Search

Introduction: Autism spectrum disorder is a genetically and phenotypically heterogeneous group. Genetic studies carried out to date have suggested that both common and rare genetic variants play a role in the etiology of this disorder. In our study, we aimed to investigate the effect of FOXP2, GRIN2B, KATNAL2 and GABRA4 gene variants in the pathogenesis of autism spectrum disorder. Method: In our prospectively planned study, all exons and exon-intron junctions of FOXP2, GRIN2B, KATNAL2 and GABRA4 genes were screened by next generation sequencing analysis in 96 patients who diagnosed with autism spectrum disorder. Results: In our study, the average age was 10.1 and the male/female ratio was 75/21. Pathogenic or likely pathogenic variants were not detected in FOXP2, GRIN2B, KATNAL2 and GABRA4 genes, however, 69 intronic variants of unknown clinical significance were detected in 50 cases (52%). Among those, 26 were in the GABRA4 gene, 22 in the FOXP2 gene, 13 in the KATNAL2 gene, and 8 in the GRIN2B gene. Twenty three of these 69 variants were novel that were not previously reported in the literature. Conclusion: In our study, we could not identify a relationship between the autism spectrum disorder and FOXP2, GRIN2B, KATNAL2 and GABRA4 genes. Identifying genetic risk factors that play a role in the etiopathogenesis of autism spectrum disorder will contribute significantly to understanding the molecular mechanisms of the disease and the development of new treatment strategies. In this context, comprehensive molecular genetic studies such as whole exome or whole genome sequencing are required with higher number of cases in different populations.

Den mest effektive behandling for patienter med solide kræft tumorer er kirurgi. Trods kurative kirurgiske indgreb opstår postoperative metastaser ofte, og disse er forbundet med høj mortalitet og morbiditet. Den perioperative stress respons forårsager biologiske forstyrrelser, som kan fremme tilbagefald. Disse forstyrrelser er induceret af neurologiske og immunologiske forandringer, som er associeret med trauma. Det er accepteret, at cytokinprofilen, grundet kirurgisk induceret inflammation, og produktionen af katekolaminer og prostaglandiner, grundet kirurgisk forløst ”flight-or-fight” respons, bidrager til dette tilbagefald. Selvom, metastasering kan blive forklaret gennem forandringer i den perioperative periode, er en direkte forbindelse mellem stressresponset og forandringer hos kræftcellen klart. Det er derfor formålet med dette studie at undersøge om, proliferation hos kræftceller bliver påvirket af dette kirurgisk induceret stress respons. Dette er undersøgt ved at udvikle en luciferase-baseret assay ved hjælp af CRISPR/cCas9 genom redigering teknologi, hvorved celle proliferation kan blive målt i reel tid uden behov for at høste cellerne. Formålet var at indsætte gener, som koder for Zeocin resistens og udskilt luciferase med deres respektive promotorer hEF1 og CMV, i safe harbor sitet AAVS1 hos PANC-1 celler. Transfektion og selektion resulterede i en klon, kaldet PANC-LUC1, hvori hele indsatsen var lokaliseret i AAVS1 sitet. Forholdet mellem celle antal og det producerede udskilte luciferase blev undersøgt. Der blev fundet en lineær sammenhæng mellem disse. PANC-1LUC celler blev tilsat medie med serum fra 30 patienter diagnosticeret med kræft i kolon, som havde gennemgået en operation. Serum fra patienter blev taget en dag før og efter operationstidspunktet. I to uafhængige forsøg blev der fundet en forøget proliferation hos PANC-1LUC celler, som blev udsat for postoperativt serum sammenlignet med preoperativt serum. Det nyudviklede assay og dets reproducerbarhed blev også undersøgt. Resultater viste, at selvom det overordnede resultat ikke ændrede sig mellem eksperimenterne, var patientvise resultater anderledes mellem eksperimenterne. Der blev konkluderet, at resultater opnået i dette studie, støtter at det perioperative stress påvirker celle proliferation, og at det udviklede luciferase-baseret assay kan blive brugt i proliferations studier, dog med justeringer. Det er stadig uvist, hvilke komponenter i postoperativt serum forårsager forhøjet proliferation hos PANC-1 celler., Surgery is the main, often curative, treatment for patients with solid cancers. However, despite curative surgical resection postsurgical development of metastases is frequent and often correlated with high mortality and morbidity. The recurrence of the tumor distant from the primary location, can partly be explained by surgical induced stress response. The perioperative stress response results in biological perturbations, that might promote disease recurrence. These perturbations are induced by the neurological and immunological changes, that are associated with trauma. It is accepted that, changes in the cytokine profile, due to surgery induced inflammation, and