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Presentazione biblioteca digitale Byterfly in occasione della cerimonia di premiazione dei vincitori delle Olimpiadi Italiane di Economia e Finanza, organizzate dal Ministero della Pubblica Istruzione.

Can a repository answer to the five laws of Library Science, proposed by S. R. Ranganathan in 1931? This report presents an overview of "Byterfly" repository model, including the adopted metadata, the used software, and the policies.

Micro(mi)RNAs play crucial roles in plant developmental processes, as well as in defence responses to biotic and abiotic stresses, through post-transcriptional control of several biological pathway intermediates. In the last years, many works on small RNAs (sRNAs) in grapevine (Vitis spp.) were published. Nevertheless, there is no uniformity in the classification of the miRNAs identified: hundreds of putative novel miRNAs were indicated in different ways, and often the same miRNA was named differently in different works. In order to reorganise the high quantity of available data, we produced 'miRVIT', the first database of all novel grapevine miRNA candidates characterised so far, and still not deposited in miRBase. To this aim, each miRNA accession published was renamed, repositioned in the last version of the grapevine genome and compared with all the novel and conserved miRNAs detected in grapevine. Overall, 901 sequences referred to as novel miRNAs, re-named using a 'vvi_miC' code, were found. Starting from the criteria published for plant miRNA annotation, we considered as novel miRNAs only the 20-22 nt long sRNAs. Of the 621 20-22 nt long novel miRNAs present in miRVIT, miRNA* sequences were identified for only 150 accessions, and 45 of these were found in at least two different works, e.g. in at least two different sRNA libraries originating from different genotypes or tissues. Hypothetically, only 5% of the novel miRNAs previously identified in grapevine satisfied the stringent requirements and could be really considered as novel miRNA candidates. miRVIT were then applied in V. vinifera plants infected by Flavescence dorée phytoplasma. The application of this database in a biological context confirmed the effectiveness of the followed approach for pinpointing complex interactions among miRNAs and related target genes. vvi_miC64 and vvi_miC137 appear to be bona fide miRNAs, spread among different genotypes, potentially regulated by diverse environmental conditions and likely playing important biological functions. miRVIT database is available at http://mirvit.ipsp.cnr.it.

ABB project (Famine and Feast, Fame e Abbondanza) has been committed by Fondazione CRT. This technical report analyzes the strategies adopted and the main open-source software used. Ircres-CNR has deployed the software and server platforms of the repository, in a virtualized and redundant infrastructure, it also take care of the design, development and management of the web portal (front-end) for the presentation, research and consulting data of the digitalized items (lyrics, lyrics text, interviews, books, poems).

Scientists often see the potential offered by Open Research Data, but most are still unready to engage in data archive and curation. One of the main issues that hinders data sharing is related to the lack of incentive mechanisms, both in terms of dedicated budgets and in terms of ready-to-use technical support tools to store, manage and make accessible research data. This situation is detrimental for the scientific community as well as for enterprises and citizens that are supposed to exploit the economic impact of new findings and benefit from the results of publicly-funded research projects, respectively. The project "V2P2 repository" aims at developing a technical solution to ensure a trustworthy e-infrastructure for permanent integrity and re-use of agricultural research data. The authors provide a step-by-step guide to the implementation of an open source repository and briefly describe its architecture, pointing out the main characteristics. Furthermore, the poster describes future developments and approaches to improve the interoperability of the repository and promote data sharing amongst scientists.

The Generic Genome Browser (GBrowse) is a simple but highly confgurable web-based genome browser. GBrowse consists in a combination of database, interactive web pages and a rich set of utilities for manipulating and displaying annotations on genomes. The Gbrowse platform has been largely used as visualization tool for most of the model organisms. This tutorial shows how to configure a GBrowse genome browser installation to display the mitochondrial genome annotation of the Arbuscular Mycorrhizal Fungus Gigaspora margarita BEG34.

