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Arthur Goetschy, Rémi Carminati, Sebastien M. Popoff, M. Durand, Université Paris sciences et lettres (PSL), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Langevin - Ondes et Images (UMR7587) (IL), Sorbonne Université (SU)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Paris (UP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Instituto de Ciencia de Materiales de Madrid (ICMM), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Laboratoire de physique et modélisation des milieux condensés (LPM2C), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), ANR-10-LABX-0024,WIFI,Institut Langevin : Ondes et Images, du Fondamental à l'Innovation(2010), PSL Research University (PSL), Ecole Supérieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris-Sciences-et-Lettres (https://www.psl.eu/), Institut Langevin - Ondes et Images, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-ESPCI ParisTech-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Spain] (CSIC), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), and LABEX WIFI (Laboratory of Excellence within the French Program 'Investments for the Future') under references ANR-10-LABX-24 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL*,LABEX WIFI (Laboratory of Excellence within the French Program 'Investments for the Future') under references ANR-10-LABX-24 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL

Jean-Philippe Groby, Amey Khanolkar, Nicholas Boechler, Alan Geslain, Claire Prada, P. Leclaire, Aroune Duclos, Samuel Raetz, M. Abi Ghanem, Morgan Hiraiwa, Samuel P. Wallen, Jérôme Laurent, Département de Recherche en Ingénierie des Véhicules pour l'Environnement [Nevers] (DRIVE), Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire d'Acoustique de l'Université du Mans (LAUM), Le Mans Université (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Mechanical Engineering [University of Washington], University of Washington [Seattle], Institut de Mécanique et d'Ingénierie de Bordeaux (I2M), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of California [San Diego] (UC San Diego), University of California (UC), Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Langevin - Ondes et Images (UMR7587) (IL), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Recherche en Ingéniérie des Véhicules pour l'Environnement (DRIVE), Université de Bourgogne (UB), Abi Ghanem, Maroun, Laboratoire d'acoustique de l'université du Mans ( LAUM ), Le Mans Université ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Department of Mechanical Engineering, University of Washington, Seattle, WA 98195, United States, affiliation inconnue, The Nobel Institute for Neurophysiology, Karolinska Institutet [Stockholm], ESPCI ParisTech, Département de Recherche en Ingéniérie des Véhicules pour l'Environnement ( DRIVE ), Université de Bourgogne ( UB ), LMAc project DECIMAP, LMAc project PAVNat, U.S. National Science Foundation CMMI-1333858, U.S. Army Research Office W911NF-15-1-0030, University of Washington Royalty Research Foundation, National Science Foundation DGE-1256082, ANR-13-BS09-0003,Metaudible,Conception de Metamatériaux absorbants le son dans la gamme audible ( 2013 ), LABEX WIFI (Laboratory of Excellence within the French Program 'Investments for the Future') under references ANR-10-LABX-24 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL*,LABEX WIFI (Laboratory of Excellence within the French Program 'Investments for the Future') under references ANR-10-LABX-24 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Le Mans Université (UM), Sorbonne Université (SU)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Paris (UP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-13-BS09-0003,Metaudible,Conception de Metamatériaux absorbants le son dans la gamme audible(2013), and ANR-10-LABX-0024,WIFI,Institut Langevin : Ondes et Images, du Fondamental à l'Innovation(2010)

Broketa, Matteo, Sokal, Aurélien, Mor, Michael, Canales-Herrerias, Pablo, Perima, Angga, Meola, Annalisa, Fernández, Ignacio, Iannascoli, Bruno, Chenon, Guilhem, Vandenberghe, Alexis, Languille, Laetitia, Michel, Marc, Godeau, Bertrand, Gallien, Sebastien, Melica, Giovanna, Backovic, Marija, Rey, Felix, Baudry, Jean, Freund, Natalia, Mahevas, Matthieu, Bruhns, Pierre, Anticorps en thérapie et pathologie - Antibodies in Therapy and Pathology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Diaccurate SAS, Physiologie, physiopathologie et thérapeutique (ED 394), Sorbonne Université (SU), Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Tel Aviv University (TAU), Virologie Structurale - Structural Virology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Laboratoire Colloïdes et Matériaux Divisés (LCMD), Chimie-Biologie-Innovation (UMR 8231) (CBI), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), M.B. is the recipient of a CIFRE PhD fellowship. P.C-H. was supported by a fellowship from the French Fondation pour la Recherche Médicale (FRM). A.S. was supported by a Poste d’Accueil from INSERM, I.F. by a fellowship from the French Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS). P.B. acknowledges funding from the Agence Nationale de la Recherche (ANR) ANR-18-CE15-0001 project Autoimmuni-B and ANR-14-CE16-0011 project DROPmAbs, from the Institut Carnot Pasteur Microbes et Santé, from the CAPNET (Comité ad-hoc de pilotage national des essais thérapeutiques et autres recherches, French government) MEMO-VOC, from the Institut Pasteur and from the Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM). M.Ma. acknowledges funding from the Agence Nationale de la Recherche and the Fondation pour la Recherche Médicale (ANR, MEMO-COV-2 -FRM). Assistance Publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP, Département de la Recherche Clinique et du Développement) was the promotor and the sponsor of MEMO-COV-2. J.B. acknowledges funding from the French government through BPIFrance under the frame Programme d’Investissements d’Avenir (CELLIGO Project), the Institut Pierre-Gilles de Gennes through the laboratoire d’excellence, Investissements d’avenir programs ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-10- EQPX-34 and ANR-10-LABX-3. N.T.F. acknowledges funding from the Israeli Science Foundation grants #1422/18 and #3711/20 and Marguerite Stolz Research Fellowship. Work in the Unit of Structural Virology was funded by Institut Pasteur, Urgence COVID-19 Fundraising Campaign of Institut Pasteur., ANR-18-CE15-0001,Autoimmuni-B,Etude de la rupture de tolérance dans une maladie humaine autoimmune médiée par les lymphocytes B(2018), ANR-14-CE16-0011,DROP-mAbs,Analyse en profondeur de répertoires d'anticorps par microfluidique en gouttelettes couplé à du séquençage haut-débit pour le diagnostic et la découverte d'anticorps thérapeutiques(2014), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-EQPX-0034,IPGG,Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique(2010), and ANR-10-LABX-0003,BCDiv,Biological and Cultural Diversities : Origins, Evolution, Interactions, Future(2010)

Sergey E. Skipetrov, B. A. van Tiggelen, Arnaud Derode, John H. Page, Laura A. Cobus, Alexandre Aubry, Department of physics and astronomy [Winnipeg], University of Manitoba [Winnipeg], Laboratoire de physique et modélisation des milieux condensés ( LPMMC ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Langevin ondes et images, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -ESPCI ParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), ANR-14-CE26-0032,LOVE,Localization d'Anderson des ondes vectoriels ( 2014 ), LABEX WIFI (Laboratory of Excellence within the French Program 'Investments for the Future') under references ANR-10-LABX-24 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL*,LABEX WIFI (Laboratory of Excellence within the French Program 'Investments for the Future') under references ANR-10-LABX-24 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, Laboratoire de physique et modélisation des milieux condensés (LPM2C), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut Langevin - Ondes et Images (UMR7587) (IL), Sorbonne Université (SU)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Paris (UP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-14-CE26-0032,LOVE,Localization d'Anderson des ondes vectoriels(2014), and ANR-10-LABX-0024,WIFI,Institut Langevin : Ondes et Images, du Fondamental à l'Innovation(2010)

Albert C. Boccara, Mathias Fink, Amaury Badon, Geoffroy Lerosey, Alexandre Aubry, Institut Langevin - Ondes et Images (UMR7587) (IL), Sorbonne Université (SU)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Paris (UP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Ondes et Acoustique (UMR 7587) (LOA), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-10-LABX-0024,WIFI,Institut Langevin : Ondes et Images, du Fondamental à l'Innovation(2010), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), Institut Langevin ondes et images, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-ESPCI ParisTech-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Laboratoire ondes et acoustique (LOA), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-ESPCI ParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Langevin - Ondes et Images, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-ESPCI ParisTech-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LABEX WIFI (Laboratory of Excellence within the French Program 'Investments for the Future') under references ANR-10-LABX-24 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL*,LABEX WIFI (Laboratory of Excellence within the French Program 'Investments for the Future') under references ANR-10-LABX-24 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, and ANR-10-IDEX-0001-02/10-LABX-0024,WIFI,Institut Langevin : Ondes et Images, du Fondamental à l'Innovation(2010)

Kuang-Yu Chen, Jayaprakash Karuppusamy, Mary B. O’Neill, Vaitea Opuu, Mathieu Bahin, Sophie Foulon, Pablo Ibanez, Lluis Quintana-Murci, Tatsuhiko Ozawa, Sylvie van der Werf, Philippe Nghe, Nadia Naffakh, Andrew Griffiths, Catherine Isel, Biologie des ARN et virus influenza - RNA Biology of Influenza Virus (CNRS-UMR3569), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Chimie-Biologie-Innovation (UMR 8231) (CBI), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Evolutive Humaine - Human Evolutionary Genetics, Max Planck Institute for Mathematics in the Sciences (MPI-MiS), Max-Planck-Gesellschaft, Institut de biologie de l'Ecole Normale Supérieure (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Collège de France - Chaire Génomique humaine et évolution, Collège de France (CdF (institution)), University of Toyama, Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses (GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2)), Centre National de Référence des virus des infections respiratoires (dont la grippe) - National Reference Center Virus Influenzae [Paris] (CNR - laboratoire coordonnateur), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité), This work is supported by grants from the Agence Nationale de la Recherche (ANR 18 CE18 0026 01 FLU_REASSORT, ANR-10-LABX-62-IBEID, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-10-LABX-31 Institut Pierre-Gilles de Gennes). We also thank the Hospices de Nuits-Saint-Georges for their financial support., We are grateful to Drs. R. Marquet and P. Dumas (Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg), Dr. G. Simon (ANSES, Ploufragan, France) for insightful discussions. We thank the Genotyping and sequencing core facility at the Institut du Cerveau-ICM (Paris, France) and the Biomics Platform at the Institut Pasteur (Paris, France) for Next Generation Sequencing and S. Behillil and V. Enouf (National Reference Center for Respiratory Viruses, Institut Pasteur, Paris, France) for providing the virus samples used in this study., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-LABX-0031,IPGG_LABEX,Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics(2010), and ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010)

