Search

Objective – to study the possible association of kidney cancer and bladder cancer onset with rs4977574-polymorphism of long non-coding RNA ANRIL gene depending on patients age.Material and methods. Whole venous blood of 242 persons with genitourinary cancer (101 patients with clear cell renal cell carcinoma and 141 patients with transitional cell carcinoma of urinary bladder) was used for the study. Genotyping of ANRIL gene rs4977574 polymorphism was performed by real-time polymerase chain reaction (Real-time PCR) in the presence of TaqMan assay C_31720978_30. The data were statistically processed using the SPSS software package (version 17.0).Results. It was found that malignant neoplasms of the urogenital tract in G-allele carriers of ANRIL gene rs4977574 polymorphic site occur approximately 5 years earlier, than in AA-homozygotes (log rank P = 0.022; Breslow P = 0.006). The results of Cox regression analysis under dominant model of inheritance showed that G-allele carriers have higher risk of genitourinary cancer (HR = 1,369; P = 0,030) compared to main A-allele homozygotes. The reliability of results was maintained even after adjustment for sex, body mass index, metastases presence, smoking and alcohol consumption (HR = 1,348; P = 0,040).Conclusion. The risk of genitourinary cancer development in G-allele carriers of ANRIL gene rs4977574-polymorphism is higher, compared to AA-homozygotes., Цель работы – изучение возможной связи возникновения рака почки и рака мочевого пузыря с rs4977574-полиморфизмом гена длинной некодирующей РНК ANRIL зависимо от возраста пациентов.Материал и методы. Для исследования использовано цельную венозную кровь 242 человек с раком мочеполовой системы (101 пациент сo светлоклеточным почечно-клеточным раком и 141 больной с переходноклеточным раком мочевого пузыря). Генотипирование по rs4977574-сайту гена ANRIL осуществляли методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (Real-time PCR) в присутствии TaqMan assay C_31720978_30. Статистически данные обрабатывали с помощью пакета программ SPSS (версия 17.0).Результаты. Установлено, что у носителей G-аллеля по полиморфному сайту rs4977574 гена ANRIL злокачественные новообразования урогенитального тракта возникают примерно на 5 лет раньше, чем у АА-гомозигот (log rank P = 0,022; Breslow P = 0,006). Результаты регрессионного анализа методом Кокса в рамках доминантной модели наследования показали, что носители G-аллеля имеют более высокий риск возникновения рака мочеполовой системы с возрастом (HR = 1,369; Р = 0,030) по сравнению с гомозиготами по основному А-аллелю. Достоверность результатов сохранялась и после поправки на пол, индекс массы тела больных, наличие у них метастазов, привычки курить и употреблять алкоголь (HR = 1,348; Р = 0,040).Выводы. Носители G-аллеля по rs4977574-полиморфизму гена длинной некодирующей РНК ANRIL имеют более высокий риск возникновения рака мочеполовой системы с возрастом, по сравнению с гомозиготами АА., Мета роботи – вивчення можливого зв’язку виникнення раку нирки та раку сечового міхура із rs4977574-поліморфізмом гена довгої некодуючої РНК ANRIL залежно від віку пацієнтів.Матеріал і методи. Для дослідження використано цільну венозну кров 242 осіб із раком сечостатевої системи (101 пацієнт зі світлоклітинним нирково-клітинним раком та 141 хворий на перехідноклітинний рак сечового міхура). Генотипування за rs4977574-сайтом гена ANRIL здійснювали методом полімеразної ланцюгової реакції в режимі реального часу (Realtime PCR) за наявності TaqMan assay C_31720978_30. Статистично дані опрацьовували за допомогою пакета програм SPSS (версія 17.0).Результати. Встановлено, що в носіїв G-алеля за поліморфним сайтом rs4977574 гена ANRIL злоякісні новоутворення урогенітального тракту виникають приблизно на 5 років раніше, ніж у АА-гомозигот (log rank P = 0,022; Breslow P = 0,006). Результати регресійного аналізу методом Кокса у рамках домінантної моделі успадкування показали, що носії G-алеля мають вищий ризик виникнення раку сечостатевої системи із віком (HR = 1,369; Р = 0,030), порівняно з гомозиготами за основним А-алелем. Достовірність результатів зберігалась і після поправки на стать, індекс маси тіла хворих, наявність у них метастазів, звички палити та вживати алкоголь (HR = 1,348; Р = 0,040).Висновки. Носії G-алеля за rs4977574-поліморфізмом гена довгої некодуючої РНК ANRIL мають вищий ризик виникнення раку сечостатевої системи з віком, порівняно із гомозиготами АА.

