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332 results on '"Rupp, Rachel"'

101. Fine mapping of a QTL for mastitis resistance on OAR3 in Lacaune dairy sheep

Author

Rupp, Rachel, Senin, Pavel, Sarry, Julien, Bouchez, Olivier, Foucras, Gilles, Tosser-Klopp, Gwenola, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP)

Subjects
resistance, disequilibrium, lacaune, dairy sheep, mastitis, somatic cell score, qtl, [INFO]Computer Science [cs], [MATH]Mathematics [math], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2013

102. Genomic selection in the multi-breed French dairy goat population

Author

Carillier, Céline, Larroque, Helene, Palhiere, Isabelle, Clément, Virginie, Rupp, Rachel, Robert Granié, Christèle, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut de l'élevage (IDELE)

Subjects
genomic, marker, milk, [SDV]Life Sciences [q-bio], selection, dairy goat, production, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2013

103. 3SR: Sustainable Solutions For Small Ruminants – Responding To The Pace Of Change

Author

Tosser-Klopp, Gwenola, Moreno-Romieux, Carole, Rupp, Rachel, Bodin, Loys, Bishop, Stephen, 3SR Consortium,, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Roslin Institute, UE, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], small ruminant, 3sr, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2013

104. QTL detection for traits of interest for the dairy goat industry

Author

Maroteau, Cyrielle, Palhière, Isabelle, Larroque, Helene, Clément, Virginie, Tosser-Klopp, Gwenola, Rupp, Rachel, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
resistance, milk, composition, qtl, [SDV]Life Sciences [q-bio], goat, snp, detection, production, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2013
Full Text
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106. A first step toward genomic selection in the multi-breed French dairy goat population

Author

Carillier, Céline, Larroque, Helene, Palhière, Isabelle, Clément, Virginie, Rupp, Rachel, Robert Granié, Christèle, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), and This work was funded by the French Genovicap and Phenofinlait programs (ANR, Apis-Gène, CASDAR, FranceAgriMer, France Génétique Élevage, and French Ministry of Agriculture, Paris, France) and the European 3SR project. The first author benefitted from financial support from the Midi-Pyrénées region (Toulouse, France) and the SELGEN program of the French National Institute of Research in Agronomy (INRA, Paris, France).

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], dairy goat, female genotype, genomic evaluation, linkage disequilibrium
Abstract

International audience; The objectives of this study were to describe, using the goat SNP50 BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA), molecular data for the French dairy goat population and compare the effect of using genomic information on breeding value accuracy in different reference populations. Several multi-breed (Alpine and Saanen) reference population sizes, including or excluding female genotypes (from 67 males to 677 males, and 1,985 females), were used. Genomic evaluations were performed using genomic best linear unbiased predictor for milk production traits, somatic cell score, and some udder type traits. At a marker distance of 50 kb, the average r(2) (squared correlation coefficient) value of linkage disequilibrium was 0.14, and persistence of linkage disequilibrium as correlation of r-values among Saanen and Alpine breeds was 0.56. Genomic evaluation accuracies obtained from cross validation ranged from 36 to 53%. Biases of these estimations assessed by regression coefficients (from 0.73 to 0.98) of phenotypes on genomic breeding values were higher for traits such as protein yield than for udder type traits. Using the reference population that included all males and females, accuracies of genomic breeding values derived from prediction error variances (model accuracy) obtained for young buck candidates without phenotypes ranged from 52 to 56%. This was lower than the average pedigree-derived breeding value accuracies obtained at birth for these males from the official genetic evaluation (62%). Adding females to the reference population of 677 males improved accuracy by 5 to 9% depending on the trait considered. Gains in model accuracies of genomic breeding values ranged from 1 to 7%, lower than reported in other studies. The gains in breeding value accuracy obtained using genomic information were not as good as expected because of the limited size (at most 677 males and 1,985 females) and the structure of the reference population.

Published
2013
Full Text
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107. Deciphering the genetic variability of milk composition and qualitu in French dair goats

Author

Maroteau, Cyrielle, Palhière, Isabelle, Larroque, Helene, Clément, Virginie, Tosser-Klopp, Gwenola, Rupp, Rachel, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], variability, [SDV]Life Sciences [q-bio], milk composition, dairy goat, genetic, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

108. Response to a divergent selection based on somatic cell counts in Alpine dairy goats

Author

Rupp, Rachel, Caillat, Hugues, Bouvier, Frédéric, Guéry, E., Martin, Patrice, Rainard, Pascal, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, International Goat Asociation (IGA). Little Rock., Universidad de las Palmas de Gran Canaria. Las Palmas, ESP., Ministerio de Agricultura Alimentacion y Medio Ambiente. Gobierno., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA). Madrid, ESP., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), and European Association of Animal Production (EAAP). NOR.

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, milk, somatic cell count, goat, selection, Agricultural sciences, scc, resistance, production, cellule somatique, sélection divergente, race caprine alpine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Sciences agricoles
Abstract

International audience

Published
2012

109. QTL detection for milk production traits, fatty acids, udder morphology and milking speed in Alpine and Saanen goats

Author

Palhière, Isabelle, Maroteau, Cyrielle, Larroque, Helene, Clément, Virginie, Tosser-Klopp, Gwenola, Rupp, Rachel, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, International Goat Asociation (IGA). Little Rock., Universidad de las Palmas de Gran Canaria. Las Palmas, ESP., Ministerio de Agricultura Alimentacion y Medio Ambiente. Gobierno., and Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA). Madrid, ESP.

