23 results on '"Ambrasienė, Daiva"'
Search Results
2. Diversity in prevalence and genospecies of Borrelia burgdorferi sensu lato in Ixodes ricinus ticks and rodents in Lithuania and Norway
- Author
-
Paulauskas, Algimantas, Ambrasiene, Daiva, Radzijevskaja, Jana, Rosef, Olav, and Turcinaviciene, Jurga
- Published
- 2008
- Full Text
- View/download PDF
3. Bedside stratification of patients according to CYP2C19*2 genotype
- Author
-
Karaliūtė, Rasa, primary, Gustienė, Olivija, additional, Kupstytė, Nora, additional, Ambrasienė, Daiva, additional, and Tatarūnas, Vacis, additional
- Published
- 2018
- Full Text
- View/download PDF
4. Molecular investigations of prevalence of human papillomavirus in Lithuania
- Author
-
Ambrasienė, Daiva, primary, Paulauskas, Algimantas, additional, Girdauskaitė, Neringa, additional, and Gudlevičienė, Živilė, additional
- Published
- 2015
- Full Text
- View/download PDF
5. Distribution of Ixodes ricinus L. ticks and prevalence of their endoparasites in Lithuania and its determinant factors
- Author
-
Ambrasienė, Daiva, Paulauskas, Algimantas, Gražulevičienė, Regina, Butkauskas, Dalius, Juknys, Romualdas, Lazutka, Juozas Rimantas, Ozolinčius, Remigijus, Gedminas, Artūras, Sruoga, Aniolas, and Vytautas Magnus University
- Subjects
Erkės ,Ticks ,PCR ,Borrelia ,Ecology and Environmental Studies ,Ixodes ricinus ,PGR ,Endoparasites ,Endoparazitai - Abstract
Due to climate change, marked developments are tracked in various links of pathogen-host distribution. Markedly increased number of ectoparasites is observed in Central and Eastern Europe. Ticks are blood feeding wide group of arthropods of utmost medical, epidemiological and veterinary significance throughout the world. The ecology of ticks, the outcome of their interactions with their natural environment, is fundamental to the spatial and temporal variation in the risk of infection by tick-borne pathogens. The aim of the study was to investigate: the distribution of Ixodes ricinus ticks and their transmitted parasites prevalence in different biotopes in Lithuania; and to find out factors influencing the activity dynamics of ticks and prevalence of endoparasites. The scientific researches on ectoparasite-endoparasite system (I. ricinus-B.burgdorferi s.l., B.divergens and Ehrlichia sp.) in different biotopes in Lithuania have been carried out for the first time. Also, it was the first investigation of prevalence of ticks (according to development phases and different sexes) in different biotopes and ticks infectious by microparasites. Influence of the main factors (air temperature, precipitations) on seasonal and daily activity changes of ticks have been described. Experiments on ectoparasites and endoparasites have been employed by the procedures on molecular level, including PCR method. As the result of the study the specificity of ticks’ species has been identified... [to full text] Vykstant klimato atšilimui yra stebimi ryškūs pokyčiai įvairiose parazitas-šeimininkas sistemos grandyse. Pastebimas ektoparazitų skaitlingumo padidėjimas Vidurio ir Rytų Europoje. Erkės yra įvairių zoonozių ir antropozių, kurias sukelia įvairūs virusai, bakterijos ir protistai, pernešėjai. Erkių platinamų ligų sukėlėjų patogeninių bakterijų (Borrelia sp., Ehrlichia sp. ir kt.) ir protistų (Babesia sp. ir kt.) tyrimus turi apimti visus ekologinius lygmenis: patogeninio organizmo, vektoriaus ir rezervuarinio šeimininko. Šio darbo tikslas – nustatyti Ixodes ricinus L. erkių ir jų pernešamų endoparazitų paplitimą skirtinguose biotopuose Lietuvoje bei išaiškinti veiksnius, turinčius įtakos erkių aktyvumui ir endoparazitų paplitimui. Lietuvoje pirmą kartą buvo atlikti ektoparazito - endoparazito sistemos (I. ricinus–B.burgdorferi s.l., B.divergens ir Ehrlichia sp.) tyrimai skirtinguose Lietuvos biotopuose. Buvo įvertintas bendras erkių (pagal vystymosi stadiją ir lytį) paplitimas skirtinguose biotopuose, jų užsikrėtimas mikroparazitais ir išanalizuoti veiksniai, lemiantys erkių aktyvumo sezoninius ir paros kitimus, gausumą ir užsikrėtimą. Ektoparazitų ir endoparazitų tyrimams buvo įdiegtas polimerazės grandininės reakcijos metodas ir identifikuotas erkių rūšinis specifiškumas, nustatyti mikroparazitai bei jų genotipai. Buvo nustatytas mikroparazitų paplitimas skirtinguose Lietuvos biotopuose ir ištirti veiksniai, galintys sąlygoti šį paplitimą. Pirmą kartą Lietuvoje buvo... [toliau žr. visą tekstą]
- Published
- 2007
6. Frequency of prenatal determination of 13, 18 and 21 trisomies and link with risk factors
- Author
-
Jotautis, Vaidas, primary, Ambrasienė, Daiva, additional, Serapinas, Danielius, additional, and Vitkauskienė, Astra, additional
- Published
- 2014
- Full Text
- View/download PDF
7. Prostatos specifinio antigeno koncentracijos reikšmė prostatos vėžio ankstyvoje diagnostikoje
- Author
-
Staradumskytė, Daiva, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University, Pranskėtienė, Eugenija, Staradumskytė, Daiva, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University, and Pranskėtienė, Eugenija
- Abstract
