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625 results on '"Ranjard , Lionel"'

151. Dossier : les maxi-pouvoirs des micro-organismes du sol

Author: Magnard, Adèle, Cailliez, Blandine, Escoffier, Isabelle, Ranjard, Lionel, Terrat, Sébastien, La France Agricole, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], professionnel, article de communication, micro-organismes des sols, vulgarisation
Abstract: EABIOmEUBINRAUMR; Comment décrire le fonctionnement biologique des sols ? Quels rôles jouent les micro-organismes ? Comment les pratiques culturales influent-elles sur l’abondance et la diversité des micro-organismes ? Pour parler de ce monde souterrain encore peu connu, l’équipe de La France Agricole a fait parler plusieurs chercheurs de l’unité Agroécologie du Centre INRA de Dijon – Bourgogne-Franche-Comté. Parmi eux, Lionel Ranjard et Sébastien Terrat
Published: 2017

152. Diagnostic microbiologique de la qualité des sols : du territoire national aux sols agricoles

Author: Ranjard, Lionel, ProdInra, Archive Ouverte, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME). FRA., and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC )
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: INRAEABIOmE; Diagnostic microbiologique de la qualité des sols : du territoire national aux sols agricoles. Journée d’Animation Scientifique et Technique sur "La Microbiologie Moléculaire au Service du Diagnostic Environnemental". ADEME, L’Observatoire Français des Sols Vivants et le GDR Génomique Environnemental
Published: 2017

153. Ecological networks as a promising approach to decipher the role of microbial communities in soil ecosystems

Author: Karimi, Battle, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Terrat, Sébastien, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, ProdInra, Migration, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Université de Nantes (UN). FRA.
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Abstract: Soil ecosystem is one of major reservoirs of microbial diversity on our planet. Many biological processes and interactions take place in soil, contributing to a considerable number of ecosystem services. Recent methodological advances, e.g. high throughput sequencing, provide an extensive knowledge on soil microbial communities in terms of diversity and composition. Thanks to these technological advances, numerous studies have investigated the variation of diversity indices and taxonomic composition of microbial communities according to changes in environmental conditions. However, estimates of microbial diversity through diversity metrics calculation such as Shannon, richness, evenness indices, etc, or determination of taxonomic composition through analysis of high throughput sequencing datasets do not provide information about interactions between community members, despite the importance of these interactions for community activity. In this context, the analysis of biotic interactions between microbial taxa is emerging in the field of environmental microbiology. First developed for the study of interactions between macroorganisms, the so-called “network approach” appears as a highly promising tool to better decipher the key role of microbial communities in soil ecology. In this presentation, we evaluate the advantages and the drawbacks of co-occurrence network approach to apprehend the microbial community modifications in response to environmental changes. We highlight that the connectance and the average degree of networks vary from 10 to 150% in response to moderate or chronic perturbations when microbial diversity remains stable. More precisely, our presentation is based on several applications revealing the sensitivity of microbial networks and associated metrics to detect changes in microbial communities such as: - Studies on a wide spatial scale (French territory) that highlight the significant influence of the level of anthropization (i.e. land use of soils) on the complexity of microbial networks - Assessment of the temporal dynamic of microbial network consecutively to organic matter addition that highlight a resilience of the network properties after strong changes occurring during the first steps of decomposition - Determination of the link between network metrics and community activity in terms of soil organic matter decomposition Altogether, our results evidence that microbial co-occurrence networks are ecological, operational and integrative bioindicators of ecosystem quality and functioning.
Published: 2017

154. Validation d’un tableau de bord d’indicateurs sur un réseau national de fermes en grande culture et en viticulture pour diagnostiquer la qualité biologique des sols agricoles

Author: Cannavacciulo, M., Cassagne, N., Riou, V., Mulliez, P., Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Dequiedt, Samuel, Villenave, C., Cérémonie, H., Cluzeau, D., Cylly, D., Vian, J.F., Peigné, J., Gontier, L., Fourrié, L., Maron, Pierre-Alain, D’oiron Verame, E., Ranjard, Lionel, Unité LEVA, Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA), Chambre d'Agriculture du Maine et Loire (CA 49), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Elisol Environnement, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Supérieur d'Agriculture et d'Agroalimentaire Rhône-Alpes (ISARA), IFV Sud Ouest, Institut Français de la Vigne et du Vin (IFV), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Observatoire Français des Sols Vivants, Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (ISARA), Légumineuses, Ecophysiologie Végétale, Agroécologie (LEVA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (I.S.A.R.A.), Ecole Supérieure d'Agricultures d'Angers ( ESA d'Angers ), Chambre d'Agriculture du Maine et Loire ( CA 49 ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Supérieur d'Agriculture et d'Agroalimentaire Rhône-Alpes ( ISARA ), and Institut Technique de l'Agriculture Biologique ( ITAB )
Subjects: agroecology, diagnostic biologique, agricultural soil, training, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], biological diagnosis, [SDV]Life Sciences [q-bio], agroécologie, formation, sols agricoles
Abstract: Dans un contexte de transition agroécologique, le projet Agrinnov a permis de valider un tableau de bord d’indicateurs analytiques de la qualité biologique des sols agricoles permettant aux agriculteurs d’appréhender l’impact de leurs pratiques. Le projet AgrInnov a amené des chercheurs et des agriculteurs à collaborer. En parallèle du tableau de bord (comprenant des indicateurs de faune du sol, de microbiologie et agronomiques), des formations sur la biologie des sols ont été élaborées ainsi qu’un mode opératoire de transfert. Les formations et le tableau de bord ont été déployés sur un réseau national de plus de 250 fermes en grande culture et en viticulture. D’un point de vue scientifique, il a été démontré que moins de 10% des parcelles testées étaient dans un état critique en termes de biologie du sol ce qui est encourageant sur la qualité des sols agricoles, même si il faudrait développer leur surveillance sur un plus grand nombre de fermes et de systèmes de production afin d’avoir un diagnostic plus exhaustif et représentatif. D’un point de vue opérationnel, plus de 97% des agriculteurs ont suivi le projet jusqu’au bout avec un fort investissement de leur part. Par conséquent, le projet AgrInnov a fait la démonstration opérationnelle de l’application et de l’appropriation par les agriculteurs des nouveaux outils de diagnostic de la qualité des sols émanant directement de la recherche, Within a context of agroecological transition, the Agrinnov project validated a set of indicators of the biological quality of agricultural soils to enable farmers to grasp the impact of their practices. AgrInnov project brought researchers and farmers to work together. To accompany the set of indicators of soil fauna, microbiology and agronomy, training sessions on soil biology have also been implemented together with an appropriate transfer procedure. The training sessions and the set of indicators were spread on a national network of more than 250 field-crop and viticulture farms. From an operational viewpoint, more than 97% of the farmers invested heavily in the project and stayed involved throughout Cannavacciulo M. et al. 42 Innovations Agronomiques 55 (2017), 41-54 the project. From a scientific viewpoint, less than 10% of the tested plots were assessed to be in a critical state in terms of soil biology, which is encouraging on agricultural soil quality, even though the monitoring should be developed on a broader number of farms and production systems in order to have a more exhaustive and representative diagnosis. Thus the AgrInnov project demonstrated the application and adoption by the farmers of new research-based tools for diagnosing soil quality.
Published: 2017
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155. La microbiologie moléculaire au service du diagnostic environnemental