Subjects
milk, qtl, [SDV]Life Sciences [q-bio], morphology, goat, detection, artificial insemination, fatty acid, production, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

110. Les recherches en génomique des caprins : Etat d'avancement

Author

Larroque, Helene, Maroteau, Cyrielle, Carillier, Céline, Palhière, Isabelle, Rupp, Rachel, Robert-Granié, Christèle, Tosser-Klopp, Gwenola, Clément, Virginie, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], caprins, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, génomique
Abstract

National audience

Published
2012

111. Goat genome assembly, availability of an international 50K SNP chip and RH panel: an update of the international goat genome consortium projects

Author

Tosser Klopp, Gwenola, Cabau, Cédric, Eggen, Andre, Faraut, Thomas, Heuven, Henri, Jamli, Saadiah, Klopp, Christophe, Taylor Lawley, Cindy, McEwan, John, Martin, Patrice, Moreno, Carole, Mulsant, Philippe, Nabihoudine, Ibouniyamine, Pailhoux, Eric, Palhière, Isabelle, Rupp, Rachel, Sarry, Julien, Sayre, Brian, Tircazes, Aurelie, Wang, Jun, Wang, Wen, Yu, Tun-Ping, Zhang, Wenguang, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Faculty of Veterinary Medicine, Utrecht University [Utrecht], Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Biologie du Développement et Reproduction (BDR), UNCEIA, Capgenes and Apis-gene, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Biologie du développement et reproduction (BDR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Plant & Animal Genome (PAG). USA.

Subjects
sheep, cattle, goat, snp, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, genome
Abstract

Goat breeds, including dairy, meat and fiber breeds, are adapted to a wide range of breeding conditions, and have a large economic impact. Currently, however, they benefit from fewer genomic research tools compared to cattle or sheep. At present, the International Goat Genome Consortium (www.goat.genome.org) federates 3 projects, aiming at the improvement of knowledge of goat genome: - de novo goat genome sequence - RH panel and whole genome high density RH maps - 50K SNP chip. An update will be made on these three topics. Details will be given on the international goat SNP chip, developed using whole genome de novo sequencing and reduced representation libraries of the genome of Alpine, Saanen, Creole, Boer, Kacang and Savanna breeds. More than 500,000 SNP were chosen by filtering on flanking sequence data, minimum allele frequency, technological qualities and categorized depending on the number of breeds in which the 2 alleles were observed. 60,000 high quality SNPs were finally spaced on the goat genome, using goat contigs. 59,000 out of the 60,000 SNPs were aligned on the bovine genome. 100 % of the SNPs were observed as heterozygous in milk breeds, 97% in meat breeds. This chip, based on Illumina Infinium technology, has been used to generate cluster files on 288 animals, using both the breeds used for SNP discovery and Skopelos, Angora and Jinlan breeds.

Published
2012

112. Overview and results of PhenoFinlait, a large scaleproject for milk fat and protein composition analysis

Author

Boichard, Didier, Martin, Patrice, Miranda, Guy, Ferrand, M., Brunschwig, P., Govignon-Gion, Armelle, Larroque, Helene, Rupp, Rachel, Palhière, Isabelle, Chantry-Darmon, Céline, Lagriffoul, G., Lahalle , F., Fritz, S., Brochard, M., Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut de l'élevage (IDELE), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Analyse Génétique pour les Espèces Animales (LABOGENA), Centre National Interprofessionnel de l'Economie Laitière (CNIEL), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), and PhenoFinlait - Lactoscan ANR Apisgene

Subjects
bovin laitier, acide gras essentiel, [SDV]Life Sciences [q-bio], spectre infrarouge, acides gras, composition du lait, spectre moyen infra rouge, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

113. A genome scan for QTL affecting resistance to Haemonchus contortus in sheep

Author

Sallé, Guillaume, Jacquiet, Philippe, Gruner, L., Cortet, Jacques, Sauvé, Christine, Prévot, Françoise, Grisez, Christelle, Bergeaud, Jean-Paul, Schibler, Laurent, Tircazes, Aurelie, François, Dominique, Péry, Christophe, Bouvier, Frédéric, Thouly, Jean-Claude, Brunel, Jean-Claude, Legarra, Andres, Elsen, Jean Michel, Bouix, Jacques, Rupp, Rachel, Moreno, Carole, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), UR1282, Infectiologie Animale et Santé Publique, UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours

Subjects
Genetic Markers, Male, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, sheep, Genotyping Techniques, Sheep Diseases, Breeding, Polymorphism, Single Nucleotide, Parasite Load, resistance, linkage disequilibrium, quantitative trait loci, haemonchus contortus, parasitic diseases, Animals, Parasite Egg Count, Crosses, Genetic, Disease Resistance, Oligonucleotide Array Sequence Analysis, Hematocrit, Female, Haemonchus, France, résistance génétique, Haemonchiasis, Blood Chemical Analysis, Microsatellite Repeats
Abstract

Gastrointestinal nematodes are one of the main health issues in sheep breeding. To identify loci affecting the resistance to Haemonchus contortus, a genome scan was carried out using 1,275 Romane × Martinik Black Belly backcross lambs. The entire population was challenged with Haemonchus contortus in 2 consecutive experimental infections, and fecal egg counts (FEC) and packed cell volumes were measured. A subgroup of 332 lambs with extreme FEC was necropsied to determine the total worm burden, length of female worms, sex ratio in the worm population, abomasal pH, and serum and mucosal G immunoglobulins (IgG) responses. Pepsinogen concentration was measured in another subset of 229 lambs. For QTL detection, 160 microsatellite markers were used as well as the Illumina OvineSNP50 BeadChip that provided 42,469 SNP markers after quality control. Linkage, association, and joint linkage and association analyses were performed with the QTLMAP software. Linkage disequilibrium (LD) was estimated within each pure breed, and association analyses were carried out either considering or not the breed origin of the haplotypes. Four QTL regions on sheep chromosomes (OAR)5, 12, 13, and 21 were identified as key players among many other QTL with small to moderate effects. A QTL on OAR21 affecting pepsinogen concentration exactly matched the pepsinogen (PGA5) locus. A 10-Mbp region affecting FEC after the 1st and 2nd infections was found on OAR12. The SNP markers outperformed microsatellites in the linkage analysis. Taking advantage of the LD helped to refine the locations of the QTL mapped on OAR5 and 13.

