Search

BACKGROUND: The function of the tensor tympani muscle and its effects, as well as a universal testing procedure, is not yet known. The purpose of this study is to investigate the effect of tactile stimulation on the tensor tympani muscle activity in an attempt to evaluate the functional status of the muscle. METHODS: In this study, 20 healthy adults aged between 18 and 30 years were included. All participants had their history taken, as well as the evaluation of otoscopy, audiometry, and tympanometry. A modified reflex decay paradigm was used to evaluate the tensor tympani muscle activity, in both humans and a fresh-frozen cadaver. The tactile stimulation was applied by thumb tappings on different forehead areas. RESULTS: Reflex decay responses were in the form of the absence of a response or either a positive or negative waveform. Tactile stimulation had no impact on reflex decay recordings obtained from the cadaver. There was no significant difference between the waveforms obtained from both ears, at different stimulation frequencies, tactile stimulation areas, or the 3 successive stimuli for 1 individual in 1 ear (P > .05). Changes observed in the reflex decay test upon tactile stimulation seem to be due to tensor tympani muscle activity as supported by the previous findings in the literature. CONCLUSION: The application of a tactile stimulus on the forehead is a non-invasive test method to assess tensor tympani muscle contraction. Understanding the function of the tensor tympani muscle using a non-invasive method will be helpful during the decision-making process in the practice of otology.

Amaç: SARS-CoV-2 ile ilişkili viral pandemisi ilk olarak Aralık 2019'da Çin'in Wuhan kentinde bildirilmiştir. enfeksiyon gücünün yüksek olması nedeniyle, Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) 11 Mart 2020 tarihinde SARS-CoV-2’yi küresel pandemi olarak ilan etmiştir. Bu nedenle en önemli viral protein hedeflerinin belirlenmesi bir zorunluluk haline geldi. En önemli hedef proteinlerden biri ise, SARS-COV-2’nin replikasyon sürecinin bağlı olduğu RNA'ya bağımlı RNA polimerazdır (RdRp). Bu çalışmada RdRp ile RdRp nükleozit inhibitörleri, özellikle de Purin nükleozid analogları arasındaki olası etkileşimlerin incelenmesi, RdRp inhibitörleri ile yaygın olarak etkileşime giren en önemli kalıntıların saptanması ve bu kalıntılarda şimdiye kadar herhangi bir mutasyon gözlemlenip gözlemlenmediği araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: SARS-CoV-2 RdRp’ye karşı fizyolojik nükleotidler (ATP ve GTP) ve farklı viral RdRpler’e karşı onaylanmış ilaçlar (Galidesivir, Remdesivir, Ribavirin, Sofosbuvir ve Favipiravir) olmak üzere toplam 7 bileşik test edilmiştir. RdRp ile bu 7 bileşik arasında AutoDock Vina yardımıyla moleküler docking çalışmaları gerçekleştirilmiş olup moleküler docking çalışmalarından elde edilen sonuçlara ve uzaydaki konfigürasyonlarına göre en uygun olan modelleri için de detaylı yüzey etkileşim analizi Pymol ve Discovery Studio Visualizer software yardımıyla yapılmıştır. Sonuç ve Tartışma: Test edilen tüm moleküller, SARS-CoV-2 RdRp'ye başarıyla bağlanabilmiştir. Ayrıca hepsi 9 farklı amino asit ile (Arg553, Arg555, Asp618, Asp623, Ser682, Asn691, Ser759, Asp760 ve Asp761) aynı zamanda 3 farklı Template-primer RNA nükleotidi (U10, A11 ve U20) ile etkileşime girmiş ve zorunlu olmayan RNA zinciri sonlandırması yoluyla viral RdRp'nin inhibisyonuna neden olmuşlardır., Objective: SARS-CoV-2 associated viral pandemic was first reported in Wuhan, China, in December 2019. Due to the rapid increase in its pathogenicity, SARS-CoV-2 was declared a global pandemic by WHO on March 11, 2020. For that reason, determining the most attractive viral protein targets became a must. One of the most important target proteins is SARS-COV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) on which COVID-19 depends in its replication process. This study aimed to examine the possible interactions between RdRp and the most promising RdRp nucleoside inhibitors especially Purine nucleoside analogs, to detect the most important residues that commonly interact with RdRp's inhibitors and to investigate whether if there any mutations have been observed so far in these residues or not. Material and Method: Molecular docking studies were carried out using AutoDock Vina between SARS-CoV-2 RdRp and drugs approved against different viral RdRps (Galidesivir, Remdesivir, Ribavirin, Sofosbuvir, and Favipiravir) as well as physiological nucleotides (ATP and GTP). Based on the obtained results, a detailed surface-interaction analysis was also performed using Pymol and Discovery Studio Visualizer software for the models that exhibited the most suitable location and configuration in space. Result and Discussion: All the tested molecules were able to bind to SARS-CoV-2 RdRp successfully. Also, they all commonly interact with 9 different amino acids (Arg553, Arg555, Asp618, Asp623, Ser682, Asn691, Ser759, Asp760, and Asp761), and 3 different Template-primer RNA nucleotides (U10, A11, and U20) causing inhibition of viral RdRp via non obligate RNA chain termination.