Author: Ranjard, Lionel, Maron, Pierre-Alain, CUNY, Philippe, d'Oiron Verame, Elisabeth, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Aix Marseille Université (AMU), Observatoire Français des Sols Vivants, ProdInra, Migration, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, atmosphère, sol, microorganisme, diagnostic environnemental, eau, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, déchet
Abstract: Ouvrage de vulgarisation professionnelle INRA EA BIOmE; National audience; Dans une société où il devient urgent de réduire l'empreinte environnementale des activités humaines, la première étape est de pouvoir faire un diagnostic de la qualité de notre environnement et des différentes matrices le constituant (eau, sol, atmosphère, déchets). Les microorganismes, de par leur petite taille, leur énorme diversité taxonomique et génétique, leur réactivité aux perturbations ainsi que par leur forte implication dans les cycles biogéochimiques gérant les flux de matière et d'énergie, sont des candidats incontournables pour élaborer ce diagnostic. Ceci est d'autant plus vrai que depuis une vingtaine d'années les fortes évolutions méthodologiques dans le domaine de la biologie moléculaire ont permis de sublimer les techniques d'étude de ces microorganismes dans l'environnement. Le présent ouvrage décrit : dans un premier chapitre les différentes techniques relevant de la microbiologie moléculaire capable de caractériser l'abondance, la diversité, l'activité et les potentialités fonctionnelles des communautés microbiennes indigènes de diverses matrices environnementales (eau, sol, atmosphère, déchets). Neuf fiches techniques viennent en appui de ce chapitre et expliquent l'intérêt et les limites des indicateurs qui en découlent ; le deuxième chapitre est constitué des fiches applications illustrant des utilisations réelles de ces techniques pour évaluer ou remédier à l'impact des activités humaines (agricoles, industrielles, urbaines) sur les différentes matrices environnementales ; le troisième chapitre présente le caractère opérationnel de ces outils biologiques pouvant répondre à diverses questions environnementales.
Published: 2017

156. Diagnostiquer l'état microbiologique des sols français, un nouveau moyen de révéler leur qualité

Author: Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Ducommun Christophe, Lucot Eric
Subjects: agronomie, sol, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], pédologie, cartographie, environnement
Abstract: EABIOME INRA; Diagnostiquer l'état microbiologique des sols français, un nouveau moyen de révéler leur qualité
Published: 2017

157. Connaitre et préserver la biodiversité

Author: Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Ducommun Christophe, Lucot Eric, and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC )
Subjects: agronomie, sol, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], pédologie, cartographie, environnement
Abstract: EABIOME INRA; Connaitre et préserver la biodiversité
Published: 2017

158. La biologie du sol au service des productions agricoles

Author: Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), ProdInra, Archive Ouverte, Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Muséum d'Histoire Naturelle de Bourges. FRA.
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmE; La biologie du sol au service des productions agricoles. Conférence au Museum d’Histoire Naturel de Bourges
Published: 2016

159. Monitoring complex bacterial communities using culture-independent molecular techniques: application to soil environment

Author: Ranjard, Lionel, Poly, Franck, and Nazaret, Sylvie
Published: 2000
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160. ReClustOR: a re‐clustering tool using an open‐reference method that improves operational taxonomic unit definition.

Author: Terrat, Sébastien, Djemiel, Christophe, Journay, Corentin, Karimi, Battle, Dequiedt, Samuel, Horrigue, Walid, Maron, Pierre‐Alain, Chemidlin Prévost‐Bouré, Nicolas, Ranjard, Lionel, and Gilbert, Tom M.
Subjects: DEFINITIONS, MICROBIAL diversity, NUCLEOTIDE sequence, GEOMETRIC congruences, CENTROID
Abstract: Copyright of Methods in Ecology & Evolution is the property of Wiley-Blackwell and its content may not be copied or emailed to multiple sites or posted to a listserv without the copyright holder's express written permission. However, users may print, download, or email articles for individual use. This abstract may be abridged. No warranty is given about the accuracy of the copy. Users should refer to the original published version of the material for the full abstract. (Copyright applies to all Abstracts.)
Published: 2020
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161. Landscape-scale analysis of cropping system effects on soil quality in a context of crop-livestock farming

Author: Viaud, Valérie, primary, Santillàn-Carvantes, Patricia, additional, Akkal-Corfini, Nouraya, additional, Le Guillou, Cédric, additional, Prévost-Bouré, Nicolas Chemidlin, additional, Ranjard, Lionel, additional, and Menasseri-Aubry, Safya, additional
Published: 2018
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162. Biogeography of soil bacteria and archaea across France

Author: Karimi, Battle, primary, Terrat, Sébastien, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Saby, Nicolas P. A., additional, Horrigue, Walid, additional, Lelièvre, Mélanie, additional, Nowak, Virginie, additional, Jolivet, Claudy, additional, Arrouays, Dominique, additional, Wincker, Patrick, additional, Cruaud, Corinne, additional, Bispo, Antonio, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Bouré, Nicolas Chemidlin Prévost, additional, and Ranjard, Lionel, additional
Published: 2018
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163. Tillage intensity and pasture in rotation effectively shape soil microbial communities at a landscape scale

Author: Le Guillou, Cédric, primary, Chemidlin Prévost‐Bouré, Nicolas, additional, Karimi, Battle, additional, Akkal‐Corfini, Nouraya, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Nowak, Virginie, additional, Terrat, Sébastien, additional, Menasseri‐Aubry, Safya, additional, Viaud, Valérie, additional, Maron, Pierre‐Alain, additional, and Ranjard, Lionel, additional
Published: 2018
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164. High Microbial Diversity Promotes Soil Ecosystem Functioning

Author: Maron, Pierre-Alain, primary, Sarr, Amadou, additional, Kaisermann, Aurore, additional, Lévêque, Jean, additional, Mathieu, Olivier, additional, Guigue, Julien, additional, Karimi, Battle, additional, Bernard, Laetitia, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Terrat, Sébastien, additional, Chabbi, Abad, additional, and Ranjard, Lionel, additional
Published: 2018
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165. Correction: Mapping and predictive variations of soil bacterial richness across France

Author: Terrat, Sébastien, primary, Horrigue, Walid, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Saby, Nicolas P. A., additional, Lelièvre, Mélanie, additional, Nowak, Virginie, additional, Tripied, Julie, additional, Régnier, Tiffanie, additional, Jolivet, Claudy, additional, Arrouays, Dominique, additional, Wincker, Patrick, additional, Cruaud, Corinne, additional, Karimi, Battle, additional, Bispo, Antonio, additional, Maron, Pierre Alain, additional, Prévost-Bouré, Nicolas Chemidlin, additional, and Ranjard, Lionel, additional
Published: 2017
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166. Biodiversité microbienne des sols : du territoire national aux agriculteurs

