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Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de surveillance microbiologique des zones de production conchylicoles (REMI) et du réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Côtes d’Armor (22). Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. Le bilan au 31 décembre 2022 est stable. Il ne présente aucune nouvelle évolution du classement sur la base des résultats plutôt favorables de 2022. C’est en partie dû à la faible pluviométrie (sécheresse estivale) et au faible nombre d’alertes associé (seulement deux alertes supérieures à 700 E. coli/100 g CLI). Le bilan présente cependant une évaluation de la qualité différente du classement administratif pour quatre zones : 22.01.20 groupe 2, 22.01.20 groupe 3, 22.03.23 groupe 2, 22.00.00 groupe 3 et 22.12.10 groupe 3 (ces deux zones sont basées sur le même point en 2023). Ils sont liés à des résultats de 2020 et 2021. Ils concernent la baie d’Arguenon, la baie d’Yffiniac et la baie de Lannion. Globalement, la qualité sanitaire reste en amélioration (statistiquement, 45% des points suivis montrent une tendance à l’amélioration – Annexe 4). Aucun point de surveillance ne présente de tendance à la dégradation.

Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de surveillance microbiologique des zones de production conchylicoles (REMI) et du réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de l’Ille‐et‐Vilaine (35). Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. Le bilan global de la qualité sanitaire des zones conchylicoles dans le département d’Ille‐et‐Vilaine est assez stable depuis trois ans. Il est en concordance avec le classement administratif pour toutes les zones sauf les zones 35.08‐groupe 3, 35.06‐groupe 3 et 35.13‐groupe 3, qui présentent une dégradation (A vers B). Le bilan est donc plus partagé en baie du Mont‐Saint‐Michel. Mais l’ensemble des points continue de présenter un faible bruit de fond des contaminations, seuls huit résultats sont déclassants dans l’ensemble de la baie. En Rance et en baie de Saint‐Malo, l’état sanitaire s’était considérablement dégradé au début des années 2010. Mais depuis 2015, l’essentiel des zones suivies connaît un regain de qualité et permet un classement généralisé en qualité moyenne. Cette qualité sanitaire se maintient en 2022 et présente quelques améliorations : une diminution des épisodes d’alertes et une zone 3522.02 très proche de la bonne qualité sanitaire pour les deux groupes. Les tendances statistiques calculées sur dix ans montrent une amélioration sur sept points, soit le tiers des points permettant ce calcul (cf. Annexe 4). Aucun point de surveillance ne présente de tendance à la dégradation. Seules quatre alertes sanitaires sont comptées en 2022. Mais deux d’entre elles, faisant partie d’un même épisode pluvieux, sont à l’origine des deux nouveaux déclassements estimés en 2023.

Ce rapport technique est dédié au volet de la modélisation hydrodynamique porté par l’Ifremer dans le cadre du projet CORAIL. Il présente une analyse des évolutions des flux de nutriments provenant des bassins versants et illustre la dispersion de leur panache en mer et la contribution relative de chacun des fleuves principaux de la côte d’Emeraude. Contexte hydrologique : La hausse de température de l’eau au large de la côte d’Emeraude, en lien avec le réchauffement global, est de 0,77 °C tous les dix ans. Les concentrations en nutriment suivent une variation saisonnière avec un maximum hivernal et un minimum estival. Les concentrations en phosphate sont de l’ordre de 80 fois inférieures aux nitrates. Ces concentrations sont surtout dépendantes des débits dans les exutoires des fleuves, expliquant les variations intra-annuelles. Les données disponibles sur l’exutoire du Frémur en baie de la Fresnaie montrent une diminution importante interannuelle : en 20 ans les concentrations en nitrates ont été divisées par deux (passant d’une moyenne de 60 mg/l à une moyenne de 30 mg/l). L’année 2021 est plutôt représentative des cinq dernières années en matière d’hydrologie (débits, concentrations des nutriments). Les observations de CORAIL peuvent être comparées aux études précédentes pour évaluer l’évolution des flux de nutriments (SOGREAH 2002). Les flux hivernaux ont ainsi été divisés par deux à trois en 20 ans sur les trois fleuves : Arguenon et les deux Frémur. Le tonnage total de nutriment apporté à la mer est lié à la surface totale de chaque bassin versant. Sur 2021, le bassin le plus producteur est celui de la Rance avec plus de 4000 T de nitrate par an, contre 150 T pour celui du Frémur de Lancieux. Quant aux flux spécifiques, le bassin du Frémur de la Fresnaie est le plus producteur au kilomètre carré (5.2 T/km² par an). Ce tonnage est à mettre en lien avec les activités, dont l’agriculture notamment. Hydrodynamisme : Les courants résiduels vont d’amont en aval dan

