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35 results on '"Artige, Emmanuelle"'

4. Sharing space between native and invasive small mammals: Study of commensal communities in Senegal

Author

Granjon, Laurent, primary, Artige, Emmanuelle, additional, Bâ, Khalilou, additional, Brouat, Carine, additional, Dalecky, Ambroise, additional, Diagne, Christophe, additional, Diallo, Mamoudou, additional, Fossati-Gaschignard, Odile, additional, Gauthier, Philippe, additional, Kane, Mamadou, additional, Husse, Laëtitia, additional, Niang, Youssoupha, additional, Piry, Sylvain, additional, Sarr, Nathalie, additional, Sow, Aliou, additional, and Duplantier, Jean-Marc, additional

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2023
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5. BRC4Env, the Biological Resource Centres for the Environment of AgroBRC-RARe

Author

Bruneau, Sylvia, Artige, Emmanuelle, Faivre-Primot, Céline, Marchand, Frédéric, Mondy, Samuel, Ratié, Céline, Redecker, Dirk, Ris, Nicolas, Starck, Agnes, Warot, Sylvie, Mougin, Christian, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Info&Sols (Info&Sols), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Côte d'Azur (UCA), Département ECODIV - INRAE, and Groupe Français de Recherches sur les Pesticides

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences
Abstract

International audience; Le réseau de Centres de Ressources Biologiques BRC4Env (https://www.brc4env.fr/), collecte, caractérise, conserve et distribue des ressources biologiques (matériel biologique et données associées) agro-environnementales. Ces ressources sont ouvertes à la recherche fondamentale et appliquée mobilisant des ressources pour caractériser l’environnement et l’évolution de sa dynamique, ou de proposer des solutions de biocontrôle. Ces ressources biologiques sont échantillonnées à partir d’écosystèmes naturels et cultivés. Elles concernent notamment des sols et les ADNs de leurs communautés microbiennes, des tissus ichtyologiques, des arthropodes et acariens, des hyménoptères parasitoïdes et des champignons mycorhiziens à arbuscule. BRC4Env rend ces ressources disponibles pour les chercheurs du monde académique, mais aussi de l'industrie et de la société civile (ONG...). Ces ressources biologiques sont mobilisables dans le cadre de projets de recherche en écotoxicologie et agroécologie.BRC4Env est un des piliers constitutifs de l'Infrastructure de Recherche nationale « Ressources Agronomiques pour la recherche », AgroBRC-RARe (https://www.agrobrc-rare.org/), co-porté par INRAE, l’IRD et le CIRAD.

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2023
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6. Supplementary material 2 from: Pradel J, Bouilloud M, Loiseau A, Piry S, Galan M, Artige E, Castel G, Ferrero J, Gallet R, Thuel G, Vieira N, Charbonnel N (2022) Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10: e95214. https://doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214

Author

Pradel, Julien, primary, Bouilloud, Marie, additional, Loiseau, Anne, additional, Piry, Sylvain, additional, Galan, Maxime, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Castel, Guillaume, additional, Ferrero, Julien, additional, Gallet, Romain, additional, Thuel, Geoffrey, additional, Vieira, Nathalie, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

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2022
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7. Figure 4 from: Pradel J, Bouilloud M, Loiseau A, Piry S, Galan M, Artige E, Castel G, Ferrero J, Gallet R, Thuel G, Vieira N, Charbonnel N (2022) Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10: e95214. https://doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214

Author

Pradel, Julien, primary, Bouilloud, Marie, additional, Loiseau, Anne, additional, Piry, Sylvain, additional, Galan, Maxime, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Castel, Guillaume, additional, Ferrero, Julien, additional, Gallet, Romain, additional, Thuel, Geoffrey, additional, Vieira, Nathalie, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

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2022
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8. Figure 2 from: Pradel J, Bouilloud M, Loiseau A, Piry S, Galan M, Artige E, Castel G, Ferrero J, Gallet R, Thuel G, Vieira N, Charbonnel N (2022) Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10: e95214. https://doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214

Author

Pradel, Julien, primary, Bouilloud, Marie, additional, Loiseau, Anne, additional, Piry, Sylvain, additional, Galan, Maxime, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Castel, Guillaume, additional, Ferrero, Julien, additional, Gallet, Romain, additional, Thuel, Geoffrey, additional, Vieira, Nathalie, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

