185 results on '"CORRELACION GENETICA"'
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2. Assessing the phenotypic variation, heritability and genetic advance in bread wheat (Triticum aestivum L.) candidate lines grown under rainfed semi-arid region of Algeria.
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Lamara, Asma, El Abidine Fellahi, Zine, Hannachi, Abderrahmane, and Benniou, Ramdane
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WHEAT , *ARID regions , *PHENOTYPIC plasticity , *WHEAT breeding , *GENETIC variation , *GRAIN yields , *DRY farming , *HERITABILITY - Abstract
The genetic improvement of any breeding population largely depends upon the magnitude of genetic variability present. This study was carried out to estimate parameters of the genetic variation among 13 quantitative traits of bread wheat evaluated at INRAA-Setif institute (Algeria) during the 2020--2021 crop season in a rainfed environment. 34 genotypes including four control checks were planted in a randomized complete block design with three replications. Genotypes showed significant variations for almost all the studied traits. Proline content, spikes weight, and grain yield exhibited a high genotypic coefficient of variation along with moderate to high heritability coupled with a high genetic gain, suggesting the implication of additive gene action. The number of spikes, spikes weight, and thousand kernel weight were significantly and positively correlated with grain yield at both phenotypic and genotypic levels. Path analysis results showed that spikes weight is an important route through which most of the measured traits influenced indirectly grain yield. Lines L1, L20, L28, L16, and L18 exhibited a sizeable grain yield advantage, which suggests they are potential candidates for future release and could be incorporated into the wheat breeding programs as parents to improve yield in the rainfed environments of Algeria. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2022
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3. Efecto de la selección genética en contra de las emisiones de metano sobre los componentes de la leche
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Rene Calderón-Chagoya, Juan Herberth Hernández-Medrano, Felipe de Jesus Ruiz-López, Adriana García-Ruiz, Vicente Eliezer Vega-Murillo, Enoc Israel Mejía-Melchor, Phil Garnsworthy, and Sergio Iván Román-Ponce
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metano ,leche ,heredabilidad ,correlación genética ,Animal culture ,SF1-1100 ,Veterinary medicine ,SF600-1100 - Abstract
El objetivo de este trabajo fue estimar la respuesta a la selección a través de diferentes índices de selección entre producción de metano y producción y componentes de la leche en los sistemas de lechería tropical especializada, doble propósito y lechería familiar. El muestreo de las emisiones de metano se realizó durante la ordeña mediante el equipo Guardian-NG. Se tomaron muestras de leche de manera individual durante el muestreo de metano. La extracción de ADN se realizó de folículos pilosos de todos los animales incluidos en el estudio. La estimación de los componentes de varianza y covarianza se realizó mediante la metodología de modelos mixtos. Se utilizaron los marcadores moleculares para construir la matriz de relaciones genómicas (Matriz G), debido a que no se contaba con información genealógica completa. La heredabilidad estimada para las emisiones de metano durante la ordeña fue de 0.18 y 0.32 para los análisis univariados y bivariados, respectivamente. Los resultados de las correlaciones genéticas entre porcentaje de grasa y proteína en leche con las emisiones de metano durante la ordeña fueron negativas, -0.09 y -0.18 respectivamente. La respuesta a la selección estimada mediante los índices de selección demostró que es factible obtener reducciones de hasta 0.021 mg/l de emisiones de metano durante la ordeña en cinco generaciones; lo anterior sin detrimento en los componentes de la leche.
- Published
- 2021
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4. Impacto de la inclusión de información extranjera sobre la evaluación genética mexicana de sementales Holstein
- Author
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Gustavo Javier Martínez Marín, Felipe de Jesús Ruiz López, Carlos Gustavo Vásquez Peláez, Sergio Iván Román Ponce, and Adriana García Ruiz
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valor genético ,confiabilidad ,evaluación genética ,correlación genetica ,Animal culture ,SF1-1100 ,Veterinary medicine ,SF600-1100 - Abstract
El objetivo del presente estudio fue evaluar el impacto de la inclusión de información extranjera de sementales de la raza Holstein, sobre su evaluación genética para las características de producción de leche (PL), grasa (PG) y proteína (PP) en kilogramos. Lo anterior, se logró mediante la comparación de valores genéticos (VG) y confiabilidades (CF), agrupación de sementales por número de hijas, ordenamiento de los sementales y la superioridad genética esperada por año (), con diferentes escenarios determinados por la intensidad de selección () de sementales usados en la evaluación genética nacional (EG-MEX), los incorporados a la evaluación genética internacional con hijas en México (EG-I) y la evaluación genética internacional con o sin hijas en México (EG-MACE). En total, se analizó la información de 5,825 sementales en la para PL y 3,914 para PG y PP. El impacto de la información extranjera en la EG-MEX es positivo, debido a que mejora la CF de los VG de los sementales usados en México. También, permitió observar diferencias importantes de los VG y CF entre las evaluaciones, generando una oportunidad de mejoramiento en la población Holstein mexicana; por lo que, es recomendable continuar con la participación en el programa de Interbull, y considerar el uso de la información validada de manera internacional en los procesos de selección de animales productores de leche y sus componentes. Estas acciones pueden contribuir de manera importante en el incremento del progreso genético productivo a nivel nacional.
- Published
- 2020
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5. Path analysis under multiple-trait BLUP: application in the study of interrelationships among traits related to cotton fiber length
- Author
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Rodrigo Alves, João Rocha, Larissa Teodoro, Luiz Carvalho, Francisco Farias, Marcos Resende, Leonardo Bhering, and Paulo Teodoro
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Modelo mixto ,genotipo x ambiente ,correlación genética ,selección genética ,Gossypium hirsutum ,Agriculture ,Food processing and manufacture ,TP368-456 - Abstract
Multi-trait best linear unbiased prediction (BLUP) is, generally, the most appropriate method to genetic evaluation because it considers the genetic and residual correlations among traits and conduct to higher selection accuracy. Thus, the present study aimed to identify traits correlated to the fiber length via path analysis under multi-trait BLUP for the cotton breeding. To this end, thirty-six elite lines were evaluated in three environments and phenotyped for many traits related to fiber quality and agronomic traits. Variance components were estimated via residual maximum likelihood (REML). The genetic correlation coefficients among traits were obtained through mixed model output, and to graphically express these results a correlation network was built. Subsequently, we performed path analysis considering fiber length as a principal dependent variable. Genetic parameters obtained by multi-trait BLUP model indicate that the phenotypic variance for most traits is mostly composed of residual effects, which reinforces the need for using more accurate statistical methods such as multi-trait BLUP. The results found for genetic correlations and path analysis under multi-trait BLUP reveal the difficulty of selection based on important fiber quality traits, especially fiber length, since most traits show very low cause-and-effect relationship, and other important traits present undesirable cause-and-effect relationship. Highlights Multiple-trait BLUP is the most appropriate method to predict genetic values. This is the first study in cotton to perform path analysis under multiple-trait BLUP. The findings of this study indicate that there is no genotype presenting all desirable traits.
- Published
- 2021
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6. Genetic parameters for ultrasound-evaluated carcass and body traits in Anglo-Nubian goats.
- Author
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Figueiredo-Filho, Luiz A. S., Sarmento, José L. R., Campelo, José E. G., Santos, Natanael P. S., Sena, Luciano S., and Torres, Tatiana S.
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GOAT breeds , *BODY size , *GOATS , *GENETIC correlations , *MEAT quality - Abstract
Meat goat breeding programs should prioritize the identification and selection of genetically superior animals for traits related to meat quality and carcass yield in order to increase the value of the final product. Objective: To estimate (co)variance components and genetic parameters for ultrasound-measured carcass traits, body size and body weight in Anglo- Nubian breed goats raised in the Mid-North region of Brazil. Methods: (Co)variance components and genetic parameters were estimated using the single and two-trait animal model analyses via Bayesian inference for loin eye dimensions (area, length, and depth), sternal fat thickness, rump height, chest circumference and depth, leg perimeter, and body weight. Results: Heritability estimates were higher when two-trait analyses were used. This finding implies that it is possible to recover part of the additive genetic variance included in the residual variance due to the correlation between traits. Genetic correlations between carcass and body size traits showed different magnitudes. On the other hand, genetic correlations between the traits related to muscularity showed high magnitudes. Conclusions: Body weight was not a good indicator of muscularity; therefore, it is not recommended as a criterion for indirect selection to improve carcass traits of Anglo-Nubian goats. Leg perimeter and chest circumference may be important to construct selection indexes in meat goat breeding programs. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2021
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7. Efecto de la selección genética en contra de las emisiones de metano sobre los componentes de la leche.
- Author
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Calderón-Chagoya, Rene, Heberth Hernández-Medrano, Juan, de Jesús Ruiz-López, Felipe, García-Ruiz, Adriana, Eliezer Vega-Murillo, Vicente, Israel Mejía-Melchor, Enoc, Garnsworthy, Phil, and Iván Román-Ponce, Sergio
- Subjects
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MILKFAT , *MILK proteins , *GENETIC correlations , *MILK yield , *HAIR follicles - Abstract
This study aimed to estimate the response to selection through different selection indices between methane production and milk production and its components in specialized tropical, dual-purpose, and family dairy systems. Methane emissions were sampled during milking using the Guardian-NG gas monitor; milk samples were collected individually during methane sampling. DNA was extracted from the hair follicles of all the animals included in this study. The variance and covariance components were estimated using the mixed model methodology. Due to the incomplete genealogical information, molecular markers were used to build the genomic relationship matrix (Matrix G). The estimated heritability for methane emissions during milking was 0.18 and 0.32 for the univariate and bivariate analysis, respectively. The genetic correlation between the milk fat and protein percentages and methane emissions during milking was negative, -0.09 and -0.18, respectively. The response to selection, estimated through selection indices, demonstrated that it is feasible to reduce methane emissions up to 0.021 mg/L during milking in five generations without detriment to milk components. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2021
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8. Single- and multiple-trait BLUP in genetic selection of parents and hybrids of grain sorghum
- Author
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Nadson Oliveira de Souza, Rodrigo Silva Alves, Paulo Eduardo Teodoro, Lidiane Aparecida Silva, Flávio Dessaune Tardin, Aisy Baldoni Tardin, Marcos Deon Vilela de Resende, and Leonardo Lopes Bhering
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fitomejoramiento ,dialelo parcial ,modelos mixtos ,correlación genética ,heterosis ,Agriculture ,Food processing and manufacture ,TP368-456 - Abstract
To increase yield, breeding programs must search for innovative and efficient methodologies for the development and selection of superior genotypes. Therefore, this study aimed to compare the single- and multiple-trait best linear unbiased prediction (BLUP) in genetic selection of parents and hybrids of grain sorghum. For this, an experiment conducted in alpha-lattice design with two replications was used. Flowering time (FT), plant height (PH), and grain yield (GY) were evaluated in 502 grain sorghum hybrids obtained by the cross of ten restorer lines and 54 male-sterile lines. Variance components were estimated via restricted maximum likelihood (REML). Significant effects of restorer lines, of male-sterile lines, and of specific combining ability were detected by the likelihood ratio test (LRT). The estimates of variance components, genetic parameters, and correlations were similar when obtained via single- and multiple trait- BLUP. Considering hybrids, the multiple-trait BLUP resulted in slightly higher predicted selection gain for the three evaluated traits and, therefore, can be efficiently applied in the genetic selection of grain sorghum.
- Published
- 2019
9. Impacto de la inclusión de información extranjera sobre la evaluación genética mexicana de sementales Holstein.
- Author
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Martínez Marín, Gustavo Javier, Ruiz López, Felipe de Jesús, Vásquez Peláez, Carlos Gustavo, Román Ponce, Sergio Iván, and García Ruiz, Adriana
- Abstract
El objetivo del presente estudio fue evaluar el impacto de la inclusión de información extranjera de sementales de la raza Holstein, sobre su evaluación genética para las características de producción de leche (PL), grasa (PG) y proteína (PP) en kilogramos. Lo anterior, se logró mediante la comparación de valores genéticos (VG) y confiabilidades (CF), agrupación de sementales por número de hijas, ordenamiento de los sementales y la superioridad genética esperada por año (ΔIs/ys), con diferentes escenarios determinados por la intensidad de selección (ips) de sementales usados en la evaluación genética nacional (EGMEX), los incorporados a la evaluación genética internacional con hijas en México (EG-I) y la evaluación genética internacional con o sin hijas en México (EG-MACE). En total, se analizó la información de 5,825 sementales en la para PL y 3,914 para PG y PP. El impacto de la información extranjera en la EG-MEX es positivo, debido a que mejora la CF de los VG de los sementales usados en México. También, permitió observar diferencias importantes de los VG y CF entre las evaluaciones, generando una oportunidad de mejoramiento en la población Holstein mexicana; por lo que, es recomendable continuar con la participación en el programa de Interbull, y considerar el uso de la información validada de manera internacional en los procesos de selección de animales productores de leche y sus componentes. Estas acciones pueden contribuir de manera importante en el incremento del progreso genético productivo a nivel nacional. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2020
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10. Parámetros genéticos en la varianza residual de variables de comportamiento en toros de lidia.
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Domínguez-Viveros, J.
- Subjects
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GENETIC correlations , *MULTIVARIATE analysis , *GENOTYPE-environment interaction , *HERITABILITY , *VARIANCES - Abstract
The objectives were to analyze the presence of genetic variance in the residual variance of behavior notes in fighting bulls. From a livestock ranch, the conditional residuals were analyzed (RCON; ê = y - [y|a] = y - Xß - Za) and marginal (RMAR; = y - [y] = y - Xß), from the notes of horse tienta (n, 2369), foot tienta (n, 1432), horse bullfight (n, 792) and foot bullfighter (n, 820); in two databases: BD1, logarithmic transformation; BD2, logarithmic transformation eliminating extreme data (x ±2s). With the MTDFREML software, a multivariate analysis (four notes) was performed within the residual type and for each database; heritability (h) and genetic correlations (rg) were calculated through variables. The h2 ranged between 0.14 and 0.96, with an average value of 0.58; h2 of RMAR in BD2 presented above estimates (> 0.78). These results show genetic variability in the residual variance and present the possibility of response to selection (environmental channeling) to reduce environmental variance. The selection for residual variance can improve the response to the concepts of resilience, plasticity, robustness and rusticity. The rg were positive, in the range of 0.01 to 0.99 and an average value of 0.79; with these rg there may be a correlated response in the residuals of the four notes. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2020
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11. Genetic parameters and association between agronomic traits in special-grain common bean (Phaseolus vulgaris L.) genotypes.
