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3,777 results on '"Unité de Recherches Avicoles"'

251. Biological basis of broiler meat quality

Author: Berri, Cécile, Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2016

252. Ingestion de sol par les poules pondeuses : Impact sur les performances de production, la qualité des oeufs et la valorisation énergétique de l’aliment

Author: Travel, Angélique, Le François, M., Mika, A, Hallouis, Jean-Marc, Jurjanz, Stefan, LESSIRE, Michel, Nys, Yves, Jondreville, Catherine, ITAVI, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux (URAFPA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL)
Subjects: ingestion sol, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, digestibilité, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], poule, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, performance
Abstract: National audience
Published: 2016

253. Variations épigénétiques en réponse à la chaleur chez le poulet de chair

Author: David, Sarah-Anne, Beauclair, Linda, Moncollin, V., Collin, Anne, Coustham, Vincent, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), ProdInra, Migration, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: modification post traductionnelle des histones, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], épigénétique, [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], chaleur, oiseau, adaptation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2016

254. Élaboration d’une architecture générique de modélisation du fonctionnement d’un système d’élevage : le projet ArchiMod

Author: Florence Garcia-Launay, Olivier Martin, Bertrand Méda, Laurence Puillet, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Unité de Recherches Avicoles (URA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], Langage graphique
Abstract: absent
Published: 2016

255. Towards a generic animal model (T-GAM): building models of key biological functions by a shared systemic approach

Author: Friggens, Nicolas, Puillet, Laurence, Favreau-Peigné, Angélique, Martin, Olivier, Taghipoor, Masoomeh, Narcy, Agnès, Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Unité de Recherches Avicoles (URA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2016

256. Mise au point d’une méthode de phénotypage à haut-débit de l’efficacité digestive chez le porc en croissance

Author: Conde Aguilera, Jose Alberto, Recoules, Emilie, Narcy, Agnès, Ayuso, Miriam, Gilbert, Hélène, Bouquet, Alban, Bastianelli, Denis, Ganier, Philippe, Labussière, Etienne, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Universidad Complutense de Madrid = Complutense University of Madrid [Madrid] (UCM), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut du Porc (IFIP), and Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)
Subjects: alimentation animale, spectrométrie proche infrarouge, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], nutrition animale, efficacité digestive, porc
Abstract: National audience; L’amélioration de l’efficacité alimentaire des porcs est un objectif de sélection prioritaire car l’alimentation représente environ deux-tiers du coût de production (66% en 2014 selon IFIP, 2015). Le travail de sélection est actuellement réalisé sur la base d’un aliment riche en énergie et facilement digestible, alors que les aliments utilisés en élevage sont généralement moins digestibles, du fait de l’utilisation croissante de coproduits. Une étude conduite à l'Inra (Saint-Gilles) en 2012 suggère un déterminisme génétique de l’aptitude à digérer les nutriments et l’énergie d’un régime fibreux ouvrant la possibilité de sélectionner spécifiquement ce caractère afin d’améliorer l’efficacité alimentaire dans ce nouveau contexte (Noblet et al., 2013). Cependant, l’absence de méthodes rapides pour caractériser la capacité digestive des animaux ne permet pas de développer des stratégies de sélection adaptées à ces évolutions du contexte alimentaire de la production porcine. L’objectif de ce projet est donc de mettre au point une méthode de phénotypage à haut-débit de l’efficacité digestive des porcs s’appuyant sur la spectrométrie dans le proche infrarouge (SPIR). Cette méthode doit permettre, à terme, d’évaluer la variabilité de l’efficacité digestive entre animaux en élevage, et de proposer des stratégies de sélection adaptées à ce nouveau contexte de ressources alimentaires. Pour cela, nous envisageons d’évaluer, d’une part, la méthode de prétraitement des échantillons avant analyse (lyophilisation, séchage en étuve ou pas de prétraitement), et d’autre part, la fiabilité d’un marqueur indigestible mesurable par SPIR qui permettrait de s’affranchir de la collecte totale des fèces, au profit d’une collecte ponctuelle. Deux régimes différant par leur teneur en fibres (4 ou 8 % de cellulose brute) ont été formulés afin de créer une variabilité d’utilisation digestive. Les marqueurs utilisés sont le polyéthylène glycol (PEG, VWR), l’huile de silicone (Thermo Ficher Scientific), et une résine plastique (polyvinyle de fluorure, Arkema SA) qui sont mesurables par la SPIR. Au total, 48 porcs ont été placés en cages à digestibilité en 2 lots de 40 kg et 70 kg de poids vif. Chaque porc a reçu l’un des 4 régimes avec 2 semaines d’adaptation et 1 semaine de mesure précise de la quantité d’aliment ingéré et de collecte des fèces. Les fèces de la collecte totale et ponctuelle partielle ont été aliquotées séparément pour des analyses par SPIR sur produit frais et sur produit lyophilisé et pour des analyses de laboratoire sur produit lyophilisé (azote, matière organique, matière grasse, fibres, et énergie). Les premiers résultats montrent que les marqueurs choisis ne modifient ni la digestibilité de la matière sèche ni la production de fèces de l’animal.
Published: 2016

257. Répondre aux enjeux du développement durable : la méthode OVALI au service des filières avicoles

Author: Isabelle Bouvarel, Bertrand Méda, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI), Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ITAVI, and Unité de Recherches Avicoles (URA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2016

258. Automédication et expérience négative post-natale chez le poussin

Author: Leterrier, Christine, Koch, Alexia, Collin, Anne, Mercerand, Frederic, Rat, Christophe, Delaveau, Joël, Grimaud, Isabelle, Constantin, Paul, Guilloteau, Laurence, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (UE PEAT), Société Française pour l'Etude du Comportement Animal (SFECA). FRA., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ProdInra, Migration
Subjects: stress, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], choix, [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], oiseau, jeune, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, automédication
Abstract: National audience
Published: 2016

259. Tissue Distribution and Transfer to Eggs of Ingested α-Hexabromocyclododecane (α-HBCDD) in Laying Hens ( Gallus domesticus )

Author: Angélique Travel, Gaud Dervilly-Pinel, Bruno Le Bizec, Catherine Jondreville, Ronan Cariou, Elena Dominguez-Romero, Elsa Omer, Philippe Marchand, Unité de Recherches Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux (URAFPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ITAVI, Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)
Subjects: medicine.medical_specialty, food.ingredient, Animal feed, Eggs, 0211 other engineering and technologies, Adipose tissue, Food Contamination, 02 engineering and technology, 010501 environmental sciences, Biology, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, Animal science, food, Internal medicine, Yolk, Abdominal fat, medicine, Animals, Tissue Distribution, Tissue distribution, 0105 earth and related environmental sciences, Hexabromocyclododecane, 021110 strategic, defence & security studies, General Chemistry, Metabolism, Animal Feed, Egg Yolk, Hydrocarbons, Brominated, Endocrinology, chemistry, [SDV.SA.SPA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, [SDE]Environmental Sciences, Female, General Agricultural and Biological Sciences, Chickens, Food contaminant
Abstract: The aim of the current study was to describe the fate of ingested alpha-hexabromocyclododecane (alpha-HBCDD) in laying hens. Individuals were exposed to two dietary concentrations of a-HBCDD (50 and 5 ng g(-1) feed) for 18 or 11 weeks followed by a 7-week decontamination period. The results show that no isomerization of alpha- to beta- or gamma-HBCDD forms occurred, whereas OH-HBCDD was identified as a product of alpha-HBCDD metabolism. Irrespective of the level of feed contamination, estimates of steady-state accumulation ratios were 5.2, 3.6, and 9.2 and half-lives were estimated at 17.4, 22.8, and 35.3 days in egg yolk, liver tissue, and abdominal fat, respectively. The steady-state carry-over rate to eggs was 22.9%. Thus, alpha-HBCDD ingested by laying hens is readily transferred to eggs and significantly accumulates in adipose tissue.
Published: 2016
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260. Etude du rôle des modifications post-traductionnelles des histones dans l’acclimatation embryonnaire à la chaleur chez le poulet

Author: David, Sarah-Anne, Moncollin, V., Collin, Anne, Coustham, Vincent, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Subjects: épigénétique, [SDV]Life Sciences [q-bio], poulet, modification post-traductionnelle, [INFO]Computer Science [cs], acclimatation au chaud, histone
Abstract: National audience; L’environnement précoce des individus est capable d’impacter l’expression des gènes à long terme via des altérations de leur épigénome. Par exemple chez Drosophila melanogaster l’exposition à un stress thermique au cours de l’embryogenèse induit des modifications épigénétiques visibles à l’âge adulte via le complexe PRC2 (Polycomb Repressive Complex 2) (pour revue Steffen and Ringrose 2014). Une marque d’histones modulée par PRC2 est la tri-méthylation de la lysine 27 sur l’histone H3 (H3K27Me3). Cette marque est décrite comme ayant un rôle dans la mémoire d’un état répressif sous l’influence de l’environnement. Notamment chez Arabidopsis thaliana, suite à l’exposition au froid de l’hiver cette marque maintient la répression d’un répresseur floral pour permettre la floraison (Coustham et al. 2012). Dans un contexte de réchauffement climatique, notre équipe a étudié les effets d’un protocole expérimental permettant d’acclimater les poulets à la chaleur pendant l’embryogénèse (Piestun et al., 2008 ; Loyau et al., 2013). En effet, les animaux sélectionnés pour leurs performances de croissance sont peu résistants aux variations de températures. Le traitement d’acclimatation embryonnaire à la chaleur (TAEC) correspond à une augmentation cyclique de la température et de l’humidité relative (HR) pendant l’incubation des jours E7 à E16 de l’embryogénèse (de 37,8°C et 55% HR à 39,5°C et 65% HR pendant 12h). Cette modification de l’environnement précoce des individus altère peu l’éclosabilité et améliore le taux de survie lors d’un coup de chaleur survenant à l’âge d’abattage (J35). Cette thermotolérance accrue est associée de changements physiologiques, métaboliques et d’expressions de gènes à 5 semaines (Piestun et al., 2011, et Loyau et al., 2013, 2014). Nos recherches reposent sur l’hypothèse que les différences d’expressions de gènes observées chez les individus acclimatés peuvent être induites par des modifications épigénétiques survenant durant le TAEC et qui perdurent au cours du développement. Les travaux présentés porteront sur la mise au point de l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) sur deux tissus de poulet afin de cartographier H3K27Me3.
Published: 2016

