to a radiofrequency ion trap, for both close- and open-shell species. A two-electron photodetachment is observed, which arises from two different mechanisms that are disentangled: a sequential multi-photon absorption and a direct one-photon two-electron process. The threshold for the direct double-electron ejection is measured at 11.4 eV and corresponds to electronic excitation in the valence shell, which makes it the first observation of direct double photodetachment in the valence shell. The results are discussed in the light of previous knowledge from multiple photoionization and ab initio calculations on model polyanions. Double photodetachment appears to be a relaxation mechanism that leads to oxidized anions of striking stability, a feature of high relevance in radiobiology.
Published: 2013

10. Ionization energy of gas phase protein cations and its dependence on charge state_and structure

Author: Giuliani, Alexandre, Milosavljević, Alexandre R., Hinsen, Konrad, Canon, Francis, Nicolas, Christophe, Refregiers, Matthieu, Nahon, Laurent, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Belgrade [Belgrade], Centre de biophysique moléculaire (CBM), Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ProdInra, Archive Ouverte, Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Synchotron SOLEIL, University of Belgrade, UPR 4301, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], [CHIM.OTHE] Chemical Sciences/Other, [ SDU.OTHER ] Sciences of the Universe [physics]/Other, [ CHIM.OTHE ] Chemical Sciences/Other, Astrophysics::High Energy Astrophysical Phenomena, Physics::Atomic and Molecular Clusters, Physics::Accelerator Physics, [SDU.OTHER] Sciences of the Universe [physics]/Other, [ SDV.OT ] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], Physics::Chemical Physics, [SDU.OTHER]Sciences of the Universe [physics]/Other, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other
Abstract: Ionization energy of gas phase protein cations and its dependence on charge state_and structure. Synchrotron SOLEIL Users Meeting
Published: 2013

11. Fast [i]in vacuo[/i] photon shutter for synchrotron radiation quadrupole ion trap tandem mass spectrometry

Author: Christophe Nicolas, Alexandre Giuliani, Francis Canon, A. R. Milosavljevic, Matthieu Réfrégiers, J. F. Gil, L. Nahon, Inst Phys, University of Belgrade [Belgrade], Synchrotron SOLEIL ( SSOLEIL ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agence Nationale de la Recherche Scientifique, France, under the project #BLAN08-1_348053, the Ministry of Education and Science of Republic of Serbia under Project No. 171020, project #20090295., Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: [SPI.OTHER]Engineering Sciences [physics]/Other, Nuclear and High Energy Physics, Photon, Synchrotron radiation, [ SPI.OTHER ] Engineering Sciences [physics]/Other, 010405 organic chemistry, Chemistry, Tandem mass spectrometry, Photon shutter, [PHYS.NEXP]Physics [physics]/Nuclear Experiment [nucl-ex], 010402 general chemistry, Mass spectrometry, 01 natural sciences, 0104 chemical sciences, Ion, Bradbury–Nielsen shutter, Shutter, Ion spectroscopy, Atomic physics, Quadrupole ion trap, [ PHYS.NEXP ] Physics [physics]/Nuclear Experiment [nucl-ex], Instrumentation
Abstract: Document Type : Proceedings Paper Conference Date : JUN 21-25, 2011 Conference Location : Belgrade, SERBIA Conference Sponsor : Univ Belgrade, Inst Phys, Serbian Acad Sci & Arts (SASA), Republ Serbia, Minist Educ & Sci, Serbian Phys Soc, Serv Cooperat Dact Culturelle Ambassade France Serbie, Osterreichisches Kulturforum Belgrad; A specific mechanical beam shutter has been designed as a part of a novel experimental setup for tandem mass spectrometry and ion spectroscopy of electrosprayed ions in a linear quadrupole ion trap using VUV and soft X-ray synchrotron radiation. This low-cost and robust shutter controls the photon irradiation of the ions in the trap, starting at a desired moment and during a well-defined period of time, with fast cutoff (on) of the photon beam (
Published: 2012

12. Gas-phase protein inner-shell spectroscopy by coupling an ion trap with a soft x-ray beamline

Author: Christophe Nicolas, Alexandre Giuliani, Laurent Nahon, Catalin Miron, Francis Canon, Aleksandar R. Milosavljević, Inst Phys, University of Belgrade [Belgrade], Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agence Nationale de la Recherche Scientifique [BLAN08-1_348053], Institut Français de Serbie through the EGIDE, Ministry of Education and Science of the Republic of Serbia [171020], Synchrotron SOLEIL ( SSOLEIL ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: NEXAFS SPECTROSCOPY, Double ionization, Analytical chemistry, Photoelectron photoion coincidence spectroscopy, 02 engineering and technology, Photoionization, 010402 general chemistry, Mass spectrometry, 01 natural sciences, Ion, REGION, Ionization, PHOTOIONIZATION, EXCITATION, SPECTRA, General Materials Science, Physical and Theoretical Chemistry, Quadrupole ion trap, PHOTOEMISSION, FUNCTIONAL PROTEINS, Chemistry, GLYCINE, MASS-SPECTROMETRY, 021001 nanoscience & nanotechnology, 0104 chemical sciences, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, [ CHIM.THEO ] Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Ion trap, 0210 nano-technology, DECAY
Abstract: C, N, and O near-edge ion yield spectroscopy of 8+ selected electrosprayed cations of cytochrome c protein (12 kDa) has been performed by coupling a linear quadrupole ion trap with a soft X-ray beamline. The photoactivation tandem mass spectra were recorded as a function of the photon energy. Photoionization of the precursor, accompanied by CO2 loss, is the dominant relaxation process, showing high photoion stability following direct or resonant photoionization. The partial ion yields extracted from recorded mass spectra show significantly different behaviors for single and double ionization channels, which can be qualitatively explained by different Auger decay mechanisms. However, the single ionization spectra reveal characteristic structures when compared to existing near-edge X-ray absorption fine structure (NEXAFS) spectra from thin films of peptides and proteins. Therefore, the present experiment opens up new avenues for near-edge X-ray spectroscopy of macromolecules in the gas phase, overcoming the radiation damage issue or the environmental effects as due to the surface, intermolecular interactions, and solvent.
Published: 2012

13. VUV action spectroscopy of protonated leucine-enkephalin peptide in the 6-14 eV range

Author: Alexandre Giuliani, Laurent Nahon, M Lj Ranković, Francis Canon, Aleksandar R. Milosavljević, University of Belgrade [Belgrade], Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synchotron SOLEIL, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Notre Dame [Indiana] (UND), Project No. ANR-08-BLAN-0065, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Synchroton SOLEIL, University of Notre Dame ( UND ), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: gas-phase, Ultraviolet Rays, synchrotron-radiation, General Physics and Astronomy, Photon energy, Photochemistry, Tandem mass spectrometry, Mass spectrometry, vacuum-ultraviolet photoionization, charge-transfer transitions, Fragmentation (mass spectrometry), Leucine, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, tandem mass-spectrometry, Physical and Theoretical Chemistry, Quadrupole ion trap, Spectroscopy, Astrophysics::Galaxy Astrophysics, induced dissociation, Quantitative Biology::Biomolecules, Photolysis, [PHYS.PHYS]Physics [physics]/Physics [physics], Chemistry, Photodissociation, Enkephalins, [ PHYS.PHYS ] Physics [physics]/Physics [physics], photofragmentation, electronic spectroscopy, Mass spectrum, Spectrophotometry, Ultraviolet, [ CHIM.ANAL ] Chemical Sciences/Analytical chemistry, Protons, Atomic physics, Peptides, glycine, energy
Abstract: We have studied the Vacuum Ultraviolet (VUV) photodissociation of gas-phase protonated leucine-enkephalin peptide ion in the 5.7 to 14 eV photon energy range by coupling a linear quadrupole ion trap with a synchrotron radiation source. We report VUV activation tandem mass spectra at 6.7, 8.4, and 12.8 eV photon energies and photodissociation yields for a number of selected fragments. The obtained results provide insight into both near VUV radiation damage and electronic properties of a model peptide. We could distinguish several absorption bands and assign them to particular electronic transitions, according to previous theoretical studies. The photodissociation yields appear to be very different for the various observed fragmentation channels, depending on both the types of fragments and their position along the peptide backbone. The present results are discussed in light of recent gas-phase spectroscopic data on peptides.
Published: 2015

14. Photodissociation of protonated Leucine-Enkephalin peptide in the VUV range

Author: Alexandre Giuliani, M Lj Ranković, Viktor Z. Cerovski, L. Nahon, Francis Canon, A. R. Milosavljevic, Institute of Physics [Belgrade], University of Belgrade [Belgrade], Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Univ Autonoma Madrid, Consejo Super Investigaciones Cient, Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Synchroton SOLEIL, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture ( CEPIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), and Ranković, Milos Lj.
Subjects: History, Physics::Instrumentation and Detectors, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, 030303 biophysics, Ingénierie des aliments, Synchrotron radiation, Peptide, Protonation, Photochemistry, 01 natural sciences, Education, 03 medical and health sciences, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, 0103 physical sciences, Physics::Atomic and Molecular Clusters, Food and Nutrition, Food engineering, Quadrupole ion trap, Spectroscopy, chemistry.chemical_classification, Physics::Biological Physics, Quantitative Biology::Biomolecules, 0303 health sciences, Range (particle radiation), 010304 chemical physics, Chemistry, Photodissociation, [ SDV.IDA ] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Computer Science Applications, Beamline, Alimentation et Nutrition, Physics::Accelerator Physics, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: We present results of VUV action spectroscopy of gas-phase protonated Leucin-Enkephalin peptide. The experiment has been performed by coupling a linear quadrupole ion trap with a synchrotron radiation VUV beamline.
Published: 2015

