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301. Aurone derivatives as promising antibacterial agents against resistant Gram-positive pathogens

Author: Basile Pérès, Marc Maresca, Hamza Olleik, Akram Hijazi, Josette Perrier, Samir Yahiaoui, Ahcène Boumendjel, Elias Baydoun, Brayan Roulier, Elise Courvoisier-Dezord, Romain Haudecoeur, Josette Raymond, Institut des Sciences Moléculaires de Marseille (ISM2), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physique et mécanique des milieux hétérogenes (UMR 7636) (PMMH), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Institut de Chimie de Strasbourg, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), American University of Beirut [Beyrouth] (AUB), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Département de pharmacochimie moléculaire (DPM ), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-17-EURE-0003,CBH-EUR-GS,CBH-EUR-GS(2017), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physique et mécanique des milieux hétérogenes (PMMH), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-ESPCI ParisTech-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Cochin [AP-HP], Département de pharmacochimie moléculaire (DPM), and Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Selective inhibition, Gram-Positive Bacteria, 01 natural sciences, Microbiology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Structure-Activity Relationship, Therapeutic index, Drug Discovery, Aurone, Cytotoxicity, 030304 developmental biology, Gram, Benzofurans, Pharmacology, 0303 health sciences, biology, 010405 organic chemistry, Chemistry, Organic Chemistry, Cell Membrane, General Medicine, biology.organism_classification, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, 3. Good health, 0104 chemical sciences, Anti-Bacterial Agents, Pseudomonas aeruginosa, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Antibacterial activity, Bacteria
Abstract: International audience; A set of variously substituted aurones was synthesized and evaluated against Methicillin-Resistant S. aureus (MRSA) and P. aeruginosa. Several analogues were found active against MRSA, but no effect was recorded against P. aeruginosa. Compounds 27, 30 and 33 showed low cytotoxicity, and were tested against a full range of bacterial (Gram-positive and Gram-negative) and fungal species, including resistant strains. These aurones displayed a selective inhibition of Gram-positive bacteria with excellent Therapeutic Index values, while showing no significant action on several Gram-negative strains, H. pylori and V. alginolyticus being the only susceptible strains among the Gram-negative bacteria tested. A per-meabilization assay showed that the antibacterial activity of at least some of the aurones could be linked to alterations of the bacterial membrane. Overall, this study endorses the use of the aurone scaffold for the development of new potent and selective antibacterial agents.
Published: 2018
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302. Rapid crack propagation in PA11: An application to pipe structure

Author: Jean-Benoit Kopp, Christophe Fond, Gilles Hochstetter, Institut de Mécanique et d'Ingénierie de Bordeaux (I2M), École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), Université Louis Pasteur - Strasbourg 1 (ULP), Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Arkema (Arkema), Administrateur Ensam, Compte De Service, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), and Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [PHYS]Physics [physics], Toughness, Materials science, Physique, Mechanical Engineering, Numerical analysis, media_common.quotation_subject, Fracture mechanics, 02 engineering and technology, Mechanics, 021001 nanoscience & nanotechnology, Branching (polymer chemistry), Inertia, Kinetic energy, [PHYS] Physics [physics], 020303 mechanical engineering & transports, 0203 mechanical engineering, Mechanics of Materials, Surface roughness, General Materials Science, Boundary value problem, 0210 nano-technology, media_common, Rapid crack propagation Dynamic fracture Energy release rate Polyamide Pipes Finite element Inertial effects Fracture surface roughness
Abstract: Dynamic fracture mechanism in Polyamide 11 (PA11) material has been described at laboratory scale to access to an intrinsic material parameter. A liquid transportation application is considered with polymer pipes. A preliminary numerical analysis of the rapid crack propagation (RCP) in polymer pipe is firstly realised. Two boundary conditions, imposed displacement or pressure, are numerically investigated. The work of external forces is not negligible for pressurized polymer pipe. A reliable estimate of the dynamic energy release rate G Id is in this last case not guaranteed. To limit unwanted structural effects a specific experimental device has been used to ensure a permanent regime of RCP in Pre-Stressed Pipe Specimen (PS2). Experimental dynamic fracture tests are realised with Polyamide 11 PS2. Dynamic instabilities inducing “ring-off” and “snake” mechanisms which could appear during full-scale test are not observed with this new test. A finite element procedure is used to estimate the material toughness G ID of PA11. Knowing the crack tip location during RCP inertia effects (i.e. kinetic energy) are quantified. The mean crack tip velocity is observed not to change in PA11 whatever the crack configuration (branching or not). This velocity is known to be the crack branching velocity ( ≈ 0.6 c R ). The average dynamic energy release rate 〈 G ID 〉 is equal to 1.5 ± 0.1 kJ m−2 at the crack branching velocity. The non-trivial fracture surface roughness is observed with a scanning electron microscope.
Published: 2018

303. Social environment mediates cancer progression in Drosophila

Author: Dawson, Erika H., Bailly, Tiphaine P. M., Dos Santos, Julie, Moreno, Céline, Devilliers, Maëlle, Maroni, Brigitte, Sueur, Cédric, Casali, Andreu, Ujvari, Beata, Thomas, Frederic, Montagne, Jacques, Mery, Frederic, Unité de modélisation mathématique et informatique des systèmes complexes [Bondy] (UMMISCO), Université de Yaoundé I-Institut de la francophonie pour l'informatique-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Université Gaston Bergé (Saint-Louis, Sénégal)-Université Cadi Ayyad [Marrakech] (UCA)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord]), Évolution, génomes, comportement et écologie (EGCE), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-IRD-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Ecologie, Physiologie et Ethologie (DEPE-IPHC), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), ANR-13-BSV7-0003,EVOCAN,Evolution de la résistance naturelle au cancer : le paradoxe de Peto revisité(2013), ANR-12-BSV7-0013,DrosoNet,DrosoNet: utilisation de l'analyse des réseaux sociaux pour la compréhension de la diffusion et du maintient de la transmission sociale chez la Drosophile(2012), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord])-Institut de la francophonie pour l'informatique-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Université Gaston Bergé (Saint-Louis, Sénégal)-Université Cadi Ayyad [Marrakech] (UCA)-Université de Yaoundé I-Sorbonne Université (SU), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IRD-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)
Subjects: Tumor Suppressor Proteins, Science, [SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, Aucun, Social Environment, Article, Cytoskeletal Proteins, Intestinal Neoplasms, [SDE]Environmental Sciences, Disease Progression, Animals, Drosophila Proteins, lcsh:Q, Drosophila, [MATH]Mathematics [math], lcsh:Science, Colorectal Neoplasms
Abstract: The influence of oncogenic phenomena on the ecology and evolution of animal species is becoming an important research topic. Similar to host–pathogen interactions, cancer negatively affects host fitness, which should lead to the selection of host control mechanisms, including behavioral traits that best minimize the proliferation of malignant cells. Social behavior is suggested to influence tumor progression. While the ecological benefits of sociality in gregarious species are widely acknowledged, only limited data are available on the role of the social environment on cancer progression. Here, we exposed adult Drosophila, with colorectal-like tumors, to different social environments. We show how subtle variations in social structure have dramatic effects on the progression of tumor growth. Finally, we reveal that flies can discriminate between individuals at different stages of tumor development and selectively choose their social environment accordingly. Our study demonstrates the reciprocal links between cancer and social interactions and how sociality may impact health and fitness in animals and its potential implications for disease ecology., There is some evidence that social context can mediate the progression of cancers. Here, the authors show that Drosophila flies housed in social isolation experienced faster cancer tumor progression than flies in groups, and that flies select for social environments that minimize cancer risk.
Published: 2018
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304. Rescoring of docking poses under Occam’s Razor: are there simpler solutions?

Author: Gilles Marcou, Malkeet Singh Bahia, Dragos Horvath, Alexandre Varnek, Hanoch Senderowitz, Michael Zhenin, Tectonique Moléculaire du Solide (TMS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Strasbourg, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Chimie de la matière complexe (CMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Computer science, Protein Conformation, Implicit solvation, occam, Ligands, 01 natural sciences, Occam's razor, Force field (chemistry), Docking, Machine Learning, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, Force Field Calculations, Drug Discovery, Desolvation, Physical and Theoretical Chemistry, Databases, Protein, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, computer.programming_language, Binding Sites, Proteins, 0104 chemical sciences, Computer Science Applications, Molecular Docking Simulation, 010404 medicinal & biomolecular chemistry, 030104 developmental biology, General purpose, Ranking, Docking (molecular), symbols, Thermodynamics, computer, Algorithm, Scoring, Software, [CHIM.CHEM]Chemical Sciences/Cheminformatics, Protein Binding
Abstract: Ligand affinity prediction from docking simulations is usually performed by means of highly empirical and diverse protocols. These protocols often involve the re-scoring of poses generated by a force field (FF) based Hamiltonian to provide either estimated binding affinities—or alternatively, some empirical goodness score. Re-scoring is performed by so-called scoring functions—typically, a reweighted sum of FF terms augmented by additional terms (e.g., desolvation/entropic penalty, hydrophobicity, aromatic interactions etc.). Sometimes, the scoring function actually drives ligand positioning, but often it only operates on the best scoring poses ranked top by the initial ligand positioning tool. In either of these rather intricate scenarios, scoring functions are docking-specific models, and most require machine-learning-based calibration. Therefore, docking simulations are less straightforward when compared to “standard” molecular simulations in which the FF Hamiltonian defines the energy, and affinity emerges as an ensemble average property over pools of representative conformers (i.e., the trajectory). Paraphrasing on Occam’s Razor principle, additional model complexity is only acceptable if demonstrated to bring a significant improvement of prediction quality. In this work we therefore examined whether the complexity inherent to scoring functions is indeed justified. For this purpose we compared sampler for multiple protein–ligand entities, a general purpose conformation sampler based on the AMBER/GAFF FF, complemented with continuum solvation terms, with several state of the art docking tools that rely on calibrated scoring functions (Glide, Gold, Autodock-Vina) in terms of its ability to top-rank the actives from large and diverse ligand series associated with various proteins. There is no clear winner of this study, where each program performed well on most of the targets, but also failed with respect to at least one of them. Therefore, a well-parameterized force field with a simple, energy-based ligand ranking protocol appears to be an as effective docking protocol as intricate rescoring strategies based on scoring functions. A tool that can sample the conformational space of the free ligand, the bound ligand and the protein binding site using the same force field may avoid many of the approximations common to contemporary docking protocols and allow e.g., for docking into highly flexible active sites, when current scoring functions are not well suited to estimate receptor strain energies.
Published: 2018
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305. Visualization and Analysis of Complex Reaction Data: The Case of Tautomeric Equilibria

Author: Timur I. Madzhidov, Dragos Horvath, Alexandre Varnek, Gilles Marcou, Igor I. Baskin, R. I. Nugmanov, Timur R. Gimadiev, Marta Glavatskikh, Chimie de la matière complexe (CMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Chémoinformatique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Tectonique Moléculaire du Solide (TMS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Strasbourg, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Quantitative structure–activity relationship, Mean squared error, Structure (category theory), Molecular Dynamics Simulation, 01 natural sciences, Set (abstract data type), 03 medical and health sciences, Isomerism, Structural Biology, Drug Discovery, Organic Chemicals, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Mathematics, Organic Chemistry, Regression analysis, Function (mathematics), 0104 chemical sciences, Computer Science Applications, Support vector machine, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, 010404 medicinal & biomolecular chemistry, 030104 developmental biology, Data point, Solvents, Molecular Medicine, Biological system, Algorithms, [CHIM.CHEM]Chemical Sciences/Cheminformatics
Abstract: Generative Topographic Mapping (GTM) approach was successfully used to visualize, analyze and model the equilibrium constants (KT ) of tautomeric transformations as a function of both structure and experimental conditions. The modeling set contained 695 entries corresponding to 350 unique transformations of 10 tautomeric types, for which KT values were measured in different solvents and at different temperatures. Two types of GTM-based classification models were trained: first, a "structural" approach focused on separating tautomeric classes, irrespective of reaction conditions, then a "general" approach accounting for both structure and conditions. In both cases, the cross-validated Balanced Accuracy was close to 1 and the clusters, assembling equilibria of particular classes, were well separated in 2-dimentional GTM latent space. Data points corresponding to similar transformations measured under different experimental conditions, are well separated on the maps. Additionally, GTM-driven regression models were found to have their predictive performance dependent on different scenarios of the selection of local fragment descriptors involving special marked atoms (proton donors or acceptors). The application of local descriptors significantly improves the model performance in 5-fold cross-validation: RMSE=0.63 and 0.82 logKT units with and without local descriptors, respectively. This trend was as well observed for SVR calculations, performed for the comparison purposes.
Published: 2018
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306. The Npa1p complex chaperones the assembly of the earliest eukaryotic large ribosomal subunit precursor

Author: Clément Joret, Régine Capeyrou, Kamila Belhabich-Baumas, Célia Plisson-Chastang, Rabea Ghandour, Odile Humbert, Sébastien Fribourg, Nicolas Leulliot, Simon Lebaron, Anthony K Henras, Yves Henry, Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote (LBME), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Acides Nucléiques : Régulations Naturelle et Artificielle (ARNA), Université de Bordeaux (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), French Ministry of Research PhD fellowship and Paul Sabatier University ATER contract [to CJ], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), The University of Toulouse, and Agence Nationale de la Recherche (ANR, http://www.agence-nationale-recherche.fr/) [ANR-2010-BLAN-1224 to YH]., ANR-10-BLAN-1224,RIBOPRE40S,Analyse structurale et fonctionnelle du processus de maturation des précurseurs de la petite sous-unité ribosomique eucaryote(2010), ULB-Cancer Research Centre, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Institut de biochimie et biophysique moléculaire et cellulaire (IBBMC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg (IPCMS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Réseau nanophotonique et optique, Bodescot, Myriam, and BLANC - Analyse structurale et fonctionnelle du processus de maturation des précurseurs de la petite sous-unité ribosomique eucaryote - - RIBOPRE40S2010 - ANR-10-BLAN-1224 - BLANC - VALID
Subjects: Models, Molecular, Ribosomal Proteins, Saccharomyces cerevisiae Proteins, lcsh:QH426-470, [SDV]Life Sciences [q-bio], Saccharomyces cerevisiae, Protein Structure, Secondary, Substrate Specificity, DEAD-box RNA Helicases, Escherichia coli, RNA Precursors, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, RNA, Small Nucleolar, Protein Interaction Domains and Motifs, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Nuclear Proteins, RNA-Binding Proteins, Ribosome Subunits, Large, Eukaryotic, Recombinant Proteins, lcsh:Genetics, RNA, Ribosomal, Peptidyl Transferases, Trans-Activators, RNA Helicases, Molecular Chaperones
Abstract: International audience; The early steps of the production of the large ribosomal subunit are probably the least understood stages of eukaryotic ribosome biogenesis. The first specific precursor to the yeast large ribosomal subunit, the first pre-60S particle, contains 30 assembly factors (AFs), including 8 RNA helicases. These helicases, presumed to drive conformational rearrangements, usually lack substrate specificity in vitro. The mechanisms by which they are targeted to their correct substrate within pre-ribosomal particles and their precise molecular roles remain largely unknown. We demonstrate that the Dbp6p helicase, essential for the normal accumulation of the first pre-60S pre-ribosomal particle in S. cerevisiae, associates with a complex of four AFs, namely Npa1p, Npa2p, Nop8p and Rsa3p, prior to their incorporation into the 90S pre-ribosomal particles. By tandem affinity purifications using yeast extracts depleted of one component of the complex, we show that Npa1p forms the backbone of the complex. We provide evidence that Npa1p and Npa2p directly bind Dbp6p and we demonstrate that Npa1p is essential for the insertion of the Dbp6p helicase within 90S pre-ribosomal particles. In addition, by an in vivo cross-linking analysis (CRAC), we map Npa1p rRNA binding sites on 25S rRNA adjacent to the root helices of the first and last secondary structure domains of 25S rRNA. This finding supports the notion that Npa1p and Dbp6p function in the formation and/or clustering of root helices of large subunit rRNAs which creates the core of the large ribosomal subunit RNA structure. Npa1p also crosslinks to snoRNAs involved in decoding center and peptidyl transferase center modifications and in the immediate vicinity of the binding sites of these snoRNAs on 25S rRNA. Our data suggest that the Dbp6p helicase and the Npa1p complex play key roles in the compaction of the central core of 25S rRNA and the control of snoRNA-pre-rRNA interactions.
Published: 2018
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307. Structural Insights into the Role of Diphthamide on Elongation Factor 2 in mRNA Reading-Frame Maintenance

Author: Sergey Melnikov, Eder Mancera-Martínez, Gulnara Yusupova, Marat Yusupov, Simone Pellegrino, A. Myasnikov, Angelita Simonetti, N. Demeshkina, Yaser Hashem, European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Institut de biologie moléculaire des plantes (IBMP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), National Research University of Information Technologies, Mechanics and Optics [St. Petersburg] (ITMO), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Architecture et réactivité de l'ARN (ARN), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Architecture et Réactivité de l'ARN (ARN), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Models, Molecular, Protein Conformation, [SDV]Life Sciences [q-bio], Saccharomyces cerevisiae, EEF2, Ribosome, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Peptide Elongation Factor 2, RNA, Transfer, Structural Biology, Protein biosynthesis, Histidine, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, RNA, Messenger, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Chemistry, Hydrolysis, Cryoelectron Microscopy, Diphthamide, Translation (biology), [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Cell biology, Elongation factor, 030104 developmental biology, Protein Biosynthesis, Transfer RNA, Guanosine Triphosphate, Eukaryotic Ribosome, Ribosomes
Abstract: One of the most critical steps of protein biosynthesis is the coupled movement of mRNA, which encodes genetic information, with tRNAs on the ribosome. In eukaryotes, this process is catalyzed by a conserved G-protein, the elongation factor 2 (eEF2), which carries a unique post-translational modification, called diphthamide, found in all eukaryotic species. Here we present near-atomic resolution cryo-electron microscopy structures of yeast 80S ribosome complexes containing mRNA, tRNA and eEF2 trapped in different GTP-hydrolysis states which provide further structural insights into the role of diphthamide in the mechanism of translation fidelity in eukaryotes.
Published: 2018
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308. Radiology information of patients in health services: Challenges, problemes and technological solutions

Author: Dona-Fernandez, Jesus M., Ruiz-Cruces, Rafael, Canete-Hidalgo, Sergio, [Dona-Fernandez, Jesus M.] Hosp Gen Malaga, Avda Carlos Haya S-N, Malaga 29010, Spain, [Ruiz-Cruces, Rafael] Ctr Invest Med Sanitarias Cimes, Bulevar Louis Pasteur 32, Malaga 29071, Spain, and [Canete-Hidalgo, Sergio] Ctr Invest Med Sanitarias Cimes, Bulevar Louis Pasteur 32, Malaga 29071, Spain
Subjects: Radiation protection, Patient safety, Health information, Health documentation, Information systems, Hospital information systems, Radiology information systems
Abstract: The information systems departments of European health services have the challenge of creating a dose record and reporting system of doses from medical procedures for its inclusion in the patient's medical history, in compliance with Directive 2013/59 Euratom, which determines the obligation to manage the measurement and evaluation of the doses as well as the evaluation of the risk associated therewith. It is important the fact that this information must be universal, because the main objective is that every patient be able to access all information about medical radiology exposures regardless of the equipment, center or organization where it has been performed. In this aerticle the main technological challenges and problems are presented and basic solutions are described to be applied in developing environments of record systems using the learned experience in the project for the measurement of doses derived from radiology explorations in Spain.
Published: 2018