- Author
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Giroletta dos Santos, Carla Medianeira, dos Santos Silva, Jeferson Antonio, Prevedel Capristo, Denise, Matinho Correa, Agenor, and Pereira Ribeiro, Larissa
- Subjects
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COMMON bean , *GENETIC correlations , *PLANT breeding , *PATH analysis (Statistics) , *GRAIN yields , *TRAIT intercorrelations , *GENOTYPES - Abstract
Estimates of genetic parameters allow to determine the genetic variability present in a population, constituting one of the initial steps in a breeding program. The objectives of this study were to estimate genetic parameters and identify agronomic traits directly and indirectly correlated with grain yield (GY), as well as to estimate their direct and indirect effects on the yield of special-grain common bean genotypes. The experiment was carried out in the 2016/2017 season, in a complete blocks design, with three repetitions. The evaluated traits were days to flowering, days to maturity, first pod height, plant height, number of pods per plant, number of grains per pod, mass of hundred grains, and grain yield. Data were subjected to analysis of variance, and genetic parameters were estimated followed by phenotypic and genotypic correlations. Phenotypic and genotypic correlations were split into direct and indirect effects by path analysis. The studied population seemed promising for breeding purposes considering most traits. Correlation and path analyses indicated that there was a positive direct effect of days to maturity on grain yield. The traits days to maturity and mass of hundred grains can be used in indirect selection aiming at higher grain yield. Path analysis also revealed that the indirect effects of number of pods per plant and number of grains per pod should be taken into consideration in the genetic breeding of the common bean for the increased grain yield. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2020
12. Valoración genética de unidades comportamentales en una ganadería de lidia colombiana.
- Author
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Calero Quintero, David, Uribe Ceballos, José Reinel, Bartolomé Rodríguez, Daniel José, Muñoz Flores, Jaime Eduardo, and González Valencia, María Fernanda
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GENETIC correlations , *RANCHES , *BREEDING , *CONSANGUINITY , *ANIMAL behavior , *STALLIONS , *HORSE breeding - Abstract
An ethogram was designed to disaggregate the behaviour of fighting cattle, quantify bravery and consolidate selection. 933 females and 787 males from the Colombian cattle ranch "Ernesto González Caicedo" (EGC), Santa Coloma lineage, at Popayán, Cauca, Colombia, were analysed. The behavioral units (UC) identified were fixity (FIJ), starting distance (DIS), readiness (PRO), reloading (RGR), absence of pain (DOL), degree of jealousy (GEN), distance (RDO), humiliating (HUM), repeat (REP), lunge type (TEM), bottom (FON), strength (FZA) and absence of defects (AUD). Information was analysed with DeLidia® software, developed for this research. The CU were adjusted according to the effect of age, consanguinity, weight, sex, place, type of celebration, number of rods, bullfighter and picador. Inheritance indices, phenotypic and genetic correlations, and breeding values of stallions were estimated. The resulting h2 values for the UC FZA and REP were 0.06 ± 0.03 and 0.36 ± 0.026, respectively, with an average of 0.21 ± 0.05 for all UC. All rg were positive except for those involved with FZA. The lowest positive value of rg was 0.1 for GEN and HUM, while the highest was 0.79 for FIJ and RDO. Trends of VG were positive and different from zero (P <0.01), except FZA (-0.004 ± 0.0004). The gain per year, as a percentage part of the mean, was -0.191% for FZA and 1.024% for REP. Resultant h2 and VG suggest their usefulness in selection programs, favouring greater genetic progress. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2020
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13. Genetic parameters between somatic cell score and production traits for Holstein cattle in Southern Brazil.
- Author
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Romano, Gabrieli S., Pinto, Luis Fernando B., Valloto, Altair A., Horst, José-Augusto, and Pedrosa, Victor B.
- Subjects
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SOMATIC cells , *HOLSTEIN-Friesian cattle , *DAIRY cattle , *HEALTH of cattle , *MILK yield , *GENETIC correlations , *MILK quality - Abstract
Background: Somatic cell score is an important parameter to predict milk quality and health of cows. However, in countries like Brazil, this trait is still not selected on a large scale, and no genetic parameters are reported in the literature. Objective: To estimate the variance components and genetic parameters for somatic cell score, milk yield, fat yield, protein yield, fat percentage, and protein percentage in Holstein cows. Methods: Records from 56,718 animals were used to estimate variance components, heritability, and genetic correlations using a multi-trait animal model by the REML method. Results: The heritability estimates were 0.19 for somatic cell score, 0.22 for milk yield, 0.26 for fat yield, 0.18 for protein yield, 0.61 for fat percentage, and 0.65 for protein percentage. The estimates of genetic correlations among analyzed traits ranged from -0.50 to 0.82. Conclusion: The low heritability observed for somatic cell score indicates that selection for this trait should result in benefits related to animal health and milk quality, but only in the long term. The low correlation between productive traits and somatic cell score indicates that inclusion of somatic cell score in animal breeding programs does not interfere negatively with the genetic selection for milk yield or solids. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2020
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14. ASOCIACIÓN GENÉTICA DEL ÍNDICE DE PRODUCTIVIDAD ANUAL CON CARACTERÍSTICAS REPRODUCTIVAS Y DE CRECIMIENTO EN BOVINOS PRODUCTORES DE CARNE.
- Author
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Ángel Hidalgo-Moreno, Jorge, Núñez-Domínguez, Rafael, Domínguez-Viveros, Joel, Ramírez-Valverde, Rodolfo, and Rodríguez-Almeida, Felipe
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GENETIC correlations , *COW-calf system , *MAXIMUM likelihood statistics , *ANIMAL models in research , *HERITABILITY , *CALVES , *BIVARIATE analysis , *CATTLE fertility - Abstract
The reproductive performance of the cow and its maternal ability affect the profitability of the cow-calf production systems. The objective of this study was to estimate components of (co) variance, heritability (h2) for the annual productivity index (PI), age at first calving (AFC), calving interval (CI) and weaning weight (WW), and genetic correlations (rg) among these traits, as well as the response to the selection in PI. The PI was calculated as the WW of the calf times 365, divided by the CI. The performance records used are from Brangus Negro (BN), Salers (SA) and Suizo Europeo (SE) cattle, coming from ranches in several Mexican states; the pedigree included 68 474 (BN), 15 594 (SA) and 187 294 (SE) animals. Univariate and bivariate analysis, which consider the animal model, were performed to estimate components of (co) variance and genetic parameters using the restricted maximum likelihood method, with the ASReml program. The direct h2 for PI varied from 0.06 to 0.12, for AFC from 0.01 to 0.15, for CI from 0.07 to 0.12 and for WW from 0.15 to 0.23. The estimators of rg ranged from -0.09 to -0.76 for PI-AFC, from -0.90 to -0.93 for PI-CI and from 0.17 to 0.97 for PI-WW. The selection for WW resulted in higher PI correlated changes (between 0.06 and 1.53 kg cow-1 year-1) than those obtained when using the direct selection for PI. The genetic correlations of PI with the other traits were favorable. The selection for WW, and then for PI, can genetically improve the annual productivity of cows. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2019
15. Parámetros genéticos para caracteres asociados a la curva de crecimiento de bovinos Tropicarne/Genetic parameters for characters associated with the growth curve of Tropicarne cattle
- Author
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Joel Domínguez-Viveros, Felipe Alonso Rodríguez-Almeida, Rafael Núñez-Domínguez, Rodolfo Ramírez-Valverde, and Juan Ángel Ortega-Gutiérrez
- Subjects
Correlación genética ,raza sintética ,ganadería tropical ,modelos no lineales ,heredabilidad. ,Agriculture - Abstract
El objetivo del presente estudio fue estimar parámetros genéticos para el peso adulto (PEA) y tasa de crecimiento (TAC) de bovinos Tropicarne, derivados del modelo no lineal de Brody; así como analizar las posibles relaciones genéticas de estas variables con el peso al destete (PD). Se analizaron 994 datos de PEA (kg) y de TAC (kg−1 mes−1 ) y 1 506 datos de PD ajustado a 240 d. Los valores promedio y la desviación estándar (±) para PEA, TAC y PD (kg) fueron de 419.1 ± 94.4, 0.0081 ± 0.0039 y 206.8 ± 34.1, respectivamente. El pedigrí se integró por 2 504 individuos. Se realizó un análisis multivariado, a partir de un modelo mixto que consideró como efectos jos los grupos contemporáneos y la covariable edad de la vaca al parto (lineal y cuadrático); y como aleatorios los efectos genéticos directos y maternos, maternos de ambiente permanente y residuales. Se estimó la heredabilidad directa (h2 a ) y materna (h2 m), las correlaciones genéticas entre los efectos directos (raa), los maternos (rmm), y los directos con maternos (ram). Las h2 a oscilaron de 0.18 a 0.30, y las h2 m de 0.07 a 0.39; lo cual indica una probable respuesta a la selección en PEA y TAC. Todas las correlaciones genéticas fueron positivas en un intervalo de 0.09 a 0.87, con excepción de raa entre PEA y TAC (-0.57); este antagonismo genético indica que los individuos con tasas altas de crecimiento no son los de mayor peso adulto.
- Published
- 2017
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16. PARÁMETROS GENÉTICOS E ÍNDICES DE SELECCIÓN PARA ALGUNAS CARACTERÍSTICAS PRODUCTIVAS Y REPRODUCTIVAS EN OVEJAS PELIBUEY EN EL SURESTE DE MÉXICO
- Author
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Juan Gabriel Magaña-Monforte, José Enrique Tec-Canché, Ricardo Aké-López, Rubén Cornelio Montes-Pérez, and José C. Segura
- Subjects
pelibuey ,heredabilidad ,correlación genética ,ganancia genética deseada ,progreso genético ,Agriculture ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
El objetivo fue estimar los parámetros genéticos para tamaño de camada al parto (LSB), tamaño de camada al destete (LSW), peso de camada al parto (LWB), peso de camada al destete ajustado a 60 días (LW60) y el intervalo de parto (LI) en ovejas de Pelibuey y comparar índices de selección. Heredabilidades y correlaciones genéticas y fenotípicas para las características fueron calculadas usando modelos animales. Dieciséis índices (IS1-IS16) basados en la metodología de ganancia genética deseada fueron comparados. Los índices fueron combinaciones de LW60 con LSB, LSW, LWB y LI. Las heredabilidades para LSB, LSW, LWB, LW60 y LI fueron 0.07, 0.02, 0.08, 0.09 y 0.03, respectivamente. Las correlaciones genéticas variaron de 0 a 0.79, mientras que las correlaciones fenotípicas variaron de -0.07 a 0.62. El mejor índice basado en la eficiencia relativa de un índice fue 2.31*LSB + 0.24*LW60. En conclusión, las heredabilidades estimadas fueron bajas y el mejor índice de selección incluyó LSB y LW60. El número y el tipo de rasgos contenidos en el índice influyeron en el progreso genético.
- Published
- 2019
17. Single- and multiple-trait BLUP in genetic selection of parents and hybrids of grain sorghum.
- Author
-
Oliveira de Souza, Nadson, Silva Alves, Rodrigo, Teodoro, Paulo Eduardo, Aparecida Silva, Lidiane, Dessaune Tardin, Flávio, Baldoni Tardin, Aisy, Vilela de Resende, Marcos Deon, and Lopes Bhering, Leonardo
- Subjects
- *
SORGHUM , *GRAIN yields , *GENOTYPES , *LIKELIHOOD ratio tests , *RESTRICTED maximum likelihood (Statistics) - Abstract
To increase yield, breeding programs must search for innovative and efficient methodologies for the development and selection of superior genotypes. Therefore, this study aimed to compare the single- and multiple-trait best linear unbiased prediction (BLUP) in genetic selection of parents and hybrids of grain sorghum. For this, an experiment conducted in alpha-lattice design with two replications was used. Flowering time (FT), plant height (PH), and grain yield (GY) were evaluated in 502 grain sorghum hybrids obtained by the cross of ten restorer lines and 54 male-sterile lines. Variance components were estimated via restricted maximum likelihood (REML). Significant effects of restorer lines, of male-sterile lines, and of specific combining ability were detected by the likelihood ratio test (LRT). The estimates of variance components, genetic parameters, and correlations were similar when obtained via single- and multiple trait-BLUP. Considering hybrids, the multiple-trait BLUP resulted in slightly higher predicted selection gain for the three evaluated traits and, therefore, can be efficiently applied in the genetic selection of grain sorghum. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2019
18. Evaluación genética para características de peso en ganado Brahman comercial.
- Author
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Bedoya O., Christian, Alzate R., Jovany, Ángel C., Juan, Escobar R., Carlos, and Calvo C., Samir
- Subjects
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ZEBUS , *BIRTH weight , *GENETIC correlations , *BIRTH certificates , *HERITABILITY , *CATTLE reproduction , *PREGNANCY in animals - Abstract
Objective. Evaluate genetically the traits of birth weight and weaning weight in commercial Brahman cattle. Materials and methods. A total of 1.015 records of birth weight (BWT) and weaning weight adjusted to 270 days (WW270), were evaluated. Data correspond to the offspring born between 2002 and 2014 belonging to "La Envidia" farm, located in the municipality of Planeta Rica, Córdoba. A bi-character animal model that included, additive genetic effect, maternal effect and sex, month, year and age at weaning as fixed effects, was used. Genetic parameters were estimated using the MTDF-REML software. Results. The average and coefficient of variation (CV) of BWT was 29.62±3.13 kg and 10.59%, respectively. The mean and CV for WW270 was 216.71±26.97 kg and 12.45%, respectively. The estimates of direct heritability were 0.44±0.143 and 0.39±0.12 for BWT and WW270, respectively. Maternal heritability was 0.09±0.092 and 0.42±0.087 for BWT and WW270, respectively. The estimated genetic and phenotypic correlation between the evaluated characteristics was 0.11 and 0.13, respectively; with genetic progress per year of -2.02 kg for BWT and 7.81 kg for WW270. Conclusion. The estimations of heritability indicate the existence of direct additive genetic variability, evidencing the opportunity of genetic gain through selection. However, environment have a great influence on birth weight and weaning weight traits, which is why special attention should be paid to the handling and nutrition of females during pregnancy and of calves from birth to weaning. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2019
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19. Efectos genéticos en el crecimiento predestete de corderos Hampshire.
