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142 results on '"Chauvin, Jean-Eric"'

1. Genome Editing Tools for Potato Improvement

Author

Ravet, Karl, Sevestre, François, Chauvin, Laura, Chauvin, Jean-Eric, Lairy-Joly, Gisèle, Katz, Andrew, Devaux, Pierre, Szydlowski, Nicolas, Gallois, Jean-Luc, Pearce, Stephen, Veillet, Florian, Zhao, Kaijun, editor, Mishra, Rukmini, editor, and Joshi, Raj Kumar, editor

Published
2022
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3. A genomic dataset integrating genotyping-by-sequencing, SolCAP array and PCR marker data on tetraploid potato advanced breeding lines.

Author

Leuenberger, Julien, Sharma, Sanjeev Kumar, McLean, Karen, Pellé, Roland, Bérard, Aurélie, Lesage, Marie-Laure, Porhel, Danièle, Dantec, Marie-Ange, Chauvin, Jean-Eric, Bryan, Glenn J., Pilet-Nayel, Marie-Laure, Kerlan, Marie-Claire, and Esnault, Florence

Subjects
POTATOES, BOTANY, GOLDEN nematode, SINGLE nucleotide polymorphisms, POTATO virus Y, PLANT genomes
Abstract

This article presents a genomic dataset that combines different genotyping techniques to analyze the genetic traits of tetraploid potato clones. The dataset focuses on resistance to diseases and pests and provides valuable information for potato researchers and breeders. The dataset includes genotyping data from genotyping-by-sequencing, SolCAP array, and PCR markers, and consists of 27,148 high-quality SNPs. The research was funded by various organizations and there are no conflicts of interest. Additionally, the document provides a list of references that cover topics related to potato genotyping and resistance to pathogens, which can be useful for researchers studying potato genetics and breeding for disease resistance. [Extracted from the article]

Published
2024
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12. Gene Editing in Potato Using Technology

Author

Chauvin, Laura, Sevestre, François, Lukan, Tjaša, Nogué, Fabien, Gallois, Jean-Luc, Chauvin, Jean-Eric, Veillet, Florian, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Miniaturisation pour la Synthèse, l’Analyse et la Protéomique - UAR 3290 (MSAP), Department of Biotechnology and Systems Biology [Ljubljana, Slovenia], National Institute of Biology [Ljubljana] (NIB), Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), and Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, Single-guide RNA, Agrobacterium tumefaciens, Protoplasts, [SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, food and beverages, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, CRISPR-Cas9, Gene editing, HRM analysis, Potato, Plant regeneration
Abstract

International audience; Genome editing in the cultivated potato (Solanum tuberosum), a vegetatively propagated and highly heterozygous species, constitutes a promising trail to directly improve traits into elite cultivars. With the recent and successful development of the clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-Cas9 system in eukaryotic cells, the plant science community has gained access to a powerful, inexpensive, and easy-to-use toolbox to target and inactivate/modify specific genes. The specificity and versatility of the CRISPR-Cas9 system rely on a variable 20 bp spacer sequence at the 5' end of a single-guide RNA (sgRNA), which directs the SpCas9 (Streptococcus pyogenes) nuclease to cut the target DNA at a precise locus with no or low off-target events. Using this system, we and other teams were able to knock out specific genes in potato through the error-prone non-homologous end-joining (NHEJ) DNA repair mechanism. In this chapter, we describe strategies to design and clone spacer sequences into CRISPR-SpCas9 plasmids. We show how these constructs can be used for Agrobacterium-mediated stable transformation or transient transfection of protoplasts, and we describe the optimization of these two delivery methods, as well as of the plant regeneration processes. Finally, the molecular screening and characterization of edited potato plants are also described, mainly relying on PCR-based methods such as high-resolution melt (HRM) analysis.

Published
2021

14. Analyse Bibliométrique des publications scientifiques mondiales sur les Fruits, Légumes et Pomme de Terre. Période 2010-2019

Author

Savajol, C, Tatry, M.-V, Amiot-Carlin, M.-J, Carlin, F, Chauvin, Jean-Eric, Colleu, S, Faloya, V, Laurens, F, Renard, C, Plénet, Daniel, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Direction pour la Science Ouverte (DipSO), Montpellier Interdisciplinary center on Sustainable Agri-food systems (Social and nutritional sciences) (UMR MoISA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité Expérimentale sur les Ressources Génétiques Végétales en Conditions Océaniques (RGCO), Collège de Direction (CODIR), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Département Aliments, produits biosourcés et déchets - INRAE (TRANSFORM), GIS FruitsGIS PIClégMission Partenariat DS AgriculturePSH, INRAE, Etude du groupe filière Fruits, Légumes et Pomme de terre et de la Direction pour la Science Ouverte (DipSO) de INRAE, Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST, TRANSFORM Division (INRAE), and Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université de Rennes 1 (UR1)

Subjects
Fruits et légumes, analyse bibliométrique, [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

