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301. Differential accumulation of volatile organic compounds by leaves and roots of two guianese philodendron species, P.fragrantissimum kunth and P.melinonii brongn

Author: Laurent Legendre, Laurence Pascal, Nina Joffard, Marc Gibernau, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Sciences pour l'environnement (SPE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pascal Paoli (UPP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR - Interactions Plantes Microorganismes Environnement (UMR IPME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), University of Montpellier II, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), UMR 6134, National Resources Projection Vignola, Université de Corse Pasquale Paoli ( UCPP ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), UMR - Interactions Plantes Microorganismes Environnement ( UMR IPME ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), and Université de Corse Pasquale Paoli (UCPP)
Subjects: 0106 biological sciences, feuille, volatile organic compound, [SDV]Life Sciences [q-bio], Bioengineering, Plant Roots, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Biochemistry, Terpene, chemistry.chemical_compound, Leaf extract, philodendron, Botany, Oils, Volatile, Volatile organic compound, terpène, Molecular Biology, chemistry.chemical_classification, GC, Volatile Organic Compounds, Philodendron, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], biology, leaf, Terpenes, composé organique volatil, General Chemistry, General Medicine, MS, biology.organism_classification, root, French Guiana, Plant Leaves, racine, chemistry, Germacrene, Monoterpenes, Sunlight, Molecular Medicine, Composition (visual arts), Root extract, Sun exposure, Gas chromatography–mass spectrometry, Sesquiterpenes, 010606 plant biology & botany
Abstract: Leaf and root essential oils of two closely related but ecologically distant Philodendron species were extracted in natural conditions in French Guiana and analysed by GC/MS to i) describe the blends of volatile organic compounds (VOCs) produced by those species and ii) analyse species and environment-based variations in extracts composition. A total of 135 VOCs were detected with a majority of aliphatic sesquiterpenes. P. fragrantissimum produced mainly β-bisabolene (on average 29.12% of the extract) as well as α- and β-selinene (14.52% and 17.50%, respectively) while in P. melinonii, four aliphatic sesquiterpenes could alternatively be the main component: (E)-β-farnesene (up to 91.42% of the extract), germacrene-D (73.74%), β-caryophyllene (51.63%) and trans-α-bergamotene (41.26%). A significant effect of species and organs on extracts composition was observed while the environment (sun exposure) only affected the relative proportions of monoterpenes and sesquiterpenes in roots of P. melinonii. These results are discussed in the light of the potential role of leaf and root terpenes in Philodendron species.
Published: 2017

302. Valorisation des savoir-faire productifs et stratégies de développement territorial : patrimoine, mise en tourisme et innovation sociale

Author: Grison, Jean-Baptiste, Rieutort, Laurent, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre d'Etudes et de Recherches Appliquées au Massif Central (CERAMAC), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Clermont Université, UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Centre d'Etudes et de Recherches Appliquées au Massif Central ( CERAMAC ), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Clermont Université, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Clermont Université-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: Développement touristique, Développement territorial, Innovation sociale, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, Patrimonialisation culturelle, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography
Abstract: International audience; De nombreux territoires abritent des productions spécifiques et des savoir-faire originaux, anciens ou contemporains, qui contribuent aux identités locales. Ces savoir-faire productifs, en activités, sont ainsi valorisables au-delà de leur rôle économique de production. Ils sont de plus en plus identifiés comme des éléments du patrimoine local, et deviennent parfois incontournables de l’image des territoires où ils se sont développés. Ils sont parfois mis en tourisme (visite d’entreprises, muséification), générant ainsi une ressource complémentaire à la seule vente des produits.Les savoir-faire productifs s’inscrivent ainsi dans des stratégies potentielles de développement territorial, que cet ouvrage s’attache à décrypter, à travers une douzaine d’exemples, en France, Italie, Afrique du Nord et Mexique, mis en perspectives. Il s’agit de mettre en évidence, de l’identification au projet de territoire, des trajectoires de valorisation et d’innovation plurielles, à la croisée de problématiques économiques, sociales ou touristiques.
Published: 2017

303. Wool, between territorial resource and governance issues: from the Pays de Saugues to Provence

Author: Grison, Jean-Baptiste, Rieutort, Laurent, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), CERAMAC, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Grison, Jean-Baptiste, UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: France Alpes du Sud, Local development France, [SHS.GEO] Humanities and Social Sciences/Geography, Territorial resource, Tourism development, Développement touristique, Innovation sociale, Laine, Social innovation, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography, Heritage building, Ressource territoriale, Développement local, Wool production, Patrimonialisation culturelle
Abstract: This article analyzes processes of economic, social and cultural valorization of the wool resource. Two French examples are particularly studied: the Pays de Saugues in Auvergne and La Routo in Provence, where ancient know-how has been reactivated recently, through coordinated territorial development actions. In the Pays de Saugues, the implementation of an action-research was the facilitating element for the networking of diverse stakeholders around a development project about the reactivation and development of wool resource. In Provence, La Routo project is the result of a cross-border cooperation around a traditional transhumance itinerary developed as a hiking route, conceived as a vector of animation for the surrounding territories. In both cases, the organization of a shared and coherent governance network of multiple stakeholders is a key element for the success of the projects. Moreover, social and solidarity economy (SSE) stakeholders play an important role in a social innovation perspective., L’objet de cet article est d’analyser les processus de valorisation économique, sociale et culturelle de la ressource lainière à travers deux exemples français : le Pays de Saugues en Auvergne et La Routo en Provence, où des savoir-faire anciens ont été réactivés récemment dans le cadre d’actions coordonnées de développement territorial. Dans le Pays de Saugues, la mise en place d’une recherche-action a été l’élément facilitateur d’une mise en réseau d’acteurs diversifiés autour d’un projet de développement centré sur la réactivation et la mise en valeur de la ressource. En Provence, le projet de La Routo est né d’une coopération transfrontalière autour d’un itinéraire de transhumance aménagé en sentier de randonnée, pensé comme un vecteur d’animation des territoires traversés. Dans les deux cas, il apparaît que l’organisation d’une gouvernance partagée et cohérente d’un réseau d’acteurs multiples est un élément clé de la réussite des projets. En outre, les acteurs de l’économie sociale et solidaire (ESS) jouent un rôle important dans une perspective d’innovation sociale.
Published: 2017

304. Origine(s) et Fonction(s) de Gènes de Résistance aux Métaux Issus de Métatranscriptomes Eucaryotes de Sols

Author: Ziller, Antoine, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon, Laurence Fraissinet-Tachet, Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), STAR, ABES, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)
Subjects: [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Genes capture, Capture de gènes, Métallothionéine, Eukaryotic microorganisms, Pollutions métalliques, [ SDV.EE ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Métatranscriptomique, [SDV.EE] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Droplet digital PCR, Sols, Metal pollutions, Soils, Metallothionein, Metatranscriptomic, Microorganismes eucaryotes
Abstract: Soil is essential to human societies, especially for food production. Its functioning relies on interaction networks sensitive to environmental alterations. Eukaryotic microorganisms are an important component of the soil ecosystem where they are involved in essential processes such as the regulation of prokaryotic populations. However, they remain poorly studied compared to bacteria, especially concerning their roles in biogeochemical cycles other than the carbon one such as metal cycles. In response to soil metal contamination, some of these eukaryotic microorganisms develop cellular "resistance" mechanisms. In this context, the host laboratory has previously isolated, directly from soils, eukaryotic genes able to confer Cd resistance. These genes form a family coding for cysteine-rich proteins whose cysteine positions are conserved within this sequences. My thesis project aimed at characterizing the function and taxonomic origin of this gene family. First, the purification of five of these proteins produced in Escherichia coli and their biochemical characterizations by spectrometric methods demonstrated that this gene family constitutes a new family of metallothioneins capable of chelating in vitro Zn, Cu and Cd. Some of these proteins are also able to confer Zn resistance when expressed in a sensitive yeast strain. In a second step, quantitative PCR methods for measuring expression levels of these genes in soil microcosms were developed. This will allow to evaluate the level of expression of these genes as a function of an increasing supply of exogenous metal. In a third step, we tried to obtain the genomic regions flanking these environmental genes in order to be able to associate the organisms from which they originate to a taxonomic group and to analyze the promoter regions of these genes using targeted capture, Le sol est essentiel à toute société humaine notamment pour la production d'aliments. Son fonctionnement repose sur des réseaux d'interactions entre les éléments qui le composent et toute perturbation modifie ces réseaux. Les microorganismes eucaryotes représentent une composante importante de l'écosystème édaphique car ils sont impliqués dans des processus essentiels comme la régulation de populations de procaryotes. Mais paradoxalement, ils restent peu étudiés comparés aux bactéries notamment lorsqu'on s'intéresse aux cycles biogéochimiques autres que celui du carbone comme par exemple ceux des métaux. Suite à une pollution par des métaux, certains de ces microorganismes eucaryotes développent des mécanismes « de résistance » cellulaires. Dans ce contexte, le laboratoire d'accueil a isolé, directement à partir d'extraits d'ARN de sol, des gènes eucaryotes impliqués dans la résistance cellulaire au Cd. Ces nouveaux gènes forment une famille codant des protéines riches en cystéines dont les positions sont conservées au sein de cette famille. Mon projet de thèse a eu pour but de caractériser l'origine taxonomique et la fonction de cette famille de gènes. Dans un premier temps, la purification de cinq de ces protéines produites dans Escherichia coli et leurs caractérisations biochimiques par des méthodes spectrométriques ont permis de montrer que cette famille génique constitue une nouvelle famille de métallothionéines capables de chélater in vitro le Zn, le Cu et le Cd. Dans un second temps, une méthode de quantification par PCR quantitative de l'expression de ces gènes, extraits à partir de sol provenant de microcosmes, a été mise au point. Dans un troisième temps, nous avons tenté d'obtenir les régions génomiques bordant ces gènes environnementaux afin d'affilier les organismes qui les portent à un groupe taxonomique et d'analyser les régions promotrices de ces gènes par capture ciblée de gènes
Published: 2017

305. Une démographie singulière

Author: Fournier, Mauricette, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), 'Université Ouverte Clermont-Auvergne, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Fournier, Mauricette, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), and AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes )
Subjects: [SHS.ANTHRO-SE] Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnology, [ SHS.ANTHRO-SE ] Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnology, [SHS.DEMO] Humanities and Social Sciences/Demography, Politique d'immigration, [SHS.GEO] Humanities and Social Sciences/Geography, Politique nataliste, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, [SHS.DEMO]Humanities and Social Sciences/Demography, [SHS.ANTHRO-SE]Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnology, [ SHS.DEMO ] Humanities and Social Sciences/Demography, Démographie Historique, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography
Abstract: National audience
Published: 2017

306. Variabilité des ressources et impacts sur les SE rendus par les systèmes pastoraux en zone subsaharienne

Author: Ickowicz, Alexandre, Corniaux, Christian, ASSOUMA, Mohamed Habibou, Lecomte, Philippe, Vayssieres, Jonathan, Blanfort, Vincent, Bernoux, Martial, Bocoum, O., Bakhoum, Amy, Balent, Gerard, Sheeren, David, Decruyenaere, Virginie, Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux (UMR SELMET), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (DYNAFOR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers (DYNAFOR), École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux ( UMR SELMET ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), UMR 0868 Systèmes d'Elevage Méditerranéens et Tropicaux, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Université Cheikh Anta Diop ( UCAD ), Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural ( DYNAFOR ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, UMR 1201 Dynamiques et écologie des paysages agriforestiers, Ecole d'Ingénieurs de Purpan ( INPT - EI Purpan ), Walloon Agricultural Research Center, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), ProdInra, Archive Ouverte, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], agricultural activity, aménagement pastoral, [SDV]Life Sciences [q-bio], sahel, range management, drought, activité agricole, service écosystémique, sécheresse
Abstract: Dans les zones semi-arides du Sahel (200-400mm pluies/an), l’élevage pastoral mobile est l’activité agricole dominante en raison des conditions climatiques et agro-écologiques qui sont marquées par une forte variabilité et incertitude sur la pluviosité et les ressources qui en dépendent. L’accroissement moyen continu de cette activité au cours des dernières décennies malgré des périodes de crises de sécheresse sévères, pose la question de la durabilité de cette activité et des écosystèmes de parcours pastoraux peu productifs qui la soutiennent. L’exploitation de cet espace pastoral basé sur la gestion de ressources collectives (parcours, eaux de surfaces) et son aménagement sous forme de points d’eaux permanents modernes est fortement structuré par les pratiques des pasteurs (campements, points d’eau saisonniers, mobilité). Ainsi, la pression exercée par le bétail sur l’espace est fortement liée à cette structuration et nous avons cherché à évaluer l’impact de cette activité pastorale sur les écosystèmes à travers l’évaluation de services éco-systémiques de régulation et d’approvisionnement. Les résultats encore partiels montrent l’impact de l’hétérogénéité spatiale et temporelle des ressources sur les caractéristiques des systèmes fourragers, des régimes alimentaires et des performances des troupeaux pastoraux sub-sahariens. Cela permet aussi d’estimer l’impact de ces aménagements, de la variabilité des ressources et des pratiques des pasteurs sur le fonctionnement et la durabilité de ces écosystèmes et d’approcher un bilan élargi des services écosystémiques liés à ces systèmes de vie et de production.
Published: 2017

307. La mobilité des systèmes d’élevage ovins utilisateurs d’une grande variété de ressources pâturées en Provence : impacts sur le bilan énergétique et les émissions de méthane

Author: Jacques Lasseur, Marc Benoit, Aurore Vigan, maguy EUGENE, Florent Mouillot, Laura Mansard, Laurent Garde, Nathalie Girard, Mathieu Vigne, Philippe Lecomte, Céline Dutilly, Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux (UMR SELMET), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre d'Etudes et de Réalisations Pastorales Alpes Méditerranée (CERPAM), Chambre d'agriculture des hautes Alpes (CA 05), Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux ( UMR SELMET ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Centre d'Etudes et de Réalisations Pastorales Alpes Méditerranée ( CERPAM ), Chambre Agriculture des Hautes Alpes, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)
Subjects: bilan énergétique, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], ovin, marsh gas, [SDV]Life Sciences [q-bio], système d'élevage, méthane, energy balance
Abstract: La mobilité des systèmes d’élevage ovins utilisateurs d’une grande variété de ressources pâturées en Provence : impacts sur le bilan énergétique et les émissions de méthane. Réseau prairies – Symposium 2017
Published: 2017

