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L’Ifremer coordonne, sur l’ensemble du littoral métropolitain, la mise en œuvre des réseaux d’observation et de surveillance de la mer côtière. Ce bulletin contient une synthèse et une analyse des données collectées par l’ensemble des réseaux pour le département du Morbihan. Des représentations graphiques homogènes, assorties de commentaires, donnent des indications sur les niveaux et les tendances des paramètres mesurés.

Ce projet, organisé en trois actions, avait pour objectif de mieux évaluer les risques d’eaux colorées vertes se produisant sur le secteur côtier situé au large de la Loire et de la Vilaine, en termes (i) de fréquence de ces épisodes, (ii) d’abondance et (iii) de localisation des zones à risque. Action 1 : Amélioration du recensement des eaux vertes à L. chlorophorum Action 2 : Optimisation de l’estimation des abondances de L. chlorophorum Action 3 : Identification des zones à risque au large de la Loire et de la Vilaine.

Activités d’observation, de surveillance de la qualité des eaux littorales du Morbihan, Pays de la Loire et Nord Vendée et résultats des projets de recherche 2019

Activités d’observation, de surveillance de la qualité des eaux littorales du Morbihan, Pays de Loire et Nord Vendée et résultats des projets de recherche 2018

Since 2014 in France, in Charente maritime and Vendée, farmed and stocks of blue mussels experienced strong mortality events. In this context, the « MORBLEU » research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. Here, the work is to study biotic factors in mussels environment, looking for describe diversity and evolution of microbial communities (water column) before, during and after mortality events using NGS technology (metabarcoding) for environmental DNA analysis. We present, sampling strategy used from 2015 to 2018, Material & Methods and some preliminary results., Dans le cadre d’une étude associée aux épisodes de mortalité des moules bleues en France, visant à décrire et comprendre les facteurs qui peuvent favoriser ces mortalités, un panel de paramètres biotiques et abiotiques ont été suivis sur différents sites entre 2015 et 2018. Ce projet a été cofinancé par Ifremer et la DPMA (étude MORBLEU, MORtalité des moules BLEUes). Parmi les facteurs biotiques évalués, une approche basée sur l’ADN environnemental de la colonne d’eau a permis de décrire dans l’espace et dans le temps l’évolution de la dynamique et de la diversité des communautés microbiennes planctoniques, procaryotes et eucaryotes (NGS, metarbarcoding). Nous détaillons la stratégie d’échantillonnage utilisée, les matériels et méthodes mis en œuvre au cours du projet, du prélèvement au séquençage ADNe et quelques résultats préliminaires.

Le réseau national Mytilobs est implanté dans les principales régions mytilicoles du littoral atlantique : Normandie, Bretagne Nord, Bretagne Sud, Pays de Loire et Poitou-Charentes. Les sites d’Agon (Ouest Cotentin), du Vivier (baie du Mont Saint-Michel), de Pont Mahé (baie de Vilaine), de l’Aiguillon (pertuis Breton), d’Yves (pertuis d’Antioche) représentent l'élevage sur bouchot du Nord au Sud. Le site Filière (pertuis Breton) représente l’élevage sur corde, en pleine eau. La mise à l’eau des cheptels sur l’ensemble des sites du réseau, en septembre 2013, s’est faite à partir d’un même lot de moules calibrées (23,97 +/- 0,7mm), captées sur corde dans le pertuis Breton. Les prélèvements de la campagne 2014 (septembre 2013-décembre 2014) sont trimestriels. La biométrie et la mortalité sont effectuées à chaque sortie. Cette campagne 2014 a été marquée par des événements climatiques remarquables avec un 3ème rang d’indices NAO+ cumulés depuis 150 ans pour la période automne 2013 - hiver 2014. L’hiver 2014 est également l’hiver le plus excédentaire en précipitations depuis 1954, marqué également par de nombreuses périodes de tempêtes et coups de vent (Météo France). Ces conditions ont favorisé des dessalures, des températures de l’eau élevées et des turbidités importantes pendant l’hiver 2014, à l’échelle de la façade Atlantique - Manche Ouest. Des mortalités massives sont apparues dans le pertuis Breton sur le site Filière. Les hypothèses relatives à l’émergence de ces mortalités se concentrent sur ce point de départ qui représente plus de 4000 tonnes de moules en élevage et où la mortalité a détruit 100% du cheptel. Alors que la baisse de salinité hivernale (25) n’est pas un facteur déclenchant de mortalité sur ce site, une rivière proche, la Sèvre, semble avoir joué le rôle de barrière dynamique au début de la diffusion des mortalités. Les températures supérieures à 10°C en janvier (pendant 20 jours) ont pu favoriser la maturation et la pontes de moules, particulièrement sur le site Filières. Ces observations, en lien avec les conditions climatiques difficiles évoquées ci dessus, conduisent à émettre l’hypothèse d’une fragilité des moules autour de la période de maturation, facilitant d’éventuelles intrusions bactériennes (affaiblissement hémocytaire, MOREST, 2007 cas de l’huître Crassostrea gigas). La diminution de l'intensité des mortalités, entre mars et juin, l'observation d'un captage régulier dans les deux pertuis (source Creaa), le constat de l'absence de mortalités des naissains en élevage jusqu'en décembre 2014 et l’identification d’une bactérie pathogène de type Vibrio splendidus (Travers, 2014) confortent cette hypothèse. Aucun parasite (Martelia), ni virus n’ont été identifiés. Par ailleurs, les pertes importantes de poids sec de chair en hiver, et les croissances en longueur réduites, relèguent l’indice de Walne et Mann sur les bouchots de l'Aiguillon et Yves à des valeurs de 78 et 72, parmi les plus faibles enregistrées dans les pertuis Charentais (Remoula 2000-2010). Contrairement aux sites océaniques du Vivier et d’Agon, ces indices révèlent probablement une "souffrance physiologique" plus importante sur ces sites durant l’hiver 2014. Apparues mi-mars, dans le Nord du pertuis Breton les mortalités ont diffusé vers le Sud où elles persistaient encore dans le pertuis d’Antioche en juin. L’importance des mortalités diminue au fur et à mesure que l’on s’écarte du foyer d’origine Filière du pertuis Breton et que l’on s’éloigne de la période de maturation (mars-juin). Le gradient de mortalité s’étale du Nord : Filière (98%), au Sud : Yves (50%), Boyard (20%). Les mortalités dans les pertuis Charentais sont estimées à 7000 à 9000 tonnes. D’autres mortalités importantes ont eu lieu sur le site d’Agon ; 50% au mois décembre. Cette mortalité, régulière dans le temps a pour origine les bigorneaux perceurs Nucella lapillus. Pour la campagne 2014, le réseau Mytilobs a joué son rôle de sentinelle active. Il a complété et renforcé l’expertise environnementale sur les mortalités massives de moules, engagée en 2014 (Bechemin 2014, Travers 2014). Pour 2015, il doit s’activer comme interface efficace, s’associer et accompagner les programmes de recherche qui se développent pour comprendre ce phénomène de mortalités massives de moules dans les pertuis Charentais et au-delà sur le littoral atlantique.