production of catecholamines and prostaglandins, due to surgery induced “fight-or-flight” response, contribute to this unfortune relapse. Although, recurrence can be explained by these changes during the perioperative period, a direct association between this stress response and the cancer cell behavior remains unanswered. It is therefore, aimed to investigate, if proliferation of cancer cells directly is affected by this stress response. This is accomplished by developing a luciferase-based assay, with the help of CRISPR/Cas9 genome editing approach, in which the cancer cell proliferation can be measured in real time without harvesting the cells. Genes encoding Zeocin resistance and secreted luciferase with their respective promoters hEF1 and CMV, was aimed to be inserted at the AAVS1 safe harbor locus in PANC-1 cells. The transfection and selection resulted in one clone, called PANC-1LUC, with the whole insert at the AAVS1 site. The relationship between cell number and produced secreted luciferase was investigated, and a linear relationship between luciferase and cell number was found. The PANC-1LUC cells were subjected to medium with serum from 30 colorectal cancer patients, that have undergone surgery for colorectal cancer. Serum from the patients was obtained one day prior and one day after surgery. It was found that postoperative serum stimulated PANC-1LUC cells had enhanced proliferation compared to preoperative serum in two independent experiments. The assay and its ability to reproduce the same results was investigated. The results showed, that even though overall results did not change between the experiments, the results of the single patient samples changed among the experiments. In conclusion, the results obtained in this study, support that the perioperative stress affect cell proliferation and that the developed luciferase-based assay can be used in such proliferation studies with adjustments. Still, it is unclear the exact unit(s) in postoperative serum, that results in increased proliferation of PANC-1 cells.

Tez çalışmasında, toplumsal cinsiyet ve kadının temsilinin etkisi, bir iletişim aracı olarak sinema üzerinden, topluma yansıyabilen olumlu ya da olumsuz etkilerin neler olabileceği, bu tezde incelenmiştir. Kadın bir yönetmen olarak Yeşim Ustaoğlu ve sineması, filmlerinde Toplumsal Cinsiyet ve kadını ele aldığı için, bu araştırmada özellikle seçilmiş, son dört film birbiriyle olan bağlantıları ve içerdikleri mesajlar açısından incelenmeye alınmıştır. Tezin ilk bölümünde, toplumda yer alan bireylerin ne gibi özelliklere sahip olması gerektiğini ve nasıl tanımlandığını, toplum tarafından yaratılan pozisyonların nasıl oluştuğu, bunu oluşturan unsurlarda etnik kökeni, aidiyet gibi kavramların insanlar üzerindeki etkileri araştırılmıştır. Sosyal hayat, statü ve rollere göre nasıl düzenlendiği incelenmiştir. Toplumsal normların davranışların toplum tarafından belirlenen kurallarla nasıl çevrelendiği, sosyal hayatın normal akış içerisinde nasıl devam ettiği, toplumsal cinsiyet rollerine uygun tutum ve davranışlara nasıl dönüştüğü, bu davranış biçimlerinin baskılanan yönlerle bireyin “çoğunluk” dediğimiz toplum tarafından kabul ve makbul görülen ortak davranışların esaretine nasıl dönüştüğü araştırılır. Kadının geleneksel ve modern toplumlardaki yerini, Cumhuriyet döneminde kadının temsiline ilişkin kazanımların ve etkilerinin neler olduğu, bu araştırmada ayrıca tarihsel olarak incelenirken,1950 ve 1980’li dönemlerde kadının kimlik olarak ulaştığı evreler bu bölümde ele alınmıştır. Tezin ikinci bölümünde, feminist kuramcılarla desteklenen Toplumsal Cinsiyete ait kavramlar, toplum tarafından icat edilen ve sonra ona inanılarak yürüyen alışkanlıkları ve davranışların kaynağı üzerinde durulur. Bir ideoloji olarak feminizmin Dünyada ve Türkiye’deki etkileri bu bölümde araştırılırken, etkili bir iletişim aracı olan sinemanın kitleleri ve toplumları farkına varmadan istenilen ideoloji ile nasıl etki altında bıraktığı, araştırmanın bu bölümünde incelenmiştir. Sinemada cinsiyet olgusunun nasıl dizayn edildiği, kadın ve erkek olgusunun zamanla toplumda nasıl etkin bir role ve statüye dönüştüğü bu bölümde ele alınmıştır. Tezin üçüncü ve son bölümünde, Yeşim Ustaoğlu sineması başta belirtilen kuramlar çerçevesinde ele alınarak incelenmiş. Yönetmenin özellikle son dört filmi olan Bulutları Beklerken (1997), Pandora’nın Kutusu (2005), Araf (2011) ve Tereddüt (2017) filmleri çalışmada örnek olarak ele alınıp incelenmiştir. İnceleme, filmlerin oyuncularından başlayarak, kadının ve erkeğin filmde temsil edilme biçimi, kadını özgürleştiren ya da tutsaklaştıran sahneleri, toplumsal cinsiyet içeren sahneleri söz konusu kriterler ölçüsünde değerlendirmeye alınarak, ortak bir ölçü getirilmiştir. Filmleri ölçmek ve değerlendirebilmek için geliştirilen bu model sayesinde yönetmenin filmleri, yapılış sırasına