296 results on '"Plateforme Génomique Santé Biogenouest®"'
Search Results
202. Gene expression profiling during gonadal differentiation in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) using a next generation sequencing (NGS) approach
- Author
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Yano, Ayaka, Jouanno, Elodie, Klopp, Christophe, Guiguen, Yann, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA)
- Subjects
[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology ,salmonid ,[SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2011
203. Characterization of novel testis specific genes during sex differentiation in rainbow trout [i](Oncorhynchus mykiss)[/i] using a next generation sequencing (NGS) approach
- Author
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Yano, Ayaka, Dupin de Beyssat, Elodie, Klopp, Christophe, Guiguen, Yann, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE)
- Subjects
[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology ,[SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology - Abstract
absent
- Published
- 2011
204. Aromatase is expressed and active in growing oocytes of two non-mammalian vertebrates (Xenopus laevis and Oncorhynchus mykiss)
- Author
-
Gohin, Maella, Bodinier, Pascal, Fostier, Alexis, Bobe, Julien, Chesnel, Frank, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Laval [Québec] (ULaval), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), ProdInra, Migration, and Université de Rennes (UR)
- Subjects
[SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,[SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2011
205. Expression and promoter methylation pattern of three major developmental genes, sox2, nanog, and c-myc, during early embryo development in goldfish
- Author
-
Jean-Jacques Lareyre, Lucie Marandel, Pierre-Yves Le Bail, Catherine Labbé, Julien Bobe, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and ProdInra, Migration
- Subjects
Homeobox protein NANOG ,Genetics ,nanog ,0303 health sciences ,030219 obstetrics & reproductive medicine ,Embryogenesis ,Sox2 ,[SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,Cell Biology ,General Medicine ,Biology ,Developmental genes ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Reproductive Medicine ,SOX2 ,c-myc ,Promoter methylation ,[SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,030304 developmental biology - Abstract
International audience
- Published
- 2011
206. Follistatin, an early player in ovarian differentiation in teleost fish?
- Author
-
Adèle Branthonne, Alexis Fostier, Ayaka Yano, Barbara Nicol, Yann Guiguen, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Archive Ouverte
- Subjects
0303 health sciences ,medicine.medical_specialty ,030219 obstetrics & reproductive medicine ,Follistatine ,Reproduction ,salmonid ,Zoology ,[SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,Cell Biology ,General Medicine ,Biology ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Endocrinology ,Reproductive Medicine ,Internal medicine ,medicine ,biology.protein ,%22">Fish ,Ovaire ,[SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,030304 developmental biology ,Follistatin - Abstract
absent
- Published
- 2011
207. ATOL: A new ontology for livestock
- Author
-
Catherine Hurtaud, Jérôme Bugeon, Olivier Dameron, Alice Fatet, Isabelle Hue, Marie-Christine Salaun, Matthieu Reichstadt, Alain Valancogne, Jean Vernet, James Reecy, Park, C., Pierre-Yves Le Bail, Production du lait (PL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), INSERM U936 - UPRES EA 3888 Modélisation Conceptuelle des Connaissances Biomédicales, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie du développement et reproduction (BDR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Systèmes d'élevage, nutrition animale et humaine (SENAH), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Department of Animal Science, Iowa State University (ISU), Université de Rennes (UR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ProdInra, Archive Ouverte, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Production du lait ( PL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé ( IFR 140 GFAS ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] ( PRC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biologie du Développement et Reproduction ( BDR ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Systèmes d'élevage, nutrition animale et humaine ( SENAH ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Iowa State University ( ISU )
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[ SDV ] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Ontologie ,Elevage - Abstract
Session 2 : phenotyping of complex traitsSession 2 : phenotyping of complex traits; absent
- Published
- 2011
208. QTL/eQTL identification for osmoregulation capacities in rainbow trout
- Author
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Le Bras, Yvan, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,SALMONIDE - Abstract
National audience
- Published
- 2011
209. Quelles méthodes pour évaluer la qualité des poissons?
- Author
-
Bugeon, Jérôme, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,ontologie ATOL - Abstract
National audience
- Published
- 2011
210. Role of myostatin in the intracellular pathways regulating the balance between atrophy and hypertrophy in skeletal muscle
- Author
-
Picard, Brigitte, Bonnieu, Anne, Cassar-Malek, Isabelle, Chelh, Ilham, Cottin, Patrick, Gabillard, Jean-Charles, Hadj Sassi, A., Leibovitch, Serge, Rodriguez, Julie, Seiliez, Iban, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Dynamique Musculaire et Métabolisme (DMEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Nutrition, Métabolisme, Aquaculture (NUMEA), and ANR-08-BLAN-0267,MYOTROPHY,Le rôle de myostatine dans les voies de signalisation régulant la balance atrophie/hypertrophie dans le muscle squelettique(2008)
- Subjects
BOVIDE ,FoxO1 ,CULTURE DE CELLULE ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,MYOTROPHIE ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,GENOMIQUE ,[SHS]Humanities and Social Sciences - Abstract
International audience
- Published
- 2011
211. Profil de sensibilisation aux protéines d'œuf et prédiction de la tolérance
- Author
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Brossard, Chantal, Rance, Fabienne, Drouet, Martine, Legoué-Morillon, Sandrine, Paty, Evelyne, Anton, Marc, Galet, Olivier, Nau, Francoise, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pédiatrie - Pneumologie, Allergologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Département Pneumologie - Unité Allergologie Générale, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Centre de Recherche et d'Education en Allergie Alimentaire, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Pneumo Allergologie Infantile, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Association pour le Développement de la Recherche sur les Ovoproduits dans l’Ouest, Partenaires INRAE, Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ANR-07-PNRA-023 OVONUTRIAL, Société Française d’Allergologie (SFA). Paris, FRA. Association Nationale de Formation Médicale Continue en Allergologie (ANAFORCAL)., CHU Toulouse [Toulouse], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), ANR-07-PNRA023 OVONUTRIAL, and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®. Saint Gilles, FRA.
