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The history of cotton (Gossypium sp), which has become along past millennia a plant of major economic interest, relies on the dried or charred cotton seeds found in archaeobotanical assemblages. Our capacity to document the dispersal routes of cotton, however, is hampered by the lack of taxonomic resolution at specific levels based on current seed anatomic features. In order to explore the taxonomic signal at the interspecific level of cotton seeds, and the impact of carbonization on this signal, we used linear measurements (length, width and thickness) and 2D geometric morphometrics (GM) comparing modern dried cotton seeds of the four domesticates (G. arboreum, G. herbaceum, G. barbadense, G. hirsutum) and experimentally charred seeds. The shape and form (size + shape) of dried and charred cotton seeds were captured using an outline analysis with a sliding semi-landmarks approach and compared after a Generalized Procrustes Superimposition (GPS). The reaction of cotton seeds to charring at 250 °C during 2 h30 was globally characterized by a size reduction but no major shape deformation; this study also shows that the outline form of the seeds rather than their shape provides more stringent taxonomic discriminations than linear measurements. This pilot study emphasizes the relevance of the GM approach while underlying the limit of this method for the taxonomical study of archaeological cotton seeds.

International audience; 30 ans. La fleur de l'âge ! Cette histoire a commencé avec les pionniers à qui il faut rendre hommage, eux qui ont eu le courage de lancer cette revue francophone en 1992 : ses premiers rédacteurs en chef, Didier Spire, de l'INRA, et Jean Semal, de la Faculté des sciences agronomiques de Gembloux, l'Agence universitaire de la francophonie (AUF), qui a soutenu cette revue dès le premier numéro, mais aussi tous les membres du comité de rédaction et du comité scientifique, garants du sérieux de la revue. Sans oublier les institutions de recherche, INRA, CIRAD et IRD (alors ORSTOM) et l'éditeur John Libbey Eurotext, avec en particulier le travail méticuleux de Chantal Delooz. Comme le disait Didier Spire dans le premier numéro, en mars 1992 : « Nous sommes dans une époque faite de spécialistes... Cahiers Agricultures sera multidisciplinaire et transdisciplinaire ». Elle « proposera à ses lecteurs une vision dynamique des débats de société qui se présentent dans un monde rural en déséquilibre... parce qu'une planète sans paysans deviendra vite un monde inculte ». Parmi ces débats de société, dès le second numéro, Jean Semal évoquait le réchauffement climatique et les énergies fossiles. Mais aussi les menaces sur la biodiversité. Visionnaire ! En 2002, René Lésel, de l'INRA, a brillamment repris le flambeau. Et a maintenu le cap, l'équilibre entre les disciplines et la transdisciplinarité. Puis, fin 2009, c'est Jean-Pascal Pichot, du CIRAD, et Didier Picard, de l'INRA, qui accepteront la charge de conduire la revue. Tout en conservant ces grands principes, ils ont su la faire évoluer, et l'adapter aux exigences scientifiques actuelles. Aujourd'hui, l'équipe actuelle est composée de Christine Rawski, Jean-Yves Jamin et Carmen Renaudeau ; nous avons pris le relais dans une période un peu mouvementée, l'AUF ayant cessé son soutien financier à toutes ses revues, la francophonie scientifique ne lui paraissant plus prioritaire. Heureusement pour les Cahiers Agricultures, nous avons connu la mobilisation de l'AMICA, les Amis des Cahiers Agricultures et du président de cette association d'auteurs et de lecteurs des Cahiers, notre collègue Jean Sibiri Zoundi (Club du Sahel/OCDE), ce qui a permis de convaincre le CIRAD (avec l'aide de Patrick Caron et Jean-Philippe Tonneau) et l'IRD (avec l'aide de Thomas Mourier) de nous apporter leur soutien financier ; cela a fait que la revue, non seulement a pu survivre, mais a continué à publier de plus en plus, et de bons articles, et des articles lus, comme en témoigne la croissance de notre facteur d'impact, qui, même s'il reste modeste, est cependant notable pour une revue francophone ; en témoigne aussi notre place actuelle de « revue phare francophone n o 1 », toutes disciplines scientifiques confondues, dans le classement de Google Scholarce n'est pas tous les jours que l'agriculture est en tête des sciences ! Nous avons aussi dû affronter l'obligation (liée aux marchés publics) de lancer des appels d'offre pour l'édition de notre revue, ce qui nous a conduit à être aujourd'hui publiés par EDP Sciences, éditeur avec lequel nous nous félicitons chaque jour de travailler. Au fil des ans, au-delà des changements de rédacteurs en chef, la revue a bénéficié du soutien continu de son comité de rédaction (https://www.cahiersagricultures.fr/fr/presentation/comite-de-redaction), où se côtoient une diversité de disciplines et de nationalités, comité impitoyable dans la rigueur de la sélection des articles, mais qui sait aussi accompagner les auteurs, jeunes ou moins jeunes, lorsque au-delà d'une forme imparfaite il détecte un fond qui vaut la peine que l'on passe du temps avec ces auteurs. La revue a aussi bénéficié de la vigilance de notre comité scientifique, qui, bien que ne pouvant plus se réunir physiquement, est en train de retrouver une seconde jeunesse sous la houlette de son président Bernard Hubert, pour continuer à nous accompagner. Il faut enfin souligner le rôle le plus ingrat, le moins reconnu, mais pourtant le plus indispensable : celui des centaines de relecteurs qui acceptent d'évaluer en double-aveugle les articles que nous recevons et qui fournissent de précieux conseils tant aux auteurs qu'aux rédacteurs en chef. Chaque année nous les remercions (https://www.cahiersagricultures.fr/articles/cagri/pdf/2022/ 01/cagri220001s.pdf), mais ces trente années de labeur désintéressé pour nous aider méritent de renouveler ces remerciements. Nous avons commencé cet éditorial en rappelant les principes fondateurs de la revue, pluri et transdisciplinarité, et participation, arguments scientifiques à l'appui, aux débats de société sur la place des paysans dans le monde, ou les questions écologiques. Ce sont plus que jamais des principes importants pour la revue, sur lesquels de nouveaux auteurs portent aujourd'hui de nouveaux regards et apportent de nouvelles contributions, depuis des pays très nombreux et très variés, où ces questions ne se posent pas tout à fait dans les mêmes termes selon qu'on est au Nord ou au Sud, à l'Est ou à l'Ouest. Nous avons aussi, pour favoriser cette ouverture au monde, accepté ces dernières années un nombre plus important d'articles en anglais : même si nous