La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012, 2013). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais s’avère beaucoup moins marquée. En outre, à la faveur du lent réchauffement des eaux, le captage peut désormais se pratiquer de plus en plus vers le nord. Ainsi, la baie de Bourgneuf, mais aussi la rade de Brest sont devenues, depuis quelques années, des secteurs où un nombre croissant d’ostréiculteurs pratiquent avec succès le captage, mais avec, là aussi, des irrégularités dans le recrutement qu’il convient de comprendre. Enfin, depuis la crise des mortalités de 2008, il se développe aussi sur l’étang de Thau une volonté de pratiquer le captage. Afin de mieux comprendre les facteurs de variations du captage, l’Ifremer a mis en place, à la demande du Comité National de la Conchyliculture, un réseau national de suivi de la reproduction : le Réseau VELYGER. Créé en 2008 sur fonds européens et financé désormais par la Direction des Pêches Maritimes et de l’Aquaculture, ce réseau apporte, chaque année, sur les écosystèmes cités précédemment, une série d’indicateurs biologiques (maturation, fécondité, date de ponte, abondance et survie larvaire, intensité du recrutement, survie du naissain) dont l’analyse croisée avec des indicateurs hydrologiques et climatiques permet progressivement de mieux appréhender les causes de variabilité du recrutement de l’huître creuse en France, modèle biologique et espèce clé de la conchyliculture française. Ce rapport présente donc les résultats 2014 de ce réseau d’observation et fait appel, pour la partie hydro-climatique, à des observations acquises par d’autres réseaux régionaux et nationaux. Il détaille toutes les caractéristiques par secteur du cycle de reproduction de l’huitre creuse : maturation et fécondité des adultes, période de ponte, abondance et survie des larves, intensité du captage et mortalités précoces. Il fournit ensuite une interprétation et une synthèse des résultats 2014 par secteur et à la lueur des résultats des années antérieures. Ainsi, pour l’année 2014, on retiendra les faits majeurs suivants : • Sur le plan hydro-climatique, cette année se caractérise par un hiver et un printemps particulièrement doux et humides, avec des épisodes de crues marquées sur la façade atlantique suivis d’un été ensoleillé et relativement chaud (mais sans épisode caniculaire). On observe des dessalures importantes en fin d’hiver, puis un retour dans les normales au printemps. Le phytoplancton est relativement abondant de la rade de Brest aux pertuis Charentais et plutôt déficitaire dans le bassin d’Arcachon et la lagune de Thau. • En termes de biologie, ces conditions hydro-climatiques se sont traduites, chez les populations d’huîtres adultes, par des indices de condition généralement élevés, avec toujours l’existence d’un gradient Nord-Sud observé chaque année, corrélativement à la concentration en phytoplancton. En outre, l’excédent thermique enregistré depuis l’hiver et tout au long du printemps s’est traduit par une ponte dés la mi juillet sur l’ensemble des écosystèmes de la côte atlantique et encore plus précocement dans la lagune de Thau. • Grâce à des températures très favorables en juillet et encore favorables en août, la plupart des cohortes larvaires observées ont eu une survie normale à bonne (e.g. 0.2 à 1.4 %), ce qui s’est généralement traduit par un captage modéré à excellent voire exceptionnel dans certains cas bien précis : la baie de Bourgneuf et le bassin d’Arcachon. Par contre, en rade de Brest, le captage est en deçà des valeurs auxquelles on aurait pu s’attendre, et la question de l’effet de certaines algues toxiques présentes en abondance au cours de cette saison de reproduction est posée. C’est aussi le cas dans la lagune de Thau, mais sur cet écosystème sans marée les aspects zootechniques liés à la gestion des collecteurs (localisation par rapport aux tables ostréicoles et technique d’exondation) constituent le facteur déterminant des performances du captage. • En conséquence, l’année 2014, se caractérise par un captage très variable géographiquement : « faible à modéré » en rade de Brest et dans la lagune de Thau (1 à 30 naissains/coupelle), modéré dans les pertuis Charentais (~200 naissains/coupelle) et excellent à exceptionnel dans le bassin d’Arcachon et en baie de Bourgneuf (de 200 à 2000 naissains/coupelle).

La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012, 2013). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais s’avère beaucoup moins marquée. En outre, à la faveur du lent réchauffement des eaux, le captage peut désormais se pratiquer de plus en plus vers le nord. Ainsi, la baie de Bourgneuf, mais aussi la rade de Brest sont devenues, depuis quelques années, des secteurs où un nombre croissant d’ostréiculteurs pratiquent avec succès le captage, mais avec, là aussi, des irrégularités dans le recrutement qu’il convient de comprendre. Enfin, depuis la crise des mortalités de 2008, il se développe aussi sur l’étang de Thau une volonté de pratiquer le captage. Afin de mieux comprendre les facteurs de variations du captage, l’Ifremer a mis en place, à la demande du Comité National de la Conchyliculture, un réseau national de suivi de la reproduction : le Réseau VELYGER. Créé en 2008 sur fonds européens et financé désormais par la Direction des Pêches Maritimes et de l’Aquaculture, ce réseau apporte, chaque année, sur les écosystèmes cités précédemment, une série d’indicateurs biologiques (maturation, fécondité, date de ponte, abondance et survie larvaire, intensité du recrutement, survie du naissain) dont l’analyse croisée avec des indicateurs hydrologiques et climatiques permet progressivement de mieux appréhender les causes de variabilité du recrutement de l’huître creuse en France, modèle biologique et espèce clé de la conchyliculture française. Ce rapport présente donc les résultats 2013 de ce réseau d’observation et fait appel, pour la partie hydro-climatique, à des observations acquises par d’autres réseaux régionaux et nationaux. Il détaille toutes les caractéristiques par secteur du cycle de reproduction de l’huitre creuse : maturation et fécondité des adultes, période de ponte, abondance et survie des larves, intensité du captage et mortalités précoces. Il fournit ensuite une interprétation et une synthèse des résultats 2013 par secteur et à la lueur des résultats des années antérieures. Ainsi, pour l’année 2013, on retiendra les faits majeurs suivants : • L’année 2013 a été très contrastée. Un printemps particulièrement frais et généralement humide (mois de juin inclus) a fait suite à un hiver tardif alors que l’été a été ensoleillé et plutôt chaud. Les concentrations en phytoplancton ont été dans les normes avec toujours l’existence d’un gradient Nord-Sud : elles sont plutôt élevées en rade de Brest, baie de Bourgneuf et bassin de Marennes Oléron et plutôt faible dans le bassin d’Arcachon et l’étang de Thau. En outre, tout au long du printemps et jusqu’au mois de juillet, les températures de l’eau ont été toujours inférieures aux normales (excepté dans l’étang de Thau). • Ces conditions hydro-climatiques ont imprimé un gradient dans la maturation et la fécondité des huitres adultes avec un indice de condition très élevé en rade de Brest, en baie de Bourgneuf, et dans le bassin de Marennes Oléron et plutôt faible dans le bassin d’Arcachon et l’étang de Thau. En outre, le déficit thermique marqué jusqu’en juillet s’est traduit par une ponte très tardive sur l’ensemble des écosystèmes de la côte atlantique : par exemple, elle est survenue au 25 août en baie de Bourgneuf, ce qui constitue une valeur record. Malgré tout, quelques pontes partielles et asynchrones ont été observées sur certains écosystèmes en juillet. • Grâce à des températures très favorables en juillet et favorables en août, la plupart des cohortes larvaires présentes à cette période (rade de Brest, bassin d’Arcachon et étang de Thau) ont eu une survie normale à bonne (e.g. 0.2 à plus de 1 %), ce qui s’est traduit par un captage bon à excellent, avec une forte variabilité dans l’étang de Thau (cf paragraphe ci-dessous). Par contre, pour la baie de Bourgneuf et les pertuis Charentais, l’arrivée trop tardive des larves à la fin août dans une eau fraiche (< 20°C) n’a pas permis une survie favorable (autour de 0.01 %) ce qui s’est traduit par un captage tout juste modéré, faible voir nul selon les secteurs. • En conséquence, l’année 2013, se caractérise par un captage très variable géographiquement : « bon voire excellent » en rade de Brest (de 138 à 245 naissains/coupelle) et dans le bassin d’Arcachon (de 177 à 429 naissains/coupelle), modéré dans le bassin de Marennes-Oléron (de 25 à 52 naissains/coupelle) et faible en baie de Bourgneuf (< 5 naissains/coupelle). Ce rapport montre aussi que l’étang de Thau joue un rôle d’exception. Malgré une ponte d’intensité normale, des abondances de larves élevées et une bonne survie des cohortes, le captage 2013 y est très variable ce qui positionne l’étang de Thau en dehors du modèle de fonctionnement admis pour le cycle de reproduction de l’huître creuse sur la façade atlantique. Il semble que, sur ce site, la métamorphose constitue un verrou biologique qui peut être levé en utilisant des pratiques zootechniques adaptées à ce site particulier. Cette optimisation des pratiques zootechniques fait l’objet d’un projet régional : le projet PRONAMED.