261. Etude d’une programmation nutritionnelle chez le canard mulard

Author: Cornuez, Alexis, Bernadet, Marie-Dominique, Secula, Aurelie, LESSIRE, Michel, bonnefont, Cécile, Cobo, Emilie, Mercerand, Frederic, LE BOURHIS, Maria-Céleste, MARTIN, Xavier, Pitel, Frédérique, Brun, Jean- Michel, Morisson, Mireille, Palmipèdes à Foie Gras (UEPFG), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de Recherches Avicoles (URA), Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (UE PEAT), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [INFO] Computer Science [cs]
Abstract: National audience; Nous nous intéressons à une programmation nutritionnelle chez le canard mulard, hybride intergénérique de la cane commune (Anas platyrhynchos) et du canard de Barbarie (Cairina moschata) utilisé pour la production de foie gras. Soixante canes communes ont été installées en cages individuelles dès l’âge de 9 semaines et nourries ad libitum. La moitié d’entre elles a reçu un aliment dont la teneur en méthionine est réduite par rapport aux recommandations. L’autre moitié a reçu un aliment témoin. Nous avons récolté 90 œufs non fécondés pour chacun des deux groupes de cannes. Ensuite, un total de 300 mulards des 2 sexes a été produit pour chacun des deux groupes. Parmi eux, 60 ont été sacrifiés à la naissance, 60 ont été abattus avant la mise en gavage (à 12 semaines d’âge) et 180 ont été gavés pendant 12 jours, puis abattus. Chez les canes communes, nous avons mesuré la consommation alimentaire individuelle, les caractères de croissance et de reproduction ainsi que les poids des œufs, du blanc et du jaune. Chez les descendants mulards, nous avons mesuré le poids des canetons, mâles et femelles, ainsi que la couleur du duvet. Sur tous les mulards en croissance, nous avons relevé la consommation alimentaire par lot de 60 animaux, le poids aux âges de 4, 8 et 12 semaines. Chez les animaux gavés, nous avons noté l’ingéré et, à l’abattage, les performances zootechniques de routine (poids vif, poids de carcasse, du foie, du magret, du gras abdominal,…) et des paramètres de qualités technologiques du foie et du magret. Enfin, quelques paramètres plasmatiques ont été dosés chez les canes et les mulards aux différents âges d’abattage. Les résultats sont en cours d’analyse mais nous avons dès à présent relevé des éléments qui suggèrent l’existence d’une programmation nutritionnelle chez nos canards mulards : 1/ Les œufs des canes carencées en méthionine sont de plus petit poids (65,6g vs 71,2g chez les témoins) et le poids du blanc (32,7g vs 37,1g) et du jaune (20,8g vs 21,7g) sont également diminués. Les embryons issus de canes carencées subissent donc une carence nutritionnelle lors de leur développement embryonnaire. 2/ Les paramètres plasmatiques mesurés (glucose, triglycérides, acides gras libres,…) chez les canetons nouveau-nés sont très affectés par la carence mais de façon différenciée entre mâles et femelles. 3/ Après gavage, le poids vif et le poids du foie gras sont diminué de façon significative chez les deux sexes. Enfin, nous avons constitué une tissuthèque composée de plus de 5000 échantillons afin de pouvoir explorer les mécanismes moléculaires impliqués dans cette programmation nutritionnelle.
Published: 2016

262. Quelques résultats issus du programme EpiBird, 'Analyses Epigénétiques chez les Oiseaux'

Author: Pitel, Frédérique, Morisson, Mireille, Leroux, Sophie, Cornuez, Alexis, Bernadet, Marie-Dominique, LESSIRE, Michel, Gourichon, David, Riviere, Sandrine, Labrune, Yann, Frésard, Laure, Pain, Bertrand, Zerjal, Tatiana, Leterrier, Christine, Coustham, Vincent, Brun, Jean- Michel, Minvielle, Francis, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Palmipèdes à Foie Gras (UEPFG), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Avicoles (URA), Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (UE PEAT), Institut cellule souche et cerveau (U846 Inserm - UCBL1), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs]
Abstract: National audience; Bien que le poulet soit la première espèce d'importance agronomique à avoir été séquencée, moins d'expériences que chez les mammifères ont été menées chez des oiseaux afin d'étudier ces processus épigénétiques, malgré leur influence possible sur les phénotypes économiquement importants. Une meilleure compréhension des mécanismes épigénétiques gouvernant la réponse du génome aux environnements changeants pourrait ouvrir de nouvelles voies pour améliorer, notamment, l'efficacité de la sélection et le bien-être animal. Ces phénomènes pourraient être pris en compte par les généticiens visant à étudier l'adaptation des animaux à des environnements changeants. Le programme EpiBird avait pour but d’aborder cette thématique, encore peu développée, chez les oiseaux. Outre les analyses approfondies, dans divers types cellulaires, des gènes présents chez la poule et pouvant intervenir dans les phénomènes épigénétiques, notamment au cours du développement, nous avons réalisé des études dans différents modèles - poule, canard et caille - pour aborder les question de l'existence d'empreinte génomique parentale chez les oiseaux, de programmation nutritionnelle et d'épigénétique transgénérationnelle. Chez la poule, nous avons caractérisé par séquençage le transcriptome embryonnaire pour mettre en évidence un phénomène d'empreinte génomique parentale, s'il existe, chez le poulet (thèse de Laure Frésard). L'obtention des séquences du transcriptome de 20 embryons issus de croisements réciproques entre deux lignées génétiquement éloignées, et les plus consanguines possible, a démontré l'absence d'empreinte génomique parentale dans l'embryon entier de 4,5 jours. Des analyses de méthylation ont été réalisées sur ces embryons par WGBS (Whole Genome Bisulfite Sequencing) et sont en cours d'analyse (thèse de Marjorie Mersch). Chez le canard, la question était d'observer si une carence en méthionine dans le régime des mères avait une influence sur le phénotype des descendants, 2 (voie paternelle) ou 3 (voie maternelle) générations plus tard. Nous avons choisi le modèle du canard mulard gavé, principale source de foie gras en France, hybride intergénérique issu du croisement d'une mère "commune" avec un père "Barbarie". Après avoir montré qu'une programmation nutritionnelle des mères influençait le phénotype des descendants (travaux poursuivis par Mireille Morisson), nous avons observé un effet général de la carence en méthionine des canes communes de la génération G0 pour plusieurs fonctions à la génération G3 : la croissance globale des mulards jusqu’à l’âge de 12 semaines, une croissance de type compensatrice entre 4 et 8 semaines, une allométrie de croissance différente de certains organes (différences de développement musculaire du magret, notamment), le gain de poids en gavage traduisant l’efficacité de la lipogénèse hépatique et enfin des différences concernant l’engraissement sous-cutané après gavage. Ces fonctions qui semblent indépendantes pourraient mettre en jeu des mécanismes physiologiques (et épigénétiques) différenciés. Des effets sexe-spécifiques sont mis en évidence sur la consommation en gavage et le poids du gras abdominal. Dans la lignée Barbarie, des mâles ayant subi une carence précoce par le régime de leurs mères transmettent, via leurs gamètes, des effets qui diminuent le poids corporel, mais augmentent le gain de poids pendant le gavage. Le poids du gras abdominal est significativement accru, ainsi que les taux de glucose et de triglycérides sanguins en fin de gavage. Enfin, nous avons utilisé une population de cailles issue de la lignée S+ (à forte motivation sociale). L'objectif était alors d’estimer les différences phénotypiques entre deux lignées de cailles de la troisième génération (G3) issues des mêmes ancêtres (G-1), aux œufs traités (G0 Epi+) ou non (G0 Epi-) par une injection de génistéine. La génistéine perturbe l'épigénome (notamment au niveau de la méthylation de l'ADN) et est un phyto-oestrogène connu pour son impact sur l'appareil reproducteur dans plusieurs espèces, au moins sur la première génération de descendants. Après 3 générations sans traitement, une différence significative sur la maturité sexuelle des animaux, qui n’est alors plus attribuable aux effets maternels directs, a été observée entre les lignées Epi+ et Epi- : les animaux Epi- sont plus précoces et pondent plus d’œufs sur leurs carrières. Un effet significatif a également été démontré sur l’interaction entre le poids à 3 semaines et le sexe des animaux. Enfin, des tests de comportement ont révélé des différences très significatives entre les deux populations : la lignée Epi , n'ayant pas subi l'injection, a un comportement similaire à la lignée S+ dont elle est issue. Phénomène remarquable, la lignée Epi+ montre, elle, un comportement comparable à la lignée S-. Les différences entre les deux populations sont de même ampleur que les différences entre les animaux de la cinquantième génération issus des deux lignées sélectionnées de manière divergente. Ces analyses mettent en évidence l'impact d'une modification de l'environnement des fondateurs sur le phénotype des descendants, 3 générations plus tard, chez la caille. Les lignées ont été construites en "miroir", de manière à disposer du fond génétique le plus homogène possible entre les deux lignées, et les effets des fondateurs ont bien sûr été intégrés dans les modèles d'analyse, mais on ne peut exclure une explication génétique aux phénomènes observés. Le programme SelGen EPIQUES devrait nous permettre d'aller plus loin dans cette thématique de recherches.
Published: 2016

263. THERMOCHICK : Acclimatation embryonnaire à la chaleur. Quels sont les mécanismes modifiés chez le poulet de chair en finition ?

Author: Loyau, Thomas, Hennequet Antier, Christelle, Métayer Coustard, Sonia, Leduc, Marie, Crochet, Sabine, Cailleau-Audouin, Estelle, SANNIER, MELANIE, Berri, Cecile, Duclos, Michel Jacques, Tesseraud, Sophie, Couroussé, Nathalie, Chartrin, Pascal, Praud, Christophe, Everaert, Nadia, Rideau, Nicole, Mignon-Grasteau, Sandrine, Moroldo, Marco, Lecardonnel, Jerôme, Martin, Patrice, COUSTHAM, Vincent, Lagarrigue, Sandrine, Yahav, S., Collin, Anne, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Liège, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Agricultural Research Organization
Subjects: adaptation à la chaleur, [SDV]Life Sciences [q-bio], embryon aviaire, [INFO]Computer Science [cs], acclimatation au chaud, poulet de chair, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2016

264. Effet des fibres alimentaires sur la digestibilité du phosphore dans des régimes à base de tourteau de colza et supplémentés en phytase microbienne chez le porc en croissance

Author: Bournazel, Marion, Meme, Nathalie, Magnin, Michel, Peyronnet, Corinne, Qunisac, Alain, LESSIRE, Michel, Labussière, Etienne, Narcy, Agnès, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MIXscience, Terres Inovia, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: porc en croissance, digestibility, digestibilité, animal nutrition, [SDV]Life Sciences [q-bio], rapeseed meal, dietary fibre, tourteau de colza, fibre alimentaire, nutrition animale, phytase microbienne, monogastrique, phosphore
Abstract: Effet des fibres alimentaires sur la digestibilité du phosphore dans des régimes à base de tourteau de colza et supplémentés en phytase microbienne chez le porc en croissance. 48. Journées de la Recherche Porcine
Published: 2016

