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1. Angiogenin Expression during Early Human Placental Development; Association with Blood Vessel Formation

Author: Séverine A. Degrelle, Jean-Louis Frendo, Josette Badet, Danièle Evain-Brion, Jean Guibourdenche, Nadine Pavlov, Badet, Josette, Université de Lorraine (UL), Physiopathologie et Pharmacotoxicologie Placentaire Humaine (U1139), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de biologie du développement (CBD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'endocrinologie clinique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), PremUp Foundation, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-CHI Créteil-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Association de la Recherche sur le Cancer, Ligue contre le Cancer, Novo Nordisk Pharmaceutics, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHI Créteil-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lorraine ( UL ), Physiopathologie et Pharmacotoxicologie Placentaire Humaine ( U1139 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Cochin [AP-HP]-Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Sorbonne Universités-Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -CHI Créteil-Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 )
Subjects: CD31, medicine.medical_specialty, Article Subject, placenta, Angiogenin, Angiogenesis, Primary Cell Culture, lcsh:Medicine, Biology, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, vasculogenesis, angiogenesis, chemistry.chemical_compound, Vasculogenesis, Pregnancy, Internal medicine, Placenta, [SDV.BDD] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, medicine, Humans, [ SDV.BDD ] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, development, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, In Situ Hybridization, [SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, General Immunology and Microbiology, lcsh:R, Decidua, Endothelial Cells, Gene Expression Regulation, Developmental, Trophoblast, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, Ribonuclease, Pancreatic, General Medicine, trophoblast, Placentation, Trophoblasts, Cell biology, Vascular endothelial growth factor, [ SDV.BDLR ] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, medicine.anatomical_structure, Endocrinology, chemistry, embryonic structures, Blood Vessels, Female, Chorionic Villi, angiogenin, Research Article
Abstract: The placenta is a transient organ essential for fetal development. During human placental development, chorionic villi grow in coordination with a large capillary network resulting from both vasculogenesis and angiogenesis. Angiogenin is one of the most potent inducers of neovascularisation in experimental modelsin vivo. We and others have previously mapped angiogenin expression in the human term placenta. Here, we explored angiogenin involvement in early human placental development. We studied, angiogenin expression byin situhybridisation and/or by RT-PCR in tissues and primary cultured trophoblastic cells and angiogenin cellular distribution by coimmunolabelling with cell markers: CD31 (PECAM-1), vascular endothelial cadherin (VE-cadherin), vascular endothelial growth factor receptor-2 (VEGF-R2), Tie-2, von Willebrand factor, CD34, erythropoeitin receptor (Epo-R), alpha-smooth muscle actin, CD45, cytokeratin 7, and Ki-67. Extravillous and villous cytotrophoblasts, isolated and differentiatedin vitro, expressed and secreted angiogenin. Angiogenin was detected in villous trophoblastic layers, and structured and nascent fetal vessels. In decidua, it was expressed by glandular epithelial cells, vascular cells and macrophages. The observed pattern of angiogenin expression is compatible with a role in blood vessel formation and in cross-talk between trophoblasts and endothelial cells. In view of angiogenin properties, we suggest that angiogenin may participate in placental vasculogenesis and organogenesis.
Published: 2014

2. Shifted, the Drosophila Ortholog of Wnt Inhibitory Factor-1, Controls the Distribution and Movement of Hedgehog

Author: Michael A. Halbisen, Bruno Glise, Alain Vincent, Michèle Crozatier, Steve Wise, Catherine A. Miller, David J. Olson, Seth S. Blair, Institut de Recherches et d'Etudes sur le Monde Arabe et Musulman (IREMAM), Sciences Po Aix - Institut d'études politiques d'Aix-en-Provence (IEP Aix-en-Provence)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anatomopathologie Haut-Lévêque (ANATOMOPATHOLOGIE), CHU, Clinical Neurology Oxford (CLINICAL NEUROLOGY), Hospital, Departement /u661 : Endocrinologie, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de synthèse organique (DCSO), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Institut de Recherches et d'Etudes sur les Mondes Arabes et Musulmans (IREMAM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), École polytechnique (X)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherches et d'Etudes sur le Monde Arabe et Musulman ( IREMAM ), Sciences Po Aix - Institut d'études politiques d'Aix-en-Provence ( IEP Aix-en-Provence ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique ( LaBRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Anatomopathologie Haut-Lévêque ( ANATOMOPATHOLOGIE ), Clinical Neurology Oxford ( CLINICAL NEUROLOGY ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de synthèse organique ( DCSO ), École polytechnique ( X ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: Male, MESH: Signal Transduction, MESH : Molecular Sequence Data, MESH: Sequence Homology, Amino Acid, MESH: Drosophila, MESH : Animals, Genetically Modified, Sequence Homology, MESH : Models, Biological, MESH: Amino Acid Sequence, Wing, MESH: Cholesterol, 0302 clinical medicine, Models, Drosophila Proteins, MESH : Female, MESH: Animals, MESH : Cholesterol, Genetics, 0303 health sciences, biology, MESH : Amino Acid Sequence, Wnt signaling pathway, Signal transducing adaptor protein, MESH : Sequence Homology, Amino Acid, Hedgehog signaling pathway, Cell biology, MESH : Phenotype, Amino Acid, Imaginal disc, Cholesterol, Phenotype, MESH: Repressor Proteins, Drosophila, Female, MESH : Mutation, MESH : Repressor Proteins, MESH : Carrier Proteins, Drosophila melanogaster, Signal transduction, MESH : Heparan Sulfate Proteoglycans, Drosophila Protein, Signal Transduction, MESH: Mutation, animal structures, MESH: Drosophila Proteins, MESH : Male, Molecular Sequence Data, MESH : Wing, Genetically Modified, MESH: Carrier Proteins, MESH: Phenotype, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, MESH: Animals, Genetically Modified, 03 medical and health sciences, Animals, Humans, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Amino Acid Sequence, MESH : Drosophila, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Molecular Biology, Hedgehog, Alleles, 030304 developmental biology, MESH : Signal Transduction, MESH: Humans, MESH: Molecular Sequence Data, MESH: Alleles, MESH : Humans, MESH: Models, Biological, Cell Biology, MESH : Drosophila Proteins, Biological, MESH: Wing, biology.organism_classification, MESH: Male, Repressor Proteins, Mutation, MESH: Heparan Sulfate Proteoglycans, MESH : Animals, MESH : Alleles, Carrier Proteins, MESH: Female, Heparan Sulfate Proteoglycans, 030217 neurology & neurosurgery, Developmental Biology
Abstract: SummaryWe here identify and characterize an extracellular modulator of Hedgehog signaling in Drosophila, Shifted. Shifted is required for high levels of long-range signaling in the developing wing imaginal disc. Surprisingly, shifted encodes the only Drosophila ortholog of the secreted vertebrate protein Wnt Inhibitory Factor-1 (WIF-1), whose known role is to bind to extracellular Wnts and inhibit their activity. However, Shifted does not regulate Hedgehog signaling by affecting Wingless or Wnt signaling. We show instead that Shifted is a secreted protein that acts over a long distance and is required for the normal accumulation of Hh protein and its movement in the wing. Our data further indicate that Shf interacts with Hh and the heparan sulfate proteoglycans. Therefore, we propose that Shf stabilizes the interaction between Hh and the proteoglycans, an unexpected role for a member of the WIF-1 family.
Published: 2005

3. Patterns in evolution: veins of the Drosophila wing

Author: Bruno Glise, Alain Vincent, Michèle Crozatier, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Anatomopathologie Haut-Lévêque (ANATOMOPATHOLOGIE), CHU, Clinical Neurology Oxford (CLINICAL NEUROLOGY), Hospital, Laboratoire de synthèse organique (DCSO), École polytechnique (X)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique ( LaBRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Anatomopathologie Haut-Lévêque ( ANATOMOPATHOLOGIE ), Clinical Neurology Oxford ( CLINICAL NEUROLOGY ), Departement /u661 : Endocrinologie, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de synthèse organique ( DCSO ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École polytechnique ( X ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)
Subjects: MESH: Signal Transduction, MESH: Drosophila, Cellular differentiation, Wing, 0302 clinical medicine, Receptors, MESH: Gene Expression Regulation, Developmental, Morphogenesis, Wings, Animal, Drosophila Proteins, Developmental, MESH: Animals, MESH : Evolution, Genetics, 0303 health sciences, Receptors, Notch, MESH: Genomics, Gene Expression Regulation, Developmental, Cell Differentiation, Genomics, Biological Evolution, Imaginal disc, Drosophila, MESH: Membrane Proteins, MESH : Cell Differentiation, Drosophila Protein, Signal Transduction, MESH: Cell Differentiation, Notch, animal structures, Evolution, MESH: Drosophila Proteins, MESH : Wing, Notch signaling pathway, Biology, 03 medical and health sciences, Species Specificity, Drosophilidae, MESH: Evolution, MESH : Species Specificity, Animals, MESH: Species Specificity, Hedgehog Proteins, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH : Drosophila, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Hedgehog, 030304 developmental biology, MESH : Signal Transduction, Decapentaplegic, MESH : Genomics, Membrane Proteins, MESH : Drosophila Proteins, MESH: Wing, biology.organism_classification, MESH: Morphogenesis, Gene Expression Regulation, MESH : Membrane Proteins, MESH : Morphogenesis, Evolutionary biology, MESH : Receptors, Notch, MESH : Animals, MESH : Gene Expression Regulation, Developmental, MESH: Receptors, Notch, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: The development of the Drosophila wing is a classical model for studying the genetic control of tissue size, shape and patterning. A detailed picture of how positional information is interpreted by cells in the imaginal disc and translated into the adult wing vein pattern has recently emerged. It highlights the central role of dose-dependent activation of distinct cell transcription programs in response to the Hedgehog (Hh) and Decapentaplegic (Dpp) morphogens, as well as an early role of Notch signalling, in connecting the positioning of vein primordia and vein differentiation proper. The biochemical basis of the cross-talk that operates between these different signalling pathways is less well understood. New strategies made possible by the genome sequencing of several insect models should provide an important complement to the knowledge obtained from >60 years of genetic studies.
Published: 2004

4. Vein-positioning in the Drosophila wing in response to Hh; new roles of Notch signaling

Author: Michèle Crozatier, Alain Vincent, Bruno Glise, Vanessa Khemici, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Anatomopathologie Haut-Lévêque (ANATOMOPATHOLOGIE), CHU, Clinical Neurology Oxford (CLINICAL NEUROLOGY), Hospital, Laboratoire de synthèse organique (DCSO), École polytechnique (X)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique ( LaBRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Anatomopathologie Haut-Lévêque ( ANATOMOPATHOLOGIE ), Clinical Neurology Oxford ( CLINICAL NEUROLOGY ), Departement /u661 : Endocrinologie, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de synthèse organique ( DCSO ), École polytechnique ( X ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)
Subjects: MESH: Signal Transduction, Embryology, MESH: Drosophila, MESH : Genotype, MESH : Models, Biological, Wing, MESH: Genotype, MESH: Protein Structure, Tertiary, 0302 clinical medicine, Models, Receptors, MESH: Gene Expression Regulation, Developmental, Wings, Animal, Drosophila Proteins, Developmental, MESH: Animals, In Situ Hybridization, Regulation of gene expression, 0303 health sciences, Receptors, Notch, Rhomboid, Gene Expression Regulation, Developmental, MESH : In Situ Hybridization, Anatomy, Cell biology, Imaginal disc, Drosophila, MESH: Membrane Proteins, MESH : Mutation, MESH : Protein Structure, Tertiary, Drosophila Protein, Signal Transduction, MESH: Body Patterning, Protein Structure, Notch, MESH: Mutation, Genotype, MESH: Drosophila Proteins, Notch signaling pathway, MESH : Wing, Biology, Models, Biological, Veins, 03 medical and health sciences, MESH: In Situ Hybridization, Compartment (development), Animals, Primordium, Hedgehog Proteins, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH : Drosophila, Hedgehog, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, 030304 developmental biology, Body Patterning, MESH : Signal Transduction, MESH: Veins, MESH : Veins, MESH: Models, Biological, Membrane Proteins, MESH : Body Patterning, MESH : Drosophila Proteins, Biological, MESH: Wing, Protein Structure, Tertiary, Gene Expression Regulation, MESH : Membrane Proteins, MESH : Receptors, Notch, Mutation, MESH : Animals, MESH : Gene Expression Regulation, Developmental, MESH: Receptors, Notch, 030217 neurology & neurosurgery, Tertiary, Developmental Biology
Abstract: The Drosophila wing is a classical model for studying the generation of developmental patterns. Previous studies have suggested that vein primordia form at boundaries between discrete sectors of gene expression along the antero-posterior (A/P) axis in the larval wing imaginal disc. Observation that the vein marker rhomboid (rho) is expressed at the centre of wider vein-competent domains led to propose that narrow vein primordia form first, and produce secondary short-range signals activating provein genes in neighbouring cells (see Curr. Opin. Genet. Dev. 10 (2000) 393). Here, we examined how the central L3 and L4 veins are positioned relative to the limits of expression of Collier (Col), a dose-dependent Hedgehog (Hh) target activated in the wing A/P organiser. We found that rho expression is first activated in broad domains adjacent to Col-expressing cells and secondarily restricted to the centre of these domains. This restriction which depends upon Notch (N) signaling sets the L3 and L4 vein primordia off the boundaries of Col expression. N activity is also required to fix the anterior limit of Col expression by locally antagonising Hh activation, thus precisely positioning the L3 vein primordium relative to the A/P compartment boundary. Experiments using Nts mutants further indicated that these two activities of N could be temporally uncoupled. Together, these observations highlight new roles of N in topologically linking the position of veins to prepattern gene expression.
Published: 2003
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5. Dual regulation of SPI1/PU.1 transcription factor by heat shock factor 1 (HSF1) during macrophage differentiation of monocytes

Author: Costis Papanayotou, Eric Solary, V Lallemand-Mezger, G. Wettstein, Laurence Duplomb, David Lanneau, A Le Mouël, Nathalie Droin, K Berthenet, Carmen Garrido, Philippe Bonniaud, Gaëtan Jego, P-S Bellaye, Arnaud Jacquel, François Girodon, Arlette Hamman, E Christians, A de Thonel, Adonis Hazoumé, Centre épigénétique et destin cellulaire (EDC (UMR_7216)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Hématopoïèse normale et pathologique, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris XI, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Physiopathologie de la survie et de la mort cellulaire et infection virale, Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-IFR50-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Génétique des Anomalies du Développement (GAD), Université de Bourgogne (UB)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Paris Cité, Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre de biologie du développement (CBD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER, This'Investissements d'Avenir' (ANR 11 LABX -0021), Ligue Nationale Contre le Cancer, Association pour la Recherche sur le Cancer , Institut National du Cancer (CG), FEDER., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon ( ENSBANA ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR50-Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ), Génétique des Anomalies du Développement ( GAD ), IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Université de Bourgogne ( UB ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Centre épigénétique et destin cellulaire ( EDC ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Jacques Monod ( IJM ), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Régional de Lutte contre le cancer - Centre Georges-François Leclerc ( CRLCC - CGFL ), Université de Bourgogne (UB), Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France, and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Subjects: Cancer Research, Cellular differentiation, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], Mice, 0302 clinical medicine, Heat Shock Transcription Factors, HSF1, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Cells, Cultured, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Regulation of gene expression, 0303 health sciences, Mice, Inbred BALB C, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, Hematology, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], 3. Good health, DNA-Binding Proteins, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, monocytes, Proteasome Endopeptidase Complex, Antigens, Differentiation, Myelomonocytic, Receptors, Cell Surface, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, 03 medical and health sciences, Antigens, CD, Heat shock protein, Proto-Oncogene Proteins, transcription factors, Animals, Humans, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [ SDV.BDD ] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Transcription factor, 030304 developmental biology, SPI1, Macrophages, heat-shock proteins, fungi, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Molecular biology, Hsp70, Heat shock factor, Mice, Inbred C57BL, cell differentiation, Gene Expression Regulation, Trans-Activators, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; : In addition to their cytoprotective role in stressful conditions, heat shock proteins (HSPs) are involved in specific differentiation pathways, e.g. we have identified a role for HSP90 in macrophage differentiation of human peripheral blood monocytes exposed to Macrophage Colony-Stimulating Factor (M-CSF). Here, we show that deletion of the main transcription factor involved in heat shock gene regulation, heat shock factor 1 (HSF1), affects M-CSF-driven differentiation of mouse bone marrow cells. HSF1 transiently accumulates in the nucleus of human monocytes undergoing macrophage differentiation, including M-CSF-treated peripheral blood monocytes and phorbol ester-treated THP1 cells. We demonstrate that HSF1 has a dual effect on SPI1/PU.1, a transcription factor essential for macrophages differentiation and whose deregulation can lead to the development of leukemias and lymphomas. First, HSF1 regulates SPI1/PU.1 gene expression through its binding to a Heat Shock Element (HSE) within the intron 2 of this gene. Furthermore, down-regulation or inhibition of HSF1 impaired both SPI1/PU.1 targeted gene transcription and macrophage differentiation. Secondly, HSF1 induces the expression of HSP70 that interacts with SPI1/PU.1 to protect the transcription factor from proteasomal degradation. Taken together, HSF1 appears as a fine-tuning regulator of SPI1/PU.1 expression at the transcriptional and post-translational levels during macrophage differentiation of monocytes.Leukemia accepted article preview online, 7 February 2014; doi:10.1038/leu.2014.63.
Published: 2014