Legoux, François, Lantz, Olivier, Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Immunité et cancer (U932), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie [Paris], ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, Agence Nationale de la Recherche, ERC-2019-AdG-885435, European Research Council, ANR-16-CE15-0020,MAIT,Biologie des cellules MAIT in vivo en situation normale ou pathologique(2016), and ANR-20-CE15-0028,MAIT-repair,Mécanisme de la fonction de réparation tissulaire des lymphocytes MAIT(2020)

Elodie Couttenier, Sophie Bachellier-Bassi, Christophe d'Enfert, Catherine Villard, Laboratoire Physico-Chimie Curie [Institut Curie] (PCC), Institut Curie [Paris]-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity (BPF), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), This work was supported by the European Research Council Advanced Grant 321107 'CellO', the Institut Pierre-Gilles de Gennes ('Investissements d'avenir' program ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-10-LABX-31, and ANR-10-EQPX-34), the ANR-10-LABX-62-IBEID and the program 'Adaptation du vivant' of the CNRS-MITI., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-LABX-0031,IPGG_LABEX,Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics(2010), ANR-10-EQPX-0034,IPGG,Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique(2010), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), and European Project: 321107,EC:FP7:ERC,ERC-2012-ADG_20120216,CELLO(2013)

Maureen de Seyssel, Marvin Lavechin, Yossi Adi, Emmanuel Dupoux, Guillaume Wisniewski, Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Facebook AI Research [Paris] (FAIR), Facebook, École des hautes études en sciences sociales (EHESS), Laboratoire de Linguistique Formelle (LLF - UMR7110), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), S’s work was partly funded by l’Agence de l’Innovation de D´efense and performed using HPC resources from GENCI-IDRIS (Grant 20XX-AD011012315). ED in his EHESS role was supported in part by the Agence Nationale pour la Recherche (ANR-17-EURE-0017 Frontcog, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL*, ANR-19-P3IA-0001 PRAIRIE 3IA Institute) and a grant from CIFAR (Learning in Machines and Brains)., ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), and ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019)

Jérôme Sackur, Carolina Manosalva, Jaime R. Silva, Franco Medina, Anastassia Vivanco-Carlevari, Gabriel Reyes, Vincent de Gardelle, Facultad de Psicología, Universidad del Desarrollo (UDD) [Chile], Faculty of Sciences, Universidad Austral de Chile (UACh) [Chile], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Paris School of Economics (PSE), École des Ponts ParisTech (ENPC)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre d'économie de la Sorbonne (CES), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL), Département d'Humanités et Sciences Sociales de l'École polytechnique (X-DEP-HSS), École polytechnique (X), Clinica Alemana de Santiago, Instituto Milenio para la Investigación en Depresión y Personalidad [Chile] (MIDAP), This research was supported by FONDECYT MetaDynamic [N° 11170775, GR], FONDECYT MetaStress [N° 1171836, JRS and GR], FONDECYT Meta3C [N° 1191708, JRS and GR], MetaStress [ANR-16-ASTR-0014, JS and VdG, ANR-10-LABX-0087 IEC and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, JS], and by the FIC, Millennium Scientific Initiative [N° IS130005, JRS]., ANR-16-ASTR-0014,MetaStress,Impact du stress sur la décision et la métacognition: applications en aéronautique(2016), and ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010)

Andrew D. Griffiths, Alexei Godina, Guillaume Mottet, Gaël A. Millot, Bingqing Shen, Samantha N. Stewart, Vera Menrath, Sosthene Essono, Baptiste Saudemont, Clément Nizak, Annabelle Gérard, Antoine Sautel-Caillé, Scott McNamara, Matthieu Delince, Sami Ellouze, Jean Baudry, Marcel Reichen, Pablo Canales-Herrerias, Charina Ortega, Patrick England, Carlos Castrillon, Odile Richard-Le Goff, Colin Brenan, Klaus Eyer, Pascaline Mary, Luis Briseño-Roa, Allan Jensen, Pierre Bruhns, Raphael Clement Li-Ming Doineau, Adam Woolfe, Roshan Kumar, Bin Jia, Bruno Iannascoli, Yannick Pousse, Kevin Grosselin, Gregory Rose, Adeline Poitou, HiFiBiO Therapeutics SAS [Paris], Anticorps en thérapie et pathologie - Antibodies in Therapy and Pathology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecole Doctorale Frontières du Vivant - Programme Bettencourt (FdV), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-PRES Sorbonne Paris Cité, Chimie-Biologie-Innovation (UMR 8231) (CBI), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Colloïdes et Matériaux Divisés (LCMD), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), HiFiBiO Therapeutics Inc. [Cambridge], Abbvie Bioresearch Center [Worcester], Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biophysique Moléculaire (Plate-forme), Biophysique des macromolécules et leurs interactions, This work was supported by the French Agence Nationale de la Recherche (ANR-14-CE16-0011 project DROPmAbs), by the Centre d’Innovation et Recherche Technologique (Citech) through the Institut Carnot Pasteur Microbes & Santé (ANR 16 CARN 0023-01), by BPI France (OSIRIS and CELLIGO projects) and by the French ‘Investissements d’Avenir’ program via the CELLIGO project and grant agreements ANR-10-NANO-02, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-10-LABX-31 and ANR-10-EQPX-34. NGS was performed by the ICGex NGS platform of the Institut Curie and the Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) platform (Gif-sur-Yvette) supported by the grants ANR-10-EQPX-03 and ANR-10-INBS-09-08 (France Génomique Consortium), by the Canceropole Ile-de-France and by the SiRIC-Curie program (SiRIC Grant INCa-DGOS- 4654). C.C. acknowledges financial support from CONCYTEC, Peru. P.C.H. is a scholar in the Pasteur - Paris University (PPU) International PhD program and was also supported by the Fondation pour la Recherche Médicale (FRM, FDT201904008240). K.E. acknowledges financial support from the Swiss National Science Foundation and The Branco Weiss Fellowship - Society in Science., We would like to thank M. Holsti and W. Somers (Pfizer, BioMedicine Design) for advice on the technology development and critical reading of the manuscript, R. Nicol (Whitehead Institute, MIT Center for Genome Research) for advice on barcoded sequencing, at the Institut Pasteur, H. Mouquet for advice on antibody sequence selection, and F. Jönsson for advice on flow cytometry analysis, T. Kirk and S. Foulon (ESPCI Paris) for their help developing the barcoded hydrogel beads, S. N. Stewart (HiFiBio Therapeutics Inc.) for her help producing and analysing recombinant antibodies, the Institut Pierre-Gilles de Gennes (IPGG) for use of clean room facilities and the laser engraver (CII08, Axyslaser)., ANR-14-CE16-0011,DROP-mAbs,Analyse en profondeur de répertoires d'anticorps par microfluidique en gouttelettes couplé à du séquençage haut-débit pour le diagnostic et la découverte d'anticorps thérapeutiques(2014), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-EQPX-0034,IPGG,Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique(2010), ANR-10-EQPX-0003,ICGex,Equipement de biologie intégrative du cancer pour une médecine personnalisée(2010), ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bruhns, Pierre, Appel à projets générique - Analyse en profondeur de répertoires d'anticorps par microfluidique en gouttelettes couplé à du séquençage haut-débit pour le diagnostic et la découverte d'anticorps thérapeutiques - - DROP-mAbs2014 - ANR-14-CE16-0011 - Appel à projets générique - VALID, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Equipements d'excellence - Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique - - IPGG2010 - ANR-10-EQPX-0034 - EQPX - VALID, Equipements d'excellence - Equipement de biologie intégrative du cancer pour une médecine personnalisée - - ICGex2010 - ANR-10-EQPX-0003 - EQPX - VALID, and Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique - - France-Génomique2010 - ANR-10-INBS-0009 - INBS - VALID

Mark Hasegawa-Johnson, Lucas Ondel, Elin Larsen, Shruti Palaskar, Liming Wang, Sebastian Stüker, Francesco Ciannella, Markus Müller, Odette Scharenborg, Rachid Riad, Florian Metze, Pierre Godard, Laurent Besacier, Mingxing Du, Alan W. Black, Danny Merkx, Emmanuel Dupoux, Philip Arthur, Graham Neubig, Delft University of Technology (TU Delft), Groupe d’Étude en Traduction Automatique/Traitement Automatisé des Langues et de la Parole (GETALP), Laboratoire d'Informatique de Grenoble (LIG), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA), Carnegie Mellon University [Pittsburgh] (CMU), Department. of Computer Science [Illinois], University of Illinois System, Institute for Anthropomatics (KIT), Karlsruhe Institute of Technology (KIT), Traitement du Langage Parlé (TLP), Laboratoire d'Informatique pour la Mécanique et les Sciences de l'Ingénieur (LIMSI), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Brno University of Technology [Brno] (BUT), Johns Hopkins University (JHU), Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Radboud University [Nijmegen], Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), The work reported here was started at JSALT 2017 in CMU,Pittsburgh, and was supported by JHU and CMU via grants from Google, Microsoft, Amazon, Facebook, and Apple. This work used the Extreme Science and Engineering Discovery Environment (XSEDE), which is supported by NSF grant number OCI-1053575. Specifically, it used the Bridges system, which is supported by NSF award number ACI-1445606, at the Pittsburgh Supercomputing Center (PSC). OS was partially supported by a Vidi-grant from NWO (276-89-003) and partially by a Delft Technology Fellowship from Delft University of Technology. PG, MM and SS were funded by the French ANR and the German DFG under grant ANR-14-CE35-0002 (BULB project). MD, EL, RR and ED were funded by the European Research Council (ERC-2011-AdG-295810 BOOTPHON), and ANR-10-LABX-0087 IEC and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL., ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-19-P3IA-0003,MIAI,MIAI @ Grenoble Alpes(2019), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Radboud university [Nijmegen], Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris-Saclay-Sorbonne Université - UFR d'Ingénierie (UFR 919), Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE), Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Saclay (COmUE)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris-Saclay-Sorbonne Université - UFR d'Ingénierie (UFR 919), Brno University of Technology, and École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Charlotte Gallezot, Rachid Riad, Hadrien Titeux, Laurie Lemoine, Justine Montillot, Agnes Sliwinski, Jennifer Hamet Bagnou, Xuan Nga Cao, Katia Youssov, Emmanuel Dupoux, Anne-Catherine Bachoud Levi, Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Meta AI Research [Paris], Meta AI, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Henri Mondor [Créteil], Institut de neurosciences translationnelles de Paris (NeurATRIS - IHU-A-ICM), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition et cerveau (U1213, U855), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), École des hautes études en sciences sociales (EHESS), Groupe Henri Mondor-Albert Chenevier, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Hôpital Albert Chenevier, IMRB - 'NeuroPsychologie Interventionnelle' [Créteil] (U955 Inserm - UPEC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université Paris sciences et lettres (PSL), This work is funded in part by the Agence Nationale pour la Recherche (ANR-17-EURE-0017 Frontcog, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL∗, ANR-19-P3IA-0001 PRAIRIE 3IA Institute) and Grants from Neuratris (ANR-11-INBS-0011), from Facebook AI Research (Research Gift), Google (Faculty Research Award), Microsoft Research (Azure Credits and Grant), and Amazon Web Service (AWS Research Credits)., ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), and ANR-11-INBS-0011,NeurATRIS,Infrastructure de Recherche Translationnelle pour les Biothérapies en Neurosciences(2011)