308. Weaning age influences the severity of gastrointestinal microbiome shifts in dairy calves

Author: Jan C. Plaizier, Hooman Derakhshani, S. Li, S. J. Meale, Ehsan Khafipour, Paula Azevedo, Michael A. Steele, T. J. Devries, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Department of Animal Science, Texas A&M University [College Station], Department of Animal Bioscience, University of Guelph, Department of Agricultural Food and Nutrition Science, University of Alberta, Department of Medicine Microbiolology, University of Manitoba, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Manitoba [Winnipeg], Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 0301 basic medicine, Rumen, Firmicutes, [SDV]Life Sciences [q-bio], Science, microbiome, microbiote digestif, Weaning, Biology, Carbohydrate metabolism, Article, fermentation ruminale, 03 medical and health sciences, Feces, âge au sevrage, Animal science, Animals, calve, Microbiome, Phylogeny, 2. Zero hunger, Multidisciplinary, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Bacteroidetes, veau, Gastrointestinal Microbiome, parasite gastro intestinal, biology.organism_classification, régime alimentaire, 030104 developmental biology, Biochemistry, Medicine, Carbohydrate Metabolism, Cattle, Digestion
Abstract: Ruminants microbial consortium is responsible for ruminal fermentation, a process which converts fibrous feeds unsuitable for human consumption into desirable dairy and meat products, begins to establish soon after birth. However, it undergoes a significant transition when digestion shifts from the lower intestine to ruminal fermentation. We hypothesised that delaying the transition from a high milk diet to an exclusively solid food diet (weaning) would lessen the severity of changes in the gastrointestinal microbiome during this transition. β-diversity of ruminal and faecal microbiota shifted rapidly in early-weaned calves (6 weeks), whereas, a more gradual shift was observed in late-weaned calves (8 weeks) up to weaning. Bacteroidetes and Firmicutes were the most abundant ruminal phyla in pre- and post-weaned calves, respectively. Yet, the relative abundance of these phyla remained stable in faeces (P ≥ 0.391). Inferred gene families assigned to KEGG pathways revealed an increase in ruminal carbohydrate metabolism (P ≤ 0.009) at 9, compared to 5 weeks. Conversely, carbohydrate metabolism in faeces declined (P ≤ 0.002) following a change in weaning status (i.e., the shift from pre- to post-weaning). Our results indicate weaning later facilitates a more gradual shift in microbiota and could potentially explain the negative effects of early-weaning associated with feeding a high-plane of pre-weaning nutrition.
Published: 2017

309. Transmission et Evaluation de la Valeur des Exploitations Agricoles

Author: Enjolras, Geoffroy, Jeanneaux, Philippe, Desjeux, Yann, Latruffe, Laure, Centre d'études et de recherches appliquées à la gestion (CERAG), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Territoires (Territoires), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART-LERECO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ANR Farm_Value, AGROCAMPUS OUEST. FRA., Coop de France. FRA., Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), IAE de Grenoble, Université Grenoble Alpes, Centre d'Etudes et de Recherches Appliquées à la Gestion ( CERAG ), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires ( SMART ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], valeur, transmission, exploitation agricole, installation
Abstract: Transmission et Evaluation de la Valeur des Exploitations Agricoles. Demi-journée Coop de France Ouest et Agrocampus Ouest, ‘Transmission des exploitations et installation des jeunes en coopératives : valeur des exploitations agricoles et modes de financement’.
Published: 2017

310. Cis-bromadiolone diastereoisomer is not involved in bromadiolone Red Kite (Milvus milvus) poisoning

Author: Marlène Damin-Pernik, Etienne Benoit, Isabelle Fourel, Virginie Lattard, Fourel, Isabelle, Rongeurs Sauvages, Risques Sanitaires et Gestion des Populations - UR 1233 (RS2GP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Bpi France 1301001W, Rongeurs Sauvages – Risques Sanitaires et Gestion des Populations, INRA, VetAgro Sup ( USC1233/RS2GP ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS )
Subjects: Environmental Engineering, Food Chain, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Rodent, Population, Bromadiolone, steréoisomère, Zoology, Milvus milvus, Conservation, 010501 environmental sciences, 4-Hydroxycoumarins, Tissue persistence, 01 natural sciences, PhD Corresponding Author's Institution: VetAgro Sup, ecotoxicology, anticoagulant rodenticides, stereoisomers, tissue persistence, conservation, predators, Toxicology, chemistry.chemical_compound, biology.animal, Secondary poisoning, Environmental Chemistry, Animals, Rodenticide, Stereoisomers, education, Waste Management and Disposal, Ecotoxicology Corresponding Author: Dr Isabelle Fourel, Falconiformes, 0105 earth and related environmental sciences, préservation, education.field_of_study, biology, Environmental and Society, rodenticide anticoagulant, Rodenticides, Pesticide, biology.organism_classification, Pollution, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, Predators, Anticoagulant rodenticides, chemistry, France, Environnement et Société, stereoisomerism, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society, écotoxicologie
Abstract: Anticoagulant rodenticides (ARs) are widely used pesticides to control rodent populations. Bromadiolone, a second generation anticoagulant rodenticide (SGARs), is authorized in France to control the population of water voles (Arvicola scherman). The persistence of SGARs in rodents is responsible for secondary exposure or poisoning of predators and scavengers, and is of ecological concern for the conservation of endangered species. Commercial formulations are a mixture of two diastereoisomers of bromadiolone: 70-90% is trans-bromadiolone and 10-30% is cis-bromadiolone. Both diastereoisomers have been shown to inhibit coagulation function with the same potency. On the other hand, cis-bromadiolone has been shown to be less tissue-persistent than transbromadiolone in rats. This difference led to residue levels in rats with substantially weakened proportion in cis-bromadiolone compared to the composition of baits. In this study, a multi-residue LC-MS/MS method for the quantification of the diastereoisomers of SGARs was used to investigate their proportions in field samples of predators. In 2011, 28 red kites (Milvus milvus) were found dead within a few months of bromadiolone application in grassland to control water vole outbreaks. In this study, we report the concentrations of the two diastereoisomers of bromadiolone measured in the livers of thirteen red kites. Exposure to bromadiolone was apparent in all the kites with hepatic concentrations of transbromadiolone ranging from 390 to 870 ng/g (89 to 99% of summed SGARs). However, cis-bromadiolone was not detected in 5 of 13 red kites and was present at very low concentrations (below 2.2 ng/g) in 8 of 13 kites, demonstrating that cis-bromadiolone is not involved in this red kite poisoning event. The results suggest that a change of the proportions of bromadiolone diastereoisomers in baits could reduce the risk of secondary poisoning of predators, but retain primary toxicity for control rodent outbreaks.
Published: 2017

311. La migration des demandeurs d’asile : Des limites méthodologiques liées aux aspects psycho-sociaux à l’apport de la géographie par l’utilisation des cartes mentales

Author: ARFAOUI, Rafik, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Libre de Bruxelles, Université de Montréal, Université de Genève, UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), ARFAOUI, Rafik, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: demandeurs d'asile, [SHS.GEO] Humanities and Social Sciences/Geography, reconstruction psychologique, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, cartes mentales, Migration, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography
Abstract: International audience; Ce poster pose la question des limites méthodologiques dans la recherche sur la migration des demandeurs d’asile. La question de la crédibilité de l’approche qualitative dans le domaine des Refugee Studies qui repose sur une méthodologie narrative nécessite d’être soulevée (Mekdjian, 2016). Les pratiques narratives sur lesquelles reposent les procédures administratives de traitement de la demande d’asile, conjuguées à la suspicion constante à laquelle ils font face, provoquent des violences psychique et physique. Ceci nous amène à nous poser, en tant que chercheurs, des questions d’ordre éthique et d’efficacité du travail mené. L’expression par le dessin, notamment à travers les cartes mentales, constitue un levier important pour cerner les dynamiques migratoires, assurer un travail crédible et échapper aux aspects formels pouvant rappeler, aux demandeurs d’asile, les audiences administratives.
Published: 2017

312. Itinéraire littéraire en Bourbonnais. Constitution d'un réseau de coopération pour la valorisation des patrimoines littéraires et des écrivains bourbonnais (Rapport final)

Author: Fournier, Mauricette, Le Bel, Pierre-Mathieu, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Programme de recherche-action dans le champ de l'innovation sociale (2015-2017), lauréat d'un appel à projet de la Région Auvergne-Rhône-Alpes, coordonné par M. Fournier, Ceramac, UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: [SHS.LITT]Humanities and Social Sciences/Literature, [SHS.INFO]Humanities and Social Sciences/Library and information sciences, Géographie culturelle, [SHS.MUSEO]Humanities and Social Sciences/Cultural heritage and museology, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography, [SHS]Humanities and Social Sciences, Géographie de la littérature, Tourisme littéraire, Patrimoine Culturel, [ SHS ] Humanities and Social Sciences, [ SHS.INFO ] Humanities and Social Sciences/Library and information sciences, Innovation sociale, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, [ SHS.LITT ] Humanities and Social Sciences/Literature, Innovation territoriale, Héritage littéraire, Valorisation de la ressource, Développement local, Recherche-action collaborative, Patrimoine littéraire, Itinéraire culturel, Territoire, [ SHS.MUSEO ] Humanities and Social Sciences/Cultural heritage and museology, Associations culturelles, écrivains, Recherche-action participative
Abstract: Ce rapport présente les résultats d'un projet de recherche visant à appuyer les acteurs locaux du département de l'Allier dans leurs démarches de mise en valeur du patrimoine littéraire territorialisé. En effet, de nombreux écrivains sont originaires ou ont séjourné dans le département. Certains héritages littéraires ont connu un début de patrimonialisation (maisons d'écrivain d’Émile Guillaumin, de Charles-Louis Philippe, maison natale d'Albert Londres à Vichy, bibliothèque de Valery Larbaud, prix René Fallet…). Cependant, ces initiatives étaient jusque là modestes et dispersées alors que ce patrimoine peut constituer une ressource pour le développement du territoire (tourisme littéraire, tourisme culturel, développement culturel). La recherche-action, conduite de 2015 à 2017, a réuni les associations impliquées dans la promotion et la perpétuation de l’œuvre d’un écrivain "bourbonnais" dans l'objectif de mettre en place une route des écrivains tant matérielle que virtuelle.
Published: 2017

313. Update on a European beef eating quality model

Author: Hocquette, Jean-François, Bonny, Sarah, Polkinghorne, Rod, Farmer, Linda, Legrand, I., Allen, Paul, Wierzbicki, Jerzy, Gardner, Graham, Pethick, David, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Murdoch University, 431 Timor Road, Murrurundi, Independent, Agri-Food and Biosciences Institute, Service Qualité de la Viande, MRAL, Institut de l'Elevage, Teagasc Food Research Centre, Polish Beef Association, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut de l'élevage (IDELE), Teagasc Food Research Centre [Fermoy, Ireland], Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Teagasc Food Research Centre [Fermoy, County Cork, Ireland]
Subjects: race bovine européenne, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], qualité alimentaire, bœuf, consommateur, qualité de la viande, europe, consumers
Abstract: Session B. Update on Eating Quality; Update on a European beef eating quality model. Sustainable beef quality for Europe - II - A Workshop for Industry and Scientists
Published: 2017

314. Wheat glutenin: the 'tail' of the 1By protein subunits

Author: Emmanuelle Bancel, Gilberto Igrejas, Gérard Branlard, José Luis Capelo, J. D. Nunes-Miranda, Christophe Chambon, Didier Viala, Catherine Ravel, Functional Genomics and Proteomics Unit, Department of Genetics and Biotechnology, University of Trás-os-Montes and Alto Douro (Portugal), UCIBIO-REQUIMTE, Faculty of Science and Technology, Universidade Nova de Lisboa, Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales ( GDEC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Qualité des Produits Animaux ( QUAPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Faculty of Sciences and Technology, Universidade Nova de Lisboa ( UNINOVA ), Unidade de Ciencias Biomoleculares Aplicadas (UCIBIO), Requimte, Universidade do Porto-Departamento de Química (DQ), Faculdade de Ciências e Tecnologia = School of Science & Technology (FCT NOVA), Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Faculdade de Ciências e Tecnologia = School of Science & Technology (FCT NOVA), Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Universidade do Porto-Departamento de Química (DQ), Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA), Portuguese Foundation for Science and Technology (FCT) SFRH/BD/80496/2011, European Social Fund, Ministry of Education and Science (MEC), FCT/MEC UID/Multi/04378/2013, ERDF POCI-01-0145-FEDER-007728, Departamento de Química (DQ), Faculdade de Ciências e Tecnologia (FCT NOVA), Universidade Nova de Lisboa (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa (NOVA)-Faculdade de Ciências e Tecnologia (FCT NOVA), Universidade Nova de Lisboa (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa (NOVA)-Universidade do Porto [Porto]-Departamento de Química (DQ), Universidade Nova de Lisboa (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa (NOVA)-Universidade do Porto [Porto], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Faculty of Sciences and Technology (FCT NOVA), Universidade Nova de Lisboa (NOVA), Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Universidade do Porto, Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Universidade do Porto = University of Porto-Departamento de Química (DQ), Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA)-Universidade do Porto = University of Porto-Departamento de Química (DQ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Universidade do Porto [Porto]-Departamento de Química (DQ), and Universidade Nova de Lisboa (NOVA)-Universidade Nova de Lisboa (NOVA)
Subjects: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, gluténine, Glutens, [SDV]Life Sciences [q-bio], Protein subunit, Biophysics, proteolytic cleavage, 01 natural sciences, Biochemistry, 1By HMW-GS, Polymerization, 03 medical and health sciences, Glutenin, clivage proteolytique, blé, wheat, Immunochemistry, Food Quality, Storage protein, Asparagine, Cysteine, Triticum, wheat glutenin, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, C-terminal domain maturation, biology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], asparaginyl endopeptidase, Seed Storage Proteins, food and beverages, asparagine, Gluten, Molecular Weight, Protein Subunits, 030104 developmental biology, Enzyme, chemistry, protéine, biology.protein, protein, Protein Processing, Post-Translational, 010606 plant biology & botany, glutenin
Abstract: Epub ahead of print; Gluten-forming storage proteins play a major role in the viscoelastic properties of wheat dough through the formation of a continuous proteinaceous network. The high-molecular-weight glutenin subunits represent a functionally important subgroup of gluten proteins by promoting the formation of large glutenin polymers through interchain disulphide bonds between glutenin subunits. Here, we present evidences that y-type glutenin subunits encoded at the Glu-B1 locus are prone to proteolytic processing at the C-terminus tail, leading to the loss of the unique cysteine residue present at the C-terminal domain. Results obtained by intact mass measurement and immunochemistry for each proteoform indicate that the proteolytic cleavage appears to occur at the carboxyl-side of two conserved asparagine residues at the C-terminal domain start. Hence, we hypothesize that the responsible enzymes are a class of cysteine endopeptidases - asparaginyl endopeptidases - described in post-translational processing of other storage proteins in wheat. Biological significance The reported study provides new insights into wheat storage protein maturation. In view of the importance of gluten proteins on dough viscoelastic properties and end-product quality, the reported C-terminal domain cleavage of high-molecular-weight glutenin subunits is of particular interest, since this domain possesses a unique conserved cysteine residue which is assumed to participate in gluten polymerization.
Published: 2017

