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RESUMO A adoção de escalas diagramáticas que viabilizem estimar a severidade de doenças no algodoeiro é fundamental para a tomada de decisão do momento mais correto de se fazer o controle químico destas enfermidades na cultura. Nas safras 2000/2001 e 2001/2002 foram realizados experimentos a campo, com cinco repetições, em delineamento de blocos ao acaso, objetivando comparar a reprodutibilidade da estimativa das severidades das manchas foliares causadas por Stemphylium spp., Alternaria spp., Ramularia areola e por Xanthomonas axonopodis pv. malvacearumpor meio de escalas diagramáticas: uma desenvolvida pelos autores deste trabalho, a de ANDRADE et al. (1999), a de CIA et al. (1999) e a de CIA; SALGADO (1997) na cultivar Delta Opal. As avaliações foram realizadas por quatro diferentes avaliadores aos 66, 81, 100 e 114 dias após a emergência no ano agrícola 2000/2001 e aos 71, 86, 106 e 124 dias após a emergência na safra 2001/2002 em 40 plantas marcadas por parcela. As escalas propiciaram aos avaliadores estimarem as severidades das manchas foliares com graus diferentes de sintomas, em planta, apresentando resultados mais uniformes quando a severidade das doenças era baixa. A escala de CIA; SALGADO (1997) exigiu maior competência dos avaliadores para a sua utilização adequada na determinação da severidade das manchas do complexo Stemphylium/Alternaria. As escalas 1 (elaborada pelos autores deste trabalho) e de CIA et al. (1999) demonstraram-se mais adequadas para a detecção dos sintomas iniciais da mancha de ramulária. ABSTRACT The adoption of a diagrammatic scale that allows for the estimation of the severity of cotton diseases is essential for decision-making in regard to the proper moment to control them chemically. During the main crops of 2000 and 2001 field experiments were carried out, with five replications, using a random complete block design, to compare the reproducibility of estimations of severity of leaf spot caused by Stemphylium spp., Alternaria spp., Ramularia areola and Xanthomonas axopodis pv. malvacearumthrough scores given by 4 evaluators using different diagrammatic scales: one developed by the present authors, one by ANDRADE et al (1999), one by CIA et al (1999) and one by CIA & SALGADO (1997) on DeltaOpal cultivar. The evaluations were performed by 4 different appraisers at 66, 81, 100 and 114 days after emergence in the crop year 2000/2001 and at 71, 86, 106 and 124 days after emergence in the season 2001/2002 in 40 marked plants per plot. The diagrammatic scale allowed the evaluators to estimate the severities of leaf spot with different levels of symptoms, in the same plant, showing more uniformity in the results when the severity of the diseases was lower. The CIA; SALGADO (1997) scale demanded more competence from the evaluators for the right use of it for determination of spot severities of the Stemphylium/ Alternaria complex. Scale 1 (created by the authors) and the CIA et al. (1999) scale were more appropriate for the detection of initial symptoms of the ramularia leaf spot.

RESUMO O setor florestal é um dos que mais contribui em termos sociais, econômicos e ambientais para o Brasil. Dentro deste setor, a eucaliptocultura pode ser apontada como a mais importante do segmento, com o plantio que representa 5,56 milhões de hectares. A primeira etapa do processo de implantação de florestas de eucaliptos é a produção de mudas, que no Brasil é feita por meio da clonagem, garantindo qualidade das mudas plantada no viveiro. Porém, um dos principais desafios em viveiros, é o controle de patógenos, e diante da variedade de espécies e híbridos de eucalipto que são suscetíveis a doença. A utilização do fosfito e silício podem diminuir o nível de severidade de bacteriose, e manter a uniformidade e qualidade das mudas em viveiros florestais. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da aplicação de produtos contendo fosfito e silício no controle de bacteriose, e na qualidade de mudas de Eucalyptus urograndis em um viveiro comercial. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado e dez tratamentos (Zincazot, Fitofos-Cu, Fitofos-K, Fitofos-Zn-Mn, Silamol, Amorux, Fitofos-Cu + Terra sorb, Fitofos-K + Terra sorb, Fitofos-Zn-Mn + Terra sorb, e testemunha) com quatro repetições, sendo cada repetição uma bandeja com 176 mudas incluindo a testemunha, a qual não recebeu aplicação. As aplicações foram realizadas via foliar, iniciando-se sete dias antes da coleta das minicepas no mini jardim clonal até os 120 dias de idade das mudas. Os resultados foram comparados pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. Conclui-se que a aplicação de produtos contendo fosfito e silício não reduziu a severidade da bacteriose causada por Xanthonomas sp. em mudas de Eucalyptus urograndis a nível de viveiro. Não houve efeito significativo dos tratamentos nos padrões de qualidade avaliados. Aos 120 dias de idade foi observado, exceto na testemunha, que os tratamentos tiveram uma maior taxa de sobrevivência das mudas adequada, podendo constatar o efeito positivo dos tratamentos nessa variável que é de grande importância econômica em um viveiro de produção mudas.

Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) is the causal agent of Cassava Bacterial Blight (CBB), one of the most important cassava diseases. The aim of this study was to evaluate the susceptibility of sweet cassava genotypes to strains of Xpm from three different geographic regions of Brazil in greenhouse conditions. The inoculation of 14 genotypes of cassava was made by cutting leaflets using scissors previously soaked in a bacterial suspension with 1 × 108 UFC ml-1 and also by inserting a soaked toothpick into the bud of the oldest leaf. The results showed significant differences when the cassava genotypes were individually evaluated in relation to the Xpm strains used; however, the relationship between cassava genotypes and Xpm strains was significant for wilt symptom. The UnB 1111 strain was more aggressive than the UnB 1386 strain based on the average value of the reaction grade, showing the variation that exists between the bacterial isolates from different regions. Considering the reaction of cassava germplasm?s resistance to the three strains used in the study, the BGMC 434 genotype was the only one classified as resistant based on the average reaction grade. The genotypes BGMC 753, BGMC 1289, BGMC 982 and the elite clones BRS 396, BRS 397, BRS 398, 259/08 and BRS 399 were classified as moderately resistant, which indicates the possibility of recommending them for disease favorable regions. Made available in DSpace on 2022-05-16T15:13:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Josefino-Reaction-of-sweet-cassava-genotypes.pdf: 174446 bytes, checksum: 5cf056056add3f10a4b6674a8e44efe6 (MD5) Previous issue date: 2021

Public Policy Lessons from the AIDS Response in Africa examines how the interplay between national state dynamics in Africa and the global political arena has shaped the global AIDS response, and in this context develops a framework for analysing public policy action more broadly in contemporary Africa. By applying comparative political sociology to AIDS public action, this book identifies four political models that are applicable to public initiatives. Fred Eboko goes on to test these in other domains - namely, the malaria and tuberculosis health subsectors, and the education and environment sectors. By articulating global and national connections and contributing a critical perspective grounded in African scholarship and French political science, the author builds a bold and ambitious framework with the potential to enable coherent and effective public policy action in Africa. This book will be of interest to scholars and students of public health, global health, political science, and development studies, as well as policy-level practitioners in the areas of global health and development.

International audience; Potato and tomato are important crops in Algerian agriculture, and both are threatened by abiotic and biotic stresses, and early blight is a major disease affecting both crops. Surveys carried out from 2012 to 2015 in 12 major growing regions for these crops yielded a total of 247 Alternaria isolates having morphological and cultural characteristics of sections Alternaria and Porri. Since early blight symptoms and morphological characteristics of the isolates did not allow sharp distinction between the different large-spored species of Alternaria, the isolates in section Porri, often considered primary causes of the diseases, were selected for molecular characterization by diagnostic PCR using specific primers. This allowed species identification of 147 Alternaria isolates as A. solani, A. protenta, A. grandis or A. linariae. These species were present on potato and tomato crops at varying frequencies, depending on the hosts and on bioclimatic locations. Pathogenicity tests for the four species, on detached leaflets and whole seedlings, showed that all were pathogenic to potato and tomato, with varying virulence. These results suggest that parasitic specialization of these Alternaria species on solanaceous plants should be reconsidered

Cassava bacterial blight, caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis, is of significant concern wherever cassava is grown. The movement of infected, asymptomatic stems is a major means of pathogen dispersal. A reliable and sensitive diagnostic procedure is necessary for the safe movement of cassava planting material. We used a cloned and sequenced pathogenicity gene of X. axonopodis pv. manihotis to develop a polymerase chain reaction (PCR) test for this pathogen. A set of primers directed the amplification of an 898-bp fragment in all 107 pathogenic strains of X. axonopodis pv. manihotis tested. PCR products were not observed when genomic DNA was tested for 27 strains of other xanthomonads, for saprophytic bacteria, or for five nonpathogenic strains of X. axonopodis pv. manihotis. The primers worked well for pathogen detection in direct PCR assays of X. axonopodis pv. manihotis colonies grown on liquid medium and in PCR assays of extracts from leaf and stem lesions. The minimum number of cells that could be detected from cassava stem and leaf lesions was 3 × 102 to 104 CFU/ml. The PCR assays proved to be relativyel sensitive and could become very useful in detecting the pathogen in cassava planting material.