L’analyse des publications mondiales du Web of Science (WoSTM) concernant les fruits et légumes au cours de la période 2010-2019 a pour objectifs (i) d’identifier les principaux acteurs de la recherche dans le monde et en France, et (ii) de visualiser les grandes évolutions depuis 2000, grâce à la comparaison avec l’analyse précédente réalisée sur la période 2000-2009. Le périmètre de l’étude concerne les publications sur les fruits et légumes (F&L) - les légumes regroupant la pomme de terre - destinés à l’alimentation humaine et à leurs effets sur la santé, ainsi que la valorisation de leurs coproduits. Le corpus F&L mondial de la période 2010-2019 comprend 154 408 publications, avec une forte augmentation (41,2 %) par rapport à la période 2000-2009, et une répartition assez équilibrée entre les fruits et les légumes. Parmi les 46 espèces ou groupes d’espèces fruitières observés, le groupe des Citrus arrive au 1er rang en nombre de publications (12 % du corpus Fruits), suivi de la pomme (11,1 %) et de l’olive (8,9 %). Sur les 35 espèces légumières analysées, la tomate domine fortement (19,8 % du corpus Légumes) suivie par la pomme de terre (10,9 %) et les choux (7,6 %). Les cinq pays publiant le plus sont les Etats-Unis (30 851 publications), la Chine (23 640), le Brésil (11 290), l’Espagne (11 178) et l’Italie (9 501). La Chine se caractérise par une augmentation très importante de ses publications au cours des dix dernières années et se positionne au 1er rang mondial en 2019, devant les Etats-Unis. A l’échelle des continents, l’UE 28 occupe le 1er rang (35,3 % du corpus F&L Monde), suivie par l’Asie et l’Amérique du Nord. Les pays du pourtour méditerranéen représentent 24,1 % des publications du corpus F&L Monde. La France se situe au 9ième rang mondial des pays avec 5 037 publications, en progression (+44,7 %) par rapport à 2000-2009 où elle se positionnait au 11ième rang avec 3 480 publications. Plus de 400 institutions françaises ont publié sur les F&L avec au 1er rang INRAE qui totalise 2 636 publications soit 52,3 % du corpus F&L France, suivi par le CNRS (15,7 %) et le CIRAD (15,5 %). INRAE se positionne à la 4ième place mondiale des institutions publiant sur les F&L.Le taux de croissance annuel moyen (+3,1 % par an) des publications INRAE pour la période 2010-2019 est supérieur au taux observé pour le corpus F&L Monde (+2,8 % par an) et à celui de la France (+1,2 % par an). Les fruits avec 1 440 publications représentent environ 55 % des publications du corpus INRAE. Dans le corpus Légumes INRAE constitué de 1 253 publications, la tomate arrive largement au 1er rang avec 26,3 % des publications. Une très forte progression des publications est observée sur la tomate au cours des vingt dernières années à INRAE comme au niveau mondial.Les 2 370 articles originaux et de synthèse signés ou co-signés par les chercheurs INRAE ont été publiés pour 69,3 % dans des revues de notoriété exceptionnelle et excellente contre 61,9 % pour le corpus France et 40,6 % pour le corpus Monde, ce qui témoigne d’une très bonne qualité des recherches de l’Institut. Les collaborations internationales représentent 58,5 % des publications INRAE, en nette progression par rapport à la période 2000-2009 (37,8 %), et très supérieures à celles observées au niveau mondial (21,5 %).Sur la période 2010-2019, 55,7 % des publications du corpus F&L INRAE sont attribuées à 9 unités de recherche dont 4 comptabilisent plus de 200 publications, les 5 autres entre 100 et 200 publications. Trois centres INRAE représentent 60 % des publications : PACA (720 publications, 27,3 % du corpus), Occitanie-Montpellier (542 publications, 20,6 %) et Nouvelle-Aquitaine Bordeaux (451 publications, 17,1 %). La contribution de chaque centre par types de F&L et par catégories thématiques du WoSTM est présentée.En conclusion, cette analyse bibliométrique sur la période 2010-2019 permet de dresser une cartographie précise de la recherche sur les espèces fruitières et légumières, au niveau mondial, européen et français. Elle confirme l’importance et la qualité de l’effort de recherche fourni par l’institut INRAE pour les filières F&L à fort enjeu pour l’économie, l’alimentation et la santé humaine.

Published
2021

17. Analyse des plans de filière des interprofessions agricoles. 2. Analyse du plan de filière Fruits et Légumes - Interfel, Anifelt

Author

Plénet, Daniel, Faloya, Vincent, Amiot-Carlin, Marie Josephe, Carlin, Frederic, Chauvin, Jean-Eric, Colleu, Sylvie, Laurens, Francois, Renard, Catherine, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biologie des organismes et des populations appliquées à la protection des plantes (BIO3P), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Marchés, Organisations, Institutions et Stratégies d'Acteurs (UMR MOISA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Collège de Direction (CODIR), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, and INRAE

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Published
2020

18. Expanding the CRISPR Toolbox in P. patens Using SpCas9-NG Variant and Application for Gene and Base Editing in Solanaceae Crops

Author

Veillet, Florian, Perrot, Laura, Guyon-Debast, Anouchka, Kermarrec, Marie-Paule, Chauvin, Laura, Chauvin, Jean-Eric, Gallois, Jean-Luc, Mazier, Marianne, Nogué, Fabien, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ANR-10-LABX-0040-SPS, Agence Nationale de la Recherche, ANR-11-BTBR-0001,GENIUS,Ingénierie cellulaire : amélioration et innovation technologiques pour les plantes d'une agriculture(2011), ANR-17-EURE-0007,SPS-GSR,Ecole Universitaire de Recherche de Sciences des Plantes de Paris-Saclay(2017), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
SpCas9-NG, Physcomitrella patens, base editing, physcomitrella patens, tomato, lcsh:Chemistry, [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, [SDV.BV.AP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding, lcsh:Biology (General), lcsh:QD1-999, potato, CBE, xCas9, CRISPR-Cas9, lcsh:QH301-705.5, alternative PAM
Abstract

Genome editing has become a major tool for both functional studies and plant breeding in several species. Besides generating knockouts through the classical CRISPR-Cas9 system, recent development of CRISPR base editing holds great and exciting opportunities for the production of gain-of-function mutants. The PAM requirement is a strong limitation for CRISPR technologies such as base editing, because the base substitution mainly occurs in a small edition window. As precise single amino-acid substitution can be responsible for functions associated to some domains or agronomic traits, development of Cas9 variants with relaxed PAM recognition is of upmost importance for gene function analysis and plant breeding. Recently, the SpCas9-NG variant that recognizes the NGN PAM has been successfully tested in plants, mainly in monocotyledon species. In this work, we studied the efficiency of SpCas9-NG in the model moss Physcomitrella patens and two Solanaceae crops (Solanum lycopersicum and Solanum tuberosum) for both classical CRISPR-generated gene knock-out and cytosine base editing. We showed that the SpCas9-NG greatly expands the scope of genome editing by allowing the targeting of non-canonical NGT and NGA PAMs. The CRISPR toolbox developed in our study opens up new gene function analysis and plant breeding perspectives for model and crop plants.

Published
2020

23. Lutte contre le mildiou : allier le biocontrôle à d'autres méthodes

Author

Menil, Antoine, Chauvin, Jean-Eric, Pellé, Rolland, Bousseau, Marie, Gaucher, Denis, Beauvallet, Guillaume, Maumené, Claude, Andrivon, Didier, Pasco, Claudine, Val, Florence, Barbary, Arnaud, turner, Marie, Vegenov-BBV, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, ARVALIS - Institut du végétal [Paris], Comité Nord Plants de Pommes de Terre, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Bretagne Plants Innovation

Subjects
ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BV.PEP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy
Abstract

International audience

Published
2019

25. Recherche et maitrise des produits de biocontrôle dans un schéma de protection intégrée des cultures (projet MilPomBio)

Author

Menil, Antoine, Chauvin, Jean-Eric, Pellé, Rolland, Bousseau, Marie, Gaucher, Denis, Beauvallet, Guillaume, Maumené, Claude, Andrivon, Didier, Pasco, Claudine, Val, Florence, Barbary, Arnaud, Turner, M., Vegenov-BBV, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ARVALIS - Institut du végétal [Paris], ARVALIS - Institut du Végétal [Boigneville], Bretagne Plants Innovation, Vegenov (BBV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Comité Nord Plants de Pommes de Terre, and Grenier, Anne-Sophie