309. Short-term propofol anaesthesia down-regulates clock genes expression in the master clock

Author: Laure Pain, Etienne Challet, Vincent-Joseph Poirel, Nawfel Ben-Hamouda, Garance Dispersyn, Paul Pévet, Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiopathologie clinique et expérimentale de la schizophrénie, and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, endocrine system, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology, Down-Regulation, Gene Expression, In situ hybridization, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, 030202 anesthesiology, Biological Clocks, Physiology (medical), Medicine, Animals, Anesthesia, Circadian rhythm, RNA, Messenger, Propofol, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, business.industry, Period Circadian Proteins, Hypothermia, 3. Good health, Circadian Rhythm, Rats, PER2, CLOCK, Darkness, Suprachiasmatic Nucleus, medicine.symptom, business, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, 030217 neurology & neurosurgery, PER1, medicine.drug, Transcription Factors
Abstract: Propofol anesthesia triggers phase-advances of circadian rhythms controlled by the suprachiasmatic nuclei (SCN), the master clock. Besides, inhalational anesthesia has been associated with a subsequent reduction of Per2 mRNA levels in the whole brain of rodents. The acute effects of propofol anesthesia per se on the SCN molecular clockwork remain unclear. Here we aim to study the expression of Per1 and Per2 clock genes in the SCN of rats exposed to constant darkness after a single dose of propofol. Thirty 2-months old rats were randomly divided into 2 groups receiving a single dose of either 120 mg/kg propofol 1% (n=15), or intralipid® 10% (n=15) in late day (projected circadian time (CT) 10, i.e., 10h after the expected time of lights on). Thereafter, rat brains were sampled in darkness 1h, 2h or 3h after the treatment (projected CT11, CT12 or CT13). Expression of Per1 and Per2 mRNA was analyzed by in situ hybridization in SCN coronal sections. Per1 expression was affected by time and treatment. Per1 expression in the SCN after propofol treatment decreased at CT11 and CT12 when compared to the vehicle group. For Per2 expression, we observed only a treatment effect. Observed in dark conditions without hypothermia or/and concomitant surgery, such down-regulation of clock genes Per is only correlated to propofol treatment. This may explain "jet-lag-like" symptoms described by patients after anesthesia. We show here for the first time that short-term propofol anesthesia leads to a transient down-regulation of Per1 and Per2 expression in the SCN.
Published: 2018
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310. Perturbing the spin crossover transition activation energies in Fe(HB(pz)²)² (bipy) with zwitterionic additions

Author: Costa, Paulo, Hao, Guanhua, N’Diaye, Alpha T, Routaboul, Lucie, Braunstein, Pierre, Zhang, Xin, Zhang, Jian, Doudin, Bernard, Enders, Axel, Dowben, Peter A, Institut de Chimie de Strasbourg, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Laboratoire de Chimie Quantique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg (IPCMS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Chimie/Autre, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other
Published: 2018
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311. The prehistoric peopling of Southeast Asia

Author: Hsiao-chun Hung, Tadayuki Masuyama, Christophe Pottier, Farhang Aghakhanian, Thi Minh Tran, Anne-Marie Bacon, Lasse Vinner, Andaine Seguin-Orlando, Laura L. Shackelford, Thi Mai Huong Nguyen, Tsunehiko Hanihara, Anh Nguyen, Hajime Ishida, Ashot Margaryan, Yasuhiro Yamada, Thongsa Sayavongkhamdy, Hiroki Shibata, Constanza de la Fuente Castro, Rasmi Shoocongdej, Eske Willerslev, Silas Anselm Rasmussen, Peter de Barros Damgaard, Patcharee Lertrit, Nobuo Shigehara, Marta Mirazón Lahr, Jean Christophe Galipaud, Jean Luc Ponche, Thomas Higham, Shigeki Nakagome, Sally Wasef, Uffe Gram Wilken, David M. Lambert, Thibaut Devièse, Takashi Gakuhari, Robert Foley, George van Driem, Atsushi Tajima, Ludovic Orlando, Bérénice Bellina-Pryce, Morten E. Allentoft, Charles Higham, Hiroki Oota, J. Víctor Moreno-Mayar, Anna-Sapfo Malaspinas, Huu Nghia Truong, Giang Hai Nguyen, Maude E. Phipps, Fernando Racimo, Rebecca Kinaston, Elise Patole-Edoumba, Supannee Kaewsutthi, Ketut Wiradnyana, Ana Prohaska, Fabrice Demeter, Viengkeo Souksavatdy, Shaiful Shahidan, Hugh McColl, Mokhtar Saidin, Hallie R. Buckley, Thorfinn Sand Korneliussen, Minoru Yoneda, Atsushi Toyoda, Takehiro Sato, Hiromi Matsumae, Philippe Duringer, Martin Sikora, Eco-Anthropologie et Ethnobiologie (EAE), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Préhistoire et Technologie (PréTech), Université Paris Nanterre (UPN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Section for GeoGenetics, Globe Institute, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU), Université Silpakorn, Department of Museums, Historic Buildings and Archaeology, Ministry of Information and Culture, Département des musées et de l'archéologie, Ministère de la Culture et de l?Information, Kyoto University [Kyoto], Dynamique de l'évolution humaine : individus, populations, espèces [Paris] (DEHIPE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de géochimie de la surface (CGS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de chimie et procédés pour l'énergie, l'environnement et la santé (ICPEES), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Illinois at Urbana Champaign (UIUC), University of Illinois at Urbana-Champaign [Urbana], University of Illinois System-University of Illinois System, Museum d'Histoire Naturelle de La Rochelle, Service d'Anatomo-Cyto-Pathologie et de NeuroPathologie [Hôpital de la Timone - APHM] (ACPNP), Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Patrimoines Locaux et Gouvernance (PALOC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Archéologies et Sciences de l'Antiquité (ArScAn), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris Nanterre (UPN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Anatomy, University of Otago, Dunedin, University of Otago [Dunedin, Nouvelle-Zélande], École française d'Extrême-Orient (EFEO), Ctr Biol Sequence Anal, Technical University of Denmark [Lyngby] (DTU), Research Laboratory for Archaeology and the History of Art, University of Oxford [Oxford], Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC), Max-Planck-Institut für evolutionäre Anthropologie (MPI-EVA), Max-Planck-Gesellschaft, Silpakorn University [Bangkok, Thaïlande], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Analyse et de Mathématiques Appliquées (LAMA), Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-Fédération de Recherche Bézout-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris Nanterre (UPN)-Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA), University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH)-Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Illinois System, Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris 8 Vincennes-Saint-Denis (UP8)-Université Paris Nanterre (UPN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Danmarks Tekniske Universitet = Technical University of Denmark (DTU), University of Oxford, Kyoto University, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université Paris 8 Vincennes-Saint-Denis (UP8)-Université Paris Nanterre (UPN)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), McColl, Hugh [0000-0002-7568-4270], Racimo, Fernando [0000-0002-5025-2607], Demeter, Fabrice [0000-0002-1288-5534], Gakuhari, Takashi [0000-0003-1855-8371], Gram Wilken, Uffe [0000-0003-3434-7312], Seguin-Orlando, Andaine [0000-0002-8265-3229], de la Fuente Castro, Constanza [0000-0002-2857-3615], Wasef, Sally [0000-0002-7207-7395], Sayavongkhamdy, Thongsa [0000-0001-9467-0811], Korneliussen, Thorfinn [0000-0001-7576-5380], Prohaska, Ana [0000-0001-5459-6186], Margaryan, Ashot [0000-0002-2576-2429], Kaewsutthi, Supannee [0000-0002-3959-8420], Lertrit, Patcharee [0000-0002-4801-3834], Hung, Hsiao-Chun [0000-0001-5794-3040], Minh Tran, Thi [0000-0001-8833-693X], Nghia Truong, Huu [0000-0003-3291-5646], Shahidan, Shaiful [0000-0002-8367-3539], Matsumae, Hiromi [0000-0003-1858-3833], Ishida, Hajime [0000-0002-5781-7914], Tajima, Atsushi [0000-0001-6808-5491], Toyoda, Atsushi [0000-0002-0728-7548], Nakagome, Shigeki [0000-0001-9613-975X], Deviese, Thibaut [0000-0003-0495-7398], Duringer, Philippe [0000-0001-6213-5726], Patole-Edoumba, Elise [0000-0002-9378-2202], Bellina-Pryce, Bérénice [0000-0001-8790-1394], Galipaud, Jean-Christophe [0000-0003-3546-5265], Kinaston, Rebecca [0000-0001-7697-4950], Higham, Tom [0000-0002-5949-598X], Foley, Robert A [0000-0003-0479-3039], Lahr, Marta Mirazón [0000-0001-5752-5770], Orlando, Ludovic [0000-0003-3936-1850], Sikora, Martin [0000-0003-2818-8319], Lambert, David M [0000-0002-5821-3637], Willerslev, Eske [0000-0002-7081-6748], and Apollo - University of Cambridge Repository
Subjects: 0301 basic medicine, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Human Migration, Population, Southeast asian, Indigenous, Prehistory, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Asian People, Humans, East Asia, 14. Life underwater, DNA, Ancient, education, Asia, Southeastern, History, Ancient, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 2. Zero hunger, education.field_of_study, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Multidisciplinary, Genome, Human, business.industry, Human migration, Genetic Variation, Sequence Analysis, DNA, Hoabinhian, 030104 developmental biology, Agriculture, Ethnology, [SHS.HIST]Humanities and Social Sciences/History, business, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Ancient migrations in Southeast AsiaThe past movements and peopling of Southeast Asia have been poorly represented in ancient DNA studies (see the Perspective by Bellwood). Lipsonet al.generated sequences from people inhabiting Southeast Asia from about 1700 to 4100 years ago. Screening of more than a hundred individuals from five sites yielded ancient DNA from 18 individuals. Comparisons with present-day populations suggest two waves of mixing between resident populations. The first mix was between local hunter-gatherers and incoming farmers associated with the Neolithic spreading from South China. A second event resulted in an additional pulse of genetic material from China to Southeast Asia associated with a Bronze Age migration. McCollet al.sequenced 26 ancient genomes from Southeast Asia and Japan spanning from the late Neolithic to the Iron Age. They found that present-day populations are the result of mixing among four ancient populations, including multiple waves of genetic material from more northern East Asian populations.Science, this issue p.92, p.88; see also p.31
Published: 2018
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312. Identification of marine key areas across the Caribbean to ensure the conservation of the critically endangered hawksbill turtle

Author: Nivière, Manon, Chambault, Philippine, Pérez, Thierry, Etienne, Denis, Bonola, Marc, Martin, Jordan, Barnerias, Cyrille, Védie, Fabien, Mailles, Julien, Dumont-Dayot, Émilie, Gresser, Julie, Hiélard, Gaëlle, Régis, Sidney, Lecerf, Nicolas, Thieulle, Laurent, Duru, Matthieu, Lefebvre, Fabien, Milet, Guillaume, Guillemot, Blandine, Bildan, Bernard, de Montgolfier, Benjamin, Benhalilou, Abdelwahab, Murgale, Céline, Maillet, Thomas, Quénéhervé, Patrick, Woignier, Thierry, Safi, Morjane, Le Maho, Yvon, Petit, Odile, Chevallier, Damien, Mailles, Julie, Département Ecologie, Physiologie et Ethologie (DEPE-IPHC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), DEAL Martinique, MEDDTL, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MEDDTL-MEDDTL, Service de police de l'Environnement, Office de l'Eau Martinique, IPHC CNRS UMR7178 (IPHC), Materials and Chemistry, Stiftelsen for INdustriell og TEknisk Forskning [Trondheim] (SINTEF), Fish Pass, CEntre Technique des Industries Mécaniques (CETIM), CEntre Technique des Industries Mécaniques - Cetim (FRANCE), Délégation Inter Régionale Outre-mer, UCPA Saint Pierre (UCPA Saint Pierre), Aquasearch, Association POEMM (Association POEMM), Station de recherches de nématologie et de génétique moléculaire des invertébrés, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Stiftelsen for INdustriell og TEknisk Forskning Digital [Trondheim] (SINTEF Digital), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Project: 31882,DEAL, European Project: 32947,DEAL, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, Satellite tracking, Home range, [SDV]Life Sciences [q-bio], location.country, Foraging, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, location, Critically endangered, Juvenile, 14. Life underwater, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Migration, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Nature and Landscape Conservation, Caribbean island, 010604 marine biology & hydrobiology, Exclusive economic zone, Diving behaviour, Fishery, Geography, Habitat, Martinique island, Eretmochelys imbricata, [SDE]Environmental Sciences, French Antilles, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; Acquisition of data on animal movement when developing management strategies is a common challenge in species conservation, especially when dealing with a critically endangered species as the hawksbill turtle Eretmochelys imbricata. To reach the objective of the 2008 national action plan for Martinique Island (French West Indies), the present paper examines horizontal and vertical movements in juveniles (n = 3) and adults life stages (11 females and 2 males) of 16 hawksbill turtles. Our results reveal the strong site fidelity of individuals to their foraging grounds (mean male foraging home range: 89.3 ± 20.2 km 2 , mean female foraging home range: 336 ± 284.7 km 2 , mean juvenile foraging home range: 157.3 ± 71.2 km 2) and to the females' inter-nesting areas (mean home range: 284.2 ± 523.7 km 2). A spatial foraging overlap occurred between juveniles and males as they shared 41% of their 95% kernel foraging habitat. The turtles performed mainly long and shallow dives within the first 20 m deep around Martinique Island, occupying shallow waters close to shore. The migratory routes of the adult females revealed regional connectivity between the Caribbean islands, crossing 31 exclusive economic zones and international waters, and featuring distinct foraging grounds. This finding reinforces the significance of a cooperative network at the Caribbean scale to ensure the efficient conservation of this critically endangered species.
Published: 2018
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313. Predictive Models for Kinetic Parameters of Cycloaddition Reactions

Author: Gilles Marcou, Timur I. Madzhidov, Timur R. Gimadiev, Dragos Horvath, Alexandre Varnek, Marta Glavatskikh, R. I. Nugmanov, Daria Malakhova, Chimie de la matière complexe (CMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Tectonique Moléculaire du Solide (TMS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Strasbourg, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Quantitative structure–activity relationship, Thermodynamics, Activation energy, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, symbols.namesake, Reaction rate constant, Structural Biology, Drug Discovery, Molecular graph, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Mathematics, Arrhenius equation, 0303 health sciences, Cycloaddition Reaction, Organic Chemistry, Cycloaddition, 0104 chemical sciences, Computer Science Applications, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, 010404 medicinal & biomolecular chemistry, Kinetics, chemistry, Models, Chemical, Test set, symbols, Molecular Medicine, Graph (abstract data type), [CHIM.CHEM]Chemical Sciences/Cheminformatics
Abstract: This paper reports SVR (Support Vector Regression) and GTM (Generative Topographic Mapping) modeling of three kinetic properties of cycloaddition reactions: rate constant (logk), activation energy (Ea) and pre-exponential factor (logA). A data set of 1849 reactions, comprising (4+2), (3+2) and (2+2) cycloadditions (CA) were studied in different solvents and at different temperatures. The reactions were encoded by the ISIDA fragment descriptors generated for Condensed Graph of Reaction (CGR). For a given reaction, a CGR condenses structures of all the reactants and products into one single molecular graph, described both by conventional chemical bonds and "dynamical" bonds characterizing chemical transformations. Different scenarios of logk assessment were exploited: direct modeling, application of the Arrhenius equation and temperature-scaled GTM landscapes. The logk models with optimal cross-validated statistics (Q2 =0.78-0.94 RMSE=0.45-0.86) have been challenged to predict rates for the external test set of 200 reactions, comprising both reactions that were not present in the training set, and training set transformations performed under different reaction conditions. The models are freely available on our web-server: http://cimm.kpfu.ru/models.
Published: 2018
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314. Aminoguanidine Hydrazone Derivatives as Nonpeptide NPFF1 Receptor Antagonists Reverse Opioid Induced Hyperalgesia

Author: Hammoud, Hassan, Elhabazi, Khadija, Bertin, Isabelle, Utard, Valeŕie, Laboureyras, Emilie, Bourguignon, Jean-Jacques, Bihel, Fredeŕic, Simonnet, Guy, Simonin, Fredeŕic, Schmitt, Martine, Quillet, Raphaelle, Utard, Valérie, Bihel, Frédéric, Simonin, Frédéric, Biotechnologie et signalisation cellulaire (BSC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS), Centre de Recherche sur les Sociétés de l'Océan Indien (CRESOI), Université de La Réunion (UR), UMR 5287, Homéostasie-Allostasie-Pathologie-Réhabilitation, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Gilbert-Laustriat : Biomolécules, Biotechnologie, Innovation Thérapeutique, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Innovation Thérapeutique (LIT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Rétrovirus et Maladies Associées, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Nociception, Receptors, Neuropeptide, GPR74, Physiology, Cognitive Neuroscience, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Pharmacology, Biochemistry, Guanidines, Rats, Sprague-Dawley, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Mice, Structure-Activity Relationship, 0302 clinical medicine, GPCR, neuropeptide FF, In vivo, medicine, Animals, Neuropeptide FF, Receptor, Opioid-induced hyperalgesia, G protein-coupled receptor, Dipeptide, Chemistry, Antagonist, Hydrazones, Sciences du Vivant [q-bio]/Biotechnologies, Cell Biology, General Medicine, Drug Tolerance, Rats, Analgesics, Opioid, 030104 developmental biology, Hyperalgesia, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], medicine.symptom, opioid-induced hyperalgesia, 030217 neurology & neurosurgery, aminoguanidine hydrazone
Abstract: International audience; Neuropeptide FF receptors (NPFF1R and NPFF2R) and their endogenous ligand neuropeptide FF have been shown previously to display antiopioid properties and to play a critical role in the adverse effects associated with chronic administrations of opiates including the development of opioid-induced hyperalgesia and analgesic tolerance. In this work, we sought to identify novel NPFF receptors ligands by focusing our interest in a series of heterocycles as rigidified nonpeptide NPFF receptor ligands, starting from already described aminoguanidine hydrazones (AGHs). Binding experiments and functional assays highlighted AGH 1n and its rigidified analogue 2-amino-dihydropyrimidine 22e for in vivo experiments. As shown earlier with the prototypical dipeptide antagonist RF9, both 1n and 22e reduced significantly the long lasting fentanyl-induced hyperalgesia in rodents. Altogether these data indicate that AGH rigidification maintains nanomolar affinities for both NPFF receptors, while improving antagonist character toward NPFF1R.
Published: 2018
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315. Hydrosilylation of esters to Aldehydes, alcohols or esters catalysed by Iiridium (III) metallacycles

Author: Rysak, Vincent, Corre, Yann, Djukic, Jean-Pierre, Agbossou-Niedercorn, Francine, Michon, Christophe, Unité de Catalyse et Chimie du Solide - UMR 8181 (UCCS), Centrale Lille Institut (CLIL)-Université d'Artois (UA)-Centrale Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille, Institut de Chimie de Strasbourg, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université d'Artois (UA)-Centrale Lille-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [CHIM.COOR]Chemical Sciences/Coordination chemistry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2018

316. Aromatic-Based Design of Highly Active and Noncalcemic Vitamin D Receptor Agonists

Author: Miguel A. Maestro, Natacha Rochel, Thierry Guiberteau, Antonio Mouriño, Roman Perez-Fernandez, Pranjal Gogoi, Rita Sigüeiro, Samuel Seoane, Universidade de Santiago de Compostela [Spain] (USC ), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Universidade da Coruña, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Santiago de Compostela University, Santiago de Compostela, Spain, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Models, Molecular, Stereochemistry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Molecular Conformation, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, 01 natural sciences, Calcitriol receptor, Hydrocarbons, Aromatic, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Mice, 0302 clinical medicine, Cell Line, Tumor, Drug Discovery, Vitamin D and neurology, Side chain, [CHIM]Chemical Sciences, Animals, Humans, Receptor, Calcipotriol, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Cell Proliferation, 010405 organic chemistry, Chemistry, 0104 chemical sciences, Cell culture, 030220 oncology & carcinogenesis, Drug Design, Molecular Medicine, Receptors, Calcitriol, Stereoselectivity, Hormone
Abstract: International audience; We report the design, synthesis, biological evaluation, and structural analysis of a new class of vitamin D analogues that possess an aromatic m-phenylene D-ring and an alkyl chain replacing the C-ring. A key feature of the synthetic strategy is a stereoselective Pd-catalyzed construction of the triene system in aqueous medium that allows the rapid preparation of small amounts of VDR ligands for biological screening. Analogues with the shorter (2a) and longer (2d, 2e) side chains attached to the triene system have no calcemic activity. Compound 2a binds to VDR with the same order of magnitude than calcipotriol and oxacalcitriol. It also reduces proliferation in normal and tumor cells similarly to the natural hormone 1α,25-dihydroxyvitamin D3, calcipotriol, and oxacalcitriol, suggesting preclinical studies related to hyperproliferative disorders such as psoriasis and cancer.
Published: 2018
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317. Polymer-free electrospinning of tannic acid and cross-linking in water for hybrid supramolecular nanofibres

