Search

الملخص: أهداف البحث: يحمل وجود المبيضات في الدم معدل وفيات مرتفعا، وقد ازدادت حالاته في السنوات القليلة الماضية. اقترحت الدراسات السابقة توزيع متغير من المبيضات بين المناطق المختلفة. وقد أجريت هذه الدراسة لتحديد الأنواع الموجودة في التهابات مجرى الدم بالمبيضات، وتحديد استجابتها لمضادات الفطريات الروتينية، مع نتائج الوفيات في مركز طبي أكاديمي. طرق البحث: بين يناير ٢٠١٢ وديسمبر ٢٠١٨، تمت دراسة نتائج مزارع الدم الإيجابية لعدوى مجرى الدم المبيضية، وتحليلها إحصائيا لانتشار الأنواع ونمط القابلية للحساسية، ومعدل الوفيات بعد ١٤ و٣٠ و٦٠ و٩٠ يوما. النتائج: من بين ١٥٦ حالة من حالات وجود المبيضات في الدم، كان سبب أغلبية الحالات (٦٩.٢٪) غير مجموعة المبيضات البيضاء. بعد مجموعة المبيضات البيضاء (٣٠.٨٪) كانت مجموعتا المبيضات الاستوائية والمبيضات المرطية، ثاني أكثر معزولة في كثير من الأحيان (٢٣.٧٪). واكتشفت المقاومة المكتسبة من الفلوكونازول في ١٤.٨٪ من سلالات المبيضات. ولم يتم الكشف عن أي مقاومة أخرى لمضادات الفطريات. وكانت المعدلات الإجمالية للوفيات لجميع الأنواع ٢٩.٣٪ و٤٧.٩٪ و٥٦.٤٪ و٥٨ في ١٤ و٣٠ و٦٠ و٩٠ يوما على التوالي. ولوحظ ارتفاع معدل الوفيات في حالات العدوى بالمبيضة الكروزية (الوفيات الخام ٧١.٤-١٠٠٪). الاستنتاجات: لوحظ تحول كبير من المبيضات غير البيضاء للتسبب بعدوى مجرى الدم. ولكونها تهديدا خطيرا للمرضى في المستشفيات، يجب حث مختبرات علم الأحياء المجهرية على اعتماد التشخيص السريع واستعمال الحد الأدنى من الاختبارات على أساس التراكيز المثبطة للكشف عن الأنماط الظاهرية المعتمدة على الجرعة. الدراسات المستقبلية ضرورية للنظر في تشخيص عدوى مجرى الدم من قبل أنواع المبيضات المختلفة في نموذج متعدد المتغيرات. Abstract: Objectives: Candidemia incidence has increased in the past few years, with high mortality. Previous studies have reported a variable distribution of Candida spp. among different regions. This study aimed to identify the species found in Candida bloodstream infections, routine antifungal susceptibility testing, and mortality outcomes in an academic medical centre. Methods: Between January 2012 and December 2018, the positive blood cultures for candidemia infection were retrieved and statistically analysed for species prevalence, susceptibility pattern, and crude mortality at 14, 30, 60 and 90 days. Results: Of 156 candidemia cases, a majority (69.2%) was caused by non-albicans Candida spp. After Candida albicans (30.8%), Candida tropicalis and Candida parapsilosis were the second and third most frequeunt isolates spp, each counting for 23.7%. Acquired resistance was detected in 14.8% of candidemia strains. No other antifungal resistance was detected. The overall crude mortality rates of all species were 29.3%, 47.9%, 56.4%, and 58.0% at 14, 30, 60, and 90 days, respectively. A higher mortality rate was noted in cases of Candida krusei infection (crude mortality 71.4–100%, p = 0.002). Conclusion: In this study, a considerable shift to non-albicans Candida causing most bloodstream infections was observed. As such infections pose a serious threat to hospitalised patients, microbiology laboratories are urged to adopt rapid diagnostic and minimal inhibitory concentration-based testing for the detection of susceptible dose-dependent phenotypes. Prospective studies are essential to consider the prognosis of bloodstream infections by various Candida species in a multivariate model.