- Author
-
Rodriguez-Almeida, F. A., Pérez-Camacho, C., Domínguez-Viveros, J., and de la Cruz-Colín, L.
- Abstract
The 30-day weight (P30; 1072) and the weaning (P75; 1750) of 10 flocks were analyzed in Hampshire lambs, to develop two objectives: to evaluate the expression of the genetic effects in the pre-weaning growth, and to analyze the possible implications in the genetic progress. The analyzes were univariate (ANAU) and bivariate (ANAB), through mixed models that included the fixed effects of contemporary groups and the covariable age of the mother; and as random, the direct and maternal genetic effects, the genetic covariance between them and the maternal effects of the permanent environment. Direct herilabilily (h²) and maternal (m²), genetic correlations (rdm), and genetic values (VG) were estimated. With the rank correlations (CR) in the VG, the ranking of the population and of the sire was analyzed; in addition, the genetic trends (TG) of the VGs were analyzed. The h² was in the range of 0.14±0.03 to 0.19±0.04; the m² in ANAU was 0.08±0.04 and 0.02±0.03, with ANAB the estimate was of 0.22±0.05 and 0.13±0.03. The rdm of ANAU was +1±0.15 in P30 and -1±0.18 in PD, changing in the ANAB to -0.46±0.10 and -0.20±0.07, respectively. The behavior of the TG in the ANAU was associated to the magnitude and sign of the rdm; likewise, the rdm of the ANAU implied changes in the ranking of sires, which was reflected in the TG and the CRs. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2019
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20. Parámetros y tendencias genéticas de variables de crecimiento para bovinos Romosinuano en México
- Author
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Rodolfo Ramírez Valverde, Ricardo E. Martínez Rocha, Rafael Núñez Domínguez, and José Guadalupe García Muñiz
- Subjects
bovinos criollos ,correlación genética ,heredabilidad ,peso al destete ,Science ,Science (General) ,Q1-390 ,Social Sciences ,Social sciences (General) ,H1-99 - Abstract
Introducción: Los bovinos Romosinuano son originarios de Colombia, pero en México hay ganaderos dedicados a su cría desde hace dos décadas. Su población en México es pequeña y no se encontraron estudios que documenten aspectos elementales para establecer un programa de mejoramiento genético en esta población. El objetivo de este estudio fue estimar los parámetros genéticos de pesos al nacimiento (PN) y al destete ajustado a 240 d (PD), así como documentar las tendencias genéticas para estas dos características en la población Romosinuano de México. Método: La base de datos provino de la “Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Criollo Lechero Tropical, A. C.”. La información utilizada incluyó 895 registros de PN y 517 de PD. El pedigrí incluyó 4,537 animales nacidos entre 1950 y 2016. Los análisis fueron realizados mediante el programa ASReml, preliminarmente usando modelos univariados para identificar los mejores, mediante la prueba de razón de verosimilitudes. El modelo animal bivariado para ambas características incluyó los efectos fijos de grupo contemporáneo (año-hato-época-sexo), la covariable edad de la madre al parto, lineal y cuadrática, y la covariable lineal de la proporción de genes Romosinuano. Los efectos aleatorios fueron los genéticos aditivos directos y la interacción semental por grupo contemporáneo para ambas características, más los genéticos aditivos maternos para PD. Las tendencias genéticas fueron estimadas mediante regresión lineal simple del promedio de los valores genéticos sobre el año de nacimiento de los animales. Resultados: Las estimaciones de heredabilidad para efectos directos fueron 0.19 ± 0.09 y 0.21 ± 0.12, para PN y PD. La heredabilidad materna para PD fue 0.04 ± 0.05. La proporción de la varianza fenotípica explicada por la interacción semental por grupo contemporáneo fueron 0.21 ± 0.05 y 0.11 ± 0.08 para PN y PD. La correlación genética entre PN y PD fue alta y positiva (0.69 ± 0.28). Las tendencias genéticas para PN y PD no fueron diferentes de cero (P > 0.05). Conclusión: Las estimaciones de heredabilidad para PN y PD reflejan variabilidad genética suficiente para implementar un programa de selección en estas características.
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- 2018
21. Parámetros y tendencias genéticas de variables de crecimiento para bovinos Romosinuano en México.
- Author
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Martínez Rocha, Ricardo E., Valverde, Rodolfo Ramírez, Domínguez, Rafael Núñez, and García Muñiz, José G.
- Abstract
Introduction: Romosinuano cattle is a breed originated in Colombia, but in Mexico there are organized breeders since two decades ago. This breed has a small population size in Mexico and no published studies documenting basic aspects to establish a breeding program were found. The objective of this study was to estimate genetic parameters for birth weight (BW) and weaning weight adjusted to 240 d (WW), as well as to document genetic trends for both traits, in the Romosinuano cattle population of Mexico. Method: The database was provided by “Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical A. C". A total of 895 and 517 records of BW and WW were used. The pedigree included 4,537 animals born between 1950 and 2016. Analyses were carried out with the ASReml program. Preliminarily, univariate models were used to identify the best one for each trait, through the likelihood ratio test. The bivariate animal model included the fixed effects of contemporary group (year-herd-season-sex), calving age as linear and quadratic covariate, and the linear covariate proportion of Romosinuano gene. The random effects were direct additive genetic and sire by contemporary group interaction for both traits, plus maternal additive genetic for WW. Genetic trends were estimated using linear regression of average breeding values on birth year of the animals. Results: Estimations of direct heritability for BW and WW were 0.19 ± 0.09 and 0.21 ± 0.12. Maternal heritability for WW was 0.04 ± 0.05. The proportion of phenotypic variance explained by the interaction of sire by contemporary group were 0.21 ± 0.05 and 0.11 ± 0.08, for BW and WW, respectively. The genetic correlation between BW and WW was strong and positive (0.69 ± 0.28). Genetic trends for BW and WW were not different from zero (P > 0.05). Conclusion: The heritability estimates for BW and WW showed enough genetic variability to implement a selection program for these traits. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
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- 2018
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22. Study of the Host Genetic Control over the Ruminal Microbiota and their Relationships with Methane Emissions in Dairy Cattle
- Author
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González Recio, Oscar, Universitat Politècnica de València. Departamento de Ciencia Animal - Departament de Ciència Animal, Universidad de Costa Rica, Ministerio de Economía y Competitividad, Saborío Montero, Alejandro, González Recio, Oscar, Universitat Politècnica de València. Departamento de Ciencia Animal - Departament de Ciència Animal, Universidad de Costa Rica, Ministerio de Economía y Competitividad, and Saborío Montero, Alejandro
- Abstract
Tesis por compendio, [ES] El análisis del control genético del hospedador sobre su microbiota ha sido señalado recientemente como un tema prometedor en diferentes campos de estudio. La relación entre el holobionte hospedador-microbioma y los fenotipos en el ganado lechero podría conducir a nuevos conocimientos en los programas de selección genética. Dentro de esta tesis doctoral, se realizó la estimación y análisis a través de diferentes enfoques estadísticos con el objetivo de desentrañar el control genético del hospedador sobre la microbiota en ganado lechero. Además, se analizó el rasgo de concentración de metano como un fenotipo potencial para ser incluido en el programa de mejora de ganado lechero español. Mayor abundancia relativa de la mayoría de los eucariotas (principalmente protozoos ciliados y hongos) y algunas arqueas (Methanobrevibacter spp. Methanothermus spp. y Methanosphaera spp.) fueron factores de riesgo para ser clasificadas en la categoría alta. Se propuso un conjunto de modelos de ecuaciones estructurales (SEM) de tipo recursivo dentro de un marco de Cadenas de Markov Monte Carlo (MCMC) para analizar conjuntamente la relación hospedador-metagenoma-fenotipo. Se estableció un modelo bivariado no-recursivo como punto de referencia. La heredabilidad de CH4 se estimó en 0,12 ± 0,01 en ambos modelos, recursivo y no recursivo. Asimismo, las estimaciones de heredabilidad para la abundancia relativa de los taxones se superpusieron entre los modelos y variaron entre 0.08 y 0.48. Las correlaciones genéticas entre la composición microbiana y el CH4 variaron de -0,76 a 0,65 en el modelo bivariado no recursivo y de -0,68 a 0,69 en el modelo recursivo. Doce matrices de relación de microbiota (K) fueron construidas a partir de diferentes métricas de distancia del microbioma, con el objetivo de comparar su desempeño dentro de un marco de estimación de componentes de varianza para CH4 y toda la microbiota. Análisis de simulación (n = 1000) y datos reales fueron desarrollados consider, [CA] L'anàlisi del control genètic de l'hoste sobre la seva microbiota s'ha assenyalat recentment com un tema prometedor en diferents camps d'estudi. La relació entre el holobiont hoste-microbioma i els fenotips en bovins de llet podria conduir a nous coneixements en els programes de cria. Dins d'aquest doctorat es van realitzar tesis, estimacions i anàlisis mitjançant diferents enfocaments estadístics amb l'objectiu de desentranyar el control genètic de l'hoste sobre la microbiota en bestiar lleter. A més, es va analitzar el tret de concentració de metà com a fenotip potencial a incloure en el programa espanyol de cria de bestiar lleter. La major abundància relativa de la majoria dels eucariotes (principalment protozous i fongs ciliats) i algunes arquees (Methanobrevibacter spp. Methanothermus spp i Methanosphera spp.) Van ser factors de risc per classificar-se en les categories altes. Es va proposar un conjunt de models d'equacions estructurals (SEM) de tipus recursiu dins d'un marc de cadena Markov Monte Carlo (MCMC) per analitzar conjuntament la relació hoste-metagenoma-fenotip. Es van establir models no recursius com a referència. L'heretabilitat del CH4 es va estimar en 0,12 ± 0,01 en ambdós models, recursius i no recursius. De la mateixa manera, les estimacions d'heretabilitat de l'abundància relativa dels tàxons es van superposar entre models i van oscil·lar entre 0,08 i 0,48. Les correlacions genètiques entre la composició microbiana i el CH4 van oscil·lar entre -0,76 i 0,65 en els models bivariables no recursius i de -0,68 a 0,69 en els models recursius. Dotze matrius de relació de microbiota (K) de diferents mètriques de distància de microbiomes, amb l'objectiu de comparar el seu rendiment dins d'un marc d'estimació de components de variància per CH4 i anàlisi de microbiomes sencers en simulació (n = 1000, 25 rèpliques) i es van realitzar dades reals , considerant quatre possibles models: un model genòmic additiu (GBLUP), un model de microbioma (MBLUP), u, [EN] The analysis of the host genetic control over its microbiota has recently been pointed out as a promising theme in different fields of study. The relationship between the host-microbiome holobiont and phenotypes in dairy cattle could lead to new insights in breeding programs. Within this Ph.D. thesis, estimation and analysis through different statistical approaches were performed aiming to unravel the host genetic control over the microbiota in dairy cattle. Besides, methane concentration trait was analyzed as a potential phenotype to be included in the Spanish dairy cattle breeding program. Higher relative abundance of most eukaryotes (mainly ciliate protozoa and fungi) and some archaea (Methanobrevibacter spp. Methanothermus spp and Methanosphera spp.) were risk factors for being classified in the high categories. a set of structural equation models (SEMs) of a recursive type within a Markov chain Monte Carlo (MCMC) framework was proposed to jointly analyze the host-metagenome-phenotype relationship. Non-recursive models were set as benchmark. Heritability of CH4 was estimated at 0.12 ± 0.01 in both, the recursive and non-recursive, models. Likewise, heritability estimates for the relative abundance of the taxa overlapped between models and ranged between 0.08 and 0.48. Genetic correlations between the microbial composition and CH4 ranged from -0.76 to 0.65 in the non-recursive bivariate models and from -0.68 to 0.69 in the recursive models. Regardless of the statistical model used, positive genetic correlations with methane were estimated consistently for the 7 genera pertaining to the Ciliophora phylum, as well as for those genera belonging to the Euryarchaeota (Methanobrevibacter sp.), Chytridiomycota (Neocallimastix sp.) and Fibrobacteres (Fibrobacter sp.) phyla. Twelve microbiota relationship matrices (K) from different microbiome distance metrics were built, aiming to compare its performance within a variance component estimation framework for CH4 and w
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- 2022
23. Factors that influence the performance of the dual purpose bovine system in the Araucanian Piedemonte (Colombia)
- Author
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Daza, O. A., Manrique, C., Daza, O. A., and Manrique, C.