Prostatos specifinio antigenas (PSA) yra vertingas prostatos vėžio biocheminių žymeklis, naudojamas dėl atrankinės patikros, diagnozės ir prostatos vėžio ligos stebėsenos. Prostatos specifinis antigenas yra baltyminė medžiaga, kurį gaminama prostatoje. Jos mažas kiekis visada yra sveiko vyro kraujo serume. Kai prostatoje yra vėžinis procesas, PSA kraujyje dažnai padidėja. Prostatos specifinis antigenas - vis dar vienintelis prostatos vėžio laboratorinis žymeklis , kurį verta tirti sveikus vyrus ir tikintis, kad butu aptiktas laiku piktybinis prostatos liaukos vėžinis procesas. Nacionalinės prostatos vėžio prevencijos programą Lietuvoje pradėta nuo 2006 metų. Būtent 50-75 metų vyrams, taip pat vyrams nuo 45 metų, jei jų tėvai ar broliai sirgo prostatos vėžiu. Vš. Į. Pakruojo ligoninėje PSA tyrimai buvo atliekami remiantis SAM įsakymu, kuris numato ir įpareigoja atlikti PSA tyrimą pagal valstybinę prevencinę programą. Į darbą įtraukti ir išanalizuoti duomenys nuo 2009 m. sausio mėn. iki 2010 gruodžio mėn. 31dienos. Tiriamojo mokslinio darbo metu nuo 2009 sausio mėnesio iki 2010 gruodžio mėnesio analizatoriumi AVA -360 buvo nustatoma PSA koncentracija 1650 pacientų kraujo serume Tyrimas parodė, kad siunčiamų tyrimų skaičius 2009-2010 metais, kuriems buvo atliktas PSA tyrimas sudarė: pagal prevencinė valstybinė programa pasitikrino 1197 vyrai ir 440 vyrų pasitikrino mokamai. PSA koncentracijos padidėjimas pastebėtas visose amžiaus grupėse. ... [toliau žr. visą tekstą], Prostate-specific antigen (PSA) is a valuable biochemical marker of prostate cancer, when used for screening, diagnosis and monitoring of prostate cancer. Prostate specific antigen is a protein substance produced by the prostate. They are always a small amount of healthy male blood serum. When the prostate is cancerous process, PSA levels often increased. Prostate specific antigen - is still the only laboratory marker of prostate cancer, which is worth investigating in healthy men and hope that time would be detected malignant cancerous prostate glands in the process. National prostate cancer prevention program was started in Lithuania since 2006. It was 50-75 years for men, as well as men from 45 years if their parents or brothers had prostate cancer. Pakruojis hospital PSA tests were carried out according to the order of the SAM, which provides for the PSA test to be carried out under the national prevention program. The work included analysis of data from 2009 January. until December 2010. During the investigation of scientific work from January 2009 to December 2010 analyzer -360 AVA was established in 1650 by PSA concentration in serum of patients The study showed that the outgoing number of studies in 2009-2010, which was carried out in the PSA test were as follows: according to undergo a preventive program for the state in 1197 men and 440 men undergo paid. PSA concentration increase was observed in all age groups. To sum up the results and... [to full text]
- Published
- 2011
8. Blusų (Insecta: Siphonaptera) rūšinė įvairovė ir užsikrėtimas Borrelia bei Anaplasma Lietuvoje
- Author
-
Paulauskas, Algimantas, Sruoga, Aniolas, Rugienius, Rytis, Tubelytė, Vaida, Radzijevskaja, Jana, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University, Kundrotaitė, Indrė, Paulauskas, Algimantas, Sruoga, Aniolas, Rugienius, Rytis, Tubelytė, Vaida, Radzijevskaja, Jana, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University, and Kundrotaitė, Indrė
- Abstract
Lietuvoje nuo 6 rušių graužikų (Apodemus agrarius, Apodemus flavicollis, Myodes glareolus, Microtus agrestis, Microtus arvalis, Sciurus vulgaris) surinktos 259 blusos ir identifikuota jų sistematinė padėtis, priklausanti trims šeimoms: Ceratophyllidae, Ctenophthalmidae ir Hystrichopsyllidae. Taip pat apibūdintos kai kurios rūšys: Ctenophthalmus agyrtes, Megabothris turbidus, M. walkeri, Hystrichopsylla talpae, Ceratophyllus sciurorum. Norvegijoje nuo 1 rūšies graužikų (A. flavicollis) surinktos 136 blusos, priklausančios Ceratophyllidae ir Ctenophthalmidae šeimoms. Įvertintas graužikų užsikrėtimas blusomis, kuris skyrėsi priklausomai nuo rūšies ir nuo sugavimo vietovės. Lietuvos teritorijoje Šilutės rajone sugautuose graužikuose ekstensyvumas didžiausias (Kintuose - 64%, Muižėje - 60%), o Kaune mažiausias - 43%. Didžiausias blusų ekstensyvumas M. agrestis – 78%, o mažiausias A. flavicollis – 48%. Intensyviausiai blusomis užsikrėtę Muižės ir Prienų graužikai (4 blusos viename graužike). Norvegijos teritorijoje blusų ekstensyvumas didžiausias Lista sugautuose graužikuose - 62%, o Hinebbu mažiausias - 25%. Norvegijos vietovių (Jomfruland, Hinebbu, Lista) blusų ekstensyvumas A. flavicollis – 49%. Intensyviausiai blusomis užsikrėtę Lista graužikai (3 blusos viename graužike). Ištirtas blusų užsikrėtimas Borrelia ir Anaplasma. B. burgdorferi s. l. patogenas neaptiktas nė vienoje blusoje, o Anaplasma identifikuota 128 (54%) blusose. Daugiausia Anaplasma patogenu užsikrėtusių... [toliau žr. visą tekstą], A total 259 fleas were collected on 6 small rodents species (Apodemus agrarius, Apodemus flavicollis, Myodes glareolus, Microtus agrestis, Microtus arvalis, Sciurus vulgaris) in Lithuania. Three families of fleas on rodents were identified: Ceratophyllidae, Ctenophthalmidae and Hystrichopsyllidae. A few species was described: Ctenophthalmus agyrtes, Megabothris turbidus, M. walkeri and Hystrichopsylla talpae, Ceratophyllus sciurorum. A total 136 fleas were collected on 1 small rodents (A. flavicollis) in Norway. Two families of fleas on rodents was identified: Ceratophyllidae and Ctenophthalmidae. Infestation fleas on rodents were estimated who was different depending on rodents species and district of capture. The overall prevalence of infestation with fleas was the biggest 64% in Kintai and the smallest 43% in Kaunas. The biggest prevalence of infestation with fleas was 78% for M. agrestis and the smallest 48% for A. flavicollis. The overall intensity of infestation with fleas was the biggest on rodents in Muize and Prienai (four fleas in one rodent). The overall prevalence of infestation with fleas was the biggest 62% in Lista and the smallest 25% in Hinebbu. The prevalence of infestation with fleas was 49% for A. flavicollis in Norway (Jomfruland, Hinebbu, Lista). The overall intensity of infestation with fleas was the biggest on rodents in Lista (threer fleas in one rodent). Infection Borrelia and Anaplasma on fleas were investigated. No fleas were found to be infected... [to full text]