Published
2012
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115. Réponse à une sélection divergente sur la concentration de cellules somatiques du lait chez la chèvre Alpine

Author

Caillat, Hugues, Bouvier, Frédéric, Rainard, Pascal, Martin, P., Clément, Virginie, Larroque, Helene, Guery, E., Rupp, Rachel, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), Capgènes, Institut de l'élevage (IDELE), Laboratoire Départemental d'Analyses du Cher, and Partenaires INRAE

Subjects
concentration cellule somatique, [SDV]Life Sciences [q-bio], staphylocoque, analyse bactériologique, CCS, génétique
Abstract

National audience; The heritability of goat milk somatic cell count (SCC) trait has been estimated to be around 0.20. Accordingly, it is possible to consider improving the mastitis resistance in goats by selection on sec. The aim of our study was to evaluate the consequences of SCC-based selection on intra-mammary infections in the goat. Using 23 progeny-tested AI bucks selected for extreme breeding values for somatic cell scores (SCS, logarithmic transformation of SCC), we created two groups of 61 High SCS and 44 Low SCS goats which were raised at the IN RA experimental facility of Bourges. Milk bacteriological analyses and sec of half-udders were performed at the kidding date and up to 8 monthly time points in first lactation. The mean sec was 1 384 000 cells/mL and 546 000 cells/mL for the High and Low SCS goats, respectively, with a significant difference of 1.2 point SCS. Regarding milk bacteriology results, 38% of samples were ·positive on average. The main bacterial types found were Coagulase Negative Staphylococci (58.4%) and especially S. xylosus (19.7%). The frequency of positive samples was significantly higher in the High SCS (46%±3) than in the Low SCS line (28%±3). Generally speaking, the cell count and the bacteriological status of the half udder were very well correlated. Indeed, the mean SCS was significantly higher for the positive than negative milk samples (3. 7±0.1 vs 4.3±0.1 ). Some bacterial types had a stronger impact on the SCS than others: S.aureus (5.5±0.5) and S.caprae (5.2±0.3) versus Bacillus (4.0±0.3) and negative samples (3 .6±0.1 ). Within the High SCS line, the SCS positive samples were significantly higher than negative samples (+0.9 point of SCS) while this difference was smaller in the Low SCS line. This observation can be explained by a higher quantity of pathogens in the positive samples of the High line than when compared to the Low line. These results suggest that the SCS-based selection in goats will decrease the prevalence of intra-mammary infections and the amount of bacteria within infected milk samples.; L’héritabilité de la concentration de cellules somatiques (CCS) a été estimée aux environs de 0,20 en caprins ce qui permet d'envisager d’améliorer la résistance aux mammites par une sélection sur ce caractère dans cette espèce. Pour évaluer les effets d'une telle sélection nous avons procrée et réalisé le suivi de deux lignées divergentes. Pour cela, après élaboration d'une evaluation genetique des CCS en race Alpine, nous avons sélectionné 23 boucs du schéma de sélection extrêmes pour ce caractère. A index de production comparables, les index CCS moyens des pères utilises différaient de près de 3 écart-types génétiques. 2 groupes de chèvres fortement divergentes (61 CCS+, 44 CCS-) ont fait l'objet d'analyses bactériologiques de lait et de CCS par hémi-mamelle à la mise-bas et a 8 reprises à 1 mois d'intervalle au cours de la 1ere lactation. La concentration cellulaire était en moyenne, de 1 384 000 cellules/mL et de 546 000 cellules/mL pour les chèvres de la lignée CCS+ et CCS-, respectivement, soit une différence significative de 1,2 point de score de cellules somatiques (SCS), après transformation logarithmique. En moyenne, 38% des prélèvements de lait étaient bactériologiquement positifs. Les types bactériens les plus fréquents étaient des staphylocoques a coagulase negative (58,4%), et principalement S. xylosus (19,7%). La fréquence des échantillons positifs était significativement plus élevée dans la lignée CCS+ (46%±3), que dans la lignée CCS- (28%±3). Globalement, la concentration cellulaire était très bien corrélée au statut bactériologique de l'hémi-mamelle. En effet, le SCS moyen a été significativement plus élevé dans les échantillons positifs que dans les échantillons négatifs (3,7±0,1 vs 4,3±0,1). Certains types bactériens ont eu un impact plus fort que d'autres sur le SCS : S.aureus (5,5±0,5), et S.caprae (5,2±0,3) versus Bacillus (4,0±0,3) et prélèvements négatifs (3,6±0,1). La quantité de germes dans l’échantillon a eu également un impact significatif sur le SCS. Au sein de la lignée CCS+, les prélèvements positifs ont eu des SCS significativement supérieurs aux prélèvements négatifs (+0,9 point de SCS) alors que la différence a été moindre dans la lignée CCS-. Cette observation semble être due principalement au fait qu'il y ait en général une quantité plus importante de germes dans les échantillons positifs de la lignée CCS+ que dans ceux de la lignée CCS-. Ces résultats donnent a penser qu'une sélection basée sur le CCS chez les caprins pour diminuer la fréquence des infections intra-mammaires et la quantité de bactéries présentes dans le lait en cas d'infection serait efficace.

