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A gluten-free diet (GFD) is currently the only effective treatment for celiac disease (CD); an individual’s daily intake of gluten should not exceed 10 mg. However, it is difficult to maintain a strict oral diet for life and at least one-third of patients with CD are exposed to gluten, despite their best efforts at dietary modifications. It has been demonstrated that both natural and certified gluten-free foods can be heavily contaminated with gluten well above the commonly accepted threshold of 20 mg/kg. Moreover, meals from food services such as restaurants, workplaces, and schools remain a significant risk for inadvertent gluten exposure. Other possible sources of gluten are non-certified oat products, numerous composite foods, medications, and cosmetics that unexpectedly contain “hidden” vital gluten, a proteinaceous by-product of wheat starch production. A number of immunochemical assays are commercially available worldwide to detect gluten. Each method has specific features, such as format, sample extraction buffers, extraction time and temperature, characteristics of the antibodies, recognition epitope, and the reference material used for calibration. Due to these differences and a lack of official reference material, the results of gluten quantitation may deviate systematically. In conclusion, incorrect gluten quantitation, improper product labeling, and poor consumer awareness, which results in the inadvertent intake of relatively high amounts of gluten, can be factors that compromise the health of patients with CD.

Elucidating the mechanisms controlling the synthesis of hydroxyectoine is important to design novel genetic engineering strategies for optimizing the production of this biotechnologically relevant compatible solute. The genome of the halophilic bacterium Chromohalobacter salexigens carries two ectoine hydroxylase genes, namely ectD and ectE, whose encoded proteins share the characteristic consensus motif of ectoine hydroxylases but showed only a 51.9% identity between them. In this work, we have shown that ectE encodes a secondary functional ectoine hydroxylase and that the hydroxyectoine synthesis mediated by this enzyme contributes to C. salexigens thermoprotection. The evolutionary pattern of EctD and EctE and related proteins suggests that they may have arisen from duplication of an ancestral gene preceding the directional divergence that gave origin to the orders Oceanospirillales and Alteromonadales. Osmoregulated expression of ectD at exponential phase, as well as the thermoregulated expression of ectD at the stationary phase, seemed to be dependent on the general stress factor RpoS. In contrast, expression of ectE was always RpoS-dependent regardless of the growth phase and osmotic or heat stress conditions tested. The data presented here suggest that the AraC-GlxA-like EctZ transcriptional regulator, whose encoding gene lies upstream of ectD, plays a dual function under exponential growth as both a transcriptional activator of osmoregulated ectD expression and a repressor of ectE transcription, privileging the synthesis of the main ectoine hydroxylase EctD. Inactivation of ectZ resulted in a higher amount of the total ectoines pool at the expenses of a higher accumulation of ectoine, with maintenance of the hydroxyectoine levels. In addition to the transcriptional control, our results suggest a strong post-transcriptional regulation of hydroxyectoine synthesis. Data on the accumulation of ectoine and hydroxyectoine in rpoS and ectZ strains pave the way for

One of the main concerns in gluten analysis is to achieve efficient extraction of gluten proteins. Conventional ethanol-based extraction solutions are inefficient and, because of this, it is necessary to use reducing agents or acids for proper solubilization. The extraction recommended by CODEX Standard 118-1979 (revised 2008) utilizes Cocktail solution (patent WO 02/092633 A1). However, it is harmful with a disgusting odor and is not compatible with some immunological techniques. Here, the versatility and extraction capacity of a new Universal Gluten Extraction Solution (UGES) (patent ES 2 392 412 A1) were evaluated using different methodological conditions, food matrices, and various immunological methods. UGES includes safer compounds for both the user and the environment, and it displayed similar extraction efficiency to that of the extraction method recommended for sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The extraction time was significantly reduced from 100 to 40 min, depending on the type of the sample. Furthermore, unlike the currently used solution, UGES is compatible with competitive ELISA.

Soil salinization is an environmental problem that adversely affects plant growth and crop productivity worldwide. As an alternative to the conventional approach of breeding salt-tolerant plant cultivars, we explored the use of plant-growth-promoting rhizobacteria (PGPR) from halophytic plants to enhance crop growth under saline conditions. Here, we report the effect of five PGPR consortia from halophytes on the growth of eight (alfalfa, flax, maize, millet, rice, strawberry, sunflower, and wheat) of the crops most commonly produced on salinized soils worldwide. To test the efficiency of halotolerant consortia, we designed a complex environmental matrix simulating future climate-change scenarios, including increased CO2 levels and temperature. Overall, biofertilizers enhanced growth of most crops with respect to non-inoculated control plants under different CO2 concentrations (400/700 ppm), temperatures (25/+4 °C), and salinity conditions (0 and 85 mM NaCl). Biofertilizers counteracted the detrimental effect of salinity on crop growth. Specifically, strawberry and rice showed the greatest positive additive response to inoculation in the presence of salt; above-ground biomasses were 35% and 3% greater, respectively, than their respective control grown without salt. Furthermore, depending on the interaction of environmental factors (salinity × CO2 × temperature) analyzed, the results varied—influencing the most effective biofertilizer determined for each crop now, or in the future. Our findings highlight the importance of conducting studies that consider stress interaction for realistic assessments of the potential of biofertilizers in a climate-changed world.

The genome of Pseudomonas fluorescens F113, a model rhizobacterium and a plant growth-promoting agent, encodes three putative type VI secretion systems (T6SSs); F1-, F2- and F3-T6SS. Bioinformatic analysis of the F113 T6SSs has revealed that they belong to group 3, group 1.1, and group 4a, respectively, similar to those previously described in Pseudomonas aeruginosa. In addition, in silico analyses allowed us to identify genes encoding a total of five orphan VgrG proteins and eight putative effectors (Tfe), some with their cognate immunity protein (Tfi) pairs. Genes encoding Tfe and Tfi are found in the proximity of P. fluorescens F113 vgrG, hcp, eagR and tap genes. RNA-Seq analyses in liquid culture and rhizosphere have revealed that F1- and F3-T6SS are expressed under all conditions, indicating that they are active systems, while F2-T6SS did not show any relevant expression under the tested conditions. The analysis of structural mutants in the three T6SSs has shown that the active F1- and F3-T6SSs are involved in interbacterial killing while F2 is not active in these conditions and its role is still unknown.. A rhizosphere colonization analysis of the double mutant affected in the F1- and F3-T6SS clusters showed that the double mutant was severely impaired in persistence in the rhizosphere microbiome, revealing the importance of these two systems for rhizosphere adaption.

Rhinonyssidae (Mesostigmata) is a family of nasal mites only found in birds. All species are hematophagous endoparasites, which may damage the nasal cavities of birds, and also could be potential reservoirs or vectors of other infections. However, the role of members of Rhinonyssidae as disease vectors in wild bird populations remains uninvestigated, with studies of the microbiomes of Rhinonyssidae being almost non-existent. In the nasal mite (Tinaminyssus melloi) from rock doves (Columba livia), a previous study found evidence of a highly abundant putatively endosymbiotic bacteria from Class Alphaproteobacteria. Here, we expanded the sample size of this species (two different hosts- ten nasal mites from two independent samples per host), incorporated contamination controls, and increased sequencing depth in shotgun sequencing and genome-resolved metagenomic analyses. Our goal was to increase the information regarding this mite species and its putative endosymbiont. We obtained a metagenome assembled genome (MAG) that was estimated to be 98.1% complete and containing only 0.9% possible contamination. Moreover, the MAG has characteristics typical of endosymbionts (namely, small genome size an AT bias). Overall, our results support the presence of a potential endosymbiont, which is the first described for avian nasal mites to date, and improve the overall understanding of the microbiota inhabiting these mites.

Background: A lifelong strict gluten-free diet is the only available treatment for celiac disease, but total exclusion of gluten is difficult to achieve. The aim of this study was to determine the range of time and the amount of gluten immunogenic peptides (GIP) excreted in urine after specific gluten ingestions. Methods: 20 healthy participants followed the same diet for 12 days in which 50 mg and 2 g of gluten were ingested and all the urinations were collected. GIP were analyzed by lateral flow immunoassay (LFIA) tests and quantified using an LFIA reader. Results: GIP were detected in 15% and 95% of participants after 50 mg and 2 g gluten intakes, respectively. The higher frequency and concentration of GIP was found between 6 and 9 h after both gluten ingestions. The ranges of detection were 3–12 h (50 mg) and 0–15 h (2 g). Conclusions: An increase in the frequency of urine tests may be a suitable approach to avoid false negative results. The use of the LFIA test in three urine samples collected at different times may show a sensitivity of 19.6% for a gluten ingestion like 50 mg, increasing to 93% after 2 g consumption.

Bistable expression of the Salmonella enterica pathogenicity island 1 (SPI-1) and the flagellar network (Flag) has been described previously. In this study, simultaneous monitoring of OFF and ON states in SPI-1 and in the flagellar regulon reveals independent switching, with concomitant formation of four subpopulations: SPI-1OFF FlagOFF, SPI-1OFF FlagON, SPI-1ON FlagOFF, and SPI-1ON FlagON. Invasion assays upon cell sorting show that none of the four subpopulations is highly invasive, thus raising the possibility that FlagOFF cells might contribute to optimal invasion as previously proposed for SPI-1OFF cells. Time lapse microscopy observation indicates that expression of the flagellar regulon contributes to the growth impairment previously described in SPI-1ON cells. As a consequence, growth resumption in SPI-1ON FlagON cells requires switching to both SPI-1OFF and FlagOFF states.