Bananes dessert 'Cavendish' du commerce international, bananes plantains à cuire des marchés du Cameroun, du Congo… ou bananes à cuire et à bière des Pays des Grands Lacs, des millions de bananiers sont cultivés en Afrique. Pourtant, aucune de ces variétés n'est originaire de ce continent ! Toutes viennent d'Asie, centre d'origine du complexe d'espèces. C'est l'histoire de ces bananiers voyageurs que nous retraçons ici.

Coup de tonnerre dans le confinement de fin avril 2020 : on apprend le décès de Lucien Séguy, une délivrance pour lui et sa famille car on le savait très malade depuis plus d'un an. Son collègue de toujours et fraternel ami Serge Bouzinac était justement au Brésil, auprès de leur ami commun l'insigne professeur ès carbone en agriculture João Carlos Moraes de Sá (Juca Sá) de l'Université de Ponta Grossa. A eux deux, ils ont orchestré en portugais un magnifique hommage publié dans le site de la tentaculaire fédération brésilienne de semis sous couvert. Nous l'avons d'ailleurs signalé dans notre hommage à nous. Hommage certes plus modeste publié par la très dynamique amicale des agrotoulousains : ma casuelle extraction agrotoulousaine conjuguée à celles de Lucien et Serge, et à celle Jean-Pierre Sarthou, de surcroît professeur d'écologie et d'agronomie à l'EnsaT, nous ont permis, grâce à la disponibilité, la bienveillance et le brio éditorial de Nathalie Malaval, volontaire de cette formidable association des agrotoulousains, d'éditer un hommage regroupant quelques beaux témoignages recueillis à la hâte. Hommage publié en mai 2020 à la rubrique Carnet, et récemment ré-publié dans la rubrique Actualités de leur site rénové. Ce bouquet d'hommages sera de nouveau republié à l'approche du colloque d'hommage à Lucien Séguy qui devrait se tenir en novembre 2021 à Montpellier, avec l'inestimable appui de Ver de terre Production. Entretemps, et toujours grâce à Nathalie Malaval, le magazine à parution semestrielle Planète Agro va publier un témoignage remarquable de concision signé du pourtant loquace Serge Bouzinac, son fidèle compagnon d'armes agroécologiques avec toujours la vie des sols au centre et les agricultures de monde autour. D'autres témoignages en mode texte libre ont été postés et peuvent encore l'être sur le livre d'or numérique ouvert à cet effet http://lucien-seguy.fr/temoignages.