Bu çalışmada çeşitli fizikokimyasal özelliklerini açıklamaya yönelik olarak, tasarlanan bileşiklerin termodinamik, hidrofobik, elektronik ve sterik parametreleri hesaplanmıştır. Bu parametreler, bileşiklerin antioksidan etkileriyle karşılaştırılarak aralarında bir ilişki olup olmadığı belirlenmeye çalışılmıştır. Yapı-aktivite ilişkileri çalışmalarında istatistiksel bir yöntem olan çoklu doğrusal regresyon analiz yöntemi kullanılmıştır, In present study, thermodynamic, hydrophobic and steric parameters of designed compounds were calculated to explain their physicochemical properties. These parameters comparing with their antioxidant activity, it has been determined if there is a relation between them. A statistics method, mostly regresyon analyzed method, was used in structure-activity relationships studies

V ÖZET YUKARI CEYHAN HAVZASINDA BİYOLOJİK ÇEŞİTLİLİĞİN EKOLOJİK YÖNETİMİ ALAGÖZ, Zeynep Yüksek Lisans Tezi, Biyoloji Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Yusuf GEMİCİ Temmuz 2005, 143 sayfa Bu çalışmamız 2004-2005 yıllan arasında, Orta Toroslar'ın doğu kesiminde kalan ve Davis (1965)'e göre Anti-Toroslar fitocoğrafik alanının güneybatısında yer alan Andırın-Kahraman Maraş-Göksun arasında bulunan kısmın öncelikle vejetasyon ekolojisi, sintaksonomik durumu ve biyolojik çeşitliliğinin belirlenmesi ve buna bağlı olarak mevcut ve potansiyel tehlikeler ile alanın sürdürebilirliğini sağlamak üzere ekolojik yönetim bazında alınması gereken önlemlerin ortaya konulması amacıyla gerçekleştirilmiştir. Çalışma bölgemizin vejetasyonu ülkemizde de yaygın olarak kullanılan Braun-Blanquet (1932) yöntemine göre araştırılmıştır. Bunun yanısıra alandaki bitki endemizmi ve fauna yapısı da arazi çalışmaları ve literatür taramasına göre belirlenmeye çalışılmıştır. Çalışmamız sonucunda kızılcam, karaçam, göknar, ardıç ve meşe topluluklarında daha önceden alana yalan bölgelerde belirlenmiş birlikler görülürken, sedir, kayın ve maki topluluklarında iki yeni birlik tespit edilmiştir.VI Orman toplulukları ve endemik bitkilerin yanı sıra alandaki yaban hayatı ve korunması bu alandaki ekosistemlerin döngüsü ve sürdürülebilirliği açısından önemlidir. Çalışmalarımız bize alanın sağlıklı, türce zengin ve yapısal olarak kompleks orman ekosistemlerinin ve alanda bulunan orman, yaban hayatı, su ve toprak gibi kaynakların korunması amacıyla alanda uygulamamız gereken ekolojik yönetim ilkelerini belirlememizi sağlamıştır. Alanda kayın ormanı topluluklarını merkez alan ve biyolojik çeşitliliği korumanın yanı sıra sürdürebilirliği de sağlayan bir yönetim ile ulusal ölçekte bir koruma alam olarak ilan edilmesi gerekliliği ortaya çıkmaktadır. Anahtar Kelimeler: Biyolojik çeşitlilik, ekolojik yönetim, vejetasyon ekolojisi, Yukarı Ceyhan Havzası VII ABSTRACT ECOLOGICAL MANAGEMENT OF BIODIVERSITY IN UPPER CEYHAN VALLEY ALAGOZ, Zeynep MSc in Biology Department Supervisor: Prof. Dr. Yusuf GEMİCİ July 2005, 143pages This study was carried out in the area at the south east of Anti- Taurus region (Davis, 1965), which is bordered by Andirin- Kahraman Maras and Goksun, between 2004 and 2005. The major purposes of the study were to define the vegetation ecology and syntaxonomic status of the region as well as its importance in terms of biodiversity so as to set the actions to be taken in the basis of ecological management principles for sustainable use and biodiversity conservation of these forest considering the current and potential impacts on these forest.. Vegetation of the project site was defined by using Braun- Blanquet (1932) method, a well-known method. Additionally, in order to determine plant endemism and fauna of the site, field studies and literature studies were realised. According to our study, while the red pine, black pine, fir, juniper and oak communities have same assosiations defined in the previous studies on the forests near to our project site, in cedar, beech and maquis communities, there are two new assosiations defined in this study.VIII Besides forest communities and high endemism rate in the