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Orientador: Wanderley Dias da Silveira Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Mestrado Genética Mestre em Ciências Biológicas

FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais O agronegócio brasileiro está entre as atividades produtivas de maior importância para a economia do país. A cada ano seus índices avançam em nível de produtividade e comercialização. Somado a isso, as discussões sobre a disponibilidade e consumo de proteína animal têm ganhado destaque científico por conta da insegurança alimentar e das imprevisibilidades de futuro. Produzir alimentos com qualidade e em quantidades suficientes para atender ao crescimento populacional, tornou-se um dos maiores desafios da humanidade. Portanto, é importante conhecer e discutir possíveis impactos negativos causados por dípteros muscoides e ácaros hematófagos sobre a produção de ovos. Foram realizados três estudos distintos, o primeiro com o objetivo de conhecer os aspectos produtivos e econômicos de ovos no Brasil, o segundo para discutir a epidemiologia das ocorrências de ácaros hematófagos e avaliar os principais fatores de risco para ocorrência de Musca domestica e o terceiro estimar os impactos econômicos das infestações de dípteros e ácaro hematófagos para um galpão de produção de ovos. Realizou-se a descrição e georreferenciamento das variáveis produtivas, valores de comercialização de ovos, fatores de risco, a partir de banco de dados secundários, entre os anos de 2010 a 2020. A verificação dos principais fatores de risco para M. domestica foi feita empregando-se modelos de regressão logística. Para as análises de impactos econômicos foram construídos modelos estocásticos, aplicando-se a simulação de hipercubo latino, considerando um galpão com 50.000 galinhas poedeiras, durante um ciclo produtivo de um ano. No ano de 2019, o Brasil teve um consumo per capita de 230 ovos por habitante e uma valorização no preço dos ovos em 21%. As linhagens Hy-Line branca, Lohmann Branca, Hisex branca e Dekalb branca foram as mais frequentes (70%). A distribuição espacial das variáveis de risco para ácaros hematófagos mostrou maior presença de roedores (12), canário-da-terra (Sicalis flaveola) (11) e garça-vaqueira (Bubulcus ibis) (8). O intervalo de remoção dos dejetos (OR=1,004; IC95%=1,001 a 1,006; p=0,001), a umidade do esterco (OR=2,56; IC95% = 2,001 a 3,28; p=0,000) e a Regional de Passos (OR=123,81; IC95%=14,47 a 1058,98; p=0,000) foram variáveis predisponentes para ocorrência de M. domestica. Para um galpão com 50.000 galinhas poedeiras estimou-se um impacto médio de R$30.862,26 causado pelas infestações por dípteros muscóides e de R$228.313,67 para ácaros hematófagos. O custo médio para controle de dípteros com ciromazina foi estimado em R$6.282,98 e com diflubenzuron um custo médio de R$6.578,92. O controle químico para ácaros hematófagos com cipermetrina foi estimado em R$6.276,00 e com fluralaner R$16.842,67. As estimativas de custos associadas com as infestações por ectoparasitoses são dispendiosas para os galpões de granjas avícolas de postura. Cabe ressaltar que o custo não é a única ferramenta usada para a tomada de decisão para o controle químico, mas deve-se considerar a eficiência, a sensibilidade e a segurança para os animais e para a produção de ovos. Brazilian agribusiness is among the most important productive activities for the country's economy. Each year its indexes advance in terms of productivity and commercialization. Added to this, discussions about the availability and consumption of animal protein have gained scientific prominence due to food insecurity and the unpredictability of the future. Producing food with quality and in sufficient quantities to meet population growth has become one of humanity's greatest challenges. Therefore, it is important to know and discuss possible negative impacts caused by muscoid diptera and hematophagous mites on egg production. Three different studies were carried out, the first with the objective of knowing the productive and economic aspects of eggs in Brazil, the second to discuss the epidemiology of occurrences of hematophagous mites and assess the main risk factors for the occurrence of Musca domestica and the third to estimate the economic impacts of diptera and hematophagous mite infestations for an egg production poultry house. The description and georeferencing of production variables, egg marketing values, risk factors was carried out from a secondary database, between the years 2010 to 2020. The main risk factors for M. domestica were verified using logistic regression models. For the analysis of economic impacts, stochastic models were built, applying the Latin hypercube simulation, considering a poultry house with 50.000 laying hens, during a one-year production cycle. In 2019, Brazil had a per capita consumption of 230 eggs per capita and an increase in the price of eggs by 21%. The Hy-Line White, Lohmann White, Hisex White and Dekalb White were the most frequent lineages (70%). The spatial distribution of risk variables for hematophagous mites showed a greater presence of rodents (12), land canary (Sicalis flaveola) (11) and cattle heron (Bubulcus ibis) (8). The waste removal interval (OR=1.004; 95%CI=1.001 to 1.006; p=0.001), manure moisture (OR=2.56; 95%CI = 2.001 to 3.28; p=0.000) and the Region of Passos (OR=123.81; 95%CI=14.47 to 1058.98; p=0.000) were predisposing variables for the occurrence of M. domestica. For a poultry house with 50.000 laying hens it was estimated an average impact of R$30.862,26 caused by infestations by muscoid diptera and R$228.313,67 by hematophagous mites. The average cost to control diptera with cyromazine was estimated at R$6.282,98 and with diflubenzuron an average cost of R$6.578,92. The chemical control for hematophagous mites with cypermethrin was estimated at R$6.276,00 and with fluralaner R$16.842,67. Estimates of costs associated with ectoparasitic infestations are costly for poultry houses. It should be noted that cost is not the only tool used for decision making for chemical control, but efficiency, sensitivity and safety for animals and for egg production must be considered.