Cet article étudie les processus d’émergence, les évolutions et les adaptations qu’a connus l’approvisionnement alimentaire sur l’île de La Réunion, depuis l’abolition de l’esclavage en 1848, jusqu’à nos jours. Nous identifions deux trajectoires de transition, au sein desquelles coexistent plusieurs modalités d’organisation de l’approvisionnement. L’article explicite comment les transitions se succèdent dans un continuum temporel, malgré des crises majeures qui affectent durablement les stratégies des acteurs en présence. En particulier, nous montrons comment les bazardiers ont été capables de s’adapter à ces transformations et de résister aux tentatives de discipline collective imposées par les autorités, tout en préservant leur emprise dans la mise en marché des fruits et légumes. This article studies the processes of emergence, evolution and adaptation experienced by the food supply industry of the island of La Reunion between the abolition of slavery in 1848 and today. We identify two main trajectories of transition in which several ways or organising the food supply system co-exist The article explains how transitions succeed one another in a temporal continuum, despite major crises that permanently affect the strategies of the actors involved. In particular, we show how the bazardiers were able to adapt to these transformations and to resist the attempts of collective discipline imposed by the authorities, while preserving their grip on the marketing of fruits and vegetables.

Coffee is cultivated in more than 70 countries of the intertropical belt where it has important economic, social and environmental impacts. As for many other crops, the development of molecular biology technics allowed to launch research projects for coffee analyzing gene expression. In the 90s decade, the first expression studies were performed by Northern-blot or PCR, and focused on genes coding enzymes of the main compounds (e.g., storage proteins, sugars, complex polysaccharides, caffeine and chlorogenic acids) found in green beans. Few years after, the development of 454 pyrosequencing technics generated expressed sequence tags (ESTs) obviously from beans but also from other organs (e.g., leaves and roots) of the two main cultivated coffee species, Coffea arabica and C. canephora. Together with the use of real-time quantitative PCR, these ESTs significantly raised the number of coffee gene expression studies leading to the identification of (1) key genes of biochemical pathways, (2) candidate genes involved in biotic and abiotic stresses as well as (3) molecular markers essential to assess the genetic diversity of the Coffea genus, for example. The development of more recent Illumina sequencing technology now allows large-scale transcriptome analysis in coffee plants and opens the way to analyze the effects on gene expression of complex biological processes like genotype and environment interactions, heterosis and gene regulation in polypoid context like in C. arabica. The aim of the present review is to make an extensive list of coffee genes studied and also to perform an inventory of large-scale sequencing (RNAseq) projects already done or on-going.

Because coffee rust occurs in almost all countries where coffee is grown, it is often cited as the most important coffee disease. In 2012, a destructive series of coffee rust epidemics devastated Central America. The authors describe the Central American coffee rust crisis, including its impacts and plausible causes; detail the breeding strategy used to fight the disease; and highlight future challenges.

Au sein de la Delegation a l’information scientifique et technique, le Cirad dispose de trois bibliotheques ouvertes a tout public specialisees en sciences agronomiques, rurales et environnementales des pays du Sud. La bibliotheque historique du Cirad a Nogent-sur-Marne fait partie de ce dispositif. Sa principale mission est de conserver et de valoriser un patrimoine documentaire sur l’histoire de la recherche francaise en agronomie ...