6. Modélisation mathématique de l'allongement de l'axe antéro-postérieur de l'embryon vertébré

Author: Romanos, Michèle, Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Sabatier - Toulouse III, Bertrand Benazeraf, and Ariane Houllier - Trescases
Subjects: Continuum mechanics, Cross diffusion, Modélisation, Modeling, Morphogenesis, Mécanique des milieux continus, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, PDE, EDP, Diffusion croisée, Morphogenèse
Abstract: During vertebrate embryo development, thousands of cells self-organize in a very precise and complex choreography to form the tissues and organs of the future adult. The objective of this thesis is to understand the mechanisms orchestrating the morphogenesis of the tissues which form the caudal part of the embryo, by combining mathematical, numerical, and experimental approaches. In the first part, we develop hydrodynamic multi-species mathematical models based on partial differential equations, to understand how the neural and mesodermal tissues form during embryo elongation. These models consider biological properties observed in the embryo such as tissue growth and viscosity, and inter-tissue interaction. By deriving free boundary problems and transmission problems, we analyse tissue dynamics and obtain qualitative properties of the mathematical models: pressure jump, ghost effect. Biological hypotheses on the cellular and tissular mechanisms governing tissue dynamics emerge from our theoretical analysis of the models, which we then confirm experimentally by integrating the biological data to the mathematical models. In the second part, we take a closer look at the cell behaviour during the growth of bird embryos. We conduct biological experiments on stem-like cells to investigate the effect of two proteins in cell specification and migration. We discover a zone where cells are spatially heterogeneous in their protein expression. We then develop an agent-based model that considers cell specification and migration to understand the role of this heterogeneity. The model highlights a surprising paradox: chaos (heterogeneity) can sustain an apparently very ordered process (morphogenesis). Through an interdisciplinary approach, our multi-scale analysis of tissue growth reveals the underlying cellular mechanisms governing tissue formation. The results in this thesis rely on the development of adequate mathematical tools (incompressible limit, free boundary problems) which go beyond the scope of developmental biology (viscous fluid mechanics, tissue growth and oncology).; Au cours du développement de l'embryon de vertébré, des milliers de cellules s'auto-organisent suivant une chorégraphie très précise et complexe pour former les tissus et les organes du futur adulte. L'objectif de cette thèse est de comprendre les mécanismes régissant la morphogenèse des tissus qui constituent la partie caudale de l'embryon, en combinant des approches mathématiques, numériques et expérimentales. Dans la première partie, nous développons des modèles mathématiques hydrodynamiques multi-espèces basés sur des équations aux dérivées partielles, pour comprendre comment les tissus neuraux et mésodermiques se forment pendant l'allongement de l'embryon. Ces modèles prennent en compte les propriétés biologiques observées dans l'embryon telles que la croissance et la viscosité des tissus, ainsi que l'interaction inter-tissulaire. En dérivant des problèmes à frontières libres et des problèmes de transmission, nous analysons la dynamique des tissus et obtenons des propriétés qualitatives des modèles mathématiques : saut de pression, effet fantôme. Il émerge de notre analyse théorique des modèles de nouvelles hypothèses biologiques sur les mécanismes cellulaires et tissulaires gouvernant la dynamique tissulaire, que nous confirmons ensuite expérimentalement en intégrant les données biologiques aux modèles mathématiques. Dans la deuxième partie, nous examinons de plus près le comportement des cellules pendant la croissance des embryons d'oiseau. Nous réalisons des expériences biologiques sur des cellules souches pour étudier l'effet de deux protéines dans la spécification et la migration cellulaire. Nous découvrons une zone où les cellules sont spatialement hétérogènes dans leur expression en protéines. Nous développons ensuite un modèle agent-centré qui prend en compte la spécification et la migration des cellules pour comprendre le rôle de cette hétérogénéité. Le modèle met en évidence un paradoxe surprenant : le chaos (l'hétérogénéité) peut soutenir un processus apparemment très ordonné (la morphogenèse). Grâce à une approche interdisciplinaire, notre analyse multi-échelle de la croissance des tissus révèle les mécanismes cellulaires sous-jacents qui régissent la formation des tissus. Les résultats de cette thèse reposent sur le développement d'outils mathématiques adéquats (limite incompressible, problèmes à frontières libres) qui dépassent le cadre de la biologie du développement (mécanique des fluides visqueux, croissance des tissus et oncologie).
Published: 2022

7. No evidence for mate copying in Danio rerio

Author: Sabine Nöbel, Xiaobo Wang, Marion Cristante, Marine Guëll, Juliette Tariel, Etienne Danchin, Myriam Roussigné, Institute for Advanced Study in Toulouse (IAST), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Evolution et Diversité Biologique (EDB), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT), ANR-10-LABX-0041,TULIP,Towards a Unified theory of biotic Interactions: the roLe of environmental(2010), ANR-11-IDEX-0002,UNITI,Université Fédérale de Toulouse(2011), ANR-13-BSV7-0007,SOC-H2,L'hérédité sociale comme processus de biodiversité(2013), and ANR-10-LABX-1401,'Investissements d'avenir',ANR-10-LABX-14-01
Subjects: social learning, Behavioral Neuroscience, personality, [SDV]Life Sciences [q-bio], public information, Animal Science and Zoology, General Medicine, mate choice, mate copying, Public information Social learning Mate choice Mate copying Personality Zebrafish, zebrafish
Abstract: International audience; The zebrafish Danio rerio is an important model organism, but little is known about its mating preferences and how these are influenced by personality traits like boldness. In this study, we tested two strains of zebrafish and addressed whether females used social information to build a mating preference, a behavior called mate copying, and whether this social learning was affected by boldness. Thus, we provided positive social information for small males to test whether female zebrafish changed their mate preference after observing a pair of a small and a large male with a demonstrator female next to the small one. After that, we tested the observer female in a test maze to evaluate boldness. We found no significant evidence for mate copying as females did not change their preference for the small male after witnessing the large male alone and the small male interacting with another female and chose consistently larger males in a control without opportunity to copy. Whether the female was defined as shy or bold had no effect on mate copying. We conclude that mate copying is probably inexistent or only relatively weak in this species.
Published: 2023

8. The hematopoietic niche: a Drosophila model, at last

Author: Crozatier, Michèle, Krzemien, Joanna, Vincent, Alain, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anatomopathologie Haut-Lévêque (ANATOMOPATHOLOGIE), CHU, Clinical Neurology Oxford (CLINICAL NEUROLOGY), Hospital, Departement /u661 : Endocrinologie, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de synthèse organique (DCSO), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD), Haenlin, Marc, Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique ( LaBRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Anatomopathologie Haut-Lévêque ( ANATOMOPATHOLOGIE ), Clinical Neurology Oxford ( CLINICAL NEUROLOGY ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de synthèse organique ( DCSO ), École polytechnique ( X ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École polytechnique (X), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), École polytechnique (X)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: Hemocytes, Calcium-Binding Proteins, Membrane Proteins, Hematopoietic Stem Cells, Larva, Models, Animal, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Animals, Drosophila Proteins, Intercellular Signaling Peptides and Proteins, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Drosophila, Serrate-Jagged Proteins, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Biomarkers, Jagged-1 Protein, Transcription Factors
Abstract: The niche provides a specialised microenvironment necessary for maintenance of stem cells in a non differentiated state. While the hematopoietic stem cell (HSC) niche in vertebrates was the first to be recognized, Drosophila niches supporting germline stem cells were characterised first. Recent evidence for the existence of a niche maintaining hematopoietic precursors in Drosophila opens the way to study in vivo the niche/hematopoietic precursors interactions. The availability of a large collection of cell markers, mutants and sophisticated genetic tools makes Drosophila an attractive model for investigating the cellular and molecular mechanisms that are involved in these interactions.
Published: 2007

9. Development of a Conditional Bioluminescent Transplant Model for TPM3-ALK-Induced Tumorigenesis as a Tool to Validate ALK-Dependent Cancer Targeted Therapy

Author: Sylvie Giuriato, Dean W. Felsher, Georges Delsol, Nathalie Faumont, Marc Moreau, Fabienne Meggetto, Anne Bibonne, Talal Al Saati, Marianne Foisseau, Emilie Bousquet, Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Physique Théorique des Liquides ( LPTL ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Géographie Physique et Environnementale ( GEOLAB ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut Sciences de l'Homme et de la Société ( IR SHS UNILIM ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut national de recherches archéologiques préventives ( Inrap ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Université Clermont Auvergne ( UCA ), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée ( LPTMC ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques ( LCBPT - UMR 8601 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Physiologie intégrative, cellulaire et moléculaire ( PICM ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), HORIBA France SAS [Villeneuve d'Ascq], HORIBA Scientific [France], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (ex IFR 30 et IFR 150), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR30-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de biologie du développement (CBD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique des Liquides (LPTL), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Géographie Physique et Environnementale (GEOLAB), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC), Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT - UMR 8601), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiologie intégrative, cellulaire et moléculaire (PICM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Cancer Research, Oncogene Proteins, Fusion, medicine.medical_treatment, Tropomyosin, medicine.disease_cause, Tyrosine-kinase inhibitor, Targeted therapy, Mice, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Genes, Reporter, hemic and lymphatic diseases, Benzoquinones, Anaplastic Lymphoma Kinase, Luciferases, Anaplastic large-cell lymphoma, 0303 health sciences, Antibiotics, Antineoplastic, Protein-Tyrosine Kinases, 3. Good health, Cell Transformation, Neoplastic, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Lymphoma, Large-Cell, Anaplastic, Molecular Medicine, Growth inhibition, Tyrosine kinase, medicine.drug_class, Lactams, Macrocyclic, Mice, Nude, Biology, 03 medical and health sciences, medicine, Animals, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Protein Kinase Inhibitors, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, 030304 developmental biology, Pharmacology, Luminescent Agents, Oncogene, Receptor Protein-Tyrosine Kinases, Cancer, medicine.disease, Molecular biology, Disease Models, Animal, Rifabutin, chemistry, Cancer research, Drug Screening Assays, Antitumor, Carcinogenesis, Neoplasm Transplantation
Abstract: Overexpression and activation of TPM3-ALK tyrosine kinase fusion protein is a causal oncogenic event in the development of Anaplastic Large Cell Lymphoma and Inflammatory Myofibroblastic ALK-positive tumours. Thus, the development of ALK specific tyrosine kinase inhibitors is a current therapeutic challenge. Animal models are essential to assess, in vivo, the efficiency of ALK-oncogene inhibitors and to identify new and/or additional therapeutic targets in the ALK tumorigenesis pathway. Using the tetracycline system to allow conditional and concomitant TPM3-ALK and luciferase expression, we have developed a unique transplant model for bioluminescent TPM3-ALK-induced fibroblastic tumours in athymic nude mice. The reversible TPM3-ALK expression allowed us to demonstrate that this oncogene is essential for the tumour growth and its maintenance. In addition, we showed that this model could be used to precisely assess tumour growth inhibition upon ALK chemical inactivation. As proof of principle, we used the general tyrosine kinase inhibitor herbimycin A to inhibit ALK oncoprotein activity. As expected, herbimycin A treatment reduced tumour growth as assessed both by tumour volume measurement and bioluminescent imaging. We conclude that this transplant model for TPM3-ALK-induced tumours represents a valuable tool not only to accurately and rapidly evaluate in vivo ALK-targeted therapies but also to gain insight into the mechanism of ALK-positive tumour development.
Published: 2007

10. [The calcium, an object of study, astonishing, no?]

Author: Moreau, Marc, Ranjeva, Raoul, Laboratoire de Physique Théorique des Liquides (LPTL), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Géographie Physique et Environnementale (GEOLAB), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT - UMR 8601), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiologie intégrative, cellulaire et moléculaire (PICM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, HORIBA France SAS [Villeneuve d'Ascq], HORIBA Scientific [France], Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Surfaces Cellulaires et Signalisation chez les Végétaux (SCSV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique des Liquides ( LPTL ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Géographie Physique et Environnementale ( GEOLAB ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut Sciences de l'Homme et de la Société ( IR SHS UNILIM ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Université de Limoges ( UNILIM ) -Institut national de recherches archéologiques préventives ( Inrap ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Université Clermont Auvergne ( UCA ), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée ( LPTMC ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques ( LCBPT - UMR 8601 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Physiologie intégrative, cellulaire et moléculaire ( PICM ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Surfaces Cellulaires et Signalisation chez les Végétaux ( SCSV ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: MESH : Calcium Signaling, MESH : Gene Expression Regulation, MESH: Calcium, MESH: Animals, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH : Animals, MESH : Calcium, MESH: Calcium Signaling, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH: Gene Expression Regulation
Published: 2006

11. Coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1) is a positive regulator of the Cyclin E1 gene

Author: Lucas Fauquier, Carmen Rodríguez, Donghang Cheng, Laurence Vandel, Eric Fabbrizio, Charles Theillet, Selma El Messaoudi, Mark T. Bedford, Paul Chuchana, Claude Sardet, Identité et plasticité tumorale, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Génotypes et phénotypes tumoraux, CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Genotypes et Phenotypes Tumoraux, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier ( IGMM ), Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Montpellier 1 (UM1)-CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI)
Subjects: Protein-Arginine N-Methyltransferases, MESH : RNA, Messenger, MESH : NIH 3T3 Cells, Cell Culture Techniques, MESH: Protein-Arginine N-Methyltransferase, MESH : RNA, Small Interfering, Histones, Mice, 0302 clinical medicine, Genes, Reporter, MESH: RNA, Small Interfering, MESH : Cell Proliferation, MESH: Animals, RNA, Small Interfering, Luciferases, Promoter Regions, Genetic, MESH : Transcription Factor DP1, Cells, Cultured, MESH: Histones, MESH : Genes, cdc, Regulation of gene expression, Swiss 3T3 Cells, MESH : Trans-Activators, 0303 health sciences, MESH : Protein-Arginine N-Methyltransferase, Multidisciplinary, MESH: Kinetics, MESH : Gene Expression Regulation, Biological Sciences, MESH : Genes, Reporter, MESH: Gene Expression Regulation, MESH : Activin Receptors, Type I, Nucleosomes, MESH: Promoter Regions (Genetics), CCNE1 Gene, MESH: E2F Transcription Factors, 030220 oncology & carcinogenesis, MESH: Transcription Factor DP1, MESH : Kinetics, MESH: Activin Receptors, Type I, Transcription Factor DP1, MESH: Swiss 3T3 Cells, MESH: Cells, Cultured, MESH : Cell Culture Techniques, CARM1, MESH: Trans-Activators, MESH : Swiss 3T3 Cells, MESH : Nucleosomes, Biology, Methylation, MESH: Methylation, 03 medical and health sciences, MESH: Nucleosomes, MESH: Cell Proliferation, MESH : Mice, MESH : Cells, Cultured, MESH : Fibroblasts, Coactivator, Animals, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH : Histones, RNA, Messenger, MESH: Mice, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH: RNA, Messenger, MESH : E2F Transcription Factors, 030304 developmental biology, Cell Proliferation, MESH : Luciferases, MESH: Cell Culture Techniques, Reporter gene, Activator (genetics), MESH: Genes, Reporter, Promoter, MESH : Methylation, Fibroblasts, MESH : Promoter Regions (Genetics), Molecular biology, E2F Transcription Factors, Genes, cdc, MESH : MicroRNAs, Cyclin E1, Kinetics, MicroRNAs, MESH: Genes, cdc, Gene Expression Regulation, MESH: Fibroblasts, NIH 3T3 Cells, Trans-Activators, MESH: Luciferases, MESH : Animals, MESH: MicroRNAs, Activin Receptors, Type I, MESH: NIH 3T3 Cells
Abstract: The Cyclin E1 gene ( CCNE1 ) is an ideal model to explore the mechanisms that control the transcription of cell cycle-regulated genes whose expression rises transiently before entry into S phase. E2F-dependent regulation of the CCNE1 promoter was shown to correlate with changes in the level of H3-K9 acetylation/methylation of nucleosomal histones positioned at the transcriptional start site region. Here we show that, upon growth stimulation, the same region is subject to variations of H3-R17 and H3-R26 methylation that correlate with the recruitment of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (CARM1) onto the CCNE1 and DHFR promoters. Accordingly, CARM1-deficient cells lack these modifications and present lowered levels and altered kinetics of CCNE1 and DHFR mRNA expression. Consistently, reporter gene assays demonstrate that CARM1 functions as a transcriptional coactivator for their E2F1/DP1-stimulated expression. CARM1 recruitment at the CCNE1 gene requires activator E2Fs and ACTR, a member of the p160 coactivator family that is frequently overexpressed in human breast cancer. Finally, we show that grade-3 breast tumors present coelevated mRNA levels of ACTR and CARM1 , along with their transcriptional target CCNE1 . All together, our results indicate that CARM1 is an important regulator of the CCNE1 gene.
Published: 2006

12. Control of blood cell homeostasis in Drosophila larvae by the posterior signalling centre

Author: Laurence Dubois, Michèle Crozatier, Rami Makki, Alain Vincent, Joanna Krzemień, Marie Meister, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Département de Recherche sur l'Etat Condensé, les Atomes et les Molécules (DRECAM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie (IEMN) - UMR 8520 (IEMN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille-Université Polytechnique Hauts-de-France (UPHF)-Ecole Centrale de Lille-Université Polytechnique Hauts-de-France (UPHF)-Institut supérieur de l'électronique et du numérique (ISEN), Réponse immunitaire et developpement chez les insectes (RIDI - UPR 9002), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Fakultät für Ingenieurwissenschaften und Informatik, Universität Ulm - Ulm University [Ulm, Allemagne], Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anatomopathologie Haut-Lévêque (ANATOMOPATHOLOGIE), CHU, Clinical Neurology Oxford (CLINICAL NEUROLOGY), Hospital, Departement /u661 : Endocrinologie, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de synthèse organique (DCSO), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie - UMR 8520 (IEMN), Centrale Lille-Institut supérieur de l'électronique et du numérique (ISEN)-Université de Valenciennes et du Hainaut-Cambrésis (UVHC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Polytechnique Hauts-de-France (UPHF), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École polytechnique (X)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département de Recherche sur l'Etat Condensé, les Atomes et les Molécules ( DRECAM ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie (IEMN) - UMR 8520 ( IEMN ), Ecole Centrale de Lille-Institut supérieur de l'électronique et du nunérique (ISEN)-Université de Valenciennes et du Hainaut-Cambresis ( UVHC ) -Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Réponse immunitaire et developpement chez les insectes ( RIDI - UPR 9002 ), Institut de biologie moléculaire et cellulaire ( IBMC ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Universität Ulm, Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique ( LaBRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Anatomopathologie Haut-Lévêque ( ANATOMOPATHOLOGIE ), Clinical Neurology Oxford ( CLINICAL NEUROLOGY ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de synthèse organique ( DCSO ), École polytechnique ( X ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), and Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB )
Subjects: MESH: Signal Transduction, Cellular immunity, Hemocytes, Cellular differentiation, Wasps, Hemocyte differentiation, MESH: Hematopoiesis, MESH : Janus Kinases, MESH: Hematopoietic Stem Cells, Blood cell, 0302 clinical medicine, MESH : Drosophila melanogaster, MESH: Janus Kinases, Homeostasis, MESH: Animals, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Cell Differentiation, MESH : Wasps, Cell biology, Haematopoiesis, STAT Transcription Factors, medicine.anatomical_structure, Drosophila melanogaster, MESH: Homeostasis, MESH : Homeostasis, Larva, MESH: Wasps, MESH : Cell Differentiation, Signal Transduction, MESH: Cell Differentiation, MESH: Lymphatic System, Notch signaling pathway, Biology, MESH: Drosophila melanogaster, Lymphatic System, 03 medical and health sciences, medicine, Animals, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, 030304 developmental biology, Janus Kinases, MESH : Signal Transduction, MESH : Lymphatic System, Innate immune system, MESH : Larva, MESH : Hematopoietic Stem Cells, MESH: Hemocytes, MESH : STAT Transcription Factors, Lamellocyte differentiation, MESH: STAT Transcription Factors, Hematopoietic Stem Cells, Hematopoiesis, MESH : Hematopoiesis, Immunology, MESH : Animals, MESH : Hemocytes, MESH: Larva, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Drosophila haemocytes (blood cells) originate from a specialized haematopoietic organ-the lymph gland. Larval haematopoietic progenitors (prohaemocytes) give rise to three types of circulating haemocytes: plasmatocytes, crystal cells and lamellocytes. Lamellocytes, which are devoted to encapsulation of large foreign bodies, only differentiate in response to specific immune threats, such as parasitization by wasps. Here we show that a small cluster of signalling cells, termed the PSC (posterior signalling centre), controls the balance between multipotent prohaemocytes and differentiating haemocytes, and is necessary for the massive differentiation of lamellocytes that follows parasitization. Communication between the PSC and haematopoietic progenitors strictly depends on the PSC-restricted expression of Collier, the Drosophila orthologue of mammalian early B-cell factor. PSC cells act, in a non-cell-autonomous manner, to maintain JAK/STAT signalling activity in prohaemocytes, preventing their premature differentiation. Serrate-mediated Notch signalling from the PSC is required to maintain normal levels of col transcription. The key role of the PSC in controlling blood cell homeostasis is reminiscent of interactions between haematopoietic progenitors and their micro-environment in vertebrates, thus further highlighting the interest of Drosophila as a model system for studying the evolution of haematopoiesis and cellular innate immunity.
Published: 2006