Author: Pascal Hébraud, Dris Ihiawakrim, Guy Schlatter, Anne Hébraud, Domitille Mailley, Florent Meyer, Manon Allais, Vincent Ball, Biomatériaux et Bioingénierie (BB), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de chimie et procédés pour l'énergie, l'environnement et la santé (ICPEES), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg (IPCMS), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Biomatériaux : Processus biophysiques et biologiques aux interfaces, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Faculté de Chirurgie Dentaire-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Ingenierie des Polymères pour les Hautes Technologies, and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: chemistry.chemical_classification, Chemical substance, Materials science, Molar mass, Sodium periodate, Supramolecular chemistry, 02 engineering and technology, Polymer, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, 01 natural sciences, Electrospinning, 0104 chemical sciences, chemistry.chemical_compound, chemistry, Dynamic light scattering, Chemical engineering, Tannic acid, [CHIM]Chemical Sciences, General Materials Science, 0210 nano-technology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: Electrospinning is the process of choice allowing the preparation of nanofibrous materials from a solution usually based on a high molar mass polymer. The solution must bring enough chain entanglements to avoid any breaking or Rayleigh instability of the electrospun jet resulting thus in the deposition of a continuous and regular solid nanofibre. It has been however shown that some few non-polymeric molecules can be electrospun without using a carrier polymer. We demonstrate here the case of tannic acid. Indeed, it was possible to electrospin this molecule solubilised in a mixture of water and ethanol as well as in pure water. Rheology, dynamic light scattering and cryo-TEM highlight the formation of tannic acid aggregates in solution. Above a critical concentration, these aggregates form a supramolecular interconnected network strong enough to allow the electrospinning of a continuous and regular nanofibre. The resulting nanoweb is mechanically stable and can be handled and wrapped. Furthermore, as opposed to the other small molecules for which polymer-free electrospinning was also demonstrated, tannic acid nanowebs can be efficiently cross-linked in water either by oxidative reaction with sodium periodate or, most interestingly, with FeIII by a combination of oxidative reaction and the formation of coordination complexes. The proposed electrospinning and cross-linking strategy is easy, of low cost, and scalable and uses non-toxic solvents as well as biocompatible and biofunctional molecules. Furthermore, thanks to the chelation capacity of tannic acid having the ability to coordinate with a wide variety of metals, hybrid smart nanowebs can be envisaged for diverse applications such as biomedical, catalysis as well as environment.
Published: 2018
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318. Discovery of a Locally and Orally Active CXCL12 Neutraligand (LIT-927) with Anti-inflammatory Effect in a Murine Model of Allergic Airway Hypereosinophilia

Author: Christine Lehalle, Tim Knehans, Vincent Gasparik, Nelly Frossard, Dayana Abboud, Jean-Luc Galzi, François Daubeuf, Damien Boeglin, Claire Marsol, Marcel Hibert, François Rohmer, Pascal Villa, Didier Rognan, Jacques Haiech, Stéphanie Riché, Patrick Gizzi, Muriel Hachet-Haas, Denis Heissler, Dominique Bonnet, Pierre Regenass, Laboratoire d'études et de recherche en génie civil (LERGEC), Biotechnologie et signalisation cellulaire (BSC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS), Laboratoire d'Innovation Thérapeutique (LIT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Plate-forme de chimie biologique intégrative de Strasbourg (PCBiS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives - Laboratoire d'Electronique et de Technologie de l'Information (CEA-LETI), Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut Gilbert-Laustriat : Biomolécules, Biotechnologie, Innovation Thérapeutique, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de neurobiologie et pharmacologie cardiovasculaire (LNPCV), Université de Strasbourg (UNISTRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synthèse, Biosynthèse et Activité de Biomolécules (SBAB), Inflammation et environnement dans l'asthme, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Faculté de Pharmacie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Male, Models, Molecular, 0301 basic medicine, Chemokine, Drug Evaluation, Preclinical, Administration, Oral, Airway Inflammation, Hypereosinophilia, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Pharmacology, 0302 clinical medicine, RSA, Oral administration, Hypereosinophilic Syndrome, Drug Discovery, Fluorescence Resonance Energy Transfer, Receptor, Pyrimidinone, Mice, Inbred BALB C, biology, Chemistry, Anti-Inflammatory Agents, Non-Steroidal, Biological activity, CXCL12, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, 030220 oncology & carcinogenesis, embryonic structures, Molecular Medicine, medicine.symptom, biological phenomena, cell phenomena, and immunity, Neutraligand, Receptors, CXCR4, medicine.drug_class, Pyrimidinones, Anti-inflammatory, Structure-Activity Relationship, 03 medical and health sciences, In vivo, Hypersensitivity, medicine, Animals, Humans, [CHIM]Chemical Sciences, CXCR4, Eosinophil, Chemokine CXCL12, Asthma, biological factors, Eosinophils, Chalcone-4, Disease Models, Animal, 030104 developmental biology, Small Molecules, biology.protein
Abstract: International audience; We previously reported Chalcone-4 (1) that binds the chemokine CXCL12, not its cognate receptors CXCR4 or CXCR7, and neutralizes its biological activity. However, this neutraligand suffers from limitations such as poor chemical stability, solubility, and oral activity. Herein, we report on the discovery of pyrimidinone 57 (LIT-927), a novel neutraligand of CXCL12 which displays a higher solubility than 1 and is no longer a Michael acceptor. While both 1 and 57 reduce eosinophil recruitment in a murine model of allergic airway hypereosinophilia, 57 is the only one to display inhibitory activity following oral administration. Thereby, we here describe 57 as the first orally active CXCL12 neutraligand with anti-inflammatory properties. Combined with a high binding selectivity for CXCL12 over other chemokines, 57 represents a powerful pharmacological tool to investigate CXCL12 physiology in vivo and to explore the activity of chemokine neutralization in inflammatory and related diseases.
Published: 2018
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319. Simulation and Analysis of the Spectroscopic Properties of Oxyluciferin and Its Analogues in Water

Author: Nicolas Ferré, Grégory Taupier, Cristina García-Iriepa, Isabelle Navizet, Jérémie Léonard, Pauline Gosset, Madjid Zemmouche, Kokou D. Dorkenoo, Romain Berraud-Pache, Pascal Didier, Laboratoire de Modélisation et Simulation Multi Echelle (MSME), Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg (IPCMS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Bioimagerie et Pathologies (UMR 7021), Université de Strasbourg (UNISTRA), Groupe d'Optique Non Linéaire et d'Optoélectronique, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Laboratoire de Bioimagerie et Pathologies (LBP), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-16-CE29-0013,BIOLUM,Origine moléculaire et modulation de la couleur de bioluminescence chez la luciole(2016)
Subjects: Absorption Spectra, Materials science, Indoles, Absorption spectroscopy, 02 engineering and technology, Molecular Dynamics Simulation, 010402 general chemistry, Molecular Dynamics, 01 natural sciences, QM/MM, Fluorescence spectroscopy, Emission Spectra, Ultrafast laser spectroscopy, Animals, Emission spectrum, Physical and Theoretical Chemistry, Spectroscopy, Molecular Structure, Fireflies, Water, Hydrogen Bonding, 021001 nanoscience & nanotechnology, 0104 chemical sciences, Computer Science Applications, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, Spectrometry, Fluorescence, Chemical physics, Absorption band, Excited state, Pyrazines, Oxyluciferin, Bioluminescence, 0210 nano-technology, TD-DFT
Abstract: International audience; Firefly bioluminescence is a quite efficient process largely used for numerous applications. However, some fundamental photochemical properties of the light emitter are still to be analyzed. Indeed, the light emitter, oxyluciferin, can be in six different forms due to interexchange reactions. In this work, we present the simulation of the absorption and emission spectra of the possible natural oxyluciferin forms in water and some of their analogues considering both the solvent/oxyluciferin interactions and the dynamical effects by using MD simulations and QM/MM methods. On the one hand, the absorption band shapes have been rationalized by analyzing the electronic nature of the transitions involved. On the other hand, the simulated and experimental emission spectra have been compared. In this case, an ultrafast excited state proton transfer (ESPT) occurs in oxyluciferin and its analogues, which impairs the detection of the emission from the protonated state by steady-state fluorescence spectroscopy. Transient absorption spectroscopy was used to evidence this ultrafast ESPT and rationalize the comparison between simulated and experimental steady-state emission spectra. Finally, this work shows the suitability of the studied oxyluciferin analogues to mimic the corresponding natural forms in water solution, as an elegant way to block the desired interexchange reactions allowing the study of each oxyluciferin form separately.
Published: 2018
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320. Phenylpyridine-2-ylguanidines and rigid mimetics as novel inhibitors of TNFα overproduction: Beneficial action in models of neuropathic pain and of acute lung inflammation

Author: Michel Barrot, Ipek Yalcin, François Daubeuf, Nelly Frossard, Frédéric Bihel, Martine Schmitt, Patrick Wagner, Jean-Jacques Bourguignon, Maud Bollenbach, Léa J. Becker, Baptiste Letellier, Adeline Obrecht, Muris Humo, Eric Salvat, Pascal Villa, Laboratoire d'Innovation Thérapeutique (LIT), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI), Rétrovirus et Maladies Associées, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Gilbert-Laustriat : Biomolécules, Biotechnologie, Innovation Thérapeutique, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biomolécules et innovation thérapeutique (IGLBIT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plateforme de chimie biologie intégrative CNRS UMS 3286 (PCBIS), Inflammation et environnement dans l'asthme, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Faculté de Pharmacie, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Plate-forme de chimie biologique intégrative de Strasbourg (PCBiS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)
Subjects: 0301 basic medicine, Acute Lung Injury, Stimulation, Inflammation, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Pharmacology, Guanidines, Models, Biological, Peripheral blood mononuclear cell, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, In vivo, Drug Discovery, medicine, Animals, Humans, Overproduction, Cytotoxicity, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Tumor Necrosis Factor-alpha, Chemistry, Anti-Inflammatory Agents, Non-Steroidal, Organic Chemistry, General Medicine, 3. Good health, 030104 developmental biology, Neuropathic pain, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Neuralgia, Tumor necrosis factor alpha, medicine.symptom, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: 4-phenylpyridin-2-yl-guanidine (5b): a new inhibitor of the overproduction of pro-inflammatory cytokines (TNFα and Il1β) was identified from a high-throughput screening of a chemical library on human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) after LPS stimulation. Derivatives, homologues and rigid mimetics of 5b were designed and synthesized, and their cytotoxicity and ability to inhibit TNFα overproduction were evaluated. Among them, compound 5b and its mimetic 12 (2-aminodihydroquinazoline) showed similar inhibitory activities, and were evaluated in vivo in models of lung inflammation and neuropathic pain in mice. In particular, compound 12 proved to be active (5 mg/kg, ip) in both models.
Published: 2018
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321. Giant Glycosidase Inhibitors: First- and Second-Generation Fullerodendrimers with a Dense Iminosugar Shell

Author: Jérémy P. Schneider, Mathieu L. Lepage, Carmen Ortiz Mellet, Anne Bodlenner, Jean-François Nierengarten, Antoine Joosten, Philippe Compain, Thi Minh Nguyet Trinh, M. Isabel García-Moreno, Michel Holler, Laboratoire d'innovation moléculaire et applications (LIMA), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Substances naturelles/chimie moléculaire, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Ecole européenne de chimie, polymères et matériaux [Strasbourg]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie Organique et Bioorganique : Réactivité et Analyse (COBRA), Institut Normand de Chimie Moléculaire Médicinale et Macromoléculaire (INC3M), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (INSA Rouen Normandie), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Le Havre Normandie (ULH), Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-École Nationale Supérieure d'Ingénieurs de Caen (ENSICAEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie Organique Fine (IRCOF), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Normandie Université (NU)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de chimie moléculaire (LCM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Strasbourg (ICS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Facultad de Química, Universidad de Sevilla
Subjects: Dendrimers, 010405 organic chemistry, Chemistry, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, Organic Chemistry, Shell (structure), Iminosugar, General Chemistry, Limiting, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Combinatorial chemistry, Iminosugars, Catalysis, 0104 chemical sciences, Glycosidase inhibition, Dendrimer, [CHIM]Chemical Sciences, Glycoside hydrolase, Fullerenes, Multivalent effects, Strong binding, Conjugate
Abstract: International audience; The multivalent effect in glycosidase inhibition is a new topic in glycoscience that has emerged a few years ago, with the discovery of neoglycoclusters displaying strong binding enhancements over the corresponding monovalent inhibitor. Iminosugar–fullerene conjugates with high valencies have been prepared from iminosugar‐terminated dendrons and a clickable fullerene hexa‐adduct scaffold. The simultaneous grafting of twelve dendrons allows for a very fast dendritic growth thus limiting the number of synthetic steps required to prepare compounds with a high number of peripheral units. The grafting of first‐ and second‐generation dendrons provided fullerodendrimers surrounded by 36 and 108 peripheral iminosugars, respectively. Inhibition studies have been carried out with a panel of glycosidases. In the particular case of Jack bean α‐mannosidase, the 108‐valent nanoconstruct displays inhibition in the nanomolar range and an additional binding enhancement of one order of magnitude when compared to the 36‐valent analogues.
Published: 2018
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322. Two Stereoinduction Events in One C-H Activation Step: A Route towards Terphenyl Ligands with Two Atropisomeric Axes

Author: Françoise Colobert, Quentin Dherbassy, Jean-Pierre Djukic, Joanna Wencel-Delord, Laboratoire de chimie moléculaire (LCM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Substances naturelles/chimie moléculaire, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Ecole européenne de chimie, polymères et matériaux [Strasbourg]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Strasbourg, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Laboratoire de Chimie Quantique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Laboratoire d'innovation moléculaire et applications (LIMA), and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Atropisomer, Denticity, Stereochemistry, 010405 organic chemistry, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, Sulfoxide, [CHIM.CATA]Chemical Sciences/Catalysis, General Chemistry, General Medicine, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Catalysis, Stereocenter, 0104 chemical sciences, 3. Good health, chemistry.chemical_compound, chemistry, SYNCAT, Axial chirality, Terphenyl, [CHIM]Chemical Sciences, Stereoselectivity, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: Herein we disclose the synthesis of original chiral scaffolds-ortho-orientated terphenyls presenting two atropisomeric Ar-Ar axes. These unusual structures were built up by using the C-H activation approach, and remarkably, both chiral axes were controlled with excellent stereoselectivity in a single transformation. During the reaction, not only does atroposelective functionalization of a biaryl precursor occur to establish one stereogenic axis, but an unprecedented atropo-stereoselective C-H arylation also takes place to generate the second stereogenic element. These enantiomerically pure ortho-terphenyls show an original tridimensional structure and thus constitute a unique foundation for building up a library of enantiomerically pure bidentate ligands, such as the new ligands S/N-Biax and diphosphine BiaxPhos.
Published: 2018
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323. CUG initiation and frameshifting enable production of dipeptide repeat proteins from ALS/FTD C9ORF72 transcripts

Author: Tania F. Gendron, Mélanie Jambeau, Chao Zong Lee, Clotilde Lagier-Tourenne, Fernande Freyermuth, Laure Schaeffer, Laurent Désaubry, Franck Martin, Chun Chia Lin, Hussein Abou-Hamdan, Karen Jansen-West, Michael Workman, Ricardos Tabet, Leonard Petrucelli, Jie Jiang, Université de Strasbourg (UNISTRA), Architecture et Réactivité de l'ARN (ARN), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'Asie Orientale (IAO), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Sciences Po Lyon - Institut d'études politiques de Lyon (IEP Lyon), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Substances naturelles/chimie moléculaire, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Ecole européenne de chimie, polymères et matériaux [Strasbourg]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Neuroscience, Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Sciences Po Lyon - Institut d'études politiques de Lyon (IEP Lyon), IMRA America, Inc., Laboratoire d'Innovation Thérapeutique (LIT), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I
Subjects: 0301 basic medicine, RNA, Transfer, Met, Science, [SDV]Life Sciences [q-bio], Reading frame, General Physics and Astronomy, Biology, Article, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Cell Line, Open Reading Frames, 03 medical and health sciences, Start codon, C9orf72, Upstream open reading frame, Humans, RNA, Antisense, Peptide Chain Initiation, Translational, lcsh:Science, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Genetics, Multidisciplinary, C9orf72 Protein, Amyotrophic Lateral Sclerosis, Frameshifting, Ribosomal, RNA, Translation (biology), Dipeptides, General Chemistry, Oligonucleotides, Antisense, Ribosomal RNA, 3. Good health, HEK293 Cells, 030104 developmental biology, Eukaryotic Initiation Factor-4F, Frontotemporal Dementia, Ran, lcsh:Q, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Ribosomes, Microsatellite Repeats
Abstract: Expansion of G4C2 repeats in the C9ORF72 gene is the most prevalent inherited form of amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia. Expanded transcripts undergo repeat-associated non-AUG (RAN) translation producing dipeptide repeat proteins from all reading frames. We determined cis-factors and trans-factors influencing translation of the human C9ORF72 transcripts. G4C2 translation operates through a 5′–3′ cap-dependent scanning mechanism, requiring a CUG codon located upstream of the repeats and an initiator Met-tRNAMeti. Production of poly-GA, poly-GP, and poly-GR proteins from the three frames is influenced by mutation of the same CUG start codon supporting a frameshifting mechanism. RAN translation is also regulated by an upstream open reading frame (uORF) present in mis-spliced C9ORF72 transcripts. Inhibitors of the pre-initiation ribosomal complex and RNA antisense oligonucleotides selectively targeting the 5′-flanking G4C2 sequence block ribosomal scanning and prevent translation. Finally, we identified an unexpected affinity of expanded transcripts for the ribosomal subunits independently from translation., Repeat-associated non-AUG (RAN) translation contributes to the pathogenic mechanism of several microsatellite expansion diseases. Here the authors delineate the different steps involved in recruiting the ribosome to initiate G4C2 RAN translation to produce poly-Glycine Alanine, poly-Glycine Proline, and poly-Glycine Arginine repeats.
Published: 2018
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324. Evaluation of the active targeting of melanin granules after intravenous injection of dendronized nanoparticles