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior No experimento 1 foi estudado o tipo de ovo (cama ou ninho)sobre a contagem de microrganismos aeróbios mesófilos totais, Enterobacteriaceae, bolores e leveduras presentes na casca dos ovos antes e após a desinfecção, eclosão, eclosão/férteis, fertilidade, e embriodiagnóstico.. Além disso, avaliou-se também a qualidade física dos pintos neonatos. O experimento possuía dois tratamentos (ovos de ninho e ovos de cama). Cada tratamento foi composto por 16 repetições com 70 ovos cada. O tipo de ovo não influenciou a fertilidade dos ovos nem os resultados de incubação (P>0,05). O número de ovos contaminados foi maior no grupo de ovos de cama (P0,05). Quanto à classificação qualitativa dos pintos não houve diferença (P>0,05). Conclui-se que o tipo dos ovos não influencia os resultados de incubação, nem a qualidade dos pintos. No experimento 2 objetivou-se avaliar os efeitos de ovos de ninho e cama e aplicação ou não de ceftiofur em pintos de um dia sobre a microbiologia do saco vitelino do pinto de um dia e desempenho zootécnico (1 a 35 dias). Os pintos foram distribuídos em delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial 2x2 sendo estudados o tipo de ovo (ninho ou cama) e o uso ou não de antibiótico via subcutânea na retirada do nascedouro, totalizando quatro tratamentos. Após o nascimento os pintos foram transferidos para sala de vacinação e receberam via subcutânea 0,05 mL de vacina contra doença de Marek associada ou não ao Ceftiofur. Houve interação entre os fatores estudados para contagens de bactérias mesófilas aeróbicas totais presentes no saco da gema dos pintos (P0,05). Pintos que receberam o Ceftiofur tiveram menor contagem de Enterobacterias quando comparados aos que não receberam (P0,05). O peso e o ganho de peso dos pintos aos sete dias foram maiores para pintos oriundos de ovos de ninho que receberam Ceftofur quando comparado aos pintos oriundos de ovos de cama que também receberam o antibiótico (P0,05). Não houve interação entre os fatores estudados nem efeito individual do tipo de ovo e nem do uso do Ceftiofur para nenhuma das variáveis de desempenho aos 14, 21, 28 e 35 dias (P>0,05). Conclui-se que o uso do antibiótico de forma profilática não contribui para melhorar o desempenho dos frangos de corte.

We studied the on-farm variety of thermotolerant Campylobacter strains isolated from field samples received over a 12-mo period from four broiler-producing companies in southern Brazil. In total, 515 of 807 (63.8%) of analyzed samples were found to be Campylobacter-positive. Campylobacter jejuni and C. coli were detected; the first one being more frequently isolated (98.2%). The highest antimicrobial resistance levels in a subset of 80 C. jejuni strains were found against enrofloxacin (89.5%) and ciprofloxacin (83.3%). Most of the 28 DNA macrorestriction profiles identified in C. jejuni were unique to each sampled broiler company. Genetically related C. jejuni populations were detected on different broiler farms integrated to the same company on different sampling occasions. Undistinguished strains were found in the indoor environment and in broilers on the same farm. The finding of recurrent strains on integrated farms suggests that particular factors or management practices may play a role in the dispersion or carry-over of C. jejuni in the studied broiler companies. Made available in DSpace on 2021-08-03T18:00:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final8623.pdf: 449623 bytes, checksum: 6eed61eaebd20828751f651ca17457de (MD5) Previous issue date: 2021 Applied research note.

Made available in DSpace on 2021-09-02T02:07:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final9750.pdf: 56907 bytes, checksum: 2979b913a8b892e896d3cf16dc5a3ce6 (MD5) Previous issue date: 2021

The objective of this study was to compare the antimicrobial activity of macrophages and serum in laying hen (MM, CC, and CCc) and broiler chicken lineages (TT and LL). Macrophages were evaluated for phagocytic and antimicrobial activity. Microbicidal serum activity was evaluated by the resistance test for serum and the agar test. The results showed that phagocytic activity was higher in males of the MM strain, with 13% of macrophages presenting phagocytosis, while the other lineages studied, and even female MM, presented a rate of 6% of phagocytic cells. However, antimicrobial activity in macrophages from males of CCc lineage and females of TT lineage were higher, eliminating more than 30% of the Salmonella enterica inoculum, while in the other strains, the results were similar, with inoculum reduction below 30%. In the serum resistance assay, female laying lines presented higher antibacterial activity than female broiler lines. In the trials to evaluate the microbicide activity of the serum, females of both broiler and laying lineages presented higher performance when compared with males of the same lineage. Females of laying hen lines (MM and CC) present a greater antibacterium activity than males. These results can contribute to a better understanding of the immune response in broiler chicken and laying hen lineages, to aid development of lineages of birds more resistant to pathogens Made available in DSpace on 2021-11-25T14:00:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final9220.pdf: 375423 bytes, checksum: 93f1118fa449bc634140423360940b25 (MD5) Previous issue date: 2021

Made available in DSpace on 2020-10-21T09:13:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final9524.pdf: 1927359 bytes, checksum: 6f8e3db6d7fc1a2ee8266f900672a3aa (MD5) Previous issue date: 2020

Made available in DSpace on 2020-12-16T09:04:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final9625.pdf: 244895 bytes, checksum: 131818a4fc3df96914c4a535b886d0eb (MD5) Previous issue date: 2020

CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico O objetivo deste estudo foi estabelecer um protocolo para obtenção de plasma rico em trombócitos (PRT) em galinhas. Foram utilizadas 19 galinhas e o projeto foi dividido em duas etapas. Na primeira etapa foram utilizadas amostras de 10 galinhas das quais foram colhidos 7 ml de sangue da veia jugular direita. Foram testados quatro protocolos (P1, P2, P3 e P4) para obtenção de plasma rico em plaquetas (PRP) utilizados em mamíferos. O sangue foi colhido em dois tubos diferentes, um contendo ACD-A e outro ACD-A acrescido de bissulfato de clopidogrel (BC). Na segunda etapa foram utilizadas amostras das 19 galinhas das quais foram colhidos 7 ml de sangue em um tubo contendo apenas ACD-A. Para essa etapa foi utilizado o protocolo P2 empregado em gatos, acrescido de modificação da região de colheita do plasma rico em trombócitos. Os resultados da concentração de trombócitos foram analisadas por meio das médias e desvio-padrão. Foi considerado um delineamento em blocos ao acaso com arranjo em parcela subdividida e o teste de Tukey foi realizado para comparação de trombócitos entre protocolos. A presença do efeito de protocolo e do acréscimo de bissulfato de clopidogrel foi avaliada por meio de análise de variância e teste de Fisher. O teste T pareado foi utilizado para comparação entre hemácias, leucócitos e trombócitos no sangue total e no PRT. Na primeira etapa não houve diferença estatística significativa nos resultados utilizando ou não o BC entre os mesmos protocolos. Nenhum dos protocolos mostrou-se eficaz para a obtenção do PRT. As médias (células/µL) (desvio-padrão) de trombócitos encontrados no sangue total foi de 48.200 (7208), no protocolo P1 4.800 (951), no protocolo P2 10050 (1932), no protocolo P3 6.750 (1292) e no protocolo P4 8.000 (1169). Os protocolos P1 e P2 foram estaticamente diferentes de todos os outros protocolos e os protocolos P3 e P4 não mostraram diferença estatística entre si. Nenhum dos protocolos apresentou resultado favorável para a obtenção do PRT. Na segunda etapa as médias (desvio-padrão) de trombócitos, eritrócitos e leucócitos no sangue total foi de 45.500 (12.900), 1.984.700 (377.700) e 14.300 (3900) respectivamente. Após a centrifugação e colheita do PRT os valores médios (desvio-padrão) obtidos dos trombócitos, eritrócitos e leucócitos foram respectivamente, de 337.900 (93.600), 189.700 (97.700) e 18.300 (5.400). Houve um aumento de 7,43 vezes dos trombócitos no PRT com relação à média do sangue total. A contagem de eritrócitos, leucócitos e trombócitos antes e após a centrifugação foram estatisticamente diferentes entre si. Os trombócitos das aves mostraram sedimentação em região diferente daquela observada nos mamíferos. Conclui-se, portanto, que é possível concentrar trombócitos em galinhas utilizando o protocolo para obtenção de PRP em gatos adaptado com a mudança da região de aspiração do concentrado de trombócitos. The study of platelet-rich plasma (PRP) has been increasing considerably in veterinary medicine, but its progress includes only domestic animals, including dogs, cats and horses. Thrombocytes in birds have similar function to platelets in mammals, but their morphology differs. They are responsible for hemostasis and when activated are able to release growth factors that are responsible for signaling the onset of tissue repair. The objective of this study was to establish a protocol to obtain plasma rich in thrombocytes (PRT) in chickens. A total of 19 chickens were used and the project was divided into two stages. In the first stage, samples of 10 chickens from which 7 ml of blood from the right jugular vein were collected were used. Four protocols (P1, P2, P3 and P4) were tested to obtain platelet rich plasma (PRP) used in mammals. Blood was collected in two different tubes, one containing ACD-A and another ACD-A plus clopidogrel bisulfate (BC). In the second step, samples of the 19 chickens from which 7 ml of blood were collected in a tube containing only ACD-A were used. For this step, the P2 protocol used in cats was used, plus modification of the collection region of the thrombocyte-rich plasma. The results of thrombocyte concentration were analyzed by means and standard deviation. A randomized complete block design with subdivided plot arrangement was considered and the Tukey test was performed to compare thrombocytes between protocols. The presence of the protocol effect and addition of clopidogrel bisulfate was evaluated by means of analysis of variance and Fisher's test. The paired T-test was used to compare red blood cells, leukocytes and thrombocytes in whole blood and PRT. In the first step there was no significant statistical difference in the results using or not the BC between the same protocols. None of the protocols proved to be effective in obtaining PRT. The mean (cell / μL) of the thrombocytes found were: total blood was 48,200 (7208), protocol P1 4,800 (951), protocol P2 10050 (1932), protocol P3 6,750 (1292) and in protocol P4 8,000 (1169). The P1 and P2 protocols were statically different from all other protocols, and the P3 and P4 protocols showed no statistical difference between them. None of the protocols presented a favorable result to obtain the PRT. In the second stage the mean (standard deviation) of thrombocytes, erythrocytes and leukocytes in whole blood was 45,500 (12,900), 1,984,700 (377,700) and 14,300 (3900) respectively. After centrifugation and collection of the PRT the mean values (standard deviation) of thrombocytes, erythrocytes and leukocytes were respectively 337,900 (93,600), 189,700 (97,700) and 18,300 (5,400). There was a 7.43 fold increase in thrombocytes in the PRT compared to the mean total blood. The counts of erythrocytes, leukocytes and thrombocytes before and after centrifugation were statistically different from each other. The thrombocytes of the birds showed sedimentation in a region different from that observed in mammals. It is concluded, therefore, that it is possible to concentrate thrombocytes in chickens using the protocol for obtaining PRP in cats plus the change in the aspiration region of the thrombocyte concentrate.

Made available in DSpace on 2019-11-06T00:39:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final8688.pdf: 546687 bytes, checksum: f1bce72bc101b61170d39db79f59f24b (MD5) Previous issue date: 2019

The objective of this study was to evaluate performance, hematological parameters, leukocyte counts, and respiratory microbiota of broilers under heat stress receiving eucalyptus oil supplementation. Cobb broilers (n = 1200) were randomly distributed on the first day of life in a factorial arrangement with additional treatment (2 × 2 + 1) with two periods of oil administration via drinking water (daily, from 18 to 35 days of life) and two periods of oil administration via spray (daily, from 18 to 35 days of age) plus a control treatment, consisting of twelve replications, with 20 animals each. The birds were kept in a controlled environment with constant temperature at 32 °C to induce heat stress by infrared heaters. Eucalyptus oil was supplied by drinking water (1 L of oil to 4000 L of water) or by spray applications with a pump (1 L of oil to 200 L of water). Bird weight was recorded at 42 days of age, along with remaining feed, to determine weight gain, feed intake, and feed conversion. In addition, one blood sample from each bird repetition was collected for hematological and leucocytic evaluation. To assess respiratory microbiota, a tracheal flushing was performed for bacteria counts. There was no difference in performance, hematological parameters, and leukocyte counts, except hematocrit, which was lower in birds that received eucalyptus oil after 18 days of age. No significant differences were observed in the respiratory microbiota comparing oil-treated and -untreated groups. Although it was not possible to verify statistical difference, the birds that received eucalyptus oil via spray plus spray from 18 days old showed lower bacterial counts and absence of isolation of Gram negatives, while the control group was the one with the highest number of Gram negatives. Therefore, eucalyptus oil can be used for heat-stressed broilers without impairing their development.