El estado nutricional previo y la alimentación durante la gestación son cruciales para la salud de la embarazada y para la del futuro bebé, ya que se ha observado que ambos factores influyen en la composición de la microbiota intestinal. La presencia de alteraciones de la microbiota (disbiosis) y el desarrollo de diversas patologías se ha asociado al seguimiento de ciertos patrones dietéticos durante la gestación. Además, hay estudios que apoyan la idea de que parte de la microbiota materna podría transferirse a la cavidad amniótica e instaurar una microbiota prenatal cuyo perfil influiría en el desarrollo de patologías en la infancia y en la edad adulta; mientras que otros estudios mantienen que el desarrollo fetal se produce en condiciones de esterilidad, descartando el establecimiento de microbiota en el líquido amniótico, sugiriendo así que la influencia materna sobre el desarrollo de patologías fetales/infantiles se debería a otros mecanismos, tales como la transmisión de nutrientes/metabolitos de la dieta materna a través de la placenta, la transmisión transplacentaria de metabolitos producidos por las bacterias intestinales maternas y la transmisión vertical de anticuerpos. El objetivo de este trabajo ha consistido en la revisión bibliográfica de los estudios relacionados con la influencia de la nutrición durante el embarazo y el desarrollo de la microbiota intestinal materna y la del líquido amniótico. Se han establecido asociaciones directas entre la nutrición y la microbiota materna sobre el desarrollo de patologías durante la gestación, tales como la obesidad materna, diabetes mellitus gestacional y trastornos hipertensivos como la hipertensión gestacional, preeclampsia y eclampsia; y también sobre el desarrollo de patologías en la descendencia como la obesidad infantil, enfermedades atópicas (asma, rinitis alérgica, dermatitis alérgica y alergias alimentarias) y enfermedades neurológicas como el autismo. En base a los estudios científicos analizados cabe

Chromohalobacter salexigens es un microorganismo extremófilo modelo de máximo interés y aplicabilidad en Biotecnología Microbiana, ya que sintetiza en respuesta a estrés osmótico y/o por temperatura, los solutos compatibles ectoína e hidroxiectoína, compuestos con propiedades estabilizadoras por lo que son de gran interés en Dermofarmacia, Biología Molecular, Agricultura o Biomedicina. La síntesis de ectoínas y su regulación es un proceso en el que intervienen complejos mecanismos transcripcionales y postranscripcionales, además de la implicación de reguladores globales y específicos. Por otro lado, se ha puesto de manifiesto la importancia de la regulación de la homeostasis del hierro en la adaptación a la salinidad, y por tanto en la síntesis de estos solutos. Así, el regulador global Fur es el encargado de mantener un control preciso de los niveles de hierro intracelulares existiendo, en C. salexigens, dos parálogos pertenecientes a la superfamilia Fur, Fur1 y Fur2. Además, para poder sintetizar la cantidad necesaria de estos solutos en condiciones de estrés, en C. salexigens se produce una adaptación metabólica en función de la salinidad y temperatura, ya que la síntesis de ectoínas depende de intermediarios procedentes de rutas del metabolismo central. Así, para poder dilucidar posibles modificaciones genéticas que permitan la obtención de cepas mejoradas en la producción de estos compuestos, se hace necesario un estudio más global e integrado tanto del metabolismo, como de los reguladores implicados en dicho proceso, así como de otros factores ambientales que puedan intervenir. En los últimos años se ha desarrollado un modelo metabólico de C. salexigens a escala genómica, que permitirá la predicción de estrategias de Ingeniería Metabólica para optimizar la producción de ectoínas en este microorganismo. Para la mejora de este modelo se está desarrollando un modelo de regulación que integre tanto las redes de señalización como las redes transcripcionales respons

En diciembre de 2019 surgió un nuevo betacoronavirus, posiblemente descendente del murciélago, que ha cambiado la forma de vida de las personas en todo el mundo y que deja cada día más fallecidos debido a su rápida transmisión por su proteína en espiga, que forma homotrímeros para unirse con mayor facilidad a la célula hospedadora. El SARS-CoV-2 no sólo provoca neumonía, si no también afecciones a nivel renal, cardiovascular o digestivas y/o secuelas de cualquier índole. En esta revisión bibliográfica se han recopilado las implicaciones que produce la COVID 19 a nivel oftalmológico de manera precisa, así como la posible vía de contagio que supone la superficie ocular o los efectos indirectos que ha dejado la pandemia en una parte importante de la población, para así ofrecer información acerca de esta patología aún por descubrir. Las afecciones más comunes que produce en el ojo la COVID-19 son la conjuntivitis, queratitis y epiescleritis, entre otras, y los síntomas más comunes son sensación de cuerpo extraño, hiperemia y lagrimeo. La incidencia de los infectados por COVID-19 que desarrollan afecciones oculares es del 10%, afectando más notablemente a la población masculina mayor de 70 años, sobre todo a los que padecen patologías previas a la infección por SARS-CoV-2. En cuanto a la enfermedad de Kawasaki, se ha demostrado que está solapada con la COVID-19 en algunos casos, provocando inyección conjuntival en el ojo. En la mayoría de los casos, no hay un tratamiento establecido para estas complicaciones, pero sí se ha mostrado efectividad en bastantes casos con la administración de corticosteroides. Asimismo, tanto la enfermedad en sí misma como el confinamiento domiciliario para evitar los contagios han dejado secuelas, tanto en la salud individual (retinopatía diabética, pupila de Adie) como colectiva (disminución de consultas oftalmológicas) de las personas. En cualquier caso, con las investigaciones venideras y publicación de casos por parte de los profesionales

Las reacciones adversas a los alimentos incluyen las intolerancias y alergias alimentarias, que son un problema creciente en la población infantil y adulta, destacando entre ellas las patologías relacionadas con el consumo de gluten. Por ello, el objetivo de este Trabajo de Fin de Grado es llevar a cabo una revisión bibliográfica actualizada sobre dichas patologías y su importancia en nuestra sociedad. El término gluten hace referencia a las proteínas responsables de la cohesividad, viscosidad y elasticidad de la masa del trigo, la cebada, el centeno, la avena y sus derivados. Estos cereales son ampliamente usados tanto por su valor nutricional como por sus propiedades químicas, lo que les confiere una gran variedad de usos en la industria alimentaria. Las enfermedades relacionadas con la ingesta de gluten se clasifican según los síntomas clínicos que producen y la respuesta inmune generada, distinguiéndose entre ellas la enfermedad celíaca, la sensibilidad al gluten no celíaca, la alergia al trigo, la dermatitis herpetiforme y la ataxia por gluten. El único tratamiento eficaz para todas estas patologías es la dieta sin gluten y, aunque existen numerosos condicionantes que impiden llevarla a cabo, se ha demostrado que elimina los síntomas, previene deficiencias nutricionales y mejora la calidad de vida de estos pacientes, evitando complicaciones a corto-medio plazo y reduciendo el coste socio-sanitario. Los diferentes trastornos relacionados con el consumo de gluten presentan una clínica característica y tienen su base en una patogénesis de distinto origen, pudiendo dar lugar a respuestas de diferente tipo en el organismo (autoinmune, alérgica o no autoinmune y no alérgica). Originariamente, la enfermedad celíaca ha sido la patología más conocida y de mayor importancia clínica asociada al consumo de gluten, y en la actualidad es considerada como una de las enfermedades gastrointestinales más importantes de la sociedad occidental. Estas patologías tienen respuestas f

Para alimentar a la creciente población y abastecer las necesidades de nutrientes de los suelos, se extendió el uso de fertilizantes sintéticos a lo largo del siglo XX (Tilman et al., 2002). En muchos de estos fertilizantes también se documentó la presencia de metales pesados como As, Cd, Cr, Hg, Pb y Zn (Brevik, 2013). Desde entonces, la contaminación de los suelos ha aumentado hasta alcanzar niveles tóxicos y perjudiciales para los seres vivos. Por esta creciente preocupación mundial, las técnicas basadas en el uso de microorganismos han alcanzado una gran importancia, no solo por su función promotora del crecimiento sino como técnica de biorremediación por las propiedades de las bacterias y su capacidad para tolerar altas concentraciones de metales pesados. Gracias a su versatilidad, su fácil cultivo y la poca especificidad de las bacterias para establecer relaciones simbióticas con las plantas leguminosas, que se han convertido en una potencial herramienta clave en la solución del problema de la contaminación de los suelos. En este trabajo se aislaron bacterias procedentes de nódulos de plantas de Medicago spp. y se caracterizaron, con intención de utilizar aquellas que reunieran las mejores características para inocular semillas del mismo género en condiciones controladas. Los resultados mostraron un efecto positivo de las bacterias seleccionadas sobre dichas plantas, que aumentaron no solo su peso y su longitud, sino también su número de hojas y nódulos. Se concluyó, por lo tanto, que la asociación leguminosa rizobio era beneficiosa para las plantas, y que la adición a esta simbiosis de una bacteria con ciertas propiedades promotoras del crecimiento vegetal (PGPB; (plant growth promoting bacteria)) incrementaba aún más el efecto positivo.