- Abstract
The objective of the present study was to evaluate the factors that influence the performance of the dual purpose system in the Araucanian Foothills. The productive records of 973 cows belonging to the project led by the National University of Colombia, “Development of a technological management program for the social and productive innovation of meat and milk in bovine production systems of the Llanos region of Colombia (PBA)”, were analyzed between 2016 and 2017. In this research the genetic potential of the bovine animal resource in the bovine dual purpose production system was evaluated, which involved the participation of 62 farms randomly selected in the municipalities of the Araucanian Foothills (Arauquita, Fortul, Saravena, and Tame), measurements of the milk production and weaning calf weight generated by this production system were performed. It was found that the characteristic milk production by lactation (PLL) is higher or lower depending on the number of deliveries, as well as it varies significantly according to the municipality, racial group and duration of lactation; regarding weaning weight (PD), it was found that the duration of lactation significantly influences this result, as well as the municipality and the racial group, however, factors such as sex did not show significant differences for this variable. In addition, the genetic parameters of heritability (h2) and genetic correlations were generated for each breed established in the dual purpose production system, for the aforementioned productive characteristics., El presente estudio tuvo como objetivo evaluar los factores que influyen en el desempeño del sistema doble propósito en el Piedemonte Araucano. Se analizaron los registros productivos de 973 vacas pertenecientes al proyecto “Desarrollo de un programa de gestión tecnológica para la innovación social y productiva de la carne y la leche en sistemas de producción bovina de la región de los Llanos de Colombia (PBA)”, liderado por la Universidad Nacional de Colombia, entre 2016 y 2017. En esta investigación se evaluó el potencial genético del recurso animal bovino en el sistema productivo doble propósito bovino. Se contó con la participación de 62 predios seleccionados aleatoriamente en los municipios del Piedemonte Araucano (Arauquita, Fortul, Saravena y Tame), se realizaron mediciones de la producción de leche y el peso del ternero desteto que genera este sistema productivo. Se encontró que la característica producción de leche por lactancia (PLL) es mayor o menor de acuerdo con el número de partos, así como también varia significativamente según el municipio, el grupo racial y la duración de la lactancia; en cuanto al peso al destete (PD), se encontró que la duración de la lactancia influye significativamente en este resultado, así como el municipio y el grupo racial, sin embargo, factores como el sexo no arrojaron diferencias significativas para esta variable. Además, se generaron los parámetros genéticos de heredabilidad (h2) y correlaciones genéticas para cada raza establecida en el sistema de producción doble propósito, para estas características productivas mencionadas, en el departamento de Arauca.
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- 2022
24. Evaluación del efecto crioprotector de diferentes fuentes de antioxidantes en el semen bovino
- Author
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Barragán, Idelmar, Suárez Usbeck, Andrés, Condolo Ortiz, Luis Agustín, Villafuerte, Alex, Mira Naranjo, José Miguel, Barragán, Idelmar, Suárez Usbeck, Andrés, Condolo Ortiz, Luis Agustín, Villafuerte, Alex, and Mira Naranjo, José Miguel
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In Chihuahua - Mexico, at the Regional Livestock Union and the Autonomous University of Chihuahua, different concentrations of antioxidants Cysteine 2mM, Caffeine 5mM, Ascorbic acid 4.5 mg/ml in a commercial extender plus a control treatment were evaluated to analyze semen quality: viability % , progressive motility %, membrane integrity % acrosomal integrity. Six ejaculates from different animals were used, obtained by using an electro-ejaculator. The experiment was managed under a DBCA, the results obtained were subjected to a Tukey statistical test at P ≥ 0.05 for the control treatment. Under the technical and resource conditions in which this research was carried out, the use of an extra source of antioxidants in the commercial extender for bovine semen cryopreservation does not improve seminal quality characteristics., Em Chihuahua - México, na União Pecuária Regional e na Universidade Autônoma de Chihuahua, foram avaliadas diferentes concentrações de antioxidantes Cisteína 2mM, Cafeína 5mM, Ácido Ascórbico 4,5 mg/ml em um diluente comercial mais um tratamento controle para analisar a qualidade do sêmen: viabilidade % , motilidade progressiva %, integridade da membrana % integridade acrossomal. Foram utilizados seis ejaculados de diferentes animais, obtidos por meio de eletroejaculador. O experimento foi conduzido sob DBCA, os resultados obtidos foram submetidos ao teste estatístico de Tukey em P ≥ 0,05 para o tratamento controle. Nas condições técnicas e de recursos em que esta pesquisa foi realizada, o uso de uma fonte extra de antioxidantes no diluente comercial para criopreservação de sêmen bovino não melhora as características de qualidade seminal., En Chihuahua – México, en la Unión Ganadera Regional y Universidad Autónoma de Chihuahua, se evaluó diferentes concentraciones de antioxidantes Cisteína 2mM, Cafeína 5mM, ácido Ascórbico 4.5 mg/ml en un diluyente comercial más un tratamiento control para analizar calidad del semen: viabilidad %, motilidad progresiva %, integridad de membrana %integridad acrosomal. Se utilizó 6 eyaculados de diferentes animales, obtenidos mediante el uso de un electroeyaculador. El experimento se manejó bajo un DBCA, los resultados obtenidos fueron sometidos a una prueba estadística Tukey a una P ≥ 0.05 para el tratamiento control. Bajo las condiciones técnicas y de recursos en las que se ejecutó esta investigación, la utilización de una fuente de antioxidantes extra en el diluyente comercial para la criopreservacion de semen bovino, no mejora las características de calidad seminal.
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- 2022
25. Evaluación de las características de producción y tipo en vacas Holstein
- Author
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Parra Rojas, Pablo Sebastián, Tello Flores, Luis Andres, Maldonado Arias, Diego Fabián, Almeida López, Fabian Augusto, Parra Rojas, Pablo Sebastián, Tello Flores, Luis Andres, Maldonado Arias, Diego Fabián, and Almeida López, Fabian Augusto
- Abstract
The objective of this research was to evaluate the type and production traits in Holstein cows from Hacienda Napoles in the province of Cañar the experimental units with which we worked were 30 Holstein cows in the production stage, which were subjected to the linear evaluation of the 21 type traits of the breed, both best scored traits such as: stature, strength, rump angle and width, coxofemoral position, teat length, hoof angle, lateroot and hind leg view, animal capacity, anterior teat placement, angularity, locomotion, udder inclination and low scoring traits such as: udder depth, posterior udder height, medial suspensory ligament, posterior udder width, subsequent to said evaluation we proceeded to carry out the correlation study between the type variables with the production variables by means of Pearson's correlation coefficient, the results of the quantitative variables were: 7.46; 8; 5; 4.90; 4.63; 5; 7.56; 4.90; 8; 7.23; 5; 7.33; 4.33; points respectively, the characteristics with lower scores were: 5.40; 6.86; 6.50; 7.10; points respectively. The correlation of the characteristics of type with production showed that the variables valued are independent. It was concluded that the establishment should select bulls that maintain the positive characteristics of the evaluated cows. It is recommended that the establishment should have in the herd functional specimens., El objetivo de esta investigación fue evaluar las características de tipo y producción en vacas Holstein de la Hacienda Nápoles de la provincia del Cañar, las unidades experimentales con las que se trabajó fueron 30 ejemplares de la raza Holstein en la etapa de producción, las cuales fueron sometidas a la evaluación lineal de las 21 características de tipo de la raza, tanto características mejor puntuadas como: estatura, fortaleza, Angulo y ancho de grupa, posición del coxofemoral, longitud de pezones, ángulo de pezuña, vista latera y posterior de patas, capacidad del animal, colocación de pezones anteriores, angularidad, locomoción, inclinación de la ubre y características con puntuaciones bajas como: profundidad de la ubre, altura de la ubre posterior, ligamento suspensor medio, anchura de la ubre trasera, posterior a dicha valoración se procedió a realizar el estudio de correlación entre las variables de tipo con las variables de producción por medio del coeficiente de correlación de Pearson, los resultados de las variables cuantitativas fueron de: 7,46; 8; 5; 4,90; 4,63; 5; 7,56; 4,90; 8; 7,23; 5; 7,33; 4,33; puntos respectivamente, las características con puntuaciones inferiores fueron: 5,40; 6,86; 6,50; 7,10; puntos respectivamente. La correlación de las características de tipo con producción arrojo que las variables valoradas son de carácter independiente. Concluyendo que en el establecimiento se debe seleccionar toros que mantengan las características positivas de las vacas evaluadas. Se recomienda que el establecimiento debe poseer en el hato ejemplar funcionales.
- Published
- 2022
26. Study of the Host Genetic Control over the Ruminal Microbiota and their Relationships with Methane Emissions in Dairy Cattle
- Author
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Alejandro Saborío Montero
- Subjects
Genetic correlation ,Holobiability ,Microbiota ,Correlación genética ,Principal component analysis ,Metano ,Microbiota relationship matrix ,Matriz de relación de la microbiota ,Microbiability ,Heritability ,Heredabilidad ,Microbiome ,Methane ,Microbioma - Abstract
[ES] El análisis del control genético del hospedador sobre su microbiota ha sido señalado recientemente como un tema prometedor en diferentes campos de estudio. La relación entre el holobionte hospedador-microbioma y los fenotipos en el ganado lechero podría conducir a nuevos conocimientos en los programas de selección genética. Dentro de esta tesis doctoral, se realizó la estimación y análisis a través de diferentes enfoques estadísticos con el objetivo de desentrañar el control genético del hospedador sobre la microbiota en ganado lechero. Además, se analizó el rasgo de concentración de metano como un fenotipo potencial para ser incluido en el programa de mejora de ganado lechero español. Mayor abundancia relativa de la mayoría de los eucariotas (principalmente protozoos ciliados y hongos) y algunas arqueas (Methanobrevibacter spp. Methanothermus spp. y Methanosphaera spp.) fueron factores de riesgo para ser clasificadas en la categoría alta. Se propuso un conjunto de modelos de ecuaciones estructurales (SEM) de tipo recursivo dentro de un marco de Cadenas de Markov Monte Carlo (MCMC) para analizar conjuntamente la relación hospedador-metagenoma-fenotipo. Se estableció un modelo bivariado no-recursivo como punto de referencia. La heredabilidad de CH4 se estimó en 0,12 ± 0,01 en ambos modelos, recursivo y no recursivo. Asimismo, las estimaciones de heredabilidad para la abundancia relativa de los taxones se superpusieron entre los modelos y variaron entre 0.08 y 0.48. Las correlaciones genéticas entre la composición microbiana y el CH4 variaron de -0,76 a 0,65 en el modelo bivariado no recursivo y de -0,68 a 0,69 en el modelo recursivo. Doce matrices de relación de microbiota (K) fueron construidas a partir de diferentes métricas de distancia del microbioma, con el objetivo de comparar su desempeño dentro de un marco de estimación de componentes de varianza para CH4 y toda la microbiota. Análisis de simulación (n = 1000) y datos reales fueron desarrollados considerando cuatro modelos posibles: un modelo genómico aditivo (GBLUP), un modelo de microbioma (MBLUP), un modelo de efectos genéticos y microbioma (HBLUP) y un modelo de efectos de interacción genético, microbioma y genético × microbioma (HiBLUP). Un nuevo término "Holobiabilidad" fue definido para referirse a la proporción de la varianza atribuible a los efectos del holobionte hospedador-microbioma. Las estimaciones a partir de datos reales usando HiBLUP variaron dependiendo de la K utilizada y estuvieron entre 0.15-0.17, 0.15-0.21 y 0.42-0.59 para heredabilidad, microbiabilidad y holobiabilidad, respectivamente. El conjunto de datos de microbioma fue agregado a través de análisis de componentes principales (PCA), en pocos componentes principales (PCs) que fueron utilizados como aproximaciones del metagenoma central. Parte de la variabilidad condensada en estos PC está controlada por el genoma de la vaca, con estimaciones de heredabilidad para el primer PC (PC1) de ~ 0,30 en todos los niveles taxonómicos, con una gran probabilidad (> 83%) de que la distribución posterior sea > 0,20 y con un intervalo de mayor densidad posterior al 95% (95% HPD) no conteniendo cero. La mayoría de las estimaciones de correlación genética entre PC1 y metano fueron grandes (>0,70) en todos los niveles taxonómicos, con la mayor parte de la distribución posterior (> 82%) siendo > 0,50 y con su 95% HPD no conteniendo cero. Estos resultados sugieren que todo el metagenoma del rumen regula recursivamente las emisiones de metano en las vacas lecheras, y que tanto el CH4 como las composiciones de la microbiota están parcialmente controladas por el genotipo del hospedador. Las variables agregadas (PC) propuestas podrían ser usadas en programas de mejora de animales para reducir las emisiones de metano en las generaciones futuras., [CA] L'anàlisi del control genètic de l'hoste sobre la seva microbiota s'ha assenyalat recentment com un tema prometedor en diferents camps d'estudi. La relació entre el holobiont hoste-microbioma i els fenotips en bovins de llet podria conduir a nous coneixements en els programes de cria. Dins d'aquest doctorat es van realitzar tesis, estimacions i anàlisis mitjançant diferents enfocaments estadístics amb l'objectiu de desentranyar el control genètic de l'hoste sobre la microbiota en bestiar lleter. A més, es va analitzar el tret de concentració de metà com a fenotip potencial a incloure en el programa espanyol de cria de bestiar lleter. La major abundància relativa de la majoria dels eucariotes (principalment protozous i fongs ciliats) i algunes arquees (Methanobrevibacter spp. Methanothermus spp i Methanosphera spp.) Van ser factors de risc per classificar-se en les categories altes. Es va proposar un conjunt de models d'equacions estructurals (SEM) de tipus recursiu dins d'un marc de cadena Markov Monte Carlo (MCMC) per analitzar conjuntament la relació hoste-metagenoma-fenotip. Es van establir models no recursius com a referència. L'heretabilitat del CH4 es va estimar en 0,12 ± 0,01 en ambdós models, recursius i no recursius. De la mateixa manera, les estimacions d'heretabilitat de l'abundància relativa dels tàxons es van superposar entre models i van oscil·lar entre 0,08 i 0,48. Les correlacions genètiques entre la composició microbiana i el CH4 van oscil·lar entre -0,76 i 0,65 en els models bivariables no recursius i de -0,68 a 0,69 en els models recursius. Dotze matrius de relació de microbiota (K) de diferents mètriques de distància de microbiomes, amb l'objectiu de comparar el seu rendiment dins d'un marc d'estimació de components de variància per CH4 i anàlisi de microbiomes sencers en simulació (n = 1000, 25 rèpliques) i es van realitzar dades reals , considerant quatre possibles models: un model genòmic additiu (GBLUP), un model de microbioma (MBLUP), un model d'efectes genètics i microbiomes (HBLUP) i