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Periwinkle (Catharanthus roseus), a tropical perennial plant, was found to be infected by a phytoplasma. Plants exhibiting virescence, phyllody and variegation symptoms were collected in the states of Minas Gerais and São Paulo, Brazil. The phytoplasma was transmitted by grafting from an infected periwinkle plant to healthy plants and by dodder to a citrus plant. Phytoplasma isolates from periwinkle plants from Brazil had the 16S rDNA gene sequenced and were classified in the 16SrIX group, subgroup A, belonging to the 'Candidatus P. phoenicium' species. Fitoplasmas foram encontrados em vinca (Catharanthus roseus), uma planta tropical herbácea. Plantas exibindo sintomas de virescência, filodia e variegação foram coletadas nos estados de Minas Gerais e São Paulo. O fitoplasma foi transmitido por enxertia a partir de uma planta de vinca infectada para plantas sadias da mesma espécie, e por Cuscuta sp. para uma planta sadia de citrus. Isolados de fitoplasma encontrados em plantas de vinca no Brasil tiveram a região 16S rDNA sequenciada e foram classificados no grupo 16SrIX, subgrupo A, pertencente a espécie 'Candidatus P. phoenicium'.

A Clorose Variegada dos Citros (CVC) tem sido considerada a mais importante doença citrícola no Brasil, mas diversos aspectos de sua epidemiologia ainda não são bem conhecidos. O presente trabalho objetivou estudar o arranjo espacial das plantas afetadas, visando caracterizar a dinâmica da doença em três regiões do Estado de São Paulo (Noroeste, Centro e Sul). Por meio de avaliação de sintomas visuais, foram mapeados, quinzenalmente, três talhões de laranja-doce (Citrus sinensis) Pêra enxertada em limão Cravo (Citrus limonia), em três regiões do Estado de São Paulo, desde julho de 1998 até dezembro de 2000. Para o estudo da dinâmica espacial, foram aplicadas as seguintes análises: seqüências ordinárias; áreas isópatas; lei de Taylor modificada; índice de dispersão e análise de dinâmica e estrutura de focos. As seqüências ordinárias indicaram uma tendência à aleatoriedade na maioria das avaliações, indicando baixa transmissão a plantas imediatamente vizinhas. A análise de áreas isópatas mostrou pouca formação de focos compactos, numa tendência à uniformidade da incidência da CVC. As demais análises demonstraram pouca diferença no padrão espacial da doença entre as regiões, que pode ser considerado levemente agregado. CVC is considered the most important disease of brazilian citrus industry but many aspects of its epidemiology are still unknown. This work aimed to characterize the spatial pattern of CVC affected trees in three regions (Northwest, Center and South) of São Paulo state, Brazil. Three orchards of Pêra sweet orange (Citrus sinensis) grafted on Rangpur lime (Citrus limonia) were evaluated twice a month by visual assessments from July 1998 to December 2000. For each evaluation all plants were inspected and assigned as diseased or healthy and cumulative maps were produced. The following analyses were performed: ordinary runs, isopath areas, Taylor law, dispersion index and foci structure and dynamics analysis. Ordinary runs indicated a trend to randomness. Isopath areas analysis showed few compact foci and a trend to uniform incidence in all areas. The other analysis showed few if any differences between regions and results that could classify CVC pattern as slightly aggregated.