315. Microbial metacommunity: a METABAR coding approach

Author: Marc Buee, Matthieu Barret, Maria Bernard, Didier Debroas, Isabelle Domaizon, Laure Fauchery, Claude Husson, Valerie Laval, Géraldine Pascal, Charlie Pauvert, Christophe Mougel, Thomas Pommier, Dirk Redecker, Aymé Spor, Sébastien Terrat, Veronique Edel-Hermann, Corinne Vacher, Interactions Arbres-Microorganismes (IAM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Angers (UA), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biodiversité, Gènes et Communautés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions Arbres-Microorganismes ( IAM ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Institut de Recherche en Horticulture et Semences ( IRHS ), Université d'Angers ( UA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne ( LMGE ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ), BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes ( BIOGER-CPP ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes ( IGEPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -AGROCAMPUS OUEST, Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), ProdInra, Archive Ouverte, AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Angers (UA)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], communauté microbienne, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], microbial community
Abstract: Microbial metacommunity: a METABAR coding approach. 2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens)
Published: 2017

316. Verticality versus horizontality of mountain areas ? The reorganization of the relationship between

Author: Lompech, Michel, Ricard, Daniel, Mintalova, tatiana, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Palacky d'Olomouc, Labex ITEM- ANR-10-LABX-50-01, LabEx ITEM (Innovation et Territoires de montagne), Labex ITEM, Labex ITEM- ANR-10-LABX-50-01,LabEx ITEM ,Innovation et TErritoires de Montagne(2010), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Palacky University Olomouc, ANR-10-LABX-0050,ITEM,Innovation and Mountain Territories(2010), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), rouanet, stephanie, Laboratoires d'excellence - Innovation and Mountain Territories - - ITEM2010 - ANR-10-LABX-0050 - LABX - VALID, UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), and Labex ITEM- ANR-10-LABX-50-01,LabEx ITEM ,Innovation et TErritoires de Montagne ( 2010 )
Subjects: Slovaquie, [ SHS ] Humanities and Social Sciences, Pologne, [SHS] Humanities and Social Sciences, Tatras, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract: International audience; Les Tatras, qui culminent à 2655 m d’altitude, constituent un massif de haute montagne, le seul qui puisse mériter cette qualification au sein de la chaîne des Carpates. Elles offrent un caractère alpin assez marqué et conviennent à une analyse comparative avec les Alpes, dans un contexte pleinement européen. On y trouve également des « fonds de vallées », plus ou moins larges, et des « espaces d’altitude », bien individualisés dans le paysage comme par leur valorisation par les sociétés montagnardes. La communication s’appuiera sur une connaissance de cette « montagne de poche » (50 km sur 20 km) acquise sur les versants slovaques comme polonais: enquêtes de terrain renouvelées au fil des années, analyses statistiques, travail bibliographique. Elle s’intéressera à la configuration particulière de cette montagne et de son avant-pays et s’efforcera de la comprendre en suivant l’argumentaire proposé par l’appel à communication. La région des Tatras englobe de nombreux « fonds de vallée » qui, aujourd’hui, concentrent l’essentiel de la population et apparaissent souvent dynamiques (Podhale, Liptov, vallée de l’Orava…), ainsi que des « espaces d’altitude » qui sont en bonne partie inoccupés, car protégés par deux parcs nationaux, ce qui n’empêche pas leur mise en valeur (pastorale hier, touristique aujourd’hui).
Published: 2017

317. Quality of Life and Attractiveness Issues in SMSTs

Author: Mainet, Helene, Edouard, Jean-Charles, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Hamdouch A., Nyseth T., et al. (eds), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Hamdouch A., Nyseth T., et al. (eds), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: quality of life, attractiveness, small and medium sized towns, France, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography
Abstract: International audience; This chapter aims at developing critical perspectives on the role of quality of life in attractiveness discourses and policies of small and medium-sized towns (SMSTs). In changing contexts linked with the economic restructuring process, accurate effects of metropolization, but also a growing residential mobility of population linked with social demand for better amenities and quality of life, SMSTs’ local actors face challenges in the implementation of development policies. They are now confronted with different and sometimes ambivalent options: to develop productive and/or residential economies; to retain and attract businesses and/or people; to compete or cooperate with policy-makers in neighbouring towns; to reproduce successful models and/or try to promote innovative actions.
Published: 2017

318. Quelle bio pour demain ? Changement d'échelle de l'AB : Anticiper les opportunités et adaptations

Author: Benoit, Marc, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: land, territoire, agriculture biologique, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], organic farming, changement d'echelle, [SDV]Life Sciences [q-bio], changement d'échelle, territoires
Abstract: Quelle bio pour demain ? Changement d'échelle de l'AB : Anticiper les opportunités et adaptations. Assemblée générale Bio63
Published: 2017

319. New sources of animal proteins: cultured meat

Author: Jean-François Hocquette, Mark J. Post, Post, Mark, Maastricht University, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Maastricht University [Maastricht], Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Peter Purslow, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: fibre musculaire, [SDV]Life Sciences [q-bio], skeletal myocytes, 010501 environmental sciences, Biology, 01 natural sciences, Cultured meat, protéine animale, Animal proteins, culture de cellules, Production (economics), Insect Proteins, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, Food security, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, 0402 animal and dairy science, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, 040201 dairy & animal science, Environmentally friendly, Biotechnology, Product (business), myoblaste, Livestock, animal protein, myoblast, production de viande bovine, business
Abstract: Cultured meat is a technology with the potential—but not yet proven—ability to solve major upcoming problems with food security and environment when meat demand will increase according to FAO expectations. The technology is available as shown by a proof of concept. Turning cultured meat into a first commercial product available on the plate of consumers still requires different additional technical efforts to improve and complement the product, to scale-up production, to reproduce meat aging and to attain regulatory approval, and this will require time. These developments will be paralleled by replacing animal-derived materials by sustainable ones and by adding new components to the meat including fat tissue. Around the potential market introduction of the first product, consumer acceptance will be an important issue. If cultured meat enters the market, it will compete with conventional meat produced by more environmental friendly livestock practices, meat substitutes made from plant proteins, mycoproteins and insect proteins. Each type of meat substitute will have its own benefits and weaknesses. Apart from improved production of livestock meat, cultured meat is the only alternative that is based on muscle tissue from staple domesticated animals although muscle aging still needs to be investigated.
Published: 2017

320. Comment prédire la qualité de la viande bovine en Europe en s’inspirant du système australien MSA ?

Author: Legrand, I., Hocquette, Jean-François, Polkinghorne, R.J., Wierzbicki, J., MRAL, Institut de l'élevage (IDELE), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Polkinghornes, Polish Beef Association, Institut de l'Elevage, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: analyse sensorielle, Australie, Pologne, France, acceptabilité consommateur, prédiction, qualité, tendreté, viande bovine, Poland, prediction, consumer acceptability, meat, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Une expérimentation franco-polonaise a testé la faisabilité de mise en place, en Europe, d’un système de prédiction de la qualité de la viande bovine en bouche s’inspirant du système australien MSA. Six muscles de 30 vaches françaises et de 30 jeunes bovins polonais ont été dégustés, en France et en Pologne. Les 960 consommateurs français et 600 consommateurs polonais ont évalué selon 4 critères la qualité de steaks grillés et leur ont affecté l’une des 4 classes de qualité proposées. La prédiction de cette classe de qualité à partir d’un index global de satisfaction combinant ces 4 critères est en moyenne excellente (> 70%) pour les viandes dégustées par le consommateur francais, moins bonne pour celles évaluées en Pologne. Deuxièmement, la prédiction de l’index global par le modèle australien à partir des caractéristiques des animaux et de leurs carcasses tend à sous-estimer la qualité des viandes, surtout lorsqu’elles sont dégustées par le consommateur français. La qualité des viandes françaises est assez bien prédite par le modèle, mais celle des viandes polonaises est sous-estimée. Globalement, la grande cohérence des résultats montre qu’il serait possible de mettre en place un classement qualitatif des viandes en France avec le système MSA, même si certains ajustements sont nécessaires., A French and Polish experiment tested if a grading scheme similar to the Australian MSA system could be implemented in Europe to predict beef eating quality. Six muscles from 30 French cows and 30 Polish young bulls were tasted in France and in Poland. 960 French and 600 Polish consumers assessed the quality of grilled steaks according to 4 criteria and assigned one of the 4 proposed quality ratings to each steak. The prediction of this quality rating using a global quality index combining the 4 criteria was judged on average excellent (> 70%) for meats tasted in France and less good for those assessed in Poland. The global index predicted through the Australian model from animals and their carcasses’ characteristics seemed to underestimate meat quality, especially when tasted in France. The French meat quality was quite well predicted by the model, while the Polish one was undervalued. Overall, the great consistency of the results showed that a qualitative meat grading system based on the Australian MSA model might be set up in France even though it should be a bit adjusted.
Published: 2017

321. Evaluer les impacts et services issus des élevages en Europe

Author: Bertrand Dumont, Catherine Donnars, Pierre Dupraz, Unité Prospective ( PROSPECTIVE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires ( SMART ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité Prospective (PROSPECTIVE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Délégation à l'Expertise scientifique collective, à la Prospective et aux Etudes (UAR), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART-LERECO), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: 0403 veterinary science, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], 040301 veterinary sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], 0402 animal and dairy science, service, 04 agricultural and veterinary sciences, Business, europe, 040201 dairy & animal science, élevage, évaluation de l'impact
Abstract: Évaluer les impacts et services issus des élevages en Europe
Published: 2017

322. Securing sustainable livestock production systems in an uncertain economic climate: Nurturing flexibility and resilience

Author: Stéphane Ingrand, Laura Astigarraga, Eduardo Chia, Xavier Coquil, Christophe David, Jean-Louis Fiorelli, UAR 0558 Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (DEPT PHASE), Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Facultad de Agronomia, Universidad Mayor de San Andrés (UMSA), Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation (UMR Innovation), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Agro-Systèmes Territoires Ressources Mirecourt (ASTER Mirecourt), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Supérieur d'Agriculture et d'Agroalimentaire Rhône-Alpes (ISARA), ANR DISCOTECH, Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (ISARA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (I.S.A.R.A.), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( DEPT PHASE ), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Universidad Mayor de San Andrés, Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation ( UMR Innovation ), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ), Agro-Systèmes Territoires Ressources Mirecourt ( ASTER Mirecourt ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut Supérieur d'Agriculture et d'Agroalimentaire Rhône-Alpes ( ISARA )
Subjects: 0106 biological sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], production animale, livestock farms, adaptive capacities, 01 natural sciences, résilience, resilience, flexibility, uncertainty, crops systems, animal system, capacité d'adaptation, Production (economics), Resilience (network), Environmental planning, 2. Zero hunger, Flexibility (engineering), flexibilité, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, plasticité, 0402 animal and dairy science, système d'élevage, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, 040201 dairy & animal science, pliability, 010601 ecology, 13. Climate action, Environmental science, Livestock, business
Abstract: Resilience is one of the three core properties of social‐ecological systems, mixing adaptability and transformability. Flexibility can be defined in terms of diversity of procedures and the speed at which they can be mobilized by one organization. The analyses performed are presented in terms of levers that farmers can deploy to protect their management systems against market uncertainty. These levers differ depending on farmer standpoints, objectives, lessons learned, the collective organizations they work with, the standards and specifications they work to, etc. It is equally important to identify the interplays between overarching and underlying scale levels for the system studied and to hone in on the dynamics at work during periods of transition. Adaptive capacities of farm systems are closely linked to how the farmer perceives the situations to manage, according to his aims, to his behaviour face to risk and to his idea of what is his job. We propose to use different words to describe the properties of farming systems to cope with changes, according to the level within the system: “adaptive capacity” or “plasticity” for the animal level, “resilience” for the biotechnical level and “flexibility” for the whole system, including the manager. We think there is a real challenge working at each level on transition periods and processes, as farming systems will have more and more to adapt face to unpredic events.
Published: 2017

323. Variations métaboliques du maïs lors de l’association coopérative avec la bactérie phytostimulatrice Azospirillum lipoferum CRT1

