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12 results on '"Carole Migne"'

1. Anti-inflammatory Streptococcus thermophilus CNRZ160 limits sarcopenia induced by low-grade inflammation in older adult rats

Author

Isabelle Savary-Auzeloux, Marianne Jarzaguet, Carole Migné, Jean-Louis Kemeny, Lorraine Novais-Gameiro, Marcela de Azevedo, Véronique Mathé, François Mariotti, Philippe Langella, Jean-Marc Chatel, and Dominique Dardevet

Subjects
aging, gut, Streptococcus thermophilus, muscle, inflammation, DSS, Nutrition. Foods and food supply, TX341-641
Abstract

Background and aimsAging is characterized, at the systemic level, by the development of low-grade inflammation, which has been identified as determining sarcopenia by blunting postprandial muscle anabolism. The causes of this “inflammageing” is still not clearly defined. An increased intestinal permeability, a microbiota dysbiosis and subsequent generation of intestinal then generalized inflammation have been hypothesized. The objective of this study was to test in vivo during aging if (1) a chronic low-grade intestinal inflammation can lead to anabolic resistance and muscle loss and (2) if a bacterial strain presenting anti-inflammatory properties could prevent these adverse effects.MethodsYoung adult (6 m) and elderly rats (18 m) received Dextran Sodium Sulfate (DSS) for 28 days to generate low-grade intestinal inflammation, and received (PB1 or PB2 groups) or not (DSS group) one of the two S. Thermophilus strains (5 × 109 CFU/day) previously shown to present an anti-inflammatory potential in vitro. They were compared to pair fed control (PF). Muscle and colon weights and protein synthesis (using 13C Valine) were measured at slaughter. Muscle proteolysis, gut permeability and inflammatory markers were assessed only in old animals by RT-PCR or proteins quantifications (ELISA).ResultsIn both adult and old rats, DSS reduced absolute protein synthesis (ASR) in gastrocnemius muscle [−12.4% (PB1) and −9.5% (PB2) vs. PF, P < 0.05] and increased ASR in colon (+86% and +30.5%, respectively vs. PF, P < 0.05). PB1 (CNRZ160 strain) but not PB2 resulted in a higher muscle ASR as compared to DSS in adults (+18%, P < 0.05), a trend also observed for PB1 in old animals (+12%, P = 0.10). This was associated with a blunted increase in colon ASR. In old rats, PB1 also significantly decreased expression of markers of autophagy and ubiquitin-proteasome pathways vs. DSS groups and improved gut permeability (assessed by Occludin, Zonula Occludens 1 and Claudin 1 expression, P < 0.05) and alleviated systemic inflammation (A2M: −48% vs. DSS, P < 0.05).ConclusionThe loss of muscle anabolism associated with low-grade intestinal inflammation can be prevented by supplementation with anti-inflammatory CNRZ160 strain. We propose that the moderated gut inflammation by CNRZ160 may result in curtailed amino acids (AA) utilization by the gut, and subsequent restored AA systemic availability to support muscle protein accretion. Therefore, CNRZ160 could be considered as an efficient probiotic to modulate muscle mass loss and limit sarcopenia during aging.

Published
2022
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2. Multiplatform metabolomics for an integrative exploration of metabolic syndrome in older men

Author

Blandine Comte, Stéphanie Monnerie, Marion Brandolini-Bunlon, Cécile Canlet, Florence Castelli, Emeline Chu-Van, Benoit Colsch, François Fenaille, Charlotte Joly, Fabien Jourdan, Natacha Lenuzza, Bernard Lyan, Jean-François Martin, Carole Migné, José A. Morais, Mélanie Pétéra, Nathalie Poupin, Florence Vinson, Etienne Thevenot, Christophe Junot, Pierrette Gaudreau, and Estelle Pujos-Guillot

Subjects
Metabolic syndrome, Metabolomics, Deep phenotyping, Lipidomics, Metabolic signature, Medicine, Medicine (General), R5-920
Abstract