15. Oxygen K-shell spectroscopy of isolated progressively solvated peptide

Author: Alexandre Giuliani, Francis Canon, Aleksandar R. Milosavljević, Miloš Lj. Ranković, Kari Jänkälä, John D. Bozek, Christophe Nicolas, Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Physics, University of Oulu, University of Belgrade [Belgrade], Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), SOLEIL support (projects no. 20160335 and 20161170). The Ministry of education, science and technological development of Republic of Serbia under the grant OI 171020., and ANR-08-BLAN-0065,SR M52,Synchrotron Radiaton for Tandem Mass Spectrometry(2008)
Subjects: Electron shell, General Physics and Astronomy, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, 7. Clean energy, Dissociation (chemistry), Fragmentation (mass spectrometry), Molecule, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Water cluster, Physics::Chemical Physics, Physical and Theoretical Chemistry, Spectroscopy, Photons, Quantitative Biology::Biomolecules, [PHYS.PHYS.PHYS-ATOM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Atomic Physics [physics.atom-ph], 010405 organic chemistry, Chemistry, 0104 chemical sciences, Oxygen, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, X-Ray Absorption Spectroscopy, Solvation shell, Energy Transfer, Solubility, Chemical physics, Mass spectrum, Peptides
Abstract: Gas-phase near-edge X-ray-absorption fine structure (NEXAFS) action spectroscopy around the oxygen K-edge and mass spectrometry were employed to probe isolated substance P (SP) molecular ions, both bare and progressively solvated with 4 and 11 water molecules. Detailed mass spectra of bare and hydrated precursors are presented for the resonant photon energy of 532 eV that corresponds to O1s --> pi(amide)* core excitation, triggering resonant Auger decay and fragmentation from the ionized radical molecular system. The fragmentation pattern of doubly protonated SP hydrated with 4 water molecules clearly shows a series of abundant doubly charged backbone fragments, as well as triply charged precursor with small neutral losses, all preserving full water cluster. This is drastically different from the collisional induced dissociation of the hydrated peptide where the water loss is a dominant relaxation process. Moreover, the action NEXAFS obtained from several resolved small backbone fragments revealed increased fragmentation of hydrated SP relative to the bare one, due to a resonant O1s excitation of the attached water molecules. Such unexpected result inspires further experimental developments to investigate possible nonlocal energy transfer from the solvent to the biomolecules within the first solvation shell. The experiment is supported by molecular dynamics and DFT calculations to estimate the intensity of the resonant X-ray absorption of bare and hydrated SP around peptide and water O1s excitation region.
Published: 2020

16. How does calcium drive the structural organization of iron–organic matter aggregates? A multiscale investigation

Author: Marie-Sousai Appavou, Camille Rivard, Andrea Sorrentino, Delphine Vantelon, Elaheh Lotfi-Kalahroodi, Anthony Beauvois, Anne-Catherine Pierson-Wickmann, Martine Bouhnik-Le Coz, Jacques Jestin, Thomas Bizien, Baohu Wu, Valérie Briois, Aurélien Dupont, Mélanie Davranche, Géosciences Rennes (GR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LLB - Matière molle et biophysique (MMB), Laboratoire Léon Brillouin (LLB - UMR 12), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biosit : biologie, santé, innovation technologique (SFR UMS CNRS 3480 - INSERM 018), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), ALBA Synchrotron light source [Barcelone], Forschungszentrum Julich, Outstn MLZ, JCNS, D-85747 Garching, Germany, ORPHREA - ARED, Région Bretagne, 'ISAAP' project, Institut national des sciences de l'Univers, ANR-10-EQPX-45, Agence Nationale de la Recherche, ANR-10-EQPX-0045,ROCK,Spectromètre EXAFS Rapide pour Cinétiques Chimiques(2010), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: chemistry.chemical_classification, Total organic carbon, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Absorption spectroscopy, Materials Science (miscellaneous), Dimer, chemistry.chemical_element, 010501 environmental sciences, Calcium, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, Ferrihydrite, chemistry, Chemical engineering, [SDU.STU.GC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geochemistry, 13. Climate action, ddc:333.7, Leonardite, Humic acid, Organic matter, 0105 earth and related environmental sciences, General Environmental Science
Abstract: International audience; Iron-organic matter (Fe-OM) aggregates are a key factor in the control of pollutant mobility. Their physical and structural organization depends on the prevailing physicochemical conditions during their formation and on subsequent exposure to variations in porewater goechemistry. Among these conditions, calcium (Ca) could be a major parameter given its high concentrations in the environment and its affinity for OM. Mimetic environmental Fe-OM-Ca associations were synthesized at various Fe/organic carbon (OC) and Ca/Fe molar ratios using Leonardite humic acid as OM model. The impact of Ca on Fe-OM aggregates was studied by a combination of X-ray absorption spectroscopy, small angle X-ray and neutron scattering and imaging techniques (TEM, cryo-TEM and cryo-TXM). Iron phases are constituted of Fe(III)-oligomers, Fe(III)-nanoparticles and ferrihydrite (Fh), all bound or embedded by OM. Iron phases exhibit a fractal organization with Fe-primary beads aggregated as Fe-primary aggregates (Fe-PA) which themselves are embedded in an OM aggregates. For Ca/OC (mol/mol) < 0.026, Fe-PA aggregate in a third level as a Fe-secondary aggregate. For Ca/OC ≥ 0.026, OM forms a large Ca-branched network in which Ca is bound as a dimer to OM carboxylic sites. In such conditions, Fe-PA are distributed in the OM network, distant from each other. All these structural transitions are driven by Ca which partially screens the Fe-OM interactions. The formation of such micrometric network should impact both the surface reactivity of the Fe phases as well as the mobility of Fe, OM and associated elements, notably in the soil porosity where they are produced under natural conditions.
Published: 2020

17. In vitro digestion of food grade TiO 2 (E171) and TiO 2 nanoparticles: physicochemical characterization and impact on the activity of digestive enzymes

Author: Bernard Humbert, Camille Rivard, William Dudefoi, Hélène Terrisse, Marie-Hélène Ropers, Hanitra Rabesona, Muriel Mercier-Bonin, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neuro-Gastroentérologie & Nutrition (ToxAlim-NGN), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut des Matériaux Jean Rouxel (IMN), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), and ANR-11-LABX-0064,SERENADE,Vers une conception de nanomatériaux innovants, durables et sûrs(2011)
Subjects: MECHANISM, HOMEOSTASIS, food.ingredient, ADSORPTION, ALPHA-AMYLASE, INHIBITION, Regulation of gastric function, 02 engineering and technology, 010501 environmental sciences, Carbohydrate metabolism, 01 natural sciences, SALIVA, Divalent, food, Adsorption, Pepsin, ADDITIVE E171, ABSORPTION, Food science, [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, 0105 earth and related environmental sciences, chemistry.chemical_classification, biology, Food additive, TITANIUM-DIOXIDE NANOPARTICLES, General Medicine, 021001 nanoscience & nanotechnology, Enzyme, chemistry, RESOLUTION, biology.protein, [PHYS.COND.CM-MS]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Materials Science [cond-mat.mtrl-sci], 0210 nano-technology, Digestion, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Food Science
Abstract: International audience; Titanium dioxide is a food additive that has raised some concerns for humans due to the presence of nanoparticles. We were interested in knowing the fate of TiO2 particles in the gastro-intestinal tract and their potential effect on digestive enzymes. For this purpose, we analysed the behaviour of two different food grade TiO2 samples (E171) and one nano-sized TiO2 sample (P25) through a standardized static in vitro digestion protocol simulating the oral, gastric and intestinal phases with appropriate juices including enzymes. Both E171 and P25 TiO2 particles remained intact in the digestive fluids but formed large agglomerates, and especially in the intestinal fluid where up to 500 mu m sized particles have been identified. The formation of these agglomerates is mediated by the adsorption of mainly alpha-amylase and divalent cations. Pepsin was also identified to adsorb onto TiO2 particles but only in the case of silica-covered E171. In the salivary conditions, TiO2 exerted an inhibitory action on the enzymatic activity of alpha-amylase. The activity was reduced by a factor dependent on enzyme concentrations (up to 34% at 1 mg mL(-1)) but this inhibitory effect was reduced to hardly 10% in the intestinal fluid. In the gastric phase, pepsin was not affected by any form of TiO2. Our results hint that food grade TiO2 has a limited impact on the global digestion of carbohydrates and proteins. However, the reduced activity specifically observed in the oral phase deserves deeper investigation to prevent any adverse health effects related to the slowdown of carbohydrate metabolism.
Published: 2021

18. Stability of 5-methyltetrahydrofolate in fortified apple and carrot purées

Author: Nicolas Delchier, Catherine M.G.C. Renard, Lisa Striegel, Anna-Lena Herbig, Michael Rychlik, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Chair of Analytical Food Chemistry, Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), European Project: 318563,EC:FP7:ICT,FP7-ICT-2011-8,CRS-I(2012), and Technische Universität München [München] (TUM)
Subjects: 0106 biological sciences, Folate, TEMPERATURE DECREASE, Vitamin C, [SDV]Life Sciences [q-bio], Fortification, 5-Methyltetrahydrofolate, 04 agricultural and veterinary sciences, Ascorbic acid, 040401 food science, 01 natural sciences, Degradation, chemistry.chemical_compound, 0404 agricultural biotechnology, chemistry, Folic acid, Impacts, 010608 biotechnology, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Food matrix, Vitamer, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Formate, Food science, Food Science
Abstract: International audience; 5-Methyltetrahydrofolate, the naturally abundant folate vitamer, has been proposed as an alternative to folic acid for fortification. However, it is less stable than folic acid. In a formate buffer (pH 3.5), folic acid was entirely preserved after heating the solution for 3 h at 80 °C. In contrast, 5-methyltetrahydrofolate was completely degraded in less than 15 min. As in the buffer, 5-methyltetrahydrofolate in apple or carrot purées degraded rapidly without the addition of ascorbic acid. By adding ascorbic acid, the stability could be increased, but the chosen amount was crucial. An excess of vitamin C compared to 5-methyltetrahydrofolate was not always sufficient for the complete protection of 5-methyltetrahydrofolate during 3 h at 80 °C. Only by adding 2840 μmol/kg of ascorbic acid (equivalent to 500 mg/kg), 5-methyltetrahydrofolate seemed to remain stable. Degradation started after approximately 60 min when 570 μmol/kg of ascorbic acid (equivalent to 100 mg/kg) were added; after 120 min with 1420 μmol/kg (equivalent to 250 mg/kg). In addition, a temperature decrease to 70 °C or 60 °C did not increase the stability of 5-methyltetrahydrofolate.
Published: 2019