Morel, Charlotte, Lacaille, Julien, Rialland, Nicolas, Pays germaniques , histoire - culture - philosophie (UMR8547) (PG,HCP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut de Recherches Philosophiques (IRePh), Université Paris Nanterre (UPN), Équipe de Recherche Interdisciplinaire sur les Aires Culturelles (ERIAC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut de Recherche Interdisciplinaire Homme et Société (IRIHS), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Translitteræ (Ecole universitaire de recherche, program 'Investissements d’avenir' ANR‐10‐IDEX‐0001‐02 PSL* and ANR‐17‐EURE‐0025), and Pierre-François Moreau

Morel, Charlotte, Nouailles, Bertrand, Pays germaniques , histoire - culture - philosophie (UMR8547) (PG,HCP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Laboratoire Philosophies et Rationalités (PHIER), Université Clermont Auvergne (UCA), Translitteræ (Ecole universitaire de recherche, program 'Investissements d’avenir' ANR‐10‐IDEX‐0001‐02 PSL* and ANR‐17‐EURE‐0025), and Pierre-François Moreau

Morel, Charlotte, Emmanuel, Hourcade, Pays germaniques , histoire - culture - philosophie (UMR8547) (PG,HCP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut d’Histoire des Représentations et des Idées dans les Modernités (IHRIM), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Translitteræ (Ecole universitaire de recherche, program 'Investissements d’avenir' ANR‐10‐IDEX‐0001‐02 PSL* and ANR‐17‐EURE‐0025), and Pierre-François Moreau

Matthieu Muffato, Alexandra Louis, Nga Thi Thuy Nguyen, Joseph Lucas, Camille Berthelot, Hugues Roest Crollius, Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge], Génomique fonctionnelle comparative - Comparative functional genomics, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), DYnamique et Organisation des GENomes - Equipe de l'IBENS (DYOGEN), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Biologie - ENS Paris, This work was supported by grants from the French Government and implemented by the AgenceNationale de la Recherche (ANR) (ANR-07-GANI-008-01 GENOVERT, ANR-10-BINF-01-03 ANCESTROME, ANR-10-LABX-54 MEMOLIFE and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL* Research University) to H.R.C., ANR-07-GANI-0008,GENOVERT,Reconstruction de génomes ancestraux et identification de séquences régulatrices chez les vertébrés(2007), ANR-10-BINF-0001,ANCESTROME,Approche de phylogénie intégrative pour la reconstruction de génomes ancestraux(2010), ANR-10-LABX-0054,MEMOLIFE,Memory in living systems: an integrated approach(2010), and ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010)

Virginia Andrade, Jian Bai, Neetu Gupta-Rossi, Ana Joaquina Jimenez, Cédric Delevoye, Christophe Lamaze, Arnaud Echard, Trafic membranaire et Division cellulaire - Membrane Traffic and Cell Division, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Sorbonne Université (SU), Dynamique de l’organisation intra-cellulaire, Biologie Cellulaire et Cancer, Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BioImaging Cell and Tissue Core Facility (PICT-IBiSA), Institut Curie [Paris], Structure et compartimentation membranaire, Compartimentation et dynamique cellulaires (CDC), Chimie biologique des membranes et ciblage thérapeutique (CBMCT - UMR 3666 / U1143), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported by Institut Pasteur (A.E.), CNRS (A.E.), ANR Cytosign, ANR SeptScort (A.E.), ANR MOTICAV (C.L.), ANR CAV-SM (C.L.), Fondation pour le Recherche Médicale: Recherche soutenue par la FRM EQU202103012627 (A.E.), French National Research Agency through the 'Investments for the Future' program, France-BioImaging, ANR-10-INSB-04 (C.D.), Cell and Tissue Imaging core facility (PICT-IBiSA), member of the France-BioImaging national research infrastructure, supported by the Labex Cell(n)Scale (ANR-10-LBX-0038) part of the IDEX PSL (ANR-10-IDEX-0001-02 PSL) (C.D. and C.L.), Doctoral School Complexité du Vivant ED515, contrat n° 2828/2017 (V.A.), La Ligue Contre le Cancer (4ème année de thèse) (V.A.), Pasteur-Paris University (PPU) international PhD program (J.B.), Fondation ARC pour la recherche sur le cancer (DOC20180507410) (J.B.), Programme Labellisé PGA1-RF20170205456 (C.L.), and CEFIPRA, project 6301-1., ANR-16-CE13-0004,CYTOSIGN,Polarité épithéliale et signalisation au cours de la cytodiérèse des cellules animales(2016), ANR-20-CE11-0014,SeptScort,Interaction spatiale et fonctionnelle entre septines et Escrt pendant la cytocinèse: une approche multi-échelle(2020), ANR-17-CE13-0020,MOTICAV,Cavéoles et Tension Membranaire dans la Migration Cellulaire(2017), ANR-20-CE13-0002,CAV-SM,Un rôle nouveau de la cavéoline dans le transport de la sphingomyéline à la membrane plasmique(2020), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), Collège Doctoral, Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Agence Nationale de la Recherche: CytosignAgence Nationale de la Recherche: SeptScortAgence Nationale de la Recherche: ANR-10-INSB-04Agence Nationale de la Recherche: ANR-10-LBX-0038Agence Nationale de la Recherche: ANR-10-IDEX-0001-02 PSLInstitut PasteurFondation ARC pour la Recherche sur le Cancer: DOC20180507410La Ligue Contre Le CancerDoctoral School Complexité du Vivant ED515: 2828/2017CNRSPasteur-Paris University (PPU) international PhD program

Pablo Canales-Herrerias, Etienne Crickx, Matteo Broketa, Aurélien Sokal, Guilhem Chenon, Imane Azzaoui, Alexis Vandenberghe, Angga Perima, Bruno Iannascoli, Odile Richard-Le Goff, Carlos Castrillon, Guillaume Mottet, Delphine Sterlin, Ailsa Robbins, Marc Michel, Patrick England, Gael A. Millot, Klaus Eyer, Jean Baudry, Matthieu Mahevas, Pierre Bruhns, RICHARD-LE GOFF, ODILE, APPEL À PROJETS GÉNÉRIQUE 2018 - Etude de la rupture de tolérance dans une maladie humaine autoimmune médiée par les lymphocytes B - - Autoimmuni-B2018 - ANR-18-CE15-0001 - AAPG2018 - VALID, Appel à projets générique - Analyse en profondeur de répertoires d'anticorps par microfluidique en gouttelettes couplé à du séquençage haut-débit pour le diagnostic et la découverte d'anticorps thérapeutiques - - DROP-mAbs2014 - ANR-14-CE16-0011 - Appel à projets générique - VALID, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Equipements d'excellence - Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique - - IPGG2010 - ANR-10-EQPX-0034 - EQPX - VALID, Laboratoire Colloïdes et Matériaux Divisés (LCMD), Chimie-Biologie-Innovation (UMR 8231) (CBI), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anticorps en thérapie et pathologie - Antibodies in Therapy and Pathology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Ecole Doctorale Frontières du Vivant - Programme Bettencourt (FdV), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-PRES Sorbonne Paris Cité, Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre de référence maladie rare des cytopénies auto-immunes de l'adulte (GECAI - Hôpital Henri-Mondor - UPEC), Diaccurate SAS, Physiologie, physiopathologie et thérapeutique (ED 394), Sorbonne Université (SU), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Robert Debré, Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Henri Mondor, Biophysique Moléculaire (plateforme) - Molecular Biophysics (platform), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité), Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich), P.C-H. was supported partly by a stipend from the Pasteur - Paris University (PPU) InternationalPhD program, and by a fellowship from the French Fondation pour la Recherche Médicale (FRM). M.B.is the recipient of a CIFRE PhD fellowship. C.C. was supported by CONCYTEC, Peru. P.B. acknowledgesfunding from the French National Research Agency grants ANR-18-CE15-0001 project Autoimmuni-Band ANR-14-CE16-0011 project DROPmAbs, funding by the Institut Carnot Pasteur Microbes et Santé,the Institut Pasteur and the Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM). E.K.acknowledges funding from the Branco Weiss Fellowship (Society in Science) and the European ResearchCouncil (ERC) (grant agreement #80336). J.B. acknowledges funding from the French government throughBPIFrance under the frame 'Programme d’Investissements d’Avenir' (CELLIGO Project), the 'InstitutPierre-Gilles de Gennes' through the laboratoire d’excellence, 'Investissements d’avenir' programs ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-10- EQPX-34 and ANR-10-LABX-3, The authors acknowledge Ms Laetitia Languille for the coordination of patient recruitment at Hôpital Henri Mondor, Créteil, France, Dr Maxime Moulard (BioCytex, Marseille, France) and Dr Habib Boukerche (Faculté de Médecine René Laënnec, Lyon, France) for their kind gifts of anti-αIIbβ3 (GPIIbIIIa) mAb clones., ANR-18-CE15-0001,Autoimmuni-B,Etude de la rupture de tolérance dans une maladie humaine autoimmune médiée par les lymphocytes B(2018), ANR-14-CE16-0011,DROP-mAbs,Analyse en profondeur de répertoires d'anticorps par microfluidique en gouttelettes couplé à du séquençage haut-débit pour le diagnostic et la découverte d'anticorps thérapeutiques(2014), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-EQPX-0034,IPGG,Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique(2010), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Cité (UPCité), and CHU Henri Mondor [Créteil]