Background: Metabolic syndrome (MetS), a cluster of factors associated with risks of developing cardiovascular diseases, is a public health concern because of its growing prevalence. Considering the combination of concomitant components, their development and severity, MetS phenotypes are largely heterogeneous, inducing disparity in diagnosis. Methods: A case/control study was designed within the NuAge longitudinal cohort on aging. From a 3-year follow-up of 123 stable individuals, we present a deep phenotyping approach based on a multiplatform metabolomics and lipidomics untargeted strategy to better characterize metabolic perturbations in MetS and define a comprehensive MetS signature stable over time in older men. Findings: We characterize significant changes associated with MetS, involving modulations of 476 metabolites and lipids, and representing 16% of the detected serum metabolome/lipidome. These results revealed a systemic alteration of metabolism, involving various metabolic pathways (urea cycle, amino-acid, sphingo- and glycerophospholipid, and sugar metabolisms…) not only intrinsically interrelated, but also reflecting environmental factors (nutrition, microbiota, physical activity…). Interpretation: These findings allowed identifying a comprehensive MetS signature, reduced to 26 metabolites for future translation into clinical applications for better diagnosing MetS.

Published
2021
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3. WiPP: Workflow for Improved Peak Picking for Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) Data

Author

Nico Borgsmüller, Yoann Gloaguen, Tobias Opialla, Eric Blanc, Emilie Sicard, Anne-Lise Royer, Bruno Le Bizec, Stéphanie Durand, Carole Migné, Mélanie Pétéra, Estelle Pujos-Guillot, Franck Giacomoni, Yann Guitton, Dieter Beule, and Jennifer Kirwan

Subjects
gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS), metabolomics, peak detection, peak classification, pre-processing workflow, parameter optimisation, machine learning, support vector machine, Microbiology, QR1-502
Abstract

Lack of reliable peak detection impedes automated analysis of large-scale gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) metabolomics datasets. Performance and outcome of individual peak-picking algorithms can differ widely depending on both algorithmic approach and parameters, as well as data acquisition method. Therefore, comparing and contrasting between algorithms is difficult. Here we present a workflow for improved peak picking (WiPP), a parameter optimising, multi-algorithm peak detection for GC-MS metabolomics. WiPP evaluates the quality of detected peaks using a machine learning-based classification scheme based on seven peak classes. The quality information returned by the classifier for each individual peak is merged with results from different peak detection algorithms to create one final high-quality peak set for immediate down-stream analysis. Medium- and low-quality peaks are kept for further inspection. By applying WiPP to standard compound mixes and a complex biological dataset, we demonstrate that peak detection is improved through the novel way to assign peak quality, an automated parameter optimisation, and results in integration across different embedded peak picking algorithms. Furthermore, our approach can provide an impartial performance comparison of different peak picking algorithms. WiPP is freely available on GitHub (https://github.com/bihealth/WiPP) under MIT licence.

Published
2019
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4. At same leucine intake, a whey/plant protein blend is not as effective as whey to initiate a transient post prandial muscle anabolic response during a catabolic state in mini pigs.

Author

Aurélia Revel, Marianne Jarzaguet, Marie-Agnès Peyron, Isabelle Papet, Noureddine Hafnaoui, Carole Migné, Laurent Mosoni, Sergio Polakof, Isabelle Savary-Auzeloux, Didier Rémond, and Dominique Dardevet

Subjects
Medicine, Science
Abstract

Muscle atrophy has been explained by an anabolic resistance following food intake and an increase of dietary protein intake is recommended. To be optimal, a dietary protein has to be effective not only to initiate but also to prolong a muscle anabolic response in a catabolic state. To our knowledge, whether or not a dairy or a dairy/plant protein blend fulfills these criterions is unknown in a muscle wasting situation.Our aim was, in a control and a catabolic state, to measure continuously muscle anabolism in term of intensity and duration in response to a meal containing casein (CAS), whey (WHEY) or a whey/ plant protein blend (BLEND) and to evaluate the best protein source to elicit the best post prandial anabolism according to the physio-pathological state.Adult male Yucatan mini pigs were infused with U-13C-Phenylalanine and fed either CAS, WHEY or BLEND. A catabolic state was induced by a glucocorticoid treatment for 8 days (DEX). Muscle protein synthesis, proteolysis and balance were measured with the hind limb arterio-venous differences technique. Repeated time variance analysis were used to assess significant differences.In a catabolic situation, whey proteins were able to initiate muscle anabolism which remained transient in contrast to the stimulated muscle protein accretion with WHEY, CAS or BLEND in healthy conditions. Despite the same leucine intake compared to WHEY, BLEND did not restore a positive protein balance in DEX animals.Even with WHEY, the duration of the anabolic response was not optimal and has to be improved in a catabolic state. The use of BLEND remained of lower efficiency even at same leucine intake than whey.

