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Overview of infectious and non-infectious diseases in French Guiana in 2022 Source of many myths, French Guiana represents an exceptional territory due to the richness of its biodiversity and the variety of its communities. The only European territory in Amazonia, surrounded by the Brazilian giant and the little-known Suriname, Ariane 6 rockets are launched from Kourou while 50% of the population lives below the poverty line. This paradoxical situation is a source of health problems specific to this territory, whether they be infectious diseases with unknown germs, intoxications or chronic pathologies. Some infectious diseases such as Q fever, toxoplasmosis, cryptococcosis or HIV infection are in common with temperate countries, but present specificities leading to sometimes different management and medical reasoning. In addition to these pathologies, many tropical diseases are present in an endemic and / or epidemic mode such as malaria, leishmaniasis, Chagas disease, histoplasmosis or dengue. Besides, Amazonian dermatology is extremely varied, ranging from rare but serious pathologies (Buruli ulcer, leprosy) to others which are frequent and benign such as agouti lice (mites of the family Trombiculidae) or papillonitis. Envenomations by wild fauna are not rare, and deserve an appropriate management of the incriminated taxon. Obstetrical, cardiovascular and metabolic cosmopolitan pathologies sometimes take on a particular dimension in French Guiana that must be taken into account in the management of patients. Finally, different types of intoxication are to be known by practitioners, especially due to heavy metals. European-level resources offer diagnostic and therapeutic possibilities that do not exist in the surrounding countries and regions, thus allowing the management of diseases that are not well known elsewhere. Thanks to these same European-level resources, research in Guyana occupies a key place within the Amazon region, despite a smaller population than in the surrounding countries. Thus, certain pathologies such as histoplasmosis of the immunocompromised patient, Amazonian toxoplasmosis or Q fever are hardly described in neighboring countries, probably due to under-diagnosis linked to more limited resources. French Guiana plays a leading role in the study of these diseases. The objective of this overview is to guide health care providers coming to or practicing in French Guiana in their daily practice, but also practitioners taking care of people returning from French Guiana. Panorama des pathologies infectieuses et non infectieuses de Guyane en 2022 Source de nombreux mythes, la Guyane représente un territoire exceptionnel par la richesse de sa biodiversité et par la variété des communautés qui la composent. Seul territoire européen en Amazonie, entouré du géant brésilien et du méconnu Suriname, on y lance des fusées Ariane 6 depuis Kourou tandis que 50 % de la population vit en dessous du seuil de pauvreté. Cette situation paradoxale est source de problématiques de santé spécifiques à ce territoire, qu’il s’agisse de maladies infectieuses à germes méconnus, d’intoxications, ou de pathologies chroniques. Certaines maladies infectieuses telles que la fièvre Q, la toxoplasmose, la cryptococcose ou l’infection à VIH sont communes aux pays tempérés, mais présentent en Guyane des spécificités entraînant une prise en charge et un raisonnement médical parfois différents. Parallèlement à ces pathologies, de nombreuses maladies tropicales sont par ailleurs présentes sur un mode endémique et / ou épidémique telles que le paludisme, la leishmaniose, la maladie de Chagas, l’histoplasmose ou la dengue. De plus, la dermatologie amazonienne est extrêmement variée, allant de pathologies rares, mais graves (ulcère de Buruli, lèpre), à d’autres fréquentes et bénignes telles que les poux d’agouti (acariens de la famille des Trombiculidae) ou la papillonite. Les envenimations par la faune sauvage ne sont pas rares, et méritent une prise en charge appropriée au taxon incriminé. Les pathologies obstétricale, cardiovasculaire et métabolique cosmopolites prennent parfois en Guyane une dimension particulière à prendre en compte dans la prise en charge des patients. Enfin, différents types d’intoxication sont à connaître par les praticiens, notamment aux métaux lourds. Les ressources de niveau européen offrent des possibilités diagnostiques et thérapeutiques inexistantes dans les pays et régions des environs, permettant ainsi la prise en charge de maladies peu connues ailleurs. Du fait de ces mêmes ressources de niveau européen, la recherche en Guyane occupe une place clé au sein de la région amazonienne, malgré une population moins nombreuse que dans les pays alentour. Ainsi, certaines pathologies telles que l’histoplasmose du patient immunodéprimé, la toxoplasmose amazonienne ou la fièvre Q ne sont pratiquement pas décrites dans les pays voisins, probablement du fait d’un sous-diagnostic lié à des ressources plus limitées. La Guyane joue ainsi un rôle moteur dans l’étude de ces pathologies. L’objectif de ce panorama est d’orienter les soignants venant ou exerçant en Guyane dans leur pratique quotidienne, mais également les praticiens prenant en charge des personnes au retour de Guyane., MTSI, Vol. 3 No 1 (2023): MTSI-Revue

The use of herbal tea with Artemisia annua by travelers and traditional communities in Africa has increased in recent years as a supposed form of malaria prophylaxis, although its use is not recommended due to lack of efficacy. The risk of severe malaria complications that can lead to death is real regarding said behavior, and awareness needs to be raised. We report a case of severe Plasmodium falciparum malaria imported in the Amazon rainforest by a traveler returning from Cameroon who treated himself with Artemisia annua herbal tea.