Emmanuel Dupoux, Reiko Mazuka, Alejandrina Cristia, Bogdan Ludusan, RIKEN Center for Brain Science [Wako] (RIKEN CBS), RIKEN - Institute of Physical and Chemical Research [Japon] (RIKEN), Department of Psychology and Neuroscience, Duke University [Durham], Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), École des hautes études en sciences sociales (EHESS), The research reported in this paper was partly funded by JSPS Grant-in-Aid for Scientific Research (16H06319, 20H05617) and MEXT Grant-in-aid on Innovative Areas #4903 (Co-creative Language Evolution), 17H06382 to RM. It was also supported by the European Research Council (ERC-2011-AdG-295810 BOOTPHON), the Agence Nationale pour la Recherche (ANR-17-CE28-0007 LangAge, ANR-16-DATA-0004 ACLEW, ANR-14-CE30-0003 MechELex, ANR-17-EURE-0017 Frontcog, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL*, ANR-19-P3IA-0001 PRAIRIE 3IA Institute). ED is further grateful to the CIFAR (Learning in Machines and Brain), BL to the Canon Foundation in Europe, and AC to the JS McDonnell Foundation., ANR-17-CE28-0007,LangAge,Différences dans l'apprenabilité du langage selon l'âge(2017), ANR-16-DATA-0004,ACLEW,Analyzing Child Language Experiences Around the World(2016), ANR-14-CE30-0003,MechELex,Méchanismes d'acquisition lexicale précoce(2014), ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), European Project: 295810,EC:FP7:ERC,ERC-2011-ADG_20110406,BOOTPHON(2012), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)

Ewan Dunbar, Nicolas Hamilakis, Emmanuel Dupoux, University of Toronto, Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Université Paris sciences et lettres (PSL), École des hautes études en sciences sociales (EHESS), Meta AI, For E. Dunbar, this research was supported by the Connaught Fund and the Arts and Science Bridging Fund, U. of Toronto, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC) RGPIN-2022-04431, and by ANR grant ANR-17-CE28-0009 GEOMPHON. For E. Dupoux in his EHESS role and N. Hamilakis, it was supported by ANR grants ANR-17-EURE-0017 Frontcog, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL and ANR-19-P3IA-0001 PRAIRIE 3IA Institute, and by a Meta AI Research Gift., ANR-17-CE28-0009,GEOMPHON,Perception et apprentissage de la parole dans la typologie géometrique des inventaires phonologiques(2017), ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), and ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019)

Lesage, Sarah, Chazal, Maxime, Beauclair, Guillaume, Batalie, Damien, Cerboni, Silvia, Couderc, Elodie, Lescure, Aurianne, Del Nery, Elaine, Tangy, Frédéric, Martin, Annette, Manel, Nicolas, Jouvenet, Nolwenn, Signalisation antivirale - Virus sensing and signaling, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses (GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2)), Immunité et cancer (U932), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), BioImaging Cell and Tissue Core Facility (PICT-IBiSA), Institut Curie [Paris], Génomique virale et vaccination, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was funded by the CNRS, INSERM, Institut Pasteur, Institut Curie, ‘Urgence COVID-19’ fundraising campaign of Institut Pasteur, LABEX VRI (ANR-10-LABX-77), LABEX DCBIOL (ANR-10-IDEX-0001-02 PSL* and ANR-11LABX-0043), the Région Ile-de-France (DIM1HEALTH 2019), EMBO Young Investigator programm bringing fund and the Agence Nationale de la Recherche sur le sida et les hépatites virales (ANRS-CSS12-2019-2). The BioPhenics laboratory is supported by Institut Curie, IBiSA (PICT-IBiSA) and part of ChemBioFRance and France-BioImaging infrastructure supported by the French National Research Agency (ANR-10-INSB-04, «Investments for the future»). SL was the recipient of a Université de Paris PhD fellowship. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript., We thank Dr. M.A. Saleem (University of Bristol, UK) for generously providing the podocytes (via E. Pays, Université Libre de Bruxelles, Belgium), C.M. Rice (Rockefeller University, New York, USA) for Huh-7.5 cells, Cinzia Traboni (IRBM, Pomezia, Italy) for Huh-7 cells, M. Bessaud (Institut Pasteur) for the CVB3 Nancy strain, N. Escriou (Institut Pasteur) for the VSV Indiana strain and anti-VSV-G antibodies, V. M. Cao-Lormeau and D. Musso (Institut Louis Malardé, Tahiti Island, French Polynesia) for the ZIKV-PF13 strain, L. Hermida and G. Enrique Guillen Nieto from the Centro de Ingeniería Genética y Biotecnología (CIGB), Cuba, for the DENV-2 strain Malaysia SB8553, T. Wakita (NIID, Tokyo, Japan) for pJFH1 HCV cDNA, R. Bartenschlager (University of Heidelberg, Germany) for pJFH1-2EI3-adapt cDNA, the French National Reference Centre for Respiratory Viruses hosted by Institut Pasteur (France) and headed by S. van der Werf for providing the historical SARS-CoV-2 viral strains, A. Merits (University of Tartu, Estonia) for anti-ZIKV NS5 antibodies, P. Desprès (Université de la Réunion, PIMIT) for 4G2 hybridoma cells, H. Mouquet (Institut Pasteur) for anti-SARS-CoV-2 S antibodies, M. Evans (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, USA) for the plasmid encoding the full-length Zika MR766 genome, F. Porrot and O. Schwartz (Institut Pasteur) for sharing MVA-GFP, C. Combredet (Institut Pasteur) for producing MeV-GFP, P. Benaroch (Institut Curie, France) for advice concerning the siRNA screening work, as well as E. Pays and S. Uzureau (Université Libre de Bruxelles, Belgium) for APOL1 and APOL3 plasmids and for stimulating APOL-focused discussions. We are grateful to the members of our laboratories for helpful discussions and technical advice. Finally, we thank Emeline Perthame (Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur) for her help in statistical analysis., ANR-11-LABX-0043,DCBIOL,Biologie des cellules dendritiques(2011), ANR-10-LABX-0077,VRI,Initiative for the creation of a Vaccine Research Institute(2010), jouvenet, nolwenn, Biologie des cellules dendritiques - - DCBIOL2011 - ANR-11-LABX-0043 - LABX - VALID, Laboratoires d'excellence - Initiative for the creation of a Vaccine Research Institute - - VRI2010 - ANR-10-LABX-0077 - LABX - VALID, Institut Pasteur [Paris], CNRS UMR3569, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Hugues Roest Crollius, Dustin J. Wcisel, Matthew P. Harris, Brett Racicot, Elise Parey, Jérôme Montfort, Solomon R. David, Quenton C. Fontenot, Kazuhiko Kawasaki, Allyse M. Ferrara, Yann Guiguen, Tatsuya Ota, Mauricio Losilla, Ingo Braasch, M. Brent Hawkins, Olivia E Fitch, Romain Feron, Andrew W. Thompson, Marine Milhes, Amy R. McCune, Qiaowei Pan, Emily Funk, Jeffrey A. Yoder, Camille Berthelot, Alex Dornburg, Alexandra Louis, Kevin L. Childs, Michigan State University [East Lansing], Michigan State University System, Harvard Medical School [Boston] (HMS), Boston Children's Hospital, Harvard University [Cambridge], Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), North Carolina State University [Raleigh] (NC State), University of North Carolina System (UNC), Graduate University for Advanced Studies [Hayama] (SOKENDAI), Pennsylvania State University (Penn State), Penn State System, Cornell University [New York], University of California [Davis] (UC Davis), University of California, University of Lausanne (UNIL), Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (SIB), Université de Lausanne (UNIL), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique ( GeT-PlaGe), Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Nicholls State University, University of North Carolina [Charlotte] (UNC), We are thankful for grant support from NIH R01OD011116 (I.B.), NSF DDIG DEB-1600920 (M.B.H.), NSF IOS-1755242 (A.D.) and NSF IOS-1755330 (J.A.Y.). Parts of this work have been supported by the Agence Nationale de la Recherche, France (ANR GenoFish project, 2016-2021, ANR-16-CE12-0035) to H.R.C., C.B., E.P., A.L. and Y.G. E.P., C.B. and H.R.C. received support under the program ‘Investissements d’Avenir’ launched by the French government and implemented by ANR with references ANR–10–LABX–54 MEMOLIFE and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL* Université Paris. We thank F. Feng for access to Oneida Lake bowfin spawning habitats, the Bauer Core at Harvard University for sequencing fin transcriptomes and M. Gundappa (FISH & LINES) for species illustrations. Species silhouettes were obtained from http://PhyloPic.org. We are exceedingly grateful to the late J.L. Gómez-Skarmeta for his guidance on establishing ATAC-seq in holosteans., ANR-16-CE12-0035,GenoFish,Evolution des génes et des génomes après duplication compléte(2016), ANR-10-LABX-0054,MEMOLIFE,Memory in living systems: an integrated approach(2010), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)

Gayle C. Ferguson, Paul B. Rainey, David W. Rogers, Silvia De Monte, Ellen McConnell, Philippe Remigi, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Massey University [New Zealand], Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max-Planck-Gesellschaft, Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Marsden Fund Council, James Cook Research Fellowship from government funding, program 'Investissements d'Avenir' : ANR-10-LABX-54 MEMOLIFE, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, Remigi, Philippe, Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Biologie - ENS Paris, and Rainey, Paul

Camille Michèle Williams, Hugo Peyre, Roberto Toro, Franck Ramus, Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service psychiatrique de l'enfant et de l'adolescent [CHU Hôpital Robert Debré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Maladies neurodéveloppementales et neurovasculaires (NeuroDiderot (UMR_S_1141 / U1141)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Neuroanatomie Appliquée et Théorique / Applied and Theoretical Neuroanatomy (NAAT), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité), This work received support under the program 'Investissements d'Avenir' launched by the French Government and implemented by l'Agence Nationale de la recherche (ANR) with the references ANR-17-EURE-0017 and ANR-10-IDEX-0001–02 PSL. Funding was also obtained from Fondation pour l'Audition (FPA RD-2016–8 research grant). This research has been conducted using the UK Biobank Resource., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), and ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017)