This study (“Risco”), implicating both industry, socio-economic experts and biologists, was funded by the Regional Council of Brittany, for 3 years (2010-2012), to investigate about the causes of oysters (Crassostrea gigas) mortalities in the bay of Quiberon (South Brittany, France). The protocol including both a sonar and video visualization of the bottom, and a monthly survey of 15 experimental oyster structures, allowed to assess the risk due to predation. A clear spatial distribution of the predatory effect was evidenced, with starfish (Asterias rubens and Marthasterias glacialis) predominating in the North-East sector, and boring snails (Ocenebra erinacea and Pterophora inornata) in the South-Center area.. The main mortalities from these predators (3/4 from starfish and ¼ from oyster drills) occur in spring and summer. Mortalities by sea breams (Sparus aurata) were observed punctually. Management measures against predators appear essential to control this risk. However, another environmental factor, namely hypoxia, might be the main cause of oyster mortalities in 2006., L’étude « Risco » s’attache aux causes possibles de mortalités massives d’huîtres creuses, de toutes classes d’âge, enregistrées par les concessionnaires de baie de Quiberon (France, 56), à partir de 2006. Le protocole engagé en 2010, avec son volet expérimental fondé sur le suivi mensuel de 15 lots d’huîtres et son volet d’imagerie in situ par sonar et vidéo, permet d’éclairer en particulier le risque lié aux prédateurs. Une spatialisation très marquée de ce risque est mise en évidence, avec une zone à l’ouest relativement épargnée, une zone à l’est très affectée par les étoiles de mer (A. rubens, M. glacialis) et une zone intermédiaire à forte prédation de bigorneaux perceurs (O. erinacea, P. inornata). Entre ces deux groupes, la prédation est réalisée pour les ¾ par les étoiles de mer et pour ¼ par les bigorneaux. Les pertes maximales ont lieu au printemps (recrudescence d’étoiles de mer) et en été (efficacité maximale de prédation). La prédation par dorades, devenue très préoccupante ces dernières années, n’a pas pu être estimée. L’analyse met aussi en évidence l’importance des mesures d’entretien des parcs pour limiter l’incidence des prédateurs. Pour autant, la prédation n’est sans doute pas le facteur principal des mortalités de 2006, une piste environnementale basée sur le risque d’hypoxie étant explorée par ailleurs.

This study (“Risco”), implicating both industry, socio-economic experts and biologists, was funded by the Regional Council of Brittany, for 3 years (2010-2013), to investigate upon the origin of oysters (Crassostrea gigas) mortalities in the bay of Quiberon (South Brittany, France). Specific mortalities of adult oysters were recorded in this bay in 2006, whereas mortalities of one year old spat were observed since in 2008 in this bay as at a national scale. The experimental protocol in 2010, including a monthly survey of oyster batches at 15 experimental stations, allowed to assess the risk for one-year oysters, due to viral disease. A clear spatial distribution of this risk was evidenced, with a western area spared from contamination and mortality, and a central and north-east sector strongly affected. The virus analysis clearly demonstrate the responsibility of the OsHV-1 virus in the mortalities. The oysters on the bottom with a lower growth appear less sensitive to the viral disease than the surelevated ones. In order to interpret this spatial distribution, an epidemiological model has been tested : it is based on emission of virus from the stock of spat in surrounding farming areas, dispersion by the hydrodynamic conditions, and inactivation of the virus by solar radiation. The resulting simulations suggest that the contamination would be endogenous to the bay (from contaminated stocks of spat seeded nearby). A decrease of densities for rearing spat, as well as the seeding of non contaminated spat may be recommended., L’étude « Risco », labellisée Pôle Mer et financée par la Région Bretagne, mobilise à la fois des socio-économistes, des biologistes et des professionnels. Elle vise à comprendre et gérer les facteurs de mortalités massives d’huîtres creuses (Crassostrea gigas) enregistrées par les concessionnaires de baie de Quiberon (France, 56), à partir de 2006 sur les huîtres adultes et 2008 sur le naissain. Le protocole engagé en 2010, avec un volet expérimental basé sur le suivi mensuel de lots d’huîtres en 15 stations et des analyses pathologiques, a permis d’éclairer notamment le risque épizootique sur le naissain. Une spatialisation très marquée de ce risque a été mise en évidence, avec une zone à l’ouest relativement épargnée et une zone au centre et à l’est très affectée. Les analyses virales mettent clairement en évidence la responsabilité du virus OsHV-1 dans ces mortalités. Les huîtres élevées au sol, moins poussantes, seraient aussi moins sensibles à la mortalité virale que les huîtres élevées en surélévation. L’existence d’une zone quasi-indemne de contamination et de mortalité à cette échelle est inédite parmi les secteurs ostréicoles français, depuis 2008. Pour interpréter cette distribution spatiale de la contamination et des mortalités, un modèle épidémiologique a été testé : il s’appuie sur une émission de virus à partir des stocks de naissain estimés en 2010 (estran et eau profonde), une dispersion par les courants, et une inactivation du virus en fonction du rayonnement solaire. Avec le taux d’abattement viral retenu, les simulations suggèrent que la contamination serait majoritairement endogène à la baie (à partir de semis de naissain en place, contaminés). Les recommandations qui en découlent sont notamment d’introduire en baie du naissain non contaminé et de diminuer les densités de naissain.

The project “Risco”, supported by the “Pôle Mer” and funded by the Regional Council of Brittany, deals with specific risks of mortality of oysters, Crassostrea gigas, cultivated on the bottom, in a subtidal bay of South Brittany : the bay of Quiberon (56, France). Massive mortalities of oysters were reported in summer 2006 in this bay, exclusively located in the deep muddy area with a positive gradient eastward. A validated biogeochemical model was applied in order to simulate the dissolved oxygen over 2000-2006 : it revealed several episodes of hypoxia, more or less intense according to years, but with the same spatial distribution. This approach proved 2006 to be the most hypoxic year since 2000. The hypoxia was due to a rare conjunction of 3 factors : (a) a local upwelling generated by north-west winds, during a neap tide; (b) an abnormal high temperature of coastal waters; (c) probably an intense phytoplankton bloom in summertime. Due to the stratification induced, oxygen consumption near the bottom exceeded its renewal. The hydrodynamism of Mor Bras, at a larger scale, excludes any import of hypoxic water from the nearby “Baie de Vilaine”, whatever the wind or tide regime. The simulated hypoxia area fitted fairly well to the 2006 mortalities. In 2010, experimental oysters deployed at 15 stations and monitored monthly, exhibited also a lower growth rate in the same area, in spite of higher chlorophyll concentration. The application of a Dynamic Energy Budget (DEB) model to growth data confirmed the responsibility of hypoxia in abnormally slow growth rates. So hypoxia may be considered as a stressful factor limiting growth prior to mortalities. It may be concluded from our study that hydro-climatic and trophic conditions have the capacity to deplete oxygen in bottom coastal zones with possible consequences on biotopes and cultivated species: farm yields may be severely affected. This study will allow to manage more closely the commercial risk of shellfish farming at spatial and temporal scale., L’étude « Risco », labellisée par le Pôle Mer et financée par la région Bretagne, a révélé un facteur insoupçonné d’altération des résultats d’élevage ostréicole en baie de Quiberon (France, 56): l’hypoxie. Elle a ainsi fourni une explication convaincante des mortalités anormales observées sur les huîtres adultes l’été 2006. Le modèle biogéochimique appliqué sur la période 2000-2006 a mis en évidence plusieurs épisodes d’hypoxie d’intensité variable selon les années, mais très géolocalisés. Parmi eux, celui de 2006 s’est avéré exceptionnel, tant par son emprise spatiale que par son intensité. L’hypoxie de 2006 résulte de la conjonction rare de plusieurs phénomènes : (a) un upwelling local généré par des vents de nord-ouest en période de morte-eau ; (b) des eaux côtières anormalement chaudes ; (c) probablement un fort bloom estival de phytoplancton. Du fait de la stratification induite, la consommation d’oxygène au niveau du fond excède alors son renouvellement. Le secteur profond et envasé, à l’est de la zone concédée, est particulièrement affecté en raison de la géomorphologie de la baie de Quiberon. L’analyse du fonctionnement hydrodynamique à l’échelle du Mor Bras montre par ailleurs qu’il n’y a pas d’importation d’eau hypoxique depuis la baie de Vilaine, ceci quel que soit le régime de vent et de marée. La diminution de la teneur en oxygène dissous apparaît responsable de ralentissements de croissance des huîtres même en année peu hypoxique (comme 2010). C’est probablement le facteur explicatif des déficits de croissance marqués chez les huîtres au sol (par rapport aux huîtres en surélévation). En situation d’hypoxie extrême (année 2006), les huîtres des deux classes d’âge subissent des mortalités. Les huîtres d’un an paraissent plus affectées par le déficit d’oxygène, tant en croissance qu’en mortalité (étude 2010). Cette étude permet d’évaluer le risque d’hypoxie (sa probabilité d’occurrence, sa répartition géographique) et d’orienter les mesures préventives applicables en conchyliculture telles que la répartition des stocks en élevage ou l’entretien des parcs. L’incidence sur les peuplements naturels et les ressources exploitées, peut également être mieux prise en compte, à l’échelle du Mor Bras. Plus généralement, une meilleure connaissance des effets de l’hypoxie fournit des arguments en faveur du contrôle de l’eutrophisation (limitation des apports en nutriments par les bassins versants…).

