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12 results on '"Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA)"'

1. Projet EVALG : Mise au point de protocoles et d'indicateurs pour l'EVaLuation de l'état écologique et des stocks de macroALGues au sein du Parc Naturel Marin de l'Estuaire de la Gironde et de la Mer des Pertuis

Author

Bouchemousse, Sarah, Le Bris, Anthony, Le Goff, Tristan, Thirion, Jean-Marc, Vollette, Julie, Sauriau, Pierre-Guy, Richier, Sophie, Michel, Rémy, Weiller, Yohan, Dessier, Aurélie, Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), Association Objectifs Biodiversités (OBIOS), LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs), La Rochelle Université (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Southampton, Office français de la biodiversité (OFB), Parc Naturel Marin de l'Estuaire de la Gironde et de la Mer des Pertuis, Anna Capietto, Sandrine Derrien, Thibaut de Bettignies, Sophie Beauvais, Anahita Marzin, Alain Pibot, Juliette Delavenne, and European Project: LIFE16 IPE/FR001,LIFE16 IPE/FR001

Subjects
Habitat marin, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [SDE.IE]Environmental Sciences/Environmental Engineering, conservation, Macroalgues marines, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography
Abstract

National audience

Published
2022

2. AlgaeTraits: a trait database for (European) seaweeds

Author

Sofie Vranken, Marine Robuchon, Stefanie Dekeyzer, Ignacio Bárbara, Inka Bartsch, Aurélie Blanfuné, Charles-François Boudouresque, Wim Decock, Christophe Destombe, Bruno de Reviers, Pilar Díaz-Tapia, Anne Herbst, Romain Julliard, Rolf Karez, Priit Kersen, Stacy A. Krueger-Hadfield, Ralph Kuhlenkamp, Akira F. Peters, Viviana Peña, Cristina Piñeiro-Corbeira, Fabio Rindi, Florence Rousseau, Jan Rueness, Hendrik Schubert, Kjersti Sjøtun, Marta Sansón, Dan Smale, Thierry Thibaut, Myriam Valero, Leen Vandepitte, Bart Vanhoorne, Alba Vergés, Marc Verlaque, Christophe Vieira, Line Le Gall, Frederik Leliaert, Olivier De Clerck, European Commission - Joint Research Centre [Ispra] (JRC), Universidade da Coruña, Alfred-Wegener-Institute Helmholtz Centre for Polar and Marine Research, Biologische Anstalt Helgoland, Helgoland, Germany, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie évolutive et écologie des algues = Evolutionary Biology and Ecology of Algae (EBEA), Pontificia Universidad Católica de Chile (UC)-Sorbonne Université (SU)-Universidad Austral de Chile-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Station biologique de Roscoff (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Centre d'Ecologie et des Sciences de la COnservation (CESCO), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Alabama at Birmingham [ Birmingham] (UAB), Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), University of Aberdeen, Bezhin Rosko, ESSD – Ocean/Biological oceanography, Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente, Università Politecnica delle Marche, Ancona, Italy, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and University of Bergen (UiB)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences
Abstract

The analysis of biological and ecological traits has a long history in evolutionary and ecological research. However, trait data are often scattered and standardised terminology that transcends taxonomic and biogeographical context are generally missing. As part of the development of a global trait database of marine species, we collated trait information for European seaweeds and structured the data within the standardised framework of the World Register of Marine Species (WoRMS). We collected 45,175 records for 21 biologically and ecologically relevant traits of seaweeds. This resulted in a trait database for 1,745 European seaweed species of which more than half (56 %) of the records were documented at the species level, while the remaining 44 % was documented at a higher taxonomic level and subsequently inherited at lower levels. The trait database for European seaweeds will serve as a foundation for future research on diversity and evolution of seaweeds, and their responses to global changes. The data will contribute to developing detailed trait-based ecosystem models, and will be an important tool to inform marine conservation policies. The data is publicly accessible through the AlgaeTraits portal, algaetraits.org, doi: https://doi.org/10.14284/574, (AlgaeTraits, 2022).