Marie Flamme, Chiara Figazzolo, Marcel Hollenstein, Gilles Gasser, Chimie bioorganique des acides nucléiques - Bioorganic chemistry of nucleic acids, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Cité (UPCité), Institute of Chemistry for Life and Health Sciences (iCLeHS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches Interdisciplinaires [Paris] (CRI), M.F. gratefully acknowledges a fellowship from the doctoral school MTCI University of Paris Descartes. C.F. gratefully acknowledges the Pasteur–Paris University (PPU) International Ph.D. Program that has received funding from INCEPTION project (PIA/ANR-16-CONV-0005), the 'Ecole Doctorale Frontières de l'Innovation en Recherche et Education—Programme Bettencourt' for financial support, and the doctoral school Université de Paris. The authors gratefully acknowledge financial support from Institut Pasteur. This work was financially supported by an ERC Consolidator Grant PhotoMedMet to G.G. (GA 681679) and has received support under the program Investissements d'Avenir launched by the French Government and implemented by the ANR with the reference ANR-10-IDEX-0001-02 PSL (G.G.)., ANR-16-CONV-0005,INCEPTION,Institut Convergences pour l'étude de l'Emergence des Pathologies au Travers des Individus et des populatiONs(2016), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), European Project: 681679, H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC),681679,PhotoMedMet(2017), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Paris (UP)

Bonsergent, Emeline, Grisard, Eleonora, Buchrieser, Julian, Schwartz, Olivier, Théry, Clotilde, Lavieu, Grégory, Immunité et cancer (U932), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Matière et Systèmes Complexes (MSC (UMR_7057)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPC), Virus et Immunité - Virus and immunity, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), E.B. is a recipient of a PhD fellowship from La ligue contre le Cancer. E.G. is a recipient of a post-doctoral fellowship from Fondation pour la Recherche Médicale (FRM (FRM: SPF20170938694). This work is supported by Fondation ARC (PJA20171206453 and PGA1 RF20180206962), Cancéropôle Île‐de‐France (Emergence 2018) and French National Research Agency (ANR‐10‐IDEX‐0001‐02 PSL*, ANR‐11‐LABX‐0043, and ANR‐18‐CE15‐0008, ANR-19-CE18-002003), and ANR-18-IDEX-0001, IdEx Université de Paris. OS lab is funded by Institut Pasteur, ANRS, Sidaction, the Vaccine Research Institute (ANR-10-LABX-77), Labex IBEID (ANR-10-LABX-62-IBEID), 'TIMTAMDEN' ANR-14-CE14-0029, 'CHIKV-Viro-Immuno' ANR-14-CE14-0015-01, ANR/FRM Covid support, and the Gilead HIV cure program., We thank Mathieu Maurin for his input on image quantification. We thank Nicolas Manel for his suggestion concerning the IFITMs. We thank Alena Ivanova and Michael Boutros for introducing us to NanoLuc Luciferase. We thank Marine Gros for her help with Galectin3-related experiments., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-11-LABX-0043,DCBIOL,Biologie des cellules dendritiques(2011), ANR-18-CE15-0008,EVUp,Mécanismes moléculaires et cellulaires du transfert d'antigènes aux cellules dendritiques par les vésicules extracellulaires(2018), ANR-19-CE18-0020,EXCELLDISC,Vésicules Extracellulaires et thérapie du disque intervertébral(2019), ANR-18-IDEX-0001,Université de Paris,Université de Paris(2018), ANR-10-LABX-0077,VRI,Initiative for the creation of a Vaccine Research Institute(2010), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-14-CE14-0029,TIMTAMDEN,Rôle des récepteurs TIM et TAM dans l'infection des cellules cibles par le virus de la dengue(2014), ANR-14-CE14-0015,CHIKV-Viro-Immuno,Multiplication et Relation avec l'hôte du virus Chikungunya(2014), Matière et Systèmes Complexes (MSC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Virus et Immunité - Virus and immunity (CNRS-UMR3569), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Romain Koszul, Angela Taddei, Luciana Lazar-Stefanita, Antoine Hocher, Myriam Ruault, Vittore F. Scolari, Isabelle Loïodice, Dynamique du noyau [Institut Curie], Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Régulation spatiale des Génomes - Spatial Regulation of Genomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Collège doctoral [Sorbonne universités], Sorbonne Université (SU), Laboratoire Cogitamus, A.T. team was financially supported by funding from the Labex DEEP (ANR-11-LABEX-0044 DEEP and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL), from the ANR DNA-Life (ANR-15-CE12-0007), Fondation pour la Recherche Médicale (DEP20151234398), and CNRS grant 80prime PhONeS.The authors greatly acknowledge the PICT-IBiSA@Pasteur Imaging Facility of the Institut Curie, member of the France Bioimaging National Infrastructure (ANR-10-INBS-04).V.F.S. is the recipient of a Roux-Cantarini Pasteur fellowship. L.L.S. was supported in part by a fellowship from the Fondation pour la Recherche Médicale. This research was supported by funding to R.K. from the European Research Council under the Horizon 2020 Program (ERC grant agreement 771813)., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-15-CE12-0007,DNA-Life,Impact de l'achitecture nucléaire sur la longévité(2015), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), European Project: 771813,SynarchiC, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Collège Doctoral, European Project: 771813,ERC-2017-COG,SynarchiC(2018), HAL-SU, Gestionnaire, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Impact de l'achitecture nucléaire sur la longévité - - DNA-Life2015 - ANR-15-CE12-0007 - AAPG2015 - VALID, Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée - - France-BioImaging2010 - ANR-10-INBS-0004 - INBS - VALID, Investigating the functional architecture of microbial genomes with synthetic approaches - SynarchiC - - ERC-2017-COG2018-04-01 - 2023-09-30 - 771813 - VALID, Laboratoire Physico-Chimie Curie [Institut Curie] (PCC), and Institut Curie [Paris]-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Nicolas Baumard, Elise Huillery, Alexandre Hyafil, Lou Safra, Institut Jean-Nicod (IJN), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Laboratoire d'Economie de Dauphine (LEDa), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recerca Matemàtica (CRM), Universitat Autònoma de Barcelona (UAB), Centre de recherches politiques de Sciences Po (Sciences Po, CNRS) (CEVIPOF), Sciences Po (Sciences Po)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This study was supported by the Institut d’Études Cognitives (ANR-17-EURE-0017 FrontCog and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL) for Nicolas Baumard and Lou Safra, by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness (RYC-2017-2323) for Alexandre Hyafil., The Cultural Evolution of Love in Literary History, ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), and Administrateur, Paris Dauphine-PSL

Martin Rieu, Bertrand Ducos, Vincent Croquette, Thibault Vieille, Nadia Ruiz-Gutierrez, Jean-François Allemand, Gaël Radou, Raphaël Jeanneret, Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ABCD : Biophysique des Biomolécules, Laboratoire de physique de l'ENS - ENS Paris (LPENS), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Département de Physique de l'ENS-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Département de Physique de l'ENS-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL), This study was supported by the ANR CLEANMD grant (ANR-14-CE10-0014) and ANR G4-CRASH (ANR-19-CE11-0021-01) from the French Agence Nationale de la Recherche to V.C., by the European Research Council grant Magreps [267 862] to V.C. Work in the group of V.C. is part of 'Institut Pierre-Gilles de Gennes' ('Investissements d’Avenir' program ANR-10-IDEX-0001-02 PSL and ANR-10-LABX-31) and the Qlife Institute of Convergence (Université PSL), ANR-14-CE10-0014,CLEANMD,Mécanismes moléculaires et impact de la voie de dégradation des ARNm nonsense (NMD) sur le transcriptome eucaryote.(2014), ANR-19-CE11-0021,G4-crash,Collision entre moteurs moléculaires et structures G4 seules ou liées à des protéines de liaison observée à l'échelle de la molécule unique en pinces magnétiques(2019), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-LABX-0031,IPGG_LABEX,Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics(2010), European Project: 267862,EC:FP7:ERC,ERC-2010-AdG_20100224,MAGREPS(2011), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Laboratoire de physique de l'ENS - ENS Paris (LPENS (UMR_8023)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Gestionnaire, HAL Sorbonne Université 5, Appel à projets générique - Mécanismes moléculaires et impact de la voie de dégradation des ARNm nonsense (NMD) sur le transcriptome eucaryote. - - CLEANMD2014 - ANR-14-CE10-0014 - Appel à projets générique - VALID, Collision entre moteurs moléculaires et structures G4 seules ou liées à des protéines de liaison observée à l'échelle de la molécule unique en pinces magnétiques - - G4-crash2019 - ANR-19-CE11-0021 - AAPG2019 - VALID, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics - - IPGG_LABEX2010 - ANR-10-LABX-0031 - LABX - VALID, High-resolution tweezers for DNA replication and sequence identification - MAGREPS - - EC:FP7:ERC2011-09-01 - 2016-08-31 - 267862 - VALID, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Sorbonne Université (SU)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Sorbonne Université (SU)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)

Louis Fournier, Ewan Dunbar, Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), University of Toronto, This work was funded in part by the European Research Council (ERC-2011-AdG-295810 BOOTPHON), the Agence Nationale pour la Recherche (ANR-17-EURE-0017 Frontcog, ANR-17-CE28-0009 GEOMPHON, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL*, ANR-19-P3IA-0001 PRAIRIE 3IA Institute, ANR-18-IDEX-0001 U de Paris, ANR-10-LABX-0083 EFL) and grants from CIFAR (Learning in Machines and Brains), Facebook AI Research (Research Grant), Google (Faculty Research Award), Microsoft Research (Azure Credits and Grant), and Amazon Web Service (AWS Research Credits)., ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-17-CE28-0009,GEOMPHON,Perception et apprentissage de la parole dans la typologie géometrique des inventaires phonologiques(2017), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), ANR-18-IDEX-0001,Université de Paris,Université de Paris(2018), and ANR-10-LABX-0083,EFL,Empirical Foundations of Linguistics : data, methods, models(2010)