La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le Bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais s’avère beaucoup moins marquée. En outre, à la faveur du lent réchauffement des eaux, le captage peut désormais se pratiquer de plus en plus vers le nord. Ainsi, la Baie de Bourgneuf, mais aussi la Rade de Brest sont devenues, depuis quelques années, des secteurs où un nombre croissant d’ostréiculteurs pratiquent avec succès le captage, mais avec, là aussi, des irrégularités dans le recrutement qu’il convient de comprendre. Enfin, depuis la crise des mortalités de 2008, il se développe aussi sur l’Etang de Thau une volonté de pratiquer le captage. Afin de mieux comprendre les facteurs de variations du captage, l’Ifremer a mis en place, à la demande du Comité National de la Conchyliculture, un réseau national de suivi de la reproduction : le Réseau Velyger. Créé en 2008 sur fonds européens et financé désormais par la Direction des Pêches Maritimes et de l’Aquaculture, ce réseau apporte, chaque année, sur les écosystèmes cités précédemment, une série d’indicateurs biologiques (maturation, fécondité, date de ponte, abondance et survie larvaire, intensité du recrutement, survie du naissain) dont l’analyse croisée avec des indicateurs hydrologiques et climatiques permet progressivement de mieux appréhender les causes de variabilité du recrutement de l’huître creuse en France, modèle biologique et espèce clé de la conchyliculture française. Ce rapport présente donc les résultats 2012 de ce réseau d’observation et fait appel, pour la partie hydro-climatique, à des observations acquises par d’autres réseaux. Il détaille toutes les caractéristiques par secteur du cycle de reproduction de l’huitre creuse : maturation des adultes, période de ponte, abondance et survie des larves, intensité du captage et mortalités précoces. Il fournit ensuite une interprétation et une synthèse des résultats 2012 par secteur et à la lueur des résultats des années antérieures. Ainsi, pour l’année 2012, on retiendra les faits majeurs suivants : • Après une année 2011 particulièrement sèche, l’année 2012 s’avère plutôt humide à partir du printemps avec un gradient Nord-Sud marqué. Ce gradient se retrouve dans les concentrations phytoplanctoniques : elles sont élevées en Rade de Brest et Baie de Bourgneuf, normales à faibles du Bassin de Marennes Oléron à l’Etang de Thau. En outre, jusqu’au mois de juillet, les températures de l’air et de l’eau sont tout justes dans les normes voire déficitaires pour les sites les plus au nord. • Ces conditions hydro-climatiques ont imprimé un gradient dans la maturation et la fécondité des huitres adultes avec un indice de condition très élevé en Rade de Brest, élevé en Baie de Bourgneuf, normal à faible du Bassin de Marennes Oléron à l’Etang de Thau. En outre, le manque de chaleur jusqu’en juillet s’est traduit par une ponte plutôt tardive sur l’ensemble des écosystèmes de la côte atlantique, à l’exception de la ponte en Baie de Bourgneuf qui a été très précoce compte tenu des conditions. A contrario, le Bassin d’Arcachon enregistre la ponte la plus tardive jamais observée sur ce secteur (au-delà du 15 août). A ce titre, le mécanisme du déclenchement de la ponte mériterait une attention particulière dans les années à venir. • Cela dit, grâce à un mois d’août favorable sur le plan thermique, les cohortes larvaires présentes à cette période ont eu une survie normale à bonne (e.g. 0.3 à 0.8 %), ce qui s’est traduit par un captage modéré à bon sur l’ensemble des secteurs de la façade atlantique. Il convient cependant de noter que la ponte trop précoce en Baie de Bourgneuf, qui s’est déroulée dans des eaux fraîches, n’a pas permis une bonne évolution de la cohorte larvaire (survie de 0.03 %) et le captage reste, sur ce secteur, faible à modéré en 2012. • En conséquence, l’année 2012, très différente de l’année 2011, se caractérise par un captage qualifié de « bon » dans le Bassin d’Arcachon (~230 naissains/coupelle), modéré dans le Bassin de Marennes-Oléron (~ 180 naissains/coupelle) et en Rade de Brest (~ 100 naissains/coupelle), modéré à faible en Baie de Bourgneuf (15 naissains/coupelle) et faible à nul dans l’étang de Thau (~ 5 naissains/coupelle). Ce rapport montre aussi que l’étang de Thau joue un rôle d’exception. Malgré une ponte d’intensité normale, des abondances de larves élevées et une bonne survie des cohortes, le captage 2012 y est très faible ce qui positionne l’étang de Thau en dehors du modèle de fonctionnement admis pour le cycle de reproduction de l’huître creuse sur la façade atlantique. Il semble que, sur ce site, la métamorphose constitue un verrou biologique qu’il convient d’étudier.

L’étude « Risco », labellisée par le Pôle Mer et financée par la région Bretagne, a révélé un facteurinsoupçonné d’altération des résultats d’élevage ostréicole en baie de Quiberon (France, 56): l’hypoxie.Elle a ainsi fourni une explication convaincante des mortalités anormales observées sur les huîtresadultes l’été 2006. Le modèle biogéochimique appliqué sur la période 2000-2006 a mis en évidenceplusieurs épisodes d’hypoxie d’intensité variable selon les années, mais très géolocalisés. Parmi eux,celui de 2006 s’est avéré exceptionnel, tant par son emprise spatiale que par son intensité. L’hypoxie de2006 résulte de la conjonction rare de plusieurs phénomènes : (a) un upwelling local généré par desvents de nord-ouest en période de morte-eau ; (b) des eaux côtières anormalement chaudes ; (c)probablement un fort bloom estival de phytoplancton. Du fait de la stratification induite, laconsommation d’oxygène au niveau du fond excède alors son renouvellement. Le secteur profond etenvasé, à l’est de la zone concédée, est particulièrement affecté en raison de la géomorphologie de labaie de Quiberon. L’analyse du fonctionnement hydrodynamique à l’échelle du Mor Bras montre parailleurs qu’il n’y a pas d’importation d’eau hypoxique depuis la baie de Vilaine, ceci quel que soit lerégime de vent et de marée. La diminution de la teneur en oxygène dissous apparaît responsable deralentissements de croissance des huîtres même en année peu hypoxique (comme 2010). C’estprobablement le facteur explicatif des déficits de croissance marqués chez les huîtres au sol (par rapportaux huîtres en surélévation). En situation d’hypoxie extrême (année 2006), les huîtres des deux classesd’âge subissent des mortalités. Les huîtres d’un an paraissent plus affectées par le déficit d’oxygène,tant en croissance qu’en mortalité (étude 2010). Cette étude permet d’évaluer le risque d’hypoxie (saprobabilité d’occurrence, sa répartition géographique) et d’orienter les mesures préventives applicablesen conchyliculture telles que la répartition des stocks en élevage ou l’entretien des parcs. L’incidencesur les peuplements naturels et les ressources exploitées, peut également être mieux prise en compte, àl’échelle du Mor Bras. Plus généralement, une meilleure connaissance des effets de l’hypoxie fournitdes arguments en faveur du contrôle de l’eutrophisation (limitation des apports en nutriments par lesbassins versants…).

This report summarizes a list of husbandry experiments conducted between 2004 and 2007 so as to reduce the summer mortalities of the oyster Crassostrea gigas by farming practices. The Japanese technique so‐called “hardening”, based on nursing the young oysters (less than 1 year‐old) in intertidal areas with high air exposure, is tested and adapted. Significant improvements of survival rates (e.g. 60% survival instead of 40% survival rate) have been obtained by transferring the spat only a few month (between march and june‐july) on “high” inter‐tidal farming plots (up to 40% of mean air exposure time). In such conditions, growth is transiently reduced, but a compensatory growth seems to happen when oysters are transferred back on low concessions. Another means of reducing growth, by increasing the density of oysters per bag, was not successful in terms of survival. The physiological effect induced by “hardening” oysters remain to be cleared and the technique tested in other sites before large scale application. Its benefit needs also to be tested in the new context of epidemic disease striking oyster cultures in France, since 2008., Ce rapport récapitule les essais menés entre 2004 et 2007 pour tenter de réduire les mortalités estivales de naissain de Crassostrea gigas, par les pratiques zootechniques et notamment celle qualifiée d’endurcissement. Il s’agit de prégrossir les huîtres dans des conditions de forte exondation (exondation par coefficient de marée de 30‐40), avant de les remettre sur parc normal d’élevage au début ou en cours d’été. Plusieurs années de suite, sur le même site en amont de la rivière d’Auray (Bretagne Sud, France), des améliorations de survie très significatives ont été ainsi obtenues. Les meilleurs résultats correspondent à un endurcissement de durée limitée (3‐4 mois, entre mars et juin‐juillet), pour lequel le ralentissement de croissance semble pouvoir être compensé une fois les huîtres ramenées au niveau bas d’élevage. Une tentative d’obtenir le même gain en bridant la croissance par une augmentation de densité intra‐poche s’est révélée moins concluante. Ces essais méritent d’être testés ailleurs et dans les conditions de mortalités plus violentes observées depuis 2008.