- Subjects
analyse in vivo ,sensibilisation allergique ,blanc d'oeuf ,jaune d'oeuf ,évaluation de tolérance ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,protéine purifiee ,méthode de suivi ,caractérisation biologique ,fraction protéique ,protéines oeuf ,alimentation de l'enfant ,oeuf ,Alimentation et Nutrition ,[SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering ,Food and Nutrition ,anticorps ige ,[SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering ,inflammation pulmonaire ,allergie alimentaire ,milieu d'inclusion ,[SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition ,étude in vivo ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2011
212. Studying the development of osmoregulatory organs in the medaka: role of cortisol receptors
- Author
-
Trayer, Vincent, Leguen, Isabelle, Horng, J.L., Hwang, P.P., Prunet, Patrick, Thermes, Violette, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, National Taiwan University, Academia Sinica, and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,ionocyte ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,cortisol ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2011
213. Qualité de la chair de truites arc-en-ciel à bas ou haut rendement en filet
- Author
-
Bugeon, Jérôme, ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,RENDEMENT EN FILET ,SALMONIDE - Abstract
National audience
- Published
- 2011
214. Nuclear transfer with cryopreserved fin cells, a unique but difficult means to reconstruct fish with diploid cells
- Author
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Labbé, Catherine, Le Bail, Pierre-Yves, Depince, Alexandra, Mella, Vanessa, Chenais, Nathalie, ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,epigenetics ,aquatic species ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,cryobanking ,microinjection ,reprogramming ,[INFO]Computer Science [cs] ,embryo development ,GENETIQUE ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,biotechnology - Abstract
International audience
- Published
- 2011
215. DNA methylation pattern in sperm and somatic cells after cryopreservation: Influence of the cryoprotectant
- Author
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Gautier, Laurent, Depince, Alexandra, Chenais, Nathalie, Marandel, Lucie, Le Bail, Pierre-Yves, Labbé, Catherine, ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2011
216. Effects of mechanical perturbation at various times during incubation on egg survival, hatching and malformation rates in the rainbow trout Oncorhynchus mykiss, and the influence of post-ovulatory oocyte ageing
- Author
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Milla, Sylvain, Sambroni, Elisabeth, Kestemont, Patrick, Jalabert, Bernard, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), University of Namur - Unité de Recherche en Biologie des Organismes (URBO), Facultés Universitaires Notre Dame de la Paix (FUNDP) - Namur, Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, University of Namur - Unité de Recherche en Biologie des Organismes, Facultés Universitaires Notre Dame de la Paix (FUNDP), Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Subjects
TRI DES OEUFS ,STRIPPING ,RAINBOW TROUT ,EGG MORTALITY ,[SDV.SA.STP]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Sciences and technics of fishery ,HANDLING ,FRY MALFORMATIONS ,SALMONIDE - Abstract
absent
- Published
- 2011
217. Trout coelomic fluid suitability as Goldfish oocyte extender can be determined by a simple turbidity test
- Author
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Catherine Labbé, Lucie Marandel, Lionel Goardon, Alexandra Depince, P.-Y. Le Bail, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Pisciculture Expérimentale INRA des Monts d'Arrée (PEIMA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE)
- Subjects
nuclear transfer ,animal structures ,Cell Culture Techniques ,law.invention ,Andrology ,03 medical and health sciences ,Human fertilization ,Food Animals ,Nephelometry and Turbidimetry ,law ,Goldfish ,medicine ,Animals ,14. Life underwater ,Small Animals ,Incubation ,030304 developmental biology ,fish ,0303 health sciences ,biology ,Equine ,Hatching ,[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology ,Extender ,Embryogenesis ,embryo development ,04 agricultural and veterinary sciences ,Anatomy ,biology.organism_classification ,Oocyte ,Body Fluids ,Trout ,androgenesis ,medicine.anatomical_structure ,Oncorhynchus mykiss ,Oocytes ,040102 fisheries ,0401 agriculture, forestry, and fisheries ,Female ,Animal Science and Zoology ,Rainbow trout - Abstract
Regeneration technologies such as androgenesis, intracytoplasmic sperm injection, and nuclear transfer require that handling conditions do not alter oocyte ability to sustain embryo development. One important parameter in the maintenance of oocyte quality in fish is the possibility to prevent oocytes activation during manipulation. In Cyprinid, such activation is known to be delayed when Salmonid coelomic fluid is used as incubation medium. Coelomic fluid however is a biological fluid whose ability to sustain oocyte quality during in vitro incubation may be variable. The purpose of the present work was to explore this variability using Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) coelomic fluid (TCF) and Goldfish (Carassius auratus) oocytes, and to set up a test which would reflect TCF suitability for Goldfish oocyte incubation. We showed that different TCF induced very different development rates after oocyte incubation for 30 min at 20 degrees C: at 24h post fertilization (pf) and at hatching, rates ranged between 35% and 110% of the non-incubated controls. When TCF (1 volume) was mixed with tap water (9 volumes), a precipitate developed whose extent was measured by spectrophotometry. This turbidity test proved to be highly correlated to development rates after Goldfish oocyte incubation in TCF (r(2) = 0.83 at hatching, n = 150): TCF with the highest turbidity (> 1.5 absorbance unit at 400 nm) were the ones which altered the most the development rates after incubation (less than 50 % at hatching). This easy and rapid turbidity test can therefore be used as a reliable estimator of TCF suitability for Goldfish oocyte incubation and manipulation. (C) 2011 Elsevier Inc. All rights reserved.