Foram realizados experimentos em ambiente controlado, em câmaras de crescimento, para a antracnose do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) causada por Colletotrichum lindemuthianum, em duas cultivares, Rosinha e Carioca, para a quantificação de componentes monocíclicos. Os componentes monocíclicos avaliados foram período de incubação e severidade da doença, sob as temperaturas de 6, 10, 14, 17, 21, 25, 29 e 33 ºC. A antracnose não se desenvolveu nas temperaturas de 6 e 33 ºC. A severidade foi mais elevada a 17 ºC e o menor período de incubação ocorreu a 29 ºC, para a cv. Rosinha, e 25 ºC para a cv. Carioca. A função beta generalizada mostrou bom ajuste aos dados de temperatura. O efeito do período de molhamento foliar (5, 6, 12, 18, 24, 30, 36, 42, 48 e 54 h) na severidade da doença também foi avaliado. Não houve incremento na severidade da antracnose do feijoeiro para períodos de molhamento superiores a 24 h. As variações de severidade da antracnose do feijoeiro, em relação ao número de horas de molhamento foliar, foram explicadas pelo modelo de Richards. A função Beta-Richards explicou o efeito combinado da temperatura e duração do molhamento foliar na severidade da antracnose do feijoeiro para ambas as cultivares. Monocyclic components of anthracnose caused by Colletotrichum lindemuthianum were quantified on two bean (Phaseolus vulgaris) cultivars Rosinha and Carioca, in growth chambers. Incubation period and disease severity were assessed, at temperatures of 6, 10, 14, 17, 21, 25, 29 and 33 ºC. Anthracnose did not develop at temperatures of 6 and 33 ºC. The severity was highest at 17 ºC and the shortest incubation periods occurred at 29 ºC for the cv. Rosinha and 25 ºC for the cv. Carioca. Beta function was fitted to data of disease severity at different temperatures. The effect of the leaf wetness duration (5, 6, 12, 18, 24, 30, 36, 42, 48 and 54 h) in disease severity was assessed as well. There was no increment in anthracnose severity of the bean for periods of wetness superior to 24 h. The variations of anthracnose in relation to the number of hours of leaf wetness were explained by the Richards model. The Beta-Richards function explained the combined effect of the temperature and leaf wetness duration in the severity of anthracnose, for both varieties.

The progress of the severity of southern rust in maize (Zea mays) caused by Puccinia polysora was quantified in staggered plantings in different geographical areas in Brazil, from October to May, over two years (1995-1996 and 1996-1997). The logistic model, fitted to the data, better described the disease progress curves than the Gompertz model. Four components of the disease progress curves (maximum disease severity; area under the disease progress curve, AUDPC; area under the disease progress curve around the inflection point, AUDPCi; and epidemic rate) were used to compare the epidemics in different areas and at different times of planting. The AUDPC, AUDPCi, and the epidemic rate were analyzed in relation to the weather (temperature, relative humidity, hours of relative humidity >90%, and rainfall) and recorded during the trials. Disease severity reached levels greater than 30% in Piracicaba and Guaíra in the plantings between December and January. Lower values of AUDPC occurred in later plantings at both locations. The epidemic rate was positively correlated (P < 0.05) with the mean daily temperatures and negatively correlated with hours of relative humidity >90%. The AUDPC was not correlated with any weather variable. The AUDPCi was negatively related to both variables connected to humidity, but not to rain. Long periods (mostly >13 h day-1) of relative humidity >90% (that corresponded to leaf wetness) occurred in Castro. Severity of southern rust in maize has always been low in Castro, thus the negative correlations between disease and the two humidity variables. O progresso temporal da severidade da ferrugem polisora causada por Puccinia polysora do milho (Zea mays) foi quantificado em plantios seqüenciais de outubro a maio em diferentes áreas no Brasil durante dois anos (1995-1996 e 1996-1997). O modelo logístico ajustou-se melhor aos dados que o modelo de Gompertz. Quatro componentes da curva de progresso da doença (severidade máxima da doença; área sob a curva de progresso da doença, AUDPC; área sob a curva de progresso da doença ao redor do ponto de inflexão, AUDPCi; e taxa epidêmica) foram usados para comparar as epidemias nas diferentes áreas e nas diferentes épocas de plantio. A AUDPC, a AUDPCi e a taxa epidêmica foram analisadas em relação a variáveis climáticas (temperatura, umidade relativa, horas de umidade relativa >90% e precipitação) medidas durante os ensaios. A severidade da doença atingiu níveis maiores que 30% em Piracicaba e Guaíra nos plantios de dezembro e janeiro. Valores mais baixos de AUDPC ocorreram nos plantios tardios em ambos os locais. A taxa epidêmica correlacionou-se positivamente (P < 0,05) com as temperaturas diárias e negativamente com horas de umidade relativa >90%. A AUDPC não se correlacionou com nenhuma variável climática. A AUDPCi correlacionou-se negativamente com ambas as variáveis ligadas à umidade, mas não se correlacionou com a precipitação. Períodos longos (>13 h por dia) de umidade relativa >90% (que correspondem ao molhamento foliar) ocorreram em Castro. A severidade da doença foi sempre baixa em Castro, o que explica as correlações negativas entre doença e as duas variáveis relacionadas com a umidade.