un model d'efectes d'interacció genètics, microbiomes i genètics × microbiomes (HiBLUP). Es va definir un nou terme "Holobiabilitat" per referir-se a la proporció de la variància fenotípica atribuïble als efectes holobiont del microbioma host. Les estimacions de dades reals mitjançant HiBLUP van variar en funció de la K utilitzada i van oscil·lar entre 0,15-0,17, 0,15-0,21 i 0,42-0,59 per heretabilitat, microbiabilitat i holobiabilitat, respectivament. El conjunt de dades de microbiomes es va agregar mitjançant l'anàlisi de components principals (PCA) en pocs components principals (PC) que es van utilitzar com a proxies del metagenoma principal. Part de la variabilitat condensada en aquestes PC està controlada pel genoma de la vaca, amb estimacions d'heretabilitat per a la primera PC (PC1) de ~ 0,30 a tots els nivells taxonòmics, amb una gran probabilitat (> 83%) de la distribució posterior> 0,20 i amb un 95% més alt interval de densitat posterior (95% HPD) que no conté zero. La majoria de les estimacions de correlació genètica entre PC1 i metà eren grans (>0,70) en tots els nivells taxonòmics, amb una gran part de la distribució posterior (> 82%)> 0,50 i amb un 95% de HPD que no contenia zero. Aquests resultats suggereixen que tot el metagenoma del rumen regula recursivament les emissions de metà en vaques lleteres i que tant el CH4 com les composicions de microbiota estan parcialment controlades pel genotip de l'hoste. Les variables agregades proposades (PC) es podrien utilitzar en programes de cria d'animals per reduir les emissions de metà en les generacions futures., [EN] The analysis of the host genetic control over its microbiota has recently been pointed out as a promising theme in different fields of study. The relationship between the host-microbiome holobiont and phenotypes in dairy cattle could lead to new insights in breeding programs. Within this Ph.D. thesis, estimation and analysis through different statistical approaches were performed aiming to unravel the host genetic control over the microbiota in dairy cattle. Besides, methane concentration trait was analyzed as a potential phenotype to be included in the Spanish dairy cattle breeding program. Higher relative abundance of most eukaryotes (mainly ciliate protozoa and fungi) and some archaea (Methanobrevibacter spp. Methanothermus spp and Methanosphera spp.) were risk factors for being classified in the high categories. a set of structural equation models (SEMs) of a recursive type within a Markov chain Monte Carlo (MCMC) framework was proposed to jointly analyze the host-metagenome-phenotype relationship. Non-recursive models were set as benchmark. Heritability of CH4 was estimated at 0.12 ± 0.01 in both, the recursive and non-recursive, models. Likewise, heritability estimates for the relative abundance of the taxa overlapped between models and ranged between 0.08 and 0.48. Genetic correlations between the microbial composition and CH4 ranged from -0.76 to 0.65 in the non-recursive bivariate models and from -0.68 to 0.69 in the recursive models. Regardless of the statistical model used, positive genetic correlations with methane were estimated consistently for the 7 genera pertaining to the Ciliophora phylum, as well as for those genera belonging to the Euryarchaeota (Methanobrevibacter sp.), Chytridiomycota (Neocallimastix sp.) and Fibrobacteres (Fibrobacter sp.) phyla. Twelve microbiota relationship matrices (K) from different microbiome distance metrics were built, aiming to compare its performance within a variance component estimation framework for CH4 and whole microbiome analysis on simulation (n = 1000, 25 replicates) and real data were performed, considering four possible models: an additive genomic model (GBLUP), a microbiome model (MBLUP), a genetic and microbiome effects model (HBLUP) and a genetic, microbiome and genetic × microbiome interaction effects model (HiBLUP). A new term "Holobiability" was defined to refer to the proportion of the phenotypic variance attributable to the host-microbiome holobiont effects. Estimates from real data using HiBLUP varied depending on the K used and ranged between 0.15-0.17, 0.15-0.21 and 0.42-0.59 for heritability, microbiability and holobiability, respectively. The microbiome dataset was aggregated through Principal Component Analysis (PCA) into few principal components (PCs) that were used as proxies of the core metagenome. Part of the variability condensed in these PCs is controlled by the cow genome, with heritability estimates for the first PC (PC1) of ~0.30 at all taxonomic levels, with a large probability (>83%) of the posterior distribution being > 0.20 and with the 95% highest posterior density interval (95%HPD) not containing zero. Most genetic correlation estimates between PC1 and methane were large (>0.70) at all taxonomic levels, with most of the posterior distribution (>82%) being >0.50 and with its 95%HPD not containing zero. These results suggest that rumen's whole metagenome recursively regulate methane emissions in dairy cows, and that both CH4 and the microbiota compositions are partially controlled by the host genotype. The purposed aggregated variables (PCs) could be used in animal breeding programs to reduce methane emissions in future generations., This research was financed by RTA2015-00022-C03-02 (METALGEN) project from the national plan of research, development and innovation 2013-2020 and the Department of Economic Development and Competitiveness (Madrid, Spain). We thank the regional Holstein Associations and farmers collaborating in the project. Computational support from the High-Performance Computing Centre in Galicia (Spain) is acknowledged. Alejandro Saborío-Montero acknowledges the scholarship from Universidad de Costa Rica for his doctorate studies which partially conducted to the progress of this study.
- Published
- 2022
27. Factores que influyen en el desempeño del sistema doble propósito bovino en el Piedemonte Araucano (Colombia).
- Author
-
Daza, O. A. and Manrique, C.
- Abstract
El presente estudio tuvo como objetivo evaluar los factores que influyen en el desempeño del sistema doble propósito en el Piedemonte Araucano. Se analizaron los registros productivos de 973 vacas pertenecientes al proyecto "Desarrollo de un programa de gestión tecnológica para la innovación social y productiva de la carne y la leche en sistemas de producción bovina de la región de los Llanos de Colombia (PBA)", liderado por la Universidad Nacional de Colombia, entre 2016 y 2017. En esta investigación se evaluó el potencial genético del recurso animal bovino en el sistema productivo doble propósito bovino, para ello se contó con la participación de 62 predios seleccionados aleatoriamente en los municipios del Piedemonte Araucano (Arauquita, Fortul, Saravena y Tame), se realizaron mediciones de la producción de leche y el peso del ternero desteto que genera este sistema productivo. Se encontró que la característica producción de leche por lactancia (PLL) es mayor o menor de acuerdo con el número de partos, así como también varia significativamente según el municipio, el grupo racial y la duración de la lactancia; en cuanto al peso al destete (PD), se encontró que la duración de la lactancia influye significativamente en este resultado, así como el municipio y el grupo racial, sin embargo, factores como el sexo no arrojaron diferencias significativas para esta variable. Además, se generaron los parámetros genéticos de heredabilidad (h2) y correlaciones genéticas para cada raza establecida en el sistema de producción doble propósito, para estas características productivas mencionadas, en el departamento de Arauca. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2022
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28. Accuracy of genomic values predicted using deregressed predicted breeding values as response variables.
- Author
-
Ramírez-Flores, Fernanda, López-Ordaz, Rufino, Domínguez-Viveros, Joel, García-Muñiz, José Guadalupe, and Ruíz-Flores, Agustín
- Subjects
- *
GENOMES , *PLANT breeding , *PLANT genetics , *GENETIC research , *PHENOTYPES , *GENOTYPES , *GENETICS - Abstract
Highly accurate predicted genetic values must be obtained at an early age to promote rapid genetic progress. The objectives of this study were to compare accuracies (R2) of genomic values (GVs) and to estimate genetic correlation between true genetic values and genomic values obtained using predicted breeding values (EBV) and deregressed EBV (DEBV) as response variables. A first population, effective population size 800 and 100 generations, was simulated using the QMSim program to generate linkage disequilibrium. Thereafter, 20 males and 200 females were used to generate a second 14-generation population, with 6,400 individuals per generation and its corresponding phenotype and genotype in SNP terms. Generations 7 to 14 of the second population were used in several combinations as training (PEn) and evaluation (PEv) subpopulations. GVs, their accuracies, and genetic correlations were obtained using the GenSel and ASREML programs. When PEn was the largest, the mean R2 of GV was the highest, 0.77 ± 0.01. The closer PEn was to PEv, the higher the R2, and correspondingly, the lower the predicted error variance. The trends for R2 and PEV held true for both EBV and DEBV used as response variables. Genetic correlation estimates between true genetic values and GVs varied from 0.41 to 0.53 in the two scenarios studied. They decreased when PEn and PEv were farther apart. There were only slight advantages of using DEBVs as response variables over using EBVs. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2017
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29. Genetic evaluation of dystocia and its relationship with productive and reproductive traits in Holstein cows.
- Author
-
Salimi, Mohammad Hossein, Hossein-Zadeh, Navid Ghavi, Shadparvar, Abdol Ahad, and Eghbal, Ali Reza
- Subjects
- *
DYSTOCIA , *HOLSTEIN-Friesian cattle , *MILK yield , *CATTLE breeding , *GENETIC correlations , *HERITABILITY , *CATTLE - Abstract
Background: dystocia is one of the most economically significant secondary traits in dairy cows and has adverse effects on the subsequent survival, health, and performance of mothers and offspring. Objective: the aim of this study was to estimate direct and maternal genetic parameters for calving ease (CE) and its relationship with productive and reproductive traits in Iranian Holstein cows. Methods: data from 1991 through 2011 were collected from the Animal Breeding Center of Iran, and contained 132,831 records of CE, 183,203 records of productive traits including 305-d adjusted milk yield (MY305), 305-d adjusted fat yield (FY305) and 305-d adjusted protein yield (PY305), and 129,199 records of reproductive traits including days open (DO), days to first service (DFS) and calving interval (CI). Univariate and bivariate linear animal models were used for the analysis of traits in two different models on which direct genetic effect (model 1) and direct + maternal genetic effects (model 2) using AI-REML algorithm were included. Results: estimated heritabilities for CE in model 1 were 0.02 in univariate and 0.02-0.03 in bivariate analyses. Direct and maternal heritabilities in model 2 were 0.02 and 0.002 for univariate, and 0.03 and 0.0004-0.006 in bivariate analyses, respectively. Genetic correlations between direct effects of CE with MY305, FY305, and PY305 were -0.99, 0.02 and -0.07 in model 1, and -0.2, -0.02 and -0.13 in model 2, respectively. Conclusion: this study suggested that a selection index that includes both direct and maternal effects should be included in CE breeding programs. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2017
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30. Parámetros genéticos para caracteres asociados a la curva de crecimiento de bovinos Tropicarne.
- Author
-
Domínguez-Viveros, Joel, Rodríguez-Almeida, Felipe Alonso, Núñez-Domínguez, Rafael, Ramírez-Valverde, Rodolfo, and Ortega-Gutiérrez, Juan Ángel
- Published
- 2017
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31. Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in first calving buffaloes
- Author
-
Naudin A Hurtado-Lugo, Severino C de Sousa, Rúsbel R Aspilcueta, Swammy Y Gutiérrez, Mario F Cerón-Muñoz, and Humberto Tonhati
- Subjects
biomodelación ,correlación genética ,modelos de regresión aleatoria ,polinomios de Legendre ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Background: the milk yield records measured along lactation provide an example of repeated measures; the random regression models are an appealing approach to model repeated measures and to estimate genetic parameters. Objective: to estimate the genetic parameters by modeling the additive genetic and the residual variance for test-day milk yield in first calving buffaloes. Methods: 3,986 test-day data from 1,246 first lactations of crossbred buffalo daughters of 23 sires and 391 dams between 1997 and 2008 from five farms were used. The model included the genetic and permanent environment additive as the random effect and the contemporary group (year, month of test-day) and age at calving as covariable (linear) fixed effects. The fixed (third order) and random (third to ninth order) regressions were obtained by Legendre polynomials. The residual variances were modeled with a homogeneous structure and various heterogeneous classes. The variance components were estimated using the WOMBAT statistical program (Meyer, 2006). Results: according to the likelihood ratio test, the best model included four variance classes, considering Legendre polynomials of the fourth order for permanent environment and additive genetic effects. The heritabilities estimates were low, varying from 0.0 to 0.14. The estimates of genetic correlations were high and positive among PDC1 and PDC8, except for PCD9, which was negative. This indicates that for any of the selection criteria adopted, the indirect genetic gain is expected for all lactation curves, except for PCD9. Conclusion: heterogeneity of residual variances should be considered in models whose goal is to examine the alterations of variances according to day of lactation.
- Published
- 2013
32. Correlaciones genotípicas, fenotípicas y ambientales, y análisis de sendero en tomate de árbol (Cyphomandra betacea Cav. Sendt.)
- Author
-
Liz Katherine Lagos Santander, Franco Alirio Vallejo, Tulio César Lagos Burbano, and David Esteban Duarte Alvarado
- Subjects
Análisis de sendero ,correlación ambiental ,correlación fenotípica ,correlación genética ,Cyphomandra betacea ,Agriculture - Abstract
En el estudio se evaluaron diferentes componentes de producción y se estimaron las correlaciones fenotípicas, genéticas y ambientales, considerando nueve variables relacionadas con el tamaño y la calidad del fruto de tomate de árbol (Cyphomandra betacea Cav. Sendt.); igualmente se establecieron los efectos directos e indirectos de las variables componentes de calidad sobre el peso del fruto. Para el efecto se utilizaron los datos existentes de 81 híbridos (72 híbridos interpoblacionales y nueve testigos) dispuestos en tres repeticiones, en condiciones del departamento de Nariño, Colombia. Los resultados obtenidos indicaron que las correlaciones genotípicas fueron superiores a las fenotípicas y ambientales. El peso de fruto (PF) presentó las mayores correlaciones genéticas con el peso de semilla por fruto (rG = 0.97) y con el peso de pulpa más semilla (rG = 0.92). El análisis de sendero con base en correlaciones genotípicas mostró que el peso de pulpa más semilla fue la variable que tuvo el mayor efecto directo sobre el PF (1.353). Esto demuestra que una selección por peso de fruto da como resultado un aumento en peso de pulpa más semilla. Teniendo en cuenta las correlaciones fenotípicas, este análisis permitió establecer que los efectos directos de peso de semilla de fruto (PSF) y peso de pulpa más semilla (P + S) (1.166 y 0.743, respectivamente) son los que más contribuyen al PF.