Celiac disease (CD) is a chronic gluten-responsive immune mediated enteropathy and is treated with a gluten-free diet (GFD). However, a strict diet for life is not easy due to the ubiquitous nature of gluten. This review aims at examining available evidence on the degree of adherence to a GFD, the methods to assess it, and the barriers to its implementation. The methods for monitoring the adherence to a GFD are comprised of a dietary questionnaire, celiac serology, or clinical symptoms; however, none of these methods generate either a direct or an accurate measure of dietary adherence. A promising advancement is the development of tests that measure gluten immunogenic peptides in stools and urine. Causes of adherence/non-adherence to a GFD are nu-merous and multifactorial. Inadvertent dietary non-adherence is more frequent than intentional non-adherence. Cross-contamination of gluten-free products with gluten is a major cause of inadvertent non-adherence, while the limited availability, high costs, and poor quality of certified gluten-free products are responsible for intentionally breaking a GFD. Therefore, several studies in the last decade have indicated that many patients with CD who follow a GFD still have difficulty controlling their diet and, therefore, regularly consume enough gluten to trigger symptoms and damage the small intestine.

To date, the only treatment for celiac disease (CD) consists of a strict lifelong gluten-free diet (GFD), which has numerous limitations in patients with CD. For this reason, dietary transgressions are frequent, implying intestinal damage and possible long-term complications. There is an unquestionable need for non-dietary alternatives to avoid damage by involuntary contamination or voluntary dietary transgressions. In recent years, different therapies and treatments for CD have been developed and studied based on the degradation of gluten in the intestinal lumen, regulation of the immune response, modulation of intestinal permeability, and induction of immunological tolerance. In this review, therapeutic lines for CD are evaluated with special emphasis on phase III and II clinical trials, some of which have promising results.

Terribacillus sp. AE2B 122 is an environmental strain isolated from olive-oil agroindustry wastes. This strain displays resistance to arsenic, one of the most ubiquitous carcinogens found in nature. Terribacillus sp. AE2B 122 possesses an unusual ars operon, consisting of the transcriptional regulator (arsR) and arsenite efflux pump (arsB) but no adjacent arsenate reductase (arsC) locus. Expression of arsR and arsB was induced when Terribacillus was exposed to sub-lethal concentrations of arsenate. Heterologous expression of the arsB homologue in Escherichia coli ∆arsRBC demonstrated that it conferred resistance to arsenite and reduced the accumulation of arsenic inside the cells. Two members of the arsC-like family (Te3384 and Te2854) found in the Terribacillus genome were not induced by arsenic, but their heterologous expression in E. coli ∆arsC and ∆arsRBC increased the accumulation of arsenic in both strains. We found that both Te3384 and Te2854 slightly increased resistance to arsenate in E. coli ∆arsC and ∆arsRBC, possibly by chelation of arsenic or by increasing the resistance to oxidative stress. Finally, arsenic speciation assays suggest that Terribacillus is incapable of arsenate reduction, in agreement with the lack of an arsC homologue in the genome.

Metagenomic studies on prokaryotic diversity of hypersaline soils from the Odiel saltmarshes, South-west Spain, revealed a high proportion of genomic sequences not related to previously cultivated taxa, that might be related to haloarchaea with a high environmental and nutritional flexibility. In this study, we used a culturomics approach in order to isolate new haloarchaeal microorganisms from these hypersaline soils. Four haloarchaeal strains, designated strains F24AT, F28, F27T, and F13T, phylogenetically related to the genus Halomicroarcula, were isolated and characterized in detail. The phylogenomic tree based on the 100 orthologous single-copy genes present in the genomes of these four strains as well as those of the type strains of the species Halomicroarcula pellucida CECT 7537T, Halomicroarcula salina JCM 18369T and Halomicroarcula limicola JCM 18640T, that were determined in this study, revealed that these four new isolates clustered on three groups, with strains F24AT and F28 within a single cluster, and altogether with the species of Halomicroarcula. Additionally, Orthologous Average Nucleotide Identity (OrthoANI), digital DNA-DNA hybridization (dDDH) and Average Amino-acid Identity (AAI) values, likewise phenotypic characteristics, including their polar lipids profiles, permitted to determine that they represent three new species, for which we propose the names Halomicroarcula rubra sp. nov. (type strain F13T), Halomicroarcula nitratireducens sp. nov. (type strain F27T) and Halomicroarcula salinisoli sp. nov. (type strain F24AT). An in deep comparative genomic analysis of species of the genus Halomicroarcula, including their metabolism, their capability to biosynthesize secondary metabolites and their osmoregulatory adaptation mechanisms was carried out. Although they use a salt-in strategy, the identification of the complete pathways for the biosynthesis of the compatible solutes trehalose and glycine betaine, not identified before in any other haloarc

BACKGROUND Gluten is a complex mixture of proteins with immunogenic peptide sequences triggering the autoimmune activity in patients with celiac disease (CeD). Gluten immunogenic peptides (GIP) are resistant to gastrointestinal digestion and are then excreted via the stool and urine. Most common detection methods applied in the follow-up visits for CeD patients such as serology tests, dietetic interviews, questionnaires, and duodenal biopsy have been proved to be inefficient, invasive, or inaccurate for evaluating gluten-free diet (GFD) compliance. Determination of excreted GIP in stool and urine has been developed as a non-invasive, direct, and specific test for GFD monitoring. AIM To summarize published literature about the clinical utility of GIP determination in comparison to the tools employed for GFD monitoring. METHODS PubMed and Web of Science searches were performed using the keywords “gluten immunogenic peptides” or “gluten immunogenic peptide” and a combination of the previous terms with “feces”, “stools”, “urine”, “celiac disease”, “gluten-free diet”, and “adherence” to identify relevant clinical studies published in English and Spanish between 2012 to January 2021. Reference lists from the articles were reviewed to identify additional pertinent articles. Published articles and abstracts reporting the clinical use of GIP determination in stool and/or urine for the follow-up of patients with CeD in comparison with other tools in use were included. Case reports, commentaries, reviews, conference papers, letters, and publications that did not focus on the aims of this review were excluded. RESULTS Total of 15 publications were found that involved the use of GIP determination in stool and/or urine to monitor the adherence to the GFD in comparison to other tools. Studies included both children and adults diagnosed with CeD and healthy volunteers. Overall, these preliminary studies indicated that this novel technique was highly sensitive for the detection of G

The haloarchaeal genera Natrinema and Haloterrigena were described almost simultaneously by two different research groups and some strains studied separately were described as different species of these genera. Furthermore, the description of additional species were assigned to either Natrinema or Haloterrigena, mainly on the basis of the phylogenetic comparative analysis of single genes (16S rRNA gene and more recently rpoB’ gene), but these species were not adequately separated or assigned to the corresponding genus. Some studies suggested that the species of these two genera should be unified into a single genus, while other studies indicated that the genera should remain but some of the species should be reassigned. In this study, we have sequenced or collected the genomes of the type strains of species of Natrinema and Haloterrigena and we have carried out a comparative genomic analysis in order to clarify the controversy related to these two genera. The phylogenomic analysis based on the comparison of 525 translated single-copy orthologous genes and the Overall Genome Relatedness Indexes (i.e., AAI, POCP, ANI, and dDDH) clearly indicate that the species Haloterrigena hispanica, Haloterrigena limicola, Haloterrigena longa, Haloterrigena mahii, Haloterrigena saccharevitans, Haloterrigena thermotolerans, and Halopiger salifodinae should be transferred to the genus Natrinema, as Natrinema hispanicum, Natrinema limicola, Natrinema longum, Natrinema mahii, Natrinema saccharevitans, Natrinema thermotolerans, and Natrinema salifodinae, respectively. On the contrary, the species Haloterrigena turkmenica, Haloterrigena salifodinae, and Haloterrigena salina will remain as the only representative species of the genus Haloterrigena. Besides, the species Haloterrigena daqingensis should be reclassified as a member of the genus Natronorubrum, as Natronorubrum daqingense. At the species level, Haloterrigena jeotgali and Natrinema ejinorense should be considered as a later het