region, the wildlife has a conservational importance in terms of sustainabiHty and ecosystem cycle. These results provided us with ecological management principles for the protection and sustainable use of the forests, the wildlife and their physical structures (i.e. water and soil) as healthy, rich in biodiversity and structurally complex ecosystems. In conclusion, the designation of a national protection area with a core zone centred in beech forests, having a long term ecological management plan for conservation of biodiversity and sustainable use of the resources should be considered as a first action to be taken in the region. Key Words: Biological diversity, ecological management, vegetation ecology, Upper Ceyhan Valley 151

191 ÖZET Yeni Melatonin Analoglarının Sentezi, Yapı Aydınlatılması, Antioksidan Enzim Sistemi Üzerinde Biyolojik Etki Çalışmaları ve Yapı-Etki İlişkileri Bu çalışmada 1. veya 5. konumda sübstitüye indol türevi, 20 tanesi ilk kez bu çalışmada olmak üzere 24 indol türevi madde sentezlenmiştir. Tasarlanan bileşiklerden 5. konumlardan sübstitüe bileşikler 4 aşamada, 1. ve 5. konumdan sübstitüe bileşikler ise S aşamada sentezlenmişlerdir. Antioksidan aktivite göstermesi beklenerek, sentezlenen bileşiklerin formülleri aşağıda verildiği gibidir. 1: N[2(lH-indol-3-il)etil]asetamid 2: N[2-(lH-indol-3-il)etil]propionamid 3: N[2(l-etil-lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 4: N[2(l-n-propil-lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 5: N[2(l-izopropil-lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 6: N[2(l(p-florobenzil)lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 7: N[2(l(o,p-diklorobenzil)lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 8: N[2(l-etil-lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni) 9: N[2(l-n-propil-lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni)192 10: N[2(l-izopropil-lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni) 11: N[2(l(p-florobenzil)lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni) 12: N[2(l(o,p-diklorobenzil)lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni) 13: N[2(5-metoksi-lH-indol-3-il)etil]asetamid (melatonin) 14: N[2(5-metoksi- lH-indol-3-il)etil]propionamid 15: N[2(5-metoksi-l-etil-lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 16: N[2(5-metoksi-l-n-propil-lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 17: N[2(5-metoksi-l-izopropil-lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 18: N[2(5-metoksi-l(p-florobenzil)lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 19: N[2(5-metoksi-l(o,p-diklorobenzil)lH-indol-3-il)etil]asetamid (Yeni) 20: N[2(5-metoksi-l-etil-lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni) 21: N[2(5-metoksi-l-n-propil-lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni) 22: N[2(5-metoksi-l-izopropil-lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni) 23: N[2(5-metoksi-l(p-florobenzil)-lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni) 24:N[2(5-metoksi- 1 (o,p-diklorobenzil)- lH-indol-3-il)etil]propionamid (Yeni)193 Bu bileşiklerin saflıkları İ.T.K ve erime noktalan tayin edilerek, kimyasal yapılan ise İR, 1H NMR, kütle spektroskopisi bulgulan ve elementel analiz sonuçlan ile aydınlatılmıştır. Bu çalışmada sentez edilen yeni (novel) melatonin türevi bileşiklerin sıçan karaciğer mikrozomlarmda NADPH'ya bağımlı lipit peroksidasyon üzerindeki olası inhibitor etkileri in vitro olarak araştınlmıştır. (tablo 4.1). Lipit peroksidasyonu inhibisyonunda standart olarak antioksidan bir bileşik olan BHT ve melatonin ile karşılaştınldığında 3, 4, 6, 11, 18, 20, 22, 23 no lu bileşiklerin lipit peroksidasyonu yüksek oranda inhibe ettikleri görülmüştür. Anahtar kelimeler: Melatonin, indol, lipit peroksidasyonu, antioksidan. 