HOX antisense intergenic RNA (HOTAIR), the well-known long noncoding RNA (lnRNA), performs epigenetic regulation of cell cycle genes expression. Based on this fact it can be assumed that HOTAIR single nucleotide polymorphisms (SNPs) affect the development of different oncological processes, in particular, bladder cancer.The aim of the study: to analyze the association between HOTAIR rs1899663 single nucleotide polymorphism and bladder cancer emergence as well as metastasis potential in Ukrainian population.Materials and methods. Venous whole blood from 241 patients was used for genotyping. The studied group was formed from 141 patients with diagnosed bladder cancer and the control group was consisted of 100 healthy subjects. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis (PCR-RFLP) was used for genotyping. The statistical processing of obtained results was done by SPSS 17.0 software.Results. There was no association between HOTAIR rs1899663 SNP and bladder cancer emergence according to the binary logistic regression analysis as well as after adjustment for age, sex and smoking (Pc > 0.05 and Pa > 0.05 for all hereditary models). In contrast, it was shown that the TT-genotype carriers have decreased risk of bladder cancer metastasis compared to G-allele carriers in the recessive (Рс = 0.047; ORс = 0.334, 95 % СІ = 0.113–0.986) model. Moreover, TT-genotype carriers have decreased risk of bladder cancer metastasis in comparison with GG-genotype carriers according to the additive (Рс = 0.04; ORс = 0.301, СІ = 0.096–0.944) model. But after the adjustment for age, sex, smoking and alcohol consumption, the statistically significant association was lost both in recessive (Рa = 0.09; ORa = 0.386; 95 % СІ = 0.129–1.159) and additive (Рa = 0.076; ORa = 0.348; СІ = 0.108–1.118) models.Conclusions. There is no association between HOTAIR rs1899663 SNP and bladder cancer emergence as well as metastasis potential in Ukrainian population., HOX antisense intergenic RNA (HOTAIR), що належить до класу довгих некодувальних РНК (днРНК), здійснює епігенетичну регуляцію експресії генів, причетних до клітинного поділу. Це дає підстави припустити: однонуклеотидні поліморфізми гена HOTAIR можуть впливати на розвиток пухлинних процесів, зокрема раку сечового міхура.Мета роботи – проаналізувати зв’язок rs1899663-поліморфізму гена HOTAIR із виникненням раку сечового міхура та його здатністю до метастазування у представників української популяції.Матеріали та методи. Для дослідження використали цільну венозну кров 241 особи (141 хворий на рак сечового міхура та 100 осіб групи контролю). Для генотипування застосована полімеразна ланцюгова реакція з аналізом довжини рестрикційних фрагментів (PCR-RFLP). Статистичне опрацювання результатів виконали за допомогою програмного забезпечення SPSS 17.0.Результати. Встановлена відсутність зв’язку між rs1899663-поліморфізмом гена HOTAIR і виникненням раку сечового міхура як за даними бінарної логістичної регресії, так і після врахування поправок на вік, стать і звичку курити (Рспост > 0,05 та Pпопр > 0,05 в усіх моделях спадкування). Натомість показано, що ризик розвитку метастазування раку сечового міхура в носіїв ТТ-генотипу менший, ніж у носіїв G-алеля відповідно до рецесивної (Рспост = 0,047; ORспост = 0,334, 95 % СІ = 0,113–0,986) моделі спадкування. До того ж, за даними адитивної моделі спадкування, ризик розвитку метастазування в осіб із ТТ-генотипом менший, ніж у гомозигот за основним алелем (Рспост = 0,04; ORспост = 0,301, СІ = 0,096–0,944). Але після застосування поправок на вік, стать, куріння та зловживання алкоголем статистично значущий зв’язок зник і в рецесивній (Рпопр = 0,09; ORпопр = 0,386, 95 % СІ = 0,129–1.159), і в адитивній (Рпопр = 0,076; ORпопр = 0,348, СІ = 0,108–1,118) моделі спадкування.