19. New exploration of the γ-gliadin structure through its partial hydrolysis

Author: Hélène Rogniaux, Adeline Boire, Alexandre Giuliani, Denis Renard, Line Sahli, Véronique Solé-Jamault, Pierre Roblin, Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement - INRAE (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Laboratoire de Génie Chimique - LGC (Toulouse, France), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Partial hydrolysis, Peptide, 02 engineering and technology, Intrinsically disordered proteins, Biochemistry, Gliadin, Domain (software engineering), 03 medical and health sciences, Protein Domains, Structural Biology, Enzymatic hydrolysis, Wheat storage proteins, Chymotrypsin, Génie chimique, Génie des procédés, Molecular Biology, Triticum, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], biology, Small-angle X-ray scattering, Hydrolysis, food and beverages, General Medicine, 021001 nanoscience & nanotechnology, 3D structure modelling, Template, chemistry, Biophysics, biology.protein, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; The partial enzymatic hydrolysis of wheat gliadins constitutes an interesting tool to unravel their structural specificity. In this work, the structure and conformation of γ-gliadin were investigated through its limited chymotrypsic digestion. Using a combination of computational, biochemical and biophysical tools, we studied each of its N and C terminal domains. Our results reveal that γ-gliadin is a partially disordered protein with an unfolded N-terminal domain surprisingly resistant to chymotrypsin and a folded C-terminal domain. Using spectroscopic tools, we showed that structural transitions occured over the disordered N-terminal domain for decreasing ethanol/water ratios. Using SAXS measurements, low-resolution 3D structures of γ-gliadin were proposed. To relate the repeated motifs of the N-terminal domain of γ-gliadin to its structure, engineered peptide models PQQPY/F were also studied. Overall results demonstrated similarities between the N-terminal domain and its derived model peptides. Our findings support the use of these peptides as general templates for understanding the wheat protein assembly and dynamics.
Published: 2020

20. Metallic ions distribution in texture and phenolic content contrasted cider apples

Author: Kévin Vidot, Camille Rivard, René Siret, Marc Lahaye, Gérard Van Vooren, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de génie des procédés - environnement - agroalimentaire (GEPEA), Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie Saint-Nazaire (IUT Saint-Nazaire), Université de Nantes (UN)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Universitaire de Technologie - La Roche-sur-Yon (IUT La Roche-sur-Yon), Université de Nantes (UN), Groupe de Recherche en Agroalimentaire sur les Produits et les Procédés (GRAPPE), Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Cap Aliment Food for Tomorrow program - Region Pays de la Loire, SOLEIL : 20170043., Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie Saint-Nazaire (IUT Saint-Nazaire), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - La Roche-sur-Yon (IUT La Roche-sur-Yon), and Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Université Bretagne Loire (UBL)
Subjects: 0106 biological sciences, Synchrotron cryo-XRF, food.ingredient, Pectin, Cuticle, Ion chromatography, Uronic acid, Horticulture, 01 natural sciences, 040501 horticulture, Image analysis, Metal, Cell wall, Multi-scales, chemistry.chemical_compound, food, Dry weight, Firmness, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Cider apples, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Food science, Texture (crystalline), Metal ions, 04 agricultural and veterinary sciences, chemistry, visual_art, visual_art.visual_art_medium, Atomic absorption spectroscopy, 0405 other agricultural sciences, Agronomy and Crop Science, 010606 plant biology & botany, Food Science
Abstract: International audience; Metallic ions were quantified and mapped at the tissue and the cell scales in two texture and phenolic content contrasted cider apples by atomic absorption spectroscopy, ion chromatography and synchrotron cryo X-ray fluorescence imaging. Metallic ions content and gradient distribution from the cuticle to the inner tissue significantly varied between years of harvest (1-294 % of differences between years). The content of non-esterified uronic acid in the cell wall pectin was also measured (3.1 and 4.9 mol kg(-1) of dry weight fruit) and found higher than the total metallic ions in the two varieties (0.22 and 0.27 mol kg(-1) of dry weight fruit). Calcium content and cell wall pectin methyl-esterification were not determinants distinguishing firm from soft apples. The results are discussed with regard to the co-location of metallic ions with the phenolic compounds which questions their role in oxidative mechanisms during fruit development and processing, affecting particularly the colour and taste of fruit products.
Published: 2020

21. Biofuels in the nexus energy-environment-food

Author: Colonna, Paul, Duplan, Jean-Luc, Legrand, Jack, Le Net, Elisabeth, Boissonnet, Guillaume, Lorne, Daphné, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), IFP Energies nouvelles (IFPEN), Bioprocédés Appliqués aux Microalgues (GEPEA-BAM), Laboratoire de génie des procédés - environnement - agroalimentaire (GEPEA), Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie Saint-Nazaire (IUT Saint-Nazaire), Université de Nantes (UN)-Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (EPUN), Université de Nantes (UN)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Universitaire de Technologie - La Roche-sur-Yon (IUT La Roche-sur-Yon), Université de Nantes (UN)-Institut Universitaire de Technologie - Nantes (IUT Nantes), Université de Nantes (UN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), and Université de Nantes (UN)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bretagne Loire (UBL)-IMT Atlantique (IMT Atlantique)
Subjects: biocarburants, [SPI]Engineering Sciences [physics], biomass, technology, biomasse, durabilité, regulation, réglements, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, sustainability, biofuels, technologie
Abstract: The production of biofuels from biological resources has been the subject of much controversy. Their opportunity update deserves to be revisited for technological maturity and assess their relevance in response to current environmental concerns.Innovations in biotechnological and chemical processes allow a wide range of liquid and gaseous biofuels; their characteristics concern energy content, compatibility with fossil fuels and openness towards strictly chemical uses.The factors driving this technological market's evolution are the implementation of abundant public policies, the evolution of agronomic practices, the concern for carbon sequestration in soils, the expectations of the aeronautical sector with biokerosenes, and consumer behaviours. From field crops and forests, the mobilizable raw materials have been extended to microalgae, animal, households and plant wastes. Biofuels are then part of the territorial bio-economy and the circular economy. Value chains are more complex than those traditionally focused on biodiesel based on oilseeds and sucrose from beet, cane or starch from wheat or maize. The integration of economic actors and the scaling of markets have been the subject of foresight work at international and French levels. Environmental sustainability is generally proven, with reservations for some sources (soya, oil palm). Biofuels are part of a food-energy-environment nexus. Public policies, if based on the sustainability and social acceptability of biotechnology, will also guide the choices of economic interests alone. This article discusses the research and development work needed to make biofuels a sustainable part of energy policy.; La production de biocarburants à partir de ressources biologiques a fait l’objet de nombreuses controverses. Leur opportunité mérite d’être revisitée pour la maturité technologique et évaluer leur pertinence en réponse aux préoccupations environnementales actuelles. Les innovations dans les procédés biotechnologiques et chimiques permettent une large gamme de biocarburants liquides et gazeux; leurs caractéristiques concernent le contenu énergétique, la compatibilité avec les carburants fossiles, l’ouverture vers des usages strictement chimiques. Les facteurs d’évolution de ce marché technologique sont l’implantation de politiques publiques foisonnantes, l’évolution des pratiques agronomiques, la préoccupation de séquestration du carbone dans les sols, les attentes du secteur aéronautique avec les biokérosènes, et les comportements des consommateurs. A partir des plantes de grande culture et des forêts, les matières premières mobilisables se sont élargies aux microalgues, aux déchets animaux et végétaux. Les biocarburants s’inscrivent alors dans la bioéconomie territoriale et l’économie circulaire. Les chaines de valeur sont plus complexes que celles anciennes centrées sur le biodiesel à base d’oléagineux et de saccharose de betterave, de canne ou d’amidon de blé ou de maïs. L’intégration des acteurs économiques et le dimensionnement des marchés ont fait l’objet de travaux de prospective aux échelles internationales et francaises. La durabilité environnementale est avérée globalement avec toutefois des réserves pour certaines sources (soja, palmier à huile). Les biocarburants s’insérent dans un nexus alimentation-énergie-environnement. Les politiques publiques, si elles se fondent sur la durabilité et l’acceptabilité sociale des biotechnologies, orienteront aussi les choix des seuls intérêts économiques. Cet article aborde les travaux de recherche et développement nécessaires pour inscrire durablement les biocarburants dans les politiques énergétiques.
Published: 2020

22. Division of Science for Food, Bioproducts and Waste TRANSFORM

Author: O'Donohue, Michael, Fournaison, Laurence, DELCLOS, Mélanie, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génie des procédés frigorifiques pour la sécurité alimentaire et l'environnement (UR FRISE), and INRAE
Subjects: [PHYS]Physics [physics], [SPI]Engineering Sciences [physics], [SDV]Life Sciences [q-bio], [CHIM]Chemical Sciences
Abstract: Research and Innovation 2020 - For Food, Bioproducts & WasteDivision of Science for Food, Bioproducts and Waste TRANSFORM
Published: 2020
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23. Nexus Santé: entre Agriculture – Alimentation – Environnement. Réflexion Prospective Pluridisciplinaire