265. Effet de l'abaissement du bilan électrolytique de l'aliment distribué en fin de gestation sur le déroulement de la mise-bas, la survie des porcelets et la dynamique de mobilisation osseuse des truies

Author: Boudon, Anne, Quesnel, Hélène, Dourmad, Jean-Yves, Duhamel, Jennifer, Quemeneur, Benoît, Planchenault, Daniel, Narcy, Agnès, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), MIXscience, Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2016

266. Microbiote digestif des volailles

Author: Gabriel, Irène, Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2016

267. Mécanismes régulant l'utilisation périphérique du glucose- Focus sur le transport de glucose

Author: Coudert, Edouard, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université François Rabelais (Tours), and Tesseraud Sophie et Sonia Métayer-Coustard
Subjects: Transport de glucose, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], these
Published: 2016

268. Transgenerational effects of modifications of the embryonic environment in quail

Author: Zerjal, Tatiana, Leroux, Sophie, Gourichon, David, Leterrier, Christine, Labrune, Yann, Coustham, Vincent, Coville, Jean-Luc, Morisson, Mireille, Minvielle, Francis, Pitel, Frédérique, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (UE PEAT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherches Avicoles (URA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, ANR EpiBird ANR-09-GENM-004, Université Paris-Saclay, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (PEAT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), American Society of Animal Science (ASAS). USA., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, animal structures, transgenerational effects, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, embryo, quail, equipment and supplies, caille, complex mixtures, genomic, effet transgénérationnel, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, épigénétique, embryon, oiseau, bacteria, [INFO]Computer Science [cs], genetic, epigenetic, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: Transgenerational effects of modifications of the embryonic environment in quail. 35. International Society for Animal Genetics Conference
Published: 2016

269. Serum and Muscle Metabolomics for the Prediction of Ultimate pH, a Key Factor for Chicken-Meat Quality

Author: Lydie Nadal-Desbarats, Stéphane Beauclercq, Sophie Tesseraud, Marie Bourin, Anne Collin, Elisabeth Le Bihan-Duval, Cécile Berri, Christelle Hennequet-Antier, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Francois Rabelais [Tours], ITAVI, and CASDAR optiviande
Subjects: 0301 basic medicine, Male, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Magnetic Resonance Spectroscopy, Meat, Poulet, Qualité viande, Biology, medicine.disease_cause, pH ultime, Biochemistry, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Metabolomics, Species Specificity, medicine, Animals, Muscle, Skeletal, Muscle catabolism, Models, Statistical, Glycogen, 0402 animal and dairy science, Discriminant Analysis, 04 agricultural and veterinary sciences, General Chemistry, Metabolism, Carbohydrate, Hydrogen-Ion Concentration, 040201 dairy & animal science, Oxidative Stress, 030104 developmental biology, chemistry, Poultry meat, Energy Metabolism, Chickens, biomarqueur, Oxidative stress, métabolomique
Abstract: International audience; Variations in muscle glycogen storage are highly correlated with variations in meat ultimate pH (pHu), a key factor for poultry meat quality. A total of two chicken lines were divergently selected on breast pHu to understand the biological basis for variations in meat quality (i.e., the pHu– and the pHu+ lines that are characterized by a 17% difference in muscle glycogen content). The effects of this selection on bird metabolism were investigated by quantifying muscle metabolites by high-resolution NMR (1H and 31P) and serum metabolites by 1H NMR. A total of 20 and 26 discriminating metabolites between the two lines were identified by orthogonal partial least-squares discriminant analysis (OPLS-DA) in the serum and muscle, respectively. There was over-representation of carbohydrate metabolites in the serum and muscle of the pHu– line, consistent with its high level of muscle glycogen. However, the pHu+ line was characterized by markers of oxidative stress and muscle catabolism, probably because of its low level of energy substrates. After OPLS-DA multiblock analysis, a metabolic set of 15 high-confidence biomarkers was identified that could be used to predict the quality of poultry meat after validation on an independent population.
Published: 2016
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270. Livrable 2.1-Rapport sur la purification de 7 protéines et peptides de l’œuf

Author: Rehault-Godbert, Sophie, Poirier, Jean-Claude, Chessé, Magali, Mills, Maryse, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), auto-saisine, Unité de Recherches Avicoles (URA), Financement : Intéret Régional Centre VdL-Projet ADAGIO, and Superviseur : Cyrille Hoarau
Subjects: purification, protéine, refining, [SDV]Life Sciences [q-bio], oeuf, egg, protein, peptide
Abstract: Livrable 2.1-Rapport sur la purification de 7 protéines et peptides de l’œuf
Published: 2016

271. Oxydation des viandes de dindes : Quels sont les facteurs impliqués ?

Author: Bourin, Marie, Baéza, Elisabeth, Mika, Amandine, Godet, Estelle, Chartrin, Pascal, Sante-Lhoutellier, Veronique, Berri, Cécile, ITAVI, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Qualité des Produits Animaux (QuaPA), and FranceAgriMer
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [INFO]Computer Science [cs], [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2016

272. Gene evolution and gene expression after whole genome duplication in fish: the PhyloFish database

Author: Cédric Cabau, Laurent Journot, Pierre Pontarotti, Julien Bobe, John H. Postlethwait, Elodie Jouanno, Thuy Thao Vi Nguyen, Jeremy Pasquier, Dany Severac, Yann Guiguen, Ingo Braasch, Christophe Klopp, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX (IGF MGX), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Michigan State University [East Lansing], Michigan State University System, Institute of Neuroscience, University of Oregon [Eugene], Institut de Mathématiques de Marseille (I2M), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Système d'Information des GENomes des Animaux d'Elevage (SIGENAE), National Institutes of Health Grant number R01 OD011116, R24 OD011199., ANR-10-GENM-0017,PhyloFish,Analyse phylogénomique des duplications géniques chez les poissons téléostéens: une approche par RNA-Seq(2010), ANR-13-BSV7-0015,Maternal Legacy,Portait moléculaire d'un oeuf de poisson de bonne qualité(2013), ANR-13-ISV7-0005,PhyloSex,Evolution des déterminants majeurs du sexe chez les poissons.(2013), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-BioCampus (BCM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Marseille (ECM)-Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: 0301 basic medicine, Gene duplication, Lineage (evolution), Assembly, Web Browser, computer.software_genre, Genome, Teleosts, Transcriptome, poisson, duplication de gènes, Holostean, duplication des génomes, Phylogeny, Genetics, salmonidae, base de données, holosteen, Database, Fishes, Gar, lepisosteus oculatus, teleosteen, DNA microarray, Databases, Nucleic Acid, Biotechnology, expression des gènes, Biology, Evolution, Molecular, reproduction, assemblage tissulaire, 03 medical and health sciences, Phylogenetics, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology, phylogénie, Animals, 14. Life underwater, Gene, Mcam, lepisosteidae, Gene Expression Profiling, Salmonids, Computational Biology, Stra8, Gene expression profiling, 030104 developmental biology, lépisosté tacheté, Gene expression, RNA-seq, computer, transcriptome, gene duplication, teleosts, holostean, gene expression, gar, salmonids, assembly
Abstract: Research Areas: Biotechnology & Applied Microbiology; Genetics & Heredity; International audience; With more than 30,000 species, ray-finned fish represent approximately half of vertebrates. The evolution of ray-finned fish was impacted by several whole genome duplication (WGD) events including a teleost-specific WGD event (TGD) that occurred at the root of the teleost lineage about 350 million years ago (Mya) and more recent WGD events in salmonids, carps, suckers and others. In plants and animals, WGD events are associated with adaptive radiations and evolutionary innovations. WGD-spurred innovation may be especially relevant in the case of teleost fish, which colonized a wide diversity of habitats on earth, including many extreme environments. Fish biodiversity, the use of fish models for human medicine and ecological studies, and the importance of fish in human nutrition, fuel an important need for the characterization of gene expression repertoires and corresponding evolutionary histories of ray-finned fish genes. To this aim, we performed transcriptome analyses and developed the PhyloFish database to provide (i) de novo assembled gene repertoires in 23 different ray-finned fish species including two holosteans (i.e. a group that diverged from teleosts before TGD) and 21 teleosts (including six salmonids), and (ii) gene expression levels in ten different tissues and organs (and embryos for many) in the same species. This resource was generated using a common deep RNA sequencing protocol to obtain the most exhaustive gene repertoire possible in each species that allows between-species comparisons to study the evolution of gene expression in different lineages. The PhyloFish database described here can be accessed and searched using RNAbrowse, a simple and efficient solution to give access to RNA-seq de novo assembled transcripts.
Published: 2016
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273. Investigation of volatolome of body fluids and tissues by SPME-GC-MS to back-trace food chain exposure to micropollutants

Author: Jihene Bouhlel, Jérémy Ratel, Said Abou El Karam, Gaud Dervilly, Timothée Guérin, Eric Verdon, Elisabeth Baéza, Angélique Travel, Catherine Jondreville, Douglas Rutledge, Erwan Engel, Qualité des Produits Animaux (QuaPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ingénierie, Procédés, Aliments (GENIAL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Laboratory for Food Safety, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Unité de Recherches Avicoles (URA), ITAVI, Agro-Systèmes Territoires Ressources Mirecourt (ASTER Mirecourt), and Laboratoire de sécurité des aliments de Maisons-Alfort (LSAl)
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract: International audience
Published: 2016

274. First annual meeting and its minutes

Author: Association française de zootechnie, ., INRA, ., INRA Transfert, ., Aarhus University, ., Wageningen University and Research, ., Kaposvár University, ., Universitat de Lleida, ., University of Newcastle upon Tyne, ., ProdInra, Migration, Adapting the feed, the animal and the feeding techniques to improve the efficiency and sustainability of monogastric livestock production systems - Feed-a-Gene - - H20202015-03-01 - 2020-02-29 - 633531 - VALID, Association Française de Zootechnie (AFZ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), INRA Transfert, Aarhus University [Aarhus], Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Kaposvár University, Universitat de Lleida, University of Newcastle upon Tyne, Inra, Contrat : 633531, Financement : UE, Superviseur : Jaap van Milgen, Commanditaire : European Union (Belgium), Type de commanditaire ou d'auteur de la saisine : Organisations européennes, European Project: 633531,H2020,H2020-SFS-2014-2,Feed-a-Gene(2015), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published: 2016

275. Evaluation de la digestibilité d'une nouvelle génération de phosphate inorganique chez le porc

Author: Le Grand, Karine, COULOIGNER, Florian, Dourmad, Jean-Yves, Narcy, Agnès, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs]
Published: 2016

276. Prédire la qualité des viandes : mythe ou réalité ? Etat des lieux des avancées récentes réalisées dans le domaine de la prédiction des qualités des viandes ; réflexion sur les perspectives d’application: Etat des lieux des avancées récentes réalisées dans le domaine de la prédiction des qualités des viandes ; réflexion sur les perspectives d’application

