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Entre la variation statistique au hasard et la variation linéaire, toutes deux bien connues, il existe d'autres modèles de variation (polynomiale linéaire, périodique, etc.) et, notamment, la variation monotone. D'une condition à l'autre dans une série à contrôle croissant, d'un niveau d'intervention ou d'une dose médicinale à l'autre, la variable mesurée reflète-t-elle un effet consistant, croissant ou décroissant, cela sans qu'un modèle précis puisse lui être sous-tendu ? L'analyse de variation monotone, intégrée à l'analyse de variance classique, permet de décider si la variable observée répond de façon cohérente à une variable indépendante en escalier, celle-ci étant de type ordinal plutôt que linéaire. Nous présentons deux techniques adaptées à l'analyse de variance, celle de Barlow et collaborateurs (1972) et celle d'Abelson et Tukey (2013), permettant de rejeter l'hypothèse nulle en regard d'une hypothèse d'évolution consistance de la variable observée, l'application étant étendue à l'analyse des proportions. Des exemples, des tables de valeurs critiques et de coefficients et les formules de base sont aussi fournis. // Between random statistical variation and simple linear change, both of which are well known, there are other models of variation (linear polynomials, periodic functions, etc.) and, particularly, that of monotonic variation. From one condition to the next in an increasing control series, from one intervention level or medicinal dose to the next, does the measured variable reflect a consistent, increasing or decreasing effect, without a definite mathematical pattern underlying it? Monotonic variation analysis, integrated with classical ANOVA, is used to decide whether the observed variable responds consistently to a staircase independent variable, which is ordinal rather than linear. We present here two techniques for ANOVA, that of Barlow and colleagues (1972) and that of Abelson and Tukey (2013), allowing the rejection of the null hypothesis against a hypothesis of consistent evolution of the observed variable; the application is extended to the analysis of proportions. Examples, tables of critical values and coefficients, and basic formulas are also provided.

International audience; The transfer function of a linear system is defined in terms of the quadruplet of matrices (A, B, C, D) that can be identified from input and output measurements. Similarly these matrices determine the state space evolution for the considered dynamical system. Estimation of the quadruplet has been well studied in the literature from both theoretical and practical points of view. Nonetheless, the uncertainty quantification of their estimation errors has been mainly discussed from a theoretical viewpoint. For several output-only and input/output subspace methods, the variance of the (A, C) matrices can be effectively obtained with recently developed first-order perturbation-based schemes. This paper addresses the estimation of the (B, D) matrices, and the remaining problem of the effective variance computation of their estimates and the resulting transfer function. The proposed schemes are validated on a simulation of a mechanical system.

Tree mortality is a key driver of forest dynamics and its occurrence is projected to increase in the future due to climate change. Despite recent advances in our understanding of the physiological mechanisms leading to death, we still lack robust indicators of mortality risk that could be applied at the individual tree scale. Here, we build on a previous contribution exploring the differences in growth level between trees that died and survived a given mortality event to assess whether changes in temporal autocorrelation, variance, and synchrony in time-series of annual radial growth data can be used as early warning signals of mortality risk. Taking advantage of a unique global ring-width database of 3065 dead trees and 4389 living trees growing together at 198 sites (belonging to 36 gymnosperm and angiosperm species), we analyzed temporal changes in autocorrelation, variance, and synchrony before tree death (diachronic analysis), and also compared these metrics between trees that died and trees that survived a given mortality event (synchronic analysis). Changes in autocorrelation were a poor indicator of mortality risk. However, we found a gradual increase in inter-annual growth variability and a decrease in growth synchrony in the last ∼20 years before mortality of gymnosperms, irrespective of the cause of mortality. These changes could be associated with drought-induced alterations in carbon economy and allocation patterns. In angiosperms, we did not find any consistent changes in any metric. Such lack of any signal might be explained by the relatively high capacity of angiosperms to recover after a stress-induced growth decline. Our analysis provides a robust method for estimating early-warning signals of tree mortality based on annual growth data. In addition to the frequently reported decrease in growth rates, an increase in inter-annual growth variability and a decrease in growth synchrony may be powerful predictors of gymnosperm mortality risk, but not necessarily so for angiosperms. Fil: Cailleret, Maxime. Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research; Suiza. Eidgenössische Technische Hochschule Zürich; Suiza Fil: Dakos, Vasilis. Université Montpellier II; Francia. Centre National de la Recherche Scientifique; Francia Fil: Jansen, Steven. Universitat Ulm; Alemania Fil: Robert, Elisabeth M. R.. Royal Museum For Central Africa; Bélgica. Vrije Unviversiteit Brussel; Bélgica. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Centre de Recerca Ecológica I Aplicacions Forestals; España Fil: Aakala, Tuomas. University of Helsinski; Finlandia Fil: Amoroso, Mariano Martin. Universidad Nacional de Río Negro. Sede Andina. Instituto de Investigaciones en Recursos Naturales, Agroecología y Desarrollo Rural; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentina Fil: Antos, Joe A.. University of Victoria; Canadá Fil: Bigler, Christof. Eidgenössische Technische Hochschule Zürich; Suiza Fil: Bugmann, Harald. Eidgenössische Technische Hochschule Zürich; Suiza Fil: Caccianaga, Marco. Università degli Studi di Milano; Italia Fil: Camarero, Jesus Julio. Instituto Pirenaico de Ecología; España. Consejo Superior de Investigaciones Científicas; España Fil: Cherubini, Paolo. Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research; Suiza Fil: Coyea, Marie R.. Laval University; Canadá Fil: Cufar, Katarina. University Of Ljubljana; Eslovenia Fil: Das, Adrian J.. United States Geological Survey; Estados Unidos Fil: Davi, Hendrik. Unité de Recherche des Forets Méditerranéennes; Francia Fil: Gea Izquierdo, Guillermo. Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria. Centro de Investigación Forestal; España Fil: Gillner, Sten. Institute of Forest Botany and Forest Zoology; Alemania Fil: Haavik, Laurel J.. USDA Forest Service, Forest Health Protection; Estados Unidos. University of Arkansas for Medical Sciences; Estados Unidos Fil: Hartmann, Henrik. Max Planck Institute Of Biochemistry.; Alemania Fil: Heres, Ana Maria. Universitatea Transilvania Din Brasov; Rumania. Basque Centre For Climate Change; España Fil: Hultine, Kevin R.. Desert Botanical Garden. Conservation and Collections. Department of Research; Estados Unidos Fil: Janda, Pavel. Czech University of Life Sciences; República Checa Fil: Kane, Jeffrey M.. Humboldt State University; Estados Unidos Fil: Kharuk, Viachelsav I.. Siberian Federal University; Rusia Fil: Kitzberger, Thomas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universidad Bariloche. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente; Argentina Fil: Klein, Tamir. Weizmann Institute of Science; Israel Fil: Levanic, Tom. Slovenian Forestry Institute; Eslovenia Fil: Linares, Juan Carlos. Universidad Pablo de Olavide; España Fil: Lombardi, Fabio. Universita Della Calabria.; Italia Fil: Mäkinen, Harri. Natural Resources Institute Finland; Finlandia Fil: Mészáros, Ilona. Debreceni Egyetem Természettudományi És Technológiai Kar; Hungría Fil: Metsaranta, Juha M.. Northern Forestry Centre; Canadá Fil: Oberhuber, Walter. Universidad de Innsbruck; Austria Fil: Papadopoulos, Andreas. Technological Educational Institute of Stereas Elladas; Grecia Fil: Petritan, Any Mary. Eidgenössische Forschungsanstalt Fur Wald, Schnee Und Landschaft Eth-bereichs; Alemania Fil: Rohner, Brigitte. Eidgenössische Forschungsanstalt Fur Wald, Schnee Und Landschaft Eth-bereichs; Alemania Fil: Sangüesa Barreda, Gabriel. Universidad de Valladolid; España Fil: Smith, Jeremy M.. State University of Colorado at Boulder; Estados Unidos Fil: Stan, Amanda B.. Northern Arizona University; Estados Unidos Fil: Stojanovic, Dejan B.. University Of Novi Sad; Serbia Fil: Suarez, Maria Laura. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria Bariloche; Argentina Fil: Svoboda, Miroslav. Czech University Of Life Sciences Prague; República Checa Fil: Trotsiuk, Volodymyr. Czech University of Life Sciences Prague; República Checa. Eidgenössische Forschungsanstalt Fur Wald, Schnee Und Landschaft Eth bereichs; Alemania. Eidgenössische Technische Hochschule Zürich; Alemania Fil: Villalba, Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Regional de Investigaciones Cientifícas y Tecnológicas; Argentina Fil: Westwood, Alana R.. University of Alberta; Canadá Fil: Wyckoff, Peter H.. University Of Minnesota System; Estados Unidos Fil: Martínez Vilalta, Jordi. Universitat Autònoma de Barcelona; España. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Centre de Recerca Ecológica I Aplicacions Forestals; España