Author: Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Académie d'Agriculture de France (AAF). FRA., and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC )
Subjects: commission européenne, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], biodiversité du sol, [SDV]Life Sciences [q-bio], Global Soil Biodiversity Initiative, atlas, European Commission, GSBI, académie d'agriculture
Abstract: EABIOME; Biodiversité microbienne des sols : du territoire national aux agriculteurs My speech will focus on the development of a biogeographical approach to study the spatial distribution of soil microbial community in terms of abundance and diversity on the scale of France. We have reached this goal by the application of molecular tools based on soil DNA extraction and characterization on the 2200 soils of the French national monitoring network. This approach enabled us to draw the biogeographical patterns of molecular microbial biomass as well as bacterial community richness and evenness on the scale of France. By this way we have identified and rank the several ecological processes involved in community assembly as well as the different environmental drivers. In addition, we have also revisited the concept of taxa area relationship for microorganisms at this scale. The set of microbial data obtained from the RQMS survey enabled us to build up the first reference system of soil microbiology on a broad scale. My speech will end with the demonstration that these molecular microbial tools can be operational to diagnose soil quality in an agricultural network of 250 farms distributed across France. Presentation congrès : Les sols représentent l’épiderme vivant de la planète qui supporte la production d’aliments, de fibre et de bois, qui purifie l’eau et l’air, contribuant ainsi à la santé humaine. Les organismes du sol, allant des bactéries et protistes microscopiques aux vers de terre, coléoptères et taupes, remplissent des tâches essentielles, dans les écosystèmes naturels et anthropisés, qui rendent possible la vie sur Terre. Ces organismes représentent des acteurs-clé des transformations des nutriments et de leurs cycles ; ils impactent la décomposition et la dynamique de la matière organique dans les sols, le stockage du carbone dans le sols et l’émission de gaz à effet de serre ; les interactions symbiotiques des champignons mycorhiziens et des bactéries fixatrices d’azote avec les plantes promeuvent le niveau et l’efficacité de la nutrition des plantes ; les prédateurs et antagonistes des ravageurs et agents phytopathogènes assurent une protection biologique des plantes, certains organismes du sol sont de plus capables de stimuler les réactions de défense des plantes contre ces ravageurs et pathogènes, l’ensemble de ces interactions contribuant à la santé des plantes. Malheureusement, la remarquable biodiversité des sols est soumise à des pressions majeures du fait de la gestion parfois inappropriée des sols. En réponse aux challenges urgents associés à la gestion durable des sols et à la préservation de la vie dans ces sols, une action collective s’est mise en place. Elle mobilise des chercheurs dans des domaines variés et complémentaires. La publication du premier atlas mondial de la biodiversité des sols ‘Global Soil Biodiversity Atlas’ représente une première réalisation remarquable de cette action collective. Le ‘Global Soil Biodiversity Atlas’ paru en mai 2016 est le résultat d’un effort collaboratif entre le ‘Joint Research Centre’ de la Commission Européenne et l’initiative mondiale de biodiversité des sols ‘Global Soil Biodiversity Initiative’. Il présente pour la première fois une vue globale de la biodiversité des sols qu’ils soient soumis ou non à l’action humaine. L’Atlas représente un effort scientifique international majeur comprenant la contribution de plus de 120 experts issus de 26 pays différents. Les progrès rapides dans le développement de nouvelles technologies d’analyse du vivant, en particulier dans le domaine de la biologie moléculaire, mais également les nouvelles technologies de l’information et de la communication ont facilité l’effort collectif qui a conduit à la réalisation du ‘Global Soil Biodiversity Atlas’. Cependant, cet Atlas serait resté incomplet sans l’apport de collaborations globales qui ont permis l’émergence de nouvelles synthèses et analyses de l’importance des organismes du sol à la surface du globe. Les huit chapitres de l’Atlas couvrent tous les aspects de la biodiversité des sols, allant de la taxonomie, la distribution géographique, les services écosystémiques, les menaces, les interventions et politique de gestion des sols en relation avec la biodiversité. L’ouvrage a été conçu pour s’adresser à un large public, aux politiciens mais également aux chercheurs et techniciens. Plus de 800 images, plus de 50 cartes et des centaines d’encadrés conduisent le lecteur au travers un voyage fantastique au coeur de la vie des sols. Cet Atlas a pour ambition de contribuer à rendre chacun et chacune conscient de l’importance et de la beauté de organismes vivants dans le sol et d’attirer l’attention et le respect qu’ils méritent. Ce symposium a pour objectif le lancement en France du ‘Global Soil Biodiversity Atlas’. Cela représente une occasion unique de présenter des initiatives européenne et mondiale relatives à la biodiversité des sols et d’illustrer les avancées de connaissances, de stratégies d’études et de gestion durable des sols en relation avec leur biodiversité dans des environnements variés par des experts européens et mondiaux, dont certains ont contribué à l’Atlas. Titre en anglais : Launch in France of the Global Soil Biodiversity Atlas
Published: 2016

167. Conférence de clôture du colloque Qualimed « la qualité des sols »

Author: Ranjard , Lionel, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Pôle de compétitivité Qualiméditerranée., ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC )
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmE; Conférence de clôture du colloque Qualimed « la qualité des sols ». Rencontres qualimÉditerranÉe 2016 - Agriculture 2025 : l'essentiel de l'innovation sur la qualité des sols
Published: 2016

168. Inventaire et cartographie des communautés microbiennes des sols de la zone OPE ANDRA

Author: Dequiedt, Samuel, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Observatoire Pérenne de l'Environnement (OPE). FRA.
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Abstract: L’Observatoire pérenne de l’environnement (OPE) de l’Andra a mis en œuvre depuis 2007 un réseau d’inventaires et d’observations à long terme des différents milieux de l’environnement sur un territoire de 240 km2 dans les départements de Meuse et de Haute-Marne. Un réseau de suivi de la qualité des sols a ainsi été mis en place selon un maillage systématique, conduit à l’échelle du paysage sur une grille de 1,5 km x 1,5 km, en suivant le protocole national d’échantillonnage et d’analyse du Réseau de Mesures de la Qualité des Sols (RMQS). L’objectif du réseau de suivi de la qualité des sols de l’OPE est d’établir un état de référence consistant à caractériser les sols en termes pédologique, physico-chimique et biologique, de cartographier ces propriétés et d’identifier les déterminants des structures spatiales observées, d’organiser le suivi de ces paramètres à long terme et de prévoir des évolutions possibles face à différents scénario. Pour établir l’état de référence, des observations et des prélèvements d’échantillons ont été effectués entre 2009 et 2012 sur un total de 127 sites dont 57 disposaient d’une fosse pédologique, selon les modes opératoires du RMQS. Les échantillons de sols ont été préparés par le Conservatoire européen d’échantillons de sols de l’INRA d’Orléans puis analysés par le Laboratoire d’analyses de sols de l’INRA d’Arras (propriétés physico-chimiques : texture, carbone, pH, calcaire, azote, CEC, phosphore assimilable, cations échangeables et éléments majeurs totaux) et la plateforme Génosol de l’INRA de Dijon (structure des communautés microbiennes). Toutes les données environnementales et pédologiques ont été rassemblées et harmonisées dans un entrepôt de données spatialisées afin d’être rendues interopérables et documentées. Afin de comprendre la distribution spatiale de la diversité pédologique et des micro-organismes telluriques à l’échelle du paysage (et les facteurs qui la pilotent) des méthodes de cartographie numérique ont été mises en œuvre. Des analyses en composantes principales (ACP) sous contraintes spatiales ont été couplées à des méthodes de fouille de données et de géostatistiques (krigeage universel). Les ACP ont été réalisées sur trois matrices différentes regroupant respectivement les données pédologiques, les communautés bactériennes et les communautés fongiques toutes deux caractérisées par les empreintes moléculaires issues des analyses de type ARISA. Les trois premiers axes des ACP ont été mis en relation avec des covariables dont la couverture spatiale est exhaustive sur la zone d’étude. Malgré une relative homogénéité, les propriétés physico-chimiques des sols se distribuent selon la nature géologique et pédologique de la zone ainsi que selon la géomorphologie du paysage (MNA et ses dérivées) et l’occupation du sol. La structure génétique des communautés bactériennes et fongiques présente des structures spatiales moyennement marquées à l’échelle du paysage, qui s’organisent selon des structures hydrologiques (fond de vallon, distance au plus proche court d’eau), la morphologie du relief (rugosité des pentes) et l’occupation du sol. Ces résultats confirment qu’il est possible d’identifier et de hiérarchiser les filtres environnementaux qui pilotent les diversités pédologique et biologique à l’échelle d’un paysage.
Published: 2016

169. Contrasting Spatial Patterns and Ecological Attributes of Soil Bacterial Taxa across French National Territory

Author: Karimi, Battle, Terrat, Sébastien, Dequiedt, Samuel, Saby, Nicolas, Horrigue, Walid, Lelievre, Mélanie, Nowak, Virginie, Jolivet, Claudy, Arrouays, Dominique, Wincker, Patrick, Cruaud, Corinne, Bispo, Antonio, Maron, Pierre-Alain, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Unité INFOSOL (ORLEANS INFOSOL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Service Agriculture et Forêt, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, InfoSol (InfoSol), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Société Française d'Ecologie (SFE). FRA., Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, AnaEE Analyses et Expérimentations sur les Ecosystèmes - France., Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Unité INFOSOL ( ORLEANS INFOSOL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de Génomique, Centre National de Séquençage (Genoscope) ( CNS ), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Institut de Génomique - Génoscope, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], ecological attributes, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], territory scale, [SDV]Life Sciences [q-bio], bacterial taxa, biogeography
Abstract: EA SPE BIOME GENOSOL UB UB Agrosup EA SPE BIOME GENOSOL UB UB AgrosupEASPEBIOMEGENOSOLUB UB Agrosup; Even though recent studies have clarified the influence of environmental filters on bacterial community diversity, those constraining bacterial populations variations remain unclear. In consequence, our ability to understand the ecological attributes of soil bacteria and to predict microbial community response to environmental stress is therefore limited. Here, we characterized the bacterial community composition and the various bacterial taxonomic groups constituting the community across the French country, by using a 16x16 km systematic grid representing 1825 sites to precisely decipher their spatial distribution and drivers at this scale. The bacterial and archaeal community composition was characterized by applying 16S rRNA gene pyrosequencing directly to soil DNA from samples. Geostatistics tools were used to identify the distribution patterns of bacterial composition at the national scale. Analysis of variance was used to estimate the amount of variation explained by soil parameters and land management for each bacterial taxa in order to determine the major processes shaping bacterial populations and community composition. This study could provide valuable clues about the ecological behavior of soil bacterial and archaeal taxa at a wide scale and could be useful for developing sustainable strategies of land management.
Published: 2016