Author: ROZIER, Camille, STAR, ABES, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Université de Lyon, Laurent Legendre, Sonia Czarnes, Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)
Subjects: [ SDV.BV ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Jasmonic acid, Azospirillum lipoferum, Ascending sap, Acide abscissique, Abscissic acid, Germination, Maize, Acide jasmonique, Host specificity, Auxines, Maïs, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Auxins, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Architecture racinaire, Métabolomique
Abstract: Plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) of the genus Azospirillum are used commercially for their capacity to stimulate the growth and enhance the yield of cereal crops via an intricate, complex and poorly understood associative relationship. The aim of this study was to use modern metabolomics tools to decipher the biochemical mechanisms activated by A. lipoferum CRT1 in its maize host.The analysis of the phytochemical contents of roots, leaves and ascending sap revealed for the first time the importance of root-to-shoot communication and of simple sugars in the enhancement of growth and photochemical conversion potential of young plantlets by A. lipoferum CRT1. A transcriptomic analysis showed moderate impact on roots and a coordinate modulation of several regulatory nodes of cellular biological processes, including some mediated by auxins and abscissic acid. Agronomic field trials conducted two consecutive years in four sites correlated yield enhancement by A. lipoferum CRT1 to the securing of seed germination during environmental stresses. No correlation was found with modifications of plantlets metabolomes (including those linked to nitrogen and phosphorus nutrition), growth and photochemical conversion potential which were found to depend on additional soil and climate cues. Germination securing was due to a speeding of radicule emergence and of seed simple sugars consumption, Les bactéries rhizosphériques stimulatrices de croissance (PGPR) du genre Azospirillum sont utilisées commercialement pour leur capacité à stimuler la croissance et à augmenter le rendement des céréales via une relation associative complexe et peu comprise. L'objectif de cette étude a été d'utiliser les outils modernes de la métabolomique pour caractériser les mécanismes biochimiques activés par la souche A. lipoferum CRT1 chez son hôte, le maïs.L'analyse des contenus phytochimiques des racines, feuilles et sève ascendante a suggéré pour la première fois l'importance de la communication racine-feuille et des sucres simples dans l’augmentation de croissance et du potentiel de conversion photochimique de jeunes plantules par A. lipoferum CRT1. Une analyse transcriptomique a révélé un impact modéré au niveau des racines et des modifications de nombreux nœuds régulateurs des processus biologiques cellulaires des feuilles, dont ceux contrôlés par les auxines et l’acide abscissique. Des essais agronomiques conduits deux années consécutives sur quatre sites ont indiqué que l'augmentation de rendement par A. lipoferum CRT1 dérivait d’une sécurisation de la germination lors de stress environnementaux précoces et non de modifications des métabolomes (dont ceux liés à la nutrition azotée et phosphorée), de la croissance et du potentiel photosynthétique des plantules, des modifications qui étaient par contre liées aux contextes pédo-climatiques. La sécurisation de la germination était due à une accélération de la sortie de la radicule et de la consommation des sucres simples, et molécules apparentées, de la graine
Published: 2017

324. Reduction of ammonia emissions from dairy cattle cubicle houses via improved management - or design - bases strategies : A modeling approach

Author: Eva Brusselman, Nico W.M. Ogink, Luciano Mendes, Jan Pieters, Dennis J.W. Snoek, Peter Demeyer, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Technology and Food Science Unity, Institute for Agricultural and Fisheries Research, Department of Biosystem Engineering, Ghent University [Belgium] (UGENT), Farm Technology Group, Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR), Wageningen University and Research Center (WUR), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Research Institute for Agricultural, Fisheries and Food (ILVO), Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT), Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ghent University [Belgium] ( UGENT ), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] ( WUR ), and Wageningen University and Research Center ( WUR )
Subjects: Empirical data, Engineering, Environmental Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], Emissie & Mestverwaarding, Farm Technology, reduction, 010501 environmental sciences, 7. Clean energy, 01 natural sciences, Reduction (complexity), modelling, medicine, Environmental Chemistry, Waste Management and Disposal, Dairy cattle, 0105 earth and related environmental sciences, modélisation, émission ammoniacale, Test facility, Waste management, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Environmental engineering, dairy cattle, 04 agricultural and veterinary sciences, Pollution, Manure, cubicle houses, bovin laitier, 13. Climate action, 040103 agronomy & agriculture, WIAS, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Flushing, Agrarische Bedrijfstechnologie, Emissions & Manure Valorisation, medicine.symptom, Ammonia emission, Floor type, business, Barn (unit)
Abstract: Given the current scarcity of empirical data on ammonia (NH3) emissions from dairy cattle under different management -based mitigation techniques, a modeling approach to assess potential NH3 emission reduction factors is needed. This paper introduces a process-based model that estimates NH3 emission reduction factors for a dairy cattle barn featuring single or multiple management-based NH3 emission mitigation techniques, as compared to another barn, to which no mitigation measure is applied. The model accounts for the following emission mitigation measures: (a) floor scraping, (b) floor type, (c) floor flushing with water and (d) indoor acidification of manure. Model sensitivity analysis indicated that manure acidification was the most efficient NH3 emission reduction technique. A fair agreement was observed between reduction factors from the model and empirical estimates found in the literature. We propose a list of combinations of techniques that achieve the largest reductions. In order of efficiency, they are: (a) floor scraping combined with manure acidification (reduction efficiency 44-49%); (b) solid floor combined with scraping and flushing (reduction efficiency 21-27%); (c) floor scraping combined with flushing and (d) floor scraping alone (reduction efficiency 17-22%). The model is currently being used to advise the Flemish Government (Belgium), on the performance of certain NH3 emission reduction systems for dairy barns in Flanders.
Published: 2017

325. From pre- to postweaning: Transformation of the young calf's gastrointestinal tract

Author: H. Berends, S. J. Meale, Michael A. Steele, Le Luo Guan, Frédérique Chaucheyras-Durand, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Microbiologie Environnement Digestif Santé - Clermont Auvergne ( MEDIS ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -INRA Clermont-Ferrand-Theix, Lallemand Animal Nutrition, Trouw Nutrition R&D, Department of Agricultural Food and Nutrition Science, University of Alberta, Natural Science and Engineering Research Council (Ottawa, ON, Canada), Alberta Milk (Edmonton, AB, Canada), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Microbiologie Environnement Digestif Santé (MEDIS), INRA Clermont-Ferrand-Theix-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Microbiologie Environnement Digestif Santé - Clermont Auvergne (MEDIS), Université Clermont Auvergne (UCA)-INRA Clermont-Ferrand-Theix, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), INRA Clermont-Ferrand-Theix-Université Clermont Auvergne (UCA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Physiology, Weaning, Biology, 03 medical and health sciences, Nutrient flow, Rumen, lower gut, intestin, Genetics, Animals, calve, intestine, Barrier function, tractus gastrointestinal, 2. Zero hunger, Gastrointestinal tract, calf, rumen, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], veau, 0402 animal and dairy science, forestomach, 04 agricultural and veterinary sciences, Animal Feed, 040201 dairy & animal science, Diet, Gastrointestinal Tract, Transformation (genetics), 030104 developmental biology, Animals, Newborn, Biochemistry, Dairy calf, Cattle, Animal Science and Zoology, Food Science, GIT diseases
Abstract: The ruminant gastrointestinal tract (GIT) faces the challenge of protecting the host from luminal contents and pathogens, while supporting the absorption and metabolism of nutrients for growth and maintenance. The GIT of the calf in early life undergoes some of the most rapid microbial and structural changes documented in nature, and these adaptations in GIT function make the young calf susceptible to GIT diseases and disorders. Despite these challenges, the calf's GIT has a certain degree of plasticity and can sense nutrient supply and respond to bioactive ingredients. Calf GIT research has historically focused on the transition during weaning and characterizing ruminal papillae development using microscopy and digesta metabolite responses. Through the use of new molecular-based approaches, we have recently shown that delaying the age of weaning and providing a step-down weaning protocol is associated with a more gradual shift in ruminal microbiota to a postweaned state. In addition to ruminal adaptations during weaning, nutrient flow to the lower gut changes dramatically during weaning, coinciding with a wide array of structural and microbiological changes. Structural and gene expression changes suggest that the lower gut of the dairy calf undergoes alterations that may reduce barrier function when solid feeds are consumed. More recently, in vivo data revealed that the weaning transition increases total gut permeability of the calf. Interestingly, the lower gut may be able to communicate with the forestomach, meaning that a nutrient can be sensed in the lower gut and cause subsequent adaptations in the forestomach. An improved understanding of how diet, microbiota, and functional ingredients interact to affect growth and barrier function of the intestinal tract would greatly benefit the dairy calf industry. A mechanistic understanding of such adaptations would also aid in the formulation of specific management regimens and provision of functional ingredients required to characterize and enhance gut function in young calves.
Published: 2017

326. Colonic transit time is a driven force of the gut microbiota composition and metabolism: In vitro evidence

Author: Benoit Sion, William Tottey, David Feria-Gervasio, Jean-François Martin, Jean-Louis Sébédio, Nadia Gaci, Jean-François Jarrige, Monique Alric, Jean-François Brugère, Estelle Pujos, Brigitte Laillet, EA 4678, Faculté de Pharmacie, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Auvergne Council (FEDER), Conception, Ingénierie et Développement de l'Aliment et du Médicament ( CIDAM ), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ), Microbiologie Environnement Digestif Santé - Clermont Auvergne ( MEDIS ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -INRA Clermont-Ferrand-Theix, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Nutrition Humaine ( UNH ), Clermont Université-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Neuro-Dol - Clermont Auvergne ( Neuro-Dol ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Clermont Auvergne ( UCA ), Institut de France, Université d'Auvergne (Clermont Ferrand 1) (UdA), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Brugère, Jean François, INRA Clermont-Ferrand-Theix-Université Clermont Auvergne ( UCA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Clermont Université
Subjects: 0301 basic medicine, Metabolite, Population, Médecine humaine et pathologie, gut microbiome, Chemostat, Gut flora, digestive system, personne âgée, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, flore intestinale, Carbohydrate fermentation, Food and Nutrition, aging, colon, constipation, microbiological techniques, education, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, senior citizens, education.field_of_study, biology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Short-chain fatty acid, digestive, oral, and skin physiology, Gastroenterology, Metabolism, biology.organism_classification, In vitro, 030104 developmental biology, chemistry, Biochemistry, Alimentation et Nutrition, Human health and pathology, Original Article, Neurology (clinical), durée du transit, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Jean-François Brugère thanks bachelors’students for their help, more specifically Céline Vidal, Claire Ardaens,Adeline Régnier, and Amandine Maurin, and Sylvain Denis forhis valuable help concerning in vitro systems. In memory of GeorgeT MacFarlane (died in 2015) for all of his pioneering works on gut in vitro simulations systemsThis work was supported by the European Union (UE) through the Auvergne Council (FEDER) with a PhD and a postdoctoral Scholarship support respectively to William Tottey and to David Feria-Gervasio, and by a PhD scholarship support from the French "Ministere de l'Enseignement Superieur et de la Recherche" to Nadia Gaci; Background/Aims: Human gut microbiota harbors numerous metabolic properties essential for the host's health. Increased intestinal transit time affects a part of the population and is notably observed with human aging, which also corresponds to modifications of the gut microbiota. Thus we tested the metabolic and compositional changes of a human gut microbiota induced by an increased transit time simulated in vitro. Methods: The in vitro system, Environmental Control System for Intestinal Microbiota, was used to simulate the environmental conditions of 3 different anatomical parts of the human colon in a continuous process. The retention times of the chemostat conditions were established to correspond to a typical transit time of 48 hours next increased to 96 hours. The bacterial communities, short chain fatty acids and metabolite fingerprints were determined. Results: Increase of transit time resulted in a decrease of biomass and of diversity in the more distal compartments. Short chain fatty acid analyses and metabolite fingerprinting revealed increased activity corresponding to carbohydrate fermentation in the proximal compartments while protein fermentations were increased in the lower parts. Conclusions: This study provides the evidence that the increase of transit time, independently of other factors, affects the composition and metabolism of the gut microbiota. The transit time is one of the factors that explain some of the modifications seen in the gut microbiota of the elderly, as well as patients with slow transit time.
Published: 2017

327. Development of a semi-automatic bibliometric system for publications on animal health and welfare: a methodological study

Author: Alain Boissy, André Jestin, Marjolaine Gautret, Stefano Messori, Marina Bagni, Département Santé Animale (DEPT SA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ministry of Health, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Santé Animale ( DEPT SA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail ( ANSES Maisons-Alfort ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and European Commission under the ANIHWA ERA-Net project (Seventh Framework Programme)291815
Subjects: Process (engineering), Computer science, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], bien-être animal, Library and Information Sciences, Bibliometrics, 050905 science studies, Domain (software engineering), methods, animal welfare, World Wide Web, animal health and welfare, media_common, base de données, bibliométrie, bibliometric, étude méthodologique, Animal health, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], animal health, Scientific progress, database accuracy, santé animale, 05 social sciences, General Social Sciences, Data science, 3. Good health, Computer Science Applications, Thematic map, research coordination, Science policy, 0509 other social sciences, bibliometrics, 050904 information & library sciences, Welfare
Abstract: Bibliometrics is a common research instrument for systemic analysis of scientific progress in many disciplines, including veterinary sciences. However, bibliometric analyses are generally biased by limited information included in scientific productions databases. The aim of this study is to propose a method for implementing databases on livestock health and welfare in a bibliometric perspective. By using the detailed classification of the scientific disciplines and the list of keywords of the CAB Abstracts®, queries were first built to combine 120 descriptors related to animal species and 1680 descriptors related to the given thematics. Then, the extraction was done from the Web of Science®. The overall process focused on the research institutes localised in Europe and on publications written in English. To assess the database accuracy, supplementary filters were validated and applied to discard non-specific terms and neighbouring topics. Additional fields for species groups, infectious and non-infectious diseases, welfare components and geographical regions were incorporated according to thematic terminologies specifically established. The final database contains 57,523 articles published over a 12 years’ period (2003–2014). The developed method, based on the complementary use of both the CAB Abstracts® and Web of Science®, can be a reference to allow an adequate semi-automatic retrieval of relevant publications on livestock health and welfare, which will be of use to implement bibliometric study to produce a realistic assessment of tendency for driving science policy. Interestingly, it can be also a model process to be easily applied to implement bibliometric studies for any other scientific thematic domain.
Published: 2017

328. Relative rumen pH thresholds to predict subacute ruminal acidosis (SARA) in dairy cows

Author: Villot, Clothilde, Martin, Cécile, Meunier, Bruno, Richard, Marie Madeleine, Silberberg, Mathieu, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), ProdInra, Archive Ouverte, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], acidose ruminale, rumen, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], ph, vache laitière, [SDV]Life Sciences [q-bio], ph value, dairy cows
Abstract: Relative rumen pH thresholds to predict subacute ruminal acidosis (SARA) in dairy cows. 8. European Conference on Precision Livestock Farming (ECPLF)
Published: 2017