13. [An increase in intracellular free calcium controls the expression of an arginine N-methyl-transferase involved in neural determination in amphibian embryo]

Author: Néant, Isabelle, Leclerc, Catherine, Batut, Julie, Vandel, Laurence, Moreau, Marc, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT - UMR 8601), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques ( LCBPT - UMR 8601 ), and Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: MESH: Cell Differentiation, MESH: Enzyme Induction, MESH : Transcription Factors, MESH: Egtazic Acid, MESH: Bone Morphogenetic Proteins, MESH: Carrier Proteins, MESH: Bone Morphogenetic Protein Receptors, MESH: Calcium Signaling, MESH: Chelating Agents, MESH : Blastula, MESH: Caffeine, MESH : Bone Morphogenetic Protein Receptors, MESH : Bone Morphogenetic Proteins, MESH : Calcium Signaling, MESH: Xenopus laevis, MESH: Gastrula, MESH : Gastrula, MESH: Homeodomain Proteins, MESH: Methyltransferases, MESH : Xenopus laevis, MESH : Chelating Agents, MESH: Animals, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH : Homeodomain Proteins, MESH: Blastula, MESH : Calcium, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH: Xenopus Proteins, MESH : Caffeine, MESH : Methyltransferases, MESH : Organ Culture Techniques, MESH : Ectoderm, MESH: Nervous System, MESH : Enzyme Induction, MESH : Xenopus Proteins, MESH : Egtazic Acid, MESH: Transcription Factors, MESH: Organ Culture Techniques, MESH: Calcium, MESH : Nervous System, MESH : Animals, MESH : Carrier Proteins, MESH : Cell Differentiation, MESH: Ectoderm
Published: 2006

14. Apisalpha2, Apisalpha7-1 and Apisalpha7-2: three new neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha-subunits in the honeybee brain

Author: Thany, S. H., Crozatier, M., Raymond-Delpech, V., Gauthier, Mélanie, Lenaers, G., Laboratoire Récepteurs et Canaux Ioniques Membranaires ( RCIM ), Université d'Angers ( UA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de Recherches sur la Cognition Animale ( CRCA ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) ( FEMTO-ST ), Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Université de Technologie de Belfort-Montbeliard ( UTBM ), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés ( IMPMC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut fur Biologie, AG Neurobiologie, Freie Universität Berlin [Berlin], Laboratoire d'automatique de Besançon ( LAB ), Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut FRESNEL ( FRESNEL ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Ecole Centrale de Marseille ( ECM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire du Contrôle de la Prolifération ( LBCMCP ), Physiopathologie et thérapie des déficits sensoriels et moteurs, Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -IFR76-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Récepteurs et Canaux Ioniques Membranaires (RCIM), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) (FEMTO-ST), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés (IMPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Freie Universität Berlin, Laboratoire d'automatique de Besançon (LAB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut FRESNEL (FRESNEL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Marseille (ECM)-Aix Marseille Université (AMU), Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire du Contrôle de la Prolifération (LBCMCP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-IFR76-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Récepteurs et Canaux Ioniques Membranaires (RCIM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Franche-Comté (UFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM), Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur la Cognition Animale - UMR5169 (CRCA), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: MESH: Sequence Analysis, DNA, MESH : RNA, Messenger, MESH : Molecular Sequence Data, MESH: Sequence Homology, Amino Acid, MESH : DNA, Complementary, MESH: Neurons, Gene Expression, Genes, Insect, MESH: Amino Acid Sequence, MESH: Genes, Insect, Receptors, Nicotinic, MESH: Bees, MESH : Bees, MESH: Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction, MESH: Animals, MESH: Phylogeny, In Situ Hybridization, Phylogeny, Neurons, Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction, MESH : Amino Acid Sequence, MESH : Sequence Alignment, MESH : Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction, MESH : Genes, Insect, Brain, MESH : In Situ Hybridization, Bees, MESH : Sequence Homology, Amino Acid, Multigene Family, MESH: Receptors, Nicotinic, DNA, Complementary, MESH: Gene Expression, Molecular Sequence Data, MESH: Sequence Alignment, MESH : Multigene Family, MESH : Neurons, MESH: Brain, MESH: In Situ Hybridization, Animals, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Amino Acid Sequence, RNA, Messenger, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH: RNA, Messenger, MESH: Molecular Sequence Data, Sequence Homology, Amino Acid, MESH : Receptors, Nicotinic, MESH : Phylogeny, Sequence Analysis, DNA, MESH: DNA, Complementary, MESH : Gene Expression, MESH : Brain, MESH: Multigene Family, MESH : Animals, Sequence Alignment, MESH : Sequence Analysis, DNA
Abstract: Acetylcholine is the principal excitatory neurotransmitter in the central nervous system of insects. Nicotinic acetylcholine receptors, which belong to the ligand-gated ion channel family, constitute important targets for insecticides. In the honeybee Apis mellifera, pharmacological evidence supports the existence of several nicotinic acetylcholine receptors. In this paper, we report the identification of three new genes that encode nicotinic acetylcholine receptor alpha-subunits in the honeybee. Phylogenetic comparisons with other ligand-gated ion channel subunit sequences support their classification as Apisalpha2, Apisalpha7-1 and Apisalpha7-2 subunits. Based on in situ hybridization experiments, we determined their expression patterns in the different brain regions of pupae and adult honeybees. Our results show that these nicotinic acetylcholine receptor subunits are differently expressed among the brain regions and that they appear at different stages of honeybee development.
Published: 2005

15. Expression patterns of the coe/ebf transcription factor genes during chicken and mouse limb development

Author: Alain Vincent, Sébastien Mella, Dominique Morello, Michèle Crozatier, Cathy Soula, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anatomopathologie Haut-Lévêque (ANATOMOPATHOLOGIE), CHU, Clinical Neurology Oxford (CLINICAL NEUROLOGY), Hospital, Departement /u661 : Endocrinologie, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de synthèse organique (DCSO), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique ( LaBRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Anatomopathologie Haut-Lévêque ( ANATOMOPATHOLOGIE ), Clinical Neurology Oxford ( CLINICAL NEUROLOGY ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de synthèse organique ( DCSO ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École polytechnique ( X ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), École polytechnique (X)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: MESH: Sequence Analysis, DNA, MESH : Molecular Sequence Data, MESH : Transcription Factors, MESH : DNA, Complementary, Chick Embryo, MESH: Base Sequence, MESH : Extremities, Mice, 0302 clinical medicine, Complementary, MESH : Chick Embryo, MESH: Gene Expression Regulation, Developmental, Developmental, MESH: Animals, In Situ Hybridization, Regulation of gene expression, Genetics, 0303 health sciences, Gene Expression Regulation, Developmental, MESH : In Situ Hybridization, MESH: Transcription Factors, MESH: Chick Embryo, Cell biology, MESH : Connective Tissue, medicine.anatomical_structure, Connective Tissue, Sequence Analysis, DNA, Complementary, animal structures, MESH: Connective Tissue, Mesenchyme, Molecular Sequence Data, In situ hybridization, Biology, 03 medical and health sciences, Limb bud, MESH: In Situ Hybridization, MESH : Mice, medicine, Animals, Limb development, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Molecular Biology, Gene, Transcription factor, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, MESH: Mice, 030304 developmental biology, MESH: Molecular Sequence Data, Base Sequence, Extremities, Sequence Analysis, DNA, DNA, MESH: DNA, Complementary, Gene Expression Regulation, MESH : Base Sequence, MESH : Animals, MESH : Gene Expression Regulation, Developmental, MESH: Extremities, Transcription Factor Gene, 030217 neurology & neurosurgery, Transcription Factors, Developmental Biology, MESH : Sequence Analysis, DNA
Abstract: The COE (Collier/Olf/EBF) family of transcription factors comprises a single member in Drosophila and four members in human and mice. We have examined by in situ hybridization the expression patterns of each ebf/coe gene during limb development in mouse and chicken embryos. Expression of mouse ebf1, 2 and 3 is detected in mesenchymal cells from stages E10.5-11, expression of ebf2 being restricted to the presumptive zeugopod. Cross sections of mouse and chicken limb buds at several stages reveal that ebfs are specifically expressed in the connective tissues surrounding chondrogenic condensations and forming tendons. They thus represent useful new markers for studying vertebrate limb development, particularly formation of ligaments.
Published: 2004

16. Identification and localization of the nicotinic acetylcholine receptor alpha3 mRNA in the brain of the honeybee, Apis mellifera

Author: Steeve H. Thany, Mélanie Gauthier, Catherine Armengaud, Guy Lenaers, M. Crozatier, Récepteurs et Canaux Ioniques Membranaires (RCIM), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire du Contrôle de la Prolifération (LBCMCP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiopathologie et thérapie des déficits sensoriels et moteurs, Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-IFR76-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de biologie du développement (CBD), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Centre de Recherches sur la Cognition Animale - UMR5169 (CRCA), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) (FEMTO-ST), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés (IMPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut fur Biologie, AG Neurobiologie, Freie Universität Berlin, Laboratoire d'automatique de Besançon (LAB), Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Institut FRESNEL (FRESNEL), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Récepteurs et Canaux Ioniques Membranaires (RCIM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Franche-Comté (UFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Récepteurs et Canaux Ioniques Membranaires ( RCIM ), Université d'Angers ( UA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire du Contrôle de la Prolifération ( LBCMCP ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -IFR76-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de biologie du développement ( CBD ), Centre de Recherches sur la Cognition Animale ( CRCA ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Franche-Comté Électronique Mécanique, Thermique et Optique - Sciences et Technologies (UMR 6174) ( FEMTO-ST ), Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Université de Technologie de Belfort-Montbeliard ( UTBM ), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés ( IMPMC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Freie Universität Berlin [Berlin], Laboratoire d'automatique de Besançon ( LAB ), Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques ( ENSMM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Institut FRESNEL ( FRESNEL ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Ecole Centrale de Marseille ( ECM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard (UTBM)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques (ENSMM)-Université de Franche-Comté (UFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Marseille (ECM)-Aix Marseille Université (AMU), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Haenlin, Marc
Subjects: MESH : RNA, Messenger, MESH : Molecular Sequence Data, MESH : DNA, MESH: Amino Acid Sequence, Receptors, Nicotinic, MESH: Base Sequence, Polymerase Chain Reaction, MESH: Bees, MESH : Bees, 0302 clinical medicine, Ganglion type nicotinic receptor, MESH: Animals, Cloning, Molecular, MESH: Phylogeny, MESH : Polymerase Chain Reaction, In Situ Hybridization, Phylogeny, G alpha subunit, 0303 health sciences, MESH : Gene Expression Regulation, MESH : Amino Acid Sequence, MESH : Sequence Alignment, MESH: DNA, Brain, MESH : In Situ Hybridization, Bees, MESH: Gene Expression Regulation, 3. Good health, Cell biology, Nicotinic acetylcholine receptor, Nicotinic agonist, Biochemistry, Mushroom bodies, MESH: Receptors, Nicotinic, MESH : Cloning, Molecular, Molecular Sequence Data, MESH: Sequence Alignment, In situ hybridization, Neurotransmission, Biology, 03 medical and health sciences, MESH: Brain, MESH: In Situ Hybridization, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Genetics, Animals, MESH: Cloning, Molecular, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Amino Acid Sequence, RNA, Messenger, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Molecular Biology, 030304 developmental biology, Acetylcholine receptor, MESH: RNA, Messenger, MESH: Molecular Sequence Data, Base Sequence, MESH : Receptors, Nicotinic, MESH : Phylogeny, MESH: Polymerase Chain Reaction, DNA, Gene Expression Regulation, MESH : Brain, Insect Science, MESH : Base Sequence, MESH : Animals, Sequence Alignment, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: The nicotinic acetylcholine receptors are ligand-gated ion channels responsible for rapid neurotransmission and are target sites for pesticides in insects. In the honeybee Apis mellifera, pharmacological and electrophysiological studies have shown that different nicotinic acetylcholine receptor subtypes may exist in the brain. Here, we have identified a honeybee cDNA that encodes a 537 amino acid protein with features typical of nicotinic acetylcholine receptor alpha subunit, and sequence homology to human alpha3. In situ hybridization on cryosections shows that the Apisalpha3 mRNA is differently expressed in larvae and adult. In larvae, Apisalpha3 mRNA expression is restricted to the suboesophageal ganglia. In adult, it is further expressed in the optic lobes, the dorsal lobes, the antennal lobes and the calyces of mushroom bodies. Together our results suggest that Apisalpha3 shows a controlled expression pattern during development.
Published: 2003

17. Decrease of Pdzrn3 is required for heart maturation and protects against heart failure

Author: Mathieu Pernot, Béatrice Jaspard-vinassa, Alice Abelanet, Sebastien Rubin, Isabelle Forfar, Sylvie Jeanningros, Laura Cetran, Murielle Han-Yee Yu, Elise Balse, Stéphane Hatem, Pascale Dufourcq, Thierry Couffinhal, Cécile Duplàa, Gestionnaire, HAL Sorbonne Université 5, Role de l'ubiquitine ligase E3 PDZRN3 dans le développement des cardiomyopathies hypertrophiques et dans la transition vers l'insuffisance cardiaque - - CardioPDZ2016 - ANR-16-CE17-0001 - AAPG2016 - VALID, Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Biologie des maladies cardiovasculaires = Biology of Cardiovascular Diseases, Université de Bordeaux (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases (ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] (IHU ICAN), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service des Maladies Cardiaques et Vasculaires [CHU Bordeaux], This work was supported by Agence National de la Recherche (ANR -16-CE17-0001-01), by the Fédération Française de Cardiologie, Fondation pour le Recherche Médicale (Equipe FRM) and by Inserm funds., ANR-16-CE17-0001,CardioPDZ,Role de l'ubiquitine ligase E3 PDZRN3 dans le développement des cardiomyopathies hypertrophiques et dans la transition vers l'insuffisance cardiaque(2016), Azevedo, Chloe, Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition (ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Adaptation cardiovasculaire à l'ischemie, and Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, Ubiquitin-Protein Ligases, [SDV]Life Sciences [q-bio], Science, 030204 cardiovascular system & hematology, Article, Basolateral polarity, Mice, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Animals, Humans, Myocytes, Cardiac, Protein Kinase C, beta Catenin, 030304 developmental biology, Heart Failure, Mice, Knockout, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Molecular medicine, Disease model, Heart, Cardiovascular biology, [SDV.MHEP.CSC] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, [SDV] Life Sciences [q-bio], Cardiac hypertrophy, Medicine, Cardiomyopathies, Signal Transduction
Abstract: Heart failure is the final common stage of most cardiopathies. Cardiomyocytes (CM) connect with others via their extremities by intercalated disk protein complexes. This planar and directional organization of myocytes is crucial for mechanical coupling and anisotropic conduction of the electric signal in the heart. One of the hallmarks of heart failure is alterations in the contact sites between CM. Yet no factor on its own is known to coordinate CM polarized organization. We have previously shown that PDZRN3, an ubiquitine ligase E3 expressed in various tissues including the heart, mediates a branch of the Planar cell polarity (PCP) signaling involved in tissue patterning, instructing cell polarity and cell polar organization within a tissue. PDZRN3 is expressed in the embryonic mouse heart then its expression dropped significantly postnatally corresponding with heart maturation and CM polarized elongation. A moderate CM overexpression of Pdzrn3 (Pdzrn3 OE) during the first week of life, induced a severe eccentric hypertrophic phenotype with heart failure. In models of pressure-overload stress heart failure, CM-specific Pdzrn3 knockout showed complete protection against degradation of heart function. We reported that Pdzrn3 signaling induced PKC ζ expression, c-Jun nuclear translocation and a reduced nuclear ß catenin level, consistent markers of the planar non-canonical Wnt signaling in CM. We then show that subcellular localization (intercalated disk) of junction proteins as Cx43, ZO1 and Desmoglein 2 was altered in Pdzrn3 OE mice, which provides a molecular explanation for impaired CM polarization in these mice. Our results reveal a novel signaling pathway that controls a genetic program essential for heart maturation and maintenance of overall geometry, as well as the contractile function of CM, and implicates PDZRN3 as a potential therapeutic target for the prevention of human heart failure.
Published: 2022

18. Targeting androgen signaling in ILC2s protects from IL-33–driven lung inflammation, independently of KLRG1

Author: Blanquart, Eve, Mandonnet, Audrey, Mars, Marion, Cenac, Claire, Anesi, Nina, Mercier, Pascale, Audouard, Christophe, Roga, Stephane, Serrano de Almeida, Gilberto, Bevan, Charlotte, Girard, Jean-Philippe, Pelletier, Lucette, Laffont, Sophie, Guéry, Jean-Charles, Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imperial College London, laffont-pradines, sophie, Toulouse Institute for Infectious and Inflammatory Diseases, University of Toulouse, CNRS, INSERM, UPS, Toulouse, France. (Infinity), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: Male, KLRG1, MESH: Signal Transduction, [SDV.IMM] Life Sciences [q-bio]/Immunology, MESH: Lung / pathology, androgen signaling, MESH: Mice, Knockout, [SDV.IMM.II]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Innate immunity, ILC2, MESH: Testosterone / pharmacology, MESH: Pneumonia / immunology, MESH: Mice, Inbred C57BL, Animals, Lectins, C-Type, Testosterone, Sex differences in asthma, MESH: Animals, Lymphocytes, MESH: Pneumonia / pathology, Receptors, Immunologic, [SDV.IMM.ALL]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Allergology, Lung, [SDV.IMM.II] Life Sciences [q-bio]/Immunology/Innate immunity, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Mice, Knockout, Sex Characteristics, lung inflammation, MESH: Androgens / pharmacology, Pneumonia, MESH: Lung / immunology, Interleukin-33, MESH: Receptors, Immunologic / immunology, MESH: Male, Mice, Inbred C57BL, MESH: Lymphocytes / immunology, MESH: Lectins, C-Type / immunology, MESH: Interleukin-33 / immunology, Androgens, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Female, MESH: Female, [SDV.IMM.ALL] Life Sciences [q-bio]/Immunology/Allergology, Signal Transduction, MESH: Sex Characteristics
Abstract: International audience; Background: Allergic asthma is more severe and frequent in women than in men. In male mice, androgens negatively control group 2 innate lymphoid cell (ILC2) development and function by yet unknown mechanisms.Objectives: We sought to investigate the impact of androgen on ILC2 homeostasis and IL-33-mediated inflammation in female lungs. We evaluated the role of androgen receptor (AR) signaling and the contribution of the putative inhibitory receptor killer cell lectin-like receptor G1 (KLRG1).Methods: Subcutaneous pellets mimicking physiological levels of androgen were used to treat female mice together with mice expressing a reporter enzyme under the control of androgen response elements and mixed bone marrow chimeras to assess the cell-intrinsic role of AR activation within ILC2s. We generated KLRG1-deficient mice.Results: We established that lung ILC2s express a functionally active AR that can be in vivo targeted with exogenous androgens to negatively control ILC2 homeostasis, proliferation, and function. Androgen signaling upregulated KLRG1 on ILC2s, which inhibited their proliferation on E-cadherin interaction. Despite evidence that KLRG1 impaired the competitive fitness of lung ILC2s during inflammation, KLRG1 deficiency neither alters in vivo ILC2 numbers and functions, nor did it lead to hyperactive ILC2s in either sexes.Conclusions: AR agonists can be used in vivo to inhibit ILC2 homeostatic numbers and ILC2-dependent lung inflammation through cell-intrinsic AR activation. Although androgen signals in ILC2s to upregulate KLRG1, we demonstrate that KLRG1 is dispensable for androgen-mediated inhibition of pulmonary ILC2s.
Published: 2022