Submitted by Vítor Rodrigues Marin (vitor.marin@unesp.br) on 2019-04-04T13:34:31Z No. of bitstreams: 1 Vitor Rodrigues Marin.pdf: 1046980 bytes, checksum: d5f3ceb432887542b0e1f0e511caee39 (MD5) Rejected by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: - Título diferente: na capa, na página de rosto e na ficha catalográfica, o título está com o artigo "a" antes de bacteriose. Na folha de aprovação não tem o artigo "a". Por favor, verifique qual é o título correto. Se for o que está na capa, página de rosto e ficha catalográfica, será necessário solicitar alteração da folha de aprovação na Seção de Pós-Graduação. Se for o que está na folha de aprovação, favor alterar a capa, página de rosto e ficha catalográfica. - Capa: em "Dissertação apresentada... Mester...", o correto é Mestre. - Agradecimento à CAPES: A CAPES publicou uma portaria na qual especifica como deve ser colocado o agradecimento: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001". Segue abaixo a Portaria: PORTARIA Nº 206, DE 4 DE SETEMBRO DE 2018 Dispõe sobre obrigatoriedade de citação da CAPES O PRESIDENTE DA COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR, no uso das atribuições que lhe foram conferidas pelo art. 26 do (a) Estatuto, aprovado (a) pelo Decreto nº 8977, de 30/01/2017, e CONSIDERANDO o indicado nos Editais da CAPES, nos Termos de Compromisso de Bolsista, nos regulamentos de bolsas no exterior e de bolsas no país, no Manual de AUXPE, e no termo de adesão ao Portal de Periódicos; CONSIDERANDO o constante dos autos do processo nº 23038.013648/2018-51, resolve: Art. 1º Os trabalhos produzidos ou publicados, em qualquer mídia, que decorram de atividades financiadas, integral ou parcialmente, pela CAPES, deverão, obrigatoriamente, fazer referência ao apoio recebido. Art. 2º Para fins de identificação da fonte de financiamento fica autorizada a utilização do código 001 para todos os financiamentos recebidos. Art. 3º Deverão ser usadas as seguintes expressões, no idioma do trabalho: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001 "This study was financed in part by the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Finance Code 001" Art. 4º Fica o pró-reitor de pós-graduação ou congênere, responsável pela divulgação e aplicação da regra dentro das Instituições de Ensino Superior que recebem apoio da CAPES. Art. 5º A falha em obedecer esta norma implicará em mudanças eventuais nos apoios da CAPES para as instituições e pesquisadores envolvidos, a partir de 2020. Art. 6º Esta Portaria entra em vigor na data de sua publicação. ABILIO A. BAETA NEVES Fonte: CAPES Diário Oficial da União: http://pesquisa.in.gov.br/imprensa/jsp/visualiza/index.jsp?data=05/09/2018&jornal=515&pagina=22 on 2019-04-04T14:11:08Z (GMT) Submitted by Vítor Rodrigues Marin (vitor.marin@unesp.br) on 2019-04-04T15:16:24Z No. of bitstreams: 1 Vitor Rodrigues Marin.pdf: 1046980 bytes, checksum: d5f3ceb432887542b0e1f0e511caee39 (MD5) Rejected by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão, a seu pedido. Segue abaixo seu e-mail: Acabei de receber as correções feitas pela repositório da UNESP, mas por um erro meu acabei enviando a mesma versão do arquivo, sem as devidas correções. Peço desculpas pelo inconveniente, se possível, se puderem liberar o acesso na plataforma do repositório, realizarei as correções necessárias. Agradecemos a compreensão. on 2019-04-04T17:33:58Z (GMT) Submitted by Vítor Rodrigues Marin (vitor.marin@unesp.br) on 2019-04-04T19:11:46Z No. of bitstreams: 1 Vítor Rodrigues Marin.pdf: 1047054 bytes, checksum: 31a0024f5ffda4269778146e58dab8c1 (MD5) Approved for entry into archive by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br) on 2019-04-05T11:56:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marin_vr_me_rcla_par.pdf: 659966 bytes, checksum: 4aab8c96a195bfbd912d58fc8089c9fb (MD5) Made available in DSpace on 2019-04-05T11:56:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 marin_vr_me_rcla_par.pdf: 659966 bytes, checksum: 4aab8c96a195bfbd912d58fc8089c9fb (MD5) Previous issue date: 2019-02-18 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O Brasil é o maior produtor de maracujá amarelo do mundo. Ainda assim, a produção da fruta é afetada por várias pragas, dentre elas destaca-se a bacteriose, ou mancha oleosa do maracujá, causada pela bactéria Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae. O manejo integrado da doença conta com aplicação de compostos químicos baseados em cobre que, com frequente utilização, podem causar danos ambientais e promover o surgimento de patógenos resistentes. Neste contexto, o uso de produtos de origem natural se mostra como uma possível alternativa no controle da bactéria devido sua diversidade estrutural e funções biológicas. Neste trabalho, 24 extratos brutos provenientes de fungos filamentosos endofíticos isolados de folhas de Passiflora incarnata Linnaeus foram submetidos a ensaios para avaliação de seu potencial de inibição de duas linhagens, LM4a e M83, da bactéria X. axonopodis pv. pasiflorae. Dentre os extratos testados, os originados dos isolados LMA 1793, LMA 1798, LMA 1719 e LMA 1602, apresentaram 95% de inibição de crescimento celular bacteriano a 2100 µg/mL para as duas linhagens. Os extratos de LMA 1793, LMA 1798 também apresentaram características bactericidas para ambas as linhagens enquanto os extratos de LMA 1719 e LMA 1602 apenas para a linhagem M83. O extrato do isolado LMA 1793 foi submetido a três etapas de fracionamento. Algumas frações apresentaram inibição igual ou superior a 90% e foram analisadas por espectrometria de massas. Uma delas apontou a possível presença da chaetoglobosina X. Brazil is the world’s biggest producer of yellow passion fruit. Nevertheless, the fruit production is affected by various pests, among them, the passion fruit bacteriosis, or grease spot, caused by the bacteria Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae is highlighted. The integrated pest management relies on the application of chemical composts based on copper, which, when applied recurrently causes environmental damage and may promote the emergence of resistant organisms. In this context, the use of products of natural origin are revealed as a viable alternative in the bacteria control due to their structural diversity and biological functions. In this work, 24 extracts from endophytic fungi, isolated from Passiflora incarnata Linnaeus were tested to assess their potential action against two strains, LM4a and M83, of the bacteria X. axonopodi pv. passiflorae. Among the extracts, the ones originated from isolates LMA 1793, LMA 1798, LMA 1719 and LMA 1602, presented inhibition of bacterial cellular growth of 95% at 2100 μg/mL. Extracts from LMA 1793 and LMA 1798 also presented bactericidal characteristics to both strains, while extracts from LMA 1719 and LMA 1602 only showed bactericidal properties to the M83 strain. Extract from isolate LMA 1793 went through three stages of fractionation. Fractions that presented inhibition equal or higher than 90% were analyzed by mass spectrometry. One of them pointed to the presence of chaetoglobosin X. CAPES: 001