A evolução de lançamentos e de flores de cupuaçuzeiro (Theobroma grandiflorum) com sintomas de vassoura-de-bruxa e a produção de basidiocarpos do patógeno (Crinipellis perniciosa) foram monitoradas em plantas enxertada e não-enxertadas de um campo experimental no município de Belém, PA. Modelos epidemiológicos (logístico, Gompertz, e as somas logístico + logístico e Gompertz + Gompertz) foram ajustados a curvas de progresso da doença bianuais (1993 e 1994 para incidência da doença em lançamentos e basidiocarpos produzidos nesses lançamentos) e anuais (1994), para incidência da doença em flores e basidiocarpos produzidos nessas flores. A soma de duas equações logísticas apresentou bom ajuste aos dados bianuais e o modelo logístico, aos dados anuais. O início da manifestação dos sintomas esteve, geralmente, associado ao período seco enquanto que a produção de basidiocarpos coincidiu com o período chuvoso. A maior emissão de vassouras-de-bruxa ocorreu de julho a outubro e a maior frutificação, entre maio e julho. An experimental field study was carried out in Belém, Pará, Brazil, in order to monitor the evolution of two diseases in grafted and non-grafted plants: 1) the amount of cupuaçuzeiro (Theobroma grandiflorum) sprouts and flowers with symptoms of witches' broom and 2) the presence of basidiocarps of the pathogen Crinipellis perniciosa. Epidemiological models (logistic, Gompertz, logistic + logistic and Gompertz + Gompertz) were fit to biannual disease progress curves (1993 and 1994 for the incidence of the disease in the sprouts and for basidiocarp production in the sprouts) and annual (1994) for the disease incidence on flowers and for basidiocarps produced in the flowers. The sum of the two logistic equations fit well with biannual data and the logistic model fit the annual data. The appearance of symptoms was generally associated with the dry period, whereas the production of basidiocarps occurred during the rainy period. The amount of witches' broom was highest from July to October and the most fungus fruiting bodies was detected in May-July.

O efeito do agente causal do crestamento bacteriano comum na eficiência fotossintética e na produção do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) foi quantificado. Dois experimentos de campo foram conduzidos durante a safra das águas de 1997, em Piracicaba-SP, com duas cultivares, IAC-Carioca e Rosinha. Diferentes níveis de severidade foram obtidos variando-se o número de inoculações com o patógeno. A severidade da doença, avaliada com auxílio de escala diagramática, não apresentou relação linear significativa (P>0,01) com a produção, enquanto a duração da área foliar sadia (HAD) relacionou-se linearmente de forma significativa (P0.01) with yield, while the healthy leaf area duration (HAD) was significantly (P

Orientadora : Profª.Drª. Louise Larissa May De Mio Coorientador : Prof. Dr. Armando Bergamin Filho Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Defesa: Curitiba, 05/09/2017 Inclui referências ao final de cada capítulo Resumo: A mancha foliar de Glomerella (MFG) e a podridão amarga (PA) são doenças muito severas e causam danos em plantas de macieira da cultivar Gala, a mais plantada no sul do Brasil. Além de também terem sido observados sintomas da doença na cultivar Eva, relatada anteriormente como resistente. As espécies patogênicas pertencem aos complexos Colletotrichum gloeosporioides (cCg), C. acutatum (cCa) e C. boninense (cCb). Os objetivos deste trabalho foram (i) comparar o efeito da temperatura na germinação e crescimento micelial de diferentes espécies de Colletotrichum isoladas de folhas de macieira e, comparar a severidade dos sintomas causados por estas espécies em frutos e folhas destacados das cultivares Gala e Eva; (ii) estudar a sensibilidade de Colletotrichum aos fungicidas mancozeb e tiofanato-metílico comparando regiões de produção no Brasil, cultivares e partes da planta e; (iii) identificar molecularmente isolados de Colletotrichum provenientes dos estados de São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul e, comparar a agressividade de espécies pertencentes a diferentes complexos em folhas das cultivares Gala e Eva. Espécies pertencentes ao cCg tiveram germinação acima de 90% em temperaturas iguais ou superiores a 15 °C, e as espécies pertencentes ao cCa apresentaram maiores porcentagens de germinação a 25 °C. As colônias pertencentes ao cCg apresentaram