International audience; Background and Aims Besides bananas belonging to the AAA triploid Mutika subgroup, which predominates in the Great Lakes countries, other AAA triploids as well as edible AA diploids, locally of considerable cultural weight, are cultivated in East Africa and in the nearby Indian Ocean islands as far as Madagascar. All these varieties call for the genetic identification and characterization of their interrelations on account of their regional socio-economic significance and their potential for banana breeding strategies. Methods An extensive sampling of all traditional bananas in East Africa and near Indian Ocean islands was genotyped with simple sequence repeat (SSR) markers, with particular emphasis on the diploid forms and on the bananas of the Indian Ocean islands, which remain poorly characterized. Key Results All the edible AA varieties studied here are genetically homogeneous, constituting a unique subgroup, here called Mchare', despite high phenotypic variation and adaptions to highly diverse ecological zones. At triploid level, and besides the well-known AAA Mutika subgroup, at least two other genetically related AAA subgroups specific to this region are identified. Neither of these East African AAA genotypes can be derived directly from the local AA Mchare diploids. However, it is demonstrated that the East African diploids and triploids together belong to the same genetic complex. The geographical distribution of their wild acuminata relatives allowed identification of the original area of this complex in a restricted part of island South-East Asia. The inferred origin leads to consideration of the history of banana introduction in Africa. Linked to biological features, documentation on the embedding of bananas in founding legends and myths and convincing linguistic elements were informative regarding the period and the peoples who introduced these Asian plants into Africa. The results point to the role of Austronesian-speaking peoples who colonized the Indian Ocean islands, particularly Madagascar, and reached the East African coasts. Conclusions Understanding of the relations between the components of this complex and identifying their Asian wild relatives and related cultivars will be a valuable asset in breeding programmes and will boost the genetic improvement of East African bananas, but also of other globally important subgroups, in particular the AAA Cavendish.

Traditional agricultural systems have been a fundamental research focus of Pacific archaeologists for decades. In many island groups, it has been demonstrated that whole landscapes have been transformed to facilitate increased agricultural production. High-resolution digital elevation models (DEM) derived from recent LiDAR survey data from Efate, Central Vanuatu, have now revealed that much of that island was completely modified by human activity prior to European contact. There are a range of substantial and more minor linear mound and circular features associated with agricultural development and innovation, of which researchers and contemporary populations are largely unaware. Detailed analysis of the features across one alluvial plain provides some quantification of the scale of landscape modification. These new data radically change perceptions of the Efate landscape and contribute to a range of debates including traditional Pacific Island food production, its surplus and sustainability, sociopolitical development, environmental change and depopulation.

Yam, a tuber crop, was domesticated alongside some African cereals and defines a cradle of domestication in West Africa., While there has been progress in our understanding of the origin and history of agriculture in sub-Saharan Africa, a unified perspective is still lacking on where and how major crops were domesticated in the region. Here, we investigated the domestication of African yam (Dioscorea rotundata), a key crop in early African agriculture. Using whole-genome resequencing and statistical models, we show that cultivated yam was domesticated from a forest species. We infer that the expansion of African yam agriculture started in the Niger River basin. This result, alongside with the origins of African rice and pearl millet, supports the hypothesis that the vicinity of the Niger River was a major cradle of African agriculture.

Most articles in the field of resilience feature research that focuses either on the individual, drawing inspiration from studies conducted in psychology, or on social and ecological systems (SES). The resilience of the individual is defined by Masten and Cicchetti (2016) as, “the potential or manifested capacity of an individual to adapt successfully through multiple processes to challenges that threaten the function, survival, or positive development.” Meanwhile, Folke (2016) defines the resilience of social and ecological systems as, “the capacity of a system to absorb disturbance and reorganize while undergoing change so as to still retain essentially the same function, structure, and feedback, and therefore identity.”

Clove farming developed on the east coast of Madagascar a little over a century ago. The species is largely cultivated and farmed by communities of smallholders. This study aims to characterize clove based cropping systems. There are three types of coexisting clove systems: monoculture where clove is the sole crop with inter-rows covered by wild grasses, agricultural parklands where clove is associated with annual crops (rain fed rice, sugar cane, cassava) and finally complex agroforestry systems where clove is associated with other crops (vanilla), fruit trees (lychees, breadfruit, jackfruit) and pepper vines, as well as some forest trees. The study also shows that the majority of existing clove trees in the various cropping systems are over 50–60 years old. Our study aims to characterise the different clove based cropping systems with the intention of establishing a typology by measuring biometric criteria associated with clove trees, by determining the accompanying species and by characterising the horizontal and vertical structuration of plots. From these observations, we suggest some evolutionary hypotheses of clove systems in an attempt to resituate this typology in a historical dynamic implicating the agricultural history of the east coast of Madagascar and the evolution of the smallholders’ strategies.