- Published
- 2010
9. Elninių genetinė įvairovė bei jų pernešamų erkių užsikrėtimas Borrelia burgdorferi s.l. ir Anaplasma phagocytophilum
- Author
-
Paulauskas, Algimantas, Radzijevskaja, Jana, Rugienius, Rytis, Sruoga, Aniolas, Tubelytė, Vaida, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University, Pūraitė, Irma, Paulauskas, Algimantas, Radzijevskaja, Jana, Rugienius, Rytis, Sruoga, Aniolas, Tubelytė, Vaida, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University, and Pūraitė, Irma
- Abstract
Elninių genetinei įvairovei nustatyti buvo tiriami 27 tauriųjų elnių ir 36 stirnų individai. Tauriųjų elnių ir stirnų pavyzdžiai surinkti 2006-2009 metais Lietuvoje ir 2007 m. Norvegijoje. Individai tirti naudojant AADP (atsitiktinai amplifikuotos DNR polimorfizmo) ir PGR (polimerazės grandininė reakcija) metodiką. Tyrimams naudoti kepenų ir raumenų pavyzdžiai. Stirnų ir tauriųjų elnių individai buvo analizuojami naudojant dešimt pradmenų: ROTH-180-01, ROTH-180-02, ROTH-180-03, ROTH-180-04, ROTH-180-05, ROTH-180-06, ROTH-180-07, ROTH-180-08, ROTH-180-09, ROTH-180-10. Elektroforezės gelių rezultatai parodė, kad polimorfinių lokusų skaičius yra 79, o fragmentų dydis - nuo 150 iki 3000 bazių porų. Nustačius fragmentų dydžius ir skaičius, gauti duomenys buvo suvesti į „TREECON for Windows“ kompiuterinę programą, kuria remiantis įvertintas genetinis kintamumas. Genetinis kintamumas tarp tirtų tauriųjų elnių individų varijavo nuo 0,08 iki 0,80, tarp stirnų – nuo 0,04 iki 0,76. Buvo įvertintas ir 75 Ixodes ricinus erkių, surinktų nuo elninių, užsikrėtimas Borrelia burgdorferi s.l. ir Anaplasma phacytophilum. 2,7% tirtų erkių buvo infekuotos Borrelia burgdorferi s.l., o 1,3% erkių – Anaplasma phagocytophilum., The Red deer (Cervus elaphus) 27 individuals from Lithuania and Norway and the Roe deer (Capreolus capreolus) 36 individuals from Lithuania were analyzed by RAPD (random amplified polymorphic DNA) polymerase chain reaction (PCR). The liver and muscle tissues samples were used for the investigations. Cervid individuals were analyzed using ten primers (ROTH-180-01, ROTH-180-02, ROTH-180-03, ROTH-180-04, ROTH-180-05, ROTH-180-06, ROTH-180-07, ROTH-180-08, ROTH-180-09, ROTH-180-10). Electrophoresis gels showed that the number of polymorphic loci are 79 and fragments size are from 150 to 3000. „TREECON for Windows“ programm was used for the estimation of genetic variability. Genetic variability among the Red deer separate individual varied from 0,08 to 0,80 and among the Roe deer varied from 0,04 to 0,76. A total 75 Ixodes ricinus ticks collected from cervids were examined for Borrelia burdorferi s.l. and Anaplasma phagocytophilum. Borrelia burgdorferi s.l. were detected in 2 ticks (2,7%) and Anaplasma phagocytophilum in 1 tick (1,3%).
- Published
- 2010
10. Geltonkaklių pelių (Apodemus flavicollis) genetinis kintamumas ir užsikrėtimas Anaplasma sp. ir Borrelia burgdorferi s.l
- Author
-
Tubelytė, Vaida, Rugienius, Rytis, Radzijevskaja, Jana, Sruoga, Aniolas, Ambrasienė, Daiva, Paulauskas, Algimantas, Vytautas Magnus University, Staradumskytė, Daiva, Tubelytė, Vaida, Rugienius, Rytis, Radzijevskaja, Jana, Sruoga, Aniolas, Ambrasienė, Daiva, Paulauskas, Algimantas, Vytautas Magnus University, and Staradumskytė, Daiva
- Abstract
Naudojant atsitiktinai amplifikuotos polimorfinės DNR ir polimerazinės grandinės reakcijos (AAPD - PGR) metodą įvertintas genetinis kintamumas Apodemus flavicollis iš dvylikos skirtingų populiacijų esančių keturiose Europos šalyse (Norvegija, Suomija, Latvija, Lietuva). Iš dešimties oligonukleotidinių pradmenų (ROTH – 180 -01, ROTH – 180 – 02, ROTH – 180 – 03, ROTH – 180 – 04, ROTH – 180 – 05, ROTH – 180 – 06, ROTH – 180 – 07, ROTH – 180 – 08, ROTH – 180 – 09, ROTH – 180 – 10) šeši buvo tinkami tirtos rūšies populiacinei analizei. Elektroforezės metu buvo nustatyti 180 skirtingų fragmentų. Duomenų analizė buvo atlikta su PopGene3.2, TREECON kompiuterinėmis programomis. Buvo apskaičiuoti populiacijų DNR polimorfizmai, polimorfinių lokusų skaičius. Nubraižytos filogenetinių ryšių dendogramos. Pasinaudojant polimerazine grandinine reakcija buvo patikrintas graužikų užsikrėtimas B. burgdorferi s. l. ir Anaplasma sp.trijose populiacijose (Ombo, Tromoya, Tuja)., DNA polymorphism were analyzed by a randomly amplified polymorphic DNA polymerase chain reaction (RAPD - PCR) technique studied in 209 specimens of Apodemus flavicollis from twelve different populations from four different countries of Europe (Norway, Finland, Latvia, Lithuania) using ten primers (ROTH – 180 -01, ROTH – 180 – 02, ROTH – 180 – 03, ROTH – 180 – 04, ROTH – 180 – 05, ROTH – 180 – 06, ROTH – 180 – 07, ROTH – 180 – 08, ROTH – 180 – 09, ROTH – 180 – 10) six of them gave specific patterns and could be used as genetic markers for the species analyzed. Visual examination of electrophoresis gels showed that the number af polymorphic loci are 180. PopGene3.2, TREECON was used for the estimation of genetic variability, DNA polimorfism, polimorfic locus. Were painted phylogenetic trees of populations. Using PCR mice infestation of B. burgdorferi s. l. and Anaplasma sp were analyzed from 3 populations (Tromoya, Ombo, Tuja).