Subjects
[SDV.BV.PEP] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BV.PEP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy
Abstract

International audience

Published
2018

26. Diversité des agricultures dans les filières fruits, légumes et pomme de terre

Author

Plénet, Daniel, Jeannequin, Benoit, Chauvin, Jean-Eric, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine Expérimental Alénya-Roussillon, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], Distribution chain, Economy, Environment, Quality, Environnement, [SHS]Humanities and Social Sciences, Sustainability, [SDE]Environmental Sciences, Farming systems, Economie, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Circuit de commercialisation, Qualité, Durabilité
Abstract

National audience; The fruit, vegetable and potato (FLP) sectors are characterised by a high structural diversity linked to the many species and varieties cultivated and to very varied production and marketing structures. The very strong competition imposed by the long distribution and import-export channels has gradually led, for reasons of economic rationality, to a specialisation of the production basins and part of the farms with standardisation of production means and products, but also the disappearance of many small farms. Overall, these changes have resulted in an erosion of surfaces and a decrease in the volumes produced for the majority of sectors with the exception of potatoes and certain nuts. Nevertheless, the dynamism of certain "product" sectors has led to a revival of competitiveness and/or a better Plénet D. et al. 80 Innovations Agronomiques 68 (2018), 79-105 development of the offer thanks to approaches relating to the development of high-tech systems, the reduction in the use of synthetic products, segmentation and commercial differentiation, and the creation of quality signs. In addition, the renewal of short and local circuits has recently made it possible to develop a very diversified network of farms in all regions. The emergence of high expectations for organic farming products and for healthy and sustainable agro-food systems offers new opportunities today. To benefit from them, the FLP sectors will have to develop coherent strategies to strengthen complementarities and synergies between different production, processing and marketing systems. These diversity enhancement strategies will contribute to increasing the economic and environmentalrobustness of the FLP sectors.; Les filières fruits, légumes et pomme de terre (FLP) se caractérisent par une diversité structurelle importante liée aux nombreuses espèces et variétés cultivées et à des structures de production et de commercialisation très variées. La très forte concurrence imposée par les circuits longs de la grande distribution et de l’import-export a progressivement entrainé pour des raisons de rationalité économique une spécialisation des bassins de production et d’une partie des exploitations avec une standardisation des moyens de production et des produits, mais aussi la disparition de nombreuses petites exploitations. Globalement, ces évolutions se sont traduites par une érosion des surfaces et une diminution des volumes produits pour la majorité des filières à l’exception de la pomme de terre et de certains fruits à coque. Néanmoins, le dynamisme de certaines filières « produit » a entrainé un regain de compétitivité et/ou une meilleure valorisation de l’offre grâce à des démarches portant sur le développement de systèmes à haute technicité, la réduction d’utilisation des produits de synthèse, la segmentation et la différenciation commerciale, et la création de signes de qualité. Par ailleurs, le renouveau des circuits courts et de proximité permet depuis peu de développer dans toutes les régions un tissu d’exploitations très diversifiées. L’émergence d’une forte attente pour les produits de l’agriculture biologique et pour des systèmes agro-alimentaires sains et durables offre aujourd’hui de nouvelles opportunités. Pour en bénéficier, les filières FLP devront élaborer des stratégies cohérentes afin de renforcer les complémentarités et les synergies entre différents systèmes de production, de transformation et de commercialisation. Ces stratégies de valorisation de la diversité contribueront à accroitre la robustesse économique et environnementale des filières FLP.

Published
2018

27. Inra, l'impact des recherches

Author

Chauvin, Jean-Eric, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BV.PEP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy
Abstract

National audience

Published
2018

28. Abstract : Agriculture diversities in fruit, vegetable and potato sectors

Author

Plénet, Daniel, Jeannequin, Benoit, Chauvin, Jean-Eric, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine Expérimental Alénya-Roussillon, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], Circuit de commercialisation, Durabilité, Economie, Environnement, Qualité, Distribution chain, Sustainability, Economy, Environment, Quality, Farming systems, [SHS]Humanities and Social Sciences, [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Abstract

Les filières fruits, légumes et pomme de terre (FLP) se caractérisent par une diversité structurelle importante liée aux nombreuses espèces et variétés cultivées et à des structures de production et de commercialisation très variées. La très forte concurrence imposée par les circuits longs de la grande distribution et de l’import-export a progressivement entrainé pour des raisons de rationalité économique une spécialisation des bassins de production et d’une partie des exploitations avec une standardisation des moyens de production et des produits, mais aussi la disparition de nombreuses petites exploitations. Globalement, ces évolutions se sont traduites par une érosion des surfaces et une diminution des volumes produits pour la majorité des filières à l’exception de la pomme de terre et de certains fruits à coque. Néanmoins, le dynamisme de certaines filières « produit » a entrainé un regain de compétitivité et/ou une meilleure valorisation de l’offre grâce à des démarches portant sur le développement de systèmes à haute technicité, la réduction d’utilisation des produits de synthèse, la segmentation et la différenciation commerciale, et la création de signes de qualité. Par ailleurs, le renouveau des circuits courts et de proximité permet depuis peu de développer dans toutes les régions un tissu d’exploitations très diversifiées. L’émergence d’une forte attente pour les produits de l’agriculture biologique et pour des systèmes agro-alimentaires sains et durables offre aujourd’hui de nouvelles opportunités. Pour en bénéficier, les filières FLP devront élaborer des stratégies cohérentes afin de renforcer les complémentarités et les synergies entre différents systèmes de production, de transformation et de commercialisation. Ces stratégies de valorisation de la diversité contribueront à accroitre la robustesse économique et environnementale des filières FLP., The fruit, vegetable and potato (FLP) sectors are characterised by a high structural diversity linked to the many species and varieties cultivated and to very varied production and marketing structures. The very strong competition imposed by the long distribution and import-export channels has gradually led, for reasons of economic rationality, to a specialisation of the production basins and part of the farms with standardisation of production means and products, but also the disappearance of many small farms. Overall, these changes have resulted in an erosion of surfaces and a decrease in the volumes produced for the majority of sectors with the exception of potatoes and certain nuts. Nevertheless, the dynamism of certain "product" sectors has led to a revival of competitiveness and/or a better Plénet D. et al. 80 Innovations Agronomiques 68 (2018), 79-105 development of the offer thanks to approaches relating to the development of high-tech systems, the reduction in the use of synthetic products, segmentation and commercial differentiation, and the creation of quality signs. In addition, the renewal of short and local circuits has recently made it possible to develop a very diversified network of farms in all regions. The emergence of high expectations for organic farming products and for healthy and sustainable agro-food systems offers new opportunities today. To benefit from them, the FLP sectors will have to develop coherent strategies to strengthen complementarities and synergies between different production, processing and marketing systems. These diversity enhancement strategies will contribute to increasing the economic and environmentalrobustness of the FLP sectors.