الملخص: أهداف البحث: اختبار حساسية الزائفة الزنجارية للأدوية المستخدمة بشكل روتيني، واثنين من مضادات الميكروبات المتوفرة مؤخرا، سفتازديم افيباكتام وسفتالوزين تازوباكتام اللذين لم يتم تقييمها بعد في المملكة العربية السعودية. طرق البحث: تم تضمين سلالات غير متكررة من الزائفة الزنجارية المعزولة من المرضى الداخليين بين ديسمبر ٢٠١٨ وأبريل ٢٠١٩. تم التعرف عليها باستخدام نظام مخبري آلي كما تم تحديد النمط الظاهري وإجراء اختبار الحساسية الأولية للميكروب. استكملنا هذه الاختبارات بتحديد الحد الأدنى من التركيز المثبط لأربعة مضادات حيوية للميكروب هي الاميبنم والميروبنم وسفتازديم افيباكتام وسفتالوزين تازوباكتام وفقا لأنظمة معهد المعايير السريرية والمخبرية. النتائج: تم الحصول على ما مجموعه ٦٧ سلالة من الزائفة الزنجارية، بما في ذلك ٣٨ سلالة مقاومة للأدوية المتعددة، من عينات مختلفة. تم الحفاظ على القابلية للعديد من الأمينوغليكوزيدات والفلوروكينولونات المختبرة. كانت السلالات عرضة للعوامل التالية بترتيب تصاعدي: سفتازديم (٣٢.٨٪)، سيفيبيم (٣٧.٣٪)، اميبنيم (٣٦٪) وبيبراسلين تازوباكتام (٣٩٪) ثم ميروبينيم (٤٤.٨٪) وسفتازديم افيباكتام (٦١،٢٪) وسفتالوزين تازوباكتام (٦٢.٧٪). كانت معدلات حساسية السلالات المقاومة للأدوية لكل من سفتازديم افيباكتام وسفتالوزين تازوباكتام أقل من ٣٥٪ كما تم اكتشاف مستويات عالية من المقاومة للأدوية الجديدة في ٢١ و٢٢ عزلة بكتيرية. الاستنتاجات: تظهر نتائج الدراسة محدودية الاستخدام التجريبي لسفتازديم افيباكتام وسفتالوزين تازوباكتام كعلاجات للعدوى الخطيرة. علاوة على ذلك، تسلط بياناتنا الضوء على الحاجة إلى اختبار حساسية سريع للميكروبات لتوجيه استخدامها السريري. Abstract: Objectives: We conducted this study to test the susceptibility of P. aeruginosa to the routinely used drugs and to the two recently available antimicrobial agents, ceftazidime-avibactam and ceftolozane-tazobactam. Methods: We isolated the non-replicate strains of P. aeruginosa from inpatients between December 2018 and April 2019. The VITEK® MS system was used for phenotypic identification and VITEK 2 for initial antimicrobial susceptibility testing. We supplemented these tests with determination of the minimum inhibitory concentration (MIC) of four antimicrobials; imipenem, meropenem, ceftazidime-avibactam and ceftolozane-tazobactam. The standards of the Clinical and Laboratory Standards Institute were followed. Results: A total of 67 strains of P. aeruginosa, including 38 multidrug-resistant strains, were obtained from various specimens. Susceptibility to various tested aminoglycosides and fluoroquinolones was maintained in 49.3–56.7% and 40.0–43.3% of the total isolates. Amongst β-lactams, the strains were susceptible to the following agents in an ascending order: ceftazidime (32.8%), cefepime (37.3%), imipenem (36.0%), piperacillin-tazobactam (39.0%), meropenem (44.8%), ceftazidime-avibactam (61.2%) and ceftolozane-tazobactam (62.7%). The susceptibility rates of the multidrug-resistant strains to both ceftazidime-avibactam and ceftolozane-tazobactam were less than 35%. High levels of resistance to the new agents (MIC > 256 ug/ml) were detected in 21 and 22 isolates. Conclusion: Our study shows limitation in the empirical use of ceftazidime-avibactam and ceftolozane-tazobactam as therapeutics in serious infections. Moreover, our data highlights the need for prompt antimicrobial susceptibility testing to guide their clinical usage.

Most of the cases of Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) were reported in Saudi Arabia. Dipeptidyl peptidase-4 (DPP4) was identified as the receptor for the virus. The level of soluble DPP4 (sDPP4) was found to be reduced in MERS-CoV infected patients while high levels of sDPP4 were suggested to be protective against MERS-CoV in animal models. We investigated whether the Saudi population has lower levels of sDPP4 which makes them more susceptible to MERS-CoV infection and, therefore, could explain the larger number of cases from the country. Blood samples were collected from 219 Saudi blood donors and 200 blood donors from other ethnic groups. The plasma level of sDPP4 was measured by ELISA and the following SNPs in the DPP4 gene; rs35128070, rs1861978, rs79700168, and rs17574, were genotyped by TaqMan SNP genotyping assay. The average level of plasma sDDP4 was significantly lower in Saudis than other Arabs and non-Arabs (P value 0.0003 and 0.012, respectively). The genotypes AG of rs35128070 and GT of rs1861978 were significantly associated with lower sDPP4 among Saudis (P value 0.002 for each). While both genotypes AA and AG of rs79700168 and rs17574 were associated with significantly lower average sDPP4 level in Saudis compared to other ethnic groups (P value 0.031 and 0.032, and 0.027 and 0.014, respectively). Herein, we report that the Saudi population has lower levels of plasma sDPP4 than other ethnic groups, which is associated with genetic variants in the DPP4 gene. This may have contributed to increase the susceptibility of the Saudi population to MERS-CoV infection and could be a factor in the long-lasting persistence of the virus in the country.

This study analyzed the genotype, antibiotic resistance, and biofilm formation of Acinetobacter baumannii strains and assessed the correlation between biofilm formation, antibiotic resistance, and biofilm-related risk factors. A total of 207 non-replicate multi-drug-resistant A. baumannii strains were prospectively isolated. Phenotypic identification and antimicrobial susceptibility testing were carried out. Isolate biofilm formation ability was evaluated using the tissue culture plate (TCP), Congo red agar, and tube methods. Clonal relatedness between the strains was assessed by enterobacterial repetitive intergenic consensus-PCR genotyping. Of the 207 isolates, 52.5% originated from an intensive care unit setting, and pan resistance was observed against ceftazidime and cefepime, with elevated resistance (99–94%) to piperacillin/tazobactam, imipenem, levofloxacin, and ciprofloxacin. alongside high susceptibility to tigecycline (97.8%). The Tissue culture plate, Tube method, and Congo red agar methods revealed that 53.6%, 20.8%, and 2.7% of the strains were strong biofilm producers, respectively, while a significant correlation was observed between biofilm formation and device-originating respiratory isolates (p = 0.0009) and between biofilm formation in colonized vs. true infection isolates (p = 0.0001). No correlation was detected between antibiotic resistance and biofilm formation capacity, and the majority of isolates were clonally unrelated. These findings highlight the urgent need for implementing strict infection control measures in clinical settings.