Author: E. Jouberton, Sophie Laurent, Sébastien Boutry, Florent Meyer, Christine Zbaraszczuk-Affolter, Elisabeth Miot-Noirault, Sébastien Piant, Bruno Labeille, Delphine Felder-Flesch, Sylvie Begin-Colin, Aurélie Walter, Audrey Parat, Elisa Cinotti, Jean-Luc Perrot, Catalina Bordeianu, Robert N. Muller, Jean-Michel Chezal, Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg (IPCMS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg, Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Biomatériaux : Processus biophysiques et biologiques aux interfaces, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Faculté de Chirurgie Dentaire-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Réseaux épuration et qualité des eaux (UR REBX), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), General, Organic and Biomedical Chemistry, UMONS, Imagerie Moléculaire et Thérapie Vectorisée (IMTV), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Cancéropôle CLARA-ITMO ' Technologies pour la Santé ', University Hospital of St-Etienne, Department of Dermatology, Valorisation Recherche et Innovations Alimentaire (Valorial), Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques - Clermont Auvergne (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA), NMR and Molecular Imaging Laboratory, Université de Mons (UMons), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), ITMO ' Technologies pour la Santé '-Cancéropôle CLARA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), NMR and Molecular Imaging Laboratory [Mons], University of Mons [Belgium] (UMONS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)
Subjects: Male, Skin Neoplasms, Polymers, Biopsy, [SDV]Life Sciences [q-bio], Pharmaceutical Science, 02 engineering and technology, Lutetium, confocal microscopy, Iron oxides, dendrimers, law.invention, Mice, 0302 clinical medicine, law, Drug Discovery, Tissue Distribution, Skin, Microscopy, Confocal, medicine.diagnostic_test, Chemistry, MRI, active targeting, melanoma, 021001 nanoscience & nanotechnology, Magnetic Resonance Imaging, Membrane, 030220 oncology & carcinogenesis, Injections, Intravenous, Molecular Medicine, 0210 nano-technology, Biodistribution, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Enhanced permeability and retention effect, 03 medical and health sciences, Confocal microscopy, In vivo, Cell Line, Tumor, Dendrimer, medicine, Animals, Humans, [CHIM]Chemical Sciences, Radionuclide Imaging, Melanins, Radioisotopes, Magnetic resonance imaging, Biophysics, Nanoparticles, Radiopharmaceuticals, Ex vivo
Abstract: International audience; The biodistribution of dendronized iron oxides, NPs10@D1_DOTAGA and melanin-targeting NPs10@D1_ICF_DOTAGA, was studied in vivo using MRI and planar scintigraphy through [177Lu]Lu-radiolabeling. MRI experiments showed high contrast power of both dendronized nanoparticles (DPs) and hepatobiliary and urinary excretions. Little tumor uptake could be highlighted after intravenous injection probably as a consequence of the negatively charged DOTAGA-derivatized shell which reduces the diffusion across the cells' membrane. Planar scintigraphy images demonstrated a moderate specific tumor uptake of melanoma-targeted [177Lu]Lu-NPs10@D1_ICF_DOTAGA at 2 h post intravenous injection, and the highest tumor uptake of the control probe [177Lu]Lu-NPs10@D1_DOTAGA at 30min pi, probably due to the enhanced permeability and retention (EPR) effect. In addition, ex vivo Confocal microscopy (EVCM) studies showed a high specific targeting of human melanoma samples impregnated with NPs10@D1_ICF_Alexa647_ DOTAGA.
Published: 2018
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325. Integrated Strategy for Lead Optimization Based on Fragment Growing: The Diversity-Oriented-Target-Focused-Synthesis Approach

Author: Yuliia V. Voitovich, Aleksey Y. Fedorov, Christophe Muller, Agnès Amouric, Dragos Horvath, Alexandre Varnek, Philippe Roche, Yves Collette, Sébastien Combes, Carine Derviaux, Stephane Betzi, Xavier Morelli, Brigitt Raux, Laurent Hoffer, Kendall Carrasco, Institut de Chimie de Strasbourg, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Enzymologie interfaciale et de physiologie de la lipolyse (EIPL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Institut des Matériaux, de Microélectronique et des Nanosciences de Provence (IM2NP), Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Théorique et Modèles Statistiques (LPTMS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC), Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Aix Marseille Université (AMU), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: 0301 basic medicine, Time Factors, In silico, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Computational biology, Chemistry Techniques, Synthetic, 01 natural sciences, Small Molecule Libraries, 03 medical and health sciences, Lead (geology), Fragment (logic), Drug Discovery, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Virtual screening, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], 010405 organic chemistry, Drug discovery, Chemistry, Reproducibility of Results, Process automation system, 0104 chemical sciences, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], Identification (information), [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], 030104 developmental biology, Proof of concept, Molecular Medicine, [CHIM.CHEM]Chemical Sciences/Cheminformatics
Abstract: Over the past few decades, hit identification has been greatly facilitated by advances in high-throughput and fragment-based screenings. One major hurdle remaining in drug discovery is process automation of hit-to-lead (H2L) optimization. Here, we report a time- and cost-efficient integrated strategy for H2L optimization as well as a partially automated design of potent chemical probes consisting of a focused-chemical-library design and virtual screening coupled with robotic diversity-oriented de novo synthesis and automated in vitro evaluation. The virtual library is generated by combining an activated fragment, corresponding to the substructure binding to the target, with a collection of functionalized building blocks using in silico encoded chemical reactions carefully chosen from a list of one-step organic transformations relevant in medicinal chemistry. The proof of concept was demonstrated using the optimization of bromodomain inhibitors as a test case, leading to the validation of several compounds with improved affinity by several orders of magnitude.
Published: 2018
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326. Development of an electron paramagnetic resonance methodology for studying the photo-generation of reactive species in semiconductor nano-particle assembled films

Author: Youcef Messai, Olivier Felix, Jean Weiss, Gero Decher, Philippe Turek, David Martel, Marek Twardoch, Djamel Eddine Mekki, Yannick Hoarau, Bertrand Vileno, Institut Charles Sadron (ICS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Strasbourg, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Badji Mokhtar Annaba (UBMA), RENARD (TGE Réseau National de RPE interdisciplinaire - 3443 ), Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT - UMR 8601), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université de Lille-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, International Center for Frontier Research in Chemistry [Strasbourg, France] (icFRC), Martel, David, Institut de Mécanique des Fluides et des Solides (IMFS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ingénierie des Agro-polymères et Technologies Émergentes (UMR IATE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), RENARD (TGE Réseau National de RPE interdisciplinaire - 3443), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-FR-CNRS 3443-Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT - UMR 8601), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Lille-Sorbonne Université (SU)-Aix Marseille Université (AMU)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT - UMR 8601), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-FR-CNRS 3443-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Materials science, education, Biophysics, Nanoparticle, Nanotechnology, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, nano-particle, law.invention, modelling, Condensed Matter::Materials Science, law, Thin film, Physical and Theoretical Chemistry, Electron paramagnetic resonance, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [PHYS]Physics [physics], business.industry, Chimie/Matériaux, technology, industry, and agriculture, kinetic of photo-generated species, semiconductor, 021001 nanoscience & nanotechnology, Condensed Matter Physics, [PHYS.COND.CM-MS] Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Materials Science [cond-mat.mtrl-sci], 0104 chemical sciences, Semiconductor, [PHYS.COND.CM-MS]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Materials Science [cond-mat.mtrl-sci], Condensed Matter::Strongly Correlated Electrons, EPR, 0210 nano-technology, business
Abstract: International audience; An experimental approach involving electron paramagnetic resonance is proposed for studying photogenerated reactive species in semiconductor nano-particle-based films deposited on the internal wall of glass capillaries. This methodology is applied here to nano-TiO2 and allows a semiquantitative analysis of the kinetic evolutions of radical production using a spin scavenger probe.
Published: 2018
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327. Monitoring of the Conformational Space of Dipeptides by Generative Topographic Mapping

Author: Gilles Marcou, Alexandre Varnek, Dragos Horvath, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Tectonique Moléculaire du Solide (TMS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Strasbourg, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie de la matière complexe (CMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Generation process, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Tanimoto coefficient, Peptide Mapping, Force field (chemistry), 03 medical and health sciences, Structural Biology, Drug Discovery, Conformational sampling, Conformational isomerism, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Physics, Organic Chemistry, Force field parameterization, Dipeptides, 0104 chemical sciences, Computer Science Applications, 030104 developmental biology, Models, Chemical, Generative topographic mapping, Molecular Medicine, Biological system, Algorithms, [CHIM.CHEM]Chemical Sciences/Cheminformatics
Abstract: This work describes a procedure to build generative topographic maps (GTM) as 2D representation of the conformational space (CS) of dipeptides. GTMs with excellent propensities to support highly predictive landscapes of various conformational properties were reported for three dipeptides (AA, KE and KR). CS monitoring via GTMproceeds through the projection of conformer ensembles on the map, producing cumulated responsibility (CR) vectors characteristic of the CS areas covered by the ensemble. Overlap of the CS areas visited by two distinct simulations can be expressed by the Tanimoto coefficient Tc of the associated CRs. This idea was used to monitor the reproducibility of the stochastic evolutionary conformer generation process implemented in S4MPLE. It could be shown that conformers produced by
Published: 2018
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328. Genetic Flexibility of the NKNK Motif in HIV-1 Integrases Allows Its Involvement in Multiple Functions During Infection

Author: Marc Ruff, Romain Gasser, Paola Rossolillo, Francesca Di Nunzio, Guillermo Blanco-Rodriguez, Matteo Negroni, Sylvie Schmidt, Oyindamola Oladosu, Christiane Moog, Daniela Lener-Ory, Marine Kanja, Nicolas Levy, Pierre Cappy, Architecture et Réactivité de l'ARN (ARN), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Architecture et réactivité de l'ARN (ARN), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre for Integrative Biology - CBI (Inserm U964 - CNRS UMR7104 - IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Immuno-Rhumatologie Moléculaire, and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: chemistry.chemical_classification, Human immunodeficiency virus (HIV), Computational biology, Integrases, Biology, medicine.disease_cause, In vitro, Reverse transcriptase, Enzyme, chemistry, medicine, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Motif (music), Nuclear transport, Aids pandemic
Abstract: Generating chimerical integrases between isolates of the HIV-1 group responsible for the AIDS pandemic (group M) and of the minor group O, we identify a new functional motif, in the C-terminal domain of integrases M, constituted of two lysines and two asparagines (NKNK). Removing these residues abolishes catalysis in vitro and the generation of proviral DNA in tissue culture. A decrease of reverse transcription and nuclear import of reverse transcription products is also observed. Remarkably, the motif shows a potential genetic flexibility with respect to integration. Indeed, despite its strict conservation in vivo, the positions of the residues in the motif can be permutated retaining in most cases the ability to generate proviral DNA. Reverse transcription is instead optimal exclusively with the canonical NKNK motif. The versatility of this region regarding integration could therefore have provided a major asset for this enzyme to acquire additional functions in the infectious cycle.
Published: 2018
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329. «Nanoscale piezoelectric measurements on single PVDF textile filament»

Author: Ferri, A., Rault, F., Da Costa, A., Cochrane, C., Boudriaux, M., Lemort, G., Campagne, C., Devaux, E., Courtois, Christian, Desfeux, R., Maes, Luc, UCCS Équipe Couches Minces & Nanomatériaux, Unité de Catalyse et Chimie du Solide - UMR 8181 (UCCS), Centrale Lille Institut (CLIL)-Université d'Artois (UA)-Centrale Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centrale Lille Institut (CLIL)-Université d'Artois (UA)-Centrale Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille, Centrale Lille Institut (CLIL)-Université d'Artois (UA)-Centrale Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille, Génie et Matériaux Textiles (GEMTEX), Ecole nationale supérieure des arts et industries textiles de Roubaix (ENSAIT), Institut de Science et d'ingénierie supramoléculaires (ISIS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Laboratoire des Matériaux Céramiques et Procédés Associés - EA 2443 (LMCPA), Université de Valenciennes et du Hainaut-Cambrésis (UVHC)-INSA Institut National des Sciences Appliquées Hauts-de-France (INSA Hauts-De-France), Université d'Artois (UA)-Centrale Lille-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Artois (UA)-Centrale Lille-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Artois (UA)-Centrale Lille-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Valenciennes et du Hainaut-Cambrésis (UVHC)
Subjects: [CHIM.MATE] Chemical Sciences/Material chemistry, [CHIM] Chemical Sciences, [CHIM]Chemical Sciences, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2018

330. A global analysis of terrestrial plant litter dynamics in non-perennial waterways

Author: Roland Corti, Clara Mendoza-Lera, Ross Vander Vorste, María Isabel Arce, Iola G. Boëchat, Ryan M. Burrows, A. Uzan, Jonathan C. Marshall, Nick Bond, Cleo Woelfle-Erskine, Christopher T. Robinson, S. Kubheka, Damien Banas, Vladimir Pešić, Arnaud Foulquier, Klement Tockner, Nathan J. Waltham, Núria Cid, Thibault Datry, Michael T. Bogan, Marcos Moleón, Melanie L. Blanchette, Björn Gücker, Brian Four, Sudeep D. Ghate, Michael Danger, Musa C. Mlambo, V. D. Diaz-Villanueva, Florian Altermatt, Rosa Gómez, K. C. Brintrup Barría, Evans De La Barra, Manuela Morais, Richard G. Storey, Robert J. Rolls, Bianca de Freitas Terra, Tommaso Cancellario, Nabor Moya, A. M. De Girolamo, Arturo Elosegi, Chelsea J. Little, Amina Taleb, Ana Savić, R. del Campo, Simone Guareschi, Dominik Zak, Elisabeth I. Meyer, J. I. Jones, Annamaria Zoppini, Dev K. Niyogi, Peter M. Negus, Manuel A. S. Graça, Isabel Pardo, Pablo Rodríguez-Lozano, Eduardo J. Martín, Kate S. Boersma, Petr Pařil, Erin E. Beller, Alex Laini, Kandikere R. Sridhar, Cristina Canhoto, Felicitas Hoppeler, D. von Schiller, Shai Arnon, Rachel Stubbington, Sarig Gafny, Alisha L. Steward, Núria Bonada, Lluís Gómez-Gener, Ricardo J. Albariño, A. Papatheodoulou, Joanna Blessing, Steffen U. Pauls, Juan F. Blanco-Libreros, Simone D. Langhans, Christiane Zarfl, Jean-Christophe Clément, Mark O. Gessner, Angus R. McIntosh, Fiona Dyer, Oleksandra Shumilova, Catherine M. Febria, Marek Polášek, Stefan Lorenz, Sophie Cauvy-Fraunié, Stephanie M. Carlson, Andy Banegas-Medina, Jason L. Hwan, M. M. Sánchez-Montoya, Daniel C. Allen, Catherine Leigh, Emile Faye, Marko Miliša, Andreas Bruder, Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA ), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Leibniz-Institut für Gewässerökologie und Binnenfischerei (IGB), Leibniz Association, Universidad del Pais Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea [Espagne] (UPV/EHU), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), School of Geography and the Environment [Oxford] (SoGE), University of Oxford [Oxford], Instituto de Investigación en Paleobiología y Geología [Río Negro] (IIPG), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas [Buenos Aires] (CONICET)-Universidad Nacional de Río Negro (UNRN), Unité de Recherches Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux (URAFPA), Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona (UB), Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux (LIEC), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Plant Biology and Ecology, University of the Basque Country, Intelligent Control Systems Laboratory (ICSL), Griffith University [Brisbane], Conseil Général du Rhône, Département du Rhône, Science et Ingénierie des Matériaux et Procédés (SIMaP ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Purdue University [West Lafayette], Centro de investigaciones biológicas, Spanish National Research Council (CSIC), Klinik für Diagnostische und Interventionelle Radiologie, Universitätsklinikum Ulm - University Hospital of Ulm, Department of Biosciences [Mangalore], Mangalore University, Langenberg, Heike, Goldin, Tamara, Plail, Melissa, Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), School of Geography and the Environment [Oxford], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Science et Ingénierie des Matériaux et Procédés (SIMaP), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut de Recherches Subatomiques (IReS), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Cancéropôle du Grand Est-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Milieux aquatiques, écologie et pollutions ( UR MALY ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Laboratoire d'Ecologie Alpine ( LECA ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Leibniz Institute of Freshwater Ecology & Inland Fisheries, Universidad del Pais Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea ( UPV/EHU ), Leibniz-Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries ( IGB ), Freie Universität Berlin [Berlin], Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ), Laboratoire Environnement Géomécanique et Ouvrages ( LAEGO ), Institut National Polytechnique de Lorraine ( INPL ), Instituto de Investigación en Paleobiología y Geología, Universidad Nacional de Río Negro, Unité de Recherches Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux ( URAFPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Universitat de Barcelona ( UB ), Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux ( LIEC ), Université de Lorraine ( UL ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'études et de recherches appliquées à la gestion ( CERAG ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Intelligent Control Systems Laboratory ( ICSL ), Griffith University, Science et Ingénierie des Matériaux et Procédés ( SIMaP ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Spanish National Research Council ( CSIC ), Universitätsklinikum Ulm, Organic Chemistry Division-I, Indian Institute of Chemical Technology, Hyderabad-500 007, India, Institut de Recherches Subatomiques ( IReS ), and Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS ( IN2P3 ) -Cancéropôle du Grand Est-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: 0106 biological sciences, RIVERS, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Perennial plant, ved/biology.organism_classification_rank.species, C CYCLE, SEQUESTRATION, 01 natural sciences, [ SDE ] Environmental Sciences, ECOSYSTEMS, ZONE CLIMATIQUE, 212 dry riverbeds, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, DROUGHT, CLIMATE-CHANGE, geography.geographical_feature_category, CYCLE DU CARBONE, Plant litter, CARBON-DIOXIDE EMISSIONS, 6. Clean water, global research, CO2 EMISSION, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, TEMPORARY RIVERS, [SDE]Environmental Sciences, Ecosystem ecology, DECOMPOSITION, riverbeds, P40 - Météorologie et climatologie, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, VÉGÉTATION RIPICOLE, ephemeral streams, ECOLOGY, Terrestrial plant, [ SDU.ENVI ] Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, STREAMS, P10 - Ressources en eau et leur gestion, GLOBAL CHANGE, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, 0105 earth and related environmental sciences, Riparian zone, RIVER ECOSYSTEM FUNCTIONING, Hydrology, geography, ved/biology, 010604 marine biology & hydrobiology, RIPARIAN VEGETATION, Global change, 15. Life on land, Arid, global change, river ecosystem functioning, CO2 emissions, temporary rivers, riparian vegetation, C cycle, COURS D'EAU, 13. Climate action, CO2 EMISSIONS, CHANGEMENT CLIMATIQUE, C-CYCLING, PATTERNS, Litter, General Earth and Planetary Sciences, Environmental science, terrestrial plant litter, intermittent rivers, MATTER, LITIÈRE VÉGÉTALE
Abstract: International audience; Perennial rivers and streams make a disproportionate contribution to global carbon (C) cycling. However, the contribution of intermittent rivers and ephemeral streams (IRES), which sometimes cease to flow and can dry completely, is largely ignored although they represent over half the global river network. Substantial amounts of terrestrial plant litter (TPL) accumulate in dry riverbeds and, upon rewetting, this material can undergo rapid microbial processing. We present the results of a global research collaboration that collected and analysed TPL from 212 dry riverbeds across major environmental gradients and climate zones. We assessed litter decomposability by quantifying the litter carbon-to-nitrogen ratio and oxygen (O2) consumption in standardized assays and estimated the potential short-term CO2 emissions during rewetting events. Aridity, cover of riparian vegetation, channel width and dry-phase duration explained most variability in the quantity and decomposability of plant litter in IRES. Our estimates indicate that a single pulse of CO2 emission upon litter rewetting contributes up to 10% of the daily CO2 emission from perennial rivers and stream, particularly in temperate climates. This indicates that the contributions of IRES should be included in global C-cycling assessments.
Published: 2018
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331. Cyclophilin A enables specific HIV-1 Tat palmitoylation and accumulation in uninfected cells