La enfermedad celiaca (EC) se define como una enteropatía inflamatoria crónica del intestino delgado causada por la ingesta de gluten en individuos genéticamente predispuestos. El término gluten hace referencia a las proteínas responsables de la cohesividad, viscosidad y elasticidad de la masa del trigo, la cebada, el centeno, la avena, y sus derivados. El gluten es una mezcla de dos grupos de proteínas las prolaminas (denominadas gliadinas en el trigo, hordeínas en la cebada, secalinas en el centeno y aveninas en la avena) y las glutelinas (gluteninas para el trigo, y sus homólogas para cebada, centeno y avena). Dichas proteínas son resistentes a las enzimas digestivas y, por lo tanto, posterior a la ingestión de alimentos que contienen gluten, se generan péptidos inmunogénicos capaces de producir daño en la mucosa intestinal de los pacientes celíacos. Esta lesión se caracteriza, histológicamente, por un infiltrado de linfocitos a nivel intraepitelial y una hiperplasia de criptas con distintos grados de atrofia de las vellosidades intestinales. Clínicamente la EC presenta una gran variedad de síntomas, tanto gastrointestinales como extra-intestinales. Los síntomas clásicos incluyen diarrea crónica, esteatorrea, distensión abdominal, dolor, pérdida de peso y anemia. En niños además es común que presenten retraso en el crecimiento y baja estatura. Sin embargo, existen situaciones en las que las manifestaciones digestivas están ausentes u ocupan un segundo lugar. Estas formas atípicas incluyen manifestaciones que pueden ser orales, cutáneas, cardíaca, dermatológicas, neurológicas, articulares, hepáticas, endocrinas, ginecológicas, psiquiátricas y hematológicas. También es frecuente que aparezcan otras complicaciones graves como adenocarcinomas intestinales. En la actualidad, el único tratamiento disponible para los celíacos es el seguimiento de dieta sin gluten (DSG). Se ha demostrado que una estricta adherencia a la DSG es fundamental para eliminar los síntomas de

Actinobacteria are prokaryotes with a large biotechnological interest due to their ability to produce secondary metabolites, produced by two main biosynthetic gene clusters (BGCs): polyketide synthase (PKS) and non-ribosomal peptide synthetase (NRPS). Most studies on bioactive products have been carried out on actinobacteria isolated from soil, freshwater or marine habitats, while very few have been focused on halophilic actinobacteria isolated from extreme environments. In this study we have carried out a comparative genomic analysis of the actinobacterial genus Saccharomonospora, which includes species isolated from soils, lake sediments, marine or hypersaline habitats. A total of 19 genome sequences of members of Saccharomonospora were retrieved and analyzed. We compared the 16S rRNA gene-based phylogeny of this genus with evolutionary relationships inferred using a phylogenomic approach obtaining almost identical topologies between both strategies. This method allowed us to unequivocally assign strains into species and to identify some taxonomic relationships that need to be revised. Our study supports a recent speciation event occurring between Saccharomonospora halophila and Saccharomonospora iraqiensis. Concerning the identification of BGCs, a total of 18 different types of BGCs were detected in the analyzed genomes of Saccharomonospora, including PKS, NRPS and hybrid clusters which might be able to synthetize 40 different putative products. In comparison to other genera of the Actinobacteria, members of the genus Saccharomonospora showed a high degree of novelty and diversity of BGCs.

BACKGROUND: The ingestion of wheat and other cereals are related to several gut disorders. The specific components responsible for non-celiac wheat-sensitivity (NCWS) may include gluten and other compounds. Tritordeum is a new cereal derived from crossing durum wheat with a wild barley species, which differs from bread wheat in its gluten composition. In the present work, we examined the response of NCWS patients to tritordeum bread Gastrointestinal symptoms as well as tritordeum acceptability, gluten immunogenic peptides excretion, and the composition and structure of the intestinal microbiota were evaluated. RESULTS: Gastrointestinal symptoms of the subjects showed no significant change between the gluten-free bread and the tritordeum bread. Participating subjects rated tritordeum bread higher than the gluten-free bread. Analysis of the bacterial gut microbiota indicated that tritordeum consumption does not alter the global structure and composition of the intestinal microbiota, and only a few changes in some butyrate-producing bacteria were observed. CONCLUSIONS: All the results derived from acceptability, biochemical and microbiological tests suggest that tritordeum may be tolerated by a sub-set of NCWS sufferers who do not require strict exclusion of gluten from their diet.

Refractory celiac disease (RCD) involves T-lymphocyte activation despite supposed absence of gluten exposure. Assessing dietary adherence is the cornerstone of RCD diagnosis, but available diagnostic tools fail to monitor gluten-free diet (GFD). A recently acknowledged GFD biomarker is gluten immunogenic peptides (GIP) in urine. This study assessed urine GIP to verify whether RCD patients could be reclassified as “exposed to gluten.” Three out of four RCD patients had at least two positive-GIP urine samples in a follow-up of 3 months, demonstrating gluten exposure. Urine GIP may enable the accurate RCD verification and decrease overuse of immunosuppressants, increasing cost effectiveness.

Strain EAR8T is a root endophyte isolated from Arthrocnemum macrostachyum plants collected from the Odiel marshes, Huelva (Spain). It presented in vitro plant growth-promoting properties and improved the plant growth and heavy metal accumulation in polluted soils playing an important role in phytoremediation strategies. Phenotypically, strain EAR8T cells were Gram-positive, aerobic and non-motile rods with terminal oval endospores and non-swollen sporangia which form beige, opaque, butyrous, raised and irregular colonies with undulate margins. The strain was able to grow between 15–45 °C, at pH 6.0–9.0 and tolerated 0–25 % NaCl (w/v) showing optimal growth conditions on trypticase soy agar plates supplemented with 2.5 % NaCl (w/v) at pH 7.0 and 37 °C for 24 h. Chemotaxonomic analyses showed that the isolate has meso-diaminopimelic acid as the peptidoglycan in the cell wall and MK-7 as the major respiratory quinone. The predominant fatty acids were anteiso-C15 : 0 and iso-C15 : 0 and the polar lipid profile was composed of diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol and phosphatidylethanolamine. Phylogenetic analyses based on the whole proteomes of closest sequenced relatives confirmed that strain EAR8T is affiliated to the genus Rossellomorea and forms a clade with Rossellomorea vietnamensis 15-1T with maximum support. Genome analyses showed that EAR8T has indole-3-acetic acid and siderophore biosynthesis and transporters genes and genes related to resistance against heavy metals. Phenotypic and phylogenomic comparative studies suggested that strain EAR8T is a new representative of the genus Rossellomorea and the name Rossellomorea arthrocnemi sp. nov. is proposed. Type strain is EAR8T (=CECT 9072T=DSM 103900T).

Human trichuriasis is a Neglected Tropical Disease, which affects hundreds of millions of persons worldwide. Several studies have reported that non-human primates (NHP) represent important reservoirs for several known zoonotic infectious diseases. In this context, Trichuris infections have been found in a range of NHP species living in natural habitats, including colobus monkeys, macaques, baboons, and chimpanzees. To date, the systematics of the genus Trichuris parasitizing humans and NHP is unclear. During many years, Trichuris trichiura was considered as the whipworm present in humans and primates. Subsequently, molecular studies suggested that Trichuris spp. in humans and NHP represent several species that differ in host specificity. This work examines the current knowledge of T. trichiura and its relationship to whipworm parasites in other primate host species. A phylogenetic hypothesis, based on three mitochondrial genes (cytochrome c oxidase subunit 1, cytochrome b, and large subunit rRNA-encoding gene) and two fragments of ribosomal DNA (Internal Transcribed Spacer 1 and 2), allowed us to define a complex of populations of T. trichiura hosting in a large variety of NHP species, in addition to humans. These populations were divided into four phylogenetic groups with a different degree of host specificity. From these data, we carry out a new morphological and biometrical description of the populations of Trichuris based on data cited by other authors as well as those provided in this study. The presence of T. trichiura is analyzed in several NHP species in captivity from different garden zoos as possible reservoir of trichuriasis for humans. This study contributes to clarify questions that lead to identification of new taxa and will determine parasite transmission routes between these primates, allowing the implementation of appropriate control and prevention measures.

Pantoea agglomerans RSO7, a rhizobacterium previously isolated from Spartina maritima grown on metal polluted saltmarshes, had demonstrated good plant growth promoting activity for its host halophyte, but was never tested in crops. The aims of this study were: (1) testing PGP activity on a model plant (alfalfa) in vitro; (2) testing a bacterial consortium including RSO7 as biofertilizer in a pilot experiment in urban orchard; and (3) identifying the traits related to PGP activities. RSO7 was able to enhance alfalfa growth in vitro, particularly the root system, besides improving plant survival and protecting plants against fungal contamination. In addition, in a pilot experiment in urban orchard, a consortium of three bacteria including RSO7 was able to foster the growth and yield of several winter crops between 1.5 and 10 fold, depending on species. Moreover, the analysis of chlorophyll fluorescence revealed that photosynthesis was highly ameliorated. Genome analysis of RSO7 depicted the robustness of this bacterial strain which showed resilience to multiple stresses (heat, cold, UV radiation, several xenobiotics). Together with wide metabolic versatility, genes conferring resistance to oxidative stress were identified. Many genes involved in metal resistance (As, Cu, Ni, Co, Zn, Se, Te) and in tolerance toward high osmolality (production of a battery of osmoprotectans) were also found. Regarding plant growth promoting properties, traits for phosphate solubilization, synthesis of a battery of siderophores and production of IAA were detected. In addition, the bacterium has genes related to key processes in the rhizosphere including flagellar motility, chemotaxis, quorum sensing, biofilm formation, plant-bacteria dialog, and high competitiveness in the rhizosphere. Our results suggest the high potential of this bacterium as bioinoculant for an array of crops. However, the classification in biosecurity group 2 prevents its use according to current European regulation.