Submitted by Sílvia Umeda Gallani (sigallani@hotmail.com) on 2019-04-09T15:16:47Z No. of bitstreams: 1 Tese pdf.pdf: 3132964 bytes, checksum: 458ccc4c97fb8358da0aeceffb3318ca (MD5) Rejected by Tatiana Camila Gricio (tatiana.gricio@unesp.br), reason: Solicitamos que realize a correção na submissão seguindo as orientações abaixo: 1 - Segundo a CAPES (Portaria nº 206, de 4 de setembro de 2018), o agradecimento deve conter exatamente a seguinte redação: O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001. 2- Acrescentar também CAPES no campo "Financiador" na submissão online (obs: conforme tutorial, para selecionar mais de uma agência, mantenha a tecla "Ctrl" pressionada ao clicar) 3- Conforme orientado no tutorial, na submissão online é obrigatório adicionar também o resumo em inglês (abstract). 4- Segundo as "Instruções para preenchimento e geração da ficha catalográfica" contidas no site, para trabalhos do CAUNESP, o modelo da ficha catalográfica é diferenciado. Favor acessar o site < http://www.fcav.unesp.br/#!/biblioteca/ficha-catalografica/>, selecione o modelo referente a dissertação (mestrado) - CAUNESP, grave em formato Word (doc), preencha com os seus dados e envie para a bibliotecária Karina, responsável pelas correções, através do e-mail: karina.gimenes@unesp.br Agradecemos a compreensão. on 2019-04-09T15:35:28Z (GMT) Submitted by Sílvia Umeda Gallani (sigallani@hotmail.com) on 2019-04-10T13:50:42Z No. of bitstreams: 1 Tese Gallani, S. U..pdf: 3123130 bytes, checksum: 859c7705a34ae14e5208ce5ebc46926c (MD5) Rejected by Tatiana Camila Gricio (tatiana.gricio@unesp.br), reason: Abaixo é possível visualizar na íntegra a Portaria em que a CAPES resolve sobre as normas para referenciar o apoio recebido. Atente-se aos artigos 2º, 3º e 5º. Não nos responsabilizamos se o aluno optar por não seguir tais normas. Agradecemos a compreensão. PORTARIA Nº 206, DE 4 DE SETEMBRO DE 2018 Dispõe sobre obrigatoriedade de citação da CAPES O PRESIDENTE DA COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR, no uso das atribuições que lhe foram conferidas pelo art. 26 do (a) Estatuto, aprovado (a) pelo Decreto nº 8977, de 30/01/2017, e CONSIDERANDO o indicado nos Editais da CAPES, nos Termos de Compromisso de Bolsista, nos regulamentos de bolsas no exterior e de bolsas no país, no Manual de AUXPE, e no termo de adesão ao Portal de Periódicos; CONSIDERANDO o constante dos autos do processo nº 23038.013648/2018-51, resolve: Art. 1º Os trabalhos produzidos ou publicados, em qualquer mídia, que decorram de atividades financiadas, integral ou parcialmente, pela CAPES, deverão, obrigatoriamente, fazer referência ao apoio recebido. Art. 2º Para fins de identificação da fonte de financiamento fica autorizada a utilização do código 001 para todos os financiamentos recebidos. Art. 3º Deverão ser usadas as seguintes expressões, no idioma do trabalho: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001 "This study was financed in part by the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Finance Code 001" Art. 4º Fica o pró-reitor de pós-graduação ou congênere, responsável pela divulgação e aplicação da regra dentro das Instituições de Ensino Superior que recebem apoio da CAPES. Art. 5º A falha em obedecer esta norma implicará em mudanças eventuais nos apoios da CAPES para as instituições e pesquisadores envolvidos, a partir de 2020. Art. 6º Esta Portaria entra em vigor na data de sua publicação. ABILIO A. BAETA NEVES Fonte: CAPES Diário Oficial da União: http://pesquisa.in.gov.br/imprensa/jsp/visualiza/index.jsp?data=05/09/2018&jornal=515&pagina=22 on 2019-04-10T14:41:42Z (GMT) Submitted by Sílvia Umeda Gallani (sigallani@hotmail.com) on 2019-04-10T18:51:08Z No. of bitstreams: 1 Tese Gallani, S. U..pdf: 3122779 bytes, checksum: 1fa0541e0f4422410313c56fe908d177 (MD5) Approved for entry into archive by Tatiana Camila Gricio (tatiana.gricio@unesp.br) on 2019-04-10T19:06:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 gallani_su_dr_jabo_par.pdf: 570715 bytes, checksum: c0f433bc3a353a4d86243546c0de400a (MD5) Made available in DSpace on 2019-04-10T19:06:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 gallani_su_dr_jabo_par.pdf: 570715 bytes, checksum: c0f433bc3a353a4d86243546c0de400a (MD5) Previous issue date: 2019-02-18 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) As enfermidades têm se destacado como um dos principais entraves para o desenvolvimento da aquicultura, e apesar do tambaqui Colossoma macropomum ser a espécie nativa mais produzida na América do Sul, pouco conhecemos sobre as enfermidades que o afetam e como o seu mecanismo imune reage frente às infecções. A septicemia hemorrágica é causada pela bactéria Aeromonas hydrophila, e se destaca como uma das principais enfermidades na aquicultura, principalmente em espécies tropicais. Por isso, confirmamos a patogenicidade de A. hydrophila pelo Postulado de Koch e estabelecemos as doses letais até 80%, estimando a DL50 em 5, 57 x 107 a 1, 41 x 108 UFC/ml. Não recomendamos o verde malaquita como recurso profilático e indicamos ceftriaxona, florfenicol, oxitetracyclina, sulfazotrim e tianfenicol como potenciais antimicrobianos para o controle desta bactéria, mas consideramos os óleos essenciais de cravo Eugenia caryophyllata e canela Cinnamomum zeylanicum como melhores opções para potencial tratamento da bacteriose, com forte atividade inibitória. Descrevemos um perfil leucocitário incomum de severa leucopenia em período agudo de infecção, devido à liberação de armadilhas extracelulares pelos leucócitos (ETosis). ETosis é um mecanismo de suicídio leucocitário, ainda não descrito para a maioria dos peixes, e que pode ser considerado como um dos últimos recursos imunes adotado pelo hospedeiro para tentar conter a infecção. Este mecanismo pode ser visualizado através de uma metodologia de baixo custo e de fácil execução em microscopia eletrônica de varredura, desenvolvida nesta tese. Como os estudos genéticos beneficiam substancialmente o desenvolvimento da criação de uma espécie, a sequência parcial genética de peptídios antimicrobianos (HSP70, lisozima e proteínas do sistema complemento), receptor de citocina e citocinas (IRAK 1, IL-1 e IL-10) foram descritas. Padrões de expressões genéticas foram caracterizadas quanto a modulação de cada gene, em resposta às diferentes fases de infecção por A. hydrophila. A modulação das expressões dos genes imunes mostrou-se aumentada em peixes infectados, tanto na fase inicial da infecção (principalmente em torno de 6h e 24h) quanto na fase crônica (7d e 14d). Apenas o gene associado à regulação térmica, HSP70, mostrou-se negativamente modulado em peixes infectados. Destacamos o aumento na expressão dos genes de citocinas e lisozima, evidenciando atividade pró e antiinflamatórias. Porém, o maior destaque é dado para os genes HSP70 e proteínas do sistema complemento: C3 e C4. A modulação dos genes de HSP70 foi afetada negativamente em peixes infectados, sugerindo que peixes afetados por A. hydrophila ficam mais propícios à sensibilidade térmica e às infecções secundárias. Com relação às proteínas do sistema complemento, apesar da regulação aumentada na expressão do gene C4, seguindo a tendência pró-inflamatória, o gene C3 surpreendentemente não foi expresso na maioria dos peixes saudáveis e infectados. Adicionalmente, na análise de do sistema complemento no soro, a ausência de atividade hemolítica corrobora com os resultados de expressão gênica, sugerindo provável deficiência no sistema complemento desta espécie, nas condições testadas. A ausência de dados na literatura e as possíveis razões para a regulação da expressão gênica e associação com doenças de peixes são abordadas nesta tese. Diseases have emerged as one of the main obstacles to aquaculture development, and although tambaqui Colossoma macropomum is the most produced native species in South America, little is known about the diseases that affect this fish and how its immune mechanism reacts to infection. Hemorrhagic septicemia is caused by the bacterium Aeromonas hydrophila, and stands out as one of the major diseases in aquaculture, especially in tropical species. Therefore, we confirmed the pathogenicity of A. hydrophila by the Koch’s Postulate and established the lethal doses up to 80%, estimating the LD50 at 5.57 x 107 to 1.41 x 108 CFU/ml. We do not recommend malachite green as a prophylactic resource and we recommend ceftriaxone, florfenicol, oxytetracycline, sulphazotrin and thiamphenicol as potential antimicrobials for this bacterium control, but we consider the essential oils of clove Eugenia caryophyllata and cinnamon Cinnamomum zeylanicum as the best options for potential treatment of bacteriosis, with strong inhibitory activity. We describe an unusual leukocyte profile with severe leukopenia during acute infection due to the release of leukocyte extracellular traps (ETosis). ETosis is a mechanism of leukocyte suicide, not described yet for most of fish species, and it can be considered as one of the last immune mechanisms adopted by the host to try to contain the infection. This mechanism can be visualized through a low-cost and of easy-execution methodology, developed in this thesis. As the genetic studies substantially benefit the development of a species farming, the genetic partial sequence of antimicrobial peptides (HSP70, lysozyme and complement system proteins), cytokine receptor and cytokines (IRAK 1, IL-1 and IL-10) were described. The patterns of gene expression were characterized for of each gene in response to the different stages of A. hydrophila infection. The immune gene expression was shown to be increased in infected fish, both in the initial phase of infection (mainly around 6h and 24h) and in the chronic phase (7d and 14d). Only the gene associated with thermal regulation, HSP70, was shown to be down-regulated in infected fish. We highlight the modulation of cytokine and lysozyme genes, evidencing pro and antiinflammatory activities. However, a great prominence is given to the genes related to HSP70 and complement system proteins: C3 and C4. The HSP70 gene was down-regulated in infected fish, suggesting that fish affected by A. hydrophila are more susceptible to thermal sensitivity and secondary infections. Regarding complement system proteins, although C4 gene regulation follows a pro-inflammatory trend, the C3 gene was surprisingly not expressed in most healthy and infected fish. Additionally, in the analysis of the complement system in the serum, the absence of hemolytic activity corroborates with the results of gene expression, suggesting a probable deficiency in the complement system of this species, under the conditions tested. The lack of data in the literature and the possible reasons for the regulation of gene expression and association with fish diseases are addressed in this thesis. 431713/2016-2 305007/2016-5 001