Published
2011

116. A case control study on genome wide SNP-based association mapping of mammary abscesses in Lacaune sheep using the Illumina ovine SNP50 BeadChip

Author

bonnefont, Cécile, Foucras, Gilles, Salle, Guillaume, Teyssedre, Simon, Allain, Charlotte, Aurel, Marie-Rose, Bergonier, Dominique, Moreno, Carole, Rupp, Rachel, Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE)

Subjects
mammary abscesses, ovine, sheep, [SDV]Life Sciences [q-bio], SNP, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2011

117. Genomic mapping of resistance to Haemonchus contortus using the high-density ovineSNP50 beachchip

Author

Salle, Guillaume, Moreno, Carole, Gruner, Lucas, Cortet, Jacques, Sauvé, Christine, Prévot, Françoise, Bouvier, Frédéric, François, Dominique, Péry, Christophe, Bouix, Jacques, Legarra, Andres, Rupp, Rachel, Jacquiet, Philippe, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), and Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES)

Subjects
haemonchus contortus, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2011

118. Towards a high density SNP International Goat Chip

Author

Tosser-Klopp, Gwenola, Jiken, Abdullah Johari, Bardou, Philippe, Cabau, Cédric, Dehais, Patrice, Faraut, Thomas, Heuven, Henri, Klopp, Christophe, Martin, Patrice, Moreno-Romieux, Carole, Mulsant, Philippe, Pailhoux, Eric, Palhiere, Isabelle, Rupp, Rachel, Sarry, Julien, Wang, J., Wang, W., Yu, Tun-Ping, Zhang, Wenguang, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Strategic Livestock Research Centre, Malaysian Agricultural Research Development Institute, Utrecht Universtiy, Faculty of Veterinary Medicine, Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), BGI-Shenzhen, Bejing Genome Institute, State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution, Kunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences [Beijing] (CAS)-Chinese Academy of Sciences [Beijing] (CAS), DNA Landmarks, caprinisp, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie du développement et reproduction (BDR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Beijing Genomics Institute [Shenzhen] (BGI)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], goat, snp
Abstract

According to FAO, in 2009, the world population of goats was estimated to be around 868 million animals and was steadily growing either in developed or developing countries. Goat breeds include dairy, meat and fiber breeds, are adapted to a wide range of breeding conditions and have thus a great economic importance. However, they benefit from fewer genomic research tools, as compared to cattle or sheep. Recently, several research projects were conducted in different laboratories to improve goat genome knowledge and develop new research tools. Goat genome was sequenced de novo (see W. Zhang presentation, this meeting), a RH panel was developed (see B. Sayre presentation, this meeting). In France, a collaborative SNP discovery research programme, CAPRISNIP, was launched by INRA and breeding organisations CAPGENES and APIS-GENE in 2009. At least two other SNP discovery projects were launched in other countries, using either reduced representations of the genome (University of Utrecht, Netherlands) or whole genome de novo sequencing (Malaysian Agricultural Research and Development Institute). RNA-sequencing projects conducted by different research groups at INRA may also be a valuable source for SNP discovery and annotation. We propose to federate these several SNP discovery and RNA-seq research programmes within the frame of the International Goat Genome Consortium in order to develop an international versatile high density SNP chip. Collection of the data is underway. SNP detection will be done in early 2011. The work plan includes i) alignment of the different sequences on de novo assembled goat contigs ii) ordering of contigs on ovine or bovine genome reference sequence iii)SNP discovery and annotation iv) small set SNP test generation v) determination of the SNP panel vi) raw data access to all partners. A first international chip order is planned for autumn 2011.

Published
2011

119. National genetic evaluations in dairy sheep and goats in France

Author

Larroque, Helene, Astruc, Jean-Michel, Barbat, Anne, Barillet, Francis, Boichard, Didier, Bonaiti, Bernard, Clément, Virginie, David, Ingrid, Lagriffoul, Gilles, Palhiere, Isabelle, Piacère, Agnès, Robert Granié, Christèle, and Rupp, Rachel

Subjects
DAIRY SHEEP, GOATS, EVALUATIONS, GENETIC, EBVs, SNP, MILK, SCS, SOMATIC CELL SCORE, LACAUNE, REPEATABILITY
Published
2011

120. Génomique fonctionnelle et mammites

Author

Foucras, Gilles, Rupp, Rachel, Rainard, Pascal, Martin, Patrice, Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Absent, ProdInra, Archive Ouverte, Félicie Lahalle-Faucon, Dominique Montagu, INRA, Institut de l'Elevage - (FRA), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], mammite
Abstract

absent

Published
2011

121. Méta-analyse des analyses transcriptomiques de la réponse à Staphylococcus aureus de deux lignées divergentes de brebis sélectionnées sur la résistance aux infections mammaires

Author

bonnefont, Cécile, Foucras, Gilles, Toufeer, Mehdi, Caubet, Cécile, Tasca, Christian, Aurel, Marie-Rose, Robert Granié, Christèle, Cunha, Patricia, Gilbert, Florence, Rainard, Pascal, Rupp, Rachel, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], OVINS, [SDV]Life Sciences [q-bio], MAMMAIRES, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, RESISTANCE, SCS
Abstract

National audience

Published
2011

122. Méta-analyse des transcriptomes de la réponse à Staphylococcus aureus de deux lignées divergentes de brebis sélectionnées sur la résistance aux infections mammaires