Published
2018

32. Impact des géniteurs Inra : valorisation de la résistance génétique aux bioagresseurs

Author

Bourget, D., Chatot, C., Chauvin, Jean-Eric, Germicopa, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST

Subjects
lutte contre les nématodes, réduction de pesticides, meloidogyne, globodera, varietal selection, géniteur de résistance, root knot nematodes, plant de pomme de terre, nematode control, pomme de terre, mildiou, tolérance au stress abiotique, potato, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, seed potatoes, résistance génétique, phytophthora infestans, sélection variétale, mildew
Abstract

National audience; Dans le cadre du plan français Ecophyto, le développement de variétés de pommes de terre résistantes aux stress abiotiques est maintenant une nécessité absolue pour réduire le nombre de traitements phytosanitaires. En effet, la culture de pomme de terre est sensible à de nombreux agents pathogènes, parmi lesquels Phytophthora infestans, agent responsable du mildiou et les nématodes, Globodera spp et Meloidogyne spp.Cet article présente le travail qui a été fait depuis les années 1980 par l'INRA pour trouver et utiliser les gènes de résistance appropriés, présents dans les espèces sauvages. Au cours des 20 dernières années, cette activité de recherche a permisla création de plus de 720 géniteurs innovants, dont 80% sont porteurs de nouveaux gènes de résistance à divers agents pathogènes. Depuis 1995, ces "parents potentiels" ont été remis aux sélectionneurs français, membres de l'ACVNPT, association des créateurs de variétés nouvelles de pommes de terre. Ceux-ci sont maintenant en mesure de développer de nouvelles variétés résistantes à l'aide de ce pool de gènes innovants.

Published
2016

33. Réduire les pertes alimentaires dans les filières Fruits, Légumes et Pomme de terre

Author

Jeannequin, Benoit, Plénet, Daniel, Carlin, Frederic, Chauvin, Jean-Eric, Dosba, Francoise, Domaine expérimental horticole du Mas Blanc (MAS BLANC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Domaine Expérimental Alénya-Roussillon, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, filière agricole, Food loss, Apple, fruit, légume, Vegetable, évaluation des pertes, perte alimentaire, Tomato, Agricultural sciences, tomate, fruit et légume, pomme de terre, Alimentation et Nutrition, Food and Nutrition, pomme de table, Potato, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Sciences agricoles
Abstract

National audience; Cette étude contribue à évaluer les pertes alimentaires en France au sein des filières de fruits, légumes et pomme de terre. Compte tenu du nombre de produits, de la variété des systèmes de production et des multiples destinations, l’analyse s’appuie sur 9 productions illustrant la diversité existant au sein de ces 3 filières. Des pertes alimentaires potentielles apparaissent tout au long de ces filières, de la parcelle du producteur à l’étal du distributeur, et peuvent être plus ou moins importantes selon les produits (d’environ 5% à plus de 20%). Elles représentent globalement pour l’ensemble des fruits et des légumes 12% de la production disponible au champ. Les trois quarts de ces pertes sont constatés aux premières étapes de la filière, de la récolte à la mise en marché. Leurs principales causes sont la sensibilité des produits aux aléas sanitaires et climatiques, leur périssabilité, l’application de normes règlementaires ou de cahiers des charges exigeants. Les pertes aux stades de la distribution (grossistes et détaillants) représentent le quart restant ; elles sont principalement dues à la manipulation de produits très périssables et surtout à des problèmes de surmaturité liés en partie à une gestion inappropriée des stocks. Ces produits écartés de ces filières sont en majorité épandus dans les parcelles agricoles, et plus occasionnellement orientés vers des plateformes de méthanisation. Pour réduire ou mieux valoriser ces pertes alimentaires, plusieurs leviers d’action peuvent être envisagés à différents niveaux de ces filières, avec pour certaines d’entre elles l’appui de la Recherche et/ou un soutien des politiques publiques.

Published
2015

34. Genome ENgineering Improvement for Useful plants of a Sustainable agriculture

Author

Nogué, Fabien, Vergne, Philippe, Chèvre, Anne-Marie, Chauvin, Jean-Eric, Bouchabke, Oumaya, Dejardin, Annabelle, Chevreau, Elisabeth, Hibrand-Saint Oyant, Laurence, Mazier, Marianne, Barret, Pierre, Guiderdoni, Emmanuel, Mathis, Luc, Sallaud, Christophe, Matt, Mireille, Pierron, Jean Philippe, Bonnel, Eric, Foucrier, Séverine, TOPPAN, Alain, TRANNOY, Laure, Rogowsky, Peter, Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Reproduction et développement des plantes (RDP), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (AGPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Cellectis SA, BIOGEMMA, Economie Appliquée de Grenoble, Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Jean Moulin Lyon 3 - Faculté de Philosophie (UJML3 Philo), Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon, Germicopa, SAS Pépinières et Roseraies Georges Delbard, Vilmorin, Direction de la Valorisation / Contrats et Propriété Intellectuelle, Investment for the Future ANR program 'Biotechnology and Bioresources', École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Faculté de Philosophie

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, agriculture durable, projet de recherche, site-specific nucleases, Agricultural sciences, culture génétiquement modifiée, gene targeting, genetically modified crops, gène cible, recherche internationale, nucléase, Sciences agricoles, transgénèse, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, amélioration des plantes
Abstract

National audience

Published
2015

35. DEFISTIM-Projet Collaboratif FUI : Accélérer, optimiser et développer la mise en marche des stimulateurs des défenses des plantes (SDP), avec l'appui des outils d'aide à la décision (OAD)

Author

Bonneau, C., Aveline, N., Ayral, J.-L., Baillieul, F., Brisset, Marie-Noelle, Chauvin, Jean-Eric, Corio-Costet, Marie-France, Daire, Xavier, Gaucher, D., Lehingrat, Y., Mery Bernardon, A., Moncomble, D., Pellé, Roland, Saubeau, Guillaume, Tailliez-Lefebvre, D., Thomas, G., Turner, M., Val, Florence, Verjux, N., Pôle de compétitivité (VEGEPOLYS), Institut Français de la Vigne et du Vin (IFV), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Santé Végétale (SV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ARVALIS - Institut du végétal [Paris], Fédération Nationale des Producteurs de Plants de Pomme de Terre (FN3PT), Goëmar Parc technopolitain Atalante, Comité Interprofessionnel du Vin de Champagne (CIVC), In Vivo Agrosolutions, Syngeta Seeds, Vegenov-BBV, Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA., IFV, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Fédération Nationale des Producteurs de Plants de Pommes de Terre (FNPPPT), Vegenov (BBV), ProdInra, Archive Ouverte, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Angers (UA), Pôle de compétitivité ( VEGEPOLYS ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ), Institut de Recherche en Horticulture et Semences ( IRHS ), Université d'Angers ( UA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes ( IGEPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -AGROCAMPUS OUEST, Santé Végétale ( SV ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux ( ENITAB ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Fédération Nationale des Producteurs de Plants de Pommes de Terre ( FNPPPT ), Comité Interprofessionnel du Vin de Champagne ( CIVC ), and Vegenov ( BBV )

