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Zusammenfassung Ziel der Studie Dieser Beitrag visualisiert regionale und zeitliche Heterogenität der SARS-CoV-2 assoziierten Mortalität in Bayern und untersucht den Einfluss regionaler Faktoren wie Inzidenzrate, Hospitalisierungen, sozio-ökonomischer Status und Pflegeheime auf die SARS-CoV-2 assoziierte Mortalität. Methodik Die offiziellen bayerischen Meldedaten zu SARS-CoV-2 wurden für drei Altersgruppen (50–64, 65–74,>74 Jahre) zwischen März 2020 und April 2021 betrachtet. Karten mit regionalen standardisierten Mortalitätsraten wurden mit einem Bayesianischen hierarchischen Modell räumlich geglättet. Ergebnisse Das Bild der regionalen Mortalität ist heterogen mit einem steigenden Gradienten nach Nord-Osten. Die Adjustierung nach standardisierten Inzidenzraten, Hospitalisierungen der infizierten Personen und Verfügbarkeit von Heimplätzen für ältere Menschen nivelliert die Heterogenität. Schlussfolgerung Der Nord-Ost Gradient in den bayerischen SARS-CoV-2 spezifischen Sterberaten wird deutlich durch den vergleichbaren Gradienten der regionalen Inzidenzraten erklärt. Andere regionale Faktoren zeigen einen weniger deutlichen Einfluss.

Supplementary Figure 2, related to main Figure 3

Supplementary Figure 1, related to main Figure 1

Supplementary Figure 3, related to main Figure 5.

Supplementary Figure 4, related to main Figure 5. Data pertaining to independent validation in the BEAT-AML cohort.

Purpose:RNA splicing is a fundamental biological process that generates protein diversity from a finite set of genes. Recurrent somatic mutations of splicing factor genes are common in some hematologic cancers but are relatively uncommon in acute myeloid leukemia (AML, < 20% of patients). We examined whether RNA splicing differences exist in AML, even in the absence of splicing factor mutations.Experimental Design:We developed a bioinformatics pipeline to study alternative RNA splicing in RNA-sequencing data from large cohorts of patients with AML.Results:We have identified recurrent differential alternative splicing between patients with poor and good prognosis. These splicing events occurred even in patients without any discernible splicing factor mutations. Alternative splicing recurrently occurred in genes with specific molecular functions, primarily related to protein translation. Developing tools to predict the functional impact of alternative splicing on the translated protein, we discovered that approximately 45% of the splicing events directly affected highly conserved protein domains. Several splicing factors were themselves misspliced and the splicing of their target transcripts were altered. Studying differential gene expression in the same patients, we identified that alternative splicing of protein translation genes in ELNAdv patients resulted in the induction of an integrated stress response and upregulation of inflammation-related genes. Finally, using machine learning techniques, we identified a splicing signature of four genes which refine the accuracy of existing risk prognosis schemes and validated it in a completely independent cohort.Conclusions:Our discoveries therefore identify aberrant alternative splicing as a molecular feature of adverse AML with clinical relevance.See related commentary by Bowman, p. 3503

Supplementary Methods - revised, plus Supplementary Tables 1-6