Bertrand Ducos, Jessica Valle-Orero, Martin Rieu, Vincent Croquette, Jean-François Allemand, Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ABCD : Biophysique des Biomolécules, Laboratoire de physique de l'ENS - ENS Paris (LPENS), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Département de Physique de l'ENS-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Département de Physique de l'ENS-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL), This study was supported by the ANR CLEANMD grant (ANR-14-CE10-0014) and ANR G4-CRASH (ANR-19-CE11-0021-01) from the French Agence Nationale de la Recherche (to V.C.) and by the European Research Council grant Magreps [267 862] (to V.C.). Work in the group of V.C.is part of 'Institut Pierre-Gilles de Gennes' ('Investissements d’Avenir' program ANR-10-IDEX-0001-02 PSL and ANR-10-LABX-31) and the Qlife Institute of Convergence (Université PSL), ANR-14-CE10-0014,CLEANMD,Mécanismes moléculaires et impact de la voie de dégradation des ARNm nonsense (NMD) sur le transcriptome eucaryote.(2014), ANR-19-CE11-0021,G4-crash,Collision entre moteurs moléculaires et structures G4 seules ou liées à des protéines de liaison observée à l'échelle de la molécule unique en pinces magnétiques(2019), ANR-10-LABX-0031,IPGG_LABEX,Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics(2010), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), HAL-SU, Gestionnaire, Appel à projets générique - Mécanismes moléculaires et impact de la voie de dégradation des ARNm nonsense (NMD) sur le transcriptome eucaryote. - - CLEANMD2014 - ANR-14-CE10-0014 - Appel à projets générique - VALID, Collision entre moteurs moléculaires et structures G4 seules ou liées à des protéines de liaison observée à l'échelle de la molécule unique en pinces magnétiques - - G4-crash2019 - ANR-19-CE11-0021 - AAPG2019 - VALID, Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics - - IPGG_LABEX2010 - ANR-10-LABX-0031 - LABX - VALID, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Laboratoire de physique de l'ENS - ENS Paris (LPENS (UMR_8023)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Sorbonne Université (SU)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Sorbonne Université (SU)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)

Daniel Brandeis, Nazanin Mirza-Schreiber, Bruce F. Pennington, Shelley D. Smith, Guillaume Huguet, Milene Bonte, Franck Ramus, Valéria Csépe, Till F. M. Andlauer, Silvia Paracchini, Arndt Wilcke, Paavo H.T. Leppänen, Dénes Tóth, Markus M. Nöthen, Heikki Lyytinen, Jessica Becker, Thomas Bourgeron, Jacqueline Hulslander, Simon E. Fisher, Karin Landerl, Richard K. Olson, Bertram Müller-Myhsok, Fabien Fauchereau, Yves Chaix, Stéphanie Iannuzzi, Juha Kere, Jean-François Démonet, Darina Czamara, Anniek Vaessen, Beate St Pourcain, Andrew P. Morris, Clyde Francks, Per Hoffmann, Myriam Peyrard-Janvid, Ferenc Honbolygó, John C. DeFries, Urs Maurer, John F. Stein, Thomas S. Scerri, Holger Kirsten, Joel B. Talcott, Gerd Schulte-Körne, Anthony P. Monaco, Alessandro Gialluisi, Erik G. Willcutt, Kerstin U. Ludwig, Bent Müller, Kristina Moll, Johannes Schumacher, STEMM - Stem Cells and Metabolism Research Program, Juha Kere / Principal Investigator, Research Programs Unit, University of Helsinki, Language, RS: FPN CN 7, Max-Planck-Institut für Psychiatrie, Max-Planck-Gesellschaft, Munich Cluster for systems neurology [Munich] (SyNergy), Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM)-Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU), Istituto Neurologico Mediterraneo (NEUROMED I.R.C.C.S.), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome]-Università degli studi di Napoli Federico II, Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM), Helmholtz-Zentrum München (HZM), Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU), University of Bonn, Max Planck Institute for Psycholinguistics, Radboud university [Nijmegen], University of Bristol [Bristol], Hungarian Academy of Sciences (MTA), Génétique humaine et fonctions cognitives - Human Genetics and Cognitive Functions (GHFC (UMR_3571 / U-Pasteur_1)), Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Toulouse Neuro Imaging Center (ToNIC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université de Lausanne (UNIL), University of Liverpool, University of Manchester [Manchester], University of Oxford [Oxford], University of Colorado [Boulder], University of Nebraska Medical Center, University of Nebraska System, University of Denver, Maastricht University [Maastricht], The Chinese University of Hong Kong [Hong Kong], University of Jyväskylä (JYU), Karolinska Institutet [Stockholm], Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich (UZH), Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich), Universität Heidelberg [Heidelberg], Aston University [Birmingham], Fraunhofer Institute for Cell Therapy and Immunology (Fraunhofer IZI), Fraunhofer (Fraunhofer-Gesellschaft), Universität Leipzig [Leipzig], Tufts University [Medford], Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BioTechMed-Graz, Graz University of Technology [Graz] (TU Graz)-University of Graz-Medical University Graz, University of Melbourne, University of St Andrews [Scotland], AG and TFMA were supported by the Munich Cluster for Systems Neurology (SyNergy). AG was supported by Fondazione Umberto Veronesi. SP is a Royal Society University Research fellow. BMM, CF, BSP and SEF are supported by the Max Planck Society. AW, BM and HK were funded by the Fraunhofer Society and the Max Planck Society within the 'Pakt für Forschung und Innovation'. HK was also supported by LIFE—Leipzig Research Center for Civilization Diseases funded by means of the European Union, the European Regional Development Fund (ERDF), and the Free State of Saxony within the excellence initiative. FR is supported by Agence Nationale de la Recherche (ANR-06-NEURO-019-01, ANR-17-EURE-0017 IEC, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-11-BSV4-014-01), European Commission (LSHM-CT-2005-018696). TFMA was supported by the B.M.B.F. through the DIFUTURE consortium of the Medical Informatics Initiative Germany (grant 01ZZ1804A) and by the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation Programme (grant MultipleMS, EU RIA 733161)., ANR-06-NEUR-0019,GENEDYS,Origines cognitives, neurologiques et génétiques des troubles développementaux du langage(2006), ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-11-BSV4-0014,DYSBRAIN,Le cerveau dyslexique(2011), Graz University of Technology [Graz] (TU Graz)-Medical University Graz-Karl-Franzens-Universität [Graz, Autriche], Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA)-University of Naples Federico II = Università degli studi di Napoli Federico II, Helmholtz Zentrum München = German Research Center for Environmental Health, Universität Bonn = University of Bonn, Radboud University [Nijmegen], Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), University of Oxford, Universität Heidelberg [Heidelberg] = Heidelberg University, Universität Leipzig, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Graz University of Technology [Graz] (TU Graz)-Karl-Franzens-Universität Graz-Medical University Graz, Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki, The Royal Society, University of St Andrews. School of Medicine, University of St Andrews. Centre for Biophotonics, University of St Andrews. Biomedical Sciences Research Complex, and University of St Andrews. Cellular Medicine Division

Didier Aubert, THALIM - Théorie et histoire des arts et des littératures de la modernité - UMR 7172 (THALIM), Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département Arts - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), ANR–10–IDEX–0001–02 PSL, ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3

Alberto Gatto, Audrey Forest, Jean-Pierre Quivy, Geneviève Almouzni, Dynamique de la Chromatine [Institut Curie], Dynamique du noyau [Institut Curie], Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ERC-2015-ADG-694694, Ligue Nationale contre le Cancer, ANR-11-LABX-0044_DEEP, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-14-CE10-0013 ‘‘CELLECTCHIP’’, ANR-16-CE12-0024 ‘‘CHIFT', ANR-16-CE12-0024,CHIFT,Chaperons et Histones Déterminants pour l'Identité Cellulaire, le Destin de Lignage et les Transitions(2016), European Project: 798106,REPLICHROM4D, and European Project: 694694,Chromatin Adaptations through Interactions of Chaperones in Time (ChromADICT)

Agnès Thierry, Astrid Lancrey, Marta Sigarteu, Saurabh Raj, Evelyne Duvernois-Berthet, Etienne Routhier, Loïc Ponger, Vincent Croquette, Julien Mozziconacci, Jean-Baptiste Boulé, Alexandra Joubert, Structure et Instabilité des Génomes (STRING), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiologie moléculaire et adaptation (PhyMA), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire de physique de l'ENS - ENS Paris (LPENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Sorbonne Université (SU)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Régulation spatiale des Génomes - Spatial Regulation of Genomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL), This work was supported by a grant from the national research agency (MuSeq, ANR-15-CE12-0015) and by core funding from CNRS, INSERM and MNHN to the Structure and Genome instability unit. French Museum of National History to the Genome Structure and Instability unit. AL was supported by a doctoral fellowship from the National Museum of Natural History. Work in the group of VC is part of 'Institut Pierre-Gilles de Gennes' ('Investissements d’Avenir' program ANR-10-IDEX-0001-02 PSL and ANR-10-LABX-31) and the Qlife Institute of Convergence (PSL Université)., The authors thank the members of the Genome Structure and Instability unit for discussions and Dr Romain Koszul for providing assistance with sequencing., ANR-15-CE12-0015,Museq,Séquençage multi-échelle d'ADN génomique répété G/C riche par manipulation en molecule unique en pinces magnétiques(2015), ANR-10-LABX-0031,IPGG_LABEX,Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics(2010), Laboratoire de physique de l'ENS - ENS Paris (LPENS (UMR_8023)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPC), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Département de Physique de l'ENS-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ABCD : Biophysique des Biomolécules, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Département de Physique de l'ENS-PSL, Boulé, Jean-Baptiste, Séquençage multi-échelle d'ADN génomique répété G/C riche par manipulation en molecule unique en pinces magnétiques - - Museq2015 - ANR-15-CE12-0015 - AAPG2015 - VALID, and Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics - - IPGG_LABEX2010 - ANR-10-LABX-0031 - LABX - VALID

Tu Anh Nguyen, Maureen de Seyssel, Patricia Rozé, Morgane Rivière, Evgeny Kharitonov, Alexei Baevski, Ewan Dunbar, Emmanuel Dupoux, Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Facebook AI Research [Paris] (FAIR), Facebook, University of Toronto, CIFAR program in Learning in Machines & Brains CIFAR LMB program, The work for MS, PR and for E Dupoux and TAN in their EHESS role was supported by the Agence Nationale de la Recherche (ANR-17-EURE-0017 Frontcog, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-19-P3IA-0001 PRAIRIE 3IA Institute) and grants from CIFAR (Learning in Minds and Brains) and Facebook AI Research (Research Grant). The work for E Dunbar was supported by a Google Faculty Research Award and by the Agence Nationale de la Recherche (ANR-17-CE28-0009 GEOMPHON,ANR-18-IDEX-0001 U de Paris, ANR-10-LABX-0083 EFL)., ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Inria de Paris, and Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP)