Introducción: El virus del Nilo Occidental (VNO) es un arbovirus que se trasmite de aves a mamíferos, principalmente humanos y caballos, a través de mosquitos. En los seres humanos, el VNO puede producir desde infecciones asintomáticas hasta una enfermedad neuroinvasiva (meningitis, encefalitis, parálisis flácida) que, aunque se desarrolla en muy pocos casos, puede ser mortal o dejar graves secuelas neurológicas. En España, hasta 2019 sólo se habían detectado algunos casos esporádicos de infecciones humanas por VNO, pero en agosto del 2020 se produjo un aumento considerable en el número de casos, algunos de ellos mortales, que afectaron principalmente a las provincias de Sevilla y Cádiz e hicieron saltar las alarmas sanitarias. El objetivo general del trabajo ha sido realizar una revisión bibliográfica sobre este último brote. Metodología: la principal base de datos utilizada ha sido PubMed, también se han consultado páginas webs oficiales relacionadas con este virus y con los casos de infecciones humanas notificados en España. Resultados y Discusión: el brote causado por el VNO en España el año pasado registró un total de 77 casos de meningoencefalitis en humanos, de los que 8 tuvieron un desenlace fatal. Todos los casos estudiados fueron causados por el linaje 1 del virus. La provincia de Sevilla y más concretamente, dos municipios de la rivera del Guadalquivir, Coria del Río y La Puebla del Río, fueron los más afectados. La especie de mosquitos predominante en las zonas afectadas durante esa temporada fue Culex perexiguus. Conclusiones: actualmente no existen medicamentos antivirales específicos ni vacunas para humanos, por lo que las únicas medidas de control frente a este virus se basan en la vigilancia epidemiológica y la detección precoz de casos, tanto en animales como en humanos.

La filariasis linfática o elefantiasis es una enfermedad producida por los nematodos Wuchereria bancrofti y Brugia malayi en la mayoría de los casos. Estos nematodos son transmitidos por la picadura de mosquitos, los más característicos del género Culex sp. El ciclo de vida del parásito está formado por una fase prelarvaria o infecciosa en la que el nematodo está en forma de microfilaria, además de una fase larvaria, donde el nematodo es adulto y produce las manifestaciones clínicas. La enfermedad afecta principalmente al sistema linfático produciendo síntomas como linfedema, elefantiasis o hidrocele creando así discapacidad en las personas que la padecen. Debido a estas manifestaciones la filariasis linfática causa estigma social en las personas que la padecen y un gran impacto económico en las zonas endémicas. En este trabajo se ha recabado información de bases de datos, libros y artículos con el fin de encontrar una información fiable de la situación epidemiológica de la enfermedad a nivel mundial. Además de hacer una búsqueda de los factores de riesgo de la enfermedad y las medidas de control de ante la misma. En el mundo actualmente existen alrededor de 120 millones de personas con filariasis linfática. Esta enfermedad sigue siendo endémica en muchos países. Las principales zonas afectadas son Asia, África, las islas del Pacífico, varias de las islas del Caribe y América del Sur. La prevalencia de la filariasis linfática se ha mantenido en cada uno de los países afectados hasta que se comenzó con la administración de drogas en masa, lo cual mejoró mucho la situación haciendo que en muchos países la enfermedad dejase de ser endémica. Los fármacos usados con este fin son dietilcarbamazina, albendazol e ivermectina combinados entre sí. Además, se usaron métodos de control como el uso de mosquiteros y el saneamiento de las aguas. Los principales factores de riesgo son las aguas estancadas, la humedad, el sexo masculino y vivir en zonas rurales.

Las zoonosis son enfermedades infecciosas transmisibles naturalmente desde animales vertebrados al ser humano y pueden ser de muchos tipos según el microorganismo causante; ya sean hongos, priones, protozoos, virus, bacterias, etc. A causa de la gran interacción animal hombre, destrucción de hábitats, cambio climático, invasión humana, la actividad comercial, y movilización de personas y animales, hoy en día las enfermedades zoonóticas están ampliamente diseminadas entre el ser humano. En concreto, las zoonosis víricas son las que más preocupan a la comunidad científica, no solo por las consecuencias sanitarias sino también las socioeconómicas, como la actual crisis debida al COVID-19. Los objetivos del trabajo están enfocados a describir las zoonosis víricas de mayor relevancia e impacto en las últimas décadas por causar epidemias o pandemias, así como los reservorios y vías de transmisión de las mismas. El Ébola es una zoonosis que ha arrasado con la vida de numerosos africanos, sobre todo en la epidemia de 2014-2016, pero que hoy en día cuenta con una vacuna recombinante que está salvando multitud de vidas. Dentro de la familia coronavirus, aunque hay distintas variantes, es destacable el SARS-CoV-2 por ser causante de la actual pandemia, en la que, a pesar del escaso arsenal terapéutico, la vacunación está siendo la herramienta clave a la hora de sobrellevar la pandemia. Por otro lado, existen otros virus zoonóticos que son transmitidos por vectores, como por ejemplo el virus del Zika y el virus del Nilo Occidental, siendo el primero de ellos causante de teratogenia o muerte fetal. Igual de relevantes son los Influenza virus, causantes de epidemias y pandemias tales como ‘’La gripe española’’ de 1918 o la pandemia a causa del virus influenza A (H1N1) de 2009. Sin olvidar lo ampliamente distribuido que está el virus de la rabia, aunque gracias a la existencia de vacunas para cánidos y a las inmunoglobulinas en casos de post infección, la situación está controlada, Zoonoses are infectious diseases that are naturally transmissible from vertebrate animals to humans and can be of many types depending on the causative micro-organism; fungi, prions, protozoa, viruses, bacteria, etc. Nowadays zoonotic diseases are widely spread among humans due to extensive animal-human interaction, habitat destruction, climate change, human encroachment, commercial activity, and movement of people. In particular, viral zoonoses are of greatest concern to the scientific community, not only because of their health consequences but also because of their socio-economic consequences, such as the current crisis due to COVID-19. The objectives of the work are focused on describing the viral zoonoses of greatest relevance and impact in recent decades for causing epidemics or pandemics, as well as their reservoirs and transmission routes. Ebola is a zoonosis that has devastated the lives of many Africans, especially in the 2014-2016 epidemic, but which today has a recombinant vaccine that is saving many lives. Within the coronavirus family, although there are different variants, SARS-CoV-2 stands out as the cause of the current pandemic, in which, despite the scarce therapeutic arsenal, vaccination is being the key tool in overcoming the pandemic. On the other hand, there are other zoonotic viruses that are transmitted by vectors, such as Zika virus and West Nile virus, the former causing teratogenic or foetal death. Equally relevant are influenza viruses, which have caused epidemics and pandemics such as the "Spanish flu" of 1918 or the pandemic caused by the influenza A (H1N1) virus in 2009. Not forgetting how widely distributed the rabies virus is, although thanks to the existence of vaccines for canids and immunoglobulins in post-infection cases, the situation is now under control. Finally, the paper reviews the future outlook for the emergence of new zoonoses and the recommendations of international bodies to minimise their incidence, such as the creat

Los mosquitos (Diptera: Nematocera: Culicidae) son importantes vectores de enfermedades infecciosas que se distribuyen ampliamente por todo el mundo. Esta distribución cosmopolita, hace que el contacto entre humanos y culícidos sea fácil tanto en zonas urbanas, periurbanas o rurales. Como consecuencia, la población en riesgo de ser infectadas con el gran número de agentes patógenos susceptibles de ser transmitidos por picaduras de culícidos es muy elevada. Este gran número de agentes patógenos pueden ser de naturaleza vírica, bacteriana y/o parasitaria. Entre las enfermedades más prevalentes y graves en el ser humano a nivel mundial destacan la malaria, el dengue, la fiebre amarilla, la fiebre del Valle del Rift, así como la tularemia. El cambio climático juega un papel crucial a la hora de que la distribución de los mosquitos, y por tanto la de las enfermedades que pueden transmitir, debido a un aumento o disminución de las temperaturas unido a las precipitaciones, se amplíe a latitudes más septentrionales. Todos estos aspectos hacen necesario implementar planes de control con el fin de controlar el desarrollo de las poblaciones de mosquitos, minimizando el riesgo de transmisión de enfermedades y el peligro para la salud pública de las personas. El establecimiento de estos planes de control, responsabilidad de los municipios, deben elaborarse siguiendo un protocolo de actuación y utilizando todos los métodos de control, eligiendo el conjunto de ellos que tenga menor impacto sobre el medio ambiente con el objetivo de conseguir un modelo más sostenible de frenar la expansión de enfermedades transmitidas por culícidos.