329. Grassland-based products: quality and authentication

Author: Coppa, Mauro, Cabiddu, A., Elsasser, M., Hulin, S., Lind, V., Martin, Bruno, Mosquera-Losada, M.R., Peeters, A., Prache, Sophie, van den Pol-van Dasselaar, A., Peratoner, G., ProdInra, Archive Ouverte, Department of Agricultural, Forest and Food Sciences, University of Turin, AGRIS sardegna, Landwirtschaftliches Zentrum, Pôle Fromager AOC Massif Central, Norwegian Institute of Bioeconomy Research (NIBIO), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Crop Production Department, Escuela Politécnica superior, Universidade de Santiago de Compostela [Spain] (USC ), RHEA, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Aeres University of Applied Sciences, Research Centre for Agriculture and Forestry Laimburg, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Norwegian Institute of Bioeconomy Research ( NIBIO ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Universidade de Santiago de Compostela, Wageningen University and Research Center ( WUR ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Wageningen University and Research Center (WUR)
Subjects: safety, viande, Animal Nutrition, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], quality trait, dairy products, [SDV]Life Sciences [q-bio], sécurité, Diervoeding, quality traits, produit laitier, [SDV] Life Sciences [q-bio], pratique de gestion, meat, dairy product, Life Science, quality traits, safety, dairy products, meat, management practice, management practice
Abstract: There is increased consumer demand for food products with a perceived positive image. Product quality can be assessed in terms of food safety, nutritional composition, technological and sensory characteristics and ethics. In order to summarise the current knowledge linking quality traits and management practices, a literature review was performed in relation to seven types of management practice: four concerning animal feeding, one concerning breeds and two concerning ethical aspects of the production, and information is presented as seven tables. Literature on use of authentication and traceability for marketed grassland-based products is summarised in a further five tables. Scientific evidence of the differentiation of grassland-based products is currently consolidating, but some practices lead to uncertain results and deserve further research. Authentication is possible but is used to a relatively small extent because of high costs or the lack of analytical techniques suitable for routine use. Marketing appears to be successful without authentication, but this may lead to product counterfeiting. Research and development should be targeted to find viable low-cost solutions to introduce authentication practices to safeguard the added value of grassland-based products and ensure fair remuneration for producers.
Published: 2017

330. Genomic characterization of Ensifer aridi, a proposed new species of nitrogen-fixing rhizobium recovered from Asian, African and American deserts

Author: Céline Lavire, David Chapulliot, Abdelkarim Filali-Maltouf, H. S. Gehlot, Antoine Le Quéré, José-Antonio Munive, Sonam Rathi, Guadalupe Rocha, Marine Rohmer, Nisha Tak, Ilham Sakrouhi, Thibault Meyer, Dany Severac, Laboratoire des symbioses tropicales et méditerranéennes (UMR LSTM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Laboratoire de Microbiologie et Biologie Moléculaire, Université Mohammed V de Rabat [Agdal], BNF & Microbial Genomics Lab, Department of Botany, Jai Narain Vyas University, Université de Lyon, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Instituto de Ciencias, Benemérita Universidad Autónoma, Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX (IGF MGX), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Project SEP-CONACYT-ANUIES-ECOS NORD France [M08-A02], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Le Quéré, Antoine, Université Mohammed V de Rabat [Agdal] (UM5), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-BioCampus (BCM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des symbioses tropicales et méditerranéennes ( LSTM ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Université Mohammed 5 Agdal, Université de Lyon (COMUE), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Montpellier GenomiX, and Institut de Génomique Fonctionnelle
Subjects: 0301 basic medicine, Biodiversité et Ecologie, bactérie fixatrice d'azote, sinorhizobium, adaptation, comparative genomics, Genome, mexique, rhizobium, maroc, octopine, Desert, Rhizobium-legume symbiosis, Phylogeny, High-Throughput Nucleotide Sequencing, asie, afrique, Genomics, legume, rhizobium-legume symbiosis, analyse phylogeographique, Phenotype, Sinorhizobium, ensifer, desert, Nitrogen fixation, Rhizobium, Desert Climate, Genome, Plant, Research Article, Biotechnology, nopaline, Asia, 030106 microbiology, interaction hôte symbiote, Biology, Synteny, légumineuse, amérique, Evolution, Molecular, Biodiversity and Ecology, 03 medical and health sciences, analyse de génome, Symbiosis, Phylogenetics, Nitrogen Fixation, Botany, Genetics, Adaptation, basicity, Comparative genomics, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Desert climate, désert, Computational Biology, Molecular Sequence Annotation, 15. Life on land, biology.organism_classification, inde, Ensifer, 030104 developmental biology, inositol, Africa, america, profilage génétique, alcalinité, Americas, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Rhizobium- legume symbiosis
Abstract: Background Nitrogen fixing bacteria isolated from hot arid areas in Asia, Africa and America but from diverse leguminous plants have been recently identified as belonging to a possible new species of Ensifer (Sinorhizobium). In this study, 6 strains belonging to this new clade were compared with Ensifer species at the genome-wide level. Their capacities to utilize various carbon sources and to establish a symbiotic interaction with several leguminous plants were examined. Results Draft genomes of selected strains isolated from Morocco (Merzouga desert), Mexico (Baja California) as well as from India (Thar desert) were produced. Genome based species delineation tools demonstrated that they belong to a new species of Ensifer. Comparison of its core genome with those of E. meliloti, E. medicae and E. fredii enabled the identification of a species conserved gene set. Predicted functions of associated proteins and pathway reconstruction revealed notably the presence of transport systems for octopine/nopaline and inositol phosphates. Phenotypic characterization of this new desert rhizobium species showed that it was capable to utilize malonate, to grow at 48 °C or under high pH while NaCl tolerance levels were comparable to other Ensifer species. Analysis of accessory genomes and plasmid profiling demonstrated the presence of large plasmids that varied in size from strain to strain. As symbiotic functions were found in the accessory genomes, the differences in symbiotic interactions between strains may be well related to the difference in plasmid content that could explain the different legumes with which they can develop the symbiosis. Conclusions The genomic analysis performed here confirms that the selected rhizobial strains isolated from desert regions in three continents belong to a new species. As until now only recovered from such harsh environment, we propose to name it Ensifer aridi. The presented genomic data offers a good basis to explore adaptations and functionalities that enable them to adapt to alkalinity, low water potential, salt and high temperature stresses. Finally, given the original phylogeographic distribution and the different hosts with which it can develop a beneficial symbiotic interaction, Ensifer aridi may provide new biotechnological opportunities for degraded land restoration initiatives in the future. Electronic supplementary material The online version of this article (doi:10.1186/s12864-016-3447-y) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Published: 2017

331. Fear and other negative emotions

Author: Boissy, Alain, Dwver, Cathy, Jones, Bryan, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, School of Vetrerinary Sciences, University of Edinburgh, Animal Behaviour & Welfare Consultant, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Fear and other negative emotions
Published: 2017

332. Identification of the functional states of human vitamin K epoxide reductase from molecular dynamics simulations

Author: Chatron, N., Chalmond, B., Trouve, A., Benoit, Etienne, Caruel, H., Lattard, Virginie, Tchertanov, L., Liphatech, Centre de Mathématiques et de Leurs Applications (CMLA), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Rongeurs Sauvages, Risques Sanitaires et Gestion des Populations - UR 1233 (RS2GP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), GENCI-IDRIS 2016-077291, Rongeurs Sauvages – Risques Sanitaires et Gestion des Populations, INRA, VetAgro Sup ( USC1233/RS2GP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Centre de Mathématiques et de Leurs Applications ( CMLA ), and École normale supérieure - Cachan ( ENS Cachan ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: vitamine k, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], [ SDV.BBM.BC ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], protéine, Chimie analytique, topologie membranaire, réticulum endoplasmique, Analytical chemistry, [ SDV.BBM.BS ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM]
Abstract: International audience; In mammalians, the enzymatic activity of vitamin K epoxide reductase (VKORC1) requires a protein conformational reorganisation that includes several transient enzymatic states involving a dynamic electron transfer. Regarding the structurally non-characterised human enzyme (hVKORC1), this process remains poorly explained and the different redox states of the enzyme generated by its biochemical transformation are unknown. Here, we report a 3D model of the fully reduced hVKORC1 at the atomistic level. By exploring this model through molecular dynamics (MD) simulations, we established the most probable intermediate states of the enzyme which were used for generation of the putative functionally-related enzymatic states. Enzymatic functionality of each state was assigned by probing their recognition properties with respect to vitamin K in its quinone and hydroxyquinone forms. Two states were identified as contributing to the two-step vitamin K transformation. The state highly selective for native vitamin K was further validated through analyses of its free energy of binding with vitamin K agonists (VKAs) that showed a high correlation with the experimental inhibiting constants.
Published: 2017

333. Mettre en situation et accompagner la construction de connaissances : un parti pris pour la formation à l’accompagnement de projets en agriculture

Author: Marion Guillot, Lucie Gouttenoire, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), and Mainet, Helene
Subjects: [SDV.SA.AGRO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, lcsh:LC8-6691, dispositif pédagogique, lcsh:Special aspects of education, 4. Education, socioconstructivisme, [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, General Medicine, accompagnement, [ SDV.SA.AGRO ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, Political science, ComputingMilieux_COMPUTERSANDEDUCATION, réflexivité, lcsh:L, Humanities, lcsh:Education, installation en agriculture
Abstract: Cet article présente une expérience pédagogique menée dans l’enseignement supérieur agronomique. Dans un secteur agricole en mutation, où les profils des candidats à l’installation se diversifient, les conseillers agricoles sont face à de nouveaux enjeux, notamment en ce qui concerne leur mission d’accompagnement des porteurs de projets. Comment la formation peut-elle prendre en charge ces dynamiques de transformation du métier de conseiller ? Plus généralement, comment préparer des étudiants à des métiers en mutation ? Nous considérons qu’encourager la réflexivité des étudiants peut les aider à se construire en professionnels agissant de manière responsable et pertinente. Nous présentons ici un module de formation de trois semaines que nous animons depuis 2012, dans lequel nous proposons aux étudiants d’accompagner des porteurs de projets, et d’exercer leur réflexivité sur cette expérience. Nous avons abouti au module d’enseignement tel que présenté ici en apprenant de notre expérience, en la confrontant à nos connaissances en pédagogie, et en participant à des dispositifs d’échanges de pratiques. Nous le présentons comme une mise en pratique de l’accompagnement socioconstructiviste interactif : les représentations des étudiants sont utilisées comme base pour la construction de nouvelles connaissances, les conflits socio-cognitifs sont favorisés, et la réflexivité des étudiants est stimulée à partir d’exercices de mise en situation professionnelle. Le module nous apporte satisfaction, mais il soulève également des questions, qui appellent un prolongement de la réflexion : des débats sur la question des connaissances qui valent, et des difficultés pour certains étudiants à véritablement entrer en réflexivité. This article is about an experiment in agricultural higher education. Faced with change and uncertainty in agriculture, agricultural advisors need to deal with new stakes. For example, the profiles of people who want to set up a farm are changing, which requires to consider new ways of helping them to achieve their goals. How to help students to move towards such changing professions ? We consider that supporting students’ reflexivity is a good way to help them become responsible professionals who act in a relevant way in their working situations. In this paper, we describe a three-week study course that we have been teaching since 2012. Students are asked to help people who want to set up a farm, and to practice their reflexivity about this experiment. We have incrementally designed this study course on the basis of learning through our experience, confronting knowledge about education and participating in practice analysis devices. We describe this study-course as an application of interactive social constructivism. Students’ representations are considered as the starting point of our teaching job, socio-cognitive conflicts are encouraged and students’ reflexivity is fostered by simulating professional situations. This study-course has real strengths, but also some weaknesses that require further research. Thus there are debates about which types of knowledge count, and some students do not manage to really practice reflexivity.
Published: 2017

334. Synthesis and biological evaluation of C-3 aliphatic coumarins as vitamin K antagonists

Author: Montagut-Romans , Adrien, Boulven , Manon, Jacolot , Maiwenn, Moebs-Sanchez , Sylvie, Hascoet , Claire, Hammed , Abdessalem, Besse , Stephane, Lemaire , Marc, Benoit , Etienne, LATTARD , Virginie, Popowycz , Florence, Rongeurs Sauvages – Risques Sanitaires et Gestion des Populations, INRA, VetAgro Sup ( USC1233/RS2GP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), UMR 5246, Laboratoire de Chimie Organique et Bioorganique, Université de Lyon (COMUE), and Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: vitamine k, Vitamin K, In vitro test, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], antagonist, in vitro, coumarin, dosage, coumarine, test in vitro, antagoniste, heterocyclic compounds, C-3 alkylation, In vitro assay, 4-Hydroxycoumarin
Abstract: Since the discovery of Warfarin in the 1940s, the design of new warfarin-derived anticoagulants for rodent management has been challenging, with mainly structural modifications performed on the C3 position of the coumarin skeleton. In order to better understand the pharmacomodulation of such derivatives, we have synthesized a family of C3 (linear and branched) alkyl-4-hydroxycoumarins, which led to the identification of compounds 5e and 5f as potential short-term active anticoagulants.
Published: 2017