170. Predictive models of abundance and diversity of soil microbial communities

Author: Horrigue, Walid, Ranjard, Lionel, Maron, Pierre-Alain, Dequiedt, Samuel, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Arrouays, Dominique, Bispo, Antonio, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, InfoSol (InfoSol), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service Agriculture et Forêt, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), ISME., and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2016

171. Intérêt de la biologie des sols pour les productions agricoles : de la recherche aux agriculteurs

Author: Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Earth and Life Institute. BEL., Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmE; Intérêt de la biologie des sols pour les productions agricoles : de la recherche aux agriculteurs. 13. Journées d'Etude des Sols - Sol et Changement Global
Published: 2016

172. Les analyses microbiologiques des sols du RMQS

Author: Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmE; Les analyses microbiologiques des sols du RMQS. Journées officielles de lancement du RMQS 2, Réseau de Mesures de la Qualité des Sols.
Published: 2016

173. Un ensemble coordonné de plateformes ouvertes la recherche internationale en écotoxicologie : Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes – France

Author: Mougin, Christian, Azam, Didier, Caquet, Thierry, Cheviron, Nathalie, Dequiedt, Samuel, Le Galliard, Jean-François, Guillaume, Olivier, Houot, Sabine, Lacroix, Gérard, Lafolie, Francois, Maron, Pierre-Alain, Michniewicz, Radika, Pichot, Christian, Ranjard, Lionel, Roy, Jacques, Zeller, Bernhard, Clobert, Jean, Chanzy, Andre, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques (UEEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (DEPT EFPA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Écotron Européen de Montpellier, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions Sol Plante Atmosphère (UMR ISPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Station d'écologie théorique et expérimentale (SETE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatiques ( UEEA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques ( DEPT EFPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Interactions plantes-microorganismes et santé végétale, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales ( UMR AGAP ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris ( IEES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes ( EMMAH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ), Ecologie des Forêts Méditerranéennes ( URFM 629 ), UPS 3248, Écotron Européen de Montpellier - Baillarguet, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Interactions Sol Plante Atmosphère ( ISPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine ( Bordeaux Sciences Agro ), CNRS, Centre National de la Recherche Scientifique - MNHN - CNRS - USR 2936, Station d’Ecologie Expérimentale, Moulis, France, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Ecologie des Forêts Méditerranéennes [Avignon] (URFM 629), Écotron Européen de Montpellier - UPS 3248, Interactions Sol Plante Atmosphère (ISPA), Station d’Ecologie Expérimentale du CNRS à Moulis (SEEM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Un ensemble coordonné de plateformes ouvertes la recherche internationale en écotoxicologie : Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes – France. Colloque « Construire le réseau ANTIOPES 2.0 - La toxicologie et l’écotoxicologie prédictives : de l’appliqué à l’opérationnel »
Published: 2016

174. Bacterial 'social' network in french soils : a Metagenomics insight

Author: Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Société Française d'Ecologie (SFE). FRA., Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmEAGROSUPINRA; Bacterial "social" network in french soils : a Metagenomics insight. Sfécologie-2016, International Conference of Ecological Sciences
Published: 2016

175. Biologie du sol : comment la diagnostiquer et la piloter en agriculture

Author: Bispo, Antonio, Ranjard, Lionel, Service Agriculture et Forêt, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA., Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmE; Biologie du sol : comment la diagnostiquer et la piloter en agriculture . Rencontre Agroécologie, Salon International de l’Agriculture SIA 2016
Published: 2016

176. Qualité microbiologique des sols et services rendus

Author: Ranjard, Lionel, ProdInra, Archive Ouverte, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Jardin des Plantes de Nantes. FRA., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmE; Qualité microbiologique des sols et services rendus. Conférence au Jardin des plantes de Nantes
Published: 2016

177. Le projet AgrInnov : développer des indicateurs de qualité biologique des sols

Author: Vian, Jean-François, d’Oiron-Verame, Elisabeth, Ranjard, Lionel, ProdInra, Archive Ouverte, Institut Supérieur d'Agriculture et d'Agroalimentaire Rhône-Alpes ( ISARA ), Observatoire Français des Sols Vivants, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Institut Supérieur d'Agriculture et d'Agroalimentaire Rhône-Alpes (ISARA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut supérieur d'agriculture et d'agroalimentaire Rhône-Alpes (ISARA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Société Suisse de Pédologie.
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmE; Le projet AgrInnov : développer des indicateurs de qualité biologique des sols. Congrès annuel de la Société Suisse de Pédologie
Published: 2016