Made available in DSpace on 2019-09-28T00:47:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final9112.pdf: 1976315 bytes, checksum: b03709f76812cf7d60b147119db4c9b4 (MD5) Previous issue date: 2019

This study aimed to determine sorption isotherms of ingredient and poultry diet. The samples were encapsulated in capsules and dehydrated by oven-drying in a desiccator for more than 24 hours. The samples were transferred to desiccator containing water in the base and placed in the oven, with one sample of each material being removed at incremental intervals. The sample was weighed and for determination of water activity and for dry matter. The moisture and water activity data were evaluated by eight mathematical models. The GAB mathematical model fitted the experimental data to constitute the isotherm for each material. Type II sorption isotherms were found, except for BHT: demonstrated values that did not fit the isotherm determination. The hygroscopic behavior of the ingredients in ascending order were: L- threonine, limestone, BHT, DL- methionine, L-valine, L- tryptophan, phosphate, kaolin, vitamin supplement, salt, mycotoxin deactivator, pelleted rooster diet, mash rooster diet, mash layer diet, pelleted layer diet, corn, bacitracin zinc, vitamin mineral supplement, phytase, rice bran, wheat bran, mineral supplement, soybean meal, coccidiostat, L- Lysine HCl and choline chloride. Ingredients and diets have different hygroscopic behavior: can lead to deterioration and low accuracy in nutritional values of diet, since formulation is based on as-is fed basis. Resumo: Objetivou-se determinar as isotermas de adsorção dos ingredientes e da dieta das aves. As amostras foram encapsuladas e desidratadas por secagem em forno em um dessecador durante mais de 24 horas. As amostras foram transferidas para o dessecador contendo água na base e colocadas na estufa, com uma amostra de cada material a ser retirada em intervalos crescentes. A amostra foi pesada para a determinação da atividade da água e da matéria seca. Os dados relativos à humidade e à atividade da água foram avaliados por oito modelos matemáticos. O modelo matemático GAB foi o que melhor ajustou os dados experimentais para constituir a isoterma de cada material. Foram encontradas isotermas de adsorção de tipo II, exceto para BHT: valores demonstrados que não se encaixavam na determinação de isotermas. O comportamento higroscópico dos ingredientes em ordem crescente foi: L-treonina, calcário, BHT, DL-metionina, L-valina, L-triptofano, fosfato, caulim, suplemento vitamínico, sal, desativador de micotoxinas, ração peletizada para galo, ração farelada para galo, ração farelada para postura, ração peletizada para postura, milho, bacitracina-zinco, suplemento vitamínico-mineral, fitase, farelo de arroz, farelo de trigo, suplemento mineral, farelo de soja, coccidiostático, L-lisina, HCl e cloreto de colina. Os ingredientes e dietas têm comportamentos higroscópicos diferentes: podem levar à deterioração e baixa precisão nos valores nutricionais da dieta, uma vez que a formulação é baseada na matéria natural. Resumen : Este estudio tenía como objetivo determinar las isotermas de absorción de los ingredientes y la dieta de las aves. Las muestras se encapsularon en cápsulas y se deshidrataron por secado en horno en un desecador durante más de 24 horas. Las muestras se transfirieron al desecador que contiene agua en la base y se colocaron en el horno, retirándose una muestra de cada material a inter valos incrementales. La muestra se pesó y para la determinación de la actividad del agua y la materia seca. Los datos de humedad y actividad del agua fueron evaluados por ocho modelos matemáticos. El modelo matemático del GAB ajustó los datos experimentale s para constituir la isoterma de cada material. Se encontraron isotermas de sorción de tipo II, excepto para el BHT: valores demostrados que no encajaban en la determinación de la isotermia. El comportamiento higroscópico de los ingredientes fue: L treonin a, piedra caliza, BHT, DL metionina, L valina, L triptófano, fosfato, caolín, suplemento vitamínico, sal, desactivador de micotoxinas, dieta del gallo en pellets, dieta de la capa de puré, dieta de capas peletizadas, maíz, bacitracina zinc, suplemento vita mínico mineral, fitasa, salvado de arroz, salvado de trigo, suplemento mineral, salvado de soja, coccidiostático, L lisina HCl y cloruro de colina. Los ingredientes y las dietas tienen diferentes comportamientos higroscópicos: pueden llevar a un deterioro y a una baja precisión en los valores nutricionales de la dieta, ya que la formulación se basa en su estado. Made available in DSpace on 2021-08-11T19:00:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final9640.pdf: 399064 bytes, checksum: 7095a176eeb0e7193996a849c257c25f (MD5) Previous issue date: 2020

The objective of this study was to determine the energy value of pasta waste through a metabolism trial and determine the best level of its inclusion in broiler diets. In the metabolism trial, sixty 14-day-old birds were assigned to two treatments (control diet and a diet in which 30% was replaced by the byproduct) with six replicates and five birds per experimental unit. In the performance trial, 525 one-day-old chicks were assigned to treatments consisting of five levels of pasta waste (0, 100, 200, 300, and 400 g kg−1) in the diet, with seven replicates and 15 birds per experimental unit, in a completely randomized design. The phases of up to 7, 21, 35, and 42 days of age were evaluated. At the end, two broilers with average weight were selected per plot for carcass evaluation. An economic analysis was undertaken. The calculated apparent metabolizable energy (AME) value of the waste was 3812 kcal kg−1, and its nitrogen-corrected AME was 3616 kcal kg−1. In the performance trial, no significant difference was detected from 1 to 7 days. However, in the other phases, a decreasing effect was observed on feed intake, weight gain, slaughter weight, hot- and cold-carcass weights, empty- and full-gizzard weights and yields, cuts (chest, drumstick, thigh, wings, and back), and feed conversion worsened. The revenue and gross margin alculated for the diets decreased with pasta waste. Therefore, pasta waste is not a viable alternative, except in the pre-starter phase of broilers. Made available in DSpace on 2018-12-05T23:50:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final9037.pdf: 506131 bytes, checksum: 5f3726e851b4d1c863276be9e73ff8db (MD5) Previous issue date: 2018-12-05