- Published
- 2011
218. FoxO1 is not a key transcription factor in the regulation of myostatin (mstn-1a and mstn-1b) gene expression in trout myotubes
- Author
-
Nathalie Sabin, Jean-Charles Gabillard, Iban Seiliez, Nutrition, Aquaculture et Génomique (NUAGE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR-08-BLAN-0267,MYOTROPHY,Le rôle de myostatine dans les voies de signalisation régulant la balance atrophie/hypertrophie dans le muscle squelettique(2008), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Subjects
Trout ,Physiology ,muscle ,Muscle Fibers, Skeletal ,Regulator ,FOXO1 ,Myostatin ,0302 clinical medicine ,poisson ,Gene expression ,insulin-like growth factor-I ,Insulin-Like Growth Factor I ,Phosphorylation ,[SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology ,Cells, Cultured ,2. Zero hunger ,Genetics ,salmonidae ,0303 health sciences ,oncorhynchus mykiss ,culture cellulaire ,biology ,Myogenesis ,[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology ,Forkhead Transcription Factors ,myostatin ,Models, Animal ,forkhead box O ,fish ,atrophy ,growth hormone ,transcription ,hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists ,expression des gènes ,endocrine system ,030209 endocrinology & metabolism ,truite ,Muscle mass ,digestive system ,hormone de croissance ,03 medical and health sciences ,Physiology (medical) ,myostatine ,Animals ,croissance animale ,Transcription factor ,030304 developmental biology ,biology.organism_classification ,Gene Expression Regulation ,biology.protein ,facteur de transcription ,truite arc en ciel - Abstract
In mammals, much evidence has demonstrated the important role of myostatin (MSTN) in regulating muscle mass and identified the transcription factor forkhead box O (FoxO) 1 as a key regulator of its gene expression during atrophy. However, in trout, food deprivation leads to muscle atrophy without an increase of the expression of mstn genes in the muscle. We therefore studied the relationship between FoxO1 activity and the expression of both mstn genes ( mstn1a and mstn1b) in primary culture of trout myotubes. To this aim, two complementary studies were undertaken. In the former, FoxO1 protein activity was modified with insulin-like growth factor-I (IGF-I) treatment, and the consequences on the expression of both mstn genes were monitored. In the second experiment, the expression of both studied genes was modified with growth hormone (GH) treatment, and the activation of FoxO1 protein was investigated. We found that IGF-I induced the phosphorylation of FoxO1 and FoxO4. Moreover, under IGF-I stimulation, FoxO1 was no longer localized in the nucleus, indicating that this growth factor inhibited FoxO1 activity. However, IGF-I treatment had no effect on mstn1a and mstn1b expression, suggesting that FoxO1 would not regulate the expression of mstn genes in trout myotubes. Furthermore, the treatment of myotubes with GH decreased the expression of both mstn genes but has no effect on the phosphorylation of FoxO1, FoxO3, and FoxO4 nor on the nuclear translocation of FoxO1. Altogether, our results showed that mstn1a and mstn1b expressions were not associated with FoxO activity, indicating that FoxO1 is likely not a key regulator of mstn genes in trout myotubes.
- Published
- 2011
219. Nme family and determination of egg quality, new insights from the zebrafish Danio rerio
- Author
-
Desvignes, Thomas, Fauvel, Chloé, Fostier, Alexis, Bobe, Julien, ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,genomics ,[INFO]Computer Science [cs] ,Nme ,[INFO] Computer Science [cs] ,zebrafish ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2011
220. Effects of iron on rainbow trout gill cells in primary culture
- Author
-
Patrick Prunet, Isabelle Leguen, Sandrine Peron, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Subjects
Gills ,Programmed cell death ,Health, Toxicology and Mutagenesis ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Cell ,Cell Count ,PAVEMENT CELL ,010501 environmental sciences ,Biology ,Toxicology ,01 natural sciences ,Epithelium ,03 medical and health sciences ,RAINBOW TROUT ,medicine ,Electric Impedance ,Animals ,GILL ,Secretion ,MUCOUS CELL ,Cells, Cultured ,030304 developmental biology ,0105 earth and related environmental sciences ,Cell Proliferation ,Cell Nucleus ,0303 health sciences ,Pavement cells ,Cell growth ,PRIMARY CULTURE ,IRON ,Cell Biology ,respiratory system ,Mucus ,Molecular biology ,medicine.anatomical_structure ,Oncorhynchus mykiss ,Immunology ,Ultrastructure - Abstract
This study investigated the effects of iron in the form of iron sulphate (FeSO(4)center dot 7H(2)O), over the range 0.01-1 mM on rainbow trout primary gill cells cultured on semi-permeable membranes. The endpoints measured were cell proliferation, mucous cell numbers, area of mucus in mucous cells, ultrastructural analysis and transepithelial resistance. Regardless of the concentration, FeSO(4) did not modify the apical surface of pavement cells (microridge) and mucous cells. However, at 1 mM, this metal reduced cell numbers, by inhibiting cell proliferation and causing cell death, and induced a decrease in transepithelial resistance. It is interesting to note that cell numbers were also reduced in the presence of 0.5 mM iron salt, although this reduction did not modify transepithelial resistance. FeSO(4) reduced mucous cell number but did not change mucus area in mucous cells suggesting that this metal could induce a discharge of mucous cells, but mucus secretion would be total and not partial. In conclusion, our in vitro model has allowed to study some toxic effect but also resistance of gill epithelium in presence of iron.
