El Caballo de Pura Raza Menorquina (PRMe) es una raza equina autóctona, catalogadaen Peligro de Extinción según el Catálogo oficial de Razas de Ganado de España (OrdenAAA/251/2012 de 9 de Febrero, por la que se modifica el Anexo I del RD 2129/2008, de26 de diciembre. BOE-A-2012-2254). Desde 1988 está reconocida como raza pura,explotándose principalmente en la Isla de Menorca (Islas Baleares -España-). SuPrograma de Mejora Genética se aprobó mediante la resolución del 10 de marzo de 2010(BOE-A-2010-5478). El Caballo PRMe es un animal adecuado para la equitación,participando en competiciones deportivas de Doma Clásica y Doma Menorquina, y para lasilla, siendo tradicionalmente el protagonista de las fiestas patronales de Menorca, “ElJaleo”.En cualquier raza equina en Peligro de Extinción, que se seleccione en función de surendimiento morfo-funcional, es preciso realizar, como paso previo a la puesta en marcade un Programa de Mejora, una caracterización fenotípica de los rasgos de mayor interéspara la raza que se quieran seleccionar y las relaciones existentes entre ellos. Ensegundo lugar, es necesario realizar un análisis genético de los caracteres morfofuncionalesseleccionados, determinando sus parámetros genéticos (heredabilidades ycorrelaciones genéticas) con el fin de precisar las variables más adecuadas en las quebasar la selección de los reproductores de la población. Y por último, es precisoestablecer, en base a la información genealógica, molecular y genética, el diseño de unprograma conjunto de selección y conservación de la raza que permita asegurar susupervivencia, haciéndola competitiva en el entorno económico donde se desarrolla. Porello, la presente Tesis Doctoral se ha estructurado en tres capítulos: ? Capítulo 1: “Caracterización fenotípica de caracteres morfo-funcionales delCaballo Pura Raza Menorquina” ? Capítulo 2: “Análisis genético de caracteres morfo-funcionales del Caballo PuraRaza Menorquina” ? Capítulo 3: “Desarrollo de estrategias conjuntas de selección y de conservaciónde la biodiversidad genética en el Caballo Pura Raza Menorquina”En el primer capítulo se ha abordado una caracterización fenotípica a partir de distintasvariables morfo-funcionales analizadas en el Caballo PRMe. Para ello, se realizaron 47medidas zoométricas y se estimaron 10 índices corporales a 147 hembras y 200 machosde la raza (con edades comprendidas entre 4 y 14 años), durante los años 2009 y 2010.Los machos se clasificaron en tres grupos, en función de su aptitud funcional (DomaClásica, Doma Menorquina y Ocio), determinando mediante un test Duncan múltiple y unanálisis de Componentes Principales (PCA) las diferencias morfo-funcionales existentesentre los tres grupos..., The Menorca Purebred horse (PRMe), is an autochthonous equine breed, catalogued asin Danger of Extinction (Official catalog of Livestock Breeds in Spain – in the latest updateincluded in Order AAA/251/2012 (9 February), which modified Annex I of RD 2129/2008(26 December) BOE-A-2012-2254). Since 1988, it has been recognized as a Purebred,and is exploited mainly on the island of Menorca (Balearic Islands, Spain). Its BreedingProgram was approved by the resolution dated 10 March 2010 (BOE-A-2010-5478). ThePRMe is an equine breed suitable for riding, which participates in both Classic andMenorca Dressage competitions, and is especially suitable for saddle, which makes it theprotagonist of the popular festivities of Menorca, "El Jaleo".In any equine breed in Danger of Extinction to be selected for its morpho-functionalperformance, an essential previous step before starting a Breeding Program is thephenotypical characterization of the most interesting features of the breed to be selectedand the relations between them. Secondly, it is necessary to carry out a genetic analysis ofthe morpho-functional characters selected, and determine their genetic parameters(heritabilities and genetic correlations). The results obtained could allow us to determinethe variables on which to base the selection of the breeding population. And finally, wemust establish, based on genealogical, molecular and genetic information, the design of ajoint program of selection and preservation of the breed which would ensure its survivaland make it competitive in the economic environment in which it is bred. This DoctoralThesis has therefore been divided into three chapters: Chapter 1: “Phenotypical characterization of morpho-functional characters of theMenorca Purebred horse” Chapter 2: “Genetic analysis of morpho-functional characters of the MenorcaPurebred horse” Chapter 3: “Design of joint strategies for selection and the conservation ofgenetic biodiversity of the Menorca Purebred horse”In the first chapter, a phenotypical characterization of the different morpho-functionalvariables analyzed in the PRMe breed is presented. To accomplish this, 47 bodymeasurements were taken and 10 body indices were estimated for 147 females and 200males of the breed (between 4 and 14 years old), during the years 2009 and 2010. Themales were classified into three different performance aptitude groups (ClassicalDressage, Menorca Dressage and Leisure), and a Duncan's multiple-range test and aPrincipal Component Analysis (PCA) were used to determine the existing differenceswithin the three groups.For the functional analysis, 35 PRMe stallions (aged between 3 and 10 years old) wererecorded, under the same experimental and environmental conditions, using a 3Dsemiautomatic movement analysis system. The functional characterization was carried outfor a total of 24 kinematic variables (temporal, linear, and angular) at the handled walk andtrot. Moreover, the effect of the hindlimb pastern angle (