Author: Axelos, Monique, Soler, Louis Georges, Dallongeville, A., Thomas, Alban, Akermann, Grégori, B., Allès, Antignac, Jean-Philippe, Benoit, Pascal, Le Bizec, Bruno, Bertin, N., Causse, M., Chakir, Raja, Chiffoleau, Yuna, Cravedi, Jean Pierre, Darmon, N., Denaix, Laurence, Doré, A., Dubuisson-Quellier, Sophie, Duru, M., Etilé, Fabrice, Fortané, Nicolas, Garric, J., Gésan-Guiziou, Geneviève, Hannachi, M., Jeuffroy, Marie-Helene, Lamine, C., Lescourret, Françoise, Libois, François, Marette, Stephan, Martin - Laurent, Fabrice, Mougin, Christian, Oswald, I., Peyraud, J. L., Plantard, Olivier, PRACHE, Sophie, Rault, A., Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Alimentation et sciences sociales (ALISS), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Economie des Ressources Naturelles (LERNA), Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation (UMR Innovation), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Economie Publique (ECO-PUB), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Interactions Sol Plante Atmosphère (ISPA), Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de sociologie des organisations (CSO), Sciences Po (Sciences Po)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Paris School of Economics (PSE), École des Ponts ParisTech (ENPC)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Panthéon-Sorbonne (UP1)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche Interdisciplinaire en Sciences Sociales (IRISSO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Agronomie, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), UR 1213 SUR LES HERBIVORES Unité de Recherches sur les Herbivores. Centre de recherche de Clermont-Ferrand-Theix, INRAE, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, 2. Zero hunger, [SDE]Environmental Sciences, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: La notion de Nexus est récemment apparue dans un certain nombre d’instances internationales dans le prolongement des publications du Millenium mettant en avant 17 objectifs pour un développement durable au niveau mondial. Utilisée à l’occasion, par exemple, des réflexions sur les relations entre énergie-eau-alimentation, ou entre climat-services écosystémiques-santé ), la notion de Nexus a été proposée pour tenir compte du fait que parmi les 17 objectifs mis en avant, certains sont étroitement liés, de façon positive ou négative, et doivent donc être associés dans la construction des priorités de recherche et la définition ou l’évaluation des politiques publiques.Les réflexions sur le Nexus Santé-Environnement-Agriculture-Alimentation s’inscrivent dans cette perspective en incitant à (i) tenir ensemble dans l’analyse ces différentes composantes de façon prendre en compte la complexité des interactions entre les dimensions économiques, sociales, environnementales et sanitaires des activités qui se déroulent au sein du système alimentaire, (ii) exploiter les synergies possibles entre objectifs ou domaines d’action généralement considérés séparément.Cette nécessité d’une « reconnexion » entre les enjeux de santé, alimentation, agriculture et environnement, étayée par les impacts environnementaux, sociaux, sanitaires des modèles agricoles et alimentaires en place a émergé au croisement de différents courants de la littérature.
Published: 2020
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24. Photo-processing of astro-PAHs

Author: Aude Simon, Alexandre Giuliani, Sarah Rodriguez Castillo, Laurent Nahon, Gabi Wenzel, D. Toublanc, Hassan Sabbah, Christine Joblin, Mingchao Ji, Giacomo Mulas, Anthony Bonnamy, Institut de recherche en astrophysique et planétologie (IRAP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Modélisation, Agrégats, Dynamique (LCPQ) (MAD), Laboratoire de Chimie et Physique Quantiques (LCPQ), Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), INAF - Osservatorio Astronomico di Cagliari (OAC), Istituto Nazionale di Astrofisica (INAF), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Project: 610256,EC:FP7:ERC,ERC-2013-SyG,NANOCOSMOS(2014), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ITA, FRA, Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: History, synchrotron radiation VUV, Photon, Astrochemistry, Hydrogen, chemistry.chemical_element, FOS: Physical sciences, 01 natural sciences, ionisation, Dissociation (chemistry), Education, Ion, chemistry.chemical_compound, Fragmentation (mass spectrometry), Ionization, Physics - Chemical Physics, 0103 physical sciences, 010306 general physics, Dicoronylene, 010303 astronomy & astrophysics, Physics, Chemical Physics (physics.chem-ph), astrochemistry, VUV processing, photo-dissociation, Astrophysics - Astrophysics of Galaxies, Computer Science Applications, [PHYS.ASTR.GA]Physics [physics]/Astrophysics [astro-ph]/Galactic Astrophysics [astro-ph.GA], chemistry, Chemical physics, Astrophysics of Galaxies (astro-ph.GA), Polycyclic aromatic hydrocarbon PAH, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph]
Abstract: Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are key species in astrophysical environments in which vacuum ultraviolet (VUV) photons are present, such as star-forming regions. The interaction with these VUV photons governs the physical and chemical evolution of PAHs. Models show that only large species can survive. However, the actual molecular properties of large PAHs are poorly characterized and the ones included in models are only an extrapolation of the properties of small and medium-sized species. We discuss here experiments performed on trapped ions including some at the SOLEIL VUV beam line DESIRS. We focus on the case of the large dicoronylene cation, C 48 H 20 + , and compare its behavior under VUV processing with that of smaller species. We suggest that C2 H2 is not a relevant channel in the fragmentation of large PAHs. Ionization is found to largely dominate fragmentation. In addition, we report evidence for a hydrogen dissociation channel through excited electronic states. Although this channel is minor, it is already effective below 13.6 eV and can significantly influence the stability of astro-PAHs. We emphasize that the competition between ionization and dissociation in large PAHs should be further evaluated for their use in astrophysical models.
Published: 2020

25. Quality traits prediction of the passion fruit pulp using NIR and MIR spectroscopy

Author: Eriel Forville de Andrade, Milene de Oliveira Bicudo, Gabrieli Oliveira-Folador, Catherine M.G.C. Renard, Sylvie Bureau, Fernanda de Castilhos, Graduate Program in Food Engineering, Universidade Federal do Parana (UFPR), Department of Food Engineering, King Mongkut’s University of Technology Thonburi [Bangkok], Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Department of Chemical Engineering, University of Patras [Patras], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), and Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: spectroscopy, modèle de prédiction, passiflora edulis, Sucrose, Quality parameters, spectre infrarouge, [SDV]Life Sciences [q-bio], Titratable acid, engineering.material, near-infrared, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, 0404 agricultural biotechnology, exploitation des données, Food science, Chemometrics, Spectroscopy, caractérisation biochimique, Mid-infrared, brésil, infrarouge moyen, Vitamin C, Chemistry, Pulp (paper), 010401 analytical chemistry, comparaison de méthodes, Fructose, 04 agricultural and veterinary sciences, Ascorbic acid, 040401 food science, 0104 chemical sciences, infrared spectrum, engineering, spectroscopie proche infrarouge, Passion fruit, Food Science
Abstract: Near (NIR) and Mid (MIR) infrared spectroscopy were investigated as rapid methods for evaluating quality traits of fresh passion fruit pulp. Models to predict soluble solids content (SSC), titratable acidity (TA), glucose (GLC), fructose (FRU), sucrose (SUC) and vitamin C (ascorbic acid) were developed using linear partial least square (PLS) regression analysis. The PLS models in MIR provided better prediction results than in NIR. Prediction models in MIR were better for SSC (R2v = 0.95), TA (R2v = 0.86), glucose (R2v = 0.93), fructose (R2v = 0.84) and sucrose (R2v = 0,74). However, due to its low level in pulp, ascorbic acid was not satisfactorily predicted either by NIR or MIR.
Published: 2018

26. Long-term neurologic and cardiac correction by intrathecal gene therapy in Pompe disease

Author: Dequéant B, Quentin Pascal, Carine Ciron, Marie-Anne Colle, Lagalice L, Pailloux J, Laurence Dubreil, Johan Deniaud, Babarit C, Huchet C, Cynthia Robveille, Caillaud C, Juliette Hordeaux, Mireille Ledevin, Marion Fusellier, Frédéric Jamme, Costiou P, Mallem Y, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiopathologie Animale et bioThérapie du muscle et du système nerveux (PAnTher), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), LUNAM Université [Nantes Angers Le Mans], Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Synchrotron SOLEIL, Laboratoire de Thérapie Génique Translationnelle des Maladies Génétiques (Inserm UMR 1089), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Region Pays de la Loire, National French Academy of Medicine and 'Investissement d'Avenir' - - 'NeurATRIS: A Translational Research Infrastructure for Biotherapies in Neurosciences' (MAC) [ANR-11-INBS-0011], French Government, and Colle, Marie-Anne
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Pathology, Neurology, Genetic enhancement, [SDV]Life Sciences [q-bio], Cardiomyopathy, lcsh:RC346-429, chemistry.chemical_compound, Random Allocation, 0302 clinical medicine, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Single-Blind Method, Injections, Spinal, Glycogen, Glycogen Storage Disease Type II, Hypertrophic cardiomyopathy, Brain, Pompe disease, Enzyme replacement therapy, Dependovirus, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, Spinal Cord, CNS, Cardiac function curve, medicine.medical_specialty, Central nervous system, Genetic Vectors, Intra-cerebrospinal fluid injection, Pathology and Forensic Medicine, 03 medical and health sciences, Cellular and Molecular Neuroscience, Gene therapy, medicine, Animals, Humans, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Muscle Strength, lcsh:Neurology. Diseases of the nervous system, business.industry, Research, alpha-Glucosidases, Genetic Therapy, Cardiomyopathy, Hypertrophic, medicine.disease, Disease Models, Animal, 030104 developmental biology, HEK293 Cells, chemistry, Neurology (clinical), business, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Pompe disease is a lysosomal storage disorder caused by acid-α-glucosidase (GAA) deficiency, leading to glycogen storage. The disease manifests as a fatal cardiomyopathy in infantile form. Enzyme replacement therapy (ERT) has recently prolonged the lifespan of these patients, revealing a new natural history. The neurologic phenotype and the persistence of selective muscular weakness in some patients could be attributed to the central nervous system (CNS) storage uncorrected by ERT. GAA-KO 6neo/6neo mice were treated with a single intrathecal administration of adeno-associated recombinant vector (AAV) mediated gene transfer of human GAA at 1 month and their neurologic, neuromuscular, and cardiac function was assessed for 1 year. We demonstrate a significant functional neurologic correction in treated animals from 4 months onward, a neuromuscular improvement from 9 months onward, and a correction of the hypertrophic cardiomyopathy at 12 months. The regions most affected by the disease i.e. the brainstem, spinal cord, and the left cardiac ventricular wall all show enzymatic, biochemical and histological correction. Muscle glycogen storage is not affected by the treatment, thus suggesting that the restoration of muscle functionality is directly related to the CNS correction. This unprecedented global and long-term CNS and cardiac cure offer new perspectives for the management of patients. Electronic supplementary material The online version of this article (doi:10.1186/s40478-017-0464-2) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Published: 2017

27. Synchrotron UV photoactivation of trapped sodiated ions produced from poly(ethylene glycol) by electrospray ionization