L’ostréiculture constitue la principale activité aquacole française. Cette activité de quasi-monoculture, basé sur l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, repose en grande partie sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain). Or, depuis une dizaine d'années, dans les bassins d'Arcachon et de Marennes-Oléron, principaux centres de captage français pour l’huître creuse, la collecte du naissain ou captage devient encore plus variable qu’auparavant: à des années de captage presque nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) succèdent des années où il est surabondant (par exemple les années 2003 ou 2006). En parallèle, et probablement en raison du progressif réchauffement des eaux, la reproduction de l’huître creuse s’étend de plus en plus vers le nord de la France. Cette mutation écologique a permis aux ostréiculteurs des régions allant de la Baie de Bourgneuf jusqu’à la Rade de Brest de se lancer à leur tour dans l’activité du captage, mais avec là aussi, des irrégularités dans le recrutement qu’il convient de comprendre. Dans ce contexte et à la demande du CNC, l’Ifremer a donc initié, depuis mars 2008, un projet d’envergure nationale sur cette problématique: le projet Velyger (Observer, Analyser et Gérer la variabilité de la reproduction de l’huître creuse sur les côtes françaises). Or, il est connu que comme pour la plupart des poissons et invertébrés marins, le recrutement naturel de l’huître creuse (et donc l’activité de captage qui en dépend) est sous la dépendance des conditions hydro-climatiques. Pour une meilleure visibilité, ce projet a été construit selon les 3 actions complémentaires suivantes : Observer - Analyser - Informer. (1) L’action A ‘Observer’ a consisté à mettre en place, dès 2008, un dispositif complet d’observation de la reproduction de C. gigas sur les différents sites de captage de la côte française, qui sont soit des sites traditionnels (Arcachon et Marennes Oléron) soit des sites émergents pour le recrutement de l’espèce et l’activité de captage (Rade de Brest et Baie de Bourgneuf). Ainsi, sur 4 sites et chaque année, les 4 indicateurs clés suivants ont été suivis: Evolution de la maturation des populations adultes d’huîtres creuses - Abondance et développement des larves - Intensité du recrutement à l’automne - Caractéristiques hydroclimatiques associées à chaque site. (2) L’action B ‘Analyser’, basée sur les résultats du réseau d’observation et sur les données antérieures, a visé à identifier la chaîne de facteurs à l’origine du succès ou de l’échec du recrutement et à proposer un schéma quantitatif expliquant les performances du recrutement pour chaque site et années étudiés. Cette action repose principalement sur une thèse (Bernard, 2011) qui a démarré dès le début du projet en décembre 2007. (3) Enfin, l’action C ‘Informer’ a constitué la pierre angulaire du projet en fournissant, chaque été depuis le démarrage du projet en 2008 et via un site Internet spécialement dédié, un premier niveau d’information aux professionnels, sous formes de bulletins téléchargeables et de pages dynamiques, sur le cycle de reproduction de l’huître dans leurs bassins, pour chaque site atelier du projet : http://www.ifremer.fr/velyger. Ce rapport de synthèse présente donc (1) les résultats du réseau d’observation, (2) une série d’analyses permettant de mettre en évidence, pour chaque année et chaque secteur, la chaîne des facteurs en cause dans la performance du recrutement observé et (3) une vue générale du site Internet du projet. Enfin, une conclusion fournit un schéma de synthèse explicatif des performances du captage associé à des recommandations de gestion pour chaque secteur. En outre, il apparaît à l’issue de cette synthèse, que la partie « réseau d’observation » de ce projet constitue un outil d’avenir totalement opérationnel et particulièrement utile aux professionnels désireux de s’approvisionner en naissain naturel, dans le contexte de la crise ostréicole actuelle.

(subtidal on-bottom rearings), has been the year of the gestation for the RISCO-QB project (Risks in shellfish farming, in baie de Quiberon). Discussions with various potential partners have resulted in the project drafting with 3 main objectives : - estimation of the trophic capacity of the bay and adjustment of the rearing biomass, - impact of sediment nearness upon on-bottom technique and adjustment of the rearing practices, - appraisal of the impact of these 2 factors (trophic capacity and sediment nearness) on the budget of the farming companies and their consequences in the management of the mortality risk. Concurrently with the project writing, pre-studies, mainly methodological, have been conducted in the bay since 2007 in order to investigate the specific methodologies required by the subtidal on-bottom rearing technique and to provide basic data to the several-years study (2008-2012) of the RISCO-QB project : - Sampling of sediment (Nov. 2007) for granulometric and chemical (organic matter) analysis, - Physical and phytoplanctonical monitoring, in situ (probes), - Potential use of spatail remote detection for the seawater monitoring, - Comparative monitoring of mortality and growth of on-bottom and off-bottom oysters, - Investigations for a specific technique of stock sampling for the subtidal culture, - Setting-up of the project co-management., L'année 2007, faisant suite à de fortes mortalités d'huîtres creuses (Crassostrea gigas) en baie de Quiberon (élevage au sol en eau profonde), a été l'année de gestation du projet RISCO-QB (Risques Conchylicoles en baie de Quiberon). Des discussions avec les différents partenaires potentiels ont eu lieu tout au long de l'année 2007 pour aboutir à la rédaction quasi-définitive du projet début 2008 qui vise 3 objectifs principaux : - l'estimation de la capacité trophique de la baie et l'adaptation de la biomasse en élevage, - l'impact du sédiment sur l'élevage au sol et l'adaptation des pratiques d'élevage, - l'évaluation de l'impact de ces 2 facteurs (trophique et sédimentaire) sur les entreprises ostréicoles de la baie et de leur conséquence en matière de gestion des risques de mortalités. Parallèlement à la définition du projet, des pré-études, essentiellement méthodologiques, ont été mises en place en baie de Quiberon dès 2007 permettant de cerner les méthodologies particulières au contexte d'eau profonde et d'approvisionner en données de base l'étude pluriannuelle 2008-2012 du projet RISCO-QB : - Campagne de prélèvement de sédiment (nov 2007) pour analyse granulométrique et chimie de base (matière organique), - Suivi physique et phytoplanctonique du milieu, in situ (sondes), - Apport possible de la télédétection spatiale au suivi du milieu, - Suivi comparé de la mortalité et de la croissance des huîtres, au sol et en surélevé, - Recherche d'une méthode spécifique d'échantillonnage des stocks en élevage subtidal, - Mise en place du co-pilotage du projet.

Dans le cadre du programme de semis de coquilles Saint-Jacques effectués par le Comité Régional des Pêches et des Elevages Marins de Poitou-Charentes (CRPMEM), un suivi a été mis en place en 2005 pour deux semis, un dans chacun des deux pertuis Charentais.