Author

bonnefont, Cécile, Foucras, Gilles, Toufeer, Mehdi, Caubet, Cécile, Aurel, Marie-Rose, Robert Granié, Christèle, Cunha, Patricia, Gilbert, Florence, Rainard, Pascal, Rupp, Rachel, ProdInra, Migration, Tissus animaux, nutrition, digestion, écosystème et métabolisme (TANDEM), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), and Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], resistance genetique aux mammites, [INFO]Computer Science [cs], [INFO] Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2011

123. Analyses transcriptomiques de la réponse des cellules de la glande mammaire à Staphylococcus aureus dans deux lignées divergentes de brebis sélectionnées sur la numération cellulaire du lait

Author

bonnefont, Cécile, Foucras, Gilles, Toufeer, Mehdi, Caubet, Cécile, Aurel, Marie-Rose, Robert Granié, Christèle, Cunha, Patricia, Gilbert, Florence, Rainard, Pascal, Rupp, Rachel, ProdInra, Migration, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), and Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], MAMMITE, [SDV]Life Sciences [q-bio], BREBIS, TRANSCRIPTOME, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, RESISTANCE
Abstract

National audience

Published
2011

124. PhénoFinlait, a French national program for high scale phenotyping and genotyping to study fine composition of small ruminant milks

Author

Lagriffoul, Gilles, Dragan, Coralie, Varenne, Amandine, Astruc, Jean-Michel, Brochard, Mickael, Barillet, Francis, Douguet, M., Esvan, S., Faucon-Lahalle, F., Ferrand, M., Larroque, Helene, Legarto, J., Maroteau, Cyrielle, Rupp, Rachel, Thomas, G., Palhière, Isabelle, Institut de l'élevage (IDELE), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
MILK, SHEEP, QTL, [SDV]Life Sciences [q-bio], GOAT, FATTY ACID, MIR, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2011

125. PhénoFinlait, les résultats : Influence de l'alimentation, de l'état physiologique et de la génétique sur la composition en acides gras des laits de vache, brebis et chèvre

Author

Esvan, S., Dragan, C., Varenne, A., Astruc, J.M., Barillet, Francis, Boichard, Didier, Brunschwig, P., Dubrulle, A., Faucon-Lahalle, F., Ferlay, Anne, Lagriffoul, G., Larroque, Helene, Legarto, J., Palhiere, Isabelle, Peyraud, Jean-Louis, Rupp, Rachel, Brochard, M., 149 rue de Bercy, Institut de l'élevage (IDELE), BP 42118, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Production du lait (PL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut de l'Elevage, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station d'Amélioration Génétique des Animaux ( SAGA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Production du lait ( PL ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST

Subjects
OVINS, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], BOVINS, PHENOFINLAIT, CAPRINS
Abstract

absent

Published
2010

126. Les protéines de la membrane du globule gras. Ou comment des protéines nous racontent la biologie de la cellule épithéliale mammaire

Author

Cebo, Christelle, Froissard, Marine, Lopez, Christelle, Hurtaud, Catherine, Henry, Celine, Beauvallet, Christian, Bevilacqua, Claudia, Rebours, Emmanuelle, Bouvier, Frédéric, Rupp, Rachel, Caillat, Hugues, Martin, Patrice, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Production du lait (PL), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UR Génomique et Physiologie de la Lactation (1196)., AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
matière grasse laitière, protéine, lactadhérine, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, cellule épithéliale mammaire, membrane, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract

absent

Published
2010

127. A Point Mutation in Suppressor of Cytokine Signalling 2 (Socs2) Increases the Susceptibility to Inflammation of the Mammary Gland while Associated with Higher Body Weight and Size and Higher Milk Production in a Sheep Model

Author

Rupp, Rachel, primary, Senin, Pavel, additional, Sarry, Julien, additional, Allain, Charlotte, additional, Tasca, Christian, additional, Ligat, Laeticia, additional, Portes, David, additional, Woloszyn, Florent, additional, Bouchez, Olivier, additional, Tabouret, Guillaume, additional, Lebastard, Mathieu, additional, Caubet, Cécile, additional, Foucras, Gilles, additional, and Tosser-Klopp, Gwenola, additional

Published
2015
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128. The present situation and perspectives on milking and milk production of dairy sheep in Europe, the Middle East and North America

Author

Marnet, Pierre-Guy, Lagriffoul, Gilles, Morin, E., Allain, Charlotte, Larroque, Helene, Rupp, Rachel, Astruc, J.M., Dessauge, Frederic, Boutinaud, Marion, Lollivier, Vanessa, Duvallon, Ophelie, Aurel, Marie-Rose, Autran, Paul, Barillet, Francis, Production du lait (PL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), BP 42118, Institut de l'élevage (IDELE), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE)

Subjects
PRODUCTION, MILK, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], INTERNATIONAL, DAIRY SHEEP, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2010

129. An integrated genomics approach towards analysis of resistance to mastitis in ruminants

Author

Rupp, Rachel, bonnefont, Cécile, Bergonier, Dominique, Aurel, Marie-Rose, Martin, Patrice, Jacquiet, Philippe, Moreno-Romieux, Carole, Robert-Granie, Christèle, Rainard, Pascal, Foucras, Gilles, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), and ProdInra, Archive Ouverte

Subjects
SELECTION, PRODUCTION, ComputingMilieux_THECOMPUTINGPROFESSION, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputerSystemsOrganization_COMPUTER-COMMUNICATIONNETWORKS, GENETIC, STAPHYLOCOCCUS, INFECTIOUS DISEASES, RUMINANTS, [SDV] Life Sciences [q-bio], MILK, SHEEP, MASTITIS, ComputingMethodologies_DOCUMENTANDTEXTPROCESSING, STREPTOCOCCUS, InformationSystems_MISCELLANEOUS, GENOMICS, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