178. Global Soil Biodiversity Atlas

Author: Blaud, Aimeric, Vizzini, Alfredo, Quadros, Aline, Bastos, Ana, Bissett, Andrew, Young, Andrew, Zaitsev, Andrey S., Murray, Andy, Yin Yee Kong, Angela, Fitzgerald, Anna, Zangerlé, Anne, Adams, Byron J., MacDonald, Catriona, Gardi, Ciro, Menta, Cristina, Bagyaraj, Davis Joseph, Renard, Delphine, Abalos, Diego, Mckey, Doyle, Velasquez, Elena, Silva, Elisangela A., Doblas-Miranda, Enrique, Blanchart, Eric, Lumini, Erica, Barreno, Eva, Sillo, Fabiano, Vaz-de-Mello, Fernando Z., Bampa, Francesca, Buscot, Francois, Verheijen, Frank G. A., Janssen, Frans, Wallender, Håkan, Segers, Hendrik, Okada, Hiroaki, Barois Boullard, Isabelle, Tuf, Ivan H., Bloem, Jaap, Keizer, Jan Jacob, Belnap, Jayne, Mathieu, Jérôme, Tondoh, Jerome E., Jiménez, Juan J., Louzada, Júlio, Zhang, Junling, Cares, Juvenil Enrique, Totsche, Kai Uwe, Ritz, Karl, Purdy, Kevin, Küsel, Kirsten, Gongalsky, Konstantin, Ranjard, Lionel, Galli, Loris, Giordano, Luana, Seldin, Lucy, Schrama, Maarten, Girlanda, Mariangela, Dunbar, Martha B., Zimmer, Martin, Nagano, Masahiro, Dita, Miguel, Pulleman, Mirjam, Pauli, Natasha, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Carrera, Noela, Trivedi, Pankaj, Gonthier, Paul, Mele, Pauline, Mortimer, Peter, Andrés, Pilar, Creamer, Rachel, Guicharnaud, Rannveig Anna, Constantino, Reginaldo, Dick, Richard, Griffiths, Robert I., van Klink, Roel, Zanetti, Ronald, Schmelz, Rüdiger, Dequiedt, Samuel, Emery, Sarah, Ohdachi, Satoshi, Shimano, Satoshi, Karasawa, Shigeori, Yu, Shixiao, Stürmer, Sidney L., Adl, Sina, Konaté, Souleymane, Banwart, Steven, Fonte, Steven J., Trumbore, Susan, Loureiro, Susana, Komatsu, Takashi, Tsunoda, Tomonori, Nielsen, Uffe N., Bianciotto, Valeria, Orgiazzi, Alberto, Bardgett, Richard, Barrios, Edmundo, Behan-Pelletier, Valerie, Briones, Maria J. I., Chotte, Jean-Luc, De Deyn, Gerlinde B., Eggleton, Paul, Fierer, Noah, Fraser, Tandra, Hedlund, Katarina, Jeffery, Simon, Johnson, Nancy, Jones, Arwyn, Kandeler, Ellen, Kaneko, Nobuhiro, Lavelle, Patrick, Lemanceau, Philippe, Miko, Ladislav, Moreira, Fatima M. S., Ramirez, Kelly S., Scheu, Stefan, Singh, Brajesh, Six, Johan, van der Putten, Wim, Wall, Diana, University of Sheffield, Universita di Torino, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), CESAM, Universidade de Aveiro, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation [Canberra] (CSIRO), Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), Independent, Columbia University [New York], Bioplatforms Australia, Partenaires INRAE, Technical University Braunschweig, Brigham Young University (BYU), Western Sydney University, European Food Safety Authority (EFSA), University of Parma = Università degli studi di Parma [Parme, Italie], Centre for Natural Biological Resources and Community Development, McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], University of Guelph, Université de Montpellier (UM), National University of Colombia, Federal University of Rondônia, Centre for Ecological Research and Forestry Applications (CREAF), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Universitat de València (UV), Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT), Teagasc Agriculture and Food Development Authority (Teagasc), Helmholtz Zentrum für Umweltforschung = Helmholtz Centre for Environmental Research (UFZ), University of Antwerp (UA), Lund University [Lund], Royal Belgian Institute of Natural Sciences (RBINS), National Institute of Agro-Environmental Sciences (NIAES), Inecol : Instituto de Ecologia A.C., Palacky University Olomouc, Alterra Green World Research (ALTERRA), Wageningen University and Research Centre (WUR), United States Geological Survey (USGS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), World Agroforestry Centre, Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Universidade Federal de Lavras (UFLA), China Agricultural University (CAU), Universidade de Brasília (UnB), Friedrich-Schiller-Universität = Friedrich Schiller University Jena [Jena, Germany], University of Nottingham, UK (UON), University of Warwick, German Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv), A.N. Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, University of Genoa (UNIGE), Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), University of Manchester [Manchester], Joint Research Centre of the European Commission, Leibniz Center for Tropical Marine Ecology, Oita University, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento [Brasil] (MAPA), Governo do Brasil-Governo do Brasil, International Center for Tropical Agriculture [Colombie] (CIAT), Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR), University of Western Australia, Universidade de Vigo, Department of Economic Development, Jobs, Transport and Resources (DEDJTR), La Trobe University, Ohio State University [Columbus] (OSU), Natural Environment Research Council (NERC), Czech Academy of Sciences [Prague] (CAS), ECT Oekotoxikologie GmbH, University of Louisville, Hokkaido University [Sapporo, Japan], Hosei University [Chiyoda], Fukuoka University, Sun Yat-Sen University [Guangzhou] (SYSU), Universidade Regional de Blumenau (FURB), University of Saskatchewan, Université Nangui Abrogoua, Colorado State University [Fort Collins] (CSU), Max-Planck-Institut, Kyushu University, Yokohama National University, European Commission's Joint Research Centre, Agriculture and Agri-Food [Ottawa] (AAFC), ProdInra, Migration, Universidade Federal do Rio Grande do Sul [Porto Alegre] (UFRGS), Technische Universität Braunschweig = Technical University of Braunschweig [Braunschweig], Università degli studi di Parma = University of Parma (UNIPR), National Research Council of Italy | Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Universidade Federal de Lavras = Federal University of Lavras (UFLA), University of Warwick [Coventry], Università degli studi di Genova = University of Genoa (UniGe), The University of Western Australia (UWA), Hosei University, University of Saskatchewan [Saskatoon] (U of S), Université Nangui Abrogoua (UNA), and Agriculture and Agri-Food (AAFC)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, Centre Commun de Recherche, [SDV]Life Sciences [q-bio], JRC, [SDE]Environmental Sciences, Global Soil Biodiversity Initiative, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, European Commission, CCR, GSBI
Abstract: SPE EA Pôle BIOME The Atlas is divided in 8 chapters covering all the aspects of soil biodiversity: - Chapter I: The soil habitat - Chapter II: Diversity of soil organisms - Chapter III: Geographical and temporal distribution - Chapter IV: Ecosystem functions and services - Chapter V: Threats - Chapter VI: Interventions - Chapter VII: Policy, education and outreach - Chapter VIII: Conclusions Soil biodiversity experts from all over the world are involved in the project aiming at the creation of a reference publication not only for soil biodiversity researchers but also policy makers and general public.; International audience; The Global Soil Biodiversity Initiative (GSBI) and the Joint Research Centre (JRC) of European Commission announce the writing of the Global Soil Biodiversity Atlas (GSBA) in the frame of the Global Soil Biodiversity Assessment. The Atlas is a series of amazing photos, maps, charts, statistics, and shared information that scientists, educators, policy makers, and non-specialists alike can use as a toolkit for knowing and understanding soil biodiversity globally.
Published: 2016

179. La microbiologie moléculaire au service du diagnostic environnemental. Synthèse de Recherche. Contrat n°1406C0050. Projet de recherche coordonné par : 'Observatoire des sols vivants'

Author: Bouchez , Théodore, Blieux , Anne Laure, Dequiedt , Samuel, Domaizon , Isabelle, Dufresne , Alexis, Ferreira , Stéphanie, Godon , Jean-Jacques, Hellal , Jennifer, Joulian , Catherine, Quaiser , Achim, Martin , Fabrice, Mauffret , Aourell, Monier , Jean Marie, Peyret , Pierre, Schmitt-Koplin , Philippe, Sibourg , Olivier, d’Oiron Verame , Elisabeth, Bispo , Antonio, Deportes , Isabelle, Grand , Cécile, Cuny , Philippe, Maron , Pierre-Alain, Ranjard , Lionel, Hydrosystèmes et bioprocédés (UR HBAN), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Welience AgroEnvironnement, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genoscreen, Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM), ENOVEO, EA CIDAM, Université Clermont Auvergne (UCA), CRBV, Helmholtz-Zentrum München (HZM), Observatoire Français des Sols Vivants, Unité INFOSOL (ORLEANS INFOSOL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Institut Pythéas (OSU PYTHEAS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), OCEAMED, n° 1406C0050, Hydrosystèmes et Bioprocédés (UR HBAN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Conception, Ingénierie et Développement de l'Aliment et du Médicament (CIDAM), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), InfoSol (InfoSol), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Helmholtz Zentrum München = German Research Center for Environmental Health, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hydrosystèmes et bioprocédés ( UR HBAN ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] ( LBE ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) ( BRGM ), Université Clermont Auvergne ( UCA ), Helmholtz-Zentrum München ( HZM ), Unité INFOSOL ( ORLEANS INFOSOL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Institut Pythéas ( OSU PYTHEAS ), and Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EABIOmEINRA; National audience; L'étude a pour objectif de décrire les différentes techniques relevant de la microbiologie moléculaire en termes d'état d'avancement, de limites techniques et de sensibilité pour étudier l'abondance, la diversité, l'activité et les potentialités fonctionnelles des communautés microbiennes indigènes de diverses matrices environnementales (eau, sol, air, substrats déchets). On trouve dans l'étude neuf fiches de présentation des méthodes, puis vingt-neuf fiches d'application sur les milieux/substrats eau, sol, air et déchets. Des indicateurs de microbiologie moléculaire permettant un diagnostic environnemental ont été recherchés. Une trentaine d'entreprise qui les propose en routine sont données dans le rapport. Ces indicateurs microbiens sont opérationnels pour des prestations de diagnostic de la qualité de différentes matrices environnementales par différents types d'opérateurs (agriculteurs, industriels, gestionnaires de déchets, aménageurs du territoire)
Published: 2016

180. Mapping and predictive variations of soil bacterial richness across France

Author: Terrat, Sébastien, primary, Horrigue, Walid, additional, Dequietd, Samuel, additional, Saby, Nicolas P. A., additional, Lelièvre, Mélanie, additional, Nowak, Virginie, additional, Tripied, Julie, additional, Régnier, Tiffanie, additional, Jolivet, Claudy, additional, Arrouays, Dominique, additional, Wincker, Patrick, additional, Cruaud, Corinne, additional, Karimi, Battle, additional, Bispo, Antonio, additional, Maron, Pierre Alain, additional, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, additional, and Ranjard, Lionel, additional
Published: 2017
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181. Soil microbial diversity drives the priming effect along climate gradients: a case study in Madagascar