göre birbirleri ile kıyaslanmış, bu sayede toplumsal cinsiyete ve kadın temsiline ilişkin çeşitli verilere ve istatistiklere ulaşılmıştır. Sinema etkili bir iletişim aracı olarak, toplumlar üzerindeki olumlu ya da olumsuz etki yaratır., This thesis includes a review of the impact of gender and female representation, the possible positive and negative impacts of this representation that can be reflected on the society via cinema as a means of communication. As a female director, Yeşim Ustaoğlu and her cinema have especially been chosen for this review since her films comprise information about the subject, and her last four films have been discussed in terms of their relation to each other and the messages they convey. In the first part of the thesis, what characteristics should be possessed by individuals in the society and how these characteristics are described, how the positions created by the society are formed, and the impact of concepts like ethnicity and belonging on people are investigated. How social life is organized according to roles and status is examined. How the social norms and behaviours are surrounded by the rules determined by the society, how social life goes on in its normal flow, how it converts to attitudes and behaviours appropriate for gender roles, how these types of suppressed behaviours turn into the slavery of common behaviours accepted and liked by the society which we call “majority” were also investigated. The place of woman in traditional and modern societies, the gainings of the representation of women in the Republican period and their impacts were also examined historically in this study. The stages that women reached as identity in 1950’s and 1980’s are discussed in this section. The second part of the thesis focuses on these concepts that are supported by feminist theoreticians, the origin of the habits and behaviours invented and then continued believeingly by the society. While the impacts of feminism on the world and on Turkey as an ideology are researched in this part, how cinema as an efficient means of communication influences the masses and societies ideologically without awareness is also discussed. How the gender in cinema is designed and how female and male phenomenon transformed into an active role and status in society in time are also examined in this part. In the third and last part of the thesis, Yeşim Ustaoğlu’s cinema is handled and analyzed within the frame of theories described at the beginning. Especially, the last four films of the director namely Waiting for the Clouds (1997), Pandora’s Box (2005), Araf- Somewhere in Between (2011) and Clair Obscure (2017) are taken as a sample for the study and discussed. Discussion starts with the characters of the films, then the way women and men are represented, the scenes that free or imprison woman, scenes that include gender are evaluated in accordance with the relevant criteria and a common measurement is brought forward. Through this model developed to measure and evaluate films, director’s films have been historically examined and compared to each other according to their status. Thus, various information and statistics have been reached regarding gender and women representation. Cinema as an efficient communication power has numerous effects on societies and makes a positive impact on those that live by traditional and modern codes and leads to the creation and survival of sound generations through the use of artistic and cultural tools.

Amniyotik hücreler fetustan köken alan ve birçok farklı doku tipine dönüşebilen hücrelerdir. Bu durum hücrelerin birçok medikal uygulamada kullanılmasına olanak sağlar. Amniyotik ve foliküler sıvılar, prenatal tanıda çok etkili bir metod olan amniyosentez ile toplanmaya çalışılmıştır. Uygulamadan 48 saat sonra domuzlarda abortus görüldüğü ve toplanan hücre sayısının yeterli olmamasından dolayı, örneklerin steril şartlar altında operasyonla toplanmasına karar verilmiştir. Alınan hücreler yeterli sayı ve mitotik aktiviteye ulaşıncaya kadar hücre kültüründe geliştirilmiştir. Takibinde Trizol ile muamele edilerek hücrelerden RNA izolasyonu yapılmıştır. Amniyotik ve foliküler hücrelerin iyi kalitede üremelerine rağmen RNA izolasyonlarından alınan sonuçlar çok tatmin edici olmamıştır. RNA bütünlüğü agaroz jel elektroforezi ile kontrol edilmiştir. Elektroforez sonuçlarına göre foliküler hücrelerden elde edilen örneklere ait 28s, 18s ve 5s rRNA bantları gözlenirken, amniyotik hücre kültürlerine ait örneklerde hiç bant gözlenmemiştir. Bu sonuçlar domuza ait amniyotik ve foliküler hücrelerin in vitro ortamda üretilebildiğini göstermiştir. Ancak amniyon hücrelerine ait başarısız RNA izolasyonları açıklanamamaktadır. Amniyotik hücreler için hazırlanacak kültüre bazı zenginleştirmeler yapılabileceği yada izolasyon için daha farklı metotların kullanılabileceğini önerilebilir