- Published
- 2013
33. Genetic parameters for ultrasound-evaluated carcass and body traits in Anglo-Nubian goats
- Author
-
Tatiana Saraiva Torres, Luciano Silva Sena, Natanael Pereira da Silva Santos, José Elivalto Guimarães Campelo, José Lindenberg Rocha Sarmento, and Luiz A. S. Figueiredo-Filho
- Subjects
seleção ,calidad de carne ,heritability ,meat quality ,parámetros genéticos ,(co)variance ,genetic parameters ,Anglo-Nubian ,índice de seleção ,selection index ,bayesian inference ,ultrasonografía ,animal production ,parâmetros genéticos ,producción animal ,ultrasonography ,heredabilidad ,genetic correlation ,Breed ,Animal culture ,inferencia Bayesiana ,anglonubian ,qualidade da carne ,goats ,Rump ,selection ,Anglonubian ,Biology ,Genetic correlation ,heredabilidade ,SF1-1100 ,Perimeter ,correlação genética ,Animal science ,Gibbs sampling ,Genetic variation ,Anglonubiana ,canal ,Selection (genetic algorithm) ,(co)variancia ,General Veterinary ,(co)variância ,cabras ,caprinocultura ,Heritability ,inferência Bayesiana ,muestreo de Gibbs ,produção animal ,selección ,carcaça ,Animal Science and Zoology ,gibbs sampling ,correlación genética ,índice de selección ,amostragem de Gibbs ,ultrassonografia ,carcass - Abstract
Background: Meat goat breeding programs should prioritize the identification and selection of genetically superior animals for traits related to meat quality and carcass yield in order to increase the value of the final product. Objective: To estimate (co)variance components and genetic parameters for ultrasound-measured carcass traits, body size and body weight in Anglo- Nubian breed goats raised in the Mid-North region of Brazil. Methods: (Co)variance components and genetic parameters were estimated using the single and two-trait animal model analyses via Bayesian inference for loin eye dimensions (area, length, and depth), sternal fat thickness, rump height, chest circumference and depth, leg perimeter, and body weight. Results: Heritability estimates were higher when two-trait analyses were used. This finding implies that it is possible to recover part of the additive genetic variance included in the residual variance due to the correlation between traits. Genetic correlations between carcass and body size traits showed different magnitudes. On the other hand, genetic correlations between the traits related to muscularity showed high magnitudes. Conclusions: Body weight was not a good indicator of muscularity; therefore, it is not recommended as a criterion for indirect selection to improve carcass traits of Anglo-Nubian goats. Leg perimeter and chest circumference may be important to construct selection indexes in meat goat breeding programs. Resumen Antecedentes: los programas de mejoramiento de caprinos de carne deben priorizar la identificación y selección de animales genéticamente superiores para características relacionadas con la calidad de la carne y rendimiento de la canal, con el fin de agregar valor al producto final. Objetivo: estimar los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para características de canal obtenidas por ultrasonografía, características de tamaño y peso corporal en caprinos de la raza Anglonubiana, criados en la región medio-norte de Brasil. Métodos: los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos fueron estimados mediante un modelo animal usando análisis uni y bi-carácter vía metodología Bayesiana para las dimensiones del ojo de lomo (área, profundidad y longitud), grosor de la grasa esternal, altura de la grupa, circunferencia y profundidad torácica, perímetro de la pierna y peso corporal. Resultados: las estimativas de heredabilidad obtenidas a partir del análisis bi-carácteristico fueron mayores que las obtenidas a partir del análisis uni-carácteristico. Este supuesto implica que es posible recuperar parte de la variancia genética aditiva incluida en la variancia residual, debido a la correlación entre las características. Las correlaciones genéticas entre las características de canal y las medidas corporales presentaron diferentes magnitudes. Por otro lado, las correlaciones genéticas entre las características relacionadas con musculatura presentaron alta magnitud. Conclusiones: el peso corporal no fue un buen indicador de musculatura; por eso no es recomendado como criterio de selección indirecta para mejorar la canal de caprinos Anglonubianos. El perímetro de la pierna y la circunferencia del pecho pueden ser importantes para la construcción de índices de selección en programas de mejoramiento de carne caprina. Resumo Antecedentes: programas de melhoramento de caprinos de corte devem priorizar a identificação e seleção de animais geneticamente superiores para características relacionadas à qualidade da carne e rendimento de carcaça, para aumentar o valor ao produto final. Objetivo: estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia, características de tamanho e peso corporal em caprinos da raça Anglo-Nubiana criados na região Meio-Norte do Brasil. Métodos: os componentes de (co)variância e parâmetros genéticos foram estimados usando análises uni e bicaracterísticas de um modelo animal via metodologia Bayesiana para área, profundidade e comprimento de olho de lombo, espessura da gordura esternal, altura da garupa, circunferência e profundidade torácica, perímetro da perna e peso corporal. Resultados: as estimativas de herdabilidade obtidas a partir das análises bicaracterísticas foram maiores que as obtidas a partir das análises unicaracterísticas. Esse resultado implica que é possível recuperar parte da variância genética aditiva incluída na variância residual devido à correlação entre as características. As correlações genéticas entre as características de carcaça e as medidas corporais apresentaram magnitudes variáveis. Por outro lado, as correlações genéticas entre as características relacionadas à musculosidade apresentaram altas magnitudes. Conclusões: o peso corporal não se mostrou um bom indicador de muscularidade, de modo que não é recomendado como critério de seleção indireta para melhorar a carcaça de caprinos Anglo-Nubiano. O perímetro de perna e a circunferência torácica podem ser importantes para a construção de índices de seleção em programas de melhoramento de carne caprina.
- Published
- 2020
34. Valoración genética de unidades comportamentales en una ganadería de lidia colombiana
- Author
-
José Reinel Uribe Ceballos, Daniel José Bartolomé Rodríguez, Jaime Eduardo Muñoz-Flores, María Fernanda González-Valencia, and David Calero Quintero
- Subjects
Genetic correlation ,Etología ,Correlación genética ,Ethology ,Soil Science ,Horse ,Biology ,Etograma ,Hereditary traits ,Ethogram ,Heritability ,Valores genéticos ,Heredabilidad ,Animal science ,Head position ,Hum ,Unidades comportamentales ,Breeding values ,Behavior traits ,Agronomy and Crop Science - Abstract
Resumen Se diseñó un etograma para desagregar el comportamiento del ganado de lidia, cuantificar la bravura y consolidar la selección. Se analizaron 933 hembras y 787 machos de la ganadería colombiana “Ernesto González Caicedo” (EGC), encaste Santa Coloma, en Popayán, Cauca, Colombia. Las unidades comportamentales (UC) identificadas fueron fijeza (FIJ), distancia de arrancada (DIS), prontitud (PRO), recargar (RGR), ausencia de dolor (DOL), grado de encelamiento (GEN), recorrido (RDO), humillar (HUM), repetir (REP), tipo de embestida (TEM), fondo (FON), fuerza (FZA) y ausencia de defectos (AUD). La información se analizó con el software DeLidia®, desarrollado para esta investigación. Las UC se ajustaron según el efecto de la edad, consanguinidad, peso, sexo, lugar, tipo de festejo, número de varas, torero y picador. Se estimaron índices de herencia, correlaciones fenotípicas y genéticas y valores de cría de sementales. Los valores resultantes de h2 para la UC FZA y REP fueron de 0.06±0.03 y 0.36±0.026, respectivamente, con un promedio de 0.21±0.05 para todas las UC. Todas las rg fueron positivas a excepción de las involucradas con FZA. El valor positivo más bajo de rg fue de 0.1 para GEN y HUM, mientras el más alto fue de 0.79 para FIJ y RDO. Las tendencias de los VG fueron positivas y diferentes de cero (P
- Published
- 2020
35. Genetic parameters between somatic cell score and production traits for Holstein cattle in Southern Brazil
- Author
-
Gabrieli de Souza Romano, José-Augusto Horst, Luís Fernando Batista Pinto, Victor Breno Pedrosa, and Altair Antônio Valloto
- Subjects
Animal breeding ,herdabilidade ,Restricted maximum likelihood ,Somatic cell ,produção de leite ,calidad de leche ,componentes de varianza ,heritability ,somatic cell score ,Biology ,mastitis ,milk quality ,SF1-1100 ,Genetic correlation ,milk yield ,Animal science ,genetic parameters ,medicine ,componentes de variância ,Selection (genetic algorithm) ,escore de células somáticas ,Holstein ,General Veterinary ,conteo de células somáticas ,producción de leche ,parâmetros genéticos ,modelo multicaracterística ,Heritability ,medicine.disease ,genetic correlation ,heredabilidad ,qualidade do leite ,Animal culture ,multi-trait model ,Mastitis ,raça Holandesa ,selección genetica ,correlação genéticas ,mastite ,seleção genética ,Trait ,holstein ,variance components ,modelo multicaracteristico ,Animal Science and Zoology ,correlación genética ,parametros geneticos - Abstract
Background: Somatic cell score is an important parameter to predict milk quality and health of cows. However, in countries like Brazil, this trait is still not selected on a large scale, and no genetic parameters are reported in the literature. Objective: To estimate the variance components and genetic parameters for somatic cell score, milk yield, fat yield, protein yield, fat percentage, and protein percentage in Holstein cows. Methods: Records from 56,718 animals were used to estimate variance components, heritability, and genetic correlations using a multi-trait animal model by the REML method. Results: The heritability estimates were 0.19 for somatic cell score, 0.22 for milk yield, 0.26 for fat yield, 0.18 for protein yield, 0.61 for fat percentage, and 0.65 for protein percentage. The estimates of genetic correlations among analyzed traits ranged from -0.50 to 0.82. Conclusion: The low heritability observed for somatic cell score indicates that selection for this trait should result in benefits related to animal health and milk quality, but only in the long term. The low correlation between productive traits and somatic cell score indicates that inclusion of somatic cell score in animal breeding programs does not interfere negatively with the genetic selection for milk yield or solids.Keywords: Holstein; genetic correlation; genetic parameters; heritability; mastitis; milk quality; milk yield; multi-trait model; somatic cell score; variance components. Resumen Antecedentes: El conteo de células somáticas es un parámetro importante para predecir la calidad de la leche y la salud de las vacas. Sin embargo, en países como Brasil, esta característica aún no se selecciona a gran escala y no se reportan parámetros genéticos en la literatura. Objetivo: Estimar los componentes de varianza y parámetros genéticos para el conteo de células somáticas, producción de leche, producción de grasa, producción de proteína, porcentaje de grasa y porcentaje de proteína en vacas de la raza Holstein. Métodos: Se usaron registros de 56.718 animales para estimar los componentes de la varianza, heredabilidad y correlaciones genéticas usando un modelo animal multicaracterístico por medio del método REML. Resultados: Las estimaciones de heredabilidad fueron 0,19 para el conteo de células somáticas, 0,22 para la producción de leche, 0,26 para la producción de grasa, 0,18 para producción de proteína, 0,61 para el porcentaje de grasa y 0,65 para el porcentaje de proteína. Las estimaciones de correlación genética entre las características analizadas variaron entre -0,50 a 0,82. Conclusión: La baja heredabilidad encontrada para conteo de células somáticas demostró que la selección para esta característica podría resultar en beneficios para la salud animal y calidad de la leche, pero sólo a largo plazo. La baja correlación genética existente entre las características productivas y el conteo de células somáticas indica que la inclusión del conteo de células somáticas en programas de selección no interfiere negativamente en la selección genética para la producción de leche o sólidos.Palabras clave: calidad de leche; correlación genética; conteo de células somáticas; componentes de varianza; heredabilidad; Holstein; mastitis; modelo multicaracteristico; parametros geneticos; producción de leche; selección genetica. Resumo Antecedentes: O escore de células somáticas é um parâmetro importante para a predição da qualidade do leite, bem como para a saúde das vacas. No entanto, em alguns países como o Brasil, essa característica não é selecionada em larga escala e não há parâmetros genéticos disponíveis na literatura. Objetivo: Estimar os componentes de variância e parâmetros genéticos para o escore de células somáticas, produção de leite, produção de gordura, produção de proteína, porcentagem de gordura e porcentagem de proteína em vacas da raça Holandesa. Métodos: Foi utilizado um total de 56.718 animais para estimar os componentes de variância, herdabilidade e correlações genéticas, considerando-se o modelo animal multicaracterística por meio do método REML. Resultados: As estimativas de herdabilidade foram de 0,19 para o escore de células somáticas, 0,22 para a produção de leite, 0,26 para a produção de gordura, 0,18 para produção de proteína, 0,61 para a porcentagem de gordura e 0,65 para a porcentagem de proteína. As estimativas de correlação genética entre as características analisadas variaram entre -0,50 a 0,82. Conclusão: A baixa herdabilidade encontrada para o escore de células somáticas demonstrou que a seleção para esta característica poderá resultar em benefícios para a saúde animal e qualidade do leite, porém, somente a longo prazo. A baixa correlação genética existente entre as características produtivas e o escore de células somáticas demonstrou que a inclusão do escore de células somáticas em programas de seleção não causa interferência negativa na seleção genética para a produção de leite ou sólidos.Palavras-chave: componentes de variância; correlação genéticas; escore de células somáticas; herdabilidade; mastite; modelo multicaracterística; parâmetros genéticos; produção de leite; qualidade do leite; raça Holandesa; seleção genética.