- Published
- 2011
221. Implication of the mineralocorticoid axis in rainbow trout osmoregulation during salinity acclimation
- Author
-
Claudiane Valotaire, Armin Sturm, Franck Giton, Patrick Prunet, Jean Fiet, Alexis Fostier, Sylvain Milla, Pia Kiilerich, Sylvie Chevolleau, Xavier Terrien, Laurent Debrauwer, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), University of Namur - Unit of Research in Organismal Biology, Facultés Universitaires Notre Dame de la Paix (FUNDP) - Namur, Institute of Aquaculture, University of Stirling, SCRIBE, IFR 140, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Xénobiotiques, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AP-HP CIB GHU Sud Henri Mondor, Faculté de Médecine, Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM), Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Facultés Universitaires Notre Dame de la Paix (FUNDP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
- Subjects
Gills ,medicine.medical_specialty ,Salinity ,endocrine system ,animal structures ,Hydrocortisone ,medicine.drug_class ,Endocrinology, Diabetes and Metabolism ,Acclimatization ,030209 endocrinology & metabolism ,Kidney ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Endocrinology ,Mineralocorticoid receptor ,Glucocorticoid receptor ,Receptors, Glucocorticoid ,Antibody Specificity ,Internal medicine ,medicine ,Animals ,Intestinal Mucosa ,Desoxycorticosterone ,030304 developmental biology ,0303 health sciences ,biology ,CORTISOL ,Kidney metabolism ,11-DEOXYCORTICOSTERONE (DOC) ,Water-Electrolyte Balance ,[SDV.MHEP.EM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Endocrinology and metabolism ,biology.organism_classification ,Immunohistochemistry ,6. Clean water ,Trout ,Receptors, Mineralocorticoid ,Mineralocorticoid ,Oncorhynchus mykiss ,Osmoregulation ,Rainbow trout ,Sodium-Potassium-Exchanging ATPase ,Glucocorticoid ,medicine.drug ,SALMONIDE - Abstract
Cortisol and glucocorticoid receptors (GRs) play an important role in fish osmoregulation, whereas the involvement of the mineralocorticoid receptor (MR) and its putative ligand 11-deoxycorticosterone (DOC) is poorly investigated. In this study, we assessed the implication of DOC and MR in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) osmoregulation during hypo- and hypersaline acclimation in parallel with the cortisol–GR system. A RIA for DOC was developed to measure plasma DOC levels, and a MR-specific antibody was developed to localize MR protein in the gill, intestine, and kidney. This is the first study to report DOC plasma levels during salinity change and MR localization in fish osmoregulatory tissue. Corticosteroid receptor mRNA abundance was investigated in osmoregulatory tissue during salinity acclimation, and the effect of cortisol and DOC on ionic transporters gene expression was assayed using an in vitro gill incubation method. Differential tissue-, salinity-, and time-dependent changes in MR mRNA levels during both hyper- and hyposaline acclimations and the ubiquitous localization of MR in osmoregulatory tissue suggest a role for the MR in osmoregulation. Presumably, DOC does not act as ligand for MR in osmoregulation because there were no changes in plasma DOC levels during either freshwater–seawater (FW–SW) or SW–FW acclimation or any effect of DOC on gill ionic transporter mRNA levels in the gill. Taken together, these results suggest a role for MR, but not for DOC, in osmoregulation and confirm the importance of cortisol as a major endocrine regulator of trout osmoregulation.
- Published
- 2011
222. Analyse du phénotype gonadique de truites arc-en-ciel porteuses de la mutation masculinisante 'mal'
- Author
-
Guiguen, Yann, ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
[SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology ,[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology ,salmonid ,[SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,[SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology - Abstract
National audience
- Published
- 2011
223. Etude de la fiabilité des listes de gènes différentiels obtenues à partir de données de comptage générées par séquençage 454 [Roche] en comparaison avec la technologie des microréseaux d'ADN [Agilent]
- Author
-
Guernec, Grégory, Montfort, Jérôme, Le Cam, Aurélie, Reinhardt, R., Prunet, Patrick, Guiguen, Yann, Rescan, Pierre-Yves, Power, D., ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Max Planck Institute for Molecular Genetics (MPIMG), Max-Planck-Gesellschaft, and Universidade do Algarve (UAlg)
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,séquençage haut-débit ,fiabilité des données ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,microréseaux ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,seuil - Abstract
National audience
- Published
- 2011
224. One Alternative to Germ Cells Cryopreservation: Cryobanking of Somatic Cells in Sturgeon
- Author
-
Catherine Labbé, Patrick Williot, Pierre-Yves Le Bail, Alexandra Depince, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Independent, Patrick Williot (Coordinateur), Eric Rochard (Coordinateur), Nathalie Desse-Berset (Coordinateur), Frank Kirschbaum (Coordinateur), and Jörn Gessner (Coordinateur)
- Subjects
0303 health sciences ,biology ,Somatic cell ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,030302 biochemistry & molecular biology ,Oocyte ,biology.organism_classification ,Cryopreservation ,Cell biology ,03 medical and health sciences ,Sturgeon ,medicine.anatomical_structure ,Cryopreserved Cell ,medicine ,Acipenser sturio ,Maternal to zygotic transition ,Somatic cell nuclear transfer ,[INFO]Computer Science [cs] ,030304 developmental biology - Abstract
International audience; Cryobanking of somatic cells is one option for preserving both parental genomes when gametes are not available or are unsuitable for cryopreservation. Somatic cells can be obtained from skin or fin biopsies, which are easy to collect long before sexual maturation is reached. This chapter develops a strategy to be considered for cryobanking of Acipenser sturio somatic cells, with the example of fin as a cell reservoir. The collected fins should be appropriately stored to allow shipping to laboratory facilities where they will be either frozen as a whole, or cultured to grow out cells which will be cryopreserved thereafter. Fish reconstruction from somatic cells will require the use of nuclear transfer technology, where the nucleus of the cryopreserved cell is transferred into the enucleated oocyte of a closely related species. The promises and drawbacks of this reconstruction technology are developed.