Nicolas Manel, Clotilde Théry, Olivier Schwartz, Federico Cocozza, Nathalie Névo, Mercedes Tkach, Julian Buchrieser, Xavier Lahaye, Lorena Martin-Jaular, Ester Piovesana, Immunité et cancer (U932), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie [Paris], Université Paris sciences et lettres (PSL), Virus et Immunité - Virus and immunity, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Paris (UP), This work was supported by Institut Curie, INSERM, CNRS, grants H2020-MSCA-ITN (722148, TRAIN-EV), INCa (11548) and Fondation ARC (PGA1 RF20180206962) to C Théry, LABEX DCBIOL (ANR-10-IDEX-0001-02 PSL* and ANR-11-LABX-0043) to C. Théry and N. Manel, LABEX VRI (ANR-10-LABX-77), ANRS (France Recherche Nord & Sud Sida-HIV Hépatites, ECTZ36691, ECTZ71745), Sidaction (17-1-AAE-11097-2), ANR (ANR-19-CE15-0018-01, ANR-18-CE92-0022-01), DIM1HEALTH to N Manel. N Manel thanks Mutuelle Bleue for support., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-11-LABX-0043,DCBIOL,Biologie des cellules dendritiques(2011), ANR-10-LABX-0077,VRI,Initiative for the creation of a Vaccine Research Institute(2010), ANR-19-CE15-0018,NUCLEONDRIA,Fonctions émergentes du détection de l'immunité innée cGAS dans les organites à ADN(2019), ANR-18-CE92-0022,cGAS-Vac,Analyses fonctionnelles de la voie cGAS/STING au cours d'infections bactériennes et infections virales et implications pour le développement de vaccins innovants(2018), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LAHAYE, Xavier, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Biologie des cellules dendritiques - - DCBIOL2011 - ANR-11-LABX-0043 - LABX - VALID, Laboratoires d'excellence - Initiative for the creation of a Vaccine Research Institute - - VRI2010 - ANR-10-LABX-0077 - LABX - VALID, Fonctions émergentes du détection de l'immunité innée cGAS dans les organites à ADN - - NUCLEONDRIA2019 - ANR-19-CE15-0018 - AAPG2019 - VALID, APPEL À PROJETS GÉNÉRIQUE 2018 - Analyses fonctionnelles de la voie cGAS/STING au cours d'infections bactériennes et infections virales et implications pour le développement de vaccins innovants - - cGAS-Vac2018 - ANR-18-CE92-0022 - AAPG2018 - VALID, and Virus et Immunité - Virus and immunity (CNRS-UMR3569)

Carlos Castrillon, Jérôme Bibette, Jean Baudry, Andrew D. Griffiths, Guilhem Chenon, Klaus Eyer, Pierre Bruhns, Millie Heo, Chimie-Biologie-Innovation (UMR 8231) (CBI), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anticorps en thérapie et pathologie - Antibodies in Therapy and Pathology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich), This work was supported by the CELLIGO project funded by the French government through BPIFrance under the frame 'Programme d’Investissements d’Avenir' (PIA), the 'Institut Pierre-Gilles de Gennes' through the laboratoire d’excellence, 'Investissements d’avenir' programs ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-10- EQPX-34 and ANR-10-LABX-31, and the European Research Council (ERC)–Seventh Framework Program (ERC-2013-CoG 616050 to P.B.). E.K. acknowledges generous funding from the ‘The Branco Weiss Fellowship—Society in Science’ and received funding from the European Research Council (ERC) under the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme (Grant agreement No. 80336). C.C. acknowledges financial support from CONCYTEC, Peru., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-EQPX-0034,IPGG,Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique(2010), European Project: 616050,EC:FP7:ERC,ERC-2013-CoG,MYELOSHOCK(2014), European Project: 37382,SLBC, Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Baudry, Jean, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Equipements d'excellence - Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique - - IPGG2010 - ANR-10-EQPX-0034 - EQPX - VALID, Role of myeloid cells, their mediators and their antibody receptors in allergic shock (anaphylaxis) using humanized mouse models and clinical samples - MYELOSHOCK - - EC:FP7:ERC2014-09-01 - 2019-08-31 - 616050 - VALID, and Scaling Limits of Brownian Coagulation - SLBC - 37382 - OLD

Piet Herdewijn, Philippe Marliere, Gilles Gasser, Pascal Röthlisberger, Marcel Hollenstein, Luigi Cavallo, Fabienne Levi-Acobas, Mohit Chawla, Marie Flamme, Romina Oliva, Chimie bioorganique des acides nucléiques - Bioorganic chemistry of nucleic acids, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Universita degli studi di Napoli 'Parthenope' [Napoli], Institute of Chemistry for Life and Health Sciences (iCLeHS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génopole [Evry], Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), Institut de biologie systémique et synthétique (ISSB), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Rega Institute for Medical Research [Leuven, België], Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), The authors gratefully acknowledge financial support from Institut Pasteur. We thank Mr. Germain Niogret for his help for the preparation of the cover picture featuring this article. The start-up company DNA Script is acknowledged for help in the UPLC-MS analysis of the oligonucleotides. L.C. and M.C. acknowledge King Abdullah University of Science and Technology (KAUST) for support and the KAUST Supercomputing Laboratory for providing computational resources of the supercomputer Shaheen II. R.O. thanks MIUR-FFABR (Fondo per il Finanziamento Attività Base di Ricerca) for funding. This work was financially supported by an ERC Consolidator Grant PhotoMedMet to G.G. (GA 681679) and has received support under the program 'Investissements d’ Avenir' launched by the French Government and implemented by the ANR with the reference ANR-10-IDEX-0001-02 PSL (G.G.)., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), European Project: 681679, H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC),681679,PhotoMedMet(2017), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Università degli Studi di Napoli 'Parthenope' = University of Naples (PARTHENOPE)

Klaus Eyer, Jérôme Bibette, Carlos Castrillon, Guilhem Chenon, Pierre Bruhns, Andrew D. Griffiths, Jean Baudry, Institute of Pharmaceutical Sciences [ETH Zürich] (IPW), Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich), Laboratoire Colloïdes et Matériaux Divisés (LCMD), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie-Biologie-Innovation (UMR 8231) (CBI), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anticorps en thérapie et pathologie - Antibodies in Therapy and Pathology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plymouth University, This work was supported by funding from the The Branco Weiss Fellowship – Society in Science and funding from the European Research Council (ERC) under the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation Program (Grant 80336) to K.E. This work has also received support from the Institut Pierre-Gilles de Gennes through Laboratoire d’Excellence, Investissements d’Avenir Programs ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-10-EQPX-34, and ANR-10-LABX-31, and the ERC–Seventh Framework Program (ERC-2013-CoG 616050 to P.B.). C.C. acknowledges financial support from Consejo Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación Tecnológica, Peru., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-EQPX-0034,IPGG,Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique(2010), European Project: 616050,EC:FP7:ERC,ERC-2013-CoG,MYELOSHOCK(2014), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), and Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Bing Er Jiang, Ewan Dunbar, Morgan Sonderegger, Meghan Clayards, Emmanuel Dupoux, Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Department of Linguistics [Montréal], McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], CIFAR program in Learning in Machines & Brains CIFAR LMB program, This work was funded in part by the Agence Nationale pour la Recherche (ANR-17-EURE-0017 Frontcog, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL*, ANR-19-P3IA-0001 PRAIRIE 3IA Institute),the CIFAR LMB program, and a grant from Facebook AI Re-search (Research Grant) to the last author, ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, and Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)

Juliette MILLET, Ewan Dunbar, Laboratoire de Linguistique Formelle (LLF - UMR7110), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Ecole Doctorale Frontiere de l’Innovation en Recherche et Education (ED 474 FIRE), Université Paris Cité (UPCité)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), This research was supported by the Ecole Doctorale Frontières du Vivant (FdV) – Programme Bettencourt, and by grants ANR-17-CE28-0009 (GEOMPHON), ANR-11-IDFI-023 (IIFR), ANR-11-IDEX-0005 (USPC), ANR-10-LABX-0083 (EFL), ANR-17-EURE-0017 Frontcog, ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-19-P3IA-0001 PRAIRIE 3IA Institute., ANR-17-CE28-0009,GEOMPHON,Perception et apprentissage de la parole dans la typologie géometrique des inventaires phonologiques(2017), ANR-11-IDFI-0023,IIFR,Institut Innovant de Formation par la Recherche(2011), ANR-11-IDEX-0005,USPC,Université Sorbonne Paris Cité(2011), ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-11-IDEX-0001,Amidex,INITIATIVE D'EXCELLENCE AIX MARSEILLE UNIVERSITE(2011), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), Laboratoire de Linguistique Formelle (LLF UMR7110), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Université de Paris (UP)-Université Paris sciences et lettres (PSL), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Nicolas Manel, Siham Boulisfane-El Khalifi, Mary Brennan, Darragh Duffy, Nadia Nathan, Serge Amselem, Kathryn J. McKenzie, Maria José Martin-Niclos, Jonny Hertzog, Carolina Uggenti, Marie Legendre, Stéphanie Chhun, Caroline Thumerelle, Luis Seabra, Marie-Louise Frémond, Vincent Bondet, Bénédicte Neven, Joseph A. Marsh, Marie Wislez, Catherine McDougall, Marine Depp, Jan Rehwinkel, Gillian I. Rice, Aurore Coulomb L'Hermine, Yanick J. Crow, Lucienne Chatenoud, Melvin Le Bihan, Thierry Jo Molina, Karen J. Mackenzie, Alice Lepelley, Edwin Carter, Jonathan Marey, Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Immunité et cancer (U932), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie [Paris], MRC Institute of Genetics and Molecular Medicine [Edinburgh] (IGMM), University of Edinburgh-Medical Research Council, Manchester Academic Health Science Centre (MAHSC), University of Manchester [Manchester], Immunobiologie des Cellules dendritiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Radcliffe Department of Medicine [Oxford], University of Oxford [Oxford], Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique (UMRS_933), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Royal Hospital for Sick Children [Edinburgh], Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Service de pathologie [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU), Service de pneumologie [CHU Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Royal Infirmary of Edinburgh, Département de Pathologie [CHU Necker], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP), M.-L. Frémond received a grant from the Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (000427993) and acknowledges La Fondation Square. Y.J. Crow acknowledges the European Research Council (GA309449 and 786142-E-T1IFNs), and a state subsidy managed by the Agence Nationale de la Recherche under the 'Investments for the Future' program (ANR-10-IAHU-01). Y.J. Crow and D. Duffy acknowledge the Agence Nationale de la Recherche (grant CE17001002). J.A. Marsh is supported by a Medical Research Council Career Development Award (MR/M02122X/1) and is a Lister Institute of Preventive Medicine Research Prize Fellow. N. Manel was supported by LABEX DCBIOL (ANR-10-IDEX-0001-02 PSL* and ANR-11-LABX-0043), ANR-17-CE15-0025-01, ANR-18-CE92-0022-01, Fondation BMS, Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ECTZ71745), Sidaction (VIH2016126002), and Ile-de-France Emergence. M. Le Bihan received a doctoral fellowship from Ile-de-France ARDoc. The project was supported by MSDAVENIR (Devo-Decode Project)., We thank Immunoqure AG for provision of antibodies for the Simoa assay., ANR-10-IAHU-0001,Imagine,Institut Hospitalo-Universitaire Imagine(2010), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-17-CE15-0025,STINGCHECK,Mécanismes des points de contrôle du senseur de l'immunité innée STING(2017), ANR-18-CE92-0022,cGAS-Vac,Analyses fonctionnelles de la voie cGAS/STING au cours d'infections bactériennes et infections virales et implications pour le développement de vaccins innovants(2018), European Project: 309449,EC:FP7:ERC,ERC-2012-StG_20111109,T1-IFN(2013), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Oxford, Maladies génétiques d'expression pédiatrique (U933), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Trousseau [APHP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Maladies génétiques d'expression pédiatrique [CHU Trousseau] (Inserm U933), UF de Génétique moléculaire [CHU Trousseau], Service de Pneumologie pédiatrique [CHU Trousseau], Vougny, Marie-Christine, Instituts Hospitalo-Universitaires - Institut Hospitalo-Universitaire Imagine - - Imagine2010 - ANR-10-IAHU-0001 - IAHU - VALID, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Mécanismes des points de contrôle du senseur de l'immunité innée STING - - STINGCHECK2017 - ANR-17-CE15-0025 - AAPG2017 - VALID, APPEL À PROJETS GÉNÉRIQUE 2018 - Analyses fonctionnelles de la voie cGAS/STING au cours d'infections bactériennes et infections virales et implications pour le développement de vaccins innovants - - cGAS-Vac2018 - ANR-18-CE92-0022 - AAPG2018 - VALID, and Definition and characterization of type I interferonopathies - T1-IFN - - EC:FP7:ERC2013-03-01 - 2018-02-28 - 309449 - VALID

