201. SNP-array lesions in core binding factor acute myeloid leukemia
- Author
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Duployez, Nicolas, Boudry-Labis, Elise, Roumier, Christophe, Boissel, Nicolas, Petit, Arnaud, Geffroy, Sandrine, Helevaut, Nathalie, Celli-Lebras, Karine, Terré, Christine, Fenneteau, Odile, Cuccuini, Wendy, Luquet, Isabelle, Lapillonne, Hélène, Lacombe, Catherine, Cornillet, Pascale, Ifrah, Norbert, Dombret, Hervé, Leverger, Guy, Jourdan, Eric, Preudhomme, Claude, Bernardo, Elizabeth, Laboratoire d'Hématologie [CHRU Lille] (Centre de Biologie et de Pathologie), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U837 (JPArc), Université Lille Nord de France (COMUE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Institut de Génétique Médicale [CHRU Lille], Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service d'Hématologie [AP-HP Hôpital Saint-Louis], Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU), CHU Trousseau [APHP], Département de Génétique [CH Versailles], Centre Hospitalier de Versailles André Mignot (CHV), Laboratoire d'Hématologie [AP-HP Hôpital Robert Debré], AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Département de Cytogénétique [AP-HP Hôpital Saint-Louis], Service Hématologie - IUCT-Oncopole [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle IUCT [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Goelamsthèque [AP-HP Hôpital Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Laboratoire d'Hématologie [CHU Reims], Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Innate Immunity and Immunotherapy (CRCINA-ÉQUIPE 7), Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes-Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Département d'Hématologie [CHU Nîmes], Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U1172 Inserm - U837 (JPArc), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Lille Nord de France (COMUE)-Université de Lille, Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire d'Hématologie [Rangueil], Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA), Laboratoire d'Hématologie [CHRU Lille] ( Centre de Biologie et de Pathologie ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer (JPArc) - U1172 ( JPArc ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), AP-HP Hôpital Saint-Louis, Groupe de Recherche Clinique n°7 - Myéloproliférations aiguës et chroniques [AP-HP Hôpital Saint-Antoine] ( GRC n°07 - MyPAC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AP-HP - Hôpital Saint-Antoine, Centre de Recherche Saint-Antoine ( CR Saint-Antoine ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Sorbonne Universités, Département d'Hématologie et d'Oncologie Pédiatrique [AP-HP Hôpitaux universitaires Est parisien], Groupe Hospitalier des Hôpitaux Universitaires de l’Est Parisien-AP-HP Hôpital Armand-Trousseau [Paris], Centre Hospitalier de Versailles (CHV), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital de Rangueil, Laboratoire d'Hématologie [AP-HP Hôpitaux universitaires Est parisien], AP-HP Hôpital cochin, Centre Hospitalier Universitaire de Reims ( CHU Reims ), Innate immunity and Immunotherapy ( CRCINA - Département INCIT - Equipe 7 ), Centre de recherche de Cancérologie et d'Immunologie / Nantes - Angers ( CRCINA ), Université d'Angers ( UA ) -Université de Nantes ( UN ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Santé de l'Université de Nantes ( IRS-UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ) -Université d'Angers ( UA ) -Université de Nantes ( UN ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Santé de l'Université de Nantes ( IRS-UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), and Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes ( CHU de Nîmes )
- Subjects
SNP-array ,[SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer ,hemic and lymphatic diseases ,[SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer ,sequencing ,acute myeloid leukemia ,core binding factor ,[ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer - Abstract
International audience; Acute myeloid leukemia (AML) with t(8;21) and inv(16), together referred as core binding factor (CBF)-AML, are recognized as unique entities. Both rearrangements share a common pathophysiology, the disruption of the CBF, and a relatively good prognosis. Experiments have demonstrated that CBF rearrangements were insufficient to induce leukemia, implying the existence of cooperating events. To explore these aberrations, we performed single nucleotide polymorphism (SNP)-array in a well-annotated cohort of 198 patients with CBF-AML. Excluding breakpoint-associated lesions, the most frequent events included loss of a sex chromosome (53%), deletions at 9q21 (12%) and 7q36 (9%) in patients with t(8;21) compared with trisomy 22 (13%), trisomy 8 (10%) and 7q36 deletions (12%) in patients with inv(16). SNP-array revealed novel recurrent genetic alterations likely to be involved in CBF-AML leukemogenesis. ZBTB7A mutations (20% of t(8;21)-AML) were shown to be a target of copy-neutral losses of heterozygosity (CN-LOH) at chromosome 19p. FOXP1 focal deletions were identified in 5% of inv(16)-AML while sequence analysis revealed that 2% carried FOXP1 truncating mutations. Finally, CCDC26 disruption was found in both subtypes (4.5% of the whole cohort) and possibly highlighted a new lesion associated with aberrant tyrosine kinase signaling in this particular subtype of leukemia.
- Published
- 2018