Search

Orta Karadeniz Bölgesi Samsun, Tokat ve Amasya ili fasulye üretim alanlarında 2013-2014 yıllarında fasulye hale yanıklığı hastalığı etmeni Pseudomonas savastonoi pv. phaseolicola (Psp) ve adi yaprak yanıklığı hastalığı etmeni Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap)’nin belirlenmesi için surveyler yapılmıştır. Güdümlü örnekleme yöntemiyle toplam 154 fasulye tarlası gezilerek şüpheli semptom gösteren yaprak ve meyve örnekleri toplanmıştır. İzolasyon çalışmaları sonucu 72 adet saf bakteri izolatı elde edilmiştir. Patojenisite, morfolojik, biyokimyasal testler, tanıyı destekleyici LOPAT testleri ve moleküler analizler (PCR) sonucunda 30 izolat Psp ve 17 izolat Xap olarak tanılanmıştır. Psp izolatları 8 farklı fasulye çeşidinden oluşan ırk ayrım setindeki bitkilere inokule edilmiş ve çeşitlerin verdiği reaksiyonlara göre Psp’nın ırk/ırkları belirlenmiştir. Çeşit reaksiyonlarına göre Psp izolatlarının tamamının 1 nolu ırk olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışmada, Türkiye fasulye üretiminin % 16’sının gerçekleştiği Orta Karadeniz bölgesinde evrensel ırk ayrım seti kullanılarak Psp izolatlarının ırk düzeyinde ayrımı ilk kez yapılmıştır., In 2013-2014, surveys were conducted in order to investigate the presence of Pseudomonas savastonoi pv. phaseolicola (Psp) halo blight and Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (common bacterial blight) (Xap) in common bean production areas of Samsun, Tokat, Amasya at Middle Black Sea region. Total, 154 common bean fields were surveyed and their leaf and bean samples were collected with typically resembling symptoms using guided sampling method. Total of 72 purified bacterial isolates were obtained. All the isolates assayed in pathogenicity, morphological, biochemical tests. Further identification methods were conducted with LOPAT tests and molecular analyses (PCR), their results have revealed that 30 isolates were Psp and 17 isolates were Xap. Psp isolates were separately inoculated on 8 bean varieties to determine their races according to phenotypic reactions. Their reactions on 8 bean varieties were revealed that all Psp isolates were Psp race 1. This work are proved that races of Psp isolates using universal separation set at Middle Black Sea region in which supplies about 16 % of the total bean production in Turkey.

Bu çalışmada Samsun, Tokat ve Amasya illerinde fasulye üretim alanlarında yapılan sürveylerde toplanan hasta bitkilerden toplam 72 bakteri izolatı elde edilmiştir. Patojenite testine tabi tutulan bu izolatlar ile yapılan morfolojik, biyokimyasal testler ve tanıyı destekleyici LOPAT testleri ve moleküler analizler (PCR) sonucunda 30 izolat Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola ve 17 izolat Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli olarak tanılanmıştır. Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola izolatları 8 farklı fasulye çeşitinden oluşan ırk ayrım setindeki bitkilere ayrı ayrı inokule edilmiş ve çeşitlerin verdiğini reaksiyonlara göre Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola'nın ırk/ırkları belirlenmiştir. Çeşit reaksiyonlarına göre Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola izolatlarının tamamının 1 nolu ırk olduğu tespit edilmiştir. Ayrıca bu çalışmada 22 taze ve 20 kuru fasulye ıslah hattının Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola ve Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli bakteriyel etmenlerine karşı dayanıklılık düzeylerinin ve sahip oldukları dayanıklılıkla ilgili genlerin belirlenmesine çalışılmıştır. Bu amaçla ıslah hatlarının yaprak ve meyveleri virülent Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola ve Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli bakteri izolatı ile inokule edilerek çeşitlerin dayanıklılık düzeyleri simptomatolojik olarak incelenmiştir. Buna ilave olarak Pse-1, Pse-3 genlerine ve Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli Major QTL bölgelerine spesifik SCAR markörleri ile PCR yöntemi kullanılarak çeşitlerin söz konusu dayanıklılık genlerini bulundurma durumları belirlenmiştir. Yapılan moleküler analizler sonucunda toplam 20 taze ve kuru fasulye ıslah hattının Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola 1 nolu ırka dayanıklılığı dağlayan Pse-1 genine ve toplam 31 taze ve kuru fasulye ıslah hattının Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola 3 nolu ırka dayanıklılığı sağlayan Pse-3 genine sahip olduğu tespit edilmiştir. Taze ve kuru fasulye ıslah hatlarında hem simptomatolojik çalışmalar hem de moleküler analizler sonucunda Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli bakteriyel etmenine karşı dayanıklılık olmadığı belirlenmiştir. In this study, 72 isolates of bacteria were collected from surveys which were conducted bean grown areas of Samsun, Tokat and Amasya provinces. All the isolates were assayed in pathogenicity test with morphological, biochemical analyses. Further identification methods were conducted with LOPAT tests and molecular analyses (PCR), their results have revealed that 30 isolates were Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola and 17 isolates were Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli found. The Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola isolates were separately inoculated on 8 bean species to determine their races according to their phenotypic reactions. Their reactions on 8 bean species were revealed that all Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola isolates were determined as Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola race 1. Additionally, to assess resistance loci of 22 fresh and 20 dry bean lines were tested with virulent isolates of Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola and Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli. Leaves and pots of beans were inoculated with the virulent isolates and their symptoms were evaluated on scale. Meanwhile specific SCAR markers of Pse-1, Pse-3 genes to Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola and QTL region gene to Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli were analyzed in PCRs to understand presence of the resistance genes in the beans. The molecular analyses have amplified specific DNA segment for Pse-1 gene to Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola race 1 isolate in 20 fresh and dry beans and have amplified product for Pse-3 gene to Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola race 3 isolate in total 31 bean lines but no amplification resulted QTL region gene to Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli in these bean lines. 164