Author: Cécile Berri, Brigitte Picard, Bénédicte Lebret, Jesus Donato Andueza Urra, Antoine Vautier, Pascal Chartrin, Stéphane Beauclercq, Florence, Isabelle Legrand, Jean-François Hocquette, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service Qualité des viandes, Institut de l'Elevage, Unité de Recherches Avicoles (URA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc (IFIP), Institut de l'élevage (IDELE), Recherches Avicoles ( SRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Subjects: perspective d'application, viande, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], qualité, marqueur biologique, [SDV]Life Sciences [q-bio], qualité sensorielle, perspective avancee, qualité de la viande, truite, qualité de la chair, spectroscopie, tendrete de la viande, volaille, qualité nutritionnelle, meat, phénotype, viande bovine, poisson, viande porcine, produit carné, prédiction, spectroscopie proche infrarouge, modèle phénotypique
Abstract: Cette revue a pour objectif de faire un point sur les avancées récentes obtenues dans le domaine de la prédiction de la qualité des viandes. Elle aborde différentes démarches menées au sein des principales filières de production pour développer des équations puis des outils prédictifs basés sur différents types de marqueurs biologiques (génomiques ou phénotypiques) ou physiques (spectroscopiques). Au travers des différents exemples présentés, il apparaît que l’identification de marqueurs biologiques se confronte au déterminisme complexe des paramètres de qualité qui rend encore difficile la mise au point de tests moléculaires génériques utilisables sur le terrain. Toutefois, les avancées ont été notables ces dernières années bénéficiant des récents développements technologiques en génomique, protéomique et métabolomique. Les premières équations de prédiction de la qualité sensorielle et du potentiel technologique des viandes laissent entrevoir des possibilités d’applications dans les années à venir. Concernant la spectroscopie, les principaux résultats ont été obtenus dans le domaine de la Spectroscopie Proche Infrarouge (SPIR) avec des développements aboutis pour prédire la composition et la valeur nutritionnelle des viandes. La prédiction du potentiel technologique des viandes à l’aide de cette méthode et surtout de la qualité sensorielle est en revanche plus difficile. Enfin, l’exemple du modèle phénotypique MSA (« Meat Standards Australia ») de prévision de la qualité sensorielle de la viande bovine basée sur une combinaison de données d’amont et d’aval et dont la plus-value pour la filière a été démontrée en Australie, présente une généricité qui a déjà été éprouvée dans plusieurs pays., This review was aimed at providing an overview of recent advancements obtained in the field of meat quality prediction. The different methods used in the production sectors for the development of equations and the tools used based on different types of biological markers (genomic or phenotypic) or physical (spectroscopy) are discussed. Through the different examples that are presented, it appears that the identification of biological markers is confronted with the complex determinism of quality parameters. This makes the development of generic molecular tests to be used on the field even more difficult. However, in recent years, progress has been made, benefitting from genomics, proteomics and metabolomics technological developments. The first equations that predict the sensorial quality and the technological potential of meat hint to possible applications in the near future. Concerning spectroscopy, the main results were obtained using Near Infrared Spectroscopy (NIR) with developments obtained for the prediction of the composition and nutritional value of meats. The prediction of the technological potential of meats using this method and mainly the sensorial quality is, however, more difficult. Finally, the example of the MSA (« Meat Standards Australia ») phenotypic model which predicts the sensorial quality of bovine meat based on a combination of upstream and downstream data and whose added-value for the sector has been identified in Australia, presents a genericness that has already been proven in several countries.
Published: 2016

277. Beta-carotene acts as a regulator of skeletal muscle cells

Author: Praud, Christophe, Le Vern, Yves, Al Ahmadieh, Sultan, Couroussé, Nathalie, Berri, Cécile, Duclos, Michel Jacques, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), AFM Téléthon. FRA., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], caroténoïde, carotenoids, myogenesis, myogénèse, croissance cellulaire, Autre (Sciences du Vivant)
Abstract: The enzyme beta, beta-carotene-15,15'-monooxygenase (BCMO1) cleaves provitamin A carotenoids into active vitamin A principally in liver and intestine. The BCMO1 gene is expressed at low level in the muscle tissue but little is known about its function. In the chicken muscle, we observed that various BCMO1 expression levels are associated with different carotenoids contents. To investigate the potential role of BCMO1 on skeletal muscle, we assessed the impact of beta-carotene (BC, the prototype substrate of the BCMO1 enzyme) supplementation in vitro on proliferative avian myoblasts. Proliferation was evaluated by BrdU incorporation and by flow cytometry. The BrdU incorporation index was reduced and th e proportion of G0/G1 cells increased following BC supplementation. Cell differentiation was evaluated by immunolabelling of sarcomeric myosin heavy chain (MHC). In this proliferative environment, the proportion of MHC positive cells increased following BC supplementation. The effects of BC were inhibited in the presence of DEAB, an inhibitor of retinaldehyde dehydrogenase, supporting the hypothesis that the BCMO1 enzyme is active in myoblasts and can contribute to retinoic acid production from BC. Our data suggest that provitamin A carotenoids could be used as nutritional regulators of skeletal muscle growth
Published: 2016

278. MUSE Medicinal USe of Eggs

Author: Réhault-Godbert, Sophie, ProdInra, Archive Ouverte, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), APR IA MUSE-Région Center VdL 2014-2016, and Unité de Recherches Avicoles (URA)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], oeuf, egg, coquille d'oeuf
Abstract: MUSE Medicinal USe of Eggs. 1. Journées du GDR MuFoPAM « MultiFonction des Peptides antimicrobiens »
Published: 2016

279. Modèle du devenir métabolique de phosphore et calcium alimentaires et de la dynamique de dépôt des cendres corporelles: inversion du modèle

Author: Létourneau-Montminy, Marie-Pierre, Narcy, Agnès, Crenshaw, T.D., Dourmad, Jean-Yves, Pomar, Candido, ProdInra, Migration, Université Laval [Québec] (ULaval), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Wisconsin-Madison, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Agriculture and Agri-Food [Ottawa] (AAFC)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [INFO] Computer Science [cs]
Published: 2016

280. Change in calcium carbonate mineralogy and in organic matrix proteins quantified by proteomic analysis during the early stages of egg shell mineralization in hens

Author: Gautron, Joël, Rodriguez-Navarro, Alejandro, Marie, Pauline, Labas, Valérie, Dominguez-Gasca, Nazaret, Brionne, Aurélien, Harichaux, Grégoire, Hennequet-Antier, Christelle, Nys, Yves, ProdInra, Migration, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Universidad de Granada (UGR), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plate-forme d'Analyse Intégrative des Biomolécules, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: egg shell, amorphous, nucleation, matrix proteins, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, CaCo3, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology
Abstract: International audience
Published: 2016

281. Phenotypic characterization of the indigenous chickens (Gallus gallus) in the northwest of Algeria

Author: Dahloum, Lahouari, Moula, N, Halbouche, M, Mignon-Grasteau, Sandrine, Université Abdelhamid Ibn Badis de Mostaganem, Faculty of Veterinary Medicine, Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: local breed, major genes, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT]
Abstract: International audience; This study was conducted to characterize local chickens in the northwest of Algeria based on some phenotypic traits and to look at prediction of body weight from morphometric measurements (linear body). The results indicated that the predominant comb colour was dark red (77.8 %), followed by light red (22.2 %). Tarsus colour was either white (40.9 %), grey (31 %), yellow (15.39 %), dark (8.05 %), or green (4.51 %). Most chickens (81.7 %) had orange eyes, while 10.37 and 7.92% had yellow and dark-brown eyes, respectively. The dominant earlobe colour was white (73.96 %), followed by red (16.81 %). The remaining proportion included yellow and red-mottled yellow and black earlobes. Proportions of the adaptive genes were low. Incidences of Na, F, Pti, Cr, R, and P genes were 8.82, 0.45, 1.22, 5.54, 3.35, and 4.7 %, respectively. The calculated gene frequencies ranged from 0.002 to 0.045. Variations were also found in quantitative morphological traits. Sex-associated differences (P
Published: 2016
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282. Rôles, impacts et services issus des élevages en Europe. Synthèse de l’expertise scientifique collective

Author: Bertrand Dumont, Pierre Dupraz, Joel Aubin, Marc Benoit, Vincent Chatellier, Zohra Bouamra-Mechemache, Luc Delaby, Claire Delfosse, Jean-Yves Dourmad, Michel Duru, Lise Frappier, Marine Friant-Perrot, Carl Gaigné, Agnès Girard, Jean-Luc Guichet, Petr Havlik, Nathalie Hostiou, Olivier Huguenin-Elie, Katja Klumpp, Alexandra Langlais, Servane Lavenant, Sophie Le Perchec, Olivier Lepiller, Bertrand Méda, Julie Ryschawy, Rodolphe Sabatier, Isabelle Veissier, Etienne Verrier, Dominique Vollet, Isabelle Savini, Jonathan Hercule, Catherine Donnars, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire d'Études et de Recherches en Economie (LERECO CEDRAN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Toulouse School of Economics (TSE), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Université Lumière - Lyon 2 (UL2), UMR : AGroécologie, Innovations, TeRritoires, Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Université de Nantes (UN), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), International Institute for Applied Systems Analysis (IIASA), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Agroscope, Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut de l'Ouest : Droit et Europe (IODE), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions (EVA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Normandie Université (NU), DIST Délégation Information Scientifique et Technique (DV-IST), Centre d'Etude et de Recherche Travail Organisation Pouvoir (CERTOP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Recherches Avicoles (SRA), Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires (SADAPT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Collège de Direction, Unité Prospective (PROSPECTIVE), auto-saisine, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART-LERECO), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (UMR METAFORT), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Unité de Recherches Avicoles (URA), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Collège de Direction (CODIR), Délégation à l'Expertise scientifique collective, à la Prospective et aux Etudes (UAR), Commanditaire : (France), Type de commanditaire ou d'auteur de la saisine : Ministères, parlements et les structures qui leur sont directement rattachées, Partenaires : Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Ministère de l'Agriculture, de l'Agroalimentaire et de la Forêt (MAAF), Ministère de l'Environnement, de l'Energie et de la Mer (MEEM), Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Amiénois de Recherche en Education et Formation - UR UPJV 4697 (CAREF), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Toulouse School of Economics (TSE-R), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires ( SMART ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), Laboratoire d'Études et de Recherches en Economie ( LERECO CEDRAN ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Toulouse School of Economics ( TSE ), Toulouse School of Economics, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Université Lumière (Lyon 2) ( UL2 ), Université de Nantes ( UN ), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), International Institute for Applied Systems Analysis ( IIASA ), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche sur l'Ecosystème Prairial, IODE, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions ( EVA ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Normandie Université ( NU ), DIST Délégation Information Scientifique et Technique ( DV-IST ), Centre d'Etude et de Recherche Travail Organisation Pouvoir ( CERTOP ), Université Toulouse - Jean Jaurès ( UT2J ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Institut national universitaire Champollion - Albi ( INU Champollion ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Recherches Avicoles ( SRA ), Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires ( SADAPT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), and Unité Prospective ( PROSPECTIVE )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, cultural inheritance, nitrogen, service écosystémique, labour, patrimoine culinaire, droit de l'environnement, [ SHS.ECO ] Humanities and Social Sciences/Economies and finances, phosphorus, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, gastronomie régionale, azote, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SHS.SOCIO]Humanities and Social Sciences/Sociology, climat, market, patrimoine culturel, expertise collective, [SHS.PHIL]Humanities and Social Sciences/Philosophy, système d'élevage, [ SHS.SOCIO ] Humanities and Social Sciences/Sociology, marché, [SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, élevage, phosphore, évaluation de l'impact environnemental, [ SHS.PHIL ] Humanities and Social Sciences/Philosophy, travail, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, europe
Abstract: À la demande des ministères en charge de l’Écologie et de l’Agriculture, et de l’Ademe, l’Inra a conduit une expertise scientifique collective sur les systèmes d’élevage européens et leurs produits. Leurs rôles, leurs impacts économiques, sociaux et environnementaux, ainsi que les services marchands ou non marchands qu’ils rendent à la société ont été analysés sur la base d’un important travail de synthèse bibliographique internationale. Les résultats, qui suggèrent aussi des leviers d’action pour les différents systèmes d’élevage, sont présentés et mis en débat lors d’un colloque le 30 novembre 2016 à Paris.
Published: 2016

