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In Peru, cocoa (Theobroma cacao) cadmium (Cd) and lead (Pb) content may exceed the established limits for international trade and human consumption. Most farmers in the Peruvian jungle generally do not fertilise their cocoa crop parcels with organic amendments (OA). Therefore, the objective of this study was to evaluate the application of compost and poultry manure in the doses of 30, 60 and 90 MT ha-1 in cocoa plantations to reduce Cd and Pb content in the cocoa nib. The study was conducted from February to November 2015, in Huánuco, Peru. The textural class of soil was loose silty clay, so it did not change after 9 months of applying the OA. The application of OA decreased available Cd and Pb content in soil over 75% and 98%, respectively. Likewise, the total content of Cd and Pb in cocoa nib decreased more than 95% and 67%, respectively (P < 0.05). Therefore, the OA could be a good alternative to reduce Cd and Pb in the cocoa nib., En Perú, el contenido cadmio (Cd) y plomo (Pb) en las nueces de cacao (Theobroma cacao) puede exceder los límites establecidos para el comercio internacional y el consumo humano. La mayoría de los agricultores en la selva peruana generalmente no fertilizan sus parcelas de cultivo de cacao con enmiendas orgánicas (EO). Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue evaluar la aplicación de compost y estiércol de aves de corral en las dosis de 30, 60 y 90 MT ha-1 en las plantaciones de cacao, para reducir el contenido de Cd y Pb en la semilla. El estudio se realizó de febrero a noviembre de 2015, en Huánuco, Perú. La clase de textura del suelo era arcilla limosa suelta, sin cambios después de 9 meses de aplicación de EO. La aplicación de EO disminuyó el contenido de Cd y Pb disponible en el suelo en más del 75% y 98%, respectivamente. Asimismo, el contenido total de Cd y Pb en la semilla de cacao disminuyó más de 95% y 67%, respectivamente (P <0.05). Por lo tanto, la EO podría ser una buena alternativa para reducir Cd y Pb en la semilla de cacao.