Diffusion du document : ID 759; absent

Published
2010

130. Differential Transcriptional Response To Staphylococcus aureus Infection In Two Divergent Lines Of Sheep Selected On Milk Somatic Cell Score

Author

Bonnefont, Cécile, Foucras, Gilles, Toufeer, Mehdi, Caubet, Cécile, Aurel, Marie-Rose, Robert-Granié, Christèle, Cunha, Patricia, Gilbert, Florence B., Rainard, Pascal, Rupp, Rachel, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Domaine Expérimental de La Fage - LA FAGE (Roquefort-sur-Soulzon, France), Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), ProdInra, Migration, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse - ENVT (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), and Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE)

Subjects
[SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Santé, [SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, [SDV]Life Sciences [q-bio], Staphylococcus, Resistance, Aureus, Somatic cell score- Sheep, Mastitis, Ruminants, Microarray, Resitance, [SDV] Life Sciences [q-bio], Médecine vétérinaire et santé animal, Milk, SHEEP, SOMATIC CELL SCORE, Infectious diseases, Transcritomic, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, SCS
Abstract

International audience; The milk somatic cell score (SCS) is an indirect indicator of mastitis, currently used as a selection criterion of dairy ruminants that leads to decreased intra-mammary infection prevalence. In the present study, gene expression profiles after Staphylococcus stimulations were determined in three cell types of mastitis resistant and susceptible ewes. The comparisons of the lists of the differentially-expressed genes allowed identification of commonly-regulated genes among cell types. These results lead to identify a subset of genes involved in pathogen-related receptor signaling. These genes may play an important role in recognition of pathogens and may improve resistance to intramammary infections.

Published
2010

131. QTL detection for resistance to Haemonchus contortus in sheep : A preliminary study using the ovineSNP50 beadchip

Author

Salle, Guillaume, Jacquiet, Philippe, Gruner, L., Cortet, Jacques, Prévot, F., Bouvier, Frédéric, François, Dominique, Perry, C., Bouix, Jacques, Legarra, Andres, Rupp, Rachel, Moreno, Carole, Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), and Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA)

Subjects
resistance, sheep, snp50, haemonchus contortus, beadchip, qtl, nematode, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2010

132. Use of genomic data in French dairy sheep breeding programs : Results an Prospects

Author

Astruc, J.M., Lagriffoul, Gilles, Larroque, Helene, Legarra, Andres, Moreno, Carole, Rupp, Rachel, Barillet, Francis, BP 42118, Institut de l'élevage (IDELE), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
genomic, [SDV]Life Sciences [q-bio], breeding sheme, selection, snp, dairy sheep, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2010

133. Preliminary results of a QTL detection study for resistance to Haemonchus contortus in sheep using the OvineSNP50 beadchip

Author

Salle, Guillaume, Jacquiet, Philippe, Gruner, L., Cortet, Jacques, Sauvé, Christine, Prévot, F., Bouvier, Frédéric, François, Dominique, Péry, Christophe, Bouix, Jacques, Legarra, Andres, Rupp, Rachel, Moreno, Carole, Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES), and Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA)

Subjects
resistance, sheep, haemonchus contortus, beadchip, qtl, [SDV]Life Sciences [q-bio], ovinesnp50, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2010

134. Transcriptional response to Staphylococcus aureus challenge in mammary epithelial cells isolated from genetically selected ewes on milk somatic cell score

Author

bonnefont, Cécile, Rainard, Pascal, Gilbert, Florence, Cunha, Patricia, Aurel, Marie-Rose, Caubet, Cécile, Toufeer, Mehdi, Robert Granié, Christèle, Rupp, Rachel, Foucras, Gilles, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
TRANSCRIPTOMIC, [SDV]Life Sciences [q-bio], MASTITIS, DIVERGENT SELECTION, MAMMARY EPITHELIAL CELLS, DAIRY SHEEP, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2010

135. Genetics of adaptation traits for harsh environment

Author

François, Dominique, Boissy, Alain, Jacquiet, Philippe, Allain, Daniel, Bibé, Bernard, Rupp, Rachel, Moreno, Carole, Bodin, Loys, Hazard, Dominique, Bouix, Jacques, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], SHEEP, GENETICS, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [SHS] Humanities and Social Sciences, HARSH ENVIRONMENT, [INFO] Computer Science [cs], ADAPTATION TRAITS, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract

National audience

Published
2010

136. Sheep breeding programs in France using modern reproductive methods : Application for genetic improvement of scrapie resistance in the national sheep flock

Author

Lagriffoul, Gilles, Astruc, Jean-Michel, Barillet, Francis, Bouix, Jacques, Bouffartigue, B., François, Dominique, Larroque, Helene, Praud, J.P., Raoul, J., Rupp, Rachel, Sidani, Chloe, Tiphine, Laurent, Institut de l'élevage (IDELE), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Races de France

Subjects
REPRODUCTION, INSEMINATION, SHEEP, [SDV]Life Sciences [q-bio], GENETIC, PROGRAM, METHODS, SCRAPIE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, RESISTANCE
Abstract

National audience

Published
2010

137. La cinétique d'émission du lait et l'anatomie de la mamelle sont associées à la résistance aux mammites : Résultats d'une sélection divergente de brebis sur les comptages de cellules somatiques

Author

Allain, Charlotte, Aurel, Marie-Rose, Pailler, Francois, Portes, David, Menras, Jean Marie, Carriere, Fabien, Duvallon, Ophelie, Pena-Arnaud, Bérengère, Caillat, Hugues, Marie Etancelin, Christel, Arhainx, Jean-Marie, Dion, Stephane, Bergonier, Dominique, Foucras, Gilles, Rupp, Rachel, ProdInra, Migration, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), BotAnique et BioinforMatique de l'Architecture des Plantes, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], OVINS, [SDV]Life Sciences [q-bio], LA CINETIQUE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, RESISTANCE, CCS
Abstract