Pasteurella (P.) multocida is the causative agent of pneumonic pasteurellosis in swine, which is commonly associated with the final stages of enzootic pneumonia or porcine respiratory disease complex. Although this syndrome is one of the most common and important diseases of pigs, data on antimicrobial susceptibility of P. multocida isolates are uncommon in Brazil. Therefore, the present study was carried out to determine and to compare antimicrobial susceptibility profile of Brazilian P. multocida isolated from pigs with lesions of pneumonia or pleuritis during two-time periods. Historical isolates (period of 1981 to 1997; n=44) and recent isolates (period of 2011 to 2012; n=50) were used to determine the MIC of amoxicillin, enrofloxacin, florfenicol and tetracycline by microbroth dilution. Florfenicol had the lowest level of resistance for both historical and recent isolates (0% and 6%, respectively), while tetracycline had the highest (20.5% and 34%, respectively). Multi-drug resistance (MDR) to amoxicillin/florfenicol/tetracycline was observed in 6% of recent isolates. There was a significant increase (p˂0.05) in resistance for amoxicillin and enrofloxacin in recent isolates compared with historic isolates (3.8% and 18%, respectively), most likely due to the selective pressure of antimicrobial usage to treat and prevent P. multocida infections. The results of this study showed an increase of isolates resistant to important drugs used in treatment of P. multocida infections in pigs, demonstrating the need for the implementation of rational use of antimicrobials in Brazilian swine industry. RESUMO: Pasteurella (P.) multocida é o agente da pasteurelose pneumônica em suínos, a qual é comumente associada com o estágio final da pneumonia enzoótica suína ou complexo das doenças respiratórias dos suínos. Apesar de ser uma das doenças mais comuns e importantes na suinocultura, dados sobre suscetibilidade antimicrobiana de isolados de P. multocida são raros no Brasil. Dessa forma, o presente estudo foi realizado para determinar e comparar o perfil de suscetibilidade de isolados de P. multocida de suínos com lesões de pneumonia ou pleurite no Brasil durante dois períodos. Isolados históricos (período de 1981 a 1997; n=44) e contemporâneos (período de 2011 a 2012; n=50) foram usados para determinar a concentração inibitória mínima (CIM) de amoxicilina, enrofloxacina, florfenicol e tetraciclina através do teste de microdiluição em caldo. Florfenicol apresentou o menor nível de resistência para ambos os isolados históricos e contemporâneos (0% e 6%, respectivamente), enquanto que tetraciclina apresentou o maior nível de resistência (20.5% e 34%, respectivamente). Resistência a múltiplos antimicrobianos (amoxicilina, florfenicol e tetraciclina) foi observada em 6% dos isolados recentes. Foi observado aumento significativo (p˂0.05) na resistência a amoxicilina e enrofloxacina em isolados recentes comparado com isolados históricos (3.8% e 18%, respectivamente), provavelmente devido à pressão de seleção de antimicrobianos usados no tratamento e prevenção de infecções causadas por P. multocida. Os resultados deste trabalho demostraram o aumento de isolados resistentes a importantes drogas utilizadas no tratamento de infecções causadas por P. multocida em suínos, evidenciando a necessidade da implementação do uso racional de antimicrobianos na suinocultura brasileira.