- Published
- 2011
225. Fishing for the genetic basis of muscle hyperplasia
- Author
-
Rescan, Pierre-Yves, ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2011
226. Pathways used by androgens or FSH to regulate testis maturation
- Author
-
Sambroni, Elisabeth, Rolland, Antoine D., Goupil, Anne-Sophie, Lareyre, Jean-Jacques, Le Gac, Florence, ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
[SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology ,[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology ,[SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,[SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology - Abstract
International audience
- Published
- 2011
227. nanog promoter sequence, DNA methylation, and expression in gametes and early embryo reveal striking differences between teleosts and mammals
- Author
-
Marandel, Lucie, Labbé, Catherine, Bobe, Julien, Le Bail, Pierre-Yves, ProdInra, Migration, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
nanog ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,transcription des gènes ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2011
228. The NME gene family in zebrafish oogenesis and early development
- Author
-
Thomas Desvignes, Christian Fauvel, Julien Bobe, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), LALR, Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Laboratoire d'Aquaculture Languedoc Roussillon (LALR)
- Subjects
Male ,Oocyte ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Teleost ,reproduction animale ,poisson zèbre ,Maternal ,NDPK ,Oogenesis ,gonade ,0302 clinical medicine ,poisson ,cyprinidae ,Zebrafish ,In Situ Hybridization ,MATERNAL ,Genetics ,0303 health sciences ,biology ,Gene Expression Regulation, Developmental ,Embryo ,ovocyte ,General Medicine ,NM23 Nucleoside Diphosphate Kinases ,GENOMIQUE ,medicine.anatomical_structure ,danio rerio ,Organ Specificity ,Female ,transcription ,expression des gènes ,qualité des oeufs ,Molecular Sequence Data ,Nm23 ,TELEOST ,Nme ,Gene Expression Regulation, Enzymologic ,OOCYTE ,03 medical and health sciences ,cyprinide ,pcr ,œuf de poisson ,medicine ,Gene family ,Animals ,Gene ,030304 developmental biology ,Pharmacology ,Base Sequence ,ovogénèse ,Vertebrate ,gène ,génome ,Gene Expression Profiling ,ovaire ,Embryogenesis ,embryogénèse ,COMPETENCE OVOCYTAIRE ,biology.organism_classification ,vertébré ,développement embryonnaire ,embryon ,Maternal to zygotic transition ,hybridation in situ ,VERTEBRATE ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
After the recent report of the expression of several nme genes in the zebrafish gonads, the present study aimed at further analyzing the expression of nme genes in the ovary with special attention for the nme transcripts that are maternally inherited and could thus participate in the determination of oocyte developmental competence. The expression levels of all groups I and II nme genes were characterized by QPCR in a panel of zebrafish tissues. The nme genes exhibiting an ovarian expression were subsequently monitored throughout oogenesis and early development, and their expression sites characterized using in situ hybridization. Here, we show that nme2b1, nme3, nme4, and nme6 are highly expressed in the ovary and present in the zebrafish oocyte throughout oogenesis. While the four transcripts are maternally inherited, nme3 and nme6 display a typical maternal profile and are detected in the zebrafish early embryo. In contrast to nme3, nme6, abundance exhibits a sharp decrease during early embryogenesis. After zygotic genome activation, we observed an increased expression of nme2b1, nme2b2, nme3, and nme6. The present study provides a comprehensive overview of the expression of nme family members during zebrafish oogenesis and early development. In addition, the maternal origin of two nme transcripts in the early embryo is reported here for the first time in any vertebrate species. Together, our observations suggest an important role of the nme family in oocyte and embryo development in vertebrates.