335. Le genre et le type racial des bovins ont un impact sur la qualité des viandes en bouche

Author: Bonny, Sarah, Legrand, I., Pethick, David W., Wierzbicki, Jerzyf, Allen, Paul, Farmer, Linda J., Polkinghorne, Rod, Gardner, Graham E., Hocquette, Jean-François, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, School of Veterinary and Life Sciences [Murdoch], Murdoch University, Service Qualité des Viandes, MRAL, Institut de l'élevage (IDELE), Polish Beef Association, Teagasac Food Research Centre, Agri-Food and Biosciences Institute, Birkenwood, VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], breed, viande bovine, genre, [SDV]Life Sciences [q-bio], qualité sensorielle, sex, consommateur, beef, race, consumers
Abstract: Fournir une viande bovine de qualité constante est essentiel non seulement pour la satisfaction du consommateur mais aussi pour soutenir durablement la filière viande bovine. Les caractéristiques de la carcasse telles que son poids, le degré d’ossification (un indicateur de la maturité physiologique des animaux), et la note de persillé sont supposées expliquer la majorité des différences de qualité de viande entre les races et les genres. Dans cette étude initialement publiée dans Animal (2016), 10:6, pp 987–995, nous avons donc fait l’hypothèse que ces facteurs expliquent avec une bonne précision la qualité sensorielle de la viande bovine issue de taurillons, de boeufs ou de femelles de races allaitante, laitière ou croisée. Au total, 8 128 échantillons de différents muscles ont été prélevés sur 482 carcasses d’animaux abattus en France, Pologne, Irlande et Irlande du Nord. Ils ont été classés à l'abattage selon la méthode du système « Meat Standards Australia » (MSA), puis évalués pour leur tendreté, jutosité, appréciation de la flaveur et appréciation globale sur une échelle de 0 à 100 par des consommateurs naïfs (c’est-à-dire non entrainés) selon les protocoles MSA (Watson et al., 2008). Les notes des 4 critères ont été pondérées (0,3 ; 0,1 ; 0,3 ; 0,3) et combinées pour former une note globale de qualité en bouche appelée MQ4. Les carcasses ont été regroupées en trois catégories de type racial : races à viande, races laitières et animaux croisés. Les taurillons ont des notes MQ4 inférieures à celles des boeufs et des femelles. Les notes MQ4 des races allaitantes sont plus faibles que celles des races laitières pour 5 muscles sur les 16 étudiés. Ces écarts sont observés même en tenant compte des différences de caractéristiques de carcasses, notamment en termes d’engraissement. Alors que ce n’est pas le cas dans la version actuelle du système MSA, le genre et le type racial de l’animal doivent donc doivent être pris en compte dans un éventuel modèle de prédiction de la qualité sensorielle de la viande bovine en Europe., Delivering beef of consistent quality to the consumer is vital for consumer satisfaction and will help to ensure demand and therefore profitability within the beef industry. Carcass traits such as ossification score, carcass weight and marbling explain the majority of the differences between breeds and sexes. Therefore, in this study previously published in Animal (2016), 10:6, pp 987–995, it was expected that these factors would explain the eating quality of bulls and dairy breeds with good accuracy. In total, 8,128 muscle samples from 482 carcasses from France, Poland, Ireland and Northern Ireland were MSA graded at slaughter then evaluated for tenderness, juiciness, flavour liking and overall liking by untrained consumers, according to MSA protocols (Watson et al., 2008). The scores were weighted (0.3, 0.1, 0.3, 0.3) and combined to form a global eating quality (MQ4) score. The carcasses were grouped into one of three breed categories; beef breeds, dairy breeds and crosses. Bulls had lower MQ4 scores than steers and females. Beef breeds had lower eating quality scores than dairy breeds and crosses for 5 out of the 16 muscles tested. Even after accounting for differences in carcass traits, bulls still differ in eating quality when compared with females and steers. Breed type also influenced eating quality beyond differences in carcass traits, which is not considered in the current MSA system. This should be taken into account in any potential model to predict the eating quality of beef in Europe.
Published: 2017

336. Importance des produits issus de bovins au pâturage sur les apports nutritionnels et la santé du consommateur

Author: Duru , Michel, Bastien , Didier, Froidmont , Eric, Graulet , Benoit, Gruffat , Dominique, UMR : AGroécologie, Innovations, TeRritoires, Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Institut de l'Elevage, Unité Nutrition animale et Durabilité, CRA-W, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de l'élevage (IDELE), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ProdInra, Archive Ouverte, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, bovin, ration alimentaire, pâturage, système de production, prairie, food and beverages, système fourrager, production de viande, légumineuse, acide gras essentiel, qualité du lait, ration de base, santé, qualité des produits, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, production laitière
Abstract: Found in products from ruminant livestock, essential fatty acids, vitamins, and polyphenols have numerous positive effects on human health. Compared to livestock fed a conventional maize-based and/or grain-based diet, grass-fed livestock produce milk or meat with higher levels of omega-3 fatty acids; vitamins A, E, B2, and B9; carotenoids; and phenolics. The effect is even more pronounced if animals are grazing on legumerich grasslands. In contrast, their levels of vitamin B12 are lower. In the case of meat production, animals must be grass fed for the 3 months prior to slaughter. Taking all systems together, 45% of milk and 25% of meat comes from grass-fed animals (a rough estimate that remains to be confirmed). However, the consumption of milk and meat from grass-fed animals is not great enough to allow consumers to achieve recommended intake levels., Les acides gras essentiels, les vitamines et les polyphénols contenus dans les produits de ruminants ont de nombreux effets positifs sur la santé humaine. Par rapport à un régime à base de maïs et/ou de céréales, une alimentation à l’herbe (d’autant plus qu’elle est riche en légumineuses) du ruminant fournit un lait ou une viande plus riches en omégas-3, en vitamines A, E, B2, B9, en caroténoïdes et en dérivés phénoliques, mais plus pauvres en vitamine B12. Pour la viande, cette alimentation doit être poursuivie dans les 3 mois précédant l’abattage.Tous systèmes confondus, 45 % du lait et 25 % de la viande proviendraient d’une alimentation à l’herbe (première estimation, à confirmer) mais la consommation de tels produits ne suffit pas pour atteindre les valeurs recommandées en alimentation humaine.
Published: 2017

337. Macrothrombocytopenia and dense granule deficiency associated with FLI1 variants: ultrastructural and pathogenic features

Author: Saultier, Paul, Vidal, Lea, Canault, Matthias, Bernot, Denis, Falaise, Celine, Pouymayou, Catherine, Bordet, Jean-Claude, Saut, Noémie, Rostan, Agathe, Baccini, Véronique, Peiretti, Franck, Favier, Marie, Lucca, Pauline, Deleuze, Jean-François, Olaso, Robert, Boland, Anne, Morange, Pierre-Emmanuel, Gachet, Christian, Malergue, Fabrice, Faure, Sixtine, Eckly, Anita, Tregouet, David-Alexandre, Poggi, Marjorie, Alessi, Marie-Christine, Nutrition, obésité et risque thrombotique (NORT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), APHM, French Reference Ctr Inherited Platelet Disorders, Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Hémostase, Inflammation et sepsis (EA 4609), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition (ICAN), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], UMR S 1166, Team Genom & Pathophysiol Cardiovasc Dis, UMR S 1166, Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), Université Paris-Sorbonne (UP4), Centre National de Génotypage, Institut de Génomique, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Fédération de Médecine Translationelle de Strasbourg (FMTS), Etablissement Français du Sang, Université de Strasbourg (UNISTRA), UMR S949, Life Sciences Global Assay and Applications Development, Beckman Coulter Genom SA, Fondation pour la Recherche Medicale FDM20150633607, ICAN Institute for Cardiometabolism and Nutrition ANR-10-IAHU-05, Nutrition, obésité et risque thrombotique ( NORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Hémostase, Inflammation et sepsis, Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup ( VAS ), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition ( ICAN ), CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Université Paris Sorbonne (Paris 4), Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Fédération de Médecine Translationelle de Strasbourg ( FMTS ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases (ICAN), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] (IHU ICAN), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Unité de recherche sur les maladies cardiovasculaires et métaboliques, UMR S 1166, and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)
Subjects: Adult, Blood Platelets, Male, Platelet Aggregation, Transcription, Genetic, cytométrie de flux, Cytoplasmic Granules, Article, Platelet Biology & its Disorders, Young Adult, genetic disease, maladie génétique, Humans, [ SDV.MHEP.HEM ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, Cell Nucleus, Proto-Oncogene Protein c-fli-1, Genetic Variation, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, Hematology, pathophysiologie, Middle Aged, Thrombocytopenia, thrombocyte, biomarker, Megakaryocytes, biomarqueur, Hématologie
Abstract: Congenital macrothrombocytopenia is a family of rare diseases, of which a significant fraction remains to be genetically characterized. To analyze cases of unexplained thrombocytopenia, 27 individuals from a patient cohort of the Bleeding and Thrombosis Exploration Center of the University Hospital of Marseille were recruited for a high-throughput gene sequencing study. This strategy led to the identification of two novel FLI1 variants (c. 1010G>A and c. 1033A>G) responsible for macrothrombocytopenia. The FLI1 variant carriers' platelets exhibited a defect in aggregation induced by low-dose adenosine diphosphate (ADP), collagen and thrombin receptor-activating peptide (TRAP), a defect in adenosine triphosphate (ATP) secretion, a reduced mepacrine uptake and release and a reduced CD63 expression upon TRAP stimulation. Precise ultrastructural analysis of platelet content was performed using transmission electron microscopy and focused ion beam scanning electron microscopy. Remarkably, dense granules were nearly absent in the carriers' platelets, presumably due to a biogenesis defect. Additionally, 25-29% of the platelets displayed giant a-granules, while a smaller proportion displayed vacuoles (7-9%) and autophagosome-like structures (0-3%). In vitro study of megakaryocytes derived from circulating CD34(+) cells of the carriers revealed a maturation defect and reduced proplatelet formation potential. The study of the FLI1 variants revealed a significant reduction in protein nuclear accumulation and transcriptional activity properties. Intraplatelet flow cytometry efficiently detected the biomarker MYH10 in FLI1 variant carriers. Overall, this study provides new insights into the phenotype, pathophysiology and diagnosis of FLI1 variant-associated thrombocytopenia.
Published: 2017

338. Feeding a concentrate rich in rapeseed oil improves fatty acid composition and flavor in Norwegian goat milk

Author: Gerd E. Vegarud, R.A. Inglingstad, T.G. Devold, M. Eknæs, Yves Chilliard, Siv Borghild Skeie, Faculty of Chemistry, Biotechnology and Food Science, Norwegian University of Life Sciences ( NMBU ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Faculty of Biosciences, Norwegian Research Council (NFR, Lysaker, Norway), TINE BA (Oslo, Norway), Norwegian University of Life Sciences (NMBU), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 0301 basic medicine, Rapeseed, huile de palme, [SDV]Life Sciences [q-bio], composition en acide gras, Fatty Acids, Nonesterified, Palmitic acid, chemistry.chemical_compound, norvège, goat milk, Lactation, Food science, Globules of fat, acide gras libre, Flavor, 2. Zero hunger, Lipoprotein lipase, palm oil, biology, Goats, Fatty Acids, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, Norwegian goat, medicine.anatomical_structure, Milk, Taste, Composition (visual arts), Female, free fatty acid, biology.animal_breed, lait de chèvre, rapeseed oil, 03 medical and health sciences, Genetics, medicine, Animals, Glycoproteins, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], huile de colza, 0402 animal and dairy science, Lipid Droplets, 040201 dairy & animal science, Diet, Lipoprotein Lipase, 030104 developmental biology, chemistry, Animal Science and Zoology, Glycolipids, Food Science
Abstract: Impaired quality due to a high content of free fatty acids (FFA) and off-flavors has caused challenges in the development of Norwegian goat milk products. The present study aimed to examine the effect of lipid-supplemented concentrates on milk fat content, fatty acid composition, FFA, lipoprotein lipase activity, sensory properties, and size of milk fat globules of goat milk. Thirty goats assigned to 3 experimental groups were fed different concentrates from 60 d in milk (DIM) until late lactation (230 DIM). The diets were (1) control concentrate (no added fat); (2) control concentrate with 8% (added on air-dry basis) hydrogenated palm oil enriched with palmitic acid (POFA); and (3) control concentrate with 8% (added on air-dry basis) rapeseed oil (RSO). The POFA group produced milk with the highest fat content, and fat content was positively correlated with the mean size of milk fat globules. Goats in the RSO group had a higher content of long-chain and unsaturated fatty acids, whereas milk from goats in the POFA group had a higher content of palmitic and palmitoleic acids (C16:0 and C16:1 cis). The control group produced milk with a higher content of short-, medium-, odd-, and branched-chain fatty acids compared with the 2 other groups. The content of FFA in milk was low in early and late lactation and peaked in mid lactation (90 DIM). A high content of FFA was correlated with poor sensory properties (tart/rancid flavor). The RSO group produced milk with lower content of FFA and off-flavors in mid lactation and a higher proportion of unsaturated fatty acids. Therefore, replacement of palm oil with rapeseed oil as a lipid source in dairy goat feed would be favorable.
Published: 2017

339. Phenotyping of animals and their meat: applications of low-power ultrasounds, near-infrared spectroscopy, raman spectroscopy and hyperspectral imaging

Author: Andueza Urra , Jesus Donato, Mourot , Benoît-Pierre, Hocquette , Jean-François, Mourot , Jacques, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Valorex SAS, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Fidel Toldra, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Archive Ouverte, VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], spectroscopy, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], ultrasound, phénotypage, spectroscopie raman, [SDV]Life Sciences [q-bio], food and beverages, animal, spectroscopie proche infrarouge, imagerie hyperspectrale, near-infrared, ultrason
Abstract: Phenotyping of animals and their meat: applications of low-power ultrasounds, near-infrared spectroscopy, raman spectroscopy and hyperspectral imaging
Published: 2017

340. The effects of low-input grazing systems and milk pasteurisation on the chemical composition, microbial communities, and sensory properties of uncooked pressed cheeses

Author: Marie-Christine Montel, Marie Frétin, Isabelle Verdier-Metz, Florence Fournier, Anne Farruggia, Céline Delbès, Bruno Martin, Anne Ferlay, Unité Mixte de Recherche Fromagère (UMRF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1414 Herbipôle, Auvergne region, FEDER funds 2101 088 272 SyEL-inAuv, Unité Mixte de Recherche sur le Fromage (UMRF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Herbipôle, VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherche Fromagère ( UMRF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: 0301 basic medicine, composition chimique, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, propriété sensorielle, Pasteurization, pasteurisation, Applied Microbiology and Biotechnology, law.invention, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, fluids and secretions, law, Grazing, Food and Nutrition, Food science, selective grazing, Thermization, Aroma, 2. Zero hunger, pasteurizing, milk, communauté microbienne, biology, Chemistry, système de pâturage, 0402 animal and dairy science, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, Raw milk, biology.organism_classification, fromage à pâte pressée non cuite, 040201 dairy & animal science, lait, Lactic acid, 030104 developmental biology, chemical analysis, Alimentation et Nutrition, Composition (visual arts), microbial community, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Food Science, Farmer cheese
Abstract: The objective of this work was to determine whether the effects of farming systems on the cheese sensory properties are reduced when the milk used to make cheese is pasteurised. The milk of cows reared under two grazing systems (extensive and semi-extensive) was processed into raw and pasteurised milk cheeses. These grazing systems were mainly differentiable by the milk fatty acid (FA) composition and, to a lesser extent, by their levels of lactic acid bacteria, which were higher in milk from the extensive grazing system. In cheese, the different FA composition persisted and affected the texture of the cheese regardless of the milk treatment. The effects of each grazing system were indistinguishable in several cheese characteristics (proteolysis, texture, and aroma) after pasteurisation. In contrast, among pasteurised milk cheeses, those resulting from an extensive system had greyer rinds, while no difference in rind colour was observed among raw milk cheeses.
Published: 2017