- Published
- 2010
11. Aktyviųjų deguonies formų (ROS) susidarymo mitochondrijose hipertermijos sąlygomis priklausomybės nuo lyties tyrimas
- Author
-
Žūkienė, Rasa, Naučienė, Zita, Ambrasienė, Daiva, Mildažienė, Vida, Vytautas Magnus University, Pivoras, Tomas, Žūkienė, Rasa, Naučienė, Zita, Ambrasienė, Daiva, Mildažienė, Vida, Vytautas Magnus University, and Pivoras, Tomas
- Abstract
Darbo tikslas buvo nustatyti aktyviųjų deguonies formų susidarymo kepenų mitochondrijose hipertermijos metu priklausomybę nuo lyties. Šiam tikslui buvo atliekami trijų rūšių bandymai. Buvo tiriama mitochondrijų kvėpavimo greičio antroje metabolinėje būsenoje 37 oC temperatūroje ir hiperterminės inkubacijos (40, 42, 45oC) metu, izoliuotose žiurkių kepenų mitochondrijose, priklausomybė nuo lyties. Taip pat buvo matuojamas ROS susidarymo greitis pagal fruorescencinio dažo H2DCF oksidacijos greitį hiperterminės inkubacijos (40, 42, 45oC) metu žiurkių patinų ir patelių kepenų mitochondrijose. Bei matuojami lipidų peroksidacijos produkto malono dealdehido koncentracijos pokyčiai hiperterminės inkubacijos (40, 42, 45oC) metu. Remiantis gautais rezultatais buvo analizuojama koreliaciją tarp ROS susidarymo greičio, MDA koncentracijos patinų ir patelių kepenų mitochondrijose ir mitochondrijų kvėpavimo greičio hipertermijos metu. Apdorojus gautus rezultatus nustatyta, kad kepenų mitochondrijų atsakas į hipertermiją priklauso nuo lyties ir temperatūros: karščiavimo temperatūra nežymiai aktyvina patelių ir slopina patinų kepenų mitochondrijų kvėpavimą 2 metabolinėje būsenoje. Grubi hipertermija (44-46oC) stipriai atskiria substratų oksidaciją nuo ADP fosforilinimo ir patelių, ir patinų mitochondrijose, atskiriantis poveikis stipresnis patelių mitochondrijoms. 37 oC temperatūroje ROS susidarymo greitis patinų mitochondrijose buvo daugiau nei 6 kartus didesnis už ROS susidarymo greitį... [toliau žr. visą tekstą], The aim of this work was to identify how the generation of reactive oxygen species (ROS) in mitochondria under hyperthermic conditions depends on gender. Therefore three types of experiments were carried out in isolated rat liver mitochondria from male and female animals. The objective of the first experiment series was to identify the gender-dependence of the respiration rate of mitochondria in metabolic state 2 under normal and hyperthermic conditions (37, 40, 42, 45oC). The objective of the second experiment series was to identify how the ROS generation rate in mitochondria, determined by the oxidation of fluorescent dye H2DCF, in normal and hyperthermic conditions (37, 40, 42, 45oC) depends on gender. During the third experiment series the generation of lipid peroxidation product - malondialdehyde (MDA) - was measured in male and female mitochondria under normal and hyperthermic conditions (37, 40, 42, 45oC). The correlation between mitochondrial state 2 respiration rate, ROS generation rate and generation of MDA in male and female mitochondria was analyzed. Our data show that the response of isolated liver mitochondria to hyperthermia depends on gender. 40 to 42 oC temperature softly activates respiratory chain in liver mitochondria in state 2. Rough hyperthermia significantly uncouples the oxidation of substrate from ADP phosphorylation in female and male mitochondria, the uncoupling process is more pronounced in female mitochondria. At 37 oC ROS generation rate in male... [to full text]
- Published
- 2009
12. Europinio bebro(Castor Fiber) Lietuvos populiacijos genetinio giminingumo įvertinimas atsitiktinai padaugintos polimrfinės DNR metodu
- Author
-
Paulauskas, Algimantas, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University, Rimkevičienė, Deimantė, Paulauskas, Algimantas, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University, and Rimkevičienė, Deimantė
- Abstract
Šio darbo tikslas buvo ištirti atsitiktinai padaugintos polimorfinės DNR (APPD) metodu skirtingas Europinio bebro (Castor fiber) subpopuliacijas Lietuvoje. Buvo ištirtos Europinio bebro 4 subpopuliacijose: Mituvos, Vilkaraisčio, Giedraičių ir Rusnės salos. DNR atsitiktinai padaugintų fragmentų polimorfizmas buvo tirtas naudojant 10 pradmenų. Pagal Nei apskaičuotą genetinę distanciją tarp populiacijų, labiausiai genetiškai panašios buvo Giedraičių ir Vilkraisčio subpopuliacijos (0,936), didžiausia genetinė distancija nustatyta tarp Rusnės salos ir Vilkaraisčio subpopuliacijų (0,288). Ištirtos subpopuliacijos grupuojasi į du klasterius: vieną klasterį sudaro Rusnės salos ir Mituvos subpopuliacijos, kitą – Vilkaraisčio ir Giedraičių subpopuliacijos. Europinio bebro subpopuliacijų genetinei įvairovei nustatyti, Popgene programa buvo apskaičiuoti 4 parametrai. Shannon informacinis indeksas svyravo nuo 0,2527 (Rusnės sala) iki 0,3895 (Giedraičiai). Nei genetinė įvairovė svyravo nuo 0,1677 (Rusnės sala) iki 0,2589 (Mituva). Didžiausias nustatytas alelių skaičius buvo Mituvoje (1,8911), mažiausias Rusnės saloje (1,5050). Efektyvus alelių skaičius svyravo nuo 1,2864 (Rusnės sala) iki 1,444 (Giedraičiai). Didžiausia genetinė įvairovė buvo aptikta Mituvos subpopuliacijoje, o mažiausia genetine įvairove pasižymi Rusnės salos subpopuliacija. Daugiausia polimorfinių lokusų buvo aptikta Mituvos subpopuliacijoje (89,11%), o mažiausiai Rusnės salos subpopuliacijoje (50,5%). Nustatėmė, kad... [toliau žr. visą tekstą], The aim of this study is to evaluate genetic structure of European beavers (Castor fiber) subpopulations from Lithuania using RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) method. We investigated genetic variability of 4 subpopulations from Rusne, Mituva, Giedraiciai and Vilkaraistis. 10 primers were used in this analysis. Acording to Nei‘s genetic identity, the most similar were subpopulations from Giedraiciai and Vilkaraistis (0,936), the highest genetic distance was observed between subpopulations from Rusnes island and Vilkaraistis (0,288). These subpopulations form two clusters: Mituva and Rusnes island forms one cluster and Vilkaraistis and Giedraiciai – another. To evaluate the genetic variation in subpopulations we analysed four parameters. Shannon’s informations index was from 0,2527 in Rusnes island to 0,3895 in Giedraiciai.The highest Nei‘s genetic variaty was observed in subpopulation from Mituva and the smallest in Rusnes island (0,1677).The highest number of alleles was detected in Mituva (1,8911) and the smalest in Rusnes island (1,5050). The efective number of alleles was from 1,2864 in Rusnes island to 1,444 in Giedraiciai. From these parametres we can see that the most genetic diversity is observed in subpopulation from Mituva and the smallest in subpopulation from Rusnes island. We detected that the in Rusnes island 50,5 % of loci were polimorphic, and in subpopulation from Mituva even 89,11% of loci were polimorphic. We found out that molecular diversity is... [to full text]