- Published
- 2010
229. Pourquoi une ontologie dédiée aux animaux d'élevage ?
- Author
-
Le Bail, Pierre-Yves, Van Milgen, Jaap, Le Roy, Pascale, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Systèmes d'élevage, nutrition animale et humaine (SENAH), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale (GARen), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,ontologie ATOL ,animal trait ontology - Abstract
National audience
- Published
- 2010
230. FIBERFISH - Identification et caractérisation fonctionnelle de gènes régulateurs de l'hyperplasie musculaire, une composante essentielle de la croissance et de la texture du muscle chez les poissons
- Author
-
Rescan, Pierre-Yves, Ralliere, Cécile, Montfort, Jérôme, Lebret, Véronique, Le Cam, Aurélie, Cousin, Xavier, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), and Plateforme Génomique Santé Biogenouest®
- Subjects
différenciation musculaire ,poisson ,expression génique ,muscle ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,cellule souche ,croissance animale ,[INFO]Computer Science [cs] ,myotome ,hyperplasie ,myogénèse ,texture ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2010
231. GENOTROUT - Apport des nouvelles technologies de séquençage (NGS) à l'analyse du génome pseudotétraploide de la truite arc-en-ciel (2010-2012)
- Author
-
Guiguen, Yann, Genet, Carine, Quillet, Edwige, Volff, Jean-Nicolas, Chalopin, Domitille, Galiana-Arnoux, Delphine, Jaillon, Olivier, Wincker, Patrick, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
- Subjects
salmonidae ,Séquençage ,oncorhynchus mykiss ,salmonidé ,génome ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,génomique fonctionnelle ,Analyse du génome ,Poisson ,truite arc en ciel - Abstract
absent
- Published
- 2010
232. SEXYTROUT - Caractérisation du phénotype gonadique d'une population de truite arc-en-ciel porteuse d'une mutation masculinisante (mutation [i]'mal'[/i]). (2009-2012)
- Author
-
Valdivia, Karina, Fostier, Alexis, Mourot, Brigitte, Jouanno, Elodie, Guyomard, René, Quillet, Edwige, Tomaszkiewicz, Marta, Gueroult-Bellone, Marion, Volff, Jean-Nicolas, Galiana-Arnoux, Delphine, Guiguen, Yann, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
- Subjects
phénotype ,salmonidé ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,génétique ,génomique - Abstract
absent
- Published
- 2010
233. Characterization of Wnt4 in the rainbow trout and its expression in differentiating gonads
- Author
-
Nicol, Barbara, Branthonne, Adèle, Guiguen, Yann, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,salmonidé ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,Wnt4 ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2010
234. The Nme family: gene repertoire and evolutionary history
- Author
-
Desvignes, Thomas, Pontarotti, Pierre, FAUVEL, Christian, Bobe, Julien, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de Provence - Aix-Marseille 1, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2010
235. Histoire évolutive des gènes de la famille Nme chez les vertébrés et implication dans la compétence ovocytaire au développement chez les poissons
- Author
-
Desvignes, Thomas, Pontarotti, Pierre, Fauvel, Christian, Bobe, Julien, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), LALR, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de Provence - Aix-Marseille 1, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and Laboratoire Aquaculture Languedoc-Roussillon (LALR)
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2010
236. Genetics of adaptation in rainbow trout: a multidisciplinary approach
- Author
-
Dupont-Nivet, Mathilde, Prunet, Patrick, Bégout, M.L., Pellegrini, Patricia, KHAW, Hooi Ling, Millot, S., Péan, S., Auperin, Benoît, Valotaire, Claudiane, Rolland, Julien, Kerneis, Thierry, Goardon, Lionel, Quillet, Edwige, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), LRH-LR Place Gaby Coll., Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Jln Batu Maung, Bayan Lepas, World Fish Center, Pisciculture Expérimentale INRA des Monts d'Arrée (PEIMA), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,GENETIQUE ,SALMONIDE ,BIEN-ETRE ANIMAL - Abstract
absent
- Published
- 2010
237. Proteome analysis and genome-wide regulatory motif prediction identify novel potentially sex-hormone regulated proteins in rat efferent ducts
- Author
-
Trépos-Pouplard, Mélanie, Lardenois, Aurélie, Staub, Christophe, Guitton, Nathalie, Dorval-Coiffec, Isabelle, Pineau, Charles, Primig, Michael, Jégou, Bernard, Trépos, Mélanie, Groupe d'Etude de la Reproduction Chez l'Homme et les Mammiferes (GERHM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), IMV Technologies, Plate-forme protéomique [Rennes], Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Biogenouest Proteomics Core Facility, Ministère de l’Enseignement, de la Recherche et de la Technologie, Inserm Avenir grant No R07216NS, Conseil Régional de Bretagne, European Project: 212844,EC:FP7:ENV,FP7-ENV-2007-1,DEER(2008), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Forgeron, Christine, and Developmental effects of environment on reproductive health - DEER - - EC:FP7:ENV2008-05-01 - 2012-04-30 - 212844 - VALID
- Subjects
Epididymis ,Male ,oestrogen response elements ,Rete Testis ,Proteome ,Tumor Protein, Translationally-Controlled 1 ,Estrogens ,[SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,androgen ,Response Elements ,Rats ,Rats, Sprague-Dawley ,androgene response elements ,Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization ,Androgens ,efferent ducts ,Animals ,Electrophoresis, Gel, Two-Dimensional ,rat ,oestrogen ,[SDV.BDLR] Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology ,Genome-Wide Association Study - Abstract
International audience; The efferent ducts are a series of tubules that conduct sperm from the rete testis to the epididymis. They absorb most fluid and proteins originating from the rete testis during concentration of spermatozoa prior to their entry into the epididymis. Proteome analysis of micro-dissected efferent duct samples from adult rats was combined with genome-wide computational prediction of conserved hormone response elements to identify factors likely regulated by oestrogens and androgens. We identified 165 proteins and found subsets of the promoters controlling their corresponding genes to contain androgen- and oestrogen response elements (ARE/EREs) at similar frequencies. Moreover, EREs were significantly enriched among the loci identified compared with their genome-wide occurrence. The expression and localization of Anxa6, Ckb, Krt19, Park7, Pdzk1 and Tpt1 in the efferent ducts and other related hormone controlled tissues was further validated at the RNA or protein level. This study identifies many novel proteins predicted to play roles in sperm maturation and male fertility and provides significant computational evidence that the efferent ducts express genes transcriptionally controlled by sex hormones.