Published
2017
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5. High whey protein intake delayed the loss of lean body mass in healthy old rats, whereas protein type and polyphenol/antioxidant supplementation had no effects.

Author

Laurent Mosoni, Eva Gatineau, Philippe Gatellier, Carole Migné, Isabelle Savary-Auzeloux, Didier Rémond, Emilie Rocher, and Dominique Dardevet

Subjects
Medicine, Science
Abstract

Our aim was to compare and combine 3 nutritional strategies to slow down the age-related loss of muscle mass in healthy old rats: 1) increase protein intake, which is likely to stimulate muscle protein anabolism; 2) use leucine rich, rapidly digested whey proteins as protein source (whey proteins are recognized as the most effective proteins to stimulate muscle protein anabolism). 3) Supplement animals with a mixture of chamomile extract, vitamin E, vitamin D (reducing inflammation and oxidative stress is also effective to improve muscle anabolism). Such comparisons and combinations were never tested before. Nutritional groups were: casein 12% protein, whey 12% protein, whey 18% protein and each of these groups were supplemented or not with polyphenols/antioxidants. During 6 months, we followed changes of weight, food intake, inflammation (plasma fibrinogen and alpha-2-macroglobulin) and body composition (DXA). After 6 months, we measured muscle mass, in vivo and ex-vivo fed and post-absorptive muscle protein synthesis, ex-vivo muscle proteolysis, and oxidative stress parameters (liver and muscle glutathione, SOD and total antioxidant activities, muscle carbonyls and TBARS). We showed that although micronutrient supplementation reduced inflammation and oxidative stress, the only factor that significantly reduced the loss of lean body mass was the increase in whey protein intake, with no detectable effect on muscle protein synthesis, and a tendency to reduce muscle proteolysis. We conclude that in healthy rats, increasing protein intake is an effective way to delay sarcopenia.

Published
2014
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6. A dietary supplementation with leucine and antioxidants is capable to accelerate muscle mass recovery after immobilization in adult rats.

Author

Isabelle Savary-Auzeloux, Hugues Magne, Carole Migné, Marion Oberli, Denis Breuillé, Magali Faure, Karine Vidal, Marie Perrot, Didier Rémond, Lydie Combaret, and Dominique Dardevet

Subjects
Medicine, Science
Abstract

Prolonged inactivity induces muscle loss due to an activation of proteolysis and decreased protein synthesis; the latter is also involved in the recovery of muscle mass. The aim of the present work was to explore the evolution of muscle mass and protein metabolism during immobilization and recovery and assess the effect of a nutritional strategy for counteracting muscle loss and facilitating recovery. Adult rats (6-8 months) were subjected to unilateral hindlimb casting for 8 days (I0-I8) and then permitted to recover for 10 to 40 days (R10-R40). They were fed a Control or Experimental diet supplemented with antioxidants/polyphenols (AOX) (I0 to I8), AOX and leucine (AOX + LEU) (I8 to R15) and LEU alone (R15 to R40). Muscle mass, absolute protein synthesis rate and proteasome activities were measured in gastrocnemius muscle in casted and non-casted legs in post prandial (PP) and post absorptive (PA) states at each time point. Immobilized gastrocnemius protein content was similarly reduced (-37%) in both diets compared to the non-casted leg. Muscle mass recovery was accelerated by the AOX and LEU supplementation (+6% AOX+LEU vs. Control, P

Published
2013
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7. Unilateral hindlimb casting induced a delayed generalized muscle atrophy during rehabilitation that is prevented by a whey or a high protein diet but not a free leucine-enriched diet.