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2015

36. GENIUS project. Genome ENgineering Improvement for Useful plants of a Sustainable agriculture

Author

Nogué, Fabien, Vergne, Philippe, Chèvre, Anne-Marie, Chauvin, Jean-Eric, Bouchabke-Coussa, Oumaya, Dejardin, Annabelle, Chevreau, Elisabeth, Hibrand-Saint Oyant, Laurence, Mazier, Marianne, Barret, Pierre, Guiderdoni, Emmanuel, Mathis, Luc, Sallaud, Christophe, Matt, Mireille, Pierron, Jean-Philippe, Bonnel, Eric, Foucrier, Séverine, TOPPAN, Alain, TRANNOY, Laure, Rogowsky, Peter, Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Reproduction et développement des plantes (RDP), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (UAGPF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Angers (UA), Unité de recherche Génétique et amélioration des fruits et légumes (GALF), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Cellectis, BIOGEMMA, Laboratoire d'Economie Appliquée de Grenoble (GAEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF), Institut de recherches philosophiques de Lyon (IRPhiL), Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon, Germicopa, SAS Pépinières et Roseraies Georges Delbard, Ets Vilmorin, Unité Contrats et Propriété Intellectuelle (UCPI), Investment for the Future ANR program 'Biotechnology and Bioresources', Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (AGPF), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Laboratoire d'Economie Appliquée = Grenoble Applied Economics Laboratory (GAEL), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, genetically modified crops, site-specific nucleases, gene targeting, agriculture durable, projet de recherche, recherche internationale, Sciences agricoles, transgénèse, Agricultural sciences, amélioration des plantes
Published
2015

37. La lutte génétique contre le mildiou et les nématodes

Author

Chauvin, Jean-Eric, Kerlan, Marie-Claire, Marhadour, Sylvie, Pellé, Roland, Esnault, Florence, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Fédération Nationale des Producteurs de Plants de Pomme de Terre (FN3PT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
résistance aux maladies, genetic control, lutte contre les nématodes, integrated protection, globodera pallida, mécanisme de résistance, mildiou phytophtora infestans, résistance partielle, sélection assisté par marqueurs, durabilité des résistances, nematode control, collection de variétés, pomme de terre, sélection, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, collections, lutte génétique, géniteurs améliorés, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, mildew, OAD (outils d'aide à la décision), phythophtora infestans, durabilité, protection intégrée, géniteur de résistance, gènes R, resistance to diseases, nématode à kyste Globodera pallida, variétés résistantes, mildiou, potato, résistance complexe, sélection assistée par marqueurs
Abstract

National audience; Depuis la découverte de résistance chez les espèces sauvages jusqu'à la création de nouvelles variétés cultivées de pommes de terre.

Published
2015

38. Pre-breeding lines for the creation of potato varieties resistant to late blight and cyst nematodes

Author

Chauvin, Jean-Eric, Kerlan, Marie-Claire, Pellé, Roland, Département BAP, ., ASIRPA (Analyse Socio‐économique des Impacts de la Recherche Publique Agronomique), ., Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), UAR 0459 Département Biologie et Amélioration des Plantes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, [SDE]Environmental Sciences, food and beverages, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Abstract

Etude réalisée dans le cadre de l’évaluation du département Biologie et Amélioration des Plantes - Avec l’appui méthodologique de l’équipe ASIRPA : Laurence Colinet (coordinatrice), INRA Co-direction - Ariane Gaunand, INRA Délégation à l'Evaluation - Amandine Hocdé, INRA SenS (2011-2012) - Pierre-Benoît Joly (coordinateur), INRA LISIS - IFRIS - Philippe Larédo, Latts - IFRIS (2011-2012) - Stéphane Lemarié, INRA GAEL - Mireille Matt, INRA GAEL; Within the framework of the French Ecophyto Plan, the development of potato varieties resistant to biotic stresses is now an absolute need in order to reduce the use of pesticides. Indeed, potato crops require a considerable use of pesticides (mean Treatment Frequency Index = 16.6), because of their susceptibility to numerous pathogens, including Phytophthora infestans (late blight agent) and cyst nematodes. This document highlights the work that has been achieved by INRA since the 1980s in order to find and use appropriate resistance genes present in different wild accessions of Solanum tuberous species. During the past 20 years, this research activity has generated 729 innovative pre‐breeding lines, 80% of which carry new resistance genes to various pathogens. Since 1995, these lines have been released to French potato breeders, who can now develop new resistant varieties using this innovative germplasm. The potential environmental impact of such varieties is considerable, because they may enable reductions in very heavy chemical applications to soils contaminated by nematodes, speed the recovery of fields placed under quarantine control and assist in the control of potato late blight using only half the amount of pesticides compared to susceptible genotypes.

Published
2015

39. Pertes alimentaires dans les filières fruits, légumes et pomme de terre

Author

Jeannequin, Benoit, Plénet, Daniel, Carlin, Frederic, Chauvin, Jean-Eric, Dosba, Francoise, Domaine expérimental horticole du Mas Blanc (MAS BLANC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Domaine Expérimental Alénya-Roussillon, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, and Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
tomate, food loss, pomme de terre, [SDV]Life Sciences [q-bio], apple, potato, vegetable, pomme de table, fruit, légume, tomato, perte alimentaire
Abstract