A avicultura brasileira é um dos setores do agronegócio que mais gera lucros para o país. A posição de destaque do Brasil, como segundo maior produtor e maior exportador de carne de frangos no mundo desde 2010, impulsiona várias linhas de pesquisa nesta área. O estudo morfológico do aparelho digestório é uma delas, uma vez que está diretamente ligado a conversão alimentar, rendimento de carcaça e ganho de peso, características fundamentais a rentabilidade do setor. No presente trabalho, as aves pesquisadas foram AP95, uma linhagem de corte. A tese foi fracionada em três capítulos, sendo o primeiro referente a importância da avicultura no Brasil, morfologia e irrigação do aparelho digestório, assuntos abordados nos demais capítulos. No segundo e terceiro capítulos, já redigidos no formato para publicação, objetivou-se descrever a origem e distribuição da artéria celíaca e mesentérica caudal, respectivamente. Os estudos realizados nesse trabalho oferecem um padrão de ramificação das principais artérias que nutrem os ógãos ligados a digestão e absorção de nutrientes em aves da linhagem AP95, podendo servir como subsídio a outros trabalhos, principalmente acerca da morfologia animal descritiva. Brazilian poultry farming is one of the agribusiness sectors that most generates profits for the country. Brazil's leading position, as the second largest producer and largest exporter of chicken meat in the world since 2010, drives several lines of research in this area. The morphological study of the digestive tract is one of them, since it is directly related to feed conversion, carcass yield and weight gain, fundamental characteristics to the profitability of the sector. In the present study the lineage studied was the AP95, are broilers. The thesis was divided in three chapters, the first referring to the importance of poultry farming in Brazil, morphology and irrigation of the digestive tract, subjects discussed in the other chapters. In the second and third chapters, already written in the format for publication, the objective was to describe the origin and distribution of the celiac and mesenteric caudal arteries, respectively. The studies carried out in this work offer a pattern of branching of the main arteries that feed the digestive and nutrient absorption organs in broilers of the AP95 lineage, and may serve as a subsidy to other works, especially descriptive animal morphology. Tese (Doutorado)

Resumo: O objetivo deste trabalho é estudar o impacto de mudanças em curso e planejadas na logística brasileira das cadeias produtivas de aves e suínos. Buscou-se determinar os fluxos comerciais de milho e soja entre os estados brasileiros, o efeito da nova configuração de logística nos preços desses cereais e seu impacto nos custos de produção de suínos e aves e seus produtos nos mercados nacional e internacional. Conclui-se que as mudanças na logística brasileira deverão afetar a competitividade e a dinâmica espacial das cadeias de suínos e aves. Adicionalmente, para a redução do custo do transporte dos produtos da agroindústria da carne, é necessário melhorar a malha rodoviária e a logística entre as regiões de processamento e os centros consumidores e exportadores. Made available in DSpace on 2018-10-19T00:49:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final8587.pdf: 791784 bytes, checksum: 2936ed259916f5175b654e504fbe742f (MD5) Previous issue date: 2018-10-18

Biogenic amines (BAs) represent a considerable toxicological risk in some food and feed products. They are formed under unhygienic conditions during storage and processing; therefore, an increase in the concentrations of those metabolites is related to putrefaction. Because BAs are thermostable, they remain in food and feed that have undergone heat treatment. There are several toxicological effects, especially caused by histamine, when high concentrations of BAs are ingested by humans, depending on the food itself and also on individual susceptibility and individual health status. The present paper reviews the main BAs in meat products, their use as spoilage indicators, the risk on human health and also the contamination of by-product meals. Furthermore, we highlight the state of art regarding impact of BAs on poultry, meat and eggs. Made available in DSpace on 2020-03-03T00:38:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Areviewonbiogenicaminesfeddern2019.pdf: 290092 bytes, checksum: 98c77fbd9d42327e91231a77801feae2 (MD5) Previous issue date: 2019

The aim of this study was to evaluate the effect of digestible threonine supplementation in the starter diet on the performance, intestinal parameters, and nutrient metabolism of broilers derived from breeders of different ages. In total, 480 one-day-old Cobb chicks, derived from 38-or 49-week-oldbreeders, were housed in experimental battery cages until 21 days of age and fed four different threonine levels (800, 900, 1,000, or 1,100 mg/kg) in the starter feed. A completely randomized experimental design in a 2x4 factorial arrangement (breeder age x threonine levels) was applied, totaling eight treatments with five replicates of 12 birds each. Broilers from older breeders fed 800 mg digestible threonine/kg of diet presented higher weight gain, with a positive linear effect. There was also an interaction between breeder age and threonine levels for the weight gain of 21-d-old broilers supplemented at maximum level of 1,003 mg Thr/kg diet during the starter phase. There was no effect of breeder age or threonine levels on nutrient metabolism during the period of 17-21 days. There was no influence of breeder age or threonine levels in the starter diet on intestinal morphometric measurements, absorption area, or percentage of goblet cells.

Genetic selection for production traits has resulted in a rapid improvement in animal performance and development. Previous studies have mapped quantitative trait loci for body weight at 35 and 41 days, and drum and thigh yield, onto chicken chromosome 4. We investigated this region for single nucleotide polymorphisms and their associations with important economic traits. Three positional candidate genes were studied: KLF3 (Krüeppel-like factor 3), SLIT2 (Slit homolog 2), and PPARGC1A (peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator 1 alpha). Fragment sequencing of these genes was conducted in 11 F1 animals, and one polymorphism in each gene was selected and genotyped in an F2 population (N = 276) and a paternal broiler line TT (N = 840). Associations were identified with growth, carcass, and fat traits in the F2 and the paternal line (P < 0.05). Using single markers in both the F2 and the TT line, KLF3 was associated with weight gain (P < 0.05), PPPARGC1A was associated with liver and wing-parts weights and yields (P < 0.05), and SLIT2 was associated with back yield (P < 0.05) and fat traits (P < 0.05). Using multiple markers, KLF3 lost its significance in both populations, and SLIT2 was associated with feed conversion only in the TT population (P < 0.05). The QTLs mapped in the F2 population could be partly explained by PPARGC1A and SLIT2, which were associated with body weight at 35 and 41 days, respectively, and with drum and thigh yield in the same population. The results of this study indicate the importance of these genes for production traits. Made available in DSpace on 2018-01-26T23:41:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final7994.pdf: 340768 bytes, checksum: 9f1dba030d9e11c5739d24755faa3ad0 (MD5) Previous issue date: 2015-10-05