Author: Alexandre Giuliani, William Buchmann, Inès Aloui, Véronique Legros, Laboratoire Analyse, Modélisation et Matériaux pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE - UMR 8587), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), DISCO beamline, Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ED 2MIB, and ANR-08-BLAN-0065,SR M52,Synchrotron Radiaton for Tandem Mass Spectrometry(2008)
Subjects: Collision-induced Dissociation, Electrospray ionization, Photochemistry, medicine.disease_cause, Tandem mass spectrometry, 01 natural sciences, Analytical Chemistry, Ion, Tandem Mass-spectrometry, chemistry.chemical_compound, Fragmentation (mass spectrometry), Fragmentation, Information, medicine, [CHIM]Chemical Sciences, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Irradiation, Quadrupole ion trap, Polymer, Spectroscopy, Energy-storage, 010401 analytical chemistry, Organic Chemistry, 0104 chemical sciences, chemistry, Mobility Spectrometry, Capture-dissociation, Structural-characterization, Polyethers, Ethylene glycol, Ultraviolet
Abstract: Rationale By taking advantage of the gas-phase decompositions of polymer ions, tandem mass spectrometry of polymers allows us to obtain more accurate structural information than from a simple mass measurement. Applied to a model polymer, the goal of this work was to evaluate the performances of an activation technique based on ultraviolet (UV) irradiation, as an alternative to conventional collisional activation. Methods Sodiated poly(ethylene glycol) produced by electrospray ionization was isolated in a linear ion trap, then submitted to synchrotron UV irradiation over a range of wavelengths (52 to 248 nm). Fragmentation pathways resulting from UV photoactivation were investigated. The proposed mechanisms take into account: (i) the comparison with collision-induced dissociation (CID) product ions, (ii) the effect of wavelength-tunable UV activation, and (iii) deuterium-labeling and various other complementary experiments. For the highest molecular weight compounds, ion mobility spectrometry was used before UV photoactivation. Results Synchrotron UV irradiation can induce dissociation of poly(ethylene glycol) sodiated ions without the requirement of the presence of a specific chromophore, if the photon energy is above 10 eV. UV photoactivation of poly(ethylene glycol) ions can yield fragmentations that differ from those in classical low-energy CID, especially from higher masses (>4000 g mol-1 ). A successful coupling of UV photoactivation with ion mobility pre-filtering was presented. Conclusions UV activation combined or not with pre-filtering ion mobility is a promising alternative approach for the structural characterization of polymers. UV synchrotron radiation with a tunable wavelength was a great opportunity to study the effect of the photon energy, and to probe the mechanisms of ion decomposition from poly(ethylene glycol).
Published: 2019

28. Role of protein conformation and weak interactions on γ-gliadin liquid-liquid phase separation

Author: Alexandre Giuliani, Véronique Solé-Jamault, Denis Renard, Adeline Boire, Line Sahli, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), DISCO, Partenaires INRAE, regional programme 'Food for Tomorrow/Cap Aliment, Research, Education and Innovation in Pays de la Loire' - French Region Pays de la Loire, European Regional Development Fund (FEDER)European Union (EU), and Sahli, Line
Subjects: Models, Molecular, 0301 basic medicine, Phase transition, Protein Conformation, Liquid-Liquid Extraction, Static Electricity, lcsh:Medicine, Gliadin, Phase Transition, Article, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Protein structure, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Static electricity, Storage protein, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, lcsh:Science, Triticum, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, Intrinsically disordered proteins, Multidisciplinary, Aqueous solution, Ethanol, Chemistry, Hydrogen bond, lcsh:R, Proteins, nutritional and metabolic diseases, food and beverages, digestive system diseases, 030104 developmental biology, Ionic strength, Seeds, Biophysics, lcsh:Q, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Wheat storage proteins, gliadins, were found to form in vitro condensates in 55% ethanol/water mixture by decreasing temperature. The possible role of this liquid-liquid phase separation (LLPS) process on the in vivo gliadins storage is elusive and remains to be explored. Here we use γ-gliadin as a model of wheat proteins to probe gliadins behavior in conditions near physiological conditions. Bioinformatic analyses suggest that γ-gliadin is a hybrid protein with N-terminal domain predicted to be disordered and C-terminal domain predicted to be ordered. Spectroscopic data highlight the disordered nature of γ-gliadin. We developed an in vitro approach consisting to first solubilize γ-gliadin in 55% ethanol (v/v) and to progressively decrease ethanol ratio in favor of increased aqueous solution. Our results show the ability of γ-gliadin to self-assemble into dynamic droplets through LLPS, with saturation concentrations ranging from 25.9 µM ± 0.85 µM (35% ethanol (v/v)) to 3.8 µM ± 0.1 µM (0% ethanol (v/v)). We demonstrate the importance of the predicted ordered C-terminal domain of γ-gliadin in the LLPS by highlighting the protein condensates transition from a liquid to a solid state under reducing conditions. We demonstrate by increasing ionic strength the role displayed by electrostatic interactions in the phase separation. We also show the importance of hydrogen bonds in this process. Finally, we discuss the importance of gliadins condensates in their accumulation and storage in the wheat seed.
Published: 2019

29. Interactions of arabinan-rich pectic polysaccharides with polyphenols

Author: Manuel A. Coimbra, Catherine M.G.C. Renard, Carine Le Bourvellec, Pedro A.R. Fernandes, Dulcineia F. Wessel, Susana M. Cardoso, Universidade de Aveiro, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Polytechnic Institute of Viseu, and Centro de Investigação e de Tecnologias Agro-Ambientais e Biológicas
Subjects: food.ingredient, Polymers and Plastics, Pectin, Branching, [SDV]Life Sciences [q-bio], 02 engineering and technology, Degree of polymerization, 010402 general chemistry, Branching (polymer chemistry), Polysaccharide, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, food, Chlorogenic acid, Materials Chemistry, Food science, chemistry.chemical_classification, Hydroxycinnamic acid, Organic Chemistry, food and beverages, 021001 nanoscience & nanotechnology, Dihydrochalcone, 0104 chemical sciences, chemistry, Proanthocyanidin, Polyphenol, 0210 nano-technology, Procyanidin
Abstract: International audience; Given the high prevalence of arabinan side chains in pectic polysaccharides, this work aims to unveil the impact of their structural diversity on pectic polysaccharides-polyphenol interactions. To assess the effect of arabinan branching degree, sugar beet arabinans (branched and debranched) were used and compared to the well-known structure of apple arabinan and other pectic polysaccharides. Furthermore, arabinans contribution to pectic polysaccharides/polyphenol interactions was assessed. The interactions were evaluated using chlorogenic acid, phloridzin and procyanidins (degree of polymerization of 9). Linear arabinans had 8-fold and 2-fold higher retention for chlorogenic acid and phloridzin, respectively, than branched arabinans. This trend was also observed for the interaction of arabinans with procyanidins. However, arabinans with covalently linked polyphenols showed lower interactions. The interactions involved between arabinans and polyphenols explained 1–28 % of the interactions of pectic polysaccharides, allowing us to conclude that the whole polysaccharide structure is more relevant for polyphenol interactions than each part.
Published: 2019

30. Time resolved transient circular dichroism spectroscopy using synchrotron natural polarization

Author: Frank Wien, D. Dennetiere, Frédéric Jamme, Bruno Lagarde, Claude Menneglier, Bastien Nay, François Auvray, Alexandre Giuliani, Séverine Zirah, Matthieu Réfrégiers, Jonathan D. Hirst, François Polack, Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Nottingham, UK (UON), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École polytechnique (X), École Nationale Supérieure de Techniques Avancées (ENSTA Paris), Institut Polytechnique de Paris (IP Paris), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes (MCAM), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), School of Chemistry, The University of Nottingham, University Park, Nottingham, NG7 2RD, UK., School of Chemistry, The University of Nottingham, University Park, Nottingham, NG7 2RD, UK. Code (UMR, EA, ...), Laboratoire de synthèse organique (DCSO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École polytechnique (X), Laboratoire de physiologie cérébrale (LPC - UMR 8118), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Circular dichroism, Materials science, Infrared, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Synchrotron radiation, 02 engineering and technology, medicine.disease_cause, Experimental Methodologies, 01 natural sciences, law.invention, ARTICLES, Optics, law, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, 0103 physical sciences, synchrotron, medicine, lcsh:QD901-999, structure, 010306 general physics, Spectroscopy, Instrumentation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Radiation, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], business.industry, Circular Dichroism, 021001 nanoscience & nanotechnology, Condensed Matter Physics, Polarization (waves), Synchrotron, [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], time resolved spectroscopy, lcsh:Crystallography, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], Time-resolved spectroscopy, 0210 nano-technology, business, protein, Ultraviolet
Abstract: International audience; Ultraviolet (UV) synchrotron radiation circular dichroism (SRCD) spectroscopy has made an important contribution to the determination and understanding of the structure of bio-molecules. In this paper, we report an innovative approach that we term time-resolved SRCD (tr-SRCD), which overcomes the limitations of current broadband UV SRCD setups. This technique allows accessing ultrafast time scales (down to nanoseconds), previously measurable only by other methods, such as infrared (IR), nuclear magnetic resonance (NMR), fluorescence and absorbance spectroscopies and small angle X-ray scattering (SAXS). The tr-SRCD setup takes advantage of the natural polarisation of the synchrotron radiation emitted by a bending magnet to record broadband UV CD faster than any current SRCD setup, improving the acquisition speed from 10 mHz to 130 Hz and the accessible temporal resolution by several orders of magnitude. We illustrate the new approach by following the isomers concentration changes of an azopeptide after a photoisomerisation. This breakthrough in SRCD spectroscopy opens up a wide range of potential applications to the detailed characterisation of biological processes, such as protein folding, protein-ligand binding.
Published: 2019

31. In-situ NMR highlights structural change during apple heating

Author: Clerjon, S., Leca, Alexandre, Renard, Catherine, Bonny, J.-M., Traore, Amidou, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), TRANSFORM Division (INRAE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Leca, Alexandre
Subjects: pomme, changement structurel, [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], résonance magnétique nucléaire, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, chauffage, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2019