Author: Chopard, Christophe, Tong, Phuoc Bao Viet, Toth, Petra, Schatz, Malvina, Yezdi, Hocine, Debaisieux, Solène, Mettling, Clément, Gross, Antoine, Pugniere, Martine, Tu, Annie, Strub, Jean Marc, Mesnard, Jean-Michel, Vitale, Nicolas, Beaumelle, Bruno, Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biomatériaux et Bioingénierie (BB), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Université de Strasbourg (UNISTRA), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Gross, Antoine, Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier (IRIM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Équipe 'Rythme, vie et mort de la rétine', Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de génétique humaine (IGH), Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Département Sciences Analytiques et Interactions Ioniques et Biomoléculaires (DSA-IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique, Département des Sciences Analytiques, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (LSMBO-DSA-IPHC), Département Recherches Subatomiques (DRS-IPHC), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sciences Analytiques et Interactions Ioniques et Biomoléculaires (DSA-IPHC), Département Interactions Physique, Chimie et Vivant (DIPCV-IPHC), Département Ecologie, Physiologie et Ethologie (DEPE-IPHC), Laboratoire de spectrométrie de masse BioOrganique, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique (LSMBO), IPHC-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique [Strasbourg] (LSMBO), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Microbiologie et Pathologie Cellulaire Infectieuse, Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département Neurotransmission et sécrétion neuroendocrine, Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)
Subjects: Phosphatidylinositol 4,5-Diphosphate, MESH: Rats, Science, Lipoylation, MESH: Lipoylation, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, MESH: Acyltransferases, PC12 Cells, MESH: Animals, Newborn, Article, MESH: HIV-1, Jurkat Cells, Mice, MESH: Mice, Inbred C57BL, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.BC.IC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB], MESH: Jurkat Cells, MESH: PC12 Cells, MESH: Protein Binding, MESH: RAW 264.7 Cells, Animals, Humans, MESH: Animals, lcsh:Science, MESH: Mice, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, MESH: tat Gene Products, Human Immunodeficiency Virus, MESH: Humans, MESH: Cyclophilin A, Cell Membrane, MESH: Phosphatidylinositol 4,5-Diphosphate, Rats, Mice, Inbred C57BL, HEK293 Cells, RAW 264.7 Cells, Animals, Newborn, MESH: HEK293 Cells, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, HIV-1, lcsh:Q, tat Gene Products, Human Immunodeficiency Virus, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Cyclophilin A, Acyltransferases, MESH: Cell Membrane, Protein Binding
Abstract: Most HIV-1 Tat is unconventionally secreted by infected cells following Tat interaction with phosphatidylinositol (4,5) bisphosphate (PI(4,5)P2) at the plasma membrane. Extracellular Tat is endocytosed by uninfected cells before escaping from endosomes to reach the cytosol and bind PI(4,5)P2. It is not clear whether and how incoming Tat concentrates in uninfected cells. Here we show that, in uninfected cells, the S-acyl transferase DHHC-20 together with the prolylisomerases cyclophilin A (CypA) and FKBP12 palmitoylate Tat on Cys31 thereby increasing Tat affinity for PI(4,5)P2. In infected cells, CypA is bound by HIV-1 Gag, resulting in its encapsidation and CypA depletion from cells. Because of the lack of this essential cofactor, Tat is not palmitoylated in infected cells but strongly secreted. Hence, Tat palmitoylation specifically takes place in uninfected cells. Moreover, palmitoylation is required for Tat to accumulate at the plasma membrane and affect PI(4,5)P2-dependent membrane traffic such as phagocytosis and neurosecretion., It is not clear whether and how incoming HIV-1 Tat accumulates in uninfected cells. Here, Chopard et al. show that, in uninfected cells, incoming Tat is palmitoylated on Cys31 by DHHC-20, which increases its affinity for PI(4,5)P2 and results in its accumulation at the plasma membrane.
Published: 2018
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332. Nucleophilic Ring Opening of Donor–Acceptor Cyclopropanes Catalyzed by a Brønsted Acid in Hexafluoroisopropanol

Author: Edward Richmond, Joseph Moran, Vuk D. Vuković, Institut de Science et d'ingénierie supramoléculaires (ISIS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), univOAK, Archive ouverte, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Alcohol, trimethoxybenzenes Nu H = arenes, 010402 general chemistry, Ring (chemistry), 01 natural sciences, Biochemistry, Medicinal chemistry, dicarbonyl compounds, Catalysis, Cyclopropane, alcohols, chemistry.chemical_compound, Nucleophile, Physical and Theoretical Chemistry, TMSN 3, NaN 3, 010405 organic chemistry, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, Aryl, Organic Chemistry, indoles, [CHIM.ORGA] Chemical Sciences/Organic chemistry, anilines, 0104 chemical sciences, Solvent, chemistry, Nu H = indoles, 2-naphthols, Brønsted–Lowry acid–base theory
Abstract: This project has received funding from the European Research Council (ERC) under the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme (grant agreement n° 639170) and by grants from LabEx “Chemistry of Complex Systems”. V.D.V. thanks the French government for an MRT fellowship. We thank Dr Helmut Muenster of MasCom and Dr Jean-Louis Schmitt (ISIS, CNRS, UMR7006) for their assistance with HRMS analysis.; International audience; A general, Brønsted acid catalyzed method for the room temperature, nucleophilic-ring opening of donor-acceptor cyclopropanes in fluorinated alcohol solvent, HFIP, is described. Salient features of this method include an expanded cyclopropane scope; including those bearing single keto-acceptor-groups, and those bearing electron deficient aryl-groups. Notably, the catalytic system proved amenable to a wide range of nucleophiles including arenes, indoles, azides, diketones and alcohols.
Published: 2018
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333. Realization of a Rydberg-dressed Ramsey interferometer and electrometer

Author: A. Arias, G. Lochead, Shannon Whitlock, T. M. Wintermantel, S. Helmrich, Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg (IPCMS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Science et d'ingénierie supramoléculaires (ISIS), Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: Physics, [SPI.OTHER]Engineering Sciences [physics]/Other, education.field_of_study, Atomic Physics (physics.atom-ph), Population, General Physics and Astronomy, FOS: Physical sciences, Laser, 01 natural sciences, law.invention, Physics - Atomic Physics, Interferometry, symbols.namesake, law, Excited state, 0103 physical sciences, Astronomical interferometer, Rydberg formula, symbols, Physics::Atomic Physics, Atomic physics, Rydberg state, 010306 general physics, education, Coherence (physics)
Abstract: We present the experimental realization and characterization of a Ramsey interferometer based on optically trapped ultracold potassium atoms, where one state is continuously coupled by an off-resonant laser field to a highly-excited Rydberg state. We show that the observed interference signals can be used to precisely measure the Rydberg atom-light coupling strength as well as the population and coherence decay rates of the Rydberg-dressed states with sub-kilohertz accuracy and for Rydberg state fractions as small as one part in $10^{6}$. We also demonstrate an application for measuring small, static electric fields with high sensitivity. This provides the means to combine the outstanding coherence properties of Ramsey interferometers based on atomic ground states with a controllable coupling to strongly interacting states, thus expanding the number of systems suitable for metrological applications and many-body physics studies.
Published: 2018
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334. Occupational exposure to petroleum-based and oxygenated solvents and hypopharyngeal and laryngeal cancer in France the ICARE study

Author: Christine Barul, Matthieu Carton, Loredana Radoï, Gwenn Menvielle, Corinne Pilorget, Simona Bara, Isabelle Stücker, Danièle Luce, ICARE study group, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Paris-Saclay, Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut Curie [Paris], Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Université Paris Descartes - Faculté de Chirurgie Dentaire (UPD5 Odontologie), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité Mixte de Recherche Epidémiologique et de Surveillance Transport Travail Environnement (UMRESTTE UMR T9405), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR), Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Registre des cancers de la Manche, CHPC - Site Louis Pasteur, Centre Hospitalier Public du Cotentin (CHPC)-Centre Hospitalier Public du Cotentin (CHPC), The ICARE study was funded by the French National Research Agency (ANR), French National Cancer Institute (INCA), French Agency for Food, Environmental and Occupational Health and Safety (ANSES), French Institute for Public Health Surveillance (InVS), Fondation pour la Recherche Médicale (FRM), Fondation de France, Fondation ARC pour la Recherche sur le Cancer, Ministry of Labour (Direction Générale du Travail), Ministry of Health (Direction Générale de la Santé)., Chard-Hutchinson, Xavier, Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Registre des cancers de la Manche [CHPC - Site Louis Pasteur], Site Louis Pasteur [CHPC], and CH Centre Hospitalier Public du Cotentin (CHPC)-CH Centre Hospitalier Public du Cotentin (CHPC)
Subjects: Adult, Male, Adolescent, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, lcsh:RC254-282, Young Adult, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Odds Ratio, Prevalence, [SDV.EE.SANT] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Humans, Laryngeal Neoplasms, Aged, Cancer, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Hypopharyngeal Neoplasms, Middle Aged, Occupational exposure, lcsh:Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, Hypopharynx, Petroleum, Socioeconomic Factors, Population Surveillance, Solvents, Female, France, Larynx, Research Article
Abstract: Background To examine associations between occupational exposure to petroleum-based and oxygenated solvents and the risk of hypopharyngeal and laryngeal cancer. Methods ICARE is a large, frequency-matched population-based case-control study conducted in France. Lifetime occupational history, tobacco smoking and alcohol consumption were collected. Analyses were restricted to men and included 383 cases of hypopharyngeal cancer, 454 cases of laryngeal cancer, and 2780 controls. Job–exposure matrices were used to assess exposure to five petroleum-based solvents (benzene; gasoline; white spirits; diesel, fuels and kerosene; special petroleum products) and to five oxygenated solvents (alcohols; ketones and esters; ethylene glycol; diethyl ether; tetrahydrofuran). Odds ratios (ORs) adjusted for smoking, alcohol drinking and other potential confounders and 95% confidence intervals (CI) were estimated with unconditional logistic models. Results No significant association was found between hypopharyngeal or laryngeal cancer risk and exposure to the solvents under study. Non-significantly elevated risks of hypopharyngeal cancer were found in men exposed to high cumulative levels of white spirits (OR = 1.46; 95% CI: 0.88–2.43) and tetrahydrofuran (OR = 2.63; 95CI%: 0.55–12.65), with some indication of a dose-response relationship (p for trend: 0.09 and 0.07 respectively). Conclusion This study provides weak evidence for an association between hypopharyngeal cancer and exposure to white spirits and tetrahydrofuran, and overall does not suggest a substantial role of exposure to petroleum-based or oxygenated solvents in hypopharyngeal or laryngeal cancer risk. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s12885-018-4324-7) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Published: 2018
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335. Evidence for $Z_c^{\pm}(3900)$ in semi-inclusive decays of $b$-flavored hadrons

Author: Abazov, Victor Mukhamedovich, Abbott, Braden Keim, Atkins, Scott, Edmunds, Daniel L, Ellison, John A, Elvira, VDaniel, Enari, Yuji, Evans, Harold G, Evdokimov, Anatoly V, Evdokimov, Valeri N, Faure, Alexandre, Feng, Lei, Ferbel, Thomas, Augsten, Kamil, Fiedler, Frank, Filthaut, Frank, Fisher, Wade Cameron, Fisk, HEugene, Fortner, Michael R, Fox, Harald, Franc, Jiri, Fuess, Stuart C, Garbincius, Peter H, Garcia-Bellido, Aran, Aushev, Volodymyr, Garcia-Gonzalez, Jose Andres, Gavrilov, Vladimir B, Geng, Weigang, Gerber, Cecilia Elena, Gershtein, Yuri S, Ginther, George E, Gogota, Olga, Golovanov, Georgy Anatolievich, Grannis, Paul D, Greder, Sebastien, Aushev, Yegor, Greenlee, Herbert B, Grenier, Gerald Jean, Gris, Phillipe Luc, Grivaz, Jean-Francois, Grohsjean, Alexander, Gruenendahl, Stefan, Gruenewald, Martin Werner, Guillemin, Thibault, Gutierrez, Gaston R, Gutierrez, Phillip, Avila, Carlos A, Haley, Joseph Glenn Biddle, Han, Liang, Harder, Kristian, Harel, Amnon, Hauptman, John Michael, Hays, Jonathan M, Head, Tim, Hebbeker, Thomas, Hedin, David R, Hegab, Hatim, Badaud, Frederique, Heinson, Ann, Heintz, Ulrich, Hensel, Carsten, Heredia-De La Cruz, Ivan, Herner, Kenneth Richard, Hesketh, Gavin G, Hildreth, Michael D, Hirosky, Robert James, Hoang, Trang, Hobbs, John D, Bagby, Linda F, Hoeneisen, Bruce, Hogan, Julie, Hohlfeld, Mark, Holzbauer, Jenny Lyn, Howley, Ian James, Hubacek, Zdenek, Hynek, Vlastislav, Iashvili, Ia, Ilchenko, Yuriy, Illingworth, Robert A, Baldin, Boris, Ito, Albert S, Jabeen, Shabnam, Jaffre, Michel J, Jayasinghe, Ayesh, Jeong, Min-Soo, Jesik, Richard L, Jiang, Peng, Johns, Kenneth Arthur, Johnson, Emily, Johnson, Marvin E, Bandurin, Dmitry V, Jonckheere, Alan M, Jonsson, Per Martin, Joshi, Jyoti, Jung, Andreas Werner, Juste, Aurelio, Kajfasz, Eric, Karmanov, Dmitriy Y, Katsanos, Ioannis, Kaur, Manbir, Kehoe, Robert Leo Patrick, Banerjee, Sunanda, Kermiche, Smain, Khalatyan, Norayr, Khanov, Alexander, Kharchilava, Avto, Kharzheev, Yuri N, Kiselevich, Ivan Lvovich, Kohli, Jatinder M, Kozelov, Alexander V, Kraus, James Alexander, Kumar, Ashish, Acharya, Bannanje Sripath, Barberis, Emanuela, Kupco, Alexander, Kurca, Tibor, Kuzmin, Valentin Alexandrovich, Lammers, Sabine Wedam, Lebrun, Patrice, Lee, Hyeon-Seung, Lee, Seh-Wook, Lee, William M, Lei, Xiaowen, Lellouch, Jeremie, Baringer, Philip S, Li, Dikai, Li, Hengne, Li, Liang, Li, Qi-Zhong, Lim, Jeong Ku, Lincoln, Donald W, Linnemann, James Thomas, Lipaev, Vladimir V, Lipton, Ronald J, Liu, Huanzhao, Bartlett, JFrederick, Liu, Yanwen, Lobodenko, Alexandre, Lokajicek, Milos, Lopes de Sa, Rafael, Luna-Garcia, Rene, Lyon, Adam Leonard, Maciel, Arthur KA, Madar, Romain, Magana-Villalba, Ricardo, Malik, Sudhir, Bassler, Ursula Rita, Malyshev, Vladimir L, Mansour, Jason, Martinez-Ortega, Jorge, McCarthy, Robert L, Mcgivern, Carrie Lynne, Meijer, Melvin M, Melnitchouk, Alexander S, Menezes, Diego D, Mercadante, Pedro Galli, Merkin, Mikhail M, Bazterra, Victor, Meyer, Arnd, Meyer, Jorg Manfred, Miconi, Florian, Mondal, Naba K, Mulhearn, Michael James, Nagy, Elemer, Narain, Meenakshi, Nayyar, Ruchika, Neal, Homer A, Negret, Juan Pablo, Bean, Alice L, Neustroev, Petr V, Nguyen, Huong Thi, Nunnemann, Thomas P, Hernandez Orduna, Jose de Jesus, Osman, Nicolas Ahmed, Pal, Arnab, Parashar, Neeti, Parihar, Vivek, Park, Sung Keun, Partridge, Richard A, Begalli, Marcia, Parua, Nirmalya, Patwa, Abid, Penning, Bjoern, Perfilov, Maxim Anatolyevich, Peters, Reinhild Yvonne Fatima, Petridis, Konstantinos, Petrillo, Gianluca, Petroff, Pierre, Pleier, Marc-Andre, Podstavkov, Vladimir M, Bellantoni, Leo, Popov, Alexey V, Prewitt, Michelle, Price, Darren, Prokopenko, Nikolay N, Qian, Jianming, Quadt, Arnulf, Quinn, Gene Breese, Ratoff, Peter N, Razumov, Ivan A, Ripp-Baudot, Isabelle, Beri, Suman B, Rizatdinova, Flera, Rominsky, Mandy Kathleen, Ross, Anthony, Royon, Christophe, Rubinov, Paul Michael, Ruchti, Randal C, Sajot, Gerard, Sanchez-Hernandez, Alberto, Sanders, Michiel P, Santos, Angelo Souza, Bernardi, Gregorio, Savage, David G, Savitskyi, Mykola, Sawyer, HLee, Scanlon, Timothy P, Schamberger, RDean, Scheglov, Yury A, Schellman, Heidi M, Schott, Matthias, Schwanenberger, Christian, Schwienhorst, Reinhard H, Adams, Mark Raymond, Bernhard, Ralf Patrick, Sekaric, Jadranka, Severini, Horst, Shabalina, Elizaveta K, Shary, Viacheslav V, Shaw, Savanna, Shchukin, Andrey A, Shkola, Oleg, Simak, Vladislav J, Skubic, Patrick Louis, Slattery, Paul F, Bertram, Iain A, Snow, Gregory R, Snow, Joel Mark, Snyder, Scott Stuart, Soldner-Rembold, Stefan, Sonnenschein, Lars, Soustruznik, Karel, Stark, Jan, Stefaniuk, Nazar, Stoyanova, Dina A, Strauss, Michael G, Besancon, Marc, Suter, Louise, Svoisky, Peter V, Titov, Maxim, Tokmenin, Valeriy V, Tsai, Yun-Tse, Tsybychev, Dmitri, Tuchming, Boris, Tully, Christopher George T, Uvarov, Lev, Uvarov, Sergey L, Beuselinck, Raymond, Uzunyan, Sergey A, Van Kooten, Richard J, van Leeuwen, Willem M, Varelas, Nikos, Varnes, Erich W, Vasilyev, Igor A, Verkheev, Alexander Yurievich, Vertogradov, Leonid S, Verzocchi, Marco, Vesterinen, Mika, Bhat, Pushpalatha C, Vilanova, Didier, Vokac, Petr, Wahl, Horst D, Wang, Michael HLS, Warchol, Jadwiga, Watts, Gordon Thomas, Wayne, Mitchell R, Weichert, Jonas, Welty-Rieger, Leah Christine, Williams, Mark Richard James, Bhatia, Sudeep, Wilson, Graham Wallace, Wobisch, Markus, Wood, Darien Robert, Wyatt, Terence R, Xie, Yunhe, Yamada, Ryuji, Yang, Siqi, Yasuda, Takahiro, Yatsunenko, Yuriy A, Ye, Wanyu, Bhatnagar, Vipin, Ye, Zhenyu, Yin, Hang, Yip, Kin, Youn, Sungwoo, Yu, Jiaming, Zennamo, Joseph, Zhao, Tianqi Gilbert, Zhou, Bing, Zhu, Junjie, Zielinski, Marek, Blazey, Gerald Charles, Zieminska, Daria, Zivkovic, Lidija, D0 Collaboration, Blessing, Susan K, Bloom, Kenneth A, Adams, Todd, Boehnlein, Amber S, Boline, Daniel Dooley, Boos, Edward E, Borissov, Guennadi, Borysova, Maryna, Brandt, Andrew, Brandt, Oleg, Brochmann, Michelle, Brock, Raymond L, Bross, Alan D, Agnew, James P, Brown, Duncan Paul, Bu, Xue-Bing, Buehler, Marc, Buescher, Volker, Bunichev, Viacheslav Yevgenyevich, Burdin, Sergey, Buszello, Claus Peter, Camacho-Perez, Enrique, Casey, Brendan Cameron Kieran, Castilla-Valdez, Heriberto, Alexeev, Guennadi D, Caughron, Seth Aaron, Chakrabarti, Subhendu, Chan, Kwok Ming Leo, Chandra, Avdhesh, Chapon, Emilien, Chen, Guo, Cho, Sung-Woong, Choi, Suyong, Choudhary, Brajesh C, Cihangir, Selcuk, Alkhazov, Georgiy D, Claes, Daniel R, Clutter, Justace Randall, Cooke, Michael P, Cooper, William Edward, Corcoran, Marjorie D, Couderc, Fabrice, Cousinou, Marie-Claude, Cuth, Jakub, Cutts, David, Das, Amitabha, Alton, Andrew K, Davies, Gavin John, de Jong, Sijbrand Jan, De La Cruz-Burelo, Eduard, Deliot, Frederic, Demina, Regina, Denisov, Dmitri S, Denisov, Sergei P, Desai, Satish Vijay, Deterre, Cecile, DeVaughan, Kayle Otis, Askew, Andrew Warren, Diehl, HThomas, Diesburg, Michael, Ding, Pengfei, Dominguez, DAaron M, Drutskoy, Alexey, Dubey, Abhinav Kumar, Dudko, Lev V, Duperrin, Arnaud, Dutt, Suneel, Eads, Michael T, Laboratoire de Physique de Clermont (LPC), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Physique des Particules (ex SPP) (DPP), Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers (IRFU), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Laboratoire de Physique Nucléaire et de Hautes Énergies (LPNHE (UMR_7585)), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Physique des Particules de Marseille (CPPM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Aix Marseille Université (AMU), Université Louis Pasteur - Strasbourg 1 (ULP), Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Physique Nucléaire de Lyon (IPNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de l'Accélérateur Linéaire (LAL), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Subatomique et de Cosmologie (LPSC), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), D0, Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Physique des Particules (ex SPP) (DPhP), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), and Université Grenoble Alpes (UGA)
Subjects: data analysis method, +J%2Fpsi%283100%29+pi%22">Z/c(3900) --> J/psi(3100) pi, M210M, FOS: Physical sciences, (J/psi(3100) pi-) [mass spectrum], hadronic decay [Y(4260)], High Energy Physics - Experiment, anti-p p: colliding beams, width [mass], High Energy Physics - Experiment (hep-ex), (J/psi(3100) pi+) [mass spectrum], mass: width, S042:Desig=22, statistical analysis, mass spectrum: (J/psi(3100) pi-), DZERO, anti-p p: scattering, [PHYS.HEXP]Physics [physics]/High Energy Physics - Experiment [hep-ex], Particle Physics Experiments, ddc:530, Batavia TEVATRON Coll, weak interaction [decay], Z/c(3900): hadronic decay, scattering [anti-p p], Y(4260): hadronic decay, +Z%2Fc%283900%29+pi%22">Y(4260) --> Z/c(3900) pi, High Energy Physics::Phenomenology, mass spectrum: (J/psi(3100) pi+), (J/psi(3100) pi+ pi-) [mass spectrum], semi-inclusive reaction, mass spectrum: (J/psi(3100) pi+ pi-), S042.563, High Energy Physics::Experiment, S042:Desig=563, decay: weak interaction, S042.22, colliding beams [anti-p p], hadronic decay [Z/c(3900)], experimental results
Abstract: We present evidence for the exotic charged charmonium-like state $Z_c^{\pm}(3900)$ in semi-inclusive weak decays of $b$-flavored hadrons. The signal is correlated with a $J/\psi \pi^+ \pi^-$ system in the invariant mass range 4.2$-$4.7~GeV and includes the sequential process $b$-quark hadron $ \rightarrow Y(4260) +$ anything, $Y(4260) \rightarrow Z_c^{\pm}(3900) \pi^{\mp}$, $Z_c^{\pm}(3900) \rightarrow J/\psi \pi^{\pm}$. The study is based on $10.4~\rm{fb^{-1}}$ of $p \overline p $ collision data collected by the D0 experiment at the Fermilab Tevatron collider., Comment: Version accepted by PRD
Published: 2018
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336. Heterogeneous microwave-assisted Ullmann type methodology for synthesis of rigid-core ionic liquid crystals

