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Resumen El Río Presidio, ubicado en el sur de Sinaloa, México, pertenece a la zona de transición zoogeográfica NeárticoNeotropical, donde su fauna de peces podría manifestar cambios en la abundancia y distribución de las especies durante los períodos de lluvias y de secas. El objetivo principal de este estudio fue describir la composición taxonómica y la abundancia espacial y temporal de la fauna de peces de la parte baja y media del Río Presidio, mediante muestreos bimestrales de abril 2008 a febrero 2009. Cuarenta especies (39 nativas y 1 exótica) pertenecientes a 32 géneros y 19 familias fueron registradas, siendo las familias Gerreidae y Poeciliidae las más diversas con cinco y cuatro especies, respectivamente. Seis especies: Lile stolifera, Oreochromis aureus, Awaous banana, Gobiomorus maculatus, Anchoa analis y Atherinella crystallina, en ese orden de importancia contribuyeron con casi el 49 % de la abundancia íctica total. La riqueza de especies y la salinidad demostraron una relación directa y ambas tuvieron una relación inversa con la altitud. Con base en la disimilitud de especies entre sitios, dos tipos de ensambles de peces fueron distinguidos a través de un gradiente de salinidad y turbidez en el río, el primero representado por especies de derivación marina (periféricas) en la parte baja, y el segundo por especies dulceacuícolas secundarias en la parte media. La mayor similitud de especies se dio en agosto y septiembre y estuvo asociada a condiciones de altos flujos del periodo de lluvias. Veintisiete especies tienen afinidad a la Región del Pacífico oriental, seis a la Región Neotropical, dos a la Región Neártica (Dorosoma smithi e Ictalurus cf. pricei), una Anfiatlántica (Mugil curema), una Circumtropical (M. cephalus), dos Anfiamericanas (Agonostomus monticola y Gerres cinereus) y una exótica (O. aureus). Abstract The Rio Presidio in the southern Sinaloa, Mexico belongs to Nearctic-Neotropical zoogeographical transition zone, where its fish fauna could manifest changes in the abundance and distribution of the species during rainy and dry periods. The main objective of this study was to describe the taxonomic composition and spatial and temporal abundance of the fish fauna from the lower and middle Rio Presidio, by means of bimonthly samplings from April 2008 to February 2009. Forty fish species (39 native and 1 exotic) belonging to 32 genera and 19 families were registered. Two families (Gerreidae and Poeciliidae) contained the highest numbers of species (five and four, respectively). Six species (Lile stolifera, Oreochromis aureus, Awaous banana, Anchoa analis, Gobiomorus maculatus and Atherinella crystallina) in this order of importance contributed with almost 49 % of the total fish abundance. Species richness and salinity showed a direct relationship and an inverse relationship with the altitude. Based on the coefficient of similarity of species among sites two fish assemblages were identified. The first assemblage formed by species from marine derivation (peripheral) occurring in the lower part of the river, and the second assemblage by secondary freshwater species in the middle part. The higher fish species similarity observed in August and September was under the influence of the highest flows of the rainy period. Twenty-seven 27 species showed affinity to the Tropical Eastern Pacific Region, six species to the Neotropical region and two to the Nearctic region (Dorosoma smithi and Ictalurus cf. pricei ); one species has an Amphiatlantic distribution (Mugil curema), another is circumtropical (Mugil cephalus), two species have Amphiamerican distribution (A. monticola and G. cinereus), and one is exotic (O. aureus). Rev. Biol. Trop. 66(2): 848-862. Epub 2018 June 01.