This study presents the main results of oyster growth obtained experimentally in 2002 and 2003, in the farming area of Cancale before the leases reorganization of 2004. According to the REMORA monitoring network from 1990 to 2004, the oyster growth in Cancale bay may be characterized by an average annual weight gain (around 30g per year), a rather weak meat content compared to other regional oyster sites, and an exceptional quality of shell (absence of blisters, few Poly do rd). Spatially, the oyster farming area of Cancale shows rather homogeneous performances of breeding, in spite of the muddy southern area. In addition an experimental trial in 2003 allowed to evaluate favourably the potential of the new oyster area of Saint-Benoît : in these experimental conditions of low density, individual oysters were able to gain 50 g of whole weight per year, instead of 30 g in Cancale bay. The available data on environmental parameters (temperature, salinity, chlorophyl-a) are typical of coastal bays with low terrestrial impact. Turbidity which reflects sedimentary and hydrodynamic conditions is moderate at high tides, but may be extremely high under a low water column, at spring tides., Cette étude récapitule les résultats acquis en matière de croissance des huîtres creuses en baie de Cancale, avant la restructuration conchylicole de 2004, notamment au travers des suivis expérimentaux et professionnels des années 2002 et 2003. L'analyse des résultats du réseau Rémora entre 1990 à 2004 permet de caractériser les performances obtenues en Baie de Cancale, relativement aux autres secteurs ostréicoles : la croissance se situe dans la moyenne (gain annuel de l'ordre de 30g), la mortalité est modérée, les indices de condition souvent inférieurs aux autres bassins bretons, la qualité de coquille exceptionnelle (absence de chambrage, faible indice Polydorà). Spatialement le bassin conchylicole de Cancale montre des performances d'élevage plutôt homogènes, malgré l'envasement important des concessions les plus au sud. Par ailleurs, une première estimation de la croissance des huîtres en 2003 dans le secteur de St Benoit, à permis d'évaluer les potentialités de cette nouvelle zone ostréicole. Les résultats d'essais à petite échelle mettent en évidence des performances d'élevage en nette amélioration par rapport au secteur traditionnel de Cancale, pour tous les paramètres (croissance pondérale, mortalité, indice de chair ...). Le gain de poids enregistré en une saison d'élevage s'est monté à 50 g par huître (au lieu de 30 g), dans les conditions de l'expérimentation (faible densité ambiante). Ces performances d'élevage peuvent s'interpréter par les paramètres environnementaux (réseau REPHY complété lors de ces études) : la température, la salinité, et la chlorophylle-a sont caractéristiques des secteurs côtiers de la Manche peu soumis à influence terrigène. La turbidité, qui traduit les conditions sédimentaires et hydrodynamiques, se révèle modérée à haute mer, mais très élevée sous faible hauteur d'eau.

in order to estimate the carrying capacity of Mont Saint-Michel Bay, the stock (or biomass) of cupped oysters, Crassostrea gigas, cultivated intertidally, in Cancale Bay, has been estimated in october 2002. Aerial photographs, at 2 scales (1/10 000 and 1/2000), provided by the mollusc farmers union, have been used to estimate the cumulative length of surelevaged trestles (« tables ») and the occupation rate by oyster bags. A field survey, between the 7th and 9th of october 2002, has been conducted by Ifremer with the help of « Lycée Maritime de Saint-Malo », on 40 sampled stations : 3 subsample bags per station were examined (counts and weights of different age-class oysters). 309 ha out of 333 leased ha were considered exploited (after elimination of unoccupied concessions). The number of surelevated places par ha was estimated to 4567, occupied at a rate of 77%, which leads to 3500 effective oyster bags per ha. All sizes together, a mean bag contains 245 oysters, and weighs 8.8 kg. The oyster biomass in october would so approximate 9500 tons (more or less 20%). From this stock, about 4700 tons of oysters exceed 50g mean weight. These estimations of oyster stock in october 2002, are rather unprecise, due to the unsufficient quality of photographs and access difficulties to muddy oyster parks. They have been completed by direct inquiry about 10 oyster farmers, in autumn 2003., A titre de contribution à l'estimation de la capacité trophique de la Baie du Mont Saint-Michel, le stock (ou biomasse) d'huîtres creuses Crassostrea gigas, cultivées sur estran en Baie de Cancale, a été estimé en octobre 2002. Des photos aériennes à 2 échelles (1/10 000 et 1/2000 environ), non orthoréférencées, mises à disposition par le syndicat conchylicole de la Baie du Mont Saint-Michel, ont été utilisées pour estimer les longueurs de tables ostréicoles en place et le taux d'occupation de ces tables par des poches. Une campagne de terrain a mobilisé durant 3 jours (7 au 9 octobre 2002) une vingtaine de personnes, agents de l'Ifremer aidés d'élèves et d'enseignants du Lycée Maritime de Saint-Malo. Malgré la difficulté d'accéder à de nombreux parcs envasés, un échantillon de 35 stations tirées aléatoirement au sein du cadastre ostréicole (DDAM 35) a pu être visité, et 3 poches sous-échantillonnées par station, afin d'en déterminer le contenu en nombre et poids d'huîtres de différentes classes d'âge. 309 ha parmi les 333 ha concédés ont été considérés comme exploités (concessions inoccupées exclues). Le nombre d'emplacements de poches par ha a été estimé 4567, avec un taux d'occupation de 77%, ce qui amène à un taux effectif d'occupation de 3500 poches par ha en moyenne. Toutes classes d'âge confondues, une poche moyenne contient 245 huîtres et pèse 8.8 kg. La biomasse présente en octobre serait alors de l'ordre de 9500 tonnes (plus ou moins 20%). La fraction d'huîtres de poids supérieur à 50 g doit avoisiner 4700 tonnes, en grande partie vendables en fin d'année.. Ces estimations du stock en place au mois d'octobre 2002, peu précises en raison des difficultés rencontrées (imprécision des photos et difficultés d'accès aux parcs), ont été complétées d'informations recueillies par enquête en automne 2003 auprès de 10 concessionnaires : elles révèlent en particulier l'existence de ventes estivales supérieures à la plupart des autres secteurs.

Temperature affects undoubtedly the 3 working sites where, systematically, the observation of the first abnormal mortalities coincides with a water temperature of around 19°C. The nature of the processes implied could have a "cumulative" effect, affecting the physiology (this phenomenon has been observed with other marine species) or a "threshold" effect, acting only as a trigger. The question has not been answered yet. The kinetics of the thermic evolution around the mortality period has to be studied in depth in order to understand if this temperature acts more as an "associated factor", during a chronic stress period, or during an acute stress, as suggested by the "on-bottom/off bottom" mortality model of the Marennes Oléron Bay [12]., La température agit sans conteste sur les 3 sites ateliers où, systématiquement, l'observation des premières mortalités à caractère anormal coïncide avec une température des masses d'eau proche des 19°C. La nature des processus impliqués pourrait être de 2 ordres : effet "cumulatif" agissant par exemple sur la physiologie (ce phénomène est connu chez d'autres espèces marines ou effet "seuil" intervenant uniquement comme déclencheur. La réponse n'est pour l'instant pas éludée. La cinétique d'évolution thermique autour de la période de mortalité doit être étudiée dans le détail afin de préciser si cette température intervient plus comme un "facteur associé", au cours de la période de stress chronique, ou au cours du stress aigu, comme cela est suggéré dans l'exemple du modèle de mortalité plat-table du Bassin de Marennes Oléron [12].

This study is the second part of a former report rapport Ifremer DRV/RST/RA/LCB/2002-08 dealing with rearing methods, growth and mortality performances, and problems encountered by the oyster farmers from Quiberon Bay (2800 ha of leases) : the first report relied on a survey achieved in july 200l, about 18 oyster farmers, and 2 diving campaigns (july and october 2001) on 2 years old oyster batches from the same farmers. Il is now completed by a last campaign of diving in october 2002, on 7 parcels out of the 18, still bearing the initial oysters. The analysed enterprises vary in particular by the location and depth of their concession inside the bay, but also by their rearing scheme : a majority favours seedings with 18 month old oysters or more, according to prices and availability of oysters supplies. This part of the study provides in particular a tool of profitability simulation, based on technical (growth, survival) and economical (prices of different oysters categories) hypothesis. Theses references may be used in ecosystem studies or long run monitoring of the area., L'étude fait suite à un premier rapport Ifremer DRV/RST/RA/LCB/2002-08 sur les méthodes d'élevage, les performances de croissance-mortalité et les problèmes rencontrés par les éleveurs d'huîtres creuses de la baie de Quiberon (2800 ha concédés), qui s'appuyait sur une enquête réalisée en juillet 2001 auprès de 18 exploitants, et 2 campagnes de plongée (juillet et octobre 2001) sur des semis d'huîtres de 2 ans des mêmes concessionnaires. Le complément est fourni par une dernière campagne de plongée en octobre 2002, sur les 7 semis parmi les 18 encore en place à cette date. Les entreprises étudiées se différencient par leur outil de production et en particulier l'emplacement de la concession en baie de Quiberon, mais également part le schéma d'élevage : une majorité privilégie les semis d'huîtres de 18 mois ou plus, en adaptant leurs approvisionnements aux disponibilités et prix du moment, mais certains sèment préférentiellement du naissain ou des huîtres de 2 ans. Cette étude fournit en particulier un outil de simulation du schéma d'élevage le plus profitable économiquement, en fonction des performances techniques (survie, croissance) et des prix des différentes classes d'âge. Ces acquis constituent une base de référence pour une analyse du fonctionnement de l'écosystème ou un suivi à plus long terme.