International audience

Published
2010

138. La sélection des ruminants laitiers pour des numérations cellulaires faibles et les conséquences sur leur sensibilité aux mammites

Author

Rupp, Rachel, Astruc, Jean-Michel, Fritz, Sébastien, Barbat, Anne, Boichard, Didier, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Service Génétique, Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut de l'élevage (IDELE), and Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA)

Subjects
ruminant laitier, [SDV]Life Sciences [q-bio], résistance, ccs
Abstract

Depuis 1997, les objectifs de sélection des bovins laitiers français, puis des ovins en 2002, incluent la résistance aux mammites. La sélection s'appuie sur la diminution d'un critère indirect : la moyenne par lactation des comptages de cellules somatiques (CCS) du lait. Les index CCS des taureaux sont étroitement associés à la fréquence des mammites cliniques observées dans leur descendance. De plus, les premiers résultats d'une expérience ovine de sélection divergente montrent des conséquences favorables chez les filles à numérations cellulaires faibles : la fréquence des infections intra-mammaires subcliniques et cliniques est diminuée et les conséquences de ces infections sont réduites. Cet article fait l'état des lieux du programme de sélection basés sur les CSS. Il aborde les conséquences d'une telle sélection ainsi que ses perspectives d'évolution notamment en terme de sélection génomique.

Published
2010

139. Genetics of adaptation traits for harsh environment in sheep

Author

François, Dominique, Boissy, Alain, Jacquiet, Philippe, Allain, Daniel, Bibé, Bernard, Rupp, Rachel, Moreno, Carole, Bodin, Loys, Hazard, Dominique, Bouix, Jacques, ProdInra, Migration, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], ENVIRONMENT, SHEEP, [SDV]Life Sciences [q-bio], GENETIC, HARSH, [INFO]Computer Science [cs], [SHS] Humanities and Social Sciences, [INFO] Computer Science [cs], ADAPTATION TRAITS, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract

International audience

Published
2010

140. Genetic improvement of adaptation traits to harsh environment in Ruminants

Author

François, Dominique, Allain, Daniel, Foulquie, Didier, Boissy, Alain, Jacquiet, Philippe, Moreno, Carole, Rupp, Rachel, Bodin, Loys, Hazard, Dominique, Bouix, Jacques, ProdInra, Migration, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], OVINS, MILIEUX DIFFICILES, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [SHS] Humanities and Social Sciences, GENETIQUE, [INFO] Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract

National audience

Published
2010

141. QTL affecting resistance to gastro intestinal parasite infection in sheep : which applications in selection programs ?

Author

Moreno, Carole, Sallé, Guillaume, Gruner, Lucas, Cortet, Jacques, Sauvé, Christine, Prévot, Françoise, François, Dominique, Bouvier, Frédéric, Péry, Christophe, Bouix, Jacques, Legarra, Andres, Rupp, Rachel, Jacquiet, Philippe, ProdInra, Migration, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES)

Subjects
resistance, [SDV] Life Sciences [q-bio], sheep, [SDV]Life Sciences [q-bio], qtl, parasite, selection, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, gastro intestinal
Abstract

International audience

Published
2010

142. Design and Characterization of a 52K SNP Chip for Goats

Author

Amills i Eras, Marcel, Tosser-Klopp, Gwenola, Bardou, Philippe, Bouchez, Olivier, Cabau, Cédric, Crooijmans, Richard, Dong, Yang, Donnadieu-Tonon, Cécile, Eggen, André, Heuven, Henri C. M., Jamli, Saadiah, Johari Jiken, Abdullah, Klopp, Christophe, Lawley, Cynthia T., McEwan, John, Martin, Patrice, Moreno, Carole R., Mulsant, Philippe, Nabihoudine, Ibouniyamine, Pailhoux, Eric, Palhière, Isabelle, Rupp, Rachel, Sarry, Julien, Sayre, Brian L., Tircazes, Aurélie, Wang, Jun, Wang, Wen, Zhang, Wenguang, International Goat Genome Consortium, Amills i Eras, Marcel, Tosser-Klopp, Gwenola, Bardou, Philippe, Bouchez, Olivier, Cabau, Cédric, Crooijmans, Richard, Dong, Yang, Donnadieu-Tonon, Cécile, Eggen, André, Heuven, Henri C. M., Jamli, Saadiah, Johari Jiken, Abdullah, Klopp, Christophe, Lawley, Cynthia T., McEwan, John, Martin, Patrice, Moreno, Carole R., Mulsant, Philippe, Nabihoudine, Ibouniyamine, Pailhoux, Eric, Palhière, Isabelle, Rupp, Rachel, Sarry, Julien, Sayre, Brian L., Tircazes, Aurélie, Wang, Jun, Wang, Wen, Zhang, Wenguang, and International Goat Genome Consortium