283. Prédire la qualité des viandes : mythe ou réalité ? Etat des lieux des avancées récentes réalisées dans le domaine de la prédiction des qualités des viandes ; réflexion sur les perspectives d’application

Author: Berri, Cécile, Picard, Brigitte, Lebret, Bénédicte, Andueza, Donato, Vautier, Antoine, Chartrin, Pascal, Beauclercq, Stéphane, Lefèvre, Florence, Legrand, Isabelle, Hocquette, Jean-François, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc (IFIP), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service Qualité des viandes, and Institut de l'élevage (IDELE)
Subjects: meat, viande, perspective d'application, qualité, marqueur biologique, [SDV]Life Sciences [q-bio], produit carné, prédiction, perspective avancee, qualité de la viande, spectroscopie, modèle phénotypique
Abstract: National audience; This review was aimed at providing an overview of recent advancements obtained in the field of meat quality prediction. The differentmethods used in the production sectors for the development of equations and the tools used based on different types of biological markers(genomic or phenotypic) or physical (spectroscopy) are discussed. Through the different examples that are presented, it appears that theidentification of biological markers is confronted with the complex determinism of quality parameters. This makes the development of genericmolecular tests to be used on the field even more difficult. However, in recent years, progress has been made, benefitting from genomics,proteomics and metabolomics technological developments. The first equations that predict the sensorial quality and the technological potentialof meat hint to possible applications in the near future. Concerning spectroscopy, the main results were obtained using Near Infrared Spectroscopy(NIR) with developments obtained for the prediction of the composition and nutritional value of meats. The prediction of the technologicalpotential of meats using this method and mainly the sensorial quality is, however, more difficult. Finally, the example of the MSA (« MeatStandards Australia ») phenotypic model which predicts the sensorial quality of bovine meat based on a combination of upstream and downstreamdata and whose added-value for the sector has been identified in Australia, presents a genericness that has already been proven in severalcountries.; Cette revue a pour objectif de faire un point sur les avancées récentes obtenues dans le domaine de la prédiction de la qualité des viandes.Elle aborde différentes démarches menées au sein des principales filières de production pour développer des équations puis des outils prédictifsbasés sur différents types de marqueurs biologiques (génomiques ou phénotypiques) ou physiques (spectroscopiques). Au travers des différentsexemples présentés, il apparaît que l’identification de marqueurs biologiques se confronte au déterminisme complexe des paramètres de qualitéqui rend encore difficile la mise au point de tests moléculaires génériques utilisables sur le terrain. Toutefois, les avancées ont été notables cesdernières années bénéficiant des récents développements technologiques en génomique, protéomique et métabolomique. Les premières équationsde prédiction de la qualité sensorielle et du potentiel technologique des viandes laissent entrevoir des possibilités d’applications dans les annéesà venir. Concernant la spectroscopie, les principaux résultats ont été obtenus dans le domaine de la Spectroscopie Proche Infrarouge (SPIR) avecdes développements aboutis pour prédire la composition et la valeur nutritionnelle des viandes. La prédiction du potentiel technologique desviandes à l’aide de cette méthode et surtout de la qualité sensorielle est en revanche plus difficile. Enfin, l’exemple du modèle phénotypiqueMSA (« Meat Standards Australia ») de prévision de la qualité sensorielle de la viande bovine basée sur une combinaison de données d’amontet d’aval et dont la plus-value pour la filière a été démontrée en Australie, présente une généricité qui a déjà été éprouvée dans plusieurs pays.
Published: 2016

284. Formuler l’aliment autrement : Intérêt de la formulation multiobjectif pour réduire les impacts environnementaux de la production de poulets de chair

Author: Léonie Dusart, Florence Garcia-Launay, Aurélie Wilfart, Bertrand Méda, Isabelle Bouvarel, Sandrine Espagnol, ITAVI, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut du Porc (IFIP)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2016

285. L’autonomie protéique : état des lieux et voies d’amélioration pour l’alimentation des volailles

Author: Recoules, Emilie, Brévault, N., Le Cadre, P., Peyronnet, C., Bouvarel, Isabelle, LESSIRE, Michel, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MIXscience, Centre d'Etude et de Recherche sur l'Economie et l'Organisation des Productions Animales (CEREOPA), Terres Univia, and ITAVI
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs]
Abstract: National audience; Protein supply in poultry diets is mainly based on soybean meal, imported from South America. This protein dependency has negative impacts on different aspects: economic (high price volatility), environmental (transport, deforestation) and social (GMO soybean unaccepted by consumers). To go towards a sustainable development, this protein dependency is questionable. The use of local protein sources (rapeseed meal, sunflower meal, pea…) in poultry diets is possible. Previous works have led to a decrease in antinutritional factor content (genetic, technological process) or an increase in nutrient bioavailability (exogenous enzymes) allowing an increase in the use of these protein sources in poultry diets. However, improvements still need to be made. Regarding plant production, one important challenge is to develop crop management techniques that include new varieties of soya which are better adapted to French pedoclimatic conditions. Progress can also be expected regarding technological process with a higher sunflower meal dehulling that would allow an increase in its protein content. Studies focusing on a greater understanding of protein digestion mechanisms have started and aim to increase the valorization of local protein sources by poultry. For these purposes, different actors in crop and animal productions have to join in order to identify and propose solutions to go towards sustainable poultry feeding systems.; L’apport protéique dans les aliments pour volailles est principalement réalisé avec du tourteau de soja essentiellement importé d’Amérique du Sud. Cependant, cette dépendance protéique pose plusieurs problèmes d’ordre économique (concurrence et volatilité des prix), environnemental (transport, déforestation) et sociétal (soja OGM mal accepté par les consommateurs). Dans un objectif de développement durable, la dépendance protéique vis-à-vis du soja pose question. L’utilisation de matières premières locales riches en protéines (tourteaux de colza, tournesol, pois,…) a été étudiée. Plusieurs voies permettant de réduire leur teneur en facteurs antinutritionnels (génétique, procédés technologiques) ou d’améliorer la disponibilité des nutriments (utilisation d’enzymes exogènes, traitements technologiques) pour augmenter leur incorporation dans les aliments volailles ont déjà été explorées. Cependant, d’autres voies existent et nécessitent des approfondissements. Au niveau agronomique, un enjeu important est de mettre au point des itinéraires techniques innovants impliquant de nouvelles variétés de soja adaptées aux différentes conditions pédoclimatiques françaises. Des progrès peuvent être escomptés en termes de process technologiques avec notamment un décorticage plus poussé du tournesol afin d’augmenter sa teneur en protéines. Des travaux sont initiés afin de mieux comprendre les mécanismes de digestion et de mieux appréhender le rôle de la sélection génétique pour aller vers une meilleure valorisation des matières premières par les animaux. Il semble nécessaire de poursuivre les recherches à travers des actions conjointes des acteurs de l’amont et l’aval de la filière afin de proposer des solutions permettant une meilleure utilisation des matières premières locales et de tendre vers des systèmes d’alimentation plus durables.
Published: 2016