Textile use of the cotton fibres from the Old World species Gossypium arboreum (Tree Cotton) and G. herbaceum (Levant Cotton) started around eight thousand years ago and possibly earlier. During the third millennium before the present, cotton cultivation, textile use and trading developed strongly in many places of the Indian Subcontinent and the Near East, but the species involved are often undetermined. Gossypium arboreum and G. herbaceum are difficult to distinguish morphologically when dealing with archaeological remains. Many traditional varieties have been described for each of these two species; an evolution is apparent from perennial, rather primitive forms through to annual varieties and modern phenotypes, with adaptations to cultivation in diverse conditions, including cold climates and short summers. The present work examines which varieties could have been cultivated in the Antiquity and in which regions had cotton cultivation spread then. Some extant varieties are hypothesized as close to the cultivars of Antiquity. The geographic distribution of each species probably reflects the initial domestication region and the subsequent adaptations, particularly regarding climate. Recent progress on ancient DNA analysis should permit easier specific assignments of archaeological remains of cotton seeds, fibres, threads or fabrics. L’usage textile des fibres de coton des espèces de l’Ancien Monde, Gossypium arboreum et G. herbaceum, a commencé il y a huit millénaires, et possiblement plus tôt. Au cours du troisième millénaire avant le présent, la culture, l’utilisation textile et le commerce du coton se sont fortement développés dans de nombreux sites du sous-continent Indien et du Moyen-Orient, mais sans détermination, souvent, de l’espèce impliquée dans chaque cas. G. arboreum et G. herbaceum sont très difficilement distinguables morphologiquement dans les vestiges archéologiques. Plusieurs variétés traditionnelles ont été décrites pour chacune des deux espèces ; une évolution apparaît depuis des formes pérennes relativement primitives jusqu’à des types annuels de morphologie moderne, avec l’adaptation à la culture en conditions très diverses incluant climats froids et étés courts. Le présent travail examine lesquelles de ces variétés ont pu être cultivées dans l’Antiquité et dans quelles régions de l’Ancien Monde avait alors diffusé la culture du coton. Certaines des variétés actuelles peuvent être supposées représentatives des cultivars de l’Antiquité. La répartition géographique des deux espèces résulte à la fois du lieu initial de domestication et de leurs adaptations agronomiques, particulièrement concernant le climat. Les progrès récents en analyse des ADN anciens devraient permettre de déterminer plus facilement l’espèce des graines, fibres et textiles archéologiques de coton.

Au XVIIe siècle, Rubens, Vermeer, Rembrandt et bien d'autres utilisaient le bois de chêne de la Baltique, le lin ou le chanvre de Silésie, le pastel de Toulouse, l'indigo des Indes… Chaque oeuvre était " une surface réduite où convergeaient des routes sillonnant le monde entier ", nous dit Benoit Daviron, l'auteur de ce livre. La grandeur de la peinture hollandaise témoigne de la capacité du pays à s'approvisionner en produits de biomasse lointaine, cette matière composée ou issue du vivant. La quête de la biomasse d'un ailleurs lointain écrira l'histoire des trois siècles suivants. Avant que, au XIXe, l'exploitation des énergies fossiles – la biomasse du passé – ne métamorphose les rapports à la biomasse immédiate. C'est une autre histoire, et une économie de l'agriculture plus vaste et plus globale, que Benoit Daviron nous propose. L'agriculture n'y est pas seulement alimentaire, ni la seule à fournir la biomasse. Comment, avant et après les énergies fossiles, les sociétés européennes ont-elles maîtrisé la distance et mobilisé le travail pour satisfaire leurs besoins croissants ? Quelles conséquences pour le reste du monde ? Au fil des périodes, nous découvrons que la capacité à mobiliser énergie et matière, et en particulier le vivant, est le miroir de la richesse et de la puissance du pays leader de son temps. Nous voyons se préciser les contours de l'agriculture dite naguère moderne, et aujourd'hui "conventionnelle" et le rôle central qu'a joué l'industrie chimique dans sa genèse. Cette lecture modifie nos interrogations sur l'avenir. Et, si le prochain leader est asiatique, quel rapport à la biomasse annonce-t-il ? S'appuyant sur une littérature abondante, Benoit Daviron nous présente une synthèse au-delà des frontières disciplinaires, dans laquelle se dessine une histoire longue, communique et politique, de la biomasse. S'il vise prioritairement enseignants, chercheurs et étudiants en agronomie et en économie agricole, ce livre intéressera les historiens et économistes, et aussi un public curieux des questions agricoles et alimentaires, de leurs enjeux passés et à venir.