The advent of high throughput sequencing and genotyping technologies allows the comparison of patterns of polymorphisms at a very large number of genetic markers. The analysis of genetic differentiation between populations at a whole-genome scale makes it possible to characterize genomic regions involved in the local adaptation of organisms to their environment. In this thesis, we followed two complementary approaches to characterize differentiation from high-throughput genotyping data. First, we developed an unbiased estimator of the parameter FST for individuals sequenced in pools (Pool-seq). Deriving this estimator, in an analysis-of-variance framework, required to properly account for the different sampling steps: individual genes from the pool, and sequence reads from these genes. We show that it outperforms previously proposed estimators. Second, we developed a method to analyze genetic differentiation at a whole-genome scale in a hierarchical bayesian framework, in order to untangle the effect of demography from that of selection. To this end, we implemented different extensions to the SelEstim model, aimed at leveraging the information from linkage disequilibrium between markers. A first approach consisted in analyzing multiallelic data derived from the local clustering of SNPs into haplotype blocks. An alternative strategy consisted in including a smoothing model, which accounts for the spatial dependency between neighboring markers. This strategy relies on the analysis of biallelic data, and can be used both with individual genotype data or Pool-seq data. We discuss the relative benefits of these different approaches, based on the analysis of simulated data sets.; L’avancée des technologies de séquençage et de génotypage à haut-débit permet la comparaison de patrons de polymorphisme à un très grand nombre de marqueurs génétiques. L'analyse de la différenciation des populations à une échelle génomique rend ainsi possible la recherche de régions génomiques impliquées dans l’adaptation locale des organismes à leur environnement. Dans cette thèse, nous avons suivi deux approches complémentaires pour caractériser la différenciation génétique à partir de données de génotypage à haut-débit. Dans un premier temps, nous avons développé un estimateur non-biaisé du paramètre FST pour des données de génotypage d’individus en mélange (Pool-seq). La construction de cet estimateur, dans un contexte d’analyse de variance, a nécessité de bien prendre en compte les différentes étapes de l’échantillonnage : des gènes dans le mélange d'individus et des lectures de séquençage parmi les gènes. Nous montrons qu’il surpasse les estimateurs utilisés jusqu'à présent. Dans un deuxième temps, nous avons développé une méthode d'analyse de la différenciation génétique à l'échelle du génome, dans le cadre d’un modèle bayésien hiérarchique, pour distinguer l'effet de la démographie de celui de la sélection. Pour cela, nous avons implémenté plusieurs extensions au modèle SelEstim, pour exploiter l'information de déséquilibre de liaison entre les marqueurs. Une première stratégie a consisté à analyser des données multialléliques, obtenues par le regroupement local de marqueurs SNPs en blocs d'haplotypes. Une stratégie alternative a consisté à intégrer un modèle de lissage prenant en compte la dépendance spatiale entre marqueurs adjacents. Cette approche repose sur l'analyse de données bialléliques, ce qui la rend applicable à la fois à des données de génotypage individuel et à des données Pool-seq. Nous discutons, sur la base de l'analyse de jeux de données simulées, des mérites relatifs de ces différentes approches.

The advent of high throughput sequencing and genotyping technologies allows the comparison of patterns of polymorphisms at a very large number of genetic markers. The analysis of genetic differentiation between populations at a whole-genome scale makes it possible to characterize genomic regions involved in the local adaptation of organisms to their environment. In this thesis, we followed two complementary approaches to characterize differentiation from high-throughput genotyping data. First, we developed an unbiased estimator of the parameter FST for individuals sequenced in pools (Pool-seq). Deriving this estimator, in an analysis-of-variance framework, required to properly account for the different sampling steps: individual genes from the pool, and sequence reads from these genes. We show that it outperforms previously proposed estimators. Second, we developed a method to analyze genetic differentiation at a whole-genome scale in a hierarchical bayesian framework, in order to untangle the effect of demography from that of selection. To this end, we implemented different extensions to the SelEstim model, aimed at leveraging the information from linkage disequilibrium between markers. A first approach consisted in analyzing multiallelic data derived from the local clustering of SNPs into haplotype blocks. An alternative strategy consisted in including a smoothing model, which accounts for the spatial dependency between neighboring markers. This strategy relies on the analysis of biallelic data, and can be used both with individual genotype data or Pool-seq data. We discuss the relative benefits of these different approaches, based on the analysis of simulated data sets.; L’avancée des technologies de séquençage et de génotypage à haut-débit permet la comparaison de patrons de polymorphisme à un très grand nombre de marqueurs génétiques. L'analyse de la différenciation des populations à une échelle génomique rend ainsi possible la recherche de régions génomiques impliquées dans l’adaptation locale des organismes à leur environnement. Dans cette thèse, nous avons suivi deux approches complémentaires pour caractériser la différenciation génétique à partir de données de génotypage à haut-débit. Dans un premier temps, nous avons développé un estimateur non-biaisé du paramètre FST pour des données de génotypage d’individus en mélange (Pool-seq). La construction de cet estimateur, dans un contexte d’analyse de variance, a nécessité de bien prendre en compte les différentes étapes de l’échantillonnage : des gènes dans le mélange d'individus et des lectures de séquençage parmi les gènes. Nous montrons qu’il surpasse les estimateurs utilisés jusqu'à présent. Dans un deuxième temps, nous avons développé une méthode d'analyse de la différenciation génétique à l'échelle du génome, dans le cadre d’un modèle bayésien hiérarchique, pour distinguer l'effet de la démographie de celui de la sélection. Pour cela, nous avons implémenté plusieurs extensions au modèle SelEstim, pour exploiter l'information de déséquilibre de liaison entre les marqueurs. Une première stratégie a consisté à analyser des données multialléliques, obtenues par le regroupement local de marqueurs SNPs en blocs d'haplotypes. Une stratégie alternative a consisté à intégrer un modèle de lissage prenant en compte la dépendance spatiale entre marqueurs adjacents. Cette approche repose sur l'analyse de données bialléliques, ce qui la rend applicable à la fois à des données de génotypage individuel et à des données Pool-seq. Nous discutons, sur la base de l'analyse de jeux de données simulées, des mérites relatifs de ces différentes approches.