Author: Lydia Karmazin, Richard Welter, Arsalan Mirjafari, Emilie Voirin, Julien Fouchet, Laurent Douce, Corinne Bailly, Benoît Heinrich, Matthieu L’Her, Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg (IPCMS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Institut de Chimie de Strasbourg, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie moléculaire des plantes (IBMP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: 010405 organic chemistry, Small-angle X-ray scattering, General Chemistry, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Catalysis, Coupling reaction, 0104 chemical sciences, chemistry.chemical_compound, Differential scanning calorimetry, chemistry, Bromide, Yield (chemistry), Ionic liquid, Materials Chemistry, Physical chemistry, Lamellar structure, Methyl group
Abstract: We present an efficient Ullmann-type synthesis methodology enabling the preparation of imidazolium compounds with an extended aromatic core in three steps. This procedure begins with a microwave-assisted, heterogeneously catalysed cross-coupling reaction in the presence of Cu(II)-doped NaY zeolite to obtain imidazole-aromatic derivatives directly in good yield. The innovation is that this reaction does not require solvent, ligand or an inert atmosphere. Subsequently, these derivatives have been alkylated with bromoalkanes and the bromide of the imidazolium products exchanged for [BF4]− or [PF6]− anions. We have studied the influence of the methyl group (inductive effect) on the aromatic unit during the coupling reaction as well as its impact on different arrangements in the crystalline state. We have been able to extend this synthesis to ionic liquid crystal compounds which display lamellar self-organization (smectic A). The mesomorphic behavior and phase transition temperatures were investigated by polarizing optical microscopy (POM), differential scanning calorimetry (DSC) and small-angle X-ray scattering (SAXS).
Published: 2018
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337. Relationship between the agonist activity of synthetic ligands of TRAIL-R2 and their cell surface binding modes

Author: Chekkat, Neila, Lombardo, Caterina, Seguin, Cendrine, Lechner, Marie-Charlotte, Dufour, Florent, Nominé, Yves, De Giorgi, Marcella, Frisch, Benoît, Micheau, Olivier, Guichard, Gilles, Altschuh, Danièle, Fournel, Sylvie, Institut de Chimie des Substances Naturelles ( ICSN ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Immunologie et chimie thérapeutiques ( ICT ), Cancéropôle du Grand Est-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Institut Gilbert-Laustriat : Biomolécules, Biotechnologie, Innovation Thérapeutique, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie ( CERMN ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Laboratoire de Conception et Application de Molécules Bioactives ( UMR 7199 CNRS/Université de Strasbourg ), Chimie et Biologie des Membranes et des Nanoobjets (CBMN), École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-08-PCVI-0034,SYMULI,Probing molecular dynamics of TNFR family members upon stimulation, in the membrane of live cells(2008), Conception et application de molécules bioactives (CAMB), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Européen de Chimie et de Biologie, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Biotechnologie et signalisation cellulaire (BSC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg (ESBS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Micheau, Olivier, Programme interdiciplinaire en physique et chimie du vivant - Probing molecular dynamics of TNFR family members upon stimulation, in the membrane of live cells - - SYMULI2008 - ANR-08-PCVI-0034 - PCV - VALID, Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Immunologie et chimie thérapeutiques (ICT), Cancéropôle du Grand Est-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: binding modes, agonist peptides, TRAIL-R2, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, interactions, signaling, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Research Paper
Abstract: IF 5.168 (2016); International audience; Tumor Necrosis Factor Receptor Apoptosis Inducing Ligand (TRAIL) appears as an interesting candidate for targeted cancer therapy as it induces apoptosis in cancer cells without toxicity to normal cells. TRAIL elicits apoptosis through agonist death receptor TRAIL-R1 and TRAIL-R2 engagement. Nevertheless, recombinant soluble TRAIL and monoclonal antibodies against these receptors demonstrated insufficient efficacy in clinical trials. This may be explained by the cell-type dependency of the apoptotic response, itself influenced by the effect on ligand binding mode of factors such as the level of receptor oligomerization or glycosylation. To investigate the relation between binding mode and signaling, we used previously described synthetic divalent and monovalent peptides specific for TRAIL-R2. We measured their pro-apoptotic activity on three cancer cell lines sensitive to rhTRAIL induced-apoptosis and monitored their cell-surface binding kinetics. The two divalent peptides bound with strong affinity to TRAIL-R2 expressed on B lymphoma BJAB cells and induced a high degree of apoptosis. By contrast, the same peptides bound weakly to TRAIL-R2 expressed at the surface of the human colon cancer HCT116 or T lymphoma Jurkat cell lines and did not induce their apoptosis. Cross-linking experiments suggest that these differences could be afforded by variations in the TRAIL-R2 oligomerization state at cell surface before ligand addition. Moreover divalent peptides showed a different efficiency in BJAB apoptosis induction, and kinetic distribution analysis of the BJAB binding curves suggested subtle differences in binding mechanisms. Thus our data support a relation between the cell-surface binding mode of the peptides and their pro-apoptotic activity. In this case the precise characterization of ligand binding to the surface of living cells would be predictive of the therapeutic potential of TRAIL-R2 synthetic ligands prior to clinical trials.
Published: 2018
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338. Sex identification in King Penguins Aptenodytes patagonicus through morphological and acoustic cues

Author: Quentin Schull, Yvon Le Maho, Víctor Planas-Bielsa, Benoit Vallas, Francesco Bonadonna, Céline Le Bohec, Hélène Gachot-Neveu, Hannah Joy Kriesell, Thierry Aubin, Marine Benoiste, Sandrine Zahn, Laboratoire de Biologie Polaire, Département Ecologie, Physiologie et Ethologie (DEPE-IPHC), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LEA BioSensib, Centre Scientifique de Monaco, Institut des Neurosciences de Paris-Saclay (Neuro-PSI), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Neurosciences Paris-Saclay (NeuroPSI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, seabird, education, Zoology, Context (language use), 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, biology.animal, morphology, sexual selection, 0501 psychology and cognitive sciences, 050102 behavioral science & comparative psychology, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, biology, 05 social sciences, biology.organism_classification, Aptenodytes patagonicus, Sexual dimorphism, penguins, Beak, Mate choice, Sexual selection, [SDE]Environmental Sciences, Animal Science and Zoology, Identification (biology), vocal sex recognition, Seabird, sexing methods
Abstract: International audience; In the context of sexual selection, animals have developed a variety of cues conveying informationabout the sex of an individual to conspecifics. In many colonial seabird species,where females and males are monomorphic and do not show obvious differences in externalmorphology, acoustic cues are an important signal for individual and sex recognition. Here,we study the vocal and morphological sex dimorphism in the King Penguin Aptenodytespatagonicus, a colonial, monomorphic seabird for which our knowledge about the role ofvocalizations and morphology in mate choice is very limited. Data were collected at PossessionIsland, Crozet Archipelago, in a breeding colony consisting of about 16 000 breedingpairs. Using measurements of six morphological features and analysing acoustic parametersof call recordings of adult individuals, we show that King Penguins can be sexed based on asingle morphological measurement of the beak with an accuracy of 79%. We found a sexspecificsyntax in adult King Penguin calls that provided a 100% accurate method to distinguishbetween the sexes in our study population. To confirm the method at the specieslevel, we analysed calls recorded from King Penguin adults in Kerguelen Island, 1300 kmaway from our study population and found the same accuracy of the sex-specific syntax.This sex-specific syllable arrangement is rare in non-passerines and is a first step in understandingthe mate choice process in this species. Furthermore, it offers a cost-effective, noninvasivetechnique for researchers to sex King Penguins in the field.
Published: 2018
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339. OZCAR : The French Network of Critical Zone Observatories

Author: Gaillardet, J., Braud, Isabelle, Hankard, F., Anquetin, S., Bour, Olivier, Dorfliger, Nathalie, de Dreuzy, Jean-Raynald, Galle, S., Galy, C., Gogo, Sébastien, Gourcy, Laurence, Habets, F., Laggoun-Défarge, Fatima, Longuevergne, Laurent, Le Borgne, Tanguy, Naaim-Bouvet, F., Nord, G., Simonneaux, Vincent, Six, D., Tallec, Tiphaine, Valentin, C., Abril, G., Allemand, P., Arènes, A., Arfib, B., Arnaud, L., Arnaud, Nicolas, Arnaud, P., Audry, S., Bailly Comte, Vincent, Batiot-Guilhe, Christelle, Battais, Annick, Bellot, H., Bernard, Eric, Bertrand, C., Bessiere, Hélène, Binet, Stéphane, Bodin, J., Bodin, X., Boithias, L., Bouchez, J., Boudevillain, B., Moussa, I., Branger, F., Braun, J., Brunet, Pascal, Caceres, B., Calmels, D., Cappelaere, B., Celle-Jeanton, Hélène, Chabaux, F., Chalikakis, K., Champollion, C., Copard, Yoann, Cotel, C., Davy, Philippe, Deline, P., Delrieu, G., Demarty, J., Dessert, C., Dumont, M., Emblanch, C., Ezzahar, J., Estèves, M., Favier, V., Faucheux, M., Filizola, N., Flammarion, P., Floury, P., Fournier, Matthieu, Fovet, Ophélie, Francez, André-Jean, Gandois, L., Gascuel, Chantal, Gayer, E., Genthon, C., Gérard, F., Gilbert, D., Gouttevin, I., Grippa, Manuela, Gruau, Gérard, Jardani, Abderrahim, Jeanneau, Laurent, Join, Jean-Lambert, Jourde, H., Karbou, F., Lagadeuc, Y., Lajeunesse, E., Lastennet, R., Lavado, W., Lawin, E., Lebel, T., Le Bouteiller, Caroline, Legout, C., Lejeune, Y., Le Meur, E., Lemoigne, Nicolas, Lions, Julie, Lucas, A., Malet, J., Marais-Sicre, Claire, Maréchal, Jean-Christophe, Marlin, C., Martin, P., Martins, J., Massei, Nicolas, Mauclerc, A., Mazzilli, Naomi, Molenat, Jérôme, Moreira-Turcq, P., Probst, Anne, Mougin, Éric, Morin, S., Ngoupayou, J., Panthou, G., Peugeot, C., Picard, G., Pierret, C., Porel, G., Probst, J., Rabatel, A., Raclot, Damien, Ravanel, Ludovic, Rejiba, Fayçal, René, P., Ribolzi, O., Riotte, J., Rivière, A., Robain, H., Ruiz, L., Sanchez-Perez, J., Santini, W., Sauvage, S., Schoeneich, Philippe, Seidel, J., Sekhar, M., Sengtaheuanghoung, O., Silvera, N., Steinmann, M., Soruco, A., Tallec, G., Thibert, Emmanuel, Lao, D., Vincent, C., Viville, D., Wagnon, P., Zitouna, Rim, Labat, David, Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hydrologie-Hydraulique (UR HHLY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut des Géosciences de l’Environnement (IGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Géosciences Rennes (GR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - UMR7327 (ISTO), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biogéosystèmes Continentaux - UMR7327, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Erosion torrentielle neige et avalanches (UR ETGR (ETNA)), Centre d'études spatiales de la biosphère (CESBIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement (LGL-TPE), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Montpellier (UM), Géosciences Paris Sud (GEOPS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Hydrologie et de Géochimie de Strasbourg (LHyGeS), Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre (EOST), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Avignon Université (AU), Géosciences Montpellier, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Faculté des Sciences Semlalia [Marrakech], Université Cadi Ayyad [Marrakech] (UCA), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, University of the Amazonas State, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), Laboratoire GéoSciences Réunion (LGSR), Université de La Réunion (UR)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP (UMR_7154)), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre national de recherches météorologiques (CNRM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 (LOG), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord]), Institut de Mécanique et d'Ingénierie de Bordeaux (I2M), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Servicio Nacional de Meteorologia e Hidrologia Jiron Cahuide, Météo-France Direction Interrégionale Sud-Est (DIRSE), Météo-France, UMR A 1154, Faculté de Pharmacie, Institut Fédératif de Recherches 141, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), laboratoire de modelisation et de prevention de la pollution, unité mixte CNRS-INRS, UNIVERSITE GRENOBLE ALPES CNRS IRD GRENOBLE INP UMR IGE FRA, Partenaires IRSTEA, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Laboratoire d'étude des Interactions Sol - 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CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Milieux Environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols (METIS), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Association MORAINE, Centre de Géosciences (GEOSCIENCES), Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Indo-French Cell for Water Sciences, Indian Institute of Science [Bangalore] (IISc Bangalore), Department of Agriculture Land Management (DALam), aucun, IGEMA, Centre de géochimie de la surface (CGS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), French Ministry of Education and Research, ANR-11-EQPX-0011,CRITEX,Parc national d'équipements innovants pour l'étude spatiale et temporelle de la Zone Critique des Bassins Versants(2011), ANR-10-LABX-0056,OSUG@2020,Innovative strategies for observing and modelling natural systems(2010), ANR-11-LABX-0010,DRIIHM / IRDHEI,Dispositif de recherche interdisciplinaire sur les Interactions Hommes-Milieux(2011), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-IPG PARIS-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement [Lyon] (LGL-TPE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université des Antilles (UA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Faculté des Sciences SEMLALIA (FSSM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe d'étude de l'atmosphère météorologique (CNRM-GAME), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Météo France-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Station Marine de Wimereux, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Météo France, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris, Institut Français de Recherche Scientifique pour le Développement en Coopération, ORSTOM, Office of Science and Land Development, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université de Poitiers-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre (EOST), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Laboratoire de thermocinétique [Nantes] (LTN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes (UN), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Réseaux épuration et qualité des eaux (UR REBX), Laboratoire d'Electronique et des Technologies de l'Information (CEA-LETI), Université Grenoble Alpes (UGA)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Université de Poitiers-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Poitiers-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), École pratique des hautes études (EPHE)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris-PSL Research University (PSL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), ANR-11-EQPX-0011/11-EQPX-0011,CRITEX,Parc national d'équipements innovants pour l'étude spatiale et temporelle de la Zone Critique des Bassins Versants(2011), ANR-10-LABX-0056/10-LABX-0056,OSUG@2020,Innovative strategies for observing and modelling natural systems(2010), ANR-11-LABX-0010/11-LABX-0010,LabEx DRIIHM,Dispositif de recherche interdisciplinaire sur les Interactions Hommes-Milieux(2011), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre (EOST), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Observatoire de Paris, PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), PSL Research University (PSL)-PSL Research University (PSL)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)-Observatoire des Sciences de l'Univers en région Centre (OSUC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École Nationale Supérieure d'Arts et Métiers (ENSAM), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [ Madagascar])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Subjects: OZCAR, [SDE.IE]Environmental Sciences/Environmental Engineering, [SDU]Sciences of the Universe [physics], [SDE]Environmental Sciences, [SDU.STU.HY]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society
Abstract: [Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]ARCEAU [ADD1_IRSTEA]Hydrosystèmes et risques naturels [Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]ARCEAU [ADD1_IRSTEA]Hydrosystèmes et risques naturelsSpecial Section: Hydrological Observatories; International audience; The French critical zone initiative, called OZCAR (Observatoires de la Zone Critique-Application et Recherche or Critical Zone Observatories-Application and Research) is a National Research Infrastructure (RI). OZCAR-RI is a network of instrumented sites, bringing together 21 pre-existing research observatories monitoring different compartments of the zone situated between "the rock and the sky," the Earth's skin or critical zone (CZ), over the long term. These observatories are regionally based and have specific initial scientific questions, monitoring strategies, databases, and modeling activities. The diversity of OZCAR-RI observatories and sites is well representative of the heterogeneity of the CZ and of the scientific communities studying it. Despite this diversity, all OZCAR-RI sites share a main overarching mandate, which is to monitor, understand, and predict ("earthcast") the fluxes of water and matter of the Earth's near surface and how they will change in response to the "new climatic regime." The vision for OZCAR strategic development aims at designing an open infrastructure, building a national CZ community able to share a systemic representation of the CZ , and educating a new generation of scientists more apt to tackle the wicked problem of the Anthropocene. OZCAR articulates around: (i) a set of common scientific questions and cross-cutting scientific activities using the wealth of OZCAR-RI observatories, (ii) an ambitious instrumental development program, and (iii) a better interaction between data and models to integrate the different time and spatial scales. Internationally, OZCAR-RI aims at strengthening the CZ community by providing a model of organization for pre-existing observatories and by offering CZ instrumented sites. OZCAR is one of two French mirrors of the European Strategy Forum on Research Infrastructure (eLTER-ESFRI) project.
Published: 2018
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340. The Strengbach catchment : a multidisciplinary environmental sentry for 30 years