Author

Hugues Magne, Isabelle Savary-Auzeloux, Carole Migné, Marie-Agnès Peyron, Lydie Combaret, Didier Rémond, and Dominique Dardevet

Subjects
Medicine, Science
Abstract

Sarcopenia is the general muscle mass and strength loss associated with ageing. Muscle atrophy could be made worse by exposure to acute periods of immobilization, because muscle disuse by itself is a stimulus for atrophy. Using a model of unilateral hindlimb casting in old adult rats, we have already demonstrated that the primary effect of immobilization was atrophy in the casted leg, but was also surprisingly associated with a retarded atrophy in the non-casted leg during rehabilitation. In search of mechanisms involved in this generalized atrophy, we demonstrated in the present study that contrary to pair-fed non-immobilized control animals, muscle protein synthesis in the non-immobilized limb was unable to adapt and to respond positively to food intake. Because pair-fed control rats did not lose muscle mass, this defect in muscle protein synthesis may represent one of the explanation for the muscle mass loss observed in the non-immobilized rats. Nevertheless, in order to stimulate protein turn over and generate a positive nitrogen balance required to maintain the whole muscle mass in immobilized rats, we tested a dietary free leucine supplementation (an amino acid known for its stimulatory effect on protein metabolism) during the rehabilitation period. Leucine supplementation was able to overcome the anabolic resistance in the non-immobilized limb. A greater muscle protein synthesis up-regulation associated with a stimulation of the mTOR signalling pathway was indeed recorded but it remained inefficient to prevent the loss of muscle in the non-immobilized limb. By contrast, we demonstrated here that whey protein or high protein diets were able to prevent the muscle mass loss of the non-immobilized limb by sustaining muscle protein synthesis during the entire rehabilitation period.

Published
2013
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8. PeakForest: a multi-platform digital infrastructure for interoperable metabolite spectral data and metadata management

Author

Nils Paulhe, Cécile Canlet, Annelaure Damont, Lindsay Peyriga, Stéphanie Durand, Catherine Deborde, Sandra Alves, Stephane Bernillon, Thierry Berton, Raphael Bir, Alyssa Bouville, Edern Cahoreau, Delphine Centeno, Robin Costantino, Laurent Debrauwer, Alexis Delabrière, Christophe Duperier, Sylvain Emery, Amelie Flandin, Ulli Hohenester, Daniel Jacob, Charlotte Joly, Cyril Jousse, Marie Lagree, Nadia Lamari, Marie Lefebvre, Claire Lopez-Piffet, Bernard Lyan, Mickael Maucourt, Carole Migne, Marie-Francoise Olivier, Estelle Rathahao-Paris, Pierre Petriacq, Julie Pinelli, Léa Roch, Pierrick Roger, Simon Roques, Jean-Claude Tabet, Marie Tremblay-Franco, Mounir Traïkia, Anna Warnet, Vanessa Zhendre, Dominique Rolin, Fabien Jourdan, Etienne Thévenot, Annick Moing, Emilien Jamin, François Fenaille, Christophe Junot, Estelle Pujos-Guillot, Franck Giacomoni, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Metatoul AXIOM (E20 ), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ToxAlim (ToxAlim), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB, Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université de Bordeaux (UB)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plateforme Bordeaux Metabolome, Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Bordeaux, MetaToul FluxoMet (TBI-MetaToul), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), The PeakForest project is supported by the French National Facility in Metabolomics & Fluxomics, MetaboHUB (11-INBS-0010), launched by the French Ministry of Research and Higher Education and the French ANR funding agency within the Programme 'Investissements d’Avenir', and ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011)

Subjects
Metadata, [INFO.INFO-DB]Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Metabolite identification, Spectral library, Interoperability, Biochemistry, Mass Spectrometry, Curation, Database, Metabolome, [CHIM]Chemical Sciences, Metabolomics, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Data Curation, FAIR
Abstract