Висновки. Зв’язок між rs1899663-поліморфізмом гена HOTAIR і виникненням і метастазуванням раку сечового міхура в українській популяції відсутній., HOX antisense intergenic RNA (HOTAIR), относящаяся к классу длинных некодирующих РНК (днРНК), осуществляет эпигенетическую регуляцию экспрессии генов, причастных к клеточному делению. Это позволяет предположить, что однонуклеотидные полиморфизмы гена HOTAIR могут оказывать влияние на развитие опухолевых процессов, в частности рака мочевого пузыря.Цель работы – проанализировать связь rs1899663-полиморфизма гена HOTAIR с возникновением рака мочевого пузыря и его способностью к метастазированию у представителей украинской популяции.Материалы и методы. Для исследования использована цельная венозная кровь 241 пациента (141 больной раком мочевого пузыря и 100 лиц группы контроля). Для генотипирования использовали полимеразную цепную реакцию с анализом длины рестрикционных фрагментов (PCR-RFLP). Статистическая обработка результатов проведена при помощи программного обеспечения SPSS 17.0.Результаты. Установлено отсутствие связи между rs1899663-полиморфизмом гена HOTAIR и возникновением рака мочевого пузыря как по данным бинарной логистической регрессии, так и после применения поправок на возраст, пол и курение (Рнабл > 0,05 и Pнабл > 0,05 во всех моделях наследования). Также показано, что риск развития метастазирования рака мочевого пузыря у носителей ТТ-генотипа меньше, чем у носителей G-аллеля в соответствии с рецессивной (Рнабл = 0,047; ORнабл = 0,334, 95 % СІ = 0,113–0,986) моделью наследования. Более того, по данным аддитивной модели наследования, риск развития метастазирования у лиц с ТТ-генотипом меньше по сравнению с обладателями GG-генотипа (Рнабл = 0,04; ORнабл = 0,301, СІ = 0,096–0,944). Однако после применения поправок на возраст, пол, курение и злоупотребление алкоголем статистически значимая связь исчезла как в рецессивной (Рпопр = 0,09; ORпопр = 0,386, 95 % СІ = 0,129–1,159), так и в аддитивной (Рпопр = 0,076; ORпопр = 0,348, СІ = 0,108–1,118) моделях наследования.Выводы. Связь между rs1899663-полиморфизмом гена HOTAIR и возникновением, а также метастазированием рака мочевого пузыря среди представителей украинской популяции отсутствует.

Objective: to study the association between rs3200401 long non-coding RNA MALAT1 gene polymorphism and bladder cancer development in population of Sumy oblast.Material and methods. Venous blood of 141 patients with transitional cell carcinoma of urinary bladder (TCCUB) and 100 clinically healthy subjects without any history of oncological diseases was used for the study. The determination of MALAT1 rs3200401 alleles distribution was carried out using Real-time PCR with 7500 Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, USA) and Taq-Man Assays (TaqMan® SNP Assay C_3246069_10). Processing of statistical data was performed using the SPSS package (Version 17.0).Results. The significant difference of rs320040 MALAT1 gene polymorphic site genotypes and alleles frequencies between TCCUB patients and control group was established (P = 0.025 and P = 0.004, respectively). The results of logistic regression revealed the minor T-allele carriers had lower risk of TCCUB development compared to CC-homozygous (OR = 0.504; P = 0.018 – according to the dominant model and OR = 0.534; P = 0.045 – according to the additive model).Conclusions. This is the first study investigating the link between rs3200401 MALAT1 gene polymorphism and bladder cancer development. The rs3200401 locus is associated with TCCUB development in population of Sumy oblast. The minor T-allele carriers have the lower risk of TCCUB onset compared to CC-homozygotes., Цель работы — изучение связи rs3200401‑полиморфизма гена длинной некодирующей РНК MALAT1 с развитием рака мочевого пузыря в популяции жителей Сумской области.Материал и методы. В исследовании была использована цельная венозная кровь 141 пациента с переходноклеточным раком мочевого пузыря (ПКРМП) и 100 клинически здоровых лиц без онкологических заболеваний в анамнезе. Определение распределения аллелей по rs3200401‑локусу гена MALAT1 осуществляли с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени (Real-time PCR) с использованием 7500 Fast Real-time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, США) и Taq-Man Assays (TaqMan® SNP Assay C_3246069_10). Статистическую обработку полученных данных проводили с использованием пакета SPSS (версия 17.0).