Author: Daniel Viville, Emilie Beaulieu, René Boutin, Bertrand Fritz, Frederick Delay, Sylvain Weill, Anatoly Legtchenko, Solenn Cotel, Sophie Gangloff, Jean-François Girard, Anne Probst, Marie Boucher, Marie-Claire Pierret, Pascal Friedmann, Colin Fourtet, Philippe Ackerer, François Chabaux, Sylvain Benarioumlil, Laboratoire d'Hydrologie et de Géochimie de Strasbourg (LHyGeS), Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre (EOST), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Technologies des Traceurs (L2T), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de Mécanique des Fluides et des Solides (IMFS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géosciences Environnement Toulouse (GET), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), Centre de géochimie de la surface (CGS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de physique du globe de Strasbourg (IPGS), Institut des Géosciences de l’Environnement (IGE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre (EOST), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Laboratoire d'étude des transferts en hydrologie et environnement (LTHE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Ecole et Observatoire des Sciences de la Terre (EOST), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Drainage basin, Soil Science, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, 010502 geochemistry & geophysics, 01 natural sciences, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Multidisciplinary approach, [SDU.STU.GC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geochemistry, [SDU.STU.HY]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, lcsh:Environmental sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, lcsh:GE1-350, geography, geography.geographical_feature_category, lcsh:QE1-996.5, 15. Life on land, 6. Clean water, lcsh:Geology, Sentry, 13. Climate action, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Water resource management
Abstract: Research activity associated with various observations at the Strengbach catchment in the Vosges Massif (880-1150 m) addresses many questions in the domains of hydrology and geochemistry. The catchment is the observation and experimental site of the Observatoire Hydro-Geochimique de l'Environnement appointed by the Centre National de la Recherche Scientifique. It also belongs to the research facilities that form the French Network of Critical Zone Observatories (OZCAR), which supports a network of critical zone observatories. The catchment is small (0.8 km(2)) with steep slopes (20-30%) on granitic bedrock that mainly allow for forestry (spruce and beech stands) as the main land cover. Meteorological, hydrological, and geochemical data have been monitored since 1986. The first studies conducted were dedicated to the elucidation of acid rain effects on forest ecosystems and particularly on forest decline. Multidisciplinary research studies conducted on the Strengbach catchment enable exploration of the following issues: (i) hydrological functioning at the scale of a small catchment and questions regarding the evolution and preservation of the water resources in mountainous environments (stock, recharge, infiltration, and water pathways), (ii) exchange processes observed at the soil-plant-atmosphere continuum and in particular weathering processes and the evolution of soil mineral fertility (Ca, Mg, K, P), (iii) processes responsible for the export of water and for associated fluxes (dissolved chemicals, suspended materials, bed loads) and their dynamic at the outlet, and (iv) responses of the ecosystems to environmental disturbances (acid rain, forest management, and climate change) and their current and future modeling.
Published: 2018
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341. A bifunctional biased mu opioid agonist-neuropeptide FF receptor antagonist as analgesic with improved acute and chronic side effects

Author: Steven Ballet, Armand Drieu la Rochelle, Pieter Mampuys, Valérie Utard, Frédéric Bihel, Séverine Schneider, Mariana Spetea, François Daubeuf, Karel Guillemyn, Tom Willemse, Maria Dumitrascuta, Nelly Frossard, Bert U. W. Maes, Raphaëlle Quillet, Charlotte Martin, Frédéric Simonin, Biotechnologie et signalisation cellulaire (BSC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS), CHU Toulouse [Toulouse], Laboratoire d'Innovation Thérapeutique (LIT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC), department of chemistry, University of Antwerp (UA), Inflammation et environnement dans l'asthme, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Faculté de Pharmacie, Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Faculty of Sciences and Bioengineering Sciences, Chemistry, and WE Academic Unit
Subjects: Male, Pain Threshold, Receptors, Neuropeptide, 0301 basic medicine, Agonist, medicine.drug_class, Physical dependence, [SDV]Life Sciences [q-bio], Analgesic, Receptors, Opioid, mu, Pain, Neuropeptide FF receptor, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Motor Activity, Pharmacology, opioid receptors, Mice, 03 medical and health sciences, RF-amide peptides, 0302 clinical medicine, Opioid analgesia, NPFF receptors, Analgesic tolerance, Animals, Humans, Medicine, Neuropeptide FF, Opioid-induced hyperalgesia, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, business.industry, Sciences du Vivant [q-bio]/Biotechnologies, 3. Good health, Analgesics, Opioid, Chemistry, HEK293 Cells, 030104 developmental biology, Anesthesiology and Pain Medicine, Neurology, Opioid, Hyperalgesia, Neurology (clinical), Human medicine, medicine.symptom, Respiratory Insufficiency, business, Oxycodone, 030217 neurology & neurosurgery, medicine.drug
Abstract: Opioid analgesics, such as morphine, oxycodone and fentanyl, are the cornerstones for treating moderate to severe pain. However, upon chronic administration, their efficiency is limited by prominent side effects such as analgesic tolerance and dependence liability. Neuropeptide FF (NPFF) and its receptors (NPFF1R and NPFF2R) are recognized as an important pronociceptive system involved in opioid-induced hyperalgesia and analgesic tolerance. Herein, we report the design of multitarget peptidomimetic compounds that show high affinity binding to the mu opioid receptor (MOPr) and NPFFRs. In vitro characterization of these compounds led to identification of KGFF03 and KGFF09 as G protein-biased MOPr agonists with full agonist or antagonist activity at NPFFRs, respectively. In agreement with their biased MOPr agonism, KGFF03/09 showed reduced respiratory depression in mice, as compared to the unbiased parent opioid agonist KGOP01. Chronic subcutaneous administration of KGOP01 and KGFF03 in mice rapidly induced hyperalgesia and analgesic tolerance, effects that were not observed upon chronic treatment with KGFF09. This favorable profile was further confirmed in a model of persistent inflammatory pain. In addition, we showed that KGFF09 induced less physical dependence compared to KGOP01 and KGFF03. Altogether, our data establish that combining, within a single molecule, the G protein-biased MOPr agonism and NPFFR antagonism, have beneficial effects on both acute and chronic side effects of conventional opioid analgesics. This strategy can lead to the development of novel and potent antinociceptive drugs with limited side effects upon acute and chronic administration.
Published: 2018
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342. A Virgo Environmental Survey Tracing Ionised Gas Emission (VESTIGE)

Author: Stephen Gwyn, Annie Zavagno, Patrick R. Durrell, Médéric Boquien, Ming Sun, P. Côté, Baerbel Koribalski, Luca Cortese, E. Toloba, Matteo Fossati, Alessandro Boselli, Bernd Vollmer, Gerhard Hensler, Joel Roediger, Giuseppe Gavazzi, Stephanie Cote, V. Buat, Denis Burgarella, Jean-Charles Cuillandre, D. Russeil, Michele Fumagalli, G. Consolandi, Laura Ferrarese, Yannick Roehlly, Samuel Boissier, Boselli, A, Fossati, M, Cuillandre, J, Boissier, S, Boquien, M, Buat, V, Burgarella, D, Consolandi, G, Cortese, L, Cote, P, Cote, S, Durrell, P, Ferrarese, L, Fumagalli, M, Gavazzi, G, Gwyn, S, Hensler, G, Koribalski, B, Roediger, J, Roehlly, Y, Russeil, D, Sun, M, Toloba, E, Vollmer, B, Zavagno, A, Laboratoire d'Astrophysique de Marseille (LAM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Astrophysique Interprétation Modélisation (AIM (UMR_7158 / UMR_E_9005 / UM_112)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Università degli Studi di Milano-Bicocca [Milano] (UNIMIB), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Shanghai Maritime University, Observatoire astronomique de Strasbourg (ObAS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universitätssternwarte der Ludwig-Maximiliansuniversität, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Unidad de Astronomia, Facultad de Ciencias Basicas, Universidad de Antofagasta, Milano, International Centre for Radio Astronomy Research, University of Western Australia (ICRAR), National Research Council of Canada (NRC), Department of Physics and Astronomy, Youngstown State University, Institute for Computational Cosmology, Department of Physics, Durham University, Durham (ICC), Department of Astrophysics, University of Vienna, Turkenschanzstrasse 17, 1180, Vienna, Austria, Australian Telescope National Facility (ATNF), Astronomy Centre, Department of Physics and Astronomy, University of Sussex, Falmer, CSPAR and Physics Department, University of Alabama in Huntsville, Huntsville, Department of Physiscs, University of the Pacific, 3601 Pacific Avenue, Stockton, CA, 95211, USA, Observatoire astronomique de Strasbourg (OAS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Astrophysique Interprétation Modélisation (AIM (UMR7158 / UMR_E_9005 / UM_112)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Università degli Studi di Milano-Bicocca = University of Milano-Bicocca (UNIMIB), CDS, Centre de Données astronomiques de Strasbourg, Observatoire astronomique de Strasbourg, France + ESO, European Southern Observatory, Garching bei Muenchen, Allemagne, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)
Subjects: [SDU.ASTR.CO]Sciences of the Universe [physics]/Astrophysics [astro-ph]/Cosmology and Extra-Galactic Astrophysics [astro-ph.CO], FOS: Physical sciences, Astrophysics, Astrophysics::Cosmology and Extragalactic Astrophysics, 01 natural sciences, [SCCO]Cognitive science, Intracluster medium, 0103 physical sciences, Galaxy formation and evolution, galaxies: interactions, Astrophysics::Solar and Stellar Astrophysics, 010303 astronomy & astrophysics, Galaxies: individual: NGC 4254, Astrophysics::Galaxy Astrophysics, Physics, Spiral galaxy, [SDU.ASTR]Sciences of the Universe [physics]/Astrophysics [astro-ph], 010308 nuclear & particles physics, Star formation, Galaxies: evolution, Astronomy and Astrophysics, Galaxies: clusters: individual: Virgo, Virgo Cluster, Astrophysics - Astrophysics of Galaxies, Galaxy, Ram pressure, Galaxies: ISM, [SDU]Sciences of the Universe [physics], 13. Climate action, Space and Planetary Science, Galaxies: interaction, Astrophysics of Galaxies (astro-ph.GA), Spectral energy distribution, Astrophysics::Earth and Planetary Astrophysics, Galaxies: clusters: general, [PHYS.ASTR]Physics [physics]/Astrophysics [astro-ph]
Abstract: During pilot observations of the Virgo Environmental Survey Tracing Galaxy Evolution (VESTIGE), a blind narrow-band Halpha+[NII] imaging survey of the Virgo cluster carried out with MegaCam at the CFHT, we have observed the spiral galaxy NGC 4254 (M99). Deep Halpha+[NII] narrow-band and GALEX UV images revealed the presence of 60 compact (70-500 pc radius) star forming regions up to ~ 20 kpc outside the optical disc of the galaxy. These regions are located along a tail of HI gas stripped from the disc of the galaxy after a rapid gravitational encounter with another Virgo cluster member that simulations indicate occurred 280-750 Myr ago. We have combined the VESTIGE data with multifrequency data from the UV to the far-infrared to characterise the stellar populations of these regions and study the star formation process in an extreme environment such as the tails of stripped gas embedded in the hot intracluster medium. The colour, spectral energy distribution (SED), and linear size consistently indicate that these regions are coeval and have been formed after a single burst of star formation that occurred ~< 100 Myr ago. These regions might become free floating objects within the cluster potential well, and be the local analogues of compact sources produced after the interaction of gas-rich systems that occurred during the early formation of clusters., Accepted for publication on Astronomy & Astrophysics
Published: 2018
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343. Of local translation control and lipid signaling in neurons

Author: Nicolas Vitale, Hervé Moine, Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I, Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives, univOAK, Archive ouverte, and Département Neurotransmission et sécrétion neuroendocrine
Subjects: 0301 basic medicine, Cancer Research, [SDV]Life Sciences [q-bio], Phosphatidic Acids, Biology, Diglycerides, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Genetics, Protein biosynthesis, Compartment (development), Animals, Humans, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Diacylglycerol kinase, Neurons, Neuronal Plasticity, Translation (biology), Phosphatidic acid, Lipid signaling, 030104 developmental biology, chemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, Fragile X Syndrome, Protein Biosynthesis, Synaptic plasticity, Proteome, Synapses, Molecular Medicine, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Neuroscience, Signal Transduction
Abstract: Fine-tuned regulation of new proteins synthesis is key to the fast adaptation of cells to their changing environment and their response to external cues. Protein synthesis regulation is particularly refined and important in the case of highly polarized cells like neurons where translation occurs in the subcellular dendritic compartment to produce long-lasting changes that enable the formation, strengthening and weakening of inter-neuronal connection, constituting synaptic plasticity. The changes in local synaptic proteome of neurons underlie several aspects of synaptic plasticity and new protein synthesis is necessary for long-term memory formation. Details of how neuronal translation is locally controlled only start to be unraveled. A generally accepted view is that mRNAs are transported in a repressed state and are translated locally upon externally cued triggering signaling cascades that derepress or activate translation machinery at specific sites. Some important yet poorly considered intermediates in these cascades of events are signaling lipids such as diacylglycerol and its balancing partner phosphatidic acid. A link between these signaling lipids and the most common inherited cause of intellectual disability, Fragile X syndrome, is emphasizing the important role of these secondary messages in synaptically controlled translation.
Published: 2018
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344. Mining for recurrent long-range interactions in RNA structures reveals embedded hierarchies in network families

Author: Reinharz, Vladimir, Soulé, Antoine, Westhof, Eric, Waldispühl, Jérôme, Denise, Alain, McGill Centre for Bioinformatics ( MCB ), McGill University, Ben-Gourion University of the Negev, Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau] ( LIX ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École polytechnique ( X ), Architecture et réactivité de l'ARN ( ARN ), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Bioinformatique (LRI) ( BioInfo - LRI ), Laboratoire de Recherche en Informatique ( LRI ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), McGill Centre for Bioinformatics (MCB), McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Ben-Gurion University of the Negev (BGU), Laboratoire d'informatique de l'École polytechnique [Palaiseau] (LIX), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Architecture et réactivité de l'ARN (ARN), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bioinformatique (LRI) (BioInfo - LRI), Laboratoire de Recherche en Informatique (LRI), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and CentraleSupélec-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CentraleSupélec-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], [ INFO.INFO-BI ] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [ SDV.BBM.BS ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM]
Abstract: International audience; The wealth of the combinatorics of nucleotide base pairs enables RNA molecules to assemble into sophisticated interaction networks, which are used to create complex 3D substructures. These interaction networks are essential to shape the 3D architecture of the molecule, and also to provide the key elements to carry molecular functions such as protein or lig-and binding. They are made of organised sets of long-range tertiary interactions which connect distinct secondary structure elements in 3D structures. Here, we present a de novo data-driven approach to extract automatically from large data sets of full RNA 3D structures the recurrent interaction networks (RINs). Our methodology enables us for the first time to detect the interaction networks connecting distinct components of the RNA structure, highlighting their diversity and conservation through non-related functional RNAs. We use a graphical model to perform pairwise comparisons of all RNA structures available and to extract RINs and modules. Our analysis yields a complete catalog of RNA 3D structures available in the Protein Data Bank and reveals the intricate hierarchical organization of the RNA interaction networks and modules. We assembled our results in an online database (http://carnaval.lri.fr) which will be regularly updated. Within the site, a tool allows users with a novel RNA structure to detect automatically whether the novel structure contains previously observed RINs.
Published: 2018

345. Stretch-Induced Helical Conformations in Poly(<scp>l</scp>-lysine)/Hyaluronic Acid Multilayers

Author: Alain Chaumont, Sarah Zahouani, Loïc Jierry, Bernard Senger, Philippe Lavalle, Fouzia Boulmedais, Pierre Schaaf, Boulmedais, Fouzia, Biomatériaux et Bioingénierie (BB), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Strasbourg, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Charles Sadron (ICS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Univ Strasbourg, INSERM, UMR S 1121, F-67085 Strasbourg, France, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), and Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [CHIM.POLY] Chemical Sciences/Polymers, Circular dichroism, polyelectrolyte multilayers, Materials science, Lysine, Aucun, Nanotechnology, 02 engineering and technology, chemistry, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Protein Structure, Secondary, chemistry.chemical_compound, Molecular dynamics, Film structure, Hyaluronic acid, [CHIM]Chemical Sciences, Polylysine, General Materials Science, Hyaluronic Acid, Protein secondary structure, Water, secondary structure, 021001 nanoscience & nanotechnology, molecular dynamics, circular dichroism, mechanoresponsive materials, 0104 chemical sciences, Crystallography, [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, 0210 nano-technology
Abstract: We investigate the effect of stretching on the secondary structure of cross-linked poly(l-lysine)/hyaluronic acid (PLL/HA) multilayers. We show that stretching these films induces changes in the secondary structure of PLL chains. Our results suggest that not only α- but also 310-helices might form in the film under stretching. Such 310-helices have never been observed for PLL so far. These changes of the secondary structure of PLL are reversible, i.e., when returning to the nonstretched state one recovers the initial film structure. Using molecular dynamics simulations of chains composed of 20 l-lysine residues (PLL20), we find that these chains never adopt a helical conformation in water. In contrast, when the end-to-end distance of the chains is restrained to values smaller than the mean end-to-end distance of free chains, a distance domain rarely explored by the free chains, helical conformations become accessible. Moreover, the formation of not only α- but also 310-helices is predicted by the simulations. These results suggest that the change of the end-to-end distance of PLL chains in the stretched film is at the origin of the helix formation. journal article research support, non-u.s. gov't 2016 06 22 2015 12 08 imported
Published: 2015
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346. Solid-State NMR/Dynamic Nuclear Polarization of Polypeptides in Planar Supported Lipid Bilayers

Author: Fabien Aussenac, Christian Reiter, Armin Purea, Olivier Ouari, Evgeniy S. Salnikov, Hiba Sarrouj, Burkhard Bechinger, Christopher Aisenbrey, Paul Tordo, Frank Engelke, Illya Fedotenko, Institut de Chimie de Strasbourg, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Bruker BioSpin GmbH, D-76287 Rheinstetten, Germany, affiliation inconnue, Bruker Biospin SA, Wissembourg, Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Magnetic Resonance Spectroscopy, 010405 organic chemistry, Filling factor, Chemistry, Lipid Bilayers, Analytical chemistry, Nuclear magnetic resonance spectroscopy, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Molecular physics, 0104 chemical sciences, Surfaces, Coatings and Films, law.invention, Solid-state nuclear magnetic resonance, law, Gyrotron, Materials Chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, Physical and Theoretical Chemistry, Peptides, Lipid bilayer, Nuclear Magnetic Resonance, Biomolecular, Local field, Two-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopy, Microwave
Abstract: International audience; Dynamic nuclear polarization has been developedto overcome the limitations of the inherently low signalintensity of NMR spectroscopy. This technique promises to beparticularly useful for solid-state NMR spectroscopy where thesignals are broadened over a larger frequency range and mostinvestigations rely on recording low gamma nuclei. To extendthe range of possible investigations, a triple-resonance flat-coilsolid-state NMR probe is presented with microwave irradiationcapacities allowing the investigation of static samples attemperatures of 100 K, including supported lipid bilayers. Theprobe performance allows for two-dimensional separated localfield experiments with high-power Lee−Goldberg decoupling and cross-polarization under simultaneous irradiation from agyrotron microwave generator. Efficient cooling of the sample turned out to be essential for best enhancements and line shapeand necessitated the development of a dedicated cooling chamber. Furthermore, a new membrane-anchored biradical ispresented, and the geometry of supported membranes was optimized not only for good membrane alignment, handling, stability,and filling factor of the coil but also for heat and microwave dissipation. Enhancement factors of 17-fold were obtained, and atwo-dimensional PISEMA spectrum of a transmembrane helical peptide was obtained in less than 2 h.
Published: 2015
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347. Operational definition of Active and Healthy Ageing (AHA)