- Published
- 2020
36. Correlaciones fenotípicas, ambientales y genéticas en berenjena Phenotypic, genotypic and environmental correlations in eggplant
- Author
-
Hermes Araméndiz Tatis, Carlos Enrique Cardona Ayala, and Miguel Mariano Espitia Camacho
- Subjects
Solanum melongena ,solanacea ,calidad de la planta ,rendimiento de fruto ,correlación genética ,solanaceae ,plant quality ,fruit yield ,genetic correlation ,Agriculture - Abstract
En el Centro de Investigaciones Turipaná de la Corporación Colombiana de Investigaciones (Corpoica) (Cereté, Córdoba, Colombia -8° 31' N y 75° 58' O, a 13 m.s.n.m) se estudiaron las correlaciones, ambientales y genéticas entre seis caracteres de 24 cultivares de berenjena (Solanum melongena). Para el efecto se utilizó un diseño de bloques completamente al azar con tres repeticiones y unidades experimentales de 10 m². Los resultados mostraron que las correlaciones fueron de mayor o igual magnitud que las fenotípicas, mientras que las ambientales fueron de escaso valor. El número de frutos y el rendimiento estuvieron genéticamente correlacionados (r = 0.56, P < 0.01), la longitud y la resistencia del fruto mostraron correlación genética negativa (r = -0.68, P < 0.01) y entre el rendimiento y peso de fruto la correlación fue muy baja (r = 0.04). El número de frutos y su peso de frutos se correlacionaron de manera negativa (r =-0.63, P < 0.01). El número de frutos por planta puede ser utilizado como criterio de selección para la obtención de cultivares de berenjena de altos rendimientos.The phenotypic, genotypic and environmental correlations between six characters of 24 cultivars of eggplant (Solanum melongena) were studied in the research centre of Turipaná of Corpoica (Cereté- Córdoba-Colombia -8° 31' N and 75° 58' W, 13 m.a.s.l.). A completely randomized block design was used with three repetitions and experimental units of 10 m2. The analyses showed that genetic correlations were of higher or equal magnitude to the phenotypic correlations, while the environmental ones had low effects on the results. The number of fruits and the yield showed a positive and highly significant (r = 0.56, P < 0.01) genetic correlation. A negative and highly significant (r = -0.68, P < 0.01) genetic correlation was observed between fruit length and fruit strength. No correlation was detected between yield and fruit weight (r = 0.04). Fruit number and fruit weight showed a negative and highly significant genetic correlation (r =-0.63, P < 0.01). It is suggested that the number of fruits per plant could be used as a selection criterium to obtain high yield eggplant cultivars.
- Published
- 2009
37. Expected genetic gain and genotype- environment interaction in Acacia mangium in the northern region of Costa Rica
- Author
-
Benjamín Pavlotzky and Olman Murillo
- Subjects
mejoramiento genético ,ensayos genéticos ,interacción genotipo-ambiente ,correlación genética ,acacia mangium ,costa rica ,Agriculture ,Agriculture (General) ,S1-972 - Abstract
Two Acacia mangium Willd. progeny tests were evaluated, pursuing an increment in the profitability of commercial plantations. The 25 open-pollinated families were established in Los Chiles and San Carlos, northern region of Costa Rica, in year 2006, and evaluated in 2007 and in 2010. Genetic material came from plus tree selections obtained by GENFORES, a costarican tree-improvement and gene-conservation cooperative. In each trial, families were represented by 48 progenies, planted in 4 pairs randomly distributed within each of the 6 blocks. In 2010, DBH, survival rate, commercial number of logs per tree, forking, forking height and log quality in the first 4 logs, were evaluated. Based on these measurements, wood commercial volume per tree and per hectare were estimated. Data was analyzed with SELEGEN software from EMBRAPA, Brasil, in order to determine all genetic parameters of the breeding population. All traits evaluated showed family mean heritability values over 0.46. Genetic gain in commercial volume per hectare was estimated as 55.8%, when selecting as parents the 2 best individuals from the top 12 families, which would correspond to an expected commercial volume.ha -1 , at 4 years age, of 78.93 m 3 .ha -1 (around 20 m 3 .ha -1 .year -1 ). The 2 Colombian provenances were significantly superior in growth to the rest of the evaluated materials. No significant gene-environment interaction was observed between both sites. Genetic correlations among evaluated traits showed that diameter growth rate is expressed early in this tree species, thus could be used in shortening future selections.
- Published
- 2014
38. Genetic parameters of growth traits in Cuban Zebu through the multi-trait animal model and reaction norm model.
- Author
-
Rodríguez, Yusleiby, de León, Raquel Ponce, and Rodríguez, Manuel
- Subjects
- *
ZEBUS , *CATTLE genetics , *CATTLE growth , *GENETIC correlations , *NATURE & nurture , *GENETIC models , *CATTLE - Abstract
A multi-trait animal model (15,904 data) and a reaction norm model (13,068 data) were studied, in order to estimate genetic parameters and environmental awareness of the weight at 18 months (P18) and (TDG) of Cuban Zebu during the performance test for future sires. The animals were born between 1981 and 2012 and were the offspring of 295 parents. Multi-trait animal model allowed to obtain the solutions of fixed effect of from the group of contemporaries, heritabilities and genetic tendencies of P18 and trial daily gain TDG. Later, a reaction norm model of sire type was considered, with the group of contemporaries (herd-year-three-month period of animal birth) as fix effect the effect of random regression of sire (cubic, square and linear Legendre polynomials) through an environmental gradient, expressed as solution of fix effect, so a total of 6 environmental classes were created. Estimated values of heritability, through the animal model, were 0.20 ± 0.02 and 0.28 ± 0.02 for TDG and P18, respectively, with a genetic correlation of 0.94 among them. Using the reaction norm model, the estimates varied from 0.13±0.04 to 0.43±0.08, and the highest corresponded to favorable environments or positive gradients. Correlation values, very close to 1, indicate the non-existence of genotype x environment interaction in most of the cases. However, there may be correlations lower than 0.8 in the most unfavorable environment, which indicates that sires selected in favorable environments may not have the same performance after passing to unfavorable environments. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2015
39. Estimation of genetic and phenotypic parameters of some important economic traits in Khazak native hen in Iran.
- Author
-
Ebrahimzadeh-Allahabad, Ahmad, Mahmodian, Zhila, Pezeshkian, Zahra, and Mollaei, A.
- Abstract
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- Published
- 2015
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40. Genetic parameters for ultrasound-evaluated carcass and body traits in Anglo-Nubian goats
- Author
-
Figueiredo Filho, L.A.S., Sarmento, J.L.R., Campelo, José E. G., Santos, N.P.S., Sena, Luciano Silva, Torres, T.S., Figueiredo Filho, L.A.S., Sarmento, J.L.R., Campelo, José E. G., Santos, N.P.S., Sena, Luciano Silva, and Torres, T.S.
- Abstract
Background: Meat goat breeding programs should prioritize the identification and selection of genetically superior animals for traits related to meat quality and carcass yield in order to increase the value of the final product. Objective: To estimate (co)variance components and genetic parameters for ultrasound-measured carcass traits, body size and body weight in AngloNubian breed goats raised in the Mid-North region of Brazil. Methods: (Co)variance components and genetic parameters were estimated using the single and two-trait animal model analyses via Bayesian inference for loin eye dimensions (area, length, and depth), sternal fat thickness, rump height, chest circumference and depth, leg perimeter, and body weight. Results: Heritability estimates were higher when two-trait analyses were used. This finding implies that it is possible to recover part of the additive genetic variance included in the residual variance due to the correlation between traits. Genetic correlations between carcass and body size traits showed different magnitudes. On the other hand, genetic correlations between the traits related to muscularity showed high magnitudes. Conclusions: Body weight was not a good indicator of muscularity; therefore, it is not recommended as a criterion for indirect selection to improve carcass traits of Anglo-Nubian goats. Leg perimeter and chest circumference may be important to construct selection indexes in meat goat breeding programs., Antecedentes: programas de melhoramento de caprinos de corte devem priorizar a identificação e seleção de animais geneticamente superiores para características relacionadas à qualidade da carne e rendimento de carcaça, para aumentar o valor ao produto final. Objetivo: estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia, características de tamanho e peso corporal em caprinos da raça Anglo-Nubiana criados na região Meio-Norte do Brasil. Métodos: os componentes de (co)variância e parâmetros genéticos foram estimados usando análises uni e bicaracterísticas de um modelo animal via metodologia Bayesiana para área, profundidade e comprimento de olho de lombo, espessura da gordura esternal, altura da garupa, circunferência e profundidade torácica, perímetro da perna e peso corporal. Resultados: as estimativas de herdabilidade obtidas a partir das análises bicaracterísticas foram maiores que as obtidas a partir das análises unicaracterísticas. Esse resultado implica que é possível recuperar parte da variância genética aditiva incluída na variância residual devido à correlação entre as características. As correlações genéticas entre as características de carcaça e as medidas corporais apresentaram magnitudes variáveis. Por outro lado, as correlações genéticas entre as características relacionadas à musculosidade apresentaram altas magnitudes. Conclusões: o peso corporal não se mostrou um bom indicador de muscularidade, de modo que não é recomendado como critério de seleção indireta para melhorar a carcaça de caprinos Anglo-Nubiano. O perímetro de perna e a circunferência torácica podem ser importantes para a construção de índices de seleção em programas de melhoramento de carne caprina., Antecedentes: los programas de mejoramiento de caprinos de carne deben priorizar la identificación y selección de animales genéticamente superiores para características relacionadas con la calidad de la carne y rendimiento de la canal, con el fin de agregar valor al producto final. Objetivo: estimar los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para características de canal obtenidas por ultrasonografía, características de tamaño y peso corporal en caprinos de la raza Anglonubiana, criados en la región medio-norte de Brasil. Métodos: los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos fueron estimados mediante un modelo animal usando análisis uni y bi-carácter vía metodología Bayesiana para las dimensiones del ojo de lomo (área, profundidad y longitud), grosor de la grasa esternal, altura de la grupa, circunferencia y profundidad torácica, perímetro de la pierna y peso corporal. Resultados: las estimativas de heredabilidad obtenidas a partir del análisis bi-carácteristico fueron mayores que las obtenidas a partir del análisis uni-carácteristico. Este supuesto implica que es posible recuperar parte de la variancia genética aditiva incluida en la variancia residual, debido a la correlación entre las características. Las correlaciones genéticas entre las características de canal y las medidas corporales presentaron diferentes magnitudes. Por otro lado, las correlaciones genéticas entre las características relacionadas con musculatura presentaron alta magnitud. Conclusiones: el peso corporal no fue un buen indicador de musculatura; por eso no es recomendado como criterio de selección indirecta para mejorar la canal de caprinos Anglonubianos. El perímetro de la pierna y la circunferencia del pecho pueden ser importantes para la construcción de índices de selección en programas de mejoramiento de carne caprina.
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- 2021
41. Parámetros genéticos y tendencias genéticas para características de comportamiento en ganaderías de lida mexicanas.
- Author
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Domínguez-Viveros, Joel, Rodríguez-Almeida, Felipe Alonso, Núñez-Domínguez, Rafael, Ramírez-Valverde, Rodolfo, and Ruiz-Flores, Agustín
- Subjects
- *
ANIMAL genetics , *HERITABILITY , *BULLFIGHTS , *RANCHES , *ANIMAL herds , *GENETIC correlations - Abstract
The aims of this study were to estimate variance components; calculate heritability (h²) and genetic correlations (rg) predict breeding values (VG) and evaluate their trends over time. Behavior information was analyzed for four Mexican bullfighting ranches: Los Encinos (ENC), Montecristo (MCR), San José (SJO) y Fernando de la Mora (FMO). The analyzed information included was horse tienta (TC), foot tienta (TP), horse bullfight (LC) and foot bullfight (LP). The number of observations ranged from 154 to 2,369, the number of animals in the pedigrees varied from 3,246 to 8,962. Multivariate analyses were conducted using the MTDFREML software. The estimates of h² were from medium to high magnitude, in a range from 0.09±0.05 to 0.47±0.22, and an average of 0.28±0.09. The average of h² by trait was 0.33±0.06 for TC and TP, 0.23±0.14 for LC and 0.27±0.12 for LP. All rg were positive and higher than 0.50, with the exception of TP and LP (0.44±0.38) in FMO, and TC and LP (0.28±0.14) in MCR. The average of the rg within ranches was 0.71±0.14 in MCR, 0.77±0.35 in FMO, 0.78±0.18 in ENC, and 0.85±0.31 in SJO. The trends of the VG were positive and nonzero (P<0.02), with the exception of LP in FMO (P>0.05). The magnitude of the genetic gain per year, as a percentage of the mean, ranged from 0.19% in LC of FMO to 1.5% in TP of ENC. The variability of VG suggests its use in breeding programs to promote greater genetic progress. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2014
42. Path analysis in characteristics of sweet potato clones aiming ethanol yield.
- Author
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Magalhães de Lázari, Thiago, Silveira, Márcio Antônio da, Parente Dourado, Daisy, des Ribeiro de Miranda, Flávia Fernan, and Muraishi, Cid Tacaoca
- Subjects
SWEET potatoes ,PATH analysis (Statistics) ,ETHANOL - Abstract
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- 2014
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43. CONSANGUINIDAD Y ESTIMACIÓN DE PARÁMETROS GENÉTICOS PARA MORFOLOGÍA DEL CABALLO LUSITANO EN MÉXICO.
- Author
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Domínguez-Viveros, J., Rodríguez-Almeida, F. A., and Ortega-Gutiérrez, J. Á.
