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6 results on '"Avila, Nicole Labra"'

1. GeoLab: Geometry-based Tractography Parcellation of Superficial White Matter

Author

Vindas, Nabil, Avila, Nicole Labra, Zhang, Fan, Xue, Tengfei, O'Donnell, Lauren J., and Mangin, Jean-François

Subjects
Electrical Engineering and Systems Science - Image and Video Processing, Computer Science - Computer Vision and Pattern Recognition, I.4.6, I.5.3
Abstract

Superficial white matter (SWM) has been less studied than long-range connections despite being of interest to clinical research, andfew tractography parcellation methods have been adapted to SWM. Here, we propose an efficient geometry-based parcellation method (GeoLab) that allows high-performance segmentation of hundreds of short white matter bundles from a subject. This method has been designed for the SWM atlas of EBRAINS European infrastructure, which is composed of 657 bundles. The atlas projection relies on the precomputed statistics of six bundle-specific geometrical properties of atlas streamlines. In the spirit of RecoBundles, a global and local streamline-based registration (SBR) is used to align the subject to the atlas space. Then, the streamlines are labeled taking into account the six geometrical parameters describing the similarity to the streamlines in the model bundle. Compared to other state-of-the-art methods, GeoLab allows the extraction of more bundles with a higher number of streamlines., Comment: Accepted by the ISBI 2023 conference, 5 pages, 3 figures, 3 tables

Published
2023

2. Inference of an Extended Short Fiber Bundle Atlas Using Sulcus-Based Constraints for a Diffeomorphic Inter-subject Alignment

Author

Avila, Nicole Labra, Lebenberg, Jessica, Rivière, Denis, Auzias, Guillaume, Fischer, Clara, Poupon, Fabrice, Guevara, Pamela, Poupon, Cyril, Mangin, Jean-François, Hege, Hans-Christian, Series Editor, Hoffman, David, Series Editor, Johnson, Christopher R., Series Editor, Polthier, Konrad, Series Editor, Rumpf, Martin, Series Editor, Bonet-Carne, Elisenda, editor, Grussu, Francesco, editor, Ning, Lipeng, editor, Sepehrband, Farshid, editor, and Tax, Chantal M. W., editor

Published
2019
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5. PaleoBRAIN : ressusciter le cerveau d’Homo erectus et des Néandertaliens

Author

Balzeau, Antoine, Bardinet, Éric, Bardo, Ameline, Gilissen, Emmanuel, Gómez-Olivencia, Asier, Gómez-Robles, Aida, Heuzé, Yann, Hublin, Jean-Jacques, Hui, Jiaming, Kubicka, Anna Maria, Avila, Nicole Labra, Masi, Shelly, Mounier, Aurélien, Noûs, Camille, Pouydebat, Emmanuelle, Prima, Sylvain, Sala, Nohemi, Santin, Mathieu, Verna, Christine, Wils, Patricia, Filippo, Andréa, Histoire naturelle de l'Homme préhistorique (HNHP), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of African Zoology [Tervuren], Royal Museum for Central Africa [Tervuren] (RMCA), University of the Basque Country/Euskal Herriko Unibertsitatea (UPV/EHU), Department of Anthropology [George Washington University] (GW), The George Washington University (GW), De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Human Evolution [Leipzig], Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig], Max-Planck-Gesellschaft-Max-Planck-Gesellschaft, Collège de France - Chaire Paléoanthropologie, Collège de France (CdF (institution)), Poznan University of Life Sciences (Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu) (PULS), Éco-Anthropologie (EA), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Cogitamus, Mécanismes Adaptatifs et Evolution (MECADEV), Space-timE RePresentation, Imaging and cellular dynamics of molecular COmplexes (SERPICO), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Center for NeuroImaging Research-Human MRI Neuroimaging core facility for clinical research [ICM Paris] (CENIR), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Acquisition et Analyse de Données pour l'Histoire naturelle (2AD), and ANR-20-CE27-0009,PaleoBRAIN,Ressusciter le cerveau d'Homo erectus et des Néandertaliens(2020)

Subjects
[SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract

International audience; La question de la correspondance entre les caractéristiques cérébrales et endocrâniennes est cruciale pour les applications en paléoneurologie et n’a jamais été abordée. Pour ce faire, le projet PaleoBRAIN, financé par l’ANR (ANR-20-CE27-0009), va étudier pour la première fois la corrélation entre la forme du cerveau et celle de l’endocrâne au sein d’un échantillon d’humains actuels en utilisant des acquisitions par imagerie à résonance magnétique (IRM), dont certaines avec une séquence spécifique (UTE) qui permet la caractérisation des tissus osseux. Cette contribution sera décisive pour l’étude détaillée des informations neurologiques provenant d’humains fossiles. Nous reconstruirons ensuite le cerveau d’Homo erectus et le cerveau d’Homo neanderthalensis, ainsi que leurs schémas de croissance respectifs, en tenant compte des spécificités de ces espèces. Au-delà de l’analyse détaillée des relations cerveau-endocrâne pour améliorer notre compréhension de l’anatomie des hominines fossiles, plusieurs objectifs complémentaires sont abordés. Nous analyserons les modèles de variation et de corrélation entre asymétries cérébrales et crâniennes, dont celles concernant les structures internes. Nous aborderons aussi les éventuelles relations entre asymétries du cerveau et latéralisations comportementales sur le même échantillon de volontaires. Tous ces résultats, confrontés à la variation observée chez les hominines fossiles, vont documenter les connaissances sur l’évolution du cerveau et donc sur le lien généralement supposé entre forme et fonction. Nous présentons ici les méthodes, les grands axes de recherche et les premiers résultats de ce projet qui se terminera en 2025. La pluridisciplinarité et l’interdisciplinarité seront des composantes fortes de PaleoBRAIN ainsi que des conditions essentielles pour atteindre nos objectifs scientifiques. En outre, ce projet est engagé dans une politique de science ouverte : tous les ensembles de données d’imagerie virtuelle produits seront mis à la disposition d’autres scientifiques pour leurs recherches.

Published
2022

6. PaleoBRAIN : ressusciter le cerveau d’Homo erectus et des Néandertaliens

Author

Balzeau, Antoine, primary, Bardinet, Éric, additional, Bardo, Ameline, additional, Gilissen, Emmanuel, additional, Gómez-Olivencia, Asier, additional, Gómez-Robles, Aida, additional, Heuzé, Yann, additional, Hublin, Jean-Jacques, additional, Hui, Jiaming, additional, Kubicka, Anna Maria, additional, Avila, Nicole Labra, additional, Masi, Shelly, additional, Mounier, Aurélien, additional, Noûs, Camille, additional, Pouydebat, Emmanuelle, additional, Prima, Sylvain, additional, Sala, Nohemi, additional, Santin, Mathieu D., additional, Verna, Christine, additional, Wils, Patricia, additional, and Filippo, Andréa, additional

Published
2022
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