New wearables devices are introduced with novel options for observing personal transport and mobility in indoor and outdoor spaces. This hardware includes low cost MEMS sensors: accelerometer, gyroscope, magnetometer, which provide continuously available data contrary to existing solutions that are based on radio signals. In order to mitigate the propagation of sensor errors in the position estimate, a pedestrian dead reckoning strategy is commonly adopted. The processing requires parametric step length models relying on some physiological parameters, displacement features and acceleration statistical properties. The coefficients of these models need frequent adjustment to limit cumulative errors induced by alteration of gait pattern. A large experimental database providing information about human locomotion variability is required for this calibration. However, the development of such database is costly in terms of time and effort, and several gait-affecting factors should be considered, which highly increases the number of measurement trials. In this thesis, we propose an alternative way of generating locomotion data that consists in simulating human gait motion under different conditions. In this scope, a 3D multibody system simulator based on parametric optimization technique was developed, and improvements were made throughout this work to get a more realistic walking motion prediction. Joint trajectories during one step were optimized by minimizing an energy criterion based on actuated torques. Validation with inertial data from overground walking experiments on one healthy subject showed an asymmetry in experimental acceleration signals from one step to the next. This suggests that asymmetric movement are likely to result in a step-level asymmetry of displacement features. This defeats the general assumption in PDR strategy: the presence of a device in hand does not impact the gait symmetry and all steps are identical for a fixed walking speed. This hypothesis is investigated with motion capture experiments with several subjects, designed to study the influence of a mass carried in hand on the walking gait cycles. Analysis of variance tests have shown that the presence of a mass in hand changes the gait symmetry at the step level, and then the proposed optimization process is extended to the stride level in order to allow observing asymmetric acceleration patterns. Overall, our simulator reproduces similar fundamental patterns of walking, and the same variation trend of acceleration related items found in experiments. However, it shows limitations when predicting acceleration data related to the hand, due to some modeling assumptions and numerical issues. Therefore, our simulation approach partially solves for the direct modeling problem in pedestrian navigation, and improvements on model assumptions are foreseen to predict acceleration signals over a complete gait cycle more reliably. Keywords: Handheld devices, MEMS sensors, Multibody system, Parametric optimization, Step-level symmetry, Walking gait patterns, Human motion analysis, Analysis of variance. New wearables devices are introduced with novel options for observing personal transport and mobility in indoor and outdoor spaces. This hardware includes low cost MEMS sensors: accelerometer, gyroscope, magnetometer, which provide continuously available data contrary to existing solutions that are based on radio signals. In order to mitigate the propagation of sensor errors in the position estimate, a pedestrian dead reckoning strategy is commonly adopted. The processing requires parametric step length models relying on some physiological parameters, displacement features and acceleration statistical properties. The coefficients of these models need frequent adjustment to limit cumulative errors induced by alteration of gait pattern. A large experimental database providing information about human locomotion variability is required for this calibration. However, the development of such database is costly in terms of time and effort, and several gait-affecting factors should be considered, which highly increases the number of measurement trials. In this thesis, we propose an alternative way of generating locomotion data that consists in simulating human gait motion under different conditions. In this scope, a 3D multibody system simulator based on parametric optimization technique was developed, and improvements were made throughout this work to get a more realistic walking motion prediction. Joint trajectories during one step were optimized by minimizing an energy criterion based on actuated torques. Validation with inertial data from overground walking experiments on one healthy subject showed an asymmetry in experimental acceleration signals from one step to the next. This suggests that asymmetric movement are likely to result in a step-level asymmetry of displacement features. This defeats the general assumption in PDR strategy: the presence of a device in hand does not impact the gait symmetry and all steps are identical for a fixed walking speed. This hypothesis is investigated with motion capture experiments with several subjects, designed to study the influence of a mass carried in hand on the walking gait cycles. Analysis of variance tests have shown that the presence of a mass in hand changes the gait symmetry at the step level, and then the proposed optimization process is extended to the stride level in order to allow observing asymmetric acceleration patterns. Overall, our simulator reproduces similar fundamental patterns of walking, and the same variation trend of acceleration related items found in experiments. However, it shows limitations when predicting acceleration data related to the hand, due to some modeling assumptions and numerical issues. Therefore, our simulation approach partially solves for the direct modeling problem in pedestrian navigation, and improvements on model assumptions are foreseen to predict acceleration signals over a complete gait cycle more reliably. Keywords: Handheld devices, MEMS sensors, Multibody system, Parametric optimization, Step-level symmetry, Walking gait patterns, Human motion analysis, Analysis of variance.

La résistivité électrique des sols a été choisie pour décrire l’hétérogénéité spatiale des sols des micro-parcelles d’essais variétés. Les mesures de résistivité ont été enregistrées à l’automne 2011 pour trois profondeurs (0.5m, 1m et environ 2m) appelées voies de mesures et on observe un nombre de mesures par micro-parcelle faible. Aussi, la résistivité a été spatialisée pour chaque voie de mesure par krigeage ordinaire (KO). Pour caractériser l’hétérogénéité spatiale des sols des micro-parcelles par rapport à la résistivité, les valeurs estimées par KO ont été classées en fonction de leur position par rapport à la moyenne (scénario 1) et à la médiane (scénario 2). Cette discrétisation a conduit à définir deux types de zones (zones avec la résistivité inférieure à la moyenne et inversement) pour chaque paramètre de position. La typologie établie a été validée par une analyse factorielle discriminante (AFD), qui a montré que la résistivité électrique des sols est une variable discriminante des deux types de zones établies. Quelle que soit la voie de mesure et quel que soit le scénario, la probabilité de classement erroné est inférieure à 5%. Par ailleurs, la moyenne des valeurs de la résistivité dans les deux types de zones sont statistiquement différentes (ANOVA : test de Tukey). Les mesures de résistivités des trois voies spatialisées par KO ont aussi été synthétisées par une analyse en composante principale (ACP). Les procédures de discrétisation (les deux scénarii) et de validation (AFD et ANOVA) appliquées à la première composante issue de l’ACP montrent des résultats similaires à ceux obtenus en considérant les voies de mesure de manière individuelle. Enfin, la comparaison des deux scénarii montre un taux de coïncidence compris entre 93.5 % et 96 % selon la voie et le scénario considérés. On peut donc indifféremment considérer la moyenne ou la médiane pour discrétiser la surface des micro-parcelles dans ce contexte d’étude., The electrical resistivity of soils was used to describe the spatial heterogeneity of micro plots soils. The resistivity measurements were recorded at the autumn 2011 for three soil depths (0.5m, 1m and approximately 2m). The number of resistivity measurements by micro plot is low. The resistivity was thus mapped for each depth by ordinary kriging (OK). To describe the spatial heterogeneity of soils in micro-plots relative to resistivity, OK estimates were classified according to their position at the mean (scenario 1) and the median (scenario 2). This classification has led to the definition of two types of areas (resistivity lower to the mean and conversely) for each position parameter. The established typology was validated by a factorial discriminant analysis (FDA), which showed that resistivity is a discriminant variable of the two types of areas established. Regardless the depth of measurement and the scenario considered, the probability of misclassification is less than 5%. Moreover, the mean resistivity values in the two types of areas are statistically different (ANOVA: Tukey test). OK estimates were also summarized through a principal component analysis (PCA). The classification procedure (both scenarios) as well as that of validation (FDA and ANOVA) applied to the first component achieved by PCA show similar results to those obtained by considering separately the resistivity measurements of three depths. Finally, the comparison of the two scenarios shows a coincidence rate ranges from 93.5% to 96% as function of resistivity measurements depth and the scenario considered. Therefore, we can indifferently consider the mean or the median to discretize the surface of the micro plots in the context of this study.