Author: Razanamalala, Kanto, primary, Razafimbelo, Tantely, additional, Maron, Pierre-Alain, additional, Ranjard, Lionel, additional, Chemidlin, Nicolas, additional, Lelièvre, Mélanie, additional, Dequiedt, Samuel, additional, Ramaroson, Volaniaina H, additional, Marsden, Claire, additional, Becquer, Thierry, additional, Trap, Jean, additional, Blanchart, Eric, additional, and Bernard, Laetitia, additional
Published: 2017
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182. AgrInnov, vers un premier tableau de bord d’indicateurs de la qualité biologique des sols agricoles et leur durabilité

Author: Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and COFIMER.
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Published: 2015

183. Le projet AgrInnov : Bilan d'un projet opérationnel sur la biologie des sols pour et par les agriculteurs

Author: Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EAECOLDUR; Le projet AgrInnov : Bilan d'un projet opérationnel sur la biologie des sols pour et par les agriculteurs. 1. édition Colloque OFSV. Journées Nationales de l'Innovation Agricole (JIAG 2015)
Published: 2015

184. Metabiobiote

Author: Adele Dit De Renseville, Nathalie, Nguyen, Do Ngoc Linh, Vandenborght, Louise-Eva, Terrat, Sébastien, Gantois, Nausicaa, Ranjard, Lionel, Delhaes, Laurence, Ferreira, Stephanie, Thumerelle, C, Wizla, N, Tuck, D, Cassaing, Sophie, Fillaux, Judith, Brémont, F, Murris, M, Genoscreen [Lille], Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur de Lille, GenoSol (plateforme de l'université de Bourgogne), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU LIlle], Institut de Microbiologie [CHRU Lille], Pôle de Biologie Pathologie Génétique [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Pôle de Biologie Pathologie Génétique [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2015

185. Réhabilitation du patrimoine microbien par implantation de Miscanthus x giganteus dans des sols pollués

Author: Bourgeois, Emilie, Dequiedt, Samuel, Lelievre, Mélanie, Van Oort, Folkert, Lamy, Isabelle, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA.
Subjects: diversité microbienne, sol pollué, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, Miscanthus x giganteus, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Abstract: National audience; La forte industrialisation des sociétés (mines métallifères, industries métallurgiques, utilisation d'engrais et d’amendements, dispersion des eaux usées) a conduit à l'introduction généralisée d’éléments traces métalliques (ETM) dans notre environnement, provoquant la contamination aiguë et diffuse des sols, les rendant inutilisables pour la production agricole. Une approche permettant leur ré-exploitation consiste à implanter des cultures à vocation énergétique telles que le Miscanthus x giganteus (MxG), une plante en C4 servant à produire du bioéthanol et des pellets pour chaudières à granulés. Au delà du potentiel économique de cette pratique, il est toutefois important de déterminer si la culture de MxG permet également une amélioration de la qualité des propriétés biologiques du sol, et donc une réhabilitation « écologique » de ces sols pollués. L’objectif de cette étude a été d’évaluer l’impact de la plantation de MxG sur les propriétés biologiques, et plus précisément microbiologiques du sol. Pour cela, le travail s’est appuyé sur un essai mis en place sur le site de Pierrelaye-Bessancourt dont la zone agricole a été irriguée pendant plus de cent ans par des eaux usées non traitées. L’effet du MxG sur les communautés microbiennes du sol a été évalué par la caractérisation de l’abondance et la diversité des communautés (bactéries et champignons) par des outils moléculaires (extraction de l’ADN du sol, estimation de la biomasse moléculaire et séquençage massif des gènes ribosomiques). L’impact de la culture de MxG a été testé (a) par comparaison des propriétés microbiennes du sol entre une parcelle labourée avec rotation de cultures et une parcelle sur laquelle du Miscanthus x giganteus était implanté depuis quatre ans, et (b) par une comparaison de l’évolution, sur deux ans suivant l’implantation de MxG, de l’abondance et de la diversité des communautés de bactéries et de champignons. Nos résultats montrent qu’il n’y a pas de différence significative d’abondance microbienne sous MxG ou sous culture avec labour, ni même lors de l’étude de l’évolution des communautés en zone irriguée et non-irriguée. Cependant la culture bioénergétique de MxG entraine une modification de la composition taxonomique des communautés de bactéries et de champignons, favorisant le développement de populations symbiotiques par rapport à la culture conventionnelle avec labour. Le suivi de la dynamique des communautés microbiennes telluriques suite à l’implantation du MxG a permis de mettre en évidence une réponse importante de la diversité des communautés de bactéries et de champignons après deux ans d’implantation du MxG. La dynamique de réponse et l’identité des populations stimulées par l’implantation de MxG indiquent que cette culture pourrait permettre une réhabilitation du patrimoine microbien de ces sols pollués.
Published: 2015

186. Journées Nationales de l'Innovation Agricole (JIAG 2015) 1ère édition colloque OFSV, Angers, France, 2-3 novembre 2015

Author: Ranjard, Lionel, Dequiedt, Samuel, Maron, Pierre-Alain, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, ProdInra, Migration, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Observatoire Français des Sols Vivants (OFSV). FRA.
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Published: 2015

187. Journées Nationales de l'Innovation Agricole (JIAG 2015) 1ère édition colloque OFSV, Angers, France, 2-3 novembre 2015

Author: Reverdy, Sylvie, Ranjard, Lionel, d’Oiron Verame, Elisabeth, Lorido, Evelyne, Angers Expo Congrès, Partenaires INRAE, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Observatoire Français des Sols Vivants, and Observatoire Français des Sols Vivants (OFSV). FRA.
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Published: 2015

188. Meta-barcoded evaluation of the ISO standard 11063 DNA extraction procedure to characterize soil bacterial and fungal community diversity and composition

Author: Ferreira, Stéphanie, Dequiedt, Samuel, Adele Dit De Renseville, Nathalie, Lemanceau, Philippe, Bispo, Antonio, Chabbi, Abad, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, Terrat, Sébastien, Plassart, Pierre, and Bourgeois, Emilie
Subjects: bactérie du sol, microbiologie du sol, norme iso, extraction adn, champignon du sol, échantillon de sol, Sciences agricoles, Agricultural sciences
Abstract: This study was designed to assess the influence of three soil DNA extraction procedures, namely the International Organization for Standardization (ISO-11063, GnS-GII and modified ISO procedure (ISOm), on the taxonomic diversity and composition of soil bacterial and fungal communities. The efficacy of each soil DNA extraction method was assessed on five soils, differing in their physico-chemical characteristics and land use. A meta-barcoded pyrosequencing approach targeting 16S and 18S rRNA genes was applied to characterize soil microbial communities. We first observed that the GnS-GII introduced some heterogeneity in bacterial composition between replicates. Then, although no major difference was observed between extraction procedures for soil bacterial diversity, we saw that the number of fungal genera could be underestimated by the ISO-11063. In particular, this procedure underestimated the detection in several soils of the genera Cryptococcus, Pseudallescheria, Hypocrea and Plectosphaerella, which are of ecological interest. Based on these results, we recommend using the ISOm method for studies focusing on both the bacterial and fungal communities. Indeed, the ISOm procedure provides a better evaluation of bacterial and fungal communities and is limited to the modification of the mechanical lysis step of the existing ISO-11063 standard.
Published: 2015

189. Meta-barcoded evaluation of the ISO standard 11063 DNA extraction procedure to characterize soil bacterial and fungal community diversity and composition

Author: Terrat, Sébastien, Plassart, Pierre, Bourgeois, Emilie, Ferreira, Stéphanie, Dequiedt, Samuel, Adele Dit de Renseville, Nathalie, Lemanceau, Philippe, Bispo, Antonio, Chabbi, Abad, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Equipe R&D Santé-Environnement, GenoScreen, Equie R&D Santé-Environnement, Agriculture et Forêt, Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR-11-INBS-0001, and European Project: 264465
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: This study was designed to assess the influence of three soil DNA extraction procedures, namely the International Organization for Standardization (ISO-11063, GnS-GII and modified ISO procedure (ISOm), on the taxonomic diversity and composition of soil bacterial and fungal communities. The efficacy of each soil DNA extraction method was assessed on five soils, differing in their physico-chemical characteristics and land use. A meta-barcoded pyrosequencing approach targeting 16S and 18S rRNA genes was applied to characterize soil microbial communities. We first observed that the GnS-GII introduced some heterogeneity in bacterial composition between replicates. Then, although no major difference was observed between extraction procedures for soil bacterial diversity, we saw that the number of fungal genera could be underestimated by the ISO-11063. In particular, this procedure underestimated the detection in several soils of the genera Cryptococcus, Pseudallescheria, Hypocrea and Plectosphaerella, which are of ecological interest. Based on these results, we recommend using the ISOm method for studies focusing on both the bacterial and fungal communities. Indeed, the ISOm procedure provides a better evaluation of bacterial and fungal communities and is limited to the modification of the mechanical lysis step of the existing ISO-11063 standard.
Published: 2015
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190. Microbial communities and nematode populations associated to rubber tree plantations along a chronosequence in North East Thailand