Introduction Accuracy of feature annotation and metabolite identification in biological samples is a key element in metabolomics research. However, the annotation process is often hampered by the lack of spectral reference data in experimental conditions, as well as logistical difficulties in the spectral data management and exchange of annotations between laboratories. Objectives To design an open-source infrastructure allowing hosting both nuclear magnetic resonance (NMR) and mass spectra (MS), with an ergonomic Web interface and Web services to support metabolite annotation and laboratory data management. Methods We developed the PeakForest infrastructure, an open-source Java tool with automatic programming interfaces that can be deployed locally to organize spectral data for metabolome annotation in laboratories. Standardized operating procedures and formats were included to ensure data quality and interoperability, in line with international recommendations and FAIR principles. Results PeakForest is able to capture and store experimental spectral MS and NMR metadata as well as collect and display signal annotations. This modular system provides a structured database with inbuilt tools to curate information, browse and reuse spectral information in data treatment. PeakForest offers data formalization and centralization at the laboratory level, facilitating shared spectral data across laboratories and integration into public databases. Conclusion PeakForest is a comprehensive resource which addresses a technical bottleneck, namely large-scale spectral data annotation and metabolite identification for metabolomics laboratories with multiple instruments. PeakForest databases can be used in conjunction with bespoke data analysis pipelines in the Galaxy environment, offering the opportunity to meet the evolving needs of metabolomics research. Developed and tested by the French metabolomics community, PeakForest is freely-available at https://github.com/peakforest.

Published
2022
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9. Can we trust untargeted metabolomics: results of the metabo-ring study

Author

Alexandre Verdu, Bernard Lyan, Carole Migne, Catherine Defoort, Cecile Canlet, Christophe Junot, Claude Guillou, Claudine Manach, Christophe Cordella, Daniel Jacob, Delphine Bouveresse, Douglas Rutledge, Estelle Rathahao, Estelle Pujos-Guillot, Fabien Jourdan, Franck Giacomoni, Frédérique Courant, Gaëlle Fave, Gwenaëlle Le Gall, Hubert Chassaigne, Jean-Charles Martin, Jean-Claude Tabet, Jean-Philippe Antignac, Laetitia Shintu, Marianne Defernez, Marie Cécile Alexandre-Gouabau, Marie Josephe Amiot-Carlin, Mathilde Bossis, Mathieu Maillot, Triba, Mohamed N., Natali Stojiljkovic, Nathalie Banzet, Roland Molinié, Romain Bott, Sophie Goulitquer, Stefano Caldarelli, Thomas Moyon, Bruker, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Nutrition, obésité et risque thrombotique (NORT), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments (LEMM), Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Joint Research Centre - Institute for Health and Consumer Protection, European Commission, Ingénierie Procédés Aliments (GENIAL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroParisTech-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institute of Food Research, Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences Moléculaires de Marseille (ISM2), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiologie des Adaptations Nutritionnelles (PhAN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Nantes (UN), Laboratoire CSPBAT, Université Paris 13 (UP13), Laboratoire des Courses Hippiques (LCH), Laboratoire de Biochimie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biologie des Plantes et Innovation - UR UPJV 3900 (BIOPI), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Station biologique de Roscoff (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), MetaToul AXIOM (E20), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - 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Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Marseille (ECM)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Marseille (ECM)-Aix Marseille Université (AMU), Physiologie des Adaptations Nutritionnelles [UMR_A1280] (PhAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Biologie des Plantes et Innovation (BIOPI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), UMR A 1280 Physiologie des Adaptations Nutritionnelles, Université de Nantes (UN), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Can we trust untargeted metabolomics: results of the metabo-ring study. 2. African-European Conference on Chemometrics - Afrodata 2012

Published
2012

10. Peut-on faire confiance à la métabolomique: résultats de l'initiative MetaboRing

Author

Alexandre Verdu, Bernard Lyan, Carole Migne, Catherine Defoort, Cecile Canlet, Christophe Junot, Claude Guillou, Claudine Manach, Christophe Cordella, Daniel Jacob, Delphine Bouveresse, Douglas Rutledge, Estelle Rathahao, Estelle Pujos-Guillot, Fabien Jourdan, Franck Giacomoni, Frédérique Courant, Gaëlle Fave, Gwénaëlle Le Gall, Hubert Chassaigne, Jean-Charles Martin, Jean Claude Tabet, Jean-Philippe Antignac, Laetitia Shintu, Marianne Defernez, Marie Josephe Amiot-Carlin, Mathilde Bossis, Mathieu Maillot, Triba, Mohamed N., Stojilkovic, N., Nathalie Banzet, Roland Molinié, Romain Bott, Sophie Goulitquer, Stefano Caldarelli, Thomas MOYON, Bruker, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Nutrition, obésité et risque thrombotique (NORT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), MetaToul AXIOM (E20), ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments (LEMM), Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Joint Research Center, Institue for Health and Consumer Protection, European Commission, Ingénierie Procédés Aliments (GENIAL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB), Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Institute for Food Research, European Commission's Joint Research Centre, Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU), Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques (CSPBAT), Université Paris 13 (UP13)-Institut Galilée-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Courses Hippiques (LCH), Fédération Nationale des Courses Françaises, Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Biologie des Plantes et Innovation - UR UPJV 3900 (BIOPI), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Transfrontalière BioEcoAgro - UMR 1158 (BioEcoAgro), Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL)-Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaboMer, Physiopathologie des Adaptations Nutritionnelles (PhAN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Nantes (UN), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroParisTech-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Physiologie des Adaptations Nutritionnelles (PhAN), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, UMR 7244 Laboratoire CSPBAT, Université Paris 13 (UP13), EA 3900 BIOPI Biologie des Plantes Innovation, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Avignon Université (AU), UMR A 1280 Physiologie des Adaptations Nutritionnelles, Université de Nantes (UN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), and Avignon Université (AU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Peut-on faire confiance à la métabolomique: résultats de l'initiative MetaboRing. 6. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique (RFMF)