Результаты. Установлено значимое различие частот генотипов и аллелей по полиморфному сайту rs3200401 гена MALAT1 между группой больных с ПКРМП и контрольной группой (P = 0,025 и Р = 0,004, соответственно). Результаты логистической регрессии показали, что риск развития ПКРМП у носителей минорного Т‑аллеля меньше, по сравнению с гомозиготами СС (OR = 0,504; Р = 0,018 — в соответствии с доминантной моделью и OR = 0,534; Р = 0,045 — в соответствии с аддитивной моделью). Выводы. Это исследование является первым касательно поиска ассоциации rs3200401‑сайта гена MALAT1 с наступлением рака мочевого пузыря. Полиморфный локус rs3200401 связан с развитием ПКРМП в популяции жителей Сумской области. Носители минорного Т‑аллеля имеют меньший риск наступления ПКРМП по сравнению с СС-гомозиготами., Мета роботи — вивчення зв’язку rs3200401‑поліморфізму гена довгої некодуючої РНК MALAT1 із розвитком раку сечового міхура в популяції мешканців Сумської області.Матеріал і методи. У дослідженні використано цільну венозну кров 141 пацієнта із перехідноклітинним раком сечового міхура (ПКРСМ) та 100 клінічно здорових осіб без онкологічних захворювань в анамнезі. Визначення розподілу алелів за rs3200401‑локусом гена MALAT1 здійснювали за допомогою полімеразної ланцюгової реакції в реальному часі (Real-time PCR) із використанням 7500 Fast Real-time P CR System (Applied Biosystems, Foster City, США) та Taq-Man Assays (TaqMan®SNP Assay C_3246069_10). Статистичне опрацювання отриманих даних проводили з використанням пакета SPSS (версія 17.0).Результати. Встановлена значуща відмінність частот генотипів та алелів за поліморфним сайтом rs3200401 гена MALAT1 між групою хворих на ПКРСМ та контрольною групою (P = 0,025 та Р = 0,004, відповідно). Результати логістичної регресії показали, що ризик розвитку ПКРСМ у носіїв мінорного Т‑алеля менший, порівняно з гомозиготами СС (OR = 0,504; Р = 0,018 — відповідно до домінантної моделі та OR = 0,534; Р = 0,045 — відповідно до адитивної моделі).Висновки. Наведене дослідження є першим щодо пошуку асоціації rs3200401‑сайту гена MALAT1 із настанням раку сечового міхура. Поліморфний локус rs3200401 пов'язаний із розвитком ПКРСМ у популяції мешканців Сумської області. Носії мінорного Т‑алеля мають менший ризик настання ПКРСМ, порівняно із СС-гомозиготами.

The results of studying T134967G polymorphism of ANKH gene among 118 patients with acute coronary syndrome (ACS) and 110 healthy individuals (control group) with normal and increased body mass indexes (BMI) is presented. There is credible association between the amount BMI ≥ 25 kg/m2 and the risk of ACS in homozygotes for the major allele T/T (P=0,028). Carriers minor allele (T/G+G/G) with BMI < 25 kg/m2 risk of ACS 3,1 times is higher than in patients with genotype T/T., Наведено результати вивчення T134967G поліморфізму гена АNКН серед 118 хворих із гострим коронарним синдромом (ГКС) і 110 практично здорових осіб (контрольна група) з нормальними та підвищеними показниками індексу маси тіла (ІМТ). Виявлено, що у гомозигот за основним алелем Т/Т з ІМТ ≥ 25 кг/м2 існує достовірний зв'язок із ризиком виникнення ГКС (Р=0,028). У носіїв мінорного алелю (Т/G+G/G) з ІМТ < 25 кг/м2 ризик виникнення ГКС в 3,1 рази вищий, ніж у пацієнтів з генотипом Т/Т., Приведены результаты изучения T134967G полиморфизма гена АNКН среди 118 больных с острым коронарным синдромом (ОКС) и 110 практически здоровых лиц (контрольная группа) с нормальными и повышенными показателями индекса массы тела (ИМТ). Выявлено, что у гомозигот по основному аллелю Т/Т с ИМТ ≥ 25 кг/м2 существует достоверная связь с риском развития ОКС (Р=0,028). У носителей минорного аллеля (Т/G+G/G) с ИМТ < 25 кг/м2 риск возникновения ОКС в 3,1 раза выше, чем у пациентов с Т/Т генотипом.