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2022
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9. Supplementary material 1 from: Pradel J, Bouilloud M, Loiseau A, Piry S, Galan M, Artige E, Castel G, Ferrero J, Gallet R, Thuel G, Vieira N, Charbonnel N (2022) Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10: e95214. https://doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214

Author

Pradel, Julien, primary, Bouilloud, Marie, additional, Loiseau, Anne, additional, Piry, Sylvain, additional, Galan, Maxime, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Castel, Guillaume, additional, Ferrero, Julien, additional, Gallet, Romain, additional, Thuel, Geoffrey, additional, Vieira, Nathalie, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

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2022
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10. Figure 1 from: Pradel J, Bouilloud M, Loiseau A, Piry S, Galan M, Artige E, Castel G, Ferrero J, Gallet R, Thuel G, Vieira N, Charbonnel N (2022) Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10: e95214. https://doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214

Author

Pradel, Julien, primary, Bouilloud, Marie, additional, Loiseau, Anne, additional, Piry, Sylvain, additional, Galan, Maxime, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Castel, Guillaume, additional, Ferrero, Julien, additional, Gallet, Romain, additional, Thuel, Geoffrey, additional, Vieira, Nathalie, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

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2022
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11. Figure 5 from: Pradel J, Bouilloud M, Loiseau A, Piry S, Galan M, Artige E, Castel G, Ferrero J, Gallet R, Thuel G, Vieira N, Charbonnel N (2022) Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10: e95214. https://doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214

Author

Pradel, Julien, primary, Bouilloud, Marie, additional, Loiseau, Anne, additional, Piry, Sylvain, additional, Galan, Maxime, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Castel, Guillaume, additional, Ferrero, Julien, additional, Gallet, Romain, additional, Thuel, Geoffrey, additional, Vieira, Nathalie, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

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2022
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12. Figure 3 from: Pradel J, Bouilloud M, Loiseau A, Piry S, Galan M, Artige E, Castel G, Ferrero J, Gallet R, Thuel G, Vieira N, Charbonnel N (2022) Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France. Biodiversity Data Journal 10: e95214. https://doi.org/10.3897/BDJ.10.e95214

Author

Pradel, Julien, primary, Bouilloud, Marie, additional, Loiseau, Anne, additional, Piry, Sylvain, additional, Galan, Maxime, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Castel, Guillaume, additional, Ferrero, Julien, additional, Gallet, Romain, additional, Thuel, Geoffrey, additional, Vieira, Nathalie, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

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2022
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13. Small terrestrial mammals (Rodentia and Soricomorpha) along a gradient of forest anthropisation (reserves, managed forests, urban parks) in France

Author

Pradel, Julien, primary, Bouilloud, Marie, additional, Loiseau, Anne, additional, Piry, Sylvain, additional, Galan, Maxime, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Castel, Guillaume, additional, Ferrero, Julien, additional, Gallet, Romain, additional, Thuel, Geoffrey, additional, Vieira, Nathalie, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

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2022
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14. BioloMICS : Un outil pour gérer les données associées aux collections des Centres de Ressources Biologiques

Author

Artige, Emmanuelle, Grondin, Cécile, Mineau, Jonathan, Mistou, Michel-Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), CIRM-Levures, Sciences Pour l'Oenologie (SPO), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas] (MaIAGE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and ARTIGE, Emmanuelle

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], base de données, software, [SDV]Life Sciences [q-bio], logiciel, collection, website, Biological ressources, BioloMICS, site web, database, Ressources biologiques
Abstract

The commercial software BioloMICS allows creating a relational database and deploying an associated website. It was chosen by several BRCs of the RARe to manage their collections. Here, we provide an extensive review of the software’s functionalities, the advantages of the solution and its limits., Le logiciel commercial Biolomics permet de créer une base de données relationnelle et de déployer un site web associé. Il a été choisi par plusieurs CRB de RARe pour la gestion de leurs collections. Nous faisons ici une revue extensive des fonctionnalités du logiciel, des avantages de la solution et de ses limites.