32. Experimental and numerical studies of semi-confined heap structure after variable pouring conditions

Author: Lehuen, Julien, Delenne, Jean-Yves, Sadoudi, Abdelkrim, Cassan, Denis, Planchot, Veronique, Ruiz, Thierry, Duri, Agnès, Ingénierie des Agro-polymères et Technologies Émergentes (UMR IATE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualisud - Pôle de La Réunion (Qualisud Réunion), Démarche intégrée pour l'obtention d'aliments de qualité (UMR Qualisud), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Ensiled granular medium, DEM Method, forces network, [SPI.FLUID]Engineering Sciences [physics]/Reactive fluid environment, coarse-graining, Janssen effect, homemade code, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [PHYS.MECA]Physics [physics]/Mechanics [physics], [SPI.MECA]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph], Rheophysics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SPI.MAT]Engineering Sciences [physics]/Materials
Abstract: International audience; The classic experience of filling a container with a granular medium poured froma source point reveals the presence of the intergranular forces network by themanifestation of the Janssen effect (Janssen, 1895). Indeed, the measurement ofthe stress applied at the base of the container according to the bed particleheight, shows that the static mechanical state of the ensiled granular medium isnot comparable to a hydrostatic one which is characteristic of a fluid. The lateraldeflection of gravity forces to the walls via the network of intergranular contacts,allows to explain the lowering of vertical stress (σzz) in relation to hydrostaticpressure. Moreover, the sliding threshold condition must be established at thewalls to explain the "saturant" shape of the σzz profile (Ovarlez and Clément,2005). If mechanical properties are involved to explain this apparentphenomenon understanding as a static equilibrium, the analyze of the free surfaceduring pouring correlated to the local mechanical state allow to indicate thatkinetic energy had an influence on the Janssen effect (Mandato et al. 2012; Duri etal. 2018). In order to revisit the Janssen effect, experiments and Discrete ElementMethod (DEM) simulations are compared to investigate the structure of an ensiledgranular medium poured in a cell by a single point at different initial drop heightsand flow rate (parameters which allow to control kinetic energy).Experimental device. The granular medium consists of a population of glass beadsof 1 to 2 mm diameter with a small span value (50/50 in volume). The experimentalset-up, developed in Mandato et al. (2012), consists of an open glass cell container(51 x 100 x 160 mm) made of transparent glass walls. A flat and rectangular steelprobe is especially designed to fit into the glass container. A small probe allowslocal measurements of the vertical stress in the powder bed. A large probe is usedto simulate the bottom of the cell and allows a global measurement of the verticalstress, as in Janssenʼs experiment (Janssen, 1895). Whatever its width, the probeis screwed on a rod that is linked to a load cell of a texture analyser (TA.XT2, TableMicro System), which is used as a force sensor. The filling is provided by a funneland the flow rate is modulated by the output diameter. After pouring, the slopeangle and the arrow of the free surface are measured by image analysis.Numerical simulation. We develop our own homemade code in c++using the DEM.Then we decide to develop also a code using the coarse-graining method(Weinhart and Luding, 2016) to highlight on the different fields. This last methodwhich doesnʼt give access to the compactness near the wall, is replaced by a newmethod using two grids in order to increase the accurate. With these three codes we can now explore all the contacts between the particles by the calculus of (i)normal and tangential forces, (ii) moment, (iii) mobility, of each particle.Results. The variation of the initial drop height and the flow rate impacts the slopeof the free surface: crater form in high kinetic energy conditions, heap form inlowest conditions and intermediary slopes between these conditions (from plate to“camel-like” form). The measured and calculated values of the arrow and of theangle of repose are in very good agreement in each case. Experiments andnumerical simulation highlight the same layout of the vertical stress field (Fig. 1). Inthe upper part of the particle bed, there is a layer in which the stress is generallyassimilated to a “quasi-hydrostatic” state. It can be seen that under this first layer,Janssenʼs hypothesis that stresses are lateral uniformity is not valid: there is astrong local heterogeneity of the stress within the granular medium. It can be seenthat the redirection coefficient defined by Janssen (Janssen, 1985) ratio betweenlateral stress and vertical stress, is not constant. The study of thickness and meanstress in each different zone of the bed versus kinetic energy during the fillingstage had been realized. The static mechanical state of the particle bed is also dueto this dynamical parameter and this point is usually not taking into account.
Published: 2019

33. How to design healthy and sustainable Food Systems ?

Author: Axelos, Monique, DE VRIES, Hugo, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ingénierie des Agro-polymères et Technologies Émergentes (UMR IATE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2019

34. Modification of cell walls of apple, red beet and kiwifruit by heating in acid conditions: common and specific responses

Author: Xuwei Liu, Catherine Renard, Agnes Rolland-Sabate, Sylvie Bureau, Carine Le Bourvellec, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and TOULOUMET, Line
Subjects: [SDV.BBM.BS] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], spectre infrarouge, [SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, Side chain, food and beverages, crab apples, Processing, Methylation, Pectin, FT-IR, infrared spectrum, betterave, pomme, traitement thermochimique, thermochemical treatment, modification structurale, beetroot, Polysaccharide, kiwi, paroi cellulaire végétale
Abstract: Modification of cell walls of apple, red beet and kiwifruit by heating in acid conditions: common and specific responses. 15th Cell wall meeting
Published: 2019

35. Non linear microscopy and Synchrotron X-ray fluorescence to investigate BiFeO3 harmonic nanoparticle-based labeling of stem cells

Author: Dubreil, Laurence, Fleurisson, Romain, Charrier, Marine, Bouche, Axelle, Leroux, Isabelle, Gerber, Sandrine, Bonacina, Luigi, Somogyl, Andrea, Tucoulou, Rémi, Rivard, Camille, Rouger, Karl, Développement et Pathologie du Tissu Musculaire (DPTM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes, Group for functionalized Biomaterials, Department of applied Physics, Synchrotron SOLEIL, European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiopathologie Animale et bioThérapie du muscle et du système nerveux (PAnTher), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Non linear microscopy and Synchrotron X-ray fluorescence to investigate BiFeO3 harmonic nanoparticle-based labeling of stem cells . 16ème colloque de la SFµ
Published: 2019

36. Apports de la microtomographie à rayons X et de l’analyse d’images pour l’étude de la croissance et la morphologie du grain de blé en développement

Author: LE, Duong Quoc Thang, Alvarado, Camille, Badel, Eric, Girousse, Christine, Guillon, Fabienne, King, Andrew, Legland, David, RIVARD, Camille, CHATEIGNER-BOUTIN, Anne Laure, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l’Arbre en environnement Fluctuant - Clermont Auvergne (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Synchrotron SOLEIL, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), ProdInra, Archive Ouverte, Laboratoire de Physique et Physiologie Intégratives de l’Arbre en environnement Fluctuant (PIAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), and Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: x ray, analyse d'images, rayon x, morphologie du grain de blé, growth, croissance, morphologie, image analysis, rayons X, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, microtomographie, grain de blé, croissance du grain de blé, development, développement
Abstract: Nous avons utilisé la microtomographie à rayons X et l'analyse d'images pour étudier le développement du grain de blé. La microtomographie à rayons X est un outil d'imagerie non invasif qui produit des images 3D d'un grain individuel, permettant d'appréhender aussi bien la morphologie externe du grain que ses structures internes. Il permet un voyage non destructif à l'intérieur du grain de blé en développement et fournit de nouvelles informations qui ne sont pas disponibles avec l'approche classique de la microscopie 2D utilisée habituellement pour étudier l'anatomie du blé. Des images de grain de blé en développement ont été acquises grâce à un microtomographe de laboratoire (Phoenix Nanotom 180NF) ainsi que sur la ligne PSICHÉ du synchrotron SOLEIL. Nous avons ensuite développé des méthodes d'analyse d'images pour l'identification des tissus internes et externes et l'extraction de caractéristiques morphométriques. Les valeurs obtenues pour le volume et les dimensions du grain sont proches de celles obtenues par les méthodes classiques, ce qui permet de valider les techniques d’acquisition et d’analyse des images. De nouvelles données concernant l'évolution du volume des tissus internes au cours du développement du grain ont été obtenues. Notre étude a mis en évidence de grandes régions vides dans les tissus périphériques du grain. Leur évolution reflète la lyse du péricarpe lors de la croissance de la graine. D’autre part, nous avons développé une méthode de quantification de la forme du sillon le long du grain ; une caractéristique importante de la morphologie du grain qui influence la contamination par certains pathogènes du grain et le rendement du broyage. Nous développons des méthodes pour analyser quantitativement la forme du grain et son évolution au cours du développement. Ces travaux montrent que la microtomographie à rayons X et les méthodes de traitement des images 3D sont des outils puissants pour extraire les paramètres morphométriques d’échantillons végétaux tels que le grain de blé en développement. Ces techniques pourraient être utilisées pour comparer des génotypes et évaluer les effets des stress biotiques, du changement climatique et des nouvelles pratiques culturales.
Published: 2019

37. Bifeo3 Harmonic Nanoparticle (Bfo-Hnps) Use for the Stem Cell Tracking: Labeling Investigation by Non Linear Microscopy and X-Ray Fluorescence

Author: Dubreil, Laurence, Fleurisson, Romain, CHARRIER, MARINE, Bouche, Axelle, Leroux, Isabelle, Gerber, Sandrine, Bonacina, Luigi, Somogyl, Andrea, Tucoulou, Rémi, RIVARD, Camille, Rouger, Karl, Développement et Pathologie du Tissu Musculaire (DPTM), Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Group for Functionalized Biomaterials, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Department of Applied Physics [Genève], Université de Genève (UNIGE), Synchrotron SOLEIL, European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiopathologie Animale et bioThérapie du muscle et du système nerveux (PAnTher), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes
Subjects: microscopie, nanoparticle, [SDV]Life Sciences [q-bio], microscopy, nanoparticule
Abstract: Duchenne Muscular Dystrophy is the most common form of degenerative muscle disease; currently, there is no effective treatment. In 2011, our group showed that an adult stem cell population (MuStem) isolated from healthy dog skeletal muscle induces long-term muscle repair and striking clinical efficacy after its systemic delivery in clinically relevant dystrophic dog. During last years, our group isolated the human counterparts (hMuStem) [1]. To achieve the full therapeutic potential of the hMuStem cells, their homing process, survival and engraftment post-transplantation must be clearly understood. BiFeO3 harmonic nanoparticles (BFO-HNPs) were used as probes for the hMuStem cell tracking [2]. We demonstrate the possibility of identifying
Published: 2019

38. Presentation of the SCAR SWG Food Systems

Author: DE VRIES, Hugo, Axelos, Monique, Terzieva, Anastasiya, Ingénierie des Agro-polymères et Technologies Émergentes (UMR IATE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Collège de Direction, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Collège de Direction (CODIR), and Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: système alimentaire, digestive, oral, and skin physiology, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, food system
Abstract: Presentation of the SCAR SWG Food Systems. FOODforce meetings
Published: 2019