Author: Henriette A. Smit, Neil Wilson, Jean-Marie Robine, J. Y. Pelissier, M. Van Beurden, A. Bedbrook, T. Standberg, Vittorio Romano, Bertrand Fougère, J. Garcia-Aymerich, C. Jeandel, Anne Hendry, B. Samolinski, Mike Bewick, Holger Schulz, P. Bertone, Yoav Ben-Shlomo, J. Coletta, D. Poethig, J. P. Michel, Valentina A. Andreeva, M. O'Neill, M. Nogues, K. Andersen Ranberg, Elena Villalba-Mora, Daniel Laune, Itziar Vergara, Maddalena Illario, F. Roubille, G. J. Buijs, J. Venne, Sylvie Arnavielhe, L. Rodriguez Manas, Carol Brayne, David Somekh, T. Camuzat, Jacques Bringer, A. Nizinkska, Marcel Goldberg, Carel Thijs, Alessandro Blasimme, Raphaëlle Varraso, Dieter Maier, Marie Zins, D. Heve, François Puisieux, Theodore D. Cosco, D. Harman, João O. Malva, Thomas Keil, Rachel Cooper, J. Mercier, M. Criton, Alfredo Cesario, Philippe-Jean Bousquet, Jean Bousquet, Davide Caimmi, John Farrell, Emmanuelle Kesse-Guyot, Dirkje S. Postma, Karen Ritchie, Joël Ankri, P. Viriot-Durandal, Pascal Demoly, G. Moda, V. Traver-Salcedo, Susanne Krauss-Etschmann, Daniela Porta, D. Kula, Jordi Alonso, Federico Alonso, Ana Todo-Bom, Frédéric Cuisinier, R. Pengelly, Guido Iaccarino, G. Mercier, C. Robalo-Cordeiro, Eveline Wouters, P. Senesse, P. Matignon, J. Touchon, Sergio Bonini, B. Combe, J. Suanzes, Marek L. Kowalski, A. Zaidi, Isabelle Momas, R. Bourret, Hasan Arshad, A. Avignon, Sylvain Lehmann, Ana Maria Carriazo, Diana Kuh, Claudine Berr, Mai Stafford, A. Scott, Marcus Richards, S. Fernandez-Nocelo, Rebecca Hardy, Z. Gutter, M. E. Joel, Erik Melén, C. Tischer, Sandra N. Slagter, Nick A. Guldemond, Bruno Vellas, H. Blain, P. Auge, O. Krys, Contre les MAladies Chroniques pour un VIeillissement Actif en Languedoc-Roussillon (MACVIA-LR), Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-European Innovation Partnership on Active and Healthy Ageing Reference Site (EIP on AHA), Commission Européenne-Commission Européenne-Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office (OMS / WHO), Physiologie & médecine expérimentale du Cœur et des Muscles [U 1046] (PhyMedExp), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Department of Prevention of Environmental Hazards and Allergology, Medical University of Warsaw - Poland-Faculté de Pharmacie de Paris, Institute of Neurobiology and Molecular Medicine, CNR, Rome, Italy and Department of Medicine-University of Naples Federico II, Institut d'Electronique du Solide et des Systèmes (InESS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Departamento de Biología Molecular y Celular del Cáncer (CSIC-UAM), Instituto de Investigaciones Biomédicas A. Sols, Hôpital Lapeyronie [Montpellier] (CHU), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuropsychiatrie : recherche épidémiologique et clinique (PSNREC), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Mécanismes moléculaires dans les démences neurodégénératives (MMDN), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), CERMES3 - Centre de recherche Médecine, sciences, santé, santé mentale, société (CERMES3 - UMR 8211 / U988 / UM 7), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Gérontopôle, Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse], Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM), Université de Montpellier (UM), Euromov (EuroMov), Eindhoven University of Technology [Eindhoven] (TU/e), Laboratoire de Bioingénierie et NanoSciences (LBN), Département pneumologie et addictologie [Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, IMIM-Hospital del Mar, Generalitat de Catalunya, Groupe Matrice Extracellulaire et Biomineralisation, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Astrophysique Interprétation Modélisation (AIM (UMR_7158 / UMR_E_9005 / UM_112)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Julius Center for Health Sciences and Primary Care, University Medical Center [Utrecht], Service de Pneumologie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Cohortes épidémiologiques en population (CONSTANCES), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Université Paris Cité (UPC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes)-European Innovation Partnership on Active and Healthy Ageing Reference Site (EIP on AHA), Commission Européenne-Commission Européenne-Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office (OMS / WHO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Université de Paris (UP), Contre les MAladies Chroniques pour un VIeillissement Actif en Languedoc-Roussillon ( MACVIA-LR ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -World Health Organization ( WHO/OMS ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes ( CHRU Nîmes ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -European Innovation Partnership on Active and Healthy Ageing Reference Site, Physiologie & médecine expérimentale du Cœur et des Muscles [U 1046] ( PhyMedExp ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de pharmacologie et innovation dans le diabète ( CPID ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Medical University of Warsaw-Faculté de Pharmacie de Paris, CNR, Rome, Italy and Department of Medicine-Second University of Naples, Institut d'Electronique du Solide et des Systèmes ( InESS ), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Departamento de Biología Molecular y Celular del Cáncer ( CSIC-UAM ), Hôpital Lapeyronie [Montpellier] ( CHU ), Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle ( CRESS - U1153 ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ) -Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité ( CRESS (U1153 / UMR_A 1125) ), Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Gerontopole of Toulouse, CHU- Université de Toulouse, Université Paris-Est Marne-la-Vallée ( UPEM ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Eindhoven University of Technology [Eindhoven] ( TU/e ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -Hôpital Arnaud de Villeneuve, Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier ( IRIM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ), Institut de génétique humaine ( IGH ), Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire AIM, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre d'Etudes de Saclay, Telecom Bretagne, Brest, Laboratoire de magnétisme et d'optique de Versailles ( LMOV ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Cognition, Action, et Plasticité Sensorimotrice [Dijon - U1093] ( CAPS ), Université de Bourgogne ( UB ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Departement de Cardiologie, Space Science Division, Neuropsychiatrie : recherche épidémiologique et clinique, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Antoine Béclère, UMS11 Cohortes en population, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Bousquet, J, Kuh, D, Bewick, M, Standberg, T, Farrell, J, Pengelly, R, Joel, M. E, Rodriguez Mañas, L, Mercier, J, Bringer, J, Camuzat, T, Bourret, R, Bedbrook, A, Kowalski, M. L, Samolinski, B, Bonini, S, Brayne, C, Michel, J. P, Venne, J, Viriot Durandal, P, Alonso, J, Avignon, A, Ben Shlomo, Y, Bousquet, P. J, Combe, B, Cooper, R, Hardy, R, Iaccarino, G, Keil, T, Kesse Guyot, E, Momas, I, Ritchie, K, Robine, J. M, Thijs, C, Tischer, C, Vellas, B, Zaidi, A, Alonso, F, Andersen Ranberg, K, Andreeva, V, Ankri, J, Arnavielhe, S, Arshad, H, Augé, P, Berr, C, Bertone, P, Blain, H, Blasimme, A, Buijs, G. J, Caimmi, D, Carriazo, A, Cesario, A, Coletta, J, Cosco, T, Criton, M, Cuisinier, F, Demoly, P, Fernandez Nocelo, S, Fougère, B, Garcia Aymerich, J, Goldberg, M, Guldemond, N, Gutter, Z, Harman, D, Hendry, A, Heve, D, Illario, Maddalena, Jeandel, C, Krauss Etschmann, S, Krys, O, Kula, D, Laune, D, Lehmann, S, Maier, D, Malva, J, Matignon, P, Melen, E, Mercier, G, Moda, G, Nizinkska, A, Nogues, M, O'Neill, M, Pelissier, J. Y, Poethig, D, Porta, D, Postma, D, Puisieux, F, Richards, M, Robalo Cordeiro, C, Romano, V, Roubille, F, Schulz, H, Scott, A, Senesse, P, Slagter, S, Smit, H. A, Somekh, D, Stafford, M, Suanzes, J, Todo Bom, A, Touchon, J, Traver Salcedo, V, Van Beurden, M, Varraso, R, Vergara, I, Villalba Mora, E, Wilson, N, Wouters, E, Zins, M., CNR, Rome, Italy and Department of Medicine-University of Naples Federico II = Università degli studi di Napoli Federico II, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Astrophysique Interprétation Modélisation (AIM (UMR7158 / UMR_E_9005 / UM_112)), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Université Paris Cité (UPCité), Bousquet, Jean, Kuh, D., Bewick, M., Standberg, T., Farrell, J., Pengelly, R., Joel, M. E., Rodriguez Mañas, L., Mercier, J., Bringer, J., Camuzat, T., Bourret, R., Bedbrook, A., Kowalski, M. L., Samolinski, B., Bonini, Sergio, Brayne, C., Michel, J. P., Venne, J., Viriot Durandal, P., Alonso, J., Avignon, A., Ben Shlomo, Y., Bousquet, P. J., Combe, B., Cooper, R., Hardy, R., Iaccarino, G., Keil, T., Kesse Guyot, E., Momas, I., Ritchie, K., Robine, J. M., Thijs, C., Tischer, C., Vellas, B., Zaidi, A., Alonso, F., Andersen Ranberg, K., Andreeva, V., Ankri, J., Arnavielhe, S., Arshad, H., Augé, P., Berr, C., Bertone, P., Blain, H., Blasimme, A., Buijs, G. J., Caimmi, D., Carriazo, A., Cesario, A., Coletta, J., Cosco, T., Criton, M., Cuisinier, F., Demoly, P., Fernandez Nocelo, S., Fougère, B., Garcia Aymerich, J., Goldberg, M., Guldemond, N., Gutter, Z., Harman, D., Hendry, A., Heve, D., Illario, M., Jeande, C., Krauss Etschmann, S., Krys, O., Kula, D., Laune, D., Lehmann, S., Maier, D., Malva, J., Matignon, P., Melen, E., Mercier, G., Moda, G., Nizinkska, A., Nogues, M., O’Neill, M., Pelissier, J. Y., Poethig, D., Porta, D., Postma, D., Puisieux, F., Richards, M., Robalo Cordeiro, C., Romano, V., Roubille, F., Schulz, H., Scott, A., Senesse, P., Slagter, S., Smit, H. A., Somekh, D., Stafford, M., Suanzes, J., Todo Bom, A., Touchon, J., Traver Salcedo, V., Van Beurden, M., Varraso, R., Vergara, I., Villalba Mora, E., Wilson, N., Wouters, E., Groningen Research Institute for Asthma and COPD (GRIAC), Epidemiologie, RS: CAPHRI School for Public Health and Primary Care, RS: CAPHRI - R5 - Optimising Patient Care, Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes (CHRU Nîmes)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-European Innovation Partnership on Active and Healthy Ageing Reference Site (EIP on AHA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Antoine Béclère, UMS011 Cohortes épidémiologiques en population (CONSTANCES), and Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Gerontology, Aging, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], EUROPEAN INNOVATION PARTNERSHIP, Population, Medicine (miscellaneous), Social Environment, MACVIA-LR, Quality of life (healthcare), European Innovation Partnership on Active and Healthy Ageing, Active and Healthy Ageing, PREVENTING CHRONIC DISEASES, definition, Nutrition and Dietetics, Geriatrics and Gerontology, LIFE YEARS, Nutrition and Dietetic, Journal Article, Medicine, Humans, DISEASES CHRONIC DISEASES, Function (engineering), education, Exercise, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, POPULATION, media_common, education.field_of_study, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Operational definition, EIP, Social environment, Conceptual framework, Health, General partnership, Chronic Disease, Quality of Life, France, Independent Living, business, Independent living, Human, macvia lr
Abstract: Health is a multi-dimensional concept, capturing how people feel and function. The broad concept of Active and Healthy Ageing was proposed by the World Health Organisation (WHO) as the process of optimizing opportunities for health to enhance quality of life as people age. It applies to both individuals and population groups. A universal Active and Healthy Ageing definition is not available and it may differ depending on the purpose of the definition and/or the questions raised. While the European Innovation Partnership on Active and Healthy Ageing (EIP on AHA) has had a major impact, a definition of Active and Healthy Ageing is urgently needed. A meeting was organised in Montpellier, France, October 20-21, 2014 as the annual conference of the EIP on AHA Reference Site MACVIA-LR (Contre les Maladies Chroniques pour un Vieillissement Actif en Languedoc Roussillon) to propose an operational definition of Active and Healthy Ageing including tools that may be used for this. The current paper describes the rationale and the process by which the aims of the meeting will be reached. Health is a multi-dimensional concept, capturing how people feel and function. The broad concept of Active and Healthy Ageing was proposed by the World Health Organisation (WHO) as the process of optimizing opportunities for health to enhance quality of life as people age. It applies to both individuals and population groups. A universal Active and Healthy Ageing definition is not available and it may differ depending on the purpose of the definition and/or the questions raised. While the European Innovation Partnership on Active and Healthy Ageing (EIP on AHA) has had a major impact, a definition of Active and Healthy Ageing is urgently needed. A meeting was organised in Montpellier, France, October 20-21, 2014 as the annual conference of the EIP on AHA Reference Site MACVIA-LR (Contre les Maladies Chroniques pour un Vieillissement Actif en Languedoc Roussillon) to propose an operational definition of Active and Healthy Ageing including tools that may be used for this. The current paper describes the rationale and the process by which the aims of the meeting will be reached.
Published: 2015
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348. Intentional gestural communication and discrimination of human attentional states in rhesus macaques (Macaca mulatta)

Author: Dalila Bovet, Hélène Meunier, Charlotte Canteloup, Laboratoire Éthologie Cognition Développement (LECD), Université Paris Nanterre (UPN), Département Ecologie, Physiologie et Ethologie (DEPE-IPHC), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Psychologie de la Connaissance, du Langage et de l'Émotion (PsyCLÉ), and Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: Male, Joint attention, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SHS.PSY]Humanities and Social Sciences/Psychology, Experimental and Cognitive Psychology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Social cognition, Orientation, Begging, Animals, Humans, Alternation (formal language theory), Attention, 0501 psychology and cognitive sciences, Animal communication, 050102 behavioral science & comparative psychology, 10. No inequality, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Communication, Gestures, business.industry, Psychological research, 05 social sciences, Macaca mulatta, Gaze, pas de mot-clé, Animal Communication, Face, Female, Cues, business, Psychology, 030217 neurology & neurosurgery, Gesture
Abstract: International audience; Pourquoi les femmes sont-elles sujettes à la ménopause ? Cette question reste en grande partie mystérieuse. Logiquement, les mécanismes biologiques de l'évolution font en sorte que les invididus ne vivent guère longtemps au-delà de leur période de procréation. La ménopause est ainsi rarissime, et ne se produit que dans l'espèce humaine, ainsi que chez deux cétacés : l'orque et le globicéphale. Ce qui a poussé les biologistes à s'intéresser aux orques, dans le but de comprendre pourquoi leurs femelles sont ménopausées.Des observations nouvelles viennent ainsi d'être réalisées et publiées par une équipe de chercheurs de l'Université d'Exeter en Grande-Bretagne associée à des spécialistes des baleines de l'État de Washington, aux États-Unis. Ces observations pourraient expliquer pourquoi les femelles de rares espèces (dont la nôtre) ont une durée de vie largement supérieure à leur période de reproduction.Les orques vivent en troupes d'une quinzaine d'individus unis par des liens sociaux riches et complexes. Remarquablement intelligentes, parfois qualifiées de « baleines tueuses », les femelles âgées tiennent une place particulière que l'on peut observer dans des scènes typiques de la vie de ces animaux, où une orque conduit par exemple ses fils et ses filles, déjà d'âge adulte, vers un banc de saumons. Les jeunes adultes, parfaitement capables de chasser, se laissent mener sur la trajectoire du banc de poissons, dont ils semblent ignorer l'emplacement exact. Tout se passe comme si la...
Published: 2015
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349. In vitro and in vivo evaluation of the inflammatory potential of various nanoporous hydroxyapatite biomaterials

Author: Frédéric Velard, Jean-Christophe Fricain, Loïc Vidal, Jean-Marie Nedelec, Cathie Vix-Guterl, Karine Anselme, Stéphanie Sayen, Silke Schlaubitz, Edouard Jallot, Dominique Laurent-Maquin, Patrice Laquerriere, Janina Möller-Siegert, Christine Guillaume, Olivier Raissle, Joëlle Amédée, Institut de Science des Matériaux de Mulhouse (IS2M), Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique, Département des Sciences Analytiques, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (LSMBO-DSA-IPHC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Recherches Subatomiques (DRS-IPHC), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sciences Analytiques et Interactions Ioniques et Biomoléculaires (DSA-IPHC), Département Interactions Physique, Chimie et Vivant (DIPCV-IPHC), Département Ecologie, Physiologie et Ethologie (DEPE-IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de spectrométrie de masse BioOrganique, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique (LSMBO), and IPHC-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: nanoporous hydroxyapatite biomaterials, Aucun, Medicine (miscellaneous), Biocompatible Materials, 02 engineering and technology, 01 natural sciences, Mice, Nanopores, Crystallinity, chemically induced, metabolism, pathology, Materials Testing, Sciences du Vivant [q-bio]/Biotechnologies, toxicity, General Materials Science, Cells, Cultured, Mice, Inbred BALB C, Nanoporous, chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Resorption, Nanomedicine, Female, Inflammation Mediators, Powders, medicine.symptom, 0210 nano-technology, Materials science, Critical size defect, Biomedical Engineering, Bioengineering, Nanotechnology, Inflammation, In Vitro Techniques, Development, 010402 general chemistry, Osseointegration, In vivo, Specific surface area, medicine, Animals, Humans, inflammatory potential, In vitro, 0104 chemical sciences, Durapatite, Bone Substitutes, Biophysics, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other
Abstract: To discriminate the most important physicochemical parameters for bone reconstruction, the inflammatory potential of seven nanoporous hydroxyapatite powders synthesized by hard or soft templating was evaluated both in vitro and in vivo. Aim: To discriminate the most important physicochemical parameters for bone reconstruction, the inflammatory potential of seven nanoporous hydroxyapatite powders synthesized by hard or soft templating was evaluated both in vitro and in vivo. Materials & methods: After physical and chemical characterization of the powders, we studied the production of inflammatory mediators by human primary monocytes after 4 and 24 h in contact with powders, and the host response after 2 weeks implantation in a mouse critical size defect model. Results:In vitro results highlighted increases in the secretion of TNF-α, IL-1, -8, -10 and proMMP-2 and -9 and decreases in the secretion of IL-6 only for powders prepared by hard templating. In vivo observations confirmed an extensive inflammatory tissue reaction and a strong resorption for the most inflammatory powder in vitro. Conclusion: These findings highlight that the most critical physicochemical parameters for these nanoporous hydroxyapatite are, the crystallinity that controls dissolution potential, the specific surface area and the size and shape of crystallites. journal article research support, non-u.s. gov't 2015 imported
Published: 2015
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350. Palladium-catalysed Suzuki--Miyaura cross-coupling with imidazolylidene ligands substituted by crowded resorcinarenyl and calixarenyl units

Author: Neslihan Şahin, Cemal Kaya, Eric Brenner, Dominique Matt, Loïc Toupet, David Sémeril, Institut de Chimie de Strasbourg, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut de Physique de Rennes (IPR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and [Sahin, Neslihan -- Semeril, David -- Brenner, Eric -- Matt, Dominique] Strasbourg Univ, UMR CNRS 7177, Lab Mol Inorgan Chem & Catalysis, Strasbourg, France -- [Sahin, Neslihan -- Kaya, Cemal] Cumhuriyet Univ, Fac Sci, Dept Chem, Sivas, Turkey -- [Toupet, Loic] Univ Rennes 1, Inst Phys, UMR CNRS 6251, F-35014 Rennes, France
Subjects: chemistry.chemical_element, Suzuki-Miyaura coupling, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Medicinal chemistry, cavitands, Resorcinarene,calixarene,cavitands,$N$-heterocyclic carbene,palladium,PEPPSI complexes,Suzuki--Miyaura coupling, chemistry.chemical_compound, Pyridine, Calixarene, Organic chemistry, [PHYS]Physics [physics], Resorcinarene, 010405 organic chemistry, Aryl, Cavitand, General Chemistry, palladium, 0104 chemical sciences, 3. Good health, chemistry, calixarene, PEPPSI complexes, N-heterocyclic carbene, Carbene, Boronic acid, Palladium
Abstract: WOS: 000365507600004, Two N-heterocyclic carbene (NHC) palladium complexes of formula [PdBr2 (NHC)(pyridine)] in which the carbenic ring is flanked by sterically crowded cavitand substituents were prepared from appropriate imidazolium salts bearing either two resorcinarene or a combination of resorcinarene and calixarene fragments. Both complexes displayed high stability and good activities in the cross-coupling of aryl bromides with phenyl boronic acid. One of the imidazolium salts was characterised by an X-ray diffraction study., Scientific and Technological Research Council of Turkey (TUBITAK-BIDEB); International Research Fellowship Programme; French Agence Nationale de la Recherche (ANR) [ANR-12-BS07-0001-01-RESICAT], The authors thank the Scientific and Technological Research Council of Turkey (TUBITAK-BIDEB), the International Research Fellowship Programme for a grant to N.S., and the French Agence Nationale de la Recherche (ANR) (ANR-12-BS07-0001-01-RESICAT) for financial support.
Published: 2015
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