- Published
- 2010
238. HERIGE : Résultats préliminaires en texture
- Author
-
Lefèvre, Florence, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2010
239. GENSPERMIATION : Genes hormono-dépendants impliqués dans la spermiation chez la truite arc-en-ciel
- Author
-
Le Gac, Florence, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,SALMONIDE - Abstract
National audience
- Published
- 2010
240. Colour image analysis as a possible tool to quantify carcass and flesh quality in a rainbow trout selective breeding program
- Author
-
Bugeon, Jérôme, Choubert, Georges, Pincent, Cédric, Chatain, Béatrice, Petit, Vincent, Vandeputte, Marc, Dupont-Nivet, Mathilde, Haffray, Pierrick, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Nutrition, Aquaculture et Génomique (NUAGE), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), INRA SCRIBE Campus de Beaulieu, Syndicats des sélectionneurs avicoles et aquacoles français (SYSAAF), Chemin de Maguelone, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Sources de l'Avance, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Archive Ouverte, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français (SYSAAF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,Fish ,Carcass quality ,Flesh quality ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Colour image ,Salmonid ,Selection ,SALMONIDE - Abstract
absent
- Published
- 2010
241. Is the fish pou2 orthologue of pou5f1/Oct4 regulated by methylation during early embryo development in goldfish?
- Author
-
Marandel, Lucie, Labbé, Catherine, Bobe, Julien, Jammes, Hélène, Lareyre, Jean-Jacques, Le Bail, Pierre-Yves, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Biologie du développement et reproduction (BDR), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2010
242. Recherche de marqueurs prédictifs de résistance des tumeurs ovariennes aux chimiothérapies par imagerie MALDI
- Author
-
Charoy, Blandine, Lincet, Hubert, Lavigne, Regis, Alexandrov, Theodore, Thiele, Hertbert, Gauduchon, Pascal, Pineau, Charles, Groupe d'Etude de la Reproduction Chez l'Homme et les Mammiferes (GERHM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Groupe Régional d'Etudes sur le CANcer (GRECAN), IFR146-Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Center of Industrial Mathematics - University of Bremen, University of Bremen, Plate-forme protéomique [Rennes], Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-IFR146, and Brébion, Alice
- Subjects
[SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] ,[SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] ,imagerie ,recherche biomarqueurs - Published
- 2010
243. Etude du sécrétome germinal testiculaire in situ par Omique combinatoire
- Author
-
Hernio, Nolwen, Chalmel, Frédéric, Com, Emmanuelle, Teixera, Ana Paula, Dacheux, Jean-Louis, Pineau, Charles, Groupe d'Etude de la Reproduction Chez l'Homme et les Mammiferes (GERHM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plate-forme protéomique [Rennes], Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-IFR140-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Brébion, Alice
- Subjects
[SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] ,[SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2010
244. What about fish feelings? An inquiry about how fish farmers and researchers approach fish welfare
- Author
-
Pellegrini, Patricia, Dupont-Nivet, Mathilde, Phocas, Florence, Quillet, Edwige, Prunet, Patrick, Begout, Marie-Laure, Tocqueville, Aurélien, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service Technique Aquaculture - 21, rue du Rocher, Paris 75008 (FRA, ITAVI, European Association of Social Anthropologists (EASA). GBR., AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI)
- Subjects
Bien-etre animal ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Aquaculture ,Poisson - Abstract
absent
- Published
- 2010
245. Acclimation to seawater in rainbow trout: a QTL/eQTL approach
- Author
-
Yvan Le Bras, Nicolas Dechamp, Jérôme Montfort, Aurélie Le Cam, Francine Krieg, Edwige Quillet, Patrick Prunet, Pascale Le Roy, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Animale (GARen), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, IFR140-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes-AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes-IFR140
- Subjects
Eau de mer ,Genotype ,Qtl ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Adaptation ,Poisson ,SALMONIDE - Abstract
Session : Breeding in aquacultural species; absent
- Published
- 2010
246. In vitro characterization of trout satellite cells proliferation and differentiation
- Author
-
Gabillard, Jean-Charles, Sabin, Nathalie, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,SALMONIDE - Abstract
International audience
- Published
- 2010
247. Cryoconservation des spermes de poissons, bases biologiques et originalités physiologiques
- Author
-
Labbé, Catherine, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, and ProdInra, Migration
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,technique de conservation ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2010
248. Proteomic analysis of the spermatogonial stem cell compartment in dogfish Scyliorhinus canicula L
- Author
-
Pierrick Auvray, Régis Lavigne, Geraldine Loppion, Pascal Sourdaine, Charles Pineau, Physiologie et Ecophysiologie des Mollusques Marins (PE2M), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe d'Etude de la Reproduction Chez l'Homme et les Mammiferes (GERHM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plate-forme protéomique [Rennes], Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, CIFRE (ANRT and C.RIS Pharma), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)
- Subjects
Male ,endocrine system ,Proteome ,Physiology ,MESH: Spermatogonia ,Protein subunit ,Blotting, Western ,MESH: Stem Cells ,Biology ,Proteomics ,Biochemistry ,Mass Spectrometry ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Testis ,Genetics ,medicine ,Animals ,MESH: Blotting, Western ,MESH: Animals ,[SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology ,Spermatogenesis ,Molecular Biology ,030304 developmental biology ,MESH: Mass Spectrometry ,0303 health sciences ,030219 obstetrics & reproductive medicine ,MESH: Testis ,Stem Cells ,Scyliorhinus canicula ,MESH: Immunohistochemistry ,biology.organism_classification ,Sertoli cell ,Shark ,Immunohistochemistry ,Molecular biology ,Spermatogonia ,MESH: Male ,MESH: Proteome ,medicine.anatomical_structure ,MESH: Dogfish ,Dogfish ,Stem cell ,MESH: Spermatogenesis - Abstract
International audience; In the dogfish (Scyliorhinus canicula L.) the testicular germinative zone (GZ), composed of large isolated spermatogonia surrounded by elongating pre-Sertoli cells, is located between the albuginea and the ventrolateral intratesticular vessel. During the spermatogenic wave, cysts radiate in maturational order forming distinct testicular zones. In this study, soluble proteins of the GZ and of the zone containing cysts with spermatocytes were separated by two-dimensional electrophoresis. Gel images were matched and then evaluated for GZ-specific proteins. From the1400 protein spots identified, 680 were found to be apparently specific to this zone. Using MALDI-TOF/TOF mass spectrometry, de novo sequences were obtained for 33 proteins out of the 169 selected for identification by mass spectrometry, but only 16 of these 169 proteins were identified. One of them, proteasome subunit alpha-6, was analyzed further by immunohistochemistry. This study demonstrates the utility of the dogfish as a model for proteome analysis of the spermatogonial stem cell niche, even if it remains restricted by the lack of genomic data available on Elasmobranchs.