341. Une nouvelle approche méthodologique pour piloter la conduite en élevage

Author: Marie-Pierre Ellies, Gonzalo Cantalapiedra Hijar, Denis Durand, Dominique Gruffat, Anne Listrat, Didier Micol, Isabelle Ortigues Marty, Jean-François Hocquette, Marie Chavent, Jerôme Saracco, Brigitte Picard, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de Mathématiques de Bordeaux ( IMB ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université de Bordeaux ( UB ) -Institut Polytechnique de Bordeaux ( Bordeaux INP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Bordeaux Sciences Agro [Gradignan], Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine ( Bordeaux Sciences Agro ), Quality control and dynamic reliability ( CQFD ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université de Bordeaux ( UB ) -Institut Polytechnique de Bordeaux ( Bordeaux INP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université de Bordeaux ( UB ) -Institut Polytechnique de Bordeaux ( Bordeaux INP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Inria Bordeaux - Sud-Ouest, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut de Mathématiques de Bordeaux (IMB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Quality control and dynamic reliability (CQFD), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Bordeaux - Sud-Ouest, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Bordeaux - Sud-Ouest, and Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro)
Subjects: analyse de données, pilotage, conduite d'élevage, statistical method, regroupement de variable, clustOfVar, méthode statistique, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], data analysis, livestock management
Abstract: Cet article fait référence à une étude publiée en fin d’année 2016 dans la revue Meat Science (122, 163-172). Afin de trouver un compromis entre les attentes des producteurs, des transformateurs et des consommateurs, les auteurs ont cherché à déterminer dans quelle mesure il est possible de piloter les performances des animaux par le biais des pratiques d’élevage, tout en préservant les qualités sensorielles et la valeur santé des viandes. Pour cela, une méthode statistique innovante a été utilisée : la classification de variables. Les données de 71 taurillons du projet européen ProSafeBeef ont été organisées en 3 jeux de données caractérisant respectivement les performances animales (36 variables), les qualités sensorielles (29 variables) et la valeur nutritionnelle des viandes (32 variables). Par la construction de 5 index synthétiques pour chaque élément du triptyque (combinaisons linéaires d’un sous-ensemble de variables constituant un pool homogène), la méthode a permis de supprimer l’information redondante et ainsi de réduire l’information des 97 variables en 15 index synthétiques. Un second regroupement de variables a ensuite été réalisé sur ces 15 index synthétiques afin de mettre en évidence les proximités entre les 3 jeux de données. L’analyse a montré qu’il n’existe pas d’opposition entre efficience animale et valeur nutritionnelle des viandes. Il est donc possible d’obtenir des animaux efficients (c’est-à-dire avec de meilleurs gains de poids et d’efficacité alimentaire) associant des carcasses à haute valeur bouchère (correspondant à un meilleur développement musculaire) et des viandes relativement riches en acides gras polyinsaturés. En revanche, l‘efficience alimentaire et le développement musculaire sont apparus négativement corrélés avec les qualités sensorielles des viandes (notamment la tendreté et l’appréciation globale). La classification de variables est une méthode d’analyse de données fréquemment employée dans certains domaines mais elle n’avait jamais été utilisée en sciences animales. D’après les résultats obtenus, cette approche pourrait s’avérer être un outil efficace pour intégrer différents concepts dans un pilotage optimisé de l’élevage pour les productions animales., This work initially published in Meat Science (122, 163-172) in 2016 provides a new methodological approach to establish the links between different data sets, by using a variable clustering procedure instead of a classical individual clustering approach. Three data sets (animal performance, nutritional value of the meat, sensory quality traits of meat) were considered for a total of 97 variables for each of the 71 young bulls. Variables of each dataset were arranged into homogeneous synthetic variables. Then, the three pools of synthetic variables were analysed together to establish the links existing among the three data sets. Classification showed no opposition between animal performances and nutritional value of meat, as it seemed possible to identify animals with a high butcher value and intramuscular fat relatively rich in polyunsaturated fatty acids. However, the classification indicated that animal performances were negatively correlated with sensory quality of meat. This method appeared to be a useful contribution to the management of animal breeding for an optimal trade-off between the three elements of the triptych (animal performances, nutritional value and sensory quality of meat).
Published: 2017

342. The study of protein biomarkers to understand the biochemical processes underlying beef color development in young bulls

Author: Brigitte Picard, E.M. Claudia Terlouw, Mohammed Gagaoua, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, EU FP6 Integrated Project ProSafeBeef FOODCT-2006-36241 AQ284, European Union council, and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: Male, couleur de la viande, Protein biomarkers, processus biochimique, [SDV]Life Sciences [q-bio], Paraspinal Muscles, Longissimus Thoracis, Color, Muscle Proteins, young bulls, bœuf, Breeding, Biology, 0404 agricultural biotechnology, taurillon, Animals, biological mechanisms, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, 0402 animal and dairy science, food and beverages, biomarkers, Regression analysis, 04 agricultural and veterinary sciences, regress, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, beef, Heat stress, Biotechnology, meat color, Red Meat, bull calf, régression, Evolutionary biology, protéine, biomarker, Cattle, business, protein, Color coordinates, biomarqueur, Muscle Contraction, Food Science
Abstract: This study investigates relationships between 21 biomarkers and meat color traits of Longissimus thoracis muscles of young Aberdeen Angus and Limousin bulls. The relationships found allowed to propose metabolic processes underlying meat color. The color coordinates were related with several biomarkers. The relationships were in some cases breed-dependent and the variability explained in the regression models varied between 31 and 56%. The correlations between biomarkers and color parameters were sometimes opposite between breeds. The PCA using the 21 biomarkers and the instrumental color coordinates showed that these variables discriminated efficiently between the two studied breeds. Results are coherent with earlier studies on other beef breeds showing that several proteins belonging to different but partly related biological pathways involved in muscle contraction, metabolism, heat stress and apoptosis are related to beef color. The results suggest that in future, biomarkers may be used to classify meat cuts sampled early post-mortem according to their forthcoming color.
Published: 2017

343. Compte-rendu du second congrès intitulé 'Qualité durable de la viande bovine en Europe'

Author: Hocquette, Jean-François, Farmer, Linda, Straif, Kurt, De Smet, Stefaan, Russo, Vincenzo, Roehe, Rainer, Moloney, Aidan, Farrell, David, Polkinghorne, Rod, Wierzbicki, Jerzy, Searchinger, Tim, Zhang, Dequan, Capri, Ettore, Ferrari, Paolo, Birnie, Jonathan, Viganò, Valeria, McDonnell, Ciara K, Hadley, Phil, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agri-Food and Biosciences Institute, International Agency for Cancer Research (IACR), LANUPRO, Ghent University [Belgium] (UGENT), Department of Agricultural and Food Sciences, School of Agriculture and Veterinary Medicine, University of Bologna, Roslin Institute Building, Scotland's Rural College (SCUR), Animal and Grassland Research and Innovation Centre, Teagasc Food Research Centre [Fermoy, County Cork, Ireland], Birkenwood Pty Ltd, 431, Independent, Polish Beef Association, Princeton's Woodrow Wilson School of Public and International Affairs, Princeton University, Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), Catholic University of the Sacred Heart, Research Centre for Animal Production (CRPA), Dunbia, Sealed Air Packaging, Agriculture and Horticulture Development Board, AHDB Beef and Lamb, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), International Agency for Research on Cancer, Ghent University [Belgium] ( UGENT ), Scotland’s Rural College, Teagasc Food Research Centre, Chinese Academy of Agricultural Sciences, National Institute of Food Science and Technology, Research Centre for Animal Production ( CRPA ), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT), Scotland's Rural College (SRUC), and Teagasc Food Research Centre [Fermoy, Ireland]
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], viande bovine, qualité, [SDV]Life Sciences [q-bio], qualité sensorielle, qualité de la viande, bien-être animal, beef, animal welfare
Abstract: Le « Agri-Food and Biosciences Institute (AFBI) » a récemment organisé un workshop européen à Milan pour discuter des principaux défis auxquels la filière viande bovine est confrontée, avec plus de 80 personnes issues de la communauté scientifique ou de la filière au niveau européen. La réunion a été organisée par l'AFBI avec l'Université de Milan et financée par le « UK Science and Innovation Network ». L'objectif global de la réunion était de renforcer les liens et les échanges de connaissances entre les scientifiques et les professionnels de la filière à travers l'Europe sur les principaux défis auxquels est confrontée la filière viande bovine. Quatre sessions avec des courtes conférences ont porté sur quatre sujets importants concernant la viande bovine (nutrition humaine, qualité sensorielle, environnement et bien-être animal, valeur ajoutée le long de la filière) tandis que deux ateliers ont permis aux participants de discuter des questions soulevées et de faire part de leurs commentaires. Les conférenciers issus de la communauté scientifique ou de la filière de différents pays d'Europe, des États-Unis, de Chine et d'Australie ont abordé un large éventail de sujets. Cet article présente un résumé de ces présentations et des résultats des ateliers., The Agri-Food and Biosciences Institute (AFBI) recently convened a European Workshop in Milan to discuss some of the key challenges facing the beef industry, with more than 80 people from the beef industry and research communities across Europe attending. The meeting was organised by AFBI with the University of Milan, funded by the UK Science and Innovation Network. The overall goal of the meeting was to strengthen links and exchange knowledge between scientists and industry representatives across Europe on some of the key challenges facing the beef industry. Four sessions of short talks addressed four key topics (Beef and Human Health, Eating Quality, Environment and welfare, Adding value throughout the supply chain), while two extended workshops provided delegates the opportunity to discuss the issues raised and contribute their comments. Expert speakers from research and industry from Europe and also USA, China and Australia covered a wide range of topics. This article presents a summary of these presentations and the outcomes of the workshops. Presentations are available on the following link.
Published: 2017

344. Microbiological changes during the preparation steps of Khliaa Ezir: a traditional cured meat product of Algeria

Author: Mohammed Gagaoua, Zahra Bennaceur, Kahina Hafid, Abdelghani Boudjellal, Meriem Sellama, Ines Nasri, Hiba-Ryma Boudechicha, Equipe Maquav, INATAA, Université Mentouri Constantine [Algérie] (UMC), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université des Frères Mentouri (Constantine 1), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 2. Zero hunger, Ethnic meat product, meat plant, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, bactérie lactique, 0402 animal and dairy science, food and beverages, microbiological safety, 04 agricultural and veterinary sciences, Biology, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, lactic acid bacteria, Algérie, 0404 agricultural biotechnology, Microbiological changes, Alimentation et Nutrition, Khliaa Ezir, Food and Nutrition, sécurité microbiologique des aliments, Food science, Product (category theory), [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, charcuterie
Abstract: Khliaa Ezir is a traditional and popular meat product, which is produced from whole beef, camel, goat or lamb meat. It is an Algerian and a ready to eat meat product that is marinated, cooked and ripened. The product is for numerous months preserved in an earthenware jar at room temperature. Microbiological investigation on Khliaa Ezir during preparation is a prerequisite and to our knowledge, this is the first study, which provide its preliminary microbiological characterization. Thus, the aim of the present work is to study the evolution of the microflora and microbiological safety of Khliaa Ezir during the main traditional preparation steps. The microbiological counts indicated that Lactic Acid Bacteria (LAB) are the most abundant in the product, namely during the repining and storage period. However, total Coliforms were very low in fresh beef, being eliminated after 3 days of curing. Yeasts and Molds were the highest in fresh beef, and then disappeared after cooking and during the ripening and storage step. None of the pathogenic flora during the whole preparation steps were detected. We think that the cooking temperature applied during thermal treatment (80°C) contributed to the high hygienic quality of Khliaa Ezir. On another hand, a significant increase in pH was observed during the storage period to achieve a final pH of 6.19 ± 0.01 at 30 days of storage.
Published: 2017

345. Invited review: Large-scale indirect measurements for enteric methane emissions in dairy cattle: A review of proxies and their potential for use in management and breeding decisions

Author: Hélène Soyeurt, Jan Dijkstra, Richard J. Dewhurst, S. van Gastelen, E. Negussie, Diego P. Morgavi, Y. de Haas, Filippo Biscarini, Nicolas Gengler, Frédéric Dehareng, Tianhai Yan, Biometric Genetic, Green Technology, Natural resources institute Finland, Animal breeding and genetics group, Valorisation Agricole Production, Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), Scotland's Rural College (SRUC), Animal Nutrition Group, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Agricuture Chemical and bioengineering, Université de Liège, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Agri Food and Biosciences Institute, Department of Bioinformatics, Faculty Bioscience and Technology Food Agriculture and Environment, University of Teramo (UT), networks of COST Action FA1302 'Large-scale methane measurements on individual ruminants for genetic evaluations', COST Action of the European Union FA1302, Natural Resources Institute Finland, Scotland's Rural College (SCUR), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Walloon Agricultural Research Center, Scotland’s Rural College, Wageningen University and Research Centre [Wageningen] ( WUR ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and University of Teramo ( UT )
Subjects: 0301 basic medicine, Animal Nutrition, breeding, dairy cattle, enteric methane, management, proxy, Breeding, [ SDV.BA ] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Proxy (climate), Enteric methane, Milk yield, Statistics, gestion, méthane, Animal biology, 2. Zero hunger, Ecology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, 04 agricultural and veterinary sciences, Diervoeding, Management, Milk, Female, Methane, Animal Breeding & Genomics, Autre (Sciences du Vivant), [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], Rumen, Biology, reproduction, 03 medical and health sciences, Biologie animale, Covariate, Genetics, Dairy cattle, Animals, Lactation, [ SDV.OT ] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], Fokkerij & Genomica, 0402 animal and dairy science, 040201 dairy & animal science, Proxy, 030104 developmental biology, bovin laitier, 13. Climate action, marsh gas, WIAS, Carbon footprint, Predictive power, Animal Science and Zoology, Cattle, Research setting, Food Science
Abstract: [object Object]Efforts to reduce the carbon footprint of milk produc- tion through selection and management of low-emitting cows require accurate and large-scale measurements of methane (CH 4 ) emissions from individual cows. Several techniques have been developed to measure CH 4 in a re- search setting but most are not suitable for large-scale recording on farm. Several groups have explored prox- ies (i.e., indicators or indirect traits) for CH 4 ; ideally these should be accurate, inexpensive, and amenable to being recorded individually on a large scale. This review (1) systematically describes the biological basis of current potential CH 4 proxies for dairy cattle; (2) assesses the accuracy and predictive power of single proxies and determines the added value of combining proxies; (3) provides a critical evaluation of the relative merit of the main proxies in terms of their simplicity, cost, accuracy, invasiveness, and throughput; and (4) discusses their suitability as selection traits. The prox- ies range from simple and low-cost measurements such as body weight and high-throughput milk mid-infrared spectroscopy (MIR) to more challenging measures such as rumen morphology, rumen metabolites, or microbi- ome profiling. Proxies based on rumen samples are gen- erally poor to moderately accurate predictors of CH 4 , and are costly and difficult to measure routinely on- farm. Proxies related to body weight or milk yield and composition, on the other hand, are relatively simple, inexpensive, and high throughput, and are easier to implement in practice. In particular, milk MIR, along with covariates such as lactation stage, are a promising option for prediction of CH 4 emission in dairy cows. No single proxy was found to accurately predict CH 4 , and combinations of 2 or more proxies are likely to be a better solution. Combining proxies can increase the accuracy of predictions by 15 to 35%, mainly because different proxies describe independent sources of varia- tion in CH 4 and one proxy can correct for shortcomings in the other(s). The most important applications of CH 4 proxies are in dairy cattle management and breed- ing for lower environmental impact. When breeding for traits of lower environmental impact, single or multiple proxies can be used as indirect criteria for the breeding objective, but care should be taken to avoid unfavor- able correlated responses. Finally, although combina- tions of proxies appear to provide the most accurate estimates of CH 4 , the greatest limitation today is the lack of robustness in their general applicability. Future efforts should therefore be directed toward developing combinations of proxies that are robust and applicable across diverse production systems and environments.
Published: 2017