Published
2022

3. Data on characterization of nano- and micro-structures resulting from glycine betaine surfactant/kappa-carrageenan interactions by Laser Scanning Confocal Microscopy and Transmission Electron Microscopy

Author

Cédric Gaillard, Rudy Covis, Maud Benoit, Thierry Benvegnu, Yunhui Wang, Thomas Vives, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d׳étude et de Valorisation des Algues, ANR-10-BTBR-04, Agence Nationale de la Recherche, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages ( BIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut des Sciences Chimiques de Rennes ( ISCR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), ANR-10-BTBR-0004,IDEALG,Biotechnologies pour la valorisation des macroalgues(2010), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], Analytical chemistry, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, lcsh:Computer applications to medicine. Medical informatics, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, Betaine, Pulmonary surfactant, Amide, Nano, lcsh:Science (General), ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Data Article, chemistry.chemical_classification, Electrostatic interactions, Multidisciplinary, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Chemistry, Glycine betaine surfactant/kappa-carrageenan complexes, Cationic polymerization, Polymer, 021001 nanoscience & nanotechnology, Nano- and micro-structures, 0104 chemical sciences, Laser Scanning Confocal Microscopy and Transmission Electron Microscopy, Chemical engineering, Transmission electron microscopy, Glycine, lcsh:R858-859.7, 0210 nano-technology, lcsh:Q1-390
Abstract

This article contains data on the Laser Scanning Confocal Microscopy (LSCM) and Transmission Electron Microscopy (TEM) images related to multi-scaled self-assemblies resulting from 'green' cationic glycine betaine surfactant/anionic kappa-carrageenan interactions. These data gave clear evidence of the evolution of the micron-, nano-sized structures obtained at two surfactant/polymer molar ratios (3.5 and 0.8) and after the dilution of the aqueous dispersions with factors of 5 and 10 times. This data article is related to the research article entitled, "Monitoring the architecture of anionic ĸ-carrageenan/cationic glycine betaine amide surfactant assemblies by dilution: A multiscale approach" (Gaillard et al., 2017) [1].

Published
2016
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4. Eutrophisation : manifestations, causes, conséquences et prédictibilité

Author

Lynda Aissani, Anschutz, P., Barthelemy, C., Fabrice Béline, Gudrun Bornette, Catherine Boutin, Magalie Bourblanc, Chapelle, A., Christian Chauvin, Claquin, P., Alain Crave, Pascal Denoroy, Dorioz, J. M., Douguet, J. M., Doussan, I., Durand, P., Claire Etrillard, Euzen, A., Didier Gascuel, Gross, E., Hoepffner, N., Humbert, J. F., Lacroix, G., Olivier Le Pape, Lefebvre, A., Jean-Marie Lescot, Alix Levain, Miossec, L., Florentina Moatar, Mostajir, B., Pannaud, A., Frédéric Rimet, Nicolas Rossi, Jose Miguel SANCHEZ PEREZ, Sauvage, S., Souchu, P., Jean-Philippe Terreaux, Usseglio Polatera, P., Vinçon Leite, B., Gilles Pinay, Chantal Gascuel, Ménesguen, A., Yves Souchon, Le Moal, M., Optimisation des procédés en Agriculture, Agroalimentaire et Environnement (UR OPAALE), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU), Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris-Saclay, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Lorraine (UL), JOINT RESEARCH CENTER ITA, Partenaires IRSTEA, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), ROYAL BELGIAN INSTITUTE OF NATURAL SCIENCES BEL, Université de Tours (UT), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), CENTRE D'ETUDE ET DE VALORISATION DES ALGUES FRA, Environnement, territoires et infrastructures (UR ETBX), École des Ponts ParisTech (ENPC), National Recherche, irstea, Ministères en charge de l'environnement et de l'agriculture Agence française pour la biodiversité, Université de Tours, Université de Rennes (UR), and Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA)

Subjects
[SDE]Environmental Sciences
Abstract

[Departement_IRSTEA]Eaux [Departement_IRSTEA]Ecotechnologies [Departement_IRSTEA]Territoires [TR1_IRSTEA]BELCA [TR2_IRSTEA]TED [TR2_IRSTEA]DTAM [TR2_IRSTEA]QUASARE [Type_IRSTEA]Rapport d'expertise; Synthèse du rapport d'une expertise scientifique collective. Elle établit un état des lieux critique sur les connaissances scientifiques disponibles au plan international sur les causes, les mécanismes, les conséquences et la prédictibilité des phénomènes d'eutrophisation.