Anne Vincent-Salomon, Becher Burkhard, Delphine Loirat, Cyrill Dimitri Anderfuhren, Nicolas Cagnard, Jimena Tosello Boari, Wilfrid Richer, Christine Sedlik, Sophie Viel, Olivier Lantz, Louis Pérol, Xavier Sastre-Garau, Sebastian Amigorena, Nicolás Gonzalo Núñez, Didier Meseure, Rodrigo Nalio Ramos, Eliane Piaggio, Maud Milder, Philippe De La Rochere, Leticia Laura Niborski, Jeremy Bigot, Immunité et cancer (U932), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich (UZH), Bioinformatics Platform [Paris], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Département de Biologie des Tumeurs, Institut Curie [Paris], Centre d'Investigation Clinique Biothérapie [Paris] (CICBT), Département d'Oncologie Médicale [Paris], Institut Curie [Paris]-Université Paris sciences et lettres (PSL), Department of Biopathology [Vandoeuvre-lès-Nancy], Institut de Cancérologie de Lorraine - Alexis Vautrin [Nancy] (UNICANCER/ICL), UNICANCER-UNICANCER, This work was funded by the Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), the Association pour la Recherche sur le Cancer (ARC), the Institut Curie, the Agence Nationale pour la Recherche (ANR Emergence program), the Institut National du Cancer (INCa), IGR-Curie 1428 Clinical Investigation Center, Labex DCBIOL (ANR-10-IDEX-0001-02 PSL and ANR-11-LABX0043), SIRIC (INCa-DGOS-Inserm_12554, projets 2011–2017:INCa-DGOS-Inserm_4654). N.G.N. received a fellowship from Ligue Nationale Contre le Cancer and the University Research Priority Program (URPP)., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), Bodescot, Myriam, and Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID

Anne-Sophie Macé, Katell Vié, Cédric M. Blouin, Christelle Guéré, Lia Domingues, Graça Raposo, Julia Sirés-Campos, Christophe Lamaze, Floriane Gilles-Marsens, Melissa Dewulf, Ilse Hurbain, Maryse Romao, Christine Viaris de Lesegno, Cédric Delevoye, Nathalie André, Structure and Membrane Compartments [Paris], Biologie Cellulaire et Cancer, Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BioImaging Cell and Tissue Core Facility (PICT-IBiSA), Institut Curie [Paris], Génétique et Neurobiologie de C. Elegans [Lyon], Institut NeuroMyoGène (INMG), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Clarins [Pontoise], Chimie biologique des membranes et ciblage thérapeutique (CBMCT - UMR 3666 / U1143), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC), We acknowledge the Nikon Imaging Center at the Institut Curie/Centre National de la Recherche Scientifique and the PICT-IBiSA, a member of the France-BioImaging national research infrastructure (ANR-10-INBS-04). This work has received support under the program 'Investissement d’Avenir' launched by the French Government and implemented by the Agence Nationale de la Recherche (ANR) with the references ANR-10-LBX-0038 and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, Fondation pour la Recherche Médicale (Equipe FRM DEQ20140329491 Team label to G.R.), Agence Nationale de la Recherche ('MOTICAV' ANR-17-CE13-0020-01 to C.L., and 'MYOACTIONS' ANR-17-CE11-0029-03 to C.D.), Fondation ARC pour la Recherche sur le Cancer (PJA20161204965 to C.D., and Programme Labellisé PGA1-RF20170205456 to C.L.). This work received support from the grants ANR-11-LABX-0038, ANR-10-IDEX-0001-02 (Labex CelTisPhyBio to L.D.), Groupe Clarins, Institut Curie, CNRS and INSERM., ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-17-CE13-0020,MOTICAV,Cavéoles et Tension Membranaire dans la Migration Cellulaire(2017), ANR-17-CE11-0029,MyoActions,Rôle des partenaires pour définir la fonction cellulaire de la myosine VI(2017), Bodescot, Myriam, Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée - - France-BioImaging2010 - ANR-10-INBS-0004 - INBS - VALID, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Cavéoles et Tension Membranaire dans la Migration Cellulaire - - MOTICAV2017 - ANR-17-CE13-0020 - AAPG2017 - VALID, Rôle des partenaires pour définir la fonction cellulaire de la myosine VI - - MyoActions2017 - ANR-17-CE11-0029 - AAPG2017 - VALID, Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Rachid Riad, Anne-Catherine Bachoud-Lévi, Frank Rudzicz, Emmanuel Dupoux, Apprentissage machine et développement cognitif (CoML), Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de sciences cognitives et psycholinguistique (LSCP), Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), University of Toronto, CIFAR program in Learning in Machines & Brains CIFAR LMB program, This work is funded through a Facebook AI Research grant,and supported by INRIA, as well as grants ANR-10-IDEX-0001-02 (PSL*) and ANR-17-EURE-0017 and grants fromFacebookAI Research (Research Grant), Google (FacultyResearchAward) and Microsoft Research (Azure Creditsand Grant)., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, and Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)

Coralie Chevallier, Lou Safra, Nicolas Baumard, Valentin Wyart, Centre de recherches politiques de Sciences Po (CEVIPOF), Sciences Po (Sciences Po)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Neurosciences Cognitives & Computationnelles (LNC2), Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris (DEC), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Jean-Nicod (IJN), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Philosophie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), All authors are supported by the Institut d’Études Cognitives (FrontCog, ANR-17-EURE-0017, ANR-10-LABX-0087 IEC and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL) https://anr.fr, ANR-17-EURE-0017,FrontCog,Frontières en cognition(2017), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), Bodescot, Myriam, Frontières en cognition - - FrontCog2017 - ANR-17-EURE-0017 - EURE - VALID, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Centre de recherches politiques de Sciences Po (Sciences Po, CNRS) (CEVIPOF), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)

Pierre-Guillaume Raverdy, François Bougard, Marie-Françoise Limon-Bonnet, Xi Shen, Oumayma Bounou, Tom Monnier, Mathieu Aubry, Marc H. Smith, Christine Benevent, Ilaria Pastrolin, Olivier Poncet, Service Expérimentation et Développement [Paris Rocquencourt] (SED), Inria Paris-Rocquencourt, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), École nationale des chartes (ENC), Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge (LIGM), École des Ponts ParisTech (ENPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Gustave Eiffel (UNIV GUSTAVE EIFFEL), Models of visual object recognition and scene understanding (WILLOW), Département d'informatique de l'École normale supérieure (DI-ENS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Archives nationales, Institut de recherche et d'histoire des textes (IRHT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work has received support under the program 'Investissements d’Avenir' launched by the French Government and implemented by ANR with the references ANR-10-IDEX-0001-02 PSL. It was also supported by the ANR project EnHerit (ANR-17-CE23-00080), project RAPID Tabasco and gifts from Adobe to Ecole des Ponts, ANR-10-IDEX-0001-02/10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), Université Paris sciences et lettres (PSL), École des Ponts ParisTech (ENPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Gustave Eiffel, Département d'informatique - ENS Paris (DI-ENS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Comité des travaux historiques et scientifiques (CTHS), Ministère de l'Education nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (M.E.N.E.S.R.)-École nationale des chartes (ENC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Centre Jean Mabillon (CJM), ANR-17-CE23-0008,EnHerit,Exploitation des bases d'images patrimoniales(2017), Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Département d'informatique - ENS Paris (DI-ENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)

Anna Notaro, Annie Castonguay, Gilles Gasser, Institute of Chemistry for Life and Health Sciences (iCLeHS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Armand Frappier (INRS-IAF), Institut National de la Recherche Scientifique [Québec] (INRS)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), This work was financially supported by an ERC Consolidator Grant PhotoMedMet to G.G. (GA 681679) and has received support under the program Investissements d'Avenir launched by the French Government and implemented by the ANR with the reference ANR-10-IDEX-0001-02 PSL (G.G.). Ile de France Region is gratefully acknowledged for financial support of 500 MHz NMR spectrometer of Chimie ParisTech in the framework of the SESAME equipment project. We acknowledge the loan of Agilent's equipment to Chimie ParisTech. This work was also supported by INRS University, the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (Discovery 06336 to A.C.), the Fonds de Recherche du Québec Santé (Junior 1 Research Scholar, Établissement de Jeunes Chercheurs 32622 to A.C.) and the Canada Foundation for Innovation (John Evans Leaders Fund 34846 to A.C.)., ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), and European Project: 681679, H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC),681679,PhotoMedMet(2017)