La infección causada por el virus de la hepatitis C supone un problema de salud general, ya que la prevalencia global de esta enfermedad aún se considera elevada y supone al año unos 250.000 fallecimientos. Esta enfermedad puede manifestarse de manera aguda o de manera crónica llegando a situaciones graves como hipertensión portal, cirrosis, carcinoma o incluso la muerte. Esta situación ha supuesto un impulso en la investigación del conocimiento de dicho virus. Para llegar a encontrar nuevos tratamientos o profilaxis, entender el mecanismo de acción del virus de la hepatitis C, así como su morfología y demás características como la transmisión, diagnóstico, epidemiología y clínica es decisivo. En este trabajo, se analizan todas las características del virus, conociendo así su maquinaria proteica constituida por diez proteínas que estarán relacionadas con el proceso de replicación y formación de las partículas virales. Asimismo, se ha estudiado el ciclo vital examinando las etapas claves que serán futuras dianas terapéuticas usadas para la síntesis de nuevos fármacos o prototipos de vacunas. Igualmente, en esta revisión, se han analizado los tratamientos que hoy en día se aplican por parte del Sistema Nacional de Salud, así como los aprobados por la Food and Drugs Administration. Sin embargo, a pesar de que la inclusión de esta variedad de fármacos ha supuesto un incremento en el número de curaciones, aún son muchos los obstáculos que hacen que no toda la población pueda acceder a estos tratamientos. Por ello, es importante la investigación de nuevos fármacos más eficientes así como el desarrollo de futuras vacunas para la prevención de esta enfermedad.

Los inicios de la microbiología en general y de la bacteriología en particular se caracterizan, entre otras cosas, por la rivalidad entre franceses y alemanes. Los nombres de Louis Pasteur y Robert Koch son bien conocidos gracias a sus descubrimientos, avances y aportaciones. Entre ellos se encuentran la refutación de la Teoría de la Generación Espontánea, el nacimiento de la Inmunología y en gran medida también el de la Salud Pública y la Higiene Social. Algo menos consabido es, sin embargo, el duelo que libraron en el establecimiento de la causa del ántrax, el desarrollo de las primeras vacunas, la caza de microbios en África y la búsqueda de tratamientos eficaces para enfermedades tan mortales como el cólera, la tuberculosis o la rabia. Como fruto de este enfrentamiento, que no solo es científico sino también fuertemente político, se establecen las bases de la Microbiología Moderna que se practica a día de hoy en todos los laboratorios del mundo. Por tanto, lejos de frenar el avance de la ciencia, el choque de dos grandes mentes como las de Pasteur y Koch revoluciona el mundo. Con dos personalidades muy distintas, trasfondos dispares, metodologías y medios diferentes y en un momento histórico tenso para las naciones francesa y alemana, los dos buscaron lo mismo: seres microscópicos, hasta entonces desconocidos, culpables de una mortalidad escandalosamente alta. También consiguieron, juntos, cambiar el enfoque erróneo del ser humano sobre la enfermedad, antes irracional, puramente divino, al establecer las bases del llamado pensamiento etiopatológico; demostrando a lo largo de su vida la necesidad de conocer la causa de la infección para poder prevenirla y, por supuesto, poder curarla.

Angiostrongylus cantonensis es el parásito responsable de la angiostrongiliasis, una enfermedad emergente que amenaza a la población española, especialmente en las Islas Baleares y Canarias. La angiostrongiliasis es endémica de zonas del sureste de Asia y en regiones del Pacífico, pero la globalización ha llevado a encontrar casos en diversas zonas del mundo, entre ellas, Europa. A pesar de que los casos notificados en Europa han sido de personas que viajaban desde lugares donde la infección presenta una elevada incidencia, el parásito ha sido encontrado en moluscos presentes en las Islas Canarias, como Plutonia lamarckii y Theba pisana, y en erizos (Atelerix algirus) que habitan en las Islas Baleares. La enfermedad producida por Angiostrongylus cantonensis es una meningitis eosinofílica, cuyo síntoma más destacado son los dolores de cabeza. Esta sintomatología está relacionada con la reacción eosinofílica que se produce en el cerebro ya que la larva queda atrapada y muere en éste. Por otro lado, el diagnóstico de esta infección es bastante complejo ya que se basa en la sintomatología del paciente y su historia clínica. Además, los métodos moleculares son difíciles de llevar a cabo en las zonas rurales donde este parasitismo es endémico. Sin embargo, se ha desarrollado la prueba AcQuickDx que puede facilitar el diagnóstico en estos lugares. Además, para tratar esta infección es conveniente iniciar con la medicación lo antes posible. Tradicionalmente se ha empleado un antihelmíntico unido a corticoides, pero diversos estudios han demostrado la importancia de la molécula Schisandra B en la mejora de la inflamación producida en el hospedador. Angiostrongylus cantonensis es un parásito potencialmente peligroso para la salud pública española, por ello es importante desarrollar medidas profilácticas y de control que eviten el paso de éste al humano.

North Africa has an interesting and rich wildlife including hematophagous arthropods, and specifically fleas, which constitute a large part of the North African fauna, and are recognised vectors of several zoonotic bacteria. Flea-borne organisms are widely distributed throughout the world in endemic disease foci, where components of the enzootic cycle are present. Furthermore, flea-borne diseases could re-emerge in epidemic form because of changes in the vector–host ecology due to environmental and human behaviour modifications. We need to know the real incidences of flea-borne diseases in the world due to this incidence could be much greater than are generally recognized by physicians and health authorities. As a result, diagnosis and treatment are often delayed by health care professionals who are unaware of the presence of these infections and thus do not take them into consideration when attempting to determine the cause of a patient's illness. In this context, this bibliographic review aims to summarise the main species of fleas present in North Africa, their geographical distribution, flea-borne diseases, and their possible re-emergence.

Los objetivos de este TFG han sido: 1) utilizar la bacteria Pantoea agglomerans RSO7 (una bacteria PGPR previamente aislada de marismas contaminadas por metales pesados) para inocular plantas de interés agronómico, y 2) aislar su ADN, secuenciar su genoma y hacer un análisis del mismo. P. agglomerans RSO7 mejoró el crecimiento de alfalfa in vitro. Los efectos beneficiosos se observaron principalmente en situación de limitación de nutrientes y afectaron sobre todo a la raíz (mayor masa, longitud y ramificación), aunque también incrementó la longitud del tallo, si bien las diferencias no fueron significativas. Además, mejoró la supervivencia de las plantas y disminuyó la contaminación por hongos. El análisis global del genoma revela que esta bacteria es capaz de adaptarse a una gran cantidad de situaciones ambientales y tolerar muchos tipos de estrés (calor, frío, radiación UV, estrés oxidativo, etc.). Además de una amplia versatilidad metabólica, se han detectado genes de resistencia a metales pesados (As, Cu, Ni, Co, Zn, Te), a sal (producción de osmoprotectores como glicina betaína, prolina, trehalosa, etc.) y a diversos compuestos tóxicos xenobióticos. Respecto a las propiedades PGPR, se han detectado genes de solubilización de fosfatos (fosfatasas extracelulares, acil-fosfatasas, mio-inositol fosfatasas) y de producción y/o captación de variedad de sideróforos (ferritinas, enterobactina, acromobactina, hemina, etc.). Además, se han identificado genes que participan en importantes procesos rizosféricos (movilidad, quimiotaxis, diálogo planta-bacteria, quorum sensing y competencia en la rizosfera). Finalmente, y dado que la bacteria pertenece al grupo de bioseguridad 2, se han buscado posibles genes implicados en patogenicidad, encontrándose genes de resistencia a múltiples antibióticos y varios sistemas toxina/antitoxina. Los resultados sugieren el gran potencial de esta bacteria en agricultura. Sin embargo, las restricciones al uso de microorganismos de grupo 2 c

La resistencia a antibióticos es una de las mayores amenazas para la salud pública a nivel mundial. La incidencia creciente de infecciones por bacterias multirresistentes supone un reto para el control de las enfermedades infecciosas y exige el desarrollo urgente y la implementación eficaz de nuevas herramientas terapéuticas para combatirlas. Los bacteriófagos son virus capaces de infectar y matar bacterias y su uso terapéutico es una de las alternativas a los antibióticos más prometedoras. Aunque la fagoterapia se implementó por primera vez hace más de un siglo, el aumento de la resistencia a antibióticos ha renovado el interés por los fagos y sus aplicaciones clínicas. En los últimos años se ha observado un número creciente de ensayos clínicos de fase I / II modernos que describen la seguridad y la eficacia de los fagos. Mediante la revisión de estos ensayos se analiza el papel que pueden desempeñar los fagos como alternativa a los antibióticos en el tratamiento de las enfermedades infecciosas. Seguidamente, se exponen las posibilidades terapéuticas de los fagos en tratamientos de fagoterapia convencional y la evolución de este enfoque tradicional a nuevas estrategias, como la terapia combinada de fagos y antibióticos, el uso de enzimas líticas de fago y la optimización de fagos mediante bioingeniería. Finalmente se discuten algunos aspectos clave que apoyan el uso de los bacteriófagos frente a los antibióticos y los inconvenientes que se han de superar para su implantación efectiva en la medicina occidental.