Cette étude contribue à évaluer les pertes alimentaires en France au sein des filières de fruits, légumes et pomme de terre. Compte tenu du nombre de produits, de la variété des systèmes de production et des multiples destinations, l’analyse s’appuie sur 9 productions illustrant la diversité existant au sein de ces trois filières. Des pertes alimentaires potentielles apparaissent tout au long de ces filières, de la parcelle du producteur à l’étal du distributeur, et peuvent être plus ou moins importantes selon les produits (d’environ 5% à plus de 20%). Elles représentent globalement pour l’ensemble des fruits et des légumes 12% de la production disponible au champ. Les trois quarts de ces pertes sont constatés aux premières étapes de la filière, de la récolte à la mise en marché. Leurs principales causes sont la sensibilité des produits aux aléas sanitaires et climatiques, leur périssabilité, l’application de normes règlementaires ou de cahiers des charges exigeants. Les pertes aux stades de la distribution (grossistes et détaillants) représentent le quart restant ; elles sont principalement dues à la manipulation de produits très périssables et surtout à des problèmes de surmaturité liés en partie à une gestion inappropriée des stocks. Ces produits écartés de ces filières sont en majorité épandus dans les parcelles agricoles, et plus occasionnellement orientés vers des plateformes de méthanisation. Pour réduire ou mieux valoriser ces pertes alimentaires, plusieurs leviers d’action peuvent être envisagés à différents niveaux de ces filières, avec pour certaines d’entre elles l’appui de la Recherche et/ou un soutien des politiques publiques., This work deals with food loss in the French production chains of fruits, vegetables and potato. The study focuses on nine products representative of the diversity of product categories, production systems and final uses. Potential losses are distributed all along the production chain, in the farmer’s field or orchard up to retail and vary according to the type of product, being comprised between 5 % and more than 20 % overall. For fruits and vegetables as a whole, food loss represents approximately 12 % of the production being ready for harvest in the field or the orchard. Three quarters of these losses are observed at the upstream stages of the chain, from harvest to marketing. These are mainly due to high sensitivity of fruits and vegetables to sanitary problems and unfavorable weather conditions, high perishability, and non-conformity to regulations or to demanding commercial specifications. Food losses at distribution stage (wholesalers and retailers) represent the remaining quarter. They are mainly due to handling of highly fragile commodities with limited shelf-live, and over-ripening problems due to inappropriate stock management. Discarded products are mostly spread on fields, and occasionally directed to anaerobic digestion units. In order to decrease food loss or make better use of it though recycling, several types of action can be considered at different steps of the production chain, with possible support from research projects and/or of public policy.

Published
2015

40. La biodiversité au service de la production

Author

Chauvin, Jean-Eric, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST

Subjects
croisement d'espèces, hybrid, clonage in vitro, crossing over, varietal selection, european potato (plant), hybride, conservation in vitro, sélection assisté par marqueurs, solanum tuberosum, sire, pomme de terre, introgression génétique, potato, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, caractérisation génétique, collection d'espèces, conservation des espèces, géniteur, sélection variétale, multiplication in vitro
Abstract

National audience; Différents articles parus dans Plants de Bretagne ont dernièrement rappelé le travail mené par la station de Kerloï pour l’obtention de variétés répondant aux enjeux des producteurs bretons de plants de pomme de terre. Il y était expliqué que, dans ses plans de croisement, la station peut être amenée à intégrer des géniteurs obtenus par l’INRA à partir d’espèces sauvages ayant pour quasi seul point commun avec notre pomme de terre classique son appartenance à la famille des Solanacées tubéreuses. Pour Plants de Bretagne, Jean-Éric Chauvin, responsable du site INRA de Ploudaniel, s’est efforcé de nous expliquer avec beaucoup de pédagogie le principe de l’introduction d’un caractère sauvage dans une variété cultivée…

Published
2015

41. GENIUS project - Genome ENgineering Improvement for Useful plants of a Sustainable agriculture. [P.06]

Author

Nogue, Fabien, Vergne, Philippe, Chèvre, Anne-Marie, Chauvin, Jean-Eric, Bouchabke, Oumaya, Déjardin, Annabelle, Chevreau, Elisabeth, Hibrand-Saint Oyant, Laurence, Mazier, Marianne, Barret, Pierre, Guiderdoni, Emmanuel, Mathis, L., Sallaud, Christophe, Matt, Mireille, Pierron, Jean-Philippe, Bonnel, Eric, Foucrier, Séverine, Toppan, Alain, Trannoy, Laure, and Rogowsky, Peter

Subjects
H01 - Protection des végétaux - Considérations générales, F30 - Génétique et amélioration des plantes, H20 - Maladies des plantes
Abstract

World agriculture needs to guarantee food security, replace fossil resources, decrease its environmental impact and adapt to a changing global climate. Whereas France and other European countries presently choose to meet the genetic aspect of these challenges by the sole use of conventional breeding, an increasing number of agriculturally important countries enlarge the available gene pool via transgenesis. Despite certain political concerns transgenesis is already an indispensible technology for French seed companies and public scientists to remain competitive at an international level. Recent scientific advances in the field of transgenesis now provide answers to certain reserves of citizens and blur the border between breeding and transgenesis. In particular the advent of nuclease technology opens the way to extremely precise modifications of plant genomes at pre-determined sites. In this context it is strategic to ascertain top-level know-how in transgenesis in France, to actively participate in the debate of these new technologies and to demonstrate their applicability in a wide range of crop species. If successful, the project GENIUS (Genome ENgineering Improvement for Useful plants of a Sustainable agriculture) will provide French researchers and plant breeders with state of the art know-how, the necessary biological material and connected intellectual property rights for precise genome modifications in a variety of crop species, laying the basis for high throughput functional genomics and efficient plant breeding. Proof of concept will concern disease resistance, salt tolerance, plant architecture and quality traits. Studies on the regulatory, economical and philosophical context will complement the experimental work. To reach these goals, in an unprecedented effort, GENIUS has assembled a consortium of 15 public and private partners - 10 public research units in biological or social sciences with 5 biotechnology and seed companies. This consortium will create synergy between field- or species-oriented entities into a technology-oriented community. The project started on September 1st, 2012 and will be developed over a period of 7 years and 4 months.

Published
2015

43. PROJET 'ARCHIDEMIO'. Modéliser les interactions entre développement de la plante, architecture du couvert et épidémies de maladies fongiques aériennes, pour une gestion durable des cultures

Author

Calonnec, Agnes, Richard, Benjamin, Andrivon, Didier, Baranger, Alain, Chauvin, Jean-Eric, Faivre, Robert, Casadebaig, Pierre, Guyader, Sébastien, Bussière, François, Langlais, Michel, Tivoli, Bernard, Santé Végétale (SV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agrosystèmes tropicaux (ASTRO), Institut de Mathématiques de Bordeaux (IMB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Projet financé par l'Agence Nationale de la Recherche (ANR) ARCHIDEMIO ANR-08-STRA-04

Subjects
Plant architecture, [SDV]Life Sciences [q-bio], Epidémies, Microclimat, Host-pathogen models, Microclimate, Dispersion, Architecture des plantes, Epidemics, Infection, Modèle hôte-pathogène
Abstract