Published
2022

16. BRC4Env, a network of Biological Resource Centres for environmental resources

Author

Mougin, Christian, Artige, Emmanuelle, Faivre-Primot, Céline, Marchand, Frédéric, Mondy, Samuel, Ratié, Céline, Rimet, Frédéric, Sellier, Nadine, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatique - U3E (Rennes, France) (U3E ), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), InfoSol (InfoSol), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)

Subjects
[SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2020
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17. Detection and Genetic Characterization of Puumala Orthohantavirus S-Segment in Areas of France Non-Endemic for Nephropathia Epidemica

Author

Murri, Séverine, Madrières, Sarah, Tatard, Caroline, Piry, Sylvain, Benoit, Laure, Loiseau, Anne, Pradel, Julien, Artige, Emmanuelle, Audiot, Philippe, Leménager, Nicolas, Lacôte, Sandra, Vulin, Johann, Charbonnel, Nathalie, Marianneau, Philippe, Castel, Guillaume, Laboratoire de Lyon [ANSES], Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), This work was funded by the PALADIN project, publicly funded through the French National Research Agency under the 'Investissements d'avenir' program with the reference ANR-10-LABX-0004 Labex CEMEB and coordinated by the University of Montpellier., ANR-10-LABX-0004,CeMEB,Mediterranean Center for Environment and Biodiversity(2010), Université de Lyon-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
Puumala virus, Puumalavirus, molecular evolution, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:R, Myodes glareolus, lcsh:Medicine, nephropathia epidemica, France, Article, diversity
Abstract

International audience; Puumala virus (PUUV) in Europe causes nephropathia epidemica (NE), a mild form of hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS). The incidence of NE is highly heterogeneous spatially, whereas the geographic distribution of the wild reservoir of PUUV, the bank vole, is essentially homogeneous. Our understanding of the processes driving this heterogeneity remains incomplete due to gaps in knowledge. Little is known about the current distribution and genetic variation of PUUV in the areas outside the well-identified zones of NE endemicity. We trapped bank voles in four forests in French regions in which NE is considered non-endemic, but sporadic NE cases have been reported recently. We tested bank voles for anti-PUUV IgG and characterized the S segment sequences of PUUV from seropositive animals. Phylogenetic analyses revealed specific amino-acid signatures and genetic differences between PUUV circulating in non-endemic and nearby NE-endemic areas. We also showed, in temporal surveys, that the amino-acid sequences of PUUV had undergone fewer recent changes in areas non-endemic for NE than in endemic areas. The evolutionary history of the current French PUUV clusters was investigated by phylogeographic approaches, and the results were considered in the context of the history of French forests. Our findings highlight the need to monitor the circulation and genetics of PUUV in a larger array of bank vole populations, to improve our understanding of the risk of NE.

Published
2020
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18. How Bank Vole-PUUV Interactions Influence the Eco-Evolutionary Processes Driving Nephropathia Epidemica Epidemiology—An Experimental and Genomic Approach

Author

Madrières, Sarah, primary, Tatard, Caroline, additional, Murri, Séverine, additional, Vulin, Johann, additional, Galan, Maxime, additional, Piry, Sylvain, additional, Pulido, Coralie, additional, Loiseau, Anne, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Benoit, Laure, additional, Leménager, Nicolas, additional, Lakhdar, Latifa, additional, Charbonnel, Nathalie, additional, Marianneau, Philippe, additional, and Castel, Guillaume, additional

Published
2020
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19. ObsMICE: a monitoring system to assess long-term changes in biodiversity of small mammals and associated parasites in a broad range of West African ecosystems

Author

Dalecky, A., ObsMICE, Consortium, Artige, Emmanuelle, Brouat, Carine, Badou, Sylvestre, Dobigny, Gauthier, Dossou, Joël, Etougbétché, J., FOSSATI, Odile, Gauthier, P., Granjon, Laurent, Loiseau, Anne, Niang, Cheikh Tidiane, Tatard, Caroline, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2019

20. Native and Invasive Small Mammals in Urban Habitats along the Commercial Axis Connecting Benin and Niger, West Africa