19. A P-insertion screen identifying novel X-linked essential genes in Drosophila

Author: Geneviève Gonzy-Treboul, Marc Haenlin, Jean S. Deutsch, David L. Cribbs, Frédérique Peronnet, Pierre Ferrer, Stéphane Noselli, Claude Ardourel, Alain Vincent, Henri-Marc Bourbon, Marie-Francoise Alin, Corinne Benassayag, Jean-Antoine Lepesant, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Laboratoire de Biologie du Développement (LBD), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génomique et épigénétique des pathologies placentaires (Inserm U709), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie moléculaire et génie génétique (IGBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anatomopathologie Haut-Lévêque (ANATOMOPATHOLOGIE), CHU, Clinical Neurology Oxford (CLINICAL NEUROLOGY), Hospital, Departement /u661 : Endocrinologie, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de synthèse organique (DCSO), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biologie structurale, Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), École polytechnique (X)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Jacques Monod ( IJM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Biologie du Développement ( LBD ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Génomique et épigénétique des pathologies placentaires ( Inserm U709 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Biologie moléculaire et génie génétique ( IGBMC ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique ( LaBRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Anatomopathologie Haut-Lévêque ( ANATOMOPATHOLOGIE ), Clinical Neurology Oxford ( CLINICAL NEUROLOGY ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de synthèse organique ( DCSO ), École polytechnique ( X ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), and Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB )
Subjects: Male, Embryology, Genetic Linkage, MESH : Animals, Genetically Modified, Genes, Insect, MESH: Genes, Insect, medicine.disease_cause, Lethal, Genome, Animals, Genetically Modified, 0302 clinical medicine, MESH : Crosses, Genetic, Genes, Reporter, MESH : Drosophila melanogaster, MESH: Gene Expression Regulation, Developmental, MESH : Female, Developmental, MESH: Animals, MESH : Lac Operon, X chromosome, Genetics, 0303 health sciences, Mutation, biology, MESH : Enhancer Elements (Genetics), MESH: Enhancer Elements (Genetics), MESH : Genes, Insect, Linkage (Genetics), Gene Expression Regulation, Developmental, MESH: Lac Operon, MESH : Genes, Reporter, MESH: Crosses, Genetic, 3. Good health, Enhancer Elements, Genetic, Drosophila melanogaster, Lac Operon, Female, MESH : X Chromosome, X Chromosome, MESH : Male, Mutagenesis (molecular biology technique), Genetically Modified, Crosses, MESH: Drosophila melanogaster, MESH: Animals, Genetically Modified, 03 medical and health sciences, Genetic, Insertional, medicine, Animals, Enhancer Elements (Genetics), [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Enhancer, Gene, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Reporter, Crosses, Genetic, 030304 developmental biology, Reporter gene, MESH : Mutagenesis, Insertional, MESH: X Chromosome, MESH: Genes, Reporter, biology.organism_classification, MESH: Male, Mutagenesis, Insertional, Gene Expression Regulation, Genes, MESH: Mutagenesis, Insertional, MESH : Genes, Lethal, Mutagenesis, Genes, Lethal, MESH : Animals, MESH : Gene Expression Regulation, Developmental, MESH: Genes, Lethal, Insect, MESH: Linkage (Genetics), MESH: Female, 030217 neurology & neurosurgery, MESH : Linkage (Genetics), Developmental Biology
Abstract: The recent determination and annotation of the entire euchromatic sequence of the Drosophila melanogaster genome predicted the existence of about 13600 different genes (Science 287 (2000) 2185; http://www.fruitfly.org/annot/index.html). In parallel, the Berkeley Drosophila Genome Project (BDGP) has undertaken systematic P-insertion screens, to isolate new lethals and misexpressing lines. To date, however, the genes of the X chromosome have been under-represented in the screens performed. In order both to characterize several X-linked genes of prime interest to our laboratories and contribute to the collection of lethal P-insertions available to the community, we performed a P-insertion mutagenesis of the X chromosome. Using the PlacW and PGawB P-elements as mutagens, we generated two complementary sets of enhancer-trap lines, l(1)(T)PL and l(1)(T)PG, respectively, which both contain a reporter gene whose developmental expression can be monitored when driven by nearby enhancer sequences. We report here the characterization of 260 new insertions, mapping to 133 different genes or predicted CGs. Of these, 83 correspond to genes for which no lethal mutation had yet been reported. For 64 of those, we could confirm that lethality was solely due to the P-element insertion. The primary molecular data, reporter gene expression patterns (observed in embryos, third instar larvae and adult ovaries) and proposed CG assignment for each strain can be accessed and updated on our website at the following address: http://www-cbd.ups-tlse.fr:8080/screen.
Published: 2002

20. Patient-matched analysis identifies deregulated networks in prostate cancer to guide personalized therapeutic intervention

Author: Kumar, Akinchan, Badredine, Alaa, Azzag, Karim, Kasikçi, Yasenya, Laure, Marie, Ranty, Quintyn, Zaidi, Falek, Serret, Nathalie, Mazerolles, Catherine, Malavaud, Bernard, Mendoza-Parra, Marco, Parra, Mendoza, Vandel, Laurence, Gronemeyer, Hinrich, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe labellisée Ligue contre le Cancer, Metabolic functional (epi)genomics and molecular mechanisms involved in type 2 diabetes and related diseases - UMR 8199 - UMR 1283 (EGENODIA (GI3M)), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Minnesota [Twin Cities] (UMN), University of Minnesota System, Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Pathologie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique, Reproduction et Développement (GReD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Vandel, Laurence, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Pathologie [CHU Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Service d'Urologie, Transplantation Rénale et Andrologie (Centre Hospitalier Universitaire), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-10-LABX-0030,INRT,Integrative Biology : Nuclear dynamics- Regenerative medicine - Translational medicine(2010), ANR-10-IDEX-0002,UNISTRA,Par-delà les frontières, l'Université de Strasbourg(2010), Metabolic functional (epi)genomics and molecular mechanisms involved in type 2 diabetes and related diseases - UMR 8199 - UMR 1283 (GI3M), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: personalized therapy, 0303 health sciences, Cancer systems biology, patient-matched deregulated networks, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BBM.MN]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular Networks [q-bio.MN], [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, urologic and male genital diseases, prostate cancer, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], 030220 oncology & carcinogenesis, Original Article, 030304 developmental biology
Abstract: Prostate cancer (PrCa) is the second most common malignancy in men1. More than 50% of advanced prostate cancers display the TMPRSS2-ERG fusion2. Despite extensive cancer genome/transcriptome2–4 and phosphoproteome5 data, little is known about the impact of mutations and altered transcription on regulatory networks in the PrCa of individual patients. Using patient-matched normal and tumor samples, we established somatic variations and differential transcriptome profiles of primary ERG-positive prostate cancers. Integration of protein-protein interaction and gene-regulatory network databases6, 7 defined highly diverse patient-specific network alterations. We found that different components of a given regulatory pathway were altered by novel and known mutations and/or aberrant gene expression, including deregulated ERG targets, such that different sets of pathways were altered in each individual PrCa. In a given PrCa, several deregulated pathways share common factors, predicting synergistic effects on cancer progression. Our integrated analysis provides a paradigm to identify key deregulated factors within regulatory networks to guide personalized therapies.
Published: 2021

21. Separation of the Ca V 1.2‐Ca V 1.3 calcium channel duo prevents type 2 allergic airway inflammation

Author: Joerg Striessnig, Marion Mars, Brice Ronsin, Magali Savignac, Marc Moreau, Jean-Charles Guéry, Lucette Pelletier, Marine Michelet, Nicolas Giang, Antoine Magnan, Geoffrey G. Murphy, José E. Mejía, Grégory Bouchaud, Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut du thorax, Université de Nantes (UN)-IFR26-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse, Hôpital des Enfants, Unité de Gastroentérologie, Hépatologie et Nutrition, Département de Pédiatrie, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Eastern Michigan University, Universität Innsbruck [Innsbruck], Leopold Franzens Universität Innsbruck - University of Innsbruck, Austrian Science Fund (FWF) : P27809, Foundation for Medical Research : DEQ20180339187, and French Society of Allergology : A11013BS.
Subjects: Calcium metabolism, Th2 lymphocytes, Voltage-dependent calcium channel, Calcium channel, T cell, Immunology, chemistry.chemical_element, Tyrosine phosphorylation, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, Calcium, asthma, Ca(v)1, cytokines, Cell biology, chemistry.chemical_compound, Calcium imaging, medicine.anatomical_structure, chemistry, Transcription (biology), calcium channels, cardiovascular system, medicine, Immunology and Allergy, [SDV.IMM.ALL]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Allergology, signaling
Abstract: International audience; Background Voltage-gated calcium (Ca(v)1) channels contribute to T-lymphocyte activation. Ca(v)1.2 and Ca(v)1.3 channels are expressed in Th2 cells but their respective roles are unknown, which is investigated herein. Methods We generated mice deleted for Ca(v)1.2 in T cells or Ca(v)1.3 and analyzed TCR-driven signaling. In this line, we developed original fast calcium imaging to measure early elementary calcium events (ECE). We also tested the impact of Ca(v)1.2 or Ca(v)1.3 deletion in models of type 2 airway inflammation. Finally, we checked whether the expression of both Ca(v)1.2 and Ca(v)1.3 in T cells from asthmatic children correlates with Th2-cytokine expression. Results We demonstrated non-redundant and synergistic functions of Ca(v)1.2 and Ca(v)1.3 in Th2 cells. Indeed, the deficiency of only one channel in Th2 cells triggers TCR-driven hyporesponsiveness with weakened tyrosine phosphorylation profile, a strong decrease in initial ECE and subsequent reduction in the global calcium response. Moreover, Ca(v)1.3 has a particular role in calcium homeostasis. In accordance with the singular roles of Ca(v)1.2 and Ca(v)1.3 in Th2 cells, deficiency in either one of these channels was sufficient to inhibit cardinal features of type 2 airway inflammation. Furthermore, Ca(v)1.2 and Ca(v)1.3 must be co-expressed within the same CD4(+) T cell to trigger allergic airway inflammation. Accordingly with the concerted roles of Ca(v)1.2 and Ca(v)1.3, the expression of both channels by activated CD4(+) T cells from asthmatic children was associated with increased Th2-cytokine transcription. Conclusions Thus, Ca(v)1.2 and Ca(v)1.3 act as a duo, and targeting only one of these channels would be efficient in allergy treatment.
Published: 2021

22. Prmt5 promotes vascular morphogenesis independently of its methyltransferase activity

Author: Manon Boulet, Lucas Waltzer, Séverine Ethuin, Guerric Gilbert, Aurelie Quillien, Laurence Vandel, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Geroscience and rejuvenation research center (RESTORE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique, Reproduction et Développement (GReD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Vandel, Laurence, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Waltzer, Lucas
Subjects: Scaffold protein, Cancer Research, Protein-Arginine N-Methyltransferases, Embryology, Embryo, Nonmammalian, Transcription, Genetic, [SDV]Life Sciences [q-bio], Gene Expression, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, QH426-470, Biochemistry, Epithelium, 0302 clinical medicine, Animal Cells, Gene expression, Transcriptional regulation, Morphogenesis, Medicine and Health Sciences, Protein Isoforms, Zebrafish, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Genetics (clinical), 0303 health sciences, biology, Chemistry, Chromosome Biology, Protein arginine methyltransferase 5, Gene Expression Regulation, Developmental, Eukaryota, Animal Models, Chromatin, Cell biology, Enzymes, [SDV] Life Sciences [q-bio], Experimental Organism Systems, Osteichthyes, Vertebrates, Epigenetics, Cellular Types, Anatomy, Signal Transduction, Research Article, Neovascularization, Physiologic, Research and Analysis Methods, 03 medical and health sciences, Model Organisms, [SDV.BDD] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Genetics, Animals, Molecular Biology, Transcription factor, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 030304 developmental biology, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Base Sequence, Proto-Oncogene Proteins c-ets, Embryos, Organisms, Endothelial Cells, Biology and Life Sciences, Proteins, Epithelial Cells, Cell Biology, Methyltransferases, Zebrafish Proteins, biology.organism_classification, Hematopoiesis, Biological Tissue, Fish, Mutation, Animal Studies, Enzymology, Cardiovascular Anatomy, Blood Vessels, Chromatin immunoprecipitation, Zoology, 030217 neurology & neurosurgery, Developmental Biology
Abstract: During development, the vertebrate vasculature undergoes major growth and remodeling. While the transcriptional cascade underlying blood vessel formation starts to be better characterized, little is known concerning the role and mode of action of epigenetic enzymes during this process. Here, we explored the role of the Protein Arginine Methyl Transferase Prmt5 in blood vessel formation as well as hematopoiesis using zebrafish as a model system. Through the combination of different prmt5 loss-of-function approaches we highlighted a key role of Prmt5 in both processes. Notably, we showed that Prmt5 promotes vascular morphogenesis through the transcriptional control of ETS transcription factors and adhesion proteins in endothelial cells. Interestingly, using a catalytic dead mutant of Prmt5 and a specific drug inhibitor, we found that while Prmt5 methyltransferase activity was required for blood cell formation, it was dispensable for vessel formation. Analyses of chromatin architecture impact on reporter genes expression and chromatin immunoprecipitation experiments led us to propose that Prmt5 regulates transcription by acting as a scaffold protein that facilitates chromatin looping to promote vascular morphogenesis., Author summary Blood vessel formation is an essential developmental process required for the survival of all vertebrates. The vascular anatomy and the mechanisms involved in vessel formation are highly conserved among vertebrates. Hence, we used zebrafish as a model, to decipher the role and the mode of action of Prmt5, an enzyme known to regulate gene expression, in vascular morphogenesis and in blood cell formation in vivo. Using different approaches, we highlighted a key role of Prmt5 during both processes. However, we found that while blood cell formation required Prmt5 enzymatic activity, vascular morphogenesis was independent on its activity. Prmt5 has been proposed as a therapeutic target in many diseases, including cancer. Yet, we show here that Prmt5 acts at least in part independently of its methyltransferase activity to regulate vascular morphogenesis. By shedding light on a mechanism of action of Prmt5 that will be insensitive to enzymatic inhibitors, our data calls forth the design of alternative drugs. In addition, this non-canonical function of Prmt5 may have a more pervasive role than previously thought in physiological conditions, i.e. during development, but also in pathological situations such as in tumor angiogenesis and certainly deserves more attention in the future.
Published: 2021

23. Mercury chloride exposure induces DNA damage, reduces fertility, and alters somatic and germline cells in Drosophila melanogaster ovaries

Author: María Elena Calderón-Segura, Rocío García-Martínez, Muriel Boube, Luis Humberto Mojica-Vázquez, Diana Madrigal-Zarraga, Justine Oyallon, Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología [Mexico] (CONACYT), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: DNA damage, Somatic cell, [SDV]Life Sciences [q-bio], Health, Toxicology and Mutagenesis, chemistry.chemical_element, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Germline, Andrology, Follicle, Animals, Environmental Chemistry, Reproductive system, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Regulation of gene expression, biology, Chemistry, Ovary, Mercury, General Medicine, biology.organism_classification, Pollution, Mercury (element), Drosophila melanogaster, Fertility, Germ Cells, Mercuric Chloride, Female, DNA Damage
Abstract: Mercury exposure has been shown to affect the reproductive system in many organisms, although the molecular mechanisms are still elusive. In the present study, we exposed Drosophila melanogaster Canton-S adult females to concentrations of 0 mM, 0.1 mM, 0.3 mM, 3 mM, and 30 mM of mercury chloride (HgCl2) for 24 h, 48 h, or 72 h to determine how mercury could affect fertility. Alkaline assays performed on dissected ovaries showed that mercury induced DNA damage that is not only dose-dependent but also time-dependent. All ovaries treated for 72 h have incorporated mercury and exhibit size reduction. Females treated with 30 mM HgCl2, the highest dose, had atrophied ovaries and exhibited a drastic 7-fold reduction in egg laying. Confocal microscopy analysis revealed that exposure to HgCl2 disrupts germinal and somatic cell organization in the germarium and leads to the aberrant expression of a germline-specific gene in somatic follicle cells in developing egg chambers. Together, these results highlight the potential long-term impact of mercury on germline and ovarian cells that might involve gene deregulation.
Published: 2019

24. Sulfatase 2 promotes generation of a spinal cord astrocyte subtype that stands out through the expression of Olig2

Author: Bruno Glise, Cathy Soula, David Ohayon, Cathy Danesin, Philippe Cochard, Nathalie Escalas, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Neurogenesis, SOX10, Mice, Transgenic, Biology, OLIG2, 03 medical and health sciences, Cellular and Molecular Neuroscience, astrocyte, 0302 clinical medicine, olig2, Neural Stem Cells, medicine, Animals, Receptor, Fibroblast Growth Factor, Type 3, Gray Matter, Progenitor cell, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Research Articles, Gliogenesis, SOXE Transcription Factors, spinal cord, Oligodendrocyte Transcription Factor 2, Spinal cord, Embryonic stem cell, Oligodendrocyte, Cell biology, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, Neurology, Astrocytes, gliogenesis, sulfatase 2, Sulfatases, oligodendrocyte, 030217 neurology & neurosurgery, Research Article, Astrocyte
Abstract: Generation of glial cell diversity in the developing spinal cord is known to depend on spatio‐temporal patterning programs. In particular, expression of the transcription factor Olig2 in neural progenitors of the pMN domain is recognized as critical to their fate choice decision to form oligodendrocyte precursor cells (OPCs) instead of astrocyte precursors (APs). However, generating some confusion, lineage‐tracing studies of Olig2 progenitors in the spinal cord provided evidence that these progenitors also generate some astrocytes. Here, we addressed the role of the heparan sulfate‐editing enzyme Sulf2 in the control of gliogenesis and found an unanticipated function for this enzyme. At initiation of gliogenesis in mouse, Sulf2 is expressed in ventral neural progenitors of the embryonic spinal cord, including in Olig2‐expressing cells of the pMN domain. We found that sulf2 deletion, while not affecting OPC production, impairs generation of a previously unknown Olig2‐expressing pMN‐derived cell subtype that, in contrast to OPCs, does not upregulate Sox10, PDGFRα or Olig1. Instead, these cells activate expression of AP identity genes, including aldh1L1 and fgfr3 and, of note, retain Olig2 expression as they populate the spinal parenchyma at embryonic stages but also as they differentiate into mature astrocytes at postnatal stages. Thus, our study, by revealing the existence of Olig2‐expressing APs that segregate early from pMN cells under the influence of Sulf2, supports the existence of a common source of APs and OPCs in the ventral spinal cord and highlights divergent regulatory mechanism for the development of pMN‐derived OPCs and APs.
Published: 2019