194 SUMMARY Synthesis, Structural Analysis, Biological Activity Studies on Antioxidant Enzym System, Structure-Activity Relationships of Novel Melatonin Derivatives In this study, it is aimed to design and synthesize twenty-four 1 and/or 5 substituted melatonin derivatives in which the twenty out of twenty-four are derived as novel indole compounds. Compounds bearing substituent at 5* position were synthesized in four steps while the compounds having substituent at 1th and 5th positions were synthesized in five steps. The compounds which are expected to show antioxidant activity are; 1: N[2(lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid 2:N[2(lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid 3: N[2(l-ethyl-lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 4: N[2(l-n-propyl-lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 5: N[2(l-izopropyl-lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 6: N[2(l(p-flourobenzyl)lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 7: N[2(l(o,p-dichloroenzyl)lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 8: N[2(l-ethyl-lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New) 9: N[2(l-n-propyl-lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New)195 10: N[2(l-izopropyl-lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New) 11: N[2(l(p-flourobenzyl)lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New) 12: N[2(l(o,p-dichloroben2yl)lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New) 13: N[2(5-methoxy-lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (Melatonin) 14:N[2(5-methoxy-lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid 15: N[2(5-methoxy-l-ethyl-lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 16: N[2(5-methoxy-l-n-propyl-lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 17: N[2(5-methoxy-l-lzopropyl-lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 18: N[2(5-methoxy-l(p-flourobenzyl)lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 19:N[2(5-methoxy-l(o,p-dichlorobenzyl)lH-indol-3-yl)ethyl]acetamid (New) 20: N[2(5-methoxy-l-etyl-lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New) 21: N[2(5-methoxy-l-n-propyl-lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New) 22: N[ 2(5-methoxy-l-izopropyl-lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New) 23:N[2(5-methoxy- 1 (p-flourobenzyl) lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New) 24: N[2(5-methoxy-l(o,p-dichlorobenzyl)lH-indol-3-yl)ethyl]propionamid (New)196 The purity of the compounds was controlled by TLC and melting point determinations followed by the compounds fully purified by column chromotografy. The compounds were elucidated by IR, NMR, and Mass spectral and elemental analys. In this study, newly synthesized melatonin derivatives were investigated the inhibition of on NADPH-bounded lipit peroxidation activity on liver, microsomal mixed-function oxidase system of rat. It is found that compounds 3, 4, 6, 11, 18, 20, 22, 23 have shown significant inhibitory activity when compared with melatonin and antioxidant referans compound BHT. Key wods: Melatonin, indol, lipid peroxidation, antioxidant. 224

Bu makale klinik ve bilimsel önemi olan ajanların geliştirilmesi amacı ile, melatonin ve ilgili analoglarının melatonin reseptörleri ile etkileşimlerini içermektedir. Derleme son zamanlarda yayınlanan melatonerjik ligandlar ve onların ilgili melatonin reseptörlerine olan affinitelerini vermekte ve geri dönüşümlü, yüksek affiniteli ve seçici melatonin alt reseptörlerinin gelişimini tartışmaktadır. İleri tasarım, sentez ve melatonerjik ligandların kullanılması melatonin ve reseptörlerinin insanlardaki rolünü daha iyi anlamamıza olanak sağlıyacaktır, This paper includes how melatonin and its related analogs interact with melatonin receptors with the hope of developing important tools and agents of significant clinical and scientific importance. The review provides currently published melatonergic ligands and their relative affinities for melatonin receptors and discusses the importance of developing reversible, high-affinity, and subtype selective melatonin receptor antagonists. Further design, synthesis, and application of melatonergic ligands will lead us to a clearer understanding of the role that melatonin and its receptors play in humans