Author: Herrmann, Laetitia, Bräu, Lambert, Nowak, Virginie, Öpik, Maarja, Ranjard, Lionel, Robain, Henri, Robin, Agnès, Wiriyakitnateekul, Wanpen, and Lesueur, Didier
Subjects: F01 - Culture des plantes, P35 - Fertilité du sol, P34 - Biologie du sol, complex mixtures, K10 - Production forestière
Abstract: Rubber tree (Hevea brasiliensis) is a crop of major socio-economic importance in Southern Asia as it represents a substantial source of income for small landholders. In Thailand (1/3 of world latex production) rubber tree plantations are currently greatly expanding in adverse eco-climatic zones, especially in Isan provinces (North East Thailand), where soils have sandy texture, low fertility and are prone to erosion and leaching of applied fertilizers. A major potential for increased production in these conditions relies on the important roles of rhizosphere microbial communities in supporting soil fertility and plant nutrition. A chronosequence of 3, 6 and 16 year-old plantations was identified and cassava fields were used as no-rubber controls for comparison. Soils from each treatment were characterized for texture and chemistry. Using 454 sequencing, total bacterial and fungal communities as well as Arbuscular Mycorrhizal Fungi (AMF) community were analyzed. Because they are known to contribute to plant P and N nutrition by increasing mineral nutrient availability or by enhancing plant nutrient uptake, root-interacting P-solubilizing bacteria (PSB) and free-living N fixing bacteria were assessed after culturing on selective media. Nematodes populations were characterized, as there are good soil fertility indicators. Functional traits were also analyzed by both qPCR and Ecoplates (Biolog) methods. Results showed significant differences between rubber and cassava associated communities but didn't reveal a strong impact of the age of the plantations on the different communities. For instance, the AMF community in cassava roots was twice as rich as in rubber tree samples but was not affected by the age of rubber trees. Concerning nematodes, their total populations decreased with the age of the plantations, and are significantly higher in the cassava fields than in the rubber plantations. The indices suggest a progressive lost of the soil fertility with the age of the plantations. To conclude, the improved understanding of the diversity of root-associated microbes and the soil nematodes will contribute to the development of alternative sustainable practices to improve and sustain soil fertility in perennial plant plantations such as rubber plantations. (Texte intégral)
Published: 2015

191. Freshwater bacteria can methylate selenium through the thiopurine methyltransferase pathway

Author: Ranjard, Lionel, Nazaret, Sylvie, and Cournoyer, Benoit
Subjects: Bacteria -- Physiological aspects, Methylation -- Genetic aspects, Methylation -- Physiological aspects, Selenium -- Physiological aspects, Biological sciences
Abstract: Results shows that an aquifer uncontaminated with selenium exhibits emission of methylated selenium derivatives following spiking with selenite or (methyl)seleno cysteine. Sequence analysis of the thiopurine methyltransferase gene (tpm) in bacterial heterotrophs, growing on selenate and selenite, indicate that it shows similarity to other bacterial, viral, rat and human thiopurine methyltransferase sequences by 52 to 71%.
Published: 2003

192. Predictive models of abundance and diversity of soil microbial communities

Author: Horrigue, Walid, Dequiedt, Samuel, Chemidlin Prévost Bouré, Nicolas, Maron, Pierre-Alain, Constancias, Florentin, Arrouays, Dominique, Jolivet, Claudy, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, InfoSol (InfoSol), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA.
Subjects: natural ranges of variation, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, soil microbial communities abundance, soil microbial diversity, predictive models, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, complex mixtures
Abstract: National audience; Soil over-exploitation for the development of intensive agriculture and industrialization has led to a significant erosion of biodiversity. Given the importance of soil biota for the delivery of many of the ecosystemic services, it becomes crucial to provide indicators and standards to soil users allowing them assessing soil biological quality and quantifying the impact of human activities. Among soil organisms, microorganisms (bacteria and fungi) are the most important in terms of density (106-109 individuals/g soil), diversity (103-106 species/g soil), and involvement in soil functioning. Consequently, the biological status of the soil depends closely on the properties of the indigenous microbial communities. Microbial indicators (density, diversity, activity) have been developed and standardized from the research conducted in environmental microbiology and they must now be transferred and made operational. To date, one missing step to develop soil biological diagnostic is the establishment of the standards needed for the robust interpretation of these bioindicators. With this goal, we developed a mathematical strategy to provide the standards for the interpretation of microbial abundance (i.e. molecular microbial biomass) and diversity (i.e. richness and evenness), which are two of the most recognized indicators of soil quality. For this, we exploited the thousands microbial and environmental data obtained from the French Soil Quality Monitoring Network (RMQS), which covers the whole environmental variability of French territory to develop a predictive model of microbial bioindicators according to soil pedo-climatic conditions. Technically, we developed statistical polynomial models to predict the natural range of variations of soil molecular microbial biomass and diversity. These models are innovative tools providing optimal value of microbial biomass and diversity for a given pedoclimatic condition, which must be compared with measured data to allow a robust diagnostic of soil quality. On the other hand, these models may provide more cognitive insights by their ability to evaluate the response of microbial community to pedoclimatic variations.
Published: 2014

193. Rehabilitation of microbial patrimony with Miscanthus x giganteus crops on polluted soils

Author: Bourgeois, Emilie, Dequiedt, Samuel, Lelievre, Mélanie, Lamy, Isabelle, Van Oort, Folkert, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
Subjects: microbial diversity, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, food and beverages, polluted soil, miscanthus, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, rehabilitation
Abstract: National audience; The discharge of urban waste water on farm land has led to a widespread introduction of pollutants into our environment, locally causing acute and diffuse contamination of soils. As a consequence, contaminated soils are unsuitable for crop production and need rehabilitation. One strategy is the establishment of energy crops such as Miscanthus x giganteus, a C4 grass used for biofuel production. Although the economical potential of this crop is known, its effects on soil biological properties remain unclear. The aim of this study was to assess the effects of Miscanthus perennial cropping on the microbial properties in a contaminated soil. The work is based on an experimental real field site close to Paris irrigated for more than hundred years by raw wastewater (Pierrelaye, France). Soil microbial communities were characterized in terms of abundance, diversity and composition with molecular tools (soil DNA extraction, estimation of molecular biomass and high throughput sequencing of 16S and 18S ribosomal genes). The impact of perennial crops on microbial communities was assessed by (a) a synchronic study comparing communities between a field under Miscanthus for four years and a field managed under conventional cereal cropping (tillage, crop rotations); and (b) by a diachronic study monitoring communities during a two years-period of growth of Miscanthus following implantation. Our results showed that the composition of the microbial community at the site was indicative of polluted state of the soil, with populations involved in PAH and hormone degradations. Perennial cropping significantly increased bacterial and fungal diversity, richness and equitability. Such perennial cropping stimulated bacterial and fungal genera, known to live in association with roots and/or to degrade easily organic matter via copiotrophic attributes. The establishment of Miscanthus appears as a good strategy to stimulate microbial resources in polluted sites and favorable for their rehabilitation.
Published: 2014

194. Réhabilitation du patrimoine microbiologique de sols pollués par l'implantation de Miscanthus x giganteus

Author: Bourgeois, Emilie, Lamy, Isabelle, Van Oort, Folkert, Dequiedt, Samuel, Lelievre, Mélanie, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de recherche Science du Sol (USS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Association Française pour l'Etude du Sol (AFES). FRA.
Subjects: communauté microbienne, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, miscanthus, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, réhabilitation, sols pollués, propriété biologique du sol, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2014