La deficiencia en micronutrientes o en inglés “Hidden Hunger”, es un tipo de desnutrición referida a una ingesta o absorción insuficiente de vitaminas y minerales. Se estima que casi un tercio de la población mundial presenta en sus dietas deficiencias en minerales como el hierro (Fe), cinc (Zn), selenio (Se) y yodo (I), y de vitaminas, particularmente la vitamina A. Esta deficiencia de nutrientes tiene efectos sobre la salud, llevando a consecuencias negativas en el desarrollo de niños en los que se ve comprometida su supervivencia o afectado el desarrollo físico y cognitivo, especialmente en sus primeros 1.000 días de vida, e impidiendo una función física y mental normal en adultos, sobre todo en mujeres embarazadas y ancianos. Las causas de la deficiencia en nutrientes están relacionadas con una dieta inadecuada, motivos económicos, culturales, necesidades especiales en etapas de la vida en las que se necesite un mayor aporte, etc., de manera que son múltiples y a veces no son muy específicas. En cualquier caso, aunque es cierto que el hambre oculta se relaciona más con la escasez de recursos y en países menos desarrollados, es importante subrayar que no siempre va asociada a pobreza, ya que a veces se puede encontrar deficiencia de nutrientes en países con alto nivel de desarrollo como es el caso de la carencia de yodo en Europa. Las estrategias para erradicar la deficiencia de nutrientes se pueden enfocar desde diferentes puntos de vista, entre ellos el agrícola, biotecnológico o farmacéutico. Engloban, desde dietas diversificadas, introducción de alimentos muy nutritivos (superalimentos), suplementación o nutracéuticos, bio(fortificación), desarrollo de alimentos transgénicos, uso de biofertilizantes o nanotecnología. Es importante destacar el papel de las autoridades sanitarias, la agricultura y la industria alimentaria, así como de la información al consumidor para que a la hora de elegir los productos que consume tenga en cuenta no solo sus preferencias, si

Background: Rhinonyssid mites are permanent parasites of birds that inhabit their respiratory tract. There are around 600 species described worldwide and almost all species of birds are found to have embedded rhinonyssid mites. Despite their presumed relevance, these mites are largely unstudied due to the difficulty in sampling them and, therefore, the majority of mite-host associations and species-prevalence data are unknown. New information: In this study, 179 mite specimens belonging to 27 species and eight genera were identified. Notably, 18 new mite-bird associations were documented for the first time, thus increasing the known host range for these mite species. In addition, mite-host associations found in this study were compared with known associations from these species of birds in the European part of Russia and in Europe. Overall, this study represents the largest survey to date carried out on rhinonyssid mites in Russia and one of the most comprehensive datasets on rhinonyssid host-range

Minimally processed or fresh fruits and vegetables are unfortunately linked to an increasing number of food-borne diseases, such as salmonellosis. One of the relevant virulence factors during the initial phases of the infection process is the bacterial flagellum. Although its function is well studied in animal systems, contradictory results have been published regarding its role during plant colonization. In this study, we tested the hypothesis that Salmonella's flagellin plays a versatile function during the colonization of tomato plants. We have assessed the persistence in plant tissues of a Salmonella enterica wild type strain, and of a strain lacking the two flagellins, FljB and FliC. We detected no differences between these strains concerning their respective abilities to reach distal, non-inoculated parts of the plant. Analysis of flagellin expression inside the plant, at both the population and single cell levels, shows that the majority of bacteria down-regulate flagellin production, however, a small fraction of the population continues to express flagellin at a very high level inside the plant. This heterogeneous expression of flagellin might be an adaptive strategy to the plant environment. In summary, our study provides new insights on Salmonella adaption to the plant environment through the regulation of flagellin expression.

This work discloses an epidemiological mathematical model to predict an empirical treatment for dogs infected by Pseudomonas aeruginosa. This dangerous pathogen is one of the leading causes of multi-resistant infections and can be transmitted from dogs to humans. Numerical simulations and appropriated codes were developed using Matlab software to gather information concerning long-time dynamics of the susceptible, infected and recovered individuals. All data compiled from the mathematical model was used to provide an appropriated antibiotic sensitivity panel for this specific infection. In this study, several variables have been included in this model to predict which treatment should be prescribed in emergency cases, when there is no time to perform an antibiogram or the cost of it could not be assumed. In particular, we highlight the use of this model aiming to become part of the convenient toolbox of Public Health research and decision-making in the design of the mitigation strategy of bacterial pathogens.

Las inmunoglobulinas son proteínas que se producen por los linfocitos B, como consecuencia de la presencia de antígenos. Los primeros anticuerpos (Ac) utilizados fueron los Ac policlonales, adquiridos del suero de animales inmunizados. En 1975, se desarrolló la tecnología del hibridoma, que permitió la obtención de anticuerpos monoclonales de origen murino. Para evitar su rechazo inmunológico se sintetizaron los Ac recombinantes, gracias a la manipulación genética. La técnica del ADN recombinante, permite reemplazar porciones del murino por porciones humanas, para la fabricación de los anticuerpos quiméricos, humanizados y humanos. Entre los diferentes modos de obtención, destacan el empleo de los ratones transgénicos, las técnicas “phage display”, “ribosomal-display” y el uso de plantas transgénicas. Además, para mejorar las funciones de los anticuerpos recombinantes, se pueden conjugar con otras moléculas (inmunoconjugados) o pueden tener dos sitios de unión distintos (biespecíficos). Su uso en el diagnóstico del cáncer, supone una alternativa a las técnicas tradicionales. La inmuno-tomografía por emisión de positrones (inmuno-PET) combina la sensibilidad de las imágenes PET y la especificidad de los anticuerpos. Un ejemplo de radioinmunoconjugado utilizado para diagnosticar el cáncer es el 89 Zr-trastuzumab. Los anticuerpos recombinantes se utilizan para tratar numerosas enfermedades. En el caso del cáncer la mayoría son poco efectivos, como monoterapias por eso destacan los anticuerpos biespecíficos y conjugados. Las enfermedades autoinmunes e inflamatorias utilizan terapias biológicas basadas en bloqueadores del factor de necrosis tumoral alfa: etanercept, infliximab, adalimumab, golimumab y certolizumab. En el tratamiento de enfermedades infecciosas, destaca el palivizumab como profiláctico de las patologías producidas por el virus sincitial respiratorio y el ibalizumab para el virus de la inmunodeficiencia humana como alternativa a los antirretrovirales. Desd

Los ceratopogónidos son dípteros nematóceros muy numerosos y ampliamente distribuidos por todo el mundo. Estos nematóceros presentan una importante relevancia en la propagación de enfermedades tanto en humanos como en animales, y a pesar de ello es una familia de insectos que no ha suscitado demasiado interés entre los entomólogos. Son capaces de transmitir enfermedades como la mansonelosis en humanos y el virus de la lengua azul en animales. La mansonelosis, provocada principalmente por Mansonella ozzardi, es una enfermedad que prácticamente se va a desarrollar solo en zonas endémicas y, actualmente, no existen demasiados trabajos al respecto, a pesar de las grandes discapacidades que produce. No ocurre lo mismo con el virus de la lengua azul, cuya enfermedad afecta a los animales y está clasificada entre las enfermedades de la categoría “A”, notificables a la Organización Mundial de Sanidad Animal (OIE). Conocer el ciclo biológico de estos nematóceros, así como las manifestaciones clínicas y síntomas que presentan las enfermedades que transmiten y/o producen, serán esenciales para un diagnóstico precoz y para su prevención y control, pudiendo así actuar más rápidamente y evitar mayores complicaciones. En la actualidad, los factores climáticos y los cambios que producen sus efectos, afectan a la distribución de muchos artrópodos vectores, como las especies del género Culicoides de la familia Ceratopogonidae, vector del virus de la lengua azul que ya se ha distribuido prácticamente por todo el mundo. Esto se debe principalmente a que se han creado zonas favorables para el desarrollo de este género, el que tiene una mayor capacidad vectorial, dentro de los ceratopogónidos. La investigación sobre estos determinantes ambientales, que favorecen el desarrollo y la actividad de estos insectos, será clave para prevenir y controlar el virus de la lengua azul y otras enfermedades transmitidas por especies de Culicoides. En este trabajo se contemplan estos factores para preve

Chromohalobacter salexigens is a halophilic bacterium which naturally produces ectoine and hydroxyectoine, two biotechnologically important compatible solutes that are accumulated in response to osmotic and heat stress, respectively. The exploitation of C. salexigens in biotechnology as a producer of ectoines requires an integral understanding of the regulatory pathways controlling ectoines metabolism. The availability of its genomic sequence, physiological, biochemical, genetic, and high performance transcriptomics data, previously obtained from our Research Group, together with regulatory studies (this work), will allow us to obtain a more global knowledge of the metabolism of the ectoines in C. salexigens. The aim of this PhD was two-fold. On the one hand, to gain insight on the regulatory circuits controlling the metabolism of ectoines in C. salexigens. On the other, to progress in the biomedical use of ectoine for the prevention and treatment of neurodegenerative diseases. The findings presented in this work provide clues for a better understanding of the complex regulation of ectoine metabolism and osmoadaptation in this moderately halophilic bacterium, and its contribution to adaptation to extreme environments. Our results will be overlayed on the existing high-quality genome-based metabolic model and global analyzes, in order to facilitate the rational design of new strains for Systems metabolic engineering. Additionally, we have investigated the in vitro and in vivo application of ectoine as neuroprotective- and inflammation-preventive- treatment in an Aβ murine model of Alzheimer's disease. Thus, we have got more insight in its potential applications in biomedicine, especially in neurodegenerative disorders as Alzheimer’s disease (AD). EupR is the first-described response regulator of a two-component system involved in bacterial osmoregulation (Rodríguez-Moya et al., 2010). Through in silico studies, EupK was selected as its putative cognate histidine kina