This study aims to compare non-linear models fitted to the growth curves of quail in order to determine which model best describes the growth , to verify the similarity of the models by analyzing estimates of the parameters and to apply the model identity in different groups of strains and Treatments . We used the weight and age data from European quails (Coturnix coturnix coturnix) from three strains, in a 2x4 factorial design, housed in a completely randomized design with two levels of energy and four levels of crude protein, with six replications. Non-linear models were used: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Logistic and Gompertz. To choose the best model we used the adjusted coefficient of determination, the percentage of convergence, the Mean Square Residue, the Durbin - Watson test, the Akaike information criteria and the Bayesian information criteria as evaluators of the quality of fit. We used cluster analysis to verify, based on average estimates of the parameters, the similarities between the models. We tested the identity of the models in order to verify whether the curve parameters for the eight treatments and for the three strains, would be equal. Among the models studied, the Logistic was the most appropriate to describe the growth curves. The Logistic and Richards models were similar in the analyzes irrespective of strain, so the analysis of Lineage 1, 2 and 3. There was no significant difference for the chosen parameters between treatments within each strain, however, there was significant difference, except for treatment 5, for the parameters of strains within each treatment, caused by the adult weight. Objetivaram-se, neste estudo, comparar modelos não lineares ajustados às curvas de crescimento de codornas para determinar qual modelo que melhor descreve o crescimento, verificar a similaridade dos modelos analisando as estimativas dos parâmetros e, aplicar a identidade de modelos em diferentes grupos de Linhagens e Tratamentos. Para a análise, foram utilizados os dados peso e idade de codornas européias de corte (Coturnix coturnix coturnix) proveniente de três linhagens, em um esquema fatorial 2x4, instalado em um delineamento inteiramente casualizado, com dois níveis de energia metabolizável e quatro níveis de proteína bruta, com seis repetições. Os modelos não lineares utilizados foram: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Logístico e Gompertz. Para a escolha do melhor modelo utilizou-se o coeficiente de determinação ajustado, o Percentual de convergência, o Quadrado Médio do Resíduo, o Teste de Durbin-Watson, o Critério de informação Akaike e o Critério de informação Bayesiano como avaliadores da qualidade do ajuste. Utilizou-se a análise de agrupamento para verificar, baseado nas estimativas médias dos parâmetros, a similaridades entre os modelos. Testou-se a identidade de modelos para verificar se os parâmetros das curvas, para os oito tratamentos e para as três linhagens, seriam iguais. Entre os modelos estudados, o Logístico foi o mais adequado para descrever as curvas de crescimento. Os modelos Logístico e Richards foram considerados similares nas análises sem distinção de linhagem, assim também nas análises das Linhagem 1, 2 e 3. Não houve diferença significativa para os parâmetros do modelo escolhido entre tratamentos dentro de cada linhagem, contudo, houve diferença significativa, exceto para o Tratamento 5, para os parâmetros entre linhagens dentro de cada tratamento, ocasionada pelo peso adulto.

