Search

Your search keyword '"Bilhere, Eric"' showing total 9 results
Start Over Author "Bilhere, Eric"
9 results on '"Bilhere, Eric"'

1. Oenococcus oeni genome plasticity is associated with fitness

Author

Bon, Elisabeth, Delaherche, Arnaud, Bilhere, Eric, Daruvar, Antoine De, Lonvaud-Funel, Aline, and Marrec, Claire Le

Subjects
Bacterial genetics -- Analysis, Nucleotide sequence -- Analysis, Gene expression -- Analysis, Genetic recombination -- Analysis, Polymerase chain reaction -- Usage, Biological sciences
Abstract

A substractive hybridization (SH) technique was used to perform comparative genome analyses to identify genetic differences between two Oenococcus oeni isolates with different tolerances for the wine environment. The findings revealed great genetic diversity among the various strains of Oenococcus oeni strains and highlighted the role of insertion/deletion (indel) events in creating diversity.

Published
2009

3. A plasmid contributing to wine adaptation and technological properties of Oenococcus oeni strains

Author

Favier, Marion, Bilhere, Eric, Lonvaud-Funel, Aline, Renouf, Vincent, Moine, Virginie, Lucas, Patrick, Œnologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Victor Segalen - Bordeaux 2, Oenologie (UMRO), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB), Laboratoire de Biotechnologie et Microbiologie Appliquée (LBMA), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, plasmid, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, wine adaptation, technological properties, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, oenococcus oeni
Abstract

International audience

Published
2011

4. Étude de la diversité génétique intraspécifique chez la bactérie lactique Œnococcus œni

Author

Bilhere, Eric, ProdInra, Migration, Oenologie (UMRO), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB), Université de Bordeaux Ségalen (Bordeaux 2), and Aline Lonvaud-Funel

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, OENOCOCCUS OENI, [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SDE]Environmental Sciences, ANALYSE BIOINFORMATIQUE, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, these, [SDV.IDA] Life Sciences [q-bio]/Food engineering
Abstract

The lactic acid bacterium Œnococcus œni plays a key role in winemaking. Since it can survive to acidic pHs and to high concentrations of alcohol, it quickly becomes the predominant species which performs the malolactic fermentation. However, there is a great natural diversity of strains which differ in terms of growth rate, fermentation efficiency or production of aromatic compounds. To better understand the origins of these phenotypic variations, we have studied several aspects of the intraspecific genetic diversity of Œ. œni. First, we have analyzed the population structure of Œ. œni strains using a dual approach involving multilocus sequencing and pulsed-field gel electrophoresis. This work revealed a species particularly well conserved in terms of sequences, but which shows a significant genotypic diversity due to frequent recombination events. In addition, we have detected two sub-populations distinguishable by their allelic repertories and their profiles of macrodigestion. Second, using suppressive subtractive hybridization, we have established a catalog of genes specific to certain strains of Œ. œni. The characterization of one of them, the mobile dpsA gene, revealed that it is involved in the response to oxidative stress and promotes bacterial survival in wine. Third, we have characterized a 18 Kb plasmid isolated from a commercial Œ. œni strain. This is a theta replicating and low copy number plasmid. Analysis of its sequence has revealed strong homologies with plasmids of other lactic acid bacteria frequently found in wine., La bactérie lactique Œnococcus œni joue un rôle essentiel lors de la vinification. Grâce à son aptitude à survivre à des pHs acides et des concentrations élevées en alcool, elle devient rapidement l'espèce majoritaire qui assure presque seule la fermentation malolactique. Toutefois, il existe naturellement une grande diversité de souches qui diffèrent par leur vitesse de croissance, leur efficacité fermentaire ou encore leur production d'arômes. Afin de mieux comprendre l'origine de ces variations phénotypiques, nous avons étudié plusieurs aspects de la diversité génétique intraspécifique d'Œ. œni. Premièrement, nous avons analysé la structure de population des souches d'Œ. œni en réalisant un double typage par séquençage multilocus et électrophorèse en champ pulsé. Ce travail révèle une espèce particulièrement conservée en termes de séquences, mais qui présente néanmoins une importante diversité génotypique en raison d'évènements de recombinaison fréquents. D'autre part, nous avons mis en évidence deux sous-populations de souches distinctes par leurs répertoires alléliques et leurs profils de digestion. Deuxièmement, grâce à une approche par hybridation soustractive suppressive nous avons dressé un catalogue d'une centaine de gènes spécifiques de certaines souches d'Œ. œni. L'un d'entre eux, le gène dpsA, intervient d'ailleurs dans la réponse au stress oxydatif et favorise la survie bactérienne dans le vin. Troisièmement, nous avons caractérisé un plasmide de 18 Kb isolé chez une souche commerciale d'Œ. Œni. ll s'agit d'un plasmide de type thêta à faible nombre de copies. L'analyse de sa séquence révèle de fortes homologies avec des plasmides d'autres bactéries lactiques retrouvées dans le vin.