Published
2017

5. Proposition of indicators of anthropogenic pressure in the Bay of Toulon (Mediterranean Sea) based on zooplankton time-series

Author

Jean-Louis Jamet, B. Serranito, Anaïs Aubert, Lars Stemmann, N Rossi, Processus de Transfert et d'Echanges dans l'Environnement - EA 3819 (PROTEE), Université de Toulon (UTLN), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), Centre d'Etude et de Valorisation des Algues (CEVA), and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)

Subjects
0106 biological sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Good Environmental Status, 010604 marine biology & hydrobiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Geology, Context (language use), Aquatic Science, Oceanography, 01 natural sciences, Zooplankton, Fishery, Marine Strategy Framework Directive, Diversity index, Mediterranean sea, 13. Climate action, [SDE]Environmental Sciences, Environmental science, Species evenness, 14. Life underwater, Bay, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract

International audience; Zooplankton present characteristics of high interest in the frame of investigation for organisms sensitive to environmental changes and/or anthropogenic pressures. Such indicators are particularly needed in the present context of European legislation (Marine Strategy Framework Directive). However, zooplankton have not been given the interest they should have in regards to these issues. The aim of the present study is to provide an attempt of proposition of indicators of good environmental status and associated thresholds based on zooplankton data. Zooplankton time-series (2002–2013) from the Toulon Bay in the Mediterranean was used. This time-series presents the great characteristics that the sampling has be done jointly in two areas of the Bay of Toulon known to differ in term of anthropogenic pressures. The study focus on the copepod assemblage and different potential indicators are tested: ratio of copepod families on total copepod and diversity index (Piélou's evenness). The indicators relevance was evaluated per season by looking at the importance of the overlapping region between density's distributions for each indicator in both bays. This methodology well-recognized is commonly used, particularly in the medical sector, for a long time. The results show that the Oithonidae relative abundance and the Piélou's evenness index are the best indicators of anthropogenic pollution for this case study. Thresholds related to the selected indicators are also proposed in order to characterize the degree of anthropogenic pressure for the Toulon Bay and to provide a first evaluation for potential environmental management. Applicability of the selected indicators and future development needed are also discussed. This study is a first step in the investigation for operational zooplankton indicators and should open the way for additional studies in coastal anthropized area such as the Mediterranean coast where it is more urgently needed. &

Published
2016

6. A novel unsaturated β-glucuronyl hydrolase involved in ulvan degradation unveils the versatility of stereochemistry requirements in family GH105

Author

Mirjam Czjzek, Pedro M. Coutinho, Pi Nyvall Collén, Jean-François Sassi, William Helbert, Alexandra Jeudy, Agnès Groisillier, Végétaux marins et biomolécules, Station biologique de Roscoff [Roscoff] (SBR), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-GOEMAR-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Architecture et fonction des macromolécules biologiques (AFMB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CNRS, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pôle biotechnologique, Amadéite SAS, Algae Prod Innovat, Centre d'Etudes et de Valorisation des Algues (CEVA), Laboratoire de Biologie Intégrative des Modèles Marins (LBI2M), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA)

Subjects
CAZy, Glycoside Hydrolases, Stereochemistry, Rhamnose, [SDV]Life Sciences [q-bio], Glycobiology and Extracellular Matrices, Iduronic acid, MESH: Flavobacteriaceae, Biochemistry, Substrate Specificity, MESH: Recombinant Proteins, chemistry.chemical_compound, Bacterial Proteins, Polysaccharides, Hydrolase, MESH: Glycoside Hydrolases, Glycoside hydrolase, Molecular Biology, MESH: Bacterial Proteins, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, chemistry.chemical_classification, biology, MESH: Kinetics, Hydrolysis, fungi, Active site, Glycoside, Glycosidic bond, Cell Biology, Recombinant Proteins, Kinetics, MESH: Polysaccharides, chemistry, biology.protein, MESH: Substrate Specificity, Flavobacteriaceae, MESH: Hydrolysis
Abstract