maior diâmetro em relação às colônias pertencentes ao cCa após 7 dias de incubação a 25 °C. A temperatura ideal para o desenvolvimento de colônias em meio de cultura não diferiu entre os complexos e variou de 23 a 27 °C. Todas as espécies foram capazes de causar sintomas em frutos. A distribuição de sensibilidade a fungicidas variou entre isolados das diferentes partes da planta, dos diferentes estados e das diferentes cultivares e, em muitos casos, a sensibilidade foi reduzida ou inexistente. Foram encontrados isolados resistentes ao mancozeb e este pode ser o motivo para a diminuição do controle das doenças nos pomares. Dos isolados obtidos nos estados de SP, PR, SC e RS, 126 pertencem ao cCa e 102 ao cCg. Estes isolados pertencem a cinco espécies: C. melonis, C. nymphaeae, C. paranaense, C. limetticola e C. fructicola. Em SC, quase 99% dos isolados pertencem à espécie C. fructicola (cCg), mas nos estados de SP, PR e RS predominam espécies pertencentes ao cCa, 100, 89 e 72%, respectivamente. Este é o primeiro relato de C. limetticola em macieira e, além disso, novas espécies de Colletotrichum foram encontradas. As temperaturas simuladas das diferentes regiões produtoras no Brasil não influenciaram a severidade dos sintomas causados por C. nymphaeae, C. fructicola e C. karstii, e na comparação entre cultivares em pomar experimental a AACPD foi significativamente superior em plantas da cultivar Gala em relação a plantas da cultivar Eva. Este é o primeiro relato oficial de sintomas graves de MFG na cultivar Eva, que é considerada resistente. Palavras-Chave: Malus domestica, resistência a fungicidas, epidemiologia. Abstract: Glomerella leaf spot (GLS) and bitter rot (BR) are very severe diseases and cause symptoms and damage in apple cultivar Gala, the most cultivated in southern Brazil. In addition to this, symptoms have been observed and isolates of the pathogen have been obtained from Eva cultivar, reported as resistant. The pathogenic species belong to the complexes Colletotrichum gloeosporioides (Cgc), C. acutatum (Cac) and C. boninense (Cbc). The objectives of this work were (i) to compare the effect of temperature on the germination and mycelial growth of different Colletotrichum species isolated from apple leaves and, to compare the severity of the symptoms caused by these species on detached fruits and leaves of Gala and Eva; (ii) to study the sensitivity of Colletotrichum isolates to mancozeb and thiophanate-methyl fungicides comparing production regions in Brazil, cultivars and parts of the plant; (iii) to identify Colletotrichum isolates from the states of São Paulo, Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul and to compare the aggressiveness of species belonging to different complexes on leaves of Gala and Eva. Species belonging to Cgc had germination of greater than 90% at temperatures equal to or greater than 15 °C, and the species belonging to Cac showed higher germination percentages at 25 °C. The colonies belonging to Cgc grew faster than those of belonging to the Cac after 7 days of incubation at 25 °C. The optimal temperature for the development of colonies in culture medium did not differ between the complexes and varied from 23 to 27 °C. All species were able to cause symptoms on fruit. The distribution of sensitivity to fungicides varied between isolates of the different parts of the plant, the different states and the different cultivars, and in many cases the sensitivity was reduced or non-existent. Higher resistance was detected for mancozeb, which may be the main reason for the reduction of control of the diseases in the field. In isolates obtained in the states of SP, PR, SC and RS,126 strains belong to the Cac and 102 to the Cgc. These strains belonged to five species: C. melonis, C. nymphaeae, C. paranaense, C. limetticola, and C. fructicola. In SC almost 99% of the isolates belong to C. fructicola (Cgc), but in the states of SP, PR and RS species belonging to Cac predominate with 100, 89 and 72%, respectively. This is the first report of C. limetticola on apple and, furthermore, new species of Colletotrichum were found. Under the conditions tested in this study the simulated temperature of different producing regions in Brazil did not influence the severity of the symptoms caused by C. nymphaeae, C. fructicola and C. karstii, and in the comparison between cultivars in experimental orchard, the AUDPC was significantly higher in plants of Gala than in plants of Eva. This is the first official report of severe symptoms of GLS in the Eva cultivar, which was considered resistant. Key-Words: Malus domestica, fungicide resistance, epidemiology.