Author

Houemenou, Gualbert, Badou, Sylvestre, Garba, Madougou, Dossou, Henri-Joel, Etougbetche, Jonas, Gauthier, Philippe, Artige, Emmanuelle, Fossati-Gaschignard, Odile, Gagare, Sama, Dobigny, Gauthier, Dalecky, Ambroise, and Hima, Karmadine

Subjects
Animal biology, afrique de l'ouest, parasitic diseases, Microbiology and Parasitology, Biologie animale, synanthropic rodents, biological invasion, community ecology, Rattus, Mus, West Africa, invasion biologique, Microbiologie et Parasitologie
Abstract

Based on compiled small mammal trapping data collected over 12 years from Benin and Niger (3701 individual records from 66 sampling sites), located in mainland Africa, we here describe the small mammal community assemblage in urban habitats along the commercial axis connecting the two countries, from the seaport of Cotonou to the Sahelian hinterland, with a particular focus on invasive species. In doing so, we document extant species distributions, which highlight the risks of continuing the range expansion of three synanthropic invasive rodent species, namely black rats (Rattus rattus), brown rats (R. norvegicus), and house mice (Mus musculus). Using various diversity estimates and community ecology approaches, we detect a latitudinal gradient of species richness that significantly decreased Northward. We show that shrews (Crocidura) represent a very important component of micro-mammal fauna in West African towns and villages, especially at lower latitudes. We also demonstrate that invasive and native synanthropic rodents do not distribute randomly in West Africa, which suggests that invasive species dynamics and history differ markedly, and that they involve gradual, as well as human-mediated, long distance dispersal. Patterns of segregation are also observed between native Mastomys natalensis and invasive rats R. rattus and R. norvegicus, suggesting potential native-to-invasive species turn over. Consequences of such processes, especially in terms of public health, are discussed.

Published
2019

21. BRC4Env, un réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections dédié aux ressources environnementales

Author

Mougin, Christian, ARTIGE, Emmanuelle, Faivre-Primot, Céline, Marchand, Frédéric, Mondy, Samuel, Ratié, Céline, Rimet, Frédéric, Sellier, Nadine, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), InfoSol (InfoSol), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), and COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience; Le réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections « ressources environnementales », BRC4Env (https://www.brc4env.fr/), conserve et distribue des ressources biologiques (matériel biologique et données associées), de manière sécurisée et avec une traçabilité optimale. BRC4Env soutient la recherche fondamentale et appliquée concernée par les bioressources agro-environnementales. Ces ressources biologiques et/ou génomiques sont échantillonnées à partir de sols, de sédiments, d’eaux, d’écosystèmes agricoles, et conservées dans des collections organisées. Elles concernent les communautés microbiennes, ainsi que les ressources animales et végétales dont la gestion ou la propagation ne dépendent pas directement d'une intervention humaine. BRC4Env rend ces ressources disponibles pour les chercheurs du monde académique, mais aussi de l'industrie et de la société civile (ONG...). Ces ressources biologiques sont mobilisables dans le cadre de projets de recherche en écotoxicologie.BRC4Env est un des piliers constitutifs de l'Infrastructure de recherche nationale « Ressources Agronomiques pour la recherche », RARe (http://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/cid99437/ressources-agronomiques-pour-la-recherche-rare.html). RARe est co-porté par l’INRA, l’IRD et le CIRAD et le CNRS.

Published
2018

22. Sampling to vouchering : collections management at the CBGP

Author

ARTIGE, Emmanuelle, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institute of Vertebrate Biology. CZE.

Subjects
[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

23. BRC4Env, the Biological Resource Centre for the Environment

Author

Mougin, Christian, ARTIGE, Emmanuelle, Marchand, Frédéric, Mondy, Samuel, Montuelle, Bernard, Ratié, Céline, Sellier, Nadine, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), InfoSol (InfoSol), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), and COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience; Le réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections « ressources environnementales », BRC4Env (https://www.brc4env.fr/), conserve et distribue des ressources biologiques (matériel biologique et données associées), de manière sécurisée et avec une traçabilité optimale. BRC4Env soutient la recherche fondamentale et appliquée concernée par les bioressources agro-environnementales. Ces ressources biologiques et/ou génomiques sont échantillonnées à partir de sols, de sédiments, d’eaux, d’écosystèmes agricoles, et conservées dans des collections organisées. Elles concernent les communautés microbiennes, ainsi que les ressources animales et végétales dont la gestion ou la propagation ne dépendent pas directement d'une intervention humaine. BRC4Env rend ces ressources disponibles pour les chercheurs du monde académique, mais aussi de l'industrie et de la société civile (ONG...).BRC4Env est un des piliers constitutifs de l'Infrastructure de recherche nationale « Ressources Agronomiques pour la recherche », RARe (http://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/cid99437/ressources-agronomiques-pour-la-recherche-rare.html). RARe est co-porté par l’INRA, l’IRD et le CIRAD et le CNRS.