- Published
- 2008
13. Distribution of Ixodes ricinus L. ticks and prevalence of their endoparasites in Lithuania and its determinant factors
- Author
-
Paulauskas, Algimantas, Gražulevičienė, Regina, Butkauskas, Dalius, Juknys, Romualdas, Lazutka, Juozas Rimantas, Ozolinčius, Remigijus, Gedminas, Artūras, Sruoga, Aniolas, Vytautas Magnus University, Ambrasienė, Daiva, Paulauskas, Algimantas, Gražulevičienė, Regina, Butkauskas, Dalius, Juknys, Romualdas, Lazutka, Juozas Rimantas, Ozolinčius, Remigijus, Gedminas, Artūras, Sruoga, Aniolas, Vytautas Magnus University, and Ambrasienė, Daiva
- Abstract
Due to climate change, marked developments are tracked in various links of pathogen-host distribution. Markedly increased number of ectoparasites is observed in Central and Eastern Europe. Ticks are blood feeding wide group of arthropods of utmost medical, epidemiological and veterinary significance throughout the world. The ecology of ticks, the outcome of their interactions with their natural environment, is fundamental to the spatial and temporal variation in the risk of infection by tick-borne pathogens. The aim of the study was to investigate: the distribution of Ixodes ricinus ticks and their transmitted parasites prevalence in different biotopes in Lithuania; and to find out factors influencing the activity dynamics of ticks and prevalence of endoparasites. The scientific researches on ectoparasite-endoparasite system (I. ricinus-B.burgdorferi s.l., B.divergens and Ehrlichia sp.) in different biotopes in Lithuania have been carried out for the first time. Also, it was the first investigation of prevalence of ticks (according to development phases and different sexes) in different biotopes and ticks infectious by microparasites. Influence of the main factors (air temperature, precipitations) on seasonal and daily activity changes of ticks have been described. Experiments on ectoparasites and endoparasites have been employed by the procedures on molecular level, including PCR method. As the result of the study the specificity of ticks’ species has been identified... [to full text], Vykstant klimato atšilimui yra stebimi ryškūs pokyčiai įvairiose parazitas-šeimininkas sistemos grandyse. Pastebimas ektoparazitų skaitlingumo padidėjimas Vidurio ir Rytų Europoje. Erkės yra įvairių zoonozių ir antropozių, kurias sukelia įvairūs virusai, bakterijos ir protistai, pernešėjai. Erkių platinamų ligų sukėlėjų patogeninių bakterijų (Borrelia sp., Ehrlichia sp. ir kt.) ir protistų (Babesia sp. ir kt.) tyrimus turi apimti visus ekologinius lygmenis: patogeninio organizmo, vektoriaus ir rezervuarinio šeimininko. Šio darbo tikslas – nustatyti Ixodes ricinus L. erkių ir jų pernešamų endoparazitų paplitimą skirtinguose biotopuose Lietuvoje bei išaiškinti veiksnius, turinčius įtakos erkių aktyvumui ir endoparazitų paplitimui. Lietuvoje pirmą kartą buvo atlikti ektoparazito - endoparazito sistemos (I. ricinus–B.burgdorferi s.l., B.divergens ir Ehrlichia sp.) tyrimai skirtinguose Lietuvos biotopuose. Buvo įvertintas bendras erkių (pagal vystymosi stadiją ir lytį) paplitimas skirtinguose biotopuose, jų užsikrėtimas mikroparazitais ir išanalizuoti veiksniai, lemiantys erkių aktyvumo sezoninius ir paros kitimus, gausumą ir užsikrėtimą. Ektoparazitų ir endoparazitų tyrimams buvo įdiegtas polimerazės grandininės reakcijos metodas ir identifikuotas erkių rūšinis specifiškumas, nustatyti mikroparazitai bei jų genotipai. Buvo nustatytas mikroparazitų paplitimas skirtinguose Lietuvos biotopuose ir ištirti veiksniai, galintys sąlygoti šį paplitimą. Pirmą kartą Lietuvoje buvo... [toliau žr. visą tekstą]
- Published
- 2007
14. Selection of RAPD primers for geographically most distinct Lithuanian populations of Impatiens parviflora
- Author
-
Janulionienė, Rasa, primary, Žukauskienė, Judita, additional, Jodinskienė, Milda, additional, Ambrasienė, Daiva, additional, Paulauskas, Algimantas, additional, and Kupčinskienė, Eugenija, additional
- Published
- 2011
- Full Text
- View/download PDF
15. Genetics Polymorphism Study of Ixodes Ricinus L. Populations in Lithuania using RAPD Markers
- Author
-
Radzijevskaja, Jana, primary, Indriulytė, Renata, additional, Paulauskas, Algimantas, additional, Ambrasienė, Daiva, additional, and Turčinavičienė, Jurga, additional
- Published
- 2005
- Full Text
- View/download PDF
16. Population Dynamics ofIxodes RicinusTicks and the Rate of Infection withBorrelia BurgdorferiSensu Lato
- Author
-
Vaščilo, Ilona, primary, Ambrasienė, Daiva, additional, Turčinavičienė, Jurga, additional, and Žygutienė, Milda, additional
- Published
- 2004
- Full Text
- View/download PDF
17. Chimaerism analysis after allogeneic haematopoietic stem cell transplantation in Lithuanian children.
- Author
-
Rascon, Jelena, Ambrasienė, Daiva, Vaitkevičienė, Goda, Pasaulienė, Ramunė, Nedzelskienė, Irena, Savinas, Aleksandras, and Ragelienė, Lina
- Subjects
- *
STEM cell transplantation , *HEMATOPOIETIC stem cells , *LEUCOCYTES , *TRANSPLANTATION of organs, tissues, etc. , *GRAFT rejection - Abstract
The aim of this study was to analyse the chimaerism kinetics in children after allogeneic HSCT performed in Vilnius University Children's Hospital. The review focused on the relationship of chimaerism kinetics and clinical course. In addition, the impact of different pre-transplant variables on the chimeric state was proven. Patients and methods. The patients' cohort consisted of 19 children with malignant and non-malignant haematological disorders. Stem cells were procured from HLA-identical siblings and HLA-matched unrelated donors. Chimeric state was assessed by means of multiplex-PCR using STR polymorphisms. The analysed DNA was extracted from whole blood leukocytes. Results. Complete DC developed in 47.4% (9/19), MC did in 52.6% (10/19) of patients. The children with non-malignant disorders showed stable and increasing MC patterns meanwhile the leukaemic patients revealed exclusively increasing MC. Development of MC was consistent with non-malignant disorder (p = 0.033) and non-myeloablative conditioning (p = 0.033). In 2 of 5 non-malignant patients MC was followed by graft rejection whereas in patients with haematological malignancies MC was found to be strongly associated with leukaemic relapse (p = 0.002). Both events were the principal factors that limited OS in patients with MC to 50.0%. On the contrary, patients with DC succumbed mostly to the transplant related mortality (p = 0.049) resulting in similar OS of 55.6%. Conclusions. Chimeric state had no significant impact either on the EFS (p = 0.435) or on the OS (p = 0.601). The results confirmed the reports of other European centres that studied chimaerism kinetics and are consistent with the current transplant practice in Europe. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2007