25. Cell-to-cell heterogeneity in Sox2 and Bra expression guides progenitor motility and destiny

Author: Léa Combres, Myriam Roussigne, Benjamin Steventon, Ariane Trescases, Francois Médevielle, Michèle Romanos, Guillaume Allio, Cathy Soula, Bertrand Bénazéraf, Nathalie Escalas, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de biologie moléculaire, cellulaire et du développement (MCD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Department of Genetics [Cambridge], University of Cambridge [UK] (CAM), Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Roussigné, Myriam [0000-0002-4240-4105], Steventon, Benjamin [0000-0001-7838-839X], Bénazéraf, Bertrand [0000-0002-1937-637X], Apollo - University of Cambridge Repository, Unité de biologie moléculaire, cellulaire et du développement - UMR5077 (MCD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-16-CE13-0008,MULTIEL,Analyse multi-tissulaire de l'allongement de l'axe embryonnaire en utilisant des cailles transgéniques et de l'imagerie en temps réel(2016)
Subjects: Fetal Proteins, Mesoderm, Embryo, Nonmammalian, QH301-705.5, [SDV]Life Sciences [q-bio], Science, Morphogenesis, Motility, Gene Expression, morphogenesis, Biology, cell motility, Quail, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, SOX2, medicine, Paraxial mesoderm, Animals, Cell Lineage, [MATH]Mathematics [math], Progenitor cell, Biology (General), 030304 developmental biology, Progenitor, 0303 health sciences, bird embryos, neuromesodermal progenitors, General Immunology and Microbiology, General Neuroscience, SOXB1 Transcription Factors, mathematical modeling, Gene Expression Regulation, Developmental, Cell Differentiation, General Medicine, Cell biology, medicine.anatomical_structure, embryonic structures, Medicine, Other, heterogeneity, T-Box Domain Proteins, Developmental biology, 030217 neurology & neurosurgery, Research Article, Developmental Biology
Abstract: International audience; Although cell-to-cell heterogeneity in gene and protein expression within cell populations has been widely documented, we know little about its biological functions. By studying progenitors of the posterior region of bird embryos, we found that expression levels of transcription factors Sox2 and Bra, respectively involved in neural tube (NT) and mesoderm specification, display a high degree of cell-to-cell heterogeneity. By combining forced expression and downregulation approaches with time-lapse imaging, we demonstrate that Sox2-to-Bra ratio guides progenitor’s motility and their ability to stay in or exit the progenitor zone to integrate neural or mesodermal tissues. Indeed, high Bra levels confer high motility that pushes cells to join the paraxial mesoderm, while high levels of Sox2 tend to inhibit cell movement forcing cells to integrate the NT. Mathematical modeling captures the importance of cell motility regulation in this process and further suggests that randomness in Sox2/Bra cell-to-cell distribution favors cell rearrangements and tissue shape conservation.
Published: 2021

26. The vascular niche controls Drosophila hematopoiesis via fibroblast growth factor signaling

Author: Yushun Tian, Michèle Crozatier, Nathalie Vanzo, Ismaël Morin-Poulard, Manon Destalminil-Letourneau, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, QH301-705.5, Science, Population, Biology, Fibroblast growth factor, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Blood cell, lymph gland, FGF signaling, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, Animals, Biology (General), Progenitor cell, education, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Progenitor, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, education.field_of_study, D. melanogaster, General Immunology and Microbiology, General Neuroscience, General Medicine, hematopoiesis, Cell biology, Fibroblast Growth Factors, Haematopoiesis, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, 030220 oncology & carcinogenesis, Medicine, microenvironment/niche, Drosophila, Bone marrow, cardiac/vascular cells, Homeostasis, Signal Transduction, Research Article, Developmental Biology
Abstract: In adult mammals, hematopoiesis, the production of blood cells from hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs), is tightly regulated by extrinsic signals from the microenvironment called ‘niche’. Bone marrow HSPCs are heterogeneous and controlled by both endosteal and vascular niches. The Drosophila hematopoietic lymph gland is located along the cardiac tube which corresponds to the vascular system. In the lymph gland, the niche called Posterior Signaling Center controls only a subset of the heterogeneous hematopoietic progenitor population indicating that additional signals are necessary. Here we report that the vascular system acts as a second niche to control lymph gland homeostasis. The FGF ligand Branchless produced by vascular cells activates the FGF pathway in hematopoietic progenitors. By regulating intracellular calcium levels, FGF signaling maintains progenitor pools and prevents blood cell differentiation. This study reveals that two niches contribute to the controlofDrosophila blood cell homeostasis through their differential regulation of progenitors.
Published: 2021

27. Steroid‐dependent switch of OvoL/Shavenbaby controls self‐renewal versus differentiation of intestinal stem cells

Author: Al Hayek, Sandy, Alsawadi, Ahmad, Kambris, Zakaria, Boquete, Jean-Philippe, Bohère, Jérôme, Immarigeon, Clément, Ronsin, Brice, Plaza, Serge, Lemaitre, Bruno, Payre, Francois, Osman, Dani, Hayek, Al, Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence Nationale de la Recherche (ANR, ChronoNet)Fondation pour la Recherche Médicale (DEQ20170336739), and ANR-14-CE11-0010,ChronoNet,CONTROLE TEMPOREL DES RESEAUX GÉNIQUES EPIDERMIQUES: UNE APPROCHE INTÉGRATIVE MULTI-ÉCHELLES(2014)
Subjects: Male, [SDV]Life Sciences [q-bio], enterocyte differentiation, OvoL transcription factors, Biology, Regenerative Medicine, Article, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 03 medical and health sciences, Wnt and EFGR pathways Subject Categories Cancer, 0302 clinical medicine, Downregulation and upregulation, Cancer stem cell, Animals, Drosophila Proteins, Cell Self Renewal, Molecular Biology, Transcription factor, Cancer, 030304 developmental biology, intestinal stem cells, 0303 health sciences, General Immunology and Microbiology, Stem Cells, General Neuroscience, Stem Cells & Regenerative Medicine, Wnt signaling pathway, Gene Expression Regulation, Developmental, Cell Differentiation, Articles, Cell biology, DNA-Binding Proteins, Intestines, Wnt and EFGR pathways, Female, Steroids, Drosophila, Enterocyte differentiation, OvoL, Stem cell, Signal transduction, 030217 neurology & neurosurgery, Transcription Factors, Signal Transduction, Adult stem cell
Abstract: Adult stem cells must continuously fine‐tune their behavior to regenerate damaged organs and avoid tumors. While several signaling pathways are well known to regulate somatic stem cells, the underlying mechanisms remain largely unexplored. Here, we demonstrate a cell‐intrinsic role for the OvoL family transcription factor, Shavenbaby (Svb), in balancing self‐renewal and differentiation of Drosophila intestinal stem cells. We find that svb is a downstream target of Wnt and EGFR pathways, mediating their activity for stem cell survival and proliferation. This requires post‐translational processing of Svb into a transcriptional activator, whose upregulation induces tumor‐like stem cell hyperproliferation. In contrast, the unprocessed form of Svb acts as a repressor that imposes differentiation into enterocytes, and suppresses tumors induced by altered signaling. We show that the switch between Svb repressor and activator is triggered in response to systemic steroid hormone, which is produced by ovaries. Therefore, the Svb axis allows intrinsic integration of local signaling cues and inter‐organ communication to adjust stem cell proliferation versus differentiation, suggesting a broad role of OvoL/Svb in adult and cancer stem cells., Post‐translational processing of the transcription factor Shavenbaby defines its dichotomous function in fly midgut homeostasis.
Published: 2020

28. Connectivity mapping of glomerular proteins identifies dimethylaminoparthenolide as a new inhibitor of diabetic kidney disease

Author: Fédou, Camille, Lescat, Ophélie, Buléon, Marie, Breuil, Benjamin, Alvès, Mélinda, Batut, Julie, Blader, Patrick, Decramer, Stéphane, Buffin-Meyer, Bénédicte, Klein, Julie, Caubet, Cécile, Camus, Mylène, Makridakis, Manousos, Denis, Colette, Gilet, Marion, Feuillet, Guylène, Rascalou, Simon, Neau, Eric, Garrigues, Luc, Thillaye du Boullay, Olivier, Mischak, Harald, Monsarrat, Bernard, Burlet-Schiltz, Odile, Vlahou, Antonia, Saulnier-Blache, Jean Sébastien, Bascands, Jean-Loup, Schanstra, Joost, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de biologie du développement (CBD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École de Droit de Sciences Po (EdD), Sciences Po (Sciences Po), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Biomedical Research Foundation of the Academy of Athens (BRFAA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: International audience; Abstract While blocking the renin angiotensin aldosterone system (RAAS) has been the main therapeutic strategy to control diabetic kidney disease (DKD) for many years, 25–30% of diabetic patients still develop the disease. In the present work we adopted a systems biology strategy to analyze glomerular protein signatures to identify drugs with potential therapeutic properties in DKD acting through a RAAS-independent mechanism. Glomeruli were isolated from wild type and type 1 diabetic (Ins2Akita) mice treated or not with the angiotensin-converting enzyme inhibitor (ACEi) ramipril. Ramipril efficiently reduced the urinary albumin/creatine ratio (ACR) of Ins2Akita mice without modifying DKD-associated renal-injuries. Large scale quantitative proteomics was used to identify the DKD-associated glomerular proteins (DKD-GPs) that were ramipril-insensitive (RI-DKD-GPs). The raw data are publicly available via ProteomeXchange with identifier PXD018728. We then applied an in silico drug repurposing approach using a pattern-matching algorithm (Connectivity Mapping) to compare the RI-DKD-GPs’s signature with a collection of thousands of transcriptional signatures of bioactive compounds. The sesquiterpene lactone parthenolide was identified as one of the top compounds predicted to reverse the RI-DKD-GPs’s signature. Oral treatment of 2 months old Ins2Akita mice with dimethylaminoparthenolide (DMAPT, a water-soluble analogue of parthenolide) for two months at 10 mg/kg/d by gavage significantly reduced urinary ACR. However, in contrast to ramipril, DMAPT also significantly reduced glomerulosclerosis and tubulointerstitial fibrosis. Using a system biology approach, we identified DMAPT, as a compound with a potential add-on value to standard-of-care ACEi-treatment in DKD.
Published: 2020

29. Sub-centrosomal mapping identifies augmin-γTuRC as part of a centriole-stabilizing scaffold

Author: Ricardo Viais, Laurence Haren, Andreas Merdes, Ilaria Dutto, Nina Schweizer, Cristina Lacasa, Jens Lüders, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Male, Centriole, Science, [SDV]Life Sciences [q-bio], General Physics and Astronomy, Cell Cycle Proteins, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, Article, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Cell Line, microtubules, Mice, gTuRC, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Microtubule, Ciliogenesis, Animals, Humans, centriole, Cilia, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Centrioles, 030304 developmental biology, Pericentriolar material, Centrosome, Neurons, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Cilium, Microtubule organizing center, General Chemistry, Cilium assembly, Cell biology, augmin, Female, Carrier Proteins, Microtubule-Associated Proteins, Microtubule-Organizing Center, ciliogenesis, 030217 neurology & neurosurgery, Biogenesis, Lumen (unit)
Abstract: Centriole biogenesis and maintenance are crucial for cells to generate cilia and assemble centrosomes that function as microtubule organizing centers (MTOCs). Centriole biogenesis and MTOC function both require the microtubule nucleator γ-tubulin ring complex (γTuRC). It is widely accepted that γTuRC nucleates microtubules from the pericentriolar material that is associated with the proximal part of centrioles. However, γTuRC also localizes more distally and in the centriole lumen, but the significance of these findings is unclear. Here we identify spatially and functionally distinct subpopulations of centrosomal γTuRC. Luminal localization is mediated by augmin, which is linked to the centriole inner scaffold through POC5. Disruption of luminal localization impairs centriole integrity and interferes with cilium assembly. Defective ciliogenesis is also observed in γTuRC mutant fibroblasts from a patient suffering from microcephaly with chorioretinopathy. These results identify a non-canonical role of augmin-γTuRC in the centriole lumen that is linked to human disease., The γ-tubulin ring complex (γTuRC) nucleates microtubules at the centrosome, but how this function is related to γTuRC subcentrosomal distribution is unclear. Here the authors show that γTuRC in the centriole lumen has a nucleation-independent role in centriole integrity and cilium assembly.
Published: 2020

30. G1 Phase Lengthening During Neural Tissue Development Involves CDC25B Induced G1 Heterogeneity

Author: Eric Agius, Jacques Gautrais, Angie Molina Delgado, Bonnet Frédéric, Valérie Lobjois, Sophie Bel-Vialar, Fabienne Pituello, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Technologies Avancées en sciences du Vivant (ITAV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Gautrais, Jacques, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Centre de Recherches sur la Cognition Animale - UMR5169 (CRCA), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI)
Subjects: G1 phase, Cell division, proliferation, [SDV]Life Sciences [q-bio], Cell, Phase (waves), Biology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, vertebrate embryo, 0502 economics and business, medicine, 050207 economics, Progenitor cell, neural tube, neural stem cells, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, 050208 finance, CDC25 phosphatase, 05 social sciences, Neurogenesis, differentiation, cell cycle kinetics, Cell cycle, Neural stem cell, Cell biology, [SDV] Life Sciences [q-bio], neurogenesis, medicine.anatomical_structure, Cell Cycle Kinetics, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: While lengthening of the cell cycle and G1 phase is a generic feature of tissue maturation during development, the underlying mechanism remains still poorly understood. Here we develop a time lapse imaging strategy to measure the four phases of the cell cycle in single neural progenitor cells in their endogenous environment. Our results show that neural progenitors possess a great heterogeneity of the cell cycle length. This duration variability is distributed over all phases of the cell cycle, with the G1 phase being the one contributing primarily to cell cycle variability. Within one cell cycle, each phase duration appears stochastic and independent except for a surprising correlation between S and M phase. Lineage analysis indicates that the majority of daughter cells display longer G1 phase than their mother’s suggesting that at each cell cycle a mechanism lengthens the G1 phase. We identify an actor of the core cell cycle machinery, the CDC25B phosphatase known to regulate G2/M transition, as an indirect regulator of the duration of the G1 phase. We propose that CDC25B acts via a cell to cell increase in G1 phase heterogeneity revealing a novel mechanism of G1 lengthening associated with tissue development.
Published: 2020

31. In vivo Neural Crest Cell Migration Is Controlled by 'Mixotaxis'

Author: Eric Theveneau, Elias H Barriga, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Cell type, Computer science, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], durotaxis, morphogenesis, Review, Haptotaxis, lcsh:Physiology, electrotaxis, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, galvanotaxis, Physiology (medical), chemotaxis, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, mixotaxis, Durotaxis, lcsh:QP1-981, Neural crest, Cell migration, Chemotaxis, directed cell migration, Neural crest cell migration, Neuroscience, neural crest, 030217 neurology & neurosurgery, Mechanotaxis
Abstract: Directed cell migration is essential all along an individual’s life, from embryogenesis to tissue repair and cancer metastasis. Thus, due to its biomedical relevance, directed cell migration is currently under intense research. Directed cell migration has been shown to be driven by an assortment of external biasing cues, ranging from gradients of soluble (chemotaxis) to bound (haptotaxis) molecules. In addition to molecular gradients, gradients of mechanical properties (duro/mechanotaxis), electric fields (electro/galvanotaxis) as well as iterative biases in the environment topology (ratchetaxis) have been shown to be able to direct cell migration. Since cells migrating in vivo are exposed to a challenging environment composed of a convolution of biochemical, biophysical, and topological cues, it is highly unlikely that cell migration would be guided by an individual type of “taxis.” This is especially true since numerous molecular players involved in the cellular response to these biasing cues are often recycled, serving as sensor or transducer of both biochemical and biophysical signals. In this review, we confront literature on Xenopus cephalic neural crest cells with that of other cell types to discuss the relevance of the current categorization of cell guidance strategies. Furthermore, we emphasize that while studying individual biasing signals is informative, the hard truth is that cells migrate by performing a sort of “mixotaxis,” where they integrate and coordinate multiple inputs through shared molecular effectors to ensure robustness of directed cell motion.
Published: 2020

32. Morphogenesis is transcriptionally coupled to neurogenesis during peripheral olfactory organ development

Author: Virginie Lecaudey, Sandra Link, Pascale Dufourcq, Marion Aguirrebengoa, Patrick Blader, Raphaël Aguillon, Gill Bejerano, Harendra Guturu, Romain Madelaine, Julie Batut, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI)
Subjects: Olfactory system, Nervous system, Receptors, CXCR4, Embryo, Nonmammalian, [SDV]Life Sciences [q-bio], Neurogenesis, Morphogenesis, Embryonic Development, Context (language use), Nerve Tissue Proteins, Biology, E-Box Elements, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Olfactory Mucosa, medicine, Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factors, Animals, Molecular Biology, Transcription factor, Zebrafish, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Neurons, 0303 health sciences, Gene Expression Regulation, Developmental, [SDV.BDD.MOR]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Morphogenesis, Zebrafish Proteins, biology.organism_classification, Cell biology, medicine.anatomical_structure, Mutation, Transcription Initiation Site, Olfactory epithelium, 030217 neurology & neurosurgery, Developmental Biology, MESH: Chemokine, Neurogenin1, Olfactory placode
Abstract: Sense organs acquire their distinctive shapes concomitantly with the differentiation of sensory cells and neurons necessary for their function. Although our understanding of the mechanisms controlling morphogenesis and neurogenesis in these structures has grown, how these processes are coordinated remains largely unexplored. Neurogenesis in the zebrafish olfactory epithelium requires the bHLH proneural transcription factor Neurogenin 1 (Neurog1). To address whether Neurog1 also controls morphogenesis, we analysed the migratory behaviour of early olfactory neural progenitors in neurog1 mutant embryos. Our results indicate that the oriented movements of these progenitors are disrupted in this context. Morphogenesis is similarly affected by mutations in the chemokine receptor gene, cxcr4b, suggesting it is a potential Neurog1 target gene. We find that Neurog1 directly regulates cxcr4b through an E-box cluster located just upstream of the cxcr4b transcription start site. Our results suggest that proneural transcription factors, such as Neurog1, directly couple distinct aspects of nervous system development.
Published: 2020