L’implantation récente de Rapana venosa, gastéropode prédateur originaire d’Extrême Orient, en plusieurs points du globe (USA, France, Uruguay, Argentine) et son impact sur les populations de bivalves autochtones justifient un certains nombre de recherches engagées par les pays concernés. Le présent rapport compile les dernières informations scientifiques disponibles sur la biologie de R. venosa. Par ailleurs, l’opportunité d’obtenir des pontes en milieu naturel et en captivité en 2001 a permis de faire des observations sur la maturation des larves. Il apparaît que dans les conditions de températures régnant en Baie de Quiberon en été (18 à 22°C), les larves de Rapana venosa sont capables d’éclore. L’impossibilité, dans cette expérimentation, d’amener ces larves jusqu’à la métamorphose ne permet pas actuellement de préjuger de leur survie éventuelle en milieu naturel. Néanmoins, la réussite des premières phases du processus de reproduction (maturation sexuelle, accouplement, pontes d’oothèques), semble prouver que cette espèce s’est acclimatée aux conditions hydrologiques de la Baie de Quiberon.

This study deals with rearing methods, growth and mortality performances, and problems encountered by the oyster farmers from Quiberon Bay (2800 ha of leases) : it relies on a survey achieved in july 2001, about 18 oyster farmers, and 2 diving campaigns (july and october 2001) on 2 years old oyster batches from the same farmers. The analysed enterprises vary in particular by the location and depth of their concession inside the bay, but also by their rearing scheme : a majority favours seedings with 18 month old oysters or more, according to prices and availability of oysters supplies. The duration until marketable size and mean mortalities seem to have increased since a preceding inquiry in 1986. The main constraint, affecting priorly the south border parks, expoded to the open sea, occurs from starfish (Asterias rubensin peculiar). Benthic red algae are also a nuisance to exploitation and eventually to oysters themselves, when they accumulate in thick layers. The main concern declared by the farmers is mortality rates, both at spat stage and commercial size. Difficulties have emerged from the variability in practices and bottom situations, but references have been acquired that may be used in ecosystem studies or long run monitoring of the area., L'étude porte sur les méthodes d'élevage, les performances de croissance-mortalité et les problèmes rencontrés par les éleveurs d'huîtres creuses de la baie de Quiberon (2800 ha concédés) : elle s'appuie sur une enquête réalisée en juillet 2001 auprès de 18 exploitants, et 2 campagnes de plongée (juillet et octobre 2001) sur des semis d'huîtres de 2 ans des mêmes concessionnaires. Les entreprises étudiées se différencient par leur outil de production et en particulier l'emplacement de la concession en baie de Quiberon, mais également part le schéma d'élevage : une majorité privilégie les semis d'huîtres de 18mois ou plus, en adaptant leurs approvisionnements aux disponibilités et prix du moment. Depuis une première enquête en 1986, la durée d'élevage semble s'être allongée et les mortalités accrues. La contrainte principale, qui affecte en particulier les concessions les plus au large est liée à l'augmentation apparente du nombre d'étoiles de mer (Asterias rubens majoritairement). Les algues benthiques (essentiellement des algues rouges) représentent une gêne à l'exploitation, mais pourraient aussi, là où elles s'accumulent en grande épaisseur, avoir un impact direct sur les huîtres. La première préoccupation des ostréiculteurs reste la mortalité des huîtres creuses en élevage, que ce soit au stade de naissain ou plus encore au stade terminal de l'élevage. Ces acquis demeurent limités par la variabilité tant des pratiques que des situations observées sur le terrain, mais constituent une base de référence pour une analyse du fonctionnement de l'écosystème ou un suivi à plus long terme.

L'apparition de deux nouvelles espèces de gastéropodes prédateurs des bivalves en Baie de Quiberon Ocinebrellus inornatus et Rapana venosa, tous deux originaires d'extrême Orient n'est pas de nature à rassurer les professionnels de ce secteur, déjà confrontés, pour beaucoup d'entre eux, aux bigorneaux perceurs indigènes (Ocenebra erinacea) ou introduits depuis longtemps déjà (Urosalpinx cinera), ainsi qu'aux étoiles de mer. Ces deux nouvelles espèces sont cependant de plus grande taille que les espèces locales, et l'on peut penser que la lutte contre ces indésirables en sera facilitée. Le faible nombre de Rapana venosa capturés depuis 4 ans était également rassurant. Néanmoins la découverte par un professionnel de la Baie de Quiberon, au printemps 2001, d'une ponte sur un cadre de captage d'huîtres plates, en prouvant la capacité de cette espèce à se reproduire localement, tempère notre optimisme.

Mussel samples have been placed in plastic-mesh bags hung on wood poles (« bouchots »), at 4 locations of a mussel culture area in the bay of Vilaine (South Brittany, France). They have been monitored for one year, from February 2000 to February 2001. The recorded growth have been rather fast (plus 1.2 g per month between April and September), and mortalities moderate (between 15% to 25%), with better results in southern stations, further from the estuary. Among the physico-chemical parameters recorded, the most striking were very low salinities (below 10 g/l) recorded for days, after heavy rains. They provoqued a valve closure of mussels (recorded by a « valvometer »). Some physiological indicators being tested (muscle force and hermeticity) seemed to show an annual pattern according to the reproduction cycle. No abnormal result has been recorded, that might suspect an effect of the oil escaped from Erika's wreck (décembre 1999)., Des moules ont été placées en paniers grillagés accrochés à des pieux de bouchots, en 4 stations expérimentales exondantes de la baie de Vilaine (Bretagne sud), et suivies durant 1 an (de février 2000 à février 2001). Les croissances observées ont été bonnes (1,2 g /mois entre avril et septembre) et les mortalités modérées (entre 15% et 25% en 1 an), avec des différences en faveur des stations les plus au large. Parmi les paramètres physico-chimiques enregistrés, les baisses de salinité en période de forte pluviométrie sont très prononcées (moins de 10 g/l pendant plusieurs jours consécutifs). Elles induisent une fermeture valvaire (enregistrée au valvomètre). Des indicateurs d'état physiologique (force musculaire, herméticité) semblent mettre en évidence un cycle annuel parallèle au cycle de reproduction. Aucune anomalie dans les résultats d'élevage, n'a été relevée, qui puisse être mise en relation avec le naufrage de l'Erika (décembre 1999), dont le pétrole a atteint cette zone côtière.

Every year, from March to December, the IFREMER / REMORA network carries out a survey of mortality, growth and quality criteria of two oyster batches ("juveniles" = one-year ciass ; and "adults" = two-years class), distributed among various stations of the main French oyster areas. In Brittany, this network includes 11 points, to which regional points can be added (15 in 2000). With regard to the Breton stations of the network, the year 2000 showed rather low mortality rates, excepted mortality of several oysters when transfered to the sea. Several areas however had higher mortality rates (> 20%) : l'Arguenon, Morlaix, les Abers, Pen-Bé and Le Croisic. 2000 is a year of good growth in South Brittany (72.8 g in December), more average in North Brittany (62.8 g). The best growths were obtained in les Abers, the bay of Quiberon, the Golfe du Morbihan, Pen-Bé and Le Croisic. On the other side, North Brittany had better quality indices than South Brittany, especially the meat index which is used to sort oysters in different quality classes. 4 sites of North Brittany might be classified in the highest class ("spéciales") ; all other Breton stations might be classified in the medium class ("fines"), and no one in the lowest one. At last, a regression of the oyster infestation by the worm Polydora was observed in 2000 on the whole French network, for the first year since the beginning of the network (1993). However, this observation is less marked in Brittany, and several sites have still remained infested since the juvenile stage., Le réseau IFREMER / REMORA suit chaque année, de mars à décembre, la mortalité, la croissance et des critères de qualité de 2 lots d'huîtres ("juvéniles" = 1 an ; et "adultes" = 2 ans) initialement répartis entre différentes stations des principaux secteurs ostréicoles français. En Bretagne, ce réseau comporte 11 stations, auxquelles s'ajoutent diverses stations régionales (15 en 2000). Le suivi des huîtres en 2000 sur l'ensemble des stations bretonnes montre que 2000 est une année d'assez faible mortalité (à l'exception d'une mortalité d'adultes à la mise à l'eau). Quelques secteurs se caractérisent cependant par des taux de mortalité plus élevés (> 20%) : l'Arguenon, Morlaix, les Abers, Pen-Bé et Le Croisic. 2000 est une année de bonne croissance en Bretagne sud (72,8 g en décembre), plus moyenne en Bretagne nord (62,8 g). Les meilleures croissances sont obtenues dans les Abers, à Quiberon-eau-profonde, dans le golfe du Morbihan, à Pen-Bé et au Croisic. Si la Bretagne sud présente une meilleure croissance que la Bretagne nord, celle-ci affiche par contre, comme tous les ans, de meilleurs indices de chair (10,0 en moyenne) qu'en Bretagne sud (8,2). Avec la nouvelle norme CNC, seuls 4 secteurs de Bretagne nord peuvent être classés en "spéciales" (il y en aurait eu 8 en Bretagne nord et 2 en Bretagne sud avec l'ancien seuil). Toutes les autres stations bretonnes se classent en "fines" ; on n'observe aucune "non classée". Enfin, 2000 marque surtout, pour la première fois depuis la création du réseau en 1993, une régression de l'infestation par le ver Polydora sur l'ensemble du réseau national, mais elle est moins marquée en Bretagne, avec des secteurs qui restent infestés dès le stade juvénile.