Introducción: La fascioliasis es un parasitismo producido por dos trematodos del género Fasciola, Fasciola hepatica y Fasciola gigantica. Este parasitismo tiene una especial relevancia en países como Asia, África y América del Sur, sin embargo, se han notificado casos en todos los continentes. Objetivos: Revisión del tratamiento del parasitismo y comparación entre los distintos métodos diagnósticos. Metodología: Se ha recurrido a diversas fuentes de información como libros, tesis doctorales, bases de datos, revistas y recursos electrónicos. Resultados y discusión: Triclabendazol es el tratamiento de elección del parasitismo, aunque debido a su uso masivo se ha notificado la aparición de resistencia. Por ello, en la actualidad se están buscando alternativas terapéuticas, como son Closantel y Oxiclozanida entre otros. En el diagnóstico contamos con métodos parasitológicos, inmunológicos y genético-moleculares. Los métodos parasitológicos resultan muy simples y baratos; no obstante, son laboriosos y su sensibilidad es especialmente baja, lo que obliga a tener que repetir numerosas veces las pruebas para poder obtener resultados fiables. Los métodos inmunológicos se basan en el uso de la técnica de Enzimoinmunoanálisis de Adsorción (ELISA) y estos suponen un aumento de la sensibilidad respecto a los anteriores. Existen dos tipos: ELISA para la detección de anticuerpos, que se considera la técnica más sensible, y ELISA para la detección de antígenos, que se consideran técnicas muy específicas. Los métodos genético-moleculares son los más recientes. Hay que destacar principalmente dos técnicas: Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) y Amplificación Isotérmica Mediada por Bucle (LAMP). Ambas son técnicas de amplificación de material genético y presentan buenos resultados de sensibilidad, aunque, como en el caso de los métodos inmunológicos, presentan el inconveniente de la necesidad de laboratorios con instrumentación especializada. Conclusiones: A pesar del gran avance

Introducción: la queratitis amebiana (QA) se considera una enfermedad emergente, siendo una de las principales causas de ceguera monocular. Objetivo: el propósito de este Trabajo de Fin de Grado es llevar a cabo una revisión bibliográfica de los casos de QA acontecidos en los últimos años, los factores de riesgos asociados, las técnicas de diagnóstico y los tratamientos más utilizados. Finalmente, exponer las medidas de prevención con el fin de minimizar los riesgos de sufrir esta patología. Metodología: la recopilación de los datos se hizo a partir de distintas fuentes bibliográficas. Los casos se diferenciaron en dos grupos: casos internacionales y nacionales, en cada grupo se compararon los casos según diferentes variables: pacientes usuarios/no usuarios de lentes de contacto (LC), diagnóstico inicial erróneo/correcto, los tratamientos utilizados, si/no se requirió trasplante de córnea. Adicionalmente, se realizó una encuesta sobre el buen uso y mantenimiento de las LC, para saber el conocimiento del usuario sobre los riesgo que supone un mal uso y mantenimiento de las LC. Resultados y discusión: los resultados mostraron que la QA predomina más en usuarios de LC blandas y se asocia al mal uso y mantenimiento de las lentes. Por otra parte, la facilidad con la que se confunde con otras queratitis hace que se retrase el diagnóstico y con ello el tratamiento. Además, se ha observado que la enfermedad presenta mejor pronóstico cuando es diagnosticada y tratada precozmente. Conclusión: ante la gran exposición a este parásito es esencial educar a los usuarios de LC en un correcto uso e higiene de estas, ya que con ello se reducen las posibilidades de desarrollar una queratitis por Acanthamoeba. Se debe llevar a cabo una buena anamnesis para detectar los factores de riesgo para realizar un correcto diagnóstico e iniciar cuanto antes el tratamiento.

En los últimos años, los avances en el conocimiento del microbioma humano han supuesto una revolucionaria respuesta a algunas preguntas sin contestar, referidas al desarrollo y padecimiento de determinadas enfermedades. La teoría de que el feto se desarolla en un ambiente estéril ha sido refutada por estudios recientes, utilizando técnicas dependientes de cultivo y técnicas moleculares, tanto en placenta como en líquido amniótico (LA) y cordón umbilical. Por tanto, el microbioma del LA puede suponer complicaciones en el devenir de la gestación, o por el contrario, participar en la protección del feto. Aunque el mecanismo exacto de transferencia de microorganismos es aún desconocido, se piensa que puede estar relacionado con el aumento de la permeabilidad de la mucosa materna, lo que permite un mayor paso de microorganismos desde el lumen a la sangre para después llegar a la placenta. De forma natural encontramos en el LA sustancias que protegen al feto como son las inmunoglobulinas, la lisozima o la transferrina. Sin embargo, pueden no ser suficientes si se produce una invasión microbiana de la cavidad amniótica por microorganismos con factores de virulencia y capacidad de evasión de las respuestas del sistema inmune, como ocurre con las especies del género Ureaplasma, provocando infecciones o ruptura prematura de membranas, entre otras complicaciones. Por otra parte, la presencia de microbiota en el ambiente uterino favorece la activación del sistema inmune en el feto y gracias a esta exposición al inicio de la vida, podría haber una menor incidencia de enfermedades a lo largo de la misma. Este trabajo bibliográfico comprende una revisión actualizada de los últimos hallazgos del microbioma del LA en relación con el desarrollo de enfermedades y sus implicaciones en el desarrollo de la gestación.

Introducción: El virus del papiloma humano (VPH) es el nombre que recibe un amplio grupo de virus que infectan la piel y las mucosas, produciendo lesiones tanto en hombres como en mujeres que, en determinadas ocasiones, pueden progresar hasta cáncer. Los genotipos 16 y 18 de este virus son los principales responsables del cáncer de cérvix, el cuarto cáncer más común en las mujeres. Por ello, el objetivo de este trabajo es el estudio de la biología molecular del VPH, su patogénesis y su implicación en el cáncer de cérvix. Metodología: Para la elaboración de este trabajo se han consultado artículos científicos utilizando distintas bases de datos, como Pubmed, y páginas web de organismos oficiales relacionadas con el tema. Resultados y discusión: La infección por VPH es el principal factor implicado en el desarrollo del cáncer de cérvix. El VPH consta de dos proteínas, E6 y E7, que son las principales responsables del proceso de carcinogénesis. La proteína L1 de la cápsida del virus también tiene gran importancia, pues se autoensambla en partículas de tipo viral (VLP) que tienen una alta capacidad inmunogénica, constituyendo la base para la fabricación de las vacunas. Las principales medidas de prevención de este tipo de cáncer son el diagnóstico precoz y la vacunación. Actualmente se dispone de tres vacunas, siendo Gardasil 9® la más completa ya que protege frente a 9 genotipos del virus de alto riesgo oncológico. Conclusiones: Es imprescindible conocer la biología del virus para comprender el proceso de carcinogénesis cervical e investigar en el futuro nuevas líneas de tratamiento. Actualmente, la mejor medida de prevención es la vacunación.

Los biopolímeros están ganando interés no solo en la industria alimentaria, textil, agrícola, cosmética o como alternativa a los plásticos, sino también en el ámbito farmacéutico y biomédico. Estos polímeros pueden ser obtenidos a partir de fuentes animales, vegetales o microorganismos. Esta revisión se centrará en los biopolímeros que son obtenidos por fermentación microbiana ya que, a diferencia de las otras alternativas de producción, nos aporta ventajas como mayor rentabilidad del proceso, modificación de los microorganismos para incrementar la producción, uso de inductores específicos y mejora de las rutas de su biosíntesis. Los polihidroxialcanoatos y los exopolisacáridos microbianos son biopolímeros con mayor interés farmacéutico y biomédico. Los primeros se acumulan como gránulos insolubles en el interior de diversos microorganismos, los segundos, sin embargo, son producidos y secretados al exterior de la célula. Ambos biopolímeros microbianos se caracterizan por poseer propiedades especiales que otros polímeros sintéticos no tienen, como biocompatibilidad, biodegradabilidad y no toxicidad hacia las células y tejidos humanos o animales. Además, posibilitan la modificación de muchas de sus propiedades como la rigidez, elasticidad, cristalinidad y degradabilidad, de forma sencilla dando lugar a una mejor adaptación del biopolímero a su uso en diversas aplicaciones. Entre sus numerosas aplicaciones farmacéuticas destaca la modificación de la liberación del fármaco, trasporte dirigido del fármaco hacia su diana terapéutica, atravesar barreras fisiológicas y la protección de agentes terapéuticos inestables en condiciones fisiológicas. Así mismo, tienen un papel fundamental en aplicaciones biomédicas para la formación de productos sanitarios, como vendas y apósitos, andamios en ingeniería de tejido que son utilizados en la reparación de tejidos óseos, cartílagos, vasculares, piel, medula ósea y conductos nerviosos. También han demostrado ser buenos adyuvantes de v