Submitted by Paulo Augusto de Souza Zingra Vomero (paulovomero@gmail.com) on 2019-02-08T15:27:26Z No. of bitstreams: 1 Paulo_Trabalho Final_2019.pdf: 1108441 bytes, checksum: 6b59bf901c9a8b052a7e057810e13087 (MD5) Approved for entry into archive by Ana Lucia de Grava Kempinas (algkempinas@fca.unesp.br) on 2019-02-11T19:05:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vomero_pasz_dr_botfca.pdf: 1108441 bytes, checksum: 6b59bf901c9a8b052a7e057810e13087 (MD5) Made available in DSpace on 2019-02-11T19:05:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vomero_pasz_dr_botfca.pdf: 1108441 bytes, checksum: 6b59bf901c9a8b052a7e057810e13087 (MD5) Previous issue date: 2018-12-17 O setor florestal brasileiro, principalmente a eucaliptocultura e os seus subprodutos, vem sofrendo com concorrências internacionais, com a inflação doméstica, secas, novas pragas, aumento das doenças no campo e principalmente no viveiro. Há anos, viveiros por todo país vêm sofrendo com doenças e perdas econômicas que elas geram quando há morte do material e seu descarte. Uma muda debilitada, que não foi corretamente manejada em sua fase de produção, ao chegar no campo resultará em um plantio fraco e isso acarretará na produção de menos madeira na época da colheita. O correto manejo de doenças no viveiro é primordial para a entrega de uma muda sadia, que no campo terá mais condições de se desenvolver em sua forma mais plena e vir a garantir o sucesso produtivo de madeira. Cada viveiro tem o seu método de monitoramento e controle de doenças, porém, na maioria deles falta um maior respaldo técnico que ajude com a melhor forma de realizar esse trabalho. Dessa forma, o presente trabalho teve por objetivo estudar a sazonalidade das ocorrências de bacteriose, mofo cinzento e oídio em um viveiro de produção de muda clonal de eucalipto em uma empresa da região de Mogi Guaçu-SP. Para isso foram coletados dados das ocorrências de doenças, entre os anos de 2014 a 2017, e dos dados climáticos para o mesmo período. Utilizando o software estatístico SAS, foi observado correlações com significância estatística entre doenças, nível de infestação, local de produção de mudas no viveiro e material genético. O jardim clonal se destacou pelo local com maior incidência de doenças. A bacteriose, o mofo cinzento e o oídio foram as doenças mais importantes encontradas nesse trabalho. Os materiais genéticos IPB24, IPB22, IPB02 apresentaram as maiores ocorrências de doenças, com destaque para o IPB24. Após as análises das ocorrências de doenças, dos períodos de incidências e dos dados de temperatura foi possível construir a sazonalidade da bacteriose, do mofo cinzento e do oídio e assim, gerar uma ferramenta que o viveiro poderá utilizar no manejo e prevenção de doenças The Brazilian forestry sector, mainly eucalyptus cultivation and its by-products, has been suffering with the international competition, with the domestic inflation, droughts, new pests, increased diseases in the field and especially in the nursery. For years, nurseries all over the country have been suffering with diseases and economic losses they cause when the seedling is killed and disposed of. A weak seedling, which has not been correctly handled during its production phase, will result in poor planting and less wood at harvest time. The correct handling of diseases in the nursery is essential for delivery a healthy seedling, which after planted in the field will be able to develop in its fullest form and ensure the sucess of wood production. Each nursery has its method of monitoring and controlling diseases, however, most of them don´t have greater technical support to help with the best way to do this. So, the present search had the objective of studying the seasonality of occurrences of bacteriosis, gray mold and powdery mildew in a nursery of eucalyptus clonal production at a company in the Mogi Guaçu region at São Paulo state. For this, occurrence of diseases data and the climatic data were collected between the years 2014 to 2017. Through statistical software SAS, correlations with statistical significance were observed between diseases, infestation level, local of production in the nursery and genetic material. The clonal garden was the place with greater incidence of diseases. Bacteriosis, gray mold and powdery mildew were the most important diseases found in this search. The clones IPB24, IPB22, IPB02 presented the highest occurrences of diseases, especially IPB24. After analyzing the occurrence of diseases, incidence periods and temperature data, was possible to construct the seasonality of bacteriosis, gray mold and powdery mildew and thus generate a tool that the nursery could use in disease management and prevention.