La baie du Mont-Saint-Michel, internationalement reconnue, est aussi une baie à forte vocation conchylicole. Son territoire, bordé par de nombreux bassins-versants de petite à moyenne taille (77 à 1100 km²), présente une diversité d’usage pouvant affecter la qualité microbiologique des eaux. Tant pour la pression démographique qu’agricole, les secteurs immédiats du centre de la baie sont plutôt épargnés du fait que ce territoire présente une forte activité maraichère en lien avec sa configuration géomorphologique (polder). Ces pressions vont croissantes à l’Est de la baie vers la Normandie. Les résultats des différents suivis sanitaires et des modélisations hydrodynamiques disponibles montrent un gradient de contamination croissant d’Ouest en Est, avec des vecteurs bien identifiés. Il s’agit des grands fleuves de fond de baie (Sée, Sélune et Couesnon), pouvant expliquer des pics de contamination sur l’extrême Est des bouchots à moules, et des Biez venant de Saint-Benoit et du Vivier-sur-Mer, pouvant toucher le centre de la baie. Historiquement stables, les qualités sanitaires de plusieurs points de suivi REMI se sont améliorées depuis la fin des années 2010, en parallèle de la mise en place d’un assouplissement des règles de classement. Des hétérogénéités entre les points de prélèvements sont apparues et posent la question d’affiner la limite de certaines zones. Cette étude sanitaire avait pour but d’évaluer la qualité sanitaire des zones de production du centre de la baie du Mont-Saint-Michel et d’en adapter la stratégie du suivi REMI si nécessaire. Conclusion intermédiaire pour la 35.06 D’après les résultats de l’étude, la bonne qualité sanitaire de l’ensemble des zones de production du centre de la baie du Mont-Saint-Michel ne tient qu’à quelques pics de moyenne qualité sanitaire. La principale source de contamination du secteur est le biez venant du Vivier-sur-Mer. Cette source peut s’avérer encore impactante sur les points de suivi situé à l’Est de son exutoire

L’Ifremer coordonne, sur l’ensemble du littoral métropolitain, la mise en oeuvre des réseaux d’observation et de surveillance de la mer côtière. Ce bulletin contient une synthèse et une analyse des données collectées par l’ensemble des réseaux pour les départements d’Ille‐et‐Vilaine et des Côtes d’Armor. Des représentations graphiques homogènes, assorties de commentaires, donnent des indications sur les niveaux et les tendances des paramètres mesurés.

L’Ifremer coordonne, sur l’ensemble du littoral métropolitain, la mise en oeuvre des réseaux d’observation et de surveillance de la mer côtière. Ce bulletin contient une synthèse et une analyse des données collectées par l’ensemble des réseaux pour les départements d’Ille‐et‐Vilaine et des Côtes d’Armor. Des représentations graphiques homogènes, assorties de commentaires, donnent des indications sur les niveaux et les tendances des paramètres mesurés.

Fecal pollution in coastal areas is of a high concern since it affects bathing and shellfish harvesting activities. Wild waterbirds are non-negligible in the overall signal of the detectable pollution. Yet, studies on wild waterbirds’ gut microbiota focus on migratory trajectories and feeding impact on their shape, rare studies address their comparison to other sources and develop quantitative PCR (qPCR)-based Microbial Source Tracking (MST) markers to detect such pollution. Thus, by using 16S rRNA amplicon high-throughput sequencing, the aims of this study were (i) to explore and compare fecal bacterial communities from wild waterbirds (i.e., six families and 15 species, n = 275 samples) to that of poultry, cattle, pigs, and influent/effluent of wastewater treatment plants (n = 150 samples) and (ii) to develop new MST markers for waterbirds. Significant differences were observed between wild waterbirds and the four other groups. We identified 7,349 Amplicon Sequence Variants (ASVs) from the hypervariable V3–V4 region. Firmicutes and Proteobacteria and, in a lesser extent, Actinobacteria and Bacteroidetes were ubiquitous while Fusobacteria and Epsilonbacteraeota were mainly present in wild waterbirds. The clustering of samples in non-metric multidimensional scaling (NMDS) ordination indicated a by-group clustering shape, with a high diversity within wild waterbirds. In addition, the structure of the bacterial communities was distinct according to bird and/or animal species and families (Adonis R2 = 0.13, p = 10–4, Adonis R2 = 0.11, p = 10–4, respectively). The Analysis of Composition of Microbiomes (ANCOM) showed that the wild waterbird group differed from the others by the significant presence of sequences from Fusobacteriaceae (W = 566) and Enterococcaceae (W = 565) families, corresponding to the Cetobacterium (W = 1427) and Catellicoccus (W = 1427) genera, respectively. Altogether, our results suggest that some waterbird members present distinct fecal microbiomes

Tetrodotoxins (TTXs) are potentially lethal paralytic toxins that have been identified in European shellfish over recent years. Risk assessment has suggested comparatively low levels (44 µg TTX-equivalent/kg) but stresses the lack of data on occurrence. Both bacteria and dinoflagellates were suggested as possible biogenic sources, either from an endogenous or exogenous origin. We thus investigated TTXs in (i) 98 shellfish samples and (ii) 122 bacterial strains, isolated from French environments. We optimized a method based on mass spectrometry, using a single extraction step followed by ultrafiltration without Solid Phase Extraction and matrix-matched calibration for both shellfish and bacterial matrix. Limits of detection and quantification were 6.3 and 12.5 µg/kg for shellfish and 5.0 and 10 µg/kg for bacterial matrix, respectively. Even though bacterial matrix resulted in signal enhancement, no TTX analog was detected in any strain. Bivalves (either Crassostrea gigas or Ruditapes philippinarum) were surveyed in six French production areas over 2.5–3 month periods (2018–2019). Concentrations of TTX ranged from ‘not detected’ to a maximum of 32 µg/kg (Bay of Brest, 17 June 2019), with events lasting 2 weeks at maximum. While these results are in line with previous studies, they provide new data of TTX occurrence and confirm that the link between bacteria, bivalves and TTX is complex