Наведено результати визначення С1173Т (rs9934438) поліморфізму гена вітамін К-епоксид редуктази (VKORC1) у 170 пацієнтів з ішемічним атеротромботичним інсультом (ІАТІ) та 124 практично здорових індивідуумів (контрольна група). Встановлено, що в осіб з інсультом співвідношення гомозигот за основним алелем (С/С), гетерозигот (С/Т) і гомозигот за мінорним алелем (Т/Т) становило 37,1 %, 43,5 % і 19,4 % (у контролі – відповідно 47,6 %, 37,9 %, 14,5 %;P = 0,178 за χ2-критерієм). Аналіз у підгрупі пацієнтів з артеріальною гіпертензією показав, що Т-алель в осіб з ІАТІ траплявся достовірно частіше, ніж у контролі (Р = 0,041). Одержані дані свідчать, що заміна цитозину на тимін у першому інтроні гена VKORC1 має стосунок до збільшення ймовірності розвитку ішемічного інсульту в осіб з артеріальною гіпертензією., Представлены результаты определения С1173Т (rs9934438) полиморфизма гена витамин К-эпоксид редуктазы (VKORC1) у 170 больных с ишемическим атеротромботическим инсультом (ИАТИ) и 124 практически здоровых индивидуумов (контрольная группа). Установлено, что у больных с инсультом соотношение гомозигот по основному аллелю (С/С), гетерозигот (С/Т) и гомозигот по минорному аллелю (Т/Т) составило 37,1 %, 43,5 % и 19,4 % (в контроле – соответственно 47,6 %, 37,9 %, 14,5 %; P=0,178 по χ2-критерию). Анализ в подгруппе с артериальной гипертензией показал, что Т-аллель у больных с ИАТИ встречался достоверно чаще, чем в контроле (Р=0,041). Полученные данные свидетельствуют о том, что замена цитозина на тимин в первом интроне гена VKORC1 имеет отношение к увеличению вероятности развития ишемического инсульта у лиц с артериальной гипертензией., The results of vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 (VKORC1) gene C1173T polymorphism determining in 170 patients with ischemic atherothrombotic stroke (IAS) and 124 healthy subjects (control group) have been submitted. The ratio of main homozygotes (C/C), heterozygotes (C/T) and minor homozygotes (T/T) in case cohort was 37,1 %, 43,5 % and 19,4 % (in control – 47,6 %, 37,9 %, 14,5 %, P=0,178 by χ2-test). Analysis in subgroup with arterial hypertension revealed, that T-allele frequency in patients with IAS was higher than in matched control (P = 0.041). Obtained data suggested that cytosine to thymine substitution in the first intron of the VKORC1 gene is related to increasing likelihood of ischemic stroke development in patients with arterial hypertension in Ukrainian population.

Several allelic variants of matrix γ-carboxyglutamic acid protein (MGP) can differentially affect the development of certain forms of ischemic heart disease depending on specific characteristics of each population.To study the distribution of allelic variants of MGP promoter T(-138)→C (rs1800802) and G(-7)→A (rs1800801), and Thr(83)→Ala exon 4 (rs4236) polymorphisms in a Ukrainian population of patients with acute coronary syndrome (ACS).Polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis were used to detect the above-mentioned variants of the MGP gene in 115 patients with ACS and in 140 essentially healthy individuals.The distribution of homozygous carriers of a major allelic variant, and heterozygous and homozygous minor allele variants of the T(-138)→C MGP promoter polymorphism in patients with ACS were 59.8%, 32.7% and 7.5%, respectively. The corresponding distributions of variants in the control group were 54.0%, 41.0% and 5.0%, respectively (P0.05 [χ(2) test]). With respect to the G(-7)→A polymorphism, the respective distributions were 42.1%, 45.6% and 12.3%, compared with 50.7%, 45.0% and 4.3% in the control group, respectively (P0.05). Finally, the respective distributions according to the Thr(83)→Ala exon 4 polymorphism were 42.6%, 43.5% and 13.9%, respectively, compared with 45.3%, 43.0% and 11.7% in the control group. Using logistic regression analysis, it was estimated that the A/A genotype (G(-7)→A polymorphism) was significantly (P=0.02) associated with ACS (OR 4.302 [95% CI 1.262 to 14.673]).The allelic A/A promoter variant of MGP G(-7)→A polymorphism can be considered a risk factor for ACS in the Ukrainian population.