Il CNR-Ceris è coinvolto in un progetto di digitalizzazione promosso da BESS (Biblioteca elettronica di Scienze economiche e sociali del Piemonte, gruppo di cooperazione composto da 18 biblioteche Piemontesi). Obiettivo del progetto denominato DigiBESS è la costituzione di un repository di pubblicazioni relative all'economia locale sia delle biblioteche aderenti al gruppo sia di partner esterni. Il CNR-Ceris si occupa del processo di post-digitalizzazione, preservazione e diffusione. In DigiBESS sono presenti attualmente 3.175 "oggetti digitali", volumi e riviste, corrispondenti a poco meno di 500.000 pagine. Uno dei punti chiave del progetto è l'apertura OAI-PMH dei dati contenuti che ne permette la diffusione nei meta-repository nazionali e internazionali come Cultura Italia, Pleiadi e Europeana. Per le collezioni di riviste digitalizzate, abbiamo previsto, per dare un ulteriore canale di accesso all'informazione, l'inserimento in @free di ACNP. In pochi passaggi è stato possibile indicare in ACNP che le riviste erano disponibili liberamente su digiBESS. Il programma gestionale di ACNP consente la cattura e la copia delle schede catalografiche con alcuni campi già precompilati (Titolo, Anno di Fine, Lingua, Paese e classificazioni), da completare indicando il periodo posseduto e reso disponibile liberamente e il link alla risorsa. Si tratta di ricercare il titolo da gestire (acnp, temp o cattura da ISSN) e scegliere l'icona @free. L'aggiunta del legame con la rivista cartacea fa in modo che le notizie (cartaceo e online free) siano collegate. Si può poi collegare l'accesso libero al proprio catalogo mediante l'icona CE. Le riviste inserite da digiBESS in @free di ACNP sono: L'Illustrato Fiat, Lancia, Bollettino Tecnico Fiat Grandi Motori, Cronache Economiche, L'indice dei libri del mese, Persone & Imprese, Sisifo, Lettera da Tecnocity. Il Poster intende stimolare le biblioteche all'inserimento di riviste digitalizzate nel catalogo evidenziandone i semplici passaggi e sottolineando come, grazie alla alta visibilità che ha ACNP in ambito nazionale, questo si traduca nell'aumento della reperibilità di queste riviste, in molti casi difficilmente disponibili nelle biblioteche.

Relazione scentifica finale del progetto "V2P2 Repository" relativo al contributo MIUR L.6/2000 per la diffusione della cultura scientifica.

Una biblioteca online attraverso la quale leggere, sfogliare, scaricare oltre mezzo milione di pagine che racchiudono la storia del pensiero socio-economico del Piemonte. Il tutto in Open Access e mediante l'utilizzo di software open source. E' questo - DigiBESS, l'archivio digitale della Biblioteca elettronica di scienze sociali ed economiche del Piemonte, gruppo di cooperazione di 18 biblioteche - il prodotto finale a disposizione di cittadini e studiosi di tutto il mondo messo a punto grazie al lavoro dell'Ufficio It del Ceris-CNR attraverso l'utilizzo di tecnologie open source. Il progetto è sostenuto dalla Compagnia di San Paolo di Torino.

Anna Perin and Giancarlo Birello will present on the digibess project, what it is (main architecture, two server solution), how it uses Islandora for presentation, how Islandora was customized for the project (repository models, collection form, custom query and more).

CNR IVV and CNR IPP Institutes have been dealing with NGS DATA (Next-gen sequencing) for years, but, until 2012, no CNR-based high-performance server was available. Powerful multi-core servers, clusters and virtual cloud-based machines represent are essential to address the computational demands of NGS. CNR CERIS Institute built up a server for such bio-applications and the joint effort amongst, IVV, IPP and CERIS put the basis for a new bioinformatics facility in the CNR Turin Research Area.

The Ceris-CNR project of digital preservation infrastructure has been committed by Bess (Social Science Electronic Library of Piemonte) for years 2011-2012 sponsored by Compagnia di San Paolo of Turin. Ceris-CNR role is to handle all the post-scan of the digitalization, for this purpose it has deployed the software and server platforms of the repository and also the web portal for the presentation, research and consulting. This report is a guide of step by step followed to build the digital archive infrastructure.

Il documento fornisce le raccomandazioni tecniche per i partecipanti alla Federazione IDEM (Identity Management per l'accesso federato, di seguito "Federazione") del Consortium GARR, ed ha ha come obiettivo la regolamentazione di tutti quegli aspetti tecnici relativi all'interazione fra i partecipanti, ovvero fra IdP e SP. Non è un manuale di supporto all'installazione del software. Nel documento sono presentate le modalità generali di configurazione dei Servizi che i partecipanti devono rispettare per ottenere l'interoperabilità fra gli aderenti alla Federazione. Le raccomandazioni sono fornite in maniera da essere applicabili a prescindere dal tipo di implementazione del protocollo SAML utilizzata, pur tenendo conto che il supporto a framework diversi da Shibboleth è attualmente limitato.