Published
2017

24. Gestion des données de la base Arthropodes sous BioloMICS (BioAware SA)

Author

ARTIGE, Emmanuelle, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2017

25. BRC4Env : un réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections dédié aux ressources environnementales

Author

Mougin, Christian, ARTIGE, Emmanuelle, Marchand, Frédéric, MONDY, Samuel, Montuelle, Bernard, Ratié, Céline, Sellier, Nadine, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité INFOSOL (ORLEANS INFOSOL), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), InfoSol (InfoSol), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations ( CBGP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques ( UEEA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ), Unité INFOSOL ( ORLEANS INFOSOL ), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] ( ISA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), and COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Le réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections « ressources environnementales », BRC4Env (https://www.brc4env.fr/), conserve et distribue des ressources biologiques (matériel biologique et données associées), de manière sécurisée et avec une traçabilité optimale. BRC4Env soutient la recherche fondamentale et appliquée concernée par les bioressources agro-environnementales. Ces ressources biologiques et/ou génomiques sont échantillonnées à partir de sols, de sédiments, d’eaux, d’écosystèmes agricoles, et conservées dans des collections organisées. Elles concernent les communautés microbiennes, ainsi que les ressources animales et végétales dont la gestion ou la propagation ne dépendent pas directement d'une intervention humaine. BRC4Env rend ces ressources disponibles pour les chercheurs du monde académique, mais aussi de l'industrie et de la société civile (ONG...).BRC4Env est un des piliers constitutifs de l'Infrastructure de recherche nationale « Ressources Agronomiques pour la recherche », RARe (http://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/cid99437/ressources-agronomiques-pour-la-recherche-rare.html). RARe est co-porté par l’INRA, l’IRD et le CIRAD, et interagit avec le CNRS.

Published
2017

27. Gestion d'une collection entomologique au CBGP : une infrastructure dédiée

Author

ARTIGE, Emmanuelle, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
collection zoologique, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, insecta, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2017

30. Contemporary variations of immune responsiveness during range expansion of two invasive rodents in Senegal

Author

Diagne, Christophe, primary, Gilot-Fromont, Emmanuelle, additional, Cornet, Stéphane, additional, Husse, Laëtitia, additional, Doucouré, Souleymane, additional, Dalecky, Ambroise, additional, Bâ, Khalilou, additional, Kane, Mamadou, additional, Niang, Youssoupha, additional, Diallo, Mamoudou, additional, Sow, Aliou, additional, Fossati-Gaschignard, Odile, additional, Piry, Sylvain, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Sembène, Mbacké, additional, Brouat, Carine, additional, and Charbonnel, Nathalie, additional

Published
2016
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31. Range expansion of the invasive house mouseMus musculus domesticusin Senegal, West Africa: a synthesis of trapping data over three decades, 1983-2014

Author

Dalecky, Ambroise, primary, Bâ, Khalilou, additional, Piry, Sylvain, additional, Lippens, Cédric, additional, Diagne, Christophe A., additional, Kane, Mamadou, additional, Sow, Aliou, additional, Diallo, Mamoudou, additional, Niang, Youssoupha, additional, Konečný, Adam, additional, Sarr, Nathalie, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Charbonnel, Nathalie, additional, Granjon, Laurent, additional, Duplantier, Jean-Marc, additional, and Brouat, Carine, additional

Published
2015
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32. DNA Barcoding and the Associated PhylAphidB@se Website for the Identification of European Aphids (Insecta: Hemiptera: Aphididae)

Author

Coeur d’acier, Armelle, primary, Cruaud, Astrid, additional, Artige, Emmanuelle, additional, Genson, Gwenaëlle, additional, Clamens, Anne-Laure, additional, Pierre, Eric, additional, Hudaverdian, Sylvie, additional, Simon, Jean-Christophe, additional, Jousselin, Emmanuelle, additional, and Rasplus, Jean-Yves, additional

Published
2014
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34. Range expansion of the invasive house mouse M us musculus domesticus in Senegal, West Africa: a synthesis of trapping data over three decades, 1983-2014.

