Acina-Mambole, Isabelle, Bonheur, Lydiane, Anzala, Fabiola, Gomez, Rose-Marie, Lange, David, Faure, Chantal, Filloux, Denis, Roumagnac, Philippe, Marais, Armelle, Candresse, Thierry, Pavis, Claude, Teycheney, Pierre-Yves, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Agrosystèmes tropicaux (ASTRO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie et Génétique des interactions Plantes-parasites pour la Protection Intégrée, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (UMR BGPI), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), and ProdInra, Migration
National audience; Les ignames (Dioscorea spp.) sont des ressources alimentaires économiquement et socialement importantes en Afrique, dans la Caraïbe, en Amérique du Sud et dans les îles du Pacifique. Les espèces cultivées hébergent de nombreux virus des genres potexvirus, carlavirus, badnavirus, cucumovirus, macluravirus et potyvirus, qui constituent la principale contrainte pour la conservation et la diffusion de ressources génétiques. Deux nouveaux virus appartenant aux genres potexvirus et sadwavirus, baptisés respectivement Yam virus X (YVX) et Yam necrosis virus (YNV), ont été mis en évidence par analyses in silico d’EST d’ignames. La partie 3’ du génome de chacun de ces virus a été amplifiée par 3’RACE à partir de plantes infectées et présentant des symptômes de nécrose foliaire récoltées en Guadeloupe, clonée puis séquencée. Les séquences obtenues ont permis d’établir les relations phylogéniques de ces espèces virales au sein des genres potexvirus et sadwavirus. Des amorces spécifiques de chacun de ces deux virus ont été dessinées dans la région codant l’ARN polymérase ARN dépendante (RdRp) et utilisées pour la mise au point de tests de détection moléculaire par direct binding reverse transcription PCR (DB-RT-PCR) dans des broyats de feuilles. Ces outils complètent l’arsenal disponible pour le diagnostic des virus des ignames et permettent d’entreprendre des études de prévalence du YVX et du YNV en Guadeloupe.