Son zamanlarda melatoninin etkili bir serbest radikal yakalayıcısı ve antioksidan olduğu rapor edilmektedir. Melatoninin çok toksik olan hidroksil radikalini, peroksinitrit anyonunu ve büyük olasılıkla peroksil radikalini yakaladığına inanılmaktadır. Ayrıca melatoninin Alzheimer hastalığında amiloid protein toksisitesini düşürdüğü, Parkinson hastalığının çeşitli tiplerinde oksidatif hasarı azalttığı gösterilmiştir. Bu derlemede melatoninin antioksidan bir ajan olarak rolü ve santral sinir sistemi hastalıklarındaki koruyuculuğu araştırılarak sunulmuştur, Melatonin was recently reported to be an effective free radical scavenger and antioxidant. It is believed that melatonin scavenges the highly toxic hydroxyl radical, the peroxynitrite anion, and possibly the peroxyl radical. Also melatonin has been shown to reduce amyloid protein toxicity of Alzheimer's disease and oxidative damage in several models of parkinson's disease. The role of melatonin as an antioxidant agent and protection against central nervous system diseases was investigated in this review

100 ÖZET Retinoidal Etkili Bazı Benzimidazol ve/veya İndol Türevi Bileşiklerin Sentezleri ve Yapı Tayini Çalışmaları Bu çalışmada 4. veya 5. konumlardan sübstitüe edilmiş (5,5,8,8-tetrametil, 5,6,7,8-tetrahidro naftil) benzimidazol türevleri, retinoidal etkileri araştırılmak üzere planlandı ve sentezlendi. Benzimidazol halka sistemi ve retinobenzoik asit yapısı birleştirilerek 9 tanesi orjinal 1 1 bileşik sentezlendi. Ayrıca 3 adet 1. konumdan sübstitüe orjinal benzimidazol türevi madde de elde edildi. Bu bileşiklerin saflıkları İ.T.K ve erime noktaları tayin edilerek, kimyasal yapıları ise İR, 1H NMR ve Mass analiz sonuçları ile aydınlatılmıştır. Z1 1 kodlu bileşik ayrıca X-Ray kristal lografik yöntem ile tanımlanmıştır. Bileşiklerin biyolojik verileri indirgenmiş sitokrom-c üzerindeki inhibisyon etkilerinin araştırılması ile elde edilmiştir. Antioksidan bir enzim olan SOD ile mukayese edildiğinde bazı bileşiklerin (Z4, Z5, Z7) oldukça kuvvetli inhibisyon gösterdiği tespit edilmiştir. Elde edilen sonuçlar doğrultusunda bu konudaki çalışmalarımız devam etmektedir. Anahtar kelimeler: Retinoik Asit, Retinol, Benzimidazol, A vitamini, Am- 580. 101 SUMMARY Synthesis and Structural Analysis of Some Benzimidazole and/or indole Derivatives with Retinoidal activity. In this study, a series of substituted (at position 4' and/or 5') (5,5,8,8- tetramethyl, 5,6,7,8-tetrahydronaftyl) benzimidazole derivatives were designed and synthesised for investigation of their retinoidal activity. The compounds were prepared mainly by condensation of substituted benzimidazole with retinobenzoic acid. Eleven compounds were synthesized and 9 of them were original. Addition of functional groups to the position 1 of the benzimidazole were also described in three compounds. The purity of the compounds were controlled by TLC and melting points were determined. The compounds were characterized by İR, NMR and Mass spectral analysis data. The conformational ly structure of compound Z1 1 was performed by X-Ray analysis. Biological activity of these compounds were obtained by examining the inhibition effect on reduced cytochrome-c. Some of the compounds ( Z4, Z5, Z7) showed significant activity when they compared with the antioxidant enzyme SOD. Since some results are promising for the substituted new derivatives, the work in progress. Key words: Retinoic acid, Retinol, Benzimidazole, Vitamin A, Am-580. 125