Published
2012

12. Nutrimetabolomics: An Integrative Action for Metabolomic Analyses in Human Nutritional Studies

Author

Mar Garcia-Aloy, Gianfranco Picone, Christoph H. Weinert, Claudine Manach, Edith J. M. Feskens, Beate Ott, Marynka Ulaszewska, Lieven Van Meulebroek, Samantha Riccadonna, Thomas Skurk, Bjoern Egert, René Badertscher, Joachim Kopka, Manuela J. Rist, Fulvio Mattivi, Kati Hanhineva, Rafael Llorach, Reto Portmann, Caroline Rombouts, Marta Cialiè Rosso, Francesco Capozzi, Josep Rubert, Chiara Cordero, Lorraine Brennan, Lynn Vanhaecke, Grégory Pimentel, Carole Migné, Guy Vergères, Achim Bub, Sabine E. Kulling, Franck Giacomoni, Cristina Andres Lacueva, Carl Brunius, Hannelore Daniel, Pietro Franceschi, Pedapati S. C. Sri Harsha, Alessia Trimigno, Pieter Giesbertz, Raúl González-Domínguez, Linda H. Münger, Stéphanie Durand, Rosa Vázquez-Fresno, Lieselot Hemeryck, Paola G. Ferrario, David S. Wishart, Estelle Pujos-Guillot, Marynka M. Ulaszewska, Christoph H. Weinert, Alessia Trimigno, Reto Portmann, Cristina Andres Lacueva, Rene Badertscher, Lorraine Brennan, Carl Brunius, Achim Bub, Francesco Capozzi, Marta Cialie Rosso, Chiara E. Cordero, Hannelore Daniel,Stephanie Durand, Bjoern Egert, Paola G. Ferrario, Edith J.M. Feskens, Pietro Franceschi, Mar Garcia-Aloy, Franck Giacomoni, Pieter Giesbertz, Raul Gonzalez-Domınguez,Kati Hanhineva, Lieselot Y. Hemeryck, Joachim Kopka, Sabine E. Kulling, Rafael Llorach, Claudine Manach, Fulvio Mattivi, Carole Migne, Linda H. Munger, Beate Ott, Gianfranco Picone, Gregory Pimentel, Estelle Pujos-Guillot, Samantha Riccadonna, Manuela J. Rist, Caroline Rombouts, Josep Rubert, Thomas Skurk, Pedapati S. C. Sri Harsha, Lieven Van Meulebroek, Lynn Vanhaecke, Rosa Vazquez-Fresno, David Wishart,Guy Vergeres, Department of Food Quality and Nutrition, Research and Innovation Centre, Department of Safety and Quality of Fruit and Vegetables, Federal Research Institute for Nutrition and Food, Department of Agricultural and Food Science, University of Bologna, Method Development and Analytics Research Division, Agroscope, Department of Nutrition and Food Sciences, Utah State University (USU), Universitat de Barcelona, Centro de Investigación Biomédica en Red Fragilidad y Envejecimiento Saludable, Instituto de Salud Carlos III [Madrid] (ISC), Institute of Food and Health, University College Dublin [Dublin] (UCD), Department of Biology and Biological Engineering, Chalmers University of Technology [Göteborg], Department of Physiology and Biochemistry of Nutrition, Max Rubner-Institut, Dipartimento di Scienza e Tecnologia, Farmaco Università degli Studi di Torino, Nutritional Physiology, Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Plateforme d'Exploration du Métabolisme, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Division of Human Nutrition, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Computational Biology Unit [Bergen] (CBU), University of Bergen (UiB), Molecular Nutrition Unit, Department of Clinical Nutrition, Research Centre for Endocrinology and Metabolism, Sahlgrenska University Hospital, University of Eastern Finland, Department of Veterinary Public Health and Food Safety, Istituto Superiore di Sanita [Rome], Ghenth University, Department of Molecular Physiology, Applied Metabolome Analysis, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology (MPI-MP), Max-Planck-Gesellschaft-Max-Planck-Gesellschaft, Center Agriculture Food Environment, Università degli Studi di Trento (UNITN), Food Microbial Systems Research Division, Else Kröner Fresenius Center for Nutritional Medicine, Technische Universität München, ZIEL Institute for Food and Health, Departments of Biological Sciences and Computing Science, University of Alberta, BioNH call under the Joint Programming Initiative 'A Healthy Diet for a Healthy Life' (JPI-HDHL) Ministry of Education, Universities and Research (MIUR)2075Ministry of Economy and Competitiveness (MINECO) PCIN-2014-133Agencia de Gestio D'Ajuts Universitaris de Recerca Agaur (AGAUR) 2017SGR1566CIBERFES [European Regional Development Fund (FEDER) program from the European Union (EU)] Swiss National Science Foundation (SNSF) 40HD40 160618'Juan de la Cierva' program from MINECO FJCI-2015-26590, Instituto de Salud Carlos III (ISC), Technical University of Munich (TUM), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR), Computational Biology Unit (BCCS), University of Bergen (UIB), University of Bologna/Università di Bologna, Università degli studi di Torino = University of Turin (UNITO), Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-MetaboHUB-Clermont, MetaboHUB-MetaboHUB, Istituto Superiore di Sanità (ISS), Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), Manach, Claudine, and Vergeres, G.