33. OvoL factors: a family of key regulators of epithelium mesenchyme plasticity and stem cells

Author: Alexandra Mancheno-Ferris, François Payre, Cédric Polesello, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0303 health sciences, Hippo signaling pathway, Mesenchyme, Mesenchymal stem cell, General Medicine, Biology, Phenotype, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 3. Good health, Cell biology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine.anatomical_structure, Cancer stem cell, 030220 oncology & carcinogenesis, medicine, Stem cell, Transcription factor, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Adult stem cell
Abstract: Des avancées majeures révèlent l’hétérogénéité intra-tumorale des cancers d’origine épithéliale, incluant des cellules initiatrices de tumeurs qui ressemblent aux cellules souches adultes. Les cellules souches normales et tumorales partagent en effet leur plasticité entre phénotypes épithéliaux et mésenchymateux, progressant par une série d’états intermédiaires, réversibles. Si un cœur de régulateurs (Snail, Zeb, …) est bien connu pour déclencher la transition épithélio-mésenchymateuse (TEM), les facteurs OvoL/Shavenbaby sont récemment apparus comme des stabilisateurs épithéliaux. La balance entre facteurs pro-TEM et OvoL pourrait ainsi réguler la plasticité phénotypique et le potentiel métastatique des tumeurs. Nous abordons cette question chez la drosophile, un modèle pour disséquer in vivo la fonction de Shavenbaby. Nos travaux montrent que Shavenbaby est un régulateur clé de l’homéostasie des cellules souches adultes. Shavenbaby est indispensable à leur survie, agissant en interaction directe avec la voie Hippo pour protéger les cellules souches de la mort cellulaire programmée.
Published: 2020

34. Functional characterization of alternative splice variants of the Drosophila GATA transcription factor serpent containing either one or two zinc finger domains

Author: Moussalem, Douaa, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Sabatier - Toulouse III, Marc Haenlin, and Dani Osman
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, GATA, Hématopoïèse, Friend of GATA, Doigt de zinc, Drosophile, Développement
Abstract: GATA transcription factors play crucial roles in various developmental processes throughout bilaterian animals. In mammals, six GATA factors are present and they play essential functions in different tissues such as the blood, the gut, the liver and the gonads. GATA proteins have two highly conserved domains, the N-terminal and the C-terminal zinc fingers. The C-terminal finger recognizes GATA DNA-binding consensus motif, while the N-terminal finger stabilizes fixation to DNA palindromic sequences and allows their interaction with cofactors of the Friend Of GATA (FOG) family. GATA zinc finger mutations are associated to a vast panel of human diseases whose severity depends on the affected GATA gene and on the position of the mutation in the zinc fingers. Numerous studies have demonstrated the high level of molecular and functional similarities existing between flies and humans. Drosophila melanogaster has five GATA factors containing either one or two zinc fingers, whose sequences are almost identical to those of the canonical zinc fingers of vertebrates. Among them, the Drosophila GATA factor Serpent (Srp) is required for the formation of blood cells, gut and fat body as well as during oogenesis. In all these tissues, two isoforms of Srp are generated through an alternative splicing event giving rise to proteins containing either both zinc fingers (N- and C-terminal, hence the name of this isoform: SrpNC) or only the C-terminal zinc finger (SrpC). In a previous work, our team has shown that SrpC and SrpNC activate some genes in a similar manner but also they regulate others differently. Moreover, interaction between SrpNC and its cofactor FOG, U-shaped, is responsible for some but not all aspects of the distinct activities of SrpC and SrpNC. The purpose of this study is to provide a deep genetic investigation of possible differential functional roles of Srp isoforms during Drosophila development. Using CRISPR/Cas9 technology, we generated two mutant fly lines deleted either of SrpC or of SrpNC. In addition, we produced a third mutant fly line in which we specifically introduced into the N-terminal zinc finger of Srp a single point mutation that alters its interaction with U-shaped. Analysis of these mutants revealed that both isoforms regulate redundantly the transcription of a common set of genes during gut development as well as few genes involved during early hematopoiesis. Surprisingly, flies devoid of SrpNC (isoform containing two-zinc fingers as the mammalian GATA factors) are viable, showing that this isoform is dispensable for most of the developmental processes controlled by Srp. [...]; Les facteurs de transcription GATA jouent un rôle crucial dans divers processus de développement chez les animaux bilatéraux. Chez les mammifères, six facteurs GATA sont présents et ils jouent des rôles essentiels dans différents tissus tels que le sang, l'intestin, le foie et les gonades. Les protéines GATA possèdent deux domaines hautement conservés, les doigts de zinc N-terminal et C-terminal. Le doigt C-terminal reconnaît le motif consensus de liaison à l'ADN GATA, tandis que le doigt N-terminal stabilise la fixation aux séquences palindromiques d'ADN et permet leur interaction avec les cofacteurs de la famille Friend Of GATA (FOG). Les mutations des doigts de zinc GATA sont associées à un vaste éventail de maladies humaines dont la gravité dépend du gène GATA affecté et de la position de la mutation dans les doigts de zinc. De nombreuses études ont démontré le haut niveau de similarités moléculaires et fonctionnelles existant entre les mouches et les humains. La drosophile possède cinq facteurs GATA contenant un ou deux doigts de zinc, dont les séquences sont presque identiques à celles des doigts de zinc canoniques des vertébrés. Parmi eux, le facteur GATA de la drosophile Serpent (Srp) est requis pour la formation des cellules sanguines, de l'intestin et du corps gras ainsi que pendant l'ovogenèse. Dans tous ces tissus, deux isoformes de Srp sont générées par un événement d'épissage alternatif donnant naissance à des protéines contenant soit les deux doigts de zinc (N- et C-terminal, d'où le nom de cette isoforme : SrpNC) ou uniquement le doigt de zinc C-terminal (SrpC). Dans un travail précédent, notre équipe a montré que SrpC et SrpNC activent certains gènes cibles de manière similaire mais aussi elles en régulent d'autres différemment. En plus, l'interaction entre SrpNC et son cofacteur FOG, U-shaped, est responsable de certaines mais pas de toutes les activités distinctes de SrpC et SrpNC. Le but de cette étude est de fournir une investigation génétique approfondie des rôles fonctionnels différentiels possibles des isoformes Srp au cours du développement de la drosophile. En utilisant la technologie CRISPR/Cas9, nous avons généré deux lignées de mouches mutantes invalidées soit pour SrpC ou pour SrpNC. En outre, nous avons produit une troisième lignée de mouche mutante dans laquelle nous avons spécifiquement introduit dans le doigt de zinc N-terminal de Srp une mutation ponctuelle qui modifie son interaction avec U-shaped. L'analyse de ces mutants a révélé que les deux isoformes régulent d'une manière redondante la transcription d'un ensemble commun de gènes au cours du développement intestinal ainsi que de quelques gènes impliqués dans l'hématopoïèse précoce.[...]
Published: 2020

35. Caractérisation fonctionnelle des variants d'épissage alternatifs du facteur de transcription GATA de la drosophile Serpent contenant un ou deux domaines de doigt de zinc

Author: Moussalem, Douaa, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Sabatier - Toulouse III, Marc Haenlin, and Dani Osman
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, GATA, Hématopoïèse, Friend of GATA, Doigt de zinc, Drosophile, Développement
Abstract: GATA transcription factors play crucial roles in various developmental processes throughout bilaterian animals. In mammals, six GATA factors are present and they play essential functions in different tissues such as the blood, the gut, the liver and the gonads. GATA proteins have two highly conserved domains, the N-terminal and the C-terminal zinc fingers. The C-terminal finger recognizes GATA DNA-binding consensus motif, while the N-terminal finger stabilizes fixation to DNA palindromic sequences and allows their interaction with cofactors of the Friend Of GATA (FOG) family. GATA zinc finger mutations are associated to a vast panel of human diseases whose severity depends on the affected GATA gene and on the position of the mutation in the zinc fingers. Numerous studies have demonstrated the high level of molecular and functional similarities existing between flies and humans. Drosophila melanogaster has five GATA factors containing either one or two zinc fingers, whose sequences are almost identical to those of the canonical zinc fingers of vertebrates. Among them, the Drosophila GATA factor Serpent (Srp) is required for the formation of blood cells, gut and fat body as well as during oogenesis. In all these tissues, two isoforms of Srp are generated through an alternative splicing event giving rise to proteins containing either both zinc fingers (N- and C-terminal, hence the name of this isoform: SrpNC) or only the C-terminal zinc finger (SrpC). In a previous work, our team has shown that SrpC and SrpNC activate some genes in a similar manner but also they regulate others differently. Moreover, interaction between SrpNC and its cofactor FOG, U-shaped, is responsible for some but not all aspects of the distinct activities of SrpC and SrpNC. The purpose of this study is to provide a deep genetic investigation of possible differential functional roles of Srp isoforms during Drosophila development. Using CRISPR/Cas9 technology, we generated two mutant fly lines deleted either of SrpC or of SrpNC. In addition, we produced a third mutant fly line in which we specifically introduced into the N-terminal zinc finger of Srp a single point mutation that alters its interaction with U-shaped. Analysis of these mutants revealed that both isoforms regulate redundantly the transcription of a common set of genes during gut development as well as few genes involved during early hematopoiesis. Surprisingly, flies devoid of SrpNC (isoform containing two-zinc fingers as the mammalian GATA factors) are viable, showing that this isoform is dispensable for most of the developmental processes controlled by Srp. [...]; Les facteurs de transcription GATA jouent un rôle crucial dans divers processus de développement chez les animaux bilatéraux. Chez les mammifères, six facteurs GATA sont présents et ils jouent des rôles essentiels dans différents tissus tels que le sang, l'intestin, le foie et les gonades. Les protéines GATA possèdent deux domaines hautement conservés, les doigts de zinc N-terminal et C-terminal. Le doigt C-terminal reconnaît le motif consensus de liaison à l'ADN GATA, tandis que le doigt N-terminal stabilise la fixation aux séquences palindromiques d'ADN et permet leur interaction avec les cofacteurs de la famille Friend Of GATA (FOG). Les mutations des doigts de zinc GATA sont associées à un vaste éventail de maladies humaines dont la gravité dépend du gène GATA affecté et de la position de la mutation dans les doigts de zinc. De nombreuses études ont démontré le haut niveau de similarités moléculaires et fonctionnelles existant entre les mouches et les humains. La drosophile possède cinq facteurs GATA contenant un ou deux doigts de zinc, dont les séquences sont presque identiques à celles des doigts de zinc canoniques des vertébrés. Parmi eux, le facteur GATA de la drosophile Serpent (Srp) est requis pour la formation des cellules sanguines, de l'intestin et du corps gras ainsi que pendant l'ovogenèse. Dans tous ces tissus, deux isoformes de Srp sont générées par un événement d'épissage alternatif donnant naissance à des protéines contenant soit les deux doigts de zinc (N- et C-terminal, d'où le nom de cette isoforme : SrpNC) ou uniquement le doigt de zinc C-terminal (SrpC). Dans un travail précédent, notre équipe a montré que SrpC et SrpNC activent certains gènes cibles de manière similaire mais aussi elles en régulent d'autres différemment. En plus, l'interaction entre SrpNC et son cofacteur FOG, U-shaped, est responsable de certaines mais pas de toutes les activités distinctes de SrpC et SrpNC. Le but de cette étude est de fournir une investigation génétique approfondie des rôles fonctionnels différentiels possibles des isoformes Srp au cours du développement de la drosophile. En utilisant la technologie CRISPR/Cas9, nous avons généré deux lignées de mouches mutantes invalidées soit pour SrpC ou pour SrpNC. En outre, nous avons produit une troisième lignée de mouche mutante dans laquelle nous avons spécifiquement introduit dans le doigt de zinc N-terminal de Srp une mutation ponctuelle qui modifie son interaction avec U-shaped. L'analyse de ces mutants a révélé que les deux isoformes régulent d'une manière redondante la transcription d'un ensemble commun de gènes au cours du développement intestinal ainsi que de quelques gènes impliqués dans l'hématopoïèse précoce.[...]
Published: 2020

36. Dynamic expression of MMP28 during cranial morphogenesis

Author: Jean Pierre Saint-Jeannet, Nadège Gouignard, Eric Theveneau, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Proteases, Embryo, Nonmammalian, Xenopus, [SDV]Life Sciences [q-bio], Morphogenesis, Biology, Matrix metalloproteinase, Xenopus Proteins, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Extracellular matrix, 03 medical and health sciences, Xenopus laevis, 0302 clinical medicine, Animals, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, MMP, Embryogenesis, Skull, Neural crest, Gene Expression Regulation, Developmental, Embryo, Articles, biology.organism_classification, Matrix Metalloproteinases, Cell biology, Neurula, cranial placodes, embryogenesis, General Agricultural and Biological Sciences, neural crest, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Matrix metalloproteinases (MMPs) are a large family of proteases comprising 24 members in vertebrates. They are well known for their extracellular matrix remodelling activity. MMP28 is the latest member of the family to be discovered. It is a secreted MMP involved in wound healing, immune system maturation, cell survival and migration. MMP28 is also expressed during embryogenesis in human and mouse. Here, we describe the detailed expression profile of MMP28 inXenopus laevisembryos. We show that MMP28 is expressed maternally and accumulates at neurula and tail bud stages specifically in the cranial placode territories adjacent to migrating neural crest cells. As a secreted MMP, MMP28 may be required in neural crest–placode interactions.This article is part of a discussion meeting issue ‘Contemporary morphogenesis’.
Published: 2020

37. Amniotic fluid peptides predict postnatal kidney survival in developmental kidney disease

Author: Romain Favre, Marie-Pierre Lavocat, Bernard Boudailliez, Charlotte Lucas, Camille Fédou, Jean-Sebastien Saulnier Blache, Anne-Sophie Weingertner, Blandine Hougas, Joost P. Schanstra, Pascal Gaucherand, Sylvie Cloarec, Julie Batut, Catherine Noel, J. Gondry, Philippe Eckart, Norbert Winer, Benjamin Breuil, Gérard Champion, Jean-Baptiste Benevent, Franck Perrotin, Christophe Vayssière, Florence Biquard, Harald Mischak, Gwenaelle Le Bouar, Jérôme Massardier, Françoise Conte Auriol, Pedro Magalhães, Sophie Martin, Jean-Paul Bory, Sophie Collardeau-Frachon, Eve Mousty, Lucie Bessenay, Corinne Floch, Julie Klein, Amelie Ryckewaert, Elisabeth Simon, Alain Martin, Guylène Bourdat-Michel, Marie-Françoise Froute, Franz Schaefer, Pascale Marcorelles, Stéphane Decramer, Nabila Moussaoui, Franck Boizard, Marie-Christine Manca-Pellissier, Mariannick Maupin-Hyvonnet, Marion Groussolles, Jean-Marie Delbosc, Guylène Feuillet, Anke Raaijmakers, François Nobili, Sophie Taque, Petra Zürbig, Vincent Guigonis, Audrey Casemayou, Patrick Blader, An Hindryckx, Luc Decatte, Karel Allegaert, Ophélie Lescat, Eric Neau, Odile Basmaison, Emma Allain-Launay, Agnes Sartor, Jean-Loup Bascands, Claudine Le Vaillant, Hélène Laurichesse Delmas, Bénédicte Buffin-Meyer, Nadia Lounis, Anne-Hélène Saliou, Véronique Baudouin, Elena Levtchenko, Maryse Fiorenza, Christine Pietrement, Valérie Goua, Marina Merveille, Laurent Bidat, Yves Aubard, Alexandra Benachi, Sylvie Kessler, Loic De Parscau, Jean-François Oury, Fabienne Prieur, Centre de biologie du développement (CBD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe 7 Inserm U1048, Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, University Hospitals Leuven [Leuven], Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Laboratoire de Gérontechnologie [Hôpital La Grave-CHU de Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Gérontopôle, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours ), Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Gatien de Clocheville [Tours] (CHRU Tours), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Clermont-Ferrand, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Groupe de Recherche sur l'Analyse Multimodale de la Fonction Cérébrale - UMR INSERM_S 1105 (GRAMFC), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Amiens-Picardie, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Hôpital Morvan - CHRU de Brest (CHU - BREST ), Centre Hospitalier René Dubos [Pontoise], Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Centre de dépistage des Carmes [Toulouse] (CDC), Hôpital des Enfants, CHU Toulouse [Toulouse], Laboratoire sur les interactions Epithéliums Neurones (LIEN), Université de Brest (UBO), Département de Pathologie [CHU Lyon-Sud - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Mosaiques Diagnostics & Therapeutics AG [Hannover, Germany], University of Glasgow, Hannover Medical School [Hannover] (MHH), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Diabète athérothrombose et thérapies Réunion Océan Indien (DéTROI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de La Réunion (UR), Heidelberg University, Centre De Référence des Maladies Rénales Rares du Sud Ouest (SORARE), Centre De Référence des Maladies Rénales Rares du Sud Ouest, BIOMAN consortium: Karel Allegaert, Yves Aubard, Odile Basmaison, Jean-Baptiste Benevent, Florence Biquard, Gérard Champion, Jean-Marie Delbosc, Philippe Eckart, Marie-Françoise Froute, Pascal Gaucherand, Marion Groussolles, Vincent Guigonis, Blandine Hougas, Gwenaelle Le Bouar, Alain Martin, Sophie Martin, Mariannick Maupin-Hyvonnet, Marina Merveille, Eve Mousty, François Nobili, Amelie Ryckewaert, Agnes Sartor, Sophie Taque, Norbert Winer, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Development and Regeneration, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Gérontopôle-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse], Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Clocheville, Department of Pediatric and Prenatal Radiology, Timone's Children-Hospital (APHM), Hôpital Dupuytren [CHU Limoges], CHU Toulouse, Hôpital des Enfants, Unité de Gastroentérologie, Hépatologie et Nutrition, Département de Pédiatrie, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Groupement Hospitalier Est [Bron], University Medical Center Heidelberg, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Saulnier-Blache, Jean Sébastien, Pôle Gériatrie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), and Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Pathology, medicine.medical_specialty, Amniotic fluid, Urinary system, [SDV]Life Sciences [q-bio], congenital anomalies of the kidney and the urinary tract, 030232 urology & nephrology, Kidney, Fetal Kidney, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Pregnancy, medicine, Animals, Humans, termination of pregnancy, Prospective Studies, Child, Urinary Tract, Zebrafish, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Fetus, business.industry, infants, Area under the curve, amniotic fluid, prediction, medicine.disease, 3. Good health, Pronephros, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, Nephrology, Urogenital Abnormalities, peptides, Female, Kidney Diseases, business, management, Kidney disease
Abstract: Although a rare disease, bilateral congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT) are the leading cause of end stage kidney disease in children. Ultrasound-based prenatal prediction of postnatal kidney survival in CAKUT pregnancies is far from accurate. To improve prediction, we conducted a prospective multicenter peptidome analysis of amniotic fluid spanning 140 evaluable fetuses with CAKUT. We identified a signature of 98 endogenous amniotic fluid peptides, mainly composed of fragments from extracellular matrix proteins and from the actin binding protein thymosin-β4. The peptide signature predicted postnatal kidney outcome with an area under the curve of 0.96 in the holdout validation set of patients with CAKUT with definite endpoint data. Additionally, this peptide signature was validated in a geographically independent sub-cohort of 12 patients (area under the curve 1.00) and displayed high specificity in non-CAKUT pregnancies (82 and 94% in 22 healthy fetuses and in 47 fetuses with congenital cytomegalovirus infection respectively). Change in amniotic fluid thymosin-β4 abundance was confirmed with ELISA. Knockout of thymosin-β4 in zebrafish altered proximal and distal tubule pronephros growth suggesting a possible role of thymosin β4 in fetal kidney development. Thus, recognition of the 98-peptide signature in amniotic fluid during diagnostic workup of prenatally detected fetuses with CAKUT can provide a long-sought evidence base for accurate management of the CAKUT disorder that is currently unavailable. ispartof: KIDNEY INTERNATIONAL vol:99 issue:3 pages:737-749 ispartof: location:United States status: published
Published: 2020