International audience; In this paper, global sensitivity analysis (GSA) and uncertainty quantification (UQ) have been applied to the problem of natural convection (NC) in a porous square cavity. This problem is widely used to provide physical insights into the processes of fluid flow and heat transfer in porous media. It introduces however several parameters whose values are usually uncertain. We herein explore the effect of the imperfect knowledge of the system parameters and their variability on the model quantities of interest (QoIs) characterizing the NC mechanisms. To this end, we use GSA in conjunction with the polynomial chaos expansion (PCE) methodology. In particular, GSA is performed using Sobol’ sensitivity indices. Moreover, the probability distributions of the QoIs assessing the flow and heat transfer are obtained by performing UQ using PCE as a surrogate of the original computational model. The results demonstrate that the temperature distribution is mainly controlled by the longitudinal thermal dispersion coefficient. The variability of the average Nusselt number is controlled by the Rayleigh number and transverse dispersion coefficient. The velocity field is mainly sensitive to the Rayleigh number and permeability anisotropy ratio. The heterogeneity slightly affects the heat transfer in the cavity and has a major effect on the flow patterns. The methodology presented in this work allows performing in-depth analyses in order to provide relevant information for the interpretation of a NC problem in porous media at low computational costs.

Le sujet de la présente étude est la violence scolaire, phénomène complexe et polysémique qui préoccupe légitimement le monde de l’éducation depuis plus de trente ans. À partir des analyses factorielles exploratoires, analyses de variance factorielle et finalement analyses multivariées de covariance, cette recherche vise plus précisément à dégager la relation entre le climat scolaire, le contexte scolaire et les différents rôles adoptés par les élèves du niveau secondaire lors d’une situation de violence scolaire. Les données de la présente étude ont été collectées par Michel Janosz et son équipe pendant l’année 2010, dans quatre établissements éducatifs provenant d’une commission scolaire de la grande région de Montréal. L’échantillon de départ est composé de 1750 élèves qui fréquentent des classes ordinaires et spéciales du premier et deuxième cycle du secondaire âgés entre 10 et 18 ans. Pour fins d’analyse, deux petites écoles ainsi que les classes spéciales ont été retirées. Il demeure donc 1551 élèves dans l’échantillon initial analysé. Les résultats des analyses permettent de constater d’une part, la relation significative existante entre les dimensions du climat scolaire et l’adoption des différents rôles lors d’une situation de violence scolaire, les climats d’appartenance et de sécurité étant les plus importants, et d’autre part d’observer des différences dans les perceptions que les élèves ont de la violence scolaire selon le niveau et selon l’école., The present study pertains to a complex and polysemic phenomenon that has preoccupied people working in the field of education since at least thirty years, that is, school violence. Using factor analysis, analysis of variance and multivariate analysis of covariance, this research aims at exploring specifically the relationship between school climate, school context and the various roles adopted by students at the high school level when they face a situation in which school violence in present. Data for this study were collected by Michel Janosz and his team in 2010, within four schools, all in the same school board of the Montreal region. The original sample comprises 1750 students who attend both standard special classes, between 10 and 18 years of age. The analyses presented are based on a reduced sample where the special classes and the two small schools have been withdrawn. Therefore, the answers from 1551 student s are used. The results show that first, there is a significant relationship between the various dimensions of school climate and the different roles adopted by students facing a situation in which violence is present, perceptions of belonging and of security being the most important. Second, all things being equal, there are significant difference between schools, and school levels.

Simmonds, E.J., Gutiérrez, M., Chipollini, A., Gerlotto, F., Woillez, M., and Bertrand, A. 2009. Optimizing the design of acoustic surveys of Peruvian anchoveta. – ICES Journal of Marine Science, 66: 1341–1348. Acoustic surveys of stocks of small pelagic fish, in particular the Peruvian anchovy or anchoveta (Engraulis ringens), have been carried out off the coast of Peru since the late 1970s. In all, 51 of these have been carefully archived since 1983. The surveys provide a wealth of data on the distribution and abundance of pelagic fish in the most productive of the world's upwelling ecosystems. The data comprise integrated acoustic data at a resolution of 1 or 2 nautical miles along the cruise tracks, and trawl data, which include catch-by-species and catch-by-length information for anchoveta. Data since 1992 are sufficiently complete to allow a full re-evaluation of the surveys to determine their precision, taking account of the spatial variability of the catch and acoustic data. The methods used include bootstrap by trawl sample and transect segment, geostatistical simulation, and simulated surveys. The results reveal consistent spatial patterns of abundance with a more variable distribution of variance and a strong relationship between the local mean abundance and the variance. The temporal and spatial variabilities are considered in an evaluation of alternative survey designs, including pre-stratified and adaptive designs.

This thesis has two different parts. In the first part we are interested in the real cubic natural exponential families such that their variance function is a polynomial of degree less than or equal to 3. We give three characterizations of such families using a Bayesian approach. One of these characterizations is based on a differential equation verified by the cumulant function. In a second part we study in depth the independence property of the type “Matsumoto-Yor” that was developed by Koudou and Vallois. This property involves the Kummer distribution of type 2 and the generalized beta ones. Using the conditioning and the rejection method, we give almost sure realization of these distributions. We characterize the family of Kummer distribution of type 2 with an algebraic equation involving the gamma ones. We proceed similarly with the generalized beta distributions, Cette thèse contient deux parties différentes. Dans la première partie, nous nous sommes intéressés aux familles exponentielles naturelles cubiques dont la fonction variance est un polynôme de degré inférieur ou égal à 3. Nous donnons trois caractérisations de ces familles en se basant sur une approche Bayesienne. L’une de ces caractérisations repose sur le fait que la fonction cumulante vérifie une équation différentielle. La deuxième partie de notre travail est consacrée aux conséquences de la propriété d’indépendance de type « Matsumoto-Yor » qui a été développée par Koudou et Vallois. Cette propriété fait intervenir la famille de lois de Kummer de type 2 et les lois Beta généralisées. En se basant sur la méthode de conditionnement et sur la méthode de rejet, nous donnons des réalisations presque sûre de ces distributions de probabilités. D’autre part, nous caractérisons la famille de lois de Kummer de type 2 (resp. les lois Beta généralisées) par une équation algébrique impliquant des lois gamma (resp. les lois Beta)