Ces 19 et 20 mai 2022 se sont tenues à Cayenne, en Guyane, les 5e journées des travaux scientifiques des soignants de Guyane « Nos soignants ont du talent ». Ces dernières ont remplacé depuis 2021 les Journées des travaux scientifiques des jeunes médecins de Guyane « Nos internes ont du talent », en s’ouvrant largement à d’autres corps de métier de la santé. Ainsi, lors de cette nouvelle session, 10 infirmières, 4 sages-femmes, 1 pharmacienne, 1 technicienne de laboratoire et 22 médecins ont contribué aux communications orales et affichées de ces journées. Les sujets abordés ont touché des domaines extrêmement variés, avec des travaux concernant les zoonoses (rage, fièvre Q), les interactions entre l’homme avec la faune sauvage (envenimation par la faune sauvage, en particulier ophidienne), la santé publique en zone isolée (Covid, VIH, paludisme), l’épidémiologie tropicale (hémopathies liées à l’HTLV, histoplasmose pulmonaire, toxoplasmose, tuberculose, fièvre jaune), la dermatologie tropicale (prurigo du VIH, dermo-hypodermites, dermatologie en zone isolée, leishmaniose cutanée), la périnatalité (exposition au plomb chez les femmes enceintes, causes de mort fœtale in utero, dépistage du cancer du col de l’utérus), la santé notamment sexuelle, mais aussi globale et addictive de différentes populations (orpailleurs clandestins, populations incarcérées, femmes migrantes, agriculteurs), les pathologies cardiovasculaires et les hémoglobinopathies (diabète, AVC, drépanocytose), la prise en charge des violences (épidémiologie des plaies par arme à feu, violences sexuelles et conjugales), la mise en place de projets en santé communautaire dans les quartiers défavorisés (Covid, eau-hygiène-assainissement), les soins et patients (interculturalité, barrière de la langue, EVASAN). Ces journées se sont tenues pour la deuxième fois en format mixte présentiel et/ou distanciel, avec environ 200 participants chaque jour qui ont assisté aux présentations et contribué aux débats. Enfin, le retour sur les années précédentes a montré que les travaux présentés lors de ces journées de Guyane sont loin d’être limités en termes d’intérêt scientifique à la sphère locale « guyano-guyanaise ». En effet, un pourcentage non négligeable des présentations réalisées ces dernières années a fait l’objet de publications dans des journaux internationaux principalement anglophones – 16/19 (84 %) en 2017, 9/28 (32 %) en 2018, 8/25 (32 %) en 2019 et 10/25 (40 %) en 2021. Tous les organisateurs de ces journées originales espèrent que l’implication et l’engouement des soignants pour la recherche scientifique se poursuivent, et connaissent une importance grandissante lors des sessions à venir., MTSI, Vol. 2 No 2 (2022): MTSI-Revue

International audience

Objectives Molecular assays on nasopharyngeal swabs remain the cornerstone of COVID-19 diagnostics. The high technicalities of nasopharyngeal sampling and molecular assays, as well as scarce resources of reagents, limit our testing capabilities. Several strategies failed, to date, to fully alleviate this testing process (e.g. saliva sampling or antigen testing on nasopharyngeal samples). We assessed the clinical performances of SARS-CoV-2 nucleocapsid antigen (N-antigen) ELISA detection in serum or plasma using the COVID-19 Quantigene® (AAZ, France) assay. Methods Performances were determined on 63 serum samples from 63 non-COVID patients and 227 serum samples (165 patients) from the French COVID and CoV-CONTACT cohorts with RT-PCR-confirmed SARS-CoV-2 infection, including 142 serum samples (114 patients) obtained within 14 days after symptom onset. Results Specificity was 98.4% (95% CI 95.3–100). Sensitivity was 79.3% overall (180/227, 95% CI, 74.0–84.6) and 93.0% (132/142, 95% CI, 88.7–97.2) within 14 days after symptom onset. Ninety-one of the included patients had serum samples and nasopharyngeal swabs collected in the same 24 hr. Among those with high nasopharyngeal viral loads, i.e. Ct value below 30 and 33, only 1/50 and 4/67 tested negative for N-antigenaemia, respectively. Among those with a negative nasopharyngeal RT-PCR, 8/12 presented positive N-antigenaemia; the lower respiratory tract was explored for six of these eight patients, showing positive RT-PCR in five cases. Discussion This is the first evaluation of a commercially available serum N-antigen detection assay. It presents a robust specificity and sensitivity within the first 14 days after symptoms onset. This approach provides a valuable new option for COVID-19 diagnosis, only requiring a blood draw and easily scalable in all clinical laboratories.