The goal of the present work was to analyze the Gompertz functions in order to describe the growth of hillbilly broilers Color Plume (CPK) subjected to different levels of digestible lysine. On the experiment were used 432 chickens from one day old, was divided into three stages: initial, growth and finale respectively corresponding to the ages from 1 to 21, from 22 to 77 days of age and from 78 to 84 days of age. During the initial phase, the birds were reared on shavings beds with access to water, food and a heating source until after 21 days of age, the birds had access to paddocks. After 21 days of age, the birds which were in terms of the medium weight were distributed randomly in four treatments of 27 birds, with four replicates each one and 10 birds per replication (5 males and 5 females) were chipped with microchip brand Animall TAG and dimensions 12x2 mm. Treatments were represented by different lysine levels (0.850, 0.970, 1.090; 1.210%) on the experimental diet. The diets used were based on corn and bran soybean, and were formulated to meet the nutritional requirements at each stage of creation, as suggested by Rostagno et al. (2011), except lysine. Diets and birds were weighed weekly to determine the performance (weight gain, feed intake and feed conversion). Gompertz curves adjusted showed good correlation coefficients above 90%, and good values of Durbin Watson test accurately, estimating the average weight gain, and the consumption ration of mixed batch of free range broiler chickens. After the tests comparison between Gompertz parameters of the model for each level of lysine was determined that: the only parameter that varied was A, since B = 0.0329 and C = 45.819 parameters presented not significant differences. At the level of digestible lysine 0.850%, A = 4870.3, 0.970% A = 4894.9, 4784.3 A = 1.09%, 1.21% A = 4740. Among them, the parameter A in 0.970% level, differed from the others, ie, showing a higher body weight at maturity. Based the performance results, it is recommended for free range broiler CPK chickens of both sexes, to use a level of digestible lysine up to 0.970% on the period 22-77 days of age. After comparison tests between the Gompertz parameters of the model for each lysine level was determined for female that: the only parameter that varied was A, since B = 0.0356 and C = 45.54 parameters presented not significant differences. In males it has been concluded that only a single equation may represent the growth in four levels of lysine. The lysine levels did not influence (P> 0.05) carcass variables, except the yield of abdominal fat, than for females improved quadratically up to the level of 1.064%, for males there was a quadratic effect. O presente trabalho objetivou-se utilizar o modelo não linear de Gompertz para descrever o crescimento de frangos caipira da linhagem Colorcpk Plumé (CPK), de ambos os sexos e entre os sexos, submetidos a diferentes níveis de lisina digestível. Foram utilizados 432 frangos com um dia de idade, o experimento foi dividido em três fases: inicial, crescimento e final correspondendo respectivamente às idades de 1 a 21, 22 a 77 e 78 a 84 dias de idade. Na fase inicial as aves foram criadas sobre cama de maravalha com acesso a água, ração e fonte de aquecimento e uma única dieta. Aos 21 dias de idade, as aves em função do peso médio foram distribuídas num delineamento inteiramente casualizado, em quatro tratamentos com quatro repetições de 27 aves por unidade experimental, e dentre elas, 10 aves de cada repetição (5 machos e 5 fêmeas) foram chipadas com microchips da marca Animall TAG e dimensões de 12x2 mm. Os tratamentos foram representados pelos diferentes níveis de lisina digestível (0,850; 0,970; 1,090; 1,210%) na dieta experimental na fase de crescimento. As dietas foram à base de milho e farelo de soja e formuladas para atender as exigências nutricionais em cada fase de criação, conforme sugerido de Rostagno et al. (2011), exceto lisina digestível. As rações e as aves foram pesadas semanalmente para determinação do desempenho (ganho de peso, consumo de ração e conversão alimentar), as aves chipadas também eram pesadas individualmente a cada 7 dias. Aos 84 dias de idade as aves chipadas foram abatidas, totalizando 160 aves. As características de carcaça avaliadas foram calculadas em relação ao peso corporal após jejum. As curvas de Gompertz ajustadas apresentaram bons coeficientes de determinação, acima de 90%, e bons valores do teste de Durbin Watson, estimando com boa acurácia o peso médio, ganho de peso e consumo de ração dos frangos caipira. Após os testes de comparação entre os parâmetros do modelo de Gompertz para cada nível de lisina para o lote misto, determinou-se que somente o parâmetro A deveria variar, pois os parâmetros B=0,0329 e C=45,819 não apresentaram diferenças significativas. No nível de lisina digestível 0,850% A=4870,3; 0,970% A=4894,9; 1,09% A=4784,3; 1,21% A=4740; dentre eles o parâmetro A no nível 0,970% diferiu dos demais, ou seja, maior peso corporal a maturidade. Com base nos resultados de desempenho, recomenda-se, para aves caipiras da linhagem CPK de ambos os sexos o nível de lisina digestível na ração de 0,970% no período de 22 a 77 dias de idade. Após os testes de comparação entre os parâmetros do modelo de Gompertz para cada nível de lisina, determinou-se para fêmeas que somente o parâmetro A deveria variar, pois os parâmetros B=0,0356 e C=42,54 não apresentaram diferenças significativas. Para os machos concluiu-se que apenas uma única equação pode representar o crescimento nos quatro níveis de lisina digestível. Os níveis de lisina digestível não influenciaram (P>0,05) as variáveis de carcaça, exceto o rendimento de gordura abdominal, que para as fêmeas melhorou de forma quadrática até o nível estimado de 1,064%.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:33Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-05-08Bitstream added on 2014-06-13T21:06:28Z : No. of bitstreams: 1 amoroso_l_dr_jabo.pdf: 911409 bytes, checksum: 08411eef5f28e10b8e5b18153c1a6e73 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) A água é um recurso natural escasso que deve ser utilizada de forma racional e apresentar qualidade química, física e microbiológica. Neste contexto, o presente trabalho avaliou a densitometria óssea, os níveis séricos de cálcio e fósforo, a histologia, a microscopia eletrônica de varredura, a morfometria intestinal e renal, o desempenho de frangos de corte, a qualidade microbiológica e química da água de consumo em frangos de corte tratados com água filtrada e não filtrada. Observou-se que a densitometria óssea apresentou níveis crescentes aos 14 e aos 21 dias de idades, estabilizando-se aos 45 dias de idade. A densidade mineral óssea foi maior na epífise distal de aves que ingeriram água filtrada fazendo com que estas aves resistissem a uma maior pressão óssea nesta região em relação às aves que ingeriram água não filtrada. Os valores médios de cálcio sérico não apresentaram variações significativas entre os tratamentos analisados. Por outro lado, os níveis de fósforo sérico de aves tratadas com água filtrada foram menores em relação às que receberam água não filtrada. Na microscopia eletrônica de varredura, observou-se que enquanto a densidade dos vilos intestinais aumentou em aves que receberam água não filtrada, a integridade intestinal foi mantida em frangos tratados com água filtrada em resposta à sua condição microbiológica. Na análise macroscópica do intestino delgado e dos rins, não houve diferença entre os tratamentos para as medidas de comprimento, largura, peso absoluto e relativo dos órgãos. Na morfometria intestinal, observou-se que o comprimento das vilosidades e o número de células caliciformes não variaram entre os tratamentos. Entretanto, houve aumento na profundidade das criptas intestinais em aves que receberam água não filtrada provavelmente em função do aumento da taxa de turnover intestinal... Water is a lean natural resource that must be used in a rational way and must be present chemical, physical and microbiological quality. In this context, the present work evaluated bone densitometry, serum levels of calcium and phosphorus, chicken performance, chemical, physical and microbiological quality of consumption water by chickens treated with filtered water and no filtered. It was observed that the bone densitometry presented crescent levels from 14 to 21 days old, and it was being stabilized on 45 days old. The bone mineral density was larger on the epiphyisis distal of birds that ingested filtered water doing these birds to resist a larger bone pressure in this area comparing to birds that ingested no filtered water. The medium values of serum calcium didn't present significant variations among the analyzed treatments. On the other hand, the serum levels of phosphorus of birds treated with filtered water were smaller in relation to the one that received water no filtered. On the scanning electron microscopy, it was observed that while the density of intestinal villi increased in birds that received no filtered water, the intestinal integrity was maintained in chickens treated with water filtered in response to their microbiological condition. In macroscopic analysis of the small intestine and of the kidneys, there wasn´t difference among the treatments for length measures, width, absolute and relative weight of the organs. In the intestinal morphometry, it was observed that the length of the villi and the number of goblet cells didn't vary among the treatments. However, there was increase of small intestinal crypts depth in birds that received no filtered water, probably in function of the tax of intestinal turnover increase. Moreover, length intestinal villi were more significant in duodenum of birds that ingested water no filtered in relation to filtered water... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-07-31Bitstream added on 2014-06-13T21:06:05Z : No. of bitstreams: 1 furuta_pi_dr_jabo.pdf: 1073038 bytes, checksum: 5e772861c92b1e24fce5e65feea5cf02 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A neosporose é uma doença causada pelo protozoário Neospora caninum, e causa um grande impacto econômico na pecuária mundial. Sabe-se que muitos mamíferos são considerados hospedeiros intermediários, e que recentemente, foi confirmado o papel das aves no ciclo de vida de N. caninum como hospedeiros intermediários. O presente trabalho teve como finalidade estudar o ciclo evolutivo e patogenia de N. caninum em cães alimentados com ovos embrionados de Gallus gallus domesticus previamente inoculados com taquizoítas. Realizou-se diariamente o exame de fezes dos animais, pela técnica de flutuação, constatando a presença de oocistos nas fezes a partir de 7 dia apósinfecção. Anticorpos anti- N. caninum foram pesquisados semanalmente nos cães pela RIFI, sendo observados anticorpos a partir dos 14dai. Semanalmente um cão foi eutanasiado e durante a necropsia observou-se em todos os cinco animais, aumento dos linfonodos mesentéricos e das tonsilas, presença de muco no duodeno e jejuno e hepatoesplenomegalia, com hiperplasia de polpa branca do baço. Pelo exame histopatológico detectou-se reatividade dos linfonodos, lesões no fígado, coração, pulmão, baço e rim. Pelas técnicas de imunoistoquímica, imunofluorescência indireta dos tecidos e no Real-time PCR, observou-se a presença do parasito. Os resultados obtidos apontam que, os ovos embrionados infectados pelo parasito mostraram eficiência como modelo experimental para infectar cães, que eliminaram oocistos nas fezes, mesmo não apresentando sinais clínicos da neosporose. Ademais, os cães infectados apresentaram prematura soroconversão pela prévia administração de bicarbonato de sódio e o uso das técnicas citadas tornou possível a detecção do parasito nos tecidos analisados. Neosporosis is a protozoan disease caused by Neospora caninum and affects the reproductive system in cattle worldwide. Infection by the parasite has been widely described in mammals, and recently the role of birds in its lifecycle was confirmed as intermediate hosts. This work aimed to study the life cycle of N. caninum and the pathogeny in dogs that were fed with embryonated eggs inoculated with tachyzoites. The tested dogs were followed up for oocyst shedding, by flotation technique, and it was detected at 7 days after infection. Antibodies anti- N. caninum were detected at 14dai. Once a week, one dog was euthanized and at the necropsy alterations was observed on the mesenteric lymph nodes and tonsils, presence of mucus at duodenum and jejunum portions, and hepatosplenomegaly. At the histopathological examination lymph nodes alterations were noticed ranging from moderate to intense. In addition, there were alterations in liver, heart, lung, spleen and kidney. The parasite was detected by immunochemistry and indirect immunofluorescense tests as well as by Real-time PCR. The results herein presented suggest that inoculated embryonated eggs showed to be an efficient model to infect dogs, because of shedding oocysts, and no clinical alterations. Moreover, the infected dogs presented earlier seroconvertion because of sodium bicarbonate solution administration and the parasite detection in the analyzed tissues was successful by the techniques used.