195. Le séquençage massif pour caractériser la diversité microbienne des sols, standardisation et applications au sein de la plateforme GenoSol

Author: Terrat, Sébastien, Dequiedt, Samuel, Chemidlin Prévost-Bouré, Nicolas, Saby, Nicolas, Lelievre, Mélanie, Wincker, Patrick, Maron, Pierre-Alain, Ranjard, Lionel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, InfoSol (InfoSol), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, diversité microbienne, microorganismes, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, veille technologique, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, pyroséquençage, RMQS
Abstract: EA SPE GenoSol EcolDur; National audience; Les microorganismes (bactéries, archées et champignons) sont les organismes les plus abondants et les plus diversifiés de la matrice sol. Ils représentent un réservoir encore largement méconnu et presque infini de ressources génétiques, fortement impliqué dans le fonctionnement biologique du sol et plus largement dans la plupart des services écosystémiques fournis par ce sol. Malgré ce rôle central dans le fonctionnement des écosystèmes, nos connaissances sur la diversité génétique, taxonomique et fonctionnelle de ces microorganismes restent limitées à ce jour. Ceci s’explique essentiellement par des difficultés techniques pour accéder à ces organismes de petites tailles, qui sont localisés dans des microenvironnements au sein d’une matrice hétérogène comme le sol mais aussi par notre incapacité à caractériser et à résoudre une ressource génétique aussi complexe (plusieurs milliards d’individus par gramme de sol regroupant plusieurs millions d’espèces selon les dernières estimations). Depuis une vingtaine d’années, le développement des techniques de biologie moléculaire a permis l’avènement de certains outils en écologie moléculaire permettant d’aborder la notion de communauté microbienne dans sa dimension quantitative (abondance) et qualitative (diversité et fonctionnalité). Récemment, les techniques de séquençage massif sont au centre des débats méthodologiques mais aussi scientifiques pour évaluer leur capacité à résoudre la diversité taxonomique des communautés microbiennes ainsi que leurs potentialités génétiques. Dans ce contexte, la plateforme GenoSol, créée en 2008, centre de ressources biologiques unique en France et en Europe, dédiée à la conservation et à l’analyse des ressources génétiques des communautés microbiennes, s’est lancée dans ce débat technique et a relevé le challenge méthodologique de standardiser et de « routiniser » cette méthodologie afin de pouvoir réellement aborder la diversité microbienne des sols grâce à des inventaires taxonomiques microbiens. La première étape a donc été d’évaluer les différentes étapes nécessaires aux approches de séquençage massif afin d’optimiser cette technique (extraction ADN du sol, effet MID, optimisation PCR, etc…). Dan un second temps, différents exemples d’applications de la technique de séquençage massif pour évaluer la diversité microbienne des sols seront présentés dans un contexte d’évaluation environnementale des pratiques agricoles (travail du sol, amendements organiques, inter-culture…) mais aussi d’un point de vue plus fondamental (réponse des communautés aux changements climatiques, stress hydrique…).
Published: 2014

196. La Biologie des Sols : outils de mesure et intérêt pour les productions agricoles

Author: Ranjard, Lionel, Maron, Pierre-Alain, Dequiedt, Samuel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, sol, microorganismes, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, agri écologie, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, biodiversité
Published: 2014

197. Les sols et la préservation de la biodiversité

Author: Chenu, Claire, Blanchart, Eric, Bispo, Antonio, Cluzeau, Daniel, Decaëns, Thibaud, Hedde, Mickael, Lavelle, Patrick, Nunan, Naoise, Peres, Guenola, Ranjard, Lionel, Vieublé, Laure, ProdInra, Archive Ouverte, Biogéochimie et écologie des milieux continentaux ( Bioemco ), École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -AgroParisTech-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Unité INFOSOL ( ORLEANS INFOSOL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecosystèmes Biodiversité Evolution, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris ( IEES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Biogéochimie et écologie des milieux continentaux (Bioemco), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), InfoSol (InfoSol), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité INFOSOL (ORLEANS INFOSOL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: Les sols et la préservation de la biodiversité. Journée Mondiale des Sols
Published: 2014

198. Quels bioindicateurs et biomarqueurs utiliser pour la surveillance de la qualité des sols et l’évaluation des risques environnementaux?

Author: Peres, Guenola, Pauget, Benjamin, Beguiristain, Thierry, Bessoule, Jean-Jacques, Bodilis, Josselin, Chaussod, Rémi, Cluzeau, Daniel, Cheviron, Nathalie, Coeurdassier, Mickaël, Cortet, Jérôme, Criquet, Steven, Dequiedt, Samuel, De Vaufleury, Annette, Thoisy, Jeanne-Chantal, Faure, Gangneux, Christophe, Gattin, Isabelle, Guergnion Muriel M., Hellal J., Hedde, Mickaël, Hitmi, Adnane, Laurent N., Legras, Marc, Leguedard, Marina, Lepelletier, Patrice, Mougin, Christian, Nélieu, Sylvie, Ponton, Stéphane, Ranjard, Lionel, Rougé, Laurence, Ruiz N., Taibi, Salima, Vandenbulcke, Franck, Villenave, Cecile, Galsomies, Laurence, Grand, Cécile, and Bispo, Antonio
Subjects: bioindicateur, biomarqueur, qualité du sol
Published: 2014

199. Impact du travail du sol sur son fonctionnement biologique

Author: Bouthier, Alain, Pelosi, Céline, Villenave, Cecile, Peres, Guenola, Hedde, Mickael, Ranjard, Lionel, Vian, Jean Francois, Peigné, Josephine, Cortet, Jacques, Bispo, Antonio, Piron, Denis, ARVALIS - Institut du végétal [Paris], Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), SARA Lyon, Université de Lyon, Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Jerôme Labreuche, François Laurent, Jean Roger-Estrade, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), ProdInra, Archive Ouverte, ARVALIS - Institut du Végétal, Physico-chimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés ( PESSAC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Université de Lyon (COMUE), Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME ), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Physicochimie et Ecotoxicologie des SolS d'Agrosystèmes Contaminés (PESSAC), ISARA-Lyon, Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), and Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], azote, prévention, agronomie, sol, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], pollution, système de culture, environnement, agriculture
Abstract: National audience; Les impacts des différentes modalités de travail du sol (labour, semis direct) sur l’environnement et les états du sol, sur la biodiversité ou sur le climat font l’objet de débats parfois passionnés mais souvent trop peu instruits sur les plans scientifique et technique. Que nous enseignent les expérimentations les plus récentes sur ce sujet ? Quelles sont les innovations qui se dessinent à l’heure actuelle ? Cet ouvrage propose une synthèse des connaissances les plus récentes dans ce domaine.
Published: 2014

200. Qu’attendre des recherches en microbiologie du sol ?

Author: Lemanceau, Philippe, Maron, Pierre-Alain, Mazurier, Sylvie, Mougel, Christophe, Philippot, Laurent, Pivato, Barbara, Plassart, Pierre, Ranjard, Lionel, Revellin, Cécile, Tardy, Vincent, Wipf, Daniel, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, diagnostic des sols, sol, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, biologie moléculaire
Abstract: SPE EA EcolDur GenoSol MERS IPM Résumé du livre : La fertilité des sols est au carrefour des enjeux de sécurité alimentaire, de protection de l’environnement et de rentabilité économique de l’activité agricole. Cet ouvrage présente les résultats d’une réflexion prospective sur le contexte de la fertilisation dans les 5-10 ans à venir. Il définit les besoins en termes de méthodes et d'outils pour la gestion des cycles biogéochimiques et le raisonnement de la fertilisation en agriculture. Mots clés du livre : agriculture - agronomie - eau - effluent - engrais - environnement - fertilisation - pollution - prévention - production végétale - prospective - sol Description du chapitre 10 (partie 3) : "Qu’attendre des recherches en microbiologie du sol ?" Introduction Diagnostic de l’état microbiologique des sols Ingénierie écologique Conclusion; National audience
Published: 2014

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