39. Photoprocessing of large PAH cations

Author: Hassan Sabbah, Alexandre Giuliani, Sarah Rodriguez Castillo, Christine Joblin, Mingchao Ji, Laurent Nahon, Anthony Bonnamy, Gabi Wenzel, Giacomo Mulas, Institut de recherche en astrophysique et planétologie (IRAP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INAF - Osservatorio Astronomico di Cagliari (OAC), Istituto Nazionale di Astrofisica (INAF), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Synchrotron SOLEIL (SSOLEIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ITA, FRA, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Astrochemistry, Materials science, Radiative cooling, Analytical chemistry, Astrophysics::Cosmology and Extragalactic Astrophysics, 010402 general chemistry, 7. Clean energy, 01 natural sciences, ultraviolet: ISM, Dissociation (chemistry), Article, law.invention, methods: laboratory, law, Ionization, 0103 physical sciences, Physics::Atomic and Molecular Clusters, Irradiation, Physics::Chemical Physics, 010303 astronomy & astrophysics, Astrophysics::Galaxy Astrophysics, Astronomy and Astrophysics, Synchrotron, ISM: molecules, 0104 chemical sciences, Stars, Beamline, 13. Climate action, Space and Planetary Science, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], [PHYS.ASTR]Physics [physics]/Astrophysics [astro-ph]
Abstract: In cosmic environments, polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) strongly interact with vacuum ultraviolet (VUV) photons emitted by young stars. Trapped PAH cations ranging in size from 30 to 48 carbon atoms were irradiated by tunable synchrotron light (DESIRS beamline at SOLEIL). Their ionization and dissociation cross sections were determined and compared with TD-DFT computed photoabsorption cross sections. Evidence for radiative cooling is reported.
Published: 2019

40. Contribution of infrared spectroscopy to evaluate the variability of quality traits of the fresh apples and processed purées

Author: Weijie Lan, Benoit Jaillais, Catherine Renard, Alexandre Leca, Sylvie Bureau, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Statistique, Sensométrie et Chimiométrie (StatSC), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), TRANSFORM Division (INRAE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agropolis fondation, CSC, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: pomme golden, stockage post récolte, procédé de transformation, stade de maturation, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, variation qualitative, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, spectroscopie infra rouge, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, purée
Abstract: International audience
Published: 2019

41. Procyanidin—Cell Wall Interactions within Apple Matrices Decrease the Metabolization of Procyanidins by the Human Gut Microbiota and the Anti-Inflammatory Effect of the Resulting Microbial Metabolome In Vitro

Author: Claire Dufour, Pascale Lepercq, Pauline Auffret, Pascale Mosoni, Catherine M.G.C. Renard, Philippe Ruiz, Sophie Comtet-Marre, Priscilla Bagano Vilas Boas, Jean-Marc Chatel, Carine Le Bourvellec, Romain Bott, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Microbiologie Environnement Digestif Santé - Clermont Auvergne (MEDIS), INRA Clermont-Ferrand-Theix-Université Clermont Auvergne (UCA), UMR 241 EIO, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbiologie Environnement Digestif Santé (MEDIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Université Clermont Auvergne (UCA)-INRA Clermont-Ferrand-Theix, INRA Clermont-Ferrand-Theix-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)
Subjects: 0301 basic medicine, procédé agroalimentaire, [SDV]Life Sciences [q-bio], Anti-Inflammatory Agents, in vitro batch fermentation, polyphenols, dietary fiber, 16S metabarcoding, metabotype, Gut flora, Cell Wall, fermentation in vitro, chemistry.chemical_classification, Nutrition and Dietetics, biology, Chemistry, solvent free microwave extraction (sfem), 04 agricultural and veterinary sciences, 040401 food science, Proanthocyanidin, Biochemistry, extraction d'adn, Malus, lcsh:Nutrition. Foods and food supply, paroi cellulaire végétale, composition phénolique, pcr quantitative, lcsh:TX341-641, Polysaccharide, Article, Cell wall, 03 medical and health sciences, polyphénol, 0404 agricultural biotechnology, Metabolome, Carbohydrate fermentation, Humans, procyanidine, Proanthocyanidins, 030109 nutrition & dietetics, Bacteria, purée de fruit, biology.organism_classification, Gastrointestinal Microbiome, Polyphenol, Fruit, Fermentation, extraction, métabolite microbien, malus domestica borkh, Food Science
Abstract: B-type oligomeric procyanidins in apples constitute an important source of polyphenols in the human diet. Their role in health is not known, although it is suggested that they generate beneficial bioactive compounds upon metabolization by the gut microbiota. During apple processing, procyanidins interact with cell-wall polysaccharides and form stable complexes. These interactions need to be taken into consideration in order to better assess the biological effects of fruit constituents. Our objectives were to evaluate the impact of these interactions on the microbial metabolization of cell walls and procyanidins, and to investigate the potential anti-inflammatory activity of the resulting metabolome, in addition to analyzing the taxonomical changes which the microbiota undergo. In vitro fermentation of three model apple matrices with microbiota from 4 healthy donors showed that the binding of procyanidins to cell-wall polysaccharides, whether covalently or non-covalently, substantially reduced procyanidin degradation. Although cell wall-unbound procyanidins negatively affected carbohydrate fermentation, they generated more hydroxyphenylvaleric acid than bound procyanidins, and increased the abundance of Adlercreutzia and Gordonibacter genera. The best results in terms of production of anti-inflammatory bioactive metabolites were observed from the apple matrix with no bonds between procyanidins and cell wall polysaccharides, although the matrix with non-covalent bonds was not far behind.
Published: 2019

42. Alimentation Durable

Author: Axelos, Monique, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration
Subjects: [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2019

43. Vacuum-UV induced DNA strand breaks - influence of the radiosensitizers 5-bromouracil and 8-bromoadenine

Author: Alexandre Giuliani, Ilko Bald, Aleksandar R. Milosavljević, Robin Schürmann, Stefanie Vogel, Christian Heck, Kenny Ebel, Institute of Chemistry (Physical Chemistry), University of Potsdam, Federal Institute for Materials Research and Testing - Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM), Humboldt-Universität zu Berlin, Synchrotron SOLEIL, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), German Research Foundation (DFG) [281049597], Federal Institute for Materials Research and Testing (BAM), DFG [GSC 1013], and synchrotron facility SOLEIL [20151010, 99170068]
Subjects: 5-Bromouracil, Bromouracil, Radiation-Sensitizing Agents, Vacuum, DNA damage, Guanine, Ultraviolet Rays, General Physics and Astronomy, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, Adenine nucleotide, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Physical and Theoretical Chemistry, Oligonucleotide, Adenine, 021001 nanoscience & nanotechnology, 0104 chemical sciences, Thymine, chemistry, Biophysics, 0210 nano-technology, Cytosine, DNA, DNA Damage
Abstract: International audience; Radiation therapy is a basic part of cancer treatment. To increase the DNA damage in carcinogenic cells and preserve healthy tissue at the same time, radiosensitizing molecules such as halogenated nucleobase analogs can be incorporated into the DNA during the cell reproduction cycle. In the present study 8.44 eV photon irradiation induced single strand breaks (SSB) in DNA sequences modified with the radiosensitizer 5-bromouracil (U-5Br) and 8-bromoadenine ((8Br)A) are investigated. U-5Br was incorporated in the 13mer oligonucleotide flanked by different nucleobases. It was demonstrated that the highest SSB cross sections were reached, when cytosine and thymine were adjacent to U-5Br, whereas guanine as a neighboring nucleobase decreases the activity of U-5Br indicating that competing reaction mechanisms are active. This was further investigated with respect to the distance of guanine to U-5Br separated by an increasing number of adenine nucleotides. It was observed that the SSB cross sections were decreasing with an increasing number of adenine spacers between guanine and U-5Br until the SSB cross sections almost reached the level of a non-modified DNA sequence, which demonstrates the high sequence dependence of the sensitizing effect of U-5Br. (8Br)A was incorporated in a 13mer oligonucleotide as well and the strand breaks were quantified upon 8.44 eV photon irradiation in direct comparison to a non-modified DNA sequence of the same composition. No clear enhancement of the SSB yield of the modified in comparison to the non-modified DNA sequence could be observed. Additionally, secondary electrons with a maximum energy of 3.6 eV were generated when using Si as a substrate giving rise to further DNA damage. A clear enhancement in the SSB yield can be ascertained, but to the same degree for both the non-modified DNA sequence and the DNA sequence modified with (8Br)A.
Published: 2019

44. Réflexion prospective interdisciplinaire Bioéconomie. Rapport de synthèse

Author: Alban Thomas, Monique Axelos, Hugo de Vries, Laure Bamière, Julie Wohlfahrt, Francis Colin, Bernard Kurek, Vincent Requillart, Jean-Yves Dourmad, Jean-Philippe Steyer, Michel Duru, Sylvie Gillot, Sylvie Recous, Donohue, Michael O., Jacques MERY, Sophie Thoyer, Toulouse School of Economics (TSE-R), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ingénierie des Agro-polymères et Technologies Émergentes (UMR IATE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Economie Publique (ECO-PUB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Agro-Systèmes Territoires Ressources Mirecourt (ASTER Mirecourt), SILVA (SILVA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Université de Lorraine (UL), Fractionnement des AgroRessources et Environnement (FARE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Collège de Direction (CODIR), Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Toulouse School of Economics (TSE), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL)-AgroParisTech, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration
Subjects: [SHS.ECO] Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, biotechnologie, produit biosourcé, [SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, gestion de la biomasse
Abstract: Réflexion prospective interdisciplinaire Bioéconomie. Rapport de synthèse
Published: 2019