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016. Até meados da última década, as tospoviroses e begomoviroses eram as duas viroses que mais preocupavam os tomaticultores brasileiros. No entanto, em 2006, outra virose, a crinivirose, foi identificada em plantas de tomate no estado de São Paulo. Hoje, as viroses com maior incidência em tomateiro são a begomovirose e a crinivirose. O manejo adequado de doenças transmitidas por vetores ainda é um desafio devido à grande carência de informações sobre os processos epidemiológicos dessas doenças sob condições de campo. Em vista dessa carência de informação, os principais objetivos desse trabalho foram estudar os processos epidemiológicos envolvidos na begomovirose e crinivirose em tomateiro com o intuito de obter informações que possam ajudar na elaboração de estratégias de manejo para a redução dos prejuízos causados por viroses em tomateiro. Os temas deste trabalho foram divididos em três capítulos. O capítulo 1 foi destinado à revisão bibliográfica. O capítulo 2 descreve o estudo do progresso espacial e temporal de begomovirose em tomateiro de crescimento determinado. O capítulo 3 foi destinado ao estudo do progresso temporal e espacial de begomovirose e crinivirose em tomateiro de crescimento do tipo indeterminado. Nos estudos de distribuição e espacial de viroses, parcelas de 15 x 15 plantas foram demarcadas e avaliadas semanalmente, quanto à presença ou ausência de sintomas característicos das viroses. Um monitoramento da população de moscas-brancas, coleta e detecção de vírus em plantas daninhas e cultivadas presentes dentro e/ou ao redor das parcelas experimentais foi realizado. Tomatosevererugosevirus (ToSRV) e Tomatochlorosisvirus (ToCV) foram respectivamente a espécie de begomovirus predominante e a única espécie de crinivirus encontrada nas amostras coletadas. Algumas plantas cultivadas e não cultivadas estavam infectadas com ToSRV ou ToCV, indicando que são potenciais plantas hospedeiras alternativas. Não foi observada correlação positiva entre a incidência de begomovirose ou crinivirose e a flutuação das populações de mosca-branca. Nas áreas monitoradas, o progresso da doença foi invariavelmente rápido, com um padrão levemente agregado das plantas sintomáticas de begomovirus (tomateiro estaqueado e rasteiro) / ou crinivirus (tomateiro estaqueado). Não foi verificada diferença significativa nas análises temporais e espaciais entre as duas espécies virais ou entre áreas de produção. No entanto, foi observada uma diferença significativa entre parcelas experimentais localizadas no centro (PC) e na borda (PE) dos pivôs centrais (área de cultivo) em tomateiro para processamento. Os resultados de análises temporais mostraram que os valores de incidência e área abaixo da curva de progresso da doença de begomovirus foram menores em PC do que em PE. Em análises espaciais, plantas sintomáticas em PC foram mais agregadas que em PE. Todos esses resultados sugerem fortemente que a distribuição de plantas sintomáticas de begomovirus em PC e PE é governada por diferentes mecanismos de disseminação. Embora essas análises temporal e espacial comparativas entre parcelas localizadas na borda e centro só tenham sido realizadas em tomateiro rasteiro, acredita-se que a dinâmica das begomoviroses e criniviroses em tomateiro estaqueado segue mesmo padrão. Em especial, verificou-se que o padrão de distribuição da crinivirose e da begomovirose é semelhante, mesmo as duas viroses apresentando modos de transmissão distintos pela mosca-branca. Esse padrão foi similar ao observado em PE, indicando que a dispersão primária assume papel relevante na disseminação das duas doenças. Levando em consideração os resultados obtidos no trabalho recomenda-se como manejo de viroses em tomateiro: a realização de um planejamento de plantio evitando associação de cultivos susceptíveis a begomovirus e também com bons hospedeiros do inseto-vetor; a prevenção de plantio escalonado; a eliminação de restos culturais e plantas de tomate voluntárias; e o controle do inseto vetor durante todo o cultivo do tomateiro dentro e fora da lavoura até a eliminação total das plantas. Todas essas medidas de manejo devem ser realizadas