International audience; In the ANR project “Archidemio” (2009 - 2012, SYSTERRA), we explored whether characteristics of the plant and the canopy (architecture, development, resistance levels) could be major determinants of epidemic development of air-borne diseases and could be used as control strategies in integrated plant protection. The project was structured in three main parts: 1) The construction of a generic model coupling host plant growth and fungal epidemics development, 2) the improvement of knowledge about four pathosystems (vine / powdery mildew, yam / anthracnose, peas / ascochyta blight, potato / downy mildew) and their characteristics (sensitivity to microclimate and susceptibility of the plant), and potential levers (genetic, or crop management), 3) the proposal of crop management scenarios at the plant level (architecture / genotype - ideotypes) and / or crop level (density, size, pruning).; Dans le projet ANR « Archidemio » (2009 – 2012, appel d’offre SYSTERRA), nous avons exploré si les caractéristiques de la plante et du couvert végétal (architecture, développement, niveaux de résistance) pouvaient être des déterminants majeurs du développement épidémique des maladies aériennes, et de leur maîtrise dans des stratégies intégrées de phytoprotection. Le projet était structuré en trois grands volets : 1) La construction d’un modèle générique couplant le développement de la plante et le développement épidémique de maladies aériennes fongiques, 2) L’acquisition de connaissances sur 4 pathosystèmes (vigne/oïdium, igname/anthracnose, pois/ascochytose, pomme de terre/mildiou) en fonction de leur caractéristiques (sensibilité au micro-climat et à la plante), et des leviers potentiels activables côté plante (génétique, conduite de la culture), 3) L’élaboration de scénarii de gestion au niveau de la plante (architecture / génotype - idéotypes variétaux) et/ou de la culture (densité, taille, tuteurage).

Published
2013

44. Projet Archidémio: Surface foliaire et mildiou étroitement liés

Author

Chauvin, Jean-Eric, Esnault, Florence, Pellé, Roland, Andrivon, Didier, Gaucher, Denis, Faivre, Robert, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ARVALIS - Institut du végétal [Paris], Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (ancêtre de MIAT) (UBIA), and Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA)

Subjects
health care facilities, manpower, and services, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, education, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [INFO]Computer Science [cs], [MATH]Mathematics [math], health care economics and organizations
Abstract

National audience; Un projet, baptisé Archidémio, a permis d'explorer des stratégies de lutte prenant en compte le développement aérien de la plante de pomme de terre et son architecture pour lutter contre les épidémies de mildiou.

Published
2013

45. PROJET 'ARCHIDEMIO'. Modéliser les interactions entre développement de la plante, architecture du couvert et épidémies de maladies fongiques aériennes, pour une gestion durable des cultures

Author

Richard, Benjamin, Andrivon, Didier, Baranger, Alain, Chauvin, Jean-Eric, Faivre, Robert, Casadebaig, Pierre, Guyader, Sébastien, Bussière, François, Langlais, Michel, Tivoli, Bernard, and Calonnec, Agnes

Subjects
anthracnose, approche génétique, microclimat, lutte intégrée, pathosystème, canopée, interaction hôte pathogène, modèle, itinéraire technique, Architecture des plantes, Epidémies, Microclimat, Modèle hôte-pathogène, Infection, Dispersion, Plant architecture, Epidemics, Microclimate, Host-pathogen models, infection, maladie fongique, ideotype, oïdium de la vigne, dioscorea, pois, mildiou, pomme de terre, épidémiologie, modèle hôte-pathogène, dispersion, génotype, vigne, épidémie, architecture de la plante
Abstract

Dans le projet ANR « Archidemio » (2009 – 2012, appel d’offre SYSTERRA), nous avons exploré si les caractéristiques de la plante et du couvert végétal (architecture, développement, niveaux de résistance) pouvaient être des déterminants majeurs du développement épidémique des maladies aériennes, et de leur maîtrise dans des stratégies intégrées de phytoprotection. Le projet était structuré en trois grands volets : 1) La construction d’un modèle générique couplant le développement de la plante et le développement épidémique de maladies aériennes fongiques, 2) L’acquisition de connaissances sur 4 pathosystèmes (vigne/oïdium, igname/anthracnose, pois/ascochytose, pomme de terre/mildiou) en fonction de leur caractéristiques (sensibilité au micro-climat et à la plante), et des leviers potentiels activables côté plante (génétique, conduite de la culture), 3) L’élaboration de scénarii de gestion au niveau de la plante (architecture / génotype - idéotypes variétaux) et/ou de la culture (densité, taille, tuteurage)., In the ANR project “Archidemio” (2009 - 2012, SYSTERRA), we explored whether characteristics of the plant and the canopy (architecture, development, resistance levels) could be major determinants of epidemic development of air-borne diseases and could be used as control strategies in integrated plant protection. The project was structured in three main parts: 1) The construction of a generic model coupling host plant growth and fungal epidemics development, 2) the improvement of knowledge about four pathosystems (vine / powdery mildew, yam / anthracnose, peas / ascochyta blight, potato / downy mildew) and their characteristics (sensitivity to microclimate and susceptibility of the plant), and potential levers (genetic, or crop management), 3) the proposal of crop management scenarios at the plant level (architecture / genotype - ideotypes) and / or crop level (density, size, pruning).

Published
2013

46. Quelle architecture des couverts végétaux pour mieux résister aux épidémies ?

Author

Bourget, Dorothée, Andrivon, Didier, Tivoli, Bernard, Baranger, Alain, Pasco, Claudine, Marquer, Bruno, Langrume, Christophe, Chauvin, Jean-Eric, Journaliste, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
résistance aux maladies, couvert végétal, [SDV]Life Sciences [q-bio], pea, architecture des plantes, plant canopy, génétique, développement de la maladie, resistance to diseases, modèle mathématique, pois, pomme de terre, mildiou, potato, résistance, épidémiologie végétale, épidémie, mildew, mathematical model, développement
Abstract

Au-delà de ses facteurs génétiques de résistance, comment peut-on utiliser la plante en tant que structure végétale architecturalement défavorable à la propagation des maladies fongiques ? Mené de 2009 à 2012 au sein de l'INRA, le projet ARCHIDEMIO s'est attaché à étudier quels éléments du développement de la plante et de l'architecture du couvert végétal pouvaient influencer le développement des maladies.Un des résultats majeurs du projet est la conception d'un modèle mathématique générique, simulant à la fois la dynamique de développement de la plante et du couvert et celle de la maladie. Il est alimenté par une série d'expérimentations ciblées. La pomme de terre et son agresseur de toujours le mildiou figurent parmi les espèces étudiées et va bénéficier des développements attendus de ce travail.