- Abstract
The Lusitano horse breeders association in Mexico proposed the development of genetic evaluation for morphological traits (VM: headneck (CC), withers (CR), chest (PC), back and loin (DR) and croup (GR)) considered in the selection criteria; however, in earlier studies found high levels of inbreeding (F; 6,6 % average), with constant trend. The objectives were to analyze the effects of F through three indicators (IDF: F of animal (IF); average correlation coefficient (CRP); and, change rate of F (ΔF)) on the average performance, the estimate of heritability (h2) and genetic correlation (rg) for the VM. Including alternately the IDF as covariate of first order were performed four univariate analysis (UNV) for each VM, and four multivariate analyses with the five VM. The covariate solutions of IDF were equal to zero (p>0,05). The h2 with the UNV ranged from 0,08 (DR) to 0,30 (CC), the general average was 0,18. The maximum change with IDF was 0,01. In the MUV, the h2 ranged from 0,11 to 0,35, the general average was 0,198; in the rg, the average without IDF was 0,53, in the interval of 0,01 to 0,97; with IDF the average was 0,59, with estimates above 0,20. The h2 of UNV vs. MUV without IDF were similar. For PC and GR the h2 decreased 0,03 of UNV to MUV with IDF; to contrast of CC, CR y DR with increments of 0,06. Inside MUV, for CC, CR and DR the h2 increased with IDF, with more effect CRP; however, in PC and GR decreased, with more effect of F. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2014
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44. Path analysis under multiple-trait BLUP: application in the study of interrelationships among traits related to cotton fiber length
- Author
-
Francisco José Correia Farias, João Romero do Amaral Santos de Carvalho Rocha, Larissa Pereira Ribeiro Teodoro, Paulo Eduardo Teodoro, Luiz Joaquim Castelo Branco Carvalho, Leonardo Lopes Bhering, Marcos Deon Vilela de Resende, and Rodrigo Silva Alves
- Subjects
Mixed model ,Restricted maximum likelihood ,Gossypium hirsutum ,selección genética ,Plant Science ,Best linear unbiased prediction ,Residual ,Genetic correlation ,Food processing and manufacture ,lcsh:Agriculture ,Statistics ,Path analysis (statistics) ,Selection (genetic algorithm) ,Mathematics ,lcsh:TP368-456 ,lcsh:S ,Agriculture ,genotipo x ambiente ,TP368-456 ,lcsh:Food processing and manufacture ,selección genética ,correlación genética ,Trait ,correlación genética ,Modelo mixto ,Agronomy and Crop Science - Abstract
Multi-trait best linear unbiased prediction (BLUP) is, generally, the most appropriate method to genetic evaluation because it considers the genetic and residual correlations among traits and conduct to higher selection accuracy. Thus, the present study aimed to identify traits correlated to the fiber length via path analysis under multi-trait BLUP for the cotton breeding. To this end, thirty-six elite lines were evaluated in three environments and phenotyped for many traits related to fiber quality and agronomic traits. Variance components were estimated via residual maximum likelihood (REML). The genetic correlation coefficients among traits were obtained through mixed model output, and to graphically express these results a correlation network was built. Subsequently, we performed path analysis considering fiber length as a principal dependent variable. Genetic parameters obtained by multi-trait BLUP model indicate that the phenotypic variance for most traits is mostly composed of residual effects, which reinforces the need for using more accurate statistical methods such as multi-trait BLUP. The results found for genetic correlations and path analysis under multi-trait BLUP reveal the difficulty of selection based on important fiber quality traits, especially fiber length, since most traits show very low cause-and-effect relationship, and other important traits present undesirable cause-and-effect relationship. Highlights Multiple-trait BLUP is the most appropriate method to predict genetic values. This is the first study in cotton to perform path analysis under multiple-trait BLUP. The findings of this study indicate that there is no genotype presenting all desirable traits.
- Published
- 2020
45. Modelación de parametros genéticos mediante regresión aleatoria en búfalos lecheros
- Author
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NAUDIN HURTADO-LUGO, DONICER MONTES, V., JÚNIOR SOUSA, JULY GÓMEZ, ELMER TAPIA, V., and HUMBERTO TONHATI
- Subjects
Ambiente ,modelo animal ,correlación genética ,Agriculture ,Agriculture (General) ,S1-972 ,Animal culture ,SF1-1100 - Abstract
Los modelos de regresión aleatoria (MRA) son utilizados para estudiar las curvas de lactancia individuales como desvíos de la media, mediante el uso de polinomios ordinarios de funciones lineales. Fueron analizados 5.386 registros para La PDC de 1.546 primeras lactancias de búfalas mestizas, hijas de 30 toros y 446 búfalas, entre 1998 y 2005. Los componentes de varianza fueron estimados utilizando el paquete estadístico WOMBAT. El modelo incluyó como aleatorios los efectos genéticos aditivo y de ambiente permanente, como efectos fijos los grupos contemporáneos (mes y año del control) y edad de la búfala al parto (efecto lineal y cuadrático). Las varianzas residuales fueron modeladas utilizando clases de varianza con 4 clases residuales. Los resultados de los criterios de información de Akaike y de Bayesiano de Schwarz, sugirieron que el modelo que considero el 7 orden del polinomio de Legendre para el efecto aditivo y el 6 orden polinomial para el efecto de ambiente permanente fue el mejor. Las heredabilidades variaron desde 0,10 hasta 0,33 a lo largo de la lactancia. En conclusión, los MRA son apropiados para estudiar la curva de lactancia en búfalos lecheros en este rebaño.
- Published
- 2012
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46. Estimadores de parámetros genéticos para características de crecimiento de ganado Charolais mexicano
- Author
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Ángel Ríos Utrera, Guillermo Martínez Velázquez, Shogo Tsuruta, J K. Bertrand, Vicente Eliezer Vega Murillo, and Moisés Montaño Bermúdez
- Subjects
Características de crecimiento ,Charolais mexicano ,Correlación genética ,Heredabilidad directa ,Heredabilidad materna ,Heredabilidad total ,Animal culture ,SF1-1100 ,Veterinary medicine ,SF600-1100 - Abstract
Registros de becerros Charolais, proporcionados por la Charolais Herd Book de México y generados en un periodo de ocho años (1997-2005), se analizaron para estimar parámetros genéticos y fenotípicos para peso al nacer (n=39,821), peso al destete ajustado a 205 días (n=39,556) y ganancia posdestete (n=21,831). Estimadores de componentes de (co)varianza se obtuvieron usando Máxima Verosimilitud Restringida con el algoritmo Esperanza-Maximización y modelos animal para una sola característica. Los efectos del ambiente materno permanente no fueron importantes para peso al nacimiento y ganancia posdestete, por lo que no se incluyeron en el modelo final. Los estimadores de heredabilidad directa fueron 0.22, 0.33 y 0.45 para peso al nacimiento, peso al destete ajustado a 205 días y ganancia posdestete, respectivamente. Los estimadores de heredabilidad para el efecto genético materno fueron 0.16, 0.17 y 0.14. Los estimadores de heredabilidad total y de correlación genética entre efectos directos y maternos fueron 0.12 y -0.65, 0.16 y -0.72, y 0.20 y -0.84 para peso al nacimiento, peso al destete ajustado a 205 días y ganancia posdestete, respectivamente. Para peso al destete ajustado a 205 días, el estimador de la varianza del ambiente materno permanente (28.93 kg2) explicó un 4 % del estimador de la varianza fenotípica (765.43 kg2). La respuesta esperada a la selección para una sola característica de crecimiento de ganado Charolais mexicano, podría ser menor debido a las altas y negativas correlaciones entre efectos genéticos directos y maternos.
- Published
- 2012
47. Parámetros y tendencias genéticas de variables de crecimiento para bovinos Romosinuano en México
- Author
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Ricardo Emmanuel Martínez-Rocha, Rodolfo Ramírez Valverde, Rafael Núñez Domínguez, and García Muñiz, José G.
- Subjects
0106 biological sciences ,Science (General) ,Science ,Social Sciences ,01 natural sciences ,lcsh:Social Sciences ,Q1-390 ,peso al destete ,lcsh:Social sciences (General) ,lcsh:Science ,lcsh:Science (General) ,H1-99 ,0402 animal and dairy science ,04 agricultural and veterinary sciences ,heredabilidad ,040201 dairy & animal science ,Social sciences (General) ,lcsh:H ,bovinos criollos ,lcsh:Q ,lcsh:H1-99 ,correlación genética ,lcsh:Q1-390 ,010606 plant biology & botany - Abstract
Introducción: Los bovinos Romosinuano son originarios de Colombia, pero en México hay ganaderos dedicados a su cría desde hace dos décadas. Su población en México es pequeña y no se encontraron estudios que documenten aspectos elementales para establecer un programa de mejoramiento genético en esta población. El objetivo de este estudio fue estimar los parámetros genéticos de pesos al nacimiento (PN) y al destete ajustado a 240 d (PD), así como documentar las tendencias genéticas para estas dos características en la población Romosinuano de México.Método: La base de datos provino de la “Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Criollo Lechero Tropical, A. C.”. La información utilizada incluyó 895 registros de PN y 517 de PD. El pedigrí incluyó 4,537 animales nacidos entre 1950 y 2016. Los análisis fueron realizados mediante el programa ASReml, preliminarmente usando modelos univariados para identificar los mejores, mediante la prueba de razón de verosimilitudes. El modelo animal bivariado para ambas características incluyó los efectos fijos de grupo contemporáneo (año-hato-época-sexo), la covariable edad de la madre al parto, lineal y cuadrática, y la covariable lineal de la proporción de genes Romosinuano. Los efectos aleatorios fueron los genéticos aditivos directos y la interacción semental por grupo contemporáneo para ambas características, más los genéticos aditivos maternos para PD. Las tendencias genéticas fueron estimadas mediante regresión lineal simple del promedio de los valores genéticos sobre el año de nacimiento de los animales.Resultados: Las estimaciones de heredabilidad para efectos directos fueron 0.19 ± 0.09 y 0.21 ± 0.12, para PN y PD. La heredabilidad materna para PD fue 0.04 ± 0.05. La proporción de la varianza fenotípica explicada por la interacción semental por grupo contemporáneo fueron 0.21 ± 0.05 y 0.11 ± 0.08 para PN y PD. La correlación genética entre PN y PD fue alta y positiva (0.69 ± 0.28). Las tendencias genéticas para PN y PD no fueron diferentes de cero (P > 0.05).Conclusión: Las estimaciones de heredabilidad para PN y PD reflejan variabilidad genética suficiente para implementar un programa de selección en estas características.
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- 2018
48. Índices de selección para producción de maíz forrajero.
- Author
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Carlos Alejandro Tucuch-Cauich, Sergio Alfredo Rodríguez-Herrera, Manuel Humberto Reyes-Valdés, Juan Manuel Pat-Fernández, Fulgencio Martín Tucuch-Cauich, and Hugo Salvador Córdova-Orellana
- Subjects
Correlación genética ,correlación fenotípica ,producción forrajera ,varianza genética y eficiencia relativa. ,Agriculture - Abstract
El objetivo del presente trabajo fue estimar índices de selección de caracteres agronómicos que ayuden a seleccionar los materia les genéticos que se utilizan en la producción de forraje y evaluar la eficiencia relativa de los índices estimados.Se evaluaron 28 cruzas directas (método IV de Griffing),producto de un diseño de cruzas dialélicas, con ocholíneas de maíz de alta calidad proteínica (QPM), en el Rancho Ampuero en Torreón, Coahuila, México, en el año 2003 y 2004. El diseño experimental utilizado fue bloques completos al azar con dos repeticiones, las variables evaluadas fueron:altura de planta (AP), altura de mazorca (AM ), rendimie ntode forraje verde (RFV) y rendimiento de forraje seco (RFS).Se encontró que: a) se obtuvo mayor eficiencia al combinar caracteres correlacionados con el carácter de interés, b) la correlación entre caracteres per se, causó decrementos en laeficiencia del índice, c) la respuesta teórica a la selección,al usar índices, fue mayor que la basada solamente en rendimiento de forraje verde, d) los índices de selección más eficientes fueron los que tomaron en cuenta el rendimiento de forraje verde y aquellas varia bles con más alta correlación genética (AP y AM ), e) el índice seleccionado fue el que incluyó las variables altura de planta, altura de mazorca yrendimiento de forraje verde (I=-20,88 X1 +49,26 X2 -0,11X3) con una eficiencia relativa de 1,5 7%.
- Published
- 2011
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49. Efectos genéticos en el crecimiento predestete de corderos Hampshire
- Author
-
Rodríguez Almeida, Felipe Alonso, Pérez Camacho, C., Domínguez Viveros, Joel, de la Cruz Colín, L., Rodríguez Almeida, Felipe Alonso, Pérez Camacho, C., Domínguez Viveros, Joel, and de la Cruz Colín, L.
- Abstract
Se analizó en corderos Hampshire el peso a 30 días (P30; 1072) y al destete (P75; 1750) de 10 rebaños, para desarrollar dos objetivos: evaluar la expresión de los efectos genéticos en el crecimiento predestete, y analizar las posibles implicaciones en el progreso genético. Los análisis fueron univariados (ANAU) y bivariados (ANAB), a través de modelos mixtos que incluyeron los efectos fijos de grupos contemporáneos y la covariable de edad de la madre; y como aleatorios, los efectos genéticos directos y maternos, la covarianza genética entre ellos, y los efectos maternos de ambiente permanente. Se estimó la heredabilidad directa (h²) y materna (m²), las correlaciones genéticas (rdm), y los valores genéticos (VG). Con correlaciones de rango (CR) en los VG se analizó la jerarquización de la población y de los sementales; además, se analizaron las tendencias genéticas (TG) de los VG. La h² estuvo en el intervalo de 0.14±0.03 a 0.19±0.04; la m² en ANAU fue de 0.08±0.04 y 0.02±0.03, con estimación en ANAB de 0.22±0.05 y 0.13±0.03. La rdm del ANAU fue +1±0.15 en P30 y -1±0.18 en PD, cambiando en el ANAB a -0.46±0.10 y -0.20±0.07, respectivamente. El comportamiento de las TG en el ANAU estuvo asociada a la magnitud y el signo de las rdm; asimismo, las rdm del ANAU implicaron cambios en jerarquización de sementales, lo cual se vio reflejado en las TG y las CR.
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- 2019
50. Parámetros genéticos de las características andrológicas en la especie bovina.
- Author
-
Silva, M. R., Pedrosa, V. B., Silva, J. B. C., Herrera, L. G. G., Eler, J. P., and Albuquerque, L. G.
- Subjects
ANIMAL genetics ,ANDROLOGY ,BOS ,HERITABILITY ,GENETIC correlations ,FERTILITY ,CATTLE herding ,PHYSIOLOGY ,CATTLE - Abstract
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- 2012
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