Published
2009

5. La diversité des bactéries lactiques du vin, cas particulier d'une espèce: Oenococcus oeni

Author

Bilhere, Eric, Lucas, Patrick, Bon, Elisabeth, Le Hénaff-Le Marrec, Claire, Dols-Lafargue, Marguerite, De Revel, Gilles, De Daruvar, Antoine, Lonvaud-Funel, Aline, Laboratoire de Biotechnologie et Microbiologie Appliquée (LBMA), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Modèles et algorithmes pour la Bioinformatique et la Visualisation d'informations, (MABIOVIS), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Bureau des Ressources Génétiques (BRG). FRA., and Bon, Elisabeth

Subjects
[SDV.BIBS] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
Abstract

National audience

Published
2008

6. Characterization of an acquired-dps-containing gene island in the lactic acid bacterium Oenococcus oeni

Author

Athane, Axel, Bilhere, Eric, Bon, Elisabeth, Lucas, Patrick, Morel, Guillaume, Lonvaud-Funel, Aline, Le Hénaff-Le Marrec, Claire, Bon, Elisabeth, Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Laboratoire de Biotechnologie et Microbiologie Appliquée (LBMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Modèles et algorithmes pour la Bioinformatique et la Visualisation d'informations, (MABIOVIS), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Unité sous contrat de biochimie et technologie des aliments, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-ISTAB, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2

Subjects
[SDV.BIBS] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
Abstract

International audience; Aims: To identify novel actors responsible for the marked adaptation of the Oenococcus oeni species to its environment. Methods and Results: Genomic surveillance of the available genome sequences from O. oeni indicated the presence of a small ORF, encoding a protein named DpsA. The cloned gene complemented the dps) mutant of Escherichia coli and conferred resistance to hydrogen peroxide, wine, and metals. The dpsA gene was flanked by IS-related elements. The entire region was characterized by an anomalously high GC content compared to those reported for oenococcal genomes. The dpsA gene was present in 15 of the 38 tested isolates. Positive strains originated from different geographical areas and sources. No change in tolerance to wine or to oxidative stress was observed between O. oeni strains harbouring dpsA and those not harbouring this gene. Conclusions: Some O. oeni have acquired a functional homologue to the dps gene from E. coli as part of a mobile element. Significance and Impact of the Study: DpsA probably increases the bacterial fitness in response to environmental challenges. However, the physiological condition under which it adds a selective advantage to O. oeni during wine-making remains to be found.

Published
2008

7. Characterization of a mobile dpsA gene from the lactic acid bacterium Oenocococcus oeni

Author

Athane, Axel, Bilhere, Eric, Bon, Elisabeth, Lucas, Patrick, Lonvaud-Funel, Aline, Le Marrec, Claire, Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Laboratoire de Biotechnologie et Microbiologie Appliquée (LBMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Modèles et algorithmes pour la Bioinformatique et la Visualisation d'informations, (MABIOVIS), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (1253)., Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, and Bon, Elisabeth

Subjects
[SDV.BIBS] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
Abstract

National audience

Published
2007

9. Antitumor activity of gammadelta T cells reactive against cytomegalovirus-infected cells in a mouse xenograft tumor model.

Author

Devaud C, Bilhere E, Loizon S, Pitard V, Behr C, Moreau JF, Dechanet-Merville J, and Capone M

Subjects
Animals, Caco-2 Cells, Chemokines immunology, Colonic Neoplasms immunology, Colonic Neoplasms virology, Cytomegalovirus Infections immunology, HT29 Cells, Humans, Mice, Receptors, CCR3 biosynthesis, Receptors, CXCR3 biosynthesis, Skin Neoplasms immunology, Skin Neoplasms virology, Xenograft Model Antitumor Assays, Colonic Neoplasms therapy, Cytomegalovirus immunology, Immunotherapy, Adoptive methods, Receptors, Antigen, T-Cell, gamma-delta immunology, Skin Neoplasms therapy, T-Lymphocytes immunology
Abstract

gammadelta T cells recognize stress-induced autoantigens and contribute to immunity against infections and cancer. Our previous study revealed that Vdelta2-negative ((neg)) gammadelta T lymphocytes isolated from transplant recipients infected by cytomegalovirus (CMV) killed both CMV-infected cells and HT29 colon cancer cells in vitro. To investigate the antitumor effects of Vdelta2(neg) clones in vivo, we generated hypodermal HT29 tumors in immunodeficient mice. Concomitant injections of Vdelta2(neg)clones, in contrast to Vdelta2(+) cells, prevented the development of HT29 tumors. Vdelta2(neg) clones expressed chemokine C-C motif receptor 3 (CCR3) and migrated in vitro in response to chemokines secreted by HT29 cells, among which were the CCR3 ligands macrophage inflammatory protein-1delta and monocyte chemoattractant protein-4. More importantly, a systemic i.p. treatment with Vdelta2(neg) clones delayed the growth of HT29 s.c. tumors. The effect of in vivo gammadelta T-cell passive immunotherapy on tumor growth could be reverted by addition of a blocking anti-CCR3 antibody. gammadelta T-cell passive immunotherapy was dependent on the cytotoxic activity of the gammadelta effectors toward their targets because Vdelta2(neg) clones were not able to inhibit the growth of A431 hypodermal tumors. Our findings suggest that CMV-specific Vdelta2(neg) cells could target in vivo cancer cells, making them an attractive candidate for antitumor immunotherapy.

Published
2009
Full Text
View/download PDF

Catalog

Books, media, physical & digital resources
See catalog results