Orientador: Wanderley Dias da Silveira Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Quarenta e nove linhagens de Escherichia coli isoladas de aves isoladas de aves doentes (24 de aves com septicemia - S, 14 de aves com síndrome da cabeça inchada SHS e 11 de aves com onfalite - O) e 30 linhagens isoladas da região cloacal de aves saudáveis (C) foram analisadas em relação à presença de genes de virulência, grupos filogenéticos de E. coli, similaridade do gene mc. Estes dados foram comparados a um estudo populacional previamente obtido a partir de ERIC PCR (Silveira et al.,2002b), para a caracterização de possíveis dones patogênicos presentes nesta população. Os resultados demonstraram que os genes de virulência analisados foram mais freqüentes entre as linhagens isoladas de aves doentes. Linhagens isoladas de aves saudáveis, de aves com onfalite e de aves com septicemia derivam-se de grupos clonais não patogênicos de E. coli (A, e 81). Por 'outro lado, linhagens SHS e com septicemia derivam-se de grupos clonais patogênicos (82 e D). A comparação destes dados com os dados de ERIC-PCR demonstrou que estas linhagens constituem de três grupos principais: (i) 1 não patogênico, formado por linhagens isoladas de aves com onfalite e de aves saudáveis ambas derivadas principalmente de grupos clonais não patogênicos de E. coli (A); (ii) outro composto por linhagens SHS, derivadas principalmente do grupo clonal patogênico de E. coli (grupo D); e um terceiro grupo (iii) formado por linhagens isoladas por aves com septicemia onde 46% derivaram-se do grupo não patogênico A e outros 46% do grupo patogênico D. Estes dados sugerem que linhagens SHS provavelmente constituem um grupo clonal patogênico dentro da população analisada. Por outro lado, linhagens S possivelmente apresentam uma origem polifilética de dois ancestrais diferentes (um patogênico e outro não patogênico) onde a aquisição de genes de virulência através de transmissão horizontal possivelmente seja responsável por eventos que conduziram a um processo de evolução convergente. O agrupamento das linhagens isoladas de aves saudáveis e de linhagens O, sugere que a onfalite seja causada por linhagens não patogênicas. Os dados de similaridade do gene fIíC demonstram que houve a formação de dois grupos: um formado por linhagens isoladas de aves doentes e outro formada por linhagens isoladas de aves saudáveis. Estes dados sugerem que o gene fliC pode estar associado à diferenciação de possíveis dones patogênicos e não patogênico em linhagens de E. coli de origem aviária, assim como o observado em E. calí patogênicas para humanos Abstract: Forty and nine Escherichía coli strains isolated frem sick chickens (24 frem septicaemia - S, 14 frem swollen head syndrem - SHS, and 11 frem omphalitis - O), and 30 strains isolated frem the cloacae region (C) of healthy chickens were analyzed in relation of the presence of virulence-related genes, E. colí phylogenetical groups, fliC gene similarity. These data were compared to a ERIC-PCR study realized of the same strains (Silveira et a/.,2002b) to characterize possible pathogenic clones present in this population. The results demonstrated that the virulence genes were more frequent among E. colí strains isolated from sick chicken. Strains isolated frem healthy chicken, frem omphalitis and from septicemic chickens were derived frem E. colí non pathogenic greups (A and B 1). SHS and septicemic strains belonged to E. coli pathogenic greups (B2 and D). The comparison of these data with the ERIC-PCR study demonstrated that these strains compounded three main clusters: (i) one non pathogenic, compunded by E. colí strains isolated frem healthy chickens and frem omphalitis; (ii) one compounded by SHS strains belonged to D phylogenetical group; (iii) one compounded by septicemic strains where 46% belonged to A E. colí greup and 46% belonged to D E. calí greup. These data suggests the SHS strains prebably form a pathogenic clonal group inside the population analyzed. By contrast, septicemic strains may have a poliphyletical origin frem two ancestors (one pathogenic and another non pathogenic) where the horizontal acquisition of virulence genes may be respansible for events that conduced to a convergent evolution. The clustering of omphalitis and strains isolated frem healthy chickens suggests that omphalitis is caused by non pathogenic E. colí strains. The mc similarity data demonstrated that were two clusters one compounded by strains isolated frem healthy chickens and other compounded by strains isolated frem sick chickens. These data suggest that f/iC gene can be associated to pathogenic and non pathogenic clones differentiation like described among E. colí strains pathogenic for human Doutorado Microbiologia Doutor em Genética e Biologia Molecular

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Filosofia e Ciências Humanas. Programa de Pós-Graduaçã em Geografia.