286. Rôles, impacts et services issus des élevages en Europe. Rapport final

Author: Bertrand Dumont, Pierre Dupraz, Joël Aubin, Miroslav Batka, Diane Beldame, Jaume Boixadera, Alain Bousquet-Mélou, Marc Benoit, Zohra Bouamra-Mechemache, Vincent Chatellier, Michael Corson, Luc Delaby, Claire Delfosse, Catherine Donnars, Jean-Yves Dourmad, Michel Duru, Nadège Edouard, Estelle Fourat, Lise Frappier, Marine Friant-Perrot, Carl Gaigné, Agnès Girard, Jean-Luc Guichet, Nadia Haddad, Petr Havlik, Jonathan Hercule, Nathalie Hostiou, Olivier Huguenin-Elie, Katja Klumpp, Alexandra Langlais, Servane Lavenant, Sophie Le Perchec, Olivier Lepiller, Elodie Letort, Fabrice Levert, Bruno Martin, Bertrand Méda, Elise Line Mognard, Christian Mougin, Carlos Ortiz, Laurent Piet, Thierry Pineau, Julie Ryschawy, Rodolphe Sabatier, Stéphane Turolla, Isabelle Veissier, Etienne Verrier, Dominique Vollet, Hayo van der Werf, Aurélie Wilfart, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART-LERECO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), International Institute for Applied Systems Analysis (IIASA), Chercheur indépendant, Gouvernement de Catalogne, ToxAlim (ToxAlim), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Toulouse School of Economics (TSE-R), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Laboratoire d'Études Rurales (LER), Université Lumière - Lyon 2 (UL2), Délégation à l'Expertise scientifique collective, à la Prospective et aux Etudes (UAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Centre d'Etude et de Recherche Travail Organisation Pouvoir (CERTOP), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Droit et changement social (DCS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes - UFR Droit et Sciences Politiques (UFR DSP), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Université de Nantes (UN), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Amiénois de Recherche en Education et Formation - UR UPJV 4697 (CAREF), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques (BIPAR), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Normandie, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (UMR METAFORT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Agroscope, Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP), Institut de l'Ouest : Droit et Europe (IODE), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR), Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions (EVA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Normandie Université (NU), DIST Délégation Information Scientifique et Technique (DV-IST), Université de Toulouse (UT), Unité de Recherches Avicoles (URA), Taylor’s University, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Département Santé Animale (DEPT SA), École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires (SADAPT), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Ministère de l'Agriculture, de l'Agroalimentaire et de la Forêt, Commanditaire : Ministère de l'Agriculture, de l'Agroalimentaire et de la Forêt (France), Type de commanditaire ou d'auteur de la saisine : Ministères, parlements et les structures qui leur sont directement rattachées, Partenaires : Ministère de l'Agriculture, de l'Agroalimentaire et de la Forêt (MAAF), Ministère de l'Environnement, de l'Energie et de la Mer (MEEM), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Toulouse School of Economics (TSE), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Isara, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Nantes - UFR Droit et Sciences Politiques (UFR DSP), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Taylor's University, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Prospective (PROSPECTIVE), UMR : AGroécologie, Innovations, TeRritoires, Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes (UN), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), Recherches Avicoles (SRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires ( SMART ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), International Institute for Applied Systems Analysis ( IIASA ), Indépendant, ToxAlim ( ToxAlim ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse, Toulouse School of Economics ( TSE ), Toulouse School of Economics, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Laboratoire d’études rurales, EA 3728 LER - Institut des sciences de l’Homme, Université Lumière (Lyon 2) ( UL2 ), Unité Prospective ( PROSPECTIVE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Centre d'Etude et de Recherche Travail Organisation Pouvoir ( CERTOP ), Université Toulouse - Jean Jaurès ( UT2J ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Institut national universitaire Champollion - Albi ( INU Champollion ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Droit et changement social ( DCS ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Nantes ( UN ), Université de Nantes ( UN ), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques ( BIPAR ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort-AFSSA-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut de l'Ouest : Droit et Europe, UMR 6262 IODE, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions ( EVA ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Normandie Université ( NU ), DIST Délégation Information Scientifique et Technique ( DV-IST ), Université de Toulouse, Recherches Avicoles ( SRA ), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Département Santé Animale ( DEPT SA ), Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires ( SADAPT ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, and Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, 030309 nutrition & dietetics, évaluation, [ SHS.DROIT ] Humanities and Social Sciences/Law, 03 medical and health sciences, [SHS.DROIT]Humanities and Social Sciences/Law, [ SHS.ECO ] Humanities and Social Sciences/Economies and finances, appraisement, service, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, 0303 health sciences, [SHS.SOCIO]Humanities and Social Sciences/Sociology, indicator, [SHS.PHIL]Humanities and Social Sciences/Philosophy, [ SHS.SOCIO ] Humanities and Social Sciences/Sociology, [SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, élevage, [ SHS.PHIL ] Humanities and Social Sciences/Philosophy, impact, expertise, impact économique, impact sur l'environnement, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, europe, indicateur
Abstract: Rapport de l’Expertise scientifique collective réalisée par l’INRA à la demande des ministères en charge de l'Ecologie et de l'Agriculture, et de l'Ademe; Rôles, impacts et services issus des élevages en Europe. Rapport final
Published: 2016

287. Transcriptomes of whole blood and PBMC in chickens

Author: Bertrand Bed'Hom, Elodie Merlot, Aurélie Le Cam, Michel J. Duclos, Colette Désert, Sandrine Lagarrigue, Sonja Härtle, Elisabeth Baéza, Tatiana Zerjal, Florence Gondret, Pierre-François Roux, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Department of Veterinary Science, Ludwig Maximilians University of Munich, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), This work was supported by INRA (SOSrnaSEQ program) and by the French National Research Agency (ANR-11-SVSE7004 FatInteger)., ANR-11-BSV7-0004,FatInteger,Recherche de régulateurs clefs de la plasticité lipidique chez deux espèces monogastriques majeures (porc et poule) en combinant des données haut débit et des approches statistique, bioinformatique et phylogénique.(2011), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), INRA, French National Research Agency, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, 040301 veterinary sciences, Physiology, Protein catabolic process, chicken, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biology, Real-Time Polymerase Chain Reaction, Biochemistry, Peripheral blood mononuclear cell, 0403 veterinary science, Transcriptome, 03 medical and health sciences, Immune system, Genetics, Animals, RNA, Messenger, Platelet activation, Molecular Biology, microarrays, Cells, Cultured, Whole blood, Genome, Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction, Microarray analysis techniques, Gene Expression Profiling, whole blood, PBMC, Computational Biology, High-Throughput Nucleotide Sequencing, Nucleated Red Blood Cell, Molecular Sequence Annotation, Blood Proteins, 04 agricultural and veterinary sciences, 030104 developmental biology, 13. Climate action, Immunology, Leukocytes, Mononuclear, gene expression, Chickens, Biomarkers
Abstract: Global transcriptome analysis of chicken whole blood to discover biomarkers of different phenotypes or physiological disorders has never been investigated so far. Whole blood provides significant advantages, allowing large scale and non-invasive sampling. However, generation of gene expression data from the blood of non-mammalian species remains a challenge, notably due to the nucleated red blood cells, hindering the use of well-established protocols. The aim of this study was to analyze the relevance of using whole blood cells (WB) to find biomarkers, instead of Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC), usually chosen for immune challenges. RNA sources from WB and PBMC was characterized by microarray analysis. Our results show that the quality and quantity of RNA obtained from WB was suitable for further analyses, although the quality was lower than that from PBMC. The transcriptome profiling comparison revealed that the majority of genes were expressed in both WB and PBMC. Hemoglobin subunits were the major transcripts in WB, whereas the most enriched biological process was related to protein catabolic process. Most of the over-represented transcripts in PBMC were implicated in functions specific to thrombocytes, like coagulation and platelet activation, probably due to the large proportion of this nucleated cell type in chicken PBMC. Functions related to B and T cells and to other immune functions were also enriched in the PBMC subset. We conclude that WB is more suitable for large scale immunity oriented studies and other biological processes that have been poorly investigated so far.
Published: 2016
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288. Seaweeds (marine macroalgae)

Author: Heuzé, Valérie, Tran, Gilles, Giger-Reverdin, Sylvie, LESSIRE, Michel, Lebas, François, Association Française de Zootechnie (AFZ), Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and Recherches Avicoles (SRA)
Subjects: on-line encyclopedia of animal feeds, base de données en ligne, Algues, alimentation animale, Feedipedia, animal feeding, Seaweed, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: Feedipedia.orgA programme by INRA, CIRAD, AFZ and FAO Last updated on April 15, 2016; absent
Published: 2016

289. Création d'un référentiel des gènes et d’éléments génétiques aviaires dont l’expression transcriptionnelle est régulée par les protéines chaperones HSP90 en réponse aux stress

Author: Beauclair, Linda, Piegu, Benoit, Asgari, Sassan, Arensburger, Peter, Coustham, Vincent, Bigot, Yves, ProdInra, Migration, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], stress, RNA seq, [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], phénotypage, intégrité du génome, CHIP seq, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2016

290. Prédire la qualité des viandes: mythe ou réalité ?

Author: Berri, Cécile, Picard, Brigitte, Lebret, Bénédicte, Andueza Urra, Jesus Donato, Vautier, Antoine, Chartrin, Pascal, Beauclercq, Stéphane, Lefèvre, Florence, Legrand, Isabelle, Hocquette, Jean-François, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service Qualité des Viandes, Institut de l'Elevage, Unité de Recherches Avicoles (URA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc (IFIP), Institut de l'élevage (IDELE), Recherches Avicoles ( SRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Subjects: spectroscopy, viande, qualité sensorielle, Ingénierie des aliments, qualité de la viande, truite, qualité de la chair, near-infrared, spectroscopie, tendrete de la viande, qualité nutritionnelle, meat, poisson, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Food engineering, prédiction, modèle phénotypique, marqueur biologique, qualité, [ SDV.IDA ] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, volaille, phénotype, viande bovine, quality, viande porcine, spectroscopie proche infrarouge, biological markers
Abstract: Cette revue a pour objectif de faire un point sur les avancées récentes obtenues dans le domaine de la prédiction de la qualité des viandes. Elle aborde différentes démarches menées au sein des principales filières de production pour développer des équations puis des outils prédictifs basés sur différents types de marqueurs biologiques (génomiques ou phénotypiques) ou physiques (spectroscopiques). Au travers des différents exemples présentés, il apparaît que l’identification de marqueurs biologiques se confronte au déterminisme complexe des paramètres de qualité qui rend encore difficile la mise au point de tests moléculaires génériques utilisables sur le terrain. Toutefois, les avancées ont été notables ces dernières années bénéficiant des récents développements technologiques en génomique, protéomique et métabolomique. Les premières équations de prédiction de la qualité sensorielle et du potentiel technologique des viandes laissent entrevoir des possibilités d’applications dans les années à venir. Concernant la spectroscopie, les principaux résultats ont été obtenus dans le domaine de la Spectroscopie Proche Infrarouge (SPIR) avec des développements aboutis pour prédire la composition et la valeur nutritionnelle des viandes. La prédiction du potentiel technologique des viandes à l’aide de cette méthode et surtout de la qualité sensorielle est en revanche plus difficile. Enfin, l’exemple du modèle phénotypique MSA (« Meat Standards Australia ») de prévision de la qualité sensorielle de la viande bovine basée sur une combinaison de données d’amont et d’aval et dont la plus-value pour la filière a été démontrée en Australie, présente une généricité qui a déjà été éprouvée dans plusieurs pays., This review was aimed at providing an overview of recent advancements obtained in the field of meat quality prediction. The different methods used in the production sectors for the development of equations and the tools used based on different types of biological markers (genomic or phenotypic) or physical (spectroscopy) are discussed. Through the different examples that are presented, it appears that the identification of biological markers is confronted with the complex determinism of quality parameters. This makes the development of generic molecular tests to be used on the field even more difficult. However, in recent years, progress has been made, benefitting from genomics, proteomics and metabolomics technological developments. The first equations that predict the sensorial quality and the technological potential of meat hint to possible applications in the near future. Concerning spectroscopy, the main results were obtained using Near Infrared Spectroscopy (NIR) with developments obtained for the prediction of the composition and nutritional value of meats. The prediction of the technological potential of meats using this method and mainly the sensorial quality is, however, more difficult. Finally, the example of the MSA (« Meat Standards Australia ») phenotypic model which predicts the sensorial quality of bovine meat based on a combination of upstream and downstream data and whose added-value for the sector has been identified in Australia, presents a genericness that has already been proven in several countries.
Published: 2016