Bu çalışma kapsamında alkil sülfonil grubu taşıyan orijinal 82 adet indol-benzimidazol türevi bileşik sentezlenmiştir. Antikanser aktiviteleri klinikte yaygın olarak kullanılan kamptotesin ile kıyaslanarak MCF-7, MDA-MB-231 ve HEPG2 hücre hatlarında geniş taramaları yapılarak in vitro olarak tayin edilmiştir. Tasarlanan türevlerin sentezine 4-klorobenzen-sülfonilklorür (1) başlangıç maddesi ile başlanmıştır ve 4-klorobenzen-sülfonilklorürden hareketle 4 basamakta N-sübstitüe-4-(alkilsülfonil)benzen-1,2-diamin türevleri (30-52) elde edilmiştir. Elde edilen o-fenilendiamin türevleri uygun sübstitüe indol-3-karboksaldehitlerin Na2S2O5 tuzları ile muamele edilerek benzimidazol siklizasyonu gerçekleştirilmiş ve sonuç ürünler (54-135) elde edilmiştir. Sentezlenen bileşiklerin saflıkları İTK ile kontrol edildikten sonra erime noktaları saptanmış ve yapıları; 1H-NMR, 13C NMR, MASS ve elementel analiz sonuçları ile aydınlatılmıştır. Sentezlenen moleküller, farklı dozlarda, MCF-7 meme kanseri hücre hattı ve karaciğer kanseri hücre hattı HEPG2'de hücre yaşamına olan etkileri açısından test edilmiştir. Bileşikler öncelikle MCF-7 hücre hattında taranmıştır. Ön taramayı geçen ve etkin dozları belirlenen bileşikler için MTT deneyleri tekrarlanmıştır. MCF-7 ve HEPG2 hücre hatlarında etkisi görülen bileşiklerin daha geniş doz aralığında taraması yapılarak IC50 değerleri hesaplanmıştır. Bu ikincil çalışmada, epitel karakterdeki MCF-7 ve HEPG2'ye ek olarak mezenkimal karakterdeki MDA-MB-231 hücresi de kullanılmıştır. Bu çalışmadan ortaya çıkan bazı önemli yapı aktivite ilişkileri (SAR'ler): R2 pozisyonlarında küçük alkil gruplarına sahip olan bileşikler nispeten daha etkili antikanser aktiviteye sahip olduğu görülmüştür. Örneğin, R3 konumunda -Cl ve R2 konumunda metil grubu içeren 93 no'lu bileşik, bu bileşikler arasında MCF-7 hücrelerine karşı en etkili olarak bulunmuştur. Yine R3 konumunda -Br ve R2 konumunda propil grubu içeren 102 no'lu bileşik, bu bileşikler arasında HEPG2 hücrelerine karşı en etkili ve ayrıca MCF-7 hücrelerine karşı da etkili olarak bulunmuştur. R2 ve R3 grupları ayrı ayrı veya kombinasyon halinde değişik sitotoksik aktivite gösterebilirler. Rı' de tek başına etil ve bütil grupları veya R3'de tek başına halojenik gruplar veya R2 üzerinde siklik gruplar ile R3' de elektron çekici grupların varlığında sitotoksik aktivite yükselmektedir. In this study, 82 original indole-benzimidazole derivative compounds carrying alkyl sulfonyl group were synthesized. Anticancer activities were determined in vitro by extensive screening on MCF-7, MDA-MB-231 and HEPG2 cell lines, comparing with clinically commonly used camptothecin. The synthesis of the derivatives was started with 4-chlorobenzene-sulfonylchloride (1) and N-substituted-4-(alkylsulfonyl)benzene-1,2-diamine derivatives (30-52) were obtained in 4 steps. o-Phenylenediamine derivatives were treated with Na2S2O5 salts of appropriately substituted indole-3-carboxaldehydes to give indole-benzimidazoles (54-135). After the purity of the synthesized compounds were checked by TLC, their melting points were determined and their structures were elucidated with their 1H-NMR, 13C-NMR spectrum, Mass (ESI+) spectral data and elementel analysis. The synthesized molecules were tested at different doses for their effect on cell life in the MCF-7 breast cancer cell line and liver cancer cell line HEPG2. Compounds were screened primarily in the MCF-7 cell line. MTT experiments were repeated for compounds that passed the pre-screening and whose effective doses were determined. Compounds with effect on MCF-7 and HEPG2 cell lines were screened at wider dose range and IC50 values were calculated. In this secondary study, in addition to MCF-7 and HEPG2 of epithelial character, mesenchymal MDA-MB-231 cell was also used. Some important structure activity relationships (SARs) resulting from this study: Compounds with small alkyl groups at the R2 positions have been found to have relatively more effective anticancer activity. For example, compound 93 containing -Cl at the R3 position and methyl group at the R2 position has been found to be the most effective against MCF-7 cells among these compounds. Again, compound 102 containing -Br in the R3 position and propyl group in the R2 position was found to be the most effective against HEPG2 cells and also effective against MCF-7 cells. The groups R2 and R3 may exhibit different cytotoxic activity, either individually or in combination. Cytotoxic activity increases in the presence of ethyl and butyl groups alone in R2, or halogenic groups alone in R3 or cyclic groups on R2 and electron withdrawing groups in R3. 340