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México es centro de origen del aguacate (Persea americana Mill.), casi todos los miembros reconocidos del género Persea ocurren primariamente desde la parte central de México hasta gran parte de Centroamérica. El objetivo de este trabajo fue realizar la caracterización molecular de germoplasma de aguacate criollo de Nuevo León. Se utilizó la técnica del DNA Polimórfico Amplificado al Azar (RAPD´s). Se colectaron 27 materiales de aguacate criollo en la región sur y 16 en la región norte del Estado de Nuevo León, México. El nivel de diversidad genética detectado fue del 84%, el cual se considera como alto. Se observaron fragmentos específicos o únicos tipo RAPD´s, presentes en un solo individuo, este tipo de fragmentos son de particular interés ya que pueden estar ligados a un genotipo en particular y servir en el diagnóstico para diferenciar un genotipo o una región específica del genoma. Lo anterior es de particular interés para el aguacate criollo del Estado de Nuevo León, cuyo problema para su comercialización es la corta vida de anaquel que presenta, por lo tanto, encontrar gran variación genética como la detectada en este trabajo incrementa la posibilidad de generar nuevos materiales cuya vida de anaquel sea más prolongada, potenciando su valor comercial y por otro lado se podría aprovechar la característica de algunas variedades que presentan contenidos de aceites esenciales superior a lo registrado en variedades comerciales como el Hass.