Accès restreint aux membres de l'Université de Lorraine jusqu'au 2015-12-18; This thesis has two different parts. In the first part we are interested in the real cubic natural exponential families such that their variance function is a polynomial of degree less than or equal to 3. We give three characterizations of such families using a Bayesian approach. One of these characterizations is based on a differential equation verified by the cumulant function. In a second part we study in depth the independence property of the type “Matsumoto-Yor” that was developed by Koudou and Vallois. This property involves the Kummer distribution of type 2 and the generalized beta ones. Using the conditioning and the rejection method, we give almost sure realization of these distributions. We characterize the family of Kummer distribution of type 2 with an algebraic equation involving the gamma ones. We proceed similarly with the generalized beta distributions; Cette thèse contient deux parties différentes. Dans la première partie, nous nous sommes intéressés aux familles exponentielles naturelles cubiques dont la fonction variance est un polynôme de degré inférieur ou égal à 3. Nous donnons trois caractérisations de ces familles en se basant sur une approche Bayesienne. L’une de ces caractérisations repose sur le fait que la fonction cumulante vérifie une équation différentielle. La deuxième partie de notre travail est consacrée aux conséquences de la propriété d’indépendance de type « Matsumoto-Yor » qui a été développée par Koudou et Vallois. Cette propriété fait intervenir la famille de lois de Kummer de type 2 et les lois Beta généralisées. En se basant sur la méthode de conditionnement et sur la méthode de rejet, nous donnons des réalisations presque sûre de ces distributions de probabilités. D’autre part, nous caractérisons la famille de lois de Kummer de type 2 (resp. les lois Beta généralisées) par une équation algébrique impliquant des lois gamma (resp. les lois Beta)

MEHDI. Résumé L'alimentation de bétail pose un sérieux problème dans notre pays. En effet, une bonne partie de l'aliment du bétail est importée alors que l'on peut, par un pastoralisme contrôlé, éliminer sinon réduire ces importations. Le couvert végétal en plantes spontanées, s'il est bien géré, et pour certaines espèces, peut constituer un substitut alimentaire intéressant. Le présent travail consiste à mettre en valeur la morphométrie de l'espèce végétale abondante et très présente dans les parcours pastoraux dans les régions de Sidi Abdeli, Ain El Houtz et Oujiida le Thymus ciliatus. Cette étude nous permet d'avoir un aperçu sur les facteurs qui influencent la croissance de cette plante du point de vue géographique, pédologique et climatique. La deuxième partie porte sur les valeurs nutritives de Thymus ciliatus. Une transformation en équivalent énergétique réellement digestible par le cheptel est calculée. Une estimation par hectare et par mouton, en fonction de l'unité fourragère équivalent à un kilogramme d'orge, est évaluée pour des rations d'engraissement et/ou d'entretien. Mots-clés :Thymus ciliatus, Analyse de variance, Unité fourragère, Ration alimentaire ovine. Summary Feeding livestock is a serious problem in our country. Indeed, much of the livestock feed is imported while we may, by controlled grazing, eliminating otherwise reduce these imports. The vegetation in wild plants, if well managed, and some species may be a useful dietary substitute. The present work is to highlight the rnorphometry of the Thymus cilialus that very abundant and very present plant species in rangelands in the regions of Sidi Abdeli, Ain El Houtz and Oujiida. This study aliows us to gain insight into the factors that influence the growth of the plant geographical point of view, soil and climate. The second part focuses on the nutritional values of Thymus ciliatus. A transformation actually digestible energy equivalent is calculated by livestock. Estimate per hectare per sheep, depending on the feed unit equivalent to one kilogram of barley, is evaluated for rations for fattening and / or maintenance. Keywords: Thymus ciliatus, analysis of variance, feed unit, sheep feed ration.

Pour remédier aux inégalités spatiales du pays, les gouvernements indiens ont conçu une suite de nombreux programme d’aménagement. Pour leur mise en œuvre on a cherché identifier les besoins les plus urgents, donc les districts qui présentent les plus nets caractères de « backwardness ». Cet article cherche à montrer quels problèmes pose cette notion, quels enseignements on peut tirer de la localisation des districts qui relèvent de sa définition. On examine en premier lieu la variété des images de leur répartition et on discute des explications de cette diversité. On montre l’importance de convergences sur lesquelles on se fonde pour construire une image, dont l’examen détaillé conduit à une discussion des aspects et des facteurs de la « backwardness. » On insiste sur l’importance des logiques multifactorielle et le rôle des temps longs. To deal with the inequalities in the country, successive Indian governments have conceived a series of development plans. Planners have been faced with the necessity of indentifying the most urgent needs, and thus the districts that show the highest degree of “backwardness”. In this paper, we seek to show which kind of problems are attached to that very notion, what can be learned from the spatial setting of backward districts. In the first place, we consider the variety of the pictures of this setting, and we discuss the possible explanations of that diversity. The importance of convergences is shown, and they are used as a base to build a new picture. A detailed examination of this picture leads to a discussion of aspects and factors of “backwardness”. The importance of multifactorial logics and long term path dependency is stressed.

Understanding how an invasive plant can colonize a large range of environments is still a great challenge in freshwater ecology. For the first time, we assessed the relative importance of four factors on the phosphorus uptake and growth of an invasive macrophyte Elodea nuttallii (Planch.) St. John. This study provided data on its phenotypic plasticity, which is frequently suggested as an important mechanism but remains poorly investigated. The phosphorus uptake of two Elodea nuttallii subpopulations was experimentally studied under contrasting environmental conditions. Plants were sampled in the Rhine floodplain and in the Northern Vosges mountains, and then maintained in aquaria in hard (Rhine) or soft (Vosges) water. Under these conditions, we tested the influence of two trophic states (eutrophic state, 100 μg.l-1 P-PO43- and hypertrophic state, 300 μg.l-1 P-PO43-) on the P metabolism of plant subpopulations collected at three seasons (winter, spring and summer). Elodea nuttallii was able to absorb high levels of phosphorus through its shoots and enhance its phosphorus uptake, continually, after an increase of the resource availability (hypertrophic > eutrophic). The lowest efficiency in nutrient use was observed in winter, whereas the highest was recorded in spring, what revealed thus a storage strategy which can be beneficial to new shoots. This experiment provided evidence that generally, the water trophic state is the main factor governing P uptake, and the mineral status (softwater > hardwater) of the stream water is the second main factor. The phenological stage appeared to be a confounding factor to P level in water. Nonetheless, phenology played a role in P turnover in the plant. Finally, phenotypic plasticity allows both subpopulations to adapt to a changing environment.