Abstract

The success of Genome Wide Association Studies in the discovery of sequence variation linked to complex traits in humans has increased interest in high throughput SNP genotyping assays in livestock species. Primary goals are QTL detection and genomic selection. The purpose here was design of a 50-60,000 SNP chip for goats. The success of a moderate density SNP assay depends on reliable bioinformatic SNP detection procedures, the technological success rate of the SNP design, even spacing of SNPs on the genome and selection of Minor Allele Frequencies (MAF) suitable to use in diverse breeds. Through the federation of three SNP discovery projects consolidated as the International Goat Genome Consortium, we have identified approximately twelve million high quality SNP variants in the goat genome stored in a database together with their biological and technical characteristics. These SNPs were identified within and between six breeds (meat, milk and mixed): Alpine, Boer, Creole, Katjang, Saanen and Savanna, comprising a total of 97 animals. Whole genome and Reduced Representation Library sequences were aligned on >10 kb scaffolds of the de novo goat genome assembly. The 60,000 selected SNPs, evenly spaced on the goat genome, were submitted for oligo manufacturing (Illumina, Inc) and published in dbSNP along with flanking sequences and map position on goat assemblies (i.e. scaffolds and pseudo-chromosomes), sheep genome V2 and cattle UMD3.1 assembly. Ten breeds were then used to validate the SNP content and 52,295 loci could be successfully genotyped and used to generate a final cluster file. The combined strategy of using mainly whole genome Next Generation Sequencing and mapping on a contig genome assembly, complemented with Illumina design tools proved to be efficient in producing this GoatSNP50 chip. Advances in use of molecular markers are expected to accelerate goat genomic studies in coming years.

Published
2014

143. SNP detection in goats : A first step towards goat genomics

Author

Palhière, Isabelle, Moreno, Carole, Klopp, Christophe, Clément, Virginie, Lecomte, C., Martin, P., Rupp, Rachel, Mulsant, Philippe, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), Institut de l'élevage (IDELE), France Contrôle Laitier, Capgènes, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
CAPRINS, [INFO]Computer Science [cs], [MATH]Mathematics [math], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, GENOMIQUE
Abstract

National audience

Published
2009

144. La sélection génétique des ruminants laitiers pour des numérations cellulaires faibles et les conséquences sur leur sensibilité aux mammites

Author

Rupp, Rachel, Fritz, Sébastien, Barbat, Anne, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service Génétique, Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Union nationale des coopératives d’élevage et d’insémination animale (UNCEIA), Société Nationale des Groupements Techniques Vétérinaires (SNGTV). FRA., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
bovin laitier, [SDV]Life Sciences [q-bio], ovin laitier, ccs, mammite, génétique, comptage de cellules somatiques
Abstract

absent

Published
2009

145. Response to mammary infection in two divergent lines of ewes selected on milk somatic cell counts : transcriptomic analyses of milk cells upon challenge

Author

bonnefont, Cécile, Rupp, Rachel, Caubet, Cécile, Toufeer, Mehdi, Robert Granié, Christèle, Foucras, Gilles, ProdInra, Migration, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], DAIRY EWES, IDENTIFICATION, HERITABILITY, MAMMARY INFECTION, [SDV]Life Sciences [q-bio], MILK SOMATIC, MAMMARY INOCULATION, TRANSCRIPTOMIC, MASTITIS RESISTANCE, DAIRY CATTLE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, SCS
Abstract

International audience

Published
2009

146. Toward implementation of selection for mastitis resistance in dairy goats

Author

Rupp, Rachel, Caillat, Hugues, Clément, Virginie, PIACERE, Agnès, Manfredi, Eduardo, Robert-Granie, Christele, Bouvier, Frédéric, Institut de l'élevage (IDELE), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, goats, selection experiment, MAMMITE, [SDV]Life Sciences [q-bio], SELECTION DIVERGENTE, COMPTAGE CELLULES SOMATIQUES, PARAMETRES GENETIQUES, CAPRIN, mastitis, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, RESISTANCE
Abstract

National audience

Published
2008

147. Amélioration de la santé, de la qualité des produits et des performances de ruminants en systèmes d'élevage biologiques ou à faibles intrants : le projet BETTERBREEDS

Author

François, Dominique, Bouix, Jacques, Barillet, Francis, Rupp, Rachel, Jacquiet, Philippe, Boissy, Alain, Allain, Daniel, Moreno, Carole, Bibé, Bernard, Hassoun, Philippe, Jouven, M., Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], sheep, [SDV]Life Sciences [q-bio], low input system, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, milieu à bas intrant
Abstract

National audience

Published
2008

149. Breeding for mastitis resistance : scc-based selection in sheep and first results from a divergent selection experiment

Author

Rupp, Rachel, Bergonier, Dominique, Dion, Stephane, Hygonenq, Marie Claude, Aurel, Marie-Rose, Robert Granié, Christèle, Foucras, Gilles, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Domaine expérimental de La Fage (LA FAGE), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], SOMATIC CELL COUNT, MILK, SHEEP, [SDV]Life Sciences [q-bio], INFECTION, MASTITIS RESISTANCE, IMI, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, SCC
Abstract

International audience

Published
2008

150. Etude de la réponse à une infection expérimentale par un parasite gastro-intestinal chez des chèvres de race Alpine

Author

Caillat, Hugues, Jacquiet, Philippe, Bouvier, Frédéric, Péry, Christophe, Bouix, Jacques, Rupp, Rachel, Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Domaine expérimental Bourges-La Sapinière (BOURGES)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], RACE ALPINE
Abstract

National audience; Depuis quelques années, le système de production de caprins laitiers s’oriente vers une utilisation privilégiée du pâturage, mais cette pratique est fréquemment associée à des problèmes de parasitisme. Notre étude a consisté à mettre en place un modèle d’infestation expérimental par un parasite de la caillette (Haemonchus contortus) qui confère un fort pouvoir discriminant entre les animaux forts et faibles répondeurs, d’après des études menées chez les ovins (Terefe et al., 2007). Les objectifs étaient de caractériser la réponse de l’hôte, d’évaluer les conséquences sur la production et d’étudier la variabilité de cette réponse entre individus.

Published
2007

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