Subjects
0301 basic medicine, Settore CHIM/01 - CHIMICA ANALITICA, Nutritional Sciences, Computer science, [SDV]Life Sciences [q-bio], Eating, Data Mining, GC–MS, 2. Zero hunger, Chromatography, Life sciences, metabolomics, Food Analysis, Molecular analysis, GC-MS, LC-MS, metabolomics, NMR, nutrition, nutrition, Metabolòmica, GC-MS, LC-MS, NMR, Alimentation et Nutrition, Biotechnology, metabolomic, Nutritional Status, LC–MS, 03 medical and health sciences, Metabolomics, Humans, Food and Nutrition, Expert Testimony, VLAG, Global Nutrition, Electronic Data Processing, Wereldvoeding, Models, Statistical, 030109 nutrition & dietetics, Clinical study design, Reproducibility of Results, Healthy diet, Data science, Biomarker (cell), 030104 developmental biology, Workflow, Action (philosophy), Multivariate Analysis, Ciències de la vida, Biomarkers, Food Science
Abstract

The life sciences are currently being transformed by an unprecedented wave of developments in molecular analysis, which include important advances in instrumental analysis as well as biocomputing. In light of the central role played by metabolism in nutrition, metabolomics is rapidly being established as a key analytical tool in human nutritional studies. Consequently, an increasing number of nutritionists integrate metabolomics into their study designs. Within this dynamic landscape, the potential of nutritional metabolomics (nutrimetabolomics) to be translated into a science, which can impact on health policies, still needs to be realized. A key element to reach this goal is the ability of the research community to join, to collectively make the best use of the potential offered by nutritional metabolomics. This article, therefore, provides a methodological description of nutritional metabolomics that reflects on the state‐of‐the‐art techniques used in the laboratories of the Food Biomarker Alliance (funded by the European Joint Programming Initiative "A Healthy Diet for a Healthy Life" (JPI HDHL)) as well as points of reflections to harmonize this field. It is not intended to be exhaustive but rather to present a pragmatic guidance on metabolomic methodologies, providing readers with useful "tips and tricks" along the analytical workflow.

Published
2019
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