18. MOLECULAR DIVERSITY OF LITHUANIAN IMPATIENS GLANDULIFERA BASED ON INTER-SIMPLE SEQUENCE REPEAT MARKERS.
- Author
-
Zybartaitė, Lina, Stravinskaitė, Kristė, Ambrasienė, Daiva, Paulauskas, Algimantas, and Kupčinskienė, Eugenija
- Subjects
PLANT molecular biology ,HIMALAYAN balsam ,ORNAMENTAL plants ,PLANT habitats ,GENETIC markers in plants ,PLANT diversity - Abstract
Himalayan balsam or policeman's helmet (Impaties glandulifera Royle) is an annual ornamental plant with attractive flowers. Introduced to Europe in the XIX century from Himalayas Mountains quickly it became a garden favourite but nowadays had become a prodigious weed occupying natural habitats. The objective of the research was to analyse genetic diversity of different in geography populations of I. glandulifera growing in Lithuania. Four most contrasting according to the geography I. glandulifera populations (Dieveniškės, Piktuižiai, Švėkšna, Zarasai) were selected for the investigation. Genetic diversity of I. glandulifera populations was evaluated using inter-simple sequence repeat (ISSR ) markers. Selected ISSR primer generated between 18 and 21 DNA bands each. In total, 80 DNA bands were recorded and all of them were polymorphic. Percentage of polymorphic DNA bands for separate populations of I. glandulifera ranged between 34 and 61, the mean being 43. Nei's gene diversity interval was 0.104-0.198 and Shannon's information index ranged between 0.160-0.303. Pairwise genetic distances between populations ranged from 0.165 to 0.317. Results of analyses of molecular variance showed quite similar intra and inter variation between populations (45% within and 55% among populations). The UPGMA dendrogram revealed a clear differentiation between the populations. The obtained results revealed that chosen ISSR markers are valuable for the evaluation of molecular diversity of I. glandulifera populations. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2013
19. DIVERSITY OF LISTERIA MONOCYTOGENES ISOLATED FROM HUMANS, FOOD, AND ENVIRONMENTAL SOURCES IN NORWAY.
- Author
-
Rosef, Olav, Klæboe, Halvdan, Paulauskas, Algimantas, and Ambrasienė, Daiva
- Subjects
- *
LISTERIA monocytogenes , *FOOD microbiology , *HUMAN microbiota , *FOOD safety ,MICROORGANISM identification - Abstract
A total of 325 Listeria monocytogenes isolates from human, food and environmental sources were ribotyped with the Qualicon Automated Riboprinter Microbial Characterization System, using the enzyme EcoR1. The human isolates (n=137) represented all isolates from clinical cases in Norway from 1992 to 2005. The food and environmental isolates (n=188) were collected from different food related sources in Norway in the period 1989-2002. A total of 37 ribotypes were differentiated. Most common ribotypes (i.e., ribotypes represented by >5 isolates) were isolated from human as well as food and environmental sources. The exceptions were ribotypes DUP-1062D and 1058A, which were found only among food and environmental samples (14 and 5 times, respectively), and DUP-1042A, which was identified only among human clinical isolates. DUP-1030A, the most frequent ribotype among the human isolates, as well as ribotypes DUP-1042B, DUP-1042C, DUP-1049B and DUP-1062B were identified from both foods, environmental and human sources. DUP-1039C (n=54) and DUP-1045B (n=27) were frequently isolated from patients, food and environmental samples. The isolates were classified into lineages based on ribotyping results. The lineage I strain DUP-1038B was isolated every year from 1992 to 2005 from the human clinical samples. Out of 137 listeriosis cases, 76 (55.6%) were caused by lineage II strains. We found a considerable overlap between ribotypes, lineages and isolation sources. It does not seem possible to establish food strain specific regulations for L. monocytogenes based on ribotyping. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2012
20. Semaforino 3A ir nervų augimo faktoriaus įtaka sensorinių neuronų aksonų augimui
- Author
-
Vosyliūtė, Rūta, Šatkauskas, Saulius, Batiuškaitė, Danutė, Rugienius, Rytis, Tubelytė, Vaida, Radzijevskaja, Jana, Ambrasienė, Daiva, Sruoga, Aniolas, and Vytautas Magnus University
- Subjects
Signaling molecules ,Nervų augimo faktorius (NGF) ,Aksonų augimas ,Nerve growth factor (NGF) ,Signalinės molekulės ,Aksonų augimo kūgeliai ,Axons growth cones ,Semaphorins ,Biology ,Axons growth ,Semaforinai - Abstract
Yra žinoma, jog nervinės ląstelės gali regeneruoti savo aksonus po periferinės, o tam tikrais atvejais ir po centrinės nervų sistemos pažeidimų. Tačiau aksonų augimas yra sudėtingas, o jo reguliacija turi kritinę įtaką tiek neuronų vystymęsi, tiek regeneracijoje. Vekiami aplinkinių ląstelių, išskiriamų pritraukiančiųjų ir atstumiančiųjų molekulių, aksonai augdami nuolat keičia augimo kryptis iki kol pasiekia galutinius taikinius. Dorsalinių ragų ganglijų (DRG) aksonų augimas priklauso nuo semaforinų klasės molekulių. Sekretuojantys, ar su membrana surišti semaforinai dalyvauja įvairiuose biologiniuose procesuose, tokiuose, kaip centrinės ir periferinės nervų sistemos (CNS ir PNS) vystymęsi ir regeneracijoje, širdies ir kraujagyslių vystymęsi ir imuninės sistemos funkcijose. DRG aksonų vystymasis ir išlikimas smarkiai priklauso nuo nervų augimo faktoriaus (NGF). Darbo tikslas buvo įvertinti NGF koncentracijos įtaką DRG aksonų augimo atsakams į semaforiną 3A. 15 parų pelių embrionų DRG buvo preparuojami iš C57/Bl linijos pelių embrionų. DRG neuronų auginimui naudoti sterilūs dengiamieji stikleliai buvo padengiami poli-L-lizino 0,01 mg/ml ir laminino 0,01 mg/ml tirpalu, pagamintu GBSS terpėje. Aksonų augimo kūgelių vertinimas buvo atliekamas praėjus 60 minučių, o aksonų ilgio vertinimas - praėjus 16 valandų po DRG pasodinimo. Tam, kad nustayti DRG apoptozės lygį, DRG neuronuose priklausomai nuo NGF koncentracijos buvo įvertinta Bcl-2, Bax, c-jun genų raiška, naudojant RT - PGR... [toliau žr. visą tekstą] It is known that nerve cells can regenerate their axons after damage to