151. Identification of bacterial from Antarctic and investigation of antiviral potential
- Author
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Damato, Mariana Bueno de Paula, 1988, Fantinatti-Garboggini, Fabiana, 1965, Kohn, Luciana Konecny, Destéfano, Suzete Aparecida Lanza, Garcia, Vera L., Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, and UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
- Subjects
Microbial activity ,Atividade microbiana ,Antiviral agents ,Bacteria ,Bactérias ,Antártica ,Agentes antivirais ,Extração líquido-líquido ,Antarctic continent ,Liquid-liquid extraction - Abstract
Orientadores: Fabiana Fantinatti Garboggini, Luciana Konecny Kohn Dissertação (mestrado) Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: O ambiente marinho é uma preciosa fonte de diversidade biológica e genética, especialmente de micro-organismos. Embora a diversidade da comunidade microbiana nos ambientes marinhos seja muito ampla, especialmente nos ambientes extremos como o continente Antártica, pouco se conhece sobre essa diversidade. Muitos desses micro-organismos, são produtores de metabólitos secundários, podendo produzir compostos naturais com aplicações na indústria farmacêutica, entre outras aplicações de bioprospecção. Esse trabalho identificou por sequenciamento 16SrRNA, 145 isolados de sedimentos marinhos e macro-organismos como Salpa, Ascídia, Líquens e Algas oriundos da Baía do Almirantado, Ilha de Rei George, Antártica. Esses 145 isolados foram pertencentes a 4 filos; Actinobacteria, Proteobacteria, Firmicutes e Bacteroidetes e identificados em 28 gêneros distintos. Dentre esses 145 isolados observou-se a possibilidade de ter isolado possíveis espécies novas. Além disso, foram produzidos 22 extratos microbianos oriundos do genero Pseudoalteromonas ( 2 extratos), Psychrobacter (4 extratos), Planococcus (3 extratos), Bacillus ( 2 extratos), Brevibacterium ( 2 extratos), Kocuria ( 1 extrato), Arthrobacter (1 extrato), Pseudomonas (2 extratos), Saccharopolyspora (1 extrato), Salinibacterium (3 extratos) e Rhodococcus (1 extrato). Posteriormente esses extratos foram submetidos a extração líquido-líquido com a utilização do solvente acetato de etila para a obtenção da fração orgânica, essas foram submetidas a ensaios antivirais. Os ensaios avaliaram o potencial antiviral contra o Herpes vírus simplex tipo 1 (HSV-1) e contra o Bovine viral diarrhea virus (BVDV). O HSV-1 é um vírus que afeta principalmente a região orofacial dos seres humanos e BVDV é um dos principais patógenos bovinos, ambos os vírus apresentam distribuição mundial. Dos 22 extratos avaliados apenas 1, identificado como Pseudomonas sp. apresentou 99% de proteção contra o vírus HSV-1 e índice de seletividade de 8,88%. Nenhum extrato apresentou inibição igual ou superior a 97% de proteção contra o vírus BVDV. Esse trabalho evidenciou a possibilidade de revelar espécies novas de bactérias e de compostos biologicamente ativos com potencial anti-herpético oriundo do genero Pseudomonas Abstract: The marine environment is a precious source of biological and genetic diversity, especially of micro-organisms. While the diversity of the microbial community in marine environments is very wide, especially in extreme environments such as the Antarctic continent, little is known about this diversity. Many of these micro-organisms are producers of secondary metabolites and can produce natural compounds with applications in the pharmaceutical industry, among other bioprospecting applications. This work identified by 16S rRNA sequencing, 145 isolated from marine sediments and macro-organisms as Salpa, Squirt, Lichens and Algae coming from Admiralty Bay, King George Island, Antarctica. These 145 isolates were belonging to 4 phyla ; Actinobacteria, Proteobacteria, Firmicutes and Bacteroidetes and were identified in 28 distinct genera. Beteween these 145 isolates it is possible had isolated new speciesof bacterias. In addition, we produced 22 microbial extracts derived from Pseudoalteromonas (2 extracts), Psychrobacter (4 extracts), Planococcus (3 extracts), Bacillus (2 extracts), Brevibacterium (2 extracts), Kocuria (1 extract), Arthrobacter (1 extract), Pseudomonas (2 extracts), Saccharopolyspora (1 extract), Salinibacterium (3 extracts) and Rhodococcus (1 extract). Subsequently, these extracts were undergoing liquid-liquid extraction with the use of ethyl acetate solvent to obtain the organic fraction, these were subjected to antiviral assays. The assays evaluated the antiviral potential against Herpes simplex virus type 1 (HSV-1) and against Bovine viral diarrhea virus (BVDV). HSV-1 is a virus that mainly affects the orofacial region of human and BVDV is a major cattle pathogens, both viruses have worldwide distribution. Of this 22 extracts only one, identified as Pseudomonas sp. showed 99% protection against HSV-1 and 8.88% selectivity index. No extract showed inhibition less than 97% protection against BVDV virus. This work highlighted the possibility to reveal new species of bacteria and biologically active compounds with anti-herpetic potential derived from the genus Pseudomonas Mestrado Microbiologia Mestra em Genética e Biologia Molecular CAPES 2013/05113-8 FAPESP 2013/05961-9
- Published
- 2016