Diversos agente infecciosos podem ocasionar perdas consideráveis na produção do pescado. Dentre eles estão as bactérias do gênero Aeromonas, caracterizadas por serem oportunistas, que habitam os ecossistemas de água doce, estuarinos e marinho. As enfermidades causadas por essas bacterianas podem estar associadas a infestações parasitárias dos peixes, como relatam trabalhos em relação aos parasitas Argulus spp. Em um espécime da Curimatã comum que chegou ao laboratório foi observado apresentar uma infecção por essas bactérias do gênero Aeromonas spp., conforme caracterização laboratorial. Buscando o controle da enfermidade foi utilizado, no tratamento, sal marinho na concentração de 15g∕L, diluído na água, com o espécime ficando submerso por 20 minutos, em uma temperatura que variou entre 26 e 28°C. Após 20 dias de tratamento observou-se a cicatrização da área danificada e recuperação parcial de uma nadadeira, o que sugere a eficiência do produto.

International audience; In the light of a double approach, at first empirical, later theoretical and comparative, illustrated by the example of the Buruli ulcer and its mycobacterial agent Mycobacterium ulcerans on which I focused my research activity these last ten years by studying determinants and factors of emerging infectious or parasitic diseases, the complexity of events explaining emerging diseases will be presented. The cascade of events occurring at various levels of spatiotemporal scales and organization of life, which lead to the numerous observed emergences, nowadays requires better taking into account the interactions between host(s), pathogen(s) and the environment by including the behavior of both individuals and the population. In numerous research studies on emerging infectious diseases, microbial hazard is described rather than infectious disease risk, the latter resulting from the confrontation between an association of threatening phenomena, or hazards, and a susceptible population. Beyond, the theme of emerging infectious diseases and its links with global environmental and societal changes leads to reconsider some well-established knowledge in infectiology and parasitology.; À la lumière d’une double approche, d’abord empirique, illustrée par l’exemple de l’ulcère de Buruli et de son agent mycobactérien Mycobacterium ulcerans sur lesquels j’ai concentré mon activité de recherche ces dix dernières années, puis théorique et comparative, en m’intéressant aux déterminants et facteurs d’émergence de nouveaux agents infectieux ou parasitaires, la complexité des événements en cause pour expliquer le phénomène d’émergence est présentée. Les cascades d’événements, intervenant à différents niveaux d’échelles spatio-temporelles et d’organisation du vivant, et qui conduisent aux nombreuses émergences observées, exigent aujourd’hui de mieux prendre en compte les interactions hôte(s)/pathogène(s)/environnement, en y incluant les comportements des individus et de la population. Dans de nombreux travaux de recherche sur les maladies infectieuses émergentes, il s’agit d’un danger infectieux qui est décrit et non un risque, ce dernier résultant de la confrontation entre une association de phénomènes menaçants, ou aléas, et une population susceptible. Au-delà, le sujet des maladies infectieuses émergentes et de ses liens avec les changements environnementaux et sociétaux globaux entraîne à devoir reconsidérer certaines connaissances bien établies en infectiologie et parasitologie.

Alternaria Leaf Blight (ALB), caused by the fungus Alternaria dauci, is the most damaging foliar disease affecting carrots (Daucus carota). In order to identify compounds potentially linked to the resistance to A. dauci, we have used a combination of targeted and non-targeted metabolomics to compare the leaf metabolome of four carrot genotypes with different resistance levels. Targeted analyses were focused on terpene volatiles, while total leaf methanolic extracts were subjected to non-targeted analyses using liquid chromatography couple to high-resolution mass spectrometry. Differences in the accumulation of major metabolites were highlighted among genotypes and some of these metabolites were identified as potentially involved in resistance or susceptibility. A bulk segregant analysis on F3 progenies obtained from a cross between one of the resistant genotypes and a susceptible one, confirmed or refuted the hypothesis that the metabolites differentially accumulated by these two parents could be linked to resistance.