peripheral and in some cases central nervous system (PNS and CNS). However, axon growth over longer distances, especially in central nervous system, is complicated. Regulation of axon growth is a critical event both in neuronal development and regeneration. To reach their proper targets, axons rely upon the actions of attractive and repulsive guidance molecules. It is known that growth of dorsal root ganglion (DRG) axons depend on guidance molecules of semaphorin class. Secreted and membrane bound semaphorins participate in diverse biological processes, including development and regeneration of central and peripheral nervous system, cardiovascular development, and immune system functioning. In addition to regulation of DRG axon growth by semaphorin class molecules, DRG axon growth and survival is strongly dependent on nerve growth factor (NGF). The aim of this study was to evaluate responses of DRG axons to semaphorin 3A in dependence of NGF concentration. DRG were dissected from C57/Bl mice E15 embryos in dissection HBSS/glucose medium. DRG were plated on cover slips coated with laminin and poly-L-lysine and grown in Neurobasal medium supplemented with 2% of B27 supplement. To evaluate collapse rate the morphology of axons growth cones were evaluated after 60 minutes and axons length were evaluated 16 hours after DRG plating. To evaluate DRG survival and level of apoptosis in dependence of NGF... [to full text]
- Published
- 2010
21. Kraujo neutrofilų aktyvumo ypatumai sergant lėtine obstrukcine plaučių liga
- Author
-
Lavinskienė, Simona, Babušytė, Agnė, Ambrasienė, Daiva, Rugienius, Rytis, Tubelytė, Vaida, Radzijevskaja, Jana, Sruoga, Aniolas, and Vytautas Magnus University
- Subjects
Inflammation ,Neutrophils ,Uždegimas ,COPD ,Neutrofilai ,Biology ,LOPL - Abstract
Lėtinė obstrukcinė plaučių liga (LOPL) - lėtai progresuojanti kvėpavimo takų obstrukcija, atsirandanti dėl nenormalaus uždegiminio plaučių atsako į žalingas su oru įkvepiamas daleles ar dujas. Tai liga, lemianti didelį sergamumą ir mirtingumą visame pasaulyje. Sergant LOPL labiausiai pažeidžiami apatiniai kvėpavimo takai, o taip pat periferiniame kraujyje nustatomas uždegimo žymenų koncentracijų padidėjimas. Pastarasis rodo, jog vyksta sisteminis uždegimas. Kvėpavimo takų sekretas yra biologinė terpė, kurioje esantys imuniniai žymenys atspindi vietinį uždegimą. Tiek vietinio, tiek ir sisteminio uždegiminio proceso metu pagrindinėmis ląstelėmis įvardijamos neutrofilai. LOPL yra daugiakomponentė liga ir siekiant suprasti šios ligos metu vykstančius įvairius patogeninius mechanizmus, būtina įvertinti vietinį ir sisteminį uždegimą jungiančias jungtis bei principus. Norint nustatyti vietinio ir sisteminio uždegimo sąsajas, svarbu įvertinti kvėpavimo takų sekreto tiesioginį poveikį kraujo neutrofilų funkcijoms. Šio darbo tikslas buvo įvertinti kraujo neutrofilų chemotaktinį ir fagocitinį aktyvumą bei reaktyvių deguonies formų (ROS) susidarymo ypatumus sergant LOPL. Kraujo neutrofilų chemotaksis tirtas aktyvinant neutrofilus klasikiniu chemotaksį skatinančiu veiksniu- interleukinu-8 (IL-8), indukuotais skrepliais bei indukuotais skrepliais papildytais skirtingomis IL-8 koncentracijomis (10, 30, 100 ng/ml). Fagocitinis kraujo neutrofilų aktyvumas bei ROS susidarymas buvo tirtas... [toliau žr. visą tekstą] Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) - slowly progressive airway obstruction resulting from abnormal inflammatory response to lung damaging particles of inhaled air or gas. It is a major cause of high morbidity and moratlity worldwide. Patients with COPD has lung injury, but determined increased blood levels of inflammatory markers shows and systemic inflammation. Neutrophils are the key inflammatory cells both in local and systemic inflammatory process. COPD is heterogeneous disease and in order to understand a variety of pathogenic mechanisms it is necessary to evaluate local and systemic inflammation combination characteristics and principles. It is also important to investigate if airway mucus influence blood neutrophils activity. The aim of this study was to evaluate both chemotactic and phagocytic activity and reactive oxygen species (ROS) production in peripheral blood neutrophils during COPD. Blood neutrophils chemotaxis was measured by activation of the interleukin-8 (IL-8), induced sputum and induced sputum and IL-8 different concentration (10, 30 and 100 ng/ml) combination. Phagocytic activity and ROS generation of blood neutrophils was measured after neutrophils activation with serum osponized/non-osponized S. aureus bacteria, induced sputum and induced sputum combination with S. aureus bacteria. The concentrations of 10, 30 and 100 bact./neutrophil S. aureus were used for all experiments. All features of neutrophils in vitro were analyzed by flow... [to full text]
- Published
- 2010
22. Hipertermijos poveikis adenino ir piridino nukleotidų koncentracijai kepenų ląstelėse ir audinyje
- Author
-
Kirvelaitytė, Dovilė, Žūkienė, Rasa, Batiuškaitė, Danutė, Rugienius, Rytis, Tubelytė, Vaida, Radzijevskaja, Jana, Ambrasienė, Daiva, Sruoga, Aniolas, and Vytautas Magnus University
- Subjects
Adenine and pyridine nucleotides ,Hipertermija ,Hepatocitai ,Hepatocytes ,Hyperthermia ,Adenino ir piridino nukleotidai ,Biology - Abstract