de forma integrada e regional para o sucesso de controle das viroses em tomateiro. Tospovirus and begomovirus diseases are the two most important viral diseases that affect Brazilian tomato crops in the last two decades. However, in 2006, another viral disease caused by a crinivirus was identified infecting tomato plants in the state of São Paulo, Brazil. Today, the viral diseases with higher incidence in tomato are the ones caused by begomoviruses and criniviruses. Management of vector-borne diseases remains a challenge due to the great lack of information on epidemiological aspects of these diseases under field conditions. In view of this lack of information, the main objectives of this work were to study the epidemiological processes involved in begomovirus and crinivirus diseases in tomato; evaluate the effect of a tomato-free-period in the incidence of the diseases caused by begomovirus and tospovirus in this crop; and evaluate the potential of five plant species as alternative host for Tomato severe rugose virus (ToSRV) and Bean golden mosaic virus (BGMV) in order to obtain information that could help in the development of management strategies to reduce the losses caused by these viral diseases. The subjects of this study were divided into five chapters. Chapter 1 contains the literature review. The chapter 2 describes the spatial and temporal distribution of the begomovirus disease in processing tomato production areas. Chapter 3 reports the temporal and spatial progress of begomovirus and crinivirus diseases in fresh market tomato production areas. In chapters 2 and 3, plots of 15 x 15 plants were marked and weekly evaluated for the presence or absence of characteristic symptoms of these diseases in the plants. Monitoring of the whitefly populations, collection and detection of viruses in weeds and in cultivated plants present inside or around of the experimental plots were carried out. These studies revealed that ToSRV and Tomato chlorosis virus (ToCV) were the predominant begomovirus species and the only crinivirus species found in the areas. Some cultivated and uncultivated plants were infected with ToSRV or ToCV, indicating that they are potential alternative host plants. There was no positive correlation between the incidence of begomovirus or crinivirus disease and the fluctuation of the whitefly population. In the monitored areas, the progress of the diseases was invariably fast, with a slightly aggregated pattern of symptomatic plants infected by begomovirus or crinivirus. There was no significant difference in the temporal and spatial analysis between the two viral species or among the tomato production areas. However, a significant difference was observed between the experimental plots located in the center (PC) and the edge (PE) of the central pivot described in Chapter 2. These results have shown that the values of incidence and the area under disease progress curve of begomovirus were lower in PC than in PE. In the spatial analyses, symptomatic plants in PC were more aggregated than in PE. All these results strongly suggest that the distribution of begomovirus symptomatic plants in PC and PE is ruled out by different spreading mechanisms. Although these temporal and spatial analyses of comparative plots located at the edge and in the center have only been carried out in processing tomato areas, it is believed that the spread of begomovirus and crinivirus disease in fresh market tomato crops follows the same pattern. In particular, it was found that the distribution pattern of crinivirus and begomovirus is similar, although they have different transmission mechanisms by whiteflies. The spatial distribution pattern of these diseases was similar to that observed in begomovirus disease in PE in processing tomato areas, indicating that the primary dispersion assumes an important role in the spread of the two diseases. In Taking all these results together, for the management of tomato viruses it is recommended: avoid areas with susceptible hosts for begomoviruses and good insect-vector hosts; prevention of continuous planting; elimination of crop residues and voluntary tomato plants; insect vector control during the cultivation of tomato inside and outside the field until the total elimination of the crop. All these management measures should be undertaken in an integrated and regional basis for a successful control of these viruses in tomato.