The network IFREMER/ REMORA watches every year, from February to December, mortality, growth and quality criteria of two oyster batches ("juveniles" = one-year class ; and "adults" = two-years class), distributed among various stations of the main French oyster areas. This network is a tool for trend estimations (geographic and chronological, on the national scale). With regard to the Breton stations of the network, the year 1999 showed a small increase of mortality rates, both in adults alter their transfer on the REMORA stations and in juveniles during the Summer season. this was particularly observed in Morlaix, Aber Benoît and Pen-Bé. Although it was better than 1998, the year 1999 was a poor year for growth, especially in North Brittany (62.5 g in average) and slightly better in South Brittany (69.7 g). Differences between stations were important, with best growths being observed in Penzé and Aber Wrac'h in North Brittany, and in Etel, Quiberon, Pénerf and Le Croisic in South Brittany. Quality indices were also under usual values. At last, the infestation by the worm Polydora has still increased and only Cancale remains poorly infested., Le réseau IFREMER / REMORA suit chaque année, de février à décembre, la mortalité, la croissance et des critères de qualité de 2 lots d'huîtres ("juvéniles" = 1 an ; et "adultes" = 2 ans) qui sont répartis entre différentes stations dans les principaux secteurs ostréicoles français. Ce réseau est un outil d'évaluation des tendances (géographiques et chronologiques, globales à l'échelle nationale). Sur le réseau REMORA Bretagne, on observe en 1999 une remontée des taux de mortalités, à la mise à l'eau pour les adultes, et estivales pour les juvéniles, particulièrement à Morlaix, dans l'Aber Benoit et à Pen-Bé. Bien que meilleure que 1998, l'année 1999 reste encore une année de croissance très moyenne, particulièrement en Bretagne nord (62,5 g de poids moyen au relevage) , un peu meilleure en Bretagne sud (69,7 g). Les différences entre secteurs restent importantes, les plus performants étant cette année Penzé et l'Aber Wrac'h en Bretagne nord, Etel-aval, Quiberon en eau profonde, Pénerf et Le Croisic en Bretagne sud. En ce qui concerne le remplissage des huîtres on observe des indices Afnor un peu au-dessous des moyennes inter-annuelles, avec une moyenne en 1999 de 9,4 en Bretagne nord et de 8,4 en Bretagne sud. Enfin pour ce qui est de l'infestation par le ver Polydora, seul le secteur de Cancale reste peu contaminé tant sur les juvéniles que sur les adultes.

Un concept original de surveillance biologique de la qualité de l'eau a été développé de 1994 à 1998. Les travaux de recherche ont été réalisés en partie dans le cadre de l'étude de l'écosystème de la rade de Brest au sein d'un groupe de travail, sur les indices biologiques, dirigé par l'Université de Bretagne Occidentale (UBO). Une nouvelle génération de valvomètre capable de détecter en temps réel des réactions valvaires anormales et de déclencher un prélèvement automatique d'eau est mis au point. Des enregistrements sont réalisés in-situ sur différents sites pour étudier les réactions valvaires. Des études toxicologiques au laboratoire sont également menées sur la réponse valvaire des bivalves à diverses substances toxiques : métaux et pesticides. Par ailleurs l'influence des efflorescences de dinoflagellés toxiques (Gymnodinium cf nagasakiense, Alexandrium minutum... ) sur l'activité valvaire a été expérimentée in-situ. Une station de surveillance de la qualité de l'eau est mise en place sur la rivière d'Auray où l'on constate régulièrement depuis plusieurs années des mortalités estivales d'huîtres. Les principaux paramètres physico-chimiques du milieu sont enregistrés ainsi que l'activité valvaire des huîtres. Des mesures physiologiques expérimentales (respiration et filtration) sont réalisées en discontinu pour affiner le diagnostic sur l'état et les réactions des animaux. L'acquisition en continu, sur une longue période (plusieurs mois), de réactions comportementales (mouvements valvaires) ou physiologiques (respiration) de mollusques bivalves révèle une densité d'informations considérable dans ces signaux, et des variations inattendues.

Un programme de soutien à la conchyliculture était inscrit au contrat Etat-région 1994-1998, intitulé "amélioration des écloseries et soutien à la conchyliculture bretonne". Ce rapport synthétise les résultats acquis au laboratoire Ifremer DRV/RA-LCB de La Trinité-surMer, qui portent sur la surveillance et l'amélioration génétique : 3 volumes plus détaillés traitant du suivi de la croissance, de la surveillance des maladies et d'un système de surveillance biologique de la qualité de l'eau sont joints. La partie relative à la maîtrise des écloseries est rapportée séparément par le laboratoire de physiologie des mollusques d'Ifremer Brest.

The network IFREMER/REMORA has watched every year, since 1993, from February to December, mortality, growth and quality criteria of two oyster class-size ("juveniles" of the first-year c1ass and "adults" of the second year c1ass), distributed among various stations of the French oyster areas. This has provided a quite standard and simple annual assessment of the rearing results, generally tallied with professional observations. From year to year, data series have been obtained, from which mean values (references), chronological trends or spatial differences can be analysed. Results in Brittany, from 1993 to 1998, show that, in a "normal" year, 30 g oysters grow to 60-80 g at the end of the year, with a mortality rate of 10-15%. Mortality occures mainly in Spring for adults and in Summer for juveniles. Beyond annual variations, mainly connected to climatic and hydrological influences, differences between monitoring stations remain high, which gives data for characterization of sites. On the other hand, unusual mortalities (in 1995), lack of growth (1998) or problem of quality (infestation by the worm Polydora) could be pointed out and quantified. Moreover, unusual results could be observed, which might not be explained only by annual trends or geographical specificities. This gives REMORA network a role of alert and advice in the collective oyster management. Lastly, REMORA data, especially when faced to climatological or hydrological data serials, may support studies in many scopes : description of oyster quality, biological indicators in coastal water monitoring, explanatory models of the oyster-farmaing ecosystems., Le réseau IFREMER IREMORA suit chaque année, depuis 1993, de février à décembre, la mortalité, la croissance et des crit7res de qualité de deux lots d'huîtres (des "juvéniles" de 1ére année et des "adultes" de 2e année) qui sont répartis entre différentes stations des secteurs ostréicoles français. Le réseau REMORA permet ainsi une évaluation annuelle standard et assez simple des rendements d'élevage des différents secteurs ostréicoles. Ses résultats recoupent en général les observations des professionnels. Avec le temps, le réseau acquiert des séries de données qui permettent d'observer des moyennes (références), des tendances chronologiques et des variations spatiales. L'analyse de ces résultats en Bretagne, de 1993 à 1998, fournit quelques références: on peut considérer comme "normaux" des poids au relevage de 60 à 80 g (à partir d'animaux mis en poche à 30 g un an auparavant) et des mortalités annuelles de 10 à 15%. La mortalité survient plutôt au printemps pour les adultes, et plutôt en été pour les juvéniles. Au-delà des variations annuelles, éminemment liées aux conditions hydro-climatiques, les différences entre les stations du réseau restent fortes, ce qui permet de caractériser les secteurs conchylicoles. Par ailleurs, des phénomènes de mortalité anormale (comme en 1995), de déficit de croissance (comme en 1998) ou de qualité (infestation croissante par le ver Polydora) ont pu être mis en évidence et quantifiés. On observe aussi des dérives inexpliquées par les seules tendances annuelles ou les particularités géographiques. Tout ceci confère au réseau REMORA un rôle d'alerte et d'aide à la décision dans la gestion des bassins conchylicoles. Enfin, les données REMORA, particulièrement dans leur confrontation avec celles d'autres réseaux de surveillance hydrologiques et météorologiques, servent d'appui à des études dans de nombreux domaines: description de la qualité des huîtres, indicateurs biologiques de la surveillance du milieu littoral, modèles explicatifs du fonctionnement des écosystèmes conchylicoles, etc.