291. Modélisation du devenir des éléments à risque en élevage cunicole

Author: Méda, Bertrand, Hassouna, Melynda, Fortun-Lamothe, Laurence, Balmisse, Elodie, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Pôle d'Expérimentation Cunicole TOULousain (PECTOUL )
Subjects: gestion des effluents, gestion des flux, [SDV]Life Sciences [q-bio], émission gazeuse, cuniculture, environnement, pratique d'élevage, [SDE]Environmental Sciences, rejet, [INFO]Computer Science [cs], lapin, flux des nutriments, modélisation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2016

292. Caractériser la valeur nutritionnelle des aliments par des méthodes innovantes de mesure de la digestibilité pour une aviculture durable

Author: Vilariño, Maria, Métayer, Jean-Paul, Mahaut, Brigitte, Bouvarel, Isabelle, Lescoat, Philippe, Chartrin, Pascal, Fournis, Yann, Hogrel, Patrick, Bonnal, Laurent, Bastianelli, D., ARVALIS - Institut du végétal [Paris], Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (UE PEAT), AgroParisTech, PROVIMI Firme Service, Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux (UMR SELMET), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Recherches Avicoles (SRA), 0609 Unité Expérimentale Avicole, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Subjects: alimentation, digestibilité, spectrométrie proche infrarouge, near infrared spectroscopy, digestibility, precision farming, chicken, [SDV]Life Sciences [q-bio], feed, élevage de précision, poulet
Abstract: Le projet DigSPIR a permis d’avancer sur deux axes majeurs pour la filière avicole : la simplification méthodologique de la détermination de la digestibilité des aliments et la faisabilité du développement de ces mesures dans les élevages, cela en s’appuyant sur un outil de mesure simple et rapide comme la spectroscopie dans le proche infra-rouge (SPIR). Pour atteindre ces objectifs, une « base de données initiale » a été constituée à partir des échantillons de fientes et d’aliments provenant d’essais de digestibilité réalisés par les partenaires entre 1997 et 2011 et les données de digestibilité correspondantes. A partir de ces échantillons une base spectrale a été générée et les premières calibrations développées. Puis, cinq essais de digestibilité ont permis d’élargir la base spectrale (différents aliments, niveaux nutritionnels et âges, sexes mélangés, ajout d’enzymes …), d’améliorer les calibrations et d’aboutir à une méthode simplifiée. Ils ont également apporté des nouvelles connaissances sur les facteurs de variation de la digestibilité. Les prédictions des composants des fientes sont très bien corrélées avec les valeurs de référence, en particulier pour l’énergie brute, l’amidon ou l’azote total. En combinant l’information des spectres de l’aliment et des fientes, la prédiction de la digestibilité de l’énergie est largement améliorée (R² de 0,94 et 56 kcal/kg MS d’erreur, soit moins de 2 % de la valeur énergétique d’un aliment). L’étude de faisabilité réalisée en élevage de poulets de chair a montré une bonne cohérence des prédictions en comparaison avec les résultats en station expérimentale, ce qui encourage à suivre cette voie et enrichir la base de calibration avec des données issues du terrain., The project entitled “DigSPIR” made it possible to progress on two main lines of research for the poultry industry: the methodological simplification of the assessment of feed digestibility and the feasibility of developing these measures in farms, with the use of a simple and fast tool as the near infrared spectroscopy. To reach these objectives, an “initial database” was designed from the analytical results on excreta and feed samples, and the digestibility values, obtained from previous experiments made by the partners from 1997 to 2011. The spectra allowed to create a new database and to get the first calibrations of prediction. Five trials with digestibility measures enabled to enlarge the spectral database (different feeds, nutritional levels and ages, both sex, adding enzymes …), to improve the calibrations and to result in a simplified method. These trials led also to new knowledge about variation factors of digestibility. The predictions of the composition of excreta were well correlated with the analytical reference values and especially for gross energy, starch and nitrogen. In combining the spectral information of feed and of excreta, the prediction of the energy digestibility is widely improved (R²=0.94 and error of 56 kcal/kg DM, or less than 2 % of feed energetic value). The study of feasibility made in poultry farms, showed a good consistency between predictions and in vivo results. These results encourage to follow this track and to enlarge the calibration database with measures in farms.
Published: 2016
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293. The level and source of free-methionine affect body composition and breast muscle traits in growing broilers

Author: Conde Aguilera, Jose Alberto, Cholet, Juliette, LESSIRE, Michel, Mercier, Yves, Tesseraud, Sophie, Van Milgen, Jaap, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Adisseo France SAS, Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Supplementary data disponible ici : http://ps.oxfordjournals.org/content/early/2016/03/29/ps.pew105/suppl/DC1; International audience; Although dietary Met, as the first limiting amino acid (AA), has been extensively studied for poultry, little is known about how the supply and source of free Met affect tissue composition. The purpose of this study was to investigate the effect of feeding young broiler chickens with a deficient or sufficient TSAA (Met+Cys) supply, using eitherdl-Met (dl-Met+ anddl-Met-, for respectively diets sufficient and deficient in TSAA) ordl-2-hydroxy-4-methylthiobutyric acid (HMTBA+ and HMTBA-, for respectively diets sufficient and deficient in TSAA) as a Met source on tissue composition and breast muscle traits. For both Met sources, the deficient diets were formulated to provide true digestible Met:Lys and TSAA:Lys respectively 45% and 30% below that of the sufficient diets. Performance and tissue weights were affected by the Met supply but not by the Met source. In TSAA-deficient chickens, ADG and FCR, and protein content in empty body and pectoralis major muscles (PM) were lower than in TSAA-sufficient chickens (P< 0.05). Reducing the Met content of the diet increased the redness value of PM (a*) and the hue angle (H°;P< 0.01). The source of Met affected body AA composition and the partitioning of body Cys among tissues (P< 0.05). In TSAA-deficient birds, body Cys mass decreased in the commercial carcass and PM, but increased in the rest of the body (P< 0.01). The Met source also had an impact on the Cys mass, which was reduced in the commercial carcass and PM ofdl-Met birds, but higher in the rest, especially in the feathers of TSAA-deficient birds (P< 0.05). The Met source, supply, or both altered the AA composition of the empty body, mostly in the commercial carcass. In conclusion, a dietary TSAA deficiency altered performance, tissue composition and quality traits of PM of broilers. There was no impact between dietarydl-Met anddl-HMTBA on performance or muscle weight, although the Met source affected the partitioning of Cys among tissues.
Published: 2016
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294. Methionine and cysteine deficiencies altered proliferation rate and time‑course differentiation of porcine preadipose cells

Author: Yves Mercier, Marie-Hélène Perruchot, Elizabeth Baeza, R. Castellano, Sophie Tesseraud, Sonia Métayer-Coustard, Florence Gondret, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Adisseo France SAS, ICSA ADISSEO-INRA, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Avicoles (URA), and AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: 0301 basic medicine, pig, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, medicine.medical_specialty, Swine, Cellular differentiation, proliferation, Clinical Biochemistry, Adipose tissue, Biology, adipocyte, Biochemistry, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Internal medicine, Adipocyte, medicine, Animals, cysteine, Cells, Cultured, Cell Proliferation, methionine, Methionine, Adipogenesis, lipid accumulation, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Organic Chemistry, differenciation, Cell Differentiation, Glutathione, 030104 developmental biology, Endocrinology, chemistry, Adipose Tissue, Gene Expression Regulation, 030220 oncology & carcinogenesis, Female, Reactive Oxygen Species, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Intracellular, Cysteine
Abstract: International audience; Methionine (Met) is an essential sulfur amino acid (AA) limiting growth and is the precursor of cysteine (Cys), the rate-limiting factor in the synthesis of glutathione, and the main intracellular non-enzymatic antioxidant. This study aimed at determining the effects of limited supplies in Met and(or) Cys in early aspects of adipose tissue development and oxidative stress in differentiated adipocytes. Incremental reductions in Met (70, 40, and 0 µM) were compared with Met 100 µM (control dose) in porcine preadipocytes cultured in media without or with Cys (250 µM). In Cys-deprived media, both the absence (0 µM) and the lowest dose of Met (40 µM) reduced preadipocyte proliferation. Adding Cys in media only partly compensated for this decrease. On the opposite, mild Met deficiency (70 µM) did not alter preadipocyte proliferation in media without or with Cys. Strong Met deficiency (40 µM) also reduced differentiation and lipid accumulation into preadipose cells. Mild Met deficiency also reduced preadipocyte differentiation when Cys was present in the culture media, whereas in Cys-deprived media, percent of differentiated cell was similar and intracellular lipid content was slightly higher at Met 70 µM than at Met 100 µM. Finally, incremental reductions in Met in media with or without Cys lowered reactive oxygen species (ROS) production by differentiated cells. These results demonstrate the strong dependency of porcine adipogenesis to sulfur AA supplies. Strong Met deficiency decreases both proliferation and differentiation, whereas mild deficiency only alters differentiation.
Published: 2016
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295. Effet d'une déplétion-réplétion en phosphore et calcium sur l'expression des gènes et protéines associés au métabolisme phosphocalcique

Author: Gonzalo, Enrique, Palin, Marie-France, Létourneau-Montminy, Marie-Pierre, Narcy, Agnès, Pomar, Candido, ProdInra, Migration, Agriculture and Agri-Food [Ottawa] (AAFC), Université Laval [Québec] (ULaval), Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [INFO] Computer Science [cs]
Published: 2016

296. Characterization of egg white antibacterial properties during the first half of incubation: A comparative study between embryonated and unfertilized eggs