International audience; Ulvans are cell wall matrix polysaccharides in green algae belonging to the genus Ulva. Enzymatic degradation of the polysaccharide by ulvan lyases leads to the production of oligosaccharides with an unsaturated β-glucuronyl residue located at the non-reducing end. Exploration of the genomic environment around the Nonlabens ulvanivorans (previously Percicivirga ulvanivorans) ulvan lyase revealed a gene highly similar to known unsaturated uronyl hydrolases classified in the CAZy glycoside hydrolase family 105. The gene was cloned, the protein was overexpressed in Escherichia coli, and enzymology experiments demonstrated its unsaturated β-glucuronyl activity. Kinetic analysis of purified oligo-ulvans incubated with the new enzyme showed that the full substrate specificity is attained by three subsites that preferentially bind anionic residues (sulfated rhamnose, glucuronic/iduronic acid). The three-dimensional crystal structure of the native enzyme reveals that a trimeric organization is required for substrate binding and recognition at the +2 binding subsite. This novel unsaturated β-glucuronyl hydrolase is part of a previously uncharacterized subgroup of GH105 members and exhibits only a very limited sequence similarity to known unsaturated β-glucuronyl sequences previously found only in family GH88. Clan-O formed by families GH88 and GH105 was singular in the fact that it covered families acting on both axial and equatorial glycosidic linkages, respectively. The overall comparison of active site structures between enzymes from these two families highlights how that within family GH105, and unlike for classical glycoside hydrolysis, the hydrolysis of vinyl ether groups from unsaturated saccharides occurs independently of the α or β configuration of the cleaved linkage.

Published
2014

7. Des marées vertes pour longtemps ? Analyses scientifiques et plans de lutte contre les algues vertes

Author

Aquilina, Luc, Aurousseau, Pierre, Croix, Nicole, Desprez, Laure, Dion, Patrick, Durand, Patrick, Helin, Jean Claude, Ménesguen, Alain, TOURNEBIZE, Julien, Van Tilbeurgh, Véronique, Géosciences Rennes (GR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Nantes (UN), Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), CEVA, Laboratoire d’écologie benthique, IFREMER, Hydrosystèmes et Bioprocédés (UR HBAN), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Espaces et Sociétés (ESO), Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université d'Angers (UA)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Le Mans Université (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), CENTRE D ETUDE ET DE VALORISATION DES ALGUES PLEUBIAN FRA, Partenaires IRSTEA, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), CEVA Santé Animale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hydrosystèmes et bioprocédés (UR HBAN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement (IGARUN), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Irstea Publications, Migration, Géosciences, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Benthique Côtière (LEBCO), Dynamiques des Écosystèmes Côtiers (DYNECO), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CEVA Santé Animale [Libourne, France] (Laboratoire Vétérinaire Pharmaceutique), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Le Mans Université (UM)-Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Géographie et d'Aménagement Régional de l'Université de Nantes (IGARUN), Le Mans Université (UM)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 2 (UR2), Institut de Géographie et d'Aménagement (IGARUN), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST-Université d'Angers (UA)-Université de Caen Normandie (UNICAEN)

Subjects
[SDE] Environmental Sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, BRETAGNE
Abstract

Dans le cadre du plan Algues vertes mis en place en 2010 par le gouvernement, un comité scientifique a été constitué pour en valider les principales orientations. Ce comité scientifique Algues vertes (CSAV) a analysé dans un premier temps le cahier des charges de l’appel à propositions, puis examiné chacun des huit plans d’actions territoriaux qui ont été proposés par les périmètres concernés et définis au Schéma directeur d’aménagement et de gestion des eaux du bassin Loire-Bretagne (SDAGE 2010-2015).La présence d’un comité scientifique en appui à une décision politique proposant une démarche de concertation territorialisée, ainsi que les échanges entre le comité et les porteurs de projet sont des expériences relativement inédites. Il nous paraît donc intéressant d’analyser l’interaction entre les scientifiques et le processus d’élaboration des projets et de synthétiser les avis rendus sur ces projets. Certains des membres du comité ont souhaité réaliser cette analyse qui se décompose en quatre parties. Dans un premier temps, on analysera comment la logique rationnelle et scientifique « objectifs-actions » se heurte à des logiques socioculturelles des acteurs de terrain, puis comment ces logiques et jeux d’acteurs condamnent les projets à n’avoir qu’une portée limitée. On montreraensuite comment le CSAV a tenté de ne pas se poser en scientifique censeur et à garder la plus grande objectivité possible et comment il a apporté des expertises qui ont permis certaines évolutions. Enfin on rappellera comment le travail a permis d’identifier des dynamiques positives et de tracer des voies d’actions plus efficaces.