Šilumos taikymas įvairioms ligoms gydyti jau buvo naudojamas senovės Egipto, Graikijos, Romos civilizacijose daugiau kaip prieš 2000 m. pr. Šiuo metu hipertermija plačiai taikoma visame pasaulyje gydant vėžį, nes tai pigus ir patogus metodas turintis mažą šalutinį poveikį. Mokslininkai nustatė, kad vėžinės ląstelės greičiau žūsta esant aukštesnei už fiziologinę (41-45°C) temperatūrai, todėl hipertermija, derinama su kitais vėžio gydymo metodais (radioterapija, chemoterapija, imunoterapija ir chirurgija), tampa efektyvesniu metodu. Kadangi yra mažai žinoma apie hipertermijos poveikio mechanizmą sveiko audinio ląstelėms karščiavimo, hiperterminio vėžio gydymo ar gydymo termoabliacija metu, todėl yra svarbu nustatyti hipertermijos paveiktų ląstelių gyvybingumą bei hipertermijos poveikį adenino ir piridino nukleotidų koncentracijoms. Šio darbo tikslas buvo įvertinti hipertermijos, būdingos nutolusioms nuo termozondo audinio sritims poveikį, adenino ir piridino nukleotidų koncentracijoms žiurkės kepenų ląstelėse bei audinyje. Buvo naudojamas jonų porų efektyviosios skysčių chromatografijos metodas, leidžiantis vienoje chromatografinėje analizėje išskirstyti labai skirtingo hidrofobiškumo junginius. Taip pat buvo vertintas gyvų ir negyvų ląstelių skaičius gautoje hepatocitų suspensijoje panaudojant tripano mėlio metodą bei NAD(P)H fluorescencijos pokyčiai kepenų audinyje termoabliacijos metu. Gauti rezultatai parodė, kad išskirti hepatocitai pasižymėjo dideliu gyvybingumu (8... [toliau žr. visą tekstą] The application of heat in the treatment of disease was first recorded in the ancient civilizations of Egypt, Greece, and Rome from as early as 2000 BC. Nowadays hiperthermia is widely using in cancer diseases in all the world. It was determined by many scientists that cancer cells are more sensitive for supraphysiological temperature (41-45°C) killing compared to normal cells. There are numerous evidences that hyperthermia can increase the effectiveness of other cancer therapies: radiotherapy, chemotherapy, immunotherapy and surgery. There is little known about the mechanisms of hyperthermia effects on healthy tissue, which are important in fever, in hyperthermic treatment of neighboring tumour and in thermoablation. Therefore it is very important to determinate the vability of cells during different hyperthermic treatment and hyperthermic effects of adenine ir pyridine nucleotides concentrations.The aim of study was to value the effect of hyperthermia,which is typical remote from thermoprobe tissue areas, on the concentration of adenine and pyridine nucleotides in hepatocytes and liver tissue. It was used ion-pair high-performance liquid chromatography method, which allows to disperse different combinations of hydrophobicity. Also were evaluated live and dead cells quantity in the suspension through tripan blue method and NAD(P)H fluorescence changes in liver tissue during the ablation. The results showed that isolated hepatocytes exhibited with high viability (80%)... [to full text]
- Published
- 2010
23. The evaluation of genetic relationship of European beaver (Castor fiber) population from Lithuania using Random amplified polimorphic DNR method
- Author
-
Rimkevičienė, Deimantė, Paulauskas, Algimantas, Ambrasienė, Daiva, and Vytautas Magnus University
- Subjects
Random amplified polimorphic DNR method ,Europinis bebras ,Relationship ,Subpopuliacijų struktūra ,Castor beaver ,Giminingumas ,Castor fiber ,Biology ,Subpopulation's structure ,Atsitiktinai padaugintos polimorfinės DNR metodas - Abstract
Šio darbo tikslas buvo ištirti atsitiktinai padaugintos polimorfinės DNR (APPD) metodu skirtingas Europinio bebro (Castor fiber) subpopuliacijas Lietuvoje. Buvo ištirtos Europinio bebro 4 subpopuliacijose: Mituvos, Vilkaraisčio, Giedraičių ir Rusnės salos. DNR atsitiktinai padaugintų fragmentų polimorfizmas buvo tirtas naudojant 10 pradmenų. Pagal Nei apskaičuotą genetinę distanciją tarp populiacijų, labiausiai genetiškai panašios buvo Giedraičių ir Vilkraisčio subpopuliacijos (0,936), didžiausia genetinė distancija nustatyta tarp Rusnės salos ir Vilkaraisčio subpopuliacijų (0,288). Ištirtos subpopuliacijos grupuojasi į du klasterius: vieną klasterį sudaro Rusnės salos ir Mituvos subpopuliacijos, kitą – Vilkaraisčio ir Giedraičių subpopuliacijos. Europinio bebro subpopuliacijų genetinei įvairovei nustatyti, Popgene programa buvo apskaičiuoti 4 parametrai. Shannon informacinis indeksas svyravo nuo 0,2527 (Rusnės sala) iki 0,3895 (Giedraičiai). Nei genetinė įvairovė svyravo nuo 0,1677 (Rusnės sala) iki 0,2589 (Mituva). Didžiausias nustatytas alelių skaičius buvo Mituvoje (1,8911), mažiausias Rusnės saloje (1,5050). Efektyvus alelių skaičius svyravo nuo 1,2864 (Rusnės sala) iki 1,444 (Giedraičiai). Didžiausia genetinė įvairovė buvo aptikta Mituvos subpopuliacijoje, o mažiausia genetine įvairove pasižymi Rusnės salos subpopuliacija. Daugiausia polimorfinių lokusų buvo aptikta Mituvos subpopuliacijoje (89,11%), o mažiausiai Rusnės salos subpopuliacijoje (50,5%). Nustatėmė, kad... [toliau žr. visą tekstą] The aim of this study is to evaluate genetic structure of European beavers (Castor fiber) subpopulations from Lithuania using RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) method. We investigated genetic variability of 4 subpopulations from Rusne, Mituva, Giedraiciai and Vilkaraistis. 10 primers were used in this analysis. Acording to Nei‘s genetic identity, the most similar were subpopulations from Giedraiciai and Vilkaraistis (0,936), the highest genetic distance was observed between subpopulations from Rusnes island and Vilkaraistis (0,288). These subpopulations form two clusters: Mituva and Rusnes island forms one cluster and Vilkaraistis and Giedraiciai – another. To evaluate the genetic variation in subpopulations we analysed four parameters. Shannon’s informations index was from 0,2527 in Rusnes island to 0,3895 in Giedraiciai.The highest Nei‘s genetic variaty was observed in subpopulation from Mituva and the smallest in Rusnes island (0,1677).The highest number of alleles was detected in Mituva (1,8911) and the smalest in Rusnes island (1,5050). The efective number of alleles was from 1,2864 in Rusnes island to 1,444 in Giedraiciai. From these parametres we can see that the most genetic diversity is observed in subpopulation from Mituva and the smallest in subpopulation from Rusnes island. We detected that the in Rusnes island 50,5 % of loci were polimorphic, and in subpopulation from Mituva even 89,11% of loci were polimorphic. We found out that molecular diversity is... [to full text]
- Published
- 2008
Catalog
Discovery Service for Jio Institute Digital Library
For full access to our library's resources, please sign in.