Author: Valérie Labas, Emmanuelle Helloin, Yves Nys, Grégoire Harichaux, Cindy Slugocki, Nicolas Guyot, Sophie Réhault-Godbert, Guyot, Nicolas, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), research grant (OVAL project, 2011–2014, 201100064336/2011–10818) delivered by the French regions Centre-Val de Loire, Pays de la Loire and Bretagne, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Staphylococcus aureus, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], 030106 microbiology, Chick Embryo, medicine.disease_cause, Incubation period, 03 medical and health sciences, Listeria monocytogenes, Escherichia coli, medicine, Animals, propriété antibactérienne, Food science, antibacterial property, Incubation, Disease Resistance, Ovum, Egg incubation, egg white, embryonated egg, incubation, unfertilized egg, blanc d'oeuf, Chemistry, Embryonated, Streptococcus, Embryo, General Medicine, Anatomy, 030104 developmental biology, Salmonella enteritidis, embryonic structures, Animal Science and Zoology, Antibacterial activity, Egg white, Autre (Sciences du Vivant), oeuf embryonné
Abstract: International audience; Egg white is an important contributor to the protection of eggs against bacterial contaminations during the first half of incubation (day zero to 12), prior to the egg white transfer into the amniotic fluid to be orally absorbed by the embryo. This protective system relies on an arsenal of antimicrobial proteins and on intrinsic physicochemical properties that are generally unfavorable for bacterial multiplication and dissemination. Some changes in these parameters can be observed in egg white during egg storage and incubation. The aim of this work was to characterize changes in the antibacterial potential of egg white in embryonated eggs (FE) during the first half of incubation using unfertilized eggs (UF) as controls. Egg white samples were collected at day zero, 4, 8, and 12 and analyzed for pH, protein concentration, and protein profile. Antibacterial properties of egg white proteins were evaluated against Listeria monocytogenes, Streptococcus uberis, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, and Salmonella Enteritidis. During incubation, differential variations of egg white pH and protein concentrations were observed between UF and FE. At equal protein concentrations, similar activities against L. monocytogenes and S. uberis were observed for FE and UF egg white proteins. A progressive decline in these activities, however, was observed over incubation time, regardless of the egg group (UF or FE). SDS-PAGE analysis of egg white proteins during incubation revealed discrete changes in the profile of major proteins, whereas the stability of some less abundant antimicrobial proteins seemed more affected. To conclude, the antibacterial activity of egg white proteins progressively decreased during the first half of egg incubation, possibly resulting from the alteration of specific antimicrobial proteins. This apparent decline may be partly counterbalanced in embryonated eggs by the increase in egg white protein concentration. The antibacterial potential of egg white is very effective during early stages of embryonic development but its alteration during incubation suggests that extra-embryonic structures could then progressively ensure protective functions.
Published: 2016
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297. Manipulation of dietary methionine+cysteine and threonine in broilers significantly decreases environmental nitrogen excretion

Author: Nilva Kazue Sakomura, Bertrand Méda, D. C. Z. Donato, A. R. Troni, L. Vargas, Edney Pereira da Silva, M. A. N. Guagnoni, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho = São Paulo State University (UNESP), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Universidade Estadual Paulista (Unesp), and INRA
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Threonine, Nitrogen, [SDV]Life Sciences [q-bio], chemistry.chemical_element, Environmental pollution, Biology, Environment, SF1-1100, Excretion, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Methionine, Animals, [INFO]Computer Science [cs], Food science, Cysteine, efficiency of utilisation, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, amino acids, poultry, 0402 animal and dairy science, Broiler, 04 agricultural and veterinary sciences, 040201 dairy & animal science, Amino acid, Diet, Animal culture, 030104 developmental biology, nutrition, chemistry, Biochemistry, 13. Climate action, Animal Science and Zoology, Female, environmental pollution, Chickens
Abstract: Made available in DSpace on 2018-11-27T16:00:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2016-06-01 Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Comite Francais d'Evaluation de la Cooperation Universitaire et Scientifique avec le Bresil (COFECUB, France) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The intensification of livestock have increased the emission of pollutants to the environment, leading to a growing interest in seeking strategies that minimise these emissions. Studies have shown that it is possible to manipulate diets by reducing CP levels and thus reducing nitrogen (N) excretion, without compromising performance. However, there is no knowledge of any study that has focused on reducing N excretion and relating this reduction to individual amino acids. This study investigated the effect of dietary methionine + cysteine (MC) and threonine (THR), the two most limiting amino acids for broiler production, on nitrogen excretion (NE) and nitrogen deposition (ND) and determined the efficiency of utilisation of both amino acids for protein deposition. Six trials were conducted to measure the NE and ND in broiler chickens during three rearing phases in response to dietary amino acid. The efficiency of utilisation of the amino acids was calculated by linear regression of body protein deposition and the amino acid intake. Despite the differences between sexes and phases, the efficiency of utilisation was the same, being 0.60 and 0.59 for MC and THR, respectively. The rate of NE behaved exponentially, increasing with amino acid intake, and can exceed 50% of N intake, being higher than ND. On average, for a reduction in intake of each unit of MC or THR (mg) there is a reduction of 0.5% of NE. Although this reduction seems low, considering that it corresponds to changes in one amino acid only, the impact on a large scale would be significant. Knowledge of how animals respond to NE and ND/protein deposition according to amino acid dietary content may represent new efforts towards reducing the impact on environment. Univ Estadual Paulista, Dept Anim Sci, Via Acesso Prof Paulo Donato Castellane, BR-14884900 Sao Paulo, Brazil INRA, CAPES COFECUB, Rech Avicoles UR83, F-37380 Nouzilly, France Univ Estadual Paulista, Dept Anim Sci, Via Acesso Prof Paulo Donato Castellane, BR-14884900 Sao Paulo, Brazil Comite Francais d'Evaluation de la Cooperation Universitaire et Scientifique avec le Bresil (COFECUB, France): Sv687/10
Published: 2016
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298. About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction

Author: Riou, Cindy, Brionne, Aurélien, Cordeiro, Luiz-Augusto, Harichaux, Grégoire, Gargaros-Ratajczak, Audrey, Labas, Valérie, Gautron, Joël, Gérard, Nadine, ProdInra, Migration, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plate-forme d'Analyse Intégrative des Biomolécules, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), University Fed Rural Semi Arido, Plateforme d'Analyse Intégrative des Biomolécules, Région Centre, Station de Phénotypage, Allice, ProdInra, Archive Ouverte, Université François Rabelais (Tours). Tours, FRA. Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FRA., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], bioinformatic, [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], proteome, poultry, processus biologique, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, exosomes, poule, coquille d'oeuf, hen, proteins, sperm storage, reproduction, uterine fluid, exosome, mineralization, cell interaction, minéralisation, faune aviaire, protéome, immunité, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, proteomic, [SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology
Abstract: About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction. 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group"
Published: 2016

299. Linkage mapping of quantitative trait loci for phosphorus utilization and growth related traits in an F2-cross of Japanese quail (Coturnix japonica)

Author: null P. Beck, null P. Stratz, null S. Preuß, null F. Pitel, null J. Recoquillay, null E. Duval, null M. Rodehutscord, null J. Bennewitz, Universität Hohenheim, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: f2-design, [SDV]Life Sciences [q-bio], 05 social sciences, japanase quail, qtl linkage, food and beverages, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, phosphorus utilization, Food Animals, 0502 economics and business, Animal Science and Zoology, [INFO]Computer Science [cs], genetic, mapping, 050203 business & management, 0105 earth and related environmental sciences
Abstract: International audience; Japanese quail (Coturnix japonica) is an important model animal in poultry studies. In the present study a large F2-cross design to map QTL for PU and other correlated traits on 14 chromosomes was used. Next to PU, the traits calcium utilization, body weight gain, and feed per gain ratio were investigated. Because the marker density was only sparse, QTL linkage interval mapping was performed. A line cross model and a paternal half-sib model was applied. Both models revealed several QTL for the traits investigated. In the line cross model QTL were identified on CJA04, CJA09 and CJA10. The dominance effect was important for the calcium utilization QTL on CJA04 and CJA09 and imprinting was important for the calcium utilization and PU QTL on CJA04 as well as for the PU QTL on CJA10. In the paternal half-sib model, QTL were identified on CJA1, CJA14, CJA17 and CJA20. There was no overlap in detected QTL between the models. A likely explanation is the different assumption made by the two models.
Published: 2016
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300. Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase kinases (CaMKKs) effects on AMP-activated protein kinase (AMPK) regulation of chicken sperm functions

Author: Yves Combarnous, Anne Duittoz, Thi Mong Diep Nguyen, Elisabeth Blesbois, Christophe Praud, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), French Agence Nationale de la Recherche, INRA, Vietnam Education Ministry, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherches Avicoles (URA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, protéine kinase, sperme, Acrosome reaction, reproduction animale, lcsh:Medicine, AMP-Activated Protein Kinases, Pathology and Laboratory Medicine, Biochemistry, Poultry, Substrate Specificity, 0302 clinical medicine, Cell Signaling, Animal Cells, Medicine and Health Sciences, Gamefowl, Post-Translational Modification, Phosphorylation, lcsh:Science, Sperm motility, 030219 obstetrics & reproductive medicine, Multidisciplinary, Kinase, Agriculture, Spermatozoa, Cell biology, Enzymes, Cell Motility, Naphthalimides, Flagella, Vertebrates, Sperm Motility, Cellular Types, Cellular Structures and Organelles, Pathogens, Research Article, Signal Transduction, Autre (Sciences du Vivant), Pathogen Motility, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], Livestock, Virulence Factors, poulet, amp protéine kinase, Calcium-Calmodulin-Dependent Protein Kinase Kinase, Biology, Birds, 03 medical and health sciences, Extracellular, Acrosomes, Animals, Calcium Signaling, Protein kinase A, Protein Kinase Inhibitors, urogenital system, Acrosome Reaction, lcsh:R, Organisms, AMPK, Biology and Life Sciences, Proteins, Cell Biology, Sperm, 030104 developmental biology, Germ Cells, Fowl, Enzymology, lcsh:Q, Benzimidazoles, Chickens, Protein Kinases
Abstract: Sperm require high levels of energy to ensure motility and acrosome reaction (AR) accomplishment. The AMP-activated protein kinase (AMPK) has been demonstrated to be strongly involved in the control of these properties. We address here the question of the potential role of calcium mobilization on AMPK activation and function in chicken sperm through the Ca(2+)/calmodulin-dependent protein kinase kinases (CaMKKs) mediated pathway. The presence of CaMKKs and their substrates CaMKI and CaMKIV was evaluated by western-blotting and indirect immunofluorescence. Sperm were incubated in presence or absence of extracellular Ca(2+), or of CaMKKs inhibitor (STO-609). Phosphorylations of AMPK, CaMKI, and CaMKIV, as well as sperm functions were evaluated. We demonstrate the presence of both CaMKKs (α and β), CaMKI and CaMKIV in chicken sperm. CaMKKα and CaMKI were localized in the acrosome, the midpiece, and at much lower fluorescence in the flagellum, whereas CaMKKβ was mostly localized in the flagellum and much less in the midpiece and the acrosome. CaMKIV was only present in the flagellum. The presence of extracellular calcium induced an increase in kinases phosphorylation and sperm activity. STO-609 reduced AMPK phosphorylation in the presence of extracellular Ca(2+) but not in its absence. STO-609 did not affect CaMKIV phosphorylation but decreased CaMKI phosphorylation and this inhibition was quicker in the presence of extracellular Ca(2+) than in its absence. STO-609 efficiently inhibited sperm motility and AR, both in the presence and absence of extracellular Ca(2+). Our results show for the first time the presence of CaMKKs (α and β) and one of its substrate, CaMKI in different subcellular compartments in germ cells, as well as the changes in the AMPK regulation pathway, sperm motility and AR related to Ca(2+) entry in sperm through the Ca(2+)/CaM/CaMKKs/CaMKI pathway. The Ca(2+)/CaMKKs/AMPK pathway is activated only under conditions of extracellular Ca(2+) entry in the cells.
Published: 2016
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