- Published
- 2010
249. EP45 accumulates in growing Xenopus laevis oocytes and has oocyte-maturation-enhancing activity involved in oocyte quality
- Author
-
Torbjørn Midtun, Anders Goksøyr, Nathalie Guitton, Laurent Richard-Parpaillon, Aude Pascal, Romain D’Inca, Gaëlle Marteil, Jacek Z. Kubiak, Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plate-forme protéomique [Rennes], Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Groupe d'Etude de la Reproduction Chez l'Homme et les Mammiferes (GERHM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Molecular Biology, University of Bergen (UiB), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), and De Villemeur, Hervé
- Subjects
Proteomics ,MESH: Signal Transduction ,Embryo, Nonmammalian ,Xenopus ,Xenopus Proteins ,MESH: Protein Isoforms ,Xenopus laevis ,0302 clinical medicine ,Cytosol ,MESH: Pregnancy ,MESH: Cytosol ,MESH: Progesterone ,Protein Isoforms ,MESH: Animals ,MESH: Peptide Fragments ,MESH: Xenopus Proteins ,[SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology ,Cells, Cultured ,Progesterone ,0303 health sciences ,medicine.diagnostic_test ,MESH: Proteomics ,MESH: CDC2 Protein Kinase ,Cell biology ,Meiosis ,medicine.anatomical_structure ,Liver ,030220 oncology & carcinogenesis ,Female ,Signal Transduction ,MESH: Cells, Cultured ,Gene isoform ,[SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology ,Biology ,MESH: Oocytes ,03 medical and health sciences ,MESH: Gene Expression Profiling ,Western blot ,MESH: Xenopus laevis ,MESH: Serpins ,[SDV.BDD] Life Sciences [q-bio]/Development Biology ,CDC2 Protein Kinase ,medicine ,Animals ,[SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology ,Serpins ,030304 developmental biology ,Messenger RNA ,Gene Expression Profiling ,MESH: Embryo, Mammalian ,RNA ,Cell Biology ,biology.organism_classification ,Oocyte ,Molecular biology ,Electrophoreses ,Peptide Fragments ,MESH: Meiosis ,Oocytes ,MESH: Female ,MESH: Liver - Abstract
International audience; The capacity of oocytes to fully support meiotic maturation develops gradually during oocyte growth. Growing oocytes accumulate proteins and mRNAs required for this process. However, little is known about the identity of these factors. We performed a differential proteomic screen comparing the proteomes of growing stage-IV oocytes, which do not undergo meiotic maturation in response to progesterone, with fully grown stage-VI ones, which do. In 2D gels of stage-VI oocytes, we identified a group of four protein spots as EP45 (estrogen-regulated protein 45 kDa), which belongs to the family of serine protease inhibitors and is also known as Seryp or pNiXa. Western blot analysis after mono- and bi-dimensional electrophoreses confirmed the accumulation of certain forms of this protein in oocytes between stages IV and VI. EP45 mRNA was not detectable in oocytes or ovaries, but was expressed in the liver. A low-mobility isoform of EP45 was detected in liver and blood, whereas two (occasionally three or four) higher-mobility isoforms were found exclusively in oocytes, suggesting that liver-synthesized protein is taken up by oocytes from the blood and rapidly modified. Alone, overexpression of RNA encoding either full-length or N-terminally truncated protein had no effect on meiotic resumption in stage-IV or -VI oocytes. However, in oocytes moderately reacting to low doses of progesterone, it significantly enhanced germinal-vesicle breakdown, showing a novel and unsuspected activity of this protein. Thus, EP45 accumulates in growing oocytes through uptake from the blood and has the capacity to act as an 'oocyte-maturation enhancer' ('Omen').
- Published
- 2010
250. Apport de la microdissection laser à l'étude des mécanismes d'acclimatation des truites lors d'un transfert d'eau douce en l'eau de mer
- Author
-
Fautrel, Alain, Leguen, Isabelle, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut Fédératif de Recherche - Génétique Fonctionnelle Agronomie et Santé (IFR 140 GFAS), Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Migration, and Université de Rennes (UR)
- Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio] ,IONOCYTE ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[INFO]Computer Science [cs] ,[INFO] Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,MICRODISSECTION LASER ,TRANSFERT EAU DE MER ,SALMONIDE - Abstract
National audience
- Published
- 2010
Catalog
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