346. Animal consciousness

Author: Le Neindre, Pierre, Bernard, Emilie, Boissy, Alain, Boivin, Xavier, Calandreau, Ludovic, Delon, Nicolas, Deputte, Bertrand, Desmoulin‐Canselier, Sonia, Dunier-Thomann, Muriel, Faivre, Nathan, Giurfa, Martin, Guichet, Jean-Luc, Lansade, Léa, Larrère, Raphaël, Mormède, Pierre, Prunet, Patrick, Schaal, Benoist, SERVIERE, Jacques, Terlouw, Claudia, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] ( PRC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environmental Studies and Animal Studies, New York University, Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort, Droit et changement social ( DCS ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Nantes ( UN ), Unité Prospective ( PROSPECTIVE ), Centre d'économie de la Sorbonne ( CES ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Panthéon-Sorbonne ( UP1 ), UMR 5169 Centre de recherches sur la cognition animale, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ), CAREF Ecole supérieure du professorat et de l’éducation de Beauvais, Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), UR Ritme, GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), AgroParisTech, EFSA-Q-2015-00390, European Food Safety Authority, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), New York University [New York] (NYU), NYU System (NYU)-NYU System (NYU), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), Droit et changement social (DCS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes - UFR Droit et Sciences Politiques (UFR DSP), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Délégation à l'Expertise scientifique collective, à la Prospective et aux Etudes (UAR), Centre d'économie de la Sorbonne (CES), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre Amiénois de Recherche en Education et Formation - UR UPJV 4697 (CAREF), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Risques, Travail, Marchés, Etat (RiTME), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Commanditaire : European Food Safety Authority (Italy), Type de commande : Commande avec contrat/convention/lettre de saisine, Type de commanditaire ou d'auteur de la saisine : Organisations européennes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes (UN), Unité Prospective (PROSPECTIVE), Université Panthéon-Sorbonne (UP1)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université de Nantes - UFR Droit et Sciences Politiques (UFR DSP), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], épistémologie, cognition animale, adaptation animale, conscience, Awareness, perception, consciousness, phylogeny, comportement animal, Philosophy, Neurobiology, neurobiologie, phylogénie, Behaviour, pain, animal, douleur, Adaptation, [ SDV.OT ] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT]
Abstract: After reviewing the literature on current knowledge about consciousness in humans, we present a state-of-the art discussion on consciousness and related key concepts in animals. Obviously much fewer publications are available on non-human species than on humans, most of them relating to laboratory or wild animal species, and only few to livestock species. Human consciousness is by definition subjective and private. Animal consciousness is usually assessed through behavioural performance. Behaviour involves a wide array of cognitive processes that have to be assessed separately using specific experimental protocols. Accordingly, several processes indicative of the presence of consciousness are discussed: perception and cognition, awareness of the bodily-self, self-related knowledge of the environment (including social environment). When available, specific examples are given in livestock species. Next, we review the existing evidence regarding neuronal correlates of consciousness, and emphasize the difficulty of linking aspects of consciousness to specific neural structures across the phyla because high-level cognitive abilities may have evolved independently along evolution. Several mammalian brain structures (cortex and midbrain) are involved in the manifestations of consciousness, while the equivalent functional structures for birds and fishes would likely be the pallium/tectum and midbrain. Caution is required before excluding consciousness in species not having the same brain structures as the mammalian ones as different neural architectures may mediate comparable processes. Finally, specific neurophysiological mechanisms appear to be strongly linked to the emergence of consciousness, namely neural synchrony and neural feedback. Considering the limited amount of data available and the few animal species studied so far, we conclude that different manifestations of consciousness can be observed in animals but that further refinement is still needed to characterize their level and content in each species. Further research is required to clarify these issues, especially in livestock species.
Published: 2017

347. Unique and highly variable bacterial communities inhabiting the surface microlayer of an oligotrophic lake

Author: Didier Debroas, Mylène Hugoni, Agnès Vellet, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne ( LMGE ), Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), and Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, 030106 microbiology, lake pavin, surface microlayer, Aquatic Science, Biology, écosystème, diversity, 03 medical and health sciences, [ SDV.MP ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Epilimnion, epilimnion, séquençage à haut débit, 14. Life underwater, Trophic state index, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, diversité, ecosystem, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Ecology, Community structure, 6. Clean water, communauté bactérienne, lac pavin, 030104 developmental biology, Oceanography, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, community structure, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: Surface microlayers (SMLs) play a key role in regulating air-water gas exchange. Few studies have investigated bacterial diversity in this particular zone in freshwater ecosystems compared to that of the epilimnetic water layer, using high-throughput sequencing technologies. The present study examined bacterial community structures in the SML and the epilimnion layers of an oligotrophic high mountain lake, Lake Pavin, France. These 2 habitats harboured distinct bacterial communities, with higher temporal variation observed in the structure of the bacterial community in the SML than in the epilimnion. This arrangement might result from aerosol deposition and/or different levels of solar radiation impacting the lake surface. The presence of typical freshwater bacterial assemblages (i.e. Alphaproteobacteria LD12 lineage, and Actinobacteria AcI clade) in the epilimnion was also examined. In contrast, the SML was clearly enriched in Alpha proteo-bacteria (i.e. Rhodospirillales and Sphingomonadales), Gammaproteobacteria (i.e. Pseudo-monadales), and Firmicutes (i.e. Clostridiales). Notably, analyses conducted on indicator species revealed that Propionibacterium and Acinetobacter were characteristic in the SML, whereas operational taxonomic units in the epilimnion showed greater diversity. SMLs present a specific bacterial community composition that might originate from the surrounding environment, raising questions about the metabolic adaptations of these organisms in this particular environment.
Published: 2017

348. La conscience animale: Une expertise scientifique collective de l’Inra

Author: Le Neindre, Pierre, Dunier-Thomann, Muriel, Boissy, Alain, BERNARD, Emilie, Boivin, Xavier, Calandreau, Ludovic, Delon, Nicolas, Deputte, Bertrand, Desmoulin‐Canselier, Sonia, Faivre, Nathan, Giurfa, Martin, Guichet, Jean‐Luc, Lansade, Léa, Larrère, Raphaël, Mormède, Pierre, Prunet, Patrick, Schaal, Benoist, SERVIERE, Jacques, Terlouw, Claudia, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Prospective (PROSPECTIVE), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Environmental Studies and Animal Studies, New York University [New York] (NYU), NYU System (NYU)-NYU System (NYU), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), Droit et changement social (DCS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes (UN), Centre d'économie de la Sorbonne (CES), Université Panthéon-Sorbonne (UP1)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, CAREF Ecole supérieure du professorat et de l’éducation de Beauvais, Université de Picardie Jules Verne (UPJV), UR Ritme, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] (CSGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), AgroParisTech, EFSA-Q-2015-00390, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Risques, Travail, Marchés, Etat (RiTME), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Prospective ( PROSPECTIVE ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] ( PRC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), New York University, Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort, Droit et changement social ( DCS ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Nantes ( UN ), Centre d'économie de la Sorbonne ( CES ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Panthéon-Sorbonne ( UP1 ), UMR 5169 Centre de recherches sur la cognition animale, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation [Dijon] ( CSGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC )
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], philosophy, neurobiology, expertise collective, conscience, bien-être animal, adaptation, consciousness, behaviour, animal welfare, neurobiologie, awareness, pain, animal, douleur, [ SDV.OT ] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT]
Abstract: Ce dossier a préalablement été publié par l’Inra sur son site : http://institut.Inra.fr/Missions/Eclairer-les-decisions/Expertises/Toutes-les-actualites/Conscience-animale; This paper presents the outcome of a scientific multidisciplinary assessment on animal consciousness carried out by Inra from 2015 to 2017. The experts, produced in a 169 pages report in English, an exhaustive analysis of the scientific and philosophical knowledge available in the international literature. It first describes the knowledge about humans in which the concepts and tools describing consciousness have been developed. The available data on animals are much less numerous, but they make it possible to draw firm conclusions, even if they still require more data. Most of the reported results were obtained on laboratory and wild vertebrates and little on livestock species. Consciousness is defined as the subjective experience that the animal has of its environment and of its own knowledge. The overall view of the behavioral, cognitive and neurobiological studies analyzed in the report tends to show the existence of elaborate consciousness contents in the species studied. The consequences for animals of the presence of consciousness on pain and on ethical behavior towards them are presented. Additional researches should complement existing ones, particularly on farmed species.; Ce dossier présente les résultats d’une expertise scientifique collective sur la conscience animale réalisée par l’Inra en 2015-2017. Les experts ont produit dans un rapport de 169 pages en anglais une analyse exhaustive des connaissances scientifiques et philosophiques disponibles dans la littérature internationale. Il décrit tout d’abord les connaissances sur les humains où ont été élaborés les concepts et les outils décrivant la conscience. Les données disponibles sur les animaux sont beaucoup moins nombreuses mais elles permettent cependant de tirer des conclusions solides, même si elles demandent à être confortées. La plupart des résultats rapportés ont été obtenus sur des vertébrés de laboratoire ou sauvages et peu sur les espèces de rente. La conscience est définie comme l’expérience subjective que l’animal a de son environnement et de ses propres connaissances. La vision d’ensemble des études comportementales, cognitives et neurobiologiques analysées dans le rapport tend à montrer l’existence de contenus élaborés de conscience chez les espèces étudiées. Les conséquences pour les animaux de la présence d’une conscience sur la douleur et sur les conduites éthiques vis-à-vis d’eux sont présentées. Des recherches supplémentaires devront compléter celles existantes, particulièrement sur les espèces d’élevage.
Published: 2017

349. La qualité sensorielle n'a pas de relation avec la qualité des carcasses bovines

Author: Bonny, Sarah, Legrand, Isabelle, Pethick, David, Wierzbicki, Jerzy, Allen, Paul, Farmer, Linda, Polkinghorne, Rod, Gardner, Graham, Hocquette, Jean-François, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Service Qualité des Viandes, Institut de l'élevage (IDELE), School of Veterinary and Life Sciences [Murdoch], Murdoch University, Polish Beef Association, Teagasac Food Research Centre, Agri-Food and Biosciences Institute, 431 Timor Road, Murrurundi, Independent, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de l'Elevage, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: bovin, classification de carcasse, consommateur, qualité en bouche, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], classification, [SDV]Life Sciences [q-bio], qualité sensorielle, carcasse, carcass
Abstract: La variabilité de la tendreté est considérée comme un facteur majeur expliquant la diminution de la consommation et de la part de marché de la viande bovine. La classification des carcasses par le système EUROP permet de déterminer la valeur économique des carcasses dans toute l’Europe. Cette étude publiée dans Animal (2016) 10:6, pp 996–1006 s’est intéressée aux relations entre les critères de classification des carcasses et la qualité sensorielle de la viande bovine. Un total de 3786 consommateurs naïfs français, polonais, irlandais et d’Irlande du nord a évalué des steaks grillés à point ou bien cuits et issus de 17 pièces de boucherie différentes prélevées sur 455 carcasses. Les consommateurs ont noté la tendreté, la flaveur, la jutosité et l’appréciation globale sur une échelle de 0 à 100 selon les protocoles du système « Meat Standards Australia ». Une relation négative a été observée entre la jutosité et la conformation des carcasses. Pour les autres critères, une relation négative avec la conformation des carcasses a été observée au plus pour trois des pièces de boucherie sur les 17 étudiées. Une relation positive entre l’engraissement des carcasses et la note de tendreté a été observée pour seulement 3 des 17 pièces de boucherie analysées. Cependant, ces relations sont entièrement expliquées par la note de persillé. Ainsi, le système de classification européen des carcasses n'a pas de relation marquée avec les notes d’analyse sensorielle de la viande. Il ne peut donc être utilisé pour rémunérer les éleveurs sur la qualité perçue par le consommateur., European conformation and fat grades are a major factor determining carcass value throughout Europe. In this study published in Animal (2016) 10:6, pp 996–1006 the relationships between these scores and sensory scores were investigated. A total of 3786 French, Polish and Irish consumers evaluated steaks, grilled to a medium or a well-done doneness, according to protocols of the “Meat Standards Australia” system, from seventeen muscles representing 455 local, commercial cattle from commercial abattoirs. A mixed linear effects model was used for the analysis. There was a negative relationship between juiciness and European conformation score. For the other sensory scores, a maximum of three muscles out of a possible 17 demonstrated negative effects of conformation score on sensory scores. There was a positive effect of European fat score on three individual muscles. However, this was accounted for by marbling score. Thus, while the European carcass classification system may indicate yield, it has no consistent relationship with sensory scores at a carcass level. It is thus not suitable to pay livestock producers according to eating quality of beef as perceived by consumers.
Published: 2017

350. Peut-on penser en commun les biens communs territoriaux ? Une approche par le récit

Author: Lelli, Laurent, LELLI, Laurent, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Billom communauté, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: [SHS.GEO] Humanities and Social Sciences/Geography, Territoire, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography, Bien commun
Abstract: National audience
Published: 2017

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