38. The Drosophila MOZ homolog Enok controls Notch-dependent induction of the RUNX gene lozenge independently of its histone-acetyl transferase activity

Author: Douaa Moussalem, Thomas Genais, Vanessa Gobert, Benoit Augé, Delhia Gigan, Marc Haenlin, Lucas Waltzer, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0303 health sciences, biology, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030302 biochemistry & molecular biology, Intron, Chromatin, Cell biology, 03 medical and health sciences, Histone, biology.protein, Transferase, Epigenetics, Enhancer, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Gene, Function (biology), 030304 developmental biology
Abstract: The human KAT6 lysine acetyltransferase MOZ has been shown to be an essential player in the field of normal and malignant hematopoiesis. It belongs to a highly conserved family of epigenetic factors and remodels chromatin by acetylating histone tails in association with its partners of the ING5 complex. Here, we report that its Drosophila counterpart Enok is required during larval hematopoiesis to control the Notch-dependent induction of circulating crystal cells. In particular enok is essential to allow expression of the RUNX factor Lozenge (Lz) that controls the crystal cell specific transcriptional program. We demonstrate that this function involves neither the Eaf6 and Ing5 subunits of the Drosophila ING5 complex, nor Enok own acetyltransferase activity. We identify in lz third intron a hematopoietic enhancer, which is both required to promote expression in Notch-activated crystal cell precursors in an enok-dependent manner and bound by Enok. The non-catalytic mode of action of Enok is likely conserved in MOZ/KAT6 proteins and might be of high relevance in mammalian hematopoiesis, whether normal or malignant.
Published: 2020

39. Intrinsic control of muscle attachment sites matching

Author: Gaëlle Lebreton, Jean-Louis Frendo, Alain Vincent, Yannick Carrier, Antoine Wystrach, Alexandre Carayon, Aurore Pelletier, Laurence Dubois, Laetitia Bataillé, Centre de biologie du développement (CBD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Centre de Biologie Intégrative (CBI), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: QH301-705.5, [SDV]Life Sciences [q-bio], Science, Mutant, Biology, Muscle Development, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, developmental biology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Live cell imaging, Transcription (biology), transcription factors, medicine, Muscle attachment, muscle identity, Animals, Drosophila Proteins, Myocyte, Biology (General), [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Transcription factor, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, D. melanogaster, General Immunology and Microbiology, Myogenesis, General Neuroscience, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, [SDV.BDD.MOR]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Morphogenesis, General Medicine, myology, Tendon, Cell biology, Drosophila melanogaster, medicine.anatomical_structure, Single muscle, Larva, Myology, Medicine, Reprogramming, Developmental biology, 030217 neurology & neurosurgery, Research Article
Abstract: Myogenesis is an evolutionarily conserved process. Little known, however, is how the morphology of each muscle is determined, such that movements relying upon contraction of many muscles are both precise and coordinated. Each Drosophila larval muscle is a single multinucleated fibre whose morphology reflects expression of distinctive identity Transcription Factors (iTFs). By deleting transcription cis-regulatory modules of one iTF, Collier, we generated viable muscle identity mutants, allowing live imaging and locomotion assays. We show that both selection of muscle attachment sites and muscle/muscle matching is intrinsic to muscle identity and requires transcriptional reprogramming of syncytial nuclei. Live-imaging shows that the staggered muscle pattern involves attraction to tendon cells and heterotypic muscle-muscle adhesion. Unbalance leads to formation of branched muscles, and this correlates with locomotor behavior deficit. Thus, engineering Drosophila muscle identity mutants allows to investigate, in vivo, physiological and mechanical properties of abnormal muscles., eLife digest Each muscle in the body has a unique size, shape and set of attachment points. Animals need all of their muscles to have the correct identity to help maintain posture and control movement. A specific set of proteins, called transcription factors, co-ordinate and regulate gene activity in cells so that each muscle develops in the right way. To create a muscle, multiple precursor cells fuse together to form a muscle fibre, which then elongates and attaches to specific sites. Correct attachment is critical so that the fibre is properly oriented. When this process goes wrong, for example in disease, muscle fibres sometimes attach to the wrong site; they become branched and cannot work properly. Collier is a transcription factor protein that controls muscle identity in the fruit fly Drosophila melanogaster. However, like many transcription factors, Collier also has several other roles throughout the body. This made it difficult to evaluate the effect of the protein on the formation of specific muscles. Here, Carayon et al. managed to selectively deactivate Collier in just one muscle per body section in the larvae of fruit flies. This showed that the transcription factor is needed throughout muscle development; in particular, it is required for muscle fibres to select the correct attachment sites, and to be properly oriented. Affected muscles showed an altered orientation, with branched fibres attaching to the wrong site. Even minor changes, which only affect a single muscle from each body segment, greatly impaired the movement of the larvae. The work by Carayon et al. offers a new approach to the study of muscular conditions. Branched muscles are seen in severe human illnesses such as Duchenne muscular dystrophy. Studying the impact of these changes in a living animal could help to understand how this disease progress, and how it can be prevented.
Published: 2020

40. A stable sub-complex between GCP4, GCP5 and GCP6 promotes the assembly of γ-tubulin ring complexes

Author: Haren, Laurence, Farache, Dorian, Emorine, Laurent, Merdes, Andreas, Centre de biologie du développement (CBD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI)
Subjects: centrosome 20, microtubule nucleation, [SDV]Life Sciences [q-bio], γ-tubulin ring complex, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; 21 22 23 24 25 26 Summary statement: 27 γ-tubulin ring complexes are templates for microtubule nucleation, composed of γ-28 tubulin and GCP proteins. GCPs 4, 5, 6 form a stable sub-complex, driving the 29 assembly of the full complex. 30 31 32 33 34 35 Abstract 36 37
Published: 2020

41. The Mediator CDK8-Cyclin C complex modulates Dpp signaling in Drosophila by stimulating Mad-dependent transcription

Author: Xiao Li, Jun-Yuan Ji, Nicolas Loncle, Henri-Marc Bourbon, Stephen H. Yu, Qun Wang, Mengmeng Liu, Muriel Boube, Xingjie Ren, Rajitha-Udakara-Sampath Hemba-Waduge, Jian-Quan Ni, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Cell signaling, Cancer Research, MED31, Transcription, Genetic, [SDV]Life Sciences [q-bio], Gene Expression, Haploinsufficiency, QH426-470, Signal transduction, Biochemistry, Suppressor Genes, Transactivation, 0302 clinical medicine, Transcription (biology), Transcriptional regulation, Drosophila Proteins, Post-Translational Modification, Phosphorylation, Genetics (clinical), ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0303 health sciences, Drosophila Melanogaster, Transcriptional Control, Eukaryota, Signaling cascades, Gene Expression Regulation, Developmental, Animal Models, Cell biology, Insects, DNA-Binding Proteins, Phenotypes, Experimental Organism Systems, Imaginal Discs, DPP signaling cascade, Drosophila, Research Article, animal structures, Arthropoda, Biology, Research and Analysis Methods, 03 medical and health sciences, Model Organisms, Mediator, Gene Types, Cyclin C, Genetics, Animals, Gene Regulation, Molecular Biology, Transcription factor, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 030304 developmental biology, Decapentaplegic, Organisms, Biology and Life Sciences, Proteins, Cyclin-Dependent Kinase 8, Invertebrates, Animal Studies, Cyclin-dependent kinase 8, 030217 neurology & neurosurgery, Transcription Factors
Abstract: Dysregulation of CDK8 (Cyclin-Dependent Kinase 8) and its regulatory partner CycC (Cyclin C), two subunits of the conserved Mediator (MED) complex, have been linked to diverse human diseases such as cancer. Thus, it is essential to understand the regulatory network modulating the CDK8-CycC complex in both normal development and tumorigenesis. To identify upstream regulators or downstream effectors of CDK8, we performed a dominant modifier genetic screen in Drosophila based on the defects in vein patterning caused by specific depletion or overexpression of CDK8 or CycC in developing wing imaginal discs. We identified 26 genomic loci whose haploinsufficiency can modify these CDK8- or CycC-specific phenotypes. Further analysis of two overlapping deficiency lines and mutant alleles led us to identify genetic interactions between the CDK8-CycC pair and the components of the Decapentaplegic (Dpp, the Drosophila homolog of TGFβ, or Transforming Growth Factor-β) signaling pathway. We observed that CDK8-CycC positively regulates transcription activated by Mad (Mothers against dpp), the primary transcription factor downstream of the Dpp/TGFβ signaling pathway. CDK8 can directly interact with Mad in vitro through the linker region between the DNA-binding MH1 (Mad homology 1) domain and the carboxy terminal MH2 (Mad homology 2) transactivation domain. Besides CDK8 and CycC, further analyses of other subunits of the MED complex have revealed six additional subunits that are required for Mad-dependent transcription in the wing discs: Med12, Med13, Med15, Med23, Med24, and Med31. Furthermore, our analyses confirmed the positive roles of CDK9 and Yorkie in regulating Mad-dependent gene expression in vivo. These results suggest that CDK8 and CycC, together with a few other subunits of the MED complex, may coordinate with other transcription cofactors in regulating Mad-dependent transcription during wing development in Drosophila., Author summary CDK8 and its dedicated partner CycC are conserved subunits of the Mediator complex that bridges transcription factors with RNA Polymerase II in eukaryotes. Here we explore the function and regulation of the CDK8-CycC pair in Drosophila by performing a dominant modifier genetic screen based on wing vein patterning defects caused by specific alteration of CDK8-CycC activities. We have observed that multiple components of the Dpp/TGFβ signaling pathway genetically interact with CDK8-CycC. CDK8 and CycC positively regulate gene expression activated by Mad, the key transcription factor downstream of Dpp/TGFβ signaling, and CDK8 can directly interact with the linker region of the Mad protein. We also identify additional, but not all, subunits of the Mediator complex that play positive roles in regulating Mad-dependent gene expression. Given the fundamental role of Dpp/TGFβ signaling in regulating development and its misregulation in a variety of diseases, understanding how Mad/Smad interacts with the Mediator complex may have broad implications in understanding the pathogenesis of these diseases.
Published: 2020

42. Ephrin-B2 paces neuronal production in the developing neocortex

Author: Anthony Kischel, Christophe Audouard, Alice Davy, Mohamad-Ali Fawal, Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique & Développement (BREED), Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Universite Paul Sabatier Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR: French National Research Agency ,15CE13-0010-01
Subjects: Male, animal structures, Mouse, Neurogenesis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Blotting, Western, Fluorescent Antibody Technique, Neocortex, Ephrin-B2, Biology, 03 medical and health sciences, Mice, 0302 clinical medicine, medicine, Eph:ephrin signaling, Ephrin, Animals, lcsh:QH301-705.5, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, 030304 developmental biology, ephrin signaling, Neurons, 0303 health sciences, Cell Cycle, Erythropoietin-producing hepatocellular (Eph) receptor, Cell Differentiation, Embryonic stem cell, Juxtacrine signalling, Neural progenitors, biological factors, Eph, medicine.anatomical_structure, [SDV.BDD.EO]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Embryology and Organogenesis, lcsh:Biology (General), nervous system, Cerebral cortex, embryonic structures, Female, Neuron, sense organs, Neuroscience, 030217 neurology & neurosurgery, Developmental Biology, Research Article, Signal Transduction
Abstract: Background During mammalian cerebral cortex development, different types of projection neurons are produced in a precise temporal order and in stereotypical numbers. The mechanisms regulating timely generation of neocortex projection neurons and ensuring production in sufficient numbers of each neuronal identity are only partially understood. Results Here, we show that ephrin-B2, a member of the Eph:ephrin cell-to-cell communication pathway, sets the neurogenic tempo in the neocortex. Indeed, conditional mutant embryos for ephrin-B2 exhibit a transient delay in neurogenesis and acute stimulation of Eph signaling by in utero injection of synthetic ephrin-B2 led to a transient increase in neuronal production. Using genetic approaches we show that ephrin-B2 acts on neural progenitors to control their differentiation in a juxtacrine manner. Unexpectedly, we observed that perinatal neuron numbers recovered following both loss and gain of ephrin-B2, highlighting the ability of neural progenitors to adapt their behavior to the state of the system in order to produce stereotypical numbers of neurons. Conclusions Altogether, our data uncover a role for ephrin-B2 in embryonic neurogenesis and emphasize the plasticity of neuronal production in the neocortex.
Published: 2020

43. MMP14 is required for delamination of chick neural crest cells independently of its catalytic activity

Author: Eric Theveneau, Evangeline Despin-Guitard, Cyril Andrieu, Audrey Montigny, Anne Bibonne, Dominique Alfandari, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Epithelial-Mesenchymal Transition, Mitosis, Chick Embryo, Biology, Matrix metalloproteinase, Catalysis, Animals, Genetically Modified, Extracellular matrix, Neural crest, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Matrix Metalloproteinase 14, Animals, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Molecular Biology, Cells, Cultured, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Polarity, Cell adhesion molecule, MMP14, EMT, [SDV.BDD.MOR]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Morphogenesis, Cadherins, Lamin Type A, Extracellular Matrix, Cell biology, Cytosol, Cytoplasm, Delamination, 030220 oncology & carcinogenesis, Research Article, Developmental Biology
Abstract: Matrix metalloproteinases have a broad spectrum of substrates ranging from extracellular matrix components and adhesion molecules to chemokines and growth factors. Despite being mostly secreted, MMPs have been detected in the cytosol, the mitochondria or the nucleus. Although most of the attention is focused on their role in matrix remodeling, the diversity of their substrates and their complex trafficking open the possibility for non-canonical functions. Yet in vivo examples and experimental demonstration of the physiological relevance of such activities are rare. Here, we have used chick neural crest (NC) cells, a highly migratory stem cell population likened to invasive cancer cells, as a model for physiological epithelial-mesenchymal transition (EMT). We demonstrate that MMP14 is required for NC delamination. Interestingly, this role is independent of its cytoplasmic tail and of its catalytic activity. Our in vivo data indicate that, in addition to being a late pro-invasive factor, MMP14 is also likely to be an early player, owing to its role in EMT.
Published: 2020

44. Internalization of miPEP165a into Arabidopsis Roots Depends on both Passive Diffusion and Endocytosis-Associated Processes

Author: Serge Plaza, Mélanie Ormancey, Hailing Jin, Carine Duboé, Patrice Thuleau, Aurélie Le Ru, Jean-Philippe Combier, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, University of California [Riverside] (UCR), University of California, Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fédération de Recherche Agrobiosciences, Interactions et Biodiversité (FR AIB), Centre de biologie du développement (CBD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Plant Pathology & Microbiology [Riverside], University of California-University of California, Peptides et petits ARN, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), National Institute of Health (R01 GM093008), ANR-10-LABX-0041,TULIP,Towards a Unified theory of biotic Interactions: the roLe of environmental(2010), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Centre de Biologie Intégrative (CBI)
Subjects: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, MESH: Cell Division / drug effects, [SDV]Life Sciences [q-bio], Mutant, Arabidopsis, MESH: Plant Roots / drug effects, 01 natural sciences, lcsh:Chemistry, Arabidopsis thaliana, Internalization, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, lcsh:QH301-705.5, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Spectroscopy, MESH: Arabidopsis / metabolism, media_common, food and beverages, MESH: Diffusion, General Medicine, MESH: Endocytosis* / drug effects, Computer Science Applications, Cell biology, microRNAs, Central cylinder, MESH: Biological Transport, media_common.quotation_subject, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, MESH: Phenotype, Endocytosis, Catalysis, Inorganic Chemistry, 03 medical and health sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, endocytosis, MESH: Arabidopsis / cytology, Physical and Theoretical Chemistry, Mode of action, Molecular Biology, Gene, MESH: Plant Roots / metabolism, Organic Chemistry, fungi, MESH: Arabidopsis / drug effects, biology.organism_classification, 030104 developmental biology, MESH: Plants, Genetically Modified, lcsh:Biology (General), lcsh:QD1-999, peptides, miPEPs, MESH: Plant Roots / cytology, 010606 plant biology & botany
Abstract: International audience; MiPEPs are short natural peptides encoded by microRNAs in plants. Exogenous application of miPEPs increases the expression of their corresponding miRNA and, consequently, induces consistent phenotypical changes. Therefore, miPEPs carry huge potential in agronomy as gene regulators that do not require genome manipulation. However, to this end, it is necessary to know their mode of action, including where they act and how they enter the plants. Here, after analyzing the effect of Arabidopsis thaliana miPEP165a on root and aerial part development, we followed the internalization of fluorescent-labelled miPEP165a into roots and compared its uptake into endocytosis-altered mutants to that observed in wild-type plants treated or not with endocytosis inhibitors. The results show that entry of miPEP165a involves both a passive diffusion at the root apex and endocytosis-associated internalization in the differentiation and mature zones. Moreover, miPEP165a is unable to enter the central cylinder and does not migrate from the roots to the aerial part of the plant, suggesting that miPEPs have no systemic effect.
Published: 2020

45. Alary muscles and thoracic alary-related muscles are atypical striated muscles involved in maintaining the position of internal organs

Author: Bataillé, Laetitia, Colombié, Nathalie, Pelletier, Aurore, Paululat, Achim, Lebreton, Gaëlle, Carrier, Yannick, Frendo, Jean-Louis, Vincent, Alain, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI)
Subjects: animal structures, [SDV]Life Sciences [q-bio], Alary muscles, Cardiac system, Visceral system, Drosophila, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Respiratory system, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Striated muscles
Abstract: International audience; Alary muscles (AMs) have been described as a component of the cardiac system in various arthropods. Lineage-related thoracic muscles (TARMs), linking the exoskeleton to specific gut regions, have recently been discovered in Drosophila. Asymmetrical attachments of AMs and TARMs, to the exoskeleton on one side and internal organs on the other, suggested an architectural function in moving larvae. Here, we analysed the shape and sarcomeric organisation of AMs and TARMs, and imaged their atypical deformability in crawling larvae. We then selectively eliminated AMs and TARMs by targeted apoptosis. Elimination of AMs revealed that AMs are required for suspending the heart in proper intra-haemocelic position and for opening of the heart lumen, and that AMs constrain the curvature of the respiratory tracheal system during crawling; TARMs are required for proper positioning of visceral organs and efficient food transit. AM/TARM cardiac versus visceral attachment depends on Hox control, with visceral attachment being the ground state. TARMs and AMs are the first example of multinucleate striated muscles connecting the skeleton to the cardiac and visceral systems in bilaterians, with multiple physiological functions.
Published: 2020