Published
2013

8. Medium-throughput profiling method for screening polysaccharide-degrading enzymes in complex bacterial extracts

Author

William Helbert, Claire Boisset, Andréa Leroy, Jean-François Sassi, Marc Lahaye, Pi Nyvall-Collen, Aurélie Prechoux, Maude Fer, Algae Prod Innovat, Centre d'Etudes et de Valorisation des Algues (CEVA), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de Recherches sur les Macromolécules Végétales (CERMAV), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Végétaux marins et biomolécules, Station biologique de Roscoff [Roscoff] (SBR), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-GOEMAR-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Microbiology (medical), LAMBDA-CARRAGEENAN, Glycoside Hydrolases, PSEUDOALTEROMONAS-CARRAGEENOVORA, Polysaccharide-Lyases, CELLULASE ACTIVITY, Biology, ENZYMATIC-HYDROLYSIS, Polysaccharide, Microbiology, MARINE-BACTERIA, 03 medical and health sciences, Polysaccharides, Mass Screening, [CHIM]Chemical Sciences, Glycoside hydrolase, ASSAY, MICROORGANISMS, Polysaccharide lyases, Molecular Biology, Pseudoalteromonas carrageenovora, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, 030306 microbiology, Profiling, REDUCING SUGARS, biology.organism_classification, OLIGOSACCHARIDES, Pseudoalteromonas, Enzyme, chemistry, Biochemistry, Metagenomics, Screening, PSEUDOMONAS-CARRAGEENOVORA, Enzyme degradation, Filtration, Macromolecule
Abstract

International audience; Polysaccharides are the most abundant and the most diverse renewable materials found on earth. Due to the stereochemical variability of carbohydrates, polysaccharide-degrading enzymes - i.e. glycoside hydrolases and polysaccharide lyases - are essential tools for resolving the structure of these complex macromolecules. The exponential increase of genomic and metagenomic data contrasts sharply with the low number of proteins that have ascribed functions. To help fill this gap, we designed and implemented a medium-throughput profiling method to screen for polysaccharide-degrading enzymes in crude bacterial extracts. Our strategy was based on a series of filtrations, which are absolutely necessary to eliminate any reducing sugars not directly generated by enzyme degradation. In contrast with other protocols already available in the literature, our method can be applied to any panel of polysaccharides having known and unknown structures because no chemical modifications are required. We applied this approach to screen for enzymes that occur in Pseudoalteromonas carrageenovora grown in two culture conditions. (c) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.

Published
2012

9. The photodynamic therapy

Author

Barberi-Heyob, Muriel, Frochot, Celine, Bezdetnaya-Bolotine, Lina, Brault, Daniel, Dumas, Dominique, Guillemin, Francois, Krausz, Pierre, Maillard, Philippe, Maunit, Benoit, Merlin, Jean-Louis, Serge Mordon, Muller, Jean-Francois, Patrice, Thierry, Simonneaux, Gerard, Tanielian, Charles, Tostivin, Gisèle, Centre de Recherche en Automatique de Nancy (CRAN), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Alexis Vautrin (CAV), Epidémiologie, Démographie et Sciences Sociales: santé reproductive, sexualité et infection à VIH (Inserm U569), Epidémiologie, sciences sociales, santé publique (IFR 69), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d'études démographiques (INED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL), Médicaments Photoactivables - Photochimiothérapie (PHOTOMED), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Etude et de Valorisation des Algues (CEVA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire de Chimie des Substances Naturelles (LCSN), Université de Limoges (UNILIM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503), Laboratoire de Spectrométrie de Masse et de Chimie Laser (LSMCL), Université Paul Verlaine - Metz (UPVM), Institut de médecine predictive et de recherche thérapeutique (IMPRT), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Centre Régional de Lutte contre le Cancer Oscar Lambret [Lille] (UNICANCER/Lille), Université Lille Nord de France (COMUE)-UNICANCER-Université Lille Nord de France (COMUE)-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Acides Nucléiques & Biophotonique (AnBiophi), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plate-forme Imagerie et Biophysique Cellulaire et Tissulaire (PTIBC-IBISA Nancy), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP), Laboratoire Énergies et Mécanique Théorique et Appliquée (LEMTA ), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Organique et Analytique (ICOA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université d'Orléans (UO)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Signalisation, Génomique et Recherche Translationnelle en Oncologie (SIGRETO), Therapies Interventionnelles Assistees Par l'Image et la Simulation, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Merigaud, Françoise, Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), Université de Lille-UNICANCER-Université de Lille-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Therapies Interventionnelles Assistees Par l'Image et la Simulation - U 703 (Thiais)