La présente étude sur la Perdrix gambra (Alectoris barbara, BONNATERRE, 1792) a pour objectifs de renforcer et de développer des connaissances fondamentales et appliquées. L'approche méthodologique repose sur plusieurs volets complémentaires dont la confrontation a débouché sur la mesure des traits de croissance et de la dynamique des populations en milieux prés forestiers et présahariens en Algérie. La sélection bidirectionnelle a concerné trois générations N = 540 d'adultes et de jeunes poussins n= 4346. Les indicateurs de l'élevage contrôlé montrent que le niveau de la fertilité reste constant, soit un taux moyen de 82,27%, pendant toute la durée de la phase reproduction –incubation. Le volet suivi de la vitesse de croissance des caractères Poids, Tarse et Aile pliée, chez deux lignées Rapide et Lente pour les trois générations successives a concerné un cycle ti = 13 semaines portant sur un effort de sondage de 8946 mesures et sur un échantillon total de N = 213 oiseaux. Les ajustements des courbes de croissance, évalués via le modèle de Gompertz, montrent que dès le premier jour de la naissance, le poids, l'aile pliée et le tarse sont significativement en faveur de la lignée LR. Nous avons confirmé cette prédiction par des analyses de variances " ANOVA-test " et que les caractères mesurés sont significativement supérieurs chez la lignée LR par rapport à la lignée L1. Nous avons mis en évidence que le caractère sexuel secondaire " ergot " en développement pendant toute la durée de l'expérimentation devient significativement apparent dès les 140 jours d'âge. Le volet recherche de terrain montre que la structure des populations reste assez stable au niveau de l'aire pré-forestière de Zéralda avec une densité moyenne de 11,72 couples/100ha. Ceci n'est pas le cas des populations présahariennes de l'aire de Djelfa où la densité fluctue significativement en fonction de la pluviométrie. Nous avons noté que dans les deux stations et pour une année sèche, celle-ci est comprise entre 4,61 à 8 couples/100ha. Pour une saison arrosée, celle-ci varie entre 4, 94 à 14,4 couples/100ha, y compris le poids des facteurs de prédation et du braconnage. Les deux volets complémentaires de notre recherche font ressortir que le schéma de sélection s'est avéré efficace : les deux lignées divergent significativement. Les facteurs génétiques sont significativement responsables de la croissance rapide ou lente. Les exigences physiques, physiologiques et comportementales propres à ce groupe d'oiseaux ont été optimisées. Au cours de notre recherche sur terrain, nous avons démontré que les populations naturelles fonctionnent en tant que système biologique et possèdent une résilience. En outre, il existe des alternatives en matière de renforcement de la Perdrix gambra par le biais des lâchers d'oiseaux d'élevage issus d'une sélection rigoureuse toute en mettant en place un plan de prélèvement indicatif.

National audience; Le contrôle externe de qualité permet aux laboratoires chargés de l'analyse de l'environnement de vérifier, d'améliorer, et de maintenir en permanence un niveau optimal de leurs analyses. La méthode principalement utilisée pour la mise en oeuvre du contrôle externe de qualité est la comparaison interlaboratoires. En microbiologie, les mesures portent sur des dénombrements bactériens. Le caratère discret des données nécessite une méthode d'analyse de la variance spécifique. Nous proposons ici une méthode d'analyse de variance à deux facteurs fixes imbriqués sur données poissoniennes.

National audience; La statistique envahit pratiquement tous les domaines d'application, aucun n'en est exclu ; elle permet d'explorer et d'analyser des corpus de données de plus en plus volumineux : l'ère des big data et du data mining s'ouvre à nous ! Cette omniprésence s'accompagne bien souvent de l'absence de regard critique tant sur l'origine des données que sur la manière de les traiter. La facilité d'utilisation des logiciels de traitement statistique permet de fournir quasi instantanément des graphiques et des résultats numériques. Le risque est donc grand d'une acceptation aveugle des conclusions qui découlent de son emploi, comme simple citoyen ou comme homme politique. Les auteurs insistent sur les concepts sans négliger la rigueur, ils décrivent les outils de décryptage des données. L'ouvrage couvre un large spectre de méthodes allant du pré-traitement des données aux méthodes de prévision, en passant par celles permettant leur visualisation et leur synthèse. De nombreux exemples issus de champs d'application variés sont traités à l'aide du logiciel libre R, dont les commandes sont commentées. L'ouvrage est destiné aux étudiants de masters scientifiques ou d'écoles d'ingénieurs ainsi qu'aux professionnels voulant utiliser la statistique de manière réfléchie : des sciences de la vie à l'archéologie, de la sociologie à l'analyse financière.

L'alimentation représente près de 70% des charges dans un élevage de porcs et contribue par ailleurs à l'impact environnemental de l’élevage porcin. De ces deux points de vue, il est donc crucial de valoriser au mieux l’aliment. Les connaissances sur la croissance du porc sont nombreuses et intégrées dans des modèles de prédiction des performances ou des besoins pour un individu moyen. Le changement d'échelle vers la modélisation des performances d’une population implique de caractériser sa variabilité, ce qui a été réalisé à partir de 1288 porcs issus de dix croisements. Un nouveau générateur de population virtuelle a été élaboré qui permet de disposer de populations de porcs virtuels utilisables pour simuler l'effet de la conduite alimentaire sur leurs performances de croissance et les rejets azotés. La pertinence des résultats de simulation a été vérifiée par leur proximité avec ceux obtenus lors d'un essai in vivo. Ces résultats seront intégrés dans des démarches d'alimentation de précision., Feed represents almost 70% of cost production in piggeries. Due to economic but also to environmental concerns, utilisation of dietary supplies should be optimized. Knowledge on the average growth performance and nutrient requirements of growing pigs is important and integrated in growth models. Accounting for differences among pigs within a group supposes to characterize the variability of the population of pigs, which was performed from 1288 pigs originating from ten crossbreeds, studied in an experimental station. Based on these data, a new generator of virtual pigs was proposed and used to obtain virtual populations for which the effect of feeding strategies on performance and N output were simulated. An in vivo trial confirmed the relevance of simulation results. This work allows considering future integration of a population dimension in growth models and tools.

Excessive fructose consumption inhibits adaptive increases in intestinal Ca2+ transport in lactating and weanling rats with increased Ca2+ requirements by preventing the increase in serum levels of 1,25(OH)(2)D-3. Here we tested the hypothesis that chronic fructose intake decreases 1,25(OH)(2)D-3 levels independent of increases in Ca2+ requirements. Adult mice fed for five wk a high glucose-low Ca2+ diet displayed expected compensatory increases in intestinal and renal Ca2+ transporter expression and activity, in renal CYP27B1 (coding for 1 alpha-hydroxylase) expression as well as in serum 1,25(OH)(2)D-3 levels, compared with mice fed isocaloric glucose- or fructose-normal Ca2+ diets. Replacing glucose with fructose prevented these increases in Ca2+ transporter, CYP27B1, and 1,25(OH)(2)D-3 levels induced by a low Ca2+ diet. In adult mice fed for three mo a normal Ca2+ diet, renal expression of CYP27B1 and of CYP24A1 (24-hydroxylase) decreased and increased, respectively, when the carbohydrate source was fructose instead of glucose or starch. Intestinal and renal Ca2+ transporter activity and expression did not vary with dietary carbohydrate. To determine the time course of fructose effects, a high fructose or glucose diet with normal Ca2+ levels was fed to adult rats for three mo. Serum levels of 1,25(OH)(2)D-3 decreased and of FGF23 increased significantly over time. Renal expression of CYP27B1 and serum levels of 1,25(OH)(2)D-3 still decreased in fructose-compared to those in glucose-fed rats after three mo. Serum parathyroid hormone, Ca2+ and phosphate levels were normal and independent of dietary sugar as well as time of feeding. Thus, chronically high fructose intakes can decrease serum levels of 1,25(OH)(2)D-3 in adult rodents experiencing no Ca2+ stress and fed sufficient levels of dietary Ca2+. This finding is highly significant because fructose constitutes a substantial portion of the average diet of Americans already deficient in vitamin D.