Published
2012

47. Integration of cryopreservation in French plant genetic resource collections: the CRYOVEG project

Author

Engelmann, Florent, Balsemin Lerigoleur, Emilie, Barreneche, Teresa, Chatelet, Philippe, Chauvin, Jean-Eric, Couturon, Emmanuel, Curk, Franck, Dantec, Marie Ange, Decourcelles , Thibault, Dussert, Stéphane, Feugey, Laurence, Froelicher, Yann, Fouihaux, Lydie, Gamiette, Franciane, Grapin, Agnès, Grisoni, Michel, Guérif, Philippe, Guyader, Arnaud, Label-Richardson, Alain, Luro, François, Moulin, Bernard, Muller, Martine, Peyriere, André, Prigent, Yvon, Renard, Michel, Roux-Cuvelier, Michel, Roques, Danièle, Rubens , Suzia, Sapotille, Jocelyne, Souchet, Catherine, Sylvestre, David, and Teyssedre, David

Published
2012

48. Analysis of volunteer density under the influence of cropping practices: a contribution to the modelling of primary inoculum of Phytophthora infestans in potato crops

Author

Rakotonindraina, Toky, Corbiere, Roselyne, Chatot, Catherine, Pinchon, Valérie, Dubois, Laurence, Aurousseau, Frederique, Chauvin, Jean-Eric, Aubertot, Jean-Noel, AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Germicopa, Chambre Régionale d'Agriculture de Picardie, DGAL SDQPV, Station de Recherche Comité Nord, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ProdInra, Migration, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, and Comité Nord Plants de Pommes de Terre

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, potato volunteer, [SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, food and beverages, cropping practices, primary inoculum, [SHS]Humanities and Social Sciences, [SDV] Life Sciences [q-bio], modelling, solanum tuberosum, [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SHS] Humanities and Social Sciences, phytophthora infestans
Abstract

International audience; In order to improve current potato late blight risk assessment, potato volunteer distribution and densities have been studied in different agricultural environments. Preliminary mathematical approach helped designing sample size for field collecting data; the quadrat method was adopted with variable sample sizes. Large set of data have been collected in two contrasting potato producing regions. Only volunteer densities as influenced by cropping practices (waste piles or volunteers as weeds) and climatic conditions are presented in this report. High densities are found on waste piles whereas volunteer as weeds are dispersed in decreasing densities according the ability of the crop to cover the soil: important density in artichokes, moderate in cereals (wheat, barley) and low in ray-grass. Further implementation of the observed data will help simulate primary inoculum production and optimize predictive quality of current decision support systems, given the fact that any potato volunteer occurrence, even in its lowest expression, is a key factor to the setting of late blight epidemics in the vicinity of a growing potato crop.

Published
2011

49. La conservation et la connaissance des ressources génétiques d'espèces végétales cultivées: un enjeu pour l'agriculture et un défi pour les acteurs

Author

Geoffriau, Emmanuel, Pitrat, Michel, Coquin, Pascal, Balfourier, François, Brand-Daunay, M-Christin, Esnault, Florence, Jouy, Chrystelle, Chauvin, Jean-Eric, Label-Richardson, Alain, Boulineau, Francois, Burck, Helene, Feugey, Laurence, Maisonneuve, Brigitte, Balsemin, Emilie, Lambert, Claudie, Sage-Palloix, Anne-Marie, Barreneche, Teresa, Delaitre, Catherine, Fourtier, Stéphane, Zanetto, Anne, Grapin, Agnès, Prosperi, Jean-Marie, Didier, Audrey, Génétique et Horticulture (GenHort), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), 0867 Gip Geves Brion, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Accueil GEVES (Accueil GEVES)-Groupe d'étude et de controle des variétés et des semences (GEVES)-Gip Geves Brion (Gip Geves Brion), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), 1346 Ressources Génétiques Végétales en Conditions Océaniques, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ressources Génétiques Végétales en Conditions Océaniques (RGCO), 0621 Gip Geves Cavaillon, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Accueil GEVES (Accueil GEVES)-Groupe d'étude et de controle des variétés et des semences (GEVES)-Gip Geves Cavaillon (Gip Geves Cavaillon), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Espèces Fruitières (UREF), Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses à Graines (UMRLEG) (UMR 102), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Domaine expérimental de Melgueil (MONTP MELGUEIL UE), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Ressources Génétiques Végétales en Conditions Océaniques (RGCO), Unité de recherche Génétique et amélioration des fruits et légumes (GALF), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Angers (UA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement

Subjects
GENETIQUE VEGETALE, [SDV]Life Sciences [q-bio], collection, diversification des espèces, ressource génétique, sélection végétale
Abstract

absent

Published
2011

50. Integration of cryopreservation in French plant genetic resource collections: the CRYOVEG project

Author

Engelmann, F., Balsemin, E., Barreneche, T., Chatelet, P., Chauvin, Jean-Eric, Couturon, E., Curk, F., Dantec, M.A., Dantec, J.P., Decourcelles, T., Dussert, S., Feugey, L., Froelicher, Y., Fouilhaux, L., Gamiette, F., Grapin, Agnès, Grisoni, Michel, Guérif, P., Guyader, A., Label, A., Génétique et Horticulture (GenHort), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
LEGUME RACINE, CULTURE IN VITRO, POMME DE TERRE, IGNAME, FRUIT, CANNE A SUCRE, plant sciences, PLANTE MARAICHERE, CRYOCONSERVATION, PLANTE ALIMENTAIRE TROPICALE, BOURGEON, CONSERVATION DES RESSOURCES GENETIQUES, COLLECTION BOTANIQUE, PROJET DE RECHERCHE, [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, GRAINE
Abstract

This book represents contributions, oral as well as posters, of the final meeting of COST Action 871, CRYOPLANET (Cryopreservation of crop species in Europe) held in Angers. Local organizers of the meeting were Dr. Agnès Grapin (AGROCAMPUS OUEST – Angers) and Dr. Florent Engelmann (Institut de Recherche pour le Développement). COST Action 871 started in December 2006 with a Kick-off meeting at the COST office in Brussels and officially ended in December 2010. Twenty-one COST Action Countries (see figure 1) and 3 non-COST institutes (New Zealand Institute for Crop & Food Research (New Zealand), Vavilov Institute of Plant Industry (Russian Federation), Faculté des Sciences de Sfax (Tunisia) participated actively in this initiative. The Action was created because plant cryobiologists realized that plant cryopreservation was hardly applied in Europe. This was mainly due to the fact that efficient and robust cryopreservation protocols applicable to many plant species and diverse germplasm types were not available, plant researchers were unacquainted to recent developments in cryogenic storage methods and there was a lack of coordinated research in Europe on plant cryopreservation. The main objective of this action was therefore “to improve and apply technologically advanced techniques for plant genetic resources conservation of crops that are grown/ and or conserved in Europe with main emphasis on long-term conservation through cryopreservation”. In order to achieve this, 2 working groups (WGs) were established

Published
2011

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