45. Interactions Between Dietary Antioxidants and Plant Cell Walls

Author: Renard, Catherine, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: pectin, 0303 health sciences, lipide antioxydant, [SDV]Life Sciences [q-bio], diffusion, food and beverages, compartimentation cellulaire, destructuration, carotenoid, antioxydant alimentaire, 03 medical and health sciences, polyphenol, 0302 clinical medicine, antioxydant, polysaccharide, 030221 ophthalmology & optometry, cell wall, ascorbic acid, food process, texture, bioencapsulation, bioaccessibilité, paroi cellulaire végétale, 030304 developmental biology, pectine
Abstract: Dietary antioxidants are a chemically diverse group of compounds, however most of them are of plant origin, with major classes being polyphenols, vitamins notable vitamin C (ascorbic acid) or E (tocopherols) and carotenoids. Other molecules may carry an antioxidant effect (e.g. amino-acids, sterols, many secondary metabolites) but are not used as such in foods. Most antioxidants are naturally present in tissues where plant cell walls play an important role in structure and texture, but also lead to encapsulation and compartimentation. Interactions withplant cell walls therefore occur in extraction processes, during food processing operations that lead to tissue destructuration, or during digestion, where they may limit bioaccessibility. Five mechanisms can be identified in interactions between polyphenols and antioxidants: protection of plant cells, limit to diffusion (of soluble molecules or enzymes), bio-encapsulation, affinity for specific molecules, and chemical reactions. Bio-encapsulation of lipophilic antioxidants, and specific interactions between polyphenols, specially tannins, and polysaccharides (mechanisms detailed in chapter “Interactions between polyphenols and macromolecules: effect of tannin structure”) will be descried in more details. Among the cell wall components, pectin is particularly relevant, due to its sensibility during processing and its affinity for some antioxidants.
Published: 2019

46. Traditional green leafy vegetables as underutilised sources of micronutrients in a rural farming community in south-west Nigeria I: estimation of vitamin C, carotenoids and mineral contents

Author: Faustina Dufie Wireko-Manu, Catherine M. C. G. Renard, Shirley Isibhakhomen Ejoh, David Page, Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Ibadan, Kwame Nkrumah University of Science and Technology [GHANA] (KNUST), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR-10-LABX-0001,AGRO,Agricultural Sciences for sustainable Development(2010), and Ejoh, Shirley Isibhakhomen
Subjects: Lutein, Ascorbic acid, indigenous vegetables, iron, lutein, provitamin A, 030309 nutrition & dietetics, Iron, [SDV]Life Sciences [q-bio], communauté rurale, Nigeria, Medicine (miscellaneous), Indigenous vegetables, Toxicology, carotenoide, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, legume frais, 0404 agricultural biotechnology, vitamine c, Medicine, Provitamin A, legume transformé, légume feuille, Carotenoid, agriculture, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Nutrition and Dietetics, Vitamin C, business.industry, Ascorbic acid, 04 agricultural and veterinary sciences, Micronutrient, teneur en elements mineraux, 040401 food science, mode de cuisson, chemistry, Provitamin a, Agriculture, Leafy vegetables, business
Abstract: International audience; Objective: To determine the micronutrient composition of fresh and boiled traditional green leafy vegetables (TGLVs). Design: Sixteen TGLVs categorised into cultivated and uncultivated vegetables were analysed for vitamin C (ascorbic acid [AA] and dehydroascorbate [DHAA]), β-carotene, lutein and minerals. Results: Basella alba had the highest AA (72 mg/100 g) content; Vernonia amygdalina (unwashed), had the highest β-carotene and lutein concentrations (14.1 and 29.0 mg/100 g, respectively); Amaranthus hybridus had the highest AA (43 mg/100 g) and β-carotene (9.3 mg/100 g) content, for cultivated sp. Celosia argentea had the highest Fe content; Zn content of all the vegetables was low, 0.4–2.6 mg/100 g. Cooking resulted in significant losses in AA content in all the samples, 19% in B. alba to 100% in Crassocephalum crepidioides. Carotenoid losses were observed in 10 samples and six samples had increased values of β-carotene (12% to 183%) and lutein (64% to double). Conclusion: Traditional green leafy vegetables studied were found to be rich in the micronutrients of interest, especially in carotenoids. Boiling of leafy vegetables, as traditionally done, led to considerable losses of the micronutrients. The micronutrient content of uncultivated leafy vegetables compared well with commonly cultivated species.
Published: 2019

47. SCAR SWG Food Systems ‘Concept Position Paper’

Author: DE VRIES, Hugo, Axelos, Monique, Ingénierie des Agro-polymères et Technologies Émergentes (UMR IATE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: système alimentaire, mental disorders, digestive, oral, and skin physiology, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, food system
Abstract: SCAR SWG Food Systems ‘Concept Position Paper’. SCAR FOOD SYSTEMS SWG meeting
Published: 2019

48. La santé, moteur des transitions agricole, alimentaire et environnementale

Author: Axelos, Monique, Soler, Louis Georges, Dallongeville, A., Thomas, Alban, Akermann, Grégori, B., Allès, Antignac, Jean-Philippe, Benoit, Pascal, Le Bizec, Bruno, Bertin, N., Causse, M., Chakir, Raja, Chiffoleau, Yuna, Cravedi, Jean Pierre, Darmon, N., Denaix, Laurence, Doré, Antoine, Dubuisson-Quellier, Sophie, Duru, Michel, Etilé, Fabrice, Fortané, Nicolas, Garric, J., Gésan-Guiziou, Geneviève, Hannachi, Mourad, Jeuffroy, Marie-Helene, Lamine, Claire, Lescourret, Françoise, Libois, François, Marette, Stephan, Martin-Laurent, Fabrice, Mougin, Christian, Oswald, Isabelle P., Peyraud, J. L., Plantard, Olivier, Prache, Sophie, Rault, A., Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Alimentation et sciences sociales (ALISS), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Economie des Ressources Naturelles (LERNA), Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation (UMR Innovation), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Economie Publique (ECO-PUB), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions Sol Plante Atmosphère (UMR ISPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre de sociologie des organisations (CSO), Sciences Po (Sciences Po)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Paris School of Economics (PSE), École des Ponts ParisTech (ENPC)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche Interdisciplinaire en Sciences Sociales (IRISSO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-AGROCAMPUS OUEST, Agronomie, Unité de recherche d'Écodéveloppement (ECODEVELOPPEMENT), Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, INRAE, Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Centre de sociologie des organisations (Sciences Po, CNRS) (CSO), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-École des Ponts ParisTech (ENPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, [SDE]Environmental Sciences, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: La notion de Nexus est récemment apparue dans un certain nombre d’instances internationales dans le prolongement des publications du Millenium mettant en avant 17 objectifs pour un développement durable au niveau mondial. Utilisée à l’occasion, par exemple, des réflexions sur les relations entre énergie-eau-alimentation, ou entre climat-services écosystémiques-santé ), la notion de Nexus a été proposée pour tenir compte du fait que parmi les 17 objectifs mis en avant, certains sont étroitement liés, de façon positive ou négative, et doivent donc être associés dans la construction des priorités de recherche et la définition ou l’évaluation des politiques publiques.Les réflexions sur le Nexus Santé-Environnement-Agriculture-Alimentation s’inscrivent dans cette perspective en incitant à (i) tenir ensemble dans l’analyse ces différentes composantes de façon prendre en compte la complexité des interactions entre les dimensions économiques, sociales, environnementales et sanitaires des activités qui se déroulent au sein du système alimentaire, (ii) exploiter les synergies possibles entre objectifs ou domaines d’action généralement considérés séparément.Cette nécessité d’une « reconnexion » entre les enjeux de santé, alimentation, agriculture et environnement, étayée par les impacts environnementaux, sociaux, sanitaires des modèles agricoles et alimentaires en place a émergé au croisement de différents courants de la littérature.
Published: 2019

49. IBISBA 1.0 Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Accelerator

Author: Michael O'Donohue, O'DONOHUE, Michael, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, JEL: O - Economic Development, Innovation, Technological Change, and Growth/O.O3 - Innovation • Research and Development • Technological Change • Intellectual Property Rights, [SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, [SHS.ECO] Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology
Abstract: International audience
Published: 2019

50. Vacuum-uv and low-energy electron-Induced dna strand breaks - influence of the dna sequence and substrate

Author: Ilko Bald, Stefanie Vogel, Robin Schürmann, Christian Heck, Kenny Ebel, Alexandre Giuliani, Till Thomas Meiling, Aleksandar R. Milosavljević, Institute of Chemistry (Physical Chemistry), University of Potsdam, Humboldt-Universität zu Berlin, Federal Institute for Materials Research and Testing - Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM), Synchrotron SOLEIL, Département Caractérisation et Elaboration des Produits Issus de l'Agriculture (CEPIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), German Research Foundation (DFG) [281049597], Federal Institute for Materials Research and Testing (BAM), DFG [GSC 1013], and 20141108
Subjects: Materials science, Vacuum, DNA damage, Ultraviolet Rays, Electrons, 02 engineering and technology, Electron, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Molecular physics, vacuum-UV radiation, Secondary electrons, dna strand breaks, Ionization, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, DNA origami, dna radiation damage, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Irradiation, Physical and Theoretical Chemistry, Range (particle radiation), Photons, Base Sequence, low-energy electrons, DNA Breaks, dna origami, DNA, 021001 nanoscience & nanotechnology, Atomic and Molecular Physics, and Optics, 0104 chemical sciences, Ionization energy, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; DNA is effectively damaged by radiation, which can on the one hand lead to cancer and is on the other hand directly exploited in the treatment of tumor tissue. DNA strand breaks are already induced by photons having an energy below the ionization energy of DNA. At high photon energies, most of the DNA strand breaks are induced by low-energy secondary electrons. In the present study we quantified photon and electron induced DNA strand breaks in four different 12mer oligonucleotides. They are irradiated directly with 8.44 eV vacuum ultraviolet (VUV) photons and 8.8 eV low energy electrons (LEE). By using Si instead of VUV transparent CaF2 as a substrate the VUV exposure leads to an additional release of LEEs, which have a maximum energy of 3.6 eV and can significantly enhance strand break cross sections. Atomic force microscopy is used to visualize strand breaks on DNA origami platforms and to determine absolute values for the strand break cross sections. Upon irradiation with 8.44 eV photons all the investigated sequences show very similar strand break cross sections in the range of 1.7-2.3x10(-16) cm(2). The strand break cross sections for LEE irradiation at 8.8 eV are one to two orders of magnitude larger than the ones for VUV photons, and a slight sequence dependence is observed. The sequence dependence is even more pronounced for LEEs with energies
Published: 2019

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