Mechanical systems under vibration excitation are prime candidate for being modeled by linear time invariant systems. Damage localization using both finite element information and modal parameters estimated from ambient vibration data collected from sensors is possible by the Stochastic Dynamic Damage Location Vector (SDDLV) approach, where the damage location is empirically related to positions where the stress is close to zero. The first contribution in this thesis shows how the uncertainty in the estimates of the state space system can be used to derive uncertainty bounds on the damage localization residuals to decide about the damage location with a hypothesis test using one chosen Laplace value. In the second contribution, the damage localization method is extended with a statistical framework and robustness of the localization information is achieved by aggregating results at different values in the Laplace domain. The Influence Line Damage Location (ILDL) is a complementary approach of the SDDLV where the subspace angle is computed and damage is empirically located at points near zero. The last contribution describes how robustness of the localization information is achieved by aggregating results at different values in the Laplace domain based on the previous two contributions. The proposed methods are validated and successfully applied to damage localization of several applications in civil structures., Les systèmes mécaniques soumis et excités par vibrations sont les candidats naturels à être modélisé par des systèmes linéaires invariables dans le temps. La localisation de dommages utilisant les paramètres modaux évalués à partir de données de vibration ambiantes mesurées grâce à de capteurs est possible notamment par l'approche nommée Stochastic Dynamic Damage Location Vector (SDDLV), où l'emplacement des dommages est empiriquement relié aux positions où le stress est proche de zéro. La première contribution dans cette thèse montre comment l'incertitude sur les paramètres du système d'état peut être utilisée pour déduire des bornes d'incertitude sur les résidus de localisation de dommages, ceci afin de décider de l'emplacement de dommage utilisant un test d'hypothèse. Dans la deuxième contribution, la méthode de localisation de dommages est étendue pour être robuste au choix des variables de Laplace utilisées dans cette méthode. Ceci est obtenue en agrégeant statistiquement les résultats à valeurs différentes dans le domaine de Laplace. L'influence Line Damage Location (ILDL) est une approche complémentaire du SDDLV où l'angle entre les sous-espaces principaux est calculé et les dommages sont empiriquement localisés aux points près du zéro. L'approche développée pour la SDDLV est étendue à cette nouvelle approche, l'ILDL. Les méthodes proposées sont validées et appliquées avec succès pour la localisation de dommages dans des structures civiles.

Chapitre numéro 4; National audience

Session : Alimentation; Methionine (Met) is an essential amino acid involved in several physiological functions. Methionine can be provided by dietary protein or by isomers (DL‐Met) or analogues (DL‐HMB) of L‐Met, the biologically active form of Met. Although a large number of studies have been carried out comparing the efficiencies of DL‐Met and DL‐HMB, little information is available on the efficiency of L‐Met. The objective of this study was to compare the efficiency of L‐Met (obtained by fermentation) relative to that of DL‐Met (obtained by chemical synthesis) in piglets. The study was carried out with seven treatments including a basal diet deficient in Met and three diets with three levels of additional L‐Met or DL‐Met. Feed intake, daily gain and feed efficiency increased curvilinearly with increasing levels of both sources of Met and attained a plateau at the highest levels of supplementation with no effect of the source of Met. A bent‐stick model was used to estimate the efficiency of L‐Met utilization. The model was parameterized to allow for different response trajectories between L‐Met and DL‐Met. The estimated efficiencies of L‐Met relative to that of DL‐Met were 1.15 (± 0.12), 1.12 (± 0.09), and 0.99 (± 0.12) for feed intake, daily gain and feed efficiency, respectively. None of these values differed significantly from 1, indicating L‐Met and DL‐Met can be used equally efficiently as a Met source for growth in piglets.

Two-level data sets consist of higher level (say population) traits computed from lower level (say individual) observations. Cluster analysis for two-level data sets aims at classifying populations using individual observations. Most existing techniques to classify populations in two-level data sets actually operate on population traits (e.g. the k -means algorithm), thus disregarding the within-population individual variability. In this study, the k -means algorithm was compared with a recently developed classification method that accounts for within-population variability. Populations were tree species in a tropical rain forest in French Guiana, and individual observations were tree diameters and diameter growth rates. Tree species were classified according to either their diameter and growth rate, or to their asymptotic diameter distribution as predicted by an Usher matrix population model. In both cases, the k -means algorithm and the two-level classification method defined species clusters that were significantly related according to the Rand index. Nevertheless, clusters showed increasing differences between the two methods as the within-population individual variability increased. Whereas the k -means algorithm produced equally-sized spherical clusters, the two-level classification method adapted the size and shape of clusters to the individual within-population variability. Taking account of individual variability to classify populations in ecology may thus be important, albeit rarely done.

La machine Wehner et Schulze est utilisée pour étudier en laboratoire l'évolution du frottement de surfaces routières au cours d'un polissage accéléré. Jusqu'ici, aucune étude approfondie n'a été menée pour évaluer les différentes sources d'incertitude de l'essai et leur impact sur l'incertitude globale. On se propose donc dans cet article, d'identifier les sources principales d'incertitudes de l'essai et d'évaluer leur impact sur l'incertitude globale en fonction de ces sources. Dans un premier temps, les principales sources d'incertitudes sont identifiées. Leurs influences sur le résultat de l'essai sont ensuite évaluées via la définition et le dépouillement d'un plan d'expériences (création de modèles). Ensuite, l'analyse de variance (ANOVA) permet d'évaluer la significativité des paramètres et leurs interactions. Enfin, après ajustement et validation du modèle de propagation, l'incertitude type de l'essai est estimée.

chapitre numéro 4; International audience

Afin d'étudier leur aptitude à la combinaison, cinquante-cinq haploïde-doublées (HD) de #Coffea canephora$ ont été croisés avec soit des génotypes hétérozygotes soit des génotypes HD. Trois essais agronomiques ont été établis. Une vigueur hybride marquée est observée pour tous les caractères analysés dont la production. Des différences importantes sont mises en évidence entre HD produits à partir d'un même clone reflétant le haut niveau d'hétérozygotie des clones. L'analyse d'un plan factoriel de croisement indique que la variance génétique est essentiellement due aux effets additifs pour la production ainsi que pour la hauteur des arbres et la forme des feuilles. L'aptitude générale à la combinaison apparaît aussi prédominante pour le diamètre au collet et la résistance à la rouille bien que des effets d'interaction soient détectés. Des combinaisons hybrides ont une productivité semblable à celle de variétés clones témoins. Les implications de ces résultats pour l'amélioration génétique de #Coffea canephora$ sont discutées. Particulièrement, le développement de variété hybride F1 est envisagé. (Résumé d'auteur)