Introduction - Staphylococcus aureus (SA) is the leading cause of infectious endocarditis (IE) and in comparison with other microorganisms, it provokes more serious infections with a higher mortality. Prognostic factors for SAIE are already known but they are not different from those reported for other IE and cannot to explain the excess of mortality. The main aim of this study was to inventory the causes of death of SAIE and second to identify new potential prognostic factors.Patients and methods - We conducted a retrospective qualitative study on all the patients who died during their hospitalization for SAIE in 2008 in 7 administrative regions of France. The qualitative analysis permitted to determine individually the final cause of death and to identify elements from patient characteristics, from the severity of the initial presentation, and from the care received. Then, those elements were selected and collected for each patient. Results - 57 patients were included. The mean age was 67,2 years (+/-16,1 Standard Deviation (SD)). The mean Charlson score was 2,5. The main final causes of death were cardiogenic choc, septic choc and neurologic causes (respectively 19, 17 and 15 patients). The other causes were acute respiratory distress syndrome (7), intraoperative death (4), hepatic insufficiency (3), final renal failure (3), mesenteric infarction (1), acute ischemia of a member (1) and slipping syndrome (1). The cause was composite in 10 cases. New elements related to the patient specificity were dependence (8 patients), pressure ulcer (8 patients) and malnutrition (20 patients). Another eight were treated by non-steroïdal anti- inflammatory drug before admission. About the gravity of the initial presentation, 18 patients had thrombocytopenia < 100 giga per liter. Eight patients had lactate over 2,5 mmol per liter. Respectively 24 (46%) and 12 patients (22,6%) needed vasopressive amines or dobutamine. During hospitalization, the empirical treatment was efficient in 40 patients on the 49 treated and included the optimal antibiotic in 11 cases. The mean time before starting documented antibiotic therapy was 5,2 days (+/-9,1 SD). The molecule and dose of this antibiotic therapy complied with the European standards in 27 cases. On the 35 patients who had an indication for cardiac surgery, only 16 patients undergo surgery. The main cause for lack of surgery was the poor condition of the patient (25,7%). Another surgery was indicated in 15 patient and it was neurosurgery in 33% of the cases. Respectively 17 and 19 patients presented a nosocomial infection or an iatrogenic complication during their hospitalization. It was drug toxicity in 14 cases and iatrogenic events in 12 cases, including skill complications, anticoagulant-linked hemorrhages.Conclusion - This qualitative study show that the main causes of death of the patient with SAIE are cardiogenic choc, neurologic causes and septic choc. It also highlight several potential prognostic factors that should be specifically studied: non-steroidal anti-inflammatory drugs, thrombocytopenia, concordance of antibiotic treatment to the microorganism and to recommendations, respect of surgical indication and occurrence of iatrogenic events., Introduction. Les endocardites à Staphylococcus aureus (ESA) sont les plus fréquentes, les plus graves et celles ayant la mortalité la plus élevée des endocardites. Leurs facteurs pronostiques sont identifiés mais ne diffèrent pas de ceux rapportés pour les autres endocardites et n’expliquent la surmortalité observée. L’objectif principal de cette étude était de recenser les causes de mortalité des ESA et secondairement d’identifier de nouveaux facteurs potentiellement liés à la mortalité. Patients et méthodes. Cette étude rétrospective qualitative porte sur 57 patients décédés pendant leur hospitalisation d’ESA au cours de l’année 2008 dans 7 régions de France. L’analyse qualitative des dossiers permettait une analyse approfondie des éléments pouvant avoir un lien avec la mortalité.Résultats. La moyenne d’âge des patients était de 67,2 ans (+/-16,1). Les principales causes de décès étaient le choc cardiogénique, le choc septique, et les causes neurologiques (15 patients chacun soit 26,3%). Les autres causes de décès étaient le syndrome de détresse respiratoire aigu (7), le décès peropératoire (4), l’insuffisance hépatocellulaire (3), l’insuffisance rénale terminale (3), l’infarctus mésentérique (1), l’ischémie aigue de membre (1) et le syndrome de glissement (1). Huit patients étaient traités par anti-inflammatoire non stéroïdien (AINS). Dix-huit patients avaient une thrombopénie. L’antibiothérapie documentée était initiée en moyenne 5,2 jours (+/- 9,1) après le diagnostic et était conforme aux recommandations dans 27 cas (57%). Sur les 35 patients présentant une indication de chirurgie cardiaque, 16 patients ont été opérés. Au total 29 patients ont présenté une complication iatrogène dont 17 infections nosocomiales et 14 événements iatrogènes médicamenteux. Conclusion. Les principales causes de décès des patients atteints d’ESA sont le choc cardiogénique, les causes neurologiques et le choc septique. Plusieurs éléments sont potentiellement associés au décès : les AINS, la thrombopénie, l’inadéquation des antibiotiques aux recommandations, le non-respect de l’indication chirurgicale et les complications iatrogènes.