Submitted by GABRIELLE VIEIRA null (gabriellevieir@gmail.com) on 2018-04-05T12:53:30Z No. of bitstreams: 1 Metabólitos secundários de fungos da Antártica com ação antimicrobiana em Xanthomonas spp.pdf: 8795008 bytes, checksum: 0df6b298004d2d27c6a56a8a8367648b (MD5) Approved for entry into archive by Adriana Aparecida Puerta null (dripuerta@rc.unesp.br) on 2018-04-05T14:02:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vieira_g_me_rcla.pdf: 8781866 bytes, checksum: e535d140907c0db6ece0255e817ca841 (MD5) Made available in DSpace on 2018-04-05T14:02:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vieira_g_me_rcla.pdf: 8781866 bytes, checksum: e535d140907c0db6ece0255e817ca841 (MD5) Previous issue date: 2018-02-28 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) As bactérias do gênero Xanthomonas afetam culturas agrícolas de grande importância econômica no Brasil. O controle destas doenças realizado pela utilização de produtos químicos, entre outras práticas, causa impactos negativos na saúde e ao meio ambiente. Isso torna a busca de alternativas sustentáveis de combate a estas doenças cada vez mais importante. Uma possível alternativa aos produtos químicos que tem despertado grande interesse é a aplicação de metabólitos secundários. Suspeita-se que fungos que vivem em ambientes extremos como a Antártica podem produzir metabólitos secundários ainda desconhecidos. Dessa maneira, este projeto teve como objetivo principal investigar a potencial atividade de metabólitos secundários produzidos por 33 fungos isolados do solo contra três espécies de Xanthomonas economicamente importantes para a agricultura do país. Para tanto, foram utilizados fungos coletados em solo em expedição à Antártica (2013) no âmbito do INCT Criosfera, que estão preservados junto à Central de Recursos Microbianos da UNESP. Os extratos (n=66) foram testados contra Xanthomonas patogênicas das culturas de tomate (Xanthomonas euvesicatoria), frutas cítricas (Xanthomonas citri subsp. citri) e maracujá (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae). Do total de extratos brutos submetidos a bioensaio contra os fitopatógenos, 18 (27,27%) apresentaram taxa de inibição ≥ 90%. Os extratos com potencial inibitório tiveram origem em fungos identificados por sequenciamento da região ITS4 e ITS5 como pertencentes ao filo Ascomycota, gênero Pseudogymnoascus. Alguns extratos ativos foram purificados utilizando diversas técnicas cromatográficas por fracionamento bioguiado como cromatografia por exclusão molecular, cromatografia em coluna em fase normal, cromatografia em coluna de fase reversa e cromatografia líquida de alta eficiência por interação hidrofílica. As frações obtidas foram testadas frente à Xanthomonas citri subsp. citri. Duas frações, obtidas por cromatografia líquida de alta eficiência, C2F2 e C2F5 apresentaram atividade inibitória contra o fitopatógeno. Bacteria of the genus Xanthomonas affect agricultural crops of great economic importance in Brazil. Control of these diseases is made by the use of chemicals, among other practices, that causes negative impacts on human health and the environment. This makes the search for sustainable alternatives to combat these diseases increasingly important. A possible alternative to chemicals that have aroused great interest is the application of secondary metabolites. It is suspected that fungi living in extreme environments such as Antarctica may produce secondary metabolites as of yet unknown. Therefore this study had as main objective investigate the potential activity of secondary metabolites produced by 33 fungi isolated from the soil against three economically important Xanthomonas species. For this purpose fungi previously collected in the Antarctic expedition (2013) under the INCOS Criosfera and preserved at the Microbial Resource Center of UNESP were utillized. The extracts produced by the 33 isolates (n = 66) were tested against pathogenic Xanthomonas of tomato crops: Xanthomonas euvesicatoria; citrus: Xanthomonas citri subsp. citri; and of passion fruit culture, Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae. From the total of extracts submitted to bioassay against phytopathogens, 18 (27.27%) presented inhibition rate ≥ 90%. The extracts with inhibitory potential were produced by fungi identified through sequencing of the ITS4 and ITS5 regions as belonging to the Ascomycota phylum, genus Pseudogymnoascus. Some active extracts were purified using chromatography techniques by bioguided fractionation such as solid phase chromatography by molecular exclusion, normal phase column chromatography, reverse phase column chromatography, and high performance liquid chromatography by hydrophilic interaction . The fractions obtained by cromatography were tested for antibacterial activity in Xanthomonas citri subsp. citri. Two fractions, obtained by high performance liquid chromatography, C2F2 and C2F5, showed inhibitory activity against the phytopathogen. FAPESP: 2015/20629-6.

Made available in DSpace on 2019-11-26T00:40:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Standardareadiagramsetforbacterial.pdf: 2180276 bytes, checksum: 7e05b16851e6f9aff9d8bb3e55f5bb34 (MD5) Previous issue date: 2018

Resumo: A caprinocultura na região Nordeste do Brasil desempenha importante função socioeconômica e estratégica. A rusticidade desta atividade nesta região, aliada a sua rápida expansão em outros estados, tem gerado perdas na sua cadeia produtiva a nível regional e nacional, causadas por doenças infecciosas, destacando-se a Linfadenite Caseosa (LC), afecção amplamente difundida nos rebanhos caprinos, acarretando sérios prejuízos econômicos à atividade. Embora LC tenha sido detectada como um problema endêmico no nordeste brasileiro, uma análise abrangente e mais recente desta prevalência nos rebanhos caprinos brasileiros se faz necessária. O objetivo desse estudo foi determinar a frequência de anticorpos anti-Corynebacterium pseudotuberculosis em cinco dos nove estados que compõem a região Nordeste do Brasil. Foram processadas amostras de soro de 2571 caprinos provenientes de 218 propriedades rurais oriundas de cinco estados da região Nordeste do Brasil, coletadas entre os anos de 2010 a 2012. O diagnóstico da infecção por C. pseudotuberculosis foi realizado pela técnica de ELISA-indireto. Em 88,5% (193/218) das propriedades investigadas, pelo menos um caprino foi soropositivo para C. pseudotuberculosis, sugerindo que o agente se encontra disseminado nos rebanhos do Nordeste, com a maior prevalência encontrada no Rio Grande do Norte (94,5%) e a menor no estado de Sergipe (70,3%). Foram identificados 783 (30,4%; IC 95%=28,7-32,2%) caprinos soropositivos, com a maior prevalência entre animais encontrada no Piauí (41,4%) e a menor no estado de Sergipe (22,5%). De um total de 279 reprodutores avaliados, 106 (37,9%) resultaram soropositivos, destacando-se o Rio Grande do Norte, com 45,30%, e Piauí com 46,8% dos reprodutores positivos para LC. Das 1420 matrizes testadas, 599(42,1%) apresentaram sorologia positiva para C. pseudotuberculosis. Entre os estados esta distribuição também se manteve semelhante, destacando-se o Rio Grande do Norte, com 47,5% e Piauí com 59,5% das matrizes positivos para LC. Entre os 872 caprinos jovens avaliados, 78 (8,9%) foram soropositivos para LC, observando-se uma diferença estatística na frequência de sopositividade obtidas entre os adultos e os jovens (P