Fresh human sweat is odorless. Odoriferous volatile compounds are produced by the metabolism of bacteria living on the skin, generating strong malodor. Sweaty body odors do also appear on clothes during use, and especially on synthetic fabrics. The aim of this document is to improve understanding of odor emission by investigating subject effect, microbiota effect and fabric effect on the emission of odoriferous volatile compounds.Odors of perspiration are hereby globally approached with a wide use of methods and experimental devices, for microbial flora study as well as for odoriferous volatile compounds emission study.First, microflora enumeration has been simultaneously processed on the skin and on the fabric after exercise for 15 subjects. This experiment allowed an evaluation of the average bacterial transfer yield during physical activity and the beginning of the investigation of its effect on odor emission.A molecular biology methodology has then been developed in order to refine these results. Monitoring of qualitative composition of the microbiota has been performed to study the stability of the armpit’s ecosystem on a subject during 3 months. Specific microbial transfer from subject’s skin to clothe has been performed for 4 textile fabrics (including cotton and PET). This leaded to characterize the effect of specific bacterial transfer on odor emission from fabric.The last chapter is dedicated to the study of the emission of odoriferous volatile compounds over time using olfactory measurements and electronic nose for 8 selected fabrics. Principal component analysis targeted 9 chemical compounds that have been selected as malodorous behavior indicators for a given fabric. Those 9 compounds could be used for setting up a fitted physicochemical method of malodor.To conclude, this study helped to understand the effect of 3 factors in odor perception from a fabric after sport : subject, microbial flora and fabric. Perspectives have been charted on contact microbial contamination, but also on odor, and especially on desorption of odoriferous volatile molecules from a textile or knitted matrix. The solutions that could be used to limit malodorous emission from fabrics have also been discussed., Si la sueur fraîchement émise par le corps humain est inodore, la dégradation de celle-ci par la flore bactérienne cutanée produit des composés volatils malodorants, responsables des odeurs de transpiration. Les odeurs de transpiration apparaissent également sur les vêtements au cours de leur utilisation, particulièrement sur les textiles réalisés en fibres synthétiques. Ce travail a pour but d’améliorer la compréhension du phénomène d’émanation d’odeurs en étudiant l’effet du sujet testé, l’effet de la flore bactérienne et l’effet du textile sur les émissions de composés volatils malodorants.L’intérêt de ce travail réside dans l’approche globale de la problématique des odeurs de transpiration et dans la diversité des méthodes de mesure mises en place, tant dans l’étude de la flore microbiologique que dans les méthodes de mesures des composés odorants émis.Dans un premier temps, le dénombrement simultané de la flore bactérienne sur la peau et sur le vêtement a été réalisé sur un échantillon de 15 sujets à l’issue d’un exercice physique. Cette expérimentation a permis d’évaluer le taux de transfert bactérien moyen lors d’une activité sportive et d’étudier son rôle dans l’émission d’odeurs. Ensuite, afin d’affiner ces résultats, une méthode basée sur la biologie moléculaire a été mise en place pour réaliser le suivi qualitatif de la stabilité de la flore commensale axillaire d’un sujet pendant 3 mois. Le transfert bactérien spécifique entre la peau du testeur et le vêtement a été étudié pour 4 matières textiles sélectionnées (dont le coton et le PET). Ceci a permis de déterminer le rôle du transfert bactérien spécifique dans l’émission des odeurs à partir de textile.Enfin, le dernier chapitre est consacré à l’étude de l’émission de composés volatils et odorants à l’aide de mesures olfactives et d’un nez électronique au cours du temps par 8 composants textiles sélectionnés. Après traitement statistique par analyse en composante principale et étude détaillée des mesures, 9 composés chimiques ont été identifiés comme indicateurs d’un comportement textile malodorant. Ces derniers pourraient être utilisés dans la mise en place d’une méthode ciblée de mesure physico-chimique des mauvaises odeurs.Ce travail a permis de déterminer l’impact de chacun des facteurs sujet, flore bactérienne et textile dans l’émission d’odeurs. En outre, ce travail ouvre des perspectives sur l’étude des contaminations bactériennes par contact, mais également dans l’étude des odeurs, sur les phénomènes de désorption de molécules volatiles à partir de différentes matrices textiles et sur les solutions pouvant être envisagées pour limiter les émissions odorantes à partir de textiles.

Diplôme : IUP

National audience

Back-calculation usually requires measurements of growth marks revealed on otoliths by specific preparations. The standardization of the grinding (or sectioning) plane is necessary, but difficult, especially along the antero-posterior axis. In order to show the importance of the grinding plane, tetracycline labelling of eel otoliths (#Anguilla anguilla L.$) has been used. This marking has a calcio-traumatic effect on otoliths, which can be revealed with staining techniques. Unless the grinding plane is incorrect, the tetracycline labelling and the staining of the ground surface are then superposed. (Résumé d'auteur)

International audience

The trophic level mean and variance, and the degree of omnivory for five Celtic Sea fish predators were estimated using a database of stomach content records characterized by a high level of taxonomic resolution. The predators occupied a high position in the food web, i.e. 4.75 for Atlantic cod Gadus morhua, 444 for haddock Melanogrammus aeglefinus, 4.88 for European hake Merluccius merluccius, 5.00 for megrim Lepidorhombus whiffiagonis and 5.27 for whiting Merlangius merlangus. The level of taxonomic resolution of the prey did not greatly affect mean T-L predator values; an effect on variance was evident, low resolution masking intra-population variability in T-L. Generalized additive models (GAM) were used to explain the variability of predator T-L caused by environmental variables (international Council for the Exploration of the Sea, ICES, division and season) and predator characteristics (total length, L-T). Significant year, location season and interaction effects were found for some species and with L-T, at the scale of ICES subdivision. The species-specific variability of T-L could be due to spatio-temporal variations in prey availability and in predator selectivity following ontogenetic changes. Omnivorous fish T-L. was less affected by spatio-temporal variations. In addition, results showed that the omnivory index and T-L variability provide dissimilar information on predator feeding strategy. Combining information on T-L. variability and omnivory allowed between within individual and between-individual components contributing to trophic niche width to be separated and the type of generalization of fish predators to be identified. (c) 2008 The Authors Journal compilation (c) 2008 The Fisheries Society of the British Isles.

© A. de Rodellec/PNRC Pour les crevettes adultes en mer, la répartition géographique est liée aux conditions de milieu. Les migrations saisonnières de grande amplitude en hiver sont signalées aux limites extrêmes de distribution de l’espèce chez les pénéides (Burkenroad, 1939 ; Lindner et Anderson, 1956). Dans certaines régions limites, l’adaptation des pénéides se traduit par l’arrêt de la croissance et une baisse de l’activité de l’animal (Garcia et al., 1973 ; Lhomme, 1981). Les contrainte...

Our research work objective is to design a methodical framework for modelling preferences, behaviour changes of people and their impacts on the state of a complex system in a dynamic context. End-user may simulate the consequences of transport and town planning policies based on supply and demand of parking needs. A multi agent approach, had to be used to model the strongly heterogeneous preferences of road network users, and to integrate the knowledge obtained, this was done according to different behavioural logics. In order to get adaptive and evolutionary representations of individual agent behaviours, decision-making and learning processes are modelled thanks to a set of tools. These toolsresult from the industrial process optimization, data mining and marketing techniques. The personalized use of a computerized tool and the interactivity between end-user and simulator were important aspects to adapt this methodical framework for the simulation of complex systems used in society.; L'objectif de nos travaux est de développer un cadre méthodique afin de modéliser les préférences, les changements de comportement des individus ainsi que leurs impacts sur l'état d'un système complexe dans un contexte dynamique. L'utilisateur doit simuler les conséquences des politiques de transports et d'urbanisme sur l'offre et demande de stationnement, étape essentielle. Modéliser les préférences hétérogènes des usagers, intégrer des connaissances, selon des logiques comportementales différentes, ont justifié l'approche multi agents. Afin d'avoir des représentations adaptatives et évolutives des comportements des agents individus, les processus décisionnels et d'apprentissage sont modélisés au moyen d'un panier d'outils issus de l'optimisation des procédés industriels, des techniques Data Mining, de marketing. L'emploi personnalisé du simulateur avec l'interactivité utilisateursimulateur a motivé l'adaptation de ce cadre méthodique à la simulation des systèmes complexes sociétaux.