Subjects
cellular pharmacokinetics, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, photosensitizer, Photodynamic therapy (PDT), [CHIM.ORGA] Chemical Sciences/Organic chemistry, photochimie, photosensibilisant, cancer, oxygène, ciblage, vivant, oxygen, Thérapie photodynamique (PDT), targeting, pharmacocinétique cellulaire
Abstract

The photodynamic therapy, more exactly named dynamic photochemotherapy, is a new approach based on the combined action of a photoactive drug or photosensitizer, light and oxygen. These compounds are non toxic without appropriated light exposure but produce, after irradiation, reactive species in presence of molecular oxygen, leading to target tissue destruction. This article describes first the photosensitization molecular mechanisms, then the photophysical and chemical properties requested to obtain a « good » photosensitizer. In order to propose photosensitizers really adapted to therapeutic applications, more efficient and selective new photoactive compounds are elaborated. At last, the main application fields of photodynamic therapy, the limits and the future of this treatment are developed., La thérapie photodynamique est une nouvelle approche, basée sur l'action sélective par la lumière de médicaments, dits photosensibilisateurs. Ces molécules, non toxiques en absence d'une lumière de longueur d'onde appropriée, génèrent, après irradiation lumineuse et en présence d'oxygène, des espèces très réactives entraînant la destruction du tissu cible. Cet article décrit tout d'abord les mécanismes moléculaires de photosensibilisation, puis les propriétés chimiques et photophysiques d'un « bon » photosensibilisateur. Une conception rationnelle de photosensibilisateurs adaptés aux applications thérapeutiques passe nécessairement par un effort d'élaboration de nouveaux composés photo-activables plus efficaces, donc plus sélectifs. Enfin, les principaux domaines d'application, notamment en cancérologie, ainsi que les freins et les perspectives de la thérapie photodynamique sont développés.

Published
2007

10. ISOLATION OF FUCANOLYTIC MARINE BACTERIA AS A SOURCE OF FUCAN DEPOLYMERAZING ENZYMES. - APPLICATION TO THE INDUSTRIAL PRODUCTION OF BIOLOGICALLY-ACTIVE OLIGO-FUCANS

Author

Hemon, E., Marfaing, H., Sassi, J.F., Lerat, Y., Brault, D., Daniel, Régis, Lebeault, Maylis, Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement (LAMBE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Etude et de Valorisation des Algues (CEVA), and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)

Subjects
[PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH] Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph]
Abstract

Conférence du 27 au 29 Juin 2007. Communication par affiche.

Published
2007

11. Thermomechanical properties of alginate films according to their microstructure, cation content and nanoparticles fillers

Author

Roger, Stéphane, Bee, Agnes, Balnois, Eric, Bourmaud, A., Le Deit, Hervé, Grohens, Yves, Liquides Ioniques et Interfaces Chargées (LI2C), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Polymères Propriétés aux Interfaces et Composites (L2PIC), Université de Bretagne Sud (UBS), Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), and CEVA

Subjects
ComputingMethodologies_GENERAL, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, [CHIM.INOR]Chemical Sciences/Inorganic chemistry
Abstract

Balnois, poster

Published
2004

12. Physical and mechanical properties of alginate films containing calcium cations and ferrofluids

Author

Roger, Stéphane, Bee, Agnes, Balnois, Eric, Bourmaud, A., Le Deit, Hervé, Grohens, Yves, Liquides Ioniques et Interfaces Chargées (LI2C), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Polymères Propriétés aux Interfaces et Composites (L2PIC), Université de Bretagne Sud (UBS), Centre d'études et de valorisation des algues (CEVA), and CEVA

Subjects
ComputingMethodologies_GENERAL, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, [CHIM.INOR]Chemical Sciences/Inorganic chemistry
Abstract

Poster

Published
2003

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