Author

Dalecky, Ambroise, Bâ, Khalilou, Piry, Sylvain, Lippens, Cédric, Diagne, Christophe A., Kane, Mamadou, Sow, Aliou, Diallo, Mamoudou, Niang, Youssoupha, Konečný, Adam, Sarr, Nathalie, Artige, Emmanuelle, Charbonnel, Nathalie, Granjon, Laurent, Duplantier, Jean-Marc, and Brouat, Carine

Subjects
INTRODUCED species, MICE ecology, SPECIES diversity, MAMMALS, BIODIVERSITY
Abstract

The worldwide intensification of human-associated exchanges favours the multiplication of biological invasions. Among mammals, rodent species, including the house mouse M us musculus, are identified as major invaders with profound impacts on native biodiversity, human health and activities. Though contemporary rodent invasions are described on several islands, there are few data describing ongoing house mouse invasions in continental areas., We first outline the known picture of the distribution of the house mouse in Africa. We then describe the ongoing range expansion of the house mouse in Senegal, in order to update its distribution area, assess the location of the invasion front, describe the spatio-temporal dynamics of the invasion at the country scale and evaluate its impact on native small mammal communities., We briefly review the worldwide status of the house mouse, with special focus on its situation in Africa. Focusing on Senegal, we then use historical records and a large body of spatio-temporal indoor trapping data obtained from small mammal communities over the last 30 years to analyse the invasion dynamics of the subspecies at the scale of the country., The geographic range of the invasive house mouse is surprisingly poorly known in Africa. In Senegal, we document a large range expansion of the subspecies in human settlements over the whole country within the last 30 years. The invasion is still ongoing further east and south within the country, and has major consequences for small mammal communities and thus probably for risks associated with zoonotic diseases. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2015
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35. Molecular identification of Epitrix potato flea beetles (Coleoptera: Chrysomelidae) in Europe and North America.

Author

Germain, Jean-François, Chatot, Catherine, Meusnier, Isabelle, Artige, Emmanuelle, Rasplus, Jean-Yves, and Cruaud, Astrid

Subjects
FLEA beetles, POTATO diseases & pests, CYTOCHROME oxidase, GENETIC markers, POLYMERASE chain reaction
Abstract

Epitrix species (Coleoptera: Chrysomelidae) feed mostly on plants from the family Solanaceae and some of them are major pests of potato crops. All Epitrix species are morphologically highly similar, which makes them difficult to identify and limits their study and management. Identification of species is mostly based on the observation of the genitalia and requires a high level of expertise. Here, we propose a tool to reliably identify all developmental stages of the most economically important Epitrix species feeding on potato in Europe and North America (Epitrix cucumeris, Epitrix similaris, Epitrix tuberis, Epitrix subcrinita and Epitrix hirtipennis). We first sequenced two DNA markers (mitochondrial cytochrome c oxidase I (COI) and nuclear internal transcribed spacer 2 (ITS2)) to test their effectiveness in differentiating among six Epitrix species (126 specimens). Morphospecies of Epitrix were well-differentiated by both DNA barcodes and no mitochondrial introgression was detected. Then, we developed an RFLP-based diagnostic method and showed that unambiguous species discrimination can be achieved by using the sole restriction enzyme TaqI on COI polymerase chain reaction products. The tool proposed here should improve our knowledge about Epitrix species biology, distribution and host range, three capacities that are particularly important in the detection and management of these pest species. Specifically, this tool should help prevent the introduction of E. tuberis and E. subcrinita in Europe and limit the spread of the recently introduced E. cucumeris and E. similaris, with minimal disruption to Solanaceae trade. [ABSTRACT FROM PUBLISHER]

Published
2013
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