46. Fonction d'un régulateur du cycle cellulaire, la phosphatase CDC25B, au cours de la neurogenèse chez les Mammifères

Author: Roussat, Mélanie, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Sabatier - Toulouse III, and Sophie Bel-Vialar
Subjects: Cortex cérébral, Neurogenesis, Progéniteurs, Cycle cellulaire, Neurogenèse, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Cerebral cortex, Cell cycle, CDC25B, Progenitor
Abstract: Building a functional central nervous system requires tight regulation between proliferation of neural stem/progenitor cells, and their differentiation into neurons. Abnormal proliferation can lead to tumor development, whereas early differentiation can deplete the progenitor pool and lead to brain malformations such as microcephaly. Increasing data suggest that the cell cycle kinetic of progenitors can influence their choice between proliferation or differentiation. In the chick embryo neural tube, our group showed that the expression of the CDC25B phosphatase, a positive regulator of the G2/M transition, shortens the G2 phase length and promotes neuronal production. In addition, a part of this neurogenic function of CDC25B is independent of its cell cycle function. In order to improve our understanding of its function in controlling cell fate and determining the part of its dependent and independent cell cycle functions, we generated conditionally CDC25B knock-out murine line. During my PhD project, I took advantage of this genetic model to explore the function of CDC25B during mammalian neurogenesis. My project aimed to (1) determine whether the neurogenic function of CDC25B in the bird model is conserved during mammalian spinal cord development, (2) explore the function of CDC25B during cerebral cortex development. (1) I showed that CDC25B loss-of-function lengthens the G2 phase without affecting the proliferation rate of spinal progenitors, and decreases the production of dorsal neurons. CDC25B therefore promotes neuronal differentiation in the developing mammalian spinal cord. (2) The cerebral cortex is the most recent central nervous system tissue from an evolutionary point of view. Its development is more complex and involves a more various cellular diversity than in the spinal cord. During its development, apical progenitors (aRGs) perform proliferative divisions and then switch their mode of division to produce neurons and basal progenitors (bIPs and bRGs). In this tissue, I showed that CDC25B loss-of-function results in a lengthening of the G2 phase and a shortening of the G1 phase of aRGs, without affecting the proliferation rate and the total cell cycle duration. In parallel, I quantified a decrease in bIPs production and an increase in bRGs number. Conversely, CDC25B gain-of-function increases the number of bIPs. CDC25B therefore regulates the ratio of basal progenitors produced from aRGs.[...]; Construire un système nerveux central fonctionnel nécessite une régulation stricte entre la prolifération des cellules souches/progéniteurs neuraux, et leur différenciation en neurones. Une prolifération anormale peut mener à l'apparition de tumeur, alors qu'une différenciation précoce peut épuiser le stock de progéniteurs et conduire à des malformations cérébrales comme la microcéphalie. De plus en plus de données suggèrent que la cinétique du cycle cellulaire des progéniteurs peut influencer le choix de proliférer ou se différencier. Dans le tube neural d'embryon de poulet, notre équipe a montré que l'expression de la phosphatase CDC25B, régulateur positif de la transition G2/M, raccourcit la longueur de la phase G2 et promeut la production neuronale. De plus, une partie de cette fonction neurogénique de CDC25B est indépendante de sa fonction sur le cycle cellulaire. Afin d'améliorer notre compréhension de sa fonction dans le contrôle du destin cellulaire et de déterminer la part de ses fonctions cycle cellulaire dépendante et indépendante, nous avons créé un modèle murin conditionnellement invalidé pour CDC25B. Au cours de ma thèse, j'ai mis à profit ce modèle génétique pour explorer la fonction de CDC25B dans la neurogenèse chez les Mammifères. Mon projet a consisté à (1) déterminer si la fonction neurogénique de CDC25B dans le modèle oiseau est conservée dans le développement de la moelle épinière mammifère, (2) explorer la fonction de CDC25B dans le développement du cortex cérébral. (1) J'ai pu montrer que la perte de fonction de CDC25B rallonge la phase G2 sans affecter le taux de prolifération des progéniteurs spinaux, et diminue la production des neurones dorsaux. CDC25B promeut donc la différenciation neuronale dans la moelle épinière en développement des Mammifères. (2) Le cortex cérébral est le tissu du système nerveux central le plus récent d'un point de vue évolutif. Sa mise en place est plus complexe et met en jeu une plus grande diversité cellulaire que dans la moelle épinière. Au cours de son développement, les progéniteurs apicaux (aRGs) effectuent des divisions prolifératives puis changent de mode de division pour produire des neurones et des progéniteurs basaux (bIPs et bRGs). Dans ce tissu, j'ai montré que la perte de fonction de CDC25B entraine un rallongement de la durée de la phase G2 et un raccourcissement de la durée de la phase G1 du cycle des aRGs, sans affecter le taux de prolifération et la durée totale du cycle cellulaire. En parallèle, j'ai identifié une diminution de la production des bIPs et une augmentation des bRGs. A l'inverse, le gain de fonction de CDC25B augmente le nombre de bIPs. [...]
Published: 2020

47. Function of a cell cycle regulator, the CDC25B phosphatase, during mammalian neurogenesis

Author: Roussat, Mélanie, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul Sabatier - Toulouse III, and Sophie Bel-Vialar
Subjects: Cortex cérébral, Neurogenesis, Progéniteurs, Cycle cellulaire, Neurogenèse, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Cerebral cortex, Cell cycle, CDC25B, Progenitor
Abstract: Building a functional central nervous system requires tight regulation between proliferation of neural stem/progenitor cells, and their differentiation into neurons. Abnormal proliferation can lead to tumor development, whereas early differentiation can deplete the progenitor pool and lead to brain malformations such as microcephaly. Increasing data suggest that the cell cycle kinetic of progenitors can influence their choice between proliferation or differentiation. In the chick embryo neural tube, our group showed that the expression of the CDC25B phosphatase, a positive regulator of the G2/M transition, shortens the G2 phase length and promotes neuronal production. In addition, a part of this neurogenic function of CDC25B is independent of its cell cycle function. In order to improve our understanding of its function in controlling cell fate and determining the part of its dependent and independent cell cycle functions, we generated conditionally CDC25B knock-out murine line. During my PhD project, I took advantage of this genetic model to explore the function of CDC25B during mammalian neurogenesis. My project aimed to (1) determine whether the neurogenic function of CDC25B in the bird model is conserved during mammalian spinal cord development, (2) explore the function of CDC25B during cerebral cortex development. (1) I showed that CDC25B loss-of-function lengthens the G2 phase without affecting the proliferation rate of spinal progenitors, and decreases the production of dorsal neurons. CDC25B therefore promotes neuronal differentiation in the developing mammalian spinal cord. (2) The cerebral cortex is the most recent central nervous system tissue from an evolutionary point of view. Its development is more complex and involves a more various cellular diversity than in the spinal cord. During its development, apical progenitors (aRGs) perform proliferative divisions and then switch their mode of division to produce neurons and basal progenitors (bIPs and bRGs). In this tissue, I showed that CDC25B loss-of-function results in a lengthening of the G2 phase and a shortening of the G1 phase of aRGs, without affecting the proliferation rate and the total cell cycle duration. In parallel, I quantified a decrease in bIPs production and an increase in bRGs number. Conversely, CDC25B gain-of-function increases the number of bIPs. CDC25B therefore regulates the ratio of basal progenitors produced from aRGs.[...]; Construire un système nerveux central fonctionnel nécessite une régulation stricte entre la prolifération des cellules souches/progéniteurs neuraux, et leur différenciation en neurones. Une prolifération anormale peut mener à l'apparition de tumeur, alors qu'une différenciation précoce peut épuiser le stock de progéniteurs et conduire à des malformations cérébrales comme la microcéphalie. De plus en plus de données suggèrent que la cinétique du cycle cellulaire des progéniteurs peut influencer le choix de proliférer ou se différencier. Dans le tube neural d'embryon de poulet, notre équipe a montré que l'expression de la phosphatase CDC25B, régulateur positif de la transition G2/M, raccourcit la longueur de la phase G2 et promeut la production neuronale. De plus, une partie de cette fonction neurogénique de CDC25B est indépendante de sa fonction sur le cycle cellulaire. Afin d'améliorer notre compréhension de sa fonction dans le contrôle du destin cellulaire et de déterminer la part de ses fonctions cycle cellulaire dépendante et indépendante, nous avons créé un modèle murin conditionnellement invalidé pour CDC25B. Au cours de ma thèse, j'ai mis à profit ce modèle génétique pour explorer la fonction de CDC25B dans la neurogenèse chez les Mammifères. Mon projet a consisté à (1) déterminer si la fonction neurogénique de CDC25B dans le modèle oiseau est conservée dans le développement de la moelle épinière mammifère, (2) explorer la fonction de CDC25B dans le développement du cortex cérébral. (1) J'ai pu montrer que la perte de fonction de CDC25B rallonge la phase G2 sans affecter le taux de prolifération des progéniteurs spinaux, et diminue la production des neurones dorsaux. CDC25B promeut donc la différenciation neuronale dans la moelle épinière en développement des Mammifères. (2) Le cortex cérébral est le tissu du système nerveux central le plus récent d'un point de vue évolutif. Sa mise en place est plus complexe et met en jeu une plus grande diversité cellulaire que dans la moelle épinière. Au cours de son développement, les progéniteurs apicaux (aRGs) effectuent des divisions prolifératives puis changent de mode de division pour produire des neurones et des progéniteurs basaux (bIPs et bRGs). Dans ce tissu, j'ai montré que la perte de fonction de CDC25B entraine un rallongement de la durée de la phase G2 et un raccourcissement de la durée de la phase G1 du cycle des aRGs, sans affecter le taux de prolifération et la durée totale du cycle cellulaire. En parallèle, j'ai identifié une diminution de la production des bIPs et une augmentation des bRGs. A l'inverse, le gain de fonction de CDC25B augmente le nombre de bIPs. [...]
Published: 2020

48. Mediator complex subunit Med19 binds directly GATA transcription factors and is required with Med1 for GATA-driven gene regulation in vivo

Author: Adeline Payet, Muriel Boube, Alexis Verger, Emmanuelle Guillou, Mohamed A. Benmedjahed, Clément Immarigeon, Marie Couralet, Didier Monté, Elodie Prince, Henri-Marc Bourbon, Vincent Villeret, Sandra Bernat-Fabre, Centre de biologie du développement (CBD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie Structurale Intégrative (ERL 9002 - BSI ), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported by French Ministère de l'Enseignement et de la Recherche (to C. I.), the Ligue Nationale contre le Cancer (to C. I. and A. P.), the Association pour la Recherche sur le Cancer Grant ARC PJA 20141201932, and the Agence Nationale de Recherche Grant ANR-16 CE12-0021-01. This work was also supported by the Centre National de Recherche Scientifique (CNRS) and Toulouse III University., ANR-16-CE12-0021,MEDNET,Le complexe Médiateur: d'un réseau d'interactions protéine-protéine à la régulation génique in vivo(2016), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 (RID-AGE), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI)
Subjects: 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], RNA polymerase II, Transcription coregulator, Drosophila development, Biochemistry, (Srp) Pannier (Pnr), MED1, thoracic closure, 03 medical and health sciences, Mediator, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Transcriptional regulation, Animals, Drosophila Proteins, Gene Regulation, Serpent, Mediator complex, DNA-binding domain, Molecular Biology, Transcription factor, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Regulation of gene expression, Binding Sites, 030102 biochemistry & molecular biology, biology, cofactor, Cell Biology, Cell biology, Med19, Drosophila melanogaster, 030104 developmental biology, Gene Expression Regulation, biology.protein, GATA transcription factors, GATA transcription factor, Med1, Activation domain
Abstract: International audience; The evolutionarily conserved multiprotein Mediator complex (MED) serves as an interface between DNA-bound transcription factors (TFs) and the RNA Pol II machinery. It has been proposed that each TF interacts with a dedicated MED subunit to induce specific transcriptional responses. But are these binary partnerships sufficient to mediate TF functions? We have previously established that the Med1 Mediator subunit serves as a cofactor of GATA TFs in Drosophila, as shown in mammals. Here, we observe mutant phenotype similarities between another subunit, Med19, and the Drosophila GATA TF Pannier (Pnr), suggesting functional interaction. We further show that Med19 physically interacts with the Drosophila GATA TFs, Pnr and Serpent (Srp), in vivo and in vitro through their conserved C-zinc finger domains. Moreover, Med19 loss of function experiments in vivo or in cellulo indicate that it is required for Pnr- and Srp-dependent gene expression, suggesting general GATA cofactor functions. Interestingly, Med19 but not Med1 is critical for the regulation of all tested GATA target genes, implying shared or differential use of MED subunits by GATAs depending on the target gene. Lastly, we show a direct interaction between Med19 and Med1 by GST pulldown experiments indicating privileged contacts between these two subunits of the MED middle module. Together, these findings identify Med19/Med1 as a composite GATA TF interface and suggest that binary MED subunit–TF partnerships are probably oversimplified models. We propose several mechanisms to account for the transcriptional regulation of GATA-targeted genes.
Published: 2020

49. Shavenbaby and Yorkie mediate Hippo signaling to protect adult stem cells from apoptosis

Author: Bohère, Jérôme, Mancheno-Ferris, Alexandra, Al Hayek, Sandy, Zanet, Jennifer, Valenti, Philippe, Akino, Kohsuke, Yamabe, Yuya, Inagaki, Sachi, Chanut-Delalande, Hélène, Plaza, Serge, Kageyama, Yuji, Osman, Dani, Polesello, Cédric, Payre, François, Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Parisien de l'Epaule, and Kanazawa Institute of Technology
Subjects: animal structures, Science, Intracellular Signaling Peptides and Proteins, Nuclear Proteins, Apoptosis, YAP-Signaling Proteins, Protein Serine-Threonine Kinases, Article, DNA-Binding Proteins, Adult Stem Cells, In Situ Nick-End Labeling, Trans-Activators, Animals, Drosophila Proteins, Drosophila, lcsh:Q, lcsh:Science, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Signal Transduction, Transcription Factors
Abstract: To compensate for accumulating damages and cell death, adult homeostasis (e.g., body fluids and secretion) requires organ regeneration, operated by long-lived stem cells. How stem cells can survive throughout the animal life remains poorly understood. Here we show that the transcription factor Shavenbaby (Svb, OvoL in vertebrates) is expressed in renal/nephric stem cells (RNSCs) of Drosophila and required for their maintenance during adulthood. As recently shown in embryos, Svb function in adult RNSCs further needs a post-translational processing mediated by the Polished rice (Pri) smORF peptides and impairing Svb function leads to RNSC apoptosis. We show that Svb interacts both genetically and physically with Yorkie (YAP/TAZ in vertebrates), a nuclear effector of the Hippo pathway, to activate the expression of the inhibitor of apoptosis DIAP1. These data therefore identify Svb as a nuclear effector in the Hippo pathway, critical for the survival of adult somatic stem cells., Organ regeneration by stem cells is required to compensate for tissue damage during aging, although how stem cells are maintained in adulthood is poorly understood. Here, the authors show in Drosophila that Shavenbaby interacts with Yorkie, a mediator of Hippo signalling, to ensure adult stem cell survival.
Published: 2018

50. Demethylation by low-dose 5-aza-2′-deoxycytidine impairs 3D melanoma invasion partially through miR-199a-3p expression revealing the role of this miR in melanoma

Author: Chantal Etievant, Audrey Delmas, Paola B. Arimondo, Arnaud Pillon, Gilles Favre, Joëlle Riond, Jörg Tost, Arnaud Carrier, Florence Busato, Cécile Desjobert, Antoine Daunay, Diego M. Marzese, Pharmacochimie de la Régulation Epigénétique du Cancer (ETaC), PIERRE FABRE-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre d'Etude du Polymorphisme Humain (CEPH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Fondation Jean Dausset, Centre National de Génotypage (CNG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoires Pierre Fabre, Laboratoire d'Epigénétique et d'Environnement [Evry] (CNG - CEA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de Genotypage-Institut de Génomique [Evry], Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), PIERRE FABRE-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), John Wayne Cancer Institute [Santa Monica, CA, USA], Chimie biologique épigénétique - Epigenetic Chemical Biology (EpiCBio), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported to P.B.A. by Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) [ATIP], Région Midi Pyrenées [Equipe d’Excellence and FEDER CNRS/Région Midi Pyrenées], Fondation InNaBioSanté, and PlanCancer2014 (N°EPIG201401)., Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fondation Jean Dausset-Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), and Riond, Joelle
Subjects: 0301 basic medicine, Lung Neoplasms, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:Medicine, MESH: Spheroids, Cellular, Transcriptome, Mice, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, MESH: DNA Methylation, MESH: Up-Regulation, MESH: Sequence Analysis, RNA, Gene Regulatory Networks, MESH: Animals, Promoter Regions, Genetic, Melanoma, Genetics (clinical), MESH: Gene Regulatory Networks, DNA methylation, microRNA, MESH: Gene Expression Regulation, Neoplastic, Up-Regulation, 3. Good health, Gene Expression Regulation, Neoplastic, [SDV] Life Sciences [q-bio], MESH: Cell Survival, 030220 oncology & carcinogenesis, Female, Deoxycytidine, Epigenetics, MESH: Cell Line, Tumor, lcsh:QH426-470, Cell Survival, MESH: Melanoma, education, Biology, Decitabine, 03 medical and health sciences, MESH: Gene Expression Profiling, In vivo, Cell Line, Tumor, Spheroids, Cellular, MESH: Promoter Regions, Genetic, Genetics, medicine, Animals, Humans, Neoplasm Invasiveness, Molecular Biology, MESH: Mice, neoplasms, MESH: Humans, MESH: Decitabine, Sequence Analysis, RNA, Research, Gene Expression Profiling, lcsh:R, MESH: Neoplasm Invasiveness, medicine.disease, Demethylating agent, MESH: Lung Neoplasms, lcsh:Genetics, MicroRNAs, 030104 developmental biology, chemistry, Cancer research, Melanoma aggressiveness, MESH: Female, MESH: MicroRNAs, Neoplasm Transplantation, MESH: Neoplasm Transplantation, Developmental Biology
Abstract: Background Efficient treatments against metastatic melanoma dissemination are still lacking. Here, we report that low-cytotoxic concentrations of 5-aza-2′-deoxycytidine, a DNA demethylating agent, prevent in vitro 3D invasiveness of metastatic melanoma cells and reduce lung metastasis formation in vivo. Results We unravelled that this beneficial effect is in part due to MIR-199A2 re-expression by promoter demethylation. Alone, this miR showed an anti-invasive and anti-metastatic effect. Throughout integration of micro-RNA target prediction databases with transcriptomic analysis after 5-aza-2′-deoxycytidine treatments, we found that miR-199a-3p downregulates set of genes significantly involved in invasion/migration processes. In addition, analysis of data from melanoma patients showed a stage- and tissue type-dependent modulation of MIR-199A2 expression by DNA methylation. Conclusions Thus, our data suggest that epigenetic- and/or miR-based therapeutic strategies